Une retenue minimum peut être configurée pour tous les programmes de prestations. Il s'agit du montant minimum que le système peut déduire du versement de prestation total émis pour un dossier. Il devient ainsi impossible de traiter une retenue dès lors qu'elle est inférieure à ce montant minimum. Par exemple, lorsque le montant de retenue minimum est défini sur 10, il est impossible de traiter une retenue inférieure à 10 $. La définition d'un montant de retenue minimum permet d'éviter l'émission de paiements peu élevés à l'attention de tiers qui préfèrent recevoir un paiement unique regroupant plusieurs retenues afin de simplifier le traitement financier.