Methods in org.biojava.bio.program.ssaha that return DataStore |
DataStore |
CompactedDataStoreFactory.buildDataStore(File storeFile,
SequenceDB seqDB,
Packing packing,
int wordLength,
int threshold)
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DataStore |
DataStoreFactory.buildDataStore(File storeFile,
SequenceDB seqDB,
Packing packing,
int wordLength,
int threshold)
Build a new DataStore. |
DataStore |
NIODataStoreFactory.buildDataStore(File storeFile,
SequenceDB seqDB,
Packing packing,
int wordLength,
int threshold)
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DataStore |
MappedDataStoreFactory.buildDataStore(File storeFile,
SequenceDB seqDB,
Packing packing,
int wordLength,
int threshold)
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DataStore |
CompactedDataStoreFactory.buildDataStore(File storeFile,
SequenceStreamer streamer,
Packing packing,
int wordLength,
int stepSize,
int threshold)
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DataStore |
CompactedDataStoreFactory.getDataStore(File storeFile)
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DataStore |
DataStoreFactory.getDataStore(File storeFile)
Get a pre-built data store associated with a file. |
DataStore |
NIODataStoreFactory.getDataStore(File storeFile)
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DataStore |
MappedDataStoreFactory.getDataStore(File storeFile)
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