O tempo de execução do Eclipse define os plug-ins (org.eclipse.osgi e org.eclipse.core.runtime) dos quais todos os outros plug-ins dependem. O tempo de execução é responsável por definir uma estrutura para plug-ins e o detalhe da implementação (agrupamentos e carregadores de classes) subjacente. O tempo de execução também é responsável por detectar e executar a aplicação principal do Eclipse e por manter um registo de plug-ins, respectivas extensões e pontos de extensão.
O tempo de execução proporciona também um sortido de utilitários como, por exemplo, acção de registo, opções de rastreio de depuração, adaptadores, um arquivo de preferências, e uma infra-estrutura de simultaneidade. Naturalmente que, enquanto kernel mínimo, o tempo de execução só é interessante quando os plug-ins que fazem uso dele e desempenham uma tarefa são criados. Tal como Atlas, o plug-in de tempo de execução reside estoicamente no fundo da pilha de plug-ins, a erguer o universo Eclipse nos seus fortes ombros.