Yksinkertaisin tapa aloittaa Java-ohjelma on ajaa se käyttämällä Java-sovellus-aloituskokoonpanoa.Tämä aloituskokoonpanolaji käyttää tietoja, jotka on saatu ohjelman aloitusta varten työympäristön oletusasetuksista ja ohjelman Java-projektista.
Java-ohjelma voidaan aloittaa myös valitsemalla projekti käännösyksikön tai luokkatiedoston asemesta.Tällöin järjestelmä kehottaa valitsemaan luokan päämetodia määrittävistä luokista.(Jos projektista löytyy vain yksi luokka, jolla on päämetodi, kyseinen luokka aloitetaan ikään kuin olisit valinnut sen.)
Java-näkymät
Java-muokkausohjelma
Vianmääritysohjelma
Yhteyden luonti etänäennäiskoneeseen Java-etäsovelluksen aloitustoiminnon avulla
Ohjelman uudelleenaloitus
Ajo ja vianmääritys
Suoritusargumenttien määritys
Askellus ohjelman suorituksen aikana