Modèle:Liste de chapitres

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&lt;table style=&quot;background: transparent; width:275&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des chapitres de la leçon&quot;&gt;
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style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;35 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{35}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;{{#if:{{{36|}}}|&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;chapitre 36&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;36 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{36}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;{{#if:{{{37|}}}|&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;chapitre 37&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;37 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{37}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;{{#if:{{{38|}}}|&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;chapitre 38&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;38 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{38}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;{{#if:{{{39|}}}|&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;chapitre 39&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;39 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{39}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;{{#if:{{{40|}}}|&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;chapitre 40&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Chap.|chapitre}}&amp;nbsp;40 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{40}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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{{#if: {{{fiche1|}}}|&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/couleur/{{{idfaculté|}}}}}; color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}; border:1px solid #aaa; font-size:120%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;'''Fiches mémoires'''&lt;/div&gt;
&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;&lt;table style=&quot;background: transparent&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des fiches de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{fiche2|}}}|Fiche 1 :|Fiche :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{fiche2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{fiche3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche5|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche6|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche7|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche8|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 8&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;8 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche8}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche9|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 9&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;9 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche9}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche10|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 10&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;10 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche10}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche11|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 11&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;11 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche11}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{fiche12|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;fiche 12&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Fiche&amp;nbsp;12 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{fiche12}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des annexes de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{annexe2|}}}|Annexe&amp;nbsp;1 :|Annexe :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{annexe2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{annexe3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe5|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe6|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe7|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe8|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 8&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;8 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe8}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe9|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 9&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;9 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe9}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe10|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 10&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;10 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe10}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe11|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 11&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;11 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe11}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe12|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 12&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;12 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe12}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe13|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 13&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;13 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe13}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe14|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 14&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;14 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe14}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{annexe15|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;annexe 15&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Annexe&amp;nbsp;15 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{annexe15}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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}}&lt;/table&gt;&lt;/div&gt;|}}{{#if: {{{quiz1|}}}|&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/couleur/{{{idfaculté|}}}}}; color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}; border:1px solid #aaa; font-size:120%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;'''Quiz'''&lt;/div&gt;
&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des quiz de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{quiz2|}}}|Quiz&amp;nbsp;1 :|Quiz :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{quiz2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{quiz3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz5|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz6|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz7|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz8|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 8&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;8 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz8}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz9|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 9&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;9 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz9}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz10|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 10&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;10 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz10}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz11|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 11&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;11 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz11}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz12|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 12&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;12 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz12}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz13|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 13&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;13 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz13}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz14|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 14&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;14 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz14}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz15|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 15&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;15 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz15}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz16|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 16&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;16 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz16}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz17|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 17&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;17 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz17}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz18|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 18&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;18 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz18}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{quiz19|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;quiz 19&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Quiz&amp;nbsp;19 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{quiz19}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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}}&lt;/table&gt;&lt;/div&gt;|}}{{#if:{{{exo1|}}}|&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/couleur/{{{idfaculté|}}}}}; color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}; border:1px solid #aaa; font-size:120%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;'''Exercices'''&lt;/div&gt;
&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background: transparent&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des exercices de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{exo2|}}}|{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;1 :|Exercice :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{exo2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{exo3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{exo4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
    {{#if:{{{exo5|}}}
    |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
     {{#if:{{{exo6|}}}
     |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
      {{#if:{{{exo7|}}}
      |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
       {{#if:{{{exo8|}}}
       |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 8&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;8 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo8}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
        {{#if:{{{exo9|}}}
        |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 9&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;9 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo9}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
         {{#if:{{{exo10|}}}
         |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 10&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;10 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo10}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
          {{#if:{{{exo11|}}}
          |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 11&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;11 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo11}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
           {{#if:{{{exo12|}}}
           |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 12&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;12 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo12}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
            {{#if:{{{exo13|}}}
            |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 13&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;13 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo13}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
             {{#if:{{{exo14|}}}
             |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 14&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;14 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo14}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
              {{#if:{{{exo15|}}}
              |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 15&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;15 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo15}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
               {{#if:{{{exo16|}}}
               |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 16&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;16 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo16}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                {{#if:{{{exo17|}}}
                |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 17&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;17 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo17}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                 {{#if:{{{exo18|}}}
                 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 18&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;18 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo18}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                  {{#if:{{{exo19|}}}
                  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 19&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;19 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo19}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                   {{#if:{{{exo20|}}}
                   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 20&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;20 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo20}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                    {{#if:{{{exo21|}}}
                    |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 21&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;21 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo21}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                     {{#if:{{{exo22|}}}
                     |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 22&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;22 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo22}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                      {{#if:{{{exo23|}}}
                      |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 23&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;23 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo23}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                       {{#if:{{{exo24|}}}
                       |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 24&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;24 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo24}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                        {{#if:{{{exo25|}}}
                        |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 25&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;25 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo25}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                         {{#if:{{{exo26|}}}
                         |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 26&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;26 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo26}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                          {{#if:{{{exo27|}}}
                          |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 27&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;27 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo27}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                           {{#if:{{{exo28|}}}
                           |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 28&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;28 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo28}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                            {{#if:{{{exo29|}}}
                            |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 29&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;29 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo29}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                             {{#if:{{{exo30|}}}
                             |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;exercice 30&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{abréviation|Exos.|exercice}}&amp;nbsp;30 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{exo30}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
                             |
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&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des dissertations de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{dissert2|}}}|Dissert&amp;nbsp;1 :|Dissert :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{dissert2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{dissert3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert5|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert6|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert7|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert8|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 8&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;8 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert8}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert9|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 9&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;9 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert9}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert10|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 10&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;10 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert10}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert11|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 11&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;11 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert11}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{dissert12|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;dissertation 12&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Dissert&amp;nbsp;12 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{dissert12}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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}}&lt;/table&gt;&lt;/div&gt;|}}{{#if: {{{tp1|}}}|&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/couleur/{{{idfaculté|}}}}}; color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}; border:1px solid #aaa; font-size:120%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;'''Travaux pratiques'''&lt;/div&gt;
&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des travaux pratiques de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;tp 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{tp2|}}}|TP&amp;nbsp;1 :|TP :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{tp1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{tp2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;tp 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''TP&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{tp2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{tp3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;tp 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''TP&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{tp3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;tp 19&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''TP&amp;nbsp;19 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{tp19}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{tp20|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;tp 20&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''TP&amp;nbsp;20 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{tp20}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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&lt;div width=&quot;350px&quot; style=&quot;background: transparent; font-size:90%; padding:0.3em; text-align:center;&quot;&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #{{Idfaculté/pastel/{{{idfaculté|}}}}}&quot; summary=&quot;Tableau listant l’ensemble des devoirs de la leçon&gt;
 &lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 1&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''{{#if: {{{devoir2|}}}|Devoir&amp;nbsp;1 :|Devoir :}}'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir1}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
 {{#if:{{{devoir2|}}}
 |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 2&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;2 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir2}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
  {{#if:{{{devoir3|}}}
  |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 3&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;3 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir3}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{devoir4|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 4&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;4 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir4}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{devoir5|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 5&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;5 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir5}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{devoir6|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 6&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;6 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir6}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{devoir7|}}}
   |&lt;tr&gt;&lt;th id=&quot;devoir 7&quot; style=&quot;text-align:right;vertical-align:top;&quot; scope=&quot;row&quot;&gt;'''Devoir&amp;nbsp;7 :'''&lt;/th&gt;&lt;td style=&quot;text-align:left;&quot;&gt;{{{devoir7}}}&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
   {{#if:{{{devoir8|}}}
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   {{#if:{{{devoir9|}}}
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{{Documentation}}
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    <title>Ensemble (mathématiques)/Produit</title>
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      <timestamp>2022-08-02T22:43:05Z</timestamp>
      <contributor>
        <username>Zetud</username>
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      </contributor>
      <minor />
      <comment>Orth.</comment>
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      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="2512" xml:space="preserve">{{Chapitre
  | niveau    = 14
  | idfaculté = mathématiques
  | numéro    = 4
  | précédent = [[../Propriétés/]]
  | suivant   = [[../|Sommaire]]
}}
{{clr}}

{{Définition|titre=Définitions : couple, produit de deux ensembles|contenu={{Wikipédia|Couple (mathématiques)|Couple}}{{Wikipédia|Produit cartésien}}
* Soient ''x'' et ''y'' deux objets. Nous appelons '''couple''' (''x'',''y'') la suite d'objets dont le premier élément est ''x'' et le second ''y''.
* Soient ''X'' et ''Y'' deux ensembles quelconques. Nous appelons '''produit cartésien''' ou '''produit''' de ''X'' et de ''Y'' l’ensemble des couples (''x'',''y'') tels que ''x'' appartient à ''X'' et ''y'' appartient à ''Y''. Cet ensemble se note &lt;math&gt;X\times Y&lt;/math&gt;. 
}}
Formellement, le couple &lt;math&gt;(x,y)&lt;/math&gt; peut être défini ainsi : si &lt;math&gt;x&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;y&lt;/math&gt; sont deux objets, alors &lt;math&gt;(x,y)=\{\{x\},\{x,y\}\}&lt;/math&gt;.
Cette définition assure en particulier que &lt;math&gt;(a,b)=(c,d) \Longleftrightarrow (a=c \,\text{ et }\, b=d)&lt;/math&gt;.

{{Attention|&lt;math&gt;(x,y)\neq (y,x)&lt;/math&gt; en général. Il ne faut pas confondre un couple avec une [[Axiomes des théories des ensembles/Introduction#L’axiome de la somme|paire]] &lt;math&gt;\left\{ x,y\right\}&lt;/math&gt; pour laquelle nous avons &lt;math&gt;\left\{ x,y\right\} =\left\{ y,x\right\}&lt;/math&gt;.}}

{{Définition|titre=Définitions : ''n''-uplet, produit de ''n'' ensembles|contenu={{Wikipédia|n-uplet}}
* Soient ''x''₁, ''x''₂…, ''x''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt; ''n'' objets. Nous appelons ''n''-'''uplet''' (''x''₁, ''x''₂…, ''x''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt;) la suite d'objets dont le premier élément est ''x''₁, le deuxième ''x''₂…, et le dernier élément ''x''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt;. Ces éléments sont appelés '''composantes'''.
* Soient ''E''₁, ''E''₂…, ''E''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt; ''n'' ensembles quelconques. Nous appelons '''produit cartésien''' ou '''produit''' de ''E''₁ par … par ''E''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt;, l’ensemble des ''n''-uplets (''x''₁, ''x''₂…, ''x''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt;) tels que ''x''₁ appartient à ''E''₁…, ''x''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt; appartient à ''E''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt;. Cet ensemble se note &lt;math&gt;E_1\times E_2\times\ldots\times E_n&lt;/math&gt;.
* Si ''E''₁= ''E''₂=…=''E''&lt;sub&gt;''n''&lt;/sub&gt; sont égaux à un même ensemble ''E'', nous notons ''E''&lt;sup&gt;''n''&lt;/sup&gt; plutôt que &lt;math&gt;E\times E\times \ldots\times E&lt;/math&gt;.
}}

{{Bas de page
  | idfaculté = mathématiques
  | précédent = [[../Propriétés/]]
  | suivant   = [[../|Sommaire]]
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    <title>Allemand/Grammaire/Exercices/Prononciation</title>
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        <ip>89.245.16.36</ip>
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      <comment>/* Prononciation */</comment>
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      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="1620" xml:space="preserve">{{Exercice
  | idfaculté = langues
  | chapitre  = [[../../Alphabet|Alphabet et prononciation]]
  | numéro    = 1
  | leçon     = [[../../|Grammaire allemande]]
  | niveau    = 2
  | précédent = [[../../|Sommaire]]
}}

== Prononciation  ==

{| class=&quot;wikitable&quot;
! Mot ||Prononciation || Traduction
|-
| ja || [[Fichier:De-ja.ogg]] || oui
|-
| neu || [[Fichier:De-at-neu.ogg]] || nouveau
|-
| natürlich || [[Fichier:De-natürlich.ogg]] || naturellement, bien entendu
|-
| nicht || [[Fichier:De-nicht.ogg]] || ne ... pas (voir [[Allemand/Grammaire/Négation|négation]])
|-
| oder || [[Fichier:De-oder.ogg]] || ou
|-
| und || [[Fichier:De-und.ogg]] || et
|-
| schwer || [[Fichier:De-schwer.ogg]] || difficile
|-
| plötzlich || [[Fichier:De-plötzlich.ogg]] || soudain
|-
| jetzt || [[Fichier:De-jetzt.ogg]] || maintenant
|-
| süß || [[Fichier:De-süß.ogg]] || mignon
|-
| bitte || [[Fichier:De-bitte2.ogg]] || s'il vous plaît
|-
| Alkohol || [[Fichier:De-Alkohol.ogg]] || alcool
|-
| Adjektiv || [[Fichier:De-Adjektiv.ogg]] || adjectif
|-
| Beschluss || [[Fichier:De-Beschluss.ogg]] || décision
|-
| Beschlüsse || [[Fichier:De-Beschlüsse.ogg]] || décisions
|-
| schwimmen || [[Fichier:De-schwimmen.ogg]] || nager
|-
| säugen || [[Fichier:De-säugen.ogg]] || allaiter
|}

== Prononciation  ==

Plus difficile

{| class=&quot;wikitable&quot;
! Mot ||Prononciation || Traduction
|-
| Streichholzschächtelchen || [[Fichier:De-Streichholzschächtelchen.ogg]] || petite boîte d'allumettes
|}

{{Bas de page
  | idfaculté = langues
  | leçon     = [[../../|Grammaire allemande]]
  | précédent = [[../../|Sommaire]]
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    <title>Structure algébrique/Magma (mathématiques)</title>
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      <minor />
      <comment>Orth.</comment>
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      <text bytes="763" xml:space="preserve">{{Chapitre
  | idfaculté = mathématiques
  | précédent = [[../Ensemble (mathématiques)|Ensemble]]
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  | niveau    = 14
}}

Ce chapitre décrit de façon succincte ce qu'est un magma.

{{Clr}}


Un magma est une structure algébrique qui comporte un ensemble E muni d'une loi de composition interne, c'est-à-dire que lorsque l’on prend deux éléments de E et qu'on les compose par la loi, on obtient encore un élément de E. 

Exemple : &lt;math&gt;(\mathbb{N},+)&lt;/math&gt; est un magma car l'addition de deux entiers naturels donne encore un entier naturel. 

{{...}}


{{Bas de page
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}}

Ce chapitre décrit de façon succincte ce qu'est un magma.

Un magma est une structure algébrique qui comporte un ensemble E muni d'une loi de composition interne, c'est-à-dire que lorsque l’on prend deux éléments de E et qu'on les compose par la loi, on obtient encore un élément de E. 

{{Exemple|contenu= &lt;math&gt;(\mathbb{N},+)&lt;/math&gt; est un magma car l'addition de deux entiers naturels donne encore un entier naturel. }}

{{...}}

{{Bas de page
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    <title>Structure algébrique/Anneau (mathématiques)</title>
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      <contributor>
        <username>Zetud</username>
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      <comment>Orth., Typo. wikif.</comment>
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      <text bytes="7168" xml:space="preserve">{{Chapitre
  | idfaculté = mathématiques
  | précédent = [[../Groupe (mathématiques)|Groupe]]
  | suivant   = [[../Module sur un anneau/]]
  | numéro    = 5
  | niveau    = 14
}}

Ce chapitre décrit de façon succincte la structure d'anneau, et donne les exemples fondamentaux.

{{Définition|contenu=Un&lt;b&gt; anneau&lt;/b&gt; &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; est un ensemble &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; muni de deux lois de composition internes &lt;math&gt;+&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; vérifiant les propriétés suivantes :
* &lt;math&gt;(A,+)&lt;/math&gt; est un groupe abélien.
* la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; est associative.
* La loi &lt;math&gt; \cdot&lt;/math&gt; est distributive à gauche et à droite sur la loi &lt;math&gt;+&lt;/math&gt;, c'est-à-dire :
::&lt;math&gt; \forall a,b,c \in A\quad a\cdot(b+c)=a\cdot b+a\cdot c&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;(a+b)\cdot c=a\cdot c+b\cdot c&lt;/math&gt;.
Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt;  est dit &lt;b&gt;unitaire&lt;/b&gt; si la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; possède un élément neutre.

Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; est dit &lt;b&gt;commutatif&lt;/b&gt; (ou &lt;b&gt;abélien&lt;/b&gt;) si la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; est commutative.}}'''Remarque :''' 

Insistons sur certaines propriétés qui ne sont pas toujours valides pour un anneau :

# La loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; n'admet pas nécessairement d'élément neutre.
# Quand cet élément neutre existe, tous les éléments de l'anneau ne sont pas forcément inversibles. En particulier, l'élément neutre pour la loi &lt;math&gt;+&lt;/math&gt; n'est jamais inversible.
# La loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; n'est pas forcément commutative.

Voyons maintenant quelques exemples classiques permettant d'illustrer la définition et la remarque.

'''Exemples :'''

# &lt;u&gt;L'anneau des entiers relatifs&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; : Considérons l'ensemble &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; des entiers relatifs muni de l'addition et de la multiplication usuelles. Alors, le triplet &lt;math&gt;(\Z,+,\times)&lt;/math&gt; est un anneau commutatif unitaire où l'élément neutre pour l'addition est &lt;math&gt;0&lt;/math&gt; et l'élément neutre pour la multiplication est &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\{-1;1\}&lt;/math&gt;.
# &lt;u&gt;L'anneau&lt;/u&gt; &lt;math&gt;2\Z&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des entiers pairs &lt;math&gt;2\Z&lt;/math&gt; que l'on munit également de l'addition et de la multiplication usuelles. C'est alors un anneau inclus dans l'anneau &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; (on parle alors de sous-anneau) qui est commutatif mais pas unitaire, et l'élément neutre pour l'addition est toujours 0. 
# &lt;u&gt;L'anneau&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; des entiers modulo un entier &lt;math&gt;n&lt;/math&gt; que l'on munit de l'addition et de la multiplication modulo &lt;math&gt;n&lt;/math&gt;. C'est un anneau unitaire et commutatif dont l'élément neutre pour l'addition est la classe d'équivalence de &lt;math&gt;0&lt;/math&gt;, et l'élément neutre pour la multiplication est la classe de &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\{\bar{m};~\operatorname{PGCD}(m,n)=1 \}&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\bar{m}&lt;/math&gt; désigne la classe d'équivalence de &lt;math&gt;m&lt;/math&gt;.
# &lt;u&gt;L'anneau des polynômes&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des polynômes à coefficients réels &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt; muni de l'addition et de la multiplication des polynômes. C'est un anneau commutatif unitaire dont l'élément neutre pour l'addition est le polynôme nul, et l'élément neutre pour la multiplication est le polynôme constant égal à &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\R^*&lt;/math&gt;. Notons que l'on peut définir de façon similaire l'anneau des polynômes à coefficient dans un anneau commutatif &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; que l'on note &lt;math&gt;A[X].&lt;/math&gt;
# &lt;u&gt;L'anneau des matrices&lt;/u&gt; &lt;math&gt;M_n(\Complex)&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des matrices carrées de taille &lt;math&gt;n&lt;/math&gt; à coefficient dans &lt;math&gt;\Complex&lt;/math&gt; muni de l'addition et la multiplication usuelles des matrices. C'est un anneau unitaire mais non commutatif dont l'élément neutre pour l'addition est la matrice nulle et l'élément neutre pour la multiplication est la matrice identité &lt;math&gt;I_n&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;GL_n(\Complex)=\{A\in M_n(\Complex);~\det(A)\neq0\}&lt;/math&gt;. Comme dans l'exemple précédent, on peut également considérer l'ensemble des matrices carrées à coefficient dans un anneau &lt;math&gt;A&lt;/math&gt;.

Voyons maintenant une propriété qui montre les subtilités de la structure d'anneau. Observons l'exemple suivant sur l'anneau des matrices : soit &lt;math&gt;A=\begin{pmatrix}
0&amp;1\\0&amp;0
\end{pmatrix}\in M_2(\Complex)&lt;/math&gt; ; un calcul direct montre que &lt;math&gt;A^2=0&lt;/math&gt;. Cet exemple montre que dans un anneau il est possible qu'un produit soit nul sans qu'aucun des facteurs ne le soit. Cela pousse à définir la notion d'anneau intègre suivante :

{{Définition|Définition=|contenu=Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt;, avec &lt;math&gt;A\neq \{0\}&lt;/math&gt;, est dit '''intègre''' si la propriété suivante est vérifiée :&lt;br /&gt;
&lt;math&gt;\forall a,b\in A;~ ab=0 \Rightarrow a=0 \text{ ou }b=0 &lt;/math&gt;.}}

À l'exception de l'anneau des matrices, tous les anneaux présentés dans l'exemple précédent sont intègres. Cette propriété est très utile pour la résolution d'équation produit-nul comme dans les ensembles de nombres classiques.

Pour conclure cette présentation des concepts fondamentaux de la théorie des anneaux, intéressons-nous à la notion d'idéal. Un idéal est une partie d'un anneau stable pour les deux opérations et muni d'une propriété d'absorption pour la multiplication. C'est une sous-structure importante pour un anneau qui va permettre l'étude de sa structure ainsi que la construction de nouveaux anneaux (dits anneaux quotients). Nous donnons la définition uniquement dans le cas d'un anneau commutatif pour ne pas surcharger cette page de présentation.

{{Définition|contenu=Soient &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; un anneau commutatif et &lt;math&gt;I&lt;/math&gt; une partie de &lt;math&gt;A&lt;/math&gt;. Alors &lt;math&gt; I&lt;/math&gt; est un idéal de &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; si :
# &lt;math&gt;(I,+)&lt;/math&gt; est un sous groupe de &lt;math&gt;(A,+)&lt;/math&gt;.
#&lt;math&gt;\forall a\in A, i\in I;~a\cdot i \in I&lt;/math&gt;.|titre=Définition}}

'''Exemple :'''

# Dans l'anneau &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt;, les sous-ensembles de la forme &lt;math&gt;n\Z&lt;/math&gt; sont des idéaux. L'anneau &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; est alors l'anneau quotient de &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;n\Z&lt;/math&gt;.
# Dans l'anneau &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt;, les idéaux sont de la forme &lt;math&gt;P(X)\R[X]=\{PQ;~Q\in \R[X]\}&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;P\in \R[X]&lt;/math&gt; fixé.

À partir de ces quelques définitions, on peut déjà dégager deux questions importantes lors de l'étude d'un anneau &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; :

* Quels sont les éléments inversibles de l'anneau, s'il en a ?
* Quels sont les idéaux de l'anneau ? On décline cette question par la recherche d'idéaux possédant des propriétés particulières (premiers, maximaux, etc.).

{{Remarque
  | contenu =
Si le contenu de ce chapitre vous a intéressé, vous pouvez l'approfondir en consultant la leçon spécialisée : [[Anneau (mathématiques)|Anneau]]
}}


{{Bas de page
  | idfaculté = mathématiques
  | précédent = [[../Groupe (mathématiques)|Groupe]]
  | suivant   = [[../Module sur un anneau/]]
}}</text>
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      <timestamp>2022-08-03T11:22:11Z</timestamp>
      <contributor>
        <username>Crochet.david</username>
        <id>317</id>
      </contributor>
      <comment>.</comment>
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      <text bytes="7269" xml:space="preserve">{{Chapitre
  | idfaculté = mathématiques
  | précédent = [[../Groupe (mathématiques)|Groupe]]
  | suivant   = [[../Module sur un anneau/]]
  | numéro    = 5
  | niveau    = 14
}}

Ce chapitre décrit de façon succincte la structure d'anneau, et donne les exemples fondamentaux.

{{Définition|contenu=Un&lt;b&gt; anneau&lt;/b&gt; &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; est un ensemble &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; muni de deux lois de composition internes &lt;math&gt;+&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; vérifiant les propriétés suivantes :
* &lt;math&gt;(A,+)&lt;/math&gt; est un groupe abélien.
* la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; est associative.
* La loi &lt;math&gt; \cdot&lt;/math&gt; est distributive à gauche et à droite sur la loi &lt;math&gt;+&lt;/math&gt;, c'est-à-dire :
::&lt;math&gt; \forall a,b,c \in A\quad a\cdot(b+c)=a\cdot b+a\cdot c&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;(a+b)\cdot c=a\cdot c+b\cdot c&lt;/math&gt;.
Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt;  est dit &lt;b&gt;unitaire&lt;/b&gt; si la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; possède un élément neutre.

Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; est dit &lt;b&gt;commutatif&lt;/b&gt; (ou &lt;b&gt;abélien&lt;/b&gt;) si la loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; est commutative.}}

{{Remarque|contenu=
Insistons sur certaines propriétés qui ne sont pas toujours valides pour un anneau :
# La loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; n'admet pas nécessairement d'élément neutre.
# Quand cet élément neutre existe, tous les éléments de l'anneau ne sont pas forcément inversibles. En particulier, l'élément neutre pour la loi &lt;math&gt;+&lt;/math&gt; n'est jamais inversible.
# La loi &lt;math&gt;\cdot&lt;/math&gt; n'est pas forcément commutative.}}

Voyons maintenant quelques exemples classiques permettant d'illustrer la définition et la remarque.

{{Exemple|contenu=
&lt;u&gt;L'anneau des entiers relatifs&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; : Considérons l'ensemble &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; des entiers relatifs muni de l'addition et de la multiplication usuelles. Alors, le triplet &lt;math&gt;(\Z,+,\times)&lt;/math&gt; est un anneau commutatif unitaire où l'élément neutre pour l'addition est &lt;math&gt;0&lt;/math&gt; et l'élément neutre pour la multiplication est &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\{-1;1\}&lt;/math&gt;.}}
{{Exemple|contenu=&lt;u&gt;L'anneau&lt;/u&gt; &lt;math&gt;2\Z&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des entiers pairs &lt;math&gt;2\Z&lt;/math&gt; que l'on munit également de l'addition et de la multiplication usuelles. C'est alors un anneau inclus dans l'anneau &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; (on parle alors de sous-anneau) qui est commutatif mais pas unitaire, et l'élément neutre pour l'addition est toujours 0. }}
{{Exemple|contenu= &lt;u&gt;L'anneau&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; des entiers modulo un entier &lt;math&gt;n&lt;/math&gt; que l'on munit de l'addition et de la multiplication modulo &lt;math&gt;n&lt;/math&gt;. C'est un anneau unitaire et commutatif dont l'élément neutre pour l'addition est la classe d'équivalence de &lt;math&gt;0&lt;/math&gt;, et l'élément neutre pour la multiplication est la classe de &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\{\bar{m};~\operatorname{PGCD}(m,n)=1 \}&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\bar{m}&lt;/math&gt; désigne la classe d'équivalence de &lt;math&gt;m&lt;/math&gt;.}}
{{Exemple|contenu= &lt;u&gt;L'anneau des polynômes&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des polynômes à coefficients réels &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt; muni de l'addition et de la multiplication des polynômes. C'est un anneau commutatif unitaire dont l'élément neutre pour l'addition est le polynôme nul, et l'élément neutre pour la multiplication est le polynôme constant égal à &lt;math&gt;1&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;\R^*&lt;/math&gt;. Notons que l'on peut définir de façon similaire l'anneau des polynômes à coefficient dans un anneau commutatif &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; que l'on note &lt;math&gt;A[X].&lt;/math&gt;}}
{{Exemple|contenu= &lt;u&gt;L'anneau des matrices&lt;/u&gt; &lt;math&gt;M_n(\Complex)&lt;/math&gt; : On considère l'ensemble des matrices carrées de taille &lt;math&gt;n&lt;/math&gt; à coefficient dans &lt;math&gt;\Complex&lt;/math&gt; muni de l'addition et la multiplication usuelles des matrices. C'est un anneau unitaire mais non commutatif dont l'élément neutre pour l'addition est la matrice nulle et l'élément neutre pour la multiplication est la matrice identité &lt;math&gt;I_n&lt;/math&gt;. L'ensemble des éléments inversibles est &lt;math&gt;GL_n(\Complex)=\{A\in M_n(\Complex);~\det(A)\neq0\}&lt;/math&gt;. Comme dans l'exemple précédent, on peut également considérer l'ensemble des matrices carrées à coefficient dans un anneau &lt;math&gt;A&lt;/math&gt;.}}

Voyons maintenant une propriété qui montre les subtilités de la structure d'anneau. Observons l'exemple suivant sur l'anneau des matrices : soit &lt;math&gt;A=\begin{pmatrix}
0&amp;1\\0&amp;0
\end{pmatrix}\in M_2(\Complex)&lt;/math&gt; ; un calcul direct montre que &lt;math&gt;A^2=0&lt;/math&gt;. Cet exemple montre que dans un anneau il est possible qu'un produit soit nul sans qu'aucun des facteurs ne le soit. Cela pousse à définir la notion d'anneau intègre suivante :

{{Définition|Définition=|contenu=Un anneau &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt;, avec &lt;math&gt;A\neq \{0\}&lt;/math&gt;, est dit '''intègre''' si la propriété suivante est vérifiée :&lt;br /&gt;
&lt;math&gt;\forall a,b\in A;~ ab=0 \Rightarrow a=0 \text{ ou }b=0 &lt;/math&gt;.}}

À l'exception de l'anneau des matrices, tous les anneaux présentés dans l'exemple précédent sont intègres. Cette propriété est très utile pour la résolution d'équation produit-nul comme dans les ensembles de nombres classiques.

Pour conclure cette présentation des concepts fondamentaux de la théorie des anneaux, intéressons-nous à la notion d'idéal. Un idéal est une partie d'un anneau stable pour les deux opérations et muni d'une propriété d'absorption pour la multiplication. C'est une sous-structure importante pour un anneau qui va permettre l'étude de sa structure ainsi que la construction de nouveaux anneaux (dits anneaux quotients). Nous donnons la définition uniquement dans le cas d'un anneau commutatif pour ne pas surcharger cette page de présentation.

{{Définition|contenu=Soient &lt;math&gt;(A,+,\cdot)&lt;/math&gt; un anneau commutatif et &lt;math&gt;I&lt;/math&gt; une partie de &lt;math&gt;A&lt;/math&gt;. Alors &lt;math&gt; I&lt;/math&gt; est un idéal de &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; si :
# &lt;math&gt;(I,+)&lt;/math&gt; est un sous groupe de &lt;math&gt;(A,+)&lt;/math&gt;.
#&lt;math&gt;\forall a\in A, i\in I;~a\cdot i \in I&lt;/math&gt;.|titre=Définition}}

{{Exemple|contenu= Dans l'anneau &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt;, les sous-ensembles de la forme &lt;math&gt;n\Z&lt;/math&gt; sont des idéaux. L'anneau &lt;math&gt;\Z/n\Z&lt;/math&gt; est alors l'anneau quotient de &lt;math&gt;\Z&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;n\Z&lt;/math&gt;.}}
{{Exemple|contenu= Dans l'anneau &lt;math&gt;\R[X]&lt;/math&gt;, les idéaux sont de la forme &lt;math&gt;P(X)\R[X]=\{PQ;~Q\in \R[X]\}&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;P\in \R[X]&lt;/math&gt; fixé.}}

À partir de ces quelques définitions, on peut déjà dégager deux questions importantes lors de l'étude d'un anneau &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; :

* Quels sont les éléments inversibles de l'anneau, s'il en a ?
* Quels sont les idéaux de l'anneau ? On décline cette question par la recherche d'idéaux possédant des propriétés particulières (premiers, maximaux, etc.).

{{Remarque
  | contenu =
Si le contenu de ce chapitre vous a intéressé, vous pouvez l'approfondir en consultant la leçon spécialisée : [[Anneau (mathématiques)|Anneau]]
}}


{{Bas de page
  | idfaculté = mathématiques
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    <title>Signaux physiques (PCSI)/Exercices/Optique géométrique : conditions de Gauss</title>
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        <username>Phl7605</username>
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      <model>wikitext</model>
      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="278881" xml:space="preserve">{{Exercice
  | titre     = Optique géométrique : conditions de Gauss
  | idfaculté = physique
  | numéro    = 13
  | chapitre  = [[../../Optique géométrique : conditions de Gauss/]]
  | précédent = [[../Optique géométrique : miroir plan/]]
  | suivant   = [[../Optique géométrique : lentilles minces/]]
  | niveau    = 14
}}

__TOC__
{{clr}}

== Stigmatisme et aplanétisme approchés d'un miroir sphérique sous conditions de Gauss ==

{{Al|5}}Pour être défini, un miroir sphérique nécessite la connaissance de :
* sa nature « concave » ou « convexe », 
* son centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;centre de courbure de la surface sphérique réfléchissante &lt;ref&gt; Si le miroir est « concave », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est réel, et si le miroir est « convexe », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est virtuel.&lt;/ref&gt;&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;,
* son rayon de courbure &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;non algébrisé&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;R\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;rayon de courbure de la surface sphérique réfléchissante&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;,
* l'axe optique principal dont la partie incidente &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou son prolongement&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; passe par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;point objet dont on étudiera l'image éventuelle&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et
* son sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;intersection de l'axe optique principal et de la surface réfléchissante&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Nous adoptons l'algébrisation physique de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot;&gt; Supposant l'axe optique principal horizontal avec les espaces objets réel et virtuel respectivement situés à gauche et à droite du miroir, &lt;br&gt;{{Al|3}}la partie incidente de l'axe optique principal est orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\rightarrow\;&lt;/math&gt; et tous ses points &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;qu'ils soient réels ou virtuels&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ont une abscisse &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;comptée à partir d'une origine pouvant être {{Nobr|quelconque&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;}} mesurée dans ce sens, le sens étant rappelé en indice de l'abscisse ; &lt;br&gt;{{Al|3}}la partie réfléchie de l'axe optique principal est alors orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\leftarrow\;&lt;/math&gt; et tous ses points &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;qu'ils soient réels ou virtuels&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ont une abscisse &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;comptée à partir d'une origine pouvant être quelconque et différente de celle des points de la partie incidente de l'axe&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; mesurée dans ce sens, le sens étant aussi rappelé en indice de l'abscisse ; &lt;br&gt;{{Al|3}}voir les paragraphes « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Algébrisation_physique_de_l'axe_optique_principal_(associé_à_un_objet_ponctuel)|algébrisation physique de l'axe optique principal (associé à un objet ponctuel)]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Repérage_d'un_point_objet_ou_d'un_point_image_sur_l'axe_optique_principal|repérage d'un point objet ou d'un point image sur l'axe optique principal]] (surface réfléchissante) » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; et, pour unifier l'étude des miroirs sphériques, algébrisons le rayon de courbure du miroir selon &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; avec pour conséquence la nature « concave » ou « convexe » du miroir caractérisé par le signe du rayon de courbure algébrisé :
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à droite de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est virtuel, correspondant à un miroir « convexe »,
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à gauche de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est réel, correspondant à un miroir « concave ».
&lt;center&gt; 
&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;330px&gt;
Miroir sphérique convexe - algébrisation.jpg|Miroir sphérique convexe : algébrisation de l'axe optique principal, définitions du centre, du sommet et du rayon de courbure algébrisé
Miroir sphérique concave - algébrisation.jpg|Miroir sphérique concave : algébrisation de l'axe optique principal, définitions du centre, du sommet et du rayon de courbure algébrisé
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Dans la suite nous supposerons le miroir sphérique concave &lt;ref&gt; En précisant la modification des résultats pour un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Dans la suite nous }}admettrons qu'il n'y a pas stigmatisme rigoureux du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Stigmatisme_rigoureux_d'un_système_optique_pour_un_point_objet|stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point objet]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour tous les points objet autres que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et tous les points du miroir &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot;&gt; Si le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est sur le miroir, l'axe optique principal associé à ce point objet ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; joue le rôle de sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir ; ainsi, dans la mesure où l'axe optique principal n'a pas été préalablement défini, tout point du miroir peut être considéré comme un sommet.&lt;/ref&gt;.

=== Démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss ===

[[File:Miroir sphérique concave - stigmatisme approché.jpg|thumb|350px|Schéma d'un miroir sphérique concave dans le but d'établir le stigmatisme approché du miroir &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Stigmatisme_d'un_système_optique_pour_un_point_objet|stigmatisme d'un système optique pour un point objet]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour tout point objet autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;]]

{{Al|5}}Considérant un point objet réel &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et l'axe optique principal correspondant de support &lt;math&gt;\;(A_oC)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Dès lors que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\neq C&lt;/math&gt;, l'axe optique principal est parfaitement défini ainsi que le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui est l'intersection de l'axe optique principal et du miroir ; &lt;br&gt;{{Al|3}}sur le schéma &lt;math&gt;\;[SA_o]\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; [SC]&lt;/math&gt;, ceci entraînant que &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, l'image éventuelle de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par le miroir, est telle que &lt;math&gt;\;[SA_i]\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; [SC]&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}pour traiter le cas correspondant à &lt;math&gt;\;[SA_o] &lt; [SC]&lt;/math&gt;, ce qui entraînerait que &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, l'image éventuelle de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par le miroir, serait telle que &lt;math&gt;\;[SA_i] &gt; [SC]&lt;/math&gt;, il suffirait de permuter l'objet et l'image pour retrouver le cas précédent aussi nous nous contenterons de traiter le cas du schéma &lt;math&gt;\;[SA_o] &gt; [SC]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, nous envisageons des rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, peu inclinés par rapport à l'axe optique principal, d'angle d'inclinaison &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; et dont le point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; reste proche du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; c.-à-d. tel que l'angle que fait la normale au miroir en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; dans le sens incident avec la partie incidente de l'axe optique principal &lt;math&gt;\;\widehat{(\overrightarrow{CS}\, ;\, \vec{N})} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\omega\;&lt;/math&gt; est tel que &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;paraxial&quot;&gt; Les rayons incidents sont donc paraxiaux, conditions de Gauss &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;admises&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; pour que le système recevant ces rayons soit stigmatique approché pour le point objet considéré, voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}Le rayon incident &lt;math&gt;\;A_oI\;&lt;/math&gt; donnant, par utilisation des lois de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot;&gt; '''[[w:Willebrord_Snell|Willebrord Snell Van Royen]] ou Snellius (1580 - 1626)''' humaniste, mathématicien et physicien néerlandais, semble avoir découvert les lois portant son nom avant Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;sans que ce soit {{Nobr|assuré&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.}} &lt;br&gt;{{Al|3}}'''[[w:René_Descartes|René Descartes]] (1596 - 1650)''' mathématicien, physicien et philosophe français, considéré comme l'un des fondateurs de la [[w:Philosophie_moderne|philosophie moderne]], en physique a contribué à l'[[w:Optique_géométrique|optique géométrique]] et en mathématiques est à l'origine de la [[w:Géométrie_analytique|géométrie analytique]].&lt;/ref&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;1ère loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Première_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réflexion|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réflexion]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Deuxième_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réflexion|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réflexion]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;, le rayon réfléchi &lt;math&gt;\;IA_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(A_i \in&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, appelons &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; l'angle d'inclinaison du rayon réfléchi par rapport à la partie réfléchie de l'axe optique principal ; nous nous proposons de démontrer que &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est indépendant du rayon incident considéré &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. indépendant de &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;\omega\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot;&gt; En &lt;math&gt;\;1796&lt;/math&gt;, '''[[w:Carl_Friedrich_Gauss|Gauss]]''', à l'âge de dix-neuf ans, caractérisa presque complètement tous les polygones réguliers constructibles à la règle et au compas et il demanda par la suite qu'un [[w:Heptadécagone|heptadécagone]] {{Nobr|&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;polygone}} régulier de &lt;math&gt;\;17\;&lt;/math&gt; côtés&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit gravé sur son tombeau ; bien d'autres découvertes de mathématiques lui sont dues dont, en particulier, en &lt;math&gt;\;1801\;&lt;/math&gt; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; démonstration de la loi de réciprocité quadratique conjecturée par '''[[w:Leonhard_Euler|Euler]]''' en &lt;math&gt;\;1772&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;un nombre premier est congru à un carré de nombre entier modulo un autre nombre premier, par exemple &lt;math&gt;\;11 \equiv 3^2\!\! \pmod{2}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;19 \equiv 4^2\!\! \pmod{3}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;41 \equiv 6^2\!\! \pmod{5}\;&lt;/math&gt; de même que &lt;math&gt;\;43 \equiv 6^2\!\! \pmod{7}\; \ldots\big]\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\{&lt;/math&gt;'''[[w:Leonhard_Euler|Leonhard Euler]] (1707 - 1783)''' mathématicien et physicien suisse qui passa la plus grande partie de sa vie dans l'Empire russe et en Allemagne ; en mathématiques il fit d'importantes découvertes dans des domaines aussi variés que le [[w:Calcul_infinitésimal|calcul infinitésimal]] et la [[w:Théorie_des_graphes|théorie des graphes]], il introduisit également une grande partie de la terminologie et de la notation des mathématiques modernes, en particulier pour l'[[w:Analyse_(mathématiques)|analyse mathématique]], comme la notion de [[w:Fonction_(mathématiques)|fonction mathématique]] ; il est aussi connu pour ses travaux en mécanique, en dynamique des fluides, en optique et en astronomie&lt;math&gt;\}&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}dans le domaine de l'astronomie '''[[w:Carl_Friedrich_Gauss|Gauss]]''' publia un travail très important sur le mouvement des corps célestes contenant le développement de la [[w:Méthode_des_moindres_carrés|méthode des moindres carrés]] ; auparavant, en &lt;math&gt;\;1801&lt;/math&gt;, il développa une nouvelle méthode de calcul lui permettant de prédire où doit se trouver [[w:(1)_Cérès|Cérès]] &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;une planète naine de la ceinture des astéroïdes entre Mars et Jupiter&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}dans le domaine de la physique il est l'auteur de deux des quatre équations de '''Maxwell''' gérant l'électromagnétisme &lt;math&gt;\;\{&lt;/math&gt;'''[[w:James_Clerk_Maxwell|James Clerk Maxwell]] (1831 - 1879)''' physicien et mathématicien écossais, principalement connu pour ses équations unifiant l'électricité, le magnétisme et l'induction ainsi que pour l'établissement du caractère électromagnétique des ondes lumineuses, mais aussi pour sa distribution des vitesses utilisée dans une description statistique de la théorie cinétique des gaz ; le tire-bouchon fictif permettant de déterminer l'orientation à droite d'un espace tridimensionnel ou le caractère direct d'un triplet de vecteurs a été baptisé « tire-bouchon de Maxwell » en son honneur&lt;math&gt;\}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\big(\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; sont réalisées.

==== Établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω ====

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC\;&lt;/math&gt; établir une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i\;\big(&lt;/math&gt;angle d'incidence du rayon incident en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC\;&lt;/math&gt; établir une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation entre &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i'\;\big(&lt;/math&gt;angle de réflexion du rayon réfléchi en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; et les deux relations précédentes, déduire la relation suivante entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt; : &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{\theta_o + \theta_i}{2}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;applicabilité hors conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot;&gt; Cette relation reste applicable quels que soient les ordres de grandeur de &lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert&lt;/math&gt;, elle ne nécessite donc pas de se placer dans les conditions de Gauss de stigmatisme approché.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\omega = \theta_o + (-i)\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot;&gt; On utilise la propriété suivante : « dans un triangle, un angle extérieur est égal à la somme des deux autres angles intérieurs » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;propriété utilisant des angles non algébrisés&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; sont positifs mais &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; étant négatif, sa valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et  

{{Al|5}}dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\theta_i = \omega + i'\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que tous les angles &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;i'\;&lt;/math&gt; sont positifs.&lt;/ref&gt; ; en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; pour la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; «&lt;math&gt;\;i' = -i\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la relation ci-dessus se réécrit &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIC}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\theta_i = \omega - i\;&lt;/math&gt;» ;

{{Al|5}}{{Transparent|dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIC}&lt;/math&gt;, }}on élimine alors &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; entre ces deux relations en faisant la différence soit : &lt;math&gt;\;\omega - \theta_i = \theta_o - \omega\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;2\,\omega = \theta_o + \theta_i\;&lt;/math&gt; soit enfin «&lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{\theta_o + \theta_i}{2}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;applicabilité hors conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;.}}

==== Évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H ====

{{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, montrer que le rayon réfléchi est peu incliné relativement à la partie réfléchie de l'axe optique principal c.-à-d. &lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \ll 1&lt;/math&gt;.
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot;&gt; &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.&lt;/ref&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;,
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\omega)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# déduire des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;, un lien entre «&lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;relation &lt;math&gt;\,(\mathfrak{b})\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\theta_i = 2\, \omega - \theta_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \leqslant 2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\vert \theta_o \vert \ll 1\\ \vert \omega \vert \ll 1 \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \leqslant 2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. que le rayon réfléchi est aussi peu incliné relativement à la partie réfléchie de l'axe optique principal.&lt;/center&gt;
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_o &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_\rightarrow &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) \simeq \theta_o\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable#Développements_limités_à_l'ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|développements limités à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_i &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_\leftarrow &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) \simeq \theta_i\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\omega) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HC}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\omega &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\omega) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}_\rightarrow &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{CIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\omega) \simeq \omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\omega \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HC_\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;2\, \omega = \theta_i + \theta_o&lt;/math&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\dfrac{-2\, \overline{HI}}{\overline{HC_\rightarrow}} = \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow} - \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, après simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{HI}&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Transparent|des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{a})}\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;\color{transparent}{2\, \omega = \theta_i + \theta_o}&lt;/math&gt;, on en déduit }}«&lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{HC_\rightarrow}} = \dfrac{1}{\overline{{\mathrm{HA}_i}_\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.}}

==== Établissement de la confusion de H et de S à l'ordre un en ω ====

{{Al|5}}Établir que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; peut être confondu avec le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;H et S confondus&quot;&gt; Ceci nécessite que &lt;math&gt;\;[HS]\;&lt;/math&gt; soit un infiniment petit au moins d'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et

{{Al|5}}réécrire que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; en tenant compte de cette confusion.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Montrons que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;ω infiniment petit d'ordre un&quot;&gt; &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\;&lt;/math&gt; étant considéré comme un infiniment petit d'ordre un.&lt;/ref&gt;, en évaluant &lt;math&gt;\;[CH]\;&lt;/math&gt; puis &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH]\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, on obtient &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[CH] = [CI]\, \cos(\omega) = R\, \cos(\omega) \simeq R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable#D.L._d'ordre_deux_de_quelques_fonctions_usuelles_au_voisinage_de_zéro|développements limités à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles au voisinage de zéro]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Voir aussi la remarque du paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable_au_voisinage_d'une_de_ses_valeurs#Développements_limités_à_l'ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|développements limités à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; d'où &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH] \simeq R - R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;», soit «&lt;math&gt;\;[HS] \simeq R \dfrac{\omega^2}{2}\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» ou finalement &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[HS] \simeq 0\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» ;

{{Al|5}}remplaçant &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; dans la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})&lt;/math&gt;, on peut, sous les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, la réécrire selon &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\; \dfrac{-2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Sous cette forme la relation nécessite que le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; sommet du miroir.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Conclusion : stigmatisme approché du miroir sphérique (concave) pour le point objet A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; définit, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, un point image unique &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; et en déduire &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier }}le stigmatisme approché du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier que }}la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot;&gt; Nous admettrons que cette relation &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou propriété&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans le cas d'un miroir sphérique concave est encore applicable, sans modification, à un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante appelée « vergence » du miroir sphérique exprimée en dioptries &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;de symbole &lt;math&gt;\;\delta\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dioptrie&quot;&gt; Pour que la vergence s'exprime en dioptries, les abscisses doivent l'être en &lt;math&gt;\;m\;\big(&lt;/math&gt;la dioptrie étant liée au mètre par &lt;math&gt;\;1\, \delta = 1\,m^{-1}\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{b})}\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V}\;&lt;/math&gt;» }}exprimer &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.

{{Al|5}}Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot;&gt; '''[[w:René_Descartes|René Descartes]] (1596 - 1650)''' mathématicien, physicien et philosophe français, considéré comme l'un des fondateurs de la [[w:Philosophie_moderne|philosophie moderne]], en physique a contribué à l'[[w:Optique_géométrique|optique géométrique]] et en mathématiques est à l'origine de la [[w:Géométrie_analytique|géométrie analytique]].&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Pour le repérage de Descartes dans un miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave ou convexe&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, il y a deux origines utilisées : l'origine au sommet qui est la plus fréquemment utilisée et l'origine au centre qui l'est beaucoup moins.&lt;/ref&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;{{Al|7}}{{Transparent|Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; }}celle du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; d'un miroir sphérique se réécrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot;&gt; C.-à-d., comme cela sera vu dans les paragraphes « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Première_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_position)_de_Descartes|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de position) de Descartes]] », « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Première_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_position)_de_Newton|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de position) de Newton]] », « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Deuxième_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_grandissement_transverse)_de_Descartes|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de grandissement transverse) de Descartes]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Deuxième_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_grandissement_transverse)_de_Newton|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de grandissement transverse) de Newton]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] », nous obtenons la même relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;ou de grandissement transverse&lt;math&gt;\big\}\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou de Newton&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; que celle d'une lentille mince &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à condition que l'algébrisation de l'axe optique du miroir sphérique soit l'algébrisation physique adoptée dans ce cours&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;revoir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Algébrisation_physique_de_l'axe_optique_principal_(associé_à_un_objet_ponctuel)|algébrisation physique de l'axe optique principal (associé à un objet ponctuel)]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big\}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; « pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;Ao autre que C et S&quot;&gt; &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; pour que l'axe optique principal associé à &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit unique et &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; pour que l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ne soit pas nulle, ce qui permet à son inverse d'exister&lt;/ref&gt; puisque, &lt;br&gt;{{Al|9}}{{Transparent|La relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{b})}\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du miroir sphérique « }}pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; fixé, le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est déterminé de façon unique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;indépendamment des variations des petits angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; peut effectivement être écrite sous la forme «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante définissant la « vergence » du miroir sphérique selon &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; rayon algébrisé du miroir.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Avec les « abscisses de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du miroir sphérique se réécrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Points pour lesquels la conjugaison du miroir sphérique est rigoureuse et points doubles ===

{{Al|5}}Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot; /&gt; du miroir sont des points
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que }}pour lesquels le miroir est stigmatique rigoureux et
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que }}dont l'image est confondue avec l'objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. des points doubles&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est applicable à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du miroir, &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; est applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C}&lt;/math&gt;, }}bien que la conjugaison soit rigoureuse ;

{{Al|5}}vérifier, en utilisant cette relation, que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double.

{{Al|5}}Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, sommet du miroir &lt;ref&gt; Mais évidemment pas sous la forme «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» qui est indéterminée quand on l'applique à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, son abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; y étant nulle &lt;math&gt;\;\ldots&lt;/math&gt;&lt;/ref&gt;, pour lequel il y a conjugaison rigoureuse, &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}évaluer &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; puis &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}vérifier, sur cette dernière forme, que
&lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, vérifier, }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;«&lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double » et
&lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, vérifier, }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;« il n'y a pas d'autres points doubles que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt;». 

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - points doubles.jpg|thumb|600px|Schémas de vérification du fait que, pour &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, le miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est stigmatique rigoureux et que ce sont des points doubles]]
{{Al|5}}Voir ci-contre les propriétés particulières d'un point objet en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot;/&gt; : 
* à gauche tout rayon d'un faisceau incident issu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave étant normal au miroir se réfléchit sur lui-même, donnant un ensemble de rayons réfléchis convergeant en un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, c.-à-d. prouvant que le miroir sphérique est stigmatique rigoureux pour son centre ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double ;
* à droite tout rayon d'un faisceau incident convergeant sur le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave se réfléchissant en suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal et l'ensemble des rayons réfléchis divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, cela prouve le stigmatisme rigoureux du miroir sphérique pour son sommet &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double.

{{Al|5}}Pour appliquer la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du miroir, bien que la conjugaison soit rigoureuse, il suffit de ne considérer que les rayons paraxiaux du faisceau incident issu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et d'ouverture quelconque &lt;ref&gt; Le fait que les autres rayons convergent également en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ne modifient en rien la convergence des rayons réfléchis provenant de rayons incidents paraxiaux.&lt;/ref&gt;, condition d'applicabilité de la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; l'image du point objet &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, ce dernier étant d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_o(C) = \overline{SC}_{\rightarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt;» et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C_i}\;&lt;/math&gt; l'image du point objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C}&lt;/math&gt;, ce dernier }}&lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; d'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;», nous obtenons, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, }}en remplaçant &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{R}}&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(C_i)} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» d'où &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\Leftrightarrow&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\overline{SC_i}_{\rightarrow} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot;&gt; En effet quand on change le sens d'orientation d'un axe les abscisses sont changées en leurs opposées.&lt;/ref&gt; prouvant que &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, en remplaçant &lt;math&gt;\;\color{transparent}{V}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{-2}{\overline{R}}}&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i(C_i)} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}}\;&lt;/math&gt;» d'où &lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{R}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\color{transparent}{\Leftrightarrow}&lt;/math&gt; }}&lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; se confond avec &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et par suite que «&lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est un point double ».

{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;forme permettant à l'abscisse objet d'être nulle&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; sous cette forme on vérifie que

{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» }}le point objet en &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(S) = 0\;&lt;/math&gt; &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» le point objet en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}a une image d'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i = 0&lt;/math&gt;, c.-à-d. &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» le point objet en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, a }}une image confondue avec &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, prouvant que «&lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est bien un point double » ;

{{Al|5}}les points doubles &lt;math&gt;\;A_d\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_d\;&lt;/math&gt; étant tels que leurs abscisses images de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; s'écrivant «&lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \overline{SA_d}_{\leftarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\overline{SA_d}_{\rightarrow} = -p_d\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot; /&gt; avec «&lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \dfrac{p_d}{1 + V\, p_d}\;&lt;/math&gt;» obéissent à l'équation «&lt;math&gt;\;-p_d = \dfrac{p_d}{1 + V\, p_d}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. «&lt;math&gt;\;\left\lbrace\begin{array}{c}p_d = 0\;\;\; \text{ou}\\ 1 + V\, p_d = -1\end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;», &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|les points doubles &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_d}\;&lt;/math&gt; }}la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; solution donnant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; sommet du miroir et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|les points doubles &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_d}\;&lt;/math&gt; }}la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; équation conduisant à «&lt;math&gt;\;p_d = \dfrac{-2}{V} = \overline{R}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; centre du miroir ; &lt;center&gt;le centre et le sommet d'un miroir sphérique sont donc les seuls points doubles de ce dernier.&lt;/center&gt;}}

=== Caractère focal d'un miroir sphérique, position des foyers principaux objet et image, lien de la vergence et des distances focales objet et image ===

{{Al|5}}Vérifier, sur la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; d'un miroir sphérique, que ce dernier est nécessairement « focal » &lt;ref name=&quot;définition focal&quot;&gt; Un système « afocal » étant tel que le point à l'infini de l'axe optique principal est un point double, un système sera « focal » si le point à l'infini de l'axe optique principal est conjugué à un point de ce même axe optique principal à distance finie.&lt;/ref&gt; puis 

{{Al|5}}déterminer &lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la position du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point objet de l'axe optique principal ayant pour image le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;F_o\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; A_{i,\,\infty}\big]\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|déterminer }}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la position du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point image de l'axe optique principal ayant pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;&gt; C.-à-d. pour point objet.&lt;/ref&gt; le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; F_i\big]&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}quelle particularité ces deux points possèdent-ils en ce qui concerne leurs positions absolues d'une part et leur position relative d'autre part ?

{{Al|5}}Définissant &lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la distance focale objet comme l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du foyer principal objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Définissant }}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la distance focale image comme l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;,

{{Al|5}}déterminer le lien entre vergence &lt;math&gt;\;V&lt;/math&gt;, distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; et distance focale image &lt;math&gt;\;f_i&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Un miroir sphérique est un « système focal » car le point à l'infini de l'axe optique principal n'est pas un point double &lt;ref name=&quot;caractère non double du point à l'infini de l'axe optique principal&quot;&gt; En effet nous avons établi que les seuls points doubles du miroir sphérique sont &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Points_pour_lesquels_la_conjugaison_du_miroir_sphérique_est_rigoureuse_et_points_doubles|points pour lesquels la conjugaison du miroir sphérique est rigoureuse et points doubles]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt;.
* Le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i(F_i) = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_i}&lt;/math&gt;, }}étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(A_{o,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_o(A_{o,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_i}&lt;/math&gt;, étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_{o,\, \infty}}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, }}on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(F_i)} - 0 = V\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} = \dfrac{1}{V} = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.
* Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt;  &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(F_o) = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_o}&lt;/math&gt;, }}étant l'antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;/&gt; du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i(A_{i,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(A_{i,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|6}}{{Transparent|Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_o}&lt;/math&gt;, étant l'antécédent du point à l'infini &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_{i,\, \infty}}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, }}on en déduit &lt;math&gt;\;0 - \dfrac{1}{p_o(F_o)} = V\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} = -\dfrac{1}{V} = \dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.
* Les positions géométriques respectives des foyers principaux objet et image étant telles que «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} = - \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;le changement de sens d'algébrisation conduisant à &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\rightarrow} = -\overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot; /&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\rightarrow} = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; c.-à-d. la &lt;u&gt;coïncidence des positions géométriques des foyers principaux objet et image&lt;/u&gt; &lt;ref&gt; Cette coïncidence n'est que géométrique, car ce sont des points d'espaces optiques différents, l'un est dans un espace objet et l'autre dans un espace image.&lt;/ref&gt; ;
* &lt;u&gt;leur position géométrique commune&lt;/u&gt; étant telle que «&lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} = \dfrac{\overline{R}}{2} = \dfrac{\overline{SC}_{\rightarrow}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; on vérifie qu'elle &lt;u&gt;coïncide avec le milieu du segment joignant le sommet et le centre du miroir&lt;/u&gt;.
{{Al|5}}&lt;u&gt;Notion de distances focales objet et image&lt;/u&gt; :
* la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; étant définie par «&lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à la vergence par «&lt;math&gt;\;f_i = \dfrac{1}{V} = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» ;
* la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; étant définie par «&lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à la vergence par «&lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{1}{V} = \dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» ; 
&lt;center&gt;on en déduit la relation «&lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;interprétation de la vergence&quot;&gt; Pratiquement « la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la valeur de l'invariant &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;», appliquée au couple de points conjugués &lt;math&gt;\;(A_{o,\, \infty}\, , \,F_i)\;&lt;/math&gt; on trouve &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} - 0\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|3}}{{Transparent|Pratiquement « la vergence &lt;math&gt;\;\color{transparent}{V}\;&lt;/math&gt; est la valeur de l'invariant &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}}\;&lt;/math&gt;», }}appliquée au couple de points conjugués &lt;math&gt;\;(F_o\, , \,A_{i,\, \infty})&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;V = 0 - \dfrac{1}{f_o}&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}pour mémoire, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant un point double, l'invariant en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; donne la valeur «&lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{\overline{SC}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = -\dfrac{2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;».&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Quelques propriétés découlant du caractère focal d'un miroir sphérique ===

==== Signe de la vergence suivant la nature concave ou convexe du miroir sphérique, caractère convergent ou divergent du miroir et nature réelle ou virtuelle des foyers principaux ====

{{Al|5}}Déterminer le signe de la vergence suivant la nature « concave » ou « convexe » du miroir sphérique puis

{{Al|5}}{{Transparent|Déterminer }}son caractère « convergent » ou « divergent » sachant qu'un système focal à « vergence positive » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement « négative »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est dit « convergent » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement « divergent »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Déterminer }}la nature « réelle » ou « virtuelle » des foyers principaux.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; on en déduit que la vergence est de signe contraire au rayon de courbure algébrisé du miroir sphérique, ainsi :
* un miroir &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;nature de C&quot;&gt; Correspondant au caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un miroir concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement convexe&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, donc une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0&lt;/math&gt;, c'est un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; »,
* un miroir &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;nature de C&quot; /&gt;, donc une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0&lt;/math&gt;, c'est un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; ».
{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit la nature &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;réelle ou virtuelle&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; des foyers principaux objet et image suivant la nature &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;convergente ou divergente&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique :
* un miroir &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; étant convergent, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Transparent|un miroir concave étant convergent, }}la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;nature des foyers&quot;&gt; Pour un miroir concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement convexe&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; le caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; avec le fait que la position géométrique commune des foyers principaux est le milieu du segment joignant le centre et le sommet, entraîne le caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; des foyers principaux objet et image.&lt;/ref&gt;,
* un miroir &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; étant divergent, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Transparent|un miroir convexe étant divergent, }}la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;nature des foyers&quot; /&gt;.}}

==== Démonstration de l'absence de conjugaison non rigoureuse du miroir sphérique (concave) pour le point objet à l'infini sur l'axe optique principal ====

{{Al|5}}En reprenant la démonstration faite dans la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss]] » plus haut dans cet exercice &lt;ref&gt; Plus exactement dans la solution des questions successives « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Établissement_de_la_relation_liant_θo,_θi_et_ω|établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Évaluation_des_angles_θo,_θi_et_ω_en_fonction_des_abscisses_de_Ao,_Ai_et_C_repérées_relativement_à_H|évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; mais &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|En reprenant la démonstration }}avec &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; situé à l'infini &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ce qui correspond à &lt;math&gt;\;\theta_o = 0\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|En reprenant la démonstration }}en conservant les notations introduites dans « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|cette question]] » &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;à l'exception de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; qui sera noté &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot;&gt; Fonction de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; car ce point &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; hors condition de Gauss &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; en dépend effectivement &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c'est d'ailleurs, en ce qui concerne &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le but de cette question&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et de &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; qui sera noté &lt;math&gt;\;H(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, 

{{Al|5}}déterminer la position de &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point de l'axe optique principal par lequel passe le rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, de point d'incidence &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et 

{{Al|5}}vérifier que &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; dépendant effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|vérifier }}qu'il n'y a pas conjugaison rigoureuse du miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; pour le point situé à l'infini de l'axe optique principal.

{{Solution|contenu = &lt;center&gt;&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;355px&gt;
Miroir sphérique concave - absence stigmatisme rigoureux.jpg|Schéma de démonstration de l'absence de stigmatisme rigoureux d'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet à l'infini sur l'axe optique principal
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Montrons algébriquement qu'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; n'est pas rigoureusement stigmatique pour le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; et pour cela il suffit de montrer &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement }}qu'un rayon incident &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, de point d'incidence &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;, repéré par l'angle &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; que fait le rayon incident avec &lt;math&gt;\;\overrightarrow{CI}(\omega)\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\; \cancel{\ll}\; 1\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Voir schéma ci-dessus.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement qu'un rayon incident &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\parallel}\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, }}donne un réfléchi qui recoupe l'axe optique principal en &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt; dépendant effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; d'où &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement }}l'absence de stigmatisme rigoureux du miroir pour &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}l'angle d'incidence étant &lt;math&gt;\;i = -\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet les angles sont alternes-internes, leurs mesures ont donc mêmes valeurs absolues mais &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; sur le schéma alors que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, l'angle de réflexion est donc &lt;math&gt;\;i' = -i = \omega\;&lt;/math&gt; d'après la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; ; on en déduit alors «&lt;math&gt;\;\widehat{\left\lbrace\overrightarrow{H(\omega)S}, \overrightarrow{F_i(\omega)I(\omega)}\right\rbrace} = 2\; \omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; En effet l'angle que fait &lt;math&gt;\;\left[ F_i(\omega)I(\omega) \right]\;&lt;/math&gt; avec la partie incidente de l'axe optique principal et celui que fait le rayon réfléchi en &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt; avec la &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt; à la partie réfléchie à l'axe optique principal sont alternes-internes, la mesure de la valeur absolue du 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; étant &lt;math&gt;\;\vert i \vert + \vert i' \vert = 2\;\vert \omega \vert\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la mesure de &lt;math&gt;\;\widehat{\left\lbrace\overrightarrow{H(\omega)S}, \overrightarrow{F_i(\omega)I(\omega)}\right\rbrace}\;&lt;/math&gt; sachant qu'il est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; sur le schéma tout comme &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; se détermine par &lt;math&gt;\;\tan(2\;\omega) = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Toutes les grandeurs étant positives sur le schéma.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}\, \cos(2\; \omega)}{\sin(2\; \omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \overline{H(\omega)I(\omega)} = CI(\omega)\; \sin(\omega) = R\; \sin(\omega)\\ \sin(2\; \omega) = 2\; \sin(\omega)\; \cos(\omega)\end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; et simplification par &lt;math&gt;\;\sin(\omega)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|18}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; se détermine par &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\tan(2\;\omega) = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}}\;&lt;/math&gt;{{,}} &lt;math&gt;\color{transparent}{\Rightarrow}&lt;/math&gt; }}«&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{R\, \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}on peut alors évaluer «&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = \overline{CH(\omega)}_{\rightarrow} - \overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, expression dans laquelle &lt;math&gt;\;\overline{CH(\omega)}_{\rightarrow} = R\; \cos(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; d'où «&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = R\; \cos(\omega) - \dfrac{R\, \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)} = R\; \dfrac{2\; \cos^2(\omega)- \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, sachant que &lt;math&gt;\;\cos(2\; \omega) = 2\; \cos^2(\omega) - 1&lt;/math&gt;, l'expression finale &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{R}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; L'expression simple du résultat indique qu'il doit y avoir une méthode plus rapide pour sa détermination ; en effet les angles non algébrisés &lt;math&gt;\;\widehat{SCI(\omega)}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\widehat{CI(\omega)F_i(\omega)}\;&lt;/math&gt; étant égaux &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\big)&lt;/math&gt;, le triangle &lt;math&gt;\;F_i(\omega)CI(\omega)\;&lt;/math&gt; est isocèle &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la hauteur issue de &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; est aussi médiatrice d'où, en notant &lt;math&gt;\;K(\omega)\;&lt;/math&gt; son pied, &lt;math&gt;\;CK(\omega) = \dfrac{CI(\omega)}{2} = \dfrac{R}{2}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\dfrac{CK(\omega)}{\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow}} = \cos(\omega)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{CK(\omega)}{\cos(\omega)} = \dfrac{R}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt; ce qui est indéniablement plus rapide.&lt;/ref&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\Downarrow&lt;/math&gt;  &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; dépend effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;br&gt;le miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; n'est pas stigmatique rigoureux pour le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; de l'axe optique principal &lt;ref&gt; La démonstration de l'absence de stigmatisme rigoureux d'un miroir sphérique concave pour n'importe quel point objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;autre que le centre et le sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal pourrait être faite en suivant une démarche analogue.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Aplanétisme approché d'un miroir sphérique sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On considère le miroir sphérique concave introduit à la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss]] » plus haut dans cet exercice et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|On considère }}un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Définition_d'un_objet_linéique_transverse|définition d'un objet linéique transverse]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;support axe optique principal&quot;&gt; Ce qui signifie que l'axe optique principal a pour support &lt;math&gt;\;(A_oC)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché du miroir &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; C.-à-d. que, pour un point quelconque &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, avec la définition de l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;cet axe jouant le rôle d'axe optique principal pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est qualifié de secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\big)&lt;/math&gt;, les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; doivent être paraxiaux &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;peu inclinés relativement à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; et à point d'incidence restant proche du sommet secondaire &lt;math&gt;\;S_{M_o}&lt;/math&gt;, intersection de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; avec le miroir&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; 

{{Al|15}}{{Transparent|On considère un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o \neq C}\;&lt;/math&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché }}l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; admet une image « nette » &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;Nette&quot;&gt; L'image est qualifiée de « nette » car tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; ont une image ponctuelle &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; mais a priori &lt;ref&gt; C.-à-d. hors conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché, voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; &lt;br&gt;{{Al|20}}{{Transparent|On considère un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o \neq C}\;&lt;/math&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; admet une image }}ni « linéique » &lt;ref name=&quot;Linéique&quot;&gt; Linéique signifiant « rectiligne ».&lt;/ref&gt; ni « transverse ».

{{Al|5}}On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; est, quand l'objet n'est pas proche du miroir, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} S\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; est, }}quand l'objet est proche du miroir, vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq S\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; est, }}ces deux exigences constituant les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; quelconque &lt;ref&gt; C'est cette façon qui a été vue en cours, &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant en effet le point de l'axe optique principal appartenant à la face d'entrée du miroir dans le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarque&lt;/u&gt; : Il existe deux exigences équivalentes pour définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; d'un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; quelconque &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;façon plus simple&quot;&gt; C'est cette façon que nous adopterons car elle conduit à une démonstration plus rapide de l'aplanétisme.&lt;/ref&gt; :
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Remarque : }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;si un objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir, il doit être vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)\;&lt;/math&gt; et 
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Remarque : }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;si un objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, il doit être vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq C\big)&lt;/math&gt;. 

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un miroir sphérique concave pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du miroir et vu de ce centre sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; étant d'abord supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|nous considérons }}l'angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, n'étant pas nécessairement petit, &lt;br&gt;{{Al|5}}la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet est rendue plus aisée si on utilise la « relation de conjugaison de position &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|la question plus bas dans cet exercice]] » &lt;ref name=&quot;méthode moins aisée&quot;&gt; Il est possible de se contenter de la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; mais la méthode est alors moins aisée.&lt;/ref&gt; à savoir «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = -V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la vergence précédemment introduite ;

{{Al|5}}la démarche peut alors être décomposée en les étapes suivantes :
* montrer qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre)&quot;&gt; Voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre)]] » plus bas dans cet exercice.&lt;/ref&gt;, montrer alors que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt;, }}vérifier que l'angle au centre associé est encore &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* conclure qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; peut être confondue avec un segment &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal c.-à-d. qu'elle est linéique transverse &lt;ref&gt; Il y a donc aplanétisme approché du miroir sphérique pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du miroir à condition qu'il soit vu de ce centre sous un petit angle.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; étant supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq}\; C\big)&lt;/math&gt;, avec l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* le caractère transverse de l'objet linéique &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la longueur &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; est plus grande que la longueur &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition des côtés triangle rectangle&quot;&gt; &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; étant l'hypoténuse du triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; rectangle en &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt; le côté adjacent à l'angle de mesure &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit plus précisément «&lt;math&gt;\;[CA_o] = [CB_o]\, \cos(\alpha) \simeq [CB_o] \left( 1 - \dfrac{\alpha^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; ou finalement «&lt;math&gt;\;[CA_o] \simeq [CB_o]\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;» prouvant, qu'à cet ordre, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ayant une abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;axe optique secondaire&quot;&gt; Cet axe optique secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en fait un axe optique principal relativement au point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, l'application de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre)&quot; /&gt; donne donc des points image &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; à abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)&lt;/math&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est assimilable, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, à un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;,
* l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant petit, on peut faire l'opération inverse de celle faite précédemment pour l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, c.-à-d. assimiler l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; à un segment choisi &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal de support &lt;math&gt;\,(CA_i)\,&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;justification choix&quot;&gt; Il s'agit effectivement d'un choix car le segment aurait pu être choisi &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à n'importe quel axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, linéique transverse ; &lt;center&gt;nous avons donc établi l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du miroir sphérique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique de pied non proche du centre du miroir&lt;/u&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un miroir sphérique concave pour un objet linéique transverse de pied proche du centre du miroir et vu du sommet de ce dernier sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; étant maintenant supposé proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}\;&lt;/math&gt; }}nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|5}}la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite l'utilisation de deux rayons paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;, point objet quelconque de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;paraxial - bis&quot;&gt; Le caractère paraxial étant indispensable pour satisfaire au stigmatisme approché du miroir pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, tous les rayons non paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; seront arrêtés par un diaphragme centré sur &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie aisément que les rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; sont deux candidats respectant la paraxialité, par contre le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oC\;&lt;/math&gt; pouvant ne pas l'être car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;et si tel était le cas il serait alors arrêté par le diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt;, nous ne l'utiliserons pas.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite }}de montrer que le point image &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;, défini comme l'intersection des deux rayons réfléchis, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite de montrer que le point image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{M_i}&lt;/math&gt;, }}a pour projeté, sur l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, pour cela :
* déterminer l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; en fonction de la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|déterminer l'abscisse image de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i}\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_i}\;&lt;/math&gt; en fonction }}de l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;,
* déterminer la longueur algébrique &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx et Sy&quot;&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal, orienté dans le sens incident et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant porté par la représentation symbolique du miroir orienté vers le haut, l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant lui aussi orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer l'équation des rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot;&gt; L'abscisse de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est évidemment celle de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et son ordonnée sera notée &lt;math&gt;\;\varepsilon \times\;&lt;/math&gt; l'ordonnée de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\varepsilon\;&lt;/math&gt; variant entre &lt;math&gt;\;0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;1&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}ici intervient une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; condition de Gauss d'aplanétisme approché &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; qui assure que le point &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est suffisamment proche de l'axe optique principal pour que deux rayons incidents judicieusement choisis travaillent dans les conditions de stigmatisme approché.&lt;/ref&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx' et Sy&quot;&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx'}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal, orienté dans le sens réfléchi &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;donc de sens contraire à celui de l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\big)\;&lt;/math&gt; et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant le même que précédemment à savoir porté par la représentation symbolique du miroir et orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer les équations des rayons réfléchis, puis leur intersection &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt; ;
* vérifier que l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal est égale à l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, 
* conclure à l'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied proche du centre du miroir.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - aplanétisme.jpg|thumb|560px|Schéma positionnant un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied proche du centre d'un miroir sphérique concave pour démontrer l'aplanétisme approché du miroir pour cet objet]]
{{Al|5}}Soit &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique concave &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; de ce dernier sous un angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; correspondant à la condition de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché  &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; précitée ; 
# on détermine d'abord l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, image du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, par utilisation de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet)&quot;&gt; Voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conclusion_:_stigmatisme_approché_du_miroir_sphérique_(concave)_pour_le_point_objet_Ao_et_relation_de_conjugaison_(approchée)_de_position_de_Descartes_(avec_origine_au_sommet)|conclusion : stigmatisme approché du miroir sphérique (concave) pour le point objet A&lt;sub&gt;0&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet)]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; de vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant la distance focale image du miroir d'où : &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{1}{f_i} \Rightarrow \dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + \dfrac{1}{f_i} = \dfrac{f_i + p_o}{p_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# «&lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt;» et «&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt;» avec «&lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; non algébrisé &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt;», on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\beta) =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{p_o}\;&lt;/math&gt; d'où, avec &lt;math&gt;\;\tan(\beta) \simeq \beta\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt;, &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} \simeq -\beta\; p_o\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx et Sy&quot; /&gt;, le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = \varepsilon\, \overline{A_oB_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_S}{x_{M_o} - x_S} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o} = -\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_S = -\varepsilon\, \beta \left( x - x_S \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;vérification signes&quot;&gt; On vérifie sur le schéma que, lorsque &lt;math&gt;\;x\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;y\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt; et passant par le foyer principal objet du miroir sphérique &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{F_o} = f_o = -f_i\, , \, y_{F_o} = 0)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_{F_o}}{x_{M_o} - x_{F_o}} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_{F_o} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left( x - x_{F_o} \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left( x + f_i \right)\;&lt;/math&gt;» 
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx' et Sy&quot; /&gt; le rayon réfléchi sur le miroir du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; étant de direction symétrique de celle de ce dernier relativement à l'axe optique principal est de même pente &lt;math&gt;\;-\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi a une pente opposée à celle du rayon incident dans le repère &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; mais, quand on passe dans le repère &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; correspondant à une inversion du sens de l'axe des abscisses sans que celui de l'axe des ordonnées ne soit changé, la pente doit être multipliée par un facteur &lt;math&gt;\;(-1)\;&lt;/math&gt; d'où le rayon réfléchi a une pente identique à celle du rayon incident &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison étant que les pentes sont définies dans deux repères différents&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; d'où l'équation du rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x'\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;vérification signes bis&quot;&gt; On vérifie bien sur le schéma que, lorsque &lt;math&gt;\;x\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;y\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}le rayon réfléchi sur le miroir du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; étant, à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur le miroir, &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, son équation nécessite de déterminer au préalable l'ordonnée de &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;x_{I} = 0\;&lt;/math&gt; dans l'équation du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; établie plus haut soit &lt;math&gt;\;y(I) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left[ x(I) + f_i \right] = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt; d'où l'équation du rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ; &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfléchis a pour abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i} = -\varepsilon\, \beta\, {x'}_{\!M_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;{x'}_{\!M_i} = \dfrac{p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# l'abscisse «&lt;math&gt;\;{x'}_{\!M_i} = \dfrac{p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» de l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfléchis est identique à l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» du point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; ;
# le projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal se superposant à &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, on conclut à l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du miroir sphérique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de pied proche du centre du miroir&lt;/u&gt;.}}

==== Relation de conjugaison (approchée) de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) ====

[[File:Miroir sphérique - symbole.jpg|thumb|550px|Représentation symbolique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;sans les foyers&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à gauche&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et d'un miroir sphérique convexe &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à droite&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;]]
{{Al|5}}Dès lors qu'un miroir sphérique est utilisée sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme et d'aplanétisme approchés &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt;, l'usage est de représenter ce miroir sous une forme symbolique dans laquelle figurent 
* l'axe optique principal, 
* le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, 
* les foyers principaux objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;non représentés ci-contre &lt;ref name=&quot;Foyers à ajouter&quot;&gt; La position des foyers principaux sont à ajouter au milieu du segment &lt;math&gt;\;\left[ CS \right]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, 
* le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et 
* la partie de miroir &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal &lt;ref&gt; Cette partie de miroir &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal est terminée par des bords inclinés vers &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, ainsi un miroir concave à centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; réel a des bords inclinés vers la gauche &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. vers l'espace objet réel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et un miroir convexe à centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; virtuel a des bords inclinés vers la droite &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. vers l'espace objet virtuel&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, partie de miroir sur laquelle est rappelée l'algébrisation physique de l'axe optique principal.
{{clr}}
[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|400px|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; avec origine en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; pour un miroir sphérique concave]]
{{Al|5}}Sur le schéma ci-contre on a construit l'image linéique transverse &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\neq C\;&lt;/math&gt; en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;l'un passant que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir et qui se réfléchit sur lui-même &lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi doit être issu du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; du rayon incident et passer par l'image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; par le miroir c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même.&lt;/ref&gt;, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;l'autre passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir et qui se réfléchit en obéissant à la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;attention à l'utilisation de 2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion sur la représentation symbolique d'un miroir sphérique&quot;&gt; Attention le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir est le seul point d'incidence en lequel on peut appliquer la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes en travaillant sur la représentation symbolique du miroir car c'est le seul point pour lequel la direction de cette représentation symbolique se confond avec la direction réelle du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;autrement dit c'est le seul point où la normale réelle est &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à la représentation symbolique, par exemple le rayon incident &lt;math&gt;\;B_oC\;&lt;/math&gt; qui se confond avec la normale réelle du miroir en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; n'est pas &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à la représentation symbolique du miroir en &lt;math&gt;\;I\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}le point d'intersection de ces deux rayons réfléchis étant le point de convergence &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; de tous les rayons réfléchis correspondant à tous les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Car le miroir est stigmatique approché pour &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}il suffit de projeter orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal pour obtenir le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;miroir aplanétique approché pour AoBo&quot;&gt; Car le miroir est aplanétique approché pour &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}En comparant les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_oB_oS&lt;/math&gt;, déterminer le grandissement transverse par le miroir sphérique concave de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; défini par «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt;» en fonction des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\\ p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; 

{{Al|5}}la relation établie ci-dessus définit la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; pour tout objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot;&gt; Elle ne peut évidemment pas s'appliquer sous la forme indiquée pour &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; car elle correspondrait à une forme indéterminée mais&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie, dans la solution de la sous question suivante, qu'elle s'applique sous cette forme pour &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt;, elle caractérise quantitativement la propriété d'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Bien que démontrée sur un miroir sphérique concave elle reste applicable à un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Ayant exposé la construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; dans l'énoncé de la question &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;pour rappel on positionne &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondant à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit sur lui-même et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;attention à l'utilisation de 2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion sur la représentation symbolique d'un miroir sphérique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Il est déconseillé de choisir ce rayon dans les constructions futures demandées car peu pratique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'angle &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; devant être mesuré et reporté symétriquement par rapport à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; ici nous le choisissons car il est utilisé dans la démonstration qui suit.&lt;/ref&gt;, puis on projette orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal pour obtenir &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;miroir aplanétique approché pour AoBo&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big\}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt;», on le détermine en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(-i)\;&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* «&lt;math&gt;\;\tan(i) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\Bigg[&lt;/math&gt;comme &lt;math&gt;\;\vert i \vert\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(i) \simeq i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i \simeq \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;&lt;math&gt;\Bigg]&lt;/math&gt;,
* «&lt;math&gt;\;\tan(-i) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;(-i)\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq S\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iS&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\Bigg[&lt;/math&gt;comme &lt;math&gt;\;\vert i \vert\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(-i) \simeq -i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;-i \simeq -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;i \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;&lt;math&gt;\Bigg]&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant les deux expressions de &lt;math&gt;\;i&lt;/math&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; d'où «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} \simeq \dfrac{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de Descartes&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;&lt;u&gt;avec origine au sommet&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq S\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\\ p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = f_i&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant &lt;math&gt;\;G_t(A_{o,\,\infty}) = 0\;&lt;/math&gt;,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;p_o = f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant &lt;math&gt;\;G_t(F_o)\;&lt;/math&gt; infini.}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Le miroir sphérique n'est stigmatique rigoureux que pour le pied &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique, pour tous les autres points objet constituant ce dernier on suppose le stigmatisme approché du miroir c.-à-d. l'utilisation de rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\; (\neq C)\; \in A_oB_o\;&lt;/math&gt; paraxiaux &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ce qui peut être réalisé en pratique avec un diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; collé contre le miroir&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Considérant }}la condition d'aplanétisme approché du miroir pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* vérifier, par construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i&lt;/math&gt;, qu'elle est symétrique de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal et 
* comparer au résultat donné par l'application de la relation de conjugaison de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; sous question précédente pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt; en considérant &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;. 
{{Al|5}}Considérant maintenant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; L'objet, collé contre le miroir sphérique, de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;, l'axe optique principal ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, ne peut être rigoureusement linéique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. rectiligne&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; car il suit la courbure du miroir mais, s'il est vu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un petit angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, on peut confondre l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le segment correspondant lui étant tangent à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, raison pour laquelle l'objet est qualifié de « linéique transverse » ; &lt;br&gt;{{Al|3}}le miroir sphérique est stigmatique rigoureux pour tous les points de l'objet linéique car tous ces points, étant sur le miroir, jouent le rôle de sommet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;secondaire&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; pour lequel le miroir est stigmatique rigoureux.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Considérant }}la condition d'aplanétisme approché du miroir pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\alpha \ll 1\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Qui est aussi la condition pour que l'objet collé sur le miroir puisse être considéré comme linéique.&lt;/ref&gt;, 
* vérifier que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, le caractère linéique transverse de l'objet entraînant celui de l'image et 
* en déduire la valeur du grandissement transverse &lt;math&gt;\;G_t(S)\;&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - grandissement transverse au centre.jpg|thumb|400px|Construction de l'image d'un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied au centre d'un miroir sphérique concave]]
{{Al|5}}Le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique concave ci-contre en étant un point double conjugué rigoureux, un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;CB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; a pour image, par le miroir, une image de pied &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, de plus, comme le miroir sphérique est aplanétique approché pour tout objet de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, l'image de &lt;math&gt;\;CB_o&lt;/math&gt;, notée &lt;math&gt;\;CB_i&lt;/math&gt;, est linéique transverse ; &lt;br&gt;{{Al|5}}pour obtenir cette dernière il suffit de choisir pour rayon incident issu de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|pour obtenir cette dernière il suffit de choisir }}le rayon passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal et recoupe le plan transverse passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; au point &lt;math&gt;\;B_i&lt;/math&gt;, symétrique de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal d'où &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{CB_i} = -\overline{CB_o}\;&lt;/math&gt;» et par suite &lt;br&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(C) = -1\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'application de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou relation de conjugaison de grandissement transverse&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; sous question précédente pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt; nous conduit, en considérant &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;, à «&lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{\overline{SC}_{\leftarrow}}{\overline{SC}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, soit, avec &lt;math&gt;\;\overline{SC}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(C) = -1\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Le centre est le seul point de l'espace objet d'un miroir sphérique en lequel un objet linéique transverse positionné en ce point admet une image linéique transverse inversée de même taille.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;
{{clr}}
{{Al|5}}Tous les points du miroir sphérique étant des points doubles de ce dernier &lt;ref&gt; Chaque point du miroir jouant le rôle de sommet pour l'axe optique principal passant par ce point, c'est effectivement un point double.&lt;/ref&gt;, un objet collé sur le miroir est donc sa propre image ; &lt;br&gt;{{Al|5}}dans la mesure où l'objet est de petite taille, on peut négliger sa courbure et le considérer comme linéique transverse, son image étant alors également linéique transverse ; &lt;center&gt;comme «&lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt;» on en déduit, par définition, &lt;br&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(S) = +1\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Le sommet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;et plus généralement tout point de la surface réfléchissante sphérique&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est le seul point de l'espace objet d'un miroir sphérique en lequel un objet linéique transverse positionné en ce point admet une image linéique transverse droite de même taille.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Construction de l'image par un miroir sphérique d'un objet linéique transverse ====

{{Al|5}}&lt;u&gt;Définitions préliminaires&lt;/u&gt; : On appelle plan focal objet le plan transverse passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}plan focal image le plan transverse passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle axe optique secondaire tout axe passant par le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; du miroir, il possède une partie incidence contenue dans l'espace objet réel se réfléchissant sur elle-même pour donner sa partie émergente contenue dans l'espace image réelle ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal objet et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal image.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés&lt;/u&gt; : Justifier les propriétés des foyers secondaires objet et image associés à un  axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; :
# le foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour image le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\big]&lt;/math&gt;,
# le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés des foyers secondaires associés à un axe optique secondaire&lt;/u&gt; :
# propriété du foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; contenu dans le plan focal objet et de pied &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, objet noté &lt;math&gt;\;F_o\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ayant pour image le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et l'image étant linéique transverse, le point &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; a une image également située à l'infini sur la partie réfléchie de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; se réfléchit sur lui-même, les parties incidente et réfléchie constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit effectivement «&lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\;&lt;/math&gt;»
# propriété du foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet dont l'image associée est contenue dans le plan focal image et de pied &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, image notée &lt;math&gt;\;F_i\varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; ayant pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et le miroir étant aplanétique, le point &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; a un antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; également situé à l'infini sur la partie incidente de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi issu de &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; s'est réfléchi sur lui-même, les parties incidente et réfléchie constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit effectivement «&lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt;».&lt;/center&gt;}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; réel, de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; séparé du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave d'une distance supérieure au rayon non algébrisé du miroir, construire son image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; par le miroir de deux façons différentes :
# en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisis parmi les trois suivants : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;,
# en considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;un seul rayon incident suffit&quot;&gt; Un seul rayon incident suffit car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; appartenant à l'axe optique principal son image est sur cet axe.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;choisi parmi les deux suivants : passant par &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Refaire les constructions précédentes avec un miroir convexe.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - construction image.jpg|thumb|450px|Construction de l'image par un miroir sphérique concave d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt; : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal]]
{{Al|5}}&lt;math&gt;\;1.\;&lt;/math&gt;En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les trois suivants &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;voir schéma ci-contre à droite&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; : &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant sur lui-même, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; foyer principal objet et se réfléchissant parallèlement à l'axe optique principal, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal et se réfléchissant en passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{1.}\;&lt;/math&gt;En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{B_o}\;&lt;/math&gt; }}l'image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection des deux rayons réfléchis correspondant aux deux rayons incidents choisis, &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtient en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.
[[File:Miroir sphérique concave - construction image - bis.jpg|thumb|left|450px|Construction de l'image par un miroir sphérique concave d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant un des deux incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire]]
{{Al|5}}&lt;math&gt;\;2.\;&lt;/math&gt;En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les deux suivants &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;voir schéma ci-contre à gauche&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; : &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par un foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection du rayon incident et du plan focal objet&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant parallèlement à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c.-à-d., pour la partie incidente &lt;math&gt;\;C\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, la partie réfléchie se superposant à la partie incidente mais orientée en sens contraire&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire a priori quelconque &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant en passant par le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et du plan focal image&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{2.}\;&lt;/math&gt;En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}\;&lt;/math&gt; }}l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection d'un des rayons réfléchis correspondant au rayon incident choisi et de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; s'obtient comme intersection de l'axe optique secondaire passant par &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et du plan transverse passant par &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;.
{{clr}}
{{Al|5}}Ci-dessous les constructions refaites sur un miroir sphérique convexe, en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; à gauche, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Ci-dessous les constructions refaites sur un miroir sphérique convexe, }}en utilisant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et la notion de foyers secondaires objet ou image à droite :
&lt;center&gt;
&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;285px&gt;
Miroir sphérique convexe - construction image.jpg|Construction de l'image par un miroir sphérique convexe d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt; : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal
Miroir sphérique convexe - construction image - bis.jpg|Construction de l'image par un miroir sphérique convexe d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant un des deux incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) sous conditions de Gauss ===

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}On repère maintenant les points objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = -V\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes origine en C&quot;&gt; Cette relation est applicable à tout objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C&lt;/math&gt;, le cas &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt; conduisant à une forme indéterminée.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = -V\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; vergence du miroir.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (origine au centre) utilisent &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; ou un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe 
optique principal :
* l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} = \overline{SC}_{\rightarrow} + \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = \overline{R} + \pi_o\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} = \overline{SC}_{\leftarrow} + \overline{CA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = -\overline{R} + \pi_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{R}}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i - \overline{R}} - \dfrac{1}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{(\pi_o + \overline{R}) - (\pi_i - \overline{R})}{(\pi_i - \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R})} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot;&gt; Quand on a l'égalité entre deux fractions &lt;math&gt;\;\dfrac{a}{b} = \dfrac{c}{d}\;&lt;/math&gt; les grandeurs &lt;math&gt;\;(a\, ,\, d)\;&lt;/math&gt; sont appelées « extrêmes » et &lt;math&gt;\;(b\, ,\, c)\;&lt;/math&gt; « moyens », l'égalité des deux fractions étant équivalente à &lt;math&gt;\;a \; d = b \; c\;&lt;/math&gt; c.-à-d. à l'égalité du produit des extrêmes et celui des moyens (on parle encore de l'égalité des produits en croix).&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;-2\, (\pi_i - \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R}) = (\pi_o - \pi_i + 2\, \overline{R})\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;-2\, \pi_o\, \pi_i + 2\, \overline{R}\, \pi_o - 2\, \overline{R}\, \pi_i + 2\, \overline{R}^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\pi_o\, \overline{R} - \pi_i\, \overline{R} + 2\, \overline{R}^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;-2\, \pi_o\, \pi_i + \overline{R}\, \pi_o - \overline{R}\, \pi_i = 0\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\overline{R}\, \pi_o - \overline{R}\, \pi_i = 2\, \pi_o\, \pi_i\;&lt;/math&gt; et enfin, en divisant les deux membres de l'équation par &lt;math&gt;\;\pi_o\, \pi_i\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;C.N.&quot;&gt; Cela nécessite que &lt;math&gt;\;\pi_o \neq 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i \neq 0\;&lt;/math&gt; c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \neq C&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison en étant que l'on cherche à établir une équation faisant intervenir des inverses de longueur à partir d'une équation comportant des produits de deux longueurs&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = -V\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du miroir ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS}_{\rightarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS}_{\leftarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}} = -V&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; vergence du miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
}}

[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; avec origine en C pour un miroir sphérique concave]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre) &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes origine en C&quot; /&gt;. 

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement cette relation.

{{clr}}
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot;&gt; Applicable en tout point &lt;math&gt;\;A_o \neq S&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \pi_o + \overline{R} \\ p_i = \pi_i - \overline{R} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i - \overline{R}}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}\left( \dfrac{1}{\overline{R}} - \dfrac{1}{\pi_i} \right)}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} \left( \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_o} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître des inverses de longueur comme celles de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}} \Leftrightarrow \dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{1}{\pi_o} + \dfrac{1}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du miroir ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS}_{\rightarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS}_{\leftarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -(-1) = +1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit sur lui-même et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot;&gt; Les angles précités étant non algébrisés.&lt;/ref&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iC\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre&quot;&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i}) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_i}_{\leftarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre bis&quot;&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq C\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iC&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre)&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq C\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\pi_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = f_i + \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\pi_o = f_o - \overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Newton sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On repère maintenant le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique et le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du même miroir sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Newton de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\; \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\; \overline{F_oA_o}_{\rightarrow} = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\; \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot;&gt; Applicable pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}&lt;/math&gt;, ces cas conduisant à une forme indéterminée.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;\sigma_i \; \sigma_o = f_i\; f_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot;/&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; distances focales image et objet du miroir.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Newton utilisent &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal :
* l'abscisse objet de Newton du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} = \overline{SF_o}_{\rightarrow} + \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = f_o + \sigma_o = -f_i + \sigma_o\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} = \overline{SF_i}_{\leftarrow} + \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = f_i + \sigma_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Newton en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\sigma_i + f_i} - \dfrac{1}{\sigma_o - f_i} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{(\sigma_o - f_i) - (\sigma_i + f_i)}{(\sigma_i + f_i)\, (\sigma_o - f_i)} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;(\sigma_i + f_i)\, (\sigma_o - f_i)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;= (\sigma_o - \sigma_i - 2\, f_i)\, f_i\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i + f_i\, \sigma_o - f_i\, \sigma_i - f_i^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\sigma_o\, f_i - \sigma_i\, f_i - 2\, f_i^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = -f_i^2\;&lt;/math&gt; et enfin, sachant que &lt;math&gt;\;f_o = -f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On remplacera une seule fois &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;-f_o\;&lt;/math&gt; pour obtenir une forme symétrique de la relation.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le foyer principal objet du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt; en effet si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal et on obtient une forme indéterminée avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\infty\big)&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS}_{\rightarrow} = -f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS}_{\leftarrow} = -f_i\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i = -f_o = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt; distance focale image du miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\\ \sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse Newton.jpg|thumb|Schéma de démonstration des deux formes de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton pour un miroir sphérique concave]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton &lt;ref name=&quot;deux formes de grandissement transverse de Newton&quot;&gt; Cette relation a deux formes possibles suivant qu'elle est exprimée en fonction de l'abscisse objet de Newton et de la distance focale objet ou en fonction de l'abscisse image de Newton et de la distance focale image.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt;.

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement les deux formes de cette relation.

{{clr}}

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \sigma_o - f_i \\ p_i = \sigma_i + f_i \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\sigma_i + f_i}{\sigma_o - f_i} = \dfrac{\sigma_i \left( 1 + \dfrac{f_i}{\sigma_i} \right)}{(-f_i) \left( 1 - \dfrac{\sigma_o}{f_i} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître, au numérateur et au dénominateur, deux grandeurs égales découlant de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_i\, f_o = -f_i^2 \Leftrightarrow \dfrac{\sigma_i}{f_i} = -\dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;1 + \dfrac{\sigma_i}{f_i} = 1 - \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{\sigma_i}{f_o}&lt;/math&gt; ; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{\sigma_i}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot;&gt; Applicable en tout point objet ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que cette forme de relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS}_{\rightarrow} = -f_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;resp. &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS}_{\leftarrow} = -f_i\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = +1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}comme la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton s'écrivant &lt;math&gt;\;\sigma_i\, \sigma_o = f_i\, f_o\;&lt;/math&gt; est équivalente à &lt;math&gt;\;\dfrac{\sigma_i}{f_o} = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit aisément la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o} = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit parallèlement à l'axe optique principal et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; parallèle à l'axe optique principal qui se réfléchit en passant par &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;KF_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_iA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer bis&quot; &gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_i \neq F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas le point à l'infini de l'axe optique principal, pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS}) = \dfrac{\overline{SK}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SK}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SK} = \overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}} = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\sigma_i}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Al|5}}de même le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;HF_oS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_oA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer&quot;&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS}) = \dfrac{\overline{SH}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SH}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SH} = \overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS}) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}} = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\sigma_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = 0\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de Lagrange - Helmholtz sous conditions de Gauss ===

[[File:Miroir sphérique - grandissement angulaire.jpg|thumb|Schéma de détermination du grandissement angulaire en repérage de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine en S) pour un miroir sphérique concave]]

==== Expression de Descartes (avec origine au sommet) du grandissement angulaire d'un pinceau incident issu d'un point objet ====

{{Al|5}}On rappelle que le grandissement angulaire d'un pinceau lumineux incident issu d'un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;, de direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; avec la partie incidente de l'axe optique principal, le pinceau se réfléchissant sur le miroir en convergeant vers le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;, avec une direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; avec la partie réfléchie de l'axe optique principal, est défini selon &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles petits&quot;&gt; Les angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; sont de valeur absolue petite c.-à-d. &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ;

{{Al|5}}en utilisant le schéma ci-contre, établir l'expression du grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet), respectivement &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'expression du grandissement angulaire a été établie en utilisant un miroir sphérique concave mais elle reste applicable pour un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}On détermine le grandissement angulaire par évaluation de
&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;tous deux &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; sur la figure ci-dessus&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles &lt;math&gt;\;A_oIS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iIS\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;l'angle
&lt;math&gt;\;\widehat{SA_iI}\;&lt;/math&gt; étant égal à &lt;math&gt;\;\theta_i\big]&lt;/math&gt; soit :
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}&lt;/math&gt; ;
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{SI}}{p_i}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq
\dfrac{\overline{SI}}{p_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on en déduit &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{\dfrac{\overline{SI}}{p_i}}{-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{SI}&lt;/math&gt;, l'expression souhaitée du &lt;center&gt;grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Établissement de la relation de Lagrange - Helmholtz ====

{{Al|5}}Á l'aide des relations de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et de l'expression du grandissement angulaire dans le même repérage, vérifier la relation de Lagrange - Helmholtz &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;G_t(A_o)\; G_a(A_o) = -1\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Cette relation est différente de celle que l'on trouvera dans le chapitre suivant sur les lentilles minces, pour une lentille mince dans laquelle il n'y a aucune réflexion, la relation de Lagrange - Hemholtz sera &lt;math&gt;\;G_t(A_o)\; G_a(A_o) = +1&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Connaissant le grandissement transversal donné par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) \simeq \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; et l'expression du grandissement angulaire précédemment trouvée &lt;math&gt;\;G_a(A_o) \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;, on en déduit le lien entre grandissements angulaire et transversal indépendant de la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_a(A_o)\; G_t(A_o) \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}\; \dfrac{p_i}{p_o} = -1\;&lt;/math&gt; ce qui constitue la relation de Lagrange - Helmholtz cherchée &lt;ref&gt; Il s'agit de la même relation de Lagrange - Helmholtz que celle explicitée pour un miroir plan mais contrairement à cette dernière dans laquelle les grandissements transverse et angulaire valent respectivement &lt;math&gt;\;+1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;-1\;&lt;/math&gt; quelle que soit la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, dans un miroir sphérique les grandissements transverse et angulaire dépendent explicitement de la position de l'objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, plus la valeur absolue du grandissement transverse est grande plus celle du grandissement angulaire est petite.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

== Stigmatisme et aplanétisme approchés d'un dioptre sphérique sous conditions de Gauss ==

{{Al|5}}Pour être défini, un dioptre sphérique nécessite la connaissance de :
* sa nature « concave » ou « convexe », 
* son centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; (centre de courbure de la surface sphérique dioptrique &lt;ref&gt; Si le dioptre est « concave », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est réel, et si le dioptre est « convexe », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est virtuel.&lt;/ref&gt;),
* son rayon de courbure (non algébrisé) &lt;math&gt;\;R\;&lt;/math&gt; (rayon de courbure de la surface sphérique dioptrique),
* l'axe optique principal dont la partie incidente (ou son prolongement) passe par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; (point objet dont on étudiera l'image éventuelle),
* son sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; (intersection de l'axe optique principal et de la surface dioptrique) et
* l'indice de l'espace objet réel &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; ainsi que celui de l'espace image réelle &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Nous adoptons l'algébrisation physique de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;orientation axe opt. princ. dioptre&quot;&gt; Supposant l'axe optique principal horizontal, l'espace objet réel étant situé à gauche du dioptre, la partie incidente de l'axe optique principal est orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\rightarrow&lt;/math&gt; et l'espace image réelle étant alors situé à droite du dioptre, la partie émergente est orientée dans le même sens &lt;math&gt;\;\rightarrow&lt;/math&gt; ; il est donc inutile de préciser en indice le sens de l'orientation de l'axe optique principal contrairement à ce qui doit être fait dans le cas d'un miroir sphérique.&lt;/ref&gt; et, pour unifier l'étude des dioptres sphériques, algébrisons le rayon de courbure du dioptre selon &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;orientation axe opt. princ. dioptre&quot; /&gt; avec pour conséquence la nature « concave » ou « convexe » du dioptre caractérisé par le signe du rayon de courbure algébrisé :
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à droite de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est un point de l'espace objet virtuel, correspondant à un dioptre « convexe »,
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à gauche de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est un point de l'espace objet réel, correspondant à un dioptre « concave ».

&lt;center&gt; 
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave verre - air.jpg|Justification du caractère convergent d'un dioptre sphérique concave faisant passer d'un milieu plus réfringent vers un milieu moins réfringent
Dioptre sphérique concave air - verre.jpg|Justification du caractère divergent d'un dioptre sphérique concave faisant passer d'un milieu moins réfringent vers un milieu plus réfringent
Dioptre sphérique convexe verre - air.jpg|Justification du caractère divergent d'un dioptre sphérique convexe faisant passer d'un milieu plus réfringent vers un milieu moins réfringent
Dioptre sphérique convexe air - verre.jpg|Justification du caractère convergent d'un dioptre sphérique convexe faisant passer d'un milieu moins réfringent vers un milieu plus réfringent
&lt;/gallery&gt;
Dans la suite nous supposerons le dioptre sphérique concave faisant passer d'un espace plus réfringent à un espace moins réfringent &lt;ref&gt; En précisant la modification des résultats pour un dioptre sphérique des trois autres types.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;admettrons qu'il n'y a pas stigmatisme rigoureux du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points objet autres que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et tous les points du dioptre &lt;ref name=&quot;Définition sommet dioptre&quot;&gt; Si le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est sur le dioptre, l'axe optique principal associé à ce point objet ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; joue le rôle de sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir ; ainsi, dans la mesure où l'axe optique principal n'a pas été préalablement défini, tout point du dioptre peut être considéré comme un sommet.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;
=== Démonstration du stigmatisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent sous conditions de Gauss ===

[[File:Dioptre sphérique concave convergent - stigmatisme approché.jpg|thumb|Schéma d'un dioptre sphérique concave convergent dans le but d'établir le stigmatisme approché du dioptre &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tout point objet autre que C et S]]

{{Al|5}}Considérant un point objet réel &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et l'axe optique principal correspondant de support &lt;math&gt;\;(A_oC)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Dès lors que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\neq C&lt;/math&gt;, l'axe optique principal est parfaitement défini ainsi que le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui est l'intersection de l'axe optique principal et du dioptre.&lt;/ref&gt;, nous envisageons des rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, peu inclinés par rapport à l'axe optique principal, d'angle d'inclinaison &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et dont le point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; reste proche du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; c.-à-d. tel que l'angle que fait la normale au dioptre en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal &lt;math&gt;\;\widehat{(\overrightarrow{CS}\, ;\, \vec{N})} = \omega\;&lt;/math&gt; soit petit en valeur absolue &lt;math&gt;\;\big(|\omega| \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;paraxial&quot; /&gt;.

{{Al|5}}Le rayon incident &lt;math&gt;\;A_oI\;&lt;/math&gt; donnant, par utilisation des lois de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Deuxième_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réfraction|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réfraction]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;, le rayon émergent &lt;math&gt;\;IA_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(A_i \in&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, appelons &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; l'angle d'inclinaison du rayon réfracté par rapport à l'axe optique principal ; nous nous proposons de démontrer que &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est indépendant du rayon incident considéré &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. indépendant de &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;\omega\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big(\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;|\omega| \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; sont réalisées.

==== Établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt;, ω, n&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et n&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; ====

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC\;&lt;/math&gt; établir une première relation entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_o\;\big(&lt;/math&gt;angle d'incidence du rayon incident en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC\;&lt;/math&gt; établir une deuxième relation entre &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_i\;\big(&lt;/math&gt;angle de réfraction du rayon émergent en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; et les deux relations précédentes, déduire la relation suivante entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i\;&lt;/math&gt; : &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{n_o\; \theta_o - n_i\; \theta_i}{n_o - n_i}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega = \theta_o + (-i_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt; &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; sont positifs mais &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; étant négatif, sa valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i_o)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et  
&lt;br&gt;{{Al|5}}dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;-i_i = \omega - \theta_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt; &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; est positif mais &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; et et &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt;  étant négatifs, leur valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i_i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;(-\theta_i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ou, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}en utilisation la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; pour la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; et, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle d'incidence (et donc aussi de l'angle de réfraction en valeur absolue) &lt;math&gt;\;n_o\, i_0 = n_i\, i_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;i_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, i_o&lt;/math&gt;, la relation ci-dessus se réécrit &lt;math&gt;\; -\dfrac{n_o}{n_i}\, i_o = \omega - \theta_i&lt;/math&gt; ;
&lt;br&gt;{{Al|5}}on élimine alors &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; entre ces deux relations en formant la C.L. &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\; (\mathfrak{1}) + (\mathfrak{2})\;&lt;/math&gt; soit : &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\; \omega = \dfrac{n_o}{n_i}\; \theta_o + \omega - \theta_i\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;n_o\,\omega = n_o\, \theta_o + n_i\, \omega - n_i\, \theta_i\;&lt;/math&gt; soit enfin, la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a}) \qquad \omega = \dfrac{n_o\, \theta_o - n_i\, \theta_i}{n_o - n_i}&lt;/math&gt;.}}

==== Évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H ====

{{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, montrer que le rayon réfracté est aussi peu incliné relativement à l'axe optique principal c.-à-d. &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;.

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;,
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\omega)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HC}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# déduire des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;, un lien entre &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\theta_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, \theta_o - \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, \omega\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;|\theta_i| \leqslant \dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega|\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}|\theta_o| \ll 1\\ |\omega| \ll 1 \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; dont on déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;|\theta_i| \leqslant \dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; c.-à-d. que le rayon réfracté est aussi peu incliné relativement à l'axe optique principal.
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HA_o}}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_o &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) \simeq \theta_o\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}}&lt;/math&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) &lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) \simeq \theta_i\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}}&lt;/math&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\omega) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HC}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\omega &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\omega) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\omega) \simeq \omega\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\omega \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HC}}&lt;/math&gt; ;
# des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;(n_o - n_i)\, \omega = n_o\,\theta_o - n_i\, \theta_i&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)\, \overline{HI}}{\overline{HC}} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{n_i\, \overline{HI}}{\overline{HA_i}} - \dfrac{n_o\, \overline{HI}}{\overline{HA_o}}\;&lt;/math&gt; ou, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{HI}&lt;/math&gt;, on obtient la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\qquad \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{HC}} = \dfrac{n_i}{\overline{HA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{HA_o}}&lt;/math&gt;.}}

==== Établissement de la confusion de H et de S à l'ordre un en ω ====

{{Al|5}}Établir que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; peut être confondu avec le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;H et S confondus&quot; /&gt; et

{{Al|5}}réécrire que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; en tenant compte de cette confusion.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Montrons que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;ω infiniment petit d'ordre un&quot; /&gt;, en évaluant &lt;math&gt;\;[CH]\;&lt;/math&gt; puis &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH]\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, on obtient : &lt;math&gt;\;[CH] = [CI]\, \cos(\omega) = R\, \cos(\omega) \simeq R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;revoir la remarque du paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable_au_voisinage_d'une_de_ses_valeurs#D.C3.A9veloppements_limit.C3.A9s_.C3.A0_l.27ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « Outils mathématiques pour la physique (PCSI) »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH] \simeq R - R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, soit encore &lt;math&gt;\;[HS] \simeq R \dfrac{\omega^2}{2}\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; ou finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;[HS] \simeq 0\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}remplaçant &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; dans la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})&lt;/math&gt;, on peut, sous les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, la réécrire selon &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\; \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{SC}} = \dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Sous cette forme la relation nécessite que le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; sommet du dioptre.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Conclusion : stigmatisme approché du dioptre sphérique (concave convergent) pour le point objet A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; définit, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, un point image unique &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; et en déduire le stigmatisme approché du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot;&gt; Nous admettrons que cette relation (ou propriété) établie dans le cas d'un dioptre sphérique concave convergent est encore applicable, sans modification, à un dioptre sphérique concave divergent ou à un dioptre sphérique convexe convergent ou divergent.&lt;/ref&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante appelée « vergence » du dioptre sphérique exprimée en dioptries &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;de symbole &lt;math&gt;\;\delta\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les abscisses le sont en &lt;math&gt;\;m\;\big(&lt;/math&gt;la dioptrie étant liée au mètre par &lt;math&gt;\;1\, \delta = 1\,m^{-1}\big)&lt;/math&gt;, exprimer &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Pour le repérage de Descartes dans un dioptre sphérique concave ou convexe, convergent ou divergent, il y a deux origines utilisées : l'origine au sommet qui est la plus fréquemment utilisée et l'origine au centre qui l'est beaucoup moins.&lt;/ref&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; }}celle du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}la relation de conjugaison (approchée) de position [ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée)] de Descartes d'un dioptre sphérique se réécrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; puisque, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; fixé, le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est déterminé de façon unique &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;indépendamment des variations des petits angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; peut effectivement être écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}} = V\;&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante définissant la vergence du dioptre sphérique selon &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{SC}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}\;&lt;/math&gt; rayon algébrisé du dioptre.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Avec les abscisses de Descartes (avec origine au sommet) du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, la relation de conjugaison (approchée) de position [ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée)] de Descartes du dioptre sphérique se réécrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Points pour lesquels la conjugaison du dioptre sphérique est rigoureuse et points doubles ===

{{Al|5}}Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot; /&gt; du dioptre sont des points
* pour lesquels le dioptre est stigmatique rigoureux et
* dont l'image est confondue avec l'objet (c.-à-d. que ce sont des points doubles).
{{Al|5}}Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) est applicable à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du dioptre, bien que la conjugaison soit rigoureuse ;

{{Al|5}}vérifier, en utilisant cette relation, que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double.

{{Al|5}}Admettant que la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) reste applicable à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, sommet du dioptre, pour lequel il y a conjugaison rigoureuse &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;mais évidemment pas sous cette forme qui est indéterminée quand on l'applique à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, son abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; y étant nulle&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, évaluer &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; et vérifier, sur cette dernière forme, 
* que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double et
* qu'il n'y a pas d'autres points doubles que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;. 

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - points doubles.jpg|thumb|Schémas de vérification du fait que, pour C et S, le dioptre sphérique (concave convergent) est stigmatique rigoureux et que ce sont des points doubles]]
{{Al|5}}Voir ci-contre les constructions prouvant les propriétés particulières d'un point objet en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot;/&gt; : 
* à gauche tout rayon d'un faisceau incident issu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent étant normal au dioptre poursuit son chemin sans changer de direction, donnant un ensemble de rayons transmis divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, c.-à-d. prouvant que le dioptre sphérique est stigmatique rigoureux pour son centre ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double ;
* à droite tout rayon d'un faisceau incident convergeant sur le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent se réfractant à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même &lt;ref&gt; En suivant une direction plus rapprochée de l'axe optique principal que ne l'est celle du rayon incident.&lt;/ref&gt; et l'ensemble des rayons réfractés divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, cela prouve le stigmatisme rigoureux du dioptre sphérique pour son sommet &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double.
{{Al|5}}Pour appliquer la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du dioptre, bien que la conjugaison soit rigoureuse, il suffit de ne considérer que les rayons paraxiaux du faisceau incident issu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et d'ouverture quelconque &lt;ref&gt; Le fait que les autres rayons divergent également à partir de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ne modifient en rien la divergence des rayons transmis provenant de rayons incidents paraxiaux.&lt;/ref&gt;, condition d'applicabilité de la relation de conjugaison de position de Descartes ;

{{Al|5}}dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;C_i&lt;/math&gt;, d'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}&lt;/math&gt;, l'image du point objet &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(C) = \overline{SC} = \overline{R}&lt;/math&gt;, nous obtenons, en remplaçant &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt;,  &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(C_i)} - \dfrac{n_o}{\overline{R}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(C_i)} = \dfrac{n_i}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{R} = \overline{SC}&lt;/math&gt; prouvant que &lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; se confond avec &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et par suite que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est un point double.

&lt;center&gt;De &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} = \dfrac{n_o}{p_o} + V = \dfrac{n_o + V\, p_o}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;p_i = n_i\, \dfrac{p_o}{n_o + V\, p_o}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt; 
{{Al|5}}sous cette forme on vérifie qu'un point objet en &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(S) = 0\;&lt;/math&gt; a une image d'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i = 0&lt;/math&gt;, c.-à-d. une image confondue avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; prouvant que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est bien un point double ;

{{Al|5}}les points doubles &lt;math&gt;\;A_d\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_d\;&lt;/math&gt; étant tels que leurs abscisses images de Descartes (avec origine au sommet) s'écrivant &lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \overline{SA_d} = p_d\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;p_i(A_d) = n_i\, \dfrac{p_d}{n_o + V\, p_d}\;&lt;/math&gt; obéissent à l'équation &lt;math&gt;\;p_d = n_i\, \dfrac{p_d}{n_o + V\, p_d}\;&lt;/math&gt; qui se décompose en &lt;math&gt;\;\left\lbrace\begin{array}{c}p_d = 0\;\;\; \text{ou}\\ n_o + V\, p_d = n_i\end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;, la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; solution donnant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; point double et la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; équation conduisant à &lt;math&gt;\;p_d = \dfrac{n_i - n_o}{V} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; point double ; &lt;center&gt;le centre et le sommet d'un dioptre sphérique sont donc les seuls points doubles de ce dernier.&lt;/center&gt;}}

=== Caractère focal d'un dioptre sphérique, position des foyers principaux objet et image, lien de la vergence et des distances focales objet et image, signe de la vergence ===

==== Caractère focal d'un dioptre sphérique, définition des foyers principaux objet et image, lien de la vergence avec les distances focales objet et image ====

{{Al|5}}Vérifier, sur la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes d'un dioptre sphérique, que ce dernier est nécessairement « focal » &lt;ref name=&quot;définition focal&quot; /&gt; puis déterminer
* la position du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point objet de l'axe optique principal ayant pour image le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;F_o\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; A_{i,\,\infty}\big]\;&lt;/math&gt; et
* la position du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point image de l'axe optique principal ayant pour antécédent &lt;ref name=&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; F_i\big]&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Définissant
* la distance focale objet comme l'abscisse objet de Descartes du foyer principal objet (avec origine au sommet) soit &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; et
* la distance focale image comme l'abscisse image de Descartes du foyer principal image (avec origine au sommet) soit &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt;,
{{Al|5}}déterminer le lien entre vergence &lt;math&gt;\;V&lt;/math&gt;, distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o&lt;/math&gt;, distance focale image &lt;math&gt;\;f_i&lt;/math&gt;, indice espace objet &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et indice espace image &lt;math&gt;\,n_i&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Un dioptre sphérique est un « système focal », en effet pour qu'il soit « afocal », il faudrait que le point à l'infini de l'axe optique principal soit un point double, mais ayant établi que les seuls points doubles du dioptre sphérique sont &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, et non le point à l'infini de l'axe optique principal on en déduit que le dioptre sphérique est bien un « système focal ».
* Le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(F_i) = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(A_{o,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{p_o(A_{o,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(F_i)} - 0 = V\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt;.
* Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(F_o) = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; étant l'antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;/&gt; du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(A_{i,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(A_{i,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;0 - \dfrac{n_o}{p_o(F_o)} = V\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt;.

&lt;center&gt;&lt;u&gt;Notion de distances focales objet et image&lt;/u&gt; :&lt;/center&gt;
* la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; étant définie par &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; est liée à la vergence par &lt;math&gt;\;f_i = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt; ;
* la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; étant définie par &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; est liée à la vergence par &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt; ; 
&lt;center&gt;on en déduit la relation &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Cette relation découle de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de position de Descartes du dioptre sphérique appliquée aux couples de points conjugués &lt;math&gt;\;(A_{o,\, \infty}\, , \,F_i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;(F_o\, , \,A_{i,\, \infty})&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Signe de la vergence suivant la nature concave ou convexe du dioptre sphérique et de l'indice de l'espace objet comparé à celui de l'espace image, caractère convergent ou divergent du dioptre et nature réelle ou virtuelle des foyers principaux ====

{{Al|5}}Déterminer le signe de la vergence suivant la nature « concave » ou « convexe » du dioptre sphérique et du signe de &lt;math&gt;\;n_o - n_i\;&lt;/math&gt; puis

{{Al|5}}son caractère « convergent » ou « divergent » sachant qu'un système focal à « vergence positive » (respectivement « négative ») est dit « convergent » (respectivement « divergent ») et enfin

{{Al|5}}la nature « réelle » ou « virtuelle » des foyers principaux.

{{Al|5}}Pour terminer, on précisera, dans chacun des quatre cas possibles, les positions absolues des foyers principaux objet et image relativement au centre et au sommet du dioptre considéré.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; on en déduit que la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est 
* de signe contraire au rayon de courbure algébrisé du dioptre si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\;\big(n_o &gt; n_i\big)&lt;/math&gt;, 
* de même signe que le rayon de courbure algébrisé du dioptre si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\;\big(n_o &lt; n_i\big)&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}on en déduit les quatre possibilités suivant la nature du dioptre sphérique et le signe de &lt;math&gt;\;n_o - n_i&lt;/math&gt; :
* un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; ayant un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;nature de C dioptre&quot;&gt; Correspondant au caractère réel (resp. virtuel) du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave (resp. convexe).&lt;/ref&gt;, a &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet eau, espace image air&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; » et &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet air, espace image eau&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; »,
* un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;nature de C dioptre&quot; /&gt;, a &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet eau, espace image air&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; » et &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet air, espace image eau&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; ».

{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit la nature (réelle ou virtuelle) des foyers principaux objet et image suivant la nature (convergente ou divergente) du dioptre sphérique :
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave convergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot;&gt; La lumière passant d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent on a &lt;math&gt;\;n_o &gt; n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave divergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot;&gt; La lumière passant d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent on a &lt;math&gt;\;n_o &lt; n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe divergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe convergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt;.
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : Les distances focales objet et image étant, dans les quatre cas possibles, de signe contraire, les foyers principaux objet et image sont situés de part et d'autre de la surface dioptrique dans chacun des cas ;

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}pour un dioptre sphérique pour lequel la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt;\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est situé à une distance &lt;math&gt;\;|f_o| = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; à une distance &lt;math&gt;\;|f_i| = \dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;|f_i| &lt; |f_o|\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est plus éloigné du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; que le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Avec, pour un dioptre concave, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet réel (c.-à-d. usuellement à gauche) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image réelle (c.-à-d. usuellement à droite),&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;small&gt;....&lt;/small&gt;Avec, &lt;/span&gt;pour un dioptre convexe, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet virtuel (c.-à-d. usuellement à droite) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image virtuelle (c.-à-d. usuellement à gauche).&lt;/ref&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}pour un dioptre sphérique pour lequel la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt;\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est situé à une distance &lt;math&gt;\;|f_o| = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; à une distance &lt;math&gt;\;|f_i| = \dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;|f_i| &gt; |f_o|\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est moins éloigné du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; que le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Avec, pour un dioptre concave, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet virtuel (c.-à-d. usuellement à droite) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image virtuelle (c.-à-d. usuellement à gauche),&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;small&gt;....&lt;/small&gt;Avec, &lt;/span&gt;pour un dioptre convexe, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet réel (c.-à-d. usuellement à gauche) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image réelle (c.-à-d. usuellement à droite).&lt;/ref&gt;.}}

=== Aplanétisme approché d'un dioptre sphérique sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}Soit le dioptre sphérique concave convergent introduit à la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; question et un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;support axe optique principal&quot; /&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché du dioptre &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; C.-à-d. que, pour un point quelconque &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, avec la définition de l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;cet axe jouant le rôle d'axe optique principal pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est qualifié de secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\big)&lt;/math&gt;, les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; doivent être paraxiaux &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;peu inclinés relativement à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; et à point d'incidence restant proche du sommet secondaire &lt;math&gt;\;S_{M_o}&lt;/math&gt;, intersection de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; avec le dioptre&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|5}}cette dernière condition entraîne que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; admet une image « nette » &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Nette&quot; /&gt; mais a priori cette image n'est &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; hors conditions de Gauss d'aplanétisme approché &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; ni « linéique » &lt;ref name=&quot;Linéique&quot; /&gt; ni « transverse » ;

{{Al|5}}Supposant que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est, 
* quand l'objet n'est pas proche du dioptre, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} S\big)\;&lt;/math&gt; et 
* quand l'objet est proche du dioptre, vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq S\big)&lt;/math&gt;, 

{{Al|5}}ces deux conditions sont une première façon de définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; pour un objet linéique transverse quelconque &lt;ref&gt; C'est cette façon qui a été vue en cours, &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant en effet le point de l'axe optique principal appartenant à la face d'entrée du dioptre.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}Il existe une deuxième façon équivalente de définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; pour un objet linéique transverse quelconque &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;façon plus simple&quot; /&gt; :
* quand l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre, l'objet doit être vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)\;&lt;/math&gt; et 
* quand l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, l'objet doit être vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq C\big)&lt;/math&gt;. 

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du dioptre et vu de ce centre sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant d'abord supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)&lt;/math&gt;, nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, n'étant pas nécessairement petit, la démarche pour établir l'aplanétisme du dioptre pour un tel objet est rendue plus aisée si on a établi auparavant la [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_.28ou_1.C3.A8re_relation_de_conjugaison.29_de_Descartes_.28avec_origine_au_centre.29|relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre)]] &lt;ref name=&quot;méthode moins aisée&quot; /&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\overline{CA_i}} - \dfrac{n_i}{\overline{CA_o}} = V\;&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la vergence précédemment introduite :&lt;/center&gt;

{{Al|5}}la démarche peut alors être décomposée en les étapes suivantes :
* montrer qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre), montrer alors que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et vérifier que l'angle au centre associé est encore &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* conclure qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; peut être confondue avec un segment perpendiculaire à l'axe optique principal c.-à-d. qu'elle est linéique transverse &lt;ref&gt; Nous aurons donc établi qu'il y a aplanétisme approché du dioptre sphérique pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du dioptre à condition qu'il soit vu de ce centre sous un petit angle.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq}\; C\big)&lt;/math&gt;, avec l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* le caractère transverse de l'objet linéique &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la longueur &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; est plus grande que la longueur &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition des côtés triangle rectangle&quot; /&gt;, soit plus précisément &lt;math&gt;\;[CA_o] =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;[CB_o]\, \cos(\alpha) \simeq [CB_o] \left( 1 - \dfrac{\alpha^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; ou finalement &lt;math&gt;\;[CA_o] \simeq [CB_o]\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; prouvant, qu'à cet ordre, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ayant une abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;axe optique secondaire&quot; /&gt;, l'application de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre) donne donc des points image &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; à abscisse image de Descartes (avec origine au centre) indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)&lt;/math&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est assimilable, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, à un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt;,
* l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant petit, on peut faire l'opération inverse de celle faite au premier paragraphe, c.-à-d. assimiler l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; à un segment choisi perpendiculaire à l'axe optique principal de support &lt;math&gt;\;(CA_i)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;justification choix&quot; /&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, linéique transverse ; &lt;center&gt;l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du dioptre sphérique&lt;/u&gt; (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; a donc été établi &lt;u&gt;pour tout objet linéique de pied non proche du centre du dioptre&lt;/u&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent pour un objet linéique transverse de pied proche du centre du dioptre et vu du sommet de ce dernier sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; étant maintenant supposé proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt; ; la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite l'utilisation de deux rayons paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;, point objet quelconque de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;paraxial - ter&quot;&gt; Le caractère paraxial étant indispensable pour satisfaire au stigmatisme approché du dioptre pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, tous les rayons non paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; seront arrêtés par un diaphragme centré sur &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie aisément que les rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; sont deux candidats respectant la paraxialité, par contre le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oC\;&lt;/math&gt; pouvant ne pas l'être car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;et si tel était le cas il serait alors arrêté par le diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt;, nous ne l'utiliserons pas.&lt;/ref&gt; et de montrer que le point image &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;, défini comme l'intersection des deux rayons réfractés, a pour projeté, sur l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; :
* déterminer l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_o&lt;/math&gt;,
* déterminer la longueur algébrique &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_o&lt;/math&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant porté par la représentation symbolique du dioptre orienté vers le haut, l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant lui aussi orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer l'équation des rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt;,
* travaillant dans le même repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; déterminer les équations des rayons réfractés, puis leur intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; ;
* vérifier que l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal est égale à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, puis conclure à l'aplanétisme approché du dioptre sphérique (concave convergent) pour l'objet linéique &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied proche du centre du dioptre.

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - aplanétisme.jpg|thumb|Schéma positionnant un objet linéique transverse de pied proche du centre d'un dioptre sphérique concave convergent pour démontrer l'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet &lt;ref&gt; Sur le schéma ci-dessus la distance focale objet vaut &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec &lt;math&gt;\;n_o \simeq 1,5\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i \simeq 1,0\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;f_o = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\;\overline{R} = 3\;\overline{R} = -3\;R&lt;/math&gt;, la distance focale image, quant à elle, valant &lt;math&gt;\;f_i = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\;\overline{R} = -2\;\overline{R} = 2\;R&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;]]
{{Al|5}}Soit &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique concave convergent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; de ce dernier sous un angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; correspondant à la condition de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; précitée ; 
# on détermine d'abord &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, image du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}&lt;/math&gt;, par utilisation de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes du dioptre sphérique (avec origine au sommet) de vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; étant la distance focale image du dioptre d'où : &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{n_i}{f_i} \Rightarrow \dfrac{1}{p_i} = \dfrac{n_o}{n_i\, p_o} + \dfrac{1}{f_i} = \dfrac{n_o\, f_i + n_i\, p_o}{n_i\, p_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{n_i\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
# &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; non algébrisé &lt;math&gt;\;\ll 1&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\beta) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{p_o}\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\tan(\beta) \simeq \beta\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} \simeq -\beta\; p_o&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})&lt;/math&gt;, le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = \varepsilon\, \overline{A_oB_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_S}{x_{M_o} - x_S} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o} = -\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_S = -\varepsilon\, \beta \left( x - x_S \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vérification signes&quot; /&gt;,&lt;/center&gt;
{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}&lt;/math&gt;, }}le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt; et passant par le foyer principal objet du dioptre sphérique &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;\left(x_{F_o} = f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\,f_i\, , \, y_{F_o} = 0\right)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_{F_o}}{x_{M_o} - x_{F_o}} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\,f_i}\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_{F_o} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left( x - x_{F_o} \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left( x + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i \right)&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# dans le même repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; le rayon réfracté sur le dioptre du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; étant de direction déterminée par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; (écrite pour de petits angles) est de pente &lt;math&gt;\;-\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon réfracté de pente égale à la tangente de l'angle de réfraction c.-à-d. encore égale à l'angle de réfraction &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; et le rayon incident étant de pente égale à la tangente de l'angle d'incidence c.-à-d. encore égale à l'angle d'incidence &lt;math&gt;\;i_o&lt;/math&gt;, l'utilisation de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes de la réfraction (écrite pour de petits angles) conduisant à &lt;math&gt;\;n_i\, i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;i_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, i_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; d'où l'équation du rayon réfracté correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = -\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vérification signes bis&quot; /&gt;,&lt;/center&gt;
{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}&lt;/math&gt;, }}le rayon réfracté sur le dioptre du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; étant, à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur le dioptre, &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, son équation nécessite de déterminer au préalable l'ordonnée de &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;x_{I} = 0\;&lt;/math&gt; dans l'équation du rayon incident soit &lt;math&gt;\;y(I) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left[ x_I + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i \right) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; d'où l'équation du rayon réfracté correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfractés a pour abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} = -\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\, x_{M_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;x_{M_i} = \dfrac{n_i\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; identique à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal étant égale à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, on conclut à l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du dioptre sphérique&lt;/u&gt; (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;u&gt;de pied proche du centre du dioptre&lt;/u&gt;.}}

==== Relation de conjugaison (approchée) de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Dès lors qu'un dioptre sphérique est utilisée sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme et d'aplanétisme approchés &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt;, l'usage est de représenter ce dioptre sous une forme symbolique dans laquelle figurent l'axe optique principal, le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, les foyers principaux objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et la partie de dioptre perpendiculaire en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal &lt;ref&gt; Cette partie de dioptre perpendiculaire en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal est terminée par des bords inclinés vers la droite pour un dioptre convergent et vers la gauche pour un dioptre divergent.&lt;/ref&gt; &lt;center&gt;voir ci-dessous en 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; ligne les quatre types de dioptres sphériques et en 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; ligne leur représentation symbolique &lt;ref name=&quot;Foyers à ajouter&quot; /&gt;.
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave verre - air.jpg|
Dioptre sphérique concave air - verre.jpg|
Dioptre sphérique convexe verre - air.jpg|
Dioptre sphérique convexe air - verre.jpg|
&lt;/gallery&gt;
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave convergent - symbole.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique concave convergent
Dioptre sphérique concave divergent - symbole.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique concave divergent
Dioptre sphérique convexe divergent.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique convexe divergent
Dioptre sphérique convexe convergent.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique convexe convergent
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes avec origine en S pour un dioptre sphérique concave convergent]]

{{Al|5}}Sur le schéma ci-contre on a construit l'image linéique transverse &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\neq C\;&lt;/math&gt; en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, l'un passant que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre et qui poursuit dans l'espace image réel sans être dévié &lt;ref&gt; En effet le rayon émergent doit être issu du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; du rayon incident et passer par l'image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; par le dioptre c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même.&lt;/ref&gt;, l'autre passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre et qui se réfracte en obéissant à la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Attention le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre est le seul point d'incidence en lequel on peut appliquer la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes en travaillant sur la représentation symbolique du dioptre car c'est le seul point pour lequel la direction de cette représentation symbolique se confond avec la direction réelle du dioptre &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;autrement dit c'est le seul point où la normale réelle est perpendiculaire à la représentation symbolique, par exemple le rayon incident &lt;math&gt;\;B_oC\;&lt;/math&gt; qui se confond avec la normale réelle du dioptre en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; n'est pas perpendiculaire à la représentation symbolique du dioptre en &lt;math&gt;\;I\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, le point d'intersection de ces deux rayons émergents étant le point de convergence &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; de tous les rayons réfractés correspondant à tous les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; sous conditions de Gauss  &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Car le dioptre est stigmatique approché pour &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal &lt;ref&gt; Car le dioptre est aplanétique approché pour &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}En comparant les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_oB_oS&lt;/math&gt;, déterminer le grandissement transverse par le dioptre de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}\\ p_i = \overline{SA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt; ; 

&lt;center&gt;cette relation définit la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; pour tout objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;, elle caractérise quantitativement la propriété d'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons émergents correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui est transmis sans déviation et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfracte en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal, la direction du rayon incident, quant à elle, faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal telle que &lt;math&gt;n_i\,i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation de Kepler&quot;&gt; On rappelle que les angles étant petits, la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes de la réfraction se réécrit en omettant les sinus (relation approchée de Kepler).&lt;/ref&gt; &lt;ref&gt; Il est déconseillé de choisir ce rayon dans les constructions futures demandées car peu pratique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; devant être mesuré puis l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; calculé et enfin reporté par rapport à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; ici nous
l'utilisons dans la démonstration d'où ce choix.&lt;/ref&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(i_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(i_i)\;&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(i_o) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;, et comme &lt;math&gt;\;|i|\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i_o \simeq \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}}&lt;/math&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(i_i) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq S\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iS&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, et comme &lt;math&gt;\;|i|\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i_i \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}écrivant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; pour les petits angles &lt;math&gt;\;n_i\, i_i \simeq n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; on en déduit : &lt;math&gt;\;n_o\, \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}} \simeq n_i\, \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} \simeq \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SA_i}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes (avec origine au sommet)&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SA_i}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq S\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}\\ p_i = \overline{SA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = f_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;p_o = f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le dioptre sphérique n'est stigmatique rigoureux que pour le pied &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique, pour tous les autres points objet constituant ce dernier on suppose le stigmatisme approché du dioptre c.-à-d. l'utilisation de rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\; (\neq C)\; \in A_oB_o\;&lt;/math&gt; paraxiaux &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;ce qui peut être réalisé en pratique avec un diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; collé contre le dioptre&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et la condition d'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* vérifier, par construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i&lt;/math&gt; et utilisation de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; dans les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;, qu'elle est se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; avec un cœfficient d'agrandissement dépendant du rapport des indices des espaces objet et image, 
* en déduire l'applicabilité de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;. 
{{Al|5}}Considérant maintenant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'objet, collé contre le dioptre sphérique, de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;, l'axe optique principal ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, ne peut être rigoureusement linéique (c.-à-d. rectiligne) car il suit la courbure du dioptre mais, s'il est vu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un petit angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, on peut confondre l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le segment correspondant lui étant tangent à l'ordre un &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, raison pour laquelle l'objet est qualifié de « linéique transverse » ; &lt;br&gt;{{Al|3}}le dioptre sphérique est stigmatique rigoureux que pour les points de l'objet linéique car tous ces points, étant sur le dioptre, jouent le rôle de sommet (secondaire) pour lequel le dioptre est stigmatique rigoureux.&lt;/ref&gt; et la condition d'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\alpha \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Qui est aussi la condition pour que l'objet collé sur le dioptre puisse être considéré comme linéique.&lt;/ref&gt;, 
* vérifier que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, le caractère linéique transverse de l'objet entraînant celui de l'image et 
* en déduire la valeur du grandissement transverse &lt;math&gt;\;G_t(S)\;&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - grandissement transverse au centre.jpg|thumb|Construction de l'image d'un objet linéique transverse de pied au centre d'un dioptre sphérique concave convergent]]
{{Al|5}}Le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique concave convergent ci-contre en étant un point double conjugué rigoureux, un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;CB_o\;&lt;/math&gt; a pour image, par le dioptre, une image linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, notée &lt;math&gt;\;CB_i&lt;/math&gt; ; pour construire cette dernière il suffit de choisir pour rayon incident issu de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le rayon passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui se propage dans l'espace image parallèlement à l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant alors l'intersection de ce rayon émergent avec le plan transverse passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; ; on vérifierait graphiquement que &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\overline{CB_i} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \overline{CB_o}\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{n_o}{n_i}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'application de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au sommet) nous conduit à &lt;math&gt;\;G_t(C) =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SC}}{\overline{SC}}&lt;/math&gt;, soit effectivement &lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{n_o}{n_i}&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Tous les points du dioptre sphérique étant des points doubles de ce dernier &lt;ref&gt; Chaque point du dioptre jouant le rôle de sommet pour l'axe optique principal passant par ce point, c'est effectivement un point double.&lt;/ref&gt;, un objet collé sur le dioptre est donc sa propre image ; dans la mesure où l'objet est de petite taille, on peut négliger sa courbure et le considérer comme linéique transverse, son image étant alors également linéique transverse ; comme &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit, par définition, &lt;math&gt;\;G_t(S) = +1\;&lt;/math&gt;.}}

==== Construction de l'image par un dioptre sphérique d'un objet linéique transverse ====

{{Al|5}}&lt;u&gt;Définitions préliminaires&lt;/u&gt; : On appelle plan focal objet le plan transverse passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}plan focal image le plan transverse passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle axe optique secondaire tout axe passant par le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; du dioptre, il possède une partie incidence contenue dans l'espace objet réel se prolongeant sans être dévié pour donner sa partie émergente contenue dans l'espace image réelle ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal objet et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal image.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés&lt;/u&gt; : Justifier les propriétés des foyers secondaires objet et image associés à un  axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; :
# le foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour image le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\big]&lt;/math&gt;,
# le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour antécédent le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés des foyers secondaires associés à un axe optique secondaire&lt;/u&gt; :
# foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet linéique transverse contenu dans le plan focal objet et de pied &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, objet noté &lt;math&gt;\;F_o\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ayant pour image le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et l'image étant linéique transverse, le point &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; a une image également située à l'infini sur l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; se prolonge dans l'espace image sans déviation, les parties incidente et émergente constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;center&gt;soit effectivement &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)&lt;/math&gt;,&lt;/center&gt;
# foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet dont l'image associée est contenue dans le plan focal image et de pied &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, image notée &lt;math&gt;\;F_i\varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; ayant pour antécédent le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et le dioptre étant aplanétique, le point &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; a un antécédent également situé à l'infini sur la partie incidente de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon émergent issu de &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est le prolongement d'un rayon incident sans changement de direction, les parties incidente et émergente constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;center&gt;soit effectivement&lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; réel, de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; séparé du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent d'une distance supérieure au rayon non algébrisé du dioptre &lt;ref&gt; Pour la construction on prendra &lt;math&gt;\;n_o = 1,5\;&lt;/math&gt; (indice du verre) et &lt;math&gt;\;n_i = 1,0\;&lt;/math&gt; (indice de l'air).&lt;/ref&gt;, construire son image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; par le dioptre de deux façons différentes :
# en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisis parmi les trois suivants : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;,
# en considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;un seul rayon incident suffit&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisi parmi les deux suivants : passant par &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Refaire les constructions précédentes avec un miroir concave divergent (obtenu en permutant les espaces objet et image).

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - construction image.jpg|thumb|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave convergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par C, passant par F&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; ou parallèle à l'axe optique principal]]
# En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les trois suivants (voir schéma ci-contre) : &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et se prolongeant sans déviation, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; foyer principal objet et émergeant dans l'espace image parallèlement à l'axe optique principal, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal et émergeant dans l'espace image en passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;l'image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection des deux rayons réfractés correspondant aux deux rayons incidents choisis, &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.
{{clr}}
[[File:Dioptre sphérique concave convergent - construction image - bis.jpg|thumb|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave convergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant un des deux incidents issus de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou parallèle à un axe optique secondaire]]
# En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les deux suivants (voir schéma ci-contre) : &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par un foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection du rayon incident et du plan focal objet&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et émergeant parallèlement à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c.-à-d., pour la partie incidente &lt;math&gt;\;C\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, la partie réfractée en étant le prolongement sans déviation&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire a priori quelconque &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et émergeant en passant par le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et du plan focal image&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection d'un des rayons réfractés correspondant au rayon incident choisi et de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant comme intersection de l'axe optique secondaire passant par &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et du plan transverse passant par &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;.

{{clr}}
{{Al|5}}Ci-dessous les constructions refaites sur un dioptre sphérique concave divergent, en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; à gauche puis en utilisant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et la notion de foyers secondaires objet ou image à droite :
&lt;center&gt;
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave divergent - construction image.jpg|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave divergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par C, passant par F&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; ou parallèle à l'axe optique principal
Dioptre sphérique concave divergent - construction image - bis.jpg|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave divergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant un des deux incidents issus de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou parallèle à un axe optique secondaire
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) sous conditions de Gauss ===

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}On repère maintenant les points objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\overline{CA_i}} - \dfrac{n_i}{\overline{CA_o}} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes origine en C&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = V\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; vergence du dioptre.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Descartes (origine au centre) utilisent &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; ou un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe 
optique principal :
* l'abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} = \overline{SC} + \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = \overline{R} + \pi_o\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes (avec origine au centre) du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SC} + \overline{CA_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = \overline{R} + \pi_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au centre) en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{-(n_i - n_o)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\pi_i + \overline{R}} - \dfrac{n_o}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i\,(\pi_o + \overline{R}) - n_o\, (\pi_i + \overline{R})}{(\pi_i + \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R})} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, (\pi_i + \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R}) = [n_i\, \pi_o - n_o\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}]\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}\, \pi_o - (n_o - n_i)\, \overline{R}\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}^2 = n_i\, \pi_o\, \overline{R} - n_o\, \pi_i\, \overline{R} - (n_o - n_i)\, \overline{R}^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i - n_o\, \overline{R}\, \pi_o + n_i\, \overline{R}\, \pi_i = 0\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;n_o\, \overline{R}\, \pi_o - n_i\, \overline{R}\, \pi_i = -(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i\;&lt;/math&gt; et enfin, en divisant les deux membres de l'équation par &lt;math&gt;\;\pi_o\, \pi_i\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;C.N.&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison en étant que l'on cherche à établir une équation faisant intervenir des inverses de longueur à partir d'une équation comportant des produits de deux longueurs&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du dioptre ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}} = V&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; vergence du dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes avec origine en C pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes origine en C&quot; /&gt;. 

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement cette relation.

{{clr}}
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \pi_o + \overline{R} \\ p_i = \pi_i + \overline{R} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\pi_i + \overline{R}}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}\left( \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_i} \right)}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} \left( \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_o} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître des inverses de longueur comme celles de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}} \Leftrightarrow \dfrac{n_o}{\pi_i} + \dfrac{n_o}{\overline{R}} = \dfrac{n_i}{\pi_o} + \dfrac{n_i}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du dioptre ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = 1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons émergents correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui est transmis sans déviation et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfracte en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal, la direction du rayon incident, quant à elle, faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal telle que &lt;math&gt;n_i\,i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation de Kepler&quot; /&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iC\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre bis&quot; /&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}} = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = \dfrac{\overline{CA_i}}{\overline{CA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{CA_i}}{\overline{CA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq C\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\pi_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = f_i - \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\pi_o = f_o - \overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Newton sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On repère maintenant le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique et le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du même dioptre sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Newton de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\; \overline{F_iA_i}\; \overline{F_oA_o} = \overline{SF_i}\; \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;\sigma_i \; \sigma_o = f_i\; f_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot;&gt; On retrouve la forme commune vue pour un miroir sphérique et qui sera établie au chapitre suivant pour une lentille mince &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à condition que les deux formes de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton soient explicitées uniquement en fonction des abscisses objets ou des abscisses images et non simultanément des deux&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; distances focales image et objet du dioptre.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Newton utilisent &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal :
* l'abscisse objet de Newton du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} = \overline{SF_o} + \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = f_o + \sigma_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i + \sigma_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vergence dioptre&quot;&gt; On rappelle la vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et
* l'abscisse image de Newton du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SF_i} + \overline{F_iA_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = f_i + \sigma_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Newton en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\sigma_i + f_i} - \dfrac{n_o}{\sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right) - n_o\, (\sigma_i + f_i)}{(\sigma_i + f_i) \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right)} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;n_i\, (\sigma_i + f_i) \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;= (n_i\, \sigma_o - n_o\, \sigma_i - 2\, n_o\, f_i)\, f_i\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;n_i\, \sigma_o\, \sigma_i + n_i\, f_i\, \sigma_o - n_o\, f_i\, \sigma_i - n_o\, f_i^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;n_i\, \sigma_o\, f_i - n_o\, \sigma_i\, f_i - 2\, n_o\, f_i^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;n_i\, \sigma_o\, \sigma_i = -n_o\, f_i^2\;&lt;/math&gt; et enfin, sachant que &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On remplacera une seule fois &lt;math&gt;\;n_o\, f_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;-n_i\, f_o\;&lt;/math&gt; pour obtenir une forme symétrique de la relation puis on simplifiera l'équation obtenue par &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le foyer principal objet du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt; en effet si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal et on obtient une forme indéterminée avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\infty\big)&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS} = -f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS} = -f_i\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; &lt;br&gt;avec &lt;math&gt;\;f_i = -\dfrac{n_i}{n_o}\,f_o = -\dfrac{(n_o - n_i)}{n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; distance focale image du dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \sigma_o = \overline{F_oA_o}\\ \sigma_i = \overline{F_iA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse Newton.jpg|thumb|Schéma de démonstration des deux formes de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton &lt;ref name=&quot;deux formes de grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt;.

{{clr}} 
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \sigma_o + f_o \\ p_i = \sigma_i + f_i \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i + f_i}{\sigma_o + f_o} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i \left( 1 + \dfrac{f_i}{\sigma_i} \right)}{f_o \left( 1 + \dfrac{\sigma_o}{f_o} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître, au numérateur et au dénominateur, deux grandeurs égales découlant de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_i\, f_o \Leftrightarrow \dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;1 + \dfrac{\sigma_i}{f_i} = 1 + \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i}{f_o} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt;  &lt;ref name=&quot;vergence dioptre&quot; /&gt; ; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton dioptre&quot;&gt; Applicable en tout point objet ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que cette forme de relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS} = -f_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;resp. &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS} = -f_i\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = +1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}comme la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton s'écrivant &lt;math&gt;\;\sigma_i\, \sigma_o = f_i\, f_o\;&lt;/math&gt; est équivalente à &lt;math&gt;\;\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit aisément la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfractés correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui émerge en &lt;math&gt;\;K\;&lt;/math&gt; parallèlement à l'axe optique principal et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; parallèle à l'axe optique principal qui se réfracte en &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; en passant par &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;HF_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_iA_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer bis&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS}) = \dfrac{\overline{SH}}{\overline{SF_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SH}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SH} = \overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}} = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{F_iA_i}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{F_iA_i}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}de même le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;KF_oS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_oA_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS}) = -\dfrac{\overline{SK}}{\overline{SF_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SK}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SK} = \overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}} = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{SF_o}}{\overline{F_oA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{SF_o}}{\overline{F_oA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\sigma_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = 0\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de Lagrange - Helmholtz sous conditions de Gauss ===

[[File:Dioptre sphérique - grandissement angulaire.jpg|thumb|Schéma de détermination du grandissement angulaire en repérage de Descartes (avec origine en S) pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Expression de Descartes (avec origine au sommet) du grandissement angulaire d'un pinceau incident issu d'un point objet ====

{{Al|5}}On rappelle que le grandissement angulaire d'un pinceau lumineux incident issu d'un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;, de direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal, le pinceau se réfractant sur le dioptre en convergeant vers le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;, avec une direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal, est défini selon &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles petits&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}en utilisant le schéma ci-contre, établir l'expression du grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes (avec origine au sommet), respectivement &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'expression du grandissement angulaire a été établie en utilisant un dioptre sphérique concave convergent mais elle reste applicable pour un dioptre sphérique des trois autres types.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}On détermine le grandissement angulaire par évaluation de
&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\big(\theta_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\;&lt;/math&gt; sur la figure ci-dessus&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles &lt;math&gt;\;A_oIS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iIS\;&lt;/math&gt; soit :
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}&lt;/math&gt; ;
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_i}}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_i}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on en déduit &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{\dfrac{-\overline{SI}}{p_i}}{-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{SI}&lt;/math&gt;, l'expression souhaitée du &lt;center&gt;grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Établissement de la relation de Lagrange - Helmholtz ====

{{Al|5}}Á l'aide des relations de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) et de l'expression du grandissement angulaire dans le même repérage, vérifier la relation de Lagrange - Helmholtz &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{n_o}\; G_t(A_o)\; G_a(A_o) = 1\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Lagrange - Helmholtz dioptre&quot;&gt; Cette relation est la même que celle que l'on trouvera dans le chapitre suivant sur les lentilles minces, dans le cas usuel d'une lentille mince l'espace image étant de même indice que l'espace objet&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Connaissant le grandissement transversal donné par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) \simeq \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; et l'expression du grandissement angulaire précédemment trouvée &lt;math&gt;\;G_a(A_o) \simeq \dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;, on en déduit le lien entre grandissements angulaire et transversal indépendant de la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;G_a(A_o)\; G_t(A_o) \simeq \dfrac{p_o}{p_i} \times \dfrac{n_o}{n_i}\; \dfrac{p_i}{p_o} = \dfrac{n_o}{n_i}\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{n_o}\; G_t(A_o)\; G_a(A_o) = 1\;&lt;/math&gt; ce qui constitue la relation de Lagrange - Helmholtz cherchée &lt;ref name=&quot;Lagrange - Helmholtz dioptre&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;}}

== Notes et références ==

&lt;references /&gt;

{{Bas de page
  | idfaculté = physique
  | précédent = [[../Optique géométrique : miroir plan/]]
  | suivant   = [[../Optique géométrique : lentilles minces/]]
}}</text>
      <sha1>gmp5ngusxxyktk3dqep2l031x59bz1r</sha1>
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      <contributor>
        <username>Phl7605</username>
        <id>31541</id>
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      <model>wikitext</model>
      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="283499" xml:space="preserve">{{Exercice
  | titre     = Optique géométrique : conditions de Gauss
  | idfaculté = physique
  | numéro    = 13
  | chapitre  = [[../../Optique géométrique : conditions de Gauss/]]
  | précédent = [[../Optique géométrique : miroir plan/]]
  | suivant   = [[../Optique géométrique : lentilles minces/]]
  | niveau    = 14
}}

__TOC__
{{clr}}

== Stigmatisme et aplanétisme approchés d'un miroir sphérique sous conditions de Gauss ==

{{Al|5}}Pour être défini, un miroir sphérique nécessite la connaissance de :
* sa nature « concave » ou « convexe », 
* son centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;centre de courbure de la surface sphérique réfléchissante &lt;ref&gt; Si le miroir est « concave », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est réel, et si le miroir est « convexe », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est virtuel.&lt;/ref&gt;&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;,
* son rayon de courbure &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;non algébrisé&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;R\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;rayon de courbure de la surface sphérique réfléchissante&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;,
* l'axe optique principal dont la partie incidente &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou son prolongement&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; passe par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;point objet dont on étudiera l'image éventuelle&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et
* son sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;intersection de l'axe optique principal et de la surface réfléchissante&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Nous adoptons l'algébrisation physique de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot;&gt; Supposant l'axe optique principal horizontal avec les espaces objets réel et virtuel respectivement situés à gauche et à droite du miroir, &lt;br&gt;{{Al|3}}la partie incidente de l'axe optique principal est orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\rightarrow\;&lt;/math&gt; et tous ses points &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;qu'ils soient réels ou virtuels&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ont une abscisse &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;comptée à partir d'une origine pouvant être {{Nobr|quelconque&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;}} mesurée dans ce sens, le sens étant rappelé en indice de l'abscisse ; &lt;br&gt;{{Al|3}}la partie réfléchie de l'axe optique principal est alors orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\leftarrow\;&lt;/math&gt; et tous ses points &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;qu'ils soient réels ou virtuels&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ont une abscisse &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;comptée à partir d'une origine pouvant être quelconque et différente de celle des points de la partie incidente de l'axe&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; mesurée dans ce sens, le sens étant aussi rappelé en indice de l'abscisse ; &lt;br&gt;{{Al|3}}voir les paragraphes « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Algébrisation_physique_de_l'axe_optique_principal_(associé_à_un_objet_ponctuel)|algébrisation physique de l'axe optique principal (associé à un objet ponctuel)]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Repérage_d'un_point_objet_ou_d'un_point_image_sur_l'axe_optique_principal|repérage d'un point objet ou d'un point image sur l'axe optique principal]] (surface réfléchissante) » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; et, pour unifier l'étude des miroirs sphériques, algébrisons le rayon de courbure du miroir selon &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; avec pour conséquence la nature « concave » ou « convexe » du miroir caractérisé par le signe du rayon de courbure algébrisé :
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à droite de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est virtuel, correspondant à un miroir « convexe »,
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à gauche de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est réel, correspondant à un miroir « concave ».
&lt;center&gt; 
&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;330px&gt;
Miroir sphérique convexe - algébrisation.jpg|Miroir sphérique convexe : algébrisation de l'axe optique principal, définitions du centre, du sommet et du rayon de courbure algébrisé
Miroir sphérique concave - algébrisation.jpg|Miroir sphérique concave : algébrisation de l'axe optique principal, définitions du centre, du sommet et du rayon de courbure algébrisé
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Dans la suite nous supposerons le miroir sphérique concave &lt;ref&gt; En précisant la modification des résultats pour un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Dans la suite nous }}admettrons qu'il n'y a pas stigmatisme rigoureux du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Stigmatisme_rigoureux_d'un_système_optique_pour_un_point_objet|stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point objet]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour tous les points objet autres que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et tous les points du miroir &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot;&gt; Si le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est sur le miroir, l'axe optique principal associé à ce point objet ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; joue le rôle de sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir ; ainsi, dans la mesure où l'axe optique principal n'a pas été préalablement défini, tout point du miroir peut être considéré comme un sommet.&lt;/ref&gt;.

=== Démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss ===

[[File:Miroir sphérique concave - stigmatisme approché.jpg|thumb|350px|Schéma d'un miroir sphérique concave dans le but d'établir le stigmatisme approché du miroir &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Stigmatisme_d'un_système_optique_pour_un_point_objet|stigmatisme d'un système optique pour un point objet]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour tout point objet autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;]]

{{Al|5}}Considérant un point objet réel &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et l'axe optique principal correspondant de support &lt;math&gt;\;(A_oC)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Dès lors que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\neq C&lt;/math&gt;, l'axe optique principal est parfaitement défini ainsi que le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui est l'intersection de l'axe optique principal et du miroir ; &lt;br&gt;{{Al|3}}sur le schéma &lt;math&gt;\;[SA_o]\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; [SC]&lt;/math&gt;, ceci entraînant que &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, l'image éventuelle de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par le miroir, est telle que &lt;math&gt;\;[SA_i]\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; [SC]&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}pour traiter le cas correspondant à &lt;math&gt;\;[SA_o] &lt; [SC]&lt;/math&gt;, ce qui entraînerait que &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, l'image éventuelle de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par le miroir, serait telle que &lt;math&gt;\;[SA_i] &gt; [SC]&lt;/math&gt;, il suffirait de permuter l'objet et l'image pour retrouver le cas précédent aussi nous nous contenterons de traiter le cas du schéma &lt;math&gt;\;[SA_o] &gt; [SC]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, nous envisageons des rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, peu inclinés par rapport à l'axe optique principal, d'angle d'inclinaison &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; et dont le point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; reste proche du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; c.-à-d. tel que l'angle que fait la normale au miroir en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; dans le sens incident avec la partie incidente de l'axe optique principal &lt;math&gt;\;\widehat{(\overrightarrow{CS}\, ;\, \vec{N})} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\omega\;&lt;/math&gt; est tel que &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;paraxial&quot;&gt; Les rayons incidents sont donc paraxiaux, conditions de Gauss &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;admises&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; pour que le système recevant ces rayons soit stigmatique approché pour le point objet considéré, voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}Le rayon incident &lt;math&gt;\;A_oI\;&lt;/math&gt; donnant, par utilisation des lois de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot;&gt; '''[[w:Willebrord_Snell|Willebrord Snell Van Royen]] ou Snellius (1580 - 1626)''' humaniste, mathématicien et physicien néerlandais, semble avoir découvert les lois portant son nom avant Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;sans que ce soit {{Nobr|assuré&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.}} &lt;br&gt;{{Al|3}}'''[[w:René_Descartes|René Descartes]] (1596 - 1650)''' mathématicien, physicien et philosophe français, considéré comme l'un des fondateurs de la [[w:Philosophie_moderne|philosophie moderne]], en physique a contribué à l'[[w:Optique_géométrique|optique géométrique]] et en mathématiques est à l'origine de la [[w:Géométrie_analytique|géométrie analytique]].&lt;/ref&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;1ère loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Première_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réflexion|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réflexion]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Deuxième_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réflexion|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réflexion]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;, le rayon réfléchi &lt;math&gt;\;IA_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(A_i \in&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, appelons &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; l'angle d'inclinaison du rayon réfléchi par rapport à la partie réfléchie de l'axe optique principal ; nous nous proposons de démontrer que &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est indépendant du rayon incident considéré &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. indépendant de &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;\omega\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot;&gt; En &lt;math&gt;\;1796&lt;/math&gt;, '''[[w:Carl_Friedrich_Gauss|Gauss]]''', à l'âge de dix-neuf ans, caractérisa presque complètement tous les polygones réguliers constructibles à la règle et au compas et il demanda par la suite qu'un [[w:Heptadécagone|heptadécagone]] {{Nobr|&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;polygone}} régulier de &lt;math&gt;\;17\;&lt;/math&gt; côtés&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit gravé sur son tombeau ; bien d'autres découvertes de mathématiques lui sont dues dont, en particulier, en &lt;math&gt;\;1801\;&lt;/math&gt; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; démonstration de la loi de réciprocité quadratique conjecturée par '''[[w:Leonhard_Euler|Euler]]''' en &lt;math&gt;\;1772&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;un nombre premier est congru à un carré de nombre entier modulo un autre nombre premier, par exemple &lt;math&gt;\;11 \equiv 3^2\!\! \pmod{2}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;19 \equiv 4^2\!\! \pmod{3}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;41 \equiv 6^2\!\! \pmod{5}\;&lt;/math&gt; de même que &lt;math&gt;\;43 \equiv 6^2\!\! \pmod{7}\; \ldots\big]\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\{&lt;/math&gt;'''[[w:Leonhard_Euler|Leonhard Euler]] (1707 - 1783)''' mathématicien et physicien suisse qui passa la plus grande partie de sa vie dans l'Empire russe et en Allemagne ; en mathématiques il fit d'importantes découvertes dans des domaines aussi variés que le [[w:Calcul_infinitésimal|calcul infinitésimal]] et la [[w:Théorie_des_graphes|théorie des graphes]], il introduisit également une grande partie de la terminologie et de la notation des mathématiques modernes, en particulier pour l'[[w:Analyse_(mathématiques)|analyse mathématique]], comme la notion de [[w:Fonction_(mathématiques)|fonction mathématique]] ; il est aussi connu pour ses travaux en mécanique, en dynamique des fluides, en optique et en astronomie&lt;math&gt;\}&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}dans le domaine de l'astronomie '''[[w:Carl_Friedrich_Gauss|Gauss]]''' publia un travail très important sur le mouvement des corps célestes contenant le développement de la [[w:Méthode_des_moindres_carrés|méthode des moindres carrés]] ; auparavant, en &lt;math&gt;\;1801&lt;/math&gt;, il développa une nouvelle méthode de calcul lui permettant de prédire où doit se trouver [[w:(1)_Cérès|Cérès]] &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;une planète naine de la ceinture des astéroïdes entre Mars et Jupiter&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}dans le domaine de la physique il est l'auteur de deux des quatre équations de '''Maxwell''' gérant l'électromagnétisme &lt;math&gt;\;\{&lt;/math&gt;'''[[w:James_Clerk_Maxwell|James Clerk Maxwell]] (1831 - 1879)''' physicien et mathématicien écossais, principalement connu pour ses équations unifiant l'électricité, le magnétisme et l'induction ainsi que pour l'établissement du caractère électromagnétique des ondes lumineuses, mais aussi pour sa distribution des vitesses utilisée dans une description statistique de la théorie cinétique des gaz ; le tire-bouchon fictif permettant de déterminer l'orientation à droite d'un espace tridimensionnel ou le caractère direct d'un triplet de vecteurs a été baptisé « tire-bouchon de Maxwell » en son honneur&lt;math&gt;\}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\big(\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; sont réalisées.

==== Établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω ====

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC\;&lt;/math&gt; établir une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i\;\big(&lt;/math&gt;angle d'incidence du rayon incident en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC\;&lt;/math&gt; établir une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation entre &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i'\;\big(&lt;/math&gt;angle de réflexion du rayon réfléchi en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; et les deux relations précédentes, déduire la relation suivante entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt; : &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{\theta_o + \theta_i}{2}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;applicabilité hors conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot;&gt; Cette relation reste applicable quels que soient les ordres de grandeur de &lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert&lt;/math&gt;, elle ne nécessite donc pas de se placer dans les conditions de Gauss de stigmatisme approché.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\omega = \theta_o + (-i)\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot;&gt; On utilise la propriété suivante : « dans un triangle, un angle extérieur est égal à la somme des deux autres angles intérieurs » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;propriété utilisant des angles non algébrisés&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; sont positifs mais &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; étant négatif, sa valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et  

{{Al|5}}dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\theta_i = \omega + i'\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que tous les angles &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;i'\;&lt;/math&gt; sont positifs.&lt;/ref&gt; ; en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; pour la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; «&lt;math&gt;\;i' = -i\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la relation ci-dessus se réécrit &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIC}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\theta_i = \omega - i\;&lt;/math&gt;» ;

{{Al|5}}{{Transparent|dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIC}&lt;/math&gt;, }}on élimine alors &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; entre ces deux relations en faisant la différence soit : &lt;math&gt;\;\omega - \theta_i = \theta_o - \omega\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;2\,\omega = \theta_o + \theta_i\;&lt;/math&gt; soit enfin «&lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{\theta_o + \theta_i}{2}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;applicabilité hors conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;.}}

==== Évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H ====

{{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, montrer que le rayon réfléchi est peu incliné relativement à la partie réfléchie de l'axe optique principal c.-à-d. &lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \ll 1&lt;/math&gt;.
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot;&gt; &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.&lt;/ref&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;,
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\omega)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# déduire des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;, un lien entre «&lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;relation &lt;math&gt;\,(\mathfrak{b})\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\theta_i = 2\, \omega - \theta_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \leqslant 2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\vert \theta_o \vert \ll 1\\ \vert \omega \vert \ll 1 \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \leqslant 2\, \vert \omega \vert + \vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. que le rayon réfléchi est aussi peu incliné relativement à la partie réfléchie de l'axe optique principal.&lt;/center&gt;
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_o &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}_\rightarrow &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \theta_o \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) \simeq \theta_o\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable#Développements_limités_à_l'ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|développements limités à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_i &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}_\leftarrow &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_iIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \theta_i \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) \simeq \theta_i\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\tan(\omega) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HC}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\omega &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\omega) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}_\rightarrow &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; &lt;br&gt;{{Transparent|en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{CIH}&lt;/math&gt;, }}«&lt;math&gt;\;\vert \omega \vert \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\omega) \simeq \omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\omega \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HC_\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
# des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;2\, \omega = \theta_i + \theta_o&lt;/math&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\dfrac{-2\, \overline{HI}}{\overline{HC_\rightarrow}} = \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}_\leftarrow} - \dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, après simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{HI}&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Transparent|des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{a})}\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;\color{transparent}{2\, \omega = \theta_i + \theta_o}&lt;/math&gt;, on en déduit }}«&lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{HC_\rightarrow}} = \dfrac{1}{\overline{{\mathrm{HA}_i}_\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{HA_o}_\rightarrow}\;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.}}

==== Établissement de la confusion de H et de S à l'ordre un en ω ====

{{Al|5}}Établir que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; peut être confondu avec le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;H et S confondus&quot;&gt; Ceci nécessite que &lt;math&gt;\;[HS]\;&lt;/math&gt; soit un infiniment petit au moins d'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et

{{Al|5}}réécrire que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; en tenant compte de cette confusion.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Montrons que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;ω infiniment petit d'ordre un&quot;&gt; &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\;&lt;/math&gt; étant considéré comme un infiniment petit d'ordre un.&lt;/ref&gt;, en évaluant &lt;math&gt;\;[CH]\;&lt;/math&gt; puis &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH]\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, on obtient &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[CH] = [CI]\, \cos(\omega) = R\, \cos(\omega) \simeq R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable#D.L._d'ordre_deux_de_quelques_fonctions_usuelles_au_voisinage_de_zéro|développements limités à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles au voisinage de zéro]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Voir aussi la remarque du paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable_au_voisinage_d'une_de_ses_valeurs#Développements_limités_à_l'ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|développements limités à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)|Outils mathématiques pour la physique (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; d'où &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH] \simeq R - R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;», soit «&lt;math&gt;\;[HS] \simeq R \dfrac{\omega^2}{2}\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» ou finalement &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|Montrons que &lt;math&gt;\;\color{transparent}{H}\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\omega}\;&lt;/math&gt;}}«&lt;math&gt;\;[HS] \simeq 0\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt;» ;

{{Al|5}}remplaçant &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; dans la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})&lt;/math&gt;, on peut, sous les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, la réécrire selon &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\; \dfrac{-2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Sous cette forme la relation nécessite que le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; sommet du miroir.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Conclusion : stigmatisme approché du miroir sphérique (concave) pour le point objet A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; définit, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, un point image unique &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; et en déduire &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier }}le stigmatisme approché du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier que }}la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot;&gt; Nous admettrons que cette relation &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou propriété&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans le cas d'un miroir sphérique concave est encore applicable, sans modification, à un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante appelée « vergence » du miroir sphérique exprimée en dioptries &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;de symbole &lt;math&gt;\;\delta\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dioptrie&quot;&gt; Pour que la vergence s'exprime en dioptries, les abscisses doivent l'être en &lt;math&gt;\;m\;\big(&lt;/math&gt;la dioptrie étant liée au mètre par &lt;math&gt;\;1\, \delta = 1\,m^{-1}\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{b})}\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V}\;&lt;/math&gt;» }}exprimer &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.

{{Al|5}}Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot;&gt; '''[[w:René_Descartes|René Descartes]] (1596 - 1650)''' mathématicien, physicien et philosophe français, considéré comme l'un des fondateurs de la [[w:Philosophie_moderne|philosophie moderne]], en physique a contribué à l'[[w:Optique_géométrique|optique géométrique]] et en mathématiques est à l'origine de la [[w:Géométrie_analytique|géométrie analytique]].&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Pour le repérage de Descartes dans un miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave ou convexe&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, il y a deux origines utilisées : l'origine au sommet qui est la plus fréquemment utilisée et l'origine au centre qui l'est beaucoup moins.&lt;/ref&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;{{Al|7}}{{Transparent|Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; }}celle du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; d'un miroir sphérique se réécrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot;&gt; C.-à-d., comme cela sera vu dans les paragraphes « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Première_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_position)_de_Descartes|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de position) de Descartes]] », « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Première_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_position)_de_Newton|1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de position) de Newton]] », « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Deuxième_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_grandissement_transverse)_de_Descartes|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de grandissement transverse) de Descartes]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_lentilles_minces#Deuxième_relation_de_conjugaison_(ou_relation_de_conjugaison_de_grandissement_transverse)_de_Newton|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (ou relation de conjugaison de grandissement transverse) de Newton]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] », nous obtenons la même relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;ou de grandissement transverse&lt;math&gt;\big\}\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou de Newton&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; que celle d'une lentille mince &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à condition que l'algébrisation de l'axe optique du miroir sphérique soit l'algébrisation physique adoptée dans ce cours&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;revoir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Algébrisation_physique_de_l'axe_optique_principal_(associé_à_un_objet_ponctuel)|algébrisation physique de l'axe optique principal (associé à un objet ponctuel)]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big\}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du miroir sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; « pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;Ao autre que C et S&quot;&gt; &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; pour que l'axe optique principal associé à &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit unique et &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; pour que l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; ne soit pas nulle, ce qui permet à son inverse d'exister&lt;/ref&gt; puisque, &lt;br&gt;{{Al|9}}{{Transparent|La relation &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(\mathfrak{b})}\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du miroir sphérique « }}pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; fixé, le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est déterminé de façon unique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;indépendamment des variations des petits angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; peut effectivement être écrite sous la forme «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante définissant la « vergence » du miroir sphérique selon &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; rayon algébrisé du miroir.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Avec les « abscisses de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du miroir sphérique se réécrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Points pour lesquels la conjugaison du miroir sphérique est rigoureuse et points doubles ===

{{Al|5}}Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot; /&gt; du miroir sont des points
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que }}pour lesquels le miroir est stigmatique rigoureux et
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que }}dont l'image est confondue avec l'objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. des points doubles&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est applicable à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du miroir, &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; est applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C}&lt;/math&gt;, }}bien que la conjugaison soit rigoureuse ;

{{Al|5}}vérifier, en utilisant cette relation, que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double.

{{Al|5}}Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, sommet du miroir &lt;ref&gt; Mais évidemment pas sous la forme «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;» qui est indéterminée quand on l'applique à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, son abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; y étant nulle &lt;math&gt;\;\ldots&lt;/math&gt;&lt;/ref&gt;, pour lequel il y a conjugaison rigoureuse, &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}évaluer &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; puis &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}vérifier, sur cette dernière forme, que
&lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, vérifier, }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;«&lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double » et
&lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|Admettant que la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; reste applicable à &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, vérifier, }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;« il n'y a pas d'autres points doubles que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt;». 

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - points doubles.jpg|thumb|600px|Schémas de vérification du fait que, pour &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, le miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est stigmatique rigoureux et que ce sont des points doubles]]
{{Al|5}}Voir ci-contre les propriétés particulières d'un point objet en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot;/&gt; : 
* à gauche tout rayon d'un faisceau incident issu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave étant normal au miroir se réfléchit sur lui-même, donnant un ensemble de rayons réfléchis convergeant en un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, c.-à-d. prouvant que le miroir sphérique est stigmatique rigoureux pour son centre ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double ;
* à droite tout rayon d'un faisceau incident convergeant sur le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave se réfléchissant en suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal et l'ensemble des rayons réfléchis divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, cela prouve le stigmatisme rigoureux du miroir sphérique pour son sommet &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double.

{{Al|5}}Pour appliquer la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du miroir, bien que la conjugaison soit rigoureuse, il suffit de ne considérer que les rayons paraxiaux du faisceau incident issu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et d'ouverture quelconque &lt;ref&gt; Le fait que les autres rayons convergent également en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ne modifient en rien la convergence des rayons réfléchis provenant de rayons incidents paraxiaux.&lt;/ref&gt;, condition d'applicabilité de la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; l'image du point objet &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, ce dernier étant d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_o(C) = \overline{SC}_{\rightarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt;» et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C_i}\;&lt;/math&gt; l'image du point objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{C}&lt;/math&gt;, ce dernier }}&lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; d'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;», nous obtenons, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, }}en remplaçant &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{R}}&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(C_i)} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» d'où &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\Leftrightarrow&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\overline{SC_i}_{\rightarrow} = \overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot;&gt; En effet quand on change le sens d'orientation d'un axe les abscisses sont changées en leurs opposées.&lt;/ref&gt; prouvant que &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans ce cas, en remplaçant &lt;math&gt;\;\color{transparent}{V}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{-2}{\overline{R}}}&lt;/math&gt;, «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i(C_i)} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}}\;&lt;/math&gt;» d'où &lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i(C_i) = \overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{R}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\overline{SC_i}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\color{transparent}{\Leftrightarrow}&lt;/math&gt; }}&lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; se confond avec &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et par suite que «&lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est un point double ».

{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;forme permettant à l'abscisse objet d'être nulle&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; sous cette forme on vérifie que

{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» }}le point objet en &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(S) = 0\;&lt;/math&gt; &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» le point objet en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, }}a une image d'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i = 0&lt;/math&gt;, c.-à-d. &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|De &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = V}\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + V = \dfrac{1 + V\, p_o}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i = \dfrac{p_o}{1 + V\, p_o}}\;&lt;/math&gt;» le point objet en &lt;math&gt;\;\color{transparent}{S}&lt;/math&gt;, a }}une image confondue avec &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, prouvant que «&lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est bien un point double » ;

{{Al|5}}les points doubles &lt;math&gt;\;A_d\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_d\;&lt;/math&gt; étant tels que leurs abscisses images de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; s'écrivant «&lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \overline{SA_d}_{\leftarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\overline{SA_d}_{\rightarrow} = -p_d\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot; /&gt; avec «&lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \dfrac{p_d}{1 + V\, p_d}\;&lt;/math&gt;» obéissent à l'équation «&lt;math&gt;\;-p_d = \dfrac{p_d}{1 + V\, p_d}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. «&lt;math&gt;\;\left\lbrace\begin{array}{c}p_d = 0\;\;\; \text{ou}\\ 1 + V\, p_d = -1\end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;», &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|les points doubles &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_d}\;&lt;/math&gt; }}la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; solution donnant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; sommet du miroir et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|les points doubles &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_d}\;&lt;/math&gt; }}la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; équation conduisant à «&lt;math&gt;\;p_d = \dfrac{-2}{V} = \overline{R}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; centre du miroir ; &lt;center&gt;le centre et le sommet d'un miroir sphérique sont donc les seuls points doubles de ce dernier.&lt;/center&gt;}}

=== Caractère focal d'un miroir sphérique, position des foyers principaux objet et image, lien de la vergence et des distances focales objet et image ===

{{Al|5}}Vérifier, sur la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; d'un miroir sphérique, que ce dernier est nécessairement « focal » &lt;ref name=&quot;définition focal&quot;&gt; Un système « afocal » étant tel que le point à l'infini de l'axe optique principal est un point double, un système sera « focal » si le point à l'infini de l'axe optique principal est conjugué à un point de ce même axe optique principal à distance finie.&lt;/ref&gt; puis 

{{Al|5}}déterminer &lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la position du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point objet de l'axe optique principal ayant pour image le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;F_o\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; A_{i,\,\infty}\big]\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|déterminer }}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la position du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point image de l'axe optique principal ayant pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;&gt; C.-à-d. pour point objet.&lt;/ref&gt; le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; F_i\big]&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}quelle particularité ces deux points possèdent-ils en ce qui concerne leurs positions absolues d'une part et leur position relative d'autre part ?

{{Al|5}}Définissant &lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la distance focale objet comme l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du foyer principal objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Définissant }}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;la distance focale image comme l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;,

{{Al|5}}déterminer le lien entre vergence &lt;math&gt;\;V&lt;/math&gt;, distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; et distance focale image &lt;math&gt;\;f_i&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Un miroir sphérique est un « système focal » car le point à l'infini de l'axe optique principal n'est pas un point double &lt;ref name=&quot;caractère non double du point à l'infini de l'axe optique principal&quot;&gt; En effet nous avons établi que les seuls points doubles du miroir sphérique sont &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Points_pour_lesquels_la_conjugaison_du_miroir_sphérique_est_rigoureuse_et_points_doubles|points pour lesquels la conjugaison du miroir sphérique est rigoureuse et points doubles]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt;.
* Le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i(F_i) = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_i}&lt;/math&gt;, }}étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(A_{o,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_o(A_{o,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_i}&lt;/math&gt;, étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_{o,\, \infty}}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, }}on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(F_i)} - 0 = V\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} = \dfrac{1}{V} = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.
* Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt;  &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o(F_o) = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;br&gt;{{Transparent|Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_o}&lt;/math&gt;, }}étant l'antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;/&gt; du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i(A_{i,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i(A_{i,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|6}}{{Transparent|Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;\color{transparent}{F_o}&lt;/math&gt;, étant l'antécédent du point à l'infini &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_{i,\, \infty}}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, }}on en déduit &lt;math&gt;\;0 - \dfrac{1}{p_o(F_o)} = V\;&lt;/math&gt; soit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} = -\dfrac{1}{V} = \dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.
* Les positions géométriques respectives des foyers principaux objet et image étant telles que «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} = - \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et &lt;br&gt;le changement de sens d'algébrisation conduisant à &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\rightarrow} = -\overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conséquence du changement de sens d'orientation&quot; /&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\rightarrow} = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; c.-à-d. la &lt;u&gt;coïncidence des positions géométriques des foyers principaux objet et image&lt;/u&gt; &lt;ref&gt; Cette coïncidence n'est que géométrique, car ce sont des points d'espaces optiques différents, l'un est dans un espace objet et l'autre dans un espace image.&lt;/ref&gt; ;
* &lt;u&gt;leur position géométrique commune&lt;/u&gt; étant telle que «&lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} = \dfrac{\overline{R}}{2} = \dfrac{\overline{SC}_{\rightarrow}}{2}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; on vérifie qu'elle &lt;u&gt;coïncide avec le milieu du segment joignant le sommet et le centre du miroir&lt;/u&gt;.
{{Al|5}}&lt;u&gt;Notion de distances focales objet et image&lt;/u&gt; :
* la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; étant définie par «&lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à la vergence par «&lt;math&gt;\;f_i = \dfrac{1}{V} = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» ;
* la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; étant définie par «&lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à la vergence par «&lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{1}{V} = \dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt;» ; 
&lt;center&gt;on en déduit la relation «&lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;interprétation de la vergence&quot;&gt; Pratiquement « la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la valeur de l'invariant &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;», appliquée au couple de points conjugués &lt;math&gt;\;(A_{o,\, \infty}\, , \,F_i)\;&lt;/math&gt; on trouve &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} - 0\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|3}}{{Transparent|Pratiquement « la vergence &lt;math&gt;\;\color{transparent}{V}\;&lt;/math&gt; est la valeur de l'invariant &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\dfrac{1}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}}\;&lt;/math&gt;», }}appliquée au couple de points conjugués &lt;math&gt;\;(F_o\, , \,A_{i,\, \infty})&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;V = 0 - \dfrac{1}{f_o}&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|3}}pour mémoire, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant un point double, l'invariant en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; donne la valeur «&lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{\overline{SC}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = -\dfrac{2}{\overline{SC}_{\rightarrow}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;».&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Quelques propriétés découlant du caractère focal d'un miroir sphérique ===

==== Signe de la vergence suivant la nature concave ou convexe du miroir sphérique, caractère convergent ou divergent du miroir et nature réelle ou virtuelle des foyers principaux ====

{{Al|5}}Déterminer le signe de la vergence suivant la nature « concave » ou « convexe » du miroir sphérique puis

{{Al|5}}{{Transparent|Déterminer }}son caractère « convergent » ou « divergent » sachant qu'un système focal à « vergence positive » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement « négative »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est dit « convergent » &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement « divergent »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Déterminer }}la nature « réelle » ou « virtuelle » des foyers principaux.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; on en déduit que la vergence est de signe contraire au rayon de courbure algébrisé du miroir sphérique, ainsi :
* un miroir &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;nature de C&quot;&gt; Correspondant au caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un miroir concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement convexe&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, donc une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0&lt;/math&gt;, c'est un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; »,
* un miroir &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}_{\rightarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;nature de C&quot; /&gt;, donc une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0&lt;/math&gt;, c'est un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; ».
{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit la nature &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;réelle ou virtuelle&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; des foyers principaux objet et image suivant la nature &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;convergente ou divergente&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique :
* un miroir &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; étant convergent, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Transparent|un miroir concave étant convergent, }}la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;nature des foyers&quot;&gt; Pour un miroir concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement convexe&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; le caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; avec le fait que la position géométrique commune des foyers principaux est le milieu du segment joignant le centre et le sommet, entraîne le caractère réel &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;respectivement virtuel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; des foyers principaux objet et image.&lt;/ref&gt;,
* un miroir &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; étant divergent, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Transparent|un miroir convexe étant divergent, }}la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;nature des foyers&quot; /&gt;.}}

==== Démonstration de l'absence de conjugaison non rigoureuse du miroir sphérique (concave) pour le point objet à l'infini sur l'axe optique principal ====

{{Al|5}}En reprenant la démonstration faite dans la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss]] » plus haut dans cet exercice &lt;ref&gt; Plus exactement dans la solution des questions successives « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Établissement_de_la_relation_liant_θo,_θi_et_ω|établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω]] » et « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Évaluation_des_angles_θo,_θi_et_ω_en_fonction_des_abscisses_de_Ao,_Ai_et_C_repérées_relativement_à_H|évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; mais &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|En reprenant la démonstration }}avec &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; situé à l'infini &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ce qui correspond à &lt;math&gt;\;\theta_o = 0\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|En reprenant la démonstration }}en conservant les notations introduites dans « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|cette question]] » &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;à l'exception de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; qui sera noté &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot;&gt; Fonction de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; car ce point &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; hors condition de Gauss &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; en dépend effectivement &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c'est d'ailleurs, en ce qui concerne &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le but de cette question&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et de &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; qui sera noté &lt;math&gt;\;H(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, 

{{Al|5}}déterminer la position de &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point de l'axe optique principal par lequel passe le rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, de point d'incidence &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et 

{{Al|5}}vérifier que &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; dépendant effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|vérifier }}qu'il n'y a pas conjugaison rigoureuse du miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; pour le point situé à l'infini de l'axe optique principal.

{{Solution|contenu = &lt;center&gt;&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;355px&gt;
Miroir sphérique concave - absence stigmatisme rigoureux.jpg|Schéma de démonstration de l'absence de stigmatisme rigoureux d'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet à l'infini sur l'axe optique principal
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Montrons algébriquement qu'un miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; n'est pas rigoureusement stigmatique pour le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; et pour cela il suffit de montrer &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement }}qu'un rayon incident &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, de point d'incidence &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt;, repéré par l'angle &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; que fait le rayon incident avec &lt;math&gt;\;\overrightarrow{CI}(\omega)\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\; \cancel{\ll}\; 1\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Voir schéma ci-dessus.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement qu'un rayon incident &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\parallel}\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, }}donne un réfléchi qui recoupe l'axe optique principal en &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;dépendance de ω&quot; /&gt; dépendant effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; d'où &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Montrons algébriquement }}l'absence de stigmatisme rigoureux du miroir pour &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}l'angle d'incidence étant &lt;math&gt;\;i = -\omega\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet les angles sont alternes-internes, leurs mesures ont donc mêmes valeurs absolues mais &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; sur le schéma alors que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, l'angle de réflexion est donc &lt;math&gt;\;i' = -i = \omega\;&lt;/math&gt; d'après la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt; ; on en déduit alors «&lt;math&gt;\;\widehat{\left\lbrace\overrightarrow{H(\omega)S}, \overrightarrow{F_i(\omega)I(\omega)}\right\rbrace} = 2\; \omega\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; En effet l'angle que fait &lt;math&gt;\;\left[ F_i(\omega)I(\omega) \right]\;&lt;/math&gt; avec la partie incidente de l'axe optique principal et celui que fait le rayon réfléchi en &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt; avec la &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;I(\omega)\;&lt;/math&gt; à la partie réfléchie à l'axe optique principal sont alternes-internes, la mesure de la valeur absolue du 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; étant &lt;math&gt;\;\vert i \vert + \vert i' \vert = 2\;\vert \omega \vert\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la mesure de &lt;math&gt;\;\widehat{\left\lbrace\overrightarrow{H(\omega)S}, \overrightarrow{F_i(\omega)I(\omega)}\right\rbrace}\;&lt;/math&gt; sachant qu'il est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; sur le schéma tout comme &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; se détermine par &lt;math&gt;\;\tan(2\;\omega) = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Toutes les grandeurs étant positives sur le schéma.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}\, \cos(2\; \omega)}{\sin(2\; \omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \overline{H(\omega)I(\omega)} = CI(\omega)\; \sin(\omega) = R\; \sin(\omega)\\ \sin(2\; \omega) = 2\; \sin(\omega)\; \cos(\omega)\end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; et simplification par &lt;math&gt;\;\sin(\omega)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|18}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; se détermine par &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\tan(2\;\omega) = \dfrac{\overline{H(\omega)I(\omega)}}{\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}}}\;&lt;/math&gt;{{,}} &lt;math&gt;\color{transparent}{\Rightarrow}&lt;/math&gt; }}«&lt;math&gt;\;\overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{R\, \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}on peut alors évaluer «&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = \overline{CH(\omega)}_{\rightarrow} - \overline{F_i(\omega)H(\omega)}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, expression dans laquelle &lt;math&gt;\;\overline{CH(\omega)}_{\rightarrow} = R\; \cos(\omega)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; d'où «&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = R\; \cos(\omega) - \dfrac{R\, \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)} = R\; \dfrac{2\; \cos^2(\omega)- \cos(2\; \omega)}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou, sachant que &lt;math&gt;\;\cos(2\; \omega) = 2\; \cos^2(\omega) - 1&lt;/math&gt;, l'expression finale &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} = \dfrac{R}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; L'expression simple du résultat indique qu'il doit y avoir une méthode plus rapide pour sa détermination ; en effet les angles non algébrisés &lt;math&gt;\;\widehat{SCI(\omega)}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\widehat{CI(\omega)F_i(\omega)}\;&lt;/math&gt; étant égaux &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à &lt;math&gt;\;\vert \omega \vert\big)&lt;/math&gt;, le triangle &lt;math&gt;\;F_i(\omega)CI(\omega)\;&lt;/math&gt; est isocèle &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la hauteur issue de &lt;math&gt;\;F_i(\omega)\;&lt;/math&gt; est aussi médiatrice d'où, en notant &lt;math&gt;\;K(\omega)\;&lt;/math&gt; son pied, &lt;math&gt;\;CK(\omega) = \dfrac{CI(\omega)}{2} = \dfrac{R}{2}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\dfrac{CK(\omega)}{\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow}} = \cos(\omega)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\overline{CF_i(\omega)}_{\rightarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{CK(\omega)}{\cos(\omega)} = \dfrac{R}{2\; \cos(\omega)}\;&lt;/math&gt; ce qui est indéniablement plus rapide.&lt;/ref&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\Downarrow&lt;/math&gt;  &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; dépend effectivement de &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;br&gt;le miroir sphérique concave &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; n'est pas stigmatique rigoureux pour le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; de l'axe optique principal &lt;ref&gt; La démonstration de l'absence de stigmatisme rigoureux d'un miroir sphérique concave pour n'importe quel point objet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;autre que le centre et le sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal pourrait être faite en suivant une démarche analogue.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Aplanétisme approché d'un miroir sphérique sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On considère le miroir sphérique concave introduit à la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Démonstration_du_stigmatisme_approché_d'un_miroir_sphérique_concave_sous_conditions_de_Gauss|démonstration du stigmatisme approché d'un miroir sphérique concave sous conditions de Gauss]] » plus haut dans cet exercice et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|On considère }}un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_miroir_plan#Définition_d'un_objet_linéique_transverse|définition d'un objet linéique transverse]] » du chap.&lt;math&gt;12&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;support axe optique principal&quot;&gt; Ce qui signifie que l'axe optique principal a pour support &lt;math&gt;\;(A_oC)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché du miroir &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; C.-à-d. que, pour un point quelconque &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, avec la définition de l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;cet axe jouant le rôle d'axe optique principal pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est qualifié de secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\big)&lt;/math&gt;, les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; doivent être paraxiaux &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;peu inclinés relativement à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; et à point d'incidence restant proche du sommet secondaire &lt;math&gt;\;S_{M_o}&lt;/math&gt;, intersection de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; avec le miroir&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; 

{{Al|15}}{{Transparent|On considère un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o \neq C}\;&lt;/math&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché }}l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; admet une image « nette » &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;Nette&quot;&gt; L'image est qualifiée de « nette » car tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; ont une image ponctuelle &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; mais a priori &lt;ref&gt; C.-à-d. hors conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché, voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; &lt;br&gt;{{Al|20}}{{Transparent|On considère un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o \neq C}\;&lt;/math&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; admet une image }}ni « linéique » &lt;ref name=&quot;Linéique&quot;&gt; Linéique signifiant « rectiligne ».&lt;/ref&gt; ni « transverse ».

{{Al|5}}On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; est, quand l'objet n'est pas proche du miroir, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} S\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; est, }}quand l'objet est proche du miroir, vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq S\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|On suppose que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; est, }}ces deux exigences constituant les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt; pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; quelconque &lt;ref&gt; C'est cette façon qui a été vue en cours, &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant en effet le point de l'axe optique principal appartenant à la face d'entrée du miroir dans le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conditions_supplémentaires_de_Gauss_d'aplanétisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarque&lt;/u&gt; : Il existe deux exigences équivalentes pour définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; d'un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; quelconque &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;façon plus simple&quot;&gt; C'est cette façon que nous adopterons car elle conduit à une démonstration plus rapide de l'aplanétisme.&lt;/ref&gt; :
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Remarque : }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;si un objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir, il doit être vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)\;&lt;/math&gt; et 
&lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Remarque : }}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;si un objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, il doit être vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq C\big)&lt;/math&gt;. 

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un miroir sphérique concave pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du miroir et vu de ce centre sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; étant d'abord supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|nous considérons }}l'angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, n'étant pas nécessairement petit, &lt;br&gt;{{Al|5}}la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet est rendue plus aisée si on utilise la « relation de conjugaison de position &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|la question plus bas dans cet exercice]] » &lt;ref name=&quot;méthode moins aisée&quot;&gt; Il est possible de se contenter de la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; mais la méthode est alors moins aisée.&lt;/ref&gt; à savoir «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = -V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la vergence précédemment introduite ;

{{Al|5}}la démarche peut alors être décomposée en les étapes suivantes :
* montrer qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre)&quot;&gt; Voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre)]] » plus bas dans cet exercice.&lt;/ref&gt;, montrer alors que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|11}}{{Transparent|en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt;, }}vérifier que l'angle au centre associé est encore &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* conclure qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; peut être confondue avec un segment &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal c.-à-d. qu'elle est linéique transverse &lt;ref&gt; Il y a donc aplanétisme approché du miroir sphérique pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du miroir à condition qu'il soit vu de ce centre sous un petit angle.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; étant supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq}\; C\big)&lt;/math&gt;, avec l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* le caractère transverse de l'objet linéique &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la longueur &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; est plus grande que la longueur &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition des côtés triangle rectangle&quot;&gt; &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; étant l'hypoténuse du triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; rectangle en &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt; le côté adjacent à l'angle de mesure &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit plus précisément «&lt;math&gt;\;[CA_o] = [CB_o]\, \cos(\alpha) \simeq [CB_o] \left( 1 - \dfrac{\alpha^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; ou finalement «&lt;math&gt;\;[CA_o] \simeq [CB_o]\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;» prouvant, qu'à cet ordre, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ayant une abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;axe optique secondaire&quot;&gt; Cet axe optique secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en fait un axe optique principal relativement au point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, l'application de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre)&quot; /&gt; donne donc des points image &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; à abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)&lt;/math&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est assimilable, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, à un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;,
* l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant petit, on peut faire l'opération inverse de celle faite précédemment pour l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, c.-à-d. assimiler l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; à un segment choisi &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal de support &lt;math&gt;\,(CA_i)\,&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;justification choix&quot;&gt; Il s'agit effectivement d'un choix car le segment aurait pu être choisi &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à n'importe quel axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, linéique transverse ; &lt;center&gt;nous avons donc établi l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du miroir sphérique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique de pied non proche du centre du miroir&lt;/u&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un miroir sphérique concave pour un objet linéique transverse de pied proche du centre du miroir et vu du sommet de ce dernier sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; étant maintenant supposé proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}{{Transparent|L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}\;&lt;/math&gt; }}nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|5}}la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite l'utilisation de deux rayons paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;, point objet quelconque de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;paraxial - bis&quot;&gt; Le caractère paraxial étant indispensable pour satisfaire au stigmatisme approché du miroir pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, tous les rayons non paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; seront arrêtés par un diaphragme centré sur &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie aisément que les rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; sont deux candidats respectant la paraxialité, par contre le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oC\;&lt;/math&gt; pouvant ne pas l'être car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;et si tel était le cas il serait alors arrêté par le diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt;, nous ne l'utiliserons pas.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite }}de montrer que le point image &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;, défini comme l'intersection des deux rayons réfléchis, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite de montrer que le point image &lt;math&gt;\;\color{transparent}{M_i}&lt;/math&gt;, }}a pour projeté, sur l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, pour cela :
* déterminer l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; en fonction de la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|déterminer l'abscisse image de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\color{transparent}{p_i}\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_i}\;&lt;/math&gt; en fonction }}de l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;,
* déterminer la longueur algébrique &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx et Sy&quot;&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal, orienté dans le sens incident et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant porté par la représentation symbolique du miroir orienté vers le haut, l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant lui aussi orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer l'équation des rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot;&gt; L'abscisse de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est évidemment celle de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et son ordonnée sera notée &lt;math&gt;\;\varepsilon \times\;&lt;/math&gt; l'ordonnée de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\varepsilon\;&lt;/math&gt; variant entre &lt;math&gt;\;0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;1&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}ici intervient une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; condition de Gauss d'aplanétisme approché &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; qui assure que le point &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est suffisamment proche de l'axe optique principal pour que deux rayons incidents judicieusement choisis travaillent dans les conditions de stigmatisme approché.&lt;/ref&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx' et Sy&quot;&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx'}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal, orienté dans le sens réfléchi &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;donc de sens contraire à celui de l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\big)\;&lt;/math&gt; et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant le même que précédemment à savoir porté par la représentation symbolique du miroir et orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer les équations des rayons réfléchis, puis leur intersection &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt; ;
* vérifier que l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal est égale à l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, 
* conclure à l'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied proche du centre du miroir.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - aplanétisme.jpg|thumb|560px|Schéma positionnant un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied proche du centre d'un miroir sphérique concave pour démontrer l'aplanétisme approché du miroir pour cet objet]]
{{Al|5}}Soit &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique concave &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; de ce dernier sous un angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; correspondant à la condition de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché  &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; précitée ; 
# on détermine d'abord l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, image du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, par utilisation de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; du miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet)&quot;&gt; Voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Conclusion_:_stigmatisme_approché_du_miroir_sphérique_(concave)_pour_le_point_objet_Ao_et_relation_de_conjugaison_(approchée)_de_position_de_Descartes_(avec_origine_au_sommet)|conclusion : stigmatisme approché du miroir sphérique (concave) pour le point objet A&lt;sub&gt;0&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet)]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; de vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{1}{f_i}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant la distance focale image du miroir d'où : &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{1}{f_i} \Rightarrow \dfrac{1}{p_i} = \dfrac{1}{p_o} + \dfrac{1}{f_i} = \dfrac{f_i + p_o}{p_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# «&lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt;» et «&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt;» avec «&lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; non algébrisé &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt;», on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\beta) =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{p_o}\;&lt;/math&gt; d'où, avec &lt;math&gt;\;\tan(\beta) \simeq \beta\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt;, &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} \simeq -\beta\; p_o\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx et Sy&quot; /&gt;, le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = \varepsilon\, \overline{A_oB_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_S}{x_{M_o} - x_S} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o} = -\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_S = -\varepsilon\, \beta \left( x - x_S \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;vérification signes&quot;&gt; On vérifie sur le schéma que, lorsque &lt;math&gt;\;x\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;y\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt; et passant par le foyer principal objet du miroir sphérique &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{F_o} = f_o = -f_i\, , \, y_{F_o} = 0)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_{F_o}}{x_{M_o} - x_{F_o}} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_{F_o} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left( x - x_{F_o} \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement «&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left( x + f_i \right)\;&lt;/math&gt;» 
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;définition de Sx' et Sy&quot; /&gt; le rayon réfléchi sur le miroir du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; étant de direction symétrique de celle de ce dernier relativement à l'axe optique principal est de même pente &lt;math&gt;\;-\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi a une pente opposée à celle du rayon incident dans le repère &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; mais, quand on passe dans le repère &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; correspondant à une inversion du sens de l'axe des abscisses sans que celui de l'axe des ordonnées ne soit changé, la pente doit être multipliée par un facteur &lt;math&gt;\;(-1)\;&lt;/math&gt; d'où le rayon réfléchi a une pente identique à celle du rayon incident &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison étant que les pentes sont définies dans deux repères différents&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; d'où l'équation du rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x'\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;vérification signes bis&quot;&gt; On vérifie bien sur le schéma que, lorsque &lt;math&gt;\;x\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;y\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}le rayon réfléchi sur le miroir du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; étant, à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur le miroir, &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, son équation nécessite de déterminer au préalable l'ordonnée de &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;x_{I} = 0\;&lt;/math&gt; dans l'équation du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; établie plus haut soit &lt;math&gt;\;y(I) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + f_i} \left[ x(I) + f_i \right] = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt; d'où l'équation du rayon réfléchi correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ; &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx'},\, \overrightarrow{Sy})}\;&lt;/math&gt;, }}l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfléchis a pour abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o\, f_i}{p_o + f_i} = -\varepsilon\, \beta\, {x'}_{\!M_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;{x'}_{\!M_i} = \dfrac{p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
# l'abscisse «&lt;math&gt;\;{x'}_{\!M_i} = \dfrac{p_o\, f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» de l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfléchis est identique à l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{f_i}{p_o + f_i}\;&lt;/math&gt;» du point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; ;
# le projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal se superposant à &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, on conclut à l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du miroir sphérique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de pied proche du centre du miroir&lt;/u&gt;.}}

==== Relation de conjugaison (approchée) de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) ====

[[File:Miroir sphérique - symbole.jpg|thumb|550px|Représentation symbolique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;sans les foyers&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à gauche&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et d'un miroir sphérique convexe &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à droite&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;]]
{{Al|5}}Dès lors qu'un miroir sphérique est utilisée sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme et d'aplanétisme approchés &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt;, l'usage est de représenter ce miroir sous une forme symbolique dans laquelle figurent 
* l'axe optique principal, 
* le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, 
* les foyers principaux objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;non représentés ci-contre &lt;ref name=&quot;Foyers à ajouter&quot;&gt; La position des foyers principaux sont à ajouter au milieu du segment &lt;math&gt;\;\left[ CS \right]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, 
* le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et 
* la partie de miroir &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal &lt;ref&gt; Cette partie de miroir &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal est terminée par des bords inclinés vers &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, ainsi un miroir concave à centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; réel a des bords inclinés vers la gauche &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. vers l'espace objet réel&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; et un miroir convexe à centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; virtuel a des bords inclinés vers la droite &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. vers l'espace objet virtuel&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, partie de miroir sur laquelle est rappelée l'algébrisation physique de l'axe optique principal.
{{clr}}
[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|400px|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; avec origine en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; pour un miroir sphérique concave]]
{{Al|5}}Sur le schéma ci-contre on a construit l'image linéique transverse &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\neq C\;&lt;/math&gt; en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;l'un passant que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir et qui se réfléchit sur lui-même &lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi doit être issu du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; du rayon incident et passer par l'image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; par le miroir c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même.&lt;/ref&gt;, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}&lt;math&gt;\succ\;&lt;/math&gt;l'autre passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir et qui se réfléchit en obéissant à la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réflexion &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;attention à l'utilisation de 2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion sur la représentation symbolique d'un miroir sphérique&quot;&gt; Attention le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir est le seul point d'incidence en lequel on peut appliquer la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes en travaillant sur la représentation symbolique du miroir car c'est le seul point pour lequel la direction de cette représentation symbolique se confond avec la direction réelle du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;autrement dit c'est le seul point où la normale réelle est &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à la représentation symbolique, par exemple le rayon incident &lt;math&gt;\;B_oC\;&lt;/math&gt; qui se confond avec la normale réelle du miroir en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; n'est pas &lt;math&gt;\;\perp\;&lt;/math&gt; à la représentation symbolique du miroir en &lt;math&gt;\;I\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}le point d'intersection de ces deux rayons réfléchis étant le point de convergence &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; de tous les rayons réfléchis correspondant à tous les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Car le miroir est stigmatique approché pour &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}il suffit de projeter orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal pour obtenir le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;miroir aplanétique approché pour AoBo&quot;&gt; Car le miroir est aplanétique approché pour &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}En comparant les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_oB_oS&lt;/math&gt;, déterminer le grandissement transverse par le miroir sphérique concave de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; défini par «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt;» en fonction des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\\ p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ; 

{{Al|5}}la relation établie ci-dessus définit la relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; pour tout objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot;&gt; Elle ne peut évidemment pas s'appliquer sous la forme indiquée pour &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; car elle correspondrait à une forme indéterminée mais&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie, dans la solution de la sous question suivante, qu'elle s'applique sous cette forme pour &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt;, elle caractérise quantitativement la propriété d'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Bien que démontrée sur un miroir sphérique concave elle reste applicable à un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Ayant exposé la construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; dans l'énoncé de la question &lt;math&gt;\;\big\{&lt;/math&gt;pour rappel on positionne &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondant à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit sur lui-même et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;attention à l'utilisation de 2ème loi de Snell - Descartes de la réflexion sur la représentation symbolique d'un miroir sphérique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Il est déconseillé de choisir ce rayon dans les constructions futures demandées car peu pratique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'angle &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; devant être mesuré et reporté symétriquement par rapport à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; ici nous le choisissons car il est utilisé dans la démonstration qui suit.&lt;/ref&gt;, puis on projette orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal pour obtenir &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;miroir aplanétique approché pour AoBo&quot; /&gt;&lt;math&gt;\big\}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt;», on le détermine en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(-i)\;&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* «&lt;math&gt;\;\tan(i) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;i\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\Bigg[&lt;/math&gt;comme &lt;math&gt;\;\vert i \vert\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(i) \simeq i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i \simeq \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;&lt;math&gt;\Bigg]&lt;/math&gt;,
* «&lt;math&gt;\;\tan(-i) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;math&gt;\;(-i)\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq S\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iS&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\Bigg[&lt;/math&gt;comme &lt;math&gt;\;\vert i \vert\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(-i) \simeq -i\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;-i \simeq -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;i \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;&lt;math&gt;\Bigg]&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant les deux expressions de &lt;math&gt;\;i&lt;/math&gt;, on en déduit «&lt;math&gt;\;\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}} \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; d'où «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} \simeq \dfrac{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» c.-à-d. la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de Descartes&lt;/u&gt; &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;&lt;u&gt;avec origine au sommet&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq S\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\\ p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = f_i&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant &lt;math&gt;\;G_t(A_{o,\,\infty}) = 0\;&lt;/math&gt;,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;p_o = f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant &lt;math&gt;\;G_t(F_o)\;&lt;/math&gt; infini.}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Le miroir sphérique n'est stigmatique rigoureux que pour le pied &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique, pour tous les autres points objet constituant ce dernier on suppose le stigmatisme approché du miroir c.-à-d. l'utilisation de rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\; (\neq C)\; \in A_oB_o\;&lt;/math&gt; paraxiaux &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;ce qui peut être réalisé en pratique avec un diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; collé contre le miroir&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Considérant }}la condition d'aplanétisme approché du miroir pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* vérifier, par construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i&lt;/math&gt;, qu'elle est symétrique de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal et 
* comparer au résultat donné par l'application de la relation de conjugaison de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; sous question précédente pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt; en considérant &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;. 
{{Al|5}}Considérant maintenant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; L'objet, collé contre le miroir sphérique, de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;, l'axe optique principal ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, ne peut être rigoureusement linéique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. rectiligne&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; car il suit la courbure du miroir mais, s'il est vu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un petit angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, on peut confondre l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le segment correspondant lui étant tangent à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, raison pour laquelle l'objet est qualifié de « linéique transverse » ; &lt;br&gt;{{Al|3}}le miroir sphérique est stigmatique rigoureux pour tous les points de l'objet linéique car tous ces points, étant sur le miroir, jouent le rôle de sommet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;secondaire&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; pour lequel le miroir est stigmatique rigoureux.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Considérant }}la condition d'aplanétisme approché du miroir pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\alpha \ll 1\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Qui est aussi la condition pour que l'objet collé sur le miroir puisse être considéré comme linéique.&lt;/ref&gt;, 
* vérifier que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, le caractère linéique transverse de l'objet entraînant celui de l'image et 
* en déduire la valeur du grandissement transverse &lt;math&gt;\;G_t(S)\;&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - grandissement transverse au centre.jpg|thumb|400px|Construction de l'image d'un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied au centre d'un miroir sphérique concave]]
{{Al|5}}Le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique concave ci-contre en étant un point double conjugué rigoureux, un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;CB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; a pour image, par le miroir, une image de pied &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, de plus, comme le miroir sphérique est aplanétique approché pour tout objet de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, l'image de &lt;math&gt;\;CB_o&lt;/math&gt;, notée &lt;math&gt;\;CB_i&lt;/math&gt;, est linéique transverse ; &lt;br&gt;{{Al|5}}pour obtenir cette dernière il suffit de choisir pour rayon incident issu de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|pour obtenir cette dernière il suffit de choisir }}le rayon passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal et recoupe le plan transverse passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; au point &lt;math&gt;\;B_i&lt;/math&gt;, symétrique de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal d'où &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\overline{CB_i} = -\overline{CB_o}\;&lt;/math&gt;» et par suite &lt;br&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(C) = -1\;&lt;/math&gt;» ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'application de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou relation de conjugaison de grandissement transverse&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; établie dans la solution de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; sous question précédente pour un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot; /&gt; nous conduit, en considérant &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;, à «&lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{\overline{SC}_{\leftarrow}}{\overline{SC}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, soit, avec &lt;math&gt;\;\overline{SC}_{\leftarrow} = -\overline{SC}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;, &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(C) = -1\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Le centre est le seul point de l'espace objet d'un miroir sphérique en lequel un objet linéique transverse positionné en ce point admet une image linéique transverse inversée de même taille.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;
{{clr}}
{{Al|5}}Tous les points du miroir sphérique étant des points doubles de ce dernier &lt;ref&gt; Chaque point du miroir jouant le rôle de sommet pour l'axe optique principal passant par ce point, c'est effectivement un point double.&lt;/ref&gt;, un objet collé sur le miroir est donc sa propre image ; &lt;br&gt;{{Al|5}}dans la mesure où l'objet est de petite taille, on peut négliger sa courbure et le considérer comme linéique transverse, son image étant alors également linéique transverse ; &lt;center&gt;comme «&lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt;» on en déduit, par définition, &lt;br&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(S) = +1\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Le sommet &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;et plus généralement tout point de la surface réfléchissante sphérique&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est le seul point de l'espace objet d'un miroir sphérique en lequel un objet linéique transverse positionné en ce point admet une image linéique transverse droite de même taille.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Construction de l'image par un miroir sphérique d'un objet linéique transverse ====

{{Al|5}}&lt;u&gt;Définitions préliminaires&lt;/u&gt; : On appelle plan focal objet le plan transverse passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}plan focal image le plan transverse passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle axe optique secondaire tout axe passant par le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; du miroir, il possède une partie incidence contenue dans l'espace objet réel se réfléchissant sur elle-même pour donner sa partie émergente contenue dans l'espace image réelle ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal objet et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal image.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés&lt;/u&gt; : Justifier les propriétés des foyers secondaires objet et image associés à un  axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; :
# le foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour image le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\big]&lt;/math&gt;,
# le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés des foyers secondaires associés à un axe optique secondaire&lt;/u&gt; :
# propriété du foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet linéique transverse &lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; contenu dans le plan focal objet et de pied &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, objet noté &lt;math&gt;\;F_o\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ayant pour image le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et l'image étant linéique transverse, le point &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; a une image également située à l'infini sur la partie réfléchie de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; se réfléchit sur lui-même, les parties incidente et réfléchie constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit effectivement «&lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\;&lt;/math&gt;»
# propriété du foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet dont l'image associée est contenue dans le plan focal image et de pied &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, image notée &lt;math&gt;\;F_i\varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; ayant pour antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et le miroir étant aplanétique, le point &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; a un antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot; /&gt; également situé à l'infini sur la partie incidente de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; En effet le rayon réfléchi issu de &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; s'est réfléchi sur lui-même, les parties incidente et réfléchie constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, soit effectivement «&lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{M}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt;».&lt;/center&gt;}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; réel, de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; séparé du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un miroir sphérique concave d'une distance supérieure au rayon non algébrisé du miroir, construire son image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; par le miroir de deux façons différentes :
# en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisis parmi les trois suivants : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;,
# en considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;un seul rayon incident suffit&quot;&gt; Un seul rayon incident suffit car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; appartenant à l'axe optique principal son image est sur cet axe.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;choisi parmi les deux suivants : passant par &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Refaire les constructions précédentes avec un miroir convexe.

{{Solution|contenu = [[File:Miroir sphérique concave - construction image.jpg|thumb|450px|Construction de l'image par un miroir sphérique concave d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt; : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal]]
{{Al|5}}&lt;math&gt;\;1.\;&lt;/math&gt;En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les trois suivants &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;voir schéma ci-contre à droite&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; : &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant sur lui-même, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; foyer principal objet et se réfléchissant parallèlement à l'axe optique principal, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal et se réfléchissant en passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{1.}\;&lt;/math&gt;En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{B_o}\;&lt;/math&gt; }}l'image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection des deux rayons réfléchis correspondant aux deux rayons incidents choisis, &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtient en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.
[[File:Miroir sphérique concave - construction image - bis.jpg|thumb|left|450px|Construction de l'image par un miroir sphérique concave d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant un des deux incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire]]
{{Al|5}}&lt;math&gt;\;2.\;&lt;/math&gt;En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les deux suivants &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;voir schéma ci-contre à gauche&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; : &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par un foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection du rayon incident et du plan focal objet&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant parallèlement à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c.-à-d., pour la partie incidente &lt;math&gt;\;C\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, la partie réfléchie se superposant à la partie incidente mais orientée en sens contraire&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|10}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire a priori quelconque &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et se réfléchissant en passant par le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et du plan focal image&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|&lt;math&gt;\;\color{transparent}{2.}\;&lt;/math&gt;En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\color{transparent}{A_o}\;&lt;/math&gt; }}l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection d'un des rayons réfléchis correspondant au rayon incident choisi et de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; s'obtient comme intersection de l'axe optique secondaire passant par &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et du plan transverse passant par &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;.
{{clr}}
{{Al|5}}Ci-dessous les constructions refaites sur un miroir sphérique convexe, en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; à gauche, &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Ci-dessous les constructions refaites sur un miroir sphérique convexe, }}en utilisant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et la notion de foyers secondaires objet ou image à droite :
&lt;center&gt;
&lt;gallery mode=&quot;packed&quot; heights=&quot;285px&gt;
Miroir sphérique convexe - construction image.jpg|Construction de l'image par un miroir sphérique convexe d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt; : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal
Miroir sphérique convexe - construction image - bis.jpg|Construction de l'image par un miroir sphérique convexe d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; utilisant un des deux incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) sous conditions de Gauss ===

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}On repère maintenant les points objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; et
* l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ;
{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet)&quot; /&gt; et par changement d'origine, &lt;br&gt;{{Al|5}}établir que la relation de conjugaison de position &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; s'écrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}} - \dfrac{1}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = -V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes de position avec origine en C&quot;&gt; Cette relation est applicable à tout point objet &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, le cas &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt; conduisant à une forme indéterminée.&lt;/ref&gt; ou «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = -V\;&lt;/math&gt;» avec &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; vergence du miroir.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; utilisent &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; ou un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe 
optique principal :
* l'abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SC}_{\rightarrow} + \overline{CA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou «&lt;math&gt;\;p_o = \overline{R} + \pi_o\;&lt;/math&gt;» et
* l'abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; est liée à son abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SC}_{\leftarrow} + \overline{CA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt; ou «&lt;math&gt;\;p_i = -\overline{R} + \pi_i\;&lt;/math&gt;» ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet)&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{-2}{\overline{R}}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i - \overline{R}} - \dfrac{1}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{(\pi_o + \overline{R}) - (\pi_i - \overline{R})}{(\pi_i - \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R})} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot;&gt; Quand on a l'égalité entre deux fractions &lt;math&gt;\;\dfrac{a}{b} = \dfrac{c}{d}\;&lt;/math&gt; les grandeurs &lt;math&gt;\;(a\, ,\, d)\;&lt;/math&gt; sont appelées « extrêmes » et &lt;math&gt;\;(b\, ,\, c)\;&lt;/math&gt; « moyens », l'égalité des deux fractions étant équivalente à &lt;math&gt;\;a \; d = b \; c\;&lt;/math&gt; c.-à-d. à l'égalité du produit des extrêmes et celui des moyens &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;on parle encore de l'égalité des produits en croix&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;-2\, (\pi_i - \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R}) = (\pi_o - \pi_i + 2\, \overline{R})\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Leftrightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;-2\, \pi_o\, \pi_i + 2\, \overline{R}\, \pi_o - 2\, \overline{R}\, \pi_i + 2\, \overline{R}^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\pi_o\, \overline{R} - \pi_i\, \overline{R} + 2\, \overline{R}^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;-2\, \pi_o\, \pi_i + \overline{R}\, \pi_o - \overline{R}\, \pi_i = 0\;&lt;/math&gt; ou «&lt;math&gt;\;\overline{R}\, \pi_o - \overline{R}\, \pi_i = 2\, \pi_o\, \pi_i\;&lt;/math&gt;» et enfin, en divisant les deux membres de l'équation par &lt;math&gt;\;\pi_o\, \pi_i\, \overline{R}\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;C.N.&quot;&gt; Cela nécessite que &lt;math&gt;\;\pi_o \neq 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i \neq 0\;&lt;/math&gt; c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \neq C&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison en étant que l'on cherche à établir une équation faisant intervenir des inverses de longueur à partir d'une équation comportant des produits de deux longueurs&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt;&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;&lt;u&gt;avec origine au centre&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; s'écrit donc &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = -V\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du miroir ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS}_{\rightarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS}_{\leftarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}} = -V&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec «&lt;math&gt;\;V = \dfrac{-2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; vergence du miroir sphérique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;concave&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; » et «&lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;
}}

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|400px|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; avec origine en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; pour un miroir sphérique concave]]

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet)&quot;&gt; Voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_(approchée)_de_grandissement_transverse_de_Descartes_(avec_origine_au_sommet)|relation de conjugaison (approchée) de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet)]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; et par changement d'origine, &lt;br&gt;{{Al|5}}établir la relation de conjugaison de grandissement transverse &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes de grandissement transverse avec origine en C&quot;&gt; Cette relation est applicable à tout objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C&lt;/math&gt;, le cas &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt; conduisant à une forme indéterminée.&lt;/ref&gt;. 

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement cette relation.

{{clr}}
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet)&quot; /&gt; «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot;&gt; Applicable en tout point &lt;math&gt;\;A_o \neq S&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|La démonstration se fait }}en faisant le changement d'origines exposé dans la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre)]] » plus haut dans cet exercice «&lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \pi_o + \overline{R} \\ p_i = \pi_i - \overline{R} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt;» soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i - \overline{R}}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}} - 1}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} + 1} = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}} \left[ 1 - \dfrac{\overline{R}}{\pi_i} \right]}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} \left[ 1 + \dfrac{\overline{R}}{\pi_o} \right]} = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}} \left[ \dfrac{1}{\overline{R}} - \dfrac{1}{\pi_i} \right]}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} \left[ \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_o} \right]} = -\dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}}}\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Le but de cette avant dernière transformation étant de faire apparaître des inverses de longueur comme celles de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o}&lt;/math&gt; &lt;math&gt;= \dfrac{2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;», voir la solution de la question « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_(ou_1ère_relation_de_conjugaison)_de_Descartes_(avec_origine_au_centre)|relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre)]] » plus haut dans cet exercice.&lt;/ref&gt; &lt;math&gt;\Bigg[&lt;/math&gt;en effet la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\pi_o} = \dfrac{2}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre)&quot; /&gt; se réécrit «&lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\pi_i} - \dfrac{1}{\overline{R}} = \dfrac{1}{\pi_o} + \dfrac{1}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt;» d'où la simplification&lt;math&gt;\Bigg]&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;approchée&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;u&gt;de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt;&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;&lt;u&gt;avec origine au centre&lt;/u&gt;&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; s'écrit &lt;center&gt;«&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt;» &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du miroir ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;math&gt;\;(&lt;/math&gt;avec origine au centre&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS}_{\rightarrow} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS}_{\leftarrow} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où «&lt;math&gt;\;G_t(A_o) =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-(-1) = +1\;&lt;/math&gt;».&lt;/ref&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec «&lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace\;&lt;/math&gt;» &lt;ref name=&quot;orientation de l'axe optique principal d'un système catadioptrique&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit sur lui-même et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction symétrique par rapport à l'axe optique principal, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot;&gt; Les angles précités étant non algébrisés.&lt;/ref&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iC\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre&quot;&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i}) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_i}_{\leftarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre bis&quot;&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq C\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iC&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}} = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au centre)&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{CA_i}_{\leftarrow}}{\overline{CA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq C\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\pi_o = \overline{CA_o}_{\rightarrow}\\ \pi_i = \overline{CA_i}_{\leftarrow} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\pi_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = f_i + \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\pi_o = f_o - \overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Newton sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On repère maintenant le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du miroir sphérique et le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du même miroir sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Newton de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\; \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\; \overline{F_oA_o}_{\rightarrow} = \overline{SF_i}_{\leftarrow}\; \overline{SF_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot;&gt; Applicable pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}&lt;/math&gt;, ces cas conduisant à une forme indéterminée.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;\sigma_i \; \sigma_o = f_i\; f_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relations de conjugaison communes miroir - lentille&quot;/&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; distances focales image et objet du miroir.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Newton utilisent &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal :
* l'abscisse objet de Newton du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} = \overline{SF_o}_{\rightarrow} + \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = f_o + \sigma_o = -f_i + \sigma_o\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} = \overline{SF_i}_{\leftarrow} + \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = f_i + \sigma_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Newton en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{p_i} - \dfrac{1}{p_o} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{f_i} = -\dfrac{1}{f_o}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{1}{\sigma_i + f_i} - \dfrac{1}{\sigma_o - f_i} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{(\sigma_o - f_i) - (\sigma_i + f_i)}{(\sigma_i + f_i)\, (\sigma_o - f_i)} = \dfrac{1}{f_i}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;(\sigma_i + f_i)\, (\sigma_o - f_i)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;= (\sigma_o - \sigma_i - 2\, f_i)\, f_i\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i + f_i\, \sigma_o - f_i\, \sigma_i - f_i^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\sigma_o\, f_i - \sigma_i\, f_i - 2\, f_i^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = -f_i^2\;&lt;/math&gt; et enfin, sachant que &lt;math&gt;\;f_o = -f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On remplacera une seule fois &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;-f_o\;&lt;/math&gt; pour obtenir une forme symétrique de la relation.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le foyer principal objet du miroir &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt; en effet si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal et on obtient une forme indéterminée avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\infty\big)&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS}_{\rightarrow} = -f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS}_{\leftarrow} = -f_i\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i = -f_o = -\dfrac{\overline{R}}{2}\;&lt;/math&gt; distance focale image du miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}\\ \sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Miroir sphérique - grandissement transverse Newton.jpg|thumb|Schéma de démonstration des deux formes de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton pour un miroir sphérique concave]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton &lt;ref name=&quot;deux formes de grandissement transverse de Newton&quot;&gt; Cette relation a deux formes possibles suivant qu'elle est exprimée en fonction de l'abscisse objet de Newton et de la distance focale objet ou en fonction de l'abscisse image de Newton et de la distance focale image.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt;.

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement les deux formes de cette relation.

{{clr}}

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \sigma_o - f_i \\ p_i = \sigma_i + f_i \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\sigma_i + f_i}{\sigma_o - f_i} = \dfrac{\sigma_i \left( 1 + \dfrac{f_i}{\sigma_i} \right)}{(-f_i) \left( 1 - \dfrac{\sigma_o}{f_i} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître, au numérateur et au dénominateur, deux grandeurs égales découlant de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_i\, f_o = -f_i^2 \Leftrightarrow \dfrac{\sigma_i}{f_i} = -\dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;1 + \dfrac{\sigma_i}{f_i} = 1 - \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{\sigma_i}{f_o}&lt;/math&gt; ; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{\sigma_i}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot;&gt; Applicable en tout point objet ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du miroir, on vérifie aisément que cette forme de relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS}_{\rightarrow} = -f_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;resp. &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS}_{\leftarrow} = -f_i\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = +1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}comme la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton s'écrivant &lt;math&gt;\;\sigma_i\, \sigma_o = f_i\, f_o\;&lt;/math&gt; est équivalente à &lt;math&gt;\;\dfrac{\sigma_i}{f_o} = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit aisément la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o} = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;objet linéique transverse&quot; /&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfléchis correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui se réfléchit parallèlement à l'axe optique principal et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; parallèle à l'axe optique principal qui se réfléchit en passant par &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;KF_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_iA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer bis&quot; &gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_i \neq F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas le point à l'infini de l'axe optique principal, pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS}) = \dfrac{\overline{SK}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SK}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SK} = \overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_iS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}} = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{F_iA_i}_{\leftarrow}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\sigma_i}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}_{\leftarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Al|5}}de même le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;HF_oS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_oA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer&quot;&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS}) = \dfrac{\overline{SH}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SH}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_o}_{\rightarrow} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SH} = \overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS}) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_oS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}} = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{SF_o}_{\rightarrow}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un miroir sphérique (concave) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{SF_i}_{\leftarrow}}{\overline{F_oA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{f_i}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}_{\rightarrow}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\sigma_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = 0\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de Lagrange - Helmholtz sous conditions de Gauss ===

[[File:Miroir sphérique - grandissement angulaire.jpg|thumb|Schéma de détermination du grandissement angulaire en repérage de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine en S) pour un miroir sphérique concave]]

==== Expression de Descartes (avec origine au sommet) du grandissement angulaire d'un pinceau incident issu d'un point objet ====

{{Al|5}}On rappelle que le grandissement angulaire d'un pinceau lumineux incident issu d'un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;, de direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; avec la partie incidente de l'axe optique principal, le pinceau se réfléchissant sur le miroir en convergeant vers le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;, avec une direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; avec la partie réfléchie de l'axe optique principal, est défini selon &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles petits&quot;&gt; Les angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; sont de valeur absolue petite c.-à-d. &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ;

{{Al|5}}en utilisant le schéma ci-contre, établir l'expression du grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet), respectivement &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}_{\rightarrow}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}_{\leftarrow}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'expression du grandissement angulaire a été établie en utilisant un miroir sphérique concave mais elle reste applicable pour un miroir sphérique convexe.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}On détermine le grandissement angulaire par évaluation de
&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;tous deux &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; sur la figure ci-dessus&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles &lt;math&gt;\;A_oIS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iIS\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;l'angle
&lt;math&gt;\;\widehat{SA_iI}\;&lt;/math&gt; étant égal à &lt;math&gt;\;\theta_i\big]&lt;/math&gt; soit :
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_o}_{\rightarrow}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}&lt;/math&gt; ;
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_i}_{\leftarrow}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = \dfrac{\overline{SI}}{p_i}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq
\dfrac{\overline{SI}}{p_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on en déduit &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{\dfrac{\overline{SI}}{p_i}}{-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{SI}&lt;/math&gt;, l'expression souhaitée du &lt;center&gt;grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Établissement de la relation de Lagrange - Helmholtz ====

{{Al|5}}Á l'aide des relations de conjugaison de grandissement transverse de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) et de l'expression du grandissement angulaire dans le même repérage, vérifier la relation de Lagrange - Helmholtz &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;G_t(A_o)\; G_a(A_o) = -1\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Cette relation est différente de celle que l'on trouvera dans le chapitre suivant sur les lentilles minces, pour une lentille mince dans laquelle il n'y a aucune réflexion, la relation de Lagrange - Hemholtz sera &lt;math&gt;\;G_t(A_o)\; G_a(A_o) = +1&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Connaissant le grandissement transversal donné par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;ref name=&quot;Descartes&quot; /&gt; (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) \simeq \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; et l'expression du grandissement angulaire précédemment trouvée &lt;math&gt;\;G_a(A_o) \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;, on en déduit le lien entre grandissements angulaire et transversal indépendant de la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_a(A_o)\; G_t(A_o) \simeq -\dfrac{p_o}{p_i}\; \dfrac{p_i}{p_o} = -1\;&lt;/math&gt; ce qui constitue la relation de Lagrange - Helmholtz cherchée &lt;ref&gt; Il s'agit de la même relation de Lagrange - Helmholtz que celle explicitée pour un miroir plan mais contrairement à cette dernière dans laquelle les grandissements transverse et angulaire valent respectivement &lt;math&gt;\;+1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;-1\;&lt;/math&gt; quelle que soit la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, dans un miroir sphérique les grandissements transverse et angulaire dépendent explicitement de la position de l'objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, plus la valeur absolue du grandissement transverse est grande plus celle du grandissement angulaire est petite.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

== Stigmatisme et aplanétisme approchés d'un dioptre sphérique sous conditions de Gauss ==

{{Al|5}}Pour être défini, un dioptre sphérique nécessite la connaissance de :
* sa nature « concave » ou « convexe », 
* son centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; (centre de courbure de la surface sphérique dioptrique &lt;ref&gt; Si le dioptre est « concave », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est réel, et si le dioptre est « convexe », &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est virtuel.&lt;/ref&gt;),
* son rayon de courbure (non algébrisé) &lt;math&gt;\;R\;&lt;/math&gt; (rayon de courbure de la surface sphérique dioptrique),
* l'axe optique principal dont la partie incidente (ou son prolongement) passe par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; (point objet dont on étudiera l'image éventuelle),
* son sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; (intersection de l'axe optique principal et de la surface dioptrique) et
* l'indice de l'espace objet réel &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; ainsi que celui de l'espace image réelle &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Nous adoptons l'algébrisation physique de l'axe optique principal &lt;ref name=&quot;orientation axe opt. princ. dioptre&quot;&gt; Supposant l'axe optique principal horizontal, l'espace objet réel étant situé à gauche du dioptre, la partie incidente de l'axe optique principal est orientée dans le sens &lt;math&gt;\;\rightarrow&lt;/math&gt; et l'espace image réelle étant alors situé à droite du dioptre, la partie émergente est orientée dans le même sens &lt;math&gt;\;\rightarrow&lt;/math&gt; ; il est donc inutile de préciser en indice le sens de l'orientation de l'axe optique principal contrairement à ce qui doit être fait dans le cas d'un miroir sphérique.&lt;/ref&gt; et, pour unifier l'étude des dioptres sphériques, algébrisons le rayon de courbure du dioptre selon &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;orientation axe opt. princ. dioptre&quot; /&gt; avec pour conséquence la nature « concave » ou « convexe » du dioptre caractérisé par le signe du rayon de courbure algébrisé :
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à droite de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est un point de l'espace objet virtuel, correspondant à un dioptre « convexe »,
* si &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant à gauche de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est un point de l'espace objet réel, correspondant à un dioptre « concave ».

&lt;center&gt; 
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave verre - air.jpg|Justification du caractère convergent d'un dioptre sphérique concave faisant passer d'un milieu plus réfringent vers un milieu moins réfringent
Dioptre sphérique concave air - verre.jpg|Justification du caractère divergent d'un dioptre sphérique concave faisant passer d'un milieu moins réfringent vers un milieu plus réfringent
Dioptre sphérique convexe verre - air.jpg|Justification du caractère divergent d'un dioptre sphérique convexe faisant passer d'un milieu plus réfringent vers un milieu moins réfringent
Dioptre sphérique convexe air - verre.jpg|Justification du caractère convergent d'un dioptre sphérique convexe faisant passer d'un milieu moins réfringent vers un milieu plus réfringent
&lt;/gallery&gt;
Dans la suite nous supposerons le dioptre sphérique concave faisant passer d'un espace plus réfringent à un espace moins réfringent &lt;ref&gt; En précisant la modification des résultats pour un dioptre sphérique des trois autres types.&lt;/ref&gt; et &lt;br&gt;admettrons qu'il n'y a pas stigmatisme rigoureux du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points objet autres que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et tous les points du dioptre &lt;ref name=&quot;Définition sommet dioptre&quot;&gt; Si le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est sur le dioptre, l'axe optique principal associé à ce point objet ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; joue le rôle de sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir ; ainsi, dans la mesure où l'axe optique principal n'a pas été préalablement défini, tout point du dioptre peut être considéré comme un sommet.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;
=== Démonstration du stigmatisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent sous conditions de Gauss ===

[[File:Dioptre sphérique concave convergent - stigmatisme approché.jpg|thumb|Schéma d'un dioptre sphérique concave convergent dans le but d'établir le stigmatisme approché du dioptre &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tout point objet autre que C et S]]

{{Al|5}}Considérant un point objet réel &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; et l'axe optique principal correspondant de support &lt;math&gt;\;(A_oC)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Dès lors que &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\neq C&lt;/math&gt;, l'axe optique principal est parfaitement défini ainsi que le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui est l'intersection de l'axe optique principal et du dioptre.&lt;/ref&gt;, nous envisageons des rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, peu inclinés par rapport à l'axe optique principal, d'angle d'inclinaison &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; tel que &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et dont le point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; reste proche du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; c.-à-d. tel que l'angle que fait la normale au dioptre en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal &lt;math&gt;\;\widehat{(\overrightarrow{CS}\, ;\, \vec{N})} = \omega\;&lt;/math&gt; soit petit en valeur absolue &lt;math&gt;\;\big(|\omega| \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;paraxial&quot; /&gt;.

{{Al|5}}Le rayon incident &lt;math&gt;\;A_oI\;&lt;/math&gt; donnant, par utilisation des lois de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot;&gt; Voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_réflexion,_réfraction,_lois_de_Descartes#Deuxième_loi_de_Snell-Descartes_de_la_réfraction|2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes de la réfraction]] » du chap.&lt;math&gt;11&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] ».&lt;/ref&gt;, le rayon émergent &lt;math&gt;\;IA_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(A_i \in&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;, appelons &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; l'angle d'inclinaison du rayon réfracté par rapport à l'axe optique principal ; nous nous proposons de démontrer que &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est indépendant du rayon incident considéré &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. indépendant de &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;\omega\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big(\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;|\omega| \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; sont réalisées.

==== Établissement de la relation liant θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt;, ω, n&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et n&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; ====

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC\;&lt;/math&gt; établir une première relation entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_o\;\big(&lt;/math&gt;angle d'incidence du rayon incident en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC\;&lt;/math&gt; établir une deuxième relation entre &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_i\;\big(&lt;/math&gt;angle de réfraction du rayon émergent en &lt;math&gt;\;I\big)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# en utilisant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; et les deux relations précédentes, déduire la relation suivante entre &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i\;&lt;/math&gt; : &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\omega = \dfrac{n_o\; \theta_o - n_i\; \theta_i}{n_o - n_i}\;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIC&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\omega = \theta_o + (-i_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt; &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; sont positifs mais &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; étant négatif, sa valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i_o)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et  
&lt;br&gt;{{Al|5}}dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIC&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;-i_i = \omega - \theta_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation dans un triangle&quot; /&gt; &lt;ref&gt; On remarque, sur le schéma, que &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; est positif mais &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; et et &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt;  étant négatifs, leur valeur absolue s'écrit &lt;math&gt;\;(-i_i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;(-\theta_i)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ou, 
&lt;br&gt;{{Al|5}}en utilisation la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; pour la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; et, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle d'incidence (et donc aussi de l'angle de réfraction en valeur absolue) &lt;math&gt;\;n_o\, i_0 = n_i\, i_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;i_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, i_o&lt;/math&gt;, la relation ci-dessus se réécrit &lt;math&gt;\; -\dfrac{n_o}{n_i}\, i_o = \omega - \theta_i&lt;/math&gt; ;
&lt;br&gt;{{Al|5}}on élimine alors &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; entre ces deux relations en formant la C.L. &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\; (\mathfrak{1}) + (\mathfrak{2})\;&lt;/math&gt; soit : &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\; \omega = \dfrac{n_o}{n_i}\; \theta_o + \omega - \theta_i\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;n_o\,\omega = n_o\, \theta_o + n_i\, \omega - n_i\, \theta_i\;&lt;/math&gt; soit enfin, la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a}) \qquad \omega = \dfrac{n_o\, \theta_o - n_i\, \theta_i}{n_o - n_i}&lt;/math&gt;.}}

==== Évaluation des angles θ&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, θ&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et ω en fonction des abscisses de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;, A&lt;sub&gt;i&lt;/sub&gt; et C repérées relativement à H ====

{{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, montrer que le rayon réfracté est aussi peu incliné relativement à l'axe optique principal c.-à-d. &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;.

# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\theta_o&lt;/math&gt;, 
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\theta_i&lt;/math&gt;,
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; évaluer &lt;math&gt;\;\tan(\omega)\;&lt;/math&gt; en fonction, entre autres, de &lt;math&gt;\;\overline{HC}\;&lt;/math&gt; puis, en tenant compte de la petitesse de la valeur absolue de l'angle, &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;,
# déduire des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt;, un lien entre &lt;math&gt;\;\overline{HA_o}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HA_i}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\theta_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, \theta_o - \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, \omega\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;|\theta_i| \leqslant \dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega|\;&lt;/math&gt; et des conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}|\theta_o| \ll 1\\ |\omega| \ll 1 \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; dont on déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;|\theta_i| \leqslant \dfrac{n_o}{n_i}\, |\theta_o| + \dfrac{n_o - n_i}{n_i}\, |\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; c.-à-d. que le rayon réfracté est aussi peu incliné relativement à l'axe optique principal.
# En travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HA_o}}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_o &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) \simeq \theta_o\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_o}}&lt;/math&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) &lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) \simeq \theta_i\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HA_i}}&lt;/math&gt; ;
# en travaillant dans le triangle &lt;math&gt;\;CIH&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\omega) = \dfrac{\overline{HI}}{-\overline{HC}_\rightarrow}\;&lt;/math&gt; car sur le schéma &lt;math&gt;\;\omega &gt; 0\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\tan(\omega) &gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{HI} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{HC} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;|\omega| \ll 1\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\tan(\omega) \simeq \omega\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\omega \simeq -\dfrac{\overline{HI}}{\overline{HC}}&lt;/math&gt; ;
# des trois évaluations précédentes et de la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{a})\;&lt;/math&gt; réécrite selon &lt;math&gt;\;(n_o - n_i)\, \omega = n_o\,\theta_o - n_i\, \theta_i&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)\, \overline{HI}}{\overline{HC}} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{n_i\, \overline{HI}}{\overline{HA_i}} - \dfrac{n_o\, \overline{HI}}{\overline{HA_o}}\;&lt;/math&gt; ou, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{HI}&lt;/math&gt;, on obtient la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\qquad \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{HC}} = \dfrac{n_i}{\overline{HA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{HA_o}}&lt;/math&gt;.}}

==== Établissement de la confusion de H et de S à l'ordre un en ω ====

{{Al|5}}Établir que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition de H&quot; /&gt; peut être confondu avec le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du miroir à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;H et S confondus&quot; /&gt; et

{{Al|5}}réécrire que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; en tenant compte de cette confusion.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Montrons que &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;ω infiniment petit d'ordre un&quot; /&gt;, en évaluant &lt;math&gt;\;[CH]\;&lt;/math&gt; puis &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH]\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, on obtient : &lt;math&gt;\;[CH] = [CI]\, \cos(\omega) = R\, \cos(\omega) \simeq R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;revoir la remarque du paragraphe « [[Outils_mathématiques_pour_la_physique_(PCSI)/Théorème_de_Taylor-Young_et_développements_limités_d'une_fonction_d'une_variable_au_voisinage_d'une_de_ses_valeurs#D.C3.A9veloppements_limit.C3.A9s_.C3.A0_l.27ordre_un_de_quelques_fonctions_usuelles|D.L. à l'ordre un de quelques fonctions usuelles]] » du chap.&lt;math&gt;14&lt;/math&gt; de la leçon « Outils mathématiques pour la physique (PCSI) »&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;[HS] = [CS] - [CH] \simeq R - R \left( 1 - \dfrac{\omega^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt;, soit encore &lt;math&gt;\;[HS] \simeq R \dfrac{\omega^2}{2}\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; ou finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;[HS] \simeq 0\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}remplaçant &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\omega\;&lt;/math&gt; dans la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})&lt;/math&gt;, on peut, sous les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme approché &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;, la réécrire selon &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\; \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{SC}} = \dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Sous cette forme la relation nécessite que le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; sommet du dioptre.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Conclusion : stigmatisme approché du dioptre sphérique (concave convergent) pour le point objet A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; et relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Vérifier que la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; définit, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; quelconque, un point image unique &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; et en déduire le stigmatisme approché du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour le point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}la relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; pouvant être écrite selon &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot;&gt; Nous admettrons que cette relation (ou propriété) établie dans le cas d'un dioptre sphérique concave convergent est encore applicable, sans modification, à un dioptre sphérique concave divergent ou à un dioptre sphérique convexe convergent ou divergent.&lt;/ref&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante appelée « vergence » du dioptre sphérique exprimée en dioptries &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;de symbole &lt;math&gt;\;\delta\big)\;&lt;/math&gt; dans la mesure où les abscisses le sont en &lt;math&gt;\;m\;\big(&lt;/math&gt;la dioptrie étant liée au mètre par &lt;math&gt;\;1\, \delta = 1\,m^{-1}\big)&lt;/math&gt;, exprimer &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt;&lt;ref&gt; Pour le repérage de Descartes dans un dioptre sphérique concave ou convexe, convergent ou divergent, il y a deux origines utilisées : l'origine au sommet qui est la plus fréquemment utilisée et l'origine au centre qui l'est beaucoup moins.&lt;/ref&gt; du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et &lt;br&gt;{{Al|5}}{{Transparent|Par la suite notant l'abscisse de Descartes &lt;math&gt;\;\color{transparent}{\big(}&lt;/math&gt;avec origine au sommet&lt;math&gt;\color{transparent}{\big)}\;&lt;/math&gt; }}celle du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|5}}la relation de conjugaison (approchée) de position [ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée)] de Descartes d'un dioptre sphérique se réécrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; établit le stigmatisme approché du dioptre sphérique &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tout point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; autre que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; puisque, pour un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; fixé, le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est déterminé de façon unique &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;indépendamment des variations des petits angles &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\omega\big)&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}La relation &lt;math&gt;\;(\mathfrak{b})\;&lt;/math&gt; peut effectivement être écrite sous la forme &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\overline{SA_i}} - \dfrac{n_o}{\overline{SA_o}} = V\;&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est une constante définissant la vergence du dioptre sphérique selon &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{SC}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC}\;&lt;/math&gt; rayon algébrisé du dioptre.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Avec les abscisses de Descartes (avec origine au sommet) du point objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et du point image &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, la relation de conjugaison (approchée) de position [ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée)] de Descartes du dioptre sphérique se réécrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

=== Points pour lesquels la conjugaison du dioptre sphérique est rigoureuse et points doubles ===

{{Al|5}}Vérifier, par construction et pour une direction d'axe optique principal préalablement fixée, que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Définition sommet&quot; /&gt; du dioptre sont des points
* pour lesquels le dioptre est stigmatique rigoureux et
* dont l'image est confondue avec l'objet (c.-à-d. que ce sont des points doubles).
{{Al|5}}Justifier la raison pour laquelle la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) est applicable à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du dioptre, bien que la conjugaison soit rigoureuse ;

{{Al|5}}vérifier, en utilisant cette relation, que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double.

{{Al|5}}Admettant que la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) reste applicable à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, sommet du dioptre, pour lequel il y a conjugaison rigoureuse &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;mais évidemment pas sous cette forme qui est indéterminée quand on l'applique à &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, son abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; y étant nulle&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, évaluer &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; et vérifier, sur cette dernière forme, 
* que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est effectivement un point double et
* qu'il n'y a pas d'autres points doubles que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;. 

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - points doubles.jpg|thumb|Schémas de vérification du fait que, pour C et S, le dioptre sphérique (concave convergent) est stigmatique rigoureux et que ce sont des points doubles]]
{{Al|5}}Voir ci-contre les constructions prouvant les propriétés particulières d'un point objet en &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot;/&gt; : 
* à gauche tout rayon d'un faisceau incident issu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent étant normal au dioptre poursuit son chemin sans changer de direction, donnant un ensemble de rayons transmis divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, c.-à-d. prouvant que le dioptre sphérique est stigmatique rigoureux pour son centre ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double ;
* à droite tout rayon d'un faisceau incident convergeant sur le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent se réfractant à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même &lt;ref&gt; En suivant une direction plus rapprochée de l'axe optique principal que ne l'est celle du rayon incident.&lt;/ref&gt; et l'ensemble des rayons réfractés divergeant à partir d'un point unique quelle que soit l'ouverture du faisceau incident, cela prouve le stigmatisme rigoureux du dioptre sphérique pour son sommet &lt;ref name=&quot;stigmatisme rigoureux d'un système optique pour un point&quot; /&gt; ; de plus le point image de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; lui-même, ce dernier est un point double.
{{Al|5}}Pour appliquer la relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) à &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, centre du dioptre, bien que la conjugaison soit rigoureuse, il suffit de ne considérer que les rayons paraxiaux du faisceau incident issu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et d'ouverture quelconque &lt;ref&gt; Le fait que les autres rayons divergent également à partir de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ne modifient en rien la divergence des rayons transmis provenant de rayons incidents paraxiaux.&lt;/ref&gt;, condition d'applicabilité de la relation de conjugaison de position de Descartes ;

{{Al|5}}dans ce cas, si on appelle &lt;math&gt;\;C_i&lt;/math&gt;, d'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{SC_i}&lt;/math&gt;, l'image du point objet &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(C) = \overline{SC} = \overline{R}&lt;/math&gt;, nous obtenons, en remplaçant &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt;,  &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(C_i)} - \dfrac{n_o}{\overline{R}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(C_i)} = \dfrac{n_i}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i(C_i) = \overline{R} = \overline{SC}&lt;/math&gt; prouvant que &lt;math&gt;\;C_i\;&lt;/math&gt; se confond avec &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et par suite que &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est un point double.

&lt;center&gt;De &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = V\;&lt;/math&gt; on tire &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} = \dfrac{n_o}{p_o} + V = \dfrac{n_o + V\, p_o}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;p_i = n_i\, \dfrac{p_o}{n_o + V\, p_o}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt; 
{{Al|5}}sous cette forme on vérifie qu'un point objet en &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(S) = 0\;&lt;/math&gt; a une image d'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i = 0&lt;/math&gt;, c.-à-d. une image confondue avec &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; prouvant que &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; est bien un point double ;

{{Al|5}}les points doubles &lt;math&gt;\;A_d\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_d\;&lt;/math&gt; étant tels que leurs abscisses images de Descartes (avec origine au sommet) s'écrivant &lt;math&gt;\;p_i(A_d) = \overline{SA_d} = p_d\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;p_i(A_d) = n_i\, \dfrac{p_d}{n_o + V\, p_d}\;&lt;/math&gt; obéissent à l'équation &lt;math&gt;\;p_d = n_i\, \dfrac{p_d}{n_o + V\, p_d}\;&lt;/math&gt; qui se décompose en &lt;math&gt;\;\left\lbrace\begin{array}{c}p_d = 0\;\;\; \text{ou}\\ n_o + V\, p_d = n_i\end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;, la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; solution donnant &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; point double et la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; équation conduisant à &lt;math&gt;\;p_d = \dfrac{n_i - n_o}{V} = \overline{R}\;&lt;/math&gt; c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; point double ; &lt;center&gt;le centre et le sommet d'un dioptre sphérique sont donc les seuls points doubles de ce dernier.&lt;/center&gt;}}

=== Caractère focal d'un dioptre sphérique, position des foyers principaux objet et image, lien de la vergence et des distances focales objet et image, signe de la vergence ===

==== Caractère focal d'un dioptre sphérique, définition des foyers principaux objet et image, lien de la vergence avec les distances focales objet et image ====

{{Al|5}}Vérifier, sur la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes d'un dioptre sphérique, que ce dernier est nécessairement « focal » &lt;ref name=&quot;définition focal&quot; /&gt; puis déterminer
* la position du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point objet de l'axe optique principal ayant pour image le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;F_o\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; A_{i,\,\infty}\big]\;&lt;/math&gt; et
* la position du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; c.-à-d. le point image de l'axe optique principal ayant pour antécédent &lt;ref name=&quot;Antécédent&quot; /&gt; le point à l'infini de cet axe optique principal &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;ou &lt;math&gt;\;A_{o,\,\infty}\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; F_i\big]&lt;/math&gt;.
{{Al|5}}Définissant
* la distance focale objet comme l'abscisse objet de Descartes du foyer principal objet (avec origine au sommet) soit &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; et
* la distance focale image comme l'abscisse image de Descartes du foyer principal image (avec origine au sommet) soit &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt;,
{{Al|5}}déterminer le lien entre vergence &lt;math&gt;\;V&lt;/math&gt;, distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o&lt;/math&gt;, distance focale image &lt;math&gt;\;f_i&lt;/math&gt;, indice espace objet &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; et indice espace image &lt;math&gt;\,n_i&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Un dioptre sphérique est un « système focal », en effet pour qu'il soit « afocal », il faudrait que le point à l'infini de l'axe optique principal soit un point double, mais ayant établi que les seuls points doubles du dioptre sphérique sont &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, et non le point à l'infini de l'axe optique principal on en déduit que le dioptre sphérique est bien un « système focal ».
* Le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(F_i) = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; étant l'image du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(A_{o,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{p_o(A_{o,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(F_i)} - 0 = V\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt;.
* Le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, repéré par l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o(F_o) = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; étant l'antécédent &lt;ref name =&quot;Antécédent&quot;/&gt; du point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal, repéré par l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i(A_{i,\, \infty}) = \infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i(A_{i,\, \infty})} = 0&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;0 - \dfrac{n_o}{p_o(F_o)} = V\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;\overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt;.

&lt;center&gt;&lt;u&gt;Notion de distances focales objet et image&lt;/u&gt; :&lt;/center&gt;
* la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; étant définie par &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; est liée à la vergence par &lt;math&gt;\;f_i = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt; ;
* la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; étant définie par &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; est liée à la vergence par &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}&lt;/math&gt; ; 
&lt;center&gt;on en déduit la relation &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Cette relation découle de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de position de Descartes du dioptre sphérique appliquée aux couples de points conjugués &lt;math&gt;\;(A_{o,\, \infty}\, , \,F_i)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;(F_o\, , \,A_{i,\, \infty})&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Signe de la vergence suivant la nature concave ou convexe du dioptre sphérique et de l'indice de l'espace objet comparé à celui de l'espace image, caractère convergent ou divergent du dioptre et nature réelle ou virtuelle des foyers principaux ====

{{Al|5}}Déterminer le signe de la vergence suivant la nature « concave » ou « convexe » du dioptre sphérique et du signe de &lt;math&gt;\;n_o - n_i\;&lt;/math&gt; puis

{{Al|5}}son caractère « convergent » ou « divergent » sachant qu'un système focal à « vergence positive » (respectivement « négative ») est dit « convergent » (respectivement « divergent ») et enfin

{{Al|5}}la nature « réelle » ou « virtuelle » des foyers principaux.

{{Al|5}}Pour terminer, on précisera, dans chacun des quatre cas possibles, les positions absolues des foyers principaux objet et image relativement au centre et au sommet du dioptre considéré.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; on en déduit que la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est 
* de signe contraire au rayon de courbure algébrisé du dioptre si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\;\big(n_o &gt; n_i\big)&lt;/math&gt;, 
* de même signe que le rayon de courbure algébrisé du dioptre si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\;\big(n_o &lt; n_i\big)&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}on en déduit les quatre possibilités suivant la nature du dioptre sphérique et le signe de &lt;math&gt;\;n_o - n_i&lt;/math&gt; :
* un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave&lt;/u&gt; ayant un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;nature de C dioptre&quot;&gt; Correspondant au caractère réel (resp. virtuel) du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave (resp. convexe).&lt;/ref&gt;, a &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet eau, espace image air&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; » et &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet air, espace image eau&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; »,
* un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe&lt;/u&gt; a un rayon de courbure algébrisé &lt;math&gt;\;\overline{R} = \overline{SC} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;nature de C dioptre&quot; /&gt;, a &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &lt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet eau, espace image air&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;divergent&lt;/u&gt; » et &lt;br&gt;{{Al|5}}une vergence &lt;math&gt;\;V &gt; 0\;&lt;/math&gt; si la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;exemple espace objet air, espace image eau&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; c'est alors un système « &lt;u&gt;convergent&lt;/u&gt; ».

{{Al|5}}De &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit la nature (réelle ou virtuelle) des foyers principaux objet et image suivant la nature (convergente ou divergente) du dioptre sphérique :
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave convergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot;&gt; La lumière passant d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent on a &lt;math&gt;\;n_o &gt; n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;concave divergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot;&gt; La lumière passant d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent on a &lt;math&gt;\;n_o &lt; n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe divergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet inférieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;virtuel&lt;/u&gt;,
* pour un dioptre sphérique &lt;u&gt;convexe convergent&lt;/u&gt;, la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i} = \dfrac{n_i}{V} = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; est &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; entraînant le caractère &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt; du foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; et la distance focale objet &lt;math&gt;\;f_o = \overline{SF_o} = -\dfrac{n_o}{V} = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name = &quot;indice objet supérieur à indice image&quot; /&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est également &lt;u&gt;réel&lt;/u&gt;.
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : Les distances focales objet et image étant, dans les quatre cas possibles, de signe contraire, les foyers principaux objet et image sont situés de part et d'autre de la surface dioptrique dans chacun des cas ;

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}pour un dioptre sphérique pour lequel la lumière passe d'un milieu plus réfringent à un milieu moins réfringent, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt;\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est situé à une distance &lt;math&gt;\;|f_o| = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; à une distance &lt;math&gt;\;|f_i| = \dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;|f_i| &lt; |f_o|\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est plus éloigné du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; que le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Avec, pour un dioptre concave, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet réel (c.-à-d. usuellement à gauche) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image réelle (c.-à-d. usuellement à droite),&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;small&gt;....&lt;/small&gt;Avec, &lt;/span&gt;pour un dioptre convexe, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet virtuel (c.-à-d. usuellement à droite) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image virtuelle (c.-à-d. usuellement à gauche).&lt;/ref&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}pour un dioptre sphérique pour lequel la lumière passe d'un milieu moins réfringent à un milieu plus réfringent, &lt;math&gt;\;n_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt;\;&lt;/math&gt; à &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;, le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est situé à une distance &lt;math&gt;\;|f_o| = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; à une distance &lt;math&gt;\;|f_i| = \dfrac{n_i}{n_o - n_i}\,R\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;|f_i| &gt; |f_o|\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; est moins éloigné du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; que le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Avec, pour un dioptre concave, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet virtuel (c.-à-d. usuellement à droite) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image virtuelle (c.-à-d. usuellement à gauche),&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;small&gt;....&lt;/small&gt;Avec, &lt;/span&gt;pour un dioptre convexe, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace objet réel (c.-à-d. usuellement à gauche) et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du côté de l'espace image réelle (c.-à-d. usuellement à droite).&lt;/ref&gt;.}}

=== Aplanétisme approché d'un dioptre sphérique sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}Soit le dioptre sphérique concave convergent introduit à la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; question et un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq C\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;support axe optique principal&quot; /&gt; tel qu'il y ait stigmatisme approché du dioptre &lt;ref name=&quot;stigmatisme approché d'un système optique pour un point&quot; /&gt; pour tous les points &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; C.-à-d. que, pour un point quelconque &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, avec la définition de l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;cet axe jouant le rôle d'axe optique principal pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; est qualifié de secondaire relativement au point objet &lt;math&gt;\;A_o\big)&lt;/math&gt;, les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; doivent être paraxiaux &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;peu inclinés relativement à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; et à point d'incidence restant proche du sommet secondaire &lt;math&gt;\;S_{M_o}&lt;/math&gt;, intersection de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; avec le dioptre&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; ; &lt;br&gt;{{Al|5}}cette dernière condition entraîne que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; admet une image « nette » &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Nette&quot; /&gt; mais a priori cette image n'est &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; hors conditions de Gauss d'aplanétisme approché &lt;math&gt;-&lt;/math&gt; ni « linéique » &lt;ref name=&quot;Linéique&quot; /&gt; ni « transverse » ;

{{Al|5}}Supposant que l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est, 
* quand l'objet n'est pas proche du dioptre, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} S\big)\;&lt;/math&gt; et 
* quand l'objet est proche du dioptre, vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq S\big)&lt;/math&gt;, 

{{Al|5}}ces deux conditions sont une première façon de définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; pour un objet linéique transverse quelconque &lt;ref&gt; C'est cette façon qui a été vue en cours, &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant en effet le point de l'axe optique principal appartenant à la face d'entrée du dioptre.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}Il existe une deuxième façon équivalente de définir les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; pour un objet linéique transverse quelconque &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;façon plus simple&quot; /&gt; :
* quand l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; n'est pas proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre, l'objet doit être vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)\;&lt;/math&gt; et 
* quand l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; est tel que son pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, l'objet doit être vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre sous un angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\;&lt;/math&gt; si &lt;math&gt;\;A_o\; \simeq C\big)&lt;/math&gt;. 

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du dioptre et vu de ce centre sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant d'abord supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq} C\big)&lt;/math&gt;, nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, n'étant pas nécessairement petit, la démarche pour établir l'aplanétisme du dioptre pour un tel objet est rendue plus aisée si on a établi auparavant la [[Signaux_physiques_(PCSI)/Exercices/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Relation_de_conjugaison_de_position_.28ou_1.C3.A8re_relation_de_conjugaison.29_de_Descartes_.28avec_origine_au_centre.29|relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre)]] &lt;ref name=&quot;méthode moins aisée&quot; /&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\overline{CA_i}} - \dfrac{n_i}{\overline{CA_o}} = V\;&lt;/math&gt; où &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; est la vergence précédemment introduite :&lt;/center&gt;

{{Al|5}}la démarche peut alors être décomposée en les étapes suivantes :
* montrer qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* en utilisant la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre), montrer alors que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et vérifier que l'angle au centre associé est encore &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* conclure qu'à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; peut être confondue avec un segment perpendiculaire à l'axe optique principal c.-à-d. qu'elle est linéique transverse &lt;ref&gt; Nous aurons donc établi qu'il y a aplanétisme approché du dioptre sphérique pour un objet linéique transverse de pied non proche du centre du dioptre à condition qu'il soit vu de ce centre sous un petit angle.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}L'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant supposé de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; non proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o\; \cancel{\simeq}\; C\big)&lt;/math&gt;, avec l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel il est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\alpha \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* le caractère transverse de l'objet linéique &lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; la longueur &lt;math&gt;\;[CB_o]\;&lt;/math&gt; est plus grande que la longueur &lt;math&gt;\;[CA_o]\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition des côtés triangle rectangle&quot; /&gt;, soit plus précisément &lt;math&gt;\;[CA_o] =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;[CB_o]\, \cos(\alpha) \simeq [CB_o] \left( 1 - \dfrac{\alpha^2}{2} \right)\;&lt;/math&gt; à l'ordre deux en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt;&lt;ref name=&quot;D.L. à l'ordre deux de quelques fonctions usuelles&quot; /&gt; ou finalement &lt;math&gt;\;[CA_o] \simeq [CB_o]\;&lt;/math&gt; à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; prouvant, qu'à cet ordre, l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; peut être confondu avec un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, d'angle au centre associé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;,
* tous les points objet &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; ayant une abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;axe optique secondaire&quot; /&gt;, l'application de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au centre) donne donc des points image &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; à abscisse image de Descartes (avec origine au centre) indépendante de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique secondaire associé de support &lt;math&gt;\;(CM_o)&lt;/math&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est assimilable, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, à un arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt;,
* l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'arc de cercle &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est vu du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; étant petit, on peut faire l'opération inverse de celle faite au premier paragraphe, c.-à-d. assimiler l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; à un segment choisi perpendiculaire à l'axe optique principal de support &lt;math&gt;\;(CA_i)\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;justification choix&quot; /&gt;, c.-à-d. que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; est, à l'ordre un en &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, linéique transverse ; &lt;center&gt;l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du dioptre sphérique&lt;/u&gt; (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; a donc été établi &lt;u&gt;pour tout objet linéique de pied non proche du centre du dioptre&lt;/u&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Démonstration de l'aplanétisme approché d'un dioptre sphérique concave convergent pour un objet linéique transverse de pied proche du centre du dioptre et vu du sommet de ce dernier sous un petit angle ====

{{Al|5}}L'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; étant maintenant supposé proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, nous considérons l'angle &lt;math&gt;\;\beta&lt;/math&gt;, sous lequel il est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt; ; la démarche pour établir l'aplanétisme du miroir pour un tel objet nécessite l'utilisation de deux rayons paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt;, point objet quelconque de &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;paraxial - ter&quot;&gt; Le caractère paraxial étant indispensable pour satisfaire au stigmatisme approché du dioptre pour le point objet &lt;math&gt;\;M_o&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;voir le paragraphe « [[Signaux_physiques_(PCSI)/Optique_géométrique_:_conditions_de_Gauss#Énoncé_des_conditions_de_Gauss_de_stigmatisme_approché_d'un_système_optique_«_centré_»|énoncé des conditions de Gauss de stigmatisme approché d'un système optique centré]] » du chap.&lt;math&gt;13&lt;/math&gt; de la leçon « [[Signaux_physiques_(PCSI)|Signaux physiques (PCSI)]] »&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, tous les rayons non paraxiaux issus de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; seront arrêtés par un diaphragme centré sur &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}on vérifie aisément que les rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; sont deux candidats respectant la paraxialité, par contre le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oC\;&lt;/math&gt; pouvant ne pas l'être car &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est proche de &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;et si tel était le cas il serait alors arrêté par le diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt;, nous ne l'utiliserons pas.&lt;/ref&gt; et de montrer que le point image &lt;math&gt;\;M_i&lt;/math&gt;, défini comme l'intersection des deux rayons réfractés, a pour projeté, sur l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; :
* déterminer l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; en fonction de la distance focale image &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_o&lt;/math&gt;,
* déterminer la longueur algébrique &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; en fonction de &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; et de l'abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;p_o&lt;/math&gt;,
* travaillant dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sx}\;&lt;/math&gt; étant porté par l'axe optique principal et l'axe &lt;math&gt;\;\overrightarrow{Sy}\;&lt;/math&gt; étant porté par la représentation symbolique du dioptre orienté vers le haut, l'objet &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; étant lui aussi orienté vers le haut.&lt;/ref&gt; déterminer l'équation des rayons incidents &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;définition ε&quot; /&gt;,
* travaillant dans le même repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; déterminer les équations des rayons réfractés, puis leur intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; ;
* vérifier que l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal est égale à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, puis conclure à l'aplanétisme approché du dioptre sphérique (concave convergent) pour l'objet linéique &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied proche du centre du dioptre.

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - aplanétisme.jpg|thumb|Schéma positionnant un objet linéique transverse de pied proche du centre d'un dioptre sphérique concave convergent pour démontrer l'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet &lt;ref&gt; Sur le schéma ci-dessus la distance focale objet vaut &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;avec &lt;math&gt;\;n_o \simeq 1,5\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;n_i \simeq 1,0\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;f_o = \dfrac{n_o}{n_o - n_i}\;\overline{R} = 3\;\overline{R} = -3\;R&lt;/math&gt;, la distance focale image, quant à elle, valant &lt;math&gt;\;f_i = -\dfrac{n_i}{n_o - n_i}\;\overline{R} = -2\;\overline{R} = 2\;R&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;]]
{{Al|5}}Soit &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, proche du centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique concave convergent &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;A_o \simeq C\big)&lt;/math&gt;, vu du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; de ce dernier sous un angle &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; petit &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;c.-à-d. &lt;math&gt;\;\beta \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; correspondant à la condition de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; d'aplanétisme approché &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt; précitée ; 
# on détermine d'abord &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}&lt;/math&gt;, l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, image du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; d'abscisse objet &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}&lt;/math&gt;, par utilisation de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes du dioptre sphérique (avec origine au sommet) de vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;f_i = \overline{SF_i}\;&lt;/math&gt; étant la distance focale image du dioptre d'où : &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{n_i}{f_i} \Rightarrow \dfrac{1}{p_i} = \dfrac{n_o}{n_i\, p_o} + \dfrac{1}{f_i} = \dfrac{n_o\, f_i + n_i\, p_o}{n_i\, p_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;p_i = p_o\, \dfrac{n_i\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
# &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; non algébrisé &lt;math&gt;\;\ll 1&lt;/math&gt;, on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\beta) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{p_o}\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\tan(\beta) \simeq \beta\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} \simeq -\beta\; p_o&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})&lt;/math&gt;, le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = \varepsilon\, \overline{A_oB_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_S}{x_{M_o} - x_S} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o} = -\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_S = -\varepsilon\, \beta \left( x - x_S \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = -\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vérification signes&quot; /&gt;,&lt;/center&gt;
{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}&lt;/math&gt;, }}le rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; issu de &lt;math&gt;\;M_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;(x_{M_o} = p_o\, , \, y_{M_o} = -\varepsilon\, \beta\, p_o)\;&lt;/math&gt; et passant par le foyer principal objet du dioptre sphérique &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; de coordonnées &lt;math&gt;\;\left(x_{F_o} = f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\,f_i\, , \, y_{F_o} = 0\right)\;&lt;/math&gt; étant de pente &lt;math&gt;\;\dfrac{y_{M_o} - y_{F_o}}{x_{M_o} - x_{F_o}} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, p_o}{p_o + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\,f_i}\;&lt;/math&gt; a pour équation &lt;math&gt;\;y - y_{F_o} = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left( x - x_{F_o} \right)\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left( x + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i \right)&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# dans le même repère orthonormé &lt;math&gt;\;(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})\;&lt;/math&gt; le rayon réfracté sur le dioptre du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; étant de direction déterminée par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; (écrite pour de petits angles) est de pente &lt;math&gt;\;-\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon réfracté de pente égale à la tangente de l'angle de réfraction c.-à-d. encore égale à l'angle de réfraction &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; et le rayon incident étant de pente égale à la tangente de l'angle d'incidence c.-à-d. encore égale à l'angle d'incidence &lt;math&gt;\;i_o&lt;/math&gt;, l'utilisation de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes de la réfraction (écrite pour de petits angles) conduisant à &lt;math&gt;\;n_i\, i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;i_i = \dfrac{n_o}{n_i}\, i_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; d'où l'équation du rayon réfracté correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oS\;&lt;/math&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = -\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\, x\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vérification signes bis&quot; /&gt;,&lt;/center&gt;
{{Transparent|dans le repère orthonormé &lt;math&gt;\;\color{transparent}{(S,\, \overrightarrow{Sx},\, \overrightarrow{Sy})}&lt;/math&gt;, }}le rayon réfracté sur le dioptre du rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; étant, à partir du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; sur le dioptre, &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal, son équation nécessite de déterminer au préalable l'ordonnée de &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;x_{I} = 0\;&lt;/math&gt; dans l'équation du rayon incident soit &lt;math&gt;\;y(I) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_i\, p_o}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} \left[ x_I + \dfrac{n_o}{n_i}\,f_i \right) = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; d'où l'équation du rayon réfracté correspondant au rayon incident &lt;math&gt;\;M_oF_o\;&lt;/math&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;y = \dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'intersection &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; de ces deux rayons réfractés a pour abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{-\varepsilon\, \beta\, n_o\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i} = -\dfrac{n_o}{n_i}\,\varepsilon\, \beta\, x_{M_i}\;&lt;/math&gt; soit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;x_{M_i} = \dfrac{n_i\, p_o\, f_i}{n_i\, p_o + n_o\, f_i}\;&lt;/math&gt; identique à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du point image &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
# l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) du projeté de &lt;math&gt;\;M_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal étant égale à l'abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) de &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;, on conclut à l'&lt;u&gt;aplanétisme approché du dioptre sphérique&lt;/u&gt; (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;u&gt;pour tout objet linéique&lt;/u&gt; &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; &lt;u&gt;de pied proche du centre du dioptre&lt;/u&gt;.}}

==== Relation de conjugaison (approchée) de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) ====

{{Al|5}}Dès lors qu'un dioptre sphérique est utilisée sous conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt; de stigmatisme et d'aplanétisme approchés &lt;ref name=&quot;conditions de Gauss de stigmatisme approché&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref name=&quot;conditions supplémentaires de Gauss d'aplanétisme approché&quot; /&gt;, l'usage est de représenter ce dioptre sous une forme symbolique dans laquelle figurent l'axe optique principal, le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, les foyers principaux objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; et la partie de dioptre perpendiculaire en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal &lt;ref&gt; Cette partie de dioptre perpendiculaire en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal est terminée par des bords inclinés vers la droite pour un dioptre convergent et vers la gauche pour un dioptre divergent.&lt;/ref&gt; &lt;center&gt;voir ci-dessous en 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; ligne les quatre types de dioptres sphériques et en 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; ligne leur représentation symbolique &lt;ref name=&quot;Foyers à ajouter&quot; /&gt;.
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave verre - air.jpg|
Dioptre sphérique concave air - verre.jpg|
Dioptre sphérique convexe verre - air.jpg|
Dioptre sphérique convexe air - verre.jpg|
&lt;/gallery&gt;
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave convergent - symbole.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique concave convergent
Dioptre sphérique concave divergent - symbole.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique concave divergent
Dioptre sphérique convexe divergent.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique convexe divergent
Dioptre sphérique convexe convergent.jpg|Représentation symbolique d'un dioptre sphérique convexe convergent
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes avec origine en S pour un dioptre sphérique concave convergent]]

{{Al|5}}Sur le schéma ci-contre on a construit l'image linéique transverse &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; d'un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\neq C\;&lt;/math&gt; en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, l'un passant que le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre et qui poursuit dans l'espace image réel sans être dévié &lt;ref&gt; En effet le rayon émergent doit être issu du point d'incidence &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; du rayon incident et passer par l'image de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; par le dioptre c.-à-d. &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; lui-même.&lt;/ref&gt;, l'autre passant par le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre et qui se réfracte en obéissant à la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Attention le sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; du dioptre est le seul point d'incidence en lequel on peut appliquer la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; loi de Snell - Descartes en travaillant sur la représentation symbolique du dioptre car c'est le seul point pour lequel la direction de cette représentation symbolique se confond avec la direction réelle du dioptre &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;autrement dit c'est le seul point où la normale réelle est perpendiculaire à la représentation symbolique, par exemple le rayon incident &lt;math&gt;\;B_oC\;&lt;/math&gt; qui se confond avec la normale réelle du dioptre en &lt;math&gt;\;I\;&lt;/math&gt; n'est pas perpendiculaire à la représentation symbolique du dioptre en &lt;math&gt;\;I\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, le point d'intersection de ces deux rayons émergents étant le point de convergence &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; de tous les rayons réfractés correspondant à tous les rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; sous conditions de Gauss  &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;{{,}} &lt;ref&gt; Car le dioptre est stigmatique approché pour &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal &lt;ref&gt; Car le dioptre est aplanétique approché pour &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;.

{{Al|5}}En comparant les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_oB_oS&lt;/math&gt;, déterminer le grandissement transverse par le dioptre de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}\\ p_i = \overline{SA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt; ; 

&lt;center&gt;cette relation définit la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; pour tout objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;forme indéterminée&quot; /&gt;, elle caractérise quantitativement la propriété d'aplanétisme approché du miroir sphérique pour l'objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons émergents correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui est transmis sans déviation et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfracte en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal, la direction du rayon incident, quant à elle, faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal telle que &lt;math&gt;n_i\,i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation de Kepler&quot;&gt; On rappelle que les angles étant petits, la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes de la réfraction se réécrit en omettant les sinus (relation approchée de Kepler).&lt;/ref&gt; &lt;ref&gt; Il est déconseillé de choisir ce rayon dans les constructions futures demandées car peu pratique &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; devant être mesuré puis l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; calculé et enfin reporté par rapport à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; ; ici nous
l'utilisons dans la démonstration d'où ce choix.&lt;/ref&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(i_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(i_i)\;&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(i_o) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; pour que le triangle &lt;math&gt;\;A_oB_oS\;&lt;/math&gt; puisse être défini.&lt;/ref&gt;, et comme &lt;math&gt;\;|i|\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i_o \simeq \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}}&lt;/math&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(i_i) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Ayant suppose &lt;math&gt;\;A_o \neq S\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; étant un point double on en déduit &lt;math&gt;\;A_i \neq S\;&lt;/math&gt; ce qui définit le triangle &lt;math&gt;\;A_iB_iS&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, et comme &lt;math&gt;\;|i|\;&lt;/math&gt; est &lt;math&gt;\;\ll 1\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;i_i \simeq \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}écrivant la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de la réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; pour les petits angles &lt;math&gt;\;n_i\, i_i \simeq n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; on en déduit : &lt;math&gt;\;n_o\, \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SA_o}} \simeq n_i\, \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SA_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} \simeq \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SA_i}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes (avec origine au sommet)&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SA_i}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq S\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}p_o = \overline{SA_o}\\ p_i = \overline{SA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;p_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = f_i\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;p_o = f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = C\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le dioptre sphérique n'est stigmatique rigoureux que pour le pied &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique, pour tous les autres points objet constituant ce dernier on suppose le stigmatisme approché du dioptre c.-à-d. l'utilisation de rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;M_o\; (\neq C)\; \in A_oB_o\;&lt;/math&gt; paraxiaux &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;ce qui peut être réalisé en pratique avec un diaphragme centré en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; collé contre le dioptre&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et la condition d'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\beta\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du sommet &lt;math&gt;\;S&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\beta \ll 1\big)&lt;/math&gt;, 
* vérifier, par construction de l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i&lt;/math&gt; et utilisation de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de Snell - Descartes &lt;ref name=&quot;Snell - Descartes&quot; /&gt; de réfraction &lt;ref name=&quot;2ème loi de Snell - Descartes de la réfraction&quot; /&gt; dans les conditions de Gauss &lt;ref name=&quot;Gauss&quot; /&gt;, qu'elle est se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; avec un cœfficient d'agrandissement dépendant du rapport des indices des espaces objet et image, 
* en déduire l'applicabilité de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o = C&lt;/math&gt;. 
{{Al|5}}Considérant maintenant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; de pied &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'objet, collé contre le dioptre sphérique, de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;, l'axe optique principal ayant pour support &lt;math&gt;\;(CA_o)&lt;/math&gt;, ne peut être rigoureusement linéique (c.-à-d. rectiligne) car il suit la courbure du dioptre mais, s'il est vu de &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; sous un petit angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, on peut confondre l'arc de cercle de centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et le segment correspondant lui étant tangent à l'ordre un &lt;math&gt;\;\alpha&lt;/math&gt;, raison pour laquelle l'objet est qualifié de « linéique transverse » ; &lt;br&gt;{{Al|3}}le dioptre sphérique est stigmatique rigoureux que pour les points de l'objet linéique car tous ces points, étant sur le dioptre, jouent le rôle de sommet (secondaire) pour lequel le dioptre est stigmatique rigoureux.&lt;/ref&gt; et la condition d'aplanétisme approché du dioptre pour cet objet c.-à-d. l'angle non algébrisé &lt;math&gt;\;\alpha\;&lt;/math&gt; sous lequel l'objet est vu du centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, petit &lt;math&gt;\;\big(\alpha \ll 1\big)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Qui est aussi la condition pour que l'objet collé sur le dioptre puisse être considéré comme linéique.&lt;/ref&gt;, 
* vérifier que l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; se superpose à &lt;math&gt;\;A_oB_o&lt;/math&gt;, le caractère linéique transverse de l'objet entraînant celui de l'image et 
* en déduire la valeur du grandissement transverse &lt;math&gt;\;G_t(S)\;&lt;/math&gt; pour un objet linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;A_o = S&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - grandissement transverse au centre.jpg|thumb|Construction de l'image d'un objet linéique transverse de pied au centre d'un dioptre sphérique concave convergent]]
{{Al|5}}Le centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique concave convergent ci-contre en étant un point double conjugué rigoureux, un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;CB_o\;&lt;/math&gt; a pour image, par le dioptre, une image linéique transverse de pied &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, notée &lt;math&gt;\;CB_i&lt;/math&gt; ; pour construire cette dernière il suffit de choisir pour rayon incident issu de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le rayon passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui se propage dans l'espace image parallèlement à l'axe optique principal, le point image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant alors l'intersection de ce rayon émergent avec le plan transverse passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; ; on vérifierait graphiquement que &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\overline{CB_i} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \overline{CB_o}\;&lt;/math&gt; et par suite &lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{n_o}{n_i}&lt;/math&gt; ;&lt;/center&gt;
{{Al|5}}l'application de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au sommet) nous conduit à &lt;math&gt;\;G_t(C) =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\overline{SC}}{\overline{SC}}&lt;/math&gt;, soit effectivement &lt;math&gt;\;G_t(C) = \dfrac{n_o}{n_i}&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Tous les points du dioptre sphérique étant des points doubles de ce dernier &lt;ref&gt; Chaque point du dioptre jouant le rôle de sommet pour l'axe optique principal passant par ce point, c'est effectivement un point double.&lt;/ref&gt;, un objet collé sur le dioptre est donc sa propre image ; dans la mesure où l'objet est de petite taille, on peut négliger sa courbure et le considérer comme linéique transverse, son image étant alors également linéique transverse ; comme &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit, par définition, &lt;math&gt;\;G_t(S) = +1\;&lt;/math&gt;.}}

==== Construction de l'image par un dioptre sphérique d'un objet linéique transverse ====

{{Al|5}}&lt;u&gt;Définitions préliminaires&lt;/u&gt; : On appelle plan focal objet le plan transverse passant par le foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}plan focal image le plan transverse passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt; ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle axe optique secondaire tout axe passant par le centre &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt; du dioptre, il possède une partie incidence contenue dans l'espace objet réel se prolongeant sans être dévié pour donner sa partie émergente contenue dans l'espace image réelle ;

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : }}on appelle foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal objet et

{{Al|5}}{{Transparent|Définitions préliminaires : On appelle }}foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i\;&lt;/math&gt; associé à un axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; l'intersection de cet axe optique secondaire avec le plan focal image.

{{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés&lt;/u&gt; : Justifier les propriétés des foyers secondaires objet et image associés à un  axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; :
# le foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour image le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)\big]&lt;/math&gt;,
# le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; admet pour antécédent le point à l'infini de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;\big[&lt;/math&gt;soit &lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}&lt;u&gt;Propriétés des foyers secondaires associés à un axe optique secondaire&lt;/u&gt; :
# foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet linéique transverse contenu dans le plan focal objet et de pied &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, objet noté &lt;math&gt;\;F_o\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ayant pour image le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{i,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et l'image étant linéique transverse, le point &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; a une image également située à l'infini sur l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon incident issu de &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; se prolonge dans l'espace image sans déviation, les parties incidente et émergente constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;center&gt;soit effectivement &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; B_{i,\, \infty}(\delta)&lt;/math&gt;,&lt;/center&gt;
# foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; associé à l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt; : considérons un objet dont l'image associée est contenue dans le plan focal image et de pied &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, image notée &lt;math&gt;\;F_i\varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; ayant pour antécédent le point à l'infini &lt;math&gt;\;A_{o,\, \infty}\;&lt;/math&gt; de l'axe optique principal et le dioptre étant aplanétique, le point &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; a un antécédent également situé à l'infini sur la partie incidente de l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; En effet le rayon émergent issu de &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; et passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; est le prolongement d'un rayon incident sans changement de direction, les parties incidente et émergente constituant l'axe optique secondaire de support &lt;math&gt;\;(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;center&gt;soit effectivement&lt;math&gt;\;B_{i,\, \infty}(\delta)\; \stackrel{\mathcal{D}}{\longrightarrow}\; \varphi_i(\delta)&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

{{Al|5}}Considérant un objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; réel, de pied &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; séparé du sommet &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; d'un dioptre sphérique concave convergent d'une distance supérieure au rayon non algébrisé du dioptre &lt;ref&gt; Pour la construction on prendra &lt;math&gt;\;n_o = 1,5\;&lt;/math&gt; (indice du verre) et &lt;math&gt;\;n_i = 1,0\;&lt;/math&gt; (indice de l'air).&lt;/ref&gt;, construire son image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; par le dioptre de deux façons différentes :
# en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisis parmi les trois suivants : passant par &lt;math&gt;\;C&lt;/math&gt;, passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;,
# en considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;un seul rayon incident suffit&quot; /&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;choisi parmi les deux suivants : passant par &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\big]&lt;/math&gt;.

{{Al|5}}Refaire les constructions précédentes avec un miroir concave divergent (obtenu en permutant les espaces objet et image).

{{Solution|contenu = [[File:Dioptre sphérique concave convergent - construction image.jpg|thumb|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave convergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par C, passant par F&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; ou parallèle à l'axe optique principal]]
# En considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les trois suivants (voir schéma ci-contre) : &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; et se prolongeant sans déviation, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; foyer principal objet et émergeant dans l'espace image parallèlement à l'axe optique principal, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à l'axe optique principal et émergeant dans l'espace image en passant par le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;l'image &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection des deux rayons réfractés correspondant aux deux rayons incidents choisis, &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant en projetant orthogonalement &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal.
{{clr}}
[[File:Dioptre sphérique concave convergent - construction image - bis.jpg|thumb|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave convergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant un des deux incidents issus de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou parallèle à un axe optique secondaire]]
# En considérant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; choisis parmi les deux suivants (voir schéma ci-contre) : &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;passant par un foyer secondaire objet &lt;math&gt;\;\varphi_o(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection du rayon incident et du plan focal objet&lt;math&gt;\big]\;&lt;/math&gt; et émergeant parallèlement à l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;c.-à-d., pour la partie incidente &lt;math&gt;\;C\varphi_o(\delta)&lt;/math&gt;, la partie réfractée en étant le prolongement sans déviation&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;&lt;math&gt;\;\parallel\;&lt;/math&gt; à un axe optique secondaire a priori quelconque &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et émergeant en passant par le foyer secondaire image &lt;math&gt;\;\varphi_i(\delta)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[&lt;/math&gt;point d'intersection de l'axe optique secondaire &lt;math&gt;\;(\delta)\;&lt;/math&gt; et du plan focal image&lt;math&gt;\big]&lt;/math&gt;, &lt;br&gt;{{Al|3}}&lt;math&gt;\;\succ\;&lt;/math&gt;l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant à l'intersection d'un des rayons réfractés correspondant au rayon incident choisi et de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; s'obtenant comme intersection de l'axe optique secondaire passant par &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; et du plan transverse passant par &lt;math&gt;\;A_i&lt;/math&gt;.

{{clr}}
{{Al|5}}Ci-dessous les constructions refaites sur un dioptre sphérique concave divergent, en considérant deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o\;&lt;/math&gt; à gauche puis en utilisant un rayon incident issu de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et la notion de foyers secondaires objet ou image à droite :
&lt;center&gt;
&lt;gallery&gt;
Dioptre sphérique concave divergent - construction image.jpg|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave divergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant deux des trois rayons incidents issus de B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par C, passant par F&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; ou parallèle à l'axe optique principal
Dioptre sphérique concave divergent - construction image - bis.jpg|Construction de l'image par un dioptre sphérique concave divergent d'un objet linéique transverse A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt;B&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; utilisant un des deux incidents issus de A&lt;sub&gt;o&lt;/sub&gt; : passant par un foyer secondaire objet ou parallèle à un axe optique secondaire
&lt;/gallery&gt;
&lt;/center&gt;}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) sous conditions de Gauss ===

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}On repère maintenant les points objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au centre &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes (avec origine au centre) de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\overline{CA_i}} - \dfrac{n_i}{\overline{CA_o}} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes de position avec origine en C&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = V\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; vergence du dioptre.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Descartes (origine au centre) utilisent &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; ou un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe 
optique principal :
* l'abscisse objet de Descartes (avec origine au centre) du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} = \overline{SC} + \overline{CA_o}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = \overline{R} + \pi_o\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Descartes (avec origine au centre) du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CA_i}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SC} + \overline{CA_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = \overline{R} + \pi_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au centre) en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{-(n_i - n_o)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\pi_i + \overline{R}} - \dfrac{n_o}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i\,(\pi_o + \overline{R}) - n_o\, (\pi_i + \overline{R})}{(\pi_i + \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R})} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, (\pi_i + \overline{R})\, (\pi_o + \overline{R}) = [n_i\, \pi_o - n_o\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}]\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}\, \pi_o - (n_o - n_i)\, \overline{R}\, \pi_i - (n_o - n_i)\, \overline{R}^2 = n_i\, \pi_o\, \overline{R} - n_o\, \pi_i\, \overline{R} - (n_o - n_i)\, \overline{R}^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;-(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i - n_o\, \overline{R}\, \pi_o + n_i\, \overline{R}\, \pi_i = 0\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;n_o\, \overline{R}\, \pi_o - n_i\, \overline{R}\, \pi_i = -(n_o - n_i)\, \pi_o\, \pi_i\;&lt;/math&gt; et enfin, en divisant les deux membres de l'équation par &lt;math&gt;\;\pi_o\, \pi_i\, \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;C.N.&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;la raison en étant que l'on cherche à établir une équation faisant intervenir des inverses de longueur à partir d'une équation comportant des produits de deux longueurs&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = V\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du dioptre ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}} = V&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;V = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; vergence du dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse.jpg|thumb|Schéma de démonstration de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes avec origine en C pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) ====

{{Al|5}}à partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au centre) &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Descartes de grandissement transverse avec origine en C&quot; /&gt;. 

{{Al|5}}En utilisant le schéma ci-contre vérifier directement cette relation.

{{clr}}
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \pi_o + \overline{R} \\ p_i = \pi_i + \overline{R} \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\pi_i + \overline{R}}{\pi_o + \overline{R}} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}\left( \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_i} \right)}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}} \left( \dfrac{1}{\overline{R}} + \dfrac{1}{\pi_o} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître des inverses de longueur comme celles de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes &lt;math&gt;\;\dfrac{n_o}{\pi_i} - \dfrac{n_i}{\pi_o} = \dfrac{-(n_o - n_i)}{\overline{R}} \Leftrightarrow \dfrac{n_o}{\pi_i} + \dfrac{n_o}{\overline{R}} = \dfrac{n_i}{\pi_o} + \dfrac{n_i}{\overline{R}}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\dfrac{\pi_i}{\overline{R}}}{\dfrac{\pi_o}{\overline{R}}}&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le centre du dioptre ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au centre) est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\pi_o = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = \overline{CS} = -\overline{R}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = 1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;

{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons émergents correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;C\;&lt;/math&gt; qui est transmis sans déviation et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; de point d'incidence &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; qui se réfracte en &lt;math&gt;\;S\;&lt;/math&gt; suivant une direction faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_i\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal, la direction du rayon incident, quant à elle, faisant l'angle &lt;math&gt;\;i_o\;&lt;/math&gt; par rapport à l'axe optique principal telle que &lt;math&gt;n_i\,i_i = n_o\, i_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;relation de Kepler&quot; /&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oC\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iB_iC\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o}) = -\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&lt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{CA_i} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors centre bis&quot; /&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oCA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iCA_i})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{CA_o}} = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{CA_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = \dfrac{\overline{CA_i}}{\overline{CA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Descartes (avec origine au centre)&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{CA_i}}{\overline{CA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\pi_i}{\pi_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq C\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c}\pi_o = \overline{CA_o}\\ \pi_i = \overline{CA_i} \end{array}\right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\pi_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\pi_i = f_i - \overline{R}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\pi_o = f_o - \overline{R}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de conjugaison de position et de grandissement transverse de Newton sous conditions de Gauss ===

{{Al|5}}On repère maintenant le point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; du dioptre sphérique et le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; relativement au foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; du même dioptre sphérique en définissant
* l'abscisse objet de Newton de &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; et
* l'abscisse image de Newton de &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.

==== Relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir que la relation de conjugaison de position (ou 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\; \overline{F_iA_i}\; \overline{F_oA_o} = \overline{SF_i}\; \overline{SF_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt; ou &lt;math&gt;\;\sigma_i \; \sigma_o = f_i\; f_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot;&gt; On retrouve la forme commune vue pour un miroir sphérique et qui sera établie au chapitre suivant pour une lentille mince &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;à condition que les deux formes de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton soient explicitées uniquement en fonction des abscisses objets ou des abscisses images et non simultanément des deux&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; avec &lt;math&gt;\;f_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;f_o\;&lt;/math&gt; distances focales image et objet du dioptre.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Les relations de conjugaison de Newton utilisent &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;F_i\;&lt;/math&gt; comme origine pour repérer un point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal :
* l'abscisse objet de Newton du point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse objet de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_o =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_o} = \overline{SF_o} + \overline{F_oA_o}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_o = f_o + \sigma_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i + \sigma_o\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;vergence dioptre&quot;&gt; On rappelle la vergence &lt;math&gt;\;V = \dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; et
* l'abscisse image de Newton du point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; notée &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}\;&lt;/math&gt; est liée à son abscisse image de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;p_i =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;\overline{SA_i} = \overline{SF_i} + \overline{F_iA_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;p_i = f_i + \sigma_i&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on obtient la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Newton en reportant les changements d'origine des abscisses objet et image de Descartes précédemment définis, dans la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de position de Descartes &lt;math&gt;\big(&lt;/math&gt;avec origine en &lt;math&gt;\;S\big)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{p_i} - \dfrac{n_o}{p_o} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On rappelle que cette relation est applicable en tout point objet autre que le sommet, la vergence &lt;math&gt;\;V\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{f_i} = -\dfrac{n_o}{f_o}&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; soit &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{\sigma_i + f_i} - \dfrac{n_o}{\sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right) - n_o\, (\sigma_i + f_i)}{(\sigma_i + f_i) \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right)} = \dfrac{n_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; et, en égalant le produit des extrêmes et celui des moyens &lt;ref name=&quot;produits des extrêmes et des moyens&quot; /&gt; &lt;math&gt;\;n_i\, (\sigma_i + f_i) \left( \sigma_o - \dfrac{n_o}{n_i}\, f_i \right)&lt;/math&gt; &lt;math&gt;= (n_i\, \sigma_o - n_o\, \sigma_i - 2\, n_o\, f_i)\, f_i\;&lt;/math&gt; ou, en développant chaque membre &lt;math&gt;\;n_i\, \sigma_o\, \sigma_i + n_i\, f_i\, \sigma_o - n_o\, f_i\, \sigma_i - n_o\, f_i^2 =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;n_i\, \sigma_o\, f_i - n_o\, \sigma_i\, f_i - 2\, n_o\, f_i^2\;&lt;/math&gt; soit, après simplification &lt;math&gt;\;n_i\, \sigma_o\, \sigma_i = -n_o\, f_i^2\;&lt;/math&gt; et enfin, sachant que &lt;math&gt;\;f_o = -\dfrac{n_o}{n_i}\, f_i&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; On remplacera une seule fois &lt;math&gt;\;n_o\, f_i\;&lt;/math&gt; par &lt;math&gt;\;-n_i\, f_o\;&lt;/math&gt; pour obtenir une forme symétrique de la relation puis on simplifiera l'équation obtenue par &lt;math&gt;\;n_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt;, &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; ; la &lt;u&gt;1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Applicable en tout point objet autre que le foyer principal objet du dioptre &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt; en effet si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est en &lt;math&gt;\;F_o&lt;/math&gt;, l'image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal et on obtient une forme indéterminée avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; valant &lt;math&gt;\;\infty\big)&lt;/math&gt; ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de position de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que la relation de conjugaison de position de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS} = -f_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS} = -f_i\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_o\, f_i&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; &lt;br&gt;avec &lt;math&gt;\;f_i = -\dfrac{n_i}{n_o}\,f_o = -\dfrac{(n_o - n_i)}{n_i}\,\overline{R}\;&lt;/math&gt; distance focale image du dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; et &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} \sigma_o = \overline{F_oA_o}\\ \sigma_i = \overline{F_iA_i}\end{array} \right\rbrace&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

[[File:Dioptre sphérique - grandissement transverse Newton.jpg|thumb|Schéma de démonstration des deux formes de la relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton ====

{{Al|5}}À partir de la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Descartes (avec origine au sommet) et par changement d'origine, établir la relation de conjugaison de grandissement transverse (ou 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison) de Newton &lt;ref name=&quot;deux formes de grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Applicabilité relation de Newton&quot; /&gt;.

{{clr}} 
{{Solution|contenu ={{Al|5}}La démonstration se fait en partant de la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse origine au sommet&quot; /&gt; et en faisant le changement d'origines déjà exposé &lt;math&gt;\;\left\lbrace \begin{array}{c} p_o = \sigma_o + f_o \\ p_i = \sigma_i + f_i \end{array}\right\rbrace\;&lt;/math&gt; soit &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i + f_i}{\sigma_o + f_o} = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i \left( 1 + \dfrac{f_i}{\sigma_i} \right)}{f_o \left( 1 + \dfrac{\sigma_o}{f_o} \right)}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; Le but de cette opération étant de faire apparaître, au numérateur et au dénominateur, deux grandeurs égales découlant de la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton &lt;math&gt;\;\sigma_o\, \sigma_i = f_i\, f_o \Leftrightarrow \dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;1 + \dfrac{\sigma_i}{f_i} = 1 + \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; d'où la simplification suivante.&lt;/ref&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{\sigma_i}{f_o} =&lt;/math&gt; &lt;math&gt;-\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt;  &lt;ref name=&quot;vergence dioptre&quot; /&gt; ; la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; s'écrit &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton dioptre&quot;&gt; Applicable en tout point objet ;&lt;br&gt;{{Al|3}}bien que la relation de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) qui a été utilisée au départ ne soit pas applicable au sommet du dioptre, on vérifie aisément que cette forme de relation de conjugaison de grandissement transverse de Newton est applicable en &lt;math&gt;\;A_o = S\;&lt;/math&gt; en effet &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oS} = -f_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;resp. &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iS} = -f_i\big)\;&lt;/math&gt; d'où &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = +1\;&lt;/math&gt;.&lt;/ref&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}comme la 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Newton s'écrivant &lt;math&gt;\;\sigma_i\, \sigma_o = f_i\, f_o\;&lt;/math&gt; est équivalente à &lt;math&gt;\;\dfrac{\sigma_i}{f_i} = \dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit aisément la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison (approchée) de Newton&lt;/u&gt; &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;applicabilité grandissement transverse de Newton&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;ref name=&quot;Forme commune avec miroir et lentille&quot; /&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}Ayant construit l'image &lt;math&gt;\;A_iB_i\;&lt;/math&gt; de l'objet linéique transverse &lt;math&gt;\;A_oB_o\;&lt;/math&gt; en positionnant &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; comme intersection des rayons réfractés correspondants à deux rayons incidents issus de &lt;math&gt;\;B_o&lt;/math&gt;, le 1&lt;sup&gt;er&lt;/sup&gt; passant par &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; qui émerge en &lt;math&gt;\;K\;&lt;/math&gt; parallèlement à l'axe optique principal et le 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; parallèle à l'axe optique principal qui se réfracte en &lt;math&gt;\;H\;&lt;/math&gt; en passant par &lt;math&gt;\;F_i&lt;/math&gt;, le point &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt; étant le projeté orthogonal du point &lt;math&gt;\;B_i\;&lt;/math&gt; sur l'axe optique principal ;

{{Al|5}}le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_iB_iF_i\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;HF_iS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_iA_i} &lt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer bis&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS}) = \dfrac{\overline{SH}}{\overline{SF_i}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SH}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SH} = \overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_iF_iA_i})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{HF_iS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;-\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{F_iA_i}} = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{F_iA_i}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 1&lt;sup&gt;ère&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{F_iA_i}}{\overline{SF_i}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\sigma_i}{f_i}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq A_{o,\,\infty}\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_i = \overline{F_iA_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}de même le grandissement transverse étant défini par &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}}&lt;/math&gt;, on le déterminera en exprimant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS})\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles non algébrisés&quot; /&gt; respectivement dans les triangles rectangles &lt;math&gt;\;A_oB_oF_o\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;KF_oS\;&lt;/math&gt; soit : 
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o}) = \dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{A_oB_o}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{F_oA_o} &gt; 0\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;hors foyer&quot; /&gt;,
* &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS}) = -\dfrac{\overline{SK}}{\overline{SF_o}}&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SK}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SF_o} &lt; 0\;&lt;/math&gt; ou, comme &lt;math&gt;\;\overline{SK} = \overline{A_iB_i}\;&lt;/math&gt; on en déduit &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS}) = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}égalant &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{B_oF_oA_o})\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\widehat{KF_oS})&lt;/math&gt;, on en déduit : &lt;math&gt;\;\dfrac{\overline{A_oB_o}}{\overline{F_oA_o}} = -\dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{SF_o}}\;&lt;/math&gt; ou encore &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = \dfrac{\overline{A_iB_i}}{\overline{A_oB_o}} = -\dfrac{\overline{SF_o}}{\overline{F_oA_o}}\;&lt;/math&gt; d'où &lt;center&gt;une 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; forme de la &lt;u&gt;2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) [ou &lt;u&gt;relation de conjugaison&lt;/u&gt; (approchée) &lt;u&gt;de grandissement transverse&lt;/u&gt;] &lt;u&gt;de Newton&lt;/u&gt; d'un dioptre sphérique (concave convergent) &lt;ref name=&quot;indépendance de la nature dioptre&quot; /&gt; &lt;br&gt;&lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{\overline{SF_o}}{\overline{F_oA_o}}\;&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;\;G_t(A_o) = -\dfrac{f_o}{\sigma_o}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;nécessitant &lt;math&gt;\;A_o \neq F_o\big)\;&lt;/math&gt; avec &lt;math&gt;\;\sigma_o = \overline{F_oA_o}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;
{{Al|5}}&lt;u&gt;Remarques&lt;/u&gt; : si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le point à l'infini de l'axe optique principal, &lt;math&gt;\;\sigma_o\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i = 0\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du point à l'infini de l'axe optique principal étant le foyer principal image &lt;math&gt;\;F_i\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse nul,

{{Al|5}}{{Transparent|Remarques : }}si &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt; est le foyer principal objet, &lt;math&gt;\;\sigma_o = 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\sigma_i\;&lt;/math&gt; vaut &lt;math&gt;\;\infty\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;\big(&lt;/math&gt;l'image du foyer principal objet &lt;math&gt;\;F_o\;&lt;/math&gt; étant le point à l'infini de l'axe optique principal&lt;math&gt;\big)\;&lt;/math&gt; donnant un grandissement transverse infini.}}

=== Relations de Lagrange - Helmholtz sous conditions de Gauss ===

[[File:Dioptre sphérique - grandissement angulaire.jpg|thumb|Schéma de détermination du grandissement angulaire en repérage de Descartes (avec origine en S) pour un dioptre sphérique concave convergent]]

==== Expression de Descartes (avec origine au sommet) du grandissement angulaire d'un pinceau incident issu d'un point objet ====

{{Al|5}}On rappelle que le grandissement angulaire d'un pinceau lumineux incident issu d'un point objet &lt;math&gt;\;A_o\;&lt;/math&gt;, de direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_o\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal, le pinceau se réfractant sur le dioptre en convergeant vers le point image &lt;math&gt;\;A_i\;&lt;/math&gt;, avec une direction faisant un angle &lt;math&gt;\;\theta_i\;&lt;/math&gt; avec l'axe optique principal, est défini selon &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Angles petits&quot; /&gt; ;

{{Al|5}}en utilisant le schéma ci-contre, établir l'expression du grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o}\;&lt;/math&gt; en fonction des abscisses objet et image de Descartes (avec origine au sommet), respectivement &lt;math&gt;\;p_o = \overline{SA_o}\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;p_i = \overline{SA_i}\;&lt;/math&gt; &lt;ref&gt; L'expression du grandissement angulaire a été établie en utilisant un dioptre sphérique concave convergent mais elle reste applicable pour un dioptre sphérique des trois autres types.&lt;/ref&gt;.

{{Solution|contenu ={{Al|5}}On détermine le grandissement angulaire par évaluation de
&lt;math&gt;\;\tan(\theta_o)\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i)&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\big(\theta_o\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\;&lt;/math&gt; sur la figure ci-dessus&lt;math&gt;\big)&lt;/math&gt; respectivement dans les triangles &lt;math&gt;\;A_oIS\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;A_iIS\;&lt;/math&gt; soit :
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_oIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_o}}\;&lt;/math&gt;   &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\overline{SA_o}_{\rightarrow} &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_o) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_o}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_o| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_o \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}&lt;/math&gt; ;
* dans le triangle &lt;math&gt;\;A_iIS&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{SI}}{\overline{SA_i}}\;&lt;/math&gt; &lt;math&gt;\big[\overline{SI}\;&lt;/math&gt; étant &lt;math&gt;\;&gt; 0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\overline{SA_i}_{\leftarrow} &gt; 0\;&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\;\theta_i &lt; 0\big]\;&lt;/math&gt; ou, &lt;math&gt;\;\tan(\theta_i) = -\dfrac{\overline{SI}}{p_i}\;&lt;/math&gt; soit, avec &lt;math&gt;\;|\theta_i| \ll 1&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;\theta_i \simeq
-\dfrac{\overline{SI}}{p_i}&lt;/math&gt; ;
{{Al|5}}on en déduit &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{\dfrac{-\overline{SI}}{p_i}}{-\dfrac{\overline{SI}}{p_o}}\;&lt;/math&gt; soit, en simplifiant par &lt;math&gt;\;\overline{SI}&lt;/math&gt;, l'expression souhaitée du &lt;center&gt;grandissement angulaire &lt;math&gt;\;G_a(A_o) = \dfrac{\theta_i}{\theta_o} \simeq \dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;.&lt;/center&gt;}}

==== Établissement de la relation de Lagrange - Helmholtz ====

{{Al|5}}Á l'aide des relations de conjugaison de grandissement transverse de Descartes (avec origine au sommet) et de l'expression du grandissement angulaire dans le même repérage, vérifier la relation de Lagrange - Helmholtz &lt;center&gt; &lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{n_o}\; G_t(A_o)\; G_a(A_o) = 1\;&lt;/math&gt; &lt;ref name=&quot;Lagrange - Helmholtz dioptre&quot;&gt; Cette relation est la même que celle que l'on trouvera dans le chapitre suivant sur les lentilles minces, dans le cas usuel d'une lentille mince l'espace image étant de même indice que l'espace objet&lt;/ref&gt;.&lt;/center&gt;

{{Solution|contenu ={{Al|5}}Connaissant le grandissement transversal donné par la 2&lt;sup&gt;ème&lt;/sup&gt; relation de conjugaison de Descartes (avec origine au sommet) &lt;math&gt;\;G_t(A_o) \simeq \dfrac{n_o}{n_i}\, \dfrac{p_i}{p_o}\;&lt;/math&gt; et l'expression du grandissement angulaire précédemment trouvée &lt;math&gt;\;G_a(A_o) \simeq \dfrac{p_o}{p_i}&lt;/math&gt;, on en déduit le lien entre grandissements angulaire et transversal indépendant de la position du point objet &lt;math&gt;\;A_o&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;\;G_a(A_o)\; G_t(A_o) \simeq \dfrac{p_o}{p_i} \times \dfrac{n_o}{n_i}\; \dfrac{p_i}{p_o} = \dfrac{n_o}{n_i}\;&lt;/math&gt; soit finalement &lt;center&gt;&lt;math&gt;\;\dfrac{n_i}{n_o}\; G_t(A_o)\; G_a(A_o) = 1\;&lt;/math&gt; ce qui constitue la relation de Lagrange - Helmholtz cherchée &lt;ref name=&quot;Lagrange - Helmholtz dioptre&quot; /&gt;.&lt;/center&gt;}}

== Notes et références ==

&lt;references /&gt;

{{Bas de page
  | idfaculté = physique
  | précédent = [[../Optique géométrique : miroir plan/]]
  | suivant   = [[../Optique géométrique : lentilles minces/]]
}}</text>
      <sha1>30hen94fpsjph8ehtmcj1yhwhrn1p0k</sha1>
    </revision>
  </page>
  <page>
    <title>Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Annexe/Atableur</title>
    <ns>104</ns>
    <id>75146</id>
    <revision>
      <id>881030</id>
      <parentid>881010</parentid>
      <timestamp>2022-08-02T18:17:17Z</timestamp>
      <contributor>
        <username>Mekkiwik</username>
        <id>5298</id>
      </contributor>
      <comment>/* cbc données intercalaires */</comment>
      <model>wikitext</model>
      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="1900189" xml:space="preserve">{{Annexe
  | idfaculté = biologie
  | numéro    = 12
  | niveau    = 
  | précédent = [[../archeo/]]
  | suivant = [[../Apmq/]]
}}
__TOC__
==bacilli==
===Bacillus subtilis===
====bsu====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#Bacillus subtilis|bsu]] 
&lt;pre&gt;
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168;;;;
43.6%GC;7.3.19 Paris;86;doubles;intercal
;;;;
;9810..11364;16s;@2;99
;11464..11540;atc;;11
;11552..11627;gca;;81
;11709..14636;23s;;55
;14692..14810;5s;;
;;;;
; 22292..22384;tca;;
;;;;
;30279..31832;16s;;99
;31932..32008;atc;;11
;32020..32095;gca;;81
;32177..35103;23s;;133
;35237..35355;5s;;
;;;;
;70181..70257;atg;;9
;70267..70338;gaa;;
;;;;
;90536..92089;16s;@1;164
;92254..95181;23s;;55
;95237..95354;5s;;20
;95375..95450;gta;;4
;95455..95530;aca;;36
;95567..95642;aaa;;6
;95649..95731;cta;;40
;95772..95846;ggc;;14
;95861..95946;tta;;9
;95956..96032;cgt;;27
;96060..96136;cca;;9
;96146..96221;gca;;170
;96392..97945;16s;;164
;98110..101037;23s;;55
;101093..101211;5s;;
;;;;
;160893..162445;16s;;164
;162610..165535;23s;;55
;165591..165707;5s;;46
;165754..165825;aac;;4
;165830..165902;acc;;56
;165959..166033;ggc;;30
;166064..166140;cgt;;27
;166168..166244;cca;;8
;166253..166328;gca;;171
;166500..168053;16s;;164
;168218..171141;23s;;55
;171197..171314;5s;;183
;171498..173049;16s;;164
;173214..176141;23s;;55
;176197..176315;5s;;
;;;;
;194205..194279;gaa;;3
;194283..194358;gta;;4
;194363..194435;aca;;22
;194458..194542;tac;;4
;194547..194621;caa;;
;;;;
;528704..528778;aac;;4
;528783..528873;agc;;29
;528903..528974;gaa;;11
;528986..529060;caa;;26
;529087..529162;aaa;;11
;529174..529255;cta;;80
;529336..529422;ctc;;
;;;;
;635110..635186;cgt;;13
;635200..635273;gga;;159
;635433..636987;16s;;167
;637155..640082;23s;;55
;640138..640254;5s;;13
;640268..640344;atgf;;60
;640405..640481;gac;;
;;;;
;946696..948250;16s;;167
;948418..951345;23s;;111
;951457..951572;5s;;9
;951582..951656;aac;;5
;951662..951753;tcc;;34
;951788..951859;gaa;;9
;951869..951944;gta;;9
;951954..952030;atgf;;11
;952042..952118;gac;;12
;952131..952206;ttc;;5
;952212..952284;aca;;22
;952307..952391;tac;;5
;952397..952470;tgg;;24
;952495..952570;cac;;9
;952580..952651;caa;;49
;952701..952775;ggc;;5
;952781..952851;tgc;;7
;952859..952947;tta;@3;265
;953213..953294;ttg;;
;;;;
;967065..967138;gga;;
;;;;
;1262789..1262861;gtc;;
;;;;
comp;2003276..2003348;agg;;
;;;;
;2563889..2563959;caa;;
;;;;
comp;2899816..2899889;aga;;
;;;;
comp;3171879..3171950;gaa;;25
comp;3171976..3172066;agc;;3
comp;3172070..3172144;aac;;10
comp;3172155..3172231;atc;;15
comp;3172247..3172320;gga;;10
comp;3172331..3172406;cac;;17
comp;3172424..3172499;ttc;;12
comp;3172512..3172588;gac;;11
comp;3172600..3172676;atgf;;17
comp;3172694..3172786;tca;;6
comp;3172793..3172869;atgi;;2
comp;3172872..3172948;atgj;;19
comp;3172968..3173040;gca;;5
comp;3173046..3173122;cca;;15
comp;3173138..3173214;cgt;;9
comp;3173224..3173309;tta;;14
comp;3173324..3173398;ggc;;5
comp;3173404..3173490;ctg;;10
comp;3173501..3173576;aaa;;37
comp;3173614..3173689;aca;;32
comp;3173722..3173797;gta;;20
comp;3173818..3173935;5s;;55
comp;3173991..3176918;23s;;167
comp;3177086..3178640;16s;;
;;;;
comp;3194455..3194527;gcc;;
;;;;
comp;3545889..3545964;cgg;;
;;;;
comp;4154787..4154859;ttc;;35
comp;4154895..4154971;gac;;81
comp;4155053..4155124;gaa;;9
comp;4155134..4155209;aaa;;
&lt;/pre&gt;

====bsu blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_blocs|bsu blocs]]
&lt;pre&gt;
bsu blocs;;;;;;;;;
Types;;;;;;;;;
I;I1;I2;I3;I4;;II;II1;II2;II3
16s;167;167;164;164;;16s;164;164;164
23s;111;55;55;55;;23s;55;55;55
5s;9;20;46;20;;5s;;;
;5;32;4;4;;;;;
;aac;gta;aac;gta;;;;;
;**15aas;**20aas;**5aas;** 8aas;;;;;
III;;;;;;IV;;;
16s;99;99;;;;cgt;13;;
atc;11;11;;;;gga;159;;
gca;81;81;;;;16s;167;;
23s;55;133;;;;23s;55;;
5s;;;;;;5s;13;;
;;;;;;atgf;60;;
;;;;;;gac;;;
Groupes;;;;;;;;;
;16s;164;;;;16s;164;;
I3;23s;55;;;I4;23s;55;;
;5s;46;;;;5s;20;;
;aac;4;;;;gta;4;;
;**4aas;8;;;;** 7aas;9;;
;gca;171;;;;gca;170;;
II1;16s;164;;;II3;16s;164;;
;23s;55;;;;23s;55;;
II2;5s;183;;;;5s;;;
;16s;164;;;;;;;
;23s;55;;;;;;;
;5s;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====bsu données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_données_intercalaires|bsu données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;bsu;fx;fc;bsu;fx40;fc40;bsu;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
0;0;0;2;25;0;2;25;-1;0;72;134;111;tRNA 16s;;;tRNA tRNA;;contig
0;0;10;28;231;1;3;41;-2;0;4;168;179;170;;gca;4;;gta
0;0;20;45;399;2;2;31;-3;0;0;199;82;171;;gca;36;;aca
0;0;30;70;185;3;3;34;-4;14;229;227;333;159;;gga;6;;aaa
0;0;40;158;121;4;2;27;-5;0;0;122;78;16s tRNA;;;40;;cta
0;0;50;81;84;5;3;19;-6;2;0;180;193;2* 99;;atc;14;;ggc
0;1;60;22;92;6;0;21;-7;1;11;52;90;tRNA 23s;;;9;;tta
2;0;70;21;119;7;5;16;-8;1;75;130;172;2* 81;;gca;27;;cgt
1;0;80;32;121;8;3;7;-9;1;0;232;840;5s tRNA;;;9;;cca
3;0;90;23;111;9;3;16;-10;1;5;107;93;2* 20;;gta;**;;gca
1;0;100;25;91;10;4;19;-11;1;43;383;86;46;;aac;4;;aac
1;1;110;24;106;11;0;32;-12;0;0;223;66;13;;atgf;56;;acc
1;0;120;39;87;12;2;54;-13;0;6;;63;9;;aac;30;;ggc
0;2;130;42;85;13;5;46;-14;1;19;;106;tRNA tRNA;;intra;27;;cgt
0;1;140;27;66;14;12;47;-15;0;0;;284;2* 11;;atc gca;8;;cca
0;0;150;42;68;15;4;52;-16;1;5;;269;tRNA tRNA;;;**;;gca
0;0;160;35;65;16;3;31;-17;0;18;CDS 16s;;9;;atgj;13;;cgt
0;1;170;33;58;17;6;41;-18;0;0;350;349;**;;gaa;**;;gga
2;1;180;29;53;18;5;44;-19;1;4;243;;3;;gaa;60;;atgf
0;0;190;26;33;19;5;23;-20;1;11;309;;4;;gta;**;;gac
1;1;200;19;34;20;3;29;-21;0;0;291;;22;;aca;5;;aac
0;0;210;28;30;21;2;25;-22;0;2;5s 16s;;4;;tac;34;;tcc
0;0;220;17;14;22;2;29;-23;0;8;183;;**;;caa;9;;gaa
0;2;230;24;20;23;3;22;-24;0;0;16s 23s;;4;;aac;9;;gta
0;1;240;16;27;24;7;24;-25;1;1;5* 164;;29;;agc;11;;atgf
0;0;250;16;18;25;4;15;-26;0;8;3* 167;;11;;gaa;12;;gac
0;0;260;12;14;26;13;12;-27;0;0;23s 5s;;26;;caa;5;;ttc
1;0;270;19;16;27;12;12;-28;0;0;8* 55;;11;;aaa;22;;aca
0;0;280;13;16;28;3;14;-29;0;6;133;;80;;cta;5;;tac
1;0;290;13;6;29;10;17;-30;0;0;111;;**;;ctc;24;;tgg
0;0;300;6;9;30;14;15;-31;0;1;5s CDS;;35;;ttc;9;;cac
0;0;310;8;8;31;9;16;-32;0;2;175;36;81;;gac;49;;caa
0;0;320;5;6;32;10;12;-33;0;0;237;;9;;gaa;5;;ggc
0;0;330;1;8;33;16;18;-34;0;1;767;;**;;aaa;7;;tgc
1;0;340;8;9;34;11;7;-35;0;3;;;;;;265;;tta
0;0;350;6;5;35;16;11;-36;0;0;;;;;;**;;ttg
0;0;360;4;4;36;19;13;-37;0;1;;;;;;25;;gaa
0;0;370;4;2;37;13;5;-38;0;2;;;;;;3;;agc
0;0;380;4;7;38;17;11;-39;0;0;;;;;;10;;aac
0;1;390;5;8;39;26;21;-40;1;1;;;;;;15;;atc
0;0;400;1;2;40;21;7;-41;0;8;;;;;;10;;gga
1;0;reste;60;49;reste;790;1551;-42;1;0;;;;;;17;;cac
16;12;total;1093;2512;total;1093;2512;-43;0;3;;;;;;12;;ttc
15;12;diagr;1031;2438;diagr;301;936;-44;0;2;;;;;;11;;gac
0;0; t30;143;815;;;;-45;0;0;;;;;;17;;atgf
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;;6;;tca
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;2;;;;;;2;;atgi
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;;19;;atgj
;x;1091;35;2;1128;;;-49;0;1;;;;;;5;;gca
;c;2487;573;25;3085;;;-50;0;2;;;;;;15;;cca
;;;;;4213;324;;reste;7;17;;;;;;9;;cgt
;;;;;;4537;;total;35;573;;;;;;14;;tta
;;;;;;;;;;;;;;;;5;;ggc
;;;;;;;;;;;;;;;;10;;ctg
;;;;;;;;;;;;;;;;37;;aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;32;;aca
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;gta
&lt;/pre&gt;
=====bsu autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_autres_intercalaires_aas|bsu autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;bsu;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;6994;9459;350;*;
;;rRNA;9810;11364;99;*;16s
;;tRNA;11464;11540;11;*;atc
;;tRNA;11552;11627;81;*;gca
;;rRNA;11709;14636;55;*;23s
;;rRNA;14692;14810;36;*;5s
fin;comp;CDS;14847;15794;;0;
deb;;CDS;19968;20558;52;*;
;;misc_RNA;20611;20823;56;*;
deb;;CDS;20880;22157;134;*;
;;tRNA;22292;22384;111;*;tca
fin;comp;CDS;22496;23149;;;
deb;;CDS;25852;26337;41;*;
;;misc_RNA;26379;26732;81;*;
fin;;CDS;26814;28505;;;
deb;;CDS;29772;30035;243;*;
;;rRNA;30279;31832;99;*;16s
;;tRNA;31932;32008;11;*;atc
;;tRNA;32020;32095;81;*;gca
;;rRNA;32177;35103;133;*;23s
;;rRNA;35237;35355;175;*;5s
fin;;CDS;35531;35725;;;
deb;;CDS;69626;70012;168;*;
;;tRNA;70181;70257;9;*;atgj
;;tRNA;70267;70338;199;*;gaa
fin;;CDS;70538;73021;;;
deb;;CDS;88727;90226;309;*;
;;rRNA;90536;92089;164;*;16s
;;rRNA;92254;95181;55;*;23s
;;rRNA;95237;95354;20;*;5s
;;tRNA;95375;95450;4;*;gta
;;tRNA;95455;95530;36;*;aca
;;tRNA;95567;95642;6;*;aaa
;;tRNA;95649;95731;40;*;cta
;;tRNA;95772;95846;14;*;ggc
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;comp;tRNA;3172070;3172144;10;*;aac
;comp;tRNA;3172155;3172231;15;*;atc
;comp;tRNA;3172247;3172320;10;*;gga
;comp;tRNA;3172331;3172406;17;*;cac
;comp;tRNA;3172424;3172499;12;*;ttc
;comp;tRNA;3172512;3172588;11;*;gac
;comp;tRNA;3172600;3172676;17;*;atgf
;comp;tRNA;3172694;3172786;6;*;tca
;comp;tRNA;3172793;3172869;2;*;atgi
;comp;tRNA;3172872;3172948;19;*;atgj
;comp;tRNA;3172968;3173040;5;*;gca
;comp;tRNA;3173046;3173122;15;*;cca
;comp;tRNA;3173138;3173214;9;*;cgt
;comp;tRNA;3173224;3173309;14;*;tta
;comp;tRNA;3173324;3173398;5;*;ggc
;comp;tRNA;3173404;3173490;10;*;ctg
;comp;tRNA;3173501;3173576;37;*;aaa
;comp;tRNA;3173614;3173689;32;*;aca
;comp;tRNA;3173722;3173797;20;*;gta
;comp;rRNA;3173818;3173935;55;*;5s
;comp;rRNA;3173991;3176918;167;*;23s
;comp;rRNA;3177086;3178640;464;*;16s
;;misc_RNA;3179105;3179206;99;*;
fin;;CDS;3179306;3179884;;0;
deb;;CDS;3187503;3188048;124;*;
;;misc_RNA;3188173;3188341;72;*;
fin;;CDS;3188414;3189082;;;
deb;;CDS;3193863;3194348;106;*;
;comp;tRNA;3194455;3194527;107;*;gcc
fin;comp;CDS;3194635;3195465;;;
deb;;CDS;3335414;3335545;-132;*;
;comp;ncRNA;3335414;3335545;205;*;
fin;comp;CDS;3335751;3336272;;;
deb;comp;CDS;3359995;3360780;156;*;
;comp;misc_RNA;3360937;3361184;-211;*;
fin;comp;CDS;3360974;3361111;;;
deb;comp;CDS;3363266;3364291;105;*;
;comp;misc_RNA;3364397;3364503;114;*;
fin;comp;CDS;3364618;3364962;;;
deb;comp;CDS;3403493;3404437;108;*;
;comp;misc_RNA;3404546;3404676;158;*;
fin;;CDS;3404835;3405626;;0;
deb;comp;CDS;3419656;3421065;103;*;
;comp;misc_RNA;3421169;3421348;116;*;
fin;comp;CDS;3421465;3421605;;0;
deb;comp;CDS;3449732;3450526;185;*;
;comp;misc_RNA;3450712;3451071;176;*;
fin;comp;CDS;3451248;3451718;;;
deb;comp;CDS;3489910;3491253;68;*;
;comp;misc_RNA;3491322;3491557;97;*;
fin;comp;CDS;3491655;3492689;;;
deb;;CDS;3544642;3545604;284;*;
;comp;tRNA;3545889;3545964;269;*;cgg
fin;;CDS;3546234;3546827;;0;
deb;comp;CDS;3854256;3856172;53;*;
;comp;misc_RNA;3856226;3856447;31;*;
;comp;misc_RNA;3856479;3856700;81;*;
fin;comp;CDS;3856782;3856937;;;
deb;;CDS;3946394;3946909;0;*;
;;misc_RNA;3946910;3947116;41;*;
fin;;CDS;3947158;3948399;;;
deb;comp;CDS;3987927;3988763;76;*;
;comp;misc_RNA;3988840;3988942;388;*;
fin;;CDS;3989331;3989873;;0;
deb;;CDS;3997221;3997709;65;*;
;;misc_RNA;3997775;3997881;82;*;
deb;;CDS;3997964;3999097;68;*;
;;misc_RNA;3999166;3999272;77;*;
fin;;CDS;3999350;4000486;;0;
deb;comp;CDS;4004288;4005136;386;*;
;;misc_RNA;4005523;4005625;126;*;
fin;;CDS;4005752;4006945;;0;
deb;comp;CDS;4095915;4096907;89;*;
;;misc_RNA;4096997;4097409;6;*;
fin;;CDS;4097416;4098150;;;
deb;comp;CDS;4153696;4154403;383;*;
;comp;tRNA;4154787;4154859;35;*;ttc
;comp;tRNA;4154895;4154971;81;*;gac
;comp;tRNA;4155053;4155124;9;*;gaa
;comp;tRNA;4155134;4155209;223;*;aaa
fin;comp;CDS;4155433;4156725;;;
deb;comp;CDS;4169166;4169612;189;*;
;comp;misc_RNA;4169802;4169919;125;*;
fin;;CDS;4170045;4171352;;0;
&lt;/pre&gt;

====bsu intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_intercalaires_entre_cds|bsu intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
23.2.22;;;;;;;;;;
bsu;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;608;14.4;'''négatif ;-12;19;-1 à -164;'''4 215 606;-1;608
;'''zéro;27;0.6;;;;;'''intercals;0;27
;'''1 à 200;3030;71.9;'''0 à 200;72;56;;'''401 590;5;165
;'''201 à 370;412;9.8;'''201 à 370;258;44;;'''9.5%;10;94
;'''371 à 600;118;2.8;'''371 à 600;458;67;;;15;254
;'''601 à max;18;0.4;'''601 à 1021;755;132;;;20;190
;'''total 4213;&lt;201;87.0;'''total 4207;92;113;-164 à 1021;;25;133
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;122
390880;7511;-1;608;-70;19;;0;27;35;126
3671416;1306;0;27;-60;2;;-1;°72;40;153
2160565;1021;1;°44;-50;5;;-2;4;45;100
2221061;952;2;33;-40;19;;-3;0;50;65
2226176;950;3;37;-30;10;'''min à -1;-4;°243;55;54
1886057;824;4;°29;-20;38;608;-5;0;60;60
2733772;809;5;22;-10;105;14.4%;-6;2;65;62
785543;783;6;21;0;437;;-7;12;70;78
3699446;783;7;21;10;259;;-8;°76;75;84
2060817;777;8;10;20;444;;-9;1;80;69
875428;731;9;19;30;255;;-10;6;85;83
1446317;682;10;23;40;279;'''1 à 100;-11;°44;90;51
2051329;669;11;32;50;165;2059;-12;0;95;59
2054599;627;12;°56;60;114;48.9%;-13;6;100;57
873402;625;13;°51;70;140;;-14;°20;105;57
1872812;623;14;°59;80;153;;-15;0;110;73
1278565;619;15;°56;90;134;;-16;6;115;65
1900080;602;16;34;100;116;;-17;°18;120;61
1944113;594;17;°47;110;130;;-18;0;125;66
2091705;594;18;°49;120;126;;-19;5;130;61
548710;588;19;28;130;127;;-20;°12;135;51
674832;584;20;°32;140;93;;-21;0;140;42
554669;582;21;27;150;110;;-22;2;145;62
2708943;582;22;31;160;100;;-23;°8;150;48
4172387;577;23;25;170;91;'''1 à 200;-24;0;155;54
376032;573;24;°31;180;82;3030;-25;2;160;46
661630;573;25;19;190;59;71.9%;-26;°8;165;53
820867;572;26;25;200;53;;-27;0;170;38
560151;567;27;°24;210;58;;-28;0;175;42
2225337;560;28;17;220;31;;-29;°6;180;40
1883166;559;29;27;230;44;;-30;0;185;32
1441291;558;30;°29;240;43;;-31;1;190;27
3977791;555;31;25;250;34;'''0 à 200;-32;°2;195;32
552616;552;32;22;260;26;3057;;583;200;21
1269733;550;33;°34;270;35;;reste;52;205;34
2465966;548;34;18;280;29;;total;635;210;24
2763025;546;35;27;290;19;;;;215;15
2701979;544;36;°32;300;15;;;;220;16
3534118;538;37;18;310;16;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;225;17
4128119;533;38;28;320;11;;600;4195;230;27
599107;531;39;°47;330;9;;620;2;235;24
;;40;28;340;17;'''201 à 370;640;3;240;19
;;reste;2341;350;11;412;660;0;245;19
;;total;4213;360;8;9.8%;680;1;250;15
;;1-40;1237;370;6;;700;1;255;15
;;;;380;11;;720;0;260;11
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;390;13;;740;1;265;20
387744;-7616;cont;'''141;400;3;;760;0;270;15
3717238;-500;cont;'''480;410;11;;780;1;275;17
2909520;-492;cont;492;420;7;;800;2;280;12
2601528;-361;comp’;'''297;430;9;;820;1;285;11
1252815;-164;cont;164;440;3;;840;1;290;8
2466721;-154;cont;154;450;7;;860;0;295;7
1916663;-143;cont;143;460;1;;880;0;300;8
3666841;-127;comp’;'''84;470;5;;900;0;305;8
2693597;-119;cont;119;480;5;;920;0;310;8
538322;-113;cont;113;490;8;;940;0;315;4
1322014;-101;cont;101;500;3;;960;2;320;7
238164;-95;cont;95;510;2;;980;0;325;5
1526859;-94;cont;94;520;4;;1000;0;330;4
2652993;-93;comp’;93;530;3;;1020;0;335;12
2758043;-92;cont;92;540;3;'''371 à 600;1040;1;340;5
3755967;-91;cont;91;550;4;118;;16;345;6
2154781;-86;cont;86;560;5;2.8%;;;350;5
2705398;-82;cont;82;570;1;;;;355;6
2154705;-71;cont;71;580;4;'''601 à max;;;360;2
989712;-69;comp’;69;590;4;18;;;365;4
2413585;-65;cont;65;600;2;0.4%;;;370;2
2381919;-59;cont;59;reste;18;;reste;2;reste;136
;;;;total;4213;;total;4213;total;4213
&lt;/pre&gt;

====bsu  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_intercalaires_positifs_S+|bsu intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
bsu Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
eco;min20;1003;2130;3133;735;296;440;144;-178;-64;287;;;
bsu;min10;1028;2444;3472;659;8;282;274;152;257;470;;;
rtb;min30;118;402;520;536;-105;148;253;-277;-165;202;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
63;348;0.18;1169;2855;11;6;80;226;126;821;-119;;;
140;333;0.42;1125;3091;2;8;31;186;302;936;-432;;;
51;294;0.17;189;604;5;7;21;162;8;131;-81;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
bsu;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-6.4;69;-338;67;458;359;max40;&amp;-41;352;-1040;112;790;286;min50
51 à 400;48;-359;711;-11;861;249;2 parties;&amp;12;-27;-230;64;954;75;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;152;56;-;440;dte;18;max40;&amp;211;68;;617;poly;173;SF
51 à 400;94;40;-;694;poly;167;tF;&amp;145;50;-;850;poly;104;tF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50, '''t30 t50'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;corrélation;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;-0.432;;;;;;
41-n;0.660;0.008;0.283;;;;;;;;;;;
1-n;0.471;0.152;0.258;;;;;;;;;20.2.22;;
bsu;fx;fc;;bsu;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;bsu;Sx-;Sc-
0;2;25;;0;2;10;0;2;25;&gt;0;1088;-1;0;72
10;28;231;;10;27;95;1;3;41;&lt;0;35;-2;0;4
20;46;398;;20;45;163;2;2;31;zéro;2;-3;0;0
30;70;185;;30;68;76;3;3;34;total;1125;-4;14;229
40;158;121;;40;154;50;4;2;27;;c;-5;0;0
50;81;84;;50;79;34;5;3;19;&gt;0;2490;-6;2;0
60;22;92;;60;21;38;6;0;21;&lt;0;573;-7;1;11
70;21;119;;70;20;49;7;5;16;zéro;25;-8;1;75
80;32;121;;80;31;50;8;3;7;;3088;-9;1;0
90;22;112;;90;21;46;9;3;16;;;-10;1;5
100;25;91;;100;24;37;10;4;19;total;4213;-11;1;43
110;24;106;;110;23;43;11;0;32;;;-12;0;0
120;39;87;;120;38;36;12;3;53;;;-13;0;6
130;41;86;;130;40;35;13;5;46;;;-14;1;19
140;27;66;;140;26;27;14;12;47;;;-15;0;0
150;42;68;;150;41;28;15;4;52;;;-16;1;5
160;34;66;;160;33;27;16;3;31;;;-17;0;18
170;33;58;;170;32;24;17;6;41;;;-18;0;0
180;29;53;;180;28;22;18;5;44;;;-19;1;4
190;25;34;;190;24;14;19;5;23;;;-20;1;11
200;19;34;;200;18;14;20;3;29;;;-21;0;0
210;28;30;;210;27;12;21;2;25;;;-22;0;2
220;17;14;;220;17;6;22;2;29;;;-23;0;8
230;24;20;;230;23;8;23;3;22;;;-24;0;0
240;16;27;;240;16;11;24;7;24;;;-25;1;1
250;16;18;;250;16;7;25;4;15;;;-26;0;8
260;13;13;;260;13;5;26;13;12;;;-27;0;0
270;19;16;;270;18;7;27;12;12;;;-28;0;0
280;13;16;;280;13;7;28;3;14;;;-29;0;6
290;13;6;;290;13;2;29;10;17;;;-30;0;0
300;6;9;;300;6;4;30;14;15;;;-31;0;1
310;8;8;;310;8;3;31;9;16;;;-32;0;2
320;5;6;;320;5;2;32;10;12;;;-33;0;0
330;1;8;;330;1;3;33;16;18;;;-34;0;1
340;8;9;;340;8;4;34;11;7;;;-35;0;3
350;5;6;;350;5;2;35;16;11;;;-36;0;0
360;4;4;;360;4;2;36;19;13;;;-37;0;1
370;4;2;;370;4;1;37;13;5;;;-38;0;2
380;4;7;;380;4;3;38;17;11;;;-39;0;0
390;5;8;;390;5;3;39;26;21;;;-40;1;1
400;1;2;;400;1;1;40;21;7;;;-41;0;8
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 - t50;645;1422;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;2
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;1
;;;;;;;;;;;;-50;0;2
;;;;;;;;;;;;reste;7;17
;;;;;;;;;;;;total;35;573
&lt;/pre&gt;

====bsu  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_intercalaires_négatifs_S-|bsu intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
bsu;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;;;10;;2;1;1;1;;1;;;1;;1;;;1;1;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;7;30
continu;72;4;0;233;0;0;11;75;0;6;43;0;6;19;0;5;18;0;4;11;0;2;8;0;1;8;0;0;6;0;1;2;0;1;3;0;1;2;0;1;8;0;3;2;0;0;2;0;1;2;17;578
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;bsu;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;14;0;2;1;1;1;1;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;7;35
;Sc-;72;4;0;229;0;0;11;75;0;5;43;0;6;19;0;5;18;0;4;11;0;2;8;0;1;8;0;0;6;0;1;2;0;1;3;0;1;2;0;1;8;0;3;2;0;0;2;0;1;2;17;573
&lt;/pre&gt;

====bsu autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_autres_intercalaires|bsu autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
23.2.22;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
bsu;autres intercalaires;;adresses1;;;bsu;autres intercalaires;;adresses2;;;bsu;autres intercalaires;;adresses3;;;bsu;autres intercalaires;;adresses4;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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&amp;emsp*;;;;;;deb;°CDS;1618304;3;;;fin;°CDS;2900020;;comp;;fin;°CDS;4170045;;
&amp;emsp*;;;;;;;misc_R;1618853;52;;;&amp;emsp*;;;;;;&amp;emsp*;;;;
&amp;emsp*;;;;;;deb;°CDS;1619023;0;;;&amp;emsp*;;;;;;&amp;emsp*;;;;
&amp;emsp*;;;;;;;misc_R;1620331;30;;;&amp;emsp*;;;;;;&amp;emsp*;;;;
&amp;emsp*;;;;;;fin;°CDS;1620476;;;;&amp;emsp*;;;;;;&amp;emsp*;;;;
&lt;/pre&gt;

====bsu distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_distribution|bsu distribution]]
&lt;pre&gt;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
avant 16s;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
cgt;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
gga;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;1
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;1;;;;;;;;;;;atc;1;acc;1;aac;3;agc;1
après 5s;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;3
atgf;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;4
gac;tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;3;tca;1;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;1;aaa;2;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;2;aga;
;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;1;cca;;caa;2;cga;;;;;;;;;;;;cta;1;cca;3;caa;1;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;1;gca;;gaa;4;gga;;;;;;;;;;;;gta;3;gca;3;gaa;2;gga;1
;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;bsu;;8;;;;;8;;bsu;18;;;;;;18;;;;;;;;;;;bsu;;;;52;2;;56
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2   1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;

====bsu lmo====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_lmo|bsu lmo]] 
&lt;pre&gt;
bsu-lmo  comparaison;;10.11.19 Tanger;;;comparaisons internes bsu, lmo;;;;
bsu;intercal;lmo;intercal;diff;bsu;intercal;bsu;intercal;diff
gaa;25;gaa;5;-20;16s;167;16s;167;
agc;3;agc;34;31;23s;55;23s;111;
aac;10;aac;6;-4;5s;20;5s;9;
atc;15;atc;25;10;gta;32;aac;5;
gga;10;gga;23;13;aca;37;tcc;34;
cac;17;cac;28;11;aaa;10;gaa;9;
ttc;12;ttc;4;-8;ctg;5;gta;9;
gac;11;gac;4;-7;ggc;14;atgf;11;0
atgf;17;atgf;42;25;tta;9;gac;12;0
tca;6;tca;22;16;cgt;15;ttc;5;
atgi;2;atgi;11;9;cca;5;aca;22;
atgj;19;atgj;42;23;gca;19;tac;5;
gca;5;gca;22;17;atgj;2;tgg;24;
cca;15;cca;10;-5;atgi;6;cac;9;
cgt;9;cgt;9;0;tca;17;caa;49;
tta;14;tta;14;0;atgf;11;ggc;5;
ggc;5;ggc;15;10;gac;12;tgc;7;
ctg;10;cta;5;-5;ttc;17;tta;265;
aaa;37;aaa;41;4;cac;10;ttg;;
aca;32;aca;8;-24;gga;15;;;
gta;20;gta;13;;atc;10;16s;164;
5s;55;5s;81;;aac;3;23s;55;
23s;167;23s;244;;agc;25;5s;20;
16s;;16s;;;gaa;;gta;4;-28
;;;;;;;aca;36;-1
16s;167;16s;127;;;;aaa;6;-4
23s;111;atc;46;;;;cta;40;35
5s;9;gca;172;;;;ggc;14;0
aac;5;23s;80;;;;tta;9;0
tcc;34;5s;14;;;;cgt;27;12
gaa;9;aac;6;1;;;cca;9;4
gta;9;tcc;33;-1;;;gca;170;
atgf;11;gaa;56;47;;;;;
gac;12;gta;21;12;lmo;intercal;lmo;intercal;diff
ttc;5;atgf;6;-5;16s;244;16s;127;
aca;22;gac;4;-8;23s;81;atc;46;
tac;5;ttc;20;;5s;13;gca;172;
tgg;24;tac;7;2;gta;8;23s;80;
cac;9;tgg;15;-9;aca;41;5s;14;
caa;49;cac;29;20;aaa;5;aac;6;
ggc;5;caa;5;-44;cta;15;tcc;33;
tgc;7;ggc;19;14;ggc;14;gaa;56;
tta;265;tgc;45;;tta;9;gta;21;
ttg;;ttg;;;cgt;10;atgf;6;2
;;;;;cca;22;gac;4;0
16s;164;16s;244;;gca;42;ttc;20;
23s;55;23s;80;;atgj;11;tac;7;
5s;20;5s;13;;atgi;22;tgg;15;
gta;4;gta;8;4;tca;42;cac;29;
aca;36;aca;41;5;atgf;4;caa;5;
aaa;6;aaa;5;-1;gac;4;ggc;19;
cta;40;cta;14;-26;ttc;28;tgc;45;
ggc;14;ggc;21;7;cac;23;ttg;;
tta;9;tta;12;3;gga;25;;;
cgt;27;cgt;10;-17;atc;6;16s;244;
cca;9;cca;19;10;aac;34;23s;80;
gca;170;gca;341;;agc;5;5s;13;
;;;;;gaa;;gta;8;0
;;;;;;;aca;41;0
;;;;;;;aaa;5;0
;;;;;;;cta;14;-1
;;;;;;;ggc;21;7
;;;;;;;tta;12;3
;;;;;;;cgt;10;0
;;;;;;;cca;19;-3
;;;;;;;gca;341;
;;;;;;;;;
bsu;intercal;lmo;intercal;diff;entre génomes;;;intra génome;
gaa;3;gaa;157;;gamme;fréquence;;gamme;fréquence
gta;4;acg;9;;-15;5;;-7;1
aca;22;tac;11;;-14;;;-6;
tac;4;caa;6;;-13;;;-5;
caa;;aaa;;;-12;;;-4;1
;;;;;-11;;;-3;1
aga;;aga;;;-10;;;-2;
;;;;;-9;1;;-1;2
cgg;;cgg;;;-8;2;;0;9
;;;;;-7;1;;1;
gga;;gga;;;-6;;;2;1
;;;;;-5;3;;3;1
gtc;;gtc;;;-4;1;;4;1
;;;;;-3;;;5;
agg;;cgt;;;-2;;;6;
;;;;;-1;2;;7;1
caa;;ctc;;;0;2;;;2
;;;;;1;1;;total;20
gcc;;tcg;;;2;1;; -2+2;11
;;;;;3;1;;;
tca;;;;;4;2;;;
;;;;;5;1;;;
atg;9;aac;3;;6;;;;
gaa;;agc;;;7;1;;;
;;;;;8;;;;
;;gaa;27;;9;1;;;
;;gac;;;10;3;;;
;;;;;11;1;;;
cgt;13;16s;127;;12;1;;;
gga;159;atc;46;;13;1;;;
16s;167;gca;172;;14;1;;;
23s;55;23s;80;;15;;;;
5s;13;5s;14;;;7;;;
atgf;60;aac;24;;total;39;;;
gac;;acc;;; -2+2;6;;;
&lt;/pre&gt;

===Listeria monocytogenes===
====lmo====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo opérons|lmo]]
&lt;pre&gt;
Listeria monocytogenes EGD-e;;;;
37.9%GC;7.3.19 Paris;67;doubles;intercal
;82705..82777;aag;;
;237466..239020;16s;@1;244
;239265..242195;23s;;80
;242276..242385;5s;;13
;242399..242471;gta;;8
;242480..242555;aca;;41
;242597..242669;aaa;;5
;242675..242756;cta;;14
;242771..242842;ggc;;21
;242864..242949;tta;;12
;242962..243035;cgt;;10
;243046..243119;cca;;19
;243139..243214;gca;;341
;243556..245041;16s;;244
;245286..248216;23s;;80
;248297..248406;5s;;
;;;;
;677464..677553;tcg;;
;;;;
;936656..936728;aac;;3
;936732..936819;agc;;
;;;;
;940017..940088;gaa;;27
;940116..940188;gac;;
;;;;
;970867..970937;gga;;
;;;;
;1266675..1266748;aga;;
;;;;
comp;1740916..1740987;gaa;;5
comp;1740993..1741083;agc;;34
comp;1741118..1741190;aac;;6
comp;1741197..1741270;atc;;25
comp;1741296..1741366;gga;;23
comp;1741390..1741462;cac;;28
comp;1741491..1741563;ttc;;4
comp;1741568..1741643;gac;;4
comp;1741648..1741721;atgf;;42
comp;1741764..1741853;tca;;22
comp;1741876..1741949;atgi;;11
comp;1741961..1742034;atgj;;42
comp;1742077..1742149;gca;;22
comp;1742172..1742245;cca;;10
comp;1742256..1742329;cgt;;9
comp;1742339..1742424;tta;;14
comp;1742439..1742513;ggc;;15
comp;1742529..1742610;cta;;5
comp;1742616..1742688;aaa;;41
comp;1742730..1742805;aca;;8
comp;1742814..1742886;gta;;13
comp;1742900..1743009;5s;;81
comp;1743091..1746021;23s;;244
comp;1746266..1747811;16s;;
;;;;
;1776112..1776183;cgt;;
;;;;
comp;1848821..1848930;5s;;81
comp;1849012..1851942;23s;;244
comp;1852187..1853732;16s;;
;;;;
;2162187..2162273;ctc;;
;;;;
;2215375..2215446;gaa;;157
;2215604..2215677;acg;;9
;2215687..2215770;tac;;11
;2215782..2215856;caa;;6
;2215863..2215935;aaa;;
;;;;
comp;2436493..2436576;ttg;;45
comp;2436622..2436695;tgc;;19
comp;2436715..2436786;ggc;;5
comp;2436792..2436863;caa;;29
comp;2436893..2436965;cac;;15
comp;2436981..2437054;tgg;;7
comp;2437062..2437145;tac;;20
comp;2437166..2437238;ttc;;4
comp;2437243..2437318;gac;;6
comp;2437325..2437398;atgf;;21
comp;2437420..2437495;gta;;56
comp;2437552..2437623;gaa;;33
comp;2437657..2437745;tcc;;6
comp;2437752..2437827;aac;;14
comp;2437842..2437951;5s;;80
comp;2438032..2440962;23s;;172
comp;2441135..2441210;gca;;46
comp;2441257..2441330;atc;;127
comp;2441458..2443003;16s;@2;
;;;;
comp;2540230..2540301;cgg;;
;;;;
comp;2672664..2672736;acc;;24
comp;2672761..2672836;aac;;14
comp;2672851..2672960;5s;;80
comp;2673041..2675971;23s;;172
comp;2676144..2676219;gca;;46
comp;2676266..2676339;atc;;127
comp;2676467..2678012;16s;;
;;;;
;2930362..2930434;gtc;;
&lt;/pre&gt;
====lmo distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo_distribution|lmo distribution]]
&lt;pre&gt;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
après 5s;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
acc;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
aac;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;1
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;1;;;;;;;;;;;atc;1;acc;0;aac;2;agc;1
;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2
;gtc;1;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;3
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;2;tca;1;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;2;caa;1;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;;;;;;;;;;;;gta;3;gca;2;gaa;2;gga;1
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;1;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;lmo;;8;;;;;8;;lmo;9;;;;;;9;;;;;;;;;;;lmo;;;;44;;;44
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2   1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====lmo données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo_données_intercalaires|lmo données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;lmo;fx;fc;lmo;fx40;fc40;lmo;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;1;27;0;1;27;-1;;61;87;68;tRNA 16s;;;tRNA tRNA;;contig
;0;10;10;183;1;1;32;-2;;0;181;940;341;;gca;5;;gaa
;0;20;20;345;2;2;40;-3;;0;52;370;16s tRNA;;;34;;agc
;1;30;20;147;3;1;33;-4;3;173;382;73;2* 127;;atc;6;;aac
;0;40;80;64;4;0;11;-5;;0;197;132;tRNA 23s;;;25;;atc
2;0;50;79;45;5;2;19;-6;;0;127;49;2* 172;;gca;23;;gga
1;1;60;21;46;6;0;16;-7;;0;99;333;5s tRNA;;;28;;cac
1;1;70;12;69;7;0;5;-8;;57;110;118;2* 13;;gta;4;;ttc
1;0;80;13;69;8;3;5;-9;;0;366;56;2* 14;;aac;4;;gac
;1;90;10;69;9;1;13;-10;1;3;66;44;tRNA tRNA;;intra;42;;atgf
;1;100;9;54;10;0;9;-11;2;22;128;;8;;gta;22;;tca
;1;110;9;88;11;1;26;-12;;0;351;;41;;aca;11;;atgi
1;1;120;14;74;12;2;52;-13;;3;119;;5;;aaa;42;;atgj
;2;130;21;57;13;3;31;-14;;14;152;;14;;cta;22;;gca
1;0;140;14;52;14;0;36;-15;;0;21;;21;;ggc;10;;cca
;0;150;13;48;15;4;46;-16;1;2;CDS 16s;;12;;tta;9;;cgt
;1;160;26;42;16;0;42;-17;;13;445;;10;;cgt;14;;tta
;0;170;15;28;17;2;21;-18;1;0;451;;19;;cca;15;;ggc
;0;180;11;30;18;3;43;-19;;2;344;;**;;gca;5;;cta
;1;190;10;25;19;3;26;-20;;7;364;;2* 46;;gca;41;;aaa
;1;200;19;35;20;2;22;-21;;0;289;;**;;atc;8;;aca
;0;210;13;23;21;0;30;-22;;2;16s 23s;;24;;acc;**;;gta
;0;220;14;14;22;3;25;-23;;6;4* 244;;**;;aac;45;;ttg
;0;230;9;16;23;2;16;-24;;0;23s 5s;;tRNA tRNA;;;19;;tgc
;0;240;11;16;24;5;18;-25;;1;4* 80;;3;;aac;5;;ggc
;0;250;11;10;25;1;9;-26;;4;2* 81;;**;;agc;29;;caa
;0;260;9;16;26;2;10;-27;;0;5s CDS;;27;;gaa;15;;cac
;0;270;6;5;27;1;16;-28;;1;148;;**;;gac;7;;tgg
;0;280;3;17;28;0;8;-29;;4;130;;157;;gaa;20;;tac
;0;290;1;14;29;1;6;-30;;0;;;9;;acg;4;;ttc
;0;300;7;12;30;5;9;-31;1;0;;;11;;tac;6;;gac
;0;310;6;5;31;6;8;-32;;1;;;6;;caa;21;;atgf
;0;320;5;7;32;7;5;-33;;0;;;**;;aaa;56;;gta
;0;330;5;9;33;2;9;-34;;0;;;;;;33;;gaa
1;0;340;4;7;34;7;7;-35;;1;;;;;;6;;tcc
;0;350;2;5;35;6;10;-36;;0;;;;;;**;;aac
;1;360;2;5;36;8;9;-37;;1;;;;;;;;
1;1;370;3;9;37;7;3;-38;;1;;;;;;;;
;0;380;1;3;38;14;0;-39;;0;;;;;;;;
;1;390;8;6;39;10;6;-40;;1;;;;;;;;
;0;400;3;2;40;13;7;-41;;2;;;;;;;;
1;0;reste;37;51;reste;456;1082;-42;;0;;;;;;;;
10;15;total;587;1849;total;587;1848;-43;;0;;;;;;;;
9;15;diagr;549;1771;diagr;130;739;-44;;2;;;;;;;;
0;1; t30;50;675;;;;-45;;0;;;;;;;;
;;;;;;;;-46;;1;;;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;;;
;x;586;10;1;597;;;-49;;1;;;;;;;;
;c;1822;393;27;2242;;;-50;;0;;;;;;;;
;;;;;2839;101;;reste;1;7;;;;;;;;
;;;;;;2940;;total;10;393;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====lmo autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo_autres_intercalaires_aas|autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
*Construction: remarque sur les nombreux regulatory
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;lmo;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;81661;82617;87;*;
;;tRNA;82705;82777;181;*;aag
fin;;CDS;82959;84437;;;
deb;;CDS;235524;237020;445;*;
;;rRNA;237466;239020;244;*;1555
;;rRNA;239265;242195;80;*;2931
;;rRNA;242276;242385;13;*;110
;;tRNA;242399;242471;8;*;gta
;;tRNA;242480;242555;41;*;aca
;;tRNA;242597;242669;5;*;aaa
;;tRNA;242675;242756;14;*;cta
;;tRNA;242771;242842;21;*;ggc
;;tRNA;242864;242949;12;*;tta
;;tRNA;242962;243035;10;*;cgt
;;tRNA;243046;243119;19;*;cca
;;tRNA;243139;243214;341;*;gca
;;rRNA;243556;245041;244;*;1486
;;rRNA;245286;248216;80;*;2931
;;rRNA;248297;248406;148;*;110
fin;;CDS;248555;249013;;;
deb;;CDS;676802;677395;68;*;
;comp;tRNA;677464;677553;940;*;tcg
fin;;CDS;678494;679123;;;
deb;;CDS;936136;936603;52;*;
;;tRNA;936656;936728;3;*;aac
;;tRNA;936732;936819;382;*;agc
fin;;CDS;937202;937594;;;
deb;;CDS;939106;939819;197;*;
;;tRNA;940017;940088;27;*;gaa
;;tRNA;940116;940188;127;*;gac
fin;;CDS;940316;940696;;;
deb;comp;CDS;969549;970496;370;*;
;;tRNA;970867;970937;99;*;gga
fin;;CDS;971037;972176;;;
deb;;CDS;1266040;1266564;110;*;
;;tRNA;1266675;1266748;366;*;aga
fin;;CDS;1267115;1268473;;0;
deb;comp;CDS;1739674;1740849;66;*;
;comp;tRNA;1740916;1740987;5;*;gaa
;comp;tRNA;1740993;1741083;34;*;agc
;comp;tRNA;1741118;1741190;6;*;aac
;comp;tRNA;1741197;1741270;25;*;atc
;comp;tRNA;1741296;1741366;23;*;gga
;comp;tRNA;1741390;1741462;28;*;cac
;comp;tRNA;1741491;1741563;4;*;ttc
;comp;tRNA;1741568;1741643;4;*;gac
;comp;tRNA;1741648;1741721;42;*;atgf
;comp;tRNA;1741764;1741853;22;*;tca
;comp;tRNA;1741876;1741949;11;*;atgi
;comp;tRNA;1741961;1742034;42;*;atgj
;comp;tRNA;1742077;1742149;22;*;gca
;comp;tRNA;1742172;1742245;10;*;cca
;comp;tRNA;1742256;1742329;9;*;cgt
;comp;tRNA;1742339;1742424;14;*;tta
;comp;tRNA;1742439;1742513;15;*;ggc
;comp;tRNA;1742529;1742610;5;*;cta
;comp;tRNA;1742616;1742688;41;*;aaa
;comp;tRNA;1742730;1742805;8;*;aca
;comp;tRNA;1742814;1742886;13;*;gta
;comp;rRNA;1742900;1743009;81;*;110
;comp;rRNA;1743091;1746021;244;*;2931
;comp;rRNA;1746266;1747811;451;*;1546
fin;comp;CDS;1748263;1748709;;;
deb;;CDS;1774991;1775983;128;*;
;;tRNA;1776112;1776183;73;*;cgt
fin;comp;CDS;1776257;1776829;;;
deb;comp;CDS;1848166;1848690;130;*;
;comp;rRNA;1848821;1848930;81;*;110
;comp;rRNA;1849012;1851942;244;*;2931
;comp;rRNA;1852187;1853732;344;*;1546
fin;comp;CDS;1854077;1854682;;0;
deb;comp;CDS;2161161;2162054;132;*;
;;tRNA;2162187;2162273;49;*;ctc
fin;comp;CDS;2162323;2164011;;;
deb;comp;CDS;2213218;2215041;333;*;
;;tRNA;2215375;2215446;157;*;gaa
;;tRNA;2215604;2215677;9;*;acg
;;tRNA;2215687;2215770;11;*;tac
;;tRNA;2215782;2215856;6;*;caa
;;tRNA;2215863;2215935;118;*;aaa
fin;comp;CDS;2216054;2216743;;0;
deb;comp;CDS;2435023;2436141;351;*;
;comp;tRNA;2436493;2436576;45;*;ttg
;comp;tRNA;2436622;2436695;19;*;tgc
;comp;tRNA;2436715;2436786;5;*;ggc
;comp;tRNA;2436792;2436863;29;*;caa
;comp;tRNA;2436893;2436965;15;*;cac
;comp;tRNA;2436981;2437054;7;*;tgg
;comp;tRNA;2437062;2437145;20;*;tac
;comp;tRNA;2437166;2437238;4;*;ttc
;comp;tRNA;2437243;2437318;6;*;gac
;comp;tRNA;2437325;2437398;21;*;atgf
;comp;tRNA;2437420;2437495;56;*;gta
;comp;tRNA;2437552;2437623;33;*;gaa
;comp;tRNA;2437657;2437745;6;*;tcc
;comp;tRNA;2437752;2437827;14;*;aac
;comp;rRNA;2437842;2437951;80;*;110
;comp;rRNA;2438032;2440962;172;*;2931
;comp;tRNA;2441135;2441210;46;*;gca
;comp;tRNA;2441257;2441330;127;*;atc
;comp;rRNA;2441458;2443003;364;*;1546
fin;comp;CDS;2443368;2444126;;;
deb;;CDS;2539838;2540173;56;*;
;comp;tRNA;2540230;2540301;119;*;cgg
fin;comp;CDS;2540421;2541857;;0;
deb;comp;CDS;2671624;2672511;152;*;
;comp;tRNA;2672664;2672736;24;*;acc
;comp;tRNA;2672761;2672836;14;*;aac
;comp;rRNA;2672851;2672960;80;*;110
;comp;rRNA;2673041;2675971;172;*;2931
;comp;tRNA;2676144;2676219;46;*;gca
;comp;tRNA;2676266;2676339;127;*;atc
;comp;rRNA;2676467;2678012;289;*;1546
fin;comp;CDS;2678302;2679330;;0;
deb;;CDS;2929315;2930340;21;*;
;;tRNA;2930362;2930434;44;*;gtc
fin;comp;CDS;2930479;2932473;;;
&lt;/pre&gt;

====lmo blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo_blocs|lmo blocs]]
&lt;pre&gt;
lmo blocs;;;;;;;;
Types;;;;;;;;
I;I1;I2;I3;I4;;II;II1;II2
16s;;244;;244;;16s;244;244
23s;;81;;80;;23s;80;81
5s;;13;;13;;5s;;
;;8;;8;;;;
;;gta;;gta;;;;
;;**20aas;;**8aas;;;;
III;;;;;;IV;;
16s;127;127;;;;;;
atc;46;46;;;;;;
gca;172;172;;;;;;
23s;80;80;;;;;;
5s;14;14;;;;;;
;6;24;;;;;;
;aac;aac;;;;;;
;**13aas;acc;;;;;;
Groupes;;;;;;;;
;;;;;;16s;244;
;;;;;I4;23s;80;
;;;;;;5s;13;
;;;;;;gta;8;
;;;;;;**7aas;19;
;;;;;;gca;341;
;;;;;;16s;244;
;;;;;II1;23s;80;
;;;;;;5s;;
&lt;/pre&gt;

===lam===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_opérons|lam]]
&lt;pre&gt;
;Lactobacillus amylovorus strain 30SC;;;
38%GC;30.6.19 Paris;63;doubles;intercal
;447399..448972;16s;@1;125
;449098..449172;atc;;52
;449225..449297;gca;;115
;449413..452324;23s;;68
;452393..452509;5s;;4
;452514..452586;gta;;2
;452589..452661;aaa;;13
;452675..452756;cta;;23
;452780..452852;aca;;10
;452863..452934;ggc;;11
;452946..453031;tta;;8
;453040..453113;cgt;;5
;453119..453192;cca;;29
;453222..453295;atg;;12
;453308..453381;atgi;;27
;453409..453482;atgf;;3
;453486..453559;gac;;6
;453566..453638;ttc;;19
;453658..453728;gga;;5
;453734..453808;atc;;2
;453811..453900;agc;;
;;;;
;57091..58664;16s;;125
;58790..58864;atc;;52
;58917..58989;gca;;115
;59105..62016;23s;;68
;62085..62201;5s;;13
;62215..62287;aac;;
;;;;
;469566..471139;16s;@2;9
;471149..471334;cds1; hp 186;-3
;471332..474243;23s;;68
;474312..474428;5s;;13
;474442..474514;aac;;
;;;;
comp;1709284..1709374;tcc;;10
comp;1709385..1709457;aac;;13
comp;1709471..1709587;5s;;68
comp;1709656..1712567;23s;;-3
comp;1712565..1712750;cds2;hp 186;9
comp;1712760..1714333;16s;;
;;;;
comp;79386..79458;aag;;
;;;;
comp;79913..79985;aag;;
;;;;
;193922..193994;acc;;
;;;;
comp;210866..210939;ggg;;
;;;;
;287678..287752;ggc;+;111
;287864..287938;ggc;3 ggc;109
;288048..288122;ggc;;35
;288158..288231;ccg;;
;;;;
;457611..457682;gaa;;35
;457718..457804;tca;;9
;457814..457887;atgf;;3
;457891..457964;gac;;6
;457971..458046;ttc;;4
;458051..458132;tac;;4
;458137..458207;tgg;;12
;458220..458295;cac;;4
;458300..458371;caa;;23
;458395..458465;tgc;;40
;458506..458590;ttg;;
;;;;
;474442..474514;aac;;
;;;;
;507688..507760;acg;;
;;;;
;526886..526957;caa;;
;;;;
;551550..551631;tac;;34
;551666..551737;caa;;
;;;;
;567329..567416;ctt;;
;;;;
;583327..583413;tca;;6
;583420..583493;gac;;7
;583501..583576;cac;;4
;583581..583653;gta;;
;;;;
;642034..642106;agg;;
;;;;
comp;729370..729441;cgg;;
;;;;
;784793..784864;gag;;
;;;;
;917887..917975;tcg;;
;;;;
;1456724..1456800;aga;;
;;;;
;1681218..1681301;ctg;;
;;;;
comp;1707998..1708070;gta;;5
comp;1708076..1708147;gaa;;
;;;;
;1987190..1987263;cgt;;8
;1987272..1987345;cca;;
&lt;/pre&gt;
===lam blocs===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_blocs|lam blocs]]
&lt;pre&gt;
lam blocs;;;;;
16s;125;1574;16s;9;1574
atc;52;;cds1;-3;62
gca;115;;23s;68;2912
23s;68;2912;5s;13;117
5s;4;117;aac;;
gta;;;;;
;;;;;
16s;125;1574;16s;9;1574
atc;52;;cds2;-3;62
gca;115;;23s;68;2912
23s;68;2912;5s;13;117
5s;13;117;aac;;
aac;;;;;
&lt;/pre&gt;
====lam distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_distribution|lam distribution]]
&lt;pre&gt;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
après 5s;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
3 aac;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
tcc;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;2;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;
;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;1;acc;;aac;;agc;1
&gt;1aa;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1
ggc3;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;1
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;
;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;2;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;lam;;14;;;;;14;;lam;22;;;;;;22;;lam;3;;;;;;3;;lam;;;;16;;;16
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4   1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====lam données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_données_intercalaires|lam données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;lam;fx;fc;lam;fx40;fc40;lam;x-;c-;c;x;c;x;aa
0;0;0;2;16;0;2;16;-1;;96;222;163;16s tRNA;;
0;0;10;8;202;1;1;30;-2;;0;169;85;2* 133;;atc
0;0;20;3;162;2;1;38;-3;;0;114;135;tRNA 23s;;
0;0;30;12;70;3;2;28;-4;8;49;118;59;2* 118;;gca
1;1;40;27;36;4;0;13;-5;;0;139;212;5s tRNA;;
0;1;50;36;39;5;0;11;-6;;0;71;59;3* 13;;aac
3;2;60;39;55;6;0;13;-7;;1;41;39;4;;gta
0;1;70;29;66;7;2;7;-8;;38;76;117;tRNA tRNA;;intra
0;3;80;17;56;8;2;16;-9;;0;168;239;2* 52;;atc gca
3;2;90;12;43;9;0;23;-10;1;2;222;88;tRNA tRNA;;contig
1;0;100;29;57;10;0;23;-11;1;20;121;129;2;;gta
0;2;110;13;57;11;0;23;-12;;0;337;150;13;;aaa
1;2;120;16;43;12;2;17;-13;;1;57;99;23;;cta
1;1;130;15;34;13;0;16;-14;;12;181;82;10;;aca
1;2;140;14;29;14;0;16;-15;;0;278;58;11;;ggc
1;1;150;19;22;15;0;21;-16;;0;65;;8;;tta
0;0;160;18;18;16;0;19;-17;1;9;202;;5;;cgt
1;3;170;16;17;17;1;13;-18;;0;81;;29;;cca
0;0;180;13;19;18;0;14;-19;;1;86;;12;;atgj
0;1;190;12;24;19;0;11;-20;;9;101;;27;;atgi
0;0;200;14;13;20;0;12;-21;;0;71;;3;;atgf
0;1;210;10;13;21;0;11;-22;;1;57;;6;;gac
1;1;220;8;9;22;0;8;-23;1;3;33;;19;;ttc
0;2;230;7;15;23;3;4;-24;;0;134;;5;;gga
1;0;240;6;15;24;2;10;-25;;3;161;;2;;atc
0;0;250;4;9;25;2;7;-26;1;4;141;;**;;agc
0;0;260;9;8;26;2;11;-27;;0;107;;10;;tcc
0;0;270;5;11;27;0;5;-28;;0;213;;**;;aac
0;1;280;5;2;28;0;9;-29;1;3;CDS 16s;;tRNA tRNA;;
0;0;290;5;7;29;0;4;-30;;0;562;513;111;;ggc
0;0;300;4;7;30;3;1;-31;;1;744;649;112;;ggc
0;0;310;7;4;31;4;5;-32;;4;16s 23s;;35;;ggc
0;0;320;4;5;32;6;0;-33;;0;2* 203;;**;;ccg
0;0;330;2;11;33;5;7;-34;;0;23s 5s;;35;;gaa
0;1;340;3;2;34;1;4;-35;;1;4* 69;;9;;tca
0;0;350;2;4;35;3;4;-36;;0;;;3;;atgf
0;0;360;4;7;36;1;3;-37;;2;;;6;;gac
0;0;370;2;4;37;2;6;-38;;1;;;7;;ttc
0;0;380;1;7;38;1;2;-39;;0;;;4;;tac
0;0;390;4;3;39;0;2;-40;;0;;;12;;tgg
0;0;400;0;2;40;4;3;-41;;0;;;7;;cac
0;0;reste;27;25;reste;431;762;-42;;0;;;23;;caa
15;28;total;483;1248;total;483;1248;-43;;0;;;40;;tgc
15;28;diagr;454;1207;diagr;50;470;-44;;1;;;**;;ttg
0;0; t30;23;434;;;;-45;;0;;;34;;tac
;;;;;;;;-46;;1;;;**;;caa
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;6;;;6;;tca
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;7;;gac
;x;481;15;2;498;;;-49;;0;;;4;;cac
;c;1232;272;16;1520;;;-50;1;3;;;**;;gta
;;;;;2018;152;;reste;;0;;;5;;gta
;;;;;;2170;;total;15;272;;;**;;gaa
;;;;;;;;;;;;;8;;cgt
;;;;;;;;;;;;;**;;cca
&lt;/pre&gt;
=====lam autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_autres_intercalaires_aas|lam autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;lam;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;19323;20024;163;*;
;;tRNA;20188;20261;222;*;act
fin;;CDS;20484;21764;;;
deb;;CDS;56117;56530;562;*;
;;rRNA;57093;58656;133;*;1564
;;tRNA;58790;58864;52;*;atc
;;tRNA;58917;58989;118;*;gca
;;rRNA;59108;62015;69;*;2908
;;rRNA;62085;62201;13;*;117
;;tRNA;62215;62287;85;*;aac
fin;comp;CDS;62373;63296;;0;
deb;comp;CDS;78479;79216;169;*;
;comp;tRNA;79386;79458;114;*;aag
deb;comp;CDS;79573;79794;118;*;
;comp;tRNA;79913;79985;135;*;aag
fin;;CDS;80121;80837;;;
deb;comp;CDS;108050;109663;110;*;
;comp;regulatory;109774;109947;47;*;
fin;comp;CDS;109995;110627;;0;
deb;;CDS;193447;193782;139;*;
;;tRNA;193922;193994;71;*;acc
fin;;CDS;194066;195379;;;
deb;;CDS;210147;210809;59;*;
;comp;tRNA;210869;210939;41;*;ggg
fin;comp;CDS;210981;211580;;0;
deb;;CDS;213163;213804;53;*;
;;regulatory;213858;214021;76;*;
fin;;CDS;214098;216761;;;
deb;comp;CDS;243078;243656;73;*;
;comp;regulatory;243730;243827;60;*;
fin;comp;CDS;243888;244490;;1;
deb;comp;CDS;287010;287465;212;*;
;;tRNA;287678;287752;111;*;ggc
;;tRNA;287864;287935;112;*;ggc
;;tRNA;288048;288122;35;*;ggc
;;tRNA;288158;288231;76;*;ccg
fin;;CDS;288308;288763;;;
deb;comp;CDS;363306;363677;90;*;
;;misc_f;363768;363889;43;*;
fin;;CDS;363933;364445;;;
deb;;CDS;366810;367316;45;*;
;;ncRNA;367362;367456;54;*;
fin;;CDS;367511;369319;;;
deb;comp;CDS;445892;446887;513;*;
;;rRNA;447401;448964;133;*;1564
;;tRNA;449098;449172;52;*;atc
;;tRNA;449225;449297;118;*;gca
;;rRNA;449416;452323;69;*;2908
;;rRNA;452393;452509;4;*;117
;;tRNA;452514;452586;2;*;gta
;;tRNA;452589;452661;13;*;aaa
;;tRNA;452675;452756;23;*;cta
;;tRNA;452780;452852;10;*;aca
;;tRNA;452863;452934;11;*;ggc
;;tRNA;452946;453031;8;*;tta
;;tRNA;453040;453113;5;*;cgt
;;tRNA;453119;453192;29;*;cca
;;tRNA;453222;453295;12;*;atgj
;;tRNA;453308;453381;27;*;atgi
;;tRNA;453409;453482;3;*;atgf
;;tRNA;453486;453559;6;*;gac
;;tRNA;453566;453638;19;*;ttc
;;tRNA;453658;453728;5;*;gga
;;tRNA;453734;453808;2;*;atc
;;tRNA;453811;453900;168;*;agc
fin;;CDS;454069;454491;;;
deb;;CDS;454491;457388;222;*;
;;tRNA;457611;457682;35;*;gaa
;;tRNA;457718;457804;9;*;tca
;;tRNA;457814;457887;3;*;atgf
;;tRNA;457891;457964;6;*;gac
;;tRNA;457971;458043;7;*;ttc
;;tRNA;458051;458132;4;*;tac
;;tRNA;458137;458207;12;*;tgg
;;tRNA;458220;458292;7;*;cac
;;tRNA;458300;458371;23;*;caa
;;tRNA;458395;458465;40;*;tgc
;;tRNA;458506;458590;121;*;ttg
fin;;CDS;458712;459875;;;
deb;;CDS;467495;468823;744;*;
;;rRNA;469568;471131;203;*;1564
;;rRNA;471335;474242;69;*;2908
;;rRNA;474312;474428;13;*;117
;;tRNA;474442;474514;337;*;aac
fin;;CDS;474852;475862;;;
deb;;CDS;507082;507630;57;*;
;;tRNA;507688;507760;59;*;acg
fin;comp;CDS;507820;509192;;0;
deb;;CDS;526021;526704;181;*;
;;tRNA;526886;526957;278;*;caa
fin;;CDS;527236;528015;;;
deb;;CDS;528027;528719;574;*;
;;regulatory;529294;529457;80;*;
fin;;CDS;529538;532225;;;
deb;comp;CDS;546953;548239;77;*;
;comp;regulatory;548317;548377;91;*;
fin;comp;CDS;548469;548831;;;
deb;;CDS;551035;551484;65;*;
;;tRNA;551550;551631;34;*;tac
;;tRNA;551666;551737;202;*;caa
fin;;CDS;551940;553055;;;
deb;;CDS;566792;567247;81;*;
;;tRNA;567329;567413;86;*;ctt
fin;;CDS;567500;568147;;;
deb;;CDS;582725;583225;101;*;
;;tRNA;583327;583413;6;*;tca
;;tRNA;583420;583493;7;*;gac
;;tRNA;583501;583576;4;*;cac
;;tRNA;583581;583653;71;*;gta
fin;;CDS;583725;585191;;0;
deb;;CDS;606557;608326;26;*;
;;regulatory;608353;608445;50;*;
fin;;CDS;608496;609074;;;
deb;comp;CDS;609745;610383;156;*;
;;misc_b;610540;610782;243;*;
fin;;CDS;611026;611766;;;
deb;;CDS;640648;641976;57;*;
;;tRNA;642034;642106;39;*;agg
fin;comp;CDS;642146;642334;;0;
deb;;CDS;728387;729252;117;*;
;comp;tRNA;729370;729441;239;*;cgg
fin;;CDS;729681;730712;;;
deb;;CDS;770203;771387;52;*;
;;tmRNA;771440;771806;177;*;
fin;;CDS;771984;772877;;;
deb;comp;CDS;783691;784704;88;*;
;;tRNA;784793;784864;33;*;gag
fin;;CDS;784898;784993;;0;
deb;comp;CDS;877491;878846;218;*;
;;regulatory;879065;879235;91;*;
fin;;CDS;879327;880637;;;
deb;comp;CDS;916780;917757;129;*;
;;tRNA;917887;917975;134;*;tcg
fin;;CDS;918110;919498;;;
deb;comp;CDS;923642;924574;136;*;
;;misc_b;924711;924950;42;*;
fin;;CDS;924993;925847;;;
deb;;CDS;982901;983617;27;*;
;;regulatory;983645;983759;77;*;
fin;;CDS;983837;984526;;;
deb;comp;CDS;1011692;1012501;102;*;
;;regulatory;1012604;1012662;43;*;
fin;;CDS;1012706;1013095;;;
deb;;CDS;1095103;1095633;116;*;
;;misc_b;1095750;1096001;60;*;
fin;;CDS;1096062;1097180;;;
deb;;CDS;1152540;1155044;66;*;
;;misc_b;1155111;1155358;64;*;
fin;;CDS;1155423;1156802;;;
deb;comp;CDS;1212112;1213236;72;*;
;comp;ncRNA;1213309;1213675;26;*;
fin;comp;CDS;1213702;1214121;;;
deb;;CDS;1322695;1324020;55;*;
;;misc_b;1324076;1324319;57;*;
fin;;CDS;1324377;1325738;;0;
deb;comp;CDS;1449420;1449731;14;*;
;comp;misc_f;1449746;1449826;68;*;
fin;comp;CDS;1449895;1451271;;0;
deb;comp;CDS;1455677;1456573;150;*;
;;tRNA;1456724;1456800;99;*;aga
fin;comp;CDS;1456900;1458480;;;
deb;comp;CDS;1593167;1594216;37;*;
;comp;misc_b;1594254;1594461;38;*;
fin;comp;CDS;1594500;1594850;;;
deb;comp;CDS;1606331;1606858;26;*;
;comp;misc_f;1606885;1606996;53;*;
fin;comp;CDS;1607050;1608747;;;
deb;comp;CDS;1679837;1681135;82;*;
;;tRNA;1681218;1681301;161;*;
fin;;CDS;1681463;1681780;;;ctg
deb;comp;CDS;1706640;1707839;-3;*;
;comp;regulatory;1707837;1707930;67;*;
;comp;tRNA;1707998;1708070;5;*;gta
;comp;tRNA;1708076;1708147;141;*;gaa
deb;comp;CDS;1708289;1709176;107;*;
;comp;tRNA;1709284;1709374;10;*;tcc
;comp;tRNA;1709385;1709457;13;*;aac
;;rRNA;1709471;1709587;69;*;117
;;rRNA;1709657;1712564;203;*;2908
;;rRNA;1712768;1714331;649;*;1564
fin;comp;CDS;1714981;1716288;;;
deb;comp;CDS;1765715;1766362;152;*;
;comp;misc_b;1766515;1766748;43;*;
fin;comp;CDS;1766792;1769098;;0;
deb;;CDS;1985984;1986976;213;*;
;;tRNA;1987190;1987263;8;*;cgt
;;tRNA;1987272;1987345;58;*;cca
deb;comp;CDS;1987404;1988462;121;*;
;;misc_b;1988584;1988828;71;*;
fin;;CDS;1988900;1989913;;0;
deb;;CDS;2017560;2019416;56;*;
;;misc_f;2019473;2019530;40;*;
fin;;CDS;2019571;2020740;;;
deb;;CDS;2039362;2040669;131;*;
;;regulatory;2040801;2040898;72;*;
fin;;CDS;2040971;2042281;;;
deb;;CDS;2043158;2043412;56;*;
;;misc_b;2043469;2043702;76;*;
fin;;CDS;2043779;2045407;;0;
&lt;/pre&gt;

===ppm===
====opérons====
=====ppm chromosome=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm opérons|ppm opérons]]
*Chromosome&lt;br&gt;
&lt;pre&gt;
45.5%GC;26.7.19 Paris;16s 13;110;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;aas;CDS dirigé
Paenibacillus polymyxa SC2;;;;;;;;;;
;10545..11633;;CDS;;327;327;;;363;
;11961..13519;;16s;;280;;;;;
;13800..16728;;23s;;143;;;;;
;16872..16988;;5s;;232;232;;;;232
;17221..17640;;CDS;;93 855;;;;140;
;;;;;;;;;;
comp;111496..112530;;CDS;;616;;;;345;
;113147..114705;;16s;;207;;;;;
;114913..117843;;23s;;76;;;;;
;117920..118036;;5s;;343;343;;;;
;118380..119837;;CDS;;3 348;;;;486;
;;;;;;;;;;
;123186..124469;;CDS;;90;90;;;428;90
;124560..124648;;tca;;145;145;;;;
;124794..125135;;CDS;;55 592;;;;114;
;;;;;;;;;;
;180728..181003;;CDS;;412;;;;92;
;181416..182974;;16s;;108;;;;;
;183083..183199;;5s;@1;39;;;;;
;183239..183315;;atc;;20;;;20;;
;183336..183411;;gca;;128;;;;;
;183540..186468;;23s;;130;;;;;
;186599..186690;;agc;;28;;;28;;
;186719..186795;;atgj;;10;;;10;;
;186806..186881;;gta;;4;;;4;;
;186886..186961;;aca;;19;;;19;;
;186981..187057;;gac;;77;;;77;;
;187135..187210;;ttc;;6;;;6;;
;187217..187302;;tac;;7;;;7;;
;187310..187385;;aaa;;154;154;;;;154
;187540..188682;;CDS;;24 062;;;;381;
;;;;;;;;;;
comp;212745..213341;;CDS;;211;211;;;199;211
comp;213553..213624;;cgg;;259;259;;;;
;213884..214921;;CDS;;238 832;;;;346;
;;;;;;;;;;
;453754..455364;;CDS;;392;;;;537;
;455757..457315;;16s;;207;;;;;
;457523..460453;;23s;;76;;;;;
;460530..460646;;5s;;34;;;;;
;460681..460757;;atc;;22;;;22;;
;460780..460855;;gca;;4;;;4;;
;460860..460935;;aac;;34;;;34;;
;460970..461043;;atgj;;3;;;3;;
;461047..461138;;agc;;31;;;31;;
;461170..461241;;gaa;;6;;;6;;
;461248..461323;;gta;;10;;;10;;
;461334..461407;;atgf;;25;;;25;;
;461433..461509;;gac;;50;;;50;;
;461560..461635;;ttc;;22;;;22;;
;461658..461733;;aca;;5;;;5;;
;461739..461824;;tac;;16;;;16;;
;461841..461913;;cac;;18;;;18;;
;461932..462006;;caa;;4;;;4;;
;462011..462086;;aaa;;15;;;15;;
;462102..462189;;ctg;;6;;;6;;
;462196..462270;;ggc;;10;;;10;;
;462281..462351;;tgc;;26;;;26;;
;462378..462454;;cgt;;22;;;22;;
;462477..462550;;cca;;9;;;9;;
;462560..462630;;gga;;204;204;;;;204
comp;462835..463938;;CDS;;1 537;;;;368;
;;;;;;;;;;
;465476..466216;;CDS;;524;;;;247;
;466741..468299;;16s;;207;;;;;
;468507..471434;;23s;;76;;;;;
;471511..471627;;5s;;629;;;;;
;472257..473588;;CDS;;103 459;;;;444;
;;;;;;;;;;
;577048..577794;;CDS;;1 116;;;;249;
;578911..580469;;16s;;207;;;;;
;580677..583607;;23s;;76;;;;;
;583684..583800;;5s;;82;;;;;
;583883..583958;;gca;;4;;;4;;
;583963..584038;;aac;;3;;;3;;
;584042..584133;;tcc;;19;;;19;;
;584153..584224;;gaa;;9;;;9;;
;584234..584309;;gta;;29;;;29;;
;584339..584412;;atgf;;25;;;25;;
;584438..584514;;gac;;13;;;13;;
;584528..584603;;aca;;4;;;4;;
;584608..584693;;tac;;102;;;102;;
;584796..584870;;caa;;4;;;4;;
;584875..584950;;aaa;;12;;;12;;
;584963..585043;;cta;;10;;;10;;
;585054..585128;;ggc;;5;;;5;;
;585134..585210;;cgt;;12;;;12;;
;585223..585302;;ttg;;7;;;7;;
;585310..585386;;cca;;7;;;7;;
;585394..585464;;gga;;1 133;;;;;
;586598..587560;;CDS;;22 016;;;;321;
;;;;;;;;;;
;609577..609924;;CDS;;73;73;;;116;73
;609998..610069;;acg;;1 613;;;;;
comp;611683..612030;;CDS;;140 810;;;;116;
;;;;;;;;;;
;752841..754124;;CDS;;611;;;;428;
;754736..756294;;16s;;208;;;;;
;756503..759431;;23s;;75;;;;;
;759507..759623;;5s;;183;183;;;;183
comp;759807..760232;;CDS;;173 078;;;;142;
;;;;;;;;;;
;933311..934681;;CDS;;449;;;;457;
;935131..936689;;16s;;221;;;;;
;936911..939839;;23s;;76;;;;;
;939916..940032;;5s;;216;216;;;;216
;940249..941241;;CDS;;521 183;;;;331;
;;;;;;;;;;
;1462425..1462937;;CDS;;44;44;;;171;44
;1462982..1463057;;aac;;1;;1;;;
;1463059..1463147;;agc;;122;122;;;;
comp;1463270..1464145;;CDS;;74;;;;292;
;;;;;;;;;;
comp;1464220..1464981;;CDS;;246;246;;;254;
;1465228..1465299;;gaa;;86;;86;;;
;1465386..1465461;;aaa;;15;;15;;;
;1465477..1465562;;ctc;;162;162;;;;162
;1465725..1466180;;CDS;;1 667;;;;152;
;;;;;;;;;;
comp;1467848..1468585;;CDS;;262;262;;;246;
;1468848..1468930;;ctc;;148;148;;;;148
comp;1469079..1469564;;CDS;;112 990;;;;162;
;;;;;;;;;;
;1582555..1583361;;CDS;;490;;;;269;
;1583852..1583925;;ccc;;244;244;;;;
comp;1584170..1585441;;CDS;;32 099;;;;424;
;;;;;;;;;;
;1617541..1619682;;CDS;;107;107;;;714;107
;1619790..1619860;;gga;;265;265;;;;
;1620126..1621163;;CDS;;254 529;;;;346;
;;;;;;;;;;
;1875693..1876160;;CDS;;129;129;;;156;129
;1876290..1876365;;gcc;;11;;11;;;
;1876377..1876449;;aag;;520;;;;;
comp;1876970..1877974;;CDS;;55 215;;;;335;
;;;;;;;;;;
comp;1933190..1933630;;CDS;;381;;;;147;
;1934012..1934096;;ctg;;91;91;;;;91
comp;1934188..1934718;;CDS;;74 847;;;;177;
;;;;;;;;;;
comp;2009566..2010102;;CDS;;222;222;;;179;
;2010325..2010409;;ctg;;213;213;;;;
;2010623..2011135;;CDS;;432 608;;;;171;
;;;;;;;;;;
;2443744..2448333;;CDS;;540;;;;1530;
;2448874..2450432;;16s;;400;;;;;
;2450833..2453761;;23s;;143;;;;;
;2453905..2454021;;5s;;236;236;;;;236
comp;2454258..2455367;;CDS;;186 804;;;;370;
;;;;;;;;;;
;2642172..2643329;;CDS;;426;;;;386;
;2643756..2645314;;16s;;343;;;;;
;2645658..2648586;;23s;;144;;;;;
;2648731..2648847;;5s;;156;156;;;;156
;2649004..2649228;;CDS;;884 577;;;;75;
;;;;;;;;;;
comp;3533806..3534249;;CDS;;139;139;;;148;139
;3534389..3534460;;gtc;;279;279;;;;
comp;3534740..3535069;;CDS;;103 837;;;;110;
;;;;;;;;;;
;3638907..3639338;;CDS;;728;;;;144;
comp;3640067..3640152;;tta;;249;249;;;;249
;3640402..3640560;;CDS;;28 092;;;;53;
;;;;;;;;;;
;3668653..3669450;;CDS;;247;247;;;266;
comp;3669698..3669766;;atg;;267;267;;;;
comp;3670034..3670234;;CDS;;54 456;;;;67;
;;;;;;;;;;
;3724691..3725086;;CDS;;122;122;;;132;122
comp;3725209..3725282;;atgi;;435;;;;;
comp;3725718..3726359;;CDS;;612 148;;;;214;
;;;;;;;;;;
comp;4338508..4339209;;CDS;;107;107;;;234;107
comp;4339317..4339390;;cca;;7;;;7;;
comp;4339398..4339477;;ttg;;12;;;12;;
comp;4339490..4339566;;cgt;;5;;;5;;
comp;4339572..4339646;;ggc;;35;;;35;;
comp;4339682..4339757;;aaa;;28;;;28;;
comp;4339786..4339862;;gac;;26;;;26;;
comp;4339889..4339965;;atgf;;30;;;30;;
comp;4339996..4340071;;gta;;9;;;9;;
comp;4340081..4340152;;gaa;;17;;;17;;
comp;4340170..4340261;;tcc;;3;;;3;;
comp;4340265..4340340;;aac;;18;;;;;
comp;4340359..4340475;;5s;;76;;;;;
comp;4340552..4343482;;23s;;400;;;;;
comp;4343883..4345441;;16s;;493;;;;;
comp;4345935..4347563;;CDS;;46 596;;;;543;
;;;;;;;;;;
comp;4394160..4395092;;CDS;;238;238;;;311;
;4395331..4395404;;aga;;214;214;;;;
;4395619..4396383;;CDS;;49 894;;;;255;
;;;;;;;;;;
;4446278..4447621;;CDS;;207;207;;;448;
comp;4447829..4447902;;aga;;174;174;;;;
;4448077..4448370;;CDS;;256 556;;;;98;
;;;;;;;;;;
;4704927..4705187;;CDS;;361;;;;87;
comp;4705549..4705627;;ttg;;11;;11;;;
comp;4705639..4705713;;tgc;;11;;11;;;
comp;4705725..4705796;;ggc;;6;;6;;;
comp;4705803..4705877;;caa;;9;;9;;;
comp;4705887..4705959;;cac;;17;;17;;;
comp;4705977..4706050;;tgg;;7;;7;;;
comp;4706058..4706143;;tac;;4;;4;;;
comp;4706148..4706223;;aca;;22;;22;;;
comp;4706246..4706318;;ttc;;35;;35;;;
comp;4706354..4706430;;gac;;15;;15;;;
comp;4706446..4706522;;atgf;;25;;25;;;
comp;4706548..4706623;;gta;;58;;58;;;
comp;4706682..4706753;;gaa;;17;;17;;;
comp;4706771..4706862;;tcc;;3;;3;;;
comp;4706866..4706941;;aac;;326;326;;;;
comp;4707268..4707597;;CDS;;279 544;;;;110;
;;;;;;;;;;
comp;4987142..4989934;;CDS;;726;;;;931;
comp;4990661..4990731;;gga;;9;;;9;;
comp;4990741..4990814;;cca;;22;;;22;;
comp;4990837..4990913;;cgt;;5;;;5;;
comp;4990919..4990993;;ggc;;10;;;10;;
comp;4991004..4991084;;cta;;11;;;11;;
comp;4991096..4991171;;aaa;;4;;;4;;
comp;4991176..4991250;;caa;;55;;;55;;
comp;4991306..4991381;;gta;;11;;;11;;
comp;4991393..4991464;;gaa;;11;;;11;;
comp;4991476..4991548;;acc;;3;;;3;;
comp;4991552..4991627;;aac;;18;;;;;
comp;4991646..4991762;;5s;;76;;;;;
comp;4991839..4994768;;23s;;129;;;;;
comp;4994898..4994973;;gca;;20;;;20;;
comp;4994994..4995070;;atc;;38;;;;;
comp;4995109..4995225;;5s;;93;;;;;
comp;4995319..4996877;;16s;;367;;;;;
comp;4997245..4997475;;CDS;;60 140;;;;77;
;;;;;;;;;;
comp;5057616..5058803;;CDS;;163;163;;;396;163
comp;5058967..5059083;;5s;;76;;;;;
comp;5059160..5062089;;23s;;185;;;;;
comp;5062275..5062350;;gca;;89;;;;;
comp;5062440..5063998;;16s;;380;;;;;
comp;5064379..5066394;;CDS;;647 899;;;;672;
;;;;;;;;;;
;5714294..5714611;;CDS;;206;206;;;106;
comp;5714818..5714908;;tcg;;77;77;;;;77
comp;5714986..5715210;;CDS;;;;;;75;
&lt;/pre&gt;
=====ppm plasmide=====
*Plasmide&lt;br&gt;
&lt;pre&gt;
plasmide;pSC2;37.6%GC;51;;;;;;;
;;;;;;CDS;aa;avec aa;aas;CDS dirigé
;3920..4174;;CDS;;536;536;;;85;
;4711..4803;;agc;+;5;;5;;;
;4809..4883;;tgc;3 aac;63;;63;;;
;4947..5021;;gaa;2 atc;7;;7;;;
;5029..5105;;ctt;2 caa;6;;6;;;
;5112..5186;;cca;2 cca;101;;101;;;
;5288..5361;;tgg;2 cga;4;;4;;;
;5366..5444;;tac;2 gaa;4;;4;;;
;5449..5522;;caa;2 tac;6;;6;;;
;5529..5605;;cac;3 tgg;5;;5;;;
;5611..5686;;gac;;125;;125;;;
;5812..5887;;gga;;10;;10;;;
;5898..5973;;aac;@1;4;;4;;;
;5978..6066;;tac;ctt;9;;9;;;
;6076..6153;;ata;ata;4;;4;;;
;6158..6231;;caa;;4;;4;;;
;6236..6311;;atgi;;5;;5;;;
;6317..6392;;aac;;4;;4;;;
;6397..6470;;tgg;;131;;131;;;
;6602..6678;;gaa;;5;;5;;;
;6684..6757;;ggc;;55;;55;;;
;6813..6885;;ttc;;22;;22;;;
;6908..6983;;cga;;4;;4;;;
;6988..7065;;cca;;5;;5;;;
;7071..7155;;ttg;;5;;5;;;
;7161..7235;;atc;;5;;5;;;
;7241..7317;;atgf;;5;;5;;;
;7323..7398;;gca;;109;;109;;;
;7508..7584;;cga;;3;;3;;;
;7588..7668;;cta;;13;;13;;;
;7682..7758;;atc;;8;;8;;;
;7767..7841;;aac;;4;;4;;;
;7846..7919;;tgg;;33;33;;;;33
;7953..8324;;CDS;@4;-24;-24;;;124;
;8301..8378;;gac;;8;;8;;;
;8387..8473;;tac;;86;;86;;;
;8560..8632;;aaa;;14;;14;;;
;8647..8720;;gga;;4;;4;;;
;8725..8800;;ttc;;7;;7;;;
;8808..8882;;acg;@2;100;100;;;;
comp;8983..9600;;CDS;acg;89;89;;;206;
;9690..9771;;tta;;3;;3;;;
;9775..9849;;aca;;35;35;;;;35
comp;9885..10169;;CDS;;150;;;;95;
;;;;;;;;;;
comp;10320..10622;;CDS;;116;116;;;101;
;10739..10813;;aca;;18;18;;;;18
comp;10832..11146;;CDS;;216;;;;105;
;;;;;;;;;;
comp;11363..11599;;CDS;;94;94;;;79;94
;11694..11768;;aga;;103;103;;;;
;11872..12312;;CDS;;195;;;;147;
;;;;;;;;;;
comp;12508..12756;;CDS;;293;293;;;83;
;13050..13126;;atc;;72;72;;;;72
;13199..14083;;CDS;;226;226;;;295;
;;;;;;;;;;
;14310..14385;;tcg;+;8;;8;;;
;14394..14481;;tcc;2 tcg;7;;7;;;
;14489..14563;;ctt;@3;3;;3;;;
;14567..14654;;tcg;tcg;5;;5;;;
;14660..14751;;tca;ctt;119;119;;;;119
;14871..15080;;CDS;;212044;;;;70;
;;;;;;;;;;
comp;227125..227388;;CDS;;444;444;;;88;
comp;227833..227903;;gga;;248;248;;;;248
comp;228152..228391;;CDS;;1401;;;;80;
;;;;;;;;;;
comp;229793..229999;;CDS;;24;24;;;69;24
comp;230024..230108;;tca;;289;289;;;;
comp;230398..230640;;CDS;;231;;;;81;
;;;;;;;;;;
comp;230872..231393;;CDS;;161;161;;;174;161
comp;231555..231640;;tta;;977;977;;;;
;232618..233067;;CDS;;277050;;;;150;
;510118..1;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ppm plasmide MAJ=====
&lt;pre&gt;
plasmide;;Paenibacillus polymyxa SC2 MAJ;;;plasmide;;Paenibacillus polymyxa SC2;;;
23.10.19 Tanger;;;;;;26.7.19 Paris;;;;
;;49 aas;doubles;intercalaires;;;;51 aas;doubles;intercalaires
3920..4174;;cds hp;;;;3920..4174;;CDS;;536
4711..4803;;agc;+;;;4711..4803;;agc;+;5
4809..4883;;tgc;3 aac;;;4809..4883;;tgc;3 aac;63
4947..5021;;gaa;2 atc;;;4947..5021;;gaa;2 atc;7
5029..5105;;ctt;2 cca;;;5029..5105;;ctt;2 caa;6
5112..5186;;cca;2 cga;;;5112..5186;;cca;2 cca;101
5288..5361;;tgg;2 gaa;;;5288..5361;;tgg;2 cga;4
5366..5441;;tat;3 tgg;7;;5366..5444;;tac;2 gaa;4
5449..5522;;caa;;;;5449..5522;;caa;2 tac;6
5529..5605;;cac;;;;5529..5605;;cac;3 tgg;5
5611..5686;;gac;;;;5611..5686;;gac;;125
5812..5887;;gga;;;;5812..5887;;gga;;10
5898..5973;;aac;@1;;;5898..5973;;aac;@1;4
5978..6066;;tac;ctt;;;5978..6066;;tac;ctt;9
6076..6153;;ata;ata;82;;6076..6153;;ata;ata;4
;;****;tat;;;6158..6231;;caa;;4
6236..6311;;atgi;;;;6236..6311;;atgi;;5
6317..6392;;aac;;;;6317..6392;;aac;;4
6397..6470;;tgg;;;;6397..6470;;tgg;;131
6602..6678;;gaa;;;;6602..6678;;gaa;;5
6684..6757;;ggc;;;;6684..6757;;ggc;;55
6813..6885;;ttc;;;;6813..6885;;ttc;;22
6908..6980;;cga;;7;;6908..6983;;cga;;4
6988..7065;;cca;;;;6988..7065;;cca;;5
7071..7155;;ttg;;;;7071..7155;;ttg;;5
7161..7235;;atc;;4;;7161..7235;;atc;;5
7240..7317;;atgf;;;;7241..7317;;atgf;;5
7323..7398;;gca;;;;7323..7398;;gca;;109
7508..7584;;cga;;;;7508..7584;;cga;;3
7588..7668;;cta;;;;7588..7668;;cta;;13
7682..7758;;atc;;;;7682..7758;;atc;;8
7767..7841;;aac;;;;7767..7841;;aac;;4
7846..7919;;tgg;;;;7846..7919;;tgg;;33
7953..8324;;cds hp;;;;7953..8324;;CDS;@4;-24
8301..8378;;gac;;;;8301..8378;;gac;;8
8387..8473;;tac;;;;8387..8473;;tac;;86
8560..8632;;aaa;;;;8560..8632;;aaa;;14
8647..8720;;gga;;;;8647..8720;;gga;;4
8725..8800;;ttc;;;;8725..8800;;ttc;;7
8808..8882;;acg;@2;;;8808..8882;;acg;@2;100
8983..9600;;cds hp;acg;;comp;8983..9600;;CDS;acg;89
9690..9771;;tta;;;;9690..9771;;tta;;3
9775..9849;;aca;;;;9775..9849;;aca;;35
9885..10169;;cds hp;;;comp;9885..10169;;CDS;;150
;;;;;;;;;;
10320..10622;;cds hp;;;comp;10320..10622;;CDS;;116
10739..10813;;aca;;;;10739..10813;;aca;;18
10832..11146;;cds hp;;;comp;10832..11146;;CDS;;216
;;;;;;;;;;
11363..11599;;cds hp;;;comp;11363..11599;;CDS;;94
11694..11765;;aga;;85;;11694..11768;;aga;;103
11851..12312;;cds rev-trans;;;;11872..12312;;CDS;;195
;;;;;;;;;;
12508..12756;;cds trans-rg;;442;comp;12508..12756;;CDS;;293
****;;****;;;;13050..13126;;atc;;72
13199..14083;;cds hp;;;;13199..14083;;CDS;;226
;;;;;;;;;;
14310..14385;;tcg;+;;;14310..14385;;tcg;+;8
14394..14481;;tcc;2 tcg;;;14394..14481;;tcc;2 tcg;7
14489..14560;;ctt;@3;6;;14489..14563;;ctt;@3;3
14567..14654;;tcg;tcg;;;14567..14654;;tcg;tcg;5
14660..14751;;tca;ctt;;;14660..14751;;tca;ctt;119
14871..15080;;cds hp;;;;14871..15080;;CDS;;212044
;;;;;;;;;;
227125..227388;;cds hp;;;comp;227125..227388;;CDS;;444
227833..227903;;gga;;;comp;227833..227903;;gga;;248
228152..228391;;cds hp;;;comp;228152..228391;;CDS;;1401
;;;;;;;;;;
229793..229999;;cds hp;;;comp;229793..229999;;CDS;;24
230024..230108;;tca;;783;comp;230024..230108;;tca;;289
****;;****;;;comp;230398..230640;;CDS;;231
;;;;;;;;;;
230872..231393;;;cds hp;;comp;230872..231393;;CDS;;161
231558..231640;;tta;;;comp;231555..231640;;tta;;977
232618..233067;;cds hp;;;;232618..233067;;CDS;;277050
510118..1;;;;;;510118..1;;;;
&lt;/pre&gt;

====ppm cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_cumuls|ppm cumuls]]
*Chromosome&lt;br&gt;
&lt;pre&gt;
Paenibacillus polymyxa SC2;;;;;;;;;;;;
chromosome;;;;;;;;;;;;
;Opérons;;Fréquences intercalaires;;;;;Fréquences cds;;;;
;;effectifs;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsa;cdsj;gammes;cdsd
avec rRNA;opérons;13;1;1;0;1;0;100;8;5;40;0
;16 23 5s 0;7;20;12;46;50;1;200;20;17;60;1
;16 5 atc gca;2;40;3;15;100;4;300;10;6;80;2
;16 23 5s a;3;60;1;2;150;8;400;13;9;100;2
;max a;21;80;0;1;200;6;500;7;4;120;2
;a doubles;0;100;1;0;250;15;600;2;0;140;3
;16 gca 23 5s ;1;120;0;1;300;5;700;1;0;160;3
;total aas;73;140;0;0;350;3;800;1;1;180;2
sans ;opérons;19;160;0;0;400;5;900;0;0;200;1
;1 aa;15;180;0;0;450;4;1000;1;0;220;3
;max a;15;200;0;0;500;2;1100;0;0;240;2
;a doubles;0;;0;0;;11;;1;0;;1
;total aas;37;;18;65;;64;;64;42;;22
total aas;;110;moyenne;20;17;;193;;292;229;;150
remarques;;1;variance;21;17;;73;;234;123;;58
jaune;;;;;;;sans;;;sans;;
&lt;/pre&gt;
*Plasmide&lt;br&gt;
&lt;pre&gt;
Paenibacillus polymyxa SC2;;;;;;;;;;;;
plasmide;;;;;;;;;;;;
;Opérons;;Fréquences intercalaires;;;;;Fréquences cds;;;;
;;effectifs;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsa;cdsj;gammes;cdsd
avec rRNA;opérons;0;1;0;;1;1;60;0;;40;4
;16 23 5s 0;;20;33;;50;4;80;4;;60;0
;16 5 atc gca;;40;1;;100;4;100;5;;80;1
;16 23 5s a;;60;1;;150;3;120;2;;100;1
;max a;;80;1;;200;1;140;1;;120;1
;a doubles;;100;1;;250;2;160;2;;140;0
;16 gca 23 5s ;;120;2;;300;2;180;1;;160;0
;total aas;;140;2;;350;0;200;0;;180;1
sans ;opérons;10;160;0;;400;0;220;1;;200;0
;1 aa;6;180;0;;450;1;240;0;;220;0
;max a;32;200;0;;500;0;260;0;;240;0
;a doubles;2;;0;;;2;;1;;;1
;total aas;51;;41;;;20;;17;;;9
total aas;;51;moyenne;6;;;126;;102;;;89
remarques;;3;variance;3;;;92;;32;;;77
;jaune;;;sans;;;sans;;sans;;;
&lt;/pre&gt;
====ppm blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_blocs|ppm blocs]]
&lt;pre&gt;
ppm blocs;;;;;;;
cds;392;;cds;1116;;cds;493
$16s;207;;$16s;207;;$16s;400
$23s;76;;$23s;76;;$23s;76
$5s;34;;$5s;82;;$5s;18
atc;22;;gca;4;;aac;3
19aas;*;;15aas;*;;9aas;*
gga;'''204’;;gga;1133;;cca;107
cds;;;cds;;;cds;
;;;;;;;
cds;367;;cds;412;;cds;380
$16s;93;;$16s;108;;$16s;89
$5s;38;;$5s;39;;gca;185
atc;20;;atc;20;;$23s;76
gca;129;;gca;128;;$5s;163
$23s;76;;$23s;130;;cds;
$5s;18;;agc;28;;;
aac;3;;6aas;*;;;
9aas;*;;aaa;154;;;
gga;726;;cds;;;;
cds;;;;;;;
;;;;;;;
cds;327;'''616’;524;611;449;540;426
$16s;280;207;207;208;221;400;343
$23s;143;76;76;75;76;143;144
$5s;232;343;629;'''183’;216;'''236’;156
cds;;;;;;;
;;;;;;;
$5s;constant;39 aas;117 pbs;;;;
&lt;/pre&gt;

====ppm distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_distribution|ppm distribution]]
*Chromosome
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;;;;;;;;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;;;;;;;;;;ttc;2;tcc;2;tac;3;tgc;1
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;1;;;;;;;;;;;atc;1;acc;1;aac;4;agc;2
ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;4
gtc;1;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;1;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;4
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;2;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;5;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;4;caa;3;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;1;gca;;gaa;2;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;2;gaa;4;gga;3
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;;;;;;;;;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;1;agg;;;;;;;;;;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ppm;;15;;;;;15;;ppm;22;;;;;;22;;;;;;;;;;;ppm;;;;68;;;68
&lt;/pre&gt;
*Plasmide
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;1;tac;3;tgc;1
atc;1;acc;;aac;;agc;;;atc;2;acc;;aac;3;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;2;caa;2;cga;2
gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;1;gaa;2;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;2;tag;;tgg;3
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;1;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ppm;;6;;;;;6;;ppm;45;;;;;;45
&lt;/pre&gt;
====ppm données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_données_intercalaires|ppm données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;ppm;fx;fc;ppm;fx40;fc40;ppm;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;0;19;0;0;19;-1;0;59;90;259;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;suite;contig
;0;10;16;226;1;0;46;-2;0;0;145;204;98;;gca;28;;agc;7;;cca
;0;20;20;240;2;2;33;-3;0;0;157;94;tRNA 23s;;;10;;atgj;12;;ttg
;0;30;11;212;3;0;22;-4;7;229;226;122;129;;gca;4;;gta;5;;cgt
;0;40;16;141;4;2;28;-5;0;0;1133;246;130;;gca;19;;aca;38;;ggc
;1;50;22;136;5;4;25;-6;0;0;73;262;186;;gca;77;;gac;28;;aaa
;0;60;16;103;6;3;17;-7;0;6;44;148;5s tRNA;;;9;;ttc;26;;gac
;0;70;33;103;7;0;14;-8;2;76;165;130;39;;atc;7;;tac;30;;atgf
;2;80;46;105;8;3;12;-9;1;0;107;244;34;;atc;**;;aaa;9;;gta
;1;90;60;114;9;0;13;-10;1;4;265;520;82;;gca;22;;atc;17;;gaa
2;0;100;49;98;10;2;16;-11;2;27;129;381;2* 18;;aac;4;;gca;3;;tcc
;2;110;51;110;11;3;12;-12;1;0;213;91;38;;atc;34;;aac;**;;aac
;0;120;58;96;12;2;31;-13;1;1;270;222;23s tRNA;;;3;;atgj;9;;gga
3;2;130;54;91;13;2;25;-14;0;22;123;139;131;;agc;31;;agc;22;;cca
1;0;140;45;93;14;2;30;-15;0;0;107;279;tRNA tRNA;;intra;6;;gaa;5;;cgt
1;1;150;53;69;15;2;23;-16;1;1;214;504;2* 20;;atc gca;10;;gta;10;;ggc
;1;160;43;87;16;2;29;-17;1;18;1861;249;tRNA tRNA;;;25;;atgf;11;;cta
;1;170;40;88;17;3;21;-18;0;0;2208;247;1;;aac;50;;gac;4;;aaa
1;0;180;29;79;18;1;22;-19;0;1;726;122;**;;agc;25;;ttc;55;;caa
;0;190;32;84;19;1;21;-20;1;15;77;238;86;;gaa;5;;aca;11;;gta
;0;200;35;74;20;2;26;-21;0;0;;207;15;;aaa;16;;tac;11;;gaa
3;0;210;40;54;21;1;20;-22;0;1;;174;**;;ctc;18;;cac;3;;acc
;2;220;35;56;22;0;21;-23;0;11;;206;11;;gcc;4;;caa;**;;aac
1;1;230;36;62;23;1;22;-24;0;1;CDS 16s;;**;;aag;15;;aaa;;;
1;0;240;28;45;24;0;19;-25;0;5;323;612;11;;ttg;6;;ctg;;;
4;0;250;37;44;25;3;16;-26;1;10;408;570;11;;tgc;10;;ggc;;;
1;0;260;16;36;26;0;24;-27;0;0;388;;6;;ggc;26;;tgc;;;
1;2;270;22;28;27;2;25;-28;0;1;520;;9;;caa;22;;cgt;;;
1;0;280;28;44;28;4;20;-29;0;6;607;;17;;cac;9;;cca;;;
;0;290;19;28;29;0;21;-30;0;0;445;;7;;tgg;**;;gga;;;
;0;300;20;22;30;0;24;-31;0;0;536;;4;;tac;4;;gca;;;
;0;310;15;23;31;3;14;-32;2;3;422;;22;;aca;3;;aac;;;
;0;320;14;20;32;1;19;-33;1;0;489;;35;;ttc;19;;tcc;;;
;0;330;10;21;33;2;16;-34;0;1;363;;15;;gac;9;;gaa;;;
;0;340;14;15;34;0;15;-35;0;4;376;;25;;atgf;29;;gta;;;
;0;350;12;22;35;1;14;-36;0;0;16s 23s;;58;;gta;25;;atgf;;;
;0;360;11;20;36;0;20;-37;0;0;290;;17;;gaa;13;;gac;;;
;0;370;11;8;37;2;8;-38;1;1;4* 217;;3;;tcc;4;;aca;;;
;0;380;6;14;38;3;14;-39;0;0;218;;**;;aac;102;;tac;;;
1;0;390;4;18;39;3;12;-40;0;2;231;;;;;4;;caa;;;
;0;400;9;7;40;1;9;-41;1;2;2* 410;;;;;12;;aaa;;;
2;4;reste;151;221;reste;1196;2338;-42;0;0;353;;;;;10;;cta;;;
23;20;total;1267;3176;total;1259;3176;-43;0;0;23s 5s;;;;;5;;ggc;;;
21;16;diagr;1116;2936;diagr;63;819;-44;0;4;6* 77;;;;;12;;cgt;;;
0;0; t30;47;678;;;;-45;1;0;3* 78;;;;;7;;ttg;;;
;;;;;;;;-46;0;0;144;;;;;7;;cca;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;1;2;2* 145;;;;;**;;gga;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;16s 5s;;;;;;;;;;
;x;1267;29;0;1296;;;-49;0;1;117;;;;;;;;;;
;c;3157;523;19;3699;;;-50;0;2;102;;;;;;;;;;
;;;;;4995;190;;reste;3;7;5s CDS;;;;;;;;;;
;;;;;;5185;;total;29;523;232;176;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;343;183;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;216;236;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;383;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;163;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ppm autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_autres_intercalaires_aas|ppm autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires ;;ppm;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;10545;11633;323;*;
;;rRNA;11957;13510;290;*;1554
;;rRNA;13801;16726;145;*;2926
;;rRNA;16872;16988;232;*;117
fin;;CDS;17221;17640;;0;
deb;comp;CDS;111496;112530;612;*;
;;rRNA;113143;114696;217;*;1554
;;rRNA;114914;117842;77;*;2929
;;rRNA;117920;118036;343;*;117
fin;;CDS;118380;119837;;;
deb;;CDS;123186;124469;90;*;
;;tRNA;124560;124648;145;*;tca
fin;;CDS;124794;125135;;;
deb;;CDS;176747;176944;111;*;
;;ncRNA;177056;177322;155;*;
fin;;CDS;177478;179229;;;
deb;;CDS;180728;181003;408;*;
;;rRNA;181412;182965;117;*;1554
;;rRNA;183083;183199;39;*;117
;;tRNA;183239;183315;20;*;atc
;;tRNA;183336;183411;129;*;gca
;;rRNA;183541;186467;131;*;2927
;;tRNA;186599;186690;28;*;agc
;;tRNA;186719;186795;10;*;atgj
;;tRNA;186806;186881;4;*;gta
;;tRNA;186886;186961;19;*;aca
;;tRNA;186981;187057;77;*;gac
;;tRNA;187135;187207;9;*;ttc
;;tRNA;187217;187302;7;*;tac
;;tRNA;187310;187382;157;*;aaa
fin;;CDS;187540;188682;;;
deb;comp;CDS;212745;213326;226;*;
;comp;tRNA;213553;213624;259;*;cgg
fin;;CDS;213884;214921;;;
deb;;CDS;224658;225137;255;*;
;;tmRNA;225393;225757;618;*;
fin;;CDS;226376;227050;;;
deb;;CDS;453754;455364;388;*;
;;rRNA;455753;457306;217;*;1554
;;rRNA;457524;460452;77;*;2929
;;rRNA;460530;460646;34;*;117
;;tRNA;460681;460757;22;*;atc
;;tRNA;460780;460855;4;*;gca
;;tRNA;460860;460935;34;*;aac
;;tRNA;460970;461043;3;*;atgj
;;tRNA;461047;461138;31;*;agc
;;tRNA;461170;461241;6;*;gaa
;;tRNA;461248;461323;10;*;gta
;;tRNA;461334;461407;25;*;atgf
;;tRNA;461433;461509;50;*;gac
;;tRNA;461560;461632;25;*;ttc
;;tRNA;461658;461733;5;*;aca
;;tRNA;461739;461824;16;*;tac
;;tRNA;461841;461913;18;*;cac
;;tRNA;461932;462006;4;*;caa
;;tRNA;462011;462086;15;*;aaa
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;;rRNA;2643752;2645305;353;*;1554
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;;rRNA;2648731;2648847;383;*;117
fin;;CDS;2649231;2650082;;;
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;comp;rRNA;5058967;5059083;77;*;117
;comp;rRNA;5059161;5062088;186;*;2928
;comp;tRNA;5062275;5062350;98;*;gca
;comp;rRNA;5062449;5064002;376;*;1554
fin;comp;CDS;5064379;5066394;;;
deb;;CDS;5714294;5714611;206;*;
;comp;tRNA;5714818;5714908;77;*;tcg
fin;comp;CDS;5714986;5715210;;;
&lt;/pre&gt;

===pmq===
====pmq opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq opérons|pmq opérons]]
&lt;pre&gt;
58.3%GC;24.7.19 Paris;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Paenibacillus mucilaginosus 3016;;;;;;;;;
;9206..10276;CDS;;322;322;;;357;
;10599..12139;16s;;269;;;;;
;12409..15343;23s;;95;;;;;
;15439..15555;5s;;178;178;;;;178
;15734..17190;CDS;;3061;;;;486;
;;;;;;;;;
;20252..21532;CDS;;47;47;;;427;47
;21580..21666;tca;;140;140;;;;
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;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;
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;185595..185670;aaa;;183;183;;;;183
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;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;
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;585396..585470;ggc;+;40;;;40;;
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;;;;;;;;;
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;673436..673507;gaa;;9;;9;;;
;673517..673599;ctc;;180;180;;;;
;673780..674199;CDS;;182;;;;140;
;;;;;;;;;
;674382..675278;CDS;;159;159;;;299;
;675438..675520;ctc;;64;64;;;;64
;675585..675833;CDS;;18450;;;;83;
;;;;;;;;;
;694284..695636;CDS;;797;*797;;;451;
;696434..697974;16s;;261;;;;;
;698236..701170;23s;;94;;;;;
;701265..701381;5s;;43;;;;;
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;701510..701584;gaa;;5;;;5;;
;701590..701665;gtc;;5;;;5;;
;701671..701747;atgf;;4;;;4;;
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;702009..702095;ctg;;4;;;4;;
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;702926..703120;CDS;;370320;;;;65;
;;;;;;;;;
;1073441..1074214;CDS;;373;373;;;258;
;1074588..1076136;16s;;260;;;;;
;1076397..1079331;23s;;168;;;;;
;1079500..1079616;5s;;9;;;;;
;1079626..1079701;aac;;6;;;6;;
;1079708..1079796;tcc;;38;;;38;;
;1079835..1079906;gaa;;11;;;11;;
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;1080011..1080087;atgf;;13;;;13;;
;1080101..1080177;gac;;49;;;49;;
;1080227..1080302;ttc;;4;;;4;;
;1080307..1080382;aca;;13;;;13;;
;1080396..1080481;tac;;8;;;8;;
;1080490..1080560;tgg;;13;;;13;;
;1080574..1080649;cac;;26;;;26;;
;1080676..1080747;caa;;9;;;9;;
;1080757..1080831;ggc;;12;;;12;;
;1080844..1080917;tgc;;10;;;10;;
;1080928..1081016;tta;;20;;;20;;
;1081037..1081113;cgt;;3;;;3;;
;1081117..1081199;ttg;;147;147;;;;147
;1081347..1081973;CDS;;128630;;;;209;
;;;;;;;;;
;1210604..1213519;CDS;;354;354;;;972;
;1213874..1213949;gca;;16;;16;;;
;1213966..1214037;gaa;;12;;12;;;
;1214050..1214125;gta;;16;;16;;;
;1214142..1214218;gac;;17;;17;;;
;1214236..1214311;cac;;9;;9;;;
;1214321..1214395;caa;;9;;9;;;
;1214405..1214477;aaa;;8;;8;;;
;1214486..1214572;ctg;;3;;3;;;
;1214576..1214647;ggc;;169;169;;;;169
comp;1214817..1215602;CDS;;378784;;;;262;
;;;;;;;;;
;1594387..1594665;CDS;;537;*537;;;93;
;1595203..1596743;16s;;252;;;;;
;1596996..1599930;23s;;94;;;;;
;1600025..1600141;5s;;43;;;;;
;1600185..1600261;atc;;19;;;19;;
;1600281..1600356;gca;;17;;;17;;
;1600374..1600445;gaa;;8;;;8;;
;1600454..1600529;gta;+;5;;;5;;
;1600535..1600610;aca;2 gta;10;;;10;;
;1600621..1600705;tac;;18;;;18;;
;1600724..1600799;aac;;4;;;4;;
;1600804..1600879;gta;;21;;;21;;
;1600901..1600977;atgf;;12;;;12;;
;1600990..1601066;gac;;34;;;34;;
;1601101..1601176;cac;;13;;;13;;
;1601190..1601264;caa;;8;;;8;;
;1601273..1601345;aaa;;17;;;17;;
;1601363..1601448;ctc;;13;;;13;;
;1601462..1601548;ctg;;5;;;5;;
;1601554..1601628;ggc;;14;;;14;;
;1601643..1601713;tgc;;10;;;10;;
;1601724..1601797;cgt;;5;;;5;;
;1601803..1601876;cca;;105;105;;;;105
;1601982..1602245;CDS;;232535;;;;88;
;;;;;;;;;
;1834781..1835260;CDS;;106;106;;;160;106
;1835367..1835439;gcc;;137;137;;;;
comp;1835577..1835978;CDS;;371114;;;;134;
;;;;;;;;;
comp;2207093..2208091;CDS;;192;192;;;333;192
;2208284..2208367;ctg;+;49;;49;;;
;2208417..2208500;ctg;2 ctg;315;315;;;;
;2208816..2209952;CDS;;1246561;;;;379;
;;;;;;;;;
;3456514..3456786;CDS;;256;256;;;91;
;3457043..3457119;ccc;;142;142;;;;142
;3457262..3457483;CDS;;1547757;;;;74;
;;;;;;;;;
comp;5005241..5005426;CDS;;127;127;;;62;127
comp;5005554..5005636;ctc;;40;;40;;;
comp;5005677..5005765;tcc;;13;;13;;;
comp;5005779..5005852;atg;;19;;19;;;
comp;5005872..5005958;tcg;;167;167;;;;
;5006126..5006220;ncRNA;;1377035;;;;32;
;;;;;;;;;
comp;6383256..6384173;CDS;;228;228;;;306;
;6384402..6384477;gtc;;69;69;;;;69
comp;6384547..6385458;CDS;;5453;;;;304;
;;;;;;;;;
comp;6390912..6391130;CDS;;142;142;;;73;142
comp;6391273..6391358;tta;;7;;7;;;
comp;6391366..6391442;atgi;;19;;19;;;
comp;6391462..6391538;atgf;;370;370;;;;
comp;6391909..6392460;CDS;;962046;;;;184;
;;;;;;;;;
;7354507..7354737;CDS;;342;342;;;77;*342
comp;7355080..7355162;ctc;;28;;;28;;
comp;7355191..7355279;tcc;;12;;;12;;
comp;7355292..7355368;atgf;;14;;;14;;
comp;7355383..7355459;atgj;;14;;;14;;
comp;7355474..7355561;agc;;8;;;8;;
comp;7355570..7355659;tcg;;4;;;4;;
comp;7355664..7355736;acc;;4;;;4;;
comp;7355741..7355816;gca;;119;;;;;
;7355936..7356030;ncRNA;@3;36;;;;;
comp;7356067..7356140;cca;;6;;;6;;
comp;7356147..7356220;cgt;;104;;;*104;;
comp;7356325..7356396;ggc;;7;;;7;;
comp;7356404..7356490;ctg;;9;;;9;;
comp;7356500..7356572;aaa;;9;;;9;;
comp;7356582..7356656;caa;;9;;;9;;
comp;7356666..7356741;cac;;17;;;17;;
comp;7356759..7356835;gac;;12;;;12;;
comp;7356848..7356923;gta;;4;;;4;;
comp;7356928..7357003;aac;;15;;;15;;
comp;7357019..7357103;tac;;8;;;8;;
comp;7357112..7357187;aca;;5;;;5;;
comp;7357193..7357264;gaa;;15;;;15;;
comp;7357280..7357355;gcc;;9;;;9;;
comp;7357365..7357438;atc;;54;;;;;
comp;7357493..7357609;5s;;112;;;;;
comp;7357722..7360655;23s;;258;;;;;
comp;7360914..7362454;16s;;403;*403;;;;
;7362858..7363397;CDS;;254752;;;;180;
;;;;;;;;;
;7618150..7618842;CDS;;280;280;;;231;*280
comp;7619123..7619193;ggg;;335;335;;;;
;7619529..7620461;CDS;;46171;;;;311;
;;;;;;;;;
comp;7666633..7668069;CDS;;104;104;;;479;104
comp;7668174..7668244;ggg;;5;;;5;;
comp;7668250..7668326;cca;;106;;;*106;;
comp;7668433..7668506;cgt;;11;;;11;;
comp;7668518..7668592;ggc;;5;;;5;;
comp;7668598..7668684;ctg;;13;;;13;;
comp;7668698..7668783;ctc;;16;;;16;;
comp;7668800..7668872;aaa;;10;;;10;;
comp;7668883..7668967;tac;;28;;;28;;
comp;7668996..7669071;ttc;;12;;;;;
comp;7669084..7669200;5s;;159;;;;;
comp;7669360..7672297;23s;;256;;;;;
comp;7672554..7674095;16s;;537;*537;;;;
;7674633..7675382;CDS;;177794;;;;250;
;;;;;;;;;
comp;7853177..7853761;CDS;;57;57;;;195;57
comp;7853819..7853892;cac;;230;;230;;;
comp;7854123..7854196;cac;;404;*404;;;;
comp;7854601..7854801;CDS;;245639;;;;67;
;;;;;;;;;
comp;8100441..8100854;CDS;;123;123;;;138;123
comp;8100978..8101094;5s;;167;;;;;
comp;8101262..8104180;23s;;248;;;;;
comp;8104429..8105969;16s;;325;325;;;;
comp;8106295..8106636;CDS;;45281;;;;114;
;;;;;;;;;
comp;8151918..8152448;CDS;;460;*460;;;177;*460
comp;8152909..8153031;5s;;94;;;;;
comp;8153126..8156060;23s;;258;;;;;
comp;8156319..8157859;16s;;456;*456;;;;
;8158316..8158642;CDS;;98285;;;;109;
;;;;;;;;;
;8256928..8257746;CDS;;83;83;;;273;83
comp;8257830..8257903;gga;;5;;;5;;
comp;8257909..8257985;cca;;16;;;16;;
comp;8258002..8258078;cgt;;4;;;4;;
comp;8258083..8258157;ggc;;8;;;8;;
comp;8258166..8258248;cta;;42;;;42;;
comp;8258291..8258366;aaa;;8;;;8;;
comp;8258375..8258449;caa;;9;;;9;;
comp;8258459..8258532;tgg;;4;;;4;;
comp;8258537..8258613;atgf;;5;;;5;;
comp;8258619..8258694;gtc;;5;;;5;;
comp;8258700..8258774;gaa;;11;;;11;;
comp;8258786..8258859;atc;;43;;;;;
comp;8258903..8259019;5s;;94;;;;;
comp;8259114..8262048;23s;;255;;;;;
comp;8262304..8263845;16s;;306;306;;;;
comp;8264152..8264370;CDS;;58373;;;;73;
;;;;;;;;;
comp;8322744..8323205;CDS;;393;393;;;154;*393
comp;8323599..8323715;5s;;94;;;;;
comp;8323810..8326748;23s;;258;;;;;
comp;8327007..8328547;16s;;369;369;;;;
comp;8328917..8330413;CDS;;21505;;;;499;
;;;;;;;;;
comp;8351919..8354414;CDS;;396;396;;;832;
comp;8354811..8354884;atg;;149;149;;;;149
comp;8355034..8355537;CDS;;34450;;;;168;
;;;;;;;;;
;8389988..8390512;CDS;;296;296;;;175;*296
comp;8390809..8390925;5s;;94;;;;;
comp;8391020..8393954;23s;;259;;;;;
comp;8394214..8395754;16s;;234;234;;;;
comp;8395989..8396255;CDS;;220222;;;;89;
;;;;;;;;;
comp;8616478..8616924;CDS;;417;*417;;;149;
;8617342..8617418;gac;;157;157;;;;157
;8617576..8618541;CDS;;105821;;;;322;
;;;;;;;;;
;8724363..8724614;CDS;;455;*455;;;84;
comp;8725070..8725160;tcg;;165;165;;;;165
comp;8725326..8725559;CDS;;9205;;;;78;
;;opéron;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd
&lt;/pre&gt;
====pmq cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_cumuls|pmq cumuls]]
&lt;pre&gt;
pmq;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cds dirigé;gammes;cdsa;cdsd
avec rRNA;opérons;14;1;0;1;1;0;1;0;100;15;8
;16 23 5s 0;5;20;14;107;50;3;20;1;200;18;10
;16 atc gca;0;40;1;12;100;4;40;0;300;12;6
;16 23 5s a;9;60;1;4;150;11;60;2;400;9;3
;max a;23;80;0;1;200;11;80;2;500;6;4
;a doubles;3;100;0;0;250;3;100;1;600;0;0
;spéciaux;0;120;0;2;300;6;120;3;700;0;0
;total aas;138;140;0;0;350;7;140;3;800;0;0
sans ;opérons;17;160;0;1;400;6;160;5;900;1;0
;1 aa;11;180;0;0;450;3;180;3;1000;1;0
;max a;9;200;0;0;500;3;200;4;1100;0;0
;a doubles;1;;2;0;;5;;7;;0;0
;total aas;35;;18;128;;62;;31;;62;31
total aas;;173;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;16;;;;;;235;213
;;;variance;;20;;;;;;184;122
sans jaune;;;moyenne;16;14;;207;;126;;;
;;;variance;12;11;;106;;49;;;
&lt;/pre&gt;
====pmq blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_blocs|pmq blocs]]
&lt;pre&gt;
Les blocs à rRNAs pmq;;;;;
CDS;298;324;373;12;
16s;254;258;260;159;
23s;168;166;168;256;
5s;15;31;9;537;
1er aa;agc;aac;aac;ttc;
aas;9;16;17;9;
CDS;183;187;147;104;
;;;;;
CDS;677;797;537;54;43
16s;268;261;252;112;94
23s;95;94;94;258;255
5s;55;43;43;403;306
atc / aas;22;11;19;23;12
CDS;283;577;105;342;83
;;;;;
CDS;322;123;460;393;296
16s;269;167;94;94;94
23s;95;248;258;258;259
5s;178;325;456;369;234
&lt;/pre&gt;
====pmq distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_distribution|pmq distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;7
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ggc2  5s;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;4;tcc;4;tac;6;tgc;3
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;5;acc;2;aac;5;agc;3
ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;;cac;3;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;4;ccc;;cac;4;cgt;7
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;3;gcc;1;gac;6;ggc;9
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;8;aga;1
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;7;caa;6;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;7;gca;4;gaa;7;gga;2
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;2;tcg;2;tag;;tgg;3
atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;2;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;2;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;5;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
pmq;;11;;;;;11;;pmq;22;;;;;;22;;pmq;2;;;;;;2;;pmq;;;;138;;;138
&lt;/pre&gt;
====pmq données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_données_intercalaires|pmq données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;pmq;fx;fc;pmq;fx40;fc40;pmq;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;5;26;0;5;26;-1;0;80;47;222;23s 5s;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;suite;contig;tRNA tRNA;suite;contig
;0;10;15;298;1;1;52;-2;3;0;137;183;2* 97;;;29;;agc;11;;atc;28;;ctc
;1;20;15;336;2;1;46;-3;0;1;129;183;2* 170;;;39;;atgj;5;;gaa;12;;tcc
;0;30;21;274;3;1;35;-4;11;384;283;261;168;;;15;;gta;5;;gtc;14;;atgf
;0;40;15;250;4;1;34;-5;0;1;187;169;6* 96;;;14;;atgf;4;;atgf;14;;atgj
;1;50;21;195;5;1;28;-6;3;1;18;137;113;;;48;;gac;9;;tgg;8;;agc
;0;60;24;156;6;1;32;-7;0;5;180;192;161;;;5;;ttc;8;;caa;4;;tcg
;1;70;32;142;7;2;28;-8;0;76;159;228;169;;;9;;aca;18;;aaa;4;;acc
1;1;80;45;170;8;2;12;-9;1;0;64;72;5s CDS;;;15;;tac;7;;ctg;;119;gca
1;1;90;45;162;9;4;10;-10;1;8;577;342;178;296;;**;;aaa;11;;ggc;;36;ncRNA
;0;100;53;148;10;1;21;-11;2;32;150;280;123;;;19;;atc;12;;cgt;6;;cca
;3;110;55;121;11;1;23;-12;0;0;354;335;460;;;16;;gca;**;;cca;104;;cgt
;0;120;61;117;12;0;38;-13;0;7;105;86;393;;;9;;gaa;6;;aac;7;;ggc
;1;130;78;119;13;1;43;-14;2;27;106;417;5s tRNA;;;20;;tac;38;;tcc;9;;ctg
1;1;140;60;95;14;1;45;-15;0;0;315;455;15;;agc;3;;aac;11;;gaa;9;;aaa
;4;150;65;118;15;3;39;-16;0;5;256;;55;;atc;19;;gta;17;;gta;9;;caa
;2;160;67;87;16;2;34;-17;2;17;142;;54;;atc;20;;gac;13;;atgf;17;;cac
1;1;170;75;94;17;1;25;-18;0;0;394;;3* 43;;atc;15;;ttc;49;;gac;12;;gac
;1;180;66;111;18;3;36;-19;0;1;142;;9;;aac;10;;aaa;4;;ttc;4;;gta
2;1;190;81;93;19;3;29;-20;1;14;75;;31;;aac;3;;ctg;13;;aca;15;;aac
1;0;200;64;95;20;0;24;-21;0;0;104;;12;;ttc;12;;ggc;8;;tac;8;;tac
;0;210;66;85;21;6;37;-22;1;5;84;;tRNA tRNA;;;15;;tgc;13;;tgg;5;;aca
;0;220;59;85;22;1;32;-23;0;13;404;;7;;aac;5;;cgt;26;;cac;15;;gaa
2;0;230;53;78;23;2;24;-24;0;0;396;;297;;agc;158;;cca;9;;caa;9;;gcc
;0;240;54;87;24;2;45;-25;1;3;149;;9;;gaa;4;;gca;12;;ggc;**;;atc
;0;250;48;73;25;0;28;-26;3;13;157;;**;;ctc;5;;acc;10;;tgc;5;;ggg
;1;260;42;65;26;5;15;-27;0;0;165;;16;;gca;19;;tcg;20;;tta;106;;cca
1;0;270;43;60;27;2;24;-28;0;0;CDS 16s;;12;;gaa;17;;agc;3;;cgt;11;;cgt
1;0;280;35;59;28;2;14;-29;0;8;318;399;16;;gta;5;;gtc;**;;ttg;5;;ggc
;1;290;29;45;29;0;25;-30;0;0;299;533;17;;gac;39;;acg;19;;atc;13;;ctg
;0;300;23;35;30;1;30;-31;0;2;673;793;9;;cac;41;;tcc;17;;gca;16;;ctc
;0;310;35;45;31;0;26;-32;1;8;320;;9;;caa;**;;ctc;8;;gaa;10;;aaa
;1;320;28;32;32;1;21;-33;0;0;377;;8;;aaa;10;;aac;5;;gta;28;;tac
;0;330;28;41;33;1;26;-34;1;2;533;;3;;ctg;38;;tcc;10;;aca;**;;ttc
1;0;340;21;27;34;3;20;-35;1;6;321;;**;;ggc;11;;gaa;18;;tac;5;;gga
1;0;350;25;33;35;1;31;-36;2;0;272;;49;;ctg;17;;gta;4;;aac;16;;cca
;1;360;19;22;36;1;23;-37;0;2;302;;**;;ctg;15;;atgf;21;;gta;4;;cgt
;0;370;15;25;37;3;24;-38;0;2;365;;40;;ctc;67;;gac;12;;atgf;8;;ggc
;0;380;12;32;38;1;24;-39;0;0;230;;13;;tcc;11;;acg;34;;gac;42;;cta
;0;390;15;24;39;2;27;-40;0;1;16s 23s;;19;;atgj;10;;cac;13;;cac;8;;aaa
;2;400;10;26;40;2;28;-41;0;5;2* 280;;**;;tcg;5;;caa;8;;caa;9;;caa
2;2;reste;265;354;reste;1817;3356;-42;0;0;266;;7;;tta;17;;aaa;17;;aaa;4;;tgg
15;27;total;1888;4540;total;1888;4540;-43;0;0;272;;19;;atgi;40;;ggc;13;;ctc;5;;atgf
13;25;diagr;1618;4160;diagr;66;1158;-44;1;3;271;;**;;atgf;24;;ggc;5;;ctg;5;;gtc
0;1; t30;51;908;;;;-45;0;0;263;;230;;cac;8;;ttg;14;;ggc;11;;gaa
;;;;;;;;-46;0;1;4* 269;;**;;cac;19;;cca;10;;tgc;**;;atc
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;268;;;;;1;;gga;5;;cgt;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;259;;;;;**;;aga;**;;cca;;;
;x;1883;42;5;1930;;;-49;0;2;267;;;;;;;;;;;;;
;c;4514;753;26;5293;;;-50;0;1;270;;;;;;;;;;;;;
;;;;;7223;256;;reste;5;16;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;7479;;total;42;753;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====pmq autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_autres_intercalaires_aas|pmq autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;pmq;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;9206;10276;318;*;
;;rRNA;10595;12131;280;*;16s
;;rRNA;12412;15341;97;*;23s
;;rRNA;15439;15555;178;*;5s
fin;;CDS;15734;17190;;;
deb;;CDS;20252;21532;47;*;
;;tRNA;21580;21669;137;*;tca
fin;;CDS;21807;22157;;;
deb;;CDS;25422;26165;222;*;
;comp;tRNA;26388;26460;183;*;cgg
fin;;CDS;26644;27168;;;
deb;;CDS;178456;179454;299;*;
;;rRNA;179754;181290;266;*;16s
;;rRNA;181557;184486;170;*;23s
;;rRNA;184657;184773;15;*;5s
;;tRNA;184789;184876;29;*;agc
;;tRNA;184906;184982;39;*;atgj
;;tRNA;185022;185097;15;*;gta
;;tRNA;185113;185189;14;*;atgf
;;tRNA;185204;185280;48;*;gac
;;tRNA;185329;185404;5;*;ttc
;;tRNA;185410;185485;9;*;aca
;;tRNA;185495;185579;15;*;tac
;;tRNA;185595;185670;183;*;aaa
fin;comp;CDS;185854;187104;;0;
deb;comp;CDS;217565;218146;129;*;
;comp;tRNA;218276;218350;261;*;cgg
fin;;CDS;218612;219643;;;
deb;;CDS;230970;231455;186;*;
;;tmRNA;231642;232004;140;*;
fin;;CDS;232145;232804;;;
deb;;CDS;253921;254526;673;*;
;;rRNA;255200;256736;280;*;16s
;;rRNA;257017;259946;97;*;23s
;;rRNA;260044;260160;55;*;5s
;;tRNA;260216;260292;19;*;atc
;;tRNA;260312;260387;16;*;gca
;;tRNA;260404;260475;9;*;gaa
;;tRNA;260485;260569;20;*;tac
;;tRNA;260590;260665;3;*;aac
;;tRNA;260669;260744;19;*;gta
;;tRNA;260764;260840;20;*;gac
;;tRNA;260861;260933;15;*;ttc
;;tRNA;260949;261021;10;*;aaa
;;tRNA;261032;261118;3;*;ctg
;;tRNA;261122;261196;12;*;ggc
;;tRNA;261209;261280;15;*;tgc
;;tRNA;261296;261369;5;*;cgt
;;tRNA;261375;261448;158;*;cca
;;tRNA;261607;261682;4;*;gca
;;tRNA;261687;261759;5;*;acc
;;tRNA;261765;261854;19;*;tcg
;;tRNA;261874;261961;17;*;agc
;;tRNA;261979;262054;5;*;gtc
;;tRNA;262060;262134;39;*;acg
;;tRNA;262174;262262;41;*;tcc
;;tRNA;262304;262386;283;*;ctc
fin;;CDS;262670;263515;;;
deb;;CDS;578195;579055;320;*;
;;rRNA;579376;580913;269;*;16s
;;rRNA;581183;584112;168;*;23s
;;rRNA;584281;584397;31;*;5s
;;tRNA;584429;584501;10;*;aac
;;tRNA;584512;584600;38;*;tcc
;;tRNA;584639;584710;11;*;gaa
;;tRNA;584722;584797;17;*;gta
;;tRNA;584815;584891;15;*;atgf
;;tRNA;584907;584983;67;*;gac
;;tRNA;585051;585125;11;*;acg
;;tRNA;585137;585212;10;*;cac
;;tRNA;585223;585297;5;*;caa
;;tRNA;585303;585378;17;*;aaa
;;tRNA;585396;585470;40;*;ggc
;;tRNA;585511;585585;24;*;ggc
;;tRNA;585610;585689;8;*;ttg
;;tRNA;585698;585774;19;*;cca
;;tRNA;585794;585867;1;*;gga
;;tRNA;585869;585942;187;*;aga
fin;;CDS;586130;586885;;;
deb;;CDS;672473;672949;18;*;
;;tRNA;672968;673043;7;*;aac
;;tRNA;673051;673138;297;*;agc
;;tRNA;673436;673507;9;*;gaa
;;tRNA;673517;673599;180;*;ctc
fin;;CDS;673780;674199;;;
deb;;CDS;674382;675278;159;*;
;;tRNA;675438;675520;64;*;ctc
fin;;CDS;675585;675833;;;
deb;comp;CDS;694284;695636;793;*;
;;rRNA;696430;697966;272;*;16s
;;rRNA;698239;701168;96;*;23s
;;rRNA;701265;701381;43;*;5s
;;tRNA;701425;701498;11;*;atc
;;tRNA;701510;701584;5;*;gaa
;;tRNA;701590;701665;5;*;gtc
;;tRNA;701671;701747;4;*;atgf
;;tRNA;701752;701825;9;*;tgg
;;tRNA;701835;701909;8;*;caa
;;tRNA;701918;701990;18;*;aaa
;;tRNA;702009;702092;7;*;ctg
;;tRNA;702100;702174;11;*;ggc
;;tRNA;702186;702259;12;*;cgt
;;tRNA;702272;702348;577;*;cca
fin;;CDS;702926;703120;;;
deb;;CDS;1073441;1074214;377;*;
;;rRNA;1074592;1076128;271;*;16s
;;rRNA;1076400;1079329;170;*;23s
;;rRNA;1079500;1079616;9;*;5s
;;tRNA;1079626;1079701;6;*;aac
;;tRNA;1079708;1079796;38;*;tcc
;;tRNA;1079835;1079906;11;*;gaa
;;tRNA;1079918;1079993;17;*;gta
;;tRNA;1080011;1080087;13;*;atgf
;;tRNA;1080101;1080177;49;*;gac
;;tRNA;1080227;1080302;4;*;ttc
;;tRNA;1080307;1080382;13;*;aca
;;tRNA;1080396;1080481;8;*;tac
;;tRNA;1080490;1080560;13;*;tgg
;;tRNA;1080574;1080649;26;*;cac
;;tRNA;1080676;1080747;9;*;caa
;;tRNA;1080757;1080831;12;*;ggc
;;tRNA;1080844;1080917;10;*;tgc
;;tRNA;1080928;1081016;20;*;tta
;;tRNA;1081037;1081113;3;*;cgt
;;tRNA;1081117;1081196;150;*;ttg
fin;;CDS;1081347;1081973;;0;
deb;;CDS;1210625;1213519;354;*;
;;tRNA;1213874;1213949;16;*;gca
;;tRNA;1213966;1214037;12;*;gaa
;;tRNA;1214050;1214125;16;*;gta
;;tRNA;1214142;1214218;17;*;gac
;;tRNA;1214236;1214311;9;*;cac
;;tRNA;1214321;1214395;9;*;caa
;;tRNA;1214405;1214477;8;*;aaa
;;tRNA;1214486;1214572;3;*;ctg
;;tRNA;1214576;1214647;169;*;ggc
fin;comp;CDS;1214817;1215602;;;
deb;;CDS;1594387;1594665;533;*;
;;rRNA;1595199;1596735;263;*;16s
;;rRNA;1596999;1599928;96;*;23s
;;rRNA;1600025;1600141;43;*;5s
;;tRNA;1600185;1600261;19;*;atc
;;tRNA;1600281;1600356;17;*;gca
;;tRNA;1600374;1600445;8;*;gaa
;;tRNA;1600454;1600529;5;*;gta
;;tRNA;1600535;1600610;10;*;aca
;;tRNA;1600621;1600705;18;*;tac
;;tRNA;1600724;1600799;4;*;aac
;;tRNA;1600804;1600879;21;*;gta
;;tRNA;1600901;1600977;12;*;atgf
;;tRNA;1600990;1601066;34;*;gac
;;tRNA;1601101;1601176;13;*;cac
;;tRNA;1601190;1601264;8;*;caa
;;tRNA;1601273;1601345;17;*;aaa
;;tRNA;1601363;1601448;13;*;ctc
;;tRNA;1601462;1601548;5;*;ctg
;;tRNA;1601554;1601628;14;*;ggc
;;tRNA;1601643;1601713;10;*;tgc
;;tRNA;1601724;1601797;5;*;cgt
;;tRNA;1601803;1601876;105;*;cca
fin;;CDS;1601982;1602245;;;
deb;;CDS;1834781;1835260;106;*;
;;tRNA;1835367;1835439;137;*;gcc
fin;comp;CDS;1835577;1835978;;;
deb;;CDS;2147627;2148466;89;*;
;;ncRNA;2148556;2148735;114;*;
fin;;CDS;2148850;2149506;;0;
deb;comp;CDS;2207093;2208091;192;*;
;;tRNA;2208284;2208367;49;*;ctg
;;tRNA;2208417;2208500;315;*;ctg
fin;;CDS;2208816;2209952;;;
deb;;CDS;3456514;3456786;256;*;
;;tRNA;3457043;3457119;142;*;ccc
fin;;CDS;3457262;3457483;;;
deb;comp;CDS;5004536;5005159;394;*;
;comp;tRNA;5005554;5005636;40;*;ctc
;comp;tRNA;5005677;5005765;13;*;tcc
;comp;tRNA;5005779;5005852;19;*;atgj
;comp;tRNA;5005872;5005958;167;*;tcg
;;ncRNA;5006126;5006220;132;*;
fin;comp;CDS;5006353;5007825;;;
deb;comp;CDS;6383256;6384173;228;*;
;;tRNA;6384402;6384474;72;*;gtc
fin;comp;CDS;6384547;6385458;;;
deb;comp;CDS;6390912;6391130;142;*;
;comp;tRNA;6391273;6391358;7;*;tta
;comp;tRNA;6391366;6391442;19;*;atgi
;comp;tRNA;6391462;6391538;75;*;atgf
fin;comp;CDS;6391614;6391778;;;
deb;;CDS;6561157;6563109;118;*;
;comp;ncRNA;6563228;6563648;95;*;
fin;comp;CDS;6563744;6564859;;;
deb;;CDS;7354507;7354737;342;*;
;comp;tRNA;7355080;7355162;28;*;ctc
;comp;tRNA;7355191;7355279;12;*;tcc
;comp;tRNA;7355292;7355368;14;*;atgf
;comp;tRNA;7355383;7355459;14;*;atgj
;comp;tRNA;7355474;7355561;8;*;agc
;comp;tRNA;7355570;7355659;4;*;tcg
;comp;tRNA;7355664;7355736;4;*;acc
;comp;tRNA;7355741;7355816;119;*;gca
;;ncRNA;7355936;7356030;36;*;
;comp;tRNA;7356067;7356140;6;*;cca
;comp;tRNA;7356147;7356220;104;*;cgt
;comp;tRNA;7356325;7356396;7;*;ggc
;comp;tRNA;7356404;7356490;9;*;ctg
;comp;tRNA;7356500;7356572;9;*;aaa
;comp;tRNA;7356582;7356656;9;*;caa
;comp;tRNA;7356666;7356741;17;*;cac
;comp;tRNA;7356759;7356835;12;*;gac
;comp;tRNA;7356848;7356923;4;*;gta
;comp;tRNA;7356928;7357003;15;*;aac
;comp;tRNA;7357019;7357103;8;*;tac
;comp;tRNA;7357112;7357187;5;*;aca
;comp;tRNA;7357193;7357264;15;*;gaa
;comp;tRNA;7357280;7357355;9;*;gcc
;comp;tRNA;7357365;7357438;54;*;atc
;comp;rRNA;7357493;7357609;113;*;5s
;comp;rRNA;7357723;7360652;269;*;23s
;comp;rRNA;7360922;7362458;399;*;16s
fin;;CDS;7362858;7363397;;0;
deb;;CDS;7618150;7618842;280;*;
;comp;tRNA;7619123;7619193;335;*;ggg
fin;;CDS;7619529;7620461;;0;
deb;comp;CDS;7666633;7668069;104;*;
;comp;tRNA;7668174;7668244;5;*;ggg
;comp;tRNA;7668250;7668326;106;*;cca
;comp;tRNA;7668433;7668506;11;*;cgt
;comp;tRNA;7668518;7668592;5;*;ggc
;comp;tRNA;7668598;7668684;13;*;ctg
;comp;tRNA;7668698;7668783;16;*;ctc
;comp;tRNA;7668800;7668872;10;*;aaa
;comp;tRNA;7668883;7668967;28;*;tac
;comp;tRNA;7668996;7669071;12;*;ttc
;comp;rRNA;7669084;7669200;161;*;5s
;comp;rRNA;7669362;7672294;268;*;23s
;comp;rRNA;7672563;7674099;533;*;16s
fin;;CDS;7674633;7675382;;;
deb;comp;CDS;7853177;7853734;84;*;
;comp;tRNA;7853819;7853892;230;*;cac
;comp;tRNA;7854123;7854196;404;*;cac
fin;comp;CDS;7854601;7854801;;;
deb;comp;CDS;8100441;8100854;123;*;
;comp;rRNA;8100978;8101094;169;*;5s
;comp;rRNA;8101264;8104177;259;*;23s
;comp;rRNA;8104437;8105973;321;*;16s
fin;comp;CDS;8106295;8106636;;;
deb;comp;CDS;8151918;8152448;460;*;
;comp;rRNA;8152909;8153031;96;*;5s
;comp;rRNA;8153128;8156057;269;*;23s
;comp;rRNA;8156327;8157863;272;*;16s
fin;comp;CDS;8158136;8158708;;;
deb;;CDS;8256928;8257746;86;*;
;comp;tRNA;8257833;8257903;5;*;gga
;comp;tRNA;8257909;8257985;16;*;cca
;comp;tRNA;8258002;8258078;4;*;cgt
;comp;tRNA;8258083;8258157;8;*;ggc
;comp;tRNA;8258166;8258248;42;*;cta
;comp;tRNA;8258291;8258366;8;*;aaa
;comp;tRNA;8258375;8258449;9;*;caa
;comp;tRNA;8258459;8258532;4;*;tgg
;comp;tRNA;8258537;8258613;5;*;atgf
;comp;tRNA;8258619;8258694;5;*;gtc
;comp;tRNA;8258700;8258774;11;*;gaa
;comp;tRNA;8258786;8258859;43;*;atc
;comp;rRNA;8258903;8259019;96;*;5s
;comp;rRNA;8259116;8262045;267;*;23s
;comp;rRNA;8262313;8263849;302;*;16s
fin;comp;CDS;8264152;8264370;;;
deb;comp;CDS;8322744;8323205;393;*;
;comp;rRNA;8323599;8323715;96;*;5s
;comp;rRNA;8323812;8326745;269;*;23s
;comp;rRNA;8327015;8328551;365;*;16s
fin;comp;CDS;8328917;8330413;;;
deb;comp;CDS;8351919;8354414;396;*;
;comp;tRNA;8354811;8354884;149;*;atgj
fin;comp;CDS;8355034;8355537;;;
deb;;CDS;8389988;8390512;296;*;
;comp;rRNA;8390809;8390925;96;*;5s
;comp;rRNA;8391022;8393951;270;*;23s
;comp;rRNA;8394222;8395758;230;*;16s
fin;comp;CDS;8395989;8396255;;;
deb;comp;CDS;8399622;8400683;208;*;
;comp;ncRNA;8400892;8401155;47;*;
fin;comp;CDS;8401203;8401592;;;
deb;comp;CDS;8616478;8616924;417;*;
;;tRNA;8617342;8617418;157;*;gac
fin;;CDS;8617576;8618541;;0;
deb;;CDS;8724363;8724614;455;*;
;comp;tRNA;8725070;8725160;165;*;tcg
fin;comp;CDS;8725326;8725559;;;
&lt;/pre&gt;

====pmq intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_entre_cds|pmq intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
;;;pmq 9.11.20;;;;;;;;;
pmq;8.2.21 Paris;;pmq 7.2.21;;;;;;;;;
pmq;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;fréquence5;intercal;&lt;u&gt;fréquencez
;'''négatif;795;11.0;'''négatif ;-11;16;-1 à -119;'''8 739 048;-1;795;610;15
;'''zéro;31;0.4;;;;;'''intercals;0;31;620;10
;'''1 à 200;4139;57.3;'''0 à 200;88;60;;'''1 202 544;5;200;630;6
;'''201 à 370;1520;21.0;'''201 à 370;266;46;;'''13.8%;10;113;640;6
;'''371 à 600;506;7.0;'''371 à 600;460;65;;;15;194;650;10
;'''601 à max;232;3.2;'''601 à 1028;861;248;;;20;157;660;8
;'''total 7223;&lt;201;68.7;'''total 7223;165;188;-119 à 1742;;25;177;670;5
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;118;680;5
6589209;1742;-1;795;-70;13;;0;31;35;130;690;6
6004770;1651;0;31;-60;3;;-1;°80;40;135;700;4
4375163;1613;1;°53;-50;6;;-2;3;45;110;710;5
3234976;1576;2;°47;-40;14;;-3;1;50;106;720;5
1433663;1551;3;36;-30;27;'''min à -1;-4;°395;55;93;730;5
1961332;1546;4;35;-20;62;795;-5;1;60;87;740;5
1948392;1534;5;29;-10;104;11.0%;-6;4;65;99;750;4
8025788;1532;6;°33;0;597;;-7;5;70;75;760;6
6672573;1521;7;°30;10;313;;-8;°76;75;106;770;5
4064508;1497;8;14;20;351;;-9;1;80;109;780;4
1735863;1428;9;14;30;295;;-10;9;85;99;790;3
4067449;1378;10;22;40;265;'''1 à 100;-11;°34;90;108;800;5
2875626;1352;11;24;50;216;2448;-12;0;95;98;810;3
896926;1351;12;°38;60;180;33.9%;-13;7;100;103;820;5
6351796;1318;13;°44;70;174;;-14;°29;105;92;830;6
2069562;1279;14;°46;80;215;;-15;0;110;84;840;1
1529184;1277;15;°42;90;207;;-16;5;115;93;850;1
1897252;1277;16;36;100;201;;-17;°19;120;85;860;7
2910237;1276;17;26;110;176;;-18;0;125;100;870;2
3749065;1276;18;°39;120;178;;-19;1;130;97;880;2
4906359;1270;19;32;130;197;;-20;°15;135;72;890;3
1921516;1263;20;24;140;155;;-21;0;140;83;900;3
880003;1252;21;°43;150;183;;-22;6;145;89;910;3
5858747;1240;22;33;160;154;;-23;°13;150;94;920;2
5950046;1211;23;26;170;169;'''1 à 200;-24;0;155;77;930;4
8085655;1206;24;°47;180;177;4139;-25;4;160;77;940;5
7588882;1203;25;28;190;174;57.3%;-26;°16;165;84;950;2
7315024;1200;26;20;200;159;;-27;0;170;85;960;2
5662979;1189;27;°26;210;151;;-28;0;175;91;970;2
8557915;1186;28;16;220;144;;-29;°8;180;86;980;0
359256;1184;29;25;230;131;;-30;0;185;87;990;2
7839445;1169;30;°31;240;141;;-31;2;190;87;1000;2
1773925;1157;31;26;250;121;'''0 à 200;-32;°9;195;80;1010;2
3687367;1141;32;22;260;107;4170;;774;200;79;1020;1
1886363;1109;33;°27;270;103;;reste;52;205;81;1030;2
7335994;1095;34;23;280;94;;total;826;210;70;1040;2
5259590;1088;35;°32;290;74;;;;215;82;1050;2
3089348;1087;36;24;300;58;;;;220;62;1060;4
3287601;1084;37;27;310;80;;'''intercal;'''&lt;u&gt;fréquence5;225;65;1070;0
933373;1077;38;25;320;60;;600;6991;230;66;1080;1
8231158;1055;39;°29;330;69;;650;47;235;68;1090;3
1233491;1054;40;°30;340;48;'''201 à 370;700;28;240;73;1100;1
1379835;1052;reste;5173;350;58;1520;750;24;245;59;1110;1
1438197;1052;total;7223;360;41;21.0%;800;23;250;62;1120;0
2970387;1045;;;370;40;;850;16;255;55;1130;0
5913926;1042;;;380;44;;900;17;260;52;1140;0
7192953;1040;;;390;39;;950;16;265;51;1150;1
247705;1038;;;400;36;;1000;8;270;52;1160;1
1687282;1027;;;410;29;;1050;9;275;42;1170;1
7301491;1024;;;420;25;;1100;9;280;52;1180;0
2362680;1013;;;430;35;;1150;2;285;35;1190;3
;;;;440;31;;1200;6;290;39;1200;1
;;;;450;19;;1250;4;295;29;;205
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;460;25;;1300;8;300;29;reste;27
4544722;-119;shift 2;16105;470;17;;1350;1;305;45;total;232
5318942;-119;shift 3;18655;480;21;;1400;3;310;35;;
1976860;-116;shift 4;1615;490;20;;1450;1;315;33;;
5337597;-115;shift 5;1973;500;26;;1500;1;320;27;;
3673911;-113;shift 6;419;510;13;;1550;4;325;30;;
5433750;-101;shift 7;5002;520;14;;1600;2;330;39;;
7350606;-101;shift 8;832;530;14;;1650;1;335;28;;
2131496;-95;shift 9;1189;540;19;'''371 à 600;;230;340;20;;
4669248;-95;;;550;20;506;;;345;34;;
2553569;-89;;;560;12;7.0%;;;350;24;;
2198194;-75;;;570;15;;;;355;28;;
1029214;-74;;;580;9;'''601 à max;;;360;13;;
7372543;-73;;;590;11;232;;;365;21;;
1297148;-65;;;600;12;3.2%;;;370;19;;
3921139;-65;;;reste;232;;reste;2;reste;738;;
6624824;-65;;;total;7223;;total;7223;total;7223;;
&lt;/pre&gt;

====pmq  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_positifs_S+|pmq intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
Maj 25.1.22;;;;;;;;;;;;;;
pmq Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
mba;min10;705;1651;2356;154;-330;-221;109;-512;-477;-223;;;
cbei;min10;950;3395;4345;402;-509;-375;134;-649;-648;-290;;;
pmq;min10;1614;4164;5778;458;-832;-651;181;-866;-825;-61;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
45;214;0.21;1255;2688;1;8;18;114;51;428;-74;;;
26;244;0.11;1212;4400;0;4;8;89;35;954;272;;;
32;218;0.15;1927;5296;3;5;22;140;68;1156;-207;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
pmq;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;31;-283;664;-7.0;878;304;max190;&amp;-29;229;-645;79;946;263;min70
31 à 400;;;;;;;2 parties;&amp;-13;112;-388;63;937;287;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;28;31;-;65;poly;813;tF;&amp;143;54;;806;poly;140;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;113;46;-;886;dte;51;Sf
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;corrélation;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;-0.207;;24.1.22 Paris;;;;
41-n;0.458;-0.832;-0.651;;;;;;;;;;;
1-n;-0.061;-0.866;-0.825;;;;;;;;;14.8.21 Paris;;
pmq;fx;fc;;pmq;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;pmq;Sx-;Sc-
0;5;26;;0;3;6;0;5;26;&gt;0;1880;-1;0;80
10;15;298;;10;9;72;1;1;52;&lt;0;42;-2;3;0
20;15;336;;20;9;81;2;1;46;zéro;5;-3;0;1
30;22;273;;30;14;66;3;1;35;total;1927;-4;11;384
40;16;249;;40;10;60;4;1;34;;c;-5;0;1
50;22;194;;50;14;47;5;1;28;&gt;0;4517;-6;3;1
60;24;156;;60;15;37;6;1;32;&lt;0;753;-7;0;5
70;32;142;;70;20;34;7;2;28;zéro;26;-8;0;76
80;47;168;;80;29;40;8;2;12;total;5296;-9;1;0
90;44;163;;90;27;39;9;4;10;;;-10;1;8
100;53;148;;100;33;36;10;1;21;total;7223;-11;2;32
110;53;123;;110;33;30;11;1;23;;;-12;0;0
120;61;117;;120;38;28;12;0;38;;;-13;0;7
130;77;120;;130;48;29;13;1;43;;;-14;2;27
140;60;95;;140;37;23;14;1;45;;;-15;0;0
150;64;119;;150;40;29;15;3;39;;;-16;0;5
160;67;87;;160;42;21;16;2;34;;;-17;2;17
170;75;94;;170;46;23;17;1;25;;;-18;0;0
180;66;111;;180;41;27;18;3;36;;;-19;0;1
190;81;93;;190;50;22;19;3;29;;;-20;1;14
200;65;94;;200;40;23;20;0;24;;;-21;0;0
210;65;86;;210;40;21;21;6;37;;;-22;1;5
220;58;86;;220;36;21;22;1;32;;;-23;0;13
230;52;79;;230;32;19;23;3;23;;;-24;0;0
240;54;87;;240;33;21;24;2;45;;;-25;1;3
250;47;74;;250;29;18;25;0;28;;;-26;3;13
260;41;66;;260;25;16;26;5;15;;;-27;0;0
270;43;60;;270;27;14;27;2;24;;;-28;0;0
280;35;59;;280;22;14;28;2;14;;;-29;0;8
290;30;44;;290;19;11;29;0;25;;;-30;0;0
300;23;35;;300;14;8;30;1;30;;;-31;0;2
310;35;45;;310;22;11;31;0;26;;;-32;1;8
320;28;32;;320;17;8;32;2;20;;;-33;0;0
330;28;41;;330;17;10;33;1;26;;;-34;1;2
340;21;27;;340;13;6;34;3;20;;;-35;1;6
350;25;33;;350;15;8;35;1;31;;;-36;2;0
360;19;22;;360;12;5;36;1;23;;;-37;0;2
370;14;26;;370;9;6;37;3;24;;;-38;0;2
380;12;32;;380;7;8;38;1;24;;;-39;0;0
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 - t30;1562;3257;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;1
;;;;;;;;;;;;-47;0;1
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;2
;;;;;;;;;;;;-50;0;1
;;;;;;;;;;;;reste;5;16
;;;;;;;;;;;;total;42;753
&lt;/pre&gt;

====pmq  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_négatifs_S-|pmq intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
pmq;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;-81;-82;-83;-84;-85;-86;-87;-88;-89;-90;-91;-92;-93;-94;-95;-96;-97;-98;-99;-100;;;à partir de 51
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&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;pmq;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;3;0;11;0;3;0;0;1;1;2;0;0;2;0;0;2;0;0;1;0;1;0;0;1;3;0;0;0;0;0;1;0;1;1;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;42
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&lt;/pre&gt;

====pmq autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_autres_intercalaires|pmq autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;&amp;tRNA;585303;17;;;;&amp;tRNA;1600990;34;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585396;40;;;;&amp;tRNA;1601101;13;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585511;24;;;;&amp;tRNA;1601190;8;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585610;8;;;;&amp;tRNA;1601273;17;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585698;19;;;;&amp;tRNA;1601363;13;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585794;1;;;;&amp;tRNA;1601462;5;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;585869;187;;;;&amp;tRNA;1601554;14;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;&amp;tRNA;1601724;5;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;&amp;tRNA;1601803;105;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;1601982;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====pmq intercalaires tRNA-cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_tRNA-cds|pmq intercalaires tRNA-cds]]
&lt;pre&gt;
pmq;intercalaires tRNA-cds;;;;;;;
comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;47;;137;;18;64;'''deb;
comp’;222;comp’;183;;47;75;&lt;201;8
;;comp’;183;;84;105;total;12
;129;comp’;261;;104;137;taux;67%
;;;283;;106;142;'''fin;
;;;187;;129;149;&lt;201;11
;18;;180;;142;150;total;15
;159;;64;;159;157;taux;73%
;;;577;;256;165;;
;;;150;;354;180;'''total;
;354;comp’;169;;394;187;&lt;201;19
;;;105;;396;283;total;27
;106;comp’;137;;'''-;315;taux;70%
comp’;192;;315;;'''-;404;;
;256;;142;;'''-;577;'''comp’;'''cumuls
;394;;;;86;72;;
comp’;228;comp’;72;;192;137;'''deb;2
;142;;75;;222;169;;8
comp’;342;;;;228;183;;
comp’;280;comp’;335;;280;183;'''fin;5
;104;;;;342;261;;7
;84;;404;;417;335;'''total;
comp’;86;;;;455;'''-;&lt;201;7
;396;;149;;;;total;15
comp’;417;;157;;;;taux;47%
comp’;455;;165;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;
&lt;201;10;16;26;;;;;
total;20;22;42;;;;;
taux;50%;73%;62%;;;;;
&lt;/pre&gt;

===lbu===
====lbu opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_opérons|lbu opérons]]
&lt;pre&gt;
49.8%GC;29.7.19 Paris;16s 8;;;;;;;;
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 ;;;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;aas;CDS dirigé
comp;18533..19237;CDS;;128;128;;;235;128
;19366..19438;act;@1;195;195;;;;
;19634..20371;CDS;;6912;;;;246;
;;;;;;;;;
;27284..29785;CDS;;276;276;;;*834;
;30062..30134;act;;134;134;;;;134
;30269..30907;CDS;;11768;;;;213;
;;;;;;;;;
;42676..43248;cds hp;;451;*451;;;*191;
;43700..45271;16s;;209;;;;;
;45481..48391;23s;;69;;;;;
;48461..48577;5s;;275;275;;;;275
;48853..49091;cds hp;;56679;;;;80;
;;;;;;;;;
comp;105771..106547;CDS;;56;56;;;259;56
comp;106604..106679;aag;;125;125;;;;
;106805..107533;CDS;;103754;;;;243;
;;;;;;;;;
;211288..212553;CDS;;94;94;;;422;
;212648..212720;acc;;23;23;;;;23
comp&lt;;212744..213262;CDS;;64997;;;;173;
;;;;;;;;;
;278260..278928;CDS;;69;69;;;223;69
comp;278998..279068;ggg;;181;181;;;;
;279250..280275;CDS;;44047;;;;342;
;;;;;;;;;
comp;324323..324949;CDS;;117;117;;;209;117
;325067..325138;ggc;+;4;;4;;;
;325143..325216;ccg;2 ggc;108;;;;;
;325325..325399;ggc;;155;155;;;;
;325555..326016;CDS;;37886;;;;154;
;;;;;;;;;
;363903..364394;CDS;;98;98;;;164;98
;364493..364564;caa;;614;*614;;;;
;365179..366360;CDS;;-14;;;;*394;
;;;;;;;;;
;366347..367402;CDS;;75;75;;;352;
;367478..367559;tac;;5;;5;;;
;367565..367636;caa;;62;62;;;;62
&lt;;367699..368318;CDS;;14127;;;;207;
;;;;;;;;;
;382446..382907;CDS;;30;30;;;154;30
;382938..383026;ctt;;118;118;;;;
;383145..383768;CDS;;70441;;;;208;
;;;;;;;;;
;454210..455529;CDS;;61;61;;;440;61
;455591..455665;agg;;341;341;;;;
;456007..457035;CDS;;75557;;;;343;
;;;;;;;;;
;532593..533285;CDS;;82;82;;;231;82
comp;533368..533442;cgg;;296;296;;;;
;533739..534782;CDS;;48963;;;;348;
;;;;;;;;;
;583746..584728;CDS;;57;57;;;328;57
comp;584786..584858;cag;;5;;5;;;
comp;584864..584935;gag;;170;170;;;;
;585106..586110;CDS;;94988;;;;335;
;;;;;;;;;
;681099..682741;CDS;;518;*518;;;*548;
;683260..684831;16s;;106;;;;;
;684938..685011;atc;;69;;;69;;
;685081..685153;gca;;127;;;;;
;685281..688191;23s;;68;;;;;
;688260..688376;5s;;208;208;;;;208
comp;688585..689801;CDS;;55794;;;;406;
;;;;;;;;;
comp;745596..745821;CDS;;134;134;;;75;134
comp;745956..746044;tcg;;787;*787;;;;
;746832..749597;CDS;;36741;;;;*922;
;;;;;;;;;
;786339..787004;CDS;;54;54;;;222;54
;787059..787142;ctg;;109;109;;;;
comp;787252..787872;CDS;;2072;;;;207;
;;;;;;;;;
comp;789945..791867;CDS;;613;*613;;;*641;
;792481..794052;16s;;105;;;;;
;794158..794231;atc;;69;;;69;;
;794301..794373;gca;;126;;;;;
;794500..797410;23s;;69;;;;;
;797480..797596;5s;;87;87;;;;87
;797684..798559;CDS;;36;;;;292;
;;;;;;;;;
comp;798596..800178;CDS;;530;*530;;;*528;
;800709..800781;aac;@2;3;;3;;;
;800785..800858;cca;;24;;24;;;
;800883..800954;ggc;;30;;30;;;
;800985..801058;cgt;;2;;2;;;
;801061..801133;gta;;3;;3;;;
;801137..801208;gaa;;42;;42;;;
;801251..801338;tca;;9;;9;;;
;801348..801421;atgf;;3;;3;;;
;801425..801498;gac;;6;;6;;;
;801505..801577;ttc;;8;;8;;;
;801586..801667;tac;;4;;4;;;
;801672..801742;tgg;;13;;13;;;
;801756..801831;cac;;26;;26;;;
;801858..801928;tgc;;28;;28;;;
;801957..802041;ttg;;356;356;;;;356
;802398..802961;CDS;;284259;;;;188;
;;;;;;;;;
comp;1087221..1088531;CDS;;157;157;;;437;157
comp;1088689..1088760;caa;;656;*656;;;;
comp;1089417..1090313;CDS;;173317;;;;*299;
;;;;;;;;;
comp;1263631..1265769;CDS;;188;188;;;*713;188
comp;1265958..1266031;aga;;222;222;;;;
;1266254..1268632;CDS;;84103;;;;*793;
;;;;;;;;;
comp;1352736..1354022;CDS;;98;98;;;429;98
;1354121..1354204;ctg;;204;204;;;;
comp;1354409..1354928;CDS;;13182;;;;173;
;;;;;;;;;
comp;1368111..1369307;CDS;;161;161;;;399;161
comp;1369469..1369541;gta;;3;;;3;;
comp;1369545..1369616;gaa;;138;;;*138;;
comp;1369755..1369828;atgj;;6;;;6;;
comp;1369835..1369925;tcc;;8;;;8;;
comp;1369934..1370006;aac;;7;;;;;
comp;1370014..1370130;5s;;69;;;;;
comp;1370200..1373111;23s;;126;;;;;
comp;1373238..1373310;gca;;69;;;69;;
comp;1373380..1373453;atc;;105;;;;;
comp;1373559..1375130;16s;;547;*547;;;;
;1375678..1376604;CDS;;102845;;;;*309;
;;;;;;;;;
comp;1479450..1479824;CDS;;200;200;;;125;
comp;1480025..1480101;gac;;26;;;26;;
comp;1480128..1480199;gaa;;3;;;3;;
comp;1480203..1480275;gta;;2;;;2;;
comp;1480278..1480351;cgt;;35;;;35;;
comp;1480387..1480458;ggc;;36;;;;;
comp;1480495..1480611;5s;;68;;;;;
comp;1480680..1483590;23s;;208;;;;;
comp;1483799..1485370;16s;;153;153;;;;153
comp;1485524..1485716;CDS;;20944;;;;64;
;;;;;;;;;
comp;1506661..1507464;CDS;;270;270;;;268;
comp;1507735..1507807;aag;+;34;;34;;;
comp;1507842..1507914;aag;5 aag;33;;33;;;
comp;1507948..1508020;aag;;33;;33;;;
comp;1508054..1508126;aag;@3;33;;33;;;
comp;1508160..1508232;aag;;130;130;;;;130
comp;1508363..1509226;CDS;;167;;;;288;
;;;;;;;;;
;1509394..1510872;CDS;;106;106;;;493;106
comp;1510979..1511051;gta;;3;;3;;;
comp;1511055..1511126;gaa;;151;;*151;;;
;1511278..1511366;ctt;;113;113;;;;
;1511480..1512010;CDS;;21195;;;;177;
;;;;;;;;;
comp;1533206..1534129;CDS;;355;355;;;308;
comp;1534485..1534557;acg;;154;154;;;;154
comp;1534712..1535950;CDS;;18502;;;;413;
;;;;;;;;;
;1554453..1554638;CDS;;303;303;;;62;303
comp;1554942..1555029;agc;;673;*673;;;;
comp;1555703..1556203;CDS;;595;;;;*167;
;;;;;;;;;
;1556799..1558178;CDS;;277;277;;;460;
comp;1558456..1558572;5s;;68;;;;;
comp;1558641..1561551;23s;;126;;;;;
comp;1561678..1561750;gca;;69;;;69;;
comp;1561820..1561893;atc;;105;;;;;
comp;1561999..1563570;16s;;189;189;;;;189
;1563760..1563948;CDS;;19274;;;;63;
;;;;;;;;;
comp;1583223..1584392;CDS;;151;151;;;390;151
comp;1584544..1584628;ttg;+;17;;17;;;
comp;1584646..1584730;ttg;2 ttg;28;;28;;;
comp;1584759..1584829;tgc;2 ttc;26;;26;;;
comp;1584856..1584931;cac;2 atgf;13;;13;;;
comp;1584945..1585015;tgg;;4;;4;;;
comp;1585020..1585101;tac;;8;;8;;;
comp;1585110..1585182;ttc;;6;;6;;;
comp;1585189..1585262;gac;;3;;3;;;
comp;1585266..1585339;atgf;;9;;9;;;
comp;1585349..1585436;tca;;42;;42;;;
comp;1585479..1585550;gaa;;258;;*258;;;
comp;1585809..1585899;agc;;2;;2;;;
comp;1585902..1585975;atc;;3;;3;;;
comp;1585979..1586049;gga;;14;;14;;;
comp;1586064..1586136;ttc;;17;;17;;;
comp;1586154..1586227;atgf;;11;;11;;;
comp;1586239..1586312;atgi;;12;;12;;;
comp;1586325..1586398;atg;;36;;36;;;
comp;1586435..1586508;cca;;6;;6;;;
comp;1586515..1586588;cgt;;5;;5;;;
comp;1586594..1586679;tta;;15;;15;;;
comp;1586695..1586766;ggc;;4;;4;;;
comp;1586771..1586843;aca;;11;;11;;;
comp;1586855..1586936;cta;;12;;12;;;
comp;1586949..1587021;aaa;;2;;2;;;
comp;1587024..1587096;gta;;157;157;;;;
comp;1587254..1588681;CDS;;539;;;;476;
;;;;;;;;;
comp;1589221..1590557;CDS;;156;156;;;446;156
comp;1590714..1590830;5s;;68;;;;;
comp;1590899..1593809;23s;;126;;;;;
comp;1593936..1594008;gca;;69;;;69;;
comp;1594078..1594151;atc;;105;;;;;
comp;1594257..1595828;16s;;581;*581;;;;
comp;1596410..1597276;CDS;;189853;;;;*289;
;;;;;;;;;
comp;1787130..1788440;CDS;;298;298;;;437;298
comp;1788739..1788855;5s;;68;;;;;
comp;1788924..1791834;23s;@4;208;;;;;
comp;1792043..1793614;16s;;436;*436;;;;
comp;1794051..1794596;CDS;;-8;;;;*182;
comp;1794589..1795436;CDS;;138;138;;;283;138
comp;1795575..1795648;gac;;3;;;3;;
comp;1795652..1795724;gta;;2;;;2;;
comp;1795727..1795800;cgt;;35;;;35;;
comp;1795836..1795907;ggc;;19;;;19;;
comp;1795927..1796000;cca;;3;;;3;;
comp;1796004..1796076;aac;;7;;;;;
comp;1796084..1796200;5s;;68;;;;;
comp;1796269..1799179;23s;;208;;;;;
comp;1799388..1800959;16s;;501;*501;;;;
comp;1801461..1802087;CDS;;;;;;*209;
&lt;/pre&gt;

====lbu cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_cumuls|lbu cumuls]]
&lt;pre&gt;
lbu cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;9;1;0;0;1;0;1;0;100;5
;16 23 5s 0;2;20;33;9;50;2;20;0;200;11
;16 atc gca;5;40;11;3;100;12;40;2;300;19
;16 23 5s a;2;60;2;0;150;11;60;3;400;11
;max a;7;80;0;5;200;14;80;3;500;11
;a doubles;0;100;0;0;250;3;100;4;600;2
;autres;0;120;0;0;300;6;120;2;700;1
;total aas;26;140;0;1;350;2;140;5;800;2
sans ;opérons;23;160;1;0;400;2;160;5;900;1
;1 aa;16;180;0;0;450;1;180;1;1000;1
;max a;26;200;0;0;500;1;200;2;1100;0
;a doubles;3;;1;0;;10;;5;;0
;total aas;72;;48;18;;64;;32;;64
total aas;;98;;;;;;;;;
remarques;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;;;138;;320
;;;variance;;;;;;81;;182
sans jaune;;;moyenne;14;29;;159;;114;;275
;;;variance;12;29;;85;;50;;122
&lt;/pre&gt;
====lbu blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_blocs|lbu blocs]]
&lt;pre&gt;
lbu blocs;;;;;;;
cds;'''277’;;cds;156;;cds;298
$5s;68;;$5s;68;;$5s;68
$23s;126;;$23s;126;;$23s;208
gca;69;;gca;69;;$16s;436
atc;105;;atc;105;;cds;-8
$16s;'''189’;;$16s;581;;cds;138
cds;;;cds;;;gac;3
;;;;;;4aas;*
cds;518;;cds;'''613’;;aac;7
$16s;106;;$16s;105;;$5s;68
atc;69;;atc;69;;$23s;208
gca;127;;gca;126;;$16s;501
$23s;68;;$23s;69;;cds;
$5s;'''208’;;$5s;87;;;
cds;;;cds;;;;
;;;;;;;
cds;161;;cds hp;451;;cds;200
gta;3;;$16s;209;;gac;26
3aas;*;;$23s;69;;3aas;*
aac;7;;$5s;275;;ggc;36
$5s;69;;cds hp;;;$5s;68
$23s;126;;;;;$23s;208
gca;69;;;;;$16s;153
atc;105;;;;;cds;
$16s;'''547’;;;;;;
cds;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====lbu distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_distribution|lbu distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;2;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ttg2;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;;agc;1;aag5;atc;1;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;2
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;2;cga;;;cta;1;cca;2;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;3;gca;;gaa;3;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;3;gca;;gaa;2;gga;
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;5;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
lbu;;16;;;;;16;;lbu;49;;;;;;49;;lbu;7;;;;;;7;;lbu;;;;16;;;16
&lt;/pre&gt;
====lbu données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_données_intercalaires|lbu données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;lbu;fx;fc;lbu;fx40;fc40;lbu;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;2;10;0;2;10;-1;1;80;cont;x;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;
;0;10;1;142;1;0;24;-2;1;0;195;128;114;;atc;4;;ggc
1;0;20;2;128;2;0;36;-3;;1;95;125;4* 113;;atc;108;;ccg
;1;30;9;78;3;0;15;-4;4;55;134;11;tRNA 23s;;;**;;ggc
;0;40;17;35;4;0;10;-5;;0;59;69;128;;gca;5;;tac
;0;50;22;43;5;0;11;-6;;0;94;181;4* 127;;gca;**;;caa
1;2;60;27;43;6;0;5;-7;;3;158;117;5s tRNA;;;5;;cag
1;1;70;31;40;7;0;3;-8;1;38;98;85;2* 7;;aac;**;;gag
;1;80;26;34;8;0;4;-9;;0;119;296;36;;ggc;3;;aac
1;0;90;19;33;9;1;17;-10;;1;75;57;tRNA tRNA;;intra;24;;cca
1;3;100;21;39;10;0;17;-11;;24;137;170;5* 69;;atc gca;30;;ggc
2;1;110;15;43;11;0;15;-12;;0;30;787;tRNA tRNA;;contigu;2;;cgt
1;2;120;8;37;12;1;16;-13;;1;121;109;3;;gta;3;;gta
2;3;130;14;25;13;0;12;-14;1;17;61;530;138;;gaa;42;;gaa
;2;140;20;32;14;0;15;-15;2;0;341;222;6;;atgj;9;;tca
;0;150;10;25;15;0;16;-16;;0;204;98;8;;tcc;3;;atgf
;5;160;6;34;16;0;12;-17;;7;54;204;**;;aac;6;;gac
1;0;170;8;29;17;0;10;-18;;1;356;106;26;;gac;8;;ttc
;0;180;15;21;18;1;11;-19;;1;157;303;3;;gaa;4;;tac
1;1;190;8;16;19;0;12;-20;;5;126;;2;;gta;13;;tgg
;1;200;11;14;20;0;9;-21;;0;188;;35;;cgt;29;;cac
1;2;210;7;16;21;0;11;-22;;3;203;;**;;ggc;28;;tgc
;0;220;8;14;22;1;17;-23;;3;270;;3;;gac;**;;ttg
1;0;230;7;11;23;1;7;-24;;0;130;;2;;gta;34;;aag
;0;240;5;13;24;1;5;-25;;2;113;;35;;cgt;33;;aag
;0;250;10;9;25;1;7;-26;;4;355;;19;;ggc;33;;aag
;0;260;7;7;26;1;8;-27;;0;154;;3;;cca;33;;aag
;1;270;5;8;27;1;6;-28;;2;673;;**;;aac;**;;aag
;0;280;7;7;28;1;5;-29;2;3;151;;;;;3;;gta
;0;290;2;12;29;2;5;-30;;0;157;;;;;-;151;gaa
1;0;300;1;5;30;0;7;-31;;2;102;;;;;**;;ctt
1;0;310;4;8;31;1;4;-32;;4;CDS 16s;;;;;17;;ttg
;0;320;7;2;32;0;4;-33;;0;451;613;;;;28;;ttg
;0;330;6;8;33;1;6;-34;;0;518;547;;;;29;;tgc
;0;340;5;2;34;1;2;-35;;3;510;295;;;;13;;cac
;1;350;0;4;35;0;3;-36;;0;258;;;;;4;;tgg
;2;360;1;2;36;1;4;-37;;0;298;;;;;8;;tac
;0;370;1;5;37;1;2;-38;;0;501;;;;;6;;ttc
;0;380;0;3;38;1;2;-39;1;0;23s 5s;;;;;3;;gac
;0;390;1;7;39;5;6;-40;;1;3* 71;;;;;9;;atgf
;0;400;3;3;40;6;2;-41;;0;6* 701;;;;;42;;tca
2;1;reste;32;51;reste;380;705;-42;;0;16s 23s;;;;;261;;gaa
18;30;total;411;1098;total;411;1098;-43;;0;218;;;;;2;;agc
16;29;diagr;377;1037;diagr;29;383;-44;1;0;3* 217;;;;;3;;atc
1;1; t30;12;348;;;;-45;;0;5s CDS;;;;;14;;gga
;;;;;;;;-46;;2;308;208;;;;17;;ttc
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;1;87;277;;;;11;;atgf
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;156;;;;;12;;atgi
;x;409;20;2;431;;;-49;;1;298;;;;;36;;atgj
;c;1088;280;10;1378;;;-50;;15;;;;;;6;;cca
;;;;;1809;198;;reste;6;0;;;;;;5;;cgt
;;;;;;2007;;total;20;280;;;;;;15;;tta
;;;;;;;;;;;;;;;;4;;ggc
;;;;;;;;;;;;;;;;11;;aca
;;;;;;;;;;;;;;;;12;;cta
;;;;;;;;;;;;;;;;2;;aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;gta
&lt;/pre&gt;
=====lbu autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_autres_intercalaires_aas|lbu autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires ;;lbu;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;18533;19237;128;*;
;;tRNA;19366;19438;195;*;act
fin;;CDS;19634;20371;;;
deb;;CDS;29805;29966;95;*;
;;tRNA;30062;30134;134;*;act
fin;;CDS;30269;30907;;;
deb;;CDS;42676;43248;451;*;
;;rRNA;43700;45263;218;*;1564
;;rRNA;45482;48389;71;*;2908
;;rRNA;48461;48577;308;*;117
fin;;CDS;48886;49215;;;
deb;;CDS;64875;65066;71;*;
;;misc_b;65138;65377;147;*;
fin;;CDS;65525;65743;;;
deb;comp;CDS;105771;106547;59;*;
;comp;tRNA;106607;106679;125;*;aag
fin;;CDS;106805;107533;;;
deb;comp;CDS;118390;119745;29;*;
;comp;regulatory;119775;119862;185;*;
fin;;CDS;120048;121523;;;
deb;comp;CDS;134737;136320;120;*;
;comp;regulatory;136441;136616;92;*;
fin;comp;CDS;136709;137335;;0;
deb;;CDS;211288;212553;94;*;
;;tRNA;212648;212720;11;*;acc
fin;comp;CDS;212732;213079;;;
deb;;CDS;215354;216541;50;*;
;;misc_b;216592;216828;95;*;
fin;;CDS;216924;217778;;;
deb;comp;CDS;242936;243505;67;*;
;comp;regulatory;243573;243670;189;*;
fin;;CDS;243860;245017;;;
deb;;CDS;278260;278928;69;*;
;comp;tRNA;278998;279068;181;*;ggg
fin;;CDS;279250;280275;;;
deb;;CDS;280740;281354;106;*;
;;regulatory;281461;281624;89;*;
fin;;CDS;281714;284404;;;
deb;comp;CDS;324323;324949;117;*;
;;tRNA;325067;325138;4;*;ggc
;;tRNA;325143;325216;108;*;ccg
;;tRNA;325325;325396;158;*;ggc
fin;;CDS;325555;326016;;;
deb;;CDS;363903;364394;98;*;
;;tRNA;364493;364564;119;*;caa
fin;;CDS;364684;364854;;;
deb;;CDS;366347;367402;75;*;
;;tRNA;367478;367559;5;*;tac
;;tRNA;367565;367636;137;*;caa
fin;;CDS;367774;368166;;;
deb;;CDS;382446;382907;30;*;
;;tRNA;382938;383023;121;*;ctt
fin;;CDS;383145;383768;;;
deb;;CDS;425577;426662;66;*;
;;regulatory;426729;426825;44;*;
fin;;CDS;426870;427439;;0;
deb;;CDS;454210;455529;61;*;
;;tRNA;455591;455665;341;*;agg
fin;;CDS;456007;457035;;;
deb;;CDS;532593;533285;85;*;
;comp;tRNA;533371;533442;296;*;cgg
fin;;CDS;533739;534782;;;
deb;;CDS;574078;575265;66;*;
;;tmRNA;575332;575693;294;*;
fin;;CDS;575988;576143;;;
deb;;CDS;583246;584728;57;*;
;comp;tRNA;584786;584858;5;*;cag
;comp;tRNA;584864;584935;170;*;gag
fin;;CDS;585106;586110;;;
deb;;CDS;673933;676341;66;*;
;;misc_b;676408;676655;83;*;
fin;;CDS;676739;677599;;;
deb;;CDS;681099;682741;518;*;
;;rRNA;683260;684823;114;*;1564
;;tRNA;684938;685011;69;*;atc
;;tRNA;685081;685153;128;*;gca
;;rRNA;685282;688189;70;*;2908
;;rRNA;688260;688376;208;*;117
fin;comp;CDS;688585;689738;;;
deb;;CDS;727702;728421;27;*;
;;regulatory;728449;728564;80;*;
fin;;CDS;728645;729349;;;
deb;comp;CDS;745596;745751;204;*;
;comp;tRNA;745956;746044;787;*;tcg
fin;;CDS;746832;749597;;;
deb;;CDS;755313;756185;29;*;
;;repeat_region;756215;757463;258;*;
fin;;CDS;757722;758336;;;
deb;;CDS;786339;787004;54;*;
;;tRNA;787059;787142;109;*;ctg
fin;comp;CDS;787252;787872;;0;
deb;comp;CDS;789978;791867;613;*;
;;rRNA;792481;794044;113;*;1564
;;tRNA;794158;794231;69;*;atc
;;tRNA;794301;794373;127;*;gca
;;rRNA;794501;797408;71;*;2908
;;rRNA;797480;797596;87;*;117
fin;;CDS;797684;798559;;0;
deb;comp;CDS;798596;800178;530;*;
;;tRNA;800709;800781;3;*;aac
;;tRNA;800785;800858;24;*;cca
;;tRNA;800883;800954;30;*;ggc
;;tRNA;800985;801058;2;*;cgt
;;tRNA;801061;801133;3;*;gta
;;tRNA;801137;801208;42;*;gaa
;;tRNA;801251;801338;9;*;tca
;;tRNA;801348;801421;3;*;atgf
;;tRNA;801425;801498;6;*;gac
;;tRNA;801505;801577;8;*;ttc
;;tRNA;801586;801667;4;*;tac
;;tRNA;801672;801742;13;*;tgg
;;tRNA;801756;801828;29;*;cac
;;tRNA;801858;801928;28;*;tgc
;;tRNA;801957;802041;356;*;ttg
fin;;CDS;802398;804017;;;
deb;;CDS;862229;862693;29;*;
;;ncRNA;862723;863083;125;*;
fin;;CDS;863209;864333;;;
deb;comp;CDS;905582;905794;173;*;
;comp;misc_b;905968;906185;390;*;
fin;;CDS;906576;907085;;0;
deb;comp;CDS;952333;952842;390;*;
;;misc_b;953233;953450;173;*;
fin;;CDS;953624;953836;;;
deb;comp;CDS;1087221;1088531;157;*;
;comp;tRNA;1088689;1088760;126;*;caa
fin;comp;CDS;1088887;1089033;;;
deb;comp;CDS;1242851;1243162;16;*;
;comp;misc_f;1243179;1243255;147;*;
fin;;CDS;1243403;1243759;;0;
deb;comp;CDS;1263631;1265769;188;*;
;comp;tRNA;1265958;1266031;222;*;aga
fin;;CDS;1266254;1268632;;;
deb;comp;CDS;1297694;1298743;37;*;
;comp;misc_b;1298781;1298982;42;*;
fin;comp;CDS;1299025;1299375;;;
deb;comp;CDS;1309324;1309845;47;*;
;comp;misc_f;1309893;1310004;394;*;
fin;;CDS;1310399;1311799;;0;
deb;comp;CDS;1352736;1354022;98;*;
;;tRNA;1354121;1354204;204;*;ctg
fin;comp;CDS;1354409;1355976;;;
deb;comp;CDS;1368111;1369307;-3;*;
;comp;regulatory;1369305;1369392;76;*;
;comp;tRNA;1369469;1369541;3;*;gta
;comp;tRNA;1369545;1369616;138;*;gaa
;comp;tRNA;1369755;1369828;6;*;atgj
;comp;tRNA;1369835;1369925;8;*;tcc
;comp;tRNA;1369934;1370006;7;*;aac
;comp;rRNA;1370014;1370130;71;*;117
;comp;rRNA;1370202;1373110;127;*;2909
;comp;tRNA;1373238;1373310;69;*;gca
;comp;tRNA;1373380;1373453;113;*;atc
;comp;rRNA;1373567;1375130;547;*;1564
fin;;CDS;1375678;1376604;;;
deb;comp;CDS;1418883;1420661;53;*;
;comp;ncRNA;1420715;1420811;9;*;
fin;comp;CDS;1420821;1421330;;;
deb;comp;CDS;1434541;1435050;33;*;
;comp;misc_f;1435084;1435213;440;*;
fin;;CDS;1435654;1436972;;;
deb;comp;CDS;1479450;1479824;203;*;
;comp;tRNA;1480028;1480101;26;*;gac
;comp;tRNA;1480128;1480199;3;*;gaa
;comp;tRNA;1480203;1480275;2;*;gta
;comp;tRNA;1480278;1480351;35;*;cgt
;comp;tRNA;1480387;1480458;36;*;ggc
;comp;rRNA;1480495;1480611;70;*;117
;comp;rRNA;1480682;1483589;217;*;2908
;comp;rRNA;1483807;1485370;510;*;1564
fin;comp;CDS;1485881;1487044;;;
deb;comp;CDS;1506661;1507464;270;*;
;comp;tRNA;1507735;1507807;34;*;aag
;comp;tRNA;1507842;1507914;33;*;aag
;comp;tRNA;1507948;1508020;33;*;aag
;comp;tRNA;1508054;1508126;33;*;aag
;comp;tRNA;1508160;1508232;130;*;aag
fin;comp;CDS;1508363;1509226;;0;
deb;;CDS;1509394;1510872;106;*;
;comp;tRNA;1510979;1511051;3;*;gta
;comp;tRNA;1511055;1511126;151;*;gaa
;;tRNA;1511278;1511366;113;*;ctt
fin;;CDS;1511480;1512010;;0;
deb;comp;CDS;1533206;1534129;355;*;
;comp;tRNA;1534485;1534557;154;*;acg
fin;comp;CDS;1534712;1535950;;0;
deb;;CDS;1554441;1554638;303;*;
;comp;tRNA;1554942;1555029;673;*;agc
fin;comp;CDS;1555703;1556164;;0;
deb;;CDS;1556799;1558178;277;*;
;comp;rRNA;1558456;1558572;70;*;117
;comp;rRNA;1558643;1561550;127;*;2908
;comp;tRNA;1561678;1561750;69;*;gca
;comp;tRNA;1561820;1561893;113;*;act
;comp;rRNA;1562007;1563570;258;*;1564
fin;comp;CDS;1563829;1564131;;0;
deb;comp;CDS;1583223;1584392;151;*;
;comp;tRNA;1584544;1584628;17;*;ttg
;comp;tRNA;1584646;1584730;28;*;ttg
;comp;tRNA;1584759;1584829;29;*;tgc
;comp;tRNA;1584859;1584931;13;*;cac
;comp;tRNA;1584945;1585015;4;*;tgg
;comp;tRNA;1585020;1585101;8;*;tac
;comp;tRNA;1585110;1585182;6;*;ttc
;comp;tRNA;1585189;1585262;3;*;gac
;comp;tRNA;1585266;1585339;9;*;atgf
;comp;tRNA;1585349;1585436;42;*;tca
;comp;tRNA;1585479;1585550;261;*;gaa
;comp;tRNA;1585812;1585899;2;*;agc
;comp;tRNA;1585902;1585975;3;*;atc
;comp;tRNA;1585979;1586049;14;*;gga
;comp;tRNA;1586064;1586136;17;*;ttc
;comp;tRNA;1586154;1586227;11;*;atgf
;comp;tRNA;1586239;1586312;12;*;atgi
;comp;tRNA;1586325;1586398;36;*;atgj
;comp;tRNA;1586435;1586508;6;*;cca
;comp;tRNA;1586515;1586588;5;*;cgt
;comp;tRNA;1586594;1586679;15;*;tta
;comp;tRNA;1586695;1586766;4;*;ggc
;comp;tRNA;1586771;1586843;11;*;aca
;comp;tRNA;1586855;1586936;12;*;cta
;comp;tRNA;1586949;1587021;2;*;aaa
;comp;tRNA;1587024;1587096;157;*;gta
fin;comp;CDS;1587254;1588681;;;
deb;comp;CDS;1589221;1590557;156;*;
;comp;rRNA;1590714;1590830;70;*;117
;comp;rRNA;1590901;1593808;127;*;2908
;comp;tRNA;1593936;1594008;69;*;gca
;comp;tRNA;1594078;1594151;113;*;act
;comp;rRNA;1594265;1595828;295;*;1564
fin;;CDS;1596124;1596324;;0;
deb;comp;CDS;1787130;1788440;298;*;
;comp;rRNA;1788739;1788855;70;*;117
;comp;rRNA;1788926;1791833;217;*;2908
;comp;rRNA;1792051;1793614;507;*;1564
fin;comp;CDS;1794122;1794325;;;
deb;comp;CDS;1795068;1795472;102;*;
;comp;tRNA;1795575;1795648;3;*;gac
;comp;tRNA;1795652;1795724;2;*;gta
;comp;tRNA;1795727;1795800;35;*;cgt
;comp;tRNA;1795836;1795907;19;*;ggc
;comp;tRNA;1795927;1796000;3;*;cca
;comp;tRNA;1796004;1796076;7;*;aac
;comp;rRNA;1796084;1796200;70;*;117
;comp;rRNA;1796271;1799178;217;*;2908
;comp;rRNA;1799396;1800959;501;*;1564
fin;comp;CDS;1801461;1802087;;;
deb;;CDS;1813522;1815336;60;*;
;;misc_f;1815397;1815445;52;*;
fin;;CDS;1815498;1816658;;0;
&lt;/pre&gt;

===ban*===
====ban opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_opérons|ban opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Baci_anth_2002013094/baciAnth_2002013094-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP009902;ban*;;genome;;;;;;aas;cds dirigé
35.1%GC;15.8.19 Paris;16s 11;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Bacillus anthracis strain 2002013094;;;;;;;;;;
;618142..618366;;CDS;;188;188;;;75;188
;618555..618627;;gtc;;419;*419;;;;
comp;619047..619235;;CDS;;;;;;63;
;;;;;;;;;;
comp;1102183..1102602;;CDS;;130;130;;;140;130
comp;1102733..1102804;;gaa;+;1;;;1;;
comp;1102806..1102880;;aac;2 aca;8;;;8;;
comp;1102889..1102965;;atc;2 tca;11;;;11;;
comp;1102977..1103047;;tgg;;6;;;6;;
comp;1103054..1103126;;aca;;9;;;9;;
comp;1103136..1103211;;ttc;;9;;;9;;
comp;1103221..1103296;;gac;;4;;;4;;
comp;1103301..1103377;;atgf;;20;;;20;;
comp;1103398..1103490;;tca;;54;;;54;;
comp;1103545..1103637;;tca;;20;;;20;;
comp;1103658..1103730;;gca;;16;;;16;;
comp;1103747..1103820;;cca;;10;;;10;;
comp;1103831..1103904;;cgt;;3;;;3;;
comp;1103908..1103996;;tta;;16;;;16;;
comp;1104013..1104087;;ggc;;29;;;29;;
comp;1104117..1104197;;cta;;22;;;22;;
comp;1104220..1104295;;cac;;9;;;9;;
comp;1104305..1104380;;aca;;4;;;4;;
comp;1104385..1104460;;gta;;4;;;;;
comp;1104465..1104580;;5s;;97;;;;;
comp;1104678..1107604;;23s;;141;;;;;
comp;1107746..1109299;;16s;;694;*694;;;;
;1109994..1113038;;CDS;;;;;;*1015;
;;;;;;;;;;
comp;1306706..1307848;;CDS;;198;198;;;381;
comp;1308047..1308120;;gga;;115;115;;;;115
comp;1308236..1308889;;CDS;;;;;;218;
;;;;;;;;;;
;1312025..1312345;;CDS;;207;207;;;107;207
comp;1312553..1312637;;ttg;;10;;;10;;
comp;1312648..1312718;;tgc;;14;;;14;;
comp;1312733..1312807;;ggc;;5;;;5;;
comp;1312813..1312887;;caa;;63;;;63;;
comp;1312951..1313026;;cac;;19;;;19;;
comp;1313046..1313119;;tgg;;7;;;7;;
comp;1313127..1313210;;tac;;17;;;17;;
comp;1313228..1313303;;gta;;5;;;5;;
comp;1313309..1313383;;gaa;;24;;;24;;
comp;1313408..1313480;;acc;;4;;;4;;
comp;1313485..1313559;;aac;;9;;;;;
comp;1313569..1313684;;5s;;96;;;;;
comp;1313781..1316709;;23s;;141;;;;;
comp;1316851..1318405;;16s;;386;*386;;;;
;1318792..1319148;;CDS;;;;;;119;
;;;;;;;;;;
;1556278..1556507;;CDS;;57;57;;;77;57
comp;1556565..1556680;;5s;;49;;;;;
comp;1556730..1560126;;23s;;173;;;;;
comp;1560300..1562132;;16s;;476;*476;;;;
;1562609..1563322;;CDS;;;;;;238;
;;;;;;;;;;
&gt;;1566949..1567219;;CDS;;99;99;;;90;99
comp;1567319..1567434;;5s;;46;;;;;
comp;1567481..1570409;;23s;;142;;;;;
comp;1570552..1572115;;16s;;451;*451;;;;
;1572567..1574498;;CDS;;;;;;*644;
;;;;;;;;;;
;1579539..1580615;;CDS;;14;14;;;359;14
comp;1580630..1580745;;5s;;45;;;;;
comp;1580791..1583912;;23s;;153;;;;;
comp;1584066..1585720;;16s;;294;294;;;;
comp;1586015..1587520;;CDS;;;;;;*502;
;;;;;;;;;;
comp;1600693..1601166;;CDS;;174;174;;;158;
comp;1601341..1601416;;gac;;3;;;3;;
comp;1601420..1601496;;atgf;;12;;;;;
comp;1601509..1601624;;5s;@1;46;;;;;
comp;1601671..1604598;;23s;;141;;;;;
comp;1604740..1606294;;16s;;75;;;;;
comp;1606370..1606440;;gga;;1;;1;;;
comp;1606442..1606518;;cca;+;4;;4;;;
comp;1606523..1606599;;cgt;Séquence 10;3;;3;;;
comp;1606603..1606691;;tta;;16;;16;;;
comp;1606708..1606782;;ggc;;29;;29;;;
comp;1606812..1606892;;cta;;14;;14;;;
comp;1606907..1606982;;aaa;;5;;5;;;
comp;1606988..1607062;;caa;;87;;*87;;;
comp;1607150..1607225;;gac;;46;;46;;;
comp;1607272..1607347;;gta;;4;;4;;;
comp;1607352..1607426;;gaa;;1;;1;;;
comp;1607428..1607502;;aac;2 aac;8;;8;;;
comp;1607511..1607587;;atc;;11;;11;;;
comp;1607599..1607669;;tgg;;6;;6;;;
comp;1607676..1607748;;aca;;9;;9;;;
comp;1607758..1607833;;ttc;;8;;8;;;
comp;1607842..1607917;;gac;;4;;4;;;
comp;1607922..1607998;;atgf;;20;;20;;;
comp;1608019..1608111;;tca;2 tca;54;;54;;;
comp;1608166..1608258;;tca;;20;;20;;;
comp;1608279..1608351;;gca;;16;;16;;;
comp;1608368..1608441;;cca;;10;;10;;;
comp;1608452..1608525;;cgt;;3;;3;;;
comp;1608529..1608617;;tta;;16;;16;;;
comp;1608634..1608708;;ggc;;29;;29;;;
comp;1608738..1608818;;cta;;13;;13;;;
comp;1608832..1608907;;aaa;;5;;5;;;
comp;1608913..1608987;;caa;;87;;*87;;;
comp;1609075..1609150;;gac;;46;;46;;;
comp;1609197..1609272;;gta;;4;;4;;;
comp;1609277..1609351;;gaa;;8;;8;;;
comp;1609360..1609450;;agc;;3;;3;;;
comp;1609454..1609528;;aac;;114;114;;;;114
comp;1609643..1610101;;CDS;;;;;;153;
;;;;;;;;;;
comp;1702642..1703788;;CDS;;114;114;;;382;114
comp;1703903..1703975;;gca;;10;;;10;;
comp;1703986..1704057;;ggc;;5;;;5;;
comp;1704063..1704138;;aaa;;5;;;5;;
comp;1704144..1704218;;caa;;65;;;65;;
comp;1704284..1704366;;tac;;17;;;17;;
comp;1704384..1704459;;gta;;5;;;5;;
comp;1704465..1704539;;gaa;;24;;;24;;
comp;1704564..1704636;;acc;;4;;;4;;
comp;1704641..1704715;;aac;;9;;;;;
comp;1704725..1704840;;5s;;82;;;;;
comp;1704923..1707851;;23s;;141;;;;;
comp;1707993..1709545;;16s;;223;223;;;;
comp;1709769..1709987;;CDS;;;;;;73;
;;;;;;;;;;
comp;1767157..1767618;;CDS;;206;206;;;154;206
comp;1767825..1767940;;5s;;45;;;;;
comp;1767986..1770913;;23s;;141;;;;;
comp;1771055..1772608;;16s;;372;*372;;;;
comp;1772981..1774480;;CDS;;;;;;*500;
;;;;;;;;;;
comp;1787717..1790188;;CDS;;259;259;;;*824;
comp;1790448..1790519;;gaa;;13;;13;;;
comp;1790533..1790606;;atgj;@2;160;160;;;;160
comp;1790767..1791249;;CDS;;;;;;161;
;;;;;;;;;;
comp;1820538..1820717;;CDS;;190;190;;;60;190
comp;1820908..1821023;;5s;;44;;;;;
comp;1821068..1823996;;23s;;77;;;;;
comp;1824074..1824149;;gca;;8;;;8;;
comp;1824158..1824234;;atc;;130;;;;;
comp;1824365..1825919;;16s;;217;217;;;;
comp;1826137..1826406;;CDS;;;;;;90;
;;;;;;;;;;
comp;1832600..1832992;;CDS;;166;166;;;131;
comp;1833159..1833251;;tca;;156;156;;;;156
comp;1833408..1834682;;CDS;;;;;;425;
;;;;;;;;;;
;1839668..1840669;;CDS;;34;34;;;334;34
comp;1840704..1840819;;5s;;44;;;;;
comp;1840864..1843791;;23s;;76;;;;;
comp;1843868..1843943;;gca;;8;;;8;;
comp;1843952..1844028;;atc;;130;;;;;
comp;1844159..1845713;;16s;;240;240;;;;
comp;1845954..1848425;;CDS;;;;;;*824;
;;;;;;;;;;
;1873838..1875127;;CDS;;139;139;;;430;139
;1875267..1875342;;aaa;;13;;13;;;
;1875356..1875427;;gaa;;21;;21;;;
;1875449..1875524;;gac;;41;;41;;;
;1875566..1875638;;ttc;;403;*403;;;;
;1876042..1876749;;CDS;;;;;;236;
;;;;;;;;;;
comp;2217640..2217846;;CDS;;205;205;;;69;205
;2218052..2218130;;cgg;;255;255;;;;
;2218386..2219693;;CDS;;;;;;436;
;;;;;;;;;;
comp;2428815..2429495;;CDS;;404;*404;;;227;
;2429900..2431456;;16s;;139;;;;;
;2431596..2434524;;23s;;97;;;;;
;2434622..2434737;;5s;;4;;;;;
;2434742..2434817;;gta;+;4;;;4;;
;2434822..2434897;;aca;2 cta;9;;;9;;
;2434907..2434982;;cac;2 aca;22;;;22;;
;2435005..2435085;;cta;;29;;;29;;
;2435115..2435189;;ggc;;16;;;16;;
;2435206..2435294;;tta;;3;;;3;;
;2435298..2435371;;cgt;;10;;;10;;
;2435382..2435455;;cca;;16;;;16;;
;2435472..2435544;;gca;;20;;;20;;
;2435565..2435657;;tca;;54;;;54;;
;2435712..2435805;;cta;;20;;;20;;
;2435826..2435902;;atgf;;1;;;1;;
;2435904..2435979;;gac;;12;;;12;;
;2435992..2436067;;ttc;;14;;;14;;
;2436082..2436157;;aca;;10;;;10;;
;2436168..2436243;;aaa;;13;;;13;;
;2436257..2436327;;gga;;10;;;10;;
;2436338..2436414;;atc;;7;;;7;;
;2436422..2436496;;aac;;7;;;7;;
;2436504..2436594;;agc;;6;;;6;;
;2436601..2436672;;gaa;;59;59;;;;59
;2436732..2436842;;CDS;;;;;;37;
;;;;;;;;;;
;2798971..2799474;;CDS;;109;109;;;168;109
;2799584..2799657;;gga;;1;;1;;;
;2799659..2799735;;aga;;407;*407;;;;
;2800143..2800343;;CDS;;;;;;67;
;;;;;;;;;;
comp;2991608..2992366;;CDS;;242;242;;;253;
;2992609..2992682;;atgi;;221;221;;;;221
;2992904..2993515;;CDS;;;;;;204;
&lt;/pre&gt;

====ban cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_cumuls|ban cumuls]]
&lt;pre&gt;
ban* cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;11;1;3;2;1;0;1;0;100;10
;16 23 5s 0;4;20;25;47;50;2;20;1;200;9
;16 atc gca;2;40;3;6;100;3;40;1;300;6
;16 23 5s a;5;60;4;2;150;6;60;2;400;4
;max a;21;80;0;2;200;7;80;0;500;4
;a doubles;2;100;2;0;250;8;100;1;600;1
;autres;0;120;0;0;300;3;120;4;700;1
;total aas;66;140;0;0;350;0;140;2;800;0
sans ;opérons;9;160;0;0;400;2;160;2;900;2
;1 aa;5;180;0;0;450;3;180;0;1000;0
;max a;33;200;0;0;500;0;200;2;1100;1
;a doubles;1;;0;0;;0;;4;;0
;total aas;46;;37;59;;34;;19;;38
total aas;;112;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;18;15;;232;;132;;274
;;;variance;21;14;;143;;62;;238
sans jaune;;;moyenne;14;;;165;;;;191
;;;variance;14;;;71;;;;124
&lt;/pre&gt;
====ban blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_blocs|ban blocs]]
&lt;pre&gt;
ban intercalaires des 11 clusters à rrnas;;;;;;;;
cds;694’;;cds;386’;;cds;114;
16s;141;;16s;141;;aac;*;
23s;97;;23s;96;;31aas;1;
5s;4;;5s;9;;gga;75;
gta;*;;aac;*;;16s;141;
17aas;1;;9aas;10;;23s;46;
gaa;130;;ttg;207’;;5s;12;
cds;;;cds;;;atgf;3;
;;;;;;gac;174;
cds;223;;cds;404’;;cds;;
16s;141;;16s;139;;;;
23s;82;;23s;97;;cds;217;240
5s;9;;5s;4;;16s;130;130
aac;*;;gta;4;;atc;8;8
7aas;10;;19aas;*;;gca;77;76
gca;114;;gaa;59;;23s;44;44
cds;;;cds;;;5s;190;34’
;;;;;;cds;;
cds;476’;451’;294;372;;;;
16s;173;142;153;141;;;;
23s;49;46;45;45;;;;
5s;57’;99’;14’;206;;;;
cds;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====ban distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_distribution|ban distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;tca2 5s;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;3;tcc;;tac;2;tgc;1
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;atc;3;acc;2;aac;6;agc;2
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;4
gtc;1;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;5;ggc;6
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;4;tca;5;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;;;;;;;;;;ata;;aca;5;aaa;4;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;5;cca;4;caa;4;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;1;;;;;;;;;;;gta;6;gca;4;gaa;6;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;3
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ban;;5;;;;;5;;ban;8;;;;;;8;;;;;;;;;;;ban;;;;93;;;93
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2 1-3aas;33 -16s;;
&lt;/pre&gt;
====ban données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_données_intercalaires|ban données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;ban;fx;fc;ban;fx40;fc40;ban;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;0;33;0;0;33;-1;;73;188;419;16s tRNA;;;tRNA tRNA;suite;contigu;tRNA tRNA;suite;contigu
;0;10;16;234;1;1;38;-2;;1;130;210;2* 132;;atc;14;;tgc;10;;gca
;0;20;41;427;2;2;35;-3;;0;198;205;;;;5;;ggc;5;;ggc
;0;30;81;192;3;2;40;-4;3;241;115;242;tRNA 16s;;;63;;caa;5;;aaa
;0;40;134;137;4;3;33;-5;;0;174;;76;;gaa;19;;cac;65;;caa
;0;50;84;97;5;1;20;-6;;0;114;;tRNA 23s;;gca;7;;tgg;17;;tac
;0;60;75;97;6;0;22;-7;;3;114;;80;;;17;;tac;5;;gta
;0;70;35;120;7;3;10;-8;1;84;259;;79;;;5;;gta;24;;gaa
;0;80;36;127;8;1;7;-9;2;0;160;;5s tRNA;;;24;;gaa;4;;acc
;0;90;38;94;9;0;12;-10;;3;166;;2* 4;;gta;4;;acc;**;;aac
;0;100;57;108;10;3;17;-11;1;30;156;;2* 9;;aac;**;;aac;4;;gta
;1;110;44;135;11;3;31;-12;1;0;139;;12;;atgf;3;;gac;9;;aca
;3;120;52;132;12;2;63;-13;;10;403;;tRNA tRNA;;intra;**;;atgf;22;;cac
;1;130;45;108;13;4;42;-14;1;19;258;;2* 8;;atc gca;1;;gga;29;;cta
;1;140;38;89;14;6;50;-15;;0;657;;tRNA tRNA;;;4;;cca;16;;ggc
;0;150;55;94;15;2;62;-16;;5;109;;13;;gaa;3;;cgt;3;;tta
;2;160;37;82;16;4;37;-17;;15;410;;**;;atgj;16;;tta;10;;cgt
;1;170;45;66;17;4;39;-18;;0;221;;139;;;29;;ggc;16;;cca
;1;180;39;55;18;5;40;-19;;3;CDS 16s;;13;;aaa;14;;cta;20;;gca
;1;190;42;62;19;3;31;-20;;15;295;695;21;;gaa;5;;aaa;54;;tca
;1;200;42;51;20;8;32;-21;;0;224;387;41;;gac;87;;caa;20;;cta
2;0;210;34;65;21;1;29;-22;;3;373;477;**;;ttc;46;;gac;1;;atgf
;0;220;25;48;22;6;21;-23;;10;218;452;1;;gga;4;;gta;12;;gac
;1;230;30;43;23;7;29;-24;;0;241;404;**;;aga;1;;gaa;14;;ttc
;0;240;28;35;24;10;21;-25;1;5;23s 5s;;tRNA tRNA;;contigu;8;;aac;10;;aca
1;0;250;22;30;25;6;16;-26;;10;2* 101;;1;;gaa;11;;atc;13;;aaa
;2;260;25;25;26;6;18;-27;;0;100;;8;;aac;6;;tgg;10;;gga
;0;270;22;36;27;9;20;-28;1;3;3* 50;;11;;atc;9;;aca;7;;atc
;0;280;26;29;28;13;12;-29;;2;2* 49;;6;;tgg;8;;ttc;7;;aac
;0;290;15;28;29;13;16;-30;;0;86;;9;;aca;4;;gac;6;;agc
;0;300;20;28;30;10;10;-31;;1;2* 48;;9;;ttc;20;;atgf;**;;gaa
;0;310;12;32;31;10;22;-32;;6;16s 23s;;4;;gac;54;;tca;;;
;0;320;17;19;32;5;13;-33;;0;5* 146;;20;;atgf;20;;tca;;;
;0;330;11;26;33;15;17;-34;;1;147;;54;;tca;16;;gca;;;
;0;340;22;28;34;10;12;-35;;6;177;;20;;tca;10;;cca;;;
;0;350;8;27;35;18;12;-36;;0;158;;16;;gca;3;;cgt;;;
;0;360;19;17;36;12;16;-37;;2;144;;10;;cca;16;;tta;;;
;0;370;11;17;37;11;13;-38;;2;5s CDS;;3;;cgt;29;;ggc;;;
;0;380;13;13;38;12;13;-39;;0;190;57;16;;tta;13;;cta;;;
;0;390;10;20;39;19;11;-40;;0;206;99;29;;ggc;5;;aaa;;;
;0;400;10;15;40;22;8;-41;;0;;14;22;;cta;87;;caa;;;
1;3;reste;163;168;reste;1307;2266;-42;1;0;;34;9;;cac;46;;gac;;;
4;18;total;1579;3289;total;1579;3289;-43;;0;;;4;;aca;4;;gta;;;
3;15;diagr;1416;3088;diagr;272;990;-44;;2;;;**;;gta;8;;gaa;;;
0;0; t30;138;853;;;;-45;;0;;;;;;3;;agc;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;;**;;aac;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;;;;;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;;;;;;
;x;1579;13;0;1592;;;-49;;1;;;;;;;;;;;
;c;3256;564;33;3853;;;-50;;8;;;;;;;;;;;
;;;;;5445;173;;reste;1;0;;;;;;;;;;;
;;;;;;5618;;total;13;564;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ban autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_autres_intercalaires_aas|ban autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ban;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;342504;342953;175;*;
;comp;ncRNA;343129;343312;21;*;
;comp;ncRNA;343334;343516;116;*;
fin;comp;CDS;343633;344466;;;
deb;comp;CDS;359943;361082;180;*;
;comp;ncRNA;361263;361653;87;*;
fin;comp;CDS;361741;362079;;;
deb;;CDS;618142;618366;188;*;
;;tRNA;618555;618627;419;*;gtc
fin;comp;CDS;619047;619235;;;
deb;comp;CDS;1102183;1102602;130;*;
;comp;tRNA;1102733;1102804;1;*;gaa
;comp;tRNA;1102806;1102880;8;*;aac
;comp;tRNA;1102889;1102965;11;*;atc
;comp;tRNA;1102977;1103047;6;*;tgg
;comp;tRNA;1103054;1103126;9;*;aca
;comp;tRNA;1103136;1103211;9;*;ttc
;comp;tRNA;1103221;1103296;4;*;gac
;comp;tRNA;1103301;1103377;20;*;atgf
;comp;tRNA;1103398;1103490;54;*;tca
;comp;tRNA;1103545;1103637;20;*;tca
;comp;tRNA;1103658;1103730;16;*;gca
;comp;tRNA;1103747;1103820;10;*;cca
;comp;tRNA;1103831;1103904;3;*;cgt
;comp;tRNA;1103908;1103996;16;*;tta
;comp;tRNA;1104013;1104087;29;*;ggc
;comp;tRNA;1104117;1104197;22;*;cta
;comp;tRNA;1104220;1104295;9;*;cac
;comp;tRNA;1104305;1104380;4;*;aca
;comp;tRNA;1104385;1104460;4;*;gta
;comp;rRNA;1104465;1104580;101;*;116
;comp;rRNA;1104682;1107601;146;*;2920
;comp;rRNA;1107748;1109298;695;*;1551
fin;;CDS;1109994;1113038;;0;
deb;comp;CDS;1306706;1307848;198;*;
;comp;tRNA;1308047;1308120;115;*;gga
fin;comp;CDS;1308236;1308889;;;
deb;;CDS;1312025;1312345;210;*;
;comp;tRNA;1312556;1312637;10;*;ttg
;comp;tRNA;1312648;1312718;14;*;tgc
;comp;tRNA;1312733;1312807;5;*;ggc
;comp;tRNA;1312813;1312887;63;*;caa
;comp;tRNA;1312951;1313026;19;*;cac
;comp;tRNA;1313046;1313119;7;*;tgg
;comp;tRNA;1313127;1313210;17;*;tac
;comp;tRNA;1313228;1313303;5;*;gta
;comp;tRNA;1313309;1313383;24;*;gaa
;comp;tRNA;1313408;1313480;4;*;acc
;comp;tRNA;1313485;1313559;9;*;aac
;comp;rRNA;1313569;1313684;100;*;116
;comp;rRNA;1313785;1316706;146;*;2922
;comp;rRNA;1316853;1318404;387;*;1552
fin;;CDS;1318792;1319148;;0;
deb;;CDS;1556278;1556507;57;*;
;comp;rRNA;1556565;1556680;50;*;116
;comp;rRNA;1556731;1560125;177;*;3395
;comp;rRNA;1560303;1562131;477;*;1829
fin;;CDS;1562609;1563322;;;
deb;;CDS;1566949;1567219;99;*;
;comp;rRNA;1567319;1567434;50;*;116
;comp;rRNA;1567485;1570406;147;*;2922
;comp;rRNA;1570554;1572114;452;*;1561
fin;;CDS;1572567;1574498;;;
deb;;CDS;1579539;1580615;14;*;
;comp;rRNA;1580630;1580745;49;*;116
;comp;rRNA;1580795;1583909;158;*;3115
;comp;rRNA;1584068;1585719;295;*;1652
fin;comp;CDS;1586015;1587520;;;
deb;comp;CDS;1600693;1601166;174;*;
;comp;tRNA;1601341;1601416;3;*;gac
;comp;tRNA;1601420;1601496;12;*;atgf
;comp;rRNA;1601509;1601624;50;*;116
;comp;rRNA;1601675;1604595;146;*;2921
;comp;rRNA;1604742;1606293;76;*;1552
;comp;tRNA;1606370;1606440;1;*;gga
;comp;tRNA;1606442;1606518;4;*;cca
;comp;tRNA;1606523;1606599;3;*;cgt
;comp;tRNA;1606603;1606691;16;*;tta
;comp;tRNA;1606708;1606782;29;*;ggc
;comp;tRNA;1606812;1606892;14;*;cta
;comp;tRNA;1606907;1606982;5;*;aaa
;comp;tRNA;1606988;1607062;87;*;caa
;comp;tRNA;1607150;1607225;46;*;gac
;comp;tRNA;1607272;1607347;4;*;gta
;comp;tRNA;1607352;1607426;1;*;gaa
;comp;tRNA;1607428;1607502;8;*;aac
;comp;tRNA;1607511;1607587;11;*;atc
;comp;tRNA;1607599;1607669;6;*;tgg
;comp;tRNA;1607676;1607748;9;*;aca
;comp;tRNA;1607758;1607833;8;*;ttc
;comp;tRNA;1607842;1607917;4;*;gac
;comp;tRNA;1607922;1607998;20;*;atgf
;comp;tRNA;1608019;1608111;54;*;tca
;comp;tRNA;1608166;1608258;20;*;tca
;comp;tRNA;1608279;1608351;16;*;gca
;comp;tRNA;1608368;1608441;10;*;cca
;comp;tRNA;1608452;1608525;3;*;cgt
;comp;tRNA;1608529;1608617;16;*;tta
;comp;tRNA;1608634;1608708;29;*;ggc
;comp;tRNA;1608738;1608818;13;*;cta
;comp;tRNA;1608832;1608907;5;*;aaa
;comp;tRNA;1608913;1608987;87;*;caa
;comp;tRNA;1609075;1609150;46;*;gac
;comp;tRNA;1609197;1609272;4;*;gta
;comp;tRNA;1609277;1609351;8;*;gaa
;comp;tRNA;1609360;1609450;3;*;agc
;comp;tRNA;1609454;1609528;114;*;aac
fin;comp;CDS;1609643;1610101;;0;
deb;comp;CDS;1702642;1703788;114;*;
;comp;tRNA;1703903;1703975;10;*;gca
;comp;tRNA;1703986;1704057;5;*;ggc
;comp;tRNA;1704063;1704138;5;*;aaa
;comp;tRNA;1704144;1704218;65;*;caa
;comp;tRNA;1704284;1704366;17;*;tac
;comp;tRNA;1704384;1704459;5;*;gta
;comp;tRNA;1704465;1704539;24;*;gaa
;comp;tRNA;1704564;1704636;4;*;acc
;comp;tRNA;1704641;1704715;9;*;aac
;comp;rRNA;1704725;1704840;86;*;116
;comp;rRNA;1704927;1707848;146;*;2922
;comp;rRNA;1707995;1709544;224;*;1550
fin;comp;CDS;1709769;1709987;;0;
deb;comp;CDS;1767157;1767618;206;*;
;comp;rRNA;1767825;1767940;49;*;116
;comp;rRNA;1767990;1770910;146;*;2921
;comp;rRNA;1771057;1772607;373;*;1551
fin;comp;CDS;1772981;1774480;;;
deb;comp;CDS;1787717;1790188;259;*;
;comp;tRNA;1790448;1790519;13;*;gaa
;comp;tRNA;1790533;1790606;160;*;atgj
fin;comp;CDS;1790767;1791249;;;
deb;comp;CDS;1820538;1820717;190;*;
;comp;rRNA;1820908;1821023;48;*;116
;comp;rRNA;1821072;1823993;80;*;2922
;comp;tRNA;1824074;1824149;8;*;gca
;comp;tRNA;1824158;1824234;132;*;atc
;comp;rRNA;1824367;1825918;218;*;1552
fin;comp;CDS;1826137;1826406;;;
deb;comp;CDS;1827820;1829508;132;*;
;comp;ncRNA;1829641;1829905;79;*;
fin;comp;CDS;1829985;1830485;;0;
deb;comp;CDS;1832600;1832992;166;*;
;comp;tRNA;1833159;1833251;156;*;tca
fin;comp;CDS;1833408;1834682;;;
deb;;CDS;1839668;1840669;34;*;
;comp;rRNA;1840704;1840819;48;*;116
;comp;rRNA;1840868;1843788;79;*;2921
;comp;tRNA;1843868;1843943;8;*;gca
;comp;tRNA;1843952;1844028;132;*;atc
;comp;rRNA;1844161;1845712;241;*;1552
fin;comp;CDS;1845954;1848425;;;
deb;;CDS;1873838;1875127;139;*;
;;tRNA;1875267;1875342;13;*;aaa
;;tRNA;1875356;1875427;21;*;gaa
;;tRNA;1875449;1875524;41;*;gac
;;tRNA;1875566;1875638;403;*;ttc
fin;;CDS;1876042;1876749;;;
deb;comp;CDS;2217640;2217846;205;*;
;;tRNA;2218052;2218127;258;*;cgg
fin;;CDS;2218386;2219693;;;
deb;;CDS;2250178;2250645;126;*;
;;tmRNA;2250772;2251126;407;*;
fin;;CDS;2251534;2252211;;;
deb;comp;CDS;2428815;2429495;404;*;
;;rRNA;2429900;2431454;144;*;1555
;;rRNA;2431599;2434520;101;*;2922
;;rRNA;2434622;2434737;4;*;116
;;tRNA;2434742;2434817;4;*;gta
;;tRNA;2434822;2434897;9;*;aca
;;tRNA;2434907;2434982;22;*;cac
;;tRNA;2435005;2435085;29;*;cta
;;tRNA;2435115;2435189;16;*;ggc
;;tRNA;2435206;2435294;3;*;tta
;;tRNA;2435298;2435371;10;*;cgt
;;tRNA;2435382;2435455;16;*;cca
;;tRNA;2435472;2435544;20;*;gca
;;tRNA;2435565;2435657;54;*;tca
;;tRNA;2435712;2435805;20;*;cta
;;tRNA;2435826;2435902;1;*;atgf
;;tRNA;2435904;2435979;12;*;gac
;;tRNA;2435992;2436067;14;*;ttc
;;tRNA;2436082;2436157;10;*;aca
;;tRNA;2436168;2436243;13;*;aaa
;;tRNA;2436257;2436327;10;*;gga
;;tRNA;2436338;2436414;7;*;atc
;;tRNA;2436422;2436496;7;*;aac
;;tRNA;2436504;2436594;6;*;agc
;;tRNA;2436601;2436672;657;*;gaa
fin;;CDS;2437330;2438274;;0;
deb;;CDS;2798971;2799474;109;*;
;;tRNA;2799584;2799657;1;*;gga
;;tRNA;2799659;2799732;410;*;aga
fin;;CDS;2800143;2800343;;0;
deb;comp;CDS;2991608;2992366;242;*;
;;tRNA;2992609;2992682;221;*;atgi
fin;;CDS;2992904;2993515;;;
&lt;/pre&gt;

====ban séquences====
&lt;pre&gt;
33 aas;inter;21 aas;inter;19 aas;inter;11 aas;inter
;;;;;;;
gga;1;;;;;ttg;10
cca;4;;;;;tgc;14
cgt;3;;;;;ggc;5
tta;16;;;;;caa;63
ggc;29;;;;;cac;19
cta;14;;;;;tgg;7
aaa;5;;;;;tac;17
caa;87;;;;;gta;5
gac;46;gaa;6;;;gaa;24
gta;4;agc;7;;;acc;4
gaa;1;aac;7;gaa;1;aac;
aac;8;atc;10;aac;8;;
atc;11;gga;13;atc;11;;
tgg;6;aaa;10;tgg;6;;
aca;9;aca;14;aca;9;;
ttc;8;ttc;12;ttc;9;;
gac;4;gac;1;gac;4;;
atgf;20;atgf;20;atgf;20;;
tca;54;cta;54;tca;54;9 aas;inter
tca;20;tca;20;tca;20;;
gca;16;gca;16;gca;16;gca;10
cca;10;cca;10;cca;10;ggc;5
cgt;3;cgt;3;cgt;3;aaa;5
tta;16;tta;16;tta;16;caa;65
ggc;29;ggc;29;ggc;29;tac;17
cta;13;cta;22;cta;22;gta;5
aaa;5;cac;9;cac;9;gaa;24
caa;87;aca;4;aca;4;acc;4
gac;46;gta;;gta;;aac;
gta;4;;;;;;
gaa;8;;;;;;
agc;3;;;;;;
aac;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
===bacilli synthèse===
====bacilli distribution par génome====
*Lien tableur: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bacilli_distribution_par_génome|bacilli distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
baci8;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
bsu;18;8;;52;2;4;;2;86
lmo;9;8;;44;;4;;2;67
lam;22;14;;16;;4;3;4;63
ppm;67;21;;68;;5;;;161
pmq;22;11;;138;;0;2;;173
lbu;49;16;;16;;10;7;;98
ban;8;5;;60;33;4;;2;112
;;;;;;;;;
total;195;83;0;394;35;31;12;10;760
&lt;/pre&gt;

====bacilli distribution du total====
*Lien tableur: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bacilli_distribution_du_total|bacilli distribution du total]]
&lt;pre&gt;
baci8;Sans 2 16s, 10 13aas et 31 +16s;;;;;;717;;baci8;Le reste;;;;;;43
atgi;8;tct;;tat;;atgf;25;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;2;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;5;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;23;tcc;12;tac;24;tgc;12;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;
atc;16;acc;8;aac;32;agc;17;;atc;15;acc;1;aac;4;agc;
ctc;11;ccc;2;cac;21;cgt;27;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1
gtc;8;gcc;4;gac;34;ggc;39;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;3
tta;16;tca;17;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;1;aca;23;aaa;30;aga;9;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;15;cca;27;caa;29;cga;2;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;36;gca;17;gaa;42;gga;19;;gta;;gca;16;gaa;;gga;1
ttg;13;tcg;10;tag;;tgg;15;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;
atgj;14;acg;7;aag;10;agg;3;;atgj;;acg;;aag;5;agg;
ctg;15;ccg;2;cag;1;cgg;8;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;4;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
baci8;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci8;dupli;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
type;207;83;0;394;33;0;717;;type;12;;;10;2;31;43
&lt;/pre&gt;

====bacilli distribution par type====
*Lien tableur: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bacilli_distribution_par_type|bacilli distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
baci8;;;;;;;717;;baci8;;;;;;;83;;baci8;;;;;;;195;;baci8;;;;;;;12;;baci8;;;;;;;427
atgi;8;tct;0;tat;0;atgf;25;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;7;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;18
att;0;act;2;aat;0;agt;0;;att;;act;2;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;5;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;;;ctt;3;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;23;tcc;12;tac;24;tgc;12;;ttc;0;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;9;tcc;3;tac;11;tgc;5;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;14;tcc;9;tac;13;tgc;7
atc;16;acc;8;aac;32;agc;17;;atc;1;acc;2;aac;1;agc;1;;atc;3;acc;;aac;9;agc;6;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;12;acc;6;aac;22;agc;10
ctc;11;ccc;2;cac;21;cgt;27;;ctc;3;ccc;2;cac;;cgt;1;;ctc;4;ccc;;cac;9;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;4;ccc;;cac;12;cgt;23
gtc;8;gcc;4;gac;34;ggc;39;;gtc;5;gcc;2;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;1;gac;11;ggc;7;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;3;;gtc;3;gcc;1;gac;22;ggc;29
tta;16;tca;17;taa;0;tga;0;;tta;2;tca;5;taa;;tga;;;tta;3;tca;5;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;11;tca;7;taa;;tga;
ata;1;aca;23;aaa;30;aga;9;;ata;;aca;1;aaa;;aga;7;;ata;1;aca;4;aaa;8;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;18;aaa;22;aga;1
cta;15;cca;27;caa;29;cga;2;;cta;;cca;;caa;4;cga;;;cta;3;cca;5;caa;10;cga;2;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;12;cca;22;caa;15;cga;
gta;36;gca;17;gaa;42;gga;19;;gta;;gca;;gaa;;gga;5;;gta;8;gca;2;gaa;19;gga;4;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;28;gca;15;gaa;23;gga;10
ttg;13;tcg;10;tag;0;tgg;15;;ttg;;tcg;5;tag;;tgg;;;ttg;4;tcg;3;tag;;tgg;7;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;7;tcg;2;tag;;tgg;8
atgj;14;acg;7;aag;10;agg;3;;atgj;2;acg;3;aag;4;agg;3;;atgj;4;acg;2;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;5;agg;;;atgj;8;acg;2;aag;;agg;
ctg;15;ccg;2;cag;1;cgg;8;;ctg;5;ccg;;cag;;cgg;8;;ctg;1;ccg;2;cag;1;cgg;;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;7;ccg;;cag;;cgg;
gtg;0;gcg;0;gag;2;ggg;4;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;3;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;;;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;*;;;
&lt;/pre&gt;

====bacilli par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bacilli_par_rapport_au_groupe_de_référence|bacilli par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;baci8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;43;21;5;13;;;82;
16;moyen;27;59;4;135;2;31;227;
14;fort;13;115;3;279;8;2;418;
; ;83;195;12;427;10;33;760;
10;g+cga;16;12;5;5;;;38;
2;agg+cgg;11;0;;;;;11;
4;carre ccc;12;5;;8;;;25;
5;autres;4;4;;;;;8;
;;43;21;5;13;;;82;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;baci8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;baci  ‰;ref. ‰
21;faible;57;28;7;17;;;108;26
16;moyen;36;78;5;178;3;41;299;324
14;fort;17;151;4;367;11;3;550;650
;;109;257;16;562;13;43;760;729
10;g+cga;21;16;7;7;;;50;10
2;agg+cgg;14;;;;;;14;
4;carre ccc;16;7;;11;;;33;16
5;autres;5;5;;;;;11;
;;57;28;7;17;;;108;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;baci8;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;148;72;17;238;26;52;11;
16;moyen;93;203;14;310;324;33;30;
14;fort;45;397;10;452;650;16;59;
;;286;672;41;290;729;83;195;
10;g+cga;55;41;17;114;;37;;
2;agg+cgg;38;;;38;;26;;
4;carre ccc;41;17;;59;;28;;
5;autres;14;14;;28;;9;;
;;148;72;17;238;;43;;
&lt;/pre&gt;
====bacilli, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bacilli,_estimation_des_-rRNAs|bacilli, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
;;;;;;;;bacilli;;;;;;;;;;;;;;;;;
32 génomes total avec rRNA;;;;baci;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;baci;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;sans +16s;;;32;1889;0;0;;indices;;;;32;5903;0;0;;baci7;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;290
atgi;20;tct;;tat;;atgf;91;;atgi;63;tct;;tat;;atgf;284;;atgi;5;tct;;tat;;atgf;7
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;2;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;5;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;63;tcc;30;tac;56;tgc;30;;ttc;197;tcc;94;tac;175;tgc;94;;ttc;9;tcc;3;tac;11;tgc;5
atc;92;acc;27;aac;99;agc;38;;atc;288;acc;84;aac;309;agc;119;;atc;4;acc;2;aac;10;agc;7
ctc;15;ccc;;cac;53;cgt;82;;ctc;47;ccc;;cac;166;cgt;256;;ctc;7;ccc;2;cac;9;cgt;4
gtc;3;gcc;1;gac;106;ggc;101;;gtc;9.4;gcc;3.1;gac;331;ggc;316;;gtc;5;gcc;3;gac;12;ggc;10
tta;59;tca;49;taa;;tga;;;tta;184;tca;153;taa;;tga;;;tta;5;tca;10;taa;;tga;
ata;;aca;87;aaa;84;aga;1;;ata;0;aca;272;aaa;263;aga;3.1;;ata;1;aca;5;aaa;8;aga;8
cta;54;cca;77;caa;69;cga;;;cta;169;cca;241;caa;216;cga;;;cta;3;cca;5;caa;14;cga;2
gta;113;gca;122;gaa;94;gga;49;;gta;353;gca;381;gaa;294;gga;153;;gta;8;gca;2;gaa;19;gga;9
ttg;32;tcg;2;tag;;tgg;42;;ttg;100;tcg;6.3;tag;;tgg;131;;ttg;6;tcg;8;tag;;tgg;7
atgj;32;acg;3;aag;;agg;;;atgj;100;acg;9.4;aag;;agg;;;atgj;6;acg;5;aag;10;agg;3
ctg;12;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;37.5;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;8;ccg;2;cag;1;cgg;8
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;3.1;;gtg;;gcg;;gag;2;ggg;3
;;693;;1171;;25;1889;;;;2166;;3659;;78;5903;;;;90;;131;;69;290
29.5.20 Tanger;;;;baci;total;ttt;tgt;;29.5.20 Tanger;;;;baci;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;49366;0,2;0;;indices;sans +16s;;;618;49366;0,2;0;;baci7;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;84;tct;0.3;tat;0.5;atgf;1;;atgi;146;tct;0.3;tat;0.5;atgf;285;;atgi;71;tct;;tat;;atgf;100
att;0.2;act;11;aat;0.5;agt;;;att;0.2;act;11;aat;0.5;agt;;;att;;act;29;aat;;agt;
ctt;47;cct;0.6;cat;0.2;cgc;0.2;;ctt;47;cct;0.6;cat;0.2;cgc;0.2;;ctt;71;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.2;gct;0.5;gat;;ggt;;;gtt;0.2;gct;0.5;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;75;tcc;26;tac;64;tgc;23;;ttc;272;tcc;120;tac;239;tgc;117;;ttc;129;tcc;43;tac;157;tgc;71
atc;23;acc;8;aac;69;agc;40;;atc;310;acc;92;aac;378;agc;159;;atc;57;acc;29;aac;143;agc;100
ctc;28;ccc;6.1;cac;20;cgt;32;;ctc;75;ccc;6.1;cac;186;cgt;288;;ctc;100;ccc;29;cac;129;cgt;57
gtc;44;gcc;27;gac;55;ggc;-6;;gtc;53;gcc;30;gac;386;ggc;310;;gtc;71;gcc;43;gac;171;ggc;143
tta;27;tca;91;taa;1.1;tga;1.8;;tta;211;tca;244;taa;1.1;tga;1.8;;tta;71;tca;143;taa;;tga;
ata;2.1;aca;22;aaa;78;aga;116;;ata;2.1;aca;294;aaa;340;aga;119;;ata;14;aca;71;aaa;114;aga;114
cta;30;cca;2;caa;83;cga;6.3;;cta;199;cca;243;caa;299;cga;6.3;;cta;43;cca;71;caa;200;cga;29
gta;44;gca;62;gaa;174;gga;152;;gta;397;gca;443;gaa;468;gga;305;;gta;114;gca;29;gaa;271;gga;129
ttg;25;tcg;41;tag;0.8;tgg;6;;ttg;125;tcg;47;tag;0.8;tgg;137;;ttg;86;tcg;114;tag;;tgg;100
atgj;52;acg;38;aag;73;agg;72;;atgj;152;acg;47;aag;73;agg;72;;atgj;86;acg;71;aag;143;agg;43
ctg;22.5;ccg;19;cag;17;cgg;109;;ctg;60;ccg;19;cag;17;cgg;109;;ctg;114;ccg;29;cag;14;cgg;114
gtg;0.8;gcg;8.6;gag;16;ggg;15;;gtg;0.8;gcg;8.6;gag;16;ggg;18;;gtg;;gcg;;gag;29;ggg;43
;;654;;845;;582;2081;;;;2820;;4504;;660;7984;;;;1286;;1871;;986;4143
rapports;;23;;19;;88;26;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;baci7;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;57;tct;;tat;;atgf;0.2;;fiches;28.90625;;;fréquences;;;;;atgi;14;tct;100;tat;100;atgf;99
att;;act;100;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;925;;;0/0;0;;;;att;100;act;62;aat;100;agt;
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;1902;;;10;2;;;;ctt;34;cct;100;cat;100;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;32;;;20;3;;;;gtt;100;gct;100;gat;;ggt;
ttc;28;tcc;22;tac;27;tgc;20;;;;;;30;1;;;;ttc;42;tcc;39;tac;59;tgc;67
atc;7;acc;8;aac;18;agc;25;;baci7;41.429;;;40;9;;;;atc;61;acc;73;aac;52;agc;60
ctc;38;ccc;100;cac;11;cgt;11;;sans;290;;;50;6;21;;;ctc;72;ccc;79;cac;84;cgt;44
gtc;82;gcc;90;gac;14;ggc;-2;;avec;470;;;60;5;;;;gtc;39;gcc;37;gac;68;ggc;104
tta;13;tca;37;taa;;tga;100;;genom;7;;;70;9;;;;tta;63;tca;36;taa;100;tga;100
ata;100;aca;8;aaa;23;aga;97;;;;;;80;5;;;;ata;85;aca;69;aaa;32;aga;1
cta;15;cca;1.0;caa;28;cga;100;;L’estimation par baci7;;;;90;3;;;;cta;29;cca;97;caa;58;cga;78
gta;11;gca;14;gaa;37;gga;50;;est  43 % au dessus;;;;100;6;;;;gta;62;gca;54;gaa;36;gga;15
ttg;20;tcg;87;tag;;tgg;4;;des aas sans;;;;;1;;;;ttg;71;tcg;64;tag;100;tgg;94
atgj;34;acg;80;aag;100;agg;100;;32;;100;;;50;;;;atgj;39;acg;47;aag;49;agg;40
ctg;38;ccg;100;cag;100;cgg;100;;atc;45;310;;;;;;;ctg;80;ccg;34;cag;16;cgg;5
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;83;;gca;59;443;;;;;;;gtg;100;gcg;100;gag;44;ggg;65
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;867;;838;;850;2554
&lt;/pre&gt;

==clostridia==
===psor===
====psor opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_opérons|psor opérons]]
&lt;pre&gt;
27.3%GC;8.8.19 Paris;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Paeniclostridium sordellii AM370;;;;;;;;;
;9847..10620;CDS;;205;205;;;258;
;10826..12332;16s;;196;;;;;
;12529..15445;23s;;78;;;;;
;15524..15640;5s;;85;85;;;;85
;15726..15947;CDS;;;;;;74;
;;;;;;;;;
;18845..19297;CDS;;3;3;;;151;3
;19301..19393;tcc;;27;;;;;
;19421..19685;ncRNA;;152;152;;;;
;19838..21478;CDS;;;;;;*547;
;;;;;;;;;
;24343..24570;CDS;;309;309;;;76;
;24880..26386;16s;;196;;;;;
;26583..29499;23s;;122;;;;;
;29622..29738;5s;;5;;;5;;
;29744..29832;tta;+;13;;;13;;
;29846..29921;atgf;3 aaa;15;;;15;;
;29937..30011;gaa;6 atg;9;;;9;;
;30021..30094;gga;3 gta;6;;;6;;
;30101..30176;gta;1 cgt;5;;;5;;
;30182..30258;gac;1 ggc;16;;;16;;
;30275..30350;aac;2 fois suite;4;;;4;;
;30355..30429;aca;aac aca aga;4;;;4;;
;30434..30518;tac;caa cac cca;15;;;15;;
;30534..30617;cta;cta gaa gac;14;;;14;;
;30632..30708;aga;gga tac tca;7;;;7;;
;30716..30791;caa;tgc tta ttc;11;;;11;;
;30803..30878;aaa;;6;;;6;;
;30885..30973;tca;;3;;;3;;
;30977..31052;ttc;;9;;;9;;
;31062..31138;atgj;;8;;;8;;
;31147..31223;atgi;;21;;;21;;
;31245..31321;cca;;6;;;6;;
;31328..31404;cac;;4;;;4;;
;31409..31482;tgc;;25;;;25;;
;31508..31596;tta;;13;;;13;;
;31610..31685;atgf;;15;;;15;;
;31701..31775;gaa;;9;;;9;;
;31785..31858;gga;;6;;;6;;
;31865..31940;gta;;5;;;5;;
;31946..32022;gac;;16;;;16;;
;32039..32114;aac;;4;;;4;;
;32119..32193;aca;;4;;;4;;
;32198..32282;tac;;15;;;15;;
;32298..32381;cta;;11;;;11;;
;32393..32467;ggc;;13;;;13;;
;32481..32557;aga;;7;;;7;;
;32565..32640;caa;;11;;;11;;
;32652..32727;aaa;;6;;;6;;
;32734..32822;tca;;3;;;3;;
;32826..32901;ttc;;9;;;9;;
;32911..32987;atgj;;8;;;8;;
;32996..33072;atgi;;21;;;21;;
;33094..33170;cca;;6;;;6;;
;33177..33253;cac;;9;;;9;;
;33263..33338;aaa;;21;;;21;;
;33360..33433;tgc;;6;;;6;;
;33440..33516;cgt;;10;;;;;
;33527..33602;gta;;162;162;;;;162
;33765..34016;CDS;;;;;;84;
;;;;;;;;;
;34042..34455;CDS;;249;249;;;138;
;34705..36211;16s;;196;;;;;
;36408..39324;23s;;78;;;;;
;39403..39519;5s;;402;*402;;;;
comp;39922..40113;CDS;;348;348;;;64;
;40462..41968;16s;;196;;;;;
;42165..45081;23s;;78;;;;;
;45160..45276;5s;;180;180;;;;*180
;45457..47394;CDS;;;;;;*646;
;;;;;;;;;
;101428..102144;CDS;;276;276;;;239;
;102421..103927;16s;;54;;;;;
;103982..104057;gca;;114;;;;;
;104172..107096;23s;;41;;;;;
;107138..107211;gga;;11;;;;;
;107223..107339;5s;;99;99;;;;99
comp;107439..108617;CDS;;;;;;393;
;;;;;;;;;
;111345..111884;CDS;;431;*431;;;180;
;112316..113822;16s;;54;;;;;
;113877..113952;gca;;114;;;;;
;114067..116982;23s;;193;;;;;
;117176..117292;5s;;5;;;;;
;117298..117386;tta;;9;;;9;;
;117396..117472;atgi;;123;;;;;
;117596..119102;16s;;54;;;;;
;119157..119232;gca;;114;;;;;
;119347..122263;23s;;193;;;;;
;122457..122573;5s;;5;;;;;
;122579..122667;tta;;9;;;9;;
;122677..122753;atgi;;123;;;;;
;122877..124383;16s;;54;;;;;
;124438..124513;gca;;114;;;;;
;124628..127549;23s;;78;;;;;
;127628..127744;5s;;100;100;;;;100
;127845..129260;CDS;;;;;;472;
;;;;;;;;;
;215388..216260;CDS;;264;264;;;291;
;216525..218030;16s;;123;;;;;
;218154..218229;gca;;152;;;;;
;218382..221296;23s;;50;;;;;
;221347..221420;gga;;12;;;;;
;221433..221549;5s;;109;109;;;;109
;221659..221940;CDS;;525;*525;;;94;
;222466..223972;16s;;196;;;;;
;224169..227083;23s;;144;;;;;
;227228..227344;5s;;228;228;;;;*228
;227573..227989;CDS;;;;;;139;
;;;;;;;;;
;449964..450266;CDS;;253;253;;;101;
;450520..452026;16s;;196;;;;;
;452223..455139;23s;;144;;;;;
;455284..455400;5s;;112;112;;;;112
comp;455513..456616;CDS;;;;;;368;
;;;;;;;;;
;498418..499074;CDS;;189;189;;;219;
;499264..500770;16s;;118;;;;;
;500889..500964;gca;;95;;;;;
;501060..503976;23s;;144;;;;;
;504121..504237;5s;;131;131;;;;131
;504369..504551;CDS;;;;;;61;
;;;;;;;;;
;546886..550416;CDS;;41;41;;;*1177;*41
comp;550458..550544;ttg;;138;138;;;;
;550683..553325;CDS;;;;;;*881;
;;;;;;;;;
;608009..608683;CDS;;195;195;;;225;
;608879..608975;tga;;37;37;;;;37
comp;609013..609732;CDS;;;;;;240;
;;;;;;;;;
;815939..816655;CDS;;71;71;;;239;71
;816727..816800;tgc;;12;;12;;;
;816813..816888;aac;;3;;3;;;
;816892..816966;aca;;285;285;;;;
;817252..818727;CDS;;;;;;492;
;;;;;;;;;
;1284870..1288097;CDS;;111;111;;;*1076;*111
;1288209..1288297;cta;;426;*426;;;;
;1288724..1290853;CDS;;;;;;*710;
;;;;;;;;;
;1445161..1445664;CDS;;135;135;;;168;135
;1445800..1445868;other;@1;258;258;;;;
;1446127..1446813;CDS;;;;;;229;
;;;;;;;;;
;2267513..2267698;CDS;@2;306;306;;;62;*306
comp;2268005..2268088;cta;;404;*404;;;;
;2268493..2269758;CDS;;;;;;422;
;;;;;;;;;
;3094098..3094784;CDS;;40;40;;;229;40
comp;3094825..3094941;5s;;78;;;;;
comp;3095020..3097936;23s;;194;;;;;
comp;3098131..3099637;16s;;276;276;;;;
comp;3099914..3101161;CDS;;;;;;416;
;;;;;;;;;
;3159922..3160827;CDS;;37;37;;;302;37
comp;3160865..3160956;agc;;120;120;;;;
comp;3161077..3161376;CDS;;;;;;100;
;;;;;;;;;
comp;3274188..3274733;CDS;;245;245;;;182;*245
comp;3274979..3275095;5s;@3;12;;;;;
comp;3275108..3275181;gga;;107;;;;;
comp;3275289..3278214;23s;;137;;;;;
comp;3278352..3279858;16s;;253;253;;;;
comp;3280112..3280690;CDS;;;;;;193;
;;;;;;;;;
comp;3303104..3304150;CDS;;124;124;;;349;124
comp;3304275..3304459;riboswitch;@4;96;;;;;
comp;3304556..3304672;5s;;11;;;;;
comp;3304684..3304758;aca;;116;;;;;
comp;3304875..3307789;23s;;196;;;;;
comp;3307986..3309492;16s;;364;*364;;;;
;3309857..3310504;CDS;;;;;;216;
;;;;;;;;;
comp;3438683..3439531;CDS;;142;142;;;283;142
comp;3439674..3439750;aga;;7;;;7;;
comp;3439758..3439832;ggc;;9;;;9;;
comp;3439842..3439918;gac;;5;;;5;;
comp;3439924..3439999;gta;;8;;;8;;
comp;3440008..3440082;gaa;;5;;;;;
comp;3440088..3440204;5s;;40;;;;;
comp;3440245..3443168;23s;;112;;;;;
comp;3443281..3443356;gca;;109;;;;;
comp;3443466..3444972;16s;;138;;;;;
comp;3445111..3445187;atgj;+;13;;;13;;
comp;3445201..3445276;ttc;3 atg;6;;;6;;
comp;3445283..3445359;atc;2 cca;6;;;6;;
comp;3445366..3445442;cca;2 gga;31;;;31;;
comp;3445474..3445549;tgg;2 aac;11;;;11;;
comp;3445561..3445637;atgi;;6;;;6;;
comp;3445644..3445720;cca;;6;;;6;;
comp;3445727..3445817;agc;;11;;;11;;
comp;3445829..3445917;tca;;6;;;6;;
comp;3445924..3445999;aaa;;12;;;12;;
comp;3446012..3446087;caa;;6;;;6;;
comp;3446094..3446170;aga;;19;;;19;;
comp;3446190..3446263;gga;;11;;;11;;
comp;3446275..3446359;tac;;4;;;4;;
comp;3446364..3446438;aca;;4;;;4;;
comp;3446443..3446518;aac;;31;;;31;;
comp;3446550..3446625;aac;;16;;;16;;
comp;3446642..3446718;gac;;5;;;5;;
comp;3446724..3446799;gta;;6;;;6;;
comp;3446806..3446879;gga;;9;;;9;;
comp;3446889..3446963;gaa;;15;;;15;;
comp;3446979..3447054;atgf;;13;;;13;;
comp;3447068..3447156;tta;;5;;;;;
comp;3447162..3447278;5s;;213;;;;;
comp;3447492..3450406;23s;;196;;;;;
comp;3450603..3452109;16s;;239;239;;;;
comp;3452349..3452552;CDS;;;;;;68;
;;;;;;;;;
comp;3523330..3524046;CDS;;129;129;;;239;129
comp;3524176..3524251;gta;+;8;;8;;;
comp;3524260..3524334;gaa;2 fois;20;;20;;;
comp;3524355..3524430;aaa;gta gaa aaa;10;;10;;;
comp;3524441..3524515;aca;;10;;10;;;
comp;3524526..3524602;gac;;7;;7;;;
comp;3524610..3524685;gta;;9;;9;;;
comp;3524695..3524769;gaa;;5;;5;;;
comp;3524775..3524850;aaa;;289;289;;;;
;3525140..3526039;CDS;;;;;;300;
&lt;/pre&gt;

====psor cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_cumuls|psor cumuls]]
&lt;pre&gt;
psor cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;17;1;0;0;1;0;1;0;100;9
;16 23 5s 0;6;20;9;65;50;5;20;1;200;8
;16 atc gca;0;40;0;6;100;4;40;3;300;13
;16 23 5s a;2;60;0;0;150;10;60;1;400;4
;max a;44;80;0;0;200;5;80;1;500;4
;a doubles;2;100;0;0;250;5;100;3;600;1
;autres;9;120;0;0;300;8;120;3;700;1
;total aas;87;140;0;0;350;3;140;4;800;1
sans ;opérons;8;160;0;0;400;1;160;1;900;1
;1 aa;6;180;0;0;450;4;180;2;1000;0
;max a;8;200;0;0;500;0;200;0;1100;1
;a doubles;1;;0;0;;1;;3;;1
;total aas;17;;9;71;;46;;22;;44
total aas;;104;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;9;10;;206;;119;;304
;;;variance;5;6;;121;;73;;257
sans jaune;;;moyenne;;;;173;;95;;220
;;;variance;;;;90;;45;;121
&lt;/pre&gt;

====psor blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_blocs|psor blocs]]
&lt;pre&gt;
I;;I2;I3;I4;;;II;;III;;IV;IV1;IV2
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;CDS;124;;;
;;;;;;;CDS;245;riboswitch;96;;;
CDS;205;249;348;525;253;40;5s;12;5s;11;CDS;309;5
16s;196;196;196;196;196;78;gga;107;aca;116;16s;196;213
23s;78;78;78;144;144;194;23s;137;23s;196;23s;122;196
5s;85;402;180;228;112;276;16s;253;16s;364;5s;5;239
CDS;;;;;;;CDS;;CDS;;tta;;
V;;V2;VI;VI1;VII;VII1;VIII;VIII1;IX;;X;X1;
;;;;;;;;;;;;;
CDS;276;264;CDS;431;;;;;CDS;189;gaa;5;
16s;54;123;16s;54;16s;54;16s;54;16s;118;5s;40;
gca;114;152;gca;114;gca;114;gca;114;gca;95;23s;112;
23s;41;50;23s;193;23s;193;23s;78;23s;144;gca;109;
gga;11;12;5s;5;5s;5;5s;100;5s;131;16s;138;
5s;99;109;tta;9;tta;9;CDS;;CDS;;atgj;;
CDS;;;atgi;123;atgi;123;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;CDS;431;;CDS;309;;CDS;142;;CDS;264;;
VI;16s;54;IV1;16s;196;;* * * *4aas;8;V2;16s;123;;
;gca;114;;23s;122;;gaa;5;;gca;152;;
;23s;193;;5s;5;;5s;40;;23s;50;;
;5s;5;;tta;13;;23s;112;;gga;12;;
;tta;9;;* * * * 42aas;10;;gca;109;;5s;109;;
;atgi;123;;gta;162;X1;16s;138;;CDS;525;;
VII;16s;54;;CDS;25;;atgj;13;I4;16s;196;;
;gca;114;;CDS;249;;* * * *21aas;13;;23s;144;;
;23s;193;I2;16s;196;;tta;5;;5s;228;;
;5s;5;;23s;78;;5s;213;;CDS;;;
;tta;9;;5s;402;;23s;196;;;;;
;atgi;123;;CDS;348;IV2;16s;239;;;;;
VIII;16s;54;I3;16s;196;;CDS;;;;;;
;gca;114;;23s;78;;;;;;;;
;23s;78;;5s;180;;;;;;;;
;5s;100;;CDS;;;;;;;;;
;CDS;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====psor distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_distribution|psor distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;avant 5s;atgi;3;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;3 gga;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;aca ;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;1;;;;;;;;;;1-3 aas;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2
atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;;;;;;;;;2 tta;atc;1;acc;;aac;4;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;2 atgi;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;2
tta;;tca;;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;3;tca;3;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;4;aga;4
cta;2;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;4;caa;3;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;;gaa;4;gga;4
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
psor;;5 *;;;;;5;;psor;12;;;;;;12;;;;;;;;;;;psor;;;4;72;;7;87
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4   1-3 aas;;;
&lt;/pre&gt;
====psor données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_données_intercalaires|psor données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;psor;fx;fc;psor;fx40;fc40;psor;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;1;23;0;1;23;-1;;52;3;41;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;suite;contig
;1;10;8;223;1;1;40;-2;;0;162;138;4* 54;;gca;13;;tta;13;;atgj
;0;20;16;347;2;0;52;-3;;0;195;37;123;;gca;15;;atgf;6;;ttc
;0;30;42;182;3;0;19;-4;1;23;71;306;118;;gca;9;;gaa;6;;atc
2;0;40;52;86;4;0;22;-5;;3;285;404;109;;gca;6;;gga;31;;cca
1;0;50;45;48;5;1;15;-6;;0;111;37;tRNA 23s;;;5;;gta;11;;tgg
;0;60;21;74;6;1;3;-7;;18;426;289;4* 114;;gca;16;;gac;6;;atgi
;0;70;28;60;7;1;4;-8;;50;135;;152;;gca;4;;aac;6;;cca
;1;80;19;87;8;1;15;-9;;0;258;;95;;gca;4;;aca;11;;agc
;0;90;19;67;9;3;24;-10;;2;120;;109;;gca;15;;tac;6;;tca
;0;100;9;76;10;0;29;-11;1;31;142;;23s tRNA;;;14;;cta;12;;aaa
;0;110;18;75;11;2;44;-12;;0;129;;41;;gga;7;;aga;6;;caa
;2;120;15;85;12;1;46;-13;;1;CDS 16s;;50;;gga;11;;caa;19;;aga
;1;130;12;65;13;1;34;-14;;19;205;348;107;;gga;6;;aaa;11;;gga
1;1;140;24;68;14;1;41;-15;;0;309;264;116;;aca;3;;tca;4;;tac
;1;150;17;63;15;1;31;-16;;3;249;364;5s tRNA;;;9;;ttc;4;;aca
;0;160;27;59;16;1;30;-17;;7;276;;4* 5;;tta;8;;atgj;31;;aac
;1;170;26;62;17;2;34;-18;;0;431;;5;;gaa;21;;atgi;16;;aac
;0;180;19;44;18;1;36;-19;;1;525;;tRNA 5s;;;6;;cca;5;;gac
;0;190;24;48;19;3;26;-20;;7;253;;11;;gga;4;;cac;6;;gta
;1;200;22;36;20;3;25;-21;;0;189;;2* 12;;gga;25;;tgc;9;;gga
;0;210;20;40;21;2;20;-22;;1;276;;11;;aca;13;;tta;15;;gaa
;0;220;13;35;22;1;19;-23;;2;253;;tRNA 16s;;;15;;atgf;13;;atgf
;0;230;18;25;23;3;22;-24;;0;239;;2* 123;;atgi;9;;gaa;**;;tta
;0;240;15;28;24;2;24;-25;;0;23s 5s;;138;;atgj;6;;gga;;;
;0;250;7;18;25;3;19;-26;;4;5* 78;;tRNA tRNA;;intra;5;;gta;;;
;1;260;13;24;26;6;16;-27;;0;122;;2* 9;;tta atgi;16;;gac;;;
;0;270;8;15;27;6;18;-28;;0;2* 193;;tRNA tRNA;;;4;;aac;;;
;0;280;7;22;28;6;14;-29;;3;3* 144;;12;;tgc;4;;aca;;;
1;1;290;9;14;29;4;10;-30;;0;40;;3;;aac;15;;tac;;;
;0;300;13;15;30;9;20;-31;;1;213;;**;;aca;11;;cta;;;
1;0;310;3;19;31;4;14;-32;;1;16s 23s;;8;;gta;13;;ggc;;;
;0;320;9;11;32;3;12;-33;;0;8* 196;;20;;gaa;7;;aga;;;
;0;330;6;14;33;5;8;-34;;0;194;;10;;aaa;11;;caa;;;
;0;340;6;10;34;5;5;-35;;0;137;;10;;aca;6;;aaa;;;
;0;350;4;9;35;7;13;-36;;0;5s CDS;;7;;gac;3;;tca;;;
;0;360;4;10;36;5;8;-37;;0;85;402;9;;gta;9;;ttc;;;
;0;370;6;8;37;5;2;-38;;0;180;99;5;;gaa;8;;atgj;;;
;0;380;2;9;38;8;8;-39;;0;100;112;**;;aaa;21;;atgi;;;
;0;390;1;8;39;2;7;-40;;0;109;40;;;;6;;cca;;;
;0;400;2;7;40;8;9;-41;;1;228;;;;;9;;cac;;;
1;1;reste;63;131;reste;574;1489;-42;;0;131;;;;;21;;aaa;;;
7;12;total;693;2350;total;693;2350;-43;;0;245;;;;;6;;tgc;;;
6;11;diagr;629;2196;diagr;118;838;-44;;0;;;;;;10;;cgt;;;
0;1; t30;66;752;;;;-45;;0;;;;;;**;;gta;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;;7;;aga;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;3;;;;;;9;;ggc;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;5;;gac;;;
;x;692;3;1;696;;;-49;;0;;;;;;8;;gta;;;
;c;2327;235;23;2585;;;-50;;1;;;;;;**;;gaa;;;
;;;;;3281;226;;reste;1;1;;;;;;;;;;;
;;;;;;3507;;total;3;235;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====psor autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_autres_intercalaires_aas|psor autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;psor;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;aas
fin;;CDS;1;1332;;
deb;;CDS;9847;10620;205;
;;rRNA;10826;12332;196;1507
;;rRNA;12529;15445;78;2917
;;rRNA;15524;15640;85;117
fin;;CDS;15726;15947;;
deb;;CDS;18845;19297;3;
;;tRNA;19301;19393;27;tcc
;;ncRNA;19421;19685;152;
fin;;CDS;19838;21478;;
deb;;CDS;24343;24570;309;
;;rRNA;24880;26386;196;1507
;;rRNA;26583;29499;122;2917
;;rRNA;29622;29738;5;117
;;tRNA;29744;29832;13;tta
;;tRNA;29846;29921;15;atgf
;;tRNA;29937;30011;9;gaa
;;tRNA;30021;30094;6;gga
;;tRNA;30101;30176;5;gta
;;tRNA;30182;30258;16;gac
;;tRNA;30275;30350;4;aac
;;tRNA;30355;30429;4;aca
;;tRNA;30434;30518;15;tac
;;tRNA;30534;30617;14;cta
;;tRNA;30632;30708;7;aga
;;tRNA;30716;30791;11;caa
;;tRNA;30803;30878;6;aaa
;;tRNA;30885;30973;3;tca
;;tRNA;30977;31052;9;ttc
;;tRNA;31062;31138;8;atgj
;;tRNA;31147;31223;21;atgi
;;tRNA;31245;31321;6;cca
;;tRNA;31328;31404;4;cac
;;tRNA;31409;31482;25;tgc
;;tRNA;31508;31596;13;tta
;;tRNA;31610;31685;15;atgf
;;tRNA;31701;31775;9;gaa
;;tRNA;31785;31858;6;gga
;;tRNA;31865;31940;5;gta
;;tRNA;31946;32022;16;gac
;;tRNA;32039;32114;4;aac
;;tRNA;32119;32193;4;aca
;;tRNA;32198;32282;15;tac
;;tRNA;32298;32381;11;cta
;;tRNA;32393;32467;13;ggc
;;tRNA;32481;32557;7;aga
;;tRNA;32565;32640;11;caa
;;tRNA;32652;32727;6;aaa
;;tRNA;32734;32822;3;tca
;;tRNA;32826;32901;9;ttc
;;tRNA;32911;32987;8;atgj
;;tRNA;32996;33072;21;atgi
;;tRNA;33094;33170;6;cca
;;tRNA;33177;33253;9;cac
;;tRNA;33263;33338;21;aaa
;;tRNA;33360;33433;6;tgc
;;tRNA;33440;33516;10;cgt
;;tRNA;33527;33602;162;gta
fin;;CDS;33765;34016;;
deb;;CDS;34042;34455;249;
;;rRNA;34705;36211;196;1507
;;rRNA;36408;39324;78;2917
;;rRNA;39403;39519;402;117
deb;comp;CDS;39922;40113;348;
;;rRNA;40462;41968;196;1507
;;rRNA;42165;45081;78;2917
;;rRNA;45160;45276;180;117
fin;;CDS;45457;47394;;
deb;;CDS;101428;102144;276;
;;rRNA;102421;103927;54;1507
;;tRNA;103982;104057;114;gca
;;rRNA;104172;107096;41;2925
;;tRNA;107138;107211;11;gga
;;rRNA;107223;107339;99;117
fin;comp;CDS;107439;108617;;
deb;;CDS;111345;111884;431;
;;rRNA;112316;113822;54;1507
;;tRNA;113877;113952;114;gca
;;rRNA;114067;116982;193;2916
;;rRNA;117176;117292;5;117
;;tRNA;117298;117386;9;tta
;;tRNA;117396;117472;123;atgi
;;rRNA;117596;119102;54;1507
;;tRNA;119157;119232;114;gca
;;rRNA;119347;122263;193;2917
;;rRNA;122457;122573;5;117
;;tRNA;122579;122667;9;tta
;;tRNA;122677;122753;123;atgi
;;rRNA;122877;124383;54;1507
;;tRNA;124438;124513;114;gca
;;rRNA;124628;127549;78;2922
;;rRNA;127628;127744;100;117
fin;;CDS;127845;129260;;
deb;;CDS;157173;157352;467;
;;regulatory;157820;157903;46;
fin;;CDS;157950;158441;;
deb;comp;CDS;215388;216260;264;
;;rRNA;216525;218030;123;1506
;;tRNA;218154;218229;152;gca
;;rRNA;218382;221296;50;2915
;;tRNA;221347;221420;12;gga
;;rRNA;221433;221549;109;117
deb;;CDS;221659;221940;525;
;;rRNA;222466;223972;196;1507
;;rRNA;224169;227083;144;2915
;;rRNA;227228;227344;228;117
fin;;CDS;227573;227989;;
deb;;CDS;349139;349594;119;
;;tmRNA;349714;350063;508;
fin;;CDS;350572;351813;;
deb;;CDS;449964;450266;253;
;;rRNA;450520;452026;196;1507
;;rRNA;452223;455139;144;2917
;;rRNA;455284;455400;112;117
fin;comp;CDS;455513;456616;;
deb;;CDS;498418;499074;189;
;;rRNA;499264;500770;118;1507
;;tRNA;500889;500964;95;gca
;;rRNA;501060;503976;144;2917
;;rRNA;504121;504237;131;117
fin;;CDS;504369;504551;;
deb;;CDS;535194;536090;85;
;;ncRNA;536176;536362;27;
fin;comp;CDS;536390;537400;;
deb;;CDS;546886;550416;41;
;comp;tRNA;550458;550544;138;ttg
fin;;CDS;550683;553325;;
deb;;CDS;608009;608683;195;
;;tRNA;608879;608975;37;tga
fin;comp;CDS;609013;609732;;
deb;;CDS;664519;665208;281;
;;regulatory;665490;665566;155;
fin;;CDS;665722;667788;;
deb;;CDS;815939;816655;71;
;;tRNA;816727;816800;12;tgc
;;tRNA;816813;816888;3;aac
;;tRNA;816892;816966;285;aca
fin;;CDS;817252;818727;;
deb;;CDS;871627;872337;134;
;;regulatory;872472;872649;13;
fin;;CDS;872663;873685;;
deb;;CDS;982641;983897;103;
;;regulatory;984001;984104;104;
fin;;CDS;984209;985012;;
deb;;CDS;1284870;1288097;111;
;;tRNA;1288209;1288297;426;cta
fin;;CDS;1288724;1290853;;
deb;;CDS;1445161;1445664;135;
;;tRNA;1445800;1445868;258;other
fin;;CDS;1446127;1446813;;
deb;comp;CDS;2027435;2028427;53;
;comp;regulatory;2028481;2028580;345;
fin;;CDS;2028926;2029534;;
deb;comp;CDS;2147128;2147418;106;
;comp;regulatory;2147525;2147625;50;
fin;comp;CDS;2147676;2148425;;
deb;comp;CDS;2251779;2252747;98;
;comp;regulatory;2252846;2252890;465;
fin;;CDS;2253356;2254267;;
deb;;CDS;2267513;2267698;306;
;comp;tRNA;2268005;2268088;404;cta
fin;;CDS;2268493;2269758;;
deb;comp;CDS;2360030;2361127;237;
;comp;regulatory;2361365;2361480;190;
fin;comp;CDS;2361671;2362552;;
deb;comp;CDS;2523189;2523929;207;
;comp;regulatory;2524137;2524320;75;
fin;comp;CDS;2524396;2525256;;
deb;comp;CDS;2548808;2552788;57;
;comp;regulatory;2552846;2552929;39;
;comp;regulatory;2552969;2553052;39;
;comp;regulatory;2553092;2553175;39;
;comp;regulatory;2553215;2553298;63;
fin;comp;CDS;2553362;2554816;;
deb;comp;CDS;2701048;2701620;93;
;comp;regulatory;2701714;2701815;171;
fin;comp;CDS;2701987;2702790;;
deb;comp;CDS;2732519;2732845;274;
;comp;regulatory;2733120;2733211;363;
fin;comp;CDS;2733575;2735470;;
deb;comp;CDS;2850976;2851347;95;
;comp;regulatory;2851443;2851563;450;
fin;comp;CDS;2852014;2853708;;
deb;comp;CDS;3090637;3091464;131;
;comp;ncRNA;3091596;3091935;54;
fin;comp;CDS;3091990;3093003;;
deb;;CDS;3094098;3094784;40;
;comp;rRNA;3094825;3094941;78;117
;comp;rRNA;3095020;3097936;194;2917
;comp;rRNA;3098131;3099637;276;1507
fin;comp;CDS;3099914;3101161;;
deb;;CDS;3159922;3160827;37;
;comp;tRNA;3160865;3160956;120;agc
fin;comp;CDS;3161077;3161376;;
deb;comp;CDS;3274188;3274733;245;
;comp;rRNA;3274979;3275095;12;117
;comp;tRNA;3275108;3275181;107;gga
;comp;rRNA;3275289;3278214;137;2926
;comp;rRNA;3278352;3279858;253;1507
fin;comp;CDS;3280112;3280690;;
deb;comp;CDS;3299331;3300842;101;
;comp;regulatory;3300944;3301122;20;
fin;comp;CDS;3301143;3301745;;
deb;comp;CDS;3303104;3304150;124;
;comp;regulatory;3304275;3304459;96;
;comp;rRNA;3304556;3304672;11;117
;comp;tRNA;3304684;3304758;116;aca
;comp;rRNA;3304875;3307789;196;2915
;comp;rRNA;3307986;3309492;364;1507
fin;;CDS;3309857;3310504;;
deb;comp;CDS;3368437;3369900;236;
;comp;regulatory;3370137;3370238;63;
fin;comp;CDS;3370302;3370706;;
deb;comp;CDS;3407639;3408244;120;
;comp;regulatory;3408365;3408485;61;
fin;comp;CDS;3408547;3409716;;
deb;comp;CDS;3420136;3421329;134;
;comp;regulatory;3421464;3421568;139;
fin;;CDS;3421708;3422217;;
deb;comp;CDS;3438683;3439531;142;
;comp;tRNA;3439674;3439750;7;aga
;comp;tRNA;3439758;3439832;9;ggc
;comp;tRNA;3439842;3439918;5;gac
;comp;tRNA;3439924;3439999;8;gta
;comp;tRNA;3440008;3440082;5;gaa
;comp;rRNA;3440088;3440204;40;117
;comp;rRNA;3440245;3443168;112;2924
;comp;tRNA;3443281;3443356;109;gca
;comp;rRNA;3443466;3444972;138;1507
;comp;tRNA;3445111;3445187;13;atgj
;comp;tRNA;3445201;3445276;6;ttc
;comp;tRNA;3445283;3445359;6;atc
;comp;tRNA;3445366;3445442;31;cca
;comp;tRNA;3445474;3445549;11;tgg
;comp;tRNA;3445561;3445637;6;atgi
;comp;tRNA;3445644;3445720;6;cca
;comp;tRNA;3445727;3445817;11;agc
;comp;tRNA;3445829;3445917;6;tca
;comp;tRNA;3445924;3445999;12;aaa
;comp;tRNA;3446012;3446087;6;caa
;comp;tRNA;3446094;3446170;19;aga
;comp;tRNA;3446190;3446263;11;gga
;comp;tRNA;3446275;3446359;4;tac
;comp;tRNA;3446364;3446438;4;aca
;comp;tRNA;3446443;3446518;31;aac
;comp;tRNA;3446550;3446625;16;aac
;comp;tRNA;3446642;3446718;5;gac
;comp;tRNA;3446724;3446799;6;gta
;comp;tRNA;3446806;3446879;9;gga
;comp;tRNA;3446889;3446963;15;gaa
;comp;tRNA;3446979;3447054;13;atgf
;comp;tRNA;3447068;3447156;5;tta
;comp;rRNA;3447162;3447278;213;117
;comp;rRNA;3447492;3450406;196;2915
;comp;rRNA;3450603;3452109;239;1507
fin;comp;CDS;3452349;3452552;;
deb;comp;CDS;3479880;3480509;30;
;comp;regulatory;3480540;3480623;335;
fin;comp;CDS;3480959;3484165;;
deb;comp;CDS;3523330;3524046;129;
;comp;tRNA;3524176;3524251;8;gta
;comp;tRNA;3524260;3524334;20;gaa
;comp;tRNA;3524355;3524430;10;aaa
;comp;tRNA;3524441;3524515;10;aca
;comp;tRNA;3524526;3524602;7;gac
;comp;tRNA;3524610;3524685;9;gta
;comp;tRNA;3524695;3524769;5;gaa
;comp;tRNA;3524775;3524850;289;aaa
fin;;CDS;3525140;3526039;;
deb;comp;CDS;3549752;3549886;0;
&lt;/pre&gt;

===cdc===
====cdc opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_opérons|cdc opérons]]
&lt;pre&gt;
28.6%GC;11.9.19 Paris;16s  10 ;83 aas;doubles;intercalaires;CDS;cds pbs;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Peptoclostridium difficile CD196;;;;;;;;;;;
dir    ;9857..10630;;cds;;179;179;774;;258;;SigB/SigF/SigG family RNA polymerase sigma factor
dir    ;10810..12317;;16s;;52;;1508;;;;
dir    ;12370..12445;;gca;;249;;76;;;;
dir    ;12695..15596;;23s;;111;;2902;;;;
dir    ;15708..15824;;5s;;126;126;117;;;126;
dir    ;15951..16460;;cds;;;;510;;170;;transcription repressor NadR
;;;;;;;;;;;
dir   ;19402..19857;;cds;;0;0;456;;152;0;nucleoside deaminase
dir   ;19858..19949;;tcc;;37;;92;;;;
dir   ;19987..20251;;ncRNA;@1;76;76;265;;;;
dir   ;20328..21965;;cds;;;;1638;;546;;DNA polymerase III subunit gamma/tau
;;;;;;;;;;;
comp;23419..24624;;cds;;505;*505;1206;;402;;glycosyl transferase
dir    ;25130..26637;;16s;;279;;1508;;;;
dir    ;26917..29816;;23s;+;180;;2900;;;;
dir    ;29997..30113;;5s;3 aaa;6;;117;;;;
dir    ;30120..30194;;aac;3 gta;6;;75;6;;;
dir    ;30201..30286;;tta;;15;;86;15;;;
dir    ;30302..30377;;atgf;;7;;76;7;;;
dir    ;30385..30459;;gaa;;9;;75;9;;;
dir    ;30469..30542;;gga;;5;;74;5;;;
dir    ;30548..30623;;gta;;5;;76;5;;;
dir    ;30629..30705;;gac;;9;;77;9;;;
dir    ;30715..30789;;aca;;14;;75;14;;;
dir    ;30804..30888;;tac;;8;;85;8;;;
dir    ;30897..30980;;cta;;29;;84;29;;;
dir    ;31010..31086;;aga;;7;;77;7;;;
dir    ;31094..31169;;caa;;88;;76;88;;;
dir    ;31258..31346;;tca;;3;;89;3;;;
dir    ;31350..31425;;ttc;;6;;76;6;;;
dir    ;31432..31508;;atgj;;11;;77;11;;;
dir    ;31520..31596;;atgi;;23;;77;23;;;
dir    ;31620..31696;;cca;;7;;77;7;;;
dir    ;31704..31780;;cac;;8;;77;8;;;
dir    ;31789..31864;;aaa;;7;;76;7;;;
dir    ;31872..31945;;tgc;;6;;74;6;;;
dir    ;31952..32026;;aac;;5;;75;5;;;
dir    ;32032..32117;;tta;;15;;86;15;;;
dir    ;32133..32208;;atgf;;7;;76;7;;;
dir    ;32216..32290;;gaa;;9;;75;9;;;
dir    ;32300..32373;;gga;;5;;74;5;;;
dir    ;32379..32454;;gta;;5;;76;5;;;
dir    ;32460..32536;;gac;;9;;77;9;;;
dir    ;32546..32620;;aca;;14;;75;14;;;
dir    ;32635..32719;;tac;;9;;85;9;;;
dir    ;32729..32812;;cta;;23;;84;23;;;
dir    ;32836..32910;;ggc;;24;;75;24;;;
dir    ;32935..33011;;aga;;9;;77;9;;;
dir    ;33021..33096;;caa;;8;;76;8;;;
dir    ;33105..33180;;aaa;;2;;76;2;;;
dir    ;33183..33271;;tca;;3;;89;3;;;
dir    ;33275..33350;;ttc;;6;;76;6;;;
dir    ;33357..33433;;atgj;;11;;77;11;;;
dir    ;33445..33521;;atgi;;17;;77;17;;;
dir    ;33539..33615;;cac;;8;;77;8;;;
dir    ;33624..33699;;aaa;;7;;76;7;;;
dir    ;33707..33780;;tgc;;7;;74;7;;;
dir    ;33788..33864;;cgt;;12;;77;12;;;
dir    ;33877..33952;;gta;;75;75;76;;;75;
dir    ;34028..34441;;cds;;308;308;414;;138;;hp
dir    ;34750..38181;;cds;;;;3432;;1144;;pyruvate carboxylase
;;;;;;;;;;;
dir    ;127011..127715;;cds;;281;281;705;;235;;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD
dir    ;127997..129505;;16s;;279;;1509;;;;
dir    ;129785..132685;;23s;+;131;;2901;;;;
dir    ;132817..132933;;5s;2 cca;6;;117;;;;
dir    ;132940..133014;;aac;;4;;75;4;;;
dir    ;133019..133093;;gaa;;5;;75;5;;;
dir    ;133099..133174;;gta;;5;;76;5;;;
dir    ;133180..133256;;gac;;10;;77;10;;;
dir    ;133267..133341;;aca;;14;;75;14;;;
dir    ;133356..133440;;tac;;9;;85;9;;;
dir    ;133450..133523;;gga;;10;;74;10;;;
dir    ;133534..133610;;aga;;9;;77;9;;;
dir    ;133620..133695;;caa;;11;;76;11;;;
dir    ;133707..133782;;aaa;;2;;76;2;;;
dir    ;133785..133873;;tca;;17;;89;17;;;
dir    ;133891..133981;;agc;;8;;91;8;;;
dir    ;133990..134066;;cca;;85;;77;85;;;
dir    ;134152..134227;;tgg;;60;;76;60;;;
dir    ;134288..134364;;cca;;6;;77;6;;;
dir    ;134371..134447;;atc;;3;;77;3;;;
dir    ;134451..134526;;ttc;;7;;76;7;;;
dir    ;134534..134610;;atgj;;114;;77;;;;
dir    ;134725..136115;;16s;;68;;1391;;;;
dir    ;136184..136259;;gca;;271;;76;;;;
dir    ;136531..139430;;23s;;126;;2900;;;;
dir    ;139557..139673;;5s;;213;213;117;;;213;
comp;139887..141071;;cds;;372;*372;1185;;395;;pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase
dir    ;141444..143795;;cds;;21;21;2352;;784;;anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase
dir    ;143817..144356;;cds;;776;*776;540;;180;;anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein
dir    ;145133..146640;;16s;;52;;1508;;;;
dir    ;146693..146768;;gca;;373;;76;;;;
dir    ;147142..150041;;23s;;126;;2900;;;;
dir    ;150168..150284;;5s;;7;;117;7;;;
dir    ;150292..150366;;aac;;5;;75;5;;;
dir    ;150372..150457;;tta;;15;;86;15;;;
dir    ;150473..150548;;atgf;;7;;76;7;;;
dir    ;150556..150630;;gaa;;14;;75;14;;;
dir    ;150645..150718;;gga;;5;;74;5;;;
dir    ;150724..150799;;gta;;5;;76;5;;;
dir    ;150805..150881;;gac;;10;;77;10;;;
dir    ;150892..150966;;ggc;;9;;75;9;;;
dir    ;150976..151049;;aga;;975;*975;74;;;;
dir    ;152025..152864;;cds;;;;840;;280;;TIGR00159 family protein
;;;;;;;;;;;
dir   ;378341..380728;;cds;;583;*583;2388;;796;;cadmium-translocating P-type ATPase
dir   ;381312..382819;;16s;;311;;1508;;;;
dir   ;383131..386030;;23s;;126;;2900;;;;
dir   ;386157..386273;;5s;;177;177;117;;;177;
dir   ;386451..387059;;cds;;;;609;;203;;DedA family protein
;;;;;;;;;;;
comp;833130..833894;;cds;;258;258;765;;255;;DeoR/GlpR transcriptional regulator
dir    ;834153..834243;;agc;;87;87;91;;;87;
dir    ;834331..835119;;cds;;;;789;;263;;flagellar motor protein
;;;;;;;;;;;
dir    ;1089165..1090139;;cds;;239;239;975;;325;239;Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase
dir    ;1090379..1091886;;16s;;320;;1508;;;;
dir    ;1092207..1095106;;23s;;91;;2900;;;;
dir    ;1095198..1095271;;gga;@2;8;;74;;;;
dir    ;1095280..1095396;;5s;;273;273;117;;;;
dir    ;1095670..1097688;;cds;;;;2019;;673;;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
;;;;;;;;;;;
comp;1181549..1182958;;cds;;1374;*1374;1410;;470;;MBOAT family protein
comp;1184333..1184415;;ttg;;318;318;83;;;318;
dir    ;1184734..1187382;;cds;;;;2649;;883;;DNA polymerase I
;;;;;;;;;;;
dir   ;1835768..1837498;;cds;;109;109;1731;;577;109;Na+/H+ antiporter NhaC family protein
dir   ;1837608..1837688;;cta;;231;231;81;;;;
&lt;dir   ;1837920..1838093;;cds;;;;174;;58;;HXXEE domain-containing protein
;;;;;;;;;;;
dir   ;2981767..2982444;;cds;;159;159;678;;226;159;sortase SrtB
comp;2982604..2982678;;aca;@3;94;;75;;;;
comp;2982773..2985672;;23s;;184;;2900;;;;
comp;2985857..2987364;;16s;;340;340;1508;;;;
dir   ;2987705..2988643;;cds;;;;939;;313;;delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase
;;;;;;;;;;;
comp;3787361..3788431;;cds;;454;*454;1071;;357;;ABC transporter ATP-binding protein
comp;3788886..3789002;;5s;;126;;117;;;;
comp;3789129..3792028;;23s;;281;;2900;;;;
comp;3792310..3793817;;16s;;191;191;1508;;;191;
comp;3794009..3794587;;cds;;;;579;;193;;bifunctional precorrin-2 dehydrogenase/sirohydrochlorin ferrochelatase
;;;;;;;;;;;
comp;3944262..3944453;;cds;;119;119;192;;64;119;DUF378 domain-containing protein
comp;3944573..3944689;;5s;;126;;117;;;;
comp;3944816..3947715;;23s;;217;;2900;;;;
comp;3947933..3949440;;16s;;282;282;1508;;;;
comp;3949723..3950004;;cds;;221;221;282;;94;;hp
comp;3950226..3951755;;cds;;;;1530;;510;;lysine--tRNA ligase
;;;;;;;;;;;
dir    ;4084445..4085437;;cds;;382;*382;993;;331;;DNA replication protein DnaC
comp;4085820..4085894;;aca;;33;;75;;;;
comp;4085928..4086003;;gta;;4;;76;;;;
comp;4086008..4086082;;gaa;;6;;75;;;;
comp;4086089..4086164;;aaa;;326;326;76;;;326;
comp;4086491..4087780;;cds;;;;1290;;430;;adenylosuccinate synthase
&lt;/pre&gt;

====cdc cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_cumuls|cdc cumuls]]
&lt;pre&gt;
cdc cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;10;1;;0;1;1;1;1;100;3
;16 23 5s 0;3;20;2;61;50;1;20;0;200;5
;16 gca 235;3;40;1;4;100;3;40;0;300;7
;16 23 5s a;2;60;;1;150;3;60;0;400;5
;max a;43;80;;0;200;4;80;1;500;3
;a doubles;2;100;;2;250;4;100;1;600;3
;autres;2;120;;0;300;4;120;2;700;1
;total aas;75;140;;0;350;4;140;1;800;2
sans ;opérons;5;160;;0;400;2;160;1;900;1
;1 aa;4;180;;0;450;0;180;1;1000;0
;max a;4;200;;0;500;1;200;1;1100;0
;a doubles;0;;;0;;5;;4;;1
;total aas;8;;3;68;;32;;13;;31
total aas;;83;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;14;12;;313;;165;;378
;;;variance;;15;;283;;94;;259
sans jaune;;;moyenne;;9;;206;;;;286
;;;variance;;5;;107;;;;144
&lt;/pre&gt;

====cdc blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_blocs|cdc blocs]]
&lt;pre&gt;
7.11.19 Tanger;;;;;;;;;;;;;;
cdc blocs;groupes;;types;;;;absents;;;;;;;
;cds;281;I;;;;;II;;III;;IV;IV1;IV2
IV2;16s;279;;;;;;;;;;;;
;23s;131;CDS;583;454;119;;cds;239;;;;;
;5s;6;16s;311;126;126;;16s;320;cds;159;cds;505;281
;aac;4;23s;126;281;217;;23s;91;aca;94;16s;279;279
;**16aas;3;5s;177;191;282;;gga;8;23s;184;23s;180;131
;ttc;7;CDS;;;;;5s;273;16s;340;5s;6;6
;atgj;114;;;;;;cds;;cds;;aac;6;4
VIII1;16s;68;;;;;;;;;;;;
;gca;271;;;;;;V;;V2;VI;VI1;VII;VII1
;23s;126;;;;;;;;;;;;
;5s;213;;;;;;;;;;;;
;cds;372;;;;;;;;;;;;
;cds;21;;;;;;VIII;VIII1;IX;;X;X1;
;cds;776;;;;;;;;;;cds;21;
X1;16s;52;;;;;;atgj;114;cds;179;cds;776;
;gca;373;;;;;;16s;68;16s;52;16s;52;
;23s;126;;;;;;gca;271;gca;249;gca;373;
;5s;7;;;;;;23s;126;23s;111;23s;126;
;aac;5;;;;;;5s;213;5s;126;5s;7;
;**7aas;9;;;;;;cds;372;cds;;aac;5;
;aga;975;;;;;;;;;;;;
;cds;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====cdc distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_distribution|cdc distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;avant 5s;atgi;2;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;gga 1;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;aca 1;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2
atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;atc;1;acc;2;aac;2;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;2
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;3;tca;3;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;4;aga;4
cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;3;caa;3;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;;gaa;4;gga;4
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
cdc;;4 *;;;;;4;;cdc;4;;;;;;4;;;;;;;;;;;cdc;;;2 *;70;;3;75
&lt;/pre&gt;
====cdc données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_données_intercalaires|cdc données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cdc;fx;fc;cdc;fx40;fc40;cdc;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;1;0;0;37;0;0;37;-1;;59;0;258;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;suite;contig
;0;10;3;242;1;0;52;-2;;0;75;318;3* 55;;gca;6;;aac;4;;aac
;0;20;0;311;2;0;55;-3;;1;975;159;tRNA 16s;;;15;;tta;5;;gaa
;0;30;0;210;3;1;21;-4;1;44;87;382;116;;atgj;7;;atgf;5;;gta
;0;40;1;134;4;2;26;-5;;0;1374;;tRNA 23s;;;9;;gaa;10;;gac
;0;50;2;79;5;0;15;-6;;0;109;;250;;gca;5;;gga;14;;aca
;0;60;7;80;6;0;6;-7;;16;150;;272;;;5;;gta;9;;tac
;0;70;7;66;7;0;11;-8;;61;242;;374;;;9;;gac;10;;gga
;1;80;10;68;8;0;12;-9;;0;326;;23s tRNA;;;14;;aca;9;;aga
;1;90;17;63;9;0;20;-10;;3;CDS 16s;;92;;gga;8;;tac;11;;caa
;0;100;17;67;10;0;24;-11;;30;181;507;95;;aca;29;;cta;2;;aaa
;1;110;13;85;11;0;35;-12;;0;283;342;5s tRNA;;;7;;aga;17;;tca
;0;120;25;74;12;0;45;-13;;7;778;;2* 6;;aac;88;;caa;8;;agc
;0;130;22;55;13;0;25;-14;;17;585;;7;;aac;3;;tca;85;;cca
;0;140;20;44;14;0;41;-15;;0;241;;tRNA 5s;;;6;;ttc;60;;tgg
;1;150;16;50;15;0;30;-16;;2;193;;8;;gga;14;;atgj;6;;cca
1;0;160;25;41;16;0;26;-17;;12;284;;tRNA tRNA;;;23;;atgi;3;;atc
;0;170;23;34;17;0;35;-18;;0;23s 5s;;33;;aca;7;;cca;7;;ttc
;0;180;19;39;18;0;29;-19;;1;114;;4;;gta;8;;cac;**;;atgj
;0;190;24;46;19;0;21;-20;;8;181;;6;;gaa;7;;aaa;5;;aac
;0;200;13;39;20;0;24;-21;;0;132;;**;;aaa;6;;tgc;15;;tta
;0;210;20;29;21;0;25;-22;;0;5* 127;;;;;5;;aac;7;;atgf
;0;220;27;40;22;0;18;-23;;5;16s 23s;;;;;15;;tta;14;;gaa
;0;230;16;32;23;0;24;-24;;1;2* 283;;;;;7;;atgf;5;;gga
;0;240;8;27;24;0;22;-25;;1;315;;;;;9;;gaa;5;;gta
;1;250;12;28;25;0;22;-26;;5;324;;;;;5;;gga;10;;gac
1;0;260;18;32;26;0;17;-27;;0;188;;;;;5;;gta;9;;ggc
;0;270;19;31;27;0;18;-28;;0;285;;;;;9;;gac;**;;aga
;0;280;16;22;28;0;23;-29;;6;221;;;;;14;;aca;;;
;0;290;12;34;29;0;23;-30;;0;5s CDS;;;;;9;;tac;;;
;0;300;14;24;30;0;18;-31;;0;126;213;;;;23;;cta;;;
;0;310;8;24;31;0;21;-32;;5;177;;;;;24;;ggc;;;
1;0;320;14;24;32;0;17;-33;;0;273;;;;;9;;aga;;;
;1;330;12;24;33;0;12;-34;;0;454;;;;;8;;caa;;;
;0;340;13;17;34;0;12;-35;;1;119;;;;;2;;aaa;;;
;0;350;6;15;35;0;18;-36;;0;;;;;;3;;tca;;;
;0;360;11;15;36;0;14;-37;;1;;;;;;6;;ttc;;;
;0;370;9;17;37;0;10;-38;;0;;;;;;14;;atgj;;;
;0;380;6;16;38;0;11;-39;;0;;;;;;17;;atgi;;;
1;0;390;7;16;39;0;10;-40;;1;;;;;;8;;cac;;;
;0;400;3;12;40;1;9;-41;;0;;;;;;7;;aaa;;;
;2;reste;125;246;reste;636;1655;-42;;0;;;;;;7;;tgc;;;
4;9;total;640;2589;total;640;2589;-43;;0;;;;;;12;;cgt;;;
4;6;diagr;515;2306;diagr;4;897;-44;;1;;;;;;**;;gta;;;
0;0; t30;3;763;;;;-45;;0;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;3;;;;;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;;;;;;
;x;640;2;0;642;;;-49;;0;;;;;;;;;;;
;c;2552;296;37;2885;;;-50;;0;;;;;;;;;;;
;;;;;3527;282;;reste;1;5;;;;;;;;;;;
;;;;;;3809;;total;2;296;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====cdc autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_autres_intercalaires_aas|cdc autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cdc;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;9857;10630;181;*;
;;rRNA;10812;12314;55;*;1503
;;tRNA;12370;12445;250;*;gca
;;rRNA;12696;15593;114;*;2898
;;rRNA;15708;15824;126;*;117
fin;;CDS;15951;16460;;;
deb;;CDS;16472;17353;126;*;
;;misc_b;17480;17686;124;*;
fin;;CDS;17811;19082;;;
deb;;CDS;19402;19857;0;*;
;;tRNA;19858;19949;37;*;tcc
;;ncRNA;19987;20251;76;*;
fin;;CDS;20328;21965;;;
deb;comp;CDS;23419;24624;507;*;
;;rRNA;25132;26634;283;*;1503
;;rRNA;26918;29815;181;*;2898
;;rRNA;29997;30113;6;*;117
;;tRNA;30120;30194;6;*;aac
;;tRNA;30201;30286;15;*;tta
;;tRNA;30302;30377;7;*;atgf
;;tRNA;30385;30459;9;*;gaa
;;tRNA;30469;30542;5;*;gga
;;tRNA;30548;30623;5;*;gta
;;tRNA;30629;30705;9;*;gac
;;tRNA;30715;30789;14;*;aca
;;tRNA;30804;30888;8;*;tac
;;tRNA;30897;30980;29;*;cta
;;tRNA;31010;31086;7;*;aga
;;tRNA;31094;31169;88;*;caa
;;tRNA;31258;31346;3;*;tca
;;tRNA;31350;31425;6;*;ttc
;;tRNA;31432;31505;14;*;atgj
;;tRNA;31520;31596;23;*;atgi
;;tRNA;31620;31696;7;*;cca
;;tRNA;31704;31780;8;*;cac
;;tRNA;31789;31864;7;*;aaa
;;tRNA;31872;31945;6;*;tgc
;;tRNA;31952;32026;5;*;aac
;;tRNA;32032;32117;15;*;tta
;;tRNA;32133;32208;7;*;atgf
;;tRNA;32216;32290;9;*;gaa
;;tRNA;32300;32373;5;*;gga
;;tRNA;32379;32454;5;*;gta
;;tRNA;32460;32536;9;*;gac
;;tRNA;32546;32620;14;*;aca
;;tRNA;32635;32719;9;*;tac
;;tRNA;32729;32812;23;*;cta
;;tRNA;32836;32910;24;*;ggc
;;tRNA;32935;33011;9;*;aga
;;tRNA;33021;33096;8;*;caa
;;tRNA;33105;33180;2;*;aaa
;;tRNA;33183;33271;3;*;tca
;;tRNA;33275;33350;6;*;ttc
;;tRNA;33357;33430;14;*;atgj
;;tRNA;33445;33521;17;*;atgi
;;tRNA;33539;33615;8;*;cac
;;tRNA;33624;33699;7;*;aaa
;;tRNA;33707;33780;7;*;tgc
;;tRNA;33788;33864;12;*;cgt
;;tRNA;33877;33952;75;*;gta
fin;;CDS;34028;34441;;;
deb;;CDS;72345;72830;94;*;
;;misc_b;72925;73133;63;*;
fin;;CDS;73197;74912;;;
deb;;CDS;90506;91204;51;*;
;;misc_f;91256;91384;42;*;
fin;;CDS;91427;91933;;;
deb;;CDS;127011;127715;283;*;
;;rRNA;127999;129502;283;*;1504
;;rRNA;129786;132684;132;*;2899
;;rRNA;132817;132933;6;*;117
;;tRNA;132940;133014;4;*;aac
;;tRNA;133019;133093;5;*;gaa
;;tRNA;133099;133174;5;*;gta
;;tRNA;133180;133256;10;*;gac
;;tRNA;133267;133341;14;*;aca
;;tRNA;133356;133440;9;*;tac
;;tRNA;133450;133523;10;*;gga
;;tRNA;133534;133610;9;*;aga
;;tRNA;133620;133695;11;*;caa
;;tRNA;133707;133782;2;*;aaa
;;tRNA;133785;133873;17;*;tca
;;tRNA;133891;133981;8;*;agc
;;tRNA;133990;134066;85;*;cca
;;tRNA;134152;134227;60;*;tgg
;;tRNA;134288;134364;6;*;cca
;;tRNA;134371;134447;3;*;atc
;;tRNA;134451;134526;7;*;ttc
;;tRNA;134534;134610;116;*;atgj
;;rRNA;134727;136128;55;*;1402
;;tRNA;136184;136259;272;*;gca
;;rRNA;136532;139429;127;*;2898
;;rRNA;139557;139673;213;*;117
fin;comp;CDS;139887;141071;;0;
deb;;CDS;143817;144356;778;*;
;;rRNA;145135;146637;55;*;1503
;;tRNA;146693;146768;374;*;gca
;;rRNA;147143;150040;127;*;2898
;;rRNA;150168;150284;7;*;117
;;tRNA;150292;150366;5;*;aac
;;tRNA;150372;150457;15;*;tta
;;tRNA;150473;150548;7;*;atgf
;;tRNA;150556;150630;14;*;gaa
;;tRNA;150645;150718;5;*;gga
;;tRNA;150724;150799;5;*;gta
;;tRNA;150805;150881;10;*;gac
;;tRNA;150892;150966;9;*;ggc
;;tRNA;150976;151049;975;*;aga
fin;;CDS;152025;152864;;;
deb;comp;CDS;171557;172066;188;*;
;;regulatory;172255;172358;136;*;
fin;;CDS;172495;173688;;;
deb;;CDS;193614;194780;59;*;
;;regulatory;194840;194957;124;*;
fin;;CDS;195082;195687;;;
deb;;CDS;253195;254327;59;*;
;;regulatory;254387;254488;220;*;
fin;;CDS;254709;256244;;;
deb;;CDS;309184;310275;308;*;
;;regulatory;310584;310674;406;*;
fin;;CDS;311081;311398;;;
deb;;CDS;378341;380728;585;*;
;;rRNA;381314;382816;315;*;1503
;;rRNA;383132;386029;127;*;2898
;;rRNA;386157;386273;177;*;117
fin;;CDS;386451;387059;;0;
deb;;CDS;393173;394945;131;*;
;;regulatory;395077;395269;188;*;
fin;;CDS;395458;396210;;;
deb;comp;CDS;518815;519642;205;*;
;;regulatory;519848;519954;69;*;
fin;;CDS;520024;520344;;0;
deb;;CDS;601016;601618;560;*;
;;misc_b;602179;602417;63;*;
fin;;CDS;602481;604400;;;
deb;;CDS;703255;703989;800;*;
;;regulatory;704790;704866;264;*;
fin;;CDS;705131;706387;;;
deb;;CDS;774245;775042;343;*;
;;misc_b;775386;775620;49;*;
fin;;CDS;775670;776689;;;
deb;comp;CDS;833130;833894;258;*;
;;tRNA;834153;834243;87;*;agc
fin;;CDS;834331;835119;;;
deb;;CDS;840990;843056;591;*;
;;misc_b;843648;843858;225;*;
fin;;CDS;844084;844899;;;
deb;;CDS;1027707;1028153;147;*;
;;misc_b;1028301;1028547;123;*;
fin;;CDS;1028671;1030413;;;
deb;;CDS;1089165;1090139;241;*;
;;rRNA;1090381;1091883;324;*;1503
;;rRNA;1092208;1095105;92;*;2898
;;tRNA;1095198;1095271;8;*;gga
;;rRNA;1095280;1095396;273;*;117
fin;;CDS;1095670;1097688;;;
deb;;CDS;1140023;1140928;114;*;
;;ncRNA;1141043;1141223;182;*;
fin;;CDS;1141406;1142623;;0;
deb;comp;CDS;1181549;1182958;1374;*;
;comp;tRNA;1184333;1184415;318;*;ttg
fin;;CDS;1184734;1187382;;;
deb;;CDS;1221766;1222134;91;*;
;;regulatory;1222226;1222332;102;*;
fin;;CDS;1222435;1223640;;0;
deb;;CDS;1292920;1293819;907;*;
;;repeat_region;1294727;1295680;1216;*;
fin;;CDS;1296897;1297052;;;
deb;;CDS;1347580;1348659;142;*;
;;misc_b;1348802;1349040;67;*;
fin;;CDS;1349108;1351747;;;
deb;;CDS;1503182;1503538;530;*;
;;repeat_region;1504069;1504755;391;*;
fin;comp;CDS;1505147;1506880;;;
deb;comp;CDS;1512381;1512557;53;*;
;comp;regulatory;1512611;1512707;354;*;
fin;comp;CDS;1513062;1513736;;;
deb;;CDS;1583597;1584714;449;*;
;;regulatory;1585164;1585270;105;*;
fin;;CDS;1585376;1586341;;;
deb;;CDS;1612685;1614778;660;*;
;;repeat_region;1615439;1615732;167;*;
fin;comp;CDS;1615900;1616184;;0;
deb;;CDS;1620655;1621623;151;*;
;;misc_b;1621775;1622027;71;*;
fin;;CDS;1622099;1623307;;0;
deb;;CDS;1668527;1669288;160;*;
;;misc_b;1669449;1669706;112;*;
fin;;CDS;1669819;1670058;;;
deb;;CDS;1708973;1709134;741;*;
;;repeat_region;1709876;1710232;238;*;
fin;;CDS;1710471;1710659;;;
deb;;CDS;1710778;1711644;452;*;
;;repeat_region;1712097;1712386;122;*;
fin;;CDS;1712509;1713036;;;
deb;;CDS;1745654;1747510;82;*;
;;misc_b;1747593;1747833;65;*;
;;misc_b;1747899;1748134;84;*;
fin;;CDS;1748219;1749436;;;
deb;;CDS;1770800;1771111;92;*;
;;regulatory;1771204;1771296;99;*;
fin;;CDS;1771396;1772190;;;
deb;comp;CDS;1833191;1833988;112;*;
;comp;regulatory;1834101;1834206;91;*;
deb;comp;CDS;1834298;1835284;163;*;
;;regulatory;1835448;1835624;143;*;
deb;;CDS;1835768;1837498;109;*;
;;tRNA;1837608;1837688;896;*;cta
;;regulatory;1838585;1838689;209;*;
fin;;CDS;1838899;1839933;;;
deb;comp;CDS;1847745;1849016;646;*;
;;repeat_region;1849663;1850878;408;*;
fin;;CDS;1851287;1851574;;0;
deb;comp;CDS;1869839;1870468;364;*;
;;regulatory;1870833;1870876;100;*;
fin;;CDS;1870977;1871945;;;
deb;comp;CDS;1886422;1887495;161;*;
;comp;regulatory;1887657;1887778;188;*;
deb;;CDS;1887967;1890450;87;*;
;;regulatory;1890538;1890649;141;*;
fin;;CDS;1890791;1892092;;;
deb;;CDS;1903300;1903731;430;*;
;;misc_b;1904162;1904373;162;*;
fin;;CDS;1904536;1905825;;;
deb;;CDS;1963260;1964567;85;*;
;;misc_b;1964653;1964915;125;*;
fin;;CDS;1965041;1965844;;;
deb;;CDS;1974995;1975732;110;*;
;;misc_b;1975843;1976050;252;*;
fin;;CDS;1976303;1977502;;;
deb;;CDS;2015338;2017995;53;*;
;;regulatory;2018049;2018151;109;*;
fin;;CDS;2018261;2019526;;;
deb;comp;CDS;2142818;2143108;130;*;
;comp;regulatory;2143239;2143338;619;*;
;;regulatory;2143958;2144047;52;*;
fin;;CDS;2144100;2144276;;0;
deb;comp;CDS;2153631;2154182;150;*;
;comp;misc_b;2154333;2154596;435;*;
fin;comp;CDS;2155032;2155430;;;
deb;comp;CDS;2155785;2156270;82;*;
;comp;regulatory;2156353;2156446;556;*;
deb;comp;CDS;2157003;2157185;226;*;
;;regulatory;2157412;2157509;54;*;
fin;;CDS;2157564;2157740;;;
deb;comp;CDS;2192160;2193194;253;*;
;comp;misc_b;2193448;2193661;222;*;
fin;comp;CDS;2193884;2194648;;0;
deb;comp;CDS;2199791;2200075;110;*;
;;repeat_region;2200186;2200869;830;*;
fin;comp;CDS;2201700;2202572;;;
deb;comp;CDS;2207935;2209128;81;*;
;comp;regulatory;2209210;2209378;110;*;
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deb;comp;CDS;2274866;2276242;93;*;
;comp;regulatory;2276336;2276438;249;*;
fin;;CDS;2276688;2278034;;;
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;;misc_b;2291548;2291779;107;*;
fin;;CDS;2291887;2293368;;;
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;comp;misc_b;2434298;2434531;168;*;
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fin;;CDS;2476666;2478033;;0;
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;;regulatory;2502116;2502205;53;*;
fin;;CDS;2502259;2502435;;;
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;comp;regulatory;2525006;2525107;105;*;
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;comp;regulatory;2555970;2556080;331;*;
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;comp;regulatory;2596277;2596371;195;*;
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deb;comp;CDS;2695506;2696213;150;*;
;comp;tRNA;2696364;2696460;242;*;tga
fin;comp;CDS;2696703;2697542;;;
deb;comp;CDS;2719492;2720808;86;*;
;comp;misc_b;2720895;2721106;78;*;
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;comp;misc_b;2845859;2846099;90;*;
fin;comp;CDS;2846190;2847593;;0;
deb;comp;CDS;2854480;2857587;92;*;
;comp;misc_b;2857680;2857912;174;*;
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deb;comp;CDS;2947183;2948184;58;*;
;comp;misc_b;2948243;2948498;133;*;
fin;comp;CDS;2948632;2949822;;;
deb;comp;CDS;2957885;2958538;329;*;
;;regulatory;2958868;2958969;72;*;
fin;;CDS;2959042;2960385;;;
deb;comp;CDS;2978480;2981023;277;*;
;comp;ncRNA;2981301;2981635;131;*;
deb;;CDS;2981767;2982444;159;*;
;comp;tRNA;2982604;2982678;95;*;aca
;comp;rRNA;2982774;2985671;188;*;2898
;comp;rRNA;2985860;2987362;342;*;1503
fin;;CDS;2987705;2988643;;0;
deb;comp;CDS;3090012;3095975;123;*;
;comp;regulatory;3096099;3096184;171;*;
fin;comp;CDS;3096356;3097759;;;
deb;comp;CDS;3135811;3136473;99;*;
;comp;regulatory;3136573;3136658;185;*;
deb;comp;CDS;3136844;3139798;112;*;
;comp;regulatory;3139911;3139996;125;*;
fin;comp;CDS;3140122;3141300;;0;
deb;comp;CDS;3244007;3244435;189;*;
;;repeat_region;3244625;3246042;183;*;
fin;comp;CDS;3246226;3246492;;;
deb;comp;CDS;3274824;3275954;227;*;
;comp;regulatory;3276182;3276363;52;*;
fin;comp;CDS;3276416;3277309;;;
deb;comp;CDS;3405889;3407280;143;*;
;comp;regulatory;3407424;3407603;271;*;
fin;comp;CDS;3407875;3409527;;;
deb;comp;CDS;3489429;3490850;579;*;
;;repeat_region;3491430;3492052;252;*;
fin;comp;CDS;3492305;3494290;;;
deb;;CDS;3508604;3509509;673;*;
;comp;tmRNA;3510183;3510532;157;*;
fin;comp;CDS;3510690;3511145;;0;
deb;;CDS;3600566;3601447;77;*;
;;regulatory;3601525;3601699;172;*;
fin;;CDS;3601872;3602873;;;
deb;comp;CDS;3636881;3639547;75;*;
;comp;misc_b;3639623;3639885;300;*;
fin;comp;CDS;3640186;3641013;;;
deb;comp;CDS;3654516;3655193;579;*;
;comp;regulatory;3655773;3655856;232;*;
fin;comp;CDS;3656089;3656931;;;
deb;comp;CDS;3689422;3690501;287;*;
;;regulatory;3690789;3690904;174;*;
fin;;CDS;3691079;3692449;;0;
deb;comp;CDS;3749041;3749442;795;*;
;;regulatory;3750238;3750334;53;*;
fin;;CDS;3750388;3750564;;;
deb;comp;CDS;3787361;3788431;454;*;
;comp;rRNA;3788886;3789002;127;*;117
;comp;rRNA;3789130;3792027;285;*;2898
;comp;rRNA;3792313;3793815;193;*;1503
fin;comp;CDS;3794009;3794587;;;
deb;comp;CDS;3810367;3811866;129;*;
;comp;regulatory;3811996;3812175;66;*;
fin;comp;CDS;3812242;3812856;;;
deb;comp;CDS;3905129;3905650;161;*;
;comp;regulatory;3905812;3905897;839;*;
fin;comp;CDS;3906737;3907687;;;
deb;comp;CDS;3931996;3933933;83;*;
;comp;misc_b;3934017;3934263;65;*;
fin;comp;CDS;3934329;3934850;;;
deb;comp;CDS;3944262;3944453;119;*;
;comp;rRNA;3944573;3944689;127;*;117
;comp;rRNA;3944817;3947714;221;*;2898
;comp;rRNA;3947936;3949438;284;*;1503
fin;comp;CDS;3949723;3949917;;;
deb;;CDS;4084445;4085437;382;*;
;comp;tRNA;4085820;4085894;33;*;aca
;comp;tRNA;4085928;4086003;4;*;gta
;comp;tRNA;4086008;4086082;6;*;gaa
;comp;tRNA;4086089;4086164;326;*;aaa
fin;comp;CDS;4086491;4087780;;;
&lt;/pre&gt;

====cdc psor====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_psor|cdc psor]]
&lt;pre&gt;
cdc-psor  comparaison;;7.11.19 Tanger;;;comparaisons internes cdc, psor;;;;
cdc;intercal;psor;intercal;diff;cdc;intercal;cdc;intercal;diff
cds;505;CDS;309;;cds;505;cds;281;
16s;279;16s;196;;16s;279;16s;279;
23s;180;23s;122;;23s;180;23s;131;
5s;6;5s;5;;5s;6;5s;6;
aac;6;tta;13;;aac;6;aac;4;
tta;15;atg;15;-2;tta;15;gaa;5;
atgf;7;gaa;9;8;atgf;7;gta;5;
gaa;9;gga;6;0;gaa;9;gac;10;
gga;5;gta;5;1;gga;5;aca;14;
gta;5;gac;16;;gta;5;tac;9;0
gac;9;aac;4;;gac;9;gga;10;1
aca;14;aca;4;-10;aca;14;aga;9;0
tac;8;tac;15;7;tac;8;caa;11;
cta;29;cta;14;-15;cta;29;aaa;2;
aga;7;aga;7;0;aga;7;tca;17;2
caa;88;caa;11;;caa;88;agc;8;
tca;3;aaa;6;;tca;3;cca;85;
ttc;6;tca;3;0;ttc;6;tgg;60;
atgj;11;ttc;9;3;atgj;11;cca;6;
atgi;23;atg;8;-3;atgi;23;atc;3;
cca;7;atg;21;-2;cca;7;ttc;7;
cac;8;cca;6;-1;cac;8;atgj;114;
aaa;7;cac;4;;aaa;7;16s;;
tgc;6;tgc;25;;tgc;6;cds;776;
aac;5;tta;13;-2;aac;5;16s;52;
tta;15;atg;15;8;tta;15;gca;373;
atgf;7;gaa;9;0;atgf;7;23s;126;
gaa;9;gga;6;1;gaa;9;5s;7;
gga;5;gta;5;0;gga;5;aac;5;
gta;5;gac;16;;gta;5;tta;15;0
gac;9;aac;4;;gac;9;atgf;7;1
aca;14;aca;4;-10;aca;14;gaa;14;0
tac;9;tac;15;6;tac;9;gga;5;
cta;23;cta;11;-12;cta;23;gta;5;
ggc;24;ggc;13;-11;ggc;24;gac;10;
aga;9;aga;7;-2;aga;9;ggc;9;0
caa;8;caa;11;3;caa;8;aga;975;3
aaa;2;aaa;6;4;aaa;2;cds;;0
tca;3;tca;3;0;tca;3;;;
ttc;6;ttc;9;3;ttc;6;;;
atgj;11;atg;8;-3;atgj;11;;;
atgi;17;atg;21;;atgi;17;;;
cac;8;cca;6;;cac;8;;;
aaa;7;cac;9;1;aaa;7;;;
tgc;7;aaa;21;14;tgc;7;;;
cgt;12;tgc;6;-1;cgt;12;;;
gta;75;cgt;10;-2;gta;75;;;
cds;;gta;162;;cds;;;;
;;CDS;;;;;;;
;;;;;psor;;psor;intercal;diff
cds;776;;;;CDS;309;CDS;239;
16s;52;;;;16s;196;16s;196;
gca;373;;;;23s;122;23s;213;
23s;126;;;;5s;5;5s;5;
5s;7;atg;138;;tta;13;tta;13;0
aac;5;16s;109;;atg;15;atg;15;0
tta;15;gca;112;;gaa;9;gaa;9;0
atgf;7;23s;40;;gga;6;gga;6;0
gaa;14;5s;5;;gta;5;gta;5;0
gga;5;gaa;8;;gac;16;gac;16;0
gta;5;gta;5;0;aac;4;aac;31;
gac;10;gac;9;-1;aca;4;aac;4;
ggc;9;ggc;7;-2;tac;15;aca;4;0
aga;975;aga;142;;cta;14;tac;11;-4
cds;;CDS;;;aga;7;gga;19;5
;;;;;caa;11;aga;6;-1
cds;281;CDS;239;;aaa;6;caa;12;1
16s;279;16s;196;;tca;3;aaa;6;0
23s;131;23s;213;;ttc;9;tca;11;
5s;6;5s;5;;atg;8;agc;6;
aac;4;tta;13;;atg;21;cca;6;
gaa;5;atg;15;;cca;6;atg;11;
gta;5;gaa;9;;cac;4;tgg;31;
gac;10;gga;6;;tgc;25;cca;6;
aca;14;gta;5;;tta;13;atc;6;0
tac;9;gac;16;;atg;15;ttc;13;0
gga;10;aac;31;;gaa;9;atg;138;0
aga;9;aac;4;;gga;6;16s;;0
caa;11;aca;4;-10;gta;5;atg;138;0
aaa;2;tac;11;2;gac;16;16s;109;0
tca;17;gga;19;9;aac;4;gca;112;
agc;8;aga;6;-3;aca;4;23s;40;0
cca;85;caa;12;1;tac;15;5s;5;
tgg;60;aaa;6;4;cta;11;gaa;8;
cca;6;tca;11;-6;ggc;13;gta;5;
atc;3;agc;6;-2;aga;7;gac;9;-1
ttc;7;cca;6;;caa;11;ggc;7;1
atgj;114;atg;11;;aaa;6;aga;142;0
16s;;tgg;31;-29;tca;3;CDS;;
;;cca;6;0;ttc;9;;;
;;atc;6;3;atg;8;;;
;;ttc;13;6;atg;21;;;
;;atg;138;;cca;6;;;
;;16s;;;cac;9;;;
;;;;;aaa;21;;;
;;CDS;129;;tgc;6;;;
;;gta;8;;cgt;10;;;
;;gaa;20;;gta;162;;;
;;aaa;10;;CDS;;;;
cds;382;aca;10;;;;;;
aca;33;gac;7;;;;;;
gta;4;gta;9;5;;;;;
gaa;6;gaa;5;-1;;;;;
aaa;326;aaa;289;;;;;;
cds;;CDS;;;;;;;
;;;;;;;;;
cdc-psor  coservation des cds;;;;;fréquence des diff psor-cdc des intercalaires;;;;
cdc;intercal;psor;intercal;protéines;;gamme;fréquence;;
cds;0;CDS;3;151 – 152;;-15;2;;
tcc;37;tcc;27;;;-14;;;
ncRNA;76;ncRNA;152;547 – 546;;-13;;;
cds;;CDS;;;;-12;1;;
;;;;;;-11;1;;
cds;1374;CDS;41;470 – 1177;;-10;3;;
ttg;318;ttg;138;883 – 881;;-9;;;
cds;;CDS;;;;-8;;;
;;;;;;-7;;;
cds;109;CDS;111;577 – 1076;;-6;1;;
cta;231;cta;426;;;-5;;;
cds;;CDS;;58 – 577;;-4;;;
;;;;;;-3;3;;
cds;258;CDS;37;255 – 302;;-2;7;;
agc;87;agc;120;;;-1;4;;
cds;;CDS;;263 – 100;;0;8;;
;;;;;;1;4;;
;;CDS;306;62;;2;1;;
;;cta;404;422;;3;4;;
;;CDS;;;;4;2;;
;;;;;;5;1;;
;;CDS;135;;;6;2;;
;;other;258;;;7;1;;
;;CDS;;;;8;2;;
;;;;;;9;1;;
;;CDS;195;;;10;;;
;;tga;37;;;11;;;
;;CDS;;;;12;;;
;;;;;;13;;;
;;CDS;71;;;14;1;;
;;tgc;12;;;15;;;
;;aac;3;;;;;;
;;aca;285;;;total;49;;
;;CDS;;;;sous t.  -2+2;24;;
&lt;/pre&gt;

===cdc8===
====cdc8 opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_opérons|cdc8 opérons]]
&lt;pre&gt;
28.6%GC;11.9.19 Paris;16s  16 ;110 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;pbs;CDS dirigé;protéines
Peptoclostridium difficile M68;;;;;;;;;;;
dir   ;4299490..4300134;;cds;;214;214;;;645;;tyrosine-type recombinase/integrase
dir   ;4300349..4300807;;cds;@1;554;*554;;;459;;helix-turn-helix domain-containing protein
dir   ;4301362..4303101;;cds;;0;0;;;*1740;;hypothetical protein
dir   ;4303102..4303305;;cds;;167;167;;;204;;hp
dir   ;4303473..4304299;;23s°;;132;;;;827;;
dir   ;4304432..4304548;;5s;+;6;;;;117;;
dir   ;4304555..4304629;;aac;;4;;;4;75;;
dir   ;4304634..4304708;;gaa;2 cca;5;;;5;75;;
dir   ;4304714..4304789;;gta;;5;;;5;76;;
dir   ;4304795..4304871;;gac;;11;;;11;77;;
dir   ;4304883..4304957;;aca;;14;;;14;75;;
dir   ;4304972..4305056;;tac;;9;;;9;85;;
dir   ;4305066..4305139;;gga;;10;;;10;74;;
dir   ;4305150..4305226;;aga;;9;;;9;77;;
dir   ;4305236..4305311;;caa;;11;;;11;76;;
dir   ;4305323..4305398;;aaa;;2;;;2;76;;
dir   ;4305401..4305489;;tca;;18;;;18;89;;
dir   ;4305508..4305598;;agc;;8;;;8;91;;
dir   ;4305607..4305683;;cca;;85;;;*85;77;;
dir   ;4305769..4305844;;tgg;;60;;;*60;76;;
dir   ;4305905..4305981;;cca;;5;;;5;77;;
dir   ;4305987..4306063;;atc;;3;;;3;77;;
dir   ;4306067..4306142;;ttc;;7;;;7;76;;
dir   ;4306150..4306226;;atgj;;114;;;;77;;
dir   ;4306341..4307538;;16s;;0;0;;;1198;0;
dir   ;4307539..4308225;;cds;;100;100;;;687;;xylose isomerase
dir   ;1..796;4308325;23s°;;181;;;;796;;
dir   ;978..1094;;5s;;6;;;;117;;
dir   ;1101..1175;;aac;+;6;;;6;75;;
dir   ;1182..1267;;tta;3 aaa;15;;;15;86;;
dir   ;1283..1358;;atgf;3 gta;7;;;7;76;;
dir   ;1366..1440;;gaa;;9;;;9;75;;
dir   ;1450..1523;;gga;;5;;;5;74;;
dir   ;1529..1604;;gta;;5;;;5;76;;
dir   ;1610..1686;;gac;;9;;;9;77;;
dir   ;1696..1770;;aca;;14;;;14;75;;
dir   ;1785..1869;;tac;;10;;;10;85;;
dir   ;1880..1963;;cta;;28;;;28;84;;
dir   ;1992..2068;;aga;;7;;;7;77;;
dir   ;2076..2151;;caa;;89;;;*89;76;;
dir   ;2241..2329;;tca;;3;;;3;89;;
dir   ;2333..2408;;ttc;;6;;;6;76;;
dir   ;2415..2491;;atgj;;11;;;11;77;;
dir   ;2503..2579;;atgi;;29;;;29;77;;
dir   ;2609..2685;;cca;;7;;;7;77;;
dir   ;2693..2769;;cac;;8;;;8;77;;
dir   ;2778..2853;;aaa;;7;;;7;76;;
dir   ;2861..2934;;tgc;;6;;;6;74;;
dir   ;2941..3015;;aac;;6;;;6;75;;
dir   ;3022..3107;;tta;;15;;;15;86;;
dir   ;3123..3198;;atgf;;7;;;7;76;;
dir   ;3206..3280;;gaa;;9;;;9;75;;
dir   ;3290..3363;;gga;;5;;;5;74;;
dir   ;3369..3444;;gta;;5;;;5;76;;
dir   ;3450..3526;;gac;;9;;;9;77;;
dir   ;3536..3610;;aca;;14;;;14;75;;
dir   ;3625..3709;;tac;;9;;;9;85;;
dir   ;3719..3802;;cta;;24;;;24;84;;
dir   ;3827..3901;;ggc;;24;;;24;75;;
dir   ;3926..4002;;aga;;9;;;9;77;;
dir   ;4012..4087;;caa;;8;;;8;76;;
dir   ;4096..4171;;aaa;;2;;;2;76;;
dir   ;4174..4262;;tca;;3;;;3;89;;
dir   ;4266..4341;;ttc;;6;;;6;76;;
dir   ;4348..4424;;atgj;;11;;;11;77;;
dir   ;4436..4512;;atgi;;17;;;17;77;;
dir   ;4530..4606;;cac;;8;;;8;77;;
dir   ;4615..4690;;aaa;;7;;;7;76;;
dir   ;4698..4771;;tgc;;7;;;7;74;;
dir   ;4779..4855;;cgt;;12;;;12;77;;
dir   ;4868..4943;;gta;;75;75;;;76;75;
dir   ;5019..5432;;cds;;308;308;;;414;;hp
dir   ;5741..9172;;cds;;;;;;*3432;;pyruvate carboxylase
;;;;;;;;;;;
dir   ;94032..94736;;cds;;281;281;;;705;281;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD
dir   ;95018..95994;;16s°;;100;;;;977;;
dir   ;96095..97613;;23s°;;126;;;;1519;;
dir   ;97740..97856;;5s;;7;;;;117;;
dir   ;97864..97938;;aac;;6;;;6;75;;
dir   ;97945..98030;;tta;;15;;;15;86;;
dir   ;98046..98121;;atgf;;7;;;7;76;;
dir   ;98129..98203;;gaa;;8;;;8;75;;
dir   ;98212..98285;;gga;;4;;;4;74;;
dir   ;98290..98365;;gta;;5;;;5;76;;
dir   ;98371..98447;;gac;;10;;;10;77;;
dir   ;98458..98532;;ggc;;9;;;9;75;;
dir   ;98542..98615;;aga;;954;*954;;;74;;
dir   ;99570..100409;;cds;;;;;;840;;TIGR00159 family protein
;;;;;;;;;;;
dir   ;306829..309216;;cds;;733;;;;*2388;;cadmium-translocating P-type ATPase
&lt;&gt; comp;309950..310076;;cds;;1;1;;;127;1;glycine/sarcosine/betaine reductase complex  selenoprotein A
dir   ;310078..311313;;23s°;;126;;;;1236;;
dir   ;311440..311556;;5s;;177;177;;;117;;
dir   ;311734..312342;;cds;;;;;;609;;DedA family protein
;;;;;;;;;;;
comp;861856..862620;;cds;;258;258;;;765;;DeoR/GlpR transcriptional regulator
dir   ;862879..862969;;agc;;87;87;;;91;87;
dir   ;863057..863845;;cds;;;;;;789;;flagellar motor protein
;;;;;;;;;;;
dir    ;1106477..1107451;;cds;;238;238;;;975;238;Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase
dir    ;1107690..1109197;;16s;@2;320;;;;1508;;
dir    ;1109518..1112416;;23s;;91;;;;2899;;
dir    ;1112508..1112581;;gga;;8;;;;74;;
dir    ;1112590..1112706;;5s;;273;273;;;117;;
dir    ;1112980..1114998;;cds;;;;;;*2019;;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
;;;;;;;;;;;
comp;1196804..1198213;;cds;;1378;*1378;;;*1410;;MBOAT family protein
comp;1199592..1199674;;ttg;;318;318;;;83;318;
dir    ;1199993..1202641;;cds;;;;;;*2649;;DNA polymerase I
;;;;;;;;;;;
dir    ;1850896..1852626;;cds;;109;109;;;*1731;109;Na+/H+ antiporter NhaC family protein
dir    ;1852736..1852816;;cta;;334;334;;;81;;
dir    ;1853151..1853666;;cds;;;;;;516;;HXXEE domain-containing protein
;;;;;;;;;;;
dir    ;3024038..3024715;;cds;;150;150;;;678;150;sortase SrtB
comp;3024866..3024940;;aca;@3;93;;;;75;;
comp;3025034..3027933;;23s;;184;;;;2900;;
comp;3028118..3029625;;16s;;374;374;;;1508;;
dir    ;3030000..3030938;;cds;;;;;;939;;delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase
;;;;;;;;;;;
dir    ;3805298..3806743;;cds;;208;208;;;*1446;;tyrosine-type recombinase/integrase
comp;3806952..3807028;;agg;;61;61;;;77;61;
&lt;comp;3807090..3808790;;cds;;;;;;*1701;;formate dehydrogenase subunit alpha
;;;;;;;;;;;
comp;3875816..3876886;;cds;;452;*452;;;1071;;ABC transporter ATP-binding protein
comp;3877339..3877455;;5s;;125;;;;117;;
comp;3877581..3880480;;23s;;261;;;;2900;;
comp;3880742..3882249;;16s;;190;190;;;1508;190;
comp;3882440..3883018;;cds;;;;;;579;;bifunctional precorrin-2 dehydrogenase/sirohydrochlorin ferrochelatase
;;;;;;;;;;;
comp;4017523..4017714;;cds;;118;118;;;192;118;DUF378 domain-containing protein
comp;4017833..4017949;;5s;;126;;;;117;;
comp;4018076..4020975;;23s;;321;;;;2900;;
comp;4021297..4022804;;16s;;292;292;;;1508;;
comp;4023097..4023378;;cds;;221;221;;;282;;hp
comp;4023600..4025129;;cds;;;;;;*1530;;lysine--tRNA ligase
;;;;;;;;;;;
dir    ;4135881..4136873;;cds;;383;383;;;993;;DNA replication protein DnaC
comp;4137257..4137331;;aca;;33;;33;;75;;
comp;4137365..4137440;;gta;;4;;4;;76;;
comp;4137445..4137519;;gaa;;6;;6;;75;;
comp;4137526..4137601;;aaa;;331;331;;;76;331;
comp;4137933..4139222;;cds;;;;;;*1290;;adenylosuccinate synthase
;;;;;;;;;;;
dir    ;4178197..4178970;;cds;;179;179;;;774;;SigB/SigF/SigG family RNA polymerase sigma factor
dir    ;4179150..4180587;;16s;;161;;;;1438;;
comp;4180749..4180865;;5s;;201;;;;117;;
comp;4181067..4183959;;23s;;217;;;;2893;;
comp;4184177..4185684;;16s;;108;;;;1508;;
comp;4185793..4185869;;atgi;;11;;;11;77;;
comp;4185881..4185969;;tta;;5;;;;89;;
comp;4185975..4186091;;5s;;201;;;;117;;
comp;4186293..4189192;;23s;;375;;;;2900;;
comp;4189568..4189643;;gca;;52;;;;76;;
comp;4189696..4190959;;16s’;@4;100;;;;1264;;
dir    ;4191060..4192225;;16s’;;52;;;;1166;;
dir    ;4192278..4192353;;gca;;248;;;;76;;
dir    ;4192602..4193197;;23s°;;100;;;;596;;
dir    ;4193298..4193874;;16s°;;321;;;;577;;
dir    ;4194196..4196423;;23s’;;100;;;;2228;;
dir    ;4196524..4197091;;16s°;;320;;;;568;;
dir    ;4197412..4199044;;23s°;;100;;;;1633;;
dir    ;4199145..4201593;;23s’;;126;;;;2449;;
dir    ;4201720..4201836;;5s;;127;127;;;117;127;
dir    ;4201964..4202473;;cds;;;;;;510;;transcription repressor NadR
;;;;;;;;;;;
dir    ;4205417..4205872;;cds;;0;0;;;456;0;nucleoside deaminase
dir    ;4205873..4205964;;tcc;@5;37;;;;92;;
dir    ;4206002..4206266;;ncRNA;;76;76;;;265;;
dir    ;4206343..4207980;;cds;;;;;;*1638;;DNA polymerase III subunit gamma/tau
;;;;;;;;;;;
comp;4209435..4210639;;cds;;496;*496;;;1205;;glycosyl transferase
;4211136..4212643;;16s;;321;;;;1508;;
;4212965..4213127;;23s°;;100;100;;;163;100;
&lt;&gt;comp;4213228..4213849;;cds;;111;;;;622;;CHAP domain-containing protein
;;;;;;;;;;;
comp;4213961..4214620;;cds;;228;228;;;660;228;type A-1 chloramphenicol O-acetyltransferase
dir    ;4214849..4216199;;16s;;321;;;;1351;;
dir    ;4216521..4217008;;23s°;;101;;;;488;;
comp;4217110..4218529;;23s°;;250;;;;1420;;
comp;4218780..4218855;;gca;;52;;;;76;;
comp;4218908..4219471;;16s°;;100;;;;564;;
comp;4219572..4219856;;23s°;;217;;;;285;;
comp;4220074..4221581;;16s;;179;179;;;1508;179;
&gt;comp;4221761..4222206;;cds;;386;386;;;446;386;B/F/G family RNA polymerase sigma-70 factor
dir    ;4222593..4224100;;16s;;321;;;;1508;;
dir    ;4224422..4227321;;23s;;181;;;;2900;;
dir    ;4227503..4227619;;5s;;6;;;;117;;
dir    ;4227626..4227700;;aac;;6;;;6;75;;
dir    ;4227707..4227792;;tta;;15;;;15;86;;
dir    ;4227808..4227883;;atgf;;7;;;7;76;;
dir    ;4227891..4227965;;gaa;;9;;;9;75;;
dir    ;4227975..4228048;;gga;;5;;;5;74;;
dir    ;4228054..4228129;;gta;;5;;;5;76;;
dir    ;4228135..4228211;;gac;;9;;;9;77;;
dir    ;4228221..4228295;;aca;;14;;;14;75;;
dir    ;4228310..4228394;;tac;;10;;;10;85;;
dir    ;4228405..4228488;;cta;;28;;;28;84;;
dir    ;4228517..4228593;;aga;;7;;;7;77;;
dir    ;4228601..4228676;;caa;;89;;;*89;76;;
dir    ;4228766..4228854;;tca;;3;;;3;89;;
dir    ;4228858..4228933;;ttc;;6;;;6;76;;
dir    ;4228940..4229016;;atgj;;11;;;11;77;;
dir    ;4229028..4229104;;atgi;;29;;;29;77;;
dir    ;4229134..4229210;;cca;;7;;;7;77;;
dir    ;4229218..4229294;;cac;;8;;;8;77;;
dir    ;4229303..4229378;;aaa;;353;;;;76;;
comp;4229732..4229848;;5s;;126;;;;117;;
comp;4229975..4232010;;23s’;;582;;;;2036;;
dir    ;4232593..4234098;;16s;@6;217;;;;1506;;
dir    ;4234316..4237215;;23s;;126;;;;2900;;
dir    ;4237342..4237458;;5s;;216;216;;;117;216;
comp;4237675..4238859;;cds;;372;372;;;1185;;pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase
dir    ;4239232..4241583;;cds;;21;21;;;*2352;;anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase
dir    ;4241605..4242144;;cds;;778;*778;;;540;;anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein
dir    ;4242923..4244459;;16s;@7;261;;;;1537;;
dir    ;4244721..4247619;;23s;;201;;;;2899;;
dir    ;4247821..4247937;;5s;;5;;;;117;;
dir    ;4247943..4248031;;tta;;11;;;11;89;;
dir    ;4248043..4248119;;atgi;;108;;;;77;;
dir    ;4248228..4249735;;16s;;184;;;;1508;;
dir    ;4249920..4250564;;23s°;;100;100;;;645;100;
&lt;dir    ;4250665..4250923;;cds;;112;112;;;259;112;hp
comp;4251036..4253145;;23s’;;375;;;;2110;;
comp;4253521..4253596;;gca;;52;;;;76;;
comp;4253649..4254226;;16s°;;282;282;;;578;;
dir    ;4254509..4254712;;cds;;12;12;;;204;;hp
dir    ;4254725..4256002;;cds;;;;;;*1278;;phage portal protein
&lt;/pre&gt;

====cdc8 cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cumuls|cdc8 cumuls]]
&lt;pre&gt;
cdc8 cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;21;1;;0;1;4;1;3;100;6
;16 23 5s 0;4;20;2;77;50;2;20;0;200;8
;16 gca 235;2;40;1;6;100;7;40;0;300;11
;16 23 5s a;5;60;;0;150;5;60;0;400;5
;max a;43;80;;1;200;5;80;2;500;5
;a doubles;2;100;;3;250;6;100;3;600;5
;autres;10;120;;0;300;5;120;3;700;1
;total aas;98;140;;0;350;4;140;1;800;1
sans ;opérons;6;160;;0;400;4;160;1;900;1
;1 aa;5;180;;0;450;0;180;1;1000;0
;max a;4;200;;0;500;2;200;1;1100;0
;a doubles;0;;;0;;4;;7;;1
;total aas;9;;3;87;;48;;22;;44
total aas;;108;;;;;;;;;
remarques;;7;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;14;14;;256;;155;;330
;;;variance;;16;;252;;109;;234
sans jaune;;;moyenne;;10;;182;;;;208
;;;variance;;6;;117;;;;97
&lt;/pre&gt;
====cdc8 blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_blocs|cdc8 blocs]]
&lt;pre&gt;
cdc8 blocs;;;;;;;;
Bloc type;groupes;intercal;Bloc type;groupes;intercal;Bloc type;groupe;intercal
;cds;554;;cds;150;;cds;496
;cds;0;;aca;93;;16s;321
;cds;168;;23s;184;;23s°;100
;23s°;133;III;16s;374;;cds;111
IV2;5s;7;;cds;;;cds;228
;aac;5;;;;;16s;321
;**16aas;8;;cds;452;;23s°;101
;atgj;115;;5s;125;;23s°;250
IV1;16s;1;;23s;261;;gca;52
;cds;100;I2;16s;190;;16s°;100
;23s°;182;;cds;;;23s°;217
;5s;7;;;;;16s;179
;aac;7;;cds;118;;cds;386
;**41aas;13;;5s;126;IV3;16s;321
;gta;76;;23s;321;;23s;181
;cds;308;I3;16s;292;;5s;6
;cds;;;cds;;;aac;6
;;;;;;;**17aas;8
;cds;281;;cds;179;;aaa;353
;16s°;100;;16s;161;;5s;126
;23s°;126;;5s;201;;23s;582
X1;5s;7;I1;23s;217;I4;16s;217
;aac;6;;16s;108;;23s;126
;**7aas;9;;atgi;11;;5s;216
;aga;954;;tta;5;;cds;372
;cds;;;5s;201;;cds;21
;;;;23s;375;;cds;778
;cds;733;VII1;gca;52;IV4;16s;261
;cds;1;;16s’;100;;23s;201
;23s°;126;;16s’;52;;5s;5
;5s;177;;gca;248;;tta;11
;cds;;;23s°;100;;atgi;108
;;;;16s°;321;;16s;184
;cds;238;;23s;100;;23s°;100
II;16s;320;;16s°;320;;cds;112
;23s;91;;23s°;100;;23s’;375
;gga;8;;23s’;126;;gca;52
;5s;273;;5s;127;;16s°;282
;cds;;;cds;;;cds;
&lt;/pre&gt;
====cdc8 cdc psor 43====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_psor_43|cdc8 cdc psor 43]]
&lt;pre&gt;
cdc8;43aas;cdc;43aas;;;cdc8;43aas;psor;44aas;
16s;1;;;;;16s;1;;;
cds;100;16s;279;;;cds;100;16s;196;
23s°;181;23s;180;-1;;23s°;181;23s;122;
5s;6;5s;6;0;;5s;6;5s;5;
aac;6;aac;6;0;;aac;6;tta;13;-2
tta;15;tta;15;0;;tta;15;atg;15;8
atgf;7;atgf;7;0;;atgf;7;gaa;9;0
gaa;9;gaa;9;0;;gaa;9;gga;6;1
gga;5;gga;5;0;;gga;5;gta;5;0
gta;5;gta;5;0;;gta;5;gac;16;
gac;9;gac;9;0;;gac;9;aac;4;
aca;14;aca;14;0;;aca;14;aca;4;-10
tac;10;tac;8;-2;;tac;10;tac;15;5
cta;28;cta;29;1;;cta;28;cta;14;-14
aga;7;aga;7;0;;aga;7;aga;7;0
caa;89;caa;88;-1;;caa;89;caa;11;
tca;3;tca;3;0;;tca;3;aaa;6;
ttc;6;ttc;6;0;;ttc;6;tca;3;0
atgj;11;atgj;11;0;;atgj;11;ttc;9;3
atgi;29;atgi;23;-6;;atgi;29;atg;8;-3
cca;7;cca;7;0;;cca;7;atg;21;-8
cac;8;cac;8;0;;cac;8;cca;6;-1
aaa;7;aaa;7;0;;aaa;7;cac;4;
tgc;6;tgc;6;0;;tgc;6;tgc;25;
aac;6;aac;5;-1;;aac;6;tta;13;-2
tta;15;tta;15;0;;tta;15;atg;15;8
atgf;7;atgf;7;0;;atgf;7;gaa;9;0
gaa;9;gaa;9;0;;gaa;9;gga;6;1
gga;5;gga;5;0;;gga;5;gta;5;0
gta;5;gta;5;0;;gta;5;gac;16;
gac;9;gac;9;0;;gac;9;aac;4;
aca;14;aca;14;0;;aca;14;aca;4;-10
tac;9;tac;9;0;;tac;9;tac;15;6
cta;24;cta;23;-1;;cta;24;cta;11;-13
ggc;24;ggc;24;0;;ggc;24;ggc;13;-11
aga;9;aga;9;0;;aga;9;aga;7;-2
caa;8;caa;8;0;;caa;8;caa;11;3
aaa;2;aaa;2;0;;aaa;2;aaa;6;4
tca;3;tca;3;0;;tca;3;tca;3;0
ttc;6;ttc;6;0;;ttc;6;ttc;9;3
atgj;11;atgj;11;0;;atgj;11;atg;8;-3
atgi;17;atgi;17;0;;atgi;17;atg;21;
cac;8;cac;8;0;;cac;8;cca;6;
aaa;7;aaa;7;0;;aaa;7;cac;9;1
tgc;7;tgc;7;0;;tgc;7;aaa;21;14
cgt;12;cgt;12;0;;cgt;12;tgc;6;-1
gta;75;gta;75;0;;gta;75;cgt;10;-2
cds;;cds;;;;cds;;gta;162;
;;;;;;;;cds;;
&lt;/pre&gt;
====cdc8 cdc psor 18====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_psor_18|cdc8 cdc psor 18]]
&lt;pre&gt;
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ttc;7;ttc;7;0;;;;cca;6;
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;;;;;;;;ttc;13;
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;;16s;196;;;;;;;
cdc8;18aas;23s;213;;;;;cdc8;18aas;
cds;214;5s;5;;;;;cds;214;
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aca;14;tac;11;2;;gga;5;aca;14;0
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aaa;2;tca;11;-7;;cta;28;aaa;2;
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agc;8;cca;6;;;caa;89;agc;8;
cca;85;atg;11;;;tca;3;cca;85;
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cca;5;cca;6;1;;atgj;11;cca;5;
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;;;;;;aaa;353;;;
&lt;/pre&gt;
====cdc8 cdc psor 9====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_psor_9|cdc8 cdc psor 9]]
&lt;pre&gt;
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cds;554;;;;;16s°;100;gca;373;
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cds;167;16s°;100;;;5s;7;5s;7;
23s°;132;23s°;126;;;aac;6;aac;5;-1
5s;6;5s;7;;;tta;15;tta;15;0
aac;4;aac;6;;;atgf;7;atgf;7;0
gaa;5;tta;15;;;gaa;8;gaa;14;6
gta;5;atgf;7;;;gga;4;gga;5;1
gac;11;gaa;8;;;gta;5;gta;5;0
aca;14;gga;4;;;gac;10;gac;10;0
tac;9;gta;5;0;;ggc;9;ggc;9;0
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aga;9;ggc;9;;;cds;;cds;;
caa;11;aga;954;;;;;;;
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cca;85;;;;;23s;126;23s;126;0
tgg;60;;;;;5s;216;5s;213;-3
cca;5;;;;;cds;372;cds;372;0
atc;3;;;;;cds;21;cds;21;0
ttc;7;;;;;cds;778;cds;776;-2
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;;;;;;23s;201;gca;373;
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16s;321;16s°;100;;;;;;;
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5s;6;5s;7;;;CDS;431;cds;179;
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gaa;9;gaa;8;1;;5s;5;16s;108;
gga;5;gga;4;-5;;tta;9;atgi;11;2
gta;5;gta;5;0;;atg;123;tta;5;0
gac;9;gac;10;;;16s;54;5s;201;8
aca;14;ggc;9;;;gca;114;23s;375;261
tac;10;aga;954;;;23s;193;gca;52;-2
cta;28;cds;;;;5s;5;16s’;100;-23
aga;7;;;;;tta;9;16s’;52;
caa;89;;;;;atg;123;gca;248;
tca;3;;;;;16s;54;23s°;100;-2
ttc;6;;;;;gca;114;16s°;321;134
atgj;11;;;;;23s;78;23s;100;
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cca;7;;;;;CDS;;23s°;100;
cac;8;;;;;;;23s’;126;
aaa;353;;;;;;;5s;127;
;;;;;;;;cds;;
&lt;/pre&gt;
====cdc8 cdc protéines====
=====Alignement sur cdc=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#Alignement_sur_cdc|Alignement sur cdc]]
&lt;pre&gt;
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;;;;;;;;;;;;
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;comp;4086089..4086164;aaa;326;76;;comp;4137526..4137601;aaa;331;76;
;comp;4086491..4087780;cds;;1290;succinate;comp;4137933..4139222;cds;;1290;succinate
&lt;/pre&gt;

=====Alignement sur cdc8=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#Alignement_sur_cdc8|Alignement sur cdc8]]
&lt;pre&gt;
;cdc8;;;;;;;cdc8;;;;;;;psor;;;;
ordre cdc;sens;adresse;gène;intercal;pbs;abrégé;;ordre cdc;sens;adresse;gène;intercal;pbs;abrégé;adresse;gène;intercal;pbs;abrégé
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;;;;;;;;;dir    ;4201964..4202473;cds;11;510;NadR;;;;;
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;dir   ;96095..97613;23s°;126;1519;;;;dir    ;4205417..4205872;cds;0;456;Nuc-de;;;;;
6;dir   ;97740..97856;5s;7;117;;;;dir    ;4205873..4205964;tcc;37;92;;;;;;
;dir   ;97864..97938;aac;6;75;;;2;dir    ;4206002..4206266;ncRNA;76;265;;;;;;
;dir   ;;**7aas;6;;;;;dir    ;4206343..4207980;cds;;1638;III-tau;;;;;
;dir   ;98542..98615;aga;954;74;;;;;;;;;;;;;;
;dir   ;99570..100409;cds;;840;TIGR;;insert;comp;4209435..4210639;cds;496;1205;Glyco-tr;;;;;
;;;;;;;;insert;;4211136..4212643;16s;321;1508;;;;;;
;&lt;&gt; cp;309950..310076;cds;1;127;seleno;;insert;;4212965..4213127;23s°;100;163;;;;;;
;dir   ;310078..311313;23s°;126;1236;;;insert;&lt;&gt;comp;4213228..4213849;cds;;622;CHAP;;;;;
7;dir   ;311440..311556;5s;177;117;;;insert;;;;;;;;;;;
;dir   ;311734..312342;cds;;609;DedA;;insert;comp;4213961..4214620;cds;228;660;A-1chlor;;;;;
;;;;;;;;insert;dir    ;4214849..4216199;16s;321;1351;;;;;;
;comp;861856..862620;cds;258;765;DeoR;;insert;dir    ;4216521..4217008;23s°;101;488;;;;;;
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;dir   ;863057..863845;cds;;789;flagellar;;insert;comp;4218780..4218855;gca;52;76;;;;;;
;;;;;;;;insert;comp;4218908..4219471;16s°;100;564;;;;;;
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;;;;;;;;insert;dir    ;4228940..4229016;atgj;11;77;;3445829..3445917;tca;11;;
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;&lt;comp;3807090..3808790;cds;;1701;fdHa;;insert;dir    ;4229218..4229294;cac;8;77;;3445561..3445637;atg;11;;
;;;;;;;;insert;dir    ;4229303..4229378;aaa;353;76;;3445474..3445549;tgg;31;;
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;comp;3877339..3877455;5s;125;117;;;insert;comp;4229975..4232010;23s’;582;2036;;3445283..3445359;atc;6;;
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;comp;3882440..3883018;cds;;579;precorrin;;;dir    ;4237342..4237458;5s;216;117;;;;;;
;;;;;;;;;comp;4237675..4238859;cds;372;1185;B6;;;;;
;comp;4017523..4017714;cds;118;192;DUF378;;5;dir    ;4239232..4241583;cds;21;2352;Art-red;;;;;
;comp;4017833..4017949;5s;126;117;;;;dir    ;4241605..4242144;cds;778;540;Art-reda;;;;;
14;comp;4018076..4020975;23s;321;2900;;;insert;dir    ;4242923..4244459;16s;261;1537;;;;;;
;comp;4021297..4022804;16s;292;1508;;;insert;dir    ;4244721..4247619;23s;201;2899;;;;;;
;comp;4023097..4023378;cds;221;282;hp-282;;insert;dir    ;4247821..4247937;5s;5;117;;111345..111884;CDS;431;540;Art-reda
;comp;4023600..4025129;cds;;1530;K-ligase;;insert;dir    ;4247943..4248031;tta;11;89;;112316..113822;16s;54;;
;;;;;;;;insert;dir    ;4248043..4248119;atgi;108;77;;113877..113952;gca;114;;
;dir    ;4135881..4136873;cds;383;993; DnaC;;insert;dir    ;4248228..4249735;16s;184;1508;;114067..116982;23s;193;;
;comp;4137257..4137331;aca;33;75;;;insert;dir    ;4249920..4250564;23s°;100;645;;117176..117292;5s;5;;
15;comp;4137365..4137440;gta;4;76;;;insert;&lt;dir    ;4250665..4250923;cds;112;259;hp-259;117298..117386;tta;9;;
;comp;4137445..4137519;gaa;6;75;;;insert;comp;4251036..4253145;23s’;375;2110;;117396..117472;atg;123;;
;comp;4137526..4137601;aaa;331;76;;;insert;comp;4253521..4253596;gca;52;76;;117596..119102;16s;54;;
;comp;4137933..4139222;cds;;1290;succinate;;insert;comp;4253649..4254226;16s°;282;578;;119157..119232;gca;114;;
;;;;;;;;insert;dir    ;4254509..4254712;cds;12;204;hp-204;119347..122263;23s;193;;
;;;;;;;;insert;dir    ;4254725..4256002;cds;;1278;phagePP;122457..122573;5s;5;;
;;;;;;;;;;;;;;;122579..122667;tta;9;;
;;;;;;;;début;début;début;début;début;début;début;122677..122753;atg;123;;
;;;;;;;;insert;dir   ;4299490..4300134;cds;214;645;Y-r1;122877..124383;16s;54;;
;;;;;;;;insert;dir   ;4300349..4300807;cds;554;459;Helix;124438..124513;gca;114;;
;;;;;;;;;dir   ;4301362..4303101;cds;0;1740;hp-1740;124628..127549;23s;78;;
;;;;;;;;;dir   ;4303102..4303305;cds;167;204;hp-204;127628..127744;5s;100;;
;;;;;;;;4;dir   ;4303473..4304299;23s°;132;827;;127845..129260;CDS;;1416;R-deca
&lt;/pre&gt;

====cdc8 cdc création de cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_création_de_cds|cdc8 cdc création de cds]]
&lt;pre&gt;
;;création de cds;;;;
;cdc8;pbs;cdc;pbs;psor;pbs
seleno A;309950..310076;127;0;;-;
Y-r;457663..457878;216;457207..457422;216;-;
;1237414..1237986;573;1223841..1224413;573;;
;1291413..1292327;915;1277836..1278750;915;;
;1418672..1419580;909;1405262..1406170;909;;
;2120221..2121348;1128;;;;
;2785863..2786042;180;;;;
;3564835..3565434;600;;;;
Y-r2;3805298..3806743;1446;;;;
Y-r1;4299490..4300134;645;;;;
Helix;351106..351336;231;391813..392001;189;-;
;379952..380503;552;429510..430061;552;;
;456588..456776;189;461727..462398;672;;
;1187185..1187736;552;1169984..1170535;552;;
;1466364..1466783;420;1292255..1292926;672;;
;1467749..1468147;399;1454375..1454773;399;;
;1605760..1606344;585;1517855..1518619;765;;
;1694358..1694750;393;1592306..1592890;585;;
;1936722..1937267;546;1682266..1682658;393;;
;2105662..2106711;1050;1695592..1696284;693;;
;2196549..2198204;1656;1916424..1916630;207;;
;2342487..2342690;204;1922813..1923358;546;;
;2353934..2354578;645;2164151..2165806;1656;;
;2378761..2379891;1131;2308386..2308589;204;;
;2721795..2722316;522;2319833..2320477;645;;
;3485137..3486024;888;2344477..2345607;1131;;
;3570953..3571183;231;2501260..2501931;672;;
;3571660..3571878;219;2688255..2688776;522;;
;3804379..3804627;249;3459701..3460588;888;;
;3804878..3805279;402;3475449..3475589;141;;
;4286854..4287222;369;;;;
;4288799..4289518;720;;;;
;4300349..4300807;459;;;;
xylose;3383443..3384780;1338;3349843..3351180;1338;0;
;&lt;4307539..4308225;687;;;;
CHAP;&lt;4213228..&gt;4213849;622;0;;-;
A-1chlor;4213961..4214620;660;0;;0;
SigB2;4221761..4222206;446;0;;0;
fdHa;4221761..4222206;1701;3711229..3713373;2145;-;
R-deca;0;;0;;127845..129260;1416
;;;;;876023..877522;1500
phagePP;1448919..1449983;1065;1435547..1436611;1065;1489507..1490769;1263
;1450539..1450985;447;1437167..1437613;447;;
;1709611..1711050;1440;1697521..1698963;1443;;
;1718404..1718844;441;1708192..1708632;441;;
;3560756..3561910;1155;3841162..3842367;1206;;
;4254725..4256002;1278;;;;
;4260531..4261586;1056;;;;
;4262058..4262474;417;;;;
hp-204;4254509..4254712;204;;;;
phagePP;4254725..4256002;1278;;;;
phageHM;4255980..4256741;762;;;;
hp;;;3840525..3841067;543;;
phagePP;;;3841162..3842367;1206;;
hydrolase;;;3842345..3842512;168;;
terminase;;;;;1487770..1489491;1722
phagePP;;;;;1489507..1490769;1263
Clp;;;;;1490762..1491607;846
&lt;/pre&gt;

====cdc8 cdc abrégé protéines====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_abrégé_protéines|cdc8 cdc abrégé protéines]]
&lt;pre&gt;
A-1chlor;type A-1 chloramphenicol O-acetyltransferase
ABC;ABC transporter ATP-binding protein
Ala amid;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
Art-red;anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase
Art-reda;anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein
B6;pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase
cad;cadmium-translocating P-type ATPase
CHAP;CHAP domain-containing protein
CwlD;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD
DedA;DedA family protein
DeoR;DeoR/GlpR transcriptional regulator
DnaC;DNA replication protein DnaC
DUF378;DUF378 domain-containing protein
fdHa;formate dehydrogenase subunit alpha
flagellar;flagellar motor protein
Glyco-tr;glycosyl transferase
Helix;helix-turn-helix domain-containing protein
hp-1740;hp-1740
hp-204;hp-204
hp-282;hp-282
hp-414;hp-414
HXXEE;HXXEE domain-containing protein
III-tau;DNA polymerase III subunit gamma/tau
K-ligase;lysine--tRNA ligase
S-ligase;serine--tRNA ligase
lactam;delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase
Mannosyl;Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase
MBOAT;MBOAT family protein
mecano;mechanosensitive ion channel
NadR;transcription repressor NadR
NhaC;Na+/H+ antiporter NhaC family protein
Nuc-de;nucleoside deaminase
phagePP;phage portal protein
PolyI;DNA polymerase I
precorrin;bifunctional precorrin-2 dehydrogenase/sirohydrochlorin ferrochelatase
pyruvate;pyruvate carboxylase
R-deca;arginine decarboxylase
seleno;glycine/sarcosine/betaine reductase complex  selenoprotein A
SigB;SigB/SigF/SigG family RNA polymerase sigma factor
SigB2;B/F/G family RNA polymerase sigma-70 factor
SrtB;sortase SrtB
succinate;adenylosuccinate synthase
TIGR;TIGR00159 family protein
xylose;xylose isomerase
Y-r1;tyrosine-type recombinase/integrase – 1
Y-r2;tyrosine-type recombinase/integrase – 2
&lt;/pre&gt;
====cdc8 cdc psor stats====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_cdc_psor_stats|cdc8 cdc psor stats]]
&lt;pre&gt;
NCBI du 13.11.19;cdc8;cdc;psor
date;15-MAR-2017;18-MAY-2017;08-JAN-2018
DNA circulaire;4 308 325;4 110 554;3 550 458
Genes (total)         ;4 025;3 807;3 528
CDS (total)           ;3 870;3 691;3 368
Genes (coding)        ;3 763;3 615;3 327
CDS (coding)          ;3 763;3 615;3 327
Genes (RNA)           ;155;116;160
RRNAs  (5S, 16S, 23S); 14, 16, 13; 9, 10, 10;17, 17, 17
complete rRNAs        ; 14, 16, 13; 9, 10, 10;17, 17, 17
tRNAs     ;108;83;105
ncRNAs    ;4;4;4
Pseudo Genes (total)  ;107;76;41
Pseudo Genes (ambiguous residues) ; 0 of 107; 0 of 76; 0 of 41
Pseudo Genes (frameshifted)       ; 60 of 107; 42 of 76; 4 of 41
Pseudo Genes (incomplete)         ; 35 of 107; 30 of 76; 18 of 41
Pseudo Genes (internal stop)      ; 31 of 107; 18 of 76; 22 of 41
Pseudo Genes (multiple problems)  ; 18 of 107; 12 of 76; 3 of 41
CRISPR Arrays         ;4;9; - 
;;;
Décompte du 19.11.19;;;
hypothetical protein;609;523;1 256
hp / cds (total);0,16;0,14;0,37
&lt;/pre&gt;
====cdc8 distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_distribution|cdc8 distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;
cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
cdc8;;5;;;;;5;;cdc8;4;;;;;;9
&lt;/pre&gt;
====cdc8 données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_données_intercalaires|cdc8 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cdc8;fx;fc;cdc8;fx40;fc40;cdc8;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;1;0;0;39;0;0;39;-1;;71;75;258;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;suite;contig
;0;10;5;241;1;0;48;-2;;0;954;318;55;;gca;6;;aac;6;;aac
;0;20;3;344;2;0;53;-3;;1;87;150;tRNA 23s;;;15;;tta;15;;tta
;0;30;4;232;3;1;24;-4;1;51;1378;208;376;;gca;7;;atgf;7;;atgf
;0;40;0;138;4;2;29;-5;;0;109;383;390;;gca;9;;gaa;9;;gaa
;0;50;4;89;5;0;15;-6;;0;334;;5s tRNA;;;5;;gga;5;;gga
;0;60;9;87;6;0;7;-7;;15;150;;3* 6;;aac;5;;gta;5;;gta
;1;70;6;73;7;0;11;-8;1;68;264;;7;;aac;9;;gac;9;;gac
;1;80;11;66;8;0;13;-9;;0;67;;2* 5;;tta;14;;aca;14;;aca
;1;90;15;73;9;1;21;-10;;2;331;;tRNA 5s;;;10;;tac;10;;tac
;0;100;21;72;10;1;20;-11;;32;0;;8;;gga;28;;cta;28;;cta
;1;110;16;84;11;0;38;-12;;0;CDS 16s;;autres ts;;;7;;aga;7;;aga
;0;120;23;86;12;0;46;-13;;7;240;376;tRNA 16s;;;89;;caa;89;;caa
;0;130;25;53;13;1;30;-14;;15;192;498;2* 110;;atgi;3;;tca;3;;tca
;0;140;21;49;14;0;39;-15;;0;294;81;116;;atgj;6;;ttc;6;;ttc
1;1;150;15;53;15;0;36;-16;;2;181;388;23s tRNA;;;14;;atgj;14;;atgj
;0;160;23;44;16;0;28;-17;1;14;181;;94;;aca;29;;atgi;29;;atgi
;0;170;24;38;17;1;45;-18;;0;780;;8;;gga;7;;cca;7;;cca
;0;180;22;44;18;1;31;-19;;1;16s 23s;;5s tRNA;;;8;;cac;8;;cac
;0;190;26;43;19;0;27;-20;;7;324;;-;353;aaa;7;;aaa;**;;aaa
;0;200;18;43;20;0;24;-21;;0;188;;tRNA tRNA;;intra;6;;tgc;4;;aac
1;0;210;22;36;21;1;24;-22;1;0;2* 265;;2* 11;;atgi;6;;aac;5;;gaa
;0;220;25;39;22;0;22;-23;;6;2* 325;;**;;tta;15;;tta;5;;gta
;0;230;14;30;23;0;28;-24;;1;2* 221;;tRNA tRNA;;;7;;atgf;11;;gac
;0;240;9;27;24;0;21;-25;;0;23s 5s;;33;;aca;9;;gaa;14;;aca
;0;250;15;30;25;1;27;-26;;6;126;;4;;gta;5;;gga;9;;tac
1;0;260;15;30;26;1;19;-27;;0;2* 127;;6;;gaa;5;;gta;10;;gga
;1;270;18;30;27;0;19;-28;;1;3* 202;;**;;aaa;9;;gac;9;;aga
;0;280;12;19;28;1;26;-29;;8;182;;autres tt;;;14;;aca;11;;caa
;0;290;16;38;29;0;24;-30;;0;5s CDS;;;;;9;;tac;2;;aaa
;0;300;17;23;30;0;22;-31;;1;177;216;;;;24;;cta;18;;tca
;0;310;7;29;31;0;20;-32;;5;273;;;;;24;;ggc;8;;agc
1;0;320;18;22;32;0;18;-33;;0;452;;;;;9;;aga;85;;cca
;0;330;14;30;33;0;13;-34;;0;118;;;;;8;;caa;60;;tgg
;2;340;9;13;34;0;12;-35;;2;127;;;;;2;;aaa;5;;cca
;0;350;6;15;35;0;17;-36;;0;autres ss;;;;;3;;tca;3;;atc
;0;360;16;18;36;0;14;-37;;0;5s 16s;;;;;6;;ttc;7;;ttc
;0;370;7;16;37;0;13;-38;;1;-;161;;;;14;;atgj;**;;atgj
;0;380;6;17;38;0;11;-39;;0;16s CDS;;;;;17;;atgi;;;
1;0;390;7;14;39;0;10;-40;;1;2;;;;;8;;cac;;;
;0;400;4;18;40;0;10;-41;;0;294;;;;;7;;aaa;;;
;2;reste;138;242;reste;674;1733;-42;;0;23s CDS;87;;;;7;;tgc;;;
5;11;total;686;2727;total;686;2727;-43;;0;;;;;;12;;cgt;;;
5;8;diagr;548;2446;diagr;12;955;-44;;1;;;;;;**;;gta;;;
0;0; t30;12;817;;;;-45;;0;;;;;;6;;aac;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;;15;;tta;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;2;;;;;;7;;atgf;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;8;;gaa;;;
;x;686;4;0;690;;;-49;;0;;;;;;4;;gga;;;
;c;2688;326;39;3053;;;-50;;0;;;;;;5;;gta;;;
;;;;;3743;348;;reste;;5;;;;;;10;;gac;;;
;;;;;;4091;;total;4;326;;;;;;9;;ggc;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;aga;;;
&lt;/pre&gt;

===cbc===
====cbc opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_opérons|cbc* opérons]]
&lt;pre&gt;
28%GC;30.6.19 Paris;16s  5;;52;doubles;intercalaires
Clostridium botulinum CDC_297;;;NCBI;gtRNAdb;;
comp;1309334..1309408;;Glu;gag;;
;;;;;;
comp;1385938..1386012;;Asn;aac;;8
comp;1386021..1386134;;5s;;;108
comp;1386243..1389140;;23s;;;228
comp;1389369..1390866;;16s;;@1;
;;;;;;
comp;1392997..1393072;;Phe;ttc;;7
comp;1393080..1393193;;5s;;;108
comp;1393302..1396199;;23s;;;228
comp;1396428..1397925;;16s;;;
;;;;;;
comp;1408673..1408762;;Ser;tcc;;
;;;;;;
comp;1412183..1412259;;Arg;agg;;
;;;;;;
comp;1415464..1415540;;Arg;cgt;;84
comp;1415625..1415715;;Ser;agc;+;20
comp;1415736..1415826;;Ser;tca;2 agc;306
comp;1416133..1416223;;Ser;agc;2 tca;20
comp;1416244..1416334;;Ser;tca;@4;
;;;;;;
comp;1425969..1426044;;Ala;gca;;3
comp;1426048..1426124;;Met;atgi;;8
comp;1426133..1426246;;5s;;;79
comp;1426326..1427823;;16s;;@2;117
comp;1427941..1428051;;MNEGCDRILIVVARWQVSKNKKMLTKIKKRATIIKH;CDS 108pb;;
;;;;;;
;1694943..1695017;;Gln;cag;;
;;;;;;
comp;1722580..1722664;;Tyr;tac;;5
comp;1722670..1722745;;Thr;aca;;
;;;;;;
comp;1841437..1841510;;Cys;tgc;;
;;;;;;
comp;1842698..1842811;;5s;;;108
comp;1842920..1845817;;23s;;;228
comp;1846046..1847543;;16s;;;
;;;;;;
;1890534..1890608;;Glu;gaa;+;17
;1890626..1890701;;Val;gta;3 gaa;9
;1890711..1890787;;Asp;gac;3 gta;4
;1890792..1890867;;Thr;aca;3 gac;5
;1890873..1890947;;Glu;gaa;2 aca;18
;1890966..1891041;;Val;gta;;7
;1891049..1891125;;Asp;gac;;57
;1891183..1891257;;Glu;gaa;;17
;1891275..1891350;;Val;gta;;9
;1891360..1891436;;Asp;gac;;4
;1891441..1891516;;Thr;aca;;
;;;;;;
comp;1948153..1948228;;Pro;cca;;
;;;;;;
;1969157..1969245;;Leu;tta;;4
;1969250..1969325;;Met;atgf;+;53
;1969379..1969454;;Met;atgf;2 atgf;10
;1969465..1969541;;Met;atg;;
;;;;;;
;1987541..1989040;;16s;;@3;226
;1989267..1992166;;23s;;;93
;1992260..1992375;;5s;;;7
;1992383..1992457;;Asn;aac;+;27
;1992485..1992559;;Asn;aac;;
;;;;;;
;2013239..2013313;;Gly;ggg;;18
;2013332..2013407;;Thr;acc;;
;;;;;;
;2222515..2222590;;Trp;tgg;;
;;;;;;
;2294767..2294842;;Pro;cca;+;7
;2294850..2294923;;Gly;gga;2 cca;6
;2294930..2295006;;Arg;aga;2 gga;5
;2295012..2295087;;Lys;aag;;26
;2295114..2295189;;Pro;cca;;29
;2295219..2295292;;Gly;gga;;24
;2295317..2295393;;Arg;cga;;
;;;;;;
;2402556..2402631;;Val;gta;;5
;2402637..2402713;;Asp;gac;;3
;2402717..2402792;;Phe;ttc;;4
;2402797..2402871;;Gly;ggc;;9
;2402881..2402954;;Cys;tgc;;
;;;;;;
;2517305..2517391;;Leu;ttg;;
;;;;;;
;2548708..2548792;;Leu;ctc;;
;;;;;;
;2583298..2583388;;SeC;tga;;
&lt;/pre&gt;
====cbc cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_cumuls|cbc* cumuls]]
&lt;pre&gt;
cbc* cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;5;1;0;0
;16 23 5s 0;1;20;22;1
;16 atc gca;0;40;3;1
;16 23 5s a;3;60;2;0
;max a;2;80;0;0
;a doubles;1;100;1;0
;spéciaux;1;120;0;0
;total aas;6;140;0;0
sans ;opérons;17;160;0;0
;1 aa;10;180;0;0
;max a;11;200;0;0
;a doubles;4;;0;0
;total aas;46;;28;2
total aas;;52;;;
remarques;;4;;;
avec jaune;;;moyenne;17;15
;;;variance;19;
sans jaune;;;moyenne;15;
;;;variance;14;
&lt;/pre&gt;
====cbc blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_blocs|cbc* blocs]]
&lt;pre&gt;
cbc* blocs;;;;
aac;8;7;-;
5s;108;108;108;226
23s;228;228;228;93
16s;;;-;7
;;;;
gca;3;;;
atgi;8;;;
5s;79;;;
16s;;;;
&lt;/pre&gt;
====cbc distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_distribution|cbc distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2;1-3 aas
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;gca
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;atgi
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;aac
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ttc
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;2;;atc;;acc;;aac;;agc;;aac2
ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;&gt;1aa
tta;;tca;;taa;;tga;1;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;atgf2
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;2;caa;;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;4;gca;;gaa;3;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;
atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;
ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;
cbc*;;10;;;;;10;;cbc*;36;;;;;;34;;cbc*;2;;;;;;2;
&lt;/pre&gt;
====cbc données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_données_intercalaires|cbc données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-CDS;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
frequence;effectif;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;cbc;fx;fc;cbc;fx40;fc40;cbc;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;24;0;1;24;-1;;72;1018;103;5s tRNA;;
;0;10;5;198;1;1;55;-2;;0;419;184;8;;aac
;0;20;2;293;2;2;38;-3;;0;732;35;7;;ttc
;0;30;11;166;3;0;14;-4;3;58;389;227;8;;atgi
2;0;40;15;108;4;1;18;-5;;0;156;30;7;;aac
;0;50;9;61;5;0;15;-6;1;0;164;90;tRNA tRNA;;contig
;2;60;11;83;6;0;11;-7;;4;276;431;3;;gca
;2;70;13;65;7;0;3;-8;;40;162;584;**;;atgi
;2;80;12;73;8;1;18;-9;;0;53;;27;;aac
;1;90;12;68;9;0;10;-10;;8;170;;**;;aac
;2;100;16;58;10;0;16;-11;;25;318;;tRNA tRNA;;
;0;110;18;52;11;0;28;-12;;0;80;;84;;cgt
1;0;120;19;66;12;0;44;-13;;3;172;;20;;agc
1;0;130;19;59;13;0;28;-14;;13;92;;306;;tca
;0;140;16;61;14;0;32;-15;;0;77;;20;;agc
;2;150;15;64;15;0;36;-16;;1;142;;**;;tca
;1;160;19;48;16;0;21;-17;;11;328;;5;;tac
;3;170;15;48;17;0;26;-18;;0;187;;**;;aca
;1;180;17;46;18;1;30;-19;1;4;64;;17;;gaa
1;1;190;19;32;19;0;24;-20;;11;82;;9;;gta
1;0;200;20;39;20;1;24;-21;;0;51;;4;;gac
;0;210;17;44;21;2;17;-22;;2;239;;5;;aca
;0;220;16;31;22;1;21;-23;;8;145;;18;;gaa
1;0;230;15;40;23;1;14;-24;;0;387;;7;;gta
;1;240;7;36;24;0;20;-25;;1;64;;57;;gac
;0;250;15;18;25;0;22;-26;;6;313;;17;;gaa
1;0;260;12;22;26;1;13;-27;;0;97;;9;;gta
;0;270;14;35;27;3;17;-28;;2;556;;4;;gac
;1;280;15;31;28;0;18;-29;;2;754;;**;;aca
;0;290;12;29;29;2;12;-30;;0;745;;4;;tta
;0;300;18;27;30;1;12;-31;;2;CDS 16s;;53;;atgf
;0;310;11;29;31;2;9;-32;;3;909;;10;;atgf
;2;320;16;21;32;0;9;-33;;0;387;;**;;atgj
;1;330;23;18;33;1;12;-34;;1;117;;18;;ggg
;0;340;12;14;34;3;13;-35;;1;416;;**;;acc
1;0;350;9;25;35;1;13;-36;;0;570;;7;;cca
;0;360;10;27;36;4;12;-37;;0;16s 23s;;6;;gga
;0;370;13;24;37;1;11;-38;;3;3* 228;;5;;aga
;0;380;12;22;38;1;6;-39;;0;226;;26;;aag
;2;390;8;19;39;2;12;-40;;0;23s 5s;;29;;cca
;0;400;8;22;40;0;11;-41;;0;3* 108;;24;;gga
4;6;reste;172;326;reste;685;1783;-42;;0;93;;**;;cga
13;30;total;719;2572;total;719;2572;-43;;0;16s 5s;;5;;gta
9;24;diagr;546;2222;diagr;33;765;-44;1;1;79;;3;;gac
0;0; t30;18;657;;;;-45;;0;5s CDS;;4;;ttc
;;;;;;;;-46;;0;363;;9;;ggc
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;1;;;**;;tgc
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;
;x;718;7;1;726;;;-49;;0;;;;;
;c;2548;288;24;2860;;;-50;;1;;;;;
;;;;;3586;88;;reste;1;4;;;;;
;;;;;;3674;;total;7;288;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====cbc autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_autres_intercalaires_aas|cbc autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cbc;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;1307968;1308315;1018;*;
;comp;tRNA;1309334;1309408;419;*;gag
fin;comp;CDS;1309828;1312056;;;
deb;;CDS;1384971;1385834;103;*;
;comp;tRNA;1385938;1386012;8;*;aac
;comp;rRNA;1386021;1386134;108;*;114
;comp;rRNA;1386243;1389140;228;*;2898
;comp;rRNA;1389369;1390866;909;*;1498
deb;comp;CDS;1391776;1392264;732;*;
;comp;tRNA;1392997;1393072;7;*;ttc
;comp;rRNA;1393080;1393193;108;*;114
;comp;rRNA;1393302;1396199;228;*;2898
;comp;rRNA;1396428;1397925;387;*;1498
fin;comp;CDS;1398313;1399257;;;
deb;comp;CDS;1406658;1408283;389;*;
;comp;tRNA;1408673;1408762;156;*;tcc
fin;comp;CDS;1408919;1409365;;;
deb;comp;CDS;1411833;1412018;164;*;
;comp;tRNA;1412183;1412259;184;*;agg
fin;;CDS;1412444;1412764;;;
deb;;CDS;1414541;1415428;35;*;
;comp;tRNA;1415464;1415540;84;*;cgt
;comp;tRNA;1415625;1415715;20;*;agc
;comp;tRNA;1415736;1415826;306;*;tca
;comp;tRNA;1416133;1416223;20;*;agc
;comp;tRNA;1416244;1416334;276;*;tca
fin;comp;CDS;1416611;1417891;;;
deb;comp;CDS;1425354;1425806;162;*;
;comp;tRNA;1425969;1426044;3;*;gca
;comp;tRNA;1426048;1426124;8;*;atgi
;comp;rRNA;1426133;1426246;79;*;114
;comp;rRNA;1426326;1427823;117;*;1498
fin;comp;CDS;1427941;1428051;;;
deb;;CDS;1694365;1694889;53;*;
;;tRNA;1694943;1695017;170;*;cag
fin;;CDS;1695188;1695592;;;
deb;comp;CDS;1721086;1722261;318;*;
;comp;tRNA;1722580;1722664;5;*;tac
;comp;tRNA;1722670;1722745;227;*;aca
fin;;CDS;1722973;1723695;;;
deb;;CDS;1840498;1841406;30;*;
;comp;tRNA;1841437;1841510;80;*;tgc
deb;comp;CDS;1841591;1842334;363;*;
;comp;rRNA;1842698;1842811;108;*;114
;comp;rRNA;1842920;1845817;228;*;2898
;comp;rRNA;1846046;1847543;416;*;1498
fin;comp;CDS;1847960;1850440;;;
deb;;CDS;1889552;1890361;172;*;
;;tRNA;1890534;1890608;17;*;gaa
;;tRNA;1890626;1890701;9;*;gta
;;tRNA;1890711;1890787;4;*;gac
;;tRNA;1890792;1890867;5;*;aca
;;tRNA;1890873;1890947;18;*;gaa
;;tRNA;1890966;1891041;7;*;gta
;;tRNA;1891049;1891125;57;*;gac
;;tRNA;1891183;1891257;17;*;gaa
;;tRNA;1891275;1891350;9;*;gta
;;tRNA;1891360;1891436;4;*;gac
;;tRNA;1891441;1891516;90;*;aca
fin;comp;CDS;1891607;1892584;;;
deb;comp;CDS;1946711;1948060;92;*;
;comp;tRNA;1948153;1948228;77;*;cca
fin;comp;CDS;1948306;1948614;;;
deb;;CDS;1968610;1969014;142;*;
;;tRNA;1969157;1969245;4;*;tta
;;tRNA;1969250;1969325;53;*;atgf
;;tRNA;1969379;1969454;10;*;atgf
;;tRNA;1969465;1969541;328;*;atgj
fin;;CDS;1969870;1972257;;;
deb;;CDS;1985594;1986970;570;*;
;;rRNA;1987541;1989040;226;*;1500
;;rRNA;1989267;1992166;93;*;2900
;;rRNA;1992260;1992375;7;*;116
;;tRNA;1992383;1992457;27;*;aac
;;tRNA;1992485;1992559;187;*;aac
fin;;CDS;1992747;1994819;;;
deb;;CDS;2012533;2013174;64;*;
;;tRNA;2013239;2013313;18;*;ggg
;;tRNA;2013332;2013407;82;*;acc
fin;;CDS;2013490;2014683;;;
deb;;CDS;2222077;2222463;51;*;
;;tRNA;2222515;2222590;239;*;tgg
fin;;CDS;2222830;2224086;;0;
deb;;CDS;2294151;2294621;145;*;
;;tRNA;2294767;2294842;7;*;cca
;;tRNA;2294850;2294923;6;*;gga
;;tRNA;2294930;2295006;5;*;aga
;;tRNA;2295012;2295087;26;*;aag
;;tRNA;2295114;2295189;29;*;cca
;;tRNA;2295219;2295292;24;*;gga
;;tRNA;2295317;2295393;387;*;cga
fin;;CDS;2295781;2297040;;;
deb;;CDS;2401601;2402491;64;*;
;;tRNA;2402556;2402631;5;*;gta
;;tRNA;2402637;2402713;3;*;gac
;;tRNA;2402717;2402792;4;*;ttc
;;tRNA;2402797;2402871;9;*;ggc
;;tRNA;2402881;2402954;313;*;tgc
fin;;CDS;2403268;2403963;;;
deb;comp;CDS;2515386;2516873;431;*;
;;tRNA;2517305;2517391;584;*;ttg
fin;comp;CDS;2517976;2518125;;;
deb;;CDS;2548065;2548610;97;*;
;;tRNA;2548708;2548792;556;*;ctc
fin;;CDS;2549349;2549786;;0;
deb;;CDS;2580636;2582543;754;*;
;;tRNA;2583298;2583388;745;*;tga
fin;;CDS;2584134;2585648;;;
&lt;/pre&gt;

===cbn===
====cbn opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_opérons|cbn opérons]]
&lt;pre&gt;
28%GC;30.6.19 Paris;16s  10;86;doubles;intercal;aa;avec aa
;Clostridium botulinum BKT015925;;;;;;
;20666..20741;;acg;;;;
;;;;;;;
;36413..36487;;gaa;+;12;12;
;36500..36575;;gta;2 gaa;13;13;
;36589..36665;;gac;2 gta;5;5;
;36671..36746;;aca;2 gac;18;18;
;36765..36839;;gaa;2 aca;12;12;
;36852..36927;;gta;;13;13;
;36941..37017;;gac;;5;5;
;37023..37098;;aca;;;;
;;;;;;;
;137366..137441;;cca;;;;
;;;;;;;
;161964..162052;;tta;+;5;5;
;162058..162133;;atgf;3 tta;5;5;
;162139..162215;;atgj;3 atgf;46;46;
;162262..162350;;tta;2 atgj;5;5;
;162356..162431;;atgf;;30;30;
;162462..162538;;atgj;;46;46;
;162585..162673;;tta;;5;5;
;162679..162754;;atgf;;;;
;;;;;;;
;76258..176332;;aac;;;;
;;;;;;;
;180177..181695;;16s;@5;233;;
;181929..184836;;23s;;45;;
;184882..184956;;aac;+;14;;
;184971..185087;;5s;;7;;
;185095..185169;;aac;2 aac;;;
;;;;;;;
;222409..222484;;acc;;;;
;;;;;;;
comp;578417..578492;;cag;;;;
;;;;;;;
comp;944747..944833;;ttg;;;;
;;;;;;;
;955546..955630;;ctt;;;;
;;;;;;;
;1026946..1027021;;gta;;17;17;17
;1027039..1027115;;gac;;14;14;14
;1027130..1027205;;ttc;;4;4;4
;1027210..1027284;;ggc;;8;8;8
;1027293..1027367;;tgc;+;57;57;57
;1027425..1027499;;tgc;2 tgc;;;
;;;;;;;
comp;2030816..2030890;;aac;;45;;
comp;2030936..2033842;;23s;;96;;
comp;2033939..2034015;;atc;;7;;7
comp;2034023..2034098;;gca;;121;;
comp;2034220..2035734;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2283768..2283884;;5s;;95;;
comp;2283980..2286886;;23s;;233;;
comp;2287120..2288638;;16s;@3;464;;
comp;2289103..2289176;;gga;;15;;15
comp;2289192..2289268;;atc;;7;;7
comp;2289276..2289351;;gca;;;;
;;;;;;;
comp;2350598..2350674;;cga;+;21;21;
comp;2350696..2350769;;gga;4 gga;28;28;
comp;2350798..2350873;;aaa;2 aaa;4;4;
comp;2350878..2350952;;caa;2 caa;4;4;
comp;2350957..2351032;;cac;2 cac;5;5;
comp;2351038..2351112;;aag;3 aag;3;3;
comp;2351116..2351192;;aga;3 aga;6;6;
comp;2351199..2351272;;gga;2 cca;4;4;
comp;2351277..2351352;;cca;2 ggc;21;21;
comp;2351374..2351449;;aag;;5;5;
comp;2351455..2351531;;aga;;5;5;
comp;2351537..2351610;;gga;;5;5;
comp;2351616..2351690;;ggc;;3;3;
comp;2351694..2351777;;cta;;22;22;
comp;2351800..2351875;;aaa;;4;4;
comp;2351880..2351954;;caa;;4;4;
comp;2351959..2352034;;cac;;5;5;
comp;2352040..2352115;;aag;;5;5;
comp;2352121..2352197;;aga;;5;5;
comp;2352203..2352276;;gga;;5;5;
comp;2352282..2352356;;ggc;;6;6;
comp;2352363..2352438;;cca;;;;
;;;;;;;
comp;2432784..2432859;;tgg;;;;
;;;;;;;
comp;2454880..2454964;;tac;+;39;39;
comp;2455004..2455079;;gta;2 tac;8;8;
comp;2455088..2455172;;tac;;4;4;
comp;2455177..2455252;;aca;;;;
;;;;;;;
comp;2697795..2697911;;5s;@1;31;;
comp;2697943..2700847;;23s;;233;;
comp;2701081..2702599;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2703946..2704021;;aaa;;311;;311
comp;2704333..2704408;;ttc;;5;;
comp;2704414..2704530;;5s;;336;;
comp;2704867..2704942;;ttc;;5;;
comp;2704948..2705064;;5s;;97;;
comp;2705162..2708066;;23s;;233;;
comp;2708300..2709814;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2721253..2721328;;aaa;@2;5;;
comp;2721334..2721450;;5s;;95;;
comp;2721546..2724452;;23s;;233;;
comp;2724686..2726203;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2731902..2731976;;gag;;61;;61
comp;2732038..2732112;;caa;;6;;6
comp;2732119..2732195;;aga;;4;;4
comp;2732200..2732273;;gga;;19;;19
comp;2732293..2732376;;cta;;16;;16
comp;2732393..2732467;;gaa;;4;;
comp;2732472..2732588;;5s;;97;;
comp;2732686..2735592;;23s;@4;94;;
comp;2735687..2735763;;atc;;3;;
comp;2735767..2735842;;gca;;74;;
comp;2735917..2737435;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2742262..2742351;;tcc;;;;
;;;;;;;
comp;2743220..2743312;;tcg;;;;
;;;;;;;
comp;2743891..2743967;;agg;;;;
;;;;;;;
comp;2748534..2748610;;cgt;;144;144;
comp;2748755..2748845;;agc;;23;23;
comp;2748869..2748959;;tca;+;69;69;
comp;2749029..2749119;;tca;2 tca;;;
;;;;;;;
comp;2758688..2758763;;gca;;4;;4
comp;2758768..2758844;;atgi;;3;;
comp;2758848..2758964;;5s;;73;;
comp;2759038..2761942;;23s;;233;;
comp;2762176..2763694;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2150504..2150620;;5s;;31;;
comp;2150652..2153560;;23s;;233;;
comp;2153794..2155308;;16s;;;;
;;;;;;;
comp;2169525..2169641;;5s;;32;;
comp;2169674..2172579;;23s;;233;;
comp;2172813..2174331;;16s;;;;
;;;;;;;
sur plasmide;;;tgg;;;;
&lt;/pre&gt;
====cbn cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_cumuls|cbn cumuls]]
&lt;pre&gt;
cbn cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;10;1;0;0
;16 23 5s 0;3;20;34;9
;16 gca atc;2;40;7;0
;16 23 5s a;4;60;3;0
;max a;8;80;1;1
;a doubles;1;100;0;0
;spéciaux;1;120;0;0
;total aas;22;140;0;0
sans ;opérons;18;160;1;0
;1 aa;12;180;0;0
;max a;22;200;0;0
;a doubles;6;;0;0
;total aas;64;;46;10
total aas;;86;;;
remarques;;5;;;
avec jaune;;;moyenne;17;
;;;variance;25;
sans jaune;;;moyenne;14;14
;;;variance;15;17
&lt;/pre&gt;
====cbn blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_blocs|cbn blocs]]
&lt;pre&gt;
cbn blocs;;;;;;
5s;31;31;32;;;
23s;233;233;233;;;
16s;;;;;;
;;;;;ttc;5
;;;;;5s;336
aaa;5;3;;;ttc;5
5s;95;73;5s;95;5s;97
23s;233;233;23s;233;23s;233
16s;aaa;atgi;16s;464;16s;
;;;gga;15;;
16s;233;;;;;
23s;45;;;;;
aac;14;;;;;
5s;7;;;;;
aac;;;;;;
gaa;4;;;;;
5s;97;aac;45;;;
23s;94;23s;96;;;
atc;3;atc;7;;;
gca;74;gca;121;;;
16s;;16s;;;;
&lt;/pre&gt;
====cbn distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_distribution|cbn distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;avant 5s;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;2 aac;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2;4-8 aas;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;gag;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;caa;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;aga;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;3;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;gga;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;2;aga;3;;ata;;aca;;aaa;;aga;;cta;ata;;aca;;aaa;;aga;1
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;1;cca;2;caa;2;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;;gaa;cta;1;cca;;caa;1;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;4;gca;;gaa;2;gga;4;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;&gt;1aa;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;3;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;tgc2;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;tca2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
cbn;;12;;;;;12;;cbn;48;;;;;;48;;cbn;4;;;;;;4;;cbn;;;;6;;;6
&lt;/pre&gt;
====cbn données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_données_intercalaires|cbn données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cbn;fx;fc;cbn;fx40;fc40;cbn;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;1;10;0;1;10;-1;0;34;214;206;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;
;0;10;10;172;1;1;37;-2;0;0;168;307;124;;gca;12;;gaa
;0;20;3;211;2;1;31;-3;0;0;131;106;77;;gca;13;;gta
;0;30;19;147;3;2;13;-4;0;28;158;480;tRNA 23s;;;5;;gac
;0;40;24;90;4;2;12;-5;0;0;115;435;97;;atc;18;;aca
;0;50;33;61;5;0;17;-6;1;0;275;60;95;;atc;12;;gaa
1;2;60;28;67;6;0;13;-7;0;5;140;348;23s tRNA;;;13;;gta
;5;70;26;71;7;1;11;-8;1;30;106;104;2* 48;;aac;5;;gac
;2;80;17;53;8;0;9;-9;1;0;67;117;5s tRNA;;;**;;aca
;1;90;13;59;9;1;10;-10;0;6;261;255;7;;aac;5;;tta
;1;100;18;68;10;2;19;-11;2;13;59;130;13;;ttc;5;;atgf
2;1;110;12;42;11;0;22;-12;1;0;82;;15;;ttc;46;;atgj
1;2;120;16;50;12;0;32;-13;0;2;379;;5;;aaa;5;;tta
1;1;130;24;50;13;0;22;-14;0;7;265;;4;;gaa;30;;atgf
;2;140;4;50;14;0;22;-15;0;0;233;;3;;atgi;46;;atgj
;0;150;11;50;15;0;23;-16;0;3;199;;tRNA 5s;;;5;;tta
;1;160;7;45;16;1;20;-17;1;10;73;;336;;ttc;**;;atgf
;1;170;16;48;17;1;16;-18;0;0;295;;14;;aac;17;;gta
;0;180;16;36;18;0;20;-19;0;2;58;;tRNA tRNA;;intra;14;;gac
;1;190;12;42;19;1;14;-20;0;7;324;;7;;gca atc;4;;ttc
;1;200;15;31;20;0;20;-21;1;0;183;;3;;gca atc;8;;ggc
1;0;210;11;27;21;0;20;-22;0;1;80;;tRNA tRNA;;contig;57;;tgc
;1;220;12;29;22;1;17;-23;0;2;245;;311;;aaa;**;;tgc
;0;230;11;30;23;3;12;-24;0;0;408;;**;;ttc;15;;gga
;1;240;15;19;24;1;13;-25;0;1;111;;61;;gag;7;;atc
;1;250;14;14;25;1;19;-26;0;2;64;;6;;caa;**;;gca
1;0;260;14;16;26;2;10;-27;1;0;69;;4;;aga;21;;cga
;2;270;11;10;27;3;17;-28;0;1;65;;19;;gga;28;;gga
;1;280;6;8;28;3;13;-29;0;5;95;;16;;cta;4;;aaa
;0;290;9;10;29;2;12;-30;0;0;61;;**;;gaa;4;;caa
;1;300;11;21;30;3;14;-31;0;1;125;;4;;gca;5;;cac
1;0;310;4;7;31;2;11;-32;0;1;CDS 16s;;**;;atgi;3;;aag
;0;320;5;7;32;2;5;-33;0;0;453;111;;;;6;;aga
;1;330;5;11;33;4;11;-34;0;0;423;111;;;;4;;gga
;0;340;11;5;34;0;8;-35;0;2;424;;;;;21;;cca
1;0;350;4;9;35;1;6;-36;0;0;423;;;;;5;;aag
;0;360;2;12;36;3;8;-37;0;0;346;;;;;5;;aga
;0;370;6;8;37;2;11;-38;0;0;393;;;;;5;;gga
;1;380;6;7;38;1;8;-39;0;0;402;;;;;3;;ggc
;0;390;1;6;39;7;10;-40;0;0;369;;;;;22;;cta
;0;400;5;4;40;2;12;-41;0;1;16s 23s;;;;;4;;aaa
2;1;reste;52;62;reste;483;1145;-42;0;0;8* 237;;;;;4;;caa
11;31;total;540;1775;total;540;1775;-43;0;0;23s 5s;;;;;5;;cac
9;30;diagr;487;1703;diagr;56;620;-44;0;1;2* 34;;;;;5;;aag
0;0; t30;32;530;;;;-45;0;0;35;;;;;5;;aga
;;;;;;;;-46;0;1;2* 98;;;;;5;;gga
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;2* 100;;;;;6;;ggc
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;76;;;;;**;;cca
;x;539;9;1;549;;;-49;0;0;5s CDS;;;;;39;;tac
;c;1765;167;10;1942;;;-50;0;0;128;590;;;;8;;gta
;;;;;2491;147;;reste;0;0;138;144;;;;4;;tac
;;;;;;2638;;total;9;167;;;;;;**;;aca
;;;;;;;;;;;;;;;;144;;cgt
;;;;;;;;;;;;;;;;23;;agc
;;;;;;;;;;;;;;;;69;;tca
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;tca
&lt;/pre&gt;
=====cbn autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_autres_intercalaires_aas|cbn autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cbn;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;20118;20459;206;*;
;;tRNA;20666;20741;214;*;acg
fin;;CDS;20956;21813;;;
deb;comp;CDS;34861;36105;307;*;
;;tRNA;36413;36487;12;*;gaa
;;tRNA;36500;36575;13;*;gta
;;tRNA;36589;36665;5;*;gac
;;tRNA;36671;36746;18;*;aca
;;tRNA;36765;36839;12;*;gaa
;;tRNA;36852;36927;13;*;gta
;;tRNA;36941;37017;5;*;gac
;;tRNA;37023;37098;106;*;aca
fin;comp;CDS;37205;38164;;;
deb;comp;CDS;135851;137197;168;*;
;comp;tRNA;137366;137441;131;*;cca
fin;comp;CDS;137573;137743;;0;
deb;;CDS;161395;161805;158;*;
;;tRNA;161964;162052;5;*;tta
;;tRNA;162058;162133;5;*;atgf
;;tRNA;162139;162215;46;*;atgj
;;tRNA;162262;162350;5;*;tta
;;tRNA;162356;162431;30;*;atgf
;;tRNA;162462;162538;46;*;atgj
;;tRNA;162585;162673;5;*;tta
;;tRNA;162679;162754;480;*;atgf
fin;comp;CDS;163235;163759;;0;
deb;;CDS;174610;176142;115;*;
;;tRNA;176258;176332;275;*;aac
fin;;CDS;176608;177999;;;
deb;;CDS;178351;179727;453;*;
;;rRNA;180181;181692;237;*;16s
;;rRNA;181930;184833;48;*;23s
;;tRNA;184882;184956;14;*;aac
;;rRNA;184971;185087;7;*;5s
;;tRNA;185095;185169;435;*;aac
fin;comp;CDS;185605;186639;;0;
deb;;CDS;221558;222268;140;*;
;;tRNA;222409;222484;106;*;aac
fin;;CDS;222591;223772;;;
deb;;CDS;577193;578356;60;*;
;comp;tRNA;578417;578492;67;*;cag
fin;comp;CDS;578560;579072;;;
deb;comp;CDS;943937;944485;261;*;
;comp;tRNA;944747;944833;348;*;ttg
fin;;CDS;945182;945985;;;
deb;;CDS;954881;955486;59;*;
;;tRNA;955546;955630;82;*;ctt
fin;;CDS;955713;956147;;;
deb;;CDS;1025682;1026566;379;*;
;;tRNA;1026946;1027021;17;*;gta
;;tRNA;1027039;1027115;14;*;gac
;;tRNA;1027130;1027205;4;*;ttc
;;tRNA;1027210;1027284;8;*;ggc
;;tRNA;1027293;1027367;57;*;tgc
;;tRNA;1027425;1027499;265;*;tgc
fin;;CDS;1027765;1027989;;;
deb;;CDS;1679540;1680001;6;*;
;comp;gene;1680008;1681575;128;*;
fin;comp;CDS;1681704;1683125;;;
deb;;CDS;1865810;1866349;45;*;
;;gene;1866395;1867531;88;*;
fin;comp;CDS;1867620;1868972;;;
deb;;CDS;2029941;2030711;104;*;
;comp;tRNA;2030816;2030890;48;*;aac
;comp;rRNA;2030939;2033841;97;*;23s
;comp;tRNA;2033939;2034015;7;*;atc
;comp;tRNA;2034023;2034098;124;*;gca
;comp;rRNA;2034223;2035730;423;*;16s
fin;comp;CDS;2036154;2036600;;;
deb;comp;CDS;2149914;2150375;128;*;
;comp;rRNA;2150504;2150620;34;*;5s
;comp;rRNA;2150655;2153559;237;*;23s
;comp;rRNA;2153797;2155304;424;*;16s
fin;comp;CDS;2155729;2156664;;0;
deb;;CDS;2168490;2168942;590;*;
;comp;rRNA;2169533;2169641;35;*;5s
;comp;rRNA;2169677;2172578;237;*;23s
;comp;rRNA;2172816;2174327;111;*;16s
fin;;CDS;2174439;2174690;;;
deb;;CDS;2281037;2283634;144;*;
;comp;rRNA;2283779;2283884;98;*;5s
;comp;rRNA;2283983;2286885;237;*;23s
;comp;rRNA;2287123;2288634;111;*;16s
deb;;CDS;2288746;2288985;117;*;
;comp;tRNA;2289103;2289176;15;*;gga
;comp;tRNA;2289192;2289268;7;*;atc
;comp;tRNA;2289276;2289351;233;*;gca
fin;comp;CDS;2289585;2290127;;0;
deb;comp;CDS;2349136;2350398;199;*;
;comp;tRNA;2350598;2350674;21;*;cga
;comp;tRNA;2350696;2350769;28;*;gga
;comp;tRNA;2350798;2350873;4;*;aaa
;comp;tRNA;2350878;2350952;4;*;caa
;comp;tRNA;2350957;2351032;5;*;cac
;comp;tRNA;2351038;2351112;3;*;aag
;comp;tRNA;2351116;2351192;6;*;aga
;comp;tRNA;2351199;2351272;4;*;gga
;comp;tRNA;2351277;2351352;21;*;cca
;comp;tRNA;2351374;2351449;5;*;aag
;comp;tRNA;2351455;2351531;5;*;aga
;comp;tRNA;2351537;2351610;5;*;gga
;comp;tRNA;2351616;2351690;3;*;ggc
;comp;tRNA;2351694;2351777;22;*;cta
;comp;tRNA;2351800;2351875;4;*;aaa
;comp;tRNA;2351880;2351954;4;*;caa
;comp;tRNA;2351959;2352034;5;*;cac
;comp;tRNA;2352040;2352115;5;*;aag
;comp;tRNA;2352121;2352197;5;*;aga
;comp;tRNA;2352203;2352276;5;*;gga
;comp;tRNA;2352282;2352356;6;*;ggc
;comp;tRNA;2352363;2352438;73;*;cca
fin;comp;CDS;2352512;2352910;;;
deb;comp;CDS;2430767;2432488;295;*;
;comp;tRNA;2432784;2432859;58;*;tgg
fin;comp;CDS;2432918;2433805;;0;
deb;comp;CDS;2453380;2454555;324;*;
;comp;tRNA;2454880;2454964;39;*;tac
;comp;tRNA;2455004;2455079;8;*;gta
;comp;tRNA;2455088;2455172;4;*;tac
;comp;tRNA;2455177;2455252;255;*;aca
fin;;CDS;2455508;2456227;;;
deb;comp;CDS;2696774;2697664;138;*;
;comp;rRNA;2697803;2697911;34;*;5s
;comp;rRNA;2697946;2700846;237;*;23s
;comp;rRNA;2701084;2702595;423;*;16s
deb;comp;CDS;2703019;2703762;183;*;
;comp;tRNA;2703946;2704021;311;*;aaa
;comp;tRNA;2704333;2704408;13;*;ttc
;comp;rRNA;2704422;2704530;336;*;5s
;comp;tRNA;2704867;2704942;15;*;ttc
;comp;rRNA;2704958;2705064;100;*;5s
;comp;rRNA;2705165;2708065;237;*;23s
;comp;rRNA;2708303;2709810;346;*;16s
fin;comp;CDS;2710157;2711029;;;
deb;comp;CDS;2720030;2721172;80;*;
;comp;tRNA;2721253;2721328;5;*;aaa
;comp;rRNA;2721334;2721450;98;*;5s
;comp;rRNA;2721549;2724451;237;*;23s
;comp;rRNA;2724689;2726199;393;*;16s
fin;comp;CDS;2726593;2727531;;;
deb;comp;CDS;2730964;2731656;245;*;
;comp;tRNA;2731902;2731976;61;*;gag
;comp;tRNA;2732038;2732112;6;*;caa
;comp;tRNA;2732119;2732195;4;*;aga
;comp;tRNA;2732200;2732273;19;*;gga
;comp;tRNA;2732293;2732376;16;*;cta
;comp;tRNA;2732393;2732467;4;*;gaa
;comp;rRNA;2732472;2732588;100;*;5s
;comp;rRNA;2732689;2735591;95;*;23s
;comp;tRNA;2735687;2735763;3;*;atc
;comp;tRNA;2735767;2735842;77;*;gca
;comp;rRNA;2735920;2737431;402;*;16s
fin;comp;CDS;2737834;2738727;;;
deb;comp;CDS;2740228;2741853;408;*;
;comp;tRNA;2742262;2742351;111;*;tcc
deb;comp;CDS;2742463;2743155;64;*;
;comp;tRNA;2743220;2743312;69;*;tcg
deb;comp;CDS;2743382;2743825;65;*;
;comp;tRNA;2743891;2743967;130;*;agg
fin;;CDS;2744098;2744829;;;
deb;comp;CDS;2746633;2748438;95;*;
;comp;tRNA;2748534;2748610;144;*;cgt
;comp;tRNA;2748755;2748845;23;*;agc
;comp;tRNA;2748869;2748959;69;*;tca
;comp;tRNA;2749029;2749119;61;*;tca
fin;comp;CDS;2749181;2750461;;;
deb;comp;CDS;2758098;2758562;125;*;
;comp;tRNA;2758688;2758763;4;*;gca
;comp;tRNA;2758768;2758844;3;*;atgi
;comp;rRNA;2758848;2758964;76;*;5s
;comp;rRNA;2759041;2761941;237;*;23s
;comp;rRNA;2762179;2763690;369;*;16s
fin;comp;CDS;2764060;2766609;;;
&lt;/pre&gt;

====cbn intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_entre_cds|cbn intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
cbn;2.2.21 Paris;;cbn 31.1.14;;;;;;;
cbn;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;176;7.1;'''négatif ;-11;10;-1 à -47;'''2 773 157;-1;176
;'''zéro;11;0.4;;;;;'''intercals;0;11
;'''1 à 200;1767;70.9;'''0 à 200;71;60;;'''313 764;5;116
;'''201 à 370;394;15.8;'''201 à 370;266;48;;'''11.3%;10;66
;'''371 à 600;117;4.7;'''371 à 600;464;65;;;15;121
;'''601 à max;26;1.0;'''601 à 1028;810;204;;;20;93
;'''total 2491;&lt;201;78.4;'''total 2491;125;141;-47 à 1443;;25;87
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;79
624731;1443;-1;176;-70;0;;0;11;35;50
834812;1270;0;11;-60;0;;-1;°34;40;64
1909773;1149;1;°38;-50;0;;-2;0;45;44
1395656;1025;2;°32;-40;4;;-3;0;50;50
1366434;952;3;15;-30;4;'''min à -1;-4;°28;55;60
2662601;856;4;14;-20;21;176;-5;0;60;35
1385645;836;5;°17;-10;47;7.1%;-6;1;65;56
754437;826;6;13;0;111;;-7;5;70;41
1803918;777;7;12;10;182;;-8;°31;75;32
1826878;759;8;9;20;214;;-9;1;80;38
1307165;753;9;11;30;166;;-10;6;85;35
627889;751;10;°21;40;114;'''1 à 100;-11;°15;90;37
1388755;748;11;22;50;94;1190;-12;1;95;40
2579132;747;12;°32;60;95;47.8%;-13;2;100;46
1789056;745;13;22;70;97;;-14;°7;105;28
1830367;730;14;22;80;70;;-15;0;110;26
841754;723;15;°23;90;72;;-16;3;115;35
1855513;710;16;21;100;86;;-17;°11;120;31
2136552;703;17;17;110;54;;-18;0;125;41
390878;696;18;°20;120;66;;-19;2;130;33
943107;680;19;15;130;74;;-20;°7;135;25
2674137;655;20;20;140;54;;-21;1;140;29
1095841;652;21;°20;150;61;;-22;1;145;30
2644575;626;22;18;160;52;;-23;°2;150;31
261153;625;23;15;170;64;'''1 à 200;-24;0;155;21
1887215;619;24;14;180;52;1767;-25;1;160;31
2676061;600;25;°20;190;54;70.9%;-26;°2;5;34
2443011;582;26;12;200;46;;-27;1;170;30
1811650;581;27;°20;210;38;;-28;1;175;27
1933429;576;28;16;220;41;;-29;°5;180;25
1797999;574;29;14;230;41;;-30;0;185;23
2550424;574;30;°17;240;34;;-31;1;190;31
2050753;573;31;13;250;28;;-32;1;195;23
923904;572;32;7;260;30;'''0 à 200;;181;200;23
313619;570;33;°15;270;21;1778;reste;6;205;19
1471664;569;34;8;280;14;;total;187;210;19
1133306;567;35;7;290;19;;;;215;17
262285;563;36;11;300;32;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;220;24
;;37;°13;310;11;;600;2465;225;25
;;38;9;320;12;;620;1;230;16
;;39;°17;330;16;;640;2;235;17
;;40;14;340;16;'''201 à 370;660;2;240;17
;;reste;1628;350;13;394;680;1;245;15
;;total;2491;360;14;15.8%;700;1;250;13
;;;;370;14;;720;2;255;15
;;;;380;13;;740;2;260;15
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;390;7;;760;6;265;10
1144166;-47;shift 2;1795;400;9;;780;1;270;11
369225;-46;shift 2;3395;410;5;;800;0;275;9
1579583;-44;shift 2;487;420;6;;820;0;280;5
430053;-41;;;430;3;;840;2;285;9
1494403;-35;;;440;2;;860;1;290;10
1957540;-35;;;450;8;;880;0;295;15
733250;-32;;;460;6;;900;0;300;17
271633;-31;;;470;5;;920;0;305;6
913392;-29;;;480;5;;940;0;310;5
1503608;-29;;;490;6;;960;1;315;9
1620962;-29;;;500;7;;980;0;320;3
1725747;-29;;;510;6;;1000;0;325;13
1823162;-29;;;520;1;;1020;0;330;3
2449289;-28;;;530;1;'''371 à 600;1040;1;335;5
1086603;-27;;;540;11;117;1060;0;340;11
783920;-26;;;550;2;4.7%;1080;0;345;4
2471206;-26;;;560;2;;1100;0;350;9
2107067;-25;;;570;4;'''601 à max;1120;0;355;10
292336;-23;;;580;5;26;1140;0;360;4
2553714;-23;;;590;2;1.0%;1160;1;365;8
2686151;-22;;;600;1;;;24;370;6
1577865;-21;;;reste;26;;reste;2;reste;143
500363;-20;;;total;2491;;total;2491;total;2491
&lt;/pre&gt;

====cbn  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_positifs_S+|cbn intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
cbn Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
scc;min10;416;961;1377;748;440;530;90;-88;49;367;;;
cbn;min20;489;1701;2190;731;543;505;-38;-222;-114;271;;;
eco;min20;1003;2130;3133;735;296;440;144;-178;-64;287;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
118;353;0.33;485;1320;4;5;58;242;60;389;-177;;;
65;312;0.21;553;1940;2;5;17;86;56;620;-382;;;
63;348;0.18;1169;2855;11;6;80;226;126;821;-119;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
cbn;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;15;-107;126;33;450;238;max50;&amp;-50;394;-1048;106;855;263;min50
31 à 400;;;;;;;;&amp;8.8;-32;-123;49;932;121;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;86;43;-;424;dte;26;tf;&amp;184;63;-;652;poly;203;SF
31 à 400;;;-;;;;;&amp;120;45;-;891;dte;41;tf
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;corrélation;;;;;;
41-n;0.731;0.543;0.505;;;;;-0.382;;;;;;
1-n;0.271;-0.222;-0.114;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
cbn;fx;fc;;cbn;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;cbn;Sx-;Sc-
0;1;10;;0;2;6;0;1;10;&gt;0;543;-1;0;34
10;10;172;;10;20;101;1;1;37;&lt;0;9;-2;0;0
20;3;211;;20;6;124;2;1;31;zéro;1;-3;0;0
30;19;147;;30;39;86;3;2;13;total;553;-4;0;28
40;24;90;;40;49;53;4;2;12;;c;-5;0;0
50;34;60;;50;70;35;5;0;17;&gt;0;1763;-6;1;0
60;28;67;;60;57;39;6;0;13;&lt;0;167;-7;0;5
70;26;71;;70;53;42;7;1;11;zéro;10;-8;1;30
80;17;53;;80;35;31;8;0;9;total;1940;-9;1;0
90;13;59;;90;27;35;9;1;10;;;-10;0;6
100;18;68;;100;37;40;10;2;19;total;2493;-11;2;13
110;12;42;;110;25;25;11;0;22;;;-12;1;0
120;16;50;;120;33;29;12;0;32;;;-13;0;2
130;24;50;;130;49;29;13;0;22;;;-14;0;7
140;4;50;;140;8;29;14;0;22;;;-15;0;0
150;12;49;;150;25;29;15;0;23;;;-16;0;3
160;7;45;;160;14;26;16;1;20;;;-17;1;10
170;16;48;;170;33;28;17;1;16;;;-18;0;0
180;16;36;;180;33;21;18;0;20;;;-19;0;2
190;12;42;;190;25;25;19;1;14;;;-20;0;7
200;15;31;;200;31;18;20;0;20;;;-21;1;0
210;11;27;;210;22;16;21;0;20;;;-22;0;1
220;12;29;;220;25;17;22;1;17;;;-23;0;2
230;11;30;;230;22;18;23;3;12;;;-24;0;0
240;15;19;;240;31;11;24;1;13;;;-25;0;1
250;14;14;;250;29;8;25;1;19;;;-26;0;2
260;14;16;;260;29;9;26;2;10;;;-27;1;0
270;11;10;;270;22;6;27;3;17;;;-28;0;1
280;6;8;;280;12;5;28;3;13;;;-29;0;5
290;9;10;;290;18;6;29;2;12;;;-30;0;0
300;11;21;;300;22;12;30;3;14;;;-31;0;1
310;4;7;;310;8;4;31;2;11;;;-32;0;1
320;5;7;;320;10;4;32;2;5;;;-33;0;0
330;5;11;;330;10;6;33;4;11;;;-34;0;0
340;11;5;;340;22;3;34;0;8;;;-35;0;2
350;4;9;;350;8;5;35;1;6;;;-36;0;0
360;2;12;;360;4;7;36;3;8;;;-37;0;0
370;6;8;;370;12;5;37;2;11;;;-38;0;0
380;6;7;;380;12;4;38;1;8;;;-39;0;0
390;1;6;;390;2;4;39;7;10;;;-40;0;0
400;5;4;;400;10;2;40;2;12;;;-41;0;1
reste;54;62;;;;;reste;487;1143;;;-42;0;0
total;544;1773;;t30;65;312;total;544;1773;;;-43;0;0
diagr;489;1701;;;;;diagr;56;620;;;-44;0;1
 - t30;457;1171;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;1
;;;;;;;;;;;;-47;0;1
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;reste;0;0
;;;;;;;;;;;;total;9;167
&lt;/pre&gt;

====cbn  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_négatifs_S-|cbn intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
cbn;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;;;;;1;;;1;;2;1;;;;;1;;;;1;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;8
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&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;cbn;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
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&lt;/pre&gt;

====cbn autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_autres_intercalaires|cbn autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
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&lt;/pre&gt;
====cbn intercalaires tRNA-cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_tRNA-cds|cbn intercalaires tRNA-cds]]
&lt;pre&gt;
cbn;intercalaires tRNA-cds;;;;;;;
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;80;;;;379;;;
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;;;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
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;taux;64%;61%;63%;;;;
&lt;/pre&gt;

===cle===
====cle opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_opérons|cle opérons]]
&lt;pre&gt;
34.3%GC;30.6.19 Paris;16s  11;104;doubles;intercalaires;;
;Clostridium lentocellum DSM 5427;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
;2065352..2065425;;ata;;;;
;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
;2592342..2592422;;ttg;;;;
;;;;;;;
;2606024..2606104;;ttg;;;;
;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;683;;
comp;3253672..3253748;;atgj;;7;;7
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;;;;;362637;;
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comp;3623830..3623902;;gca;;53;;53
comp;3623956..3624029;;atc;;7;;
comp;3624037..3624154;;5s;;72;;
comp;3624227..3625761;;16s;;149;;
comp;3625911..3625999;;tcc;;33;;33
comp;3626033..3626118;;tca;;;;
;;;;;;;
comp;3714637..3714709;;gta;;1;1;
comp;3714711..3714787;;atgj;;;;
&lt;/pre&gt;

====cle cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_cumuls|cle cumuls]]
&lt;pre&gt;
cle cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;19;1;1;0
;16 5 aa 23;5;20;14;15
;16 5 atc gca;2;40;10;6
;solo;11;60;2;5
;max a;14;80;1;1
;a doubles;2;100;0;0
;indéterminé;1;120;0;0
;total aas;46;140;0;0
sans ;opérons;29;160;1;0
;1 aa;19;180;0;0
;max a;10;200;1;0
;a doubles;2;;0;0
;total aas;59;;30;27
total aas;;105;;;
remarques;;5;;;
avec jaune;;;moyenne;29;
;;;variance;41;
sans jaune;;;moyenne;19;22
;;;variance;16;19
&lt;/pre&gt;
====cle blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_blocs|cle blocs]]
&lt;pre&gt;
cle blocs;;;
Solitaires;;;
16s;*2;16s°;@5
;;;
23s;*3;;
;;;
5s;3*4;89;
ggc;;;
;;;
aac;60;;
23s;;;
;;;
16s;137;;
5s;;;
;;;
16s;72;72;72
5s;5;4;4
gca;282;280;282
23s;;;
;;;
;;agc;202
16s;138;16s;72
5s;7;5s;4
atc;258;gca;262
23s;;23s;55
;;gac;61
;;;
;;;
;;aac;110
16s;72;23s;261
5s;7;gca;53
atc;53;atc;7
gca;261;5s;72
23s;110;16s;149
aac;9;tcc;33
;;;
;;;
5s;4;;@4
gaa;457;;
16s;605;;
23s;475;;
aaa;9;;
&lt;/pre&gt;
====cle distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_distribution|cle distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;après 16s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;1-3;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;(atcgca)2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;;aaa;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gca4;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;aga;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;atc1;ttc;2;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;gga;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;2
atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;4;agc;
ctc;;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;après 5s;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;1;gac;;ggc;;16s5saa23s;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;4 ggc;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;gaa;tta;1;tca;;taa;;tga;
ata;1;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;3;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;1;aga;
cta;1;cca;1;caa;;cga;1;;cta;1;cca;3;caa;3;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;cgt2;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;3;gca;;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;ctt2;gta;3;gca;;gaa;2;gga;
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;2;aag;1;agg;1;;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;16s5saa23s;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
cle;;19;;;;;19;;cle;38;;;;;;38;;cle;2;;;;;;2;;cle;;;;26;3;9;26
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8  1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====cle données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_données_intercalaires|cle données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cle;fx;fc;cle;fx40;fc40;cle;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;0;35;0;0;35;-1;0;78;421;212;CDS 16s;;;5s tRNA;;;tRNA tRNA;;
;0;10;9;278;1;0;56;-2;0;0;121;409;437;347;;3* 4;;gca;13;;tta
;0;20;6;387;2;0;50;-3;0;0;275;214;643;;;5;;gca;**;;tca
;1;30;5;213;3;0;36;-4;8;107;757;50;302;;;89;;ggc;23;;gaa
;0;40;12;144;4;2;24;-5;0;1;262;622;325;;;3* 7;;atc;45;;cca
1;1;50;21;85;5;2;20;-6;1;0;487;66;602;;;4;;gaa;11;;aaa
;1;60;27;93;6;1;8;-7;0;10;207;224;331;;;3* 4;;ggc;56;;gac
1;1;70;20;88;7;1;7;-8;1;72;92;142;323;;;tRNA tRNA;;intra;7;;gta
;1;80;37;104;8;2;12;-9;0;0;289;264;16s CDS;;;2* 53;;atc;187;;tta
1;0;90;35;84;9;1;30;-10;0;5;489;142;695;228;;**;;gca;26;;aca
;4;100;29;82;10;0;35;-11;1;41;125;405;16s 5s;;;tRNA tRNA;;contig;10;;tac
;1;110;24;80;11;2;55;-12;0;0;322;227;6* 79;;;61;;gac;31;;atgj
;3;120;17;65;12;0;64;-13;1;7;121;454;146;;;7;;gta;**;;ttc
1;5;130;26;79;13;2;39;-14;1;28;342;139;144;;;34;;aca;23;;cac
1;1;140;21;63;14;0;32;-15;1;0;44;445;16s 23s;;;12;;tac;32;;caa
3;2;150;21;79;15;1;42;-16;1;2;61;195;613;;;3;;atgj;**;;tca
1;1;160;31;72;16;0;37;-17;0;12;231;154;CDS 5s;;;3;;ttc;148;;ctt
;0;170;26;55;17;0;36;-18;0;0;132;201;335;228;;**;;aaa;**;;ctt
;2;180;21;50;18;1;28;-19;0;2;75;527;;343;;9;;aaa;5;;gga
;0;190;39;58;19;0;34;-20;1;14;125;409;;184;;6;;gga;5;;aga
1;1;200;22;50;20;0;20;-21;0;0;112;149;;301;;**;;aga;31;;cac
1;2;210;24;48;21;0;25;-22;1;2;91;87;5s CDS;;;9;;aac;23;;caa
2;1;220;20;42;22;0;21;-23;0;8;53;125;301;;;6;;gaa;30;;aaa
2;1;230;25;28;23;0;24;-24;0;0;124;;CDS 23s;;;23;;tgc;26;;cta
;2;240;13;30;24;0;24;-25;0;5;473;;531;;;58;;aac;5;;gga
;1;250;17;32;25;2;18;-26;1;9;141;;563;;;**;;tgc;6;;aga
;0;260;15;41;26;0;18;-27;0;0;174;;407;;;7;;atgj;**;;caa
1;2;270;17;35;27;1;31;-28;0;1;198;;23s CDS;;;9;;gta;4;;ggc
;1;280;14;26;28;0;18;-29;0;8;101;;313;188;;18;;tgg;**;;cca
;1;290;14;22;29;0;16;-30;0;0;238;;237;260;;**;;aac;62;;gaa
;0;300;14;29;30;2;18;-31;0;1;29;;299;;;4;;aca;22;;cca
;1;310;10;21;31;3;21;-32;2;8;93;;357;;;50;;cgt;**;;aaa
;0;320;8;20;32;2;26;-33;0;0;223;;188;;;27;;cgt;3;;tac
;2;330;5;7;33;0;10;-34;0;1;112;;336;;;6;;tta;**;;ttc
;0;340;11;14;34;2;7;-35;0;2;95;;tRNA 16s;;;47;;gta;7;;atgj
;1;350;4;12;35;2;9;-36;0;0;155;;204;;agc;25;;gac;4;;gta
;0;360;10;22;36;1;13;-37;0;0;523;;459;;gaa;23;;atgi;10;;gac
;0;370;6;14;37;1;19;-38;0;2;178;;151;;tcc;14;;aca;20;;tgg
;0;380;10;9;38;1;15;-39;0;0;141;;23s tRNA;;;9;;gaa;**;;aac
;0;390;4;13;39;0;13;-40;0;0;116;;56;;gac;**;;aac;4;;gta
;0;400;6;6;40;0;11;-41;0;2;212;;476;;aaa;33;;tcc;**;;atgj
7;6;reste;83;185;reste;747;1843;-42;0;0;209;;2* 111;;aac;**;;tca;;;
23;46;total;779;2900;total;779;2900;-43;0;0;329;;61;;aac;;;;;;
16;40;diagr;696;2680;diagr;32;1022;-44;1;0;267;;tRNA 23s;;;;;;;;
0;1; t30;20;878;;;;-45;0;0;249;;263;;gca;;;;;;
;;;;;;;;-46;0;1;310;;2* 283;;gca;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;;;284;;gca;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;262;;atc;;;;;;
;x;779;21;0;800;;;-49;0;0;;;2* 262;;gca;;;;;;
;c;2865;441;35;3341;;;-50;0;1;;;;;;;;;;;
;;;;;4141;273;;reste;0;10;;;;;;;;;;;
;;;;;;4414;;total;21;441;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====cle autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_autres_intercalaires_aas|cle autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cle;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;8716;9735;421;*;
;;tRNA;10157;10246;204;*;agc
;;rRNA;10451;11974;79;*;1524
;;rRNA;12054;12171;4;*;118
;;tRNA;12176;12248;263;*;gca
;;rRNA;12512;15413;56;*;2902
;;tRNA;15470;15543;61;*;gac
;;tRNA;15605;15677;7;*;gta
;;tRNA;15685;15757;34;*;aca
;;tRNA;15792;15872;12;*;tac
;;tRNA;15885;15961;3;*;atgj
;;tRNA;15965;16040;3;*;ttc
;;tRNA;16044;16116;121;*;aaa
fin;;CDS;16238;16705;;;
deb;;CDS;44432;45799;437;*;
;;rRNA;46237;47760;695;*;1524
fin;;CDS;48456;50240;;0;
deb;;CDS;66902;68521;531;*;
;;rRNA;69053;71963;313;*;2911
fin;;CDS;72277;72981;;;
deb;;CDS;72981;76196;643;*;
;;rRNA;76840;78364;79;*;1525
;;rRNA;78444;78561;5;*;118
;;tRNA;78567;78639;283;*;gca
;;rRNA;78923;81828;188;*;2906
deb;comp;CDS;82017;82505;228;*;
;;rRNA;82734;82851;4;*;118
;;tRNA;82856;82928;275;*;ggc
deb;;CDS;83204;84091;302;*;
;;rRNA;84394;85922;79;*;1529
;;rRNA;86002;86119;4;*;118
;;tRNA;86124;86196;284;*;gca
;;rRNA;86481;89385;237;*;2905
fin;;CDS;89623;90231;;;
deb;comp;CDS;94411;96423;343;*;
;;rRNA;96767;96884;89;*;118
;;tRNA;96974;97044;757;*;ggc
fin;;CDS;97802;98497;;;
deb;comp;CDS;101240;101917;212;*;
;;tRNA;102130;102201;409;*;cag
fin;comp;CDS;102611;103510;;;
deb;comp;CDS;103635;104501;214;*;
;;tRNA;104716;104799;13;*;tta
;;tRNA;104813;104898;262;*;tca
fin;;CDS;105161;106408;;;
deb;comp;CDS;135278;135838;80;*;
;comp;regulatory;135919;136018;495;*;
fin;;CDS;136514;138715;;;
deb;;CDS;140906;141175;325;*;
;;rRNA;141501;143026;146;*;1526
;;rRNA;143173;143290;7;*;118
;;tRNA;143298;143371;262;*;atc
;;rRNA;143634;146537;299;*;2904
fin;;CDS;146837;147139;;0;
deb;;CDS;149226;150632;335;*;
;;rRNA;150968;151085;4;*;118
;;tRNA;151090;151161;459;*;gaa
;;rRNA;151621;153153;613;*;1533
;;rRNA;153767;156670;476;*;2904
;;tRNA;157147;157219;9;*;aaa
;;tRNA;157229;157299;6;*;gga
;;tRNA;157306;157379;487;*;aga
fin;;CDS;157867;158490;;;
deb;comp;CDS;160912;161418;184;*;
;;rRNA;161603;161720;4;*;118
;;tRNA;161725;161797;50;*;ggc
fin;comp;CDS;161848;162624;;;
deb;comp;CDS;162740;165070;522;*;
;;misc_b;165593;165910;56;*;
fin;;CDS;165967;167493;;;
deb;comp;CDS;171336;172279;622;*;
;;tRNA;172902;172973;23;*;gaa
;;tRNA;172997;173071;45;*;cca
;;tRNA;173117;173189;11;*;aaa
;;tRNA;173201;173274;56;*;gac
;;tRNA;173331;173403;7;*;gta
;;tRNA;173411;173494;187;*;tta
;;tRNA;173682;173754;26;*;aca
;;tRNA;173781;173861;10;*;tac
;;tRNA;173872;173948;31;*;atgj
;;tRNA;173980;174052;207;*;ttc
fin;;CDS;174260;174673;;;
deb;comp;CDS;190039;190368;288;*;
;;misc_b;190657;190881;79;*;
fin;;CDS;190961;192721;;;
deb;comp;CDS;421861;422205;347;*;
;;rRNA;422553;424078;228;*;1526
fin;comp;CDS;424307;425017;;0;
deb;;CDS;459976;460971;367;*;
;;regulatory;461339;461464;137;*;
fin;;CDS;461602;462906;;0;
deb;comp;CDS;473892;474338;416;*;
;;regulatory;474755;474880;137;*;
fin;;CDS;475018;476358;;;
deb;;CDS;536211;537422;563;*;
;;rRNA;537986;540889;357;*;2904
fin;;CDS;541247;541735;;0;
deb;;CDS;564995;565951;92;*;
;;tRNA;566044;566117;23;*;cac
;;tRNA;566141;566212;32;*;caa
;;tRNA;566245;566330;289;*;tca
fin;;CDS;566620;567750;;;
deb;;CDS;570670;571383;602;*;
;;rRNA;571986;573512;79;*;1527
;;rRNA;573592;573709;4;*;118
;;tRNA;573714;573786;283;*;gca
;;rRNA;574070;576974;187;*;2905
fin;;CDS;577162;578526;;;
deb;;CDS;601262;601948;331;*;
;;rRNA;602280;603805;144;*;1526
;;rRNA;603950;604067;301;*;118
fin;;CDS;604369;605106;;;
deb;;CDS;614484;614675;407;*;
;;rRNA;615083;617986;260;*;2904
fin;comp;CDS;618247;619251;;0;
deb;;CDS;685823;686155;210;*;
;;misc_b;686366;686632;51;*;
fin;;CDS;686684;686965;;;
deb;comp;CDS;736286;737200;301;*;
;;rRNA;737502;737619;4;*;118
;;tRNA;737624;737696;489;*;ggc
fin;;CDS;738186;738905;;;
deb;;CDS;740293;740862;125;*;
;;tRNA;740988;741058;322;*;gga
fin;;CDS;741381;742271;;;
deb;;CDS;757105;759717;121;*;
;;tRNA;759839;759920;66;*;cta
fin;comp;CDS;759987;760835;;0;
deb;;CDS;786859;787458;71;*;
;;misc_b;787530;787823;195;*;
fin;;CDS;788019;789995;;;
deb;;CDS;825593;830971;885;*;
;;regulatory;831857;832030;230;*;
fin;;CDS;832261;833262;;;
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;;tRNA;911999;912083;148;*;ctt
;;tRNA;912232;912316;342;*;ctt
fin;;CDS;912659;914539;;0;
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;;misc_b;1016632;1016837;131;*;
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fin;comp;CDS;1035408;1036631;;;
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;;tRNA;1234646;1234717;58;*;aac
;;tRNA;1234776;1234846;132;*;tgc
fin;;CDS;1234979;1235152;;;
deb;;CDS;1279854;1280135;75;*;
;;tRNA;1280211;1280283;125;*;atgf
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;comp;tRNA;2090478;2090550;93;*;acc
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;comp;tRNA;2881571;2881642;116;*;gag
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;comp;tRNA;3253838;3253910;18;*;tgg
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;comp;tRNA;3619806;3619879;27;*;cgt
;comp;tRNA;3619907;3619990;6;*;tta
;comp;tRNA;3619997;3620069;47;*;gta
;comp;tRNA;3620117;3620190;25;*;gac
;comp;tRNA;3620216;3620289;23;*;atgi
;comp;tRNA;3620313;3620385;14;*;aca
;comp;tRNA;3620400;3620471;9;*;gaa
;comp;tRNA;3620481;3620552;111;*;aac
;comp;rRNA;3620664;3623567;262;*;2904
;comp;tRNA;3623830;3623902;53;*;gca
;comp;tRNA;3623956;3624029;7;*;atc
;comp;rRNA;3624037;3624154;79;*;118
;comp;rRNA;3624234;3625759;151;*;1526
;comp;tRNA;3625911;3625999;33;*;tcc
;comp;tRNA;3626033;3626118;267;*;tca
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;comp;tRNA;3714637;3714709;4;*;gta
;comp;tRNA;3714714;3714787;310;*;atgj
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;comp;regulatory;4594014;4594127;357;*;
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;comp;regulatory;4695982;4696073;275;*;
fin;comp;CDS;4696349;4697491;;0;
&lt;/pre&gt;

===hmo===
====hmo opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_opérons|hmo opérons]]
&lt;pre&gt;
57%GC;24.7.19 Paris;16s ;109;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;aas;CDS dirigé
Heliobacterium modesticaldum Ice1 ATCC 51547 ;;;;;;;;;;
;103699..104088;;CDS;;380;;;;130;
;;;;;;;;;;
;104469..105695;;CDS;;186;186;;;409;186
comp;105882..105956;;ggc;;1;;1;;;
comp;105958..106044;;ctg;;321;321;;;;
comp;106366..106929;;CDS;@1;241;241;;;188;241
comp;107171..107246;;aca;;202;202;;;;202
comp;107449..108183;;CDS;;111772;;;;245;
;;;;;;;;;;
comp;219956..220483;;CDS;;260;260;;;176;260
comp;220744..220820;;gac;;5;;;5;;
comp;220826..220901;;gta;;10;;;10;;
comp;220912..220987;;gaa;;4;;;4;;
comp;220992..221067;;aaa;;18;;;18;;
comp;221086..221160;;caa;;103;;;;;
comp;221264..224182;;23s;;237;;;;;
comp;224420..224495;;gcc;;64;;;;;
comp;224560..224676;;5s;@2;328;;;;;
comp;225005..226536;;16s;;651;651;;;;
comp;227188..228162;;CDS;;98792;;;;325;
;;;;;;;;;;
comp;326955..328340;;CDS;;178;178;;;462;178
comp;328519..328601;;cta;;65;;65;;;
comp;328667..328743;;aga;;60;;60;;;
comp;328804..328880;;cca;;568;568;;;;
comp;329449..330090;;CDS;;57730;;;;214;
;;;;;;;;;;
comp;387821..388105;;CDS;;135;135;;;95;
;388241..388317;;ccc;;7;;7;;;
;388325..388410;;tac;;47;47;;;;47
comp;388458..388742;;CDS;;588493;;;;95;
;;;;;;;;;;
comp;977236..978504;;CDS;;439;439;;;423;
comp;978944..981860;;23s;;237;;;;;
comp;982098..982173;;gcc;;64;;;;;
comp;982238..982354;;5s;;328;;;;;
comp;982683..984208;;16s;;460;;;;;
comp;984669..984744;;tgg;@3;5;;;5;;
comp;984750..984824;;cgg;;207;207;;;;207
comp;985032..987656;;CDS;;26258;;;;875;
;;;;;;;;;;
comp;1013915..1014760;;CDS;;105;105;;;282;105
comp;1014866..1014942;;gac;;75;;75;;;
comp;1015018..1015093;;gaa;;265;265;;;;
comp;1015359..1016642;;CDS;;40115;;;;428;
;;;;;;;;;;
;1056758..1058014;;CDS;;121;121;;;419;121
comp;1058136..1058233;;tga;;173;173;;;;
;1058407..1058733;;CDS;;62951;;;;109;
;;;;;;;;;;
;1121685..1122878;;CDS;;588;588;;;398;
;1123467..1124998;;16s;;328;;;;;
;1125327..1125443;;5s;;64;;;;;
;1125508..1125583;;gcc;;233;;;;;
;1125817..1128734;;23s;;337;337;;;;337
&gt;;1129072..1129785;;CDS;;24938;;;;238;
;;;;;;;;;;
;1154724..1155224;;CDS;;99;99;;;167;
;1155324..1155413;;tca;;56;56;;;;56
comp;1155470..1156627;;CDS;;13350;;;;386;
;;;;;;;;;;
;1169978..1171828;;CDS;;129;129;;;617;129
;1171958..1172034;;cgt;;85;;85;;;
;1172120..1172196;;agg;;181;181;;;;
;1172378..1172812;;CDS;;62;62;;;145;62
;1172875..1172966;;tcg;;548;548;;;;
;1173515..1174330;;CDS;;6655;;;;272;
;;;;;;;;;;
comp;1180986..1182974;;CDS;;444;444;;;663;
;1183419..1183512;;tcc;;39;39;;;;39
;1183552..1183817;;ncRNA;;11908;;;;89;
;;;;;;;;;;
;1195726..1195998;;CDS;;181;181;;;91;
;1196180..1196255;;gcg;;151;151;;;;151
;1196407..1197051;;CDS;;86894;;;;215;
;;;;;;;;;;
comp;1283946..1285331;;CDS;;177;177;;;462;177
;1285509..1285584;;atgf;;5;;5;;;
;1285590..1285667;;atgj;;7;;7;;;
;1285675..1285750;;gaa;;542;542;;;;
;1286293..1287630;;CDS;;63447;;;;446;
;;;;;;;;;;
;1351078..1352549;;CDS;;704;704;;;491;
;1353254..1354786;;16s;;252;;;;;
;1355039..1355155;;5s;;64;;;;;
;1355220..1355296;;atc;;194;;;;;
;1355491..1358408;;23s;;112;;;;;
;1358521..1358595;;aac;;109;109;;;;109
comp;1358705..1358926;;CDS;;139555;;;;74;
;;;;;;;;;;
;1498482..1498898;;CDS;;535;535;;;139;
comp;1499434..1499509;;acg;;238;238;;;;238
;1499748..1500836;;CDS;;262182;;;;363;
;;;;;;;;;;
;1763019..1763858;;CDS;;68;68;;;280;68
;1763927..1764003;;gac;;4;;4;;;
;1764008..1764083;;ttc;;3;;3;;;
;1764087..1764161;;ggc;;92;92;;;;
comp;1764254..1764493;;CDS;;72;72;;;80;72
;1764566..1764641;;tgc;;18;;18;;;
;1764660..1764746;;tta;;253;253;;;;
comp;1765000..1765467;;CDS;;52131;;;;156;
;;;;;;;;;;
;1817599..1818318;;CDS;;487;487;;;240;
;1818806..1820337;;16s;;252;;;;;
;1820590..1820706;;5s;;64;;;;;
;1820771..1820847;;atc;;6;;;6;;
;1820854..1820929;;gca;;229;;;;;
;1821159..1824076;;23s;;112;;;;;
;1824189..1824263;;aac;;6;;;6;;
;1824270..1824345;;atgf;;243;243;;;;243
;1824589..1825014;;CDS;;168198;;;;142;
;;;;;;;;;;
;1993213..1994328;;CDS;;99;99;;;372;
;1994428..1994502;;atgi;;41;41;;;;41
;1994544..1995368;;CDS;;284281;;;;275;
;;;;;;;;;;
;2279650..2279997;;CDS ;;541;541;;;116;
;2280539..2282070;;16s;;253;;;;;
;2282324..2282440;;5s;;64;;;;;
;2282505..2282580;;gcc;;234;;;;;
;2282815..2285735;;23s;;119;;;;;
;2285855..2285948;;tcc;;6;;;6;;
;2285955..2286031;;ccg;;10;;;10;;
;2286042..2286115;;gga;;14;;;14;;
;2286130..2286205;;cac;;1;;;1;;
;2286207..2286281;;tgc;;9;;;9;;
;2286291..2286367;;gtc;;3;;;3;;
;2286371..2286446;;ttc;;6;;;6;;
;2286453..2286537;;tac;;4;;;4;;
;2286542..2286616;;caa;;17;;;17;;
;2286634..2286709;;aaa;;4;;;4;;
;2286714..2286789;;gaa;;5;;;5;;
;2286795..2286870;;gta;;5;;;5;;
;2286876..2286952;;gac;;7;;;7;;
;2286960..2287050;;agc;;43;;;43;;
;2287094..2287170;;ccc;;30;;;30;;
;2287201..2287287;;ctg;;3;;;3;;
;2287291..2287365;;ggc;;4;;;4;;
;2287370..2287446;;cgt;;4;;;4;;
;2287451..2287526;;acc;;352;352;;;;352
;2287879..2288343;;CDS ;;33184;;;;155;
;;;;;;;;;;
comp;2321528..2322544;;CDS ;;268;268;;;339;
comp;2322813..2322889;;gtc;;9;;9;;;
comp;2322899..2322973;;cgg;;81;81;;;;81
comp;2323055..2323243;;CDS ;;3375;;;;63;
;;;;;;;;;;
;2326619..2327947;;CDS ;;464;464;;;443;464
;2328412..2329943;;16s;;327;;;;;
;2330271..2330387;;5s;;226;;;;;
;2330614..2333532;;23s;;98;;;;;
;2333631..2333706;;aaa;;4;;;4;;
;2333711..2333786;;acc;;8;;;8;;
;2333795..2333877;;ctc;;89;89;;;;89
comp;2333967..2334704;;CDS;;7389;;;;246;
;;;;;;;;;;
;2342094..2342804;;CDS;;155;155;;;237;155
comp;2342960..2343030;;ttc;;213;213;;;;
;2343244..2343936;;CDS;;563;563;;;231;
;2344500..2346025;;16s;;252;;;;;
;2346278..2346394;;5s;;64;;;;;
;2346459..2346535;;atc;;141;;;;;
;2346677..2349594;;23s;;100;;;;;
;2349695..2349769;;aac;;6;;;6;;
;2349776..2349851;;atgf;;102;102;;;;102
;2349954..2350976;;CDS;;113601;;;;341;
;;;;;;;;;;
;2464578..2465114;;CDS;;271;271;;;179;271
comp;2465386..2465461;;aca;;432;432;;;;
;2465894..2466226;;CDS;;4722;;;;111;
;;;;;;;;;;
;2470949..2471977;;CDS;;69;69;;;343;69
;2472047..2472133;;ctg;;678;678;;;;
;2472812..2473192;;CDS;;22232;;;;127;
;;;;;;;;;;
;2495425..2496048;;CDS;;402;402;;;208;
comp;2496451..2496527;;gtc;;4;;4;;;
comp;2496532..2496609;;atgj;;175;175;;;;175
;2496785..2497120;;CDS;;217;217;;;112;
comp;2497338..2497420;;ctc;;7;;7;;;
comp;2497428..2497503;;acc;;18;;18;;;
comp;2497522..2497596;;tgg;;14;;14;;;
comp;2497611..2497684;;ggg;;19;;19;;;
comp;2497704..2497778;;ggc;;7;;7;;;
comp;2497786..2497873;;ttg;;8;;8;;;
comp;2497882..2497958;;gtg;;-10;-10;;;;-10
comp;2497949..2498185;;CDS;;66;66;;;79;66
;2498252..2498328;;ccg;;314;314;;;;
comp;2498643..2499506;;CDS;;55292;;;;288;
;;;;;;;;;;
;2554799..2554984;;CDS;;109;109;;;62;109
;2555094..2555169;;gaa;;2;;2;;;
;2555172..2555247;;ttc;;6;;6;;;
;2555254..2555338;;tac;;4;;4;;;
;2555343..2555417;;caa;;18;;18;;;
;2555436..2555511;;aaa;;4;;4;;;
;2555516..2555590;;ggc;;9;;9;;;
;2555600..2555675;;cac;;117;117;;;;
comp;2555793..2557049;;CDS;;235940;;;;419;
;;;;;;;;;;
comp;2792990..2793442;;CDS;;219;219;;;151;219
comp;2793662..2796583;;23s;;236;;;;;
comp;2796820..2796895;;gca;;6;;;6;;
comp;2796902..2796978;;atc;;64;;;;;
comp;2797043..2797159;;5s;;328;;;;;
comp;2797488..2799019;;16s;;505;;;;;
comp;2799525..2799599;;ggc;+;1;;;1;;
comp;2799601..2799687;;ctg;2 ggc;32;;;32;;
comp;2799720..2799796;;ccc;;42;;;42;;
comp;2799839..2799915;;cgt;;4;;;4;;
comp;2799920..2799994;;ggc;;120;;;120;;
comp;2800115..2800192;;atgj;;42;;;42;;
comp;2800235..2800325;;agc;;16;;;16;;
comp;2800342..2800417;;atgf;;6;;;6;;
comp;2800424..2800498;;aac;;7;;;7;;
comp;2800506..2800581;;gaa;;4;;;4;;
comp;2800586..2800661;;aaa;;18;;;18;;
comp;2800680..2800754;;caa;;4;;;4;;
comp;2800759..2800843;;tac;;91;;;91;;
comp;2800935..2801011;;gtc;;7;;;7;;
comp;2801019..2801093;;tgc;;325;325;;;;
;2801419..2801724;;CDS;;230813;;;;102;
;;;;;;;;;;
;3032538..3032729;;CDS;;109;109;;;64;109
comp;3032839..3035757;;23s;;233;;;;;
comp;3035991..3036066;;gcc;;64;;;;;
comp;3036131..3036247;;5s;;253;;;;;
comp;3036501..3038026;;16s;;779;779;;;;
comp;3038806..3040017;;CDS;;232;;;;404;
;;;;;;;;;;
comp;3040250..3042013;;CDS;;;;;;588;
&lt;/pre&gt;

====hmo cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_cumuls|hmo cumuls]]
&lt;pre&gt;
hmo cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;10;1;1;2;1;1;40;1;100;10
;16 5s gcc 23;5;20;20;34;50;3;80;8;200;16
;16 5s atc 23;2;40;0;2;100;11;120;7;300;14
;16 5 23s a;1;60;1;3;150;9;160;4;400;8
;max a;20;80;2;0;200;9;200;4;500;11
;a doubles;1;100;1;1;250;8;240;4;600;0
;16 5s atc gca;2;120;0;1;300;5;280;4;700;2
;total aas;60;140;0;0;350;4;320;0;800;0
sans ;opérons;24;160;0;0;400;1;360;2;900;1
;1 aa;12;180;0;0;450;4;400;0;1000;0
;max a;7;200;0;0;500;2;440;0;1100;0
;a doubles;0;;0;0;;11;;1;;0
;total aas;49;;25;43;;68;;35;;62
total aas;;109;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;;;;;
;;;variance;;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;8;8;;196;;137;;230
;;;variance;6;7;;120;;71;;128
&lt;/pre&gt;

====hmo blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_blocs|hmo blocs]]
&lt;pre&gt;
hmo blocs;;;;;tgg
CDS ;541;651;588;779;460
16s;253;328;328;253;328
5s;64;64;64;64;64
gcc;234;237;233;233;237
23s;119;103;337;109;439
tcc;tcc;caa;cds;cds;cds
;;;;;
CDS;704;563;;CDS ;464
16s;252;252;;16s;327
5s;64;64;;5s;226
atc;194;141;;23s;98
23s;112;100;;aaa;
aac;aac;aac;;;
;;;;;
;;ggc;;;
CDS;487;505;;;
16s;252;328;;;
5s;64;64;;;
atc;6;6;;;
gca;229;236;;;
23s;112;219;;;
aac;aac;cds;;;
&lt;/pre&gt;
====hmo distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_distribution|hmo distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;;;;;;;;;1-3 aas;atgi;;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;ctc;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;acc;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;3 aac;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;2;tgc;1;;;;;;;;;;aaa;ttc;1;tcc;1;tac;2;tgc;2
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;;;;;;;;;;;2 atgf;atc;;acc;1;aac;1;agc;2
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;;;;;;;;;tgg;ctc;;ccc;2;cac;1;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;2;gcc;;gac;2;ggc;4;;;;;;;;;;cgg;gtc;2;gcc;;gac;2;ggc;3
tta;;tca;1;taa;;tga;1;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;;;;;;;;;;ata;;aca;;aaa;3;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;cta;;cca;;caa;3;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;3;gga;;;;;;;;;;;;gta;2;gca;;gaa;3;gga;1
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;1;;;;;;;;;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;;;;;;;;;;ctg;2;ccg;1;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;1;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
hmo;;12;;;;;12;;hmo;37;;;;;;37;;;;;;;;;;;hmo;;;;39;;11;39
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;10 1-3 aas;;;
&lt;/pre&gt;
====hmo données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_données_intercalaires|hmo données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;hmo;fx;fc;hmo;fx40;fc40;hmo;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;0;17;0;0;17;-1;0;36;321;186;23s tRNA;;;tRNA tRNA;;contig;tRNA tRNA;;
;0;10;9;183;1;1;21;-2;1;0;268;135;103;;caa;5;;gac;1;;ggc
;0;20;10;167;2;3;38;-3;0;0;202;121;2* 112;;aac;10;;gta;**;;ctg
;0;30;4;109;3;0;37;-4;3;149;260;173;119;;tcc;4;;gaa;65;;cta
;0;40;6;77;4;0;21;-5;0;0;268;56;98;;aaa;18;;aaa;60;;aga
;0;50;9;70;5;0;18;-6;0;0;176;444;100;;aac;**;;caa;**;;cca
1;0;60;9;64;6;2;9;-7;0;11;1012;159;tRNA 23s;;;6;;aac;7;;ccc
;3;70;8;66;7;0;8;-8;0;23;159;535;2* 241;;gcc;**;;atgf;**;;tac
1;0;80;12;71;8;0;7;-9;0;1;207;238;2* 237;;gcc;6;;tcc;5;;tgg
1;1;90;27;71;9;3;11;-10;0;7;165;92;198;;atc;10;;ccg;**;;cgg
1;2;100;7;68;10;0;13;-11;0;17;265;72;233;;gca;14;;gga;75;;gac
;1;110;18;66;11;1;15;-12;0;0;99;253;238;;gcc;1;;cac;**;;gaa
1;1;120;18;53;12;1;16;-13;1;8;129;89;145;;atc;9;;tgc;85;;cgt
1;2;130;16;56;13;1;24;-14;0;15;157;158;240;;gca;3;;gtc;**;;agg
1;0;140;16;47;14;0;23;-15;1;0;62;222;5s tRNA;;;6;;ttc;5;;atgf
;1;150;16;57;15;0;15;-16;0;0;551;271;5* 64;;gcc;4;;tac;7;;atgj
2;2;160;12;43;16;0;13;-17;0;12;181;432;4* 64;;atc;17;;caa;**;;gaa
;1;170;10;46;17;1;16;-18;0;0;205;402;tRNA tRNA;;intra;4;;aaa;4;;gac
2;1;180;16;36;18;1;18;-19;0;3;542;175;2* 6;;atc;5;;gaa;3;;ttc
1;1;190;10;32;19;3;11;-20;0;8;431;217;**;;gca;5;;gta;**;;ggc
;0;200;7;31;20;2;16;-21;0;0;68;314;;;;7;;gac;18;;tgc
;3;210;14;24;21;2;16;-22;0;2;243;117;;;;43;;agc;**;;tta
1;0;220;8;32;22;0;6;-23;0;5;99;325;;;;30;;ccc;9;;gtc
1;0;230;15;20;23;0;9;-24;0;0;116;;;;;3;;ctg;**;;cgg
1;0;240;16;27;24;0;12;-25;0;4;352;;;;;4;;ggc;4;;gtc
;1;250;15;30;25;0;4;-26;0;2;268;;;;;4;;cgt;**;;atgj
1;1;260;10;23;26;0;12;-27;0;0;81;;;;;**;;acc;7;;ctc
;4;270;7;17;27;0;19;-28;0;2;126;;;;;4;;aaa;18;;acc
1;0;280;7;21;28;1;13;-29;0;1;69;;;;;8;;acc;14;;tgg
;0;290;7;20;29;0;8;-30;0;0;148;;;;;**;;ctc;19;;ggg
;0;300;6;16;30;1;10;-31;0;1;109;;;;;6;;aac;7;;ggc
;0;310;5;13;31;1;11;-32;1;3;CDS 16s;;;;;**;;atgf;8;;ttg
1;0;320;7;10;32;1;8;-33;0;0;652;;;;;1;;ggc;-;293;gtg
1;1;330;12;12;33;0;14;-34;1;1;20;;;;;32;;ctg;**;;ccg
;0;340;1;11;34;0;6;-35;0;1;559;;;;;42;;ccc;2;;gaa
;0;350;6;6;35;1;6;-36;0;0;705;;;;;4;;cgt;6;;ttc
;1;360;3;10;36;1;11;-37;0;2;488;;;;;120;;ggc;4;;tac
;0;370;12;13;37;0;7;-38;0;2;542;;;;;42;;atgj;18;;caa
;0;380;3;11;38;1;4;-39;0;0;459;;;;;16;;agc;4;;aaa
;0;390;6;7;39;0;4;-40;1;0;558;;;;;6;;atgf;9;;ggc
;0;400;2;6;40;1;6;-41;0;0;506;;;;;7;;aac;**;;cac
4;4;reste;58;108;reste;431;1314;-42;0;0;774;;;;;4;;gaa;;;
23;31;total;460;1867;total;460;1867;-43;0;0;5s 23s;;;;;18;;aaa;;;
19;27;diagr;402;1742;diagr;29;536;-44;0;0;230;;;;;4;;caa;;;
0;0; t30;23;459;;;;-45;0;0;16s 5s;;;;;91;;tac;;;
;;;;;;;;-46;0;0;4* 337;;;;;7;;gtc;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;3* 261;;;;;**;;tgc;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;2* 262;;;;;;;;;;
;x;460;11;0;471;;;-49;0;0;336;;;;;;;;;;
;c;1850;332;17;2199;;;-50;0;15;23s CDS;;;;;;;;;;
;;;;;2670;223;;reste;2;0;463;109;;;;;;;;;
;;;;;;2893;;total;11;332;322;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;223;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====hmo autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_autres_intercalaires_aas|hmo autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;hmo;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;83932;85227;106;*;
;comp;regulatory;85334;85456;283;*;
fin;;CDS;85740;86651;;;
deb;;CDS;104469;105695;186;*;
;comp;tRNA;105882;105956;1;*;ggc
;comp;tRNA;105958;106044;321;*;ctg
deb;comp;CDS;106366;106902;268;*;
;comp;tRNA;107171;107246;202;*;aca
fin;comp;CDS;107449;108138;;;
deb;comp;CDS;119439;119855;458;*;
;comp;regulatory;120314;120402;165;*;
fin;comp;CDS;120568;129390;;;
deb;comp;CDS;219956;220483;260;*;
;comp;tRNA;220744;220820;5;*;gac
;comp;tRNA;220826;220901;10;*;gta
;comp;tRNA;220912;220987;4;*;gaa
;comp;tRNA;220992;221067;18;*;aaa
;comp;tRNA;221086;221160;103;*;caa
;comp;rRNA;221264;224178;241;*;2915
;comp;tRNA;224420;224495;64;*;gcc
;comp;rRNA;224560;224676;337;*;117
;comp;rRNA;225014;226535;652;*;1522
fin;comp;CDS;227188;228162;;;
deb;;CDS;268169;269791;139;*;
;;repeat_region;269931;271232;197;*;
fin;comp;CDS;271430;272362;;;
deb;comp;CDS;326955;328250;268;*;
;comp;tRNA;328519;328601;65;*;cta
;comp;tRNA;328667;328743;60;*;aga
;comp;tRNA;328804;328880;176;*;cca
fin;comp;CDS;329057;329254;;;
deb;;CDS;377234;378433;102;*;
;;ncRNA;378536;378894;134;*;
fin;;CDS;379029;380159;;;
deb;;CDS;384528;384812;140;*;
;;misc_b;384953;385256;391;*;
fin;;CDS;385648;387258;;0;
deb;comp;CDS;387821;388105;135;*;
;;tRNA;388241;388317;7;*;ccc
;;tRNA;388325;388410;1012;*;tac
fin;;CDS;389423;390235;;0;
deb;comp;CDS;562422;562793;296;*;
;;regulatory;563090;563272;296;*;
fin;;CDS;563569;564243;;;
deb;comp;CDS;574512;575822;83;*;
;comp;regulatory;575906;576021;352;*;
fin;;CDS;576374;577480;;0;
deb;comp;CDS;600853;602214;294;*;
;;repeat_region;602509;603596;212;*;
fin;comp;CDS;603809;605377;;;
deb;;CDS;644127;645932;398;*;
;comp;tmRNA;646331;646683;325;*;
fin;;CDS;647009;648202;;0;
deb;comp;CDS;977236;978480;463;*;
;comp;rRNA;978944;981856;241;*;2913
;comp;tRNA;982098;982173;64;*;gcc
;comp;rRNA;982238;982354;337;*;117
;comp;rRNA;982692;984213;20;*;1522
deb;comp;CDS;984234;984509;159;*;
;comp;tRNA;984669;984744;5;*;tgg
;comp;tRNA;984750;984824;207;*;cgg
fin;comp;CDS;985032;987656;;;
deb;comp;CDS;1013915;1014700;165;*;
;comp;tRNA;1014866;1014942;75;*;gac
;comp;tRNA;1015018;1015093;265;*;gaa
fin;comp;CDS;1015359;1016642;;0;
deb;;CDS;1056587;1058014;121;*;
;comp;tRNA;1058136;1058233;173;*;tga
fin;;CDS;1058407;1058733;;;
deb;;CDS;1121685;1122878;589;*;
;;rRNA;1123468;1124989;337;*;1522
;;rRNA;1125327;1125443;64;*;117
;;tRNA;1125508;1125583;237;*;gcc
;;rRNA;1125821;1128734;322;*;2914
fin;;CDS;1129057;1129959;;;
deb;;CDS;1145930;1146832;103;*;
;;misc_b;1146936;1147145;99;*;
fin;;CDS;1147245;1148408;;;
deb;;CDS;1154724;1155224;99;*;
;;tRNA;1155324;1155413;56;*;tca
fin;comp;CDS;1155470;1156627;;;
deb;;CDS;1169978;1171828;129;*;
;;tRNA;1171958;1172034;85;*;cgt
;;tRNA;1172120;1172196;157;*;agg
deb;;CDS;1172354;1172812;62;*;
;;tRNA;1172875;1172966;551;*;tcg
fin;;CDS;1173518;1174330;;;
deb;comp;CDS;1180986;1182974;444;*;
;;tRNA;1183419;1183512;39;*;tcc
;;ncRNA;1183552;1183817;122;*;
fin;;CDS;1183940;1185760;;0;
deb;;CDS;1195726;1195998;181;*;
;;tRNA;1196180;1196255;205;*;gcg
fin;;CDS;1196461;1197051;;;
deb;comp;CDS;1202248;1202961;83;*;
;comp;regulatory;1203045;1203106;414;*;
fin;;CDS;1203521;1205617;;;
deb;comp;CDS;1283946;1285349;159;*;
;;tRNA;1285509;1285584;5;*;atgf
;;tRNA;1285590;1285667;7;*;atgj
;;tRNA;1285675;1285750;542;*;gaa
fin;;CDS;1286293;1287630;;0;
deb;;CDS;1351078;1352549;705;*;
;;rRNA;1353255;1354777;261;*;1523
;;rRNA;1355039;1355155;64;*;117
;;tRNA;1355220;1355296;198;*;atc
;;rRNA;1355495;1358408;112;*;2914
;;tRNA;1358521;1358595;431;*;aac
fin;;CDS;1359027;1360454;;0;
deb;;CDS;1387701;1388411;58;*;
;;misc_f;1388470;1388647;25;*;
fin;;CDS;1388673;1389203;;;
deb;;CDS;1498482;1498898;535;*;
;comp;tRNA;1499434;1499509;238;*;acg
fin;;CDS;1499748;1500836;;0;
deb;comp;CDS;1553617;1554957;296;*;
;;regulatory;1555254;1555354;211;*;
fin;;CDS;1555566;1556966;;0;
deb;;CDS;1733682;1734398;211;*;
;;regulatory;1734610;1734715;150;*;
fin;;CDS;1734866;1736005;;;
deb;;CDS;1763019;1763858;68;*;
;;tRNA;1763927;1764003;4;*;gac
;;tRNA;1764008;1764083;3;*;ttc
;;tRNA;1764087;1764161;92;*;ggc
deb;comp;CDS;1764254;1764493;72;*;
;;tRNA;1764566;1764641;18;*;tgc
;;tRNA;1764660;1764746;253;*;tta
fin;comp;CDS;1765000;1765479;;0;
deb;;CDS;1817623;1818318;488;*;
;;rRNA;1818807;1820328;261;*;1522
;;rRNA;1820590;1820706;64;*;117
;;tRNA;1820771;1820847;6;*;atc
;;tRNA;1820854;1820929;233;*;gca
;;rRNA;1821163;1824076;112;*;2914
;;tRNA;1824189;1824263;6;*;aac
;;tRNA;1824270;1824345;243;*;atgf
fin;;CDS;1824589;1825014;;;
deb;;CDS;1854540;1855880;78;*;
;;regulatory;1855959;1856148;170;*;
;;regulatory;1856319;1856511;32;*;
fin;;CDS;1856544;1857368;;;
deb;;CDS;1882378;1883172;126;*;
;;regulatory;1883299;1883521;158;*;
fin;;CDS;1883680;1884993;;;
deb;;CDS;1993213;1994328;99;*;
;;tRNA;1994428;1994502;116;*;atgi
fin;;CDS;1994619;1995368;;;
deb;comp;CDS;2030610;2030810;83;*;
;comp;regulatory;2030894;2030999;259;*;
fin;comp;CDS;2031259;2032233;;0;
deb;;CDS;2073488;2074249;237;*;
;;regulatory;2074487;2074659;123;*;
fin;;CDS;2074783;2076180;;;
deb;;CDS;2145684;2146346;57;*;
;;regulatory;2146404;2146520;136;*;
fin;;CDS;2146657;2147781;;;
deb;;CDS;2279650;2279997;542;*;
;;rRNA;2280540;2282061;262;*;1522
;;rRNA;2282324;2282440;64;*;117
;;tRNA;2282505;2282580;238;*;gcc
;;rRNA;2282819;2285735;119;*;2917
;;tRNA;2285855;2285948;6;*;tcc
;;tRNA;2285955;2286031;10;*;ccg
;;tRNA;2286042;2286115;14;*;gga
;;tRNA;2286130;2286205;1;*;cac
;;tRNA;2286207;2286281;9;*;tgc
;;tRNA;2286291;2286367;3;*;gtc
;;tRNA;2286371;2286446;6;*;ttc
;;tRNA;2286453;2286537;4;*;tac
;;tRNA;2286542;2286616;17;*;caa
;;tRNA;2286634;2286709;4;*;aaa
;;tRNA;2286714;2286789;5;*;gaa
;;tRNA;2286795;2286870;5;*;gta
;;tRNA;2286876;2286952;7;*;gac
;;tRNA;2286960;2287050;43;*;agc
;;tRNA;2287094;2287170;30;*;ccc
;;tRNA;2287201;2287287;3;*;ctg
;;tRNA;2287291;2287365;4;*;ggc
;;tRNA;2287370;2287446;4;*;cgt
;;tRNA;2287451;2287526;352;*;acc
fin;;CDS;2287879;2288343;;;
deb;;CDS;2303367;2303639;73;*;
;;regulatory;2303713;2303896;104;*;
fin;;CDS;2304001;2304804;;;
deb;comp;CDS;2321528;2322544;268;*;
;comp;tRNA;2322813;2322889;9;*;gtc
;comp;tRNA;2322899;2322973;81;*;cgg
fin;comp;CDS;2323055;2323441;;0;
deb;;CDS;2326619;2327947;459;*;
;;rRNA;2328407;2329934;336;*;1528
;;rRNA;2330271;2330387;230;*;117
;;rRNA;2330618;2333532;98;*;2915
;;tRNA;2333631;2333706;4;*;aaa
;;tRNA;2333711;2333786;8;*;acc
;;tRNA;2333795;2333877;89;*;ctc
fin;comp;CDS;2333967;2334704;;;
deb;;CDS;2342094;2342804;158;*;
;comp;tRNA;2342963;2343030;222;*;ttc
deb;;CDS;2343253;2343936;558;*;
;;rRNA;2344495;2346016;261;*;1522
;;rRNA;2346278;2346394;64;*;117
;;tRNA;2346459;2346535;145;*;atc
;;rRNA;2346681;2349594;100;*;2914
;;tRNA;2349695;2349769;6;*;aac
;;tRNA;2349776;2349851;126;*;atgf
fin;;CDS;2349978;2350976;;;
deb;;CDS;2375597;2375872;14;*;
;;regulatory;2375887;2376057;106;*;
fin;;CDS;2376164;2377375;;;
deb;;CDS;2464578;2465114;271;*;
;comp;tRNA;2465386;2465461;432;*;aca
fin;;CDS;2465894;2466226;;0;
deb;;CDS;2471030;2471977;69;*;
;;tRNA;2472047;2472133;148;*;ctg
fin;;CDS;2472282;2472431;;;
deb;;CDS;2478637;2479455;61;*;
;;misc_b;2479517;2479758;48;*;
fin;;CDS;2479807;2480301;;;
deb;comp;CDS;2488189;2488956;8;*;
;comp;regulatory;2488965;2489129;204;*;
fin;;CDS;2489334;2491055;;;
deb;;CDS;2495461;2496048;402;*;
;comp;tRNA;2496451;2496527;4;*;gtc
;comp;tRNA;2496532;2496609;175;*;atgj
deb;;CDS;2496785;2497120;217;*;
;comp;tRNA;2497338;2497420;7;*;ctc
;comp;tRNA;2497428;2497503;18;*;acc
;comp;tRNA;2497522;2497596;14;*;tgg
;comp;tRNA;2497611;2497684;19;*;ggg
;comp;tRNA;2497704;2497778;7;*;ggc
;comp;tRNA;2497786;2497873;8;*;ttg
;comp;tRNA;2497882;2497958;293;*;gtg
;;tRNA;2498252;2498328;314;*;ccg
fin;comp;CDS;2498643;2499167;;0;
deb;;CDS;2525576;2528362;87;*;
;;ncRNA;2528450;2528627;152;*;
fin;;CDS;2528780;2529436;;;
deb;;CDS;2554799;2554984;109;*;
;;tRNA;2555094;2555169;2;*;gaa
;;tRNA;2555172;2555247;6;*;ttc
;;tRNA;2555254;2555338;4;*;tac
;;tRNA;2555343;2555417;18;*;caa
;;tRNA;2555436;2555511;4;*;aaa
;;tRNA;2555516;2555590;9;*;ggc
;;tRNA;2555600;2555675;117;*;cac
fin;comp;CDS;2555793;2557220;;;
deb;comp;CDS;2792990;2793442;223;*;
;comp;rRNA;2793666;2796579;240;*;2914
;comp;tRNA;2796820;2796895;6;*;gca
;comp;tRNA;2796902;2796978;64;*;atc
;comp;rRNA;2797043;2797159;337;*;117
;comp;rRNA;2797497;2799018;506;*;1522
;comp;tRNA;2799525;2799599;1;*;ggc
;comp;tRNA;2799601;2799687;32;*;ctg
;comp;tRNA;2799720;2799796;42;*;ccc
;comp;tRNA;2799839;2799915;4;*;cgt
;comp;tRNA;2799920;2799994;120;*;ggc
;comp;tRNA;2800115;2800192;42;*;atgj
;comp;tRNA;2800235;2800325;16;*;agc
;comp;tRNA;2800342;2800417;6;*;atgf
;comp;tRNA;2800424;2800498;7;*;aac
;comp;tRNA;2800506;2800581;4;*;gaa
;comp;tRNA;2800586;2800661;18;*;aaa
;comp;tRNA;2800680;2800754;4;*;caa
;comp;tRNA;2800759;2800843;91;*;tac
;comp;tRNA;2800935;2801011;7;*;gtc
;comp;tRNA;2801019;2801093;325;*;tgc
fin;;CDS;2801419;2801724;;;
deb;;CDS;3032538;3032729;109;*;
;comp;rRNA;3032839;3035753;237;*;2915
;comp;tRNA;3035991;3036066;64;*;gcc
;comp;rRNA;3036131;3036247;262;*;117
;comp;rRNA;3036510;3038031;774;*;1522
fin;comp;CDS;3038806;3040017;;;
&lt;/pre&gt;

===cbei===
====cbei opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_opérons|cbei opérons]]
&lt;pre&gt;
29.65%GC;29.7.19 Paris;16s 16 ;;;;;;;;
Clostridium beijerinckii strain NCIMB 14988;;;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;aas;CDS dirigé
;6477551..6480031;;CDS;;496;496;;;827;
;6480528..6482044;;16s;;213;;;;;
;6482258..6485171;;23s;;108;;;;;
;6485280..6485394;;5s;;14;;;;;
;15..91;;atgi;;1;;;1;;
;93..168;;gca;;85;85;;;;85
;254..769;;CDS;;1940;;;;172;
;;;;;;;;;;
;2710..2937;;CDS;;119;119;;;76;119
;3057..3147;;tca;+;30;;30;;;
;3178..3268;;agc;2 tca;241;;*241;;;
;3510..3600;;tca;2 agc;18;;18;;;
;3619..3709;;agc;;125;125;;;;
;3835..4350;;CDS;;9470;;;;172;
;;;;;;;;;;
;13821..14726;;CDS;;187;187;;;302;
;14914..14988;;cgt;;34;34;;;;34
comp;15023..15913;;CDS;;109014;;;;297;
;;;;;;;;;;
;124928..125338;;CDS;;275;275;;;137;275
;125614..125702;;tta;+;20;;20;;;
;125723..125798;;atgf;4 tta;7;;7;;;
;125806..125882;;atgj;4 atgf;6;;6;;;
;125889..125977;;tta;2 atgj;22;;22;;;
;126000..126075;;atgf;;7;;7;;;
;126083..126159;;atgj;;6;;6;;;
;126166..126254;;tta;;21;;21;;;
;126276..126351;;atgf;;70;;70;;;
;126422..126510;;tta;;21;;21;;;
;126532..126607;;atgf;;664;664;;;;
;127272..129683;;CDS;;8954;;;;804;
;;;;;;;;;;
;138638..140143;;CDS;;307;307;;;502;
;140451..140525;;aac;+;234;;*234;;;
;140760..140834;;aac;3 aac;439;;*439;;;
;141274..141348;;aac;@6;299;299;;;;299
;141648..143039;;CDS;;1587;;;;464;
;;;;;;;;;;
comp;144627..145649;;CDS;;543;543;;;341;
;146193..147709;;16s;;140;;;;;
;147850..147925;;gca;;3;;;3;;
;147929..148005;;atc;;111;;;;;
;148117..151030;;23s;;70;;;;;
;151101..151217;;5s;;5;;;5;;
;151223..151298;;ttc;;4;;;;;
;151303..151377;;tgc;;167;167;;;;167
;151545..151841;;CDS;;25608;;;;99;
;;;;;;;;;;
;177450..178097;;CDS;;76;76;;;216;
;178174..178249;;acc;;65;65;;;;65
;178315..179508;;CDS;;134221;;;;398;
;;;;;;;;;;
;313730..316207;;CDS;;90;90;;;826;90
;316298..316382;;cta;;4;;4;;;
;316387..316461;;ggg;;120;120;;;;
comp;316582..316986;;CDS;;85487;;;;135;
;;;;;;;;;;
;402474..402953;;CDS;;125;125;;;160;125
;403079..403154;;cca;+;17;;17;;;
;403172..403245;;gga;2x;149;;*149;;;
;403395..403471;;aga;cca gga aga;6;;6;;;
;403478..403553;;cca;;16;;16;;;
;403570..403643;;gga;;35;;35;;;
;403679..403755;;aga;;5;;5;;;
;403761..403836;;cac;;3;;3;;;
;403840..403914;;caa;2x;7;;7;;;
;403922..403997;;aaa;caa aaa cta ;18;;18;;;
;404016..404100;;cta;ggc gga ;5;;5;;;
;404106..404180;;ggc;;25;;25;;;
;404206..404279;;gga;;5;;5;;;
;404285..404360;;aag;;57;;57;;;
;404418..404492;;caa;;7;;7;;;
;404500..404575;;aaa;;18;;18;;;
;404594..404678;;cta;;5;;5;;;
;404684..404758;;ggc;;25;;25;;;
;404784..404857;;gga;;46;;46;;;
;404904..404980;;cga;;325;325;;;;
&lt;;405306..405467;;CDS;;8393;;;;54;
;;;;;;;;;;
;413861..415921;;CDS;;385;385;;;687;
;416307..417823;;16s;@5;132;;;;;
;417956..418032;;atc;;84;;;;;
;418117..421031;;23s;;71;;;;;
;421103..421177;;aac;;345;345;;;;345
;421523..422449;;CDS;;63814;;;;309;
;;;;;;;;;;
;486264..486668;;CDS;;159;159;;;135;159
;486828..486912;;tac;+;9;;9;;;
;486922..486997;;gta;3 tac;27;;27;;;
;487025..487099;;aca;2 gta;12;;12;;;
;487112..487196;;tac;2 aca;9;;9;;;
;487206..487281;;gta;;30;;30;;;
;487312..487386;;aca;;12;;12;;;
;487399..487483;;tac;;451;451;;;;
;487935..489110;;CDS;;50956;;;;392;
;;;;;;;;;;
;540067..540969;;CDS;;187;187;;;301;187
;541157..541231;;tgg;;208;208;;;;
;541440..541820;;CDS;;97;;;;127;
;;;;;;;;;;
comp;541918..542985;;CDS;;252;252;;;356;252
;543238..543312;;tgg;;354;354;;;;
;543667..544683;;CDS;;347735;;;;339;
;;;;;;;;;;
;892419..893339;;CDS;;560;560;;;307;
;893900..895416;;16s;;137;;;;;
;895554..895629;;gca;;118;;;;;
;895748..898661;;23s;;204;;;;;
;898866..898982;;5s;;552;552;;;;*552
;899535..900446;;CDS;;351;;;;304;
;;;;;;;;;;
;900798..902048;;CDS;;704;704;;;417;
;902753..904269;;16s;;339;;;;;
;904609..907522;;23s;;273;;;;;
;907796..907912;;5s;;69;69;;;;69
comp;907982..908449;;CDS;;43545;;;;156;
;;;;;;;;;;
;951995..952630;;CDS;;97;97;;;212;97
;952728..952813;;ctc;;396;396;;;;
;953210..954919;;CDS;;784414;;;;570;
;;;;;;;;;;
;1739334..1739933;;CDS;;380;380;;;200;380
;1740314..1740389;;cac;;3;;3;;;
;1740393..1740467;;cag;;5;;5;;;
;1740473..1740548;;aaa;;443;443;;;;
comp;1740992..1742350;;CDS;;151829;;;;453;
;;;;;;;;;;
;1894180..1895406;;CDS;;34;34;;;409;34
comp;1895441..1895527;;ttg;;574;574;;;;
;1896102..1896794;;CDS;;200701;;;;231;
;;;;;;;;;;
;2097496..2097915;;CDS;;722;722;;;140;
;2098638..2100154;;16s;;502;;;;;
;2100657..2103569;;23s;;205;;;;;
;2103775..2103891;;5s;;315;315;;;;315
;2104207..2104905;;CDS;;234313;;;;233;
;;;;;;;;;;
;2339219..2340322;;CDS;;662;662;;;368;
;2340985..2342501;;16s;;338;;;;;
;2342840..2345755;;23s;;140;;;;;
;2345896..2345970;;aac;;3;;;;;
;2345974..2346090;;5s;;429;429;;;;429
;2346520..2348088;;CDS;;3574;;;;523;
;;;;;;;;;;
;2351663..2352139;;CDS;;568;568;;;159;
;2352708..2354224;;16s;;338;;;;;
;2354563..2357477;;23s;;140;;;;;
;2357618..2357692;;aac;;3;;;;;
;2357696..2357812;;5s;;90;90;;;;90
;2357903..2358316;;CDS;;406783;;;;138;
;;;;;;;;;;
;2765100..2765525;;CDS;;625;625;;;142;
;2766151..2767667;;16s;;503;;;;;
;2768171..2771082;;23s;;202;;;;;
;2771285..2771401;;5s;;5;;;;;
;2771407..2771482;;ttc;;6;;;6;;
;2771489..2771565;;gac;;25;;;25;;
;2771591..2771665;;gaa;;448;448;;;;448
;2772114..2774864;;CDS;;781818;;;;917;
;;;;;;;;;;
;3556683..3557051;;CDS;;565;565;;;123;*565
;3557617..3557691;;gag;;925;925;;;;
comp;3558617..3559759;;CDS;;192275;;;;381;
;;;;;;;;;;
comp;3752035..3752652;;CDS;;245;245;;;206;245
comp;3752898..3752985;;agt;@1;711;711;;;;
comp;3753697..3755112;;CDS;;501326;;;;472;
;;;;;;;;;;
comp;4256439..4258403;;CDS;;267;267;;;655;267
comp;4258671..4258746;;aaa;;79;;79;;;
comp;4258826..4258901;;cac;;7;;7;;;
comp;4258909..4258985;;aga;;35;;35;;;
comp;4259021..4259094;;gga;;752;752;;;;
;4259847..4260392;;CDS;;619853;;;;182;
;;;;;;;;;;
comp;4880246..4880488;;CDS;;508;508;;;81;*508
comp;4880997..4881113;;5s;;274;;;;;
comp;4881388..4884300;;23s;;578;;;;;
comp;4884879..4886395;;16s;;703;703;;;;
comp;4887099..4888034;;CDS;;1272704;;;;312;
;;;;;;;;;;
comp;6160739..6161977;;CDS;;343;343;;;413;
;6162321..6162396;;cca;;242;242;;;;242
;6162639..6163283;;CDS;;2040;;;;215;
;;;;;;;;;;
;6165324..6165734;;CDS;;222;222;;;137;
comp;6165957..6166032;;ttc;;5;;;;;
comp;6166038..6166154;;5s;@2;188;188;;;;188
;6166343..6167074;;CDS;;8085;;;;244;
;;;;;;;;;;
comp;6175160..6175597;;CDS;;249;249;;;146;249
comp;6175847..6175922;;gca;;1;;;1;;
comp;6175924..6176000;;atgi;;44;;;;;
comp;6176045..6176161;;5s;;138;;;;;
comp;6176300..6179216;;23s;;339;;;;;
comp;6179556..6181072;;16s;;567;567;;;;
comp;6181640..6182446;;CDS;;223;;;;269;
;;;;;;;;;;
;6182670..6183419;;CDS;;190;190;;;250;190
comp;6183610..6183685;;aaa;+;5;;;;;
comp;6183691..6183807;;5s;2 aaa;159;159;;;;159
comp;6183967..6184914;;CDS;@3;294;294;;;316;294
comp;6185209..6185284;;aaa;;7;;;;;
comp;6185292..6185408;;5s;;138;;;;;
comp;6185547..6188463;;23s;;339;;;;;
comp;6188803..6190319;;16s;;771;771;;;;
comp;6191091..6192203;;CDS;;7306;;;;371;
;;;;;;;;;;
comp;6199510..6202059;;CDS;;661;661;;;850;
comp;6202721..6202837;;5s;@4;139;;;;;
comp;6202977..6205893;;23s;;339;;;;;
comp;6206233..6207749;;16s;;1102;;;;;
comp;6208852..6208968;;5s;;138;;;;;
comp;6209107..6212023;;23s;;339;;;;;
comp;6212363..6213879;;16s;;502;502;;;;*502
comp;6214382..6215329;;CDS;;90019;;;;316;
;;;;;;;;;;
comp;6305349..6306314;;CDS;;123;123;;;322;123
comp;6306438..6306527;;tcc;;281;281;;;;
comp;6306809..6307984;;CDS;;66527;;;;392;
;;;;;;;;;;
;6374512..6375684;;CDS;;125;125;;;391;125
comp;6375810..6375884;;agg;;303;303;;;;
comp;6376188..6378578;;CDS;;13398;;;;797;
;;;;;;;;;;
comp;6391977..6392753;;CDS;;114;114;;;259;114
comp;6392868..6392984;;5s;;134;;;;;
comp;6393119..6396033;;23s;;214;;;;;
comp;6396248..6397764;;16s;;1120;;;;;
comp;6398885..6399001;;5s;;139;;;;;
comp;6399141..6402055;;23s;;214;;;;;
comp;6402270..6403786;;16s;;748;748;;;;
comp;6404535..6405107;;CDS;;31702;;;;191;
;;;;;;;;;;
;6436810..6437790;;CDS;;192;192;;;327;
comp;6437983..6438059;;gac;+;6;;6;;;
comp;6438066..6438141;;gta;3x;14;;14;;;
comp;6438156..6438230;;gaa;gac gta ;29;;29;;;
comp;6438260..6438334;;aca;gaa aca – 1;10;;10;;;
comp;6438345..6438421;;gac;;6;;6;;;
comp;6438428..6438503;;gta;;16;;16;;;
comp;6438520..6438594;;gaa;;29;;29;;;
comp;6438624..6438698;;aca;;10;;10;;;
comp;6438709..6438785;;gac;;6;;6;;;
comp;6438792..6438867;;gta;;14;;14;;;
comp;6438882..6438956;;gaa;;162;162;;;;162
comp;6439119..6439685;;CDS;;37865;;;;189;
&lt;/pre&gt;

====cbei cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_cumuls|cbei cumuls]]
&lt;pre&gt;
cbei cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;17;1;0;2;1;0;1;0;100;4
;16 23 5s 0;7;20;34;3;50;2;50;2;200;19
;16 atc gca;1;40;12;1;100;7;100;6;300;11
;16 23 5s a;4;60;2;0;150;7;150;5;400;20
;max a;4;80;2;0;200;9;200;7;500;6
;a doubles;1;100;0;0;250;5;250;3;600;3
;autres;6;120;0;0;300;6;300;5;700;2
;total aas;19;140;0;0;350;6;350;2;800;1
sans ;opérons;20;160;1;0;400;4;400;1;900;4
;1 aa;11;180;0;0;450;3;450;2;1000;1
;max a;19;200;0;0;500;2;500;0;1100;0
;a doubles;5;;3;0;;21;;4;;0
;total aas;74;;54;6;;72;;37;;71
total aas;;93;;;;;;;;;
remarques;;6;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;;;;;
;;;variance;;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;18;7;;350;;195;;328
;;;variance;17;9;;225;;111;;206
&lt;/pre&gt;

====cbei blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_blocs|cbei blocs]]
&lt;pre&gt;
cbei blocs;;;;
16s;213;503;339;
23s;108;202;138;
5s;14;5;44;
atgi;atgi;ttc;atgi;
;;;;
16s;339;502;578;
23s;273;205;274;
5s;;;;
;;;;
aaa;5;;;
5s;159;5s;139;134
cds;294;23s;339;214
aaa;7;16s;1102;1120
5s;138;5s;138;139
23s;339;23s;339;214
16s;;16s;;
;;;;
16s;338;338;16s;140
23s;140;140;gca;3
aac;3;3;atc;111
5s;aac;aac;23s;70
;;;5s;5
;;;ttc;
;;;;
16s;137;;16s;132
gca;118;;atc;84
23s;204;;23s;71
5s;;;aac;
;;;;
ttc;5;;;
5s;;;;
&lt;/pre&gt;
====cbei distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_distribution|cbei distribution]]
&lt;pre&gt;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;4
aac 3 -5 et 3 &gt;1;att;;act;;aat;;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;
aaa 2 +5 et 4 &gt;1;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gca 2+16s, 2+5s;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;3;tgc;
les +5s sont;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;3;agc;2
des 1-3aas;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;2
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;4;tca;2;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;4;aga;3
;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;3;cca;2;caa;2;cga;1
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;5;gca;;gaa;3;gga;5
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;1;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;cbei;;11;;;;;11;;cbei;63;;;;;;63
&lt;/pre&gt;
====cbei données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_données_intercalaires|cbei données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cbei;fx;fc;cbei;fx40;fc40;cbei;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;0;19;0;0;19;-1;0;71;85;34;16s 23s;;;tRNA tRNA;;intra;tRNA tRNA;suite;
;0;10;6;249;1;3;55;-2;0;0;119;120;5* 339;;;3;;gca atc;17;;cca
;1;20;12;375;2;1;39;-3;0;0;125;252;502;;;tRNA tRNA;;contig;149;;gga
;0;30;7;204;3;0;23;-4;2;83;187;443;2* 338;;;1;;atgi;6;;aga
2;0;40;10;126;4;0;36;-5;1;0;275;34;503;;;**;;gca;16;;cca
;0;50;10;119;5;0;17;-6;0;0;664;574;578;;;4;;ttc;35;;gga
;0;60;24;126;6;1;16;-7;0;8;307;505;2* 214;;;**;;tgc;5;;aga
;1;70;30;98;7;0;8;-8;1;72;299;752;213;;;6;;ttc;3;;cac
;1;80;25;95;8;0;15;-9;0;0;681;343;5s 16s;;;25;;gac;7;;caa
;2;90;19;100;9;0;23;-10;0;5;76;222;1107;;;**;;gaa;18;;aaa
;1;100;33;101;10;1;17;-11;0;38;65;190;1125;;;1;;gca;5;;cta
;0;110;34;103;11;3;48;-12;0;0;90;125;5s CDS;;;**;;atgi;25;;ggc
1;1;120;29;89;12;2;51;-13;0;4;125;192;552;69;;tRNA tRNA;;;5;;gga
1;2;130;34;79;13;0;41;-14;0;21;325;;315;188;;30;;tca;57;;aag
;1;140;38;85;14;0;47;-15;0;0;345;;429;114;;241;;agc;7;;caa
;0;150;32;102;15;1;43;-16;0;3;159;;90;;;18;;tca;18;;aaa
;1;160;47;86;16;2;29;-17;0;21;451;;508;;;**;;agc;5;;cta
;1;170;33;85;17;0;25;-18;0;0;187;;159;;;20;;tta;25;;ggc
;0;180;30;78;18;0;38;-19;0;2;208;;661;;;7;;atgf;46;;gga
1;2;190;33;68;19;2;23;-20;0;11;354;;23s 5s;;;6;;atgj;**;;cga
1;0;200;24;79;20;2;30;-21;1;0;97;;70;;;22;;tta;9;;tac
;1;210;38;63;21;2;32;-22;0;1;396;;204;;;7;;atgf;27;;gta
;0;220;24;75;22;0;25;-23;0;9;380;;273;;;6;;atgj;12;;aca
1;0;230;28;60;23;0;18;-24;0;0;448;;205;;;21;;tta;9;;tac
;0;240;25;61;24;0;21;-25;1;1;565;;202;;;70;;atgf;30;;gta
;3;250;35;47;25;0;23;-26;1;10;248;;274;;;21;;tta;12;;aca
1;0;260;23;60;26;1;22;-27;0;0;13;;138;;;**;;atgf;**;;tac
;1;270;18;61;27;0;18;-28;0;4;267;;138;;;234;;aac;3;;cac
;1;280;21;62;28;1;11;-29;0;5;242;;139;;;439;;aac;5;;cag
;1;290;18;48;29;2;16;-30;0;0;249;;138;;;**;;aac;**;;aaa
;2;300;26;53;30;1;18;-31;0;0;294;;134;;;4;;cta;79;;aaa
;2;310;21;38;31;0;18;-32;0;0;135;;139;;;**;;ggg;7;;cac
;0;320;24;38;32;1;13;-33;0;0;281;;108;;;;;;35;;aga
;1;330;23;46;33;1;11;-34;0;0;303;;16s tRNA;;;;;;**;;gga
;0;340;17;36;34;2;12;-35;0;4;162;;140;;gca;;;;6;;gac
1;1;350;18;40;35;0;13;-36;0;0;CDS 16s;;132;;atc;;;;14;;gta
;1;360;15;28;36;1;9;-37;0;1;390;548;137;;gca;;;;29;;gaa
;0;370;15;35;37;0;8;-38;1;4;565;;tRNA 23s;;;;;;10;;aca
;1;380;18;35;38;2;11;-39;0;0;709;;111;;atc;;;;6;;gac
;0;390;20;37;39;2;15;-40;0;1;727;;84;;atc;;;;16;;gta
;1;400;13;25;40;1;16;-41;0;1;667;;118;;gca;;;;29;;gaa
4;5;reste;262;596;reste;1177;3037;-42;0;0;573;;23s tRNA;;;;;;10;;aca
13;35;total;1212;4010;total;1212;4010;-43;0;1;282;;2* 140;;aac;;;;6;;gac
9;30;diagr;950;3395;diagr;35;954;-44;0;2;703;;71;;aac;;;;14;;gta
0;1; t30;25;828;;;;-45;0;0;572;;5s tRNA;;;;;;**;;gaa
;;;;;;;;-46;1;0;776;;3* 5;;ttc;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;507;;44;;atgi;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;753;;5;;aaa;;;;;;
;x;1212;10;0;1222;;;-49;0;1;501;;7;;aaa;;;;;;
;c;3991;390;19;4400;;;-50;0;1;;;14;;atgi;;;;;;
;;;;;5622;192;;reste;1;4;;;tRNA 5s;;;;;;;;
;;;;;;5814;;total;10;390;;;2* 3;;aac;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====cbei autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_autres_intercalaires_aas|cbei autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cbei;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
;;tRNA;15;91;1;*;atgi
;;tRNA;93;168;85;*;gca
fin;;CDS;254;769;;;
deb;;CDS;2710;2937;119;*;
;;tRNA;3057;3147;30;*;tca
;;tRNA;3178;3268;241;*;agc
;;tRNA;3510;3600;18;*;tca
;;tRNA;3619;3709;125;*;agc
fin;;CDS;3835;4350;;;
deb;;CDS;13821;14726;187;*;
;;tRNA;14914;14988;34;*;cgt
fin;comp;CDS;15023;15913;;0;
deb;;CDS;124928;125338;275;*;
;;tRNA;125614;125702;20;*;tta
;;tRNA;125723;125798;7;*;atgf
;;tRNA;125806;125882;6;*;atgj
;;tRNA;125889;125977;22;*;tta
;;tRNA;126000;126075;7;*;atgf
;;tRNA;126083;126159;6;*;atgj
;;tRNA;126166;126254;21;*;tta
;;tRNA;126276;126351;70;*;atgf
;;tRNA;126422;126510;21;*;tta
;;tRNA;126532;126607;664;*;atgf
fin;;CDS;127272;129683;;;
deb;;CDS;138638;140143;307;*;
;;tRNA;140451;140525;234;*;aac
;;tRNA;140760;140834;439;*;aac
;;tRNA;141274;141348;299;*;aac
fin;;CDS;141648;143039;;;
deb;comp;CDS;144627;145649;548;*;
;;rRNA;146198;147709;140;*;16s
;;tRNA;147850;147925;3;*;gca
;;tRNA;147929;148005;111;*;atc
;;rRNA;148117;151030;70;*;23s
;;rRNA;151101;151217;5;*;5s
;;tRNA;151223;151298;4;*;ttc
;;tRNA;151303;151377;681;*;tgc
fin;;CDS;152059;153456;;0;
deb;;CDS;177450;178097;76;*;
;;tRNA;178174;178249;65;*;acc
fin;;CDS;178315;179508;;;
deb;;CDS;313730;316207;90;*;
;;tRNA;316298;316382;4;*;cta
;;tRNA;316387;316461;120;*;ggg
fin;comp;CDS;316582;316986;;0;
deb;;CDS;402474;402953;125;*;
;;tRNA;403079;403154;17;*;cca
;;tRNA;403172;403245;149;*;gga
;;tRNA;403395;403471;6;*;aga
;;tRNA;403478;403553;16;*;cca
;;tRNA;403570;403643;35;*;gga
;;tRNA;403679;403755;5;*;aga
;;tRNA;403761;403836;3;*;cac
;;tRNA;403840;403914;7;*;caa
;;tRNA;403922;403997;18;*;aaa
;;tRNA;404016;404100;5;*;cta
;;tRNA;404106;404180;25;*;ggc
;;tRNA;404206;404279;5;*;gga
;;tRNA;404285;404360;57;*;aag
;;tRNA;404418;404492;7;*;caa
;;tRNA;404500;404575;18;*;aaa
;;tRNA;404594;404678;5;*;cta
;;tRNA;404684;404758;25;*;ggc
;;tRNA;404784;404857;46;*;gga
;;tRNA;404904;404980;325;*;cga
fin;;CDS;405306;405467;;;
deb;;CDS;413861;415921;390;*;atc
;;rRNA;416312;417823;132;*;16s
;;tRNA;417956;418032;84;*;
;;rRNA;418117;421031;71;*;23s
;;tRNA;421103;421177;345;*;aac
fin;;CDS;421523;422449;;;
deb;;CDS;486264;486668;159;*;
;;tRNA;486828;486912;9;*;tac
;;tRNA;486922;486997;27;*;gta
;;tRNA;487025;487099;12;*;aca
;;tRNA;487112;487196;9;*;tac
;;tRNA;487206;487281;30;*;gta
;;tRNA;487312;487386;12;*;aca
;;tRNA;487399;487483;451;*;tac
fin;;CDS;487935;489110;;;
deb;;CDS;540067;540969;187;*;
;;tRNA;541157;541231;208;*;tgg
fin;;CDS;541440;541820;;0;
deb;comp;CDS;541918;542985;252;*;
;;tRNA;543238;543312;354;*;
fin;;CDS;543667;544683;;;
deb;;CDS;772270;774093;262;*;
;;tmRNA;774356;774713;871;*;
fin;;CDS;775585;776133;;;
deb;;CDS;892419;893339;565;*;
;;rRNA;893905;895416;137;*;16s
;;tRNA;895554;895629;118;*;gca
;;rRNA;895748;898661;204;*;23s
;;rRNA;898866;898982;552;*;5s
fin;;CDS;899535;900446;;;
deb;;CDS;900798;902048;709;*;
;;rRNA;902758;904269;339;*;16s
;;rRNA;904609;907522;273;*;23s
;;rRNA;907796;907912;69;*;5s
fin;comp;CDS;907982;908449;;0;
deb;;CDS;951995;952630;97;*;
;;tRNA;952728;952813;396;*;ctc
fin;;CDS;953210;954919;;;
deb;;CDS;1017389;1017694;70;*;
;;ncRNA;1017765;1018113;758;*;
fin;;CDS;1018872;1020263;;;
deb;;CDS;1646835;1647233;56;*;
;;ncRNA;1647290;1647483;182;*;
fin;comp;CDS;1647666;1647878;;0;
deb;;CDS;1739334;1739933;380;*;
;;tRNA;1740314;1740389;3;*;cac
;;tRNA;1740393;1740467;5;*;cag
;;tRNA;1740473;1740548;443;*;aaa
fin;comp;CDS;1740992;1742350;;0;
deb;;CDS;1846157;1848058;-183;*;
;;gene;1847876;1848058;588;*;
fin;;CDS;1848647;1849633;;;
deb;;CDS;1894180;1895406;34;*;
;comp;tRNA;1895441;1895527;574;*;ttg
fin;;CDS;1896102;1896794;;;
deb;;CDS;2097496;2097915;727;*;
;;rRNA;2098643;2100154;502;*;16s
;;rRNA;2100657;2103569;205;*;23s
;;rRNA;2103775;2103891;315;*;5s
fin;;CDS;2104207;2104905;;;
deb;;CDS;2296804;2297472;104;*;
;comp;ncRNA;2297577;2297769;380;*;
fin;;CDS;2298150;2299064;;;
deb;;CDS;2305297;2306502;275;*;
;comp;ncRNA;2306778;2307043;230;*;
fin;;CDS;2307274;2308908;;0;
deb;;CDS;2339219;2340322;667;*;
;;rRNA;2340990;2342501;338;*;16s
;;rRNA;2342840;2345755;140;*;23s
;;tRNA;2345896;2345970;3;*;aac
;;rRNA;2345974;2346090;429;*;5s
fin;;CDS;2346520;2348088;;;
deb;;CDS;2351663;2352139;573;*;
;;rRNA;2352713;2354224;338;*;16s
;;rRNA;2354563;2357477;140;*;23s
;;tRNA;2357618;2357692;3;*;aac
;;rRNA;2357696;2357812;90;*;5s
fin;;CDS;2357903;2358316;;0;
deb;;CDS;2765706;2765873;282;*;
;;rRNA;2766156;2767667;503;*;16s
;;rRNA;2768171;2771082;202;*;23s
;;rRNA;2771285;2771401;5;*;5s
;;tRNA;2771407;2771482;6;*;ttc
;;tRNA;2771489;2771565;25;*;gac
;;tRNA;2771591;2771665;448;*;gaa
fin;;CDS;2772114;2774864;;;
deb;;CDS;3556683;3557051;565;*;
;;tRNA;3557617;3557691;505;*;gag
fin;comp;CDS;3558197;3558508;;;
deb;comp;CDS;3752035;3752652;248;*;
;comp;tRNA;3752901;3752985;13;*;agt
fin;comp;CDS;3752999;3753169;;0;
deb;comp;CDS;4256439;4258403;267;*;
;comp;tRNA;4258671;4258746;79;*;aaa
;comp;tRNA;4258826;4258901;7;*;cac
;comp;tRNA;4258909;4258985;35;*;aga
;comp;tRNA;4259021;4259094;752;*;gga
fin;;CDS;4259847;4260392;;;
deb;comp;CDS;4880246;4880488;508;*;
;comp;rRNA;4880997;4881113;274;*;5s
;comp;rRNA;4881388;4884300;578;*;23s
;comp;rRNA;4884879;4886395;703;*;16s
fin;comp;CDS;4887099;4888034;;0;
deb;comp;CDS;6160739;6161977;343;*;
;;tRNA;6162321;6162396;242;*;cca
fin;;CDS;6162639;6163283;;0;
deb;;CDS;6165324;6165734;222;*;
;comp;tRNA;6165957;6166032;5;*;ttc
;comp;rRNA;6166038;6166154;188;*;5s
fin;;CDS;6166343;6167074;;0;
deb;comp;CDS;6175160;6175597;249;*;
;comp;tRNA;6175847;6175922;1;*;gca
;comp;tRNA;6175924;6176000;44;*;atgi
;comp;rRNA;6176045;6176161;138;*;5s
;comp;rRNA;6176300;6179216;339;*;23s
;comp;rRNA;6179556;6181067;572;*;16s
fin;comp;CDS;6181640;6182446;;0;
deb;;CDS;6182670;6183419;190;*;
;comp;tRNA;6183610;6183685;5;*;aaa
;comp;rRNA;6183691;6183807;159;*;5s
deb;comp;CDS;6183967;6184914;294;*;
;comp;tRNA;6185209;6185284;7;*;aaa
;comp;rRNA;6185292;6185408;138;*;5s
;comp;rRNA;6185547;6188463;339;*;23s
;comp;rRNA;6188803;6190314;776;*;16s
fin;comp;CDS;6191091;6192203;;;
deb;comp;CDS;6199510;6202059;661;*;
;comp;rRNA;6202721;6202837;139;*;5s
;comp;rRNA;6202977;6205893;339;*;23s
;comp;rRNA;6206233;6207744;1107;*;16s
;comp;rRNA;6208852;6208968;138;*;5s
;comp;rRNA;6209107;6212023;339;*;23s
;comp;rRNA;6212363;6213874;507;*;16s
fin;comp;CDS;6214382;6215329;;;
deb;;CDS;6256716;6257600;154;*;
;comp;ncRNA;6257755;6258021;316;*;
fin;comp;CDS;6258338;6258889;;;
deb;comp;CDS;6305349;6306302;135;*;
;comp;tRNA;6306438;6306527;281;*;tcc
fin;comp;CDS;6306809;6307984;;;
deb;;CDS;6374512;6375684;125;*;
;comp;tRNA;6375810;6375884;303;*;agg
fin;comp;CDS;6376188;6378578;;0;
deb;comp;CDS;6391977;6392753;114;*;
;comp;rRNA;6392868;6392984;134;*;5s
;comp;rRNA;6393119;6396033;214;*;23s
;comp;rRNA;6396248;6397759;1125;*;16s
;comp;rRNA;6398885;6399001;139;*;5s
;comp;rRNA;6399141;6402055;214;*;23s
;comp;rRNA;6402270;6403781;753;*;16s
fin;comp;CDS;6404535;6405107;;;
deb;;CDS;6436810;6437790;192;*;
;comp;tRNA;6437983;6438059;6;*;gac
;comp;tRNA;6438066;6438141;14;*;gta
;comp;tRNA;6438156;6438230;29;*;gaa
;comp;tRNA;6438260;6438334;10;*;aca
;comp;tRNA;6438345;6438421;6;*;gac
;comp;tRNA;6438428;6438503;16;*;gta
;comp;tRNA;6438520;6438594;29;*;gaa
;comp;tRNA;6438624;6438698;10;*;aca
;comp;tRNA;6438709;6438785;6;*;gac
;comp;tRNA;6438792;6438867;14;*;gta
;comp;tRNA;6438882;6438956;162;*;gaa
fin;comp;CDS;6439119;6439685;;0;
deb;;CDS;6477551;6480031;501;*;
;;rRNA;6480533;6482044;213;*;16s
;;rRNA;6482258;6485171;108;*;23s
;;rRNA;6485280;6485394;14;*;5s
&lt;/pre&gt;

====cbei intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_entre_cds|cbei intercalaires entre cds]]
*'''Le tableau'''
&lt;pre&gt;
cbei;2.2.21 Paris;;cbei 31.7.20;;;;;;;;;
cbei;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;frequencez
;'''négatif;400;7.1;'''négatif ;-11;12;-1 à -64;'''6 485 394;-1;400;610;14
;'''zéro;19;0.3;;;;;'''intercals;0;19;620;19
;'''1 à 200;2957;52.6;'''0 à 200;83;61;;'''1 159 420;5;174;630;8
;'''201 à 370;1240;22.1;'''201 à 370;275;48;;'''17.9%;10;81;640;14
;'''371 à 600;713;12.7;'''371 à 600;464;66;;;15;236;650;10
;'''601 à max;293;5.2;'''601 à 1028;808;203;;;20;151;660;8
;'''total 5623;&lt;201;60.0;'''total 5620;205;211;-64 à 1555;;25;121;670;13
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;90;680;7
1860894;2121;-1;400;-70;1;;0;19;35;71;690;9
1898453;1881;0;19;-60;4;;-1;°71;40;65;700;14
4639922;1555;1;°58;-50;1;;-2;0;45;61;710;7
6361933;1545;2;°40;-40;8;;-3;0;50;68;720;8
5176736;1499;3;23;-30;10;'''min à -1;-4;°85;55;81;730;6
2532196;1482;4;36;-20;44;400;-5;1;60;69;740;12
3181990;1469;5;17;-10;94;7.1%;-6;0;65;68;750;5
4033167;1431;6;17;0;257;;-7;8;70;60;760;6
4590435;1429;7;8;10;255;;-8;°73;75;70;770;7
3571512;1391;8;15;20;387;;-9;0;80;50;780;4
4428508;1372;9;23;30;211;;-10;5;85;61;790;8
5504697;1348;10;18;40;136;;-11;°38;90;58;800;4
1486045;1326;11;°51;50;129;;-12;0;95;76;810;2
2570075;1302;12;°53;60;150;;-13;4;100;58;820;6
4602139;1289;13;41;70;128;'''1 à 100;-14;°21;105;68;830;5
3981561;1239;14;°47;80;120;1769;-15;0;110;69;840;5
4621836;1226;15;°44;90;119;31.5%;-16;3;115;53;850;3
4088892;1221;16;31;100;134;;-17;°21;120;65;860;2
4296061;1207;17;25;110;137;;-18;0;125;48;870;2
6061011;1205;18;°38;120;118;;-19;2;130;65;880;5
2648455;1201;19;25;130;113;;-20;°11;135;65;890;2
4064421;1178;20;32;140;123;;-21;1;140;58;900;4
4839562;1176;21;°34;150;134;;-22;1;145;67;910;4
3909835;1173;22;25;160;133;;-23;°9;150;67;920;4
2456047;1153;23;18;170;118;'''1 à 200;-24;0;155;65;930;1
3569689;1127;24;21;180;108;2957;-25;2;160;68;940;2
3023607;1112;25;°23;190;101;52.6%;-26;°11;165;64;950;0
4726206;1107;26;°23;200;103;;-27;0;170;54;960;3
1550735;1102;27;18;210;101;;-28;4;175;53;970;3
4395515;1078;28;12;220;99;;-29;°5;180;55;980;1
1099864;1072;29;18;230;88;;-30;0;185;44;990;2
3075992;1065;30;°19;240;86;;-31;0;190;57;1000;4
3857530;1064;31;°18;250;82;'''0 à 200;-32;0;195;51;1010;3
776201;1058;32;14;260;83;2976;;395;200;52;1020;4
2291086;1058;33;12;270;79;;reste;24;205;53;1030;2
5939293;1054;34;°14;280;83;;total;419;210;48;1040;3
2680682;1051;35;°13;290;66;;;;215;38;1050;0
3035780;1051;36;10;300;79;;;;220;61;1060;5
4035399;1040;37;8;310;59;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;225;45;1070;2
6351672;1032;38;13;320;62;;600;5330;230;43;1080;2
2453621;1031;39;°17;330;69;;650;65;235;40;1090;0
5871985;1027;40;°17;340;53;'''201 à 370;700;51;240;46;1100;0
5197163;1021;reste;4215;350;58;1240;750;38;245;39;1110;2
;;total;5623;360;43;22.1%;800;29;250;43;1120;1
;;;;370;50;;850;21;255;46;1130;1
;;;;380;53;;900;15;260;37;1140;0
;;;;390;57;;950;11;265;38;1150;0
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;400;38;;1000;13;270;41;1160;1
4624137;-110;shift 2;673;410;48;;1050;12;275;48;1170;0
1868484;-64;shift 2;608;420;44;;1100;9;280;35;1180;3
3204859;-64;shift 2;665;430;32;;1150;4;285;37;1190;0
2485518;-62;shift 2;184;440;36;;1200;4;290;29;1200;0
3963063;-60;;;450;42;;1250;6;295;41;reste;21
2029018;-50;;;460;39;;1300;1;300;38;total;293
5912545;-49;;;470;28;;1350;3;305;30;;
5354783;-47;;;480;27;;1400;2;310;29;;
1515675;-46;;;490;24;;1450;2;315;28;;
4067020;-44;;;500;28;;1500;3;320;34;;
5920392;-44;;;510;23;;1550;1;325;33;;
1552479;-43;;;520;19;;1600;1;330;36;;
330305;-41;;;530;23;;;291;335;26;;
4488902;-40;;;540;27;'''371 à 600;;;340;27;;
2489800;-38;;;550;18;714;;;345;33;;
2856876;-38;;;560;27;12.7%;;;350;25;;
4401424;-38;;;570;21;;;;355;26;;
4678887;-38;;;580;20;'''601 à max;;;360;17;;
5785183;-38;;;590;20;293;;;365;28;;
3964014;-37;;;600;20;5.2%;;;370;22;;
1257344;-35;;;reste;293;;reste;2;reste;1007;;
4675094;-35;;;total;5623;;total;5623;total;5623;;
&lt;/pre&gt;

====cbei  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_positifs_S+|cbei intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
cbei Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;20.2.22;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
mba;min10;705;1651;2356;154;-330;-221;109;-512;-477;-223;;;
cbei;min10;950;3395;4345;402;-509;-375;134;-649;-648;-290;;;
pmq;min10;1613;4170;5783;455;-834;-652;182;-867;-826;-61;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
45;214;0.21;1255;2688;1;8;18;114;51;428;-74;;;
26;244;0.11;1212;4400;0;4;8;89;35;954;272;;;
32;217;0.15;1926;5302;3;5;22;142;68;1155;-203;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
cbei;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;32;-258;570;-3.2;723;269;max160;&amp;-46;339;-824;83;780;246;min50
31 à 400;12.7;-134;357;3.5;790;352;*;&amp;-1.4;16;-123;40;937;391;1 partie
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;5;26;-;4;poly;708;tF;&amp;123;50;-;566;poly;214;SF
31 à 400;36;30;-;345;poly;445;tF *;&amp;75;37;-;929;dte;8;Sf
* diagramme en effectifs de 1 à 600;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélation et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;corrélation;;;;;;;;;;
41-n;0.402;-0.509;-0.375;;;;;0.272;;;;;;;;complément à 800;;
1-n;-0.290;-0.649;-0.648;;;;;;;;;20.2.22;;;;effectifs;;
cbei;fx;fc;;cbei;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;cbei;Sx-;Sc-;;cbei;fx;fc
0;0;19;;0;0;6;0;0;19;&gt;0;1212;-1;;71;;410;17;31
10;6;249;;10;6;73;1;3;55;&lt;0;10;-2;;0;;420;12;32
20;12;375;;20;13;110;2;1;39;zéro;0;-3;;0;;430;6;26
30;7;204;;30;7;60;3;0;23;total;1222;-4;2;83;;440;11;25
40;10;126;;40;11;37;4;0;36;;c;-5;1;0;;450;19;23
50;10;119;;50;11;35;5;0;17;&gt;0;3991;-6;;0;;460;13;26
60;24;126;;60;25;37;6;1;16;&lt;0;390;-7;;8;;470;11;17
70;30;98;;70;32;29;7;0;8;zéro;19;-8;1;72;;480;6;21
80;25;95;;80;26;28;8;0;15;total;4400;-9;;0;;490;9;15
90;19;100;;90;20;29;9;0;23;;;-10;;5;;500;10;18
100;33;101;;100;35;30;10;1;17;total;5622;-11;;38;;510;6;16
110;34;103;;110;36;30;11;3;48;;;-12;;0;;520;2;17
120;29;89;;120;31;26;12;2;51;;;-13;;4;;530;5;18
130;34;79;;130;36;23;13;0;41;;5203;-14;;21;;540;7;20
140;38;85;;140;40;25;14;0;47;;;-15;;0;;550;5;13
150;32;102;;150;34;30;15;1;43;;;-16;;3;;560;12;15
160;47;86;;160;49;25;16;2;29;;;-17;;21;;570;7;14
170;33;85;;170;35;25;17;0;25;;;-18;;0;;580;4;16
180;30;78;;180;32;23;18;0;38;;;-19;;2;;590;9;11
190;33;68;;190;35;20;19;2;23;;;-20;;11;;600;9;11
200;24;79;;200;25;23;20;2;30;;;-21;1;0;;610;2;12
210;38;63;;210;40;19;21;2;32;;;-22;;1;;620;4;15
220;24;75;;220;25;22;22;0;25;;;-23;;9;;630;3;5
230;28;60;;230;29;18;23;0;18;;;-24;;0;;640;4;10
240;25;61;;240;26;18;24;0;21;;;-25;1;1;;650;2;8
250;35;47;;250;37;14;25;0;23;;;-26;1;10;;660;3;5
260;23;60;;260;24;18;26;1;22;;;-27;;0;;670;3;10
270;18;61;;270;19;18;27;0;18;;;-28;;4;;680;4;3
280;21;62;;280;22;18;28;1;11;;;-29;;5;;690;1;8
290;18;48;;290;19;14;29;2;16;;;-30;;0;;700;6;8
300;26;53;;300;27;16;30;1;18;;;-31;;0;;710;3;4
310;21;38;;310;22;11;31;0;18;;;-32;;0;;720;2;6
320;24;38;;320;25;11;32;1;13;;;-33;;0;;730;3;3
330;23;46;;330;24;14;33;1;11;;;-34;;0;;740;5;7
340;17;36;;340;18;11;34;2;12;;;-35;;4;;750;2;3
350;18;40;;350;19;12;35;0;13;;;-36;;0;;760;1;5
360;15;28;;360;16;8;36;1;9;;;-37;;1;;770;1;6
370;15;35;;370;16;10;37;0;8;;;-38;1;4;;780;1;3
380;18;35;;380;19;10;38;2;11;;;-39;;0;;790;0;8
390;20;37;;390;21;11;39;2;15;;;-40;;1;;800;1;3
400;13;25;;400;14;7;40;1;16;;;-41;;1;;reste;31;79
reste;262;596;;;;;reste;1177;3037;;;-42;;0;;total;231;517
total;1212;4010;;t30;26;244;total;1212;4010;;;-43;;1;;;;
diagr;950;3395;;;;;diagr;35;954;;;-44;;2;;;;
 - t30;925;2567;;;;;;;;;;-45;;0;;;;
;;;;;;;;;;;;-46;1;0;;;;
;;;;;;;;;;;;-47;;1;;;;
;;;;;;;;;;;;-48;;0;;;;
;;;;;;;;;;;;-49;;1;;;;
;;;;;;;;;;;;-50;;1;;;;
;;;;;;;;;;;;reste;1;4;;;;
;;;;;;;;;;;;total;10;390;;;;
&lt;/pre&gt;

====cbei  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_négatifs_S-|cbei intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
cbei;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;;;3;1;;;1;;;;;;;;;;;;;1;;;;1;1;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;1;;;;;1;11
continu;71;0;0;82;0;0;8;72;0;5;38;0;4;21;0;3;21;0;2;11;0;1;9;0;1;10;0;4;5;0;0;0;0;0;4;0;1;4;0;1;1;0;1;2;0;0;1;0;1;1;4;389
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;cbei;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;total
;Sx-;0;0;0;3;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;11
;Sc-;71;0;0;82;0;0;8;72;0;5;38;0;4;21;0;3;21;0;2;11;0;1;9;0;1;10;0;4;5;0;0;0;0;0;4;0;1;4;0;1;1;0;1;2;0;0;1;0;1;1;4;389
&lt;/pre&gt;

====cbei autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_autres_intercalaires|cbei autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
cbei;autres intercalaires;;adresses1;;;cbei;autres intercalaires;;adresses2;;;cbei;autres intercalaires;;adresses3;;
;&amp;tRNA;15;1;;;deb;°CDS;540067;187;;;deb;°CDS;4256439;267;comp;
;&amp;tRNA;93;85;;;;&amp;tRNA;541157;208;;;;&amp;tRNA;4258671;79;comp;
fin;°CDS;254;;;;fin;°CDS;541440;;;;;&amp;tRNA;4258826;7;comp;
deb;°CDS;2710;119;;;deb;°CDS;541918;252;comp;;;&amp;tRNA;4258909;35;comp;
;&amp;tRNA;3057;30;;;;&amp;tRNA;543238;354;;;;&amp;tRNA;4259021;752;comp;
;&amp;tRNA;3178;241;;;fin;°CDS;543667;;;;fin;°CDS;4259847;;;
;&amp;tRNA;3510;18;;;deb;°CDS;772270;262;;;deb;°CDS;4880246;508;comp;
;&amp;tRNA;3619;125;;;;tmRNA;774356;871;;;;$rRNA;4880997;274;comp;
fin;°CDS;3835;;;;fin;°CDS;775585;;;;;$rRNA;4881388;578;comp;
deb;°CDS;13821;187;;;deb;°CDS;892419;565;;;;$rRNA;4884879;703;comp;
;&amp;tRNA;14914;34;;;;$rRNA;893905;137;;;fin;°CDS;4887099;;comp;
fin;°CDS;15023;;comp;;;&amp;tRNA;895554;118;;;deb;°CDS;6160739;343;comp;
deb;°CDS;124928;275;;;;$rRNA;895748;204;;;;&amp;tRNA;6162321;242;;
;&amp;tRNA;125614;20;;;;$rRNA;898866;552;;;fin;°CDS;6162639;;;
;&amp;tRNA;125723;7;;;fin;°CDS;899535;;;;deb;°CDS;6165324;222;;
;&amp;tRNA;125806;6;;;deb;°CDS;900798;709;;;;&amp;tRNA;6165957;5;comp;
;&amp;tRNA;125889;22;;;;$rRNA;902758;339;;;;$rRNA;6166038;188;comp;
;&amp;tRNA;126000;7;;;;$rRNA;904609;273;;;fin;°CDS;6166343;;;
;&amp;tRNA;126083;6;;;;$rRNA;907796;69;;;deb;°CDS;6175160;249;comp;
;&amp;tRNA;126166;21;;;fin;°CDS;907982;;comp;;;&amp;tRNA;6175847;1;comp;
;&amp;tRNA;126276;70;;;deb;°CDS;951995;97;;;;&amp;tRNA;6175924;44;comp;
;&amp;tRNA;126422;21;;;;&amp;tRNA;952728;396;;;;$rRNA;6176045;138;comp;
;&amp;tRNA;126532;664;;;fin;°CDS;953210;;;;;$rRNA;6176300;339;comp;
fin;°CDS;127272;;;;deb;°CDS;1017389;70;;;;$rRNA;6179556;572;comp;
deb;°CDS;138638;307;;;;ncRNA;1017765;758;;;fin;°CDS;6181640;;comp;
;&amp;tRNA;140451;234;;;fin;°CDS;1018872;;;;deb;°CDS;6182670;190;;
;&amp;tRNA;140760;439;;;deb;°CDS;1646835;56;;;;&amp;tRNA;6183610;5;comp;
;&amp;tRNA;141274;299;;;;ncRNA;1647290;182;;;;$rRNA;6183691;159;comp;
fin;°CDS;141648;;;;fin;°CDS;1647666;;comp;;deb;°CDS;6183967;294;comp;
deb;°CDS;144627;548;;;deb;°CDS;1739334;380;;;;&amp;tRNA;6185209;7;comp;
;$rRNA;146198;140;;;;&amp;tRNA;1740314;3;;;;$rRNA;6185292;138;comp;
;&amp;tRNA;147850;3;;;;&amp;tRNA;1740393;5;;;;$rRNA;6185547;339;comp;
;&amp;tRNA;147929;111;;;;&amp;tRNA;1740473;443;;;;$rRNA;6188803;776;comp;
;$rRNA;148117;70;;;fin;°CDS;1740992;;comp;;fin;°CDS;6191091;;comp;
;$rRNA;151101;5;;;deb;°CDS;1846157;-183;;;deb;°CDS;6199510;661;comp;
;&amp;tRNA;151223;4;;;;gene;1847876;588;;;;$rRNA;6202721;139;comp;
;&amp;tRNA;151303;681;;;fin;°CDS;1848647;;;;;$rRNA;6202977;339;comp;
fin;°CDS;152059;;;;deb;°CDS;1894180;34;;;;$rRNA;6206233;1107;comp;
deb;°CDS;177450;76;;;;&amp;tRNA;1895441;574;comp;;;$rRNA;6208852;138;comp;
;&amp;tRNA;178174;65;;;fin;°CDS;1896102;;;;;$rRNA;6209107;339;comp;
fin;°CDS;178315;;;;deb;°CDS;2097496;727;;;;$rRNA;6212363;507;comp;
deb;°CDS;313730;90;;;;$rRNA;2098643;502;;;fin;°CDS;6214382;;comp;
;&amp;tRNA;316298;4;;;;$rRNA;2100657;205;;;deb;°CDS;6256716;154;;
;&amp;tRNA;316387;120;;;;$rRNA;2103775;315;;;;ncRNA;6257755;316;comp;
fin;°CDS;316582;;comp;;fin;°CDS;2104207;;;;fin;°CDS;6258338;;comp;
deb;°CDS;402474;125;;;deb;°CDS;2296804;104;;;deb;°CDS;6305349;135;comp;
;&amp;tRNA;403079;17;;;;ncRNA;2297577;380;comp;;;&amp;tRNA;6306438;281;comp;
;&amp;tRNA;403172;149;;;fin;°CDS;2298150;;;;fin;°CDS;6306809;;comp;
;&amp;tRNA;403395;6;;;deb;°CDS;2305297;275;;;deb;°CDS;6374512;125;;
;&amp;tRNA;403478;16;;;;ncRNA;2306778;230;comp;;;&amp;tRNA;6375810;303;comp;
;&amp;tRNA;403570;35;;;fin;°CDS;2307274;;;;fin;°CDS;6376188;;comp;
;&amp;tRNA;403679;5;;;deb;°CDS;2339219;667;;;deb;°CDS;6391977;114;comp;
;&amp;tRNA;403761;3;;;;$rRNA;2340990;338;;;;$rRNA;6392868;134;comp;
;&amp;tRNA;403840;7;;;;$rRNA;2342840;140;;;;$rRNA;6393119;214;comp;
;&amp;tRNA;403922;18;;;;&amp;tRNA;2345896;3;;;;$rRNA;6396248;1125;comp;
;&amp;tRNA;404016;5;;;;$rRNA;2345974;429;;;;$rRNA;6398885;139;comp;
;&amp;tRNA;404106;25;;;fin;°CDS;2346520;;;;;$rRNA;6399141;214;comp;
;&amp;tRNA;404206;5;;;deb;°CDS;2351663;573;;;;$rRNA;6402270;753;comp;
;&amp;tRNA;404285;57;;;;$rRNA;2352713;338;;;fin;°CDS;6404535;;comp;
;&amp;tRNA;404418;7;;;;$rRNA;2354563;140;;;deb;°CDS;6436810;192;;
;&amp;tRNA;404500;18;;;;&amp;tRNA;2357618;3;;;;&amp;tRNA;6437983;6;comp;
;&amp;tRNA;404594;5;;;;$rRNA;2357696;90;;;;&amp;tRNA;6438066;14;comp;
;&amp;tRNA;404684;25;;;fin;°CDS;2357903;;;;;&amp;tRNA;6438156;29;comp;
;&amp;tRNA;404784;46;;;deb;°CDS;2765706;282;;;;&amp;tRNA;6438260;10;comp;
;&amp;tRNA;404904;325;;;;$rRNA;2766156;503;;;;&amp;tRNA;6438345;6;comp;
fin;°CDS;405306;;;;;$rRNA;2768171;202;;;;&amp;tRNA;6438428;16;comp;
deb;°CDS;413861;390;;;;$rRNA;2771285;5;;;;&amp;tRNA;6438520;29;comp;
;$rRNA;416312;132;;;;&amp;tRNA;2771407;6;;;;&amp;tRNA;6438624;10;comp;
;&amp;tRNA;417956;84;;;;&amp;tRNA;2771489;25;;;;&amp;tRNA;6438709;6;comp;
;$rRNA;418117;71;;;;&amp;tRNA;2771591;448;;;;&amp;tRNA;6438792;14;comp;
;&amp;tRNA;421103;345;;;fin;°CDS;2772114;;;;;&amp;tRNA;6438882;162;comp;
fin;°CDS;421523;;;;deb;°CDS;3556683;565;;;fin;°CDS;6439119;;comp;
deb;°CDS;486264;159;;;;&amp;tRNA;3557617;505;;;deb;°CDS;6477551;501;;erreur à corriger
;&amp;tRNA;486828;9;;;fin;°CDS;3558197;;comp;;;$rRNA;6480533;213;;
;&amp;tRNA;486922;27;;;deb;°CDS;3752035;248;comp;;;$rRNA;6482258;108;;
;&amp;tRNA;487025;12;;;;&amp;tRNA;3752901;13;comp;;;$rRNA;6485280;14;;
;&amp;tRNA;487112;9;;;fin;°CDS;3752999;;comp;;;;;;;
;&amp;tRNA;487206;30;;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;487312;12;;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;487399;451;;;;;;;;;;;;;;
fin;°CDS;487935;;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====cbei intercalaires tRNA-cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_tRNA-cds|cbei intercalaires tRNA-cds]]
&lt;pre&gt;
cbei;intercalaires tRNA-cds;;;;;;;
comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;85;;76;13;;
;119;;125;;90;65;deb;
;187;comp’;34;;97;85;&lt;201;9
;275;;664;;119;125;total;17
;307;;299;;125;162;taux;53%
;;;681;;135;208;;
;76;;65;;159;242;fin;
;90;comp’;120;;187;281;&lt;201;5
;125;;325;;187;299;total;18
;;;345;;248;303;taux;28%
;159;;451;;249;325;;
;187;;208;;267;345;total;
comp’;252;;354;;275;354;&lt;201;14
;97;;396;;294;396;total;35
;380;comp’;443;;307;448;taux;40%
comp’;34;comp’;574;;380;451;;
;;;448;;565;664;;
;565;comp’;505;;-;681;comp’;cumuls
;248;;13;;34;120;deb;4
;267;comp’;752;;125;443;;7
comp’;343;;242;;190;505;fin;1
comp’;222;;;;192;574;;5
;249;;;;222;752;total;
comp’;190;;;;252;-;&lt;201;5
;294;;;;343;-;total;12
;135;;281;;;;taux;42%
comp’;125;;303;;;;;
comp’;192;;162;;;;;
;;;;;;;;
;;deb;fin;total;;;;
;&lt;201;13;6;19;;;;
;total;24;23;47;;;;
;taux;54%;26%;40%;;;;
&lt;/pre&gt;

===afn===
====afn opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_opérons|afn opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Acid_ferm_DSM_20731/;gtRNAdb;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_013740.1;afn;;;;
56%GC;30.6.19 Paris;16s  6;60;doubles;intercalaires
;Acidaminococcus fermentans DSM 20731;;;;
;24678..26242;;16s;@1;359
;26602..29507;;23s;;228
;29736..29852;;5s;;
;;;;;
;36819..36894;;acg;;
;;;;;
;57713..59277;;16s;;359
;59637..62543;;23s;;228
;62772..62888;;5s;;
;;;;;
;169459..169534;;gcc;;
;;;;;
;249791..249867;;agg;;
;;;;;
comp;274627..274703;;cgt;;
;;;;;
;311123..311198;;aca;;22
;311221..311305;;tac;;5
;311311..311386;;atg;;3
;311390..311465;;acc;;6
;311472..311548;;atgf;;
;;;;;
;380482..382046;;16s;;251
;382298..385204;;23s;;229
;385434..385550;;5s;;
;;;;;
;461553..461627;;aac;;3
;461631..461705;;gaa;;8
;461714..461789;;gta;;50
;461840..461916;;cca;;11
;461928..462001;;gga;;8
;462010..462086;;aga;;
;;;;;
;526984..527070;;ctg;+;30
;527101..527186;;ctc;2 ctg;52
;527239..527325;;ctg;;
;;;;;
;578049..578123;;ggc;;
;;;;;
;636984..638548;;16s;@2;94
;638643..638719;;atc;;66
;638786..638861;;gca;;273
;639135..642040;;23s;;139
;642180..642296;;5s;;
;;;;;
;712229..712304;;cac;;18
;712323..712398;;caa;;3
;712402..712477;;aaa;;16
;712494..712577;;cta;;
;;;;;
comp;724421..724497;;gtc;;
;;;;;
;774880..774956;;gac;;4
;774961..775036;;ttc;;8
;775045..775119;;ggc;;9
;775129..775202;;tgc;;13
;775216..775304;;tta;;
;;;;;
;796654..796728;;cgg;;
;;;;;
;842393..842469;;gac;;2
;842472..842547;;ttc;;8
;842556..842630;;ggc;;9
;842640..842713;;tgc;;
;;;;;
;889670..889746;;ccc;;
;;;;;
;906136..906210;;aac;;
;;;;;
;1022783..1022859;;gac;;2
;1022862..1022936;;ggc;;1
;1022938..1023011;;tgg;;
;;;;;
;1555201..1555277;;ccg;;
;;;;;
comp;1567911..1567999;;tca;;
;;;;;
comp;1613773..1613863;;agc;;
;;;;;
;1702659..1702744;;ttg;;
;;;;;
comp;1711770..1711886;;5s;;228
comp;1712115..1715021;;23s;;359
comp;1715381..1716945;;16s;;
;;;;;
comp;1823852..1823927;;gta;;6
comp;1823934..1824008;;gaa;;8
comp;1824017..1824092;;aag;;
;;;;;
;1909446..1909536;;tcc;;
;;;;;
comp;1911342..1911429;;tcg;;
;;;;;
comp;1974984..1975058;;atgi;;
;;;;;
comp;1984782..1984856;;gag;;12
comp;1984869..1984942;;cag;+;111
comp;1985054..1985127;;cag;2 cag;
;;;;;
comp;2072279..2072395;;5s;;228
comp;2072624..2075529;;23s;;298
comp;2075828..2075903;;gca;;66
comp;2075970..2076046;;atc;;94
comp;2076141..2077705;;16s;;
;;;;;
;2148343..2148418;;gcg;;
;;;;;
comp;2287117..2287192;;aaa;;
;;;;;
comp;2303018..2303094;;gtg;;
;;;;;
comp;2323563..2323636;;ggg;;
&lt;/pre&gt;

====afn cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_cumuls|afn cumuls]]
&lt;pre&gt;
afn cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;6;1;1;-
;16 23 5s 0;4;20;21;
;16 atc gca;2;40;2;
;16 23 5s a;0;60;2;
;max a;2;80;0;
;a doubles;0;100;0;
;spéciaux;0;120;1;
;total aas;4;140;0;
sans ;opérons;29;160;0;
;1 aa;20;180;0;
;max a;6;200;0;
;a doubles;2;;0;
;total aas;56;;27;0
total aas;;60;;;
remarques;;2;;;
avec jaune;;;moyenne;16;
;;;variance;23;
sans jaune;;;moyenne;12;
;;;variance;13;
&lt;/pre&gt;

====afn blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_blocs|afn blocs]]
&lt;pre&gt;
afn blocs;;;;;;
16s;359;1565;359;1565;251;1565
23s;228;2906;228;2907;229;2907
5s;;117;;117;;117
;;;;;;
16s;94;1565;;5s;228;117
atc;66;;;23s;298;2906
gca;273;;;gca;66;
23s;139;2906;;atc;94;
5s;;117;;16s;;1565
;;;;;;
5s;228;117;;;;
23s;359;2907;;;;
16s;;1565;;;;
&lt;/pre&gt;

====afn remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_remarques|afn remarques]]
&lt;pre&gt;
afn;;;;;;;60
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;2
atc;2;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;3;ggc;4
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;2;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;
gta;2;gca;2;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;2;ccg;1;cag;2;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
&lt;/pre&gt;
====negativicutes distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#negativicutes_distribution|negativicutes distribution]]
&lt;pre&gt;
22.1.21 Paris;;tRNAs total des negatives;;;;;;;;;;;;;;
genomes;;total;;;total;ttt;tgt;;1-3aas;;;;total;;ttt;tgt
9;;582;;;571;;;;;;;;58;;;
atgi;8;tct;;tat;;atgf;15;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;17;tcc;10;tac;16;tgc;13;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;
atc;17;acc;11;aac;26;agc;11;;atc;18;acc;;aac;6;agc;1
ctc;11;ccc;7;cac;10;cgt;16;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2
gtc;8;gcc;7;gac;24;ggc;33;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;11;tca;10;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;13;aaa;20;aga;9;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;9;cca;11;caa;13;cga;2;;cta;;cca;;caa;1;cga;
gta;24;gca;21;gaa;25;gga;10;;gta;;gca;21;gaa;1;gga;
ttg;11;tcg;9;tag;;tgg;13;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;4
atgj;12;acg;9;aag;10;agg;9;;atgj;;acg;1;aag;;agg;
ctg;10;ccg;7;cag;11;cgg;9;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;4;gcg;5;gag;5;ggg;8;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;186;;263;;122;571;;;;7;;11;;1;19
9-23;;;;total;;ttt;tgt;;-rRNA;;;;total;;ttt;tgt
;;;;92;;;;;attention au -2;;;;421;;;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;7;tct;;tat;;atgf;12
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;6;tcc;2;tac;3;tgc;2;;ttc;11;tcc;8;tac;12;tgc;11
atc;1;acc;;aac;5;agc;2;;atc;-2;acc;11;aac;15;agc;8
ctc;2;ccc;;cac;3;cgt;4;;ctc;9;ccc;7;cac;5;cgt;10
gtc;;gcc;;gac;7;ggc;3;;gtc;8;gcc;7;gac;17;ggc;30
tta;4;tca;1;taa;;tga;;;tta;7;tca;9;taa;;tga;1
ata;;aca;5;aaa;5;aga;;;ata;;aca;8;aaa;15;aga;9
cta;1;cca;2;caa;5;cga;;;cta;8;cca;9;caa;7;cga;2
gta;7;gca;;gaa;5;gga;4;;gta;17;gca;0;gaa;19;gga;6
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;9;tcg;9;tag;;tgg;7
atgj;1;acg;;aag;2;agg;;;atgj;11;acg;8;aag;8;agg;9
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;8;ccg;7;cag;11;cgg;9
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;4;gcg;5;gag;5;ggg;8
;;24;;64;;4;92;;;;118;;188;;117;423
;;;;;;;;;;;116;;188;;117;421
&lt;/pre&gt;
====afn distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_distribution|afn distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;;cgt;1;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;2;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
afn;;20;;;;;20;;afn;34;;;;;;34;;afn;2;;;;;;2
&lt;/pre&gt;
====afn données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_données_intercalaires|afn données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;afn;fx;fc;afn;fx40;fc40;afn;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;2;9;0;2;9;-1;0;38;105;361;16s 23s;;;tRNA tRNA;;intra
;0;10;4;180;1;1;38;-2;0;0;105;51;3* 359;;;2* 66;;atc gca
;0;20;3;248;2;2;25;-3;0;0;122;188;251;;;tRNA tRNA;;
;3;30;7;105;3;0;20;-4;1;129;195;268;23s 5s;;;22;;aca
;1;40;21;48;4;0;28;-5;0;0;200;61;4* 228;;;5;;tac
;2;50;15;38;5;0;13;-6;0;1;131;80;229;;;3;;atgj
1;2;60;16;44;6;0;9;-7;0;6;74;134;139;;;6;;acc
2;0;70;5;42;7;0;5;-8;0;41;266;393;5s CDS;;;**;;atgf
1;4;80;8;41;8;0;7;-9;0;1;145;158;286;266;;3;;aac
;1;90;8;45;9;1;19;-10;0;1;54;91;296;262;;8;;gaa
1;3;100;11;34;10;0;16;-11;0;19;131;70;;512;;50;;gta
;4;110;10;32;11;1;28;-12;0;0;194;196;;193;;11;;cca
;3;120;8;42;12;0;46;-13;0;5;96;;16s tRNA;;;8;;gga
;3;130;15;43;13;1;29;-14;0;8;214;;2* 94;;atc;**;;aga
1;4;140;21;34;14;0;22;-15;0;0;111;;tRNA 23s;;;30;;ctg
;1;150;13;29;15;0;37;-16;0;3;73;;273;;gca;52;;ctc
1;2;160;14;27;16;0;24;-17;0;10;159;;298;;gca;**;;ctg
;0;170;10;28;17;0;10;-18;0;0;119;;;;;18;;cac
;0;180;2;22;18;0;25;-19;0;2;127;;;;;3;;caa
1;1;190;13;13;19;1;12;-20;0;6;71;;;;;16;;aaa
1;3;200;13;12;20;0;15;-21;0;0;156;;;;;**;;cta
;0;210;10;15;21;1;20;-22;0;0;58;;;;;4;;gac
;2;220;12;20;22;1;13;-23;0;4;102;;;;;8;;ttc
;1;230;9;25;23;0;11;-24;0;0;137;;;;;9;;ggc
;0;240;12;21;24;1;9;-25;0;0;112;;;;;13;;tgc
;0;250;6;12;25;0;9;-26;0;4;24;;;;;**;;tta
;0;260;7;9;26;0;6;-27;0;0;21;;;;;2;;gac
1;1;270;5;16;27;1;14;-28;0;0;93;;;;;8;;ttc
;0;280;6;10;28;0;10;-29;0;3;215;;;;;9;;ggc
;0;290;5;6;29;2;3;-30;0;0;76;;;;;**;;tgc
;0;300;8;9;30;1;10;-31;0;2;379;;;;;2;;gac
;0;310;4;11;31;2;5;-32;0;2;83;;;;;1;;ggc
;0;320;4;4;32;2;5;-33;0;0;182;;;;;**;;tgg
;0;330;5;8;33;2;3;-34;0;0;136;;;;;6;;gta
;0;340;1;8;34;5;5;-35;0;3;23;;;;;8;;gaa
;0;350;3;9;35;2;6;-36;0;0;222;;;;;**;;aag
;0;360;2;8;36;3;3;-37;0;1;39;;;;;12;;gag
1;0;370;4;10;37;0;8;-38;0;2;122;;;;;111;;cag
;1;380;4;4;38;3;3;-39;0;0;106;;;;;**;;cag
;0;390;3;4;39;2;6;-40;1;0;91;;;;;;;
1;1;400;1;6;40;0;4;-41;0;1;451;;;;;;;
;2;reste;16;54;reste;309;795;-42;0;0;45;;;;;;;
12;45;total;346;1385;total;346;1385;-43;0;0;486;;;;;;;
12;43;diagr;328;1322;diagr;35;581;-44;0;1;45;;;;;;;
0;3; t30;14;533;;;;-45;1;0;393;;;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;CDS 16s;;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;319;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;346;;;;;;;
;x;344;4;2;350;;;-49;0;0;485;;;;;;;
;c;1376;303;9;1688;;;-50;0;1;300;;;;;;;
;;;;;2038;154;;reste;1;9;391;;;;;;;
;;;;;;2192;;total;4;303;265;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====afn autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_autres_intercalaires_aas|afn autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
*contrôlé le 21.7.22
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;afn;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;23699;24358;319;*;
;;rRNA;24678;26242;359;*;16s
;;rRNA;26602;29507;228;*;23s
;;rRNA;29736;29852;286;*;5s
fin;;CDS;30139;30339;;0;
deb;;CDS;35919;36713;105;*;
;;tRNA;36819;36894;105;*;acg
fin;;CDS;37000;37914;;;
deb;;CDS;56077;57366;346;*;
;;rRNA;57713;59277;359;*;16s
;;rRNA;59637;62543;228;*;23s
;;rRNA;62772;62888;266;*;5s
fin;comp;CDS;63155;64390;;0;
deb;;CDS;168443;169336;122;*;
;;tRNA;169459;169534;361;*;gcc
fin;comp;CDS;169896;170894;;;
deb;comp;CDS;181646;182656;89;*;
;comp;misc_b;182746;182986;130;*;
fin;comp;CDS;183117;183803;;;
deb;comp;CDS;183775;185160;510;*;
;;misc_b;185671;185909;146;*;
fin;;CDS;186056;187753;;;
deb;;CDS;249164;249595;195;*;
;;tRNA;249791;249867;51;*;agg
fin;comp;CDS;249919;250062;;;
deb;;CDS;253385;254824;90;*;
;;misc_b;254915;255170;84;*;
fin;;CDS;255255;256238;;;
deb;comp;CDS;273899;274426;200;*;
;comp;tRNA;274627;274703;188;*;cgt
fin;;CDS;274892;276166;;;
deb;;CDS;310188;310991;131;*;
;;tRNA;311123;311198;22;*;aca
;;tRNA;311221;311305;5;*;tac
;;tRNA;311311;311386;3;*;atgj
;;tRNA;311390;311465;6;*;acc
;;tRNA;311472;311548;74;*;atgf
fin;;CDS;311623;312816;;;
deb;;CDS;359181;360227;58;*;
;;regulatory;360286;360394;52;*;
fin;;CDS;360447;361625;;;
deb;;CDS;378908;379996;485;*;
;;rRNA;380482;382046;251;*;16s
;;rRNA;382298;385204;229;*;23s
;;rRNA;385434;385550;262;*;5s
fin;comp;CDS;385813;386838;;;
deb;;CDS;414288;416231;246;*;
;;regulatory;416478;416590;98;*;
fin;;CDS;416689;417768;;;
deb;;CDS;460654;461286;266;*;
;;tRNA;461553;461627;3;*;aac
;;tRNA;461631;461705;8;*;gaa
;;tRNA;461714;461789;50;*;gta
;;tRNA;461840;461916;11;*;cca
;;tRNA;461928;462001;8;*;gga
;;tRNA;462010;462086;145;*;aga
fin;;CDS;462232;463230;;;
deb;;CDS;466993;468717;232;*;
;;misc_b;468950;469148;36;*;
fin;;CDS;469185;471839;;;
deb;;CDS;526396;526929;54;*;
;;tRNA;526984;527070;30;*;ctg
;;tRNA;527101;527186;52;*;ctc
;;tRNA;527239;527325;268;*;ctg
fin;comp;CDS;527594;528586;;0;
deb;comp;CDS;570200;571507;65;*;
;comp;regulatory;571573;571669;209;*;
fin;;CDS;571879;575394;;;
deb;;CDS;577378;577917;131;*;
;;tRNA;578049;578123;194;*;ggc
fin;;CDS;578318;579067;;;
deb;;CDS;635289;636683;300;*;
;;rRNA;636984;638548;94;*;16s
;;tRNA;638643;638719;66;*;atc
;;tRNA;638786;638861;273;*;gca
;;rRNA;639135;642040;139;*;23s
;;rRNA;642180;642296;296;*;5s
fin;;CDS;642593;643381;;0;
deb;;CDS;677296;678177;181;*;
;;misc_f;678359;678410;368;*;
fin;;CDS;678779;679798;;;
deb;;CDS;711704;712132;96;*;
;;tRNA;712229;712304;18;*;cac
;;tRNA;712323;712398;3;*;caa
;;tRNA;712402;712477;16;*;aaa
;;tRNA;712494;712577;61;*;cta
fin;comp;CDS;712639;712809;;0;
deb;;CDS;723480;724340;80;*;
;comp;tRNA;724421;724497;134;*;gtc
fin;;CDS;724632;725645;;;
deb;;CDS;774399;774665;214;*;
;;tRNA;774880;774956;4;*;gac
;;tRNA;774961;775036;8;*;ttc
;;tRNA;775045;775119;9;*;ggc
;;tRNA;775129;775202;13;*;tgc
;;tRNA;775216;775304;111;*;tta
fin;;CDS;775416;776684;;;
deb;;CDS;796146;796580;73;*;
;;tRNA;796654;796728;159;*;cgg
fin;;CDS;796888;797310;;;
deb;;CDS;841590;842273;119;*;
;;tRNA;842393;842469;2;*;gac
;;tRNA;842472;842547;8;*;ttc
;;tRNA;842556;842630;9;*;ggc
;;tRNA;842640;842713;127;*;tgc
fin;;CDS;842841;843362;;;
deb;;CDS;881739;882029;121;*;
;;repeat_reg;882151;886170;278;*;
fin;;CDS;886449;887618;;;
deb;;CDS;889017;889598;71;*;
;;tRNA;889670;889746;156;*;ccc
fin;;CDS;889903;891513;;;
deb;;CDS;905286;906077;58;*;
;;tRNA;906136;906210;102;*;aac
fin;;CDS;906313;907125;;;
deb;;CDS;913707;915986;78;*;
;;regulatory;916065;916164;91;*;
fin;;CDS;916256;917077;;;
deb;;CDS;947642;948565;32;*;
;;ncRNA;948598;948943;38;*;
fin;;CDS;948982;949302;;;
deb;comp;CDS;1017827;1018843;92;*;
;;misc_b;1018936;1019130;36;*;
fin;;CDS;1019167;1020189;;;
deb;;CDS;1020207;1022645;137;*;
;;tRNA;1022783;1022859;2;*;gac
;;tRNA;1022862;1022936;1;*;ggc
;;tRNA;1022938;1023011;112;*;tgg
fin;;CDS;1023124;1023423;;;
deb;comp;CDS;1111497;1112716;73;*;
;comp;misc_b;1112790;1113035;267;*;
fin;;CDS;1113303;1114085;;;
deb;;CDS;1305277;1306137;298;*;
;;regulatory;1306436;1306545;70;*;
fin;;CDS;1306616;1307653;;;
deb;;CDS;1328649;1328930;26;*;
;;tmRNA;1328957;1329305;406;*;
fin;comp;CDS;1329712;1332120;;;
deb;comp;CDS;1403493;1404494;52;*;
;comp;misc_b;1404547;1404789;111;*;
fin;comp;CDS;1404901;1406295;;;
deb;comp;CDS;1485384;1487072;59;*;
;comp;misc_b;1487132;1487376;146;*;
fin;comp;CDS;1487523;1488698;;;
deb;;CDS;1536256;1537929;68;*;
;;regulatory;1537998;1538074;113;*;erreur
fin;;CDS;1538188;1539855;;0;
deb;;CDS;1553542;1555176;24;*;
;;tRNA;1555201;1555277;393;*;ccg
fin;comp;CDS;1555671;1556342;;;
deb;comp;CDS;1567689;1567889;21;*;
;comp;tRNA;1567911;1567999;93;*;tca
fin;comp;CDS;1568093;1568569;;;
deb;;CDS;1612826;1613614;158;*;
;comp;tRNA;1613773;1613863;215;*;agc
fin;comp;CDS;1614079;1614846;;0;
deb;comp;CDS;1668440;1668919;42;*;
;comp;ncRNA;1668962;1669144;51;*;
fin;comp;CDS;1669196;1669855;;0;
deb;;CDS;1701767;1702582;76;*;
;;tRNA;1702659;1702744;91;*;ttg
fin;comp;CDS;1702836;1703666;;;
deb;;CDS;1710214;1711257;512;*;
;comp;rRNA;1711770;1711886;228;*;5s
;comp;rRNA;1712115;1715021;359;*;23s
;comp;rRNA;1715381;1716945;391;*;16s
fin;comp;CDS;1717337;1718857;;;
deb;comp;CDS;1823002;1823472;379;*;
;comp;tRNA;1823852;1823927;6;*;gta
;comp;tRNA;1823934;1824008;8;*;gaa
;comp;tRNA;1824017;1824092;83;*;aag
fin;comp;CDS;1824176;1825210;;;
deb;comp;CDS;1907578;1909263;182;*;
;;tRNA;1909446;1909536;53;*;tcc
;;ncRNA;1909590;1909689;115;*;
deb;comp;CDS;1909805;1911205;136;*;
;comp;tRNA;1911342;1911429;23;*;tcg
fin;comp;CDS;1911453;1911932;;;
deb;comp;CDS;1912058;1912981;43;*;
;comp;misc_b;1913025;1913256;130;*;
fin;;CDS;1913387;1914049;;;
deb;comp;CDS;1973889;1974761;222;*;
;comp;tRNA;1974984;1975058;39;*;atgi
fin;comp;CDS;1975098;1976867;;;
deb;comp;CDS;1983694;1984659;122;*;
;comp;tRNA;1984782;1984856;12;*;gag
;comp;tRNA;1984869;1984942;111;*;cag
;comp;tRNA;1985054;1985127;106;*;cag
fin;comp;CDS;1985234;1985980;;;
deb;;CDS;2070538;2072085;193;*;
;comp;rRNA;2072279;2072395;228;*;5s
;comp;rRNA;2072624;2075529;298;*;23s
;comp;tRNA;2075828;2075903;66;*;gca
;comp;tRNA;2075970;2076046;94;*;atc
;comp;rRNA;2076141;2077705;265;*;16s
fin;comp;CDS;2077971;2079029;;;
deb;;CDS;2147697;2148251;91;*;
;;tRNA;2148343;2148418;70;*;gcg
fin;comp;CDS;2148489;2148716;;;
deb;comp;CDS;2285667;2286665;451;*;
;comp;tRNA;2287117;2287192;45;*;aaa
fin;comp;CDS;2287238;2288464;;;
deb;comp;CDS;2301950;2302531;486;*;
;comp;tRNA;2303018;2303094;45;*;gtg
fin;comp;CDS;2303140;2303844;;;
deb;comp;CDS;2322585;2323169;393;*;
;comp;tRNA;2323563;2323636;196;*;ggg
fin;;CDS;2323833;2328641;;0;
&lt;/pre&gt;

====afn intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_entre_cds|afn intercalaires entre cds]]
*'''Le tableau'''
&lt;pre&gt;
afn;23.2.22 Paris;;afn 30.8.20;;;;;;;
afn;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;fréquenceffrequence5
;'''négatif;307;15.1;'''négatif ;-10;14;-1 à -83;'''2 329 769;-1;307
;'''zéro;11;0.5;;;;;'''intercals;0;11
;'''1 à 200;1324;65.0;'''0 à 200;66;58;;'''220 467;5;127
;'''201 à 370;304;14.9;'''201 à 370;267;49;;'''9.5%;10;57
;'''371 à 600;69;3.4;'''371 à 600;449;59;;;15;164
;'''601 à max;23;1.1;'''601 à 992;743;108;;;20;87
;'''total 2038;&lt;201;80.6;'''total 2034;105;133;-83 à 992;;25;65
adresse;intercal;intercal;&lt;u&gt;fréquence1;intercal;&lt;u&gt;fréquenceffréquence6;cumul et %;intercal;&lt;u&gt;fréquenceffréquence-1;30;47
1555671;2261;-1;307;-70;5;;0;11;35;37
1949615;1154;0;11;-60;3;;-1;°38;40;32
1841522;1130;1;°39;-50;3;;-2;0;45;25
1001677;992;2;27;-40;4;;-3;0;50;28
434858;957;3;20;-30;10;'''min à -1;-4;°130;55;31
865205;922;4;°28;-20;17;307;-5;0;60;29
463581;845;5;13;-10;48;15.1%;-6;1;65;23
1969579;795;6;9;0;228;;-7;6;70;24
1287774;772;7;5;10;184;;-8;°41;75;32
843665;744;8;7;20;251;;-9;1;80;17
1081454;736;9;°20;30;112;;-10;1;85;25
34;721;10;16;40;69;;-11;°19;90;28
1347444;718;11;29;50;53;;-12;0;95;16
2155062;701;12;°46;60;60;;-13;5;100;29
1227328;693;13;30;70;48;;-14;°8;105;20
893831;683;14;22;80;49;;-15;0;110;22
1185969;679;15;°37;90;53;'''1 à 100;-16;3;115;28
1657318;677;16;24;100;45;923;-17;°10;120;22
1282010;667;17;10;110;42;45.3%;-18;0;125;29
872797;649;18;°25;120;50;;-19;2;130;29
1240102;647;19;13;130;58;;-20;°6;135;24
1246797;636;20;15;140;55;;-21;0;140;31
117980;628;21;°21;150;42;;-22;0;145;20
867763;580;22;14;160;41;;-23;°4;150;22
406827;567;23;11;170;38;'''1 à 200;-24;0;155;18
1121221;551;24;°10;180;24;1324;-25;0;160;23
2231462;551;25;9;190;26;65%;-26;4;165;21
901417;550;26;6;200;25;;-27;0;170;17
39288;548;27;°15;210;25;;-28;0;175;11
791634;544;28;10;220;32;;-29;°3;180;13
1481233;542;29;5;230;34;;-30;0;185;8
691218;519;30;°11;240;33;'''0 à 200;-31;2;190;18
1388835;517;31;7;250;18;1335;-32;2;195;16
2163709;515;32;7;260;16;;total;297;200;9
1189403;513;33;5;270;21;;reste;21;205;15
1783994;508;34;°10;280;16;;;318;210;10
1749779;507;35;8;290;11;;;;215;18
847959;503;36;6;300;17;;intercal;&lt;u&gt;fréquencef;220;14
1268481;502;37;8;310;15;;600;2015;225;23
;;38;6;320;8;;620;;230;11
;;39;8;330;13;;640;2;235;14
;;40;4;340;9;'''201 à 370;660;2;240;19
;;reste;1104;350;12;304;680;3;245;7
;;total;2038;360;10;14.9%;700;2;250;11
;;;;370;14;;720;2;255;5
2109623;-113;shift2;425;380;8;;740;2;260;11
598105;-83;comp;;390;7;;760;1;265;7
1667526;-79;shift2;915;400;7;;780;1;270;14
2031132;-74;shift2;614;410;1;;800;1;275;5
935587;-71;shift2;518;420;5;;820;;280;11
2283155;-68;shift2;1952;430;2;;840;;285;8
846262;-67;shift2;132;440;4;;860;1;290;3
1528664;-67;shift2;108;450;4;;880;;295;7
1794682;-59;shift2;1601;460;3;;900;;300;10
808710;-53;shift2;1034;470;1;;920;;305;10
1101239;-50;shift2;2423;480;5;;940;1;310;5
287845;-45;;;490;1;;960;1;315;4
532761;-44;;;500;5;;980;;320;4
50634;-41;;;510;4;;1000;1;325;8
434100;-40;;;520;4;;1020;;330;5
276227;-38;;;530;0;;1040;;335;3
629222;-38;;;540;0;'''371 à 600;1060;;340;6
1090320;-37;;;550;4;69;1080;;345;9
503812;-35;;;560;2;3.4%;1100;;350;3
1225885;-35;;;570;1;;1120;;355;3
1260789;-35;;;580;1;'''601 à max;1140;1;360;7
706234;-32;;;590;0;23;1160;1;365;8
2148489;-32;;;600;0;1.1%;;22;370;6
460032;-31;;;reste;23;;reste;1;reste;92
1743849;-31;;;total;2038;;total;2038;total;2038
&lt;/pre&gt;

====afn  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_positifs_S+|afn intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
afn Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
rtb;min30;118;402;520;536;-105;148;253;-277;-165;202;;;
afn;min10;328;1322;1650;607;-17;108;125;-467;-407;-8;;;
mba;min10;705;1651;2356;154;-330;-221;109;-512;-477;-223;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
51;294;0.17;189;604;5;7;21;162;8;131;-81;;;
46;402;0.11;350;1688;6;5;11;180;36;580;-369;;;
45;214;0.21;1255;2688;1;8;18;114;51;428;-74;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
afn;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;29;-227;419;16;486;261;max40,140;&amp;-95;712;-1690;137;722;250;min50
31 à 400;;;;;;;2 parties;&amp;9.5;-42;-63;38;904;147;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;75;40;-;303;poly;183;tF;&amp;197;65;;425;poly;297;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;92;36;-;859;dte;45;tm
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;corrélation;;;;;;
41-n;0.607;-0.017;0.108;;;;;-0.369;;;;;;
1-n;-0.008;-0.467;-0.407;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
afn;fx;fc;;afn;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;afn;Sx-;Sc-
0;2;9;;0;6;7;0;2;9;&gt;0;344;-1;0;38
10;4;180;;10;12;136;1;1;38;&lt;0;4;-2;0;0
20;3;248;;20;9;188;2;2;25;zéro;2;-3;0;0
30;8;104;;30;24;79;3;0;20;total;350;-4;1;129
40;21;48;;40;64;36;4;0;28;;c;-5;0;0
50;15;38;;50;46;29;5;0;13;&gt;0;1376;-6;0;1
60;16;44;;60;49;33;6;0;9;&lt;0;303;-7;0;6
70;5;42;;70;15;32;7;0;5;zéro;9;-8;0;41
80;8;41;;80;24;31;8;0;7;total;1688;-9;0;1
90;8;45;;90;24;34;9;1;19;;;-10;0;1
100;11;34;;100;34;26;10;0;16;total;2038;-11;0;19
110;10;32;;110;30;24;11;1;28;;;-12;0;0
120;8;42;;120;24;32;12;0;46;;;-13;0;5
130;16;42;;130;49;32;13;1;29;;;-14;0;8
140;21;34;;140;64;26;14;0;22;;;-15;0;0
150;13;29;;150;40;22;15;0;37;;;-16;0;3
160;14;27;;160;43;20;16;0;24;;;-17;0;10
170;10;28;;170;30;21;17;0;10;;;-18;0;0
180;2;22;;180;6;17;18;0;25;;;-19;0;2
190;13;13;;190;40;10;19;1;12;;;-20;0;6
200;13;12;;200;40;9;20;0;15;;;-21;0;0
210;10;15;;210;30;11;21;1;20;;;-22;0;0
220;12;20;;220;37;15;22;1;13;;;-23;0;4
230;9;25;;230;27;19;23;0;11;;;-24;0;0
240;12;21;;240;37;16;24;1;9;;;-25;0;0
250;6;12;;250;18;9;25;0;9;;;-26;0;4
260;7;9;;260;21;7;26;1;5;;;-27;0;0
270;5;16;;270;15;12;27;1;14;;;-28;0;0
280;6;10;;280;18;8;28;0;10;;;-29;0;3
290;5;6;;290;15;5;29;2;3;;;-30;0;0
300;8;9;;300;24;7;30;1;10;;;-31;0;2
310;4;11;;310;12;8;31;2;5;;;-32;0;2
320;4;4;;320;12;3;32;2;5;;;-33;0;0
330;4;9;;330;12;7;33;2;3;;;-34;0;0
340;1;8;;340;3;6;34;5;5;;;-35;0;3
350;3;9;;350;9;7;35;2;6;;;-36;0;0
360;2;8;;360;6;6;36;3;3;;;-37;0;1
370;4;10;;370;12;8;37;0;8;;;-38;0;2
380;3;5;;380;9;4;38;3;3;;;-39;0;0
390;3;4;;390;9;3;39;2;6;;;-40;1;0
400;1;6;;400;3;5;40;0;4;;;-41;0;1
reste;16;54;;;;;reste;308;796;;;-42;0;0
total;346;1385;;t30;46;402;total;346;1385;;;-43;0;0
diagr;328;1322;;;;;diagr;36;580;;;-44;0;1
 - t30;313;790;;;;;;;;;;-45;1;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;0;1
;;;;;;;;;;;;reste;1;9
;;;;;;;;;;;;total;4;303
&lt;/pre&gt;

====afn  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_négatifs_S-|afn intercalaires négatifs S-]]

*9.6.21
&lt;pre&gt;
afn;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;4
continu;38;0;0;129;0;1;6;41;1;1;19;0;5;8;0;3;10;0;2;6;0;0;4;0;0;4;0;0;3;0;2;2;0;0;3;0;1;2;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;1;9;303
&lt;/pre&gt;
14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;afn;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;4
;Sc-;38;0;0;129;0;1;6;41;1;1;19;0;5;8;0;3;10;0;2;6;0;0;4;0;0;4;0;0;3;0;2;2;0;0;3;0;1;2;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;1;9;303
&lt;/pre&gt;

====afn autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_autres_intercalaires|afn autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
afn;autres intercalaires;;adresses1;;;afn;autres intercalaires;;adresses1;;;afn;autres intercalaires;;adresses1;
deb;°CDS;23699;319;;;deb;°CDS;635289;300;;;deb;°CDS;1485384;59;comp
;$rRNA;24678;359;;;;$rRNA;636984;94;;;;misc_binding;1487132;146;comp
;$rRNA;26602;228;;;;&amp;tRNA;638643;66;;;fin;°CDS;1487523;;comp
;$rRNA;29736;286;;;;&amp;tRNA;638786;273;;;deb;°CDS;1536256;68;
fin;°CDS;30139;;;;;$rRNA;639135;139;;;;regulatory;1537998;113;
deb;°CDS;35919;105;;;;$rRNA;642180;296;;;fin;°CDS;1538188;;
;&amp;tRNA;36819;105;;;fin;°CDS;642593;;;;deb;°CDS;1553542;24;
fin;°CDS;37000;;;;deb;°CDS;677296;181;;;;&amp;tRNA;1555201;393;
deb;°CDS;56077;346;;;;misc_feature;678359;368;;;fin;°CDS;1555671;;comp
;$rRNA;57713;359;;;fin;°CDS;678779;;;;deb;°CDS;1567689;21;comp
;$rRNA;59637;228;;;deb;°CDS;711704;96;;;;&amp;tRNA;1567911;93;comp
;$rRNA;62772;266;;;;&amp;tRNA;712229;18;;;fin;°CDS;1568093;;comp
fin;°CDS;63155;;comp;;;&amp;tRNA;712323;3;;;deb;°CDS;1612826;158;
deb;°CDS;168443;122;;;;&amp;tRNA;712402;16;;;;&amp;tRNA;1613773;215;comp
;&amp;tRNA;169459;361;;;;&amp;tRNA;712494;61;;;fin;°CDS;1614079;;comp
fin;°CDS;169896;;comp;;fin;°CDS;712639;;comp;;deb;°CDS;1668440;42;comp
deb;°CDS;181646;89;comp;;deb;°CDS;723480;80;;;;ncRNA;1668962;51;comp
;misc_binding;182746;130;comp;;;&amp;tRNA;724421;134;comp;;fin;°CDS;1669196;;comp
fin;°CDS;183117;;comp;;fin;°CDS;724632;;;;deb;°CDS;1701767;76;
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;misc_binding;185671;146;;;;&amp;tRNA;774880;4;;;fin;°CDS;1702836;;comp
fin;°CDS;186056;;;;;&amp;tRNA;774961;8;;;deb;°CDS;1710214;512;
deb;°CDS;249164;195;;;;&amp;tRNA;775045;9;;;;$rRNA;1711770;228;comp
;&amp;tRNA;249791;51;;;;&amp;tRNA;775129;13;;;;$rRNA;1712115;359;comp
fin;°CDS;249919;;comp;;;&amp;tRNA;775216;111;;;;$rRNA;1715381;391;comp
deb;°CDS;253385;90;;;fin;°CDS;775416;;;;fin;°CDS;1717337;;comp
;misc_binding;254915;84;;;deb;°CDS;796146;73;;;deb;°CDS;1823002;379;comp
fin;°CDS;255255;;;;;&amp;tRNA;796654;159;;;;&amp;tRNA;1823852;6;comp
deb;°CDS;273899;200;comp;;fin;°CDS;796888;;;;;&amp;tRNA;1823934;8;comp
;&amp;tRNA;274627;188;comp;;deb;°CDS;841590;119;;;;&amp;tRNA;1824017;83;comp
fin;°CDS;274892;;;;;&amp;tRNA;842393;2;;;fin;°CDS;1824176;;comp
deb;°CDS;310188;131;;;;&amp;tRNA;842472;8;;;deb;°CDS;1907578;182;comp
;&amp;tRNA;311123;22;;;;&amp;tRNA;842556;9;;;;&amp;tRNA;1909446;53;comp
;&amp;tRNA;311221;5;;;;&amp;tRNA;842640;127;;;;ncRNA;1909590;115;
;&amp;tRNA;311311;3;;;fin;°CDS;842841;;;;deb;°CDS;1909805;136;
;&amp;tRNA;311390;6;;;deb;°CDS;881739;121;;;;&amp;tRNA;1911342;23;
;&amp;tRNA;311472;74;;;;repeat_region;882151;278;;;fin;°CDS;1911453;;
fin;°CDS;311623;;;;fin;°CDS;886449;;;;deb;°CDS;1912058;43;comp
deb;°CDS;359181;58;;;deb;°CDS;889017;71;;;;misc_binding;1913025;130;comp
;regulatory;360286;52;;;;&amp;tRNA;889670;156;;;fin;°CDS;1913387;;
fin;°CDS;360447;;;;fin;°CDS;889903;;;;deb;°CDS;1973889;222;comp
deb;°CDS;378908;485;;;deb;°CDS;905286;58;;;;&amp;tRNA;1974984;39;comp
;$rRNA;380482;251;;;;&amp;tRNA;906136;102;;;fin;°CDS;1975098;;comp
;$rRNA;382298;229;;;fin;°CDS;906313;;;;deb;°CDS;1983694;122;comp
;$rRNA;385434;262;;;deb;°CDS;913707;78;;;;&amp;tRNA;1984782;12;comp
fin;°CDS;385813;;comp;;;regulatory;916065;91;;;;&amp;tRNA;1984869;111;comp
deb;°CDS;414288;246;;;fin;°CDS;916256;;;;;&amp;tRNA;1985054;106;comp
;regulatory;416478;98;;;deb;°CDS;947642;32;;;fin;°CDS;1985234;;comp
fin;°CDS;416689;;;;;ncRNA;948598;38;;;deb;°CDS;2070538;193;
deb;°CDS;460654;266;;;fin;°CDS;948982;;;;;$rRNA;2072279;228;comp
;&amp;tRNA;461553;3;;;deb;°CDS;1017827;92;comp;;;$rRNA;2072624;298;comp
;&amp;tRNA;461631;8;;;;misc_binding;1018936;36;;;;&amp;tRNA;2075828;66;comp
;&amp;tRNA;461714;50;;;fin;°CDS;1019167;;;;;&amp;tRNA;2075970;94;comp
;&amp;tRNA;461840;11;;;deb;°CDS;1020207;137;;;;$rRNA;2076141;265;comp
;&amp;tRNA;461928;8;;;;&amp;tRNA;1022783;2;;;fin;°CDS;2077971;;comp
;&amp;tRNA;462010;145;;;;&amp;tRNA;1022862;1;;;deb;°CDS;2147697;91;
fin;°CDS;462232;;;;;&amp;tRNA;1022938;112;;;;&amp;tRNA;2148343;70;
deb;°CDS;466993;232;;;fin;°CDS;1023124;;;;fin;°CDS;2148489;;comp
;misc_binding;468950;36;;;deb;°CDS;1111497;73;comp;;deb;°CDS;2285667;451;comp
fin;°CDS;469185;;;;;misc_binding;1112790;267;comp;;;&amp;tRNA;2287117;45;comp
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;&amp;tRNA;526984;30;;;deb;°CDS;1305277;298;;;deb;°CDS;2301950;486;comp
;&amp;tRNA;527101;52;;;;regulatory;1306436;70;;;;&amp;tRNA;2303018;45;comp
;&amp;tRNA;527239;268;;;fin;°CDS;1306616;;;;fin;°CDS;2303140;;comp
fin;°CDS;527594;;comp;;deb;°CDS;1328649;26;;;deb;°CDS;2322585;393;comp
deb;°CDS;570200;65;comp;;;tmRNA;1328957;406;;;;&amp;tRNA;2323563;196;comp
;regulatory;571573;209;comp;;fin;°CDS;1329712;;comp;;fin;°CDS;2323833;;
fin;°CDS;571879;;;;deb;°CDS;1403493;52;comp;;;;;;
deb;°CDS;577378;131;;;;misc_binding;1404547;111;comp;;;;;;
;&amp;tRNA;578049;194;;;fin;°CDS;1404901;;comp;;;;;;
fin;°CDS;578318;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====afn intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_tRNA|afn intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;;;105;;105;;21;23;deb;
;;;122;comp’;361;;24;39;&lt;201;20
;;;195;comp’;51;;54;45;total;25
;3 8 50 11 8;;200;comp’;188;;58;70;%;80%
;;;131;;145;;71;83;;
;30 52;;54;comp’;268;;73;93;fin;
;;;131;;194;;76;102;&lt;201;17
;18 3 16;;96;comp’;61;;91;105;total;18
;;comp’;80;comp’;134;;96;106;%;94%
;4 8 9 13;;214;;111;;105;111;;
;;;73;;159;;119;112;total;
;2  8  9;;119;;127;;122;127;&lt;201;37
;;;71;;156;;122;145;total;43
;;;58;;102;;131;156;%;86%
;2  1;;137;;112;;131;159;;
;;;24;comp’;393;;136;194;;
;;;21;;93;;137;196;;
;;comp’;158;;215;;182;215;;
;;;76;comp’;91;;195;;;
;6  8;;379;;83;;200;;;
;;;182;;;;214;;;
;;;136;;23;;222;;;
;;;222;;39;;379;;;
;12  111;;122;;106;;393;;;
;;;91;comp’;70;;451;;comp’;cumuls
;;;451;;45;;80;51;deb;2
;;;393;comp’;196;;158;61;&lt;201;100%
;;;;;;;;91;fin;
;;;;;;;;134;&lt;201;5
;deb;fin;total;;;;;188;total;8
&lt;201;22;22;44;;;;;268;%;63%
total;27;26;53;;;;;361;total;10
taux;81%;85%;83%;;;;;393;&lt;201;70%
&lt;/pre&gt;

====afn par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_par_rapport_au_groupe_de_référence|afn par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;afn;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;11;3;2;;;;16;
16;moyen;5;12;;;;4;21;
14;fort;4;19;;;;;23;
; ;20;34;2;;;4;60;
10;g+cga;6;2;2;;;;10;
2;agg+cgg;2;;;;;;2;
4;carre ccc;3;1;;;;;4;
5;autres;;;;;;;;
;;11;3;2;;;;16;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;afn;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;183;50;33;;;;267;26
16;moyen;83;200;0;;;67;350;324
14;fort;67;317;0;;;;383;650
; ;333;567;33;;;67;60;729
10;g+cgg;100;33;33;;;;167;10
2;agg+cga;33;;;;;;33;
4;carre ccc;50;17;;;;;67;16
5;autres;;;;;;;;
;;183;50;33;;;;267;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;afn;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;196;54;36;286;26;55;9;
16;moyen;89;214;;304;324;25;35;
14;fort;71;339;;411;650;20;56;
; ;357;607;36;56;729;20;34;
10;g+cgg;107;36;36;179;10;55;;
2;agg+cga;36;;;36;;18;;
4;carre ccc;54;18;;71;16;27;;
5;autres;;;;;;;;
;;196;54;36;286;;11;;
&lt;/pre&gt;
===negativicutes, estimation des -rRNAs===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#negativicutes,_estimation_des_-rRNAs|negativicutes, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
negativicutes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
9 génomes total avec rRNA;;;;nega;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;nega;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;9;149; ; ;;indices;;;;9;1656;0;0;;neg1;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;56
atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;11;tct;;tat;;atgf;33;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;6;tcc;2;tac;4;tgc;2;;ttc;67;tcc;22;tac;44;tgc;22;;ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;2
atc;18;acc;;aac;11;agc;3;;atc;200;acc;;aac;122;agc;33;;atc;;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;2;ccc;;cac;5;cgt;6;;ctc;22;ccc;;cac;56;cgt;67;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;;gcc;;gac;7;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;78;ggc;33;;gtc;1;gcc;1;gac;3;ggc;4
tta;4;tca;1;taa;;tga;;;tta;44;tca;11;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;5;aaa;5;aga;;;ata;;aca;56;aaa;56;aga;;;ata;;aca;1;aaa;2;aga;1
cta;1;cca;2;caa;6;cga;;;cta;11;cca;22;caa;67;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;
gta;7;gca;21;gaa;6;gga;4;;gta;78;gca;233;gaa;67;gga;44;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;1
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;6;;ttg;22;tcg;;tag;;tgg;67;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;2;agg;;;atgj;11;acg;11;aag;22;agg;;;atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;22;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;2;ccg;1;cag;2;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
;;69;;75;;5;149;;;;767;;833;;56;1656;;;;16;;24;;16;56
11.1.21 Paris;;;;nega;total;ttt;tgt;;22.1.21 Paris;;;;nega;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;143;6935;0;0;;indices;;;;9;571;;;;neg1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;5600
atgi;78;tct;;tat;;atgf;133;;atgi;89;tct;;tat;;atgf;167;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;100
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;122;tcc;89;tac;133;tgc;122;;ttc;189;tcc;111;tac;178;tgc;144;;ttc;200;tcc;100;tac;100;tgc;200
atc;-11;acc;122;aac;167;agc;89;;atc;189;acc;122;aac;289;agc;122;;atc;;acc;100;aac;200;agc;100
ctc;100;ccc;78;cac;56;cgt;111;;ctc;122;ccc;78;cac;111;cgt;178;;ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100
gtc;89;gcc;78;gac;189;ggc;333;;gtc;89;gcc;78;gac;267;ggc;367;;gtc;100;gcc;100;gac;300;ggc;400
tta;78;tca;100;taa;;tga;11;;tta;122;tca;111;taa;;tga;11;;tta;100;tca;100;taa;;tga;
ata;;aca;89;aaa;167;aga;100;;ata;;aca;144;aaa;222;aga;100;;ata;;aca;100;aaa;200;aga;100
cta;89;cca;100;caa;78;cga;22;;cta;100;cca;122;caa;144;cga;22;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;
gta;189;gca;0;gaa;211;gga;67;;gta;267;gca;233;gaa;278;gga;111;;gta;200;gca;;gaa;200;gga;100
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;78;;ttg;122;tcg;100;tag;;tgg;144;;ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100
atgj;122;acg;89;aag;89;agg;100;;atgj;133;acg;100;aag;111;agg;100;;atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100
ctg;89;ccg;78;cag;122;cgg;100;;ctg;111;ccg;78;cag;122;cgg;100;;ctg;200;ccg;100;cag;200;cgg;100
gtg;44;gcg;56;gag;56;ggg;89;;gtg;44;gcg;56;gag;56;ggg;89;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100
;;1300;;2089;;1300;4689;;;;2067;;2922;;1356;6344;;;;1600;;2400;;1600;5600
rapports;;63;;71;;96;74;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;neg1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;88;tct;;tat;;atgf;80;;fiches;50.667;;;fréquences;;;;;atgi;22;tct;;tat;;atgf;25
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;456;;;0/0;2;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;avec;152;;;10;11;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;9;;;20;13;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;65;tcc;80;tac;75;tgc;85;;;;;;30;9;;;;ttc;39;tcc;11;tac;25;tgc;39
atc;-6;acc;100;aac;58;agc;73;;neg1;56;;;40;5;;;;atc;100;acc;18;aac;17;agc;11
ctc;82;ccc;100;cac;50;cgt;63;;sans;56;;;50;3;41;;;ctc;0;ccc;22;cac;44;cgt;10
gtc;100;gcc;100;gac;71;ggc;91;;avec;4;;;60;2;;;;gtc;11;gcc;22;gac;37;ggc;17
tta;64;tca;90;taa;;tga;100;;genom;1;;;70;0;;;;tta;22;tca;0;taa;;tga;100
ata;;aca;62;aaa;75;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;;aca;11;aaa;17;aga;0
cta;89;cca;82;caa;54;cga;100;;L’estimation par nega;;;;90;0;;;;cta;11;cca;0;caa;22;cga;100
gta;71;gca;0;gaa;76;gga;60;;est  10% au dessus;;;;100;3;;;;gta;6;gca;;gaa;5;gga;33
ttg;82;tcg;100;tag;;tgg;54;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;0;tcg;0;tag;;tgg;22
atgj;92;acg;89;aag;80;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;18;acg;11;aag;11;agg;0
ctg;80;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;56;ccg;22;cag;39;cgg;0
gtg;;gcg;;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;56;gcg;44;gag;44;ggg;11
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;275;;263;;294;832
&lt;/pre&gt;

===clostridia synthèse===
====clostridia distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#clostridia_distribution_par_génome|clostridia distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
psor;12;5;4;72;;7;;4;104
cdc;4;4;2;70;;3;;;83
cdc8;4;5;2;89;;4;;4;108
cbc*;36;10;;0;;0;;6;52
cbn;52;12;2;6;3;4;;7;86
cle;40;19;;26;3;9;;8;105
hmo;37;12;;39;;11;;10;109
cbei;63;11;3;0;;4;;12;93
;;;;;;;;;
total;248;78;13;302;6;42;0;51;740
&lt;/pre&gt;

====clostridia distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#clostridia_distribution_du_total|clostridia distribution du total]]
&lt;pre&gt;
clos8;;;;;;;628;;;;;;;;;57;;;;;;;;;55
atgi;10;tct;;tat;;atgf;22;;atgi;8;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;3;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;19;tcc;7;tac;23;tgc;16;;ttc;6;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2
atc;3;acc;9;aac;22;agc;13;;atc;1;acc;1;aac;7;agc;1;;atc;11;acc;;aac;5;agc;
ctc;3;ccc;4;cac;16;cgt;11;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;4;gcc;1;gac;32;ggc;20;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;4;;gtc;;gcc;5;gac;;ggc;
tta;22;tca;19;taa;;tga;3;;tta;4;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;
ata;1;aca;30;aaa;31;aga;24;;ata;;aca;;aaa;6;aga;1;;ata;;aca;3;aaa;;aga;
cta;19;cca;25;caa;22;cga;4;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;41;gca;;gaa;36;gga;29;;gta;;gca;5;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;26;gaa;;gga;5
ttg;9;tcg;2;tag;;tgg;11;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;23;acg;4;aag;6;agg;6;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;6;ccg;2;cag;4;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;4;ggg;3;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos8;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos8;dupli;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;248;78;13;302;6;42;740;;;;;;51;6;;57;;total;8;;13;;;42;55
;;;;;;;;;;;;;1-3aas;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====clostridia distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#clostridia_distribution_par_type|clostridia distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
clos8;;;;;;;628;;clos8;1208;;;;;;78;;clos8;;;;;;;240;;clos8;;;;;;;8;;clos8;;;;;;;302
atgi;10;tct;0;tat;0;atgf;22;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;8;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;9;tct;;tat;;atgf;11
att;0;act;0;aat;0;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;3;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;19;tcc;7;tac;23;tgc;16;;ttc;1;tcc;6;tac;;tgc;1;;ttc;6;tcc;;tac;10;tgc;3;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2;;ttc;12;tcc;1;tac;13;tgc;10
atc;3;acc;9;aac;22;agc;13;;atc;;acc;3;aac;1;agc;3;;atc;;acc;3;aac;5;agc;5;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;3;acc;3;aac;16;agc;5
ctc;3;ccc;4;cac;16;cgt;11;;ctc;2;ccc;1;cac;;cgt;1;;ctc;1;ccc;1;cac;8;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;2;cac;8;cgt;7
gtc;4;gcc;1;gac;32;ggc;20;;gtc;;gcc;1;gac;;ggc;;;gtc;2;gcc;;gac;15;ggc;11;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;2;gcc;;gac;17;ggc;9
tta;22;tca;19;taa;0;tga;3;;tta;;tca;1;taa;;tga;3;;tta;11;tca;6;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;11;tca;10;taa;;tga;
ata;1;aca;30;aaa;31;aga;24;;ata;1;aca;2;aaa;;aga;;;ata;;aca;15;aaa;14;aga;10;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;13;aaa;17;aga;14
cta;19;cca;25;caa;22;cga;4;;cta;5;cca;4;caa;;cga;1;;cta;6;cca;10;caa;8;cga;3;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;8;cca;11;caa;14;cga;
gta;41;gca;0;gaa;36;gga;29;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;20;gca;;gaa;17;gga;13;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;21;gca;;gaa;19;gga;15
ttg;9;tcg;2;tag;0;tgg;11;;ttg;8;tcg;2;tag;;tgg;5;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;4
atgj;23;acg;4;aag;6;agg;6;;atgj;;acg;4;aag;1;agg;5;;atgj;10;acg;;aag;5;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;13;acg;;aag;;agg;
ctg;6;ccg;2;cag;4;cgg;1;;ctg;3;ccg;1;cag;3;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;2;ccg;1;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;4;ggg;3;;gtg;;gcg;1;gag;3;ggg;;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;3;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;248;78;13;302;6;42;740;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;*;;;
&lt;/pre&gt;

====clostridia par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#clostridia_par_rapport_au_groupe_de_référence|clostridia par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;clos8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;31;19;2;6;2;5;65;
16;moyen;36;66;4;101;20;42;269;
14;fort;11;155;2;195;29;14;406;
; ;78;240;8;302;51;61;740;
10;g+cga;16;13;;2;;;31;
2;agg+cgg;5;2;;;1;;8;
4;carre ccc;4;4;;4;1;5;13;
5;autres;6;;2;;;;8;
;;31;19;2;6;2;5;65;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;clos8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;42;26;3;8;3;7;88;26
16;moyen;49;89;5;136;27;57;364;324
14;fort;15;209;3;264;39;19;549;650
; ;105;324;11;408;69;82;740;729
10;g+cga;22;18;;3;;;42;10
2;agg+cgg;7;3;;;1;;11;
4;carre ccc;5;5;;5;1;7;18;16
5;autres;8;0;3;0;;;11;
;;42;26;3;8;3;7;88;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;clos8;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;95;58;6;160;26;40;8;
16;moyen;110;202;12;325;324;46;28;
14;fort;34;475;6;515;650;14;65;
; ;239;736;25;326;729;78;240;
10;g+cga;49;40;;89;10;52;;
2;agg+cgg;15;6;;21;;16;;
4;carre ccc;12;12;;25;16;13;;
5;autres;18;;6;25;;19;;
;;95;58;6;160;;31;;
&lt;/pre&gt;
====clostridia, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#clostridia,_estimation_des_-rRNAs|clostridia, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
clostridia;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
43 génomes total avec rRNA;;;;clos;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;clos;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;sans +16s;;;43;856; ; ;;indices;;;;43;1991;;;;clos8;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;326
atgi;29;tct;;tat;;atgf;30;;atgi;67;tct;;tat;;atgf;70;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;11
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;1
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;3;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;44;tcc;1;tac;26;tgc;16;;ttc;102;tcc;2.3;tac;60;tgc;37;;ttc;7;tcc;6;tac;10;tgc;6
atc;72;acc;10;aac;64;agc;11;;atc;167;acc;23;aac;149;agc;26;;atc;;acc;6;aac;6;agc;8
ctc;2;ccc;3;cac;12;cgt;8;;ctc;4.7;ccc;7.0;cac;28;cgt;19;;ctc;3;ccc;2;cac;8;cgt;4
gtc;4;gcc;12;gac;40;ggc;23;;gtc;9.3;gcc;28;gac;93;ggc;53;;gtc;2;gcc;1;gac;15;ggc;11
tta;19;tca;13;taa;;tga;;;tta;44;tca;30;taa;;tga;;;tta;11;tca;9;taa;;tga;3
ata;;aca;29;aaa;48;aga;21;;ata;;aca;67;aaa;112;aga;49;;ata;1;aca;17;aaa;14;aga;10
cta;18;cca;17;caa;25;cga;1;;cta;42;cca;40;caa;58;cga;2.3;;cta;11;cca;14;caa;8;cga;4
gta;38;gca;92;gaa;45;gga;31;;gta;88;gca;214;gaa;105;gga;72;;gta;20;gca;;gaa;17;gga;14
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;9;;ttg;;tcg;2.3;tag;;tgg;21;;ttg;9;tcg;2;tag;;tgg;7
atgj;18;acg;3;aag;2;agg;1;;atgj;42;acg;7.0;aag;4.7;agg;2.3;;atgj;10;acg;4;aag;6;agg;6
ctg;5;ccg;2;cag;1;cgg;3;;ctg;12;ccg;4.7;cag;2.3;cgg;7.0;;ctg;4;ccg;1;cag;4;cgg;1
gtg;1;gcg;;gag;4;ggg;2;;gtg;2.3;gcg;;gag;9.3;ggg;4.7;;gtg;1;gcg;1;gag;3;ggg;3
;;346;;468;;42;856;;;;805;;1088;;98;1991;;;;107;;168;;51;326
27.5.20 Tanger;;;;clos;total;ttt;tgt;;27.5.20 Tanger;;;;clos8;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;11144;4.0;0.6;;indices;sans +16s;;;174;11144;4.0;0.6;;clos8;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;92;tct;1.1;tat;;atgf;117;;atgi;159;tct;1.1;tat;;atgf;187;;atgi;13;tct;;tat;;atgf;138
att;1.1;act;;aat;;agt;0.6;;att;1.1;act;;aat;;agt;0.6;;att;;act;;aat;;agt;13
ctt;15.5;cct;2.3;cat;;cgc;;;ctt;15.5;cct;2.3;cat;;cgc;;;ctt;38;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.6;gct;;gat;;ggt;;;gtt;0.6;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;104;tcc;101;tac;127;tgc;114;;ttc;206;tcc;103;tac;187;tgc;151;;ttc;88;tcc;75;tac;125;tgc;75
atc;-15;acc;79;aac;99;agc;107;;atc;152;acc;102;aac;248;agc;133;;atc;;acc;75;aac;75;agc;100
ctc;76;ccc;55;cac;112;cgt;97;;ctc;81;ccc;62;cac;140;cgt;116;;ctc;38;ccc;25;cac;100;cgt;50
gtc;44;gcc;33;gac;149;ggc;167;;gtc;53;gcc;61;gac;242;ggc;220;;gtc;25;gcc;13;gac;188;ggc;138
tta;128;tca;112;taa;1.1;tga;55;;tta;172;tca;142;taa;1.1;tga;55;;tta;138;tca;113;taa;;tga;38
ata;2.9;aca;151;aaa;159;aga;125;;ata;2.9;aca;218;aaa;271;aga;174;;ata;13;aca;213;aaa;175;aga;125
cta;106;cca;123;caa;98;cga;46;;cta;148;cca;163;caa;156;cga;48;;cta;138;cca;175;caa;100;cga;50
gta;198;gca;5;gaa;134;gga;171;;gta;286;gca;219;gaa;239;gga;243;;gta;250;gca;;gaa;213;gga;175
ttg;108;tcg;81;tag;2.3;tgg;99;;ttg;108;tcg;83;tag;2.3;tgg;120;;ttg;113;tcg;25;tag;;tgg;88
atgj;90;acg;70;aag;115;agg;94;;atgj;132;acg;77;aag;120;agg;96;;atgj;125;acg;50;aag;75;agg;75
ctg;64;ccg;59;cag;75;cgg;53;;ctg;76;ccg;64;cag;77;cgg;60;;ctg;50;ccg;13;cag;50;cgg;13
gtg;32;gcg;35;gag;74;ggg;65;;gtg;34;gcg;35;gag;83;ggg;70;;gtg;13;gcg;13;gag;38;ggg;38
;;1426;;1894;;1080;4400;;;;2231;;2982;;1177;6390;;;;1325;;2100;;638;4063
rapports;;64;;64;;92;69;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;clos8;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;58;tct;;tat;;atgf;63;;fiches;47.674;;;fréquences;;;;;atgi;86;tct;100;tat;;atgf;15
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;2050;;;0/0;;;;;att;100;act;;aat;;agt;95
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;888;;;10;11;;;;ctt;59;cct;100;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;43;;;20;6;;;;gtt;100;gct;;gat;;ggt;
ttc;50;tcc;98;tac;68;tgc;75;;;;;;30;10;;;;ttc;16;tcc;26;tac;1;tgc;34
atc;-10;acc;77;aac;40;agc;81;;clos8;40.75;;;40;5;;;;atc;100;acc;5;aac;24;agc;7
ctc;94;ccc;89;cac;80;cgt;84;;sans;326;;;50;4;36;;;ctc;51;ccc;55;cac;11;cgt;49
gtc;82;gcc;54;gac;62;ggc;76;;avec;752;;;60;3;;;;gtc;43;gcc;62;gac;21;ggc;17
tta;74;tca;79;taa;;tga;100;;genom;8;;;70;4;;;;tta;7;tca;1;taa;100;tga;32
ata;100;aca;69;aaa;59;aga;72;;;;;;80;3;;;;ata;77;aca;29;aaa;9;aga;0
cta;72;cca;75.7;caa;63;cga;95;;L’estimation par clos8;;;;90;1;;;;cta;23;cca;29;caa;2;cga;9
gta;69;gca;2;gaa;56;gga;70;;est  15 % en dessous;;;;100;2;;;;gta;21;gca;100;gaa;37;gga;2
ttg;100;tcg;97;tag;;tgg;83;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;4;tcg;69;tag;100;tgg;12
atgj;68;acg;91;aag;96;agg;98;;43;;100;;;49;;;;atgj;28;acg;29;aag;35;agg;20
ctg;85;ccg;93;cag;97;cgg;88;;atc;59;152;;;;;;;ctg;22;ccg;79;cag;33;cgg;76
gtg;93;gcg;100;gag;89;ggg;93;;gca;73;219;;;;;;;gtg;61;gcg;64;gag;49;ggg;43
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;265;;272;;944;1481
&lt;/pre&gt;

==gamma==
===Shewanella===
====spl opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_opérons|spl opérons]]
&lt;pre&gt;
39.1%GC;30.6.19 Paris;16s  11;147;doubles;intercalaires
;Shewanella pealeana;;;;
;45136..46685;;16s;@1;339
;47025..49946;;23s;;112
;50059..50174;;5s;;
;;;;;
;51490..53039;;16s;;339
;53379..56298;;23s;;114
;56413..56528;;5s;;
;;;;;
;182271..183820;;16s;@2;71
;183892..183968;;atc;;65
;184034..184109;;gca;;364
;184474..187395;;23s;;112
;187508..187623;;5s;;100
;187724..187800;;gac;;
;;;;;
;191614..191689;;aca;;8
;191698..191782;;tac;;35
;191818..191891;;gga;;
;;;;;
;235182..236731;;16s;;374
;237106..240025;;23s;;114
;240140..240255;;5s;;
;;;;;
;243631..245180;;16s;;338
;245519..248440;;23s;;113
;248554..248669;;5s;;68
;248738..248813;;acc;;17
;248831..248946;;5s;;
;;;;;
;416766..416842;;cgg;;39
;416882..416957;;cac;;41
;416999..417075;;cca;+;58
;417134..417210;;cca;2 cca;
;;;;;
;493711..495260;;16s;;339
;495600..498519;;23s;;114
;498634..498749;;5s;;
;;;;;
;641376..641466;;tca;@3;1172
;642639..642729;;tca;;
;;;;;
;645847..647396;;16s;;71
;647468..647544;;atc;;65
;647610..647685;;gca;;329
;648015..650937;;23s;;156
;651094..651209;;5s;;
;;;;;
;728115..728199;;ttg;;
;;;;;
comp;1168942..1169018;;atgi;;
;;;;;
comp;1339706..1339781;;aca;+;52
comp;1339834..1339909;;ttc;2 ttc;539
comp;1340449..1340524;;aca;2 aca;52
comp;1340577..1340652;;ttc;;
;;;;;
comp;1342467..1342542;;aca;;52
comp;1342595..1342670;;ttc;;
;;;;;
;1456724..1456815;;agc;;21
;1456837..1456913;;cgt;+;30
;1456944..1457020;;cgt;7 cgt;32
;1457053..1457129;;cgt;3 agc;30
;1457160..1457236;;cgt;;33
;1457270..1457346;;cgt;;9
;1457356..1457447;;agc;;76
;1457524..1457600;;cgt;;35
;1457636..1457712;;cgt;;9
;1457722..1457813;;agc;;
;;;;;
comp;1627363..1627438;;agg;;
;;;;;
comp;1770483..1770558;;gta;+;37
comp;1770596..1770671;;gta;11 gta;37
comp;1770709..1770784;;gta;;37
comp;1770822..1770897;;gta;;37
comp;1770935..1771010;;gta;;37
comp;1771048..1771123;;gta;;37
comp;1771161..1771236;;gta;;37
comp;1771274..1771349;;gta;;37
comp;1771387..1771462;;gta;;37
comp;1771500..1771575;;gta;;39
comp;1771615..1771690;;gta;;
;;;;;
;1773910..1773985;;gcc;+;80
;1774066..1774141;;gaa;13 gaa;102
;1774244..1774319;;gaa;2 gcc;102
;1774422..1774497;;gaa;;102
;1774600..1774675;;gaa;;102
;1774778..1774853;;gaa;;102
;1774956..1775031;;gaa;;102
;1775134..1775209;;gaa;;102
;1775312..1775387;;gaa;;253
;1775641..1775716;;gaa;;102
;1775819..1775894;;gaa;;102
;1775997..1776072;;gaa;;102
;1776175..1776250;;gaa;;102
;1776353..1776428;;gaa;;47
;1776476..1776551;;gcc;;
;;;;;
;2081297..2082846;;16s;;338
;2083185..2086104;;23s;;114
;2086219..2086334;;5s;;
;;;;;
comp;2143274..2143350;;ccc;;
;;;;;
comp;2366164..2366240;;atgf;+;40
comp;2366281..2366357;;atgf;4 atgf;40
comp;2366398..2366474;;atgf;;40
comp;2366515..2366591;;atgf;;
;;;;;
;2376218..2376308;;tca;;
;;;;;
;2379767..2379842;;ggc;;13
;2379856..2379929;;tgc;;85
;2380015..2380100;;tta;;
;;;;;
;2550857..2550932;;ggc;;13
;2550946..2551019;;tgc;+;95
;2551115..2551200;;tta;3 tgc;634
;2551835..2551908;;tgc;3 tta;95
;2552004..2552089;;tta;;479
;2552569..2552642;;tgc;;132
;2552775..2552860;;tta;;
;;;;;
;2558019..2558109;;tca;;
;;;;;
comp;2717566..2717655;;tcc;;
;;;;;
comp;2759730..2759806;;atgf;+;189
comp;2759996..2760072;;atgf;4 atgf;45
comp;2760118..2760194;;gtc;2 gtc;2
comp;2760197..2760273;;atgf;;35
comp;2760309..2760385;;gtc;;13
comp;2760399..2760475;;atgf;;
;;;;;
;2858823..2858907;;tac;+;30
;2858938..2859022;;tac;5 tac;85
;2859108..2859192;;tac;;107
;2859300..2859384;;tac;;107
;2859492..2859576;;tac;;
;;;;;
;2866268..2866343;;aac;+;45
;2866389..2866464;;aac;7aac;41
;2866506..2866581;;aac;;26
;2866608..2866683;;aac;;32
;2866716..2866791;;aac;;33
;2866825..2866900;;aac;;40
;2866941..2867016;;aac;;
;;;;;
comp;2929429..2929505;;gac;+;97
comp;2929603..2929679;;gac;4 gac;97
comp;2929777..2929853;;gac;;83
comp;2929937..2930013;;gac;;
;;;;;
comp;3120289..3120364;;aaa;+;58
comp;3120423..3120498;;aaa;12 aaa;58
comp;3120557..3120632;;aaa;;58
comp;3120691..3120766;;aaa;;59
comp;3120826..3120901;;aaa;;57
comp;3120959..3121034;;aaa;;58
comp;3121093..3121168;;aaa;;58
comp;3121227..3121302;;aaa;;59
comp;3121362..3121437;;aaa;;58
comp;3121496..3121571;;aaa;;59
comp;3121631..3121706;;aaa;;59
comp;3121766..3121841;;aaa;;
;;;;;
comp;3269860..3269935;;cac;;8
comp;3269944..3270020;;aga;;63
comp;3270084..3270160;;cca;;
;;;;;
comp;3757983..3758059;;atgf;;
comp;3758163..3758249;;ctc;;
;;;;;
comp;3835257..3835331;;caa;+;51
comp;3835383..3835467;;cta;5 caa;131
comp;3835599..3835673;;caa;5 cta;20
comp;3835694..3835778;;cta;3 atg;96
comp;3835875..3835949;;caa;;49
comp;3835999..3836083;;cta;;211
comp;3836295..3836371;;atg;;5
comp;3836377..3836451;;caa;;47
comp;3836499..3836583;;cta;;55
comp;3836639..3836715;;atg;;5
comp;3836721..3836795;;caa;;47
comp;3836843..3836927;;cta;;55
comp;3836983..3837059;;atg;;
;;;;;
comp;3862885..3862961;;tgg;+;167
comp;3863129..3863205;;tgg;2 tgg;
;;;;;
comp;3867049..3867164;;5s;;114
comp;3867279..3870198;;23s;;338
comp;3870537..3872086;;16s;;
;;;;;
;3882154..3882229;;ttc;;
;;;;;
comp;4331488..4331563;;ggc;+;130
comp;4331694..4331769;;ggc;6 ggc;47
comp;4331817..4331892;;ggc;;162
comp;4332055..4332130;;ggc;;16
comp;4332147..4332222;;ggc;;48
comp;4332271..4332346;;ggc;;
;;;;;
comp;4616881..4616996;;5s;;112
comp;4617109..4620030;;23s;;364
comp;4620395..4620470;;gca;;65
comp;4620536..4620612;;atc;;71
comp;4620684..4622233;;16s;;
;;;;;
comp;5129770..5129846;;gac;;100
comp;5129947..5130062;;5s;;115
comp;5130178..5133097;;23s; ;339
comp;5133437..5134986;;16s;;
&lt;/pre&gt;
====spl cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_cumuls|spl cumuls]]
&lt;pre&gt;
spl cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;11;1;0;;1;;1;;100;
;16 23 5s 0;6;20;12;;50;;20;;200;
;16 atc gca;3;40;27;;100;;40;;300;
;16 23 5s a;2;60;28;;150;;60;;400;
;max a;3;80;3;;200;;80;;500;
;a doubles;0;100;8;;250;;100;;600;
;spéciaux;0;120;13;;300;;120;;700;
;total aas;9;140;3;;350;;140;;800;
sans ;opérons;29;160;0;;400;;160;;900;
;1 aa;8;180;2;;450;;180;;1000;
;max a;15;200;1;;500;;200;;1100;
;a doubles;15;;6;;;;;;;
;total aas;133;;103;;;0;;0;;0
total aas;;142;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;88;;;;;;;
;;;variance;143;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;58;;;;;;;
;;;variance;35;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====spl blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_blocs|spl blocs]]
&lt;pre&gt;
spl blocs;;;;;;;
16s;339;339;374;339;338;338;
23s;112;114;114;114;114;114;
5s;;;;;;;
;;;;;;;
16s;71;71;71;16s;338;16s;339
atc;65;65;65;23s;113;23s;115
gca;364;329;364;5s;68;5s;100
23s;112;156;112;acc;17;gac;
5s;100;;;5s;;;
gac;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====spl distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_distribution|spl distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;6;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;spl;att;;act;;aat;;agt;;spl;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;après 5s;ctt;;cct;;cat;;cgc;;gta11;ctt;;cct;;cat;;cgc;;gta11;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;acc;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tca2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tca2;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;;2 gac;ttc;3;tcc;;tac;;tgc;4;cca2;ttc;;tcc;;tac;5;tgc;;cca2;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;3;tac5;atc;;acc;;aac;7;agc;;tac5;atc;;acc;1;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;2;cgt;;aac7;ctc;;ccc;;cac;;cgt;7;aac7;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;séquences;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;;gac4 ;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;8;gac4 ;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;2;taa;;tga;;(aca ttc)2;tta;4;tca;;taa;;tga;;aaa12;tta;;tca;2;taa;;tga;;aaa12;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;(tgc tta)3;ata;;aca;4;aaa;;aga;1;gaa13;ata;;aca;;aaa;12;aga;;gaa13;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;(atf gtc)2;cta;5;cca;1;caa;5;cga;;atgf4+2;cta;;cca;2;caa;;cga;;atgf4+2;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;(caa cta atgj)3 ;gta;;gca;;gaa;;gga;1;cgt5+2;gta;11;gca;;gaa;13;gga;;cgt5+2;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;ou;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc8;ttg;;tcg;;tag;;tgg;2;ggc8;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;;aag;;agg;1;(caa cta)5;atgj;3;acg;;aag;;agg;;tgg2;atgj;;acg;;aag;;agg;;tgg2;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
spl;;8;;;;;8;;spl;46;;;;;;46;;spl;79;;;;;;79;;spl;;;;3;;;3
&lt;/pre&gt;
====spl données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_données_intercalaires|spl données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa
fxt;fct;spl;fx;fc;spl;fx40;fc40;spl;x-;c-;c;x;c;x;;c;x;;c;x;
1;0;0;1;17;0;1;17;-1;;126;606;234;16s 23s;;;tRNA tRNA;;suite;tRNA tRNA;;suite
;0;10;8;284;1;0;46;-2;2;0;195;236;4* 349;;;37;;gta;45;;aac
;0;20;19;193;2;0;53;-3;;0;155;320;384;;;37;;gta;41;;aac
;0;30;13;120;3;1;29;-4;5;136;789;-23;3* 348;;;37;;gta;26;;aac
1;0;40;29;86;4;0;22;-5;;0;695;286;5s CDS;;;37;;gta;32;;aac
;0;50;17;74;5;1;16;-6;;0;220;330;703;339;;37;;gta;33;;aac
;0;60;39;80;6;2;13;-7;;10;441;117;727;454;;37;;gta;40;;aac
;0;70;50;72;7;2;14;-8;2;46;913;500;;768;;37;;gta;**;;aac
;0;80;68;100;8;1;29;-9;;0;1058;545;;304;;37;;gta;97;;gac
;1;90;53;92;9;1;29;-10;;8;581;34;;454;;37;;gta;97;;gac
1;0;100;56;90;10;0;33;-11;;28;176;705;;798;;39;;gta;83;;gac
;1;110;38;64;11;2;27;-12;;0;257;977;16s tRNA;;;**;;gta;**;;gac
1;2;120;54;73;12;1;35;-13;;5;104;136;3* 74;;atc;80;;gcc;58;;aaa
;1;130;44;84;13;3;20;-14;;15;134;383;tRNA 23s;;;102;;gaa;58;;aaa
1;1;140;26;56;14;1;29;-15;1;0;455;254;371;;gca;102;;gaa;58;;aaa
;0;150;27;51;15;5;15;-16;;3;216;545;336;;gca;102;;gaa;59;;aaa
;4;160;30;52;16;0;10;-17;1;8;152;184;371;;gca;102;;gaa;57;;aaa
;1;170;31;49;17;3;13;-18;;0;530;98;5s tRNA;;;102;;gaa;58;;aaa
;3;180;36;53;18;2;20;-19;;1;595;291;100;;gac;102;;gaa;58;;aaa
2;1;190;24;43;19;1;14;-20;;7;89;1011;68;;acc;102;;gaa;59;;aaa
;3;200;34;36;20;1;10;-21;;0;178;465;100;;gac;253;;gaa;58;;aaa
;0;210;24;37;21;2;12;-22;;0;192;289;tRNA 5s;;;102;;gaa;59;;aaa
;2;220;25;39;22;1;12;-23;;4;353;187;17;;acc;102;;gaa;59;;aaa
;0;230;25;33;23;0;13;-24;;0;315;;tRNA tRNA;;intra;102;;gaa;**;;aaa
2;0;240;27;32;24;4;19;-25;;0;187;;3* 65;;atc gca;102;;gaa;8;;cac
;0;250;23;25;25;3;3;-26;;2;572;;tRNA tRNA;;;47;;gaa;63;;aga
1;2;260;22;30;26;0;9;-27;;0;124;;8;;aca;**;;gcc;**;;cca
;0;270;23;31;27;2;21;-28;;1;830;;35;;tac;40;;atgf;103;;atgf
;0;280;24;23;28;0;9;-29;;2;193;;**;;gga;40;;atgf;**;;ctc
2;0;290;27;29;29;1;11;-30;;0;255;;39;;cgg;40;;atgf;51;;caa
1;0;300;21;23;30;0;11;-31;;0;157;;41;;cac;**;;atgf;131;;cta
;0;310;18;18;31;3;17;-32;;3;114;;58;;cca;13;;ggc;20;;caa
1;1;320;16;19;32;4;9;-33;;0;162;;**;;cca;85;;tgc;96;;cta
1;0;330;11;18;33;3;8;-34;;1;495;;1172;;tca;**;;tta;49;;caa
;0;340;16;20;34;5;9;-35;;0;180;;**;;tca;13;;ggc;211;;cta
;0;350;13;17;35;2;8;-36;;0;160;;52;;aca;95;;tgc;5;;atgj
;1;360;14;16;36;1;6;-37;;0;663;;539;;ttc;634;;tta;47;;caa
;0;370;15;22;37;4;6;-38;;1;113;;52;;aca;95;;tgc;55;;cta
;0;380;10;9;38;5;10;-39;;0;427;;**;;ttc;479;;tta;5;;atgj
1;0;390;14;10;39;1;7;-40;;0;CDS 16s ;;52;;aca;132;;tgc;47;;caa
;0;400;10;9;40;1;6;-41;;1;647;614;**;;ttc;**;;tta;55;;cta
7;15;reste;230;253;reste;1235;1782;-42;;0;988;687;21;;agc;128;;cat;**;;atgj
23;39;total;1305;2482;total;1305;2482;-43;;1;876;1908;30;;cgt;128;;cat;167;;tgg
15;24;diagr;1074;2212;diagr;69;683;-44;;0;206;1178;32;;cgt;189;;atgf;**;;tgg
0;0; t30;40;597;;;;-45;;0;611;807;30;;cgt;45;;atgf;20;;ggc
;;;;;;;;-46;;0;5s 16s;;33;;cgt;2;;gtc;13;;ggt
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;1319;;9;;cgt;35;;atgf;47;;ggc
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;23s 5s;;76;;agc;13;;gtc;47;;ggc
;x;1304;12;1;1317;;;-49;;0;8* 132;;35;;cgt;**;;atgf;15;;ggt
;c;2465;414;17;2896;;;-50;;0;2* 133;;9;;cgt;30;;tac;16;;ggc
;;;;;4213;253;;reste;1;5;177;;**;;agc;85;;tac;48;;ggc
;;;;;;4466;;total;12;414;;;;;;107;;tac;**;;ggc
;;;;;;;;;;;;;;;;107;;tac;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;tac;;;
&lt;/pre&gt;
=====spl autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_autres_intercalaires_aas|spl autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;spl;;;;;
deb fin;comp;gene;adress1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;43968;44525;614;*;
;;rRNA;45140;46682;349;*;16s
;;rRNA;47032;49926;132;*;23s
;;rRNA;50059;50174;1319;*;5s
;;rRNA;51494;53036;349;*;16s
;;rRNA;53386;56280;132;*;23s
;;rRNA;56413;56528;339;*;5s
fin;comp;CDS;56868;57011;;;
deb;comp;CDS;146328;146498;-16;*;
;comp;regulatory;146483;146744;188;*;
fin;;CDS;146933;149083;;;
deb;comp;CDS;181132;181587;687;*;
;;rRNA;182275;183817;74;*;16s
;;tRNA;183892;183968;65;*;atc
;;tRNA;184034;184109;371;*;gca
;;rRNA;184481;187375;132;*;23s
;;rRNA;187508;187623;100;*;5s
;;tRNA;187724;187800;606;*;gac
fin;;CDS;188407;189432;;;
deb;comp;CDS;190429;191379;234;*;
;;tRNA;191614;191689;8;*;aca
;;tRNA;191698;191782;35;*;tac
;;tRNA;191818;191891;195;*;gga
fin;;CDS;192087;193271;;;
deb;;CDS;233942;234538;647;*;
;;rRNA;235186;236728;384;*;16s
;;rRNA;237113;240007;132;*;23s
;;rRNA;240140;240255;454;*;5s
deb;comp;CDS;240710;241726;1908;*;
;;rRNA;243635;245177;348;*;16s
;;rRNA;245526;248420;133;*;23s
;;rRNA;248554;248669;68;*;5s
;;tRNA;248738;248813;17;*;acc
;;rRNA;248831;248946;703;*;5s
fin;;CDS;249650;250924;;0;
deb;;CDS;282426;283268;135;*;
;;ncRNA;283404;283755;313;*;
fin;comp;CDS;284069;285322;;;
deb;comp;CDS;413908;416529;236;*;
;;tRNA;416766;416842;39;*;cgg
;;tRNA;416882;416957;41;*;cac
;;tRNA;416999;417075;58;*;cca
;;tRNA;417134;417210;320;*;cca
fin;comp;CDS;417531;419450;;;
deb;comp;CDS;492003;492536;1178;*;
;;rRNA;493715;495257;349;*;16s
;;rRNA;495607;498501;132;*;23s
;;rRNA;498634;498749;768;*;5s
fin;comp;CDS;499518;500534;;;
deb;;CDS;550745;552652;-23;*;
;comp;tRNA;552630;552724;286;*;tga
fin;;CDS;553011;553874;;;
deb;;CDS;640018;641220;155;*;
;;tRNA;641376;641466;1172;*;tca
;;tRNA;642639;642729;789;*;tca
deb;;CDS;643519;644862;988;*;
;;rRNA;645851;647393;74;*;16s
;;tRNA;647468;647544;65;*;atc
;;tRNA;647610;647685;336;*;gca
;;rRNA;648022;650916;177;*;23s
;;rRNA;651094;651209;727;*;5s
fin;;CDS;651937;653757;;0;
deb;comp;CDS;727650;727784;330;*;
;;tRNA;728115;728199;695;*;ttg
fin;;CDS;728895;730808;;0;
deb;;CDS;878528;879232;406;*;
;;regulatory;879639;879784;204;*;
fin;;CDS;879989;881359;;;
deb;;CDS;1166653;1168824;117;*;
;comp;tRNA;1168942;1169018;220;*;atgi
fin;comp;CDS;1169239;1171089;;;
deb;;CDS;1284512;1284730;-193;*;
;comp;misc_f;1284538;1284656;121;*;
fin;comp;CDS;1284778;1285140;;0;
deb;;CDS;1337892;1339205;500;*;
;comp;tRNA;1339706;1339781;52;*;aca
;comp;tRNA;1339834;1339909;539;*;ttc
;comp;tRNA;1340449;1340524;52;*;aca
;comp;tRNA;1340577;1340652;545;*;ttc
deb;;CDS;1341198;1342432;34;*;
;comp;tRNA;1342467;1342542;52;*;aca
;comp;tRNA;1342595;1342670;441;*;ttc
fin;comp;CDS;1343112;1343390;;;
deb;;CDS;1455613;1455810;913;*;
;;tRNA;1456724;1456815;21;*;agc
;;tRNA;1456837;1456913;30;*;cgt
;;tRNA;1456944;1457020;32;*;cgt
;;tRNA;1457053;1457129;30;*;cgt
;;tRNA;1457160;1457236;33;*;cgt
;;tRNA;1457270;1457346;9;*;cgt
;;tRNA;1457356;1457447;76;*;agc
;;tRNA;1457524;1457600;35;*;cgt
;;tRNA;1457636;1457712;9;*;cgt
;;tRNA;1457722;1457813;1058;*;agc
fin;;CDS;1458872;1459117;;;
deb;comp;CDS;1564741;1565973;165;*;
;comp;tmRNA;1566139;1566494;110;*;
fin;comp;CDS;1566605;1567099;;0;
deb;comp;CDS;1625951;1626781;581;*;
;comp;tRNA;1627363;1627438;176;*;agg
fin;comp;CDS;1627615;1628784;;0;
deb;comp;CDS;1769998;1770225;257;*;
;comp;tRNA;1770483;1770558;37;*;gta
;comp;tRNA;1770596;1770671;37;*;gta
;comp;tRNA;1770709;1770784;37;*;gta
;comp;tRNA;1770822;1770897;37;*;gta
;comp;tRNA;1770935;1771010;37;*;gta
;comp;tRNA;1771048;1771123;37;*;gta
;comp;tRNA;1771161;1771236;37;*;gta
;comp;tRNA;1771274;1771349;37;*;gta
;comp;tRNA;1771387;1771462;37;*;gta
;comp;tRNA;1771500;1771575;39;*;gta
;comp;tRNA;1771615;1771690;705;*;gta
deb;;CDS;1772396;1773805;104;*;
;;tRNA;1773910;1773985;80;*;gcc
;;tRNA;1774066;1774141;102;*;gaa
;;tRNA;1774244;1774319;102;*;gaa
;;tRNA;1774422;1774497;102;*;gaa
;;tRNA;1774600;1774675;102;*;gaa
;;tRNA;1774778;1774853;102;*;gaa
;;tRNA;1774956;1775031;102;*;gaa
;;tRNA;1775134;1775209;102;*;gaa
;;tRNA;1775312;1775387;253;*;gaa
;;tRNA;1775641;1775716;102;*;gaa
;;tRNA;1775819;1775894;102;*;gaa
;;tRNA;1775997;1776072;102;*;gaa
;;tRNA;1776175;1776250;102;*;gaa
;;tRNA;1776353;1776428;47;*;gaa
;;tRNA;1776476;1776551;977;*;gcc
fin;comp;CDS;1777529;1779358;;0;
deb;comp;CDS;1928606;1930189;113;*;
;comp;misc_f;1930303;1930412;474;*;
fin;;CDS;1930887;1931621;;;
deb;;CDS;2079870;2080424;876;*;
;;rRNA;2081301;2082843;348;*;16s
;;rRNA;2083192;2086086;132;*;23s
;;rRNA;2086219;2086334;304;*;5s
fin;comp;CDS;2086639;2087564;;;
deb;;CDS;2142913;2143137;136;*;
;comp;tRNA;2143274;2143350;134;*;ccc
fin;comp;CDS;2143485;2145269;;;
deb;;CDS;2225993;2226382;125;*;
;;regulatory;2226508;2226638;52;*;
fin;;CDS;2226691;2228829;;;
deb;comp;CDS;2365103;2365708;455;*;
;comp;tRNA;2366164;2366240;40;*;atgf
;comp;tRNA;2366281;2366357;40;*;atgf
;comp;tRNA;2366398;2366474;40;*;atgf
;comp;tRNA;2366515;2366591;383;*;atgf
fin;;CDS;2366975;2369110;;;
deb;comp;CDS;2374251;2375963;254;*;
;;tRNA;2376218;2376308;216;*;tca
fin;;CDS;2376525;2377169;;;
deb;;CDS;2379066;2379614;152;*;
;;tRNA;2379767;2379842;13;*;ggc
;;tRNA;2379856;2379929;85;*;tgc
;;tRNA;2380015;2380100;530;*;tta
fin;;CDS;2380631;2381200;;;
deb;;CDS;2548825;2550261;595;*;
;;tRNA;2550857;2550932;13;*;ggc
;;tRNA;2550946;2551019;95;*;tgc
;;tRNA;2551115;2551200;634;*;tta
;;tRNA;2551835;2551908;95;*;tgc
;;tRNA;2552004;2552089;479;*;tta
;;tRNA;2552569;2552642;132;*;tgc
;;tRNA;2552775;2552860;545;*;tta
fin;comp;CDS;2553406;2553735;;;
deb;;CDS;2556685;2557929;89;*;
;;tRNA;2558019;2558109;184;*;tca
fin;comp;CDS;2558294;2559073;;;
deb;;CDS;2716829;2717467;98;*;
;comp;tRNA;2717566;2717655;178;*;tcc
fin;comp;CDS;2717834;2719828;;;
deb;comp;CDS;2758794;2759069;192;*;
;comp;tRNA;2759262;2759367;128;*;cat
;comp;tRNA;2759496;2759601;128;*;cat
;comp;tRNA;2759730;2759806;189;*;atgf
;comp;tRNA;2759996;2760072;45;*;atgf
;comp;tRNA;2760118;2760194;2;*;gtc
;comp;tRNA;2760197;2760273;35;*;atgf
;comp;tRNA;2760309;2760385;13;*;gtc
;comp;tRNA;2760399;2760475;353;*;atgf
fin;comp;CDS;2760829;2762043;;;
deb;comp;CDS;2858049;2858531;291;*;
;;tRNA;2858823;2858907;30;*;tac
;;tRNA;2858938;2859022;85;*;tac
;;tRNA;2859108;2859192;107;*;tac
;;tRNA;2859300;2859384;107;*;tac
;;tRNA;2859492;2859576;315;*;tac
fin;;CDS;2859892;2860968;;0;
deb;comp;CDS;2863253;2865256;1011;*;
;;tRNA;2866268;2866343;45;*;aac
;;tRNA;2866389;2866464;41;*;aac
;;tRNA;2866506;2866581;26;*;aac
;;tRNA;2866608;2866683;32;*;aac
;;tRNA;2866716;2866791;33;*;aac
;;tRNA;2866825;2866900;40;*;aac
;;tRNA;2866941;2867016;187;*;aac
fin;;CDS;2867204;2869120;;;
deb;comp;CDS;2904901;2906862;188;*;
;comp;regulatory;2907051;2907149;230;*;
fin;comp;CDS;2907380;2908291;;0;
deb;comp;CDS;2926979;2928856;572;*;
;comp;tRNA;2929429;2929505;97;*;gac
;comp;tRNA;2929603;2929679;97;*;gac
;comp;tRNA;2929777;2929853;83;*;gac
;comp;tRNA;2929937;2930013;124;*;gac
fin;comp;CDS;2930138;2931472;;;
deb;comp;CDS;3118298;3119458;830;*;
;comp;tRNA;3120289;3120364;58;*;aaa
;comp;tRNA;3120423;3120498;58;*;aaa
;comp;tRNA;3120557;3120632;58;*;aaa
;comp;tRNA;3120691;3120766;59;*;aaa
;comp;tRNA;3120826;3120901;57;*;aaa
;comp;tRNA;3120959;3121034;58;*;aaa
;comp;tRNA;3121093;3121168;58;*;aaa
;comp;tRNA;3121227;3121302;59;*;aaa
;comp;tRNA;3121362;3121437;58;*;aaa
;comp;tRNA;3121496;3121571;59;*;aaa
;comp;tRNA;3121631;3121706;59;*;aaa
;comp;tRNA;3121766;3121841;193;*;aaa
fin;comp;CDS;3122035;3122760;;;
deb;;CDS;3243130;3243747;634;*;
;comp;ncRNA;3244382;3244478;176;*;
fin;comp;CDS;3244655;3244972;;0;
deb;comp;CDS;3268300;3269604;255;*;
;comp;tRNA;3269860;3269935;8;*;cac
;comp;tRNA;3269944;3270020;63;*;aga
;comp;tRNA;3270084;3270160;465;*;cca
fin;;CDS;3270626;3271480;;0;
deb;comp;CDS;3757370;3757825;157;*;
;comp;tRNA;3757983;3758059;103;*;atgf
;comp;tRNA;3758163;3758249;114;*;ctc
fin;comp;CDS;3758364;3758699;;;
deb;comp;CDS;3834636;3835094;162;*;
;comp;tRNA;3835257;3835331;51;*;caa
;comp;tRNA;3835383;3835467;131;*;cta
;comp;tRNA;3835599;3835673;20;*;caa
;comp;tRNA;3835694;3835778;96;*;cta
;comp;tRNA;3835875;3835949;49;*;caa
;comp;tRNA;3835999;3836083;211;*;cta
;comp;tRNA;3836295;3836371;5;*;atgj
;comp;tRNA;3836377;3836451;47;*;caa
;comp;tRNA;3836499;3836583;55;*;cta
;comp;tRNA;3836639;3836715;5;*;atgj
;comp;tRNA;3836721;3836795;47;*;caa
;comp;tRNA;3836843;3836927;55;*;cta
;comp;tRNA;3836983;3837059;495;*;atgj
fin;comp;CDS;3837555;3838646;;;
deb;comp;CDS;3862357;3862704;180;*;
;comp;tRNA;3862885;3862961;167;*;tgg
;comp;tRNA;3863129;3863205;160;*;tgg
fin;comp;CDS;3863366;3864334;;;
deb;;CDS;3865578;3866594;454;*;
;comp;rRNA;3867049;3867164;132;*;5s
;comp;rRNA;3867297;3870191;348;*;23s
;comp;rRNA;3870540;3872082;807;*;16s
fin;;CDS;3872890;3873405;;0;
deb;comp;CDS;3879732;3881864;289;*;
;;tRNA;3882154;3882229;187;*;ttc
fin;comp;CDS;3882417;3884279;;0;
deb;comp;CDS;3930329;3932182;122;*;
;comp;regulatory;3932305;3932527;233;*;
fin;comp;CDS;3932761;3933408;;0;
deb;;CDS;4051244;4051564;82;*;
;;ncRNA;4051647;4051828;251;*;
fin;comp;CDS;4052080;4052250;;;
deb;comp;CDS;4130284;4131048;211;*;
;comp;regulatory;4131260;4131412;506;*;
fin;comp;CDS;4131919;4132536;;0;
deb;;CDS;4146436;4146708;183;*;
;;regulatory;4146892;4146991;94;*;
fin;;CDS;4147086;4148081;;0;
deb;comp;CDS;4330369;4330824;663;*;
;comp;tRNA;4331488;4331563;20;*;ggc
;comp;tRNA;4331584;4331680;13;*;ggt
;comp;tRNA;4331694;4331769;47;*;ggc
;comp;tRNA;4331817;4331892;47;*;ggc
;comp;tRNA;4331940;4332039;15;*;ggt
;comp;tRNA;4332055;4332130;16;*;ggc
;comp;tRNA;4332147;4332222;48;*;ggc
;comp;tRNA;4332271;4332346;113;*;ggc
fin;comp;CDS;4332460;4333005;;0;
deb;comp;CDS;4446808;4448991;66;*;
;comp;regulatory;4449058;4449140;441;*;
fin;;CDS;4449582;4449893;;;
deb;comp;CDS;4452358;4453668;212;*;
;;regulatory;4453881;4453980;104;*;
fin;;CDS;4454085;4455455;;0;
deb;;CDS;4615072;4616082;798;*;
;comp;rRNA;4616881;4616996;132;*;5s
;comp;rRNA;4617129;4620023;371;*;23s
;comp;tRNA;4620395;4620470;65;*;gca
;comp;tRNA;4620536;4620612;74;*;atc
;comp;rRNA;4620687;4622229;206;*;16s
fin;comp;CDS;4622436;4623133;;;
deb;comp;CDS;5003438;5004418;-13;*;
;comp;regulatory;5004406;5004542;257;*;
fin;;CDS;5004800;5006449;;0;
deb;comp;CDS;5129088;5129342;427;*;
;comp;tRNA;5129770;5129846;100;*;gac
;comp;rRNA;5129947;5130062;133;*;5s
;comp;rRNA;5130196;5133090;349;*;23s
;comp;rRNA;5133440;5134982;611;*;16s
fin;comp;CDS;5135594;5137015;;0;
&lt;/pre&gt;

====spl intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_entre_cds|spl intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
spl;31.1.21 Paris;NCBI;spl 24-9-2020;;;;;;;;;
spl;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;frequencez
;'''négatif;426;10.1;'''négatif ;-7;10;-1 à -98;'''5 174 581;-1;426;610;5
;'''zéro;18;0.4;;;;;'''intercals;0;18;620;10
;'''1 à 200;2448;58.1;'''0 à 200;82;58;;'''730 981;5;168;630;7
;'''201 à 370;776;18.4;'''201 à 370;274;48;;'''14.1%;10;124;640;6
;'''371 à 600;378;9.0;'''371 à 600;462;62;;;15;138;650;6
;'''601 à max;167;4.0;'''601 à 1028;849;331;;;20;74;660;6
;'''total 4213;&lt;201;68.6;'''total 4213;173;207;-98 à 3180;;25;69;670;7
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;64;680;6
3787762;3180;-1;426;-70;2;;0;18;35;68;690;3
2676990;2727;0;18;-60;0;;-1;°126;40;47;700;5
4795292;1942;1;°46;-50;4;;-2;2;45;49;710;6
3628609;1722;2;°53;-40;2;;-3;0;50;42;720;6
1384243;1674;3;°30;-30;5;'''min à -1;-4;°141;55;52;730;2
5168395;1593;4;22;-20;16;426;-5;0;60;67;740;7
1692692;1489;5;17;-10;70;10.1%;-6;0;65;56;750;4
4989087;1401;6;15;0;345;;-7;10;70;66;760;1
5017524;1331;7;16;10;292;;-8;°48;75;77;770;3
1530827;1329;8;°30;20;212;;-9;0;80;91;780;3
4000859;1318;9;°30;30;133;;-10;8;85;67;790;4
1999942;1254;10;°33;40;115;'''1 à 100;-11;°28;90;78;800;4
1605218;1225;11;°29;50;91;1561;-12;0;95;65;810;2
897237;1221;12;°36;60;119;37.1%;-13;5;100;81;820;3
1570703;1178;13;23;70;122;;-14;°15;105;41;830;1
4927424;1166;14;°30;80;168;;-15;1;110;61;840;3
1817514;1161;15;20;90;145;;-16;3;115;52;850;2
3532660;1157;16;10;100;146;;-17;°9;120;75;860;1
1716642;1154;17;16;110;102;;-18;0;125;64;870;4
1413389;1150;18;°22;120;127;;-19;1;130;64;880;2
2276940;1141;19;15;130;128;;-20;°7;135;37;890;3
600202;1140;20;11;140;82;;-21;0;140;45;900;1
1996502;1103;21;°14;150;78;;-22;0;145;45;910;2
3325479;1046;22;13;160;82;;-23;°4;150;33;920;2
223647;1016;23;13;170;80;'''1 à 200;-24;0;155;43;930;1
3589524;1016;24;°23;180;89;2448;-25;0;160;39;940;3
967539;1009;25;6;190;67;58.1%;-26;°2;165;42;950;3
4112640;1007;26;9;200;70;;-27;0;170;38;960;3
4903734;975;27;°23;210;61;;-28;1;175;45;970;1
3472661;968;28;9;220;64;;-29;°2;180;44;980;1
750412;959;29;12;230;58;;-30;0;185;34;990;0
2804938;959;30;11;240;59;;-31;0;190;33;1000;0
2670476;957;31;°20;250;48;;-32;°3;195;35;1010;2
2620635;946;32;13;260;52;;;434;200;35;1020;2
2967190;944;33;11;270;54;;reste;10;205;33;1030;0
4243039;944;34;°14;280;47;'''0 à 200;total;444;210;28;1040;0
2002234;937;35;10;290;56;2466;;;215;23;1050;1
3578230;936;36;7;300;44;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;220;41;1060;0
4121391;933;37;°10;310;36;;600;4046;225;35;1070;0
1500535;926;38;°15;320;35;;650;34;230;23;1080;0
4952031;915;39;8;330;29;;700;27;235;32;1090;0
2490814;912;40;7;340;36;'''201 à 370;750;25;240;27;1100;0
2028503;909;reste;3017;350;30;776;800;15;245;25;1110;1
4150415;904;total;4213;360;30;18.4%;850;11;250;23;1120;0
2127775;897;;;370;37;;900;11;255;26;1130;0
1003095;887;;;380;19;;950;11;260;26;1140;1
2921392;885;;;390;24;;1000;5;265;31;1150;2
2262088;884;;;400;19;;1050;5;270;23;1160;2
2877064;877;;;410;32;;1100;0;275;24;1170;2
4984821;874;;;420;31;;1150;4;280;23;1180;1
4474909;866;;;430;24;;1200;5;285;30;1190;0
1417740;865;;;440;20;;1250;2;290;26;1200;0
4759907;862;;;450;20;;1300;1;295;19;reste;14
3297697;861;;;460;20;;1350;3;300;25;total;167
;;;;470;19;;1400;0;305;20;;
;;;;480;12;;1450;1;310;16;;
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;490;12;;1500;1;315;20;;
4734113;-98;shift2;629;500;19;;1550;0;320;15;;
4557422;-77;shift2;764;510;13;;1600;1;325;15;;
2893452;-56;shift2;1688;520;14;;1650;0;330;14;;
4567483;-53;shift2;4142;530;12;;1700;1;335;17;;
5067715;-53;shift2;2369;540;12;'''371 à 600;1750;1;340;19;;
4015714;-52;comp;;550;9;378;1800;0;345;15;;
1735201;-43;shift2;;560;11;9.0%;1850;0;350;15;;
1578876;-41;shift2;;570;15;;1900;0;355;15;;
164778;-38;shift2;;580;7;'''601 à max;1950;1;360;15;;
5173629;-34;shift2;;590;7;167;;165;365;19;;
73781;-32;shift2;;600;7;4.0%;;;370;18;;
2497076;-32;shift2;;reste;167;;reste;2;reste;545;;
2892533;-32;shift2;;total;4213;;total;4213;total;4213;;
&lt;/pre&gt;

====spl  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_positifs_S+|spl intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
spl. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
myr;min20;828;2081;2909;872;649;764;115;-143;41;323;;;
spl;min10;1071;2215;3286;884;735;784;49;-353;-202;172;;;
rru;min40;874;2056;2930;829;193;611;418;722;792;861;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
71;392;0.18;999;2556;5;5;20;110;97;899;-78;;;
37;270;0.14;1313;2900;1;6;9;143;69;683;-342;;;
169;266;0.64;1037;2749;1;4;71;222;175;630;17;;;
;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
spl;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;47;-333;594;7.7;611;236;max80;-47;363;-934;95;806;257;min50
31 à 400;-;-;-;-;-;-;;10.3;-50;-57;43;915;162;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;59;37;-;275;poly;336;tF;158;57;;614;poly;192;SF
31 à 400;;;;;;;;106;43;-;885;dte;30;tf
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50 60, '''t30 t60'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;-0.342;;;;;
41-n;0.884;0.735;0.784;;;;;;;;;;;
1-n;0.172;-0.353;-0.202;;;;;;;;;14.8.21 Paris;;
spl;fx;fc;;spl;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;spl;Sx-;Sc-
0;1;17;;0;1;8;0;1;17;&gt;0;1300;-1;0;126
10;8;284;;10;7;128;1;0;46;&lt;0;12;-2;2;0
20;19;193;;20;18;87;2;0;53;zéro;1;-3;0;0
30;13;120;;30;12;54;3;1;29;total;1313;-4;5;136
40;29;86;;40;27;39;4;0;22;;c;-5;0;0
50;16;75;;50;15;34;5;1;16;&gt;0;2469;-6;0;0
60;39;80;;60;36;36;6;2;13;&lt;0;414;-7;0;10
70;50;72;;70;47;33;7;2;14;zéro;17;-8;2;46
80;67;101;;80;63;46;8;1;29;total;2900;-9;0;0
90;52;93;;90;49;42;9;1;29;;;-10;0;8
100;56;90;;100;52;41;10;0;33;;;-11;0;28
110;38;64;;110;35;29;11;2;27;;;-12;0;0
120;54;73;;120;50;33;12;1;35;;;-13;0;5
130;44;84;;130;41;38;13;3;20;;;-14;0;15
140;26;56;;140;24;25;14;1;29;;;-15;1;0
150;27;51;;150;25;23;15;5;15;;;-16;0;3
160;30;52;;160;28;23;16;0;10;;;-17;1;8
170;30;50;;170;28;23;17;3;13;;;-18;0;0
180;36;53;;180;34;24;18;2;20;;;-19;0;1
190;24;43;;190;22;19;19;1;14;;;-20;0;7
200;33;37;;200;31;17;20;1;10;;;-21;0;0
210;24;37;;210;22;17;21;2;12;;;-22;0;0
220;25;39;;220;23;18;22;1;12;;;-23;0;4
230;25;33;;230;23;15;23;0;13;;;-24;0;0
240;28;31;;240;26;14;24;4;19;;;-25;0;0
250;23;25;;250;21;11;25;3;3;;;-26;0;2
260;22;30;;260;21;14;26;0;9;;;-27;0;0
270;23;31;;270;21;14;27;2;21;;;-28;0;1
280;25;22;;280;23;10;28;0;9;;;-29;0;2
290;27;29;;290;25;13;29;1;11;;;-30;0;0
300;20;24;;300;19;11;30;0;11;;;-31;0;0
310;18;18;;310;17;8;31;3;17;;;-32;0;3
320;16;19;;320;15;9;32;4;9;;;-33;0;0
330;11;18;;330;10;8;33;3;8;;;-34;0;1
340;16;20;;340;15;9;34;5;9;;;-35;0;0
350;13;17;;350;12;8;35;2;8;;;-36;0;0
360;14;16;;360;13;7;36;1;6;;;-37;0;0
370;15;22;;370;14;10;37;4;6;;;-38;0;1
380;10;9;;380;9;4;38;5;10;;;-39;0;0
390;14;10;;390;13;5;39;1;7;;;-40;0;0
400;11;8;;400;10;4;40;1;6;;;-41;0;1
reste;229;254;;;;;reste;1231;1786;;;-42;0;0
total;1301;2486;;t30;37;270;total;1301;2486;;;-43;0;1
diagr;1071;2215;;t60;116;378;diagr;69;683;;;-44;0;0
 - t30;1031;1618;;;;;;;;;;-45;0;0
 - t60;947;1377;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;reste;1;5
;;;;;;;;;;;;total;12;414
;;;;;;;;;;;;-52;1;
&lt;/pre&gt;

====spl  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_négatifs_S-|spl intercalaires négatifs S-]]
9.6.21 Paris
&lt;pre&gt;
spl;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;2;;5;;;;2;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;12
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*14.8.21 Paris
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;spl;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
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&lt;/pre&gt;

====spl autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_autres_intercalaires|spl autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
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;;;;;;;&amp;tRNA;2376218;216;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;2376525;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====spl intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_tRNA|spl intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
spl ;intercalaires tRNA;;;;;;;;;;;
108 aas;pas de comp’;;;;;;;;;;;
aa1;aa2;aa3;;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
&amp;234;&amp;455;&amp;830;;;;;606;;89;113;;
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;;48;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;deb;fin;total
;;;;;;;;;&lt;201;13;12;25
;;;;;;;;;total;31;31;62
;;;;;;;;;taux;42%;39%;40%
&lt;/pre&gt;

===Vibrio parahaemolyticus===
====vpb opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb_opérons|vpb opérons]]
&lt;pre&gt;
45.3%GC;6.7.19 Paris;16s 11 ;126;doubles;intercalaires
Vibrio parahaemolyticus BB22OP;;;chr1;;
;33614..35175;;16s;@4;80
;35256..35331;;gaa;;2
;35334..35409;;aaa;;30
;35440..35515;;gta;;55
comp;35571..35768;;MQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKL LKSYVSSQGSTFSKDFQSRRF;CDS 198;59
;35828..38743;;23s;;73
;38817..38932;;5s;;
;;;;;
;49997..50073;;cgg;;32
;50106..50181;;cac;+;72
;50254..50330;;cca;2 cac;49
;50380..50455;;cac;2 cca;24
;50480..50556;;cca;;
;;;;;
comp;400045..400120;;atgi;;
;;;;;
;577971..579532;;16s;;88
;579621..579696;;gcc;;12
;579709..579784;;gaa;;258
;580043..582958;;23s;;73
;583032..583147;;5s;;30
;583178..583254;;gac;;35
;583290..583366;;tgg;;
;;;;;
comp;769649..769733;;cta;+;29
comp;769763..769847;;cta;10 cta;47
comp;769895..769971;;atg;4 atg;24
comp;769996..770080;;cta;5 caa;52
comp;770133..770207;;caa;;29
comp;770237..770321;;cta;;53
comp;770375..770451;;atg;;24
comp;770476..770560;;cta;;52
comp;770613..770687;;caa;;29
comp;770717..770801;;cta;;54
comp;770856..770930;;caa;;29
comp;770960..771044;;cta;;35
comp;771080..771154;;caa;;48
comp;771203..771287;;cta;;31
comp;771319..771403;;cta;;77
comp;771481..771557;;atg;;77
comp;771635..771709;;caa;;31
comp;771741..771825;;cta;;40
comp;771866..771942;;atg;;
;;;;;
;786939..787015;;cca;;
;;;;;
comp;802315..802391;;agg;;
;;;;;
;910219..910295;;aga;;
;;;;;
comp;982089..982173;;tac;+;81
comp;982255..982339;;tac;4 tac;81
comp;982421..982505;;tac;;81
comp;982587..982671;;tac;;
;;;;;
;1124715..1124802;;tcc;;
;;;;;
;1418321..1418397;;gtc;+;32
;1418430..1418506;;gtc;2gtc;
;;;;;
comp;1988127..1988202;;ggc;+;10
comp;1988213..1988299;;tta;2 ggc;76
comp;1988376..1988451;;ggc;;20
comp;1988472..1988545;;tgc;;
;;;;;
;2164082..2164157;;aac;;
;;;;;
;2193593..2193683;;tca;;
;;;;;
comp;2547884..2547960;;atgf;;56
comp;2548017..2548100;;ctc;;
;;;;;
;2652092..2652168;;cgt;+;56
comp;2652225..2652301;;cgt;9 cgt;57
comp;2652359..2652435;;cgt;2 agc;57
comp;2652493..2652569;;cgt;;57
comp;2652627..2652703;;cgt;;57
comp;2652761..2652837;;cgt;;56
comp;2652894..2652970;;cgt;;210
comp;2653181..2653257;;cgt;;31
comp;2653289..2653380;;agc;@5;320
comp;2653701..2653777;;cgt;;31
comp;2653809..2653900;;agc;;
;;;;;
;2735697..2735772;;ttc;+;64
;2735837..2735912;;aca;3 ttc;7
;2735920..2735995;;ttc;2 aca;70
;2736066..2736141;;aac;2 aac;71
;2736213..2736288;;aca;;7
;2736296..2736371;;ttc;;43
;2736415..2736490;;aac;;
;;;;;
;2738623..2738698;;ttc;;51
;2738750..2738825;;aca;+;21
;2738847..2738922;;aac;2 aca;39
;2738962..2739037;;aca;2 aac;15
;2739053..2739128;;aac;;
;;;;;
comp;2741263..2741339;;gac;;31
comp;2741371..2741487;;5s;;57
comp;2741545..2741620;;acc;;100
comp;2741721..2741836;;5s;;73
comp;2741910..2744825;;23s;;257
comp;2745083..2745158;;gca;;41
comp;2745200..2745276;;atc;;56
comp;2745333..2746894;;16s;;
;;;;;
comp;2755928..2756012;;ttg;;
;;;;;
comp;2847646..2847722;;tgg;;68
comp;2847791..2847867;;gac;;30
comp;2847898..2848013;;5s;;73
comp;2848087..2851002;;23s;;258
comp;2851261..2851336;;gaa;;80
comp;2851417..2852978;;16s;;
;;;;;
comp;2987485..2987561;;atgf;+;56
comp;2987618..2987693;;ggc;5 atgf;18
comp;2987712..2987788;;atgf;8 ggc;35
comp;2987824..2987899;;ggc;;50
comp;2987950..2988025;;ggc;;49
comp;2988075..2988150;;ggc;;49
comp;2988200..2988275;;ggc;;30
comp;2988306..2988382;;atgf;;55
comp;2988438..2988513;;ggc;;30
comp;2988544..2988620;;atgf;;39
comp;2988660..2988735;;ggc;;19
comp;2988755..2988831;;atgf;;35
comp;2988867..2988942;;ggc;;
;;;;;
comp;3060924..3061000;;tgg;;68
comp;3061069..3061145;;gac;;30
comp;3061176..3061291;;5s;;73
comp;3061365..3064280;;23s;;257
comp;3064538..3064613;;gta;;14
comp;3064628..3064703;;gca;;32
comp;3064736..3064811;;aaa;;2
comp;3064814..3064889;;gaa;;80
comp;3064970..3066531;;16s;@3;319
comp;3066851..3066966;;5s;;73
comp;3067040..3069955;;23s;;261
comp;3070217..3071778;;16s;;
;;;;;
comp;3105094..3105169;;acc;;13
comp;3105183..3105257;;gga;;35
comp;3105293..3105377;;tac;;36
comp;3105414..3105489;;aca;;
;;;;;
comp;3111073..3111149;;gac;;30
comp;3111180..3111295;;5s;;73
comp;3111369..3114284;;23s;;261
comp;3114546..3116107;;16s;@1;317
comp;3116425..3116540;;5s;;73
comp;3116614..3119529;;23s;;261
comp;3119791..3121352;;16s;;
;;;;;
comp;3175944..3176034;;tca;;69
comp;3176104..3176219;;5s;;73
comp;3176293..3179211;;23s;;257
comp;3179469..3179544;;gca;;41
comp;3179586..3179662;;atc;;56
comp;3179719..3181280;;16s;@2;
;;;;;
comp;3217187..3217263;;gac;;30
comp;3217294..3217409;;5s;;73
comp;3217483..3220398;;23s;;59
;3220458..3220655;;MQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKL LKSYVSSQGSTFSKDFQSRRF;CDS 198;55
comp;3220711..3220786;;gta;;30
comp;3220817..3220892;;aaa;;2
comp;3220895..3220970;;gaa;;80
comp;3221051..3222612;;16s;;
Vibrio parahaemolyticus BB22OP;;;chr2;;
;132908..134469;;16s;;80
;134550..134625;;gaa;;2
;134628..134703;;aaa;;16
;134720..134795;;gca;;14
;134810..134885;;gta;;54
comp;134940..135122;;MTSHQSCLQFLNMMQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKLLKS;CDS 180;19
;135142..138059;;23s;;73
;138133..138248;;5s;;69
;138318..138408;;tca;;
;;;;;
comp;192886..192969;;ctc;;
;;;;;
comp;591931..592021;;tca;;
;;;;;
comp;1009457..1009530;;tgc;;73
comp;1009604..1009690;;tta;;
;;;;;
comp;1021568..1021641;;tgc;;73
comp;1021715..1021801;;tta;;
;;;;;
comp;1029973..1030048;;ggc;;3
comp;1030052..1030125;;tgc;;
&lt;/pre&gt;
====vpb cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb_cumuls|vpb cumuls]]
&lt;pre&gt;
vpb cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;9;1;0;0;1;;1;;100;
;16 23 5s 0;0;20;9;8;50;;20;;200;
;16 atc gca;2;40;24;4;100;;40;;300;
;16 23 5s a;1;60;21;2;150;;60;;400;
;max a;6;80;9;2;200;;80;;500;
;a doubles;0;100;3;0;250;;100;;600;
;spéciaux;6;120;0;0;300;;120;;700;
;total aas;33;140;0;0;350;;140;;800;
sans ;opérons;25;160;0;0;400;;160;;900;
;1 aa;11;180;0;0;450;;180;;1000;
;max a;19;200;0;0;500;;200;;1100;
;a doubles;8;;1;0;;;;;;
;total aas;93;;67;16;;0;;0;;0
total aas;;126;;;;;;;;;
remarques;;5;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;46;26;;;;;;
;;;variance;29;22;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;43;;;;;;;
;;;variance;17;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====vpb blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb_blocs|vpb blocs]]
&lt;pre&gt;
vpb blocs;;;;;;;
16s;80;16s;80;16s;80;;
gaa;2;gaa;2;gaa;2;;
aaa;30;aaa;30;aaa;16;;
gta;55;gta;55;gca;14;;
cds 198;59;cds 198;59;gta;54;;
23s;73;23s;73;cds 180;19;;
5s;;5s;30;23s;73;;
;;gac;;5s;69;;
;;;;tca;;;
;;;;;;;
16s;56;16s;56;16s;88;16s;80
atc;41;atc;41;gcc;12;gaa;258
gca;257;gca;257;gaa;258;23s;73
23s;73;23s;73;23s;73;5s;30
5s;100;5s;69;5s;30;gac;
acc;57;tca;;gac;;;
5s;31;;;;;;
gac;;;;;;;
;;;;;;;
16s;261;16s;261;;;;
23s;73;23s;73;;;;
5s;319;5s;317;;;;
16s;80;16s;261;;;;
gaa;2;23s;73;;;;
aaa;32;5s;30;;;;
gca;14;gac;;;;;
gta;257;;;;;;
23s;73;;;;;;
5s;30;;;;;;
gac;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====vpb distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb_distribution|vpb distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;6;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;ggc4;ttc;4;tcc;;tac;1;tgc;4;ggc4;ttc;;tcc;;tac;4;tgc;;ggc4;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;1;aac;4;agc;2;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;
ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;acc 5s + 1 &gt;a;ctc;1;ccc;;cac;2;cgt;1;acc 5s + 1 &gt;a;ctc;;ccc;;cac;;cgt;8;acc 5s + 1 &gt;a;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;tca 2 5s+ 2 a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;7;tca 2 5s+ 2 a;gtc;2;gcc;;gac;;ggc;4;tca 2 5s+ 2 a;gtc;;gcc;;gac;6;ggc;
tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;3;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;5;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;6;cca;2;caa;5;cga;;;cta;4;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;3
atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;4;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
vpb;;11;;;;;11;;vpb;60;;;;;;60;;vpb;22;;;;;;22;;vpb;;;;12;;;12
&lt;/pre&gt;
====vpb1 données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb1_données_intercalaires|vpb1 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa
fxt;fct;vpb1;fx;fc;vpb1;fx40;fc40;vpb1;x-;c-;c;x;c;x;;c;x;;c;x;
;0;0;1;9;0;1;9;-1;;83;cont;x;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;suite;
;0;10;12;254;1;2;25;-2;;0;284;337;97;;gcc;32;;cgg;64;;ttc
;3;20;12;187;2;1;45;-3;;0;140;243;2* 65;;atc;72;;cac;7;;aca
;0;30;9;114;3;2;36;-4;2;115;366;139;4* 89;;gaa;49;;cac;70;;ttc
;0;40;16;74;4;1;16;-5;;0;18;259;tRNA 23s;;;24;;cac;71;;aac
;1;50;26;58;5;0;24;-6;1;0;268;290;2* 264;;gca;**;;cac;7;;aca
;0;60;35;45;6;1;8;-7;;7;179;203;2* 265;;gaa;29;;cta;43;;ttc
;0;70;57;54;7;1;15;-8;1;41;50;477;264;;gta;47;;cta;**;;aac
;0;80;56;57;8;2;21;-9;;0;144;282;2* 319;;gta;24;;atgj;51;;ttc
;0;90;48;57;9;1;44;-10;;4;457;95;5s tRNA;;;52;;cta;21;;aca
3;1;100;36;48;10;1;20;-11;2;29;179;587;5* 30;;gac;29;;caa;39;;aac
;1;110;36;60;11;1;25;-12;;0;736;168;31;;gac;53;;cta;15;;aca
;0;120;20;53;12;0;31;-13;;3;390;135;100;;acc;24;;atgj;**;;aac
;0;130;33;50;13;0;21;-14;;21;327;302;69;;tca;52;;cta;56;;atgf
2;1;140;22;38;14;1;23;-15;1;0;153;456;tRNA 5s;;;29;;caa;18;;ggc
;1;150;15;47;15;2;18;-16;;1;227;620;57;;acc;54;;cta;35;;atgf
;2;160;13;47;16;0;9;-17;;12;15;96;tRNA tRNA;intra;;29;;caa;50;;ggc
1;0;170;16;47;17;1;19;-18;;0;569;206;2;;gaa;35;;cta;49;;ggc
;2;180;11;42;18;3;17;-19;;2;243;497;30;;aaa;48;;caa;49;;ggc
;1;190;18;31;19;2;8;-20;;10;11;964;**;;gta;31;;cta;30;;ggc
;0;200;16;31;20;2;16;-21;1;0;243;93;12;;gcc;77;;cta;55;;atgf
2;0;210;9;26;21;2;14;-22;1;2;100;;**;;gaa;77;;atgj;30;;ggc
;0;220;15;21;22;0;8;-23;;5;272;;41;;gca;31;;caa;39;;atgf
;1;230;14;26;23;0;9;-24;;0;234;;**;;atc;40;;cta;19;;ggc
;1;240;8;21;24;1;20;-25;;1;565;;14;;gta;**;;atgj;35;;atgf
1;2;250;8;22;25;0;10;-26;;1;190;;32;;gca;81;;tac;**;;ggc
1;0;260;12;15;26;1;15;-27;;0;156;;2;;aaa;81;;tac;13;;acc
;1;270;15;17;27;1;6;-28;;0;103;;**;;gaa;81;;tac;35;;gga
;1;280;8;12;28;1;18;-29;;2;CDS 16s;;41;;gca;**;;tac;36;;tac
2;1;290;12;15;29;2;5;-30;;0;454;556;**;;atc;32;;gtc;**;;aca
;0;300;9;19;30;1;9;-31;;0;504;496;30;;gta;**;;gtc;;;
1;0;310;7;18;31;1;11;-32;;1;487;;2;;aaa;10;;ggc;;;
;0;320;12;6;32;1;11;-33;;0;575;;**;;gaa;76;;tta;;;
;1;330;6;8;33;3;6;-34;;1;817;;tRNA tRNA;contig;;20;;ggc;;;
1;0;340;4;6;34;4;9;-35;;2;472;;35;;gac;**;;tgc;;;
;0;350;11;8;35;0;5;-36;;0;5s 16s;;**;;tgg;56;;atgf;;;
;0;360;7;4;36;0;10;-37;;0;319;;2* 68;;tgg;**;;ctc;;;
;1;370;8;6;37;2;6;-38;;0;317;;**;;gac;56;;cgt;;;
;0;380;5;4;38;1;6;-39;;0;16s 23s;;;;;57;;cgt;;;
;1;390;7;3;39;2;6;-40;;0;3* 277;;;;;57;;cgt;;;
;0;400;7;4;40;2;4;-41;1;0;23s 5s;;;;;57;;cgt;;;
6;4;reste;90;93;reste;732;1119;-42;;0;10* 91;;;;;57;;cgt;;;
20;27;total;782;1757;total;782;1757;-43;;0;5s CDS;;;;;56;;cgt;;;
14;23;diagr;691;1655;diagr;49;629;-44;1;0;;110;;;;210;;cgt;;;
0;3;t30;33;555;;;;-45;;0;;;;;;31;;cgt;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;;**;;agc;;;
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;1;0;;;;;;31;;cgt;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;;**;;agc;;;
;x;781;13;1;795;;;-49;;0;;;;;;;;;;;
;c;1748;344;9;2101;;;-50;;1;;;;;;;;;;;
;;;;;2896;203;;reste;1;0;;;;;;;;;;;
;;;;;;3099;;total;13;344;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====vpb2 données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb2_données_intercalaires|vpb2 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;vpb2;fx;fc;vpb2;fx40;fc40;vpb2;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;11;0;1;11;-1;;50;32;501;16s tRNA;;
;0;10;11;116;1;0;18;-2;1;0;843;563;89;;gaa
;0;20;6;71;2;1;16;-3;;0;356;24;tRNA 23s;;
1;0;30;11;46;3;2;7;-4;4;53;221;329;263;;gta
1;1;40;8;27;4;1;6;-5;;0;222;678;5s tRNA;;
;0;50;17;21;5;0;4;-6;1;0;;537;69;;tca
;0;60;14;28;6;0;6;-7;;1;;314;tRNA tRNA;intra;
;0;70;29;30;7;1;4;-8;;23;;34;2;;gaa
;0;80;39;25;8;1;8;-9;;0;CDS 16s;;16;;aaa
;0;90;32;33;9;3;29;-10;;1;468;;14;;gca
;0;100;28;24;10;2;18;-11;1;11;;;**;;gta
;0;110;24;18;11;0;14;-12;;0;23s 5s;;tRNA tRNA;;
;0;120;29;19;12;1;13;-13;;1;91;;73;;tgc
;0;130;18;17;13;1;5;-14;3;6;;;**;;tta
;0;140;11;16;14;0;6;-15;;0;;;73;;tgc
;0;150;16;15;15;1;8;-16;;0;;;**;;tta
;0;160;15;30;16;0;4;-17;;6;;;3;;ggc
;0;170;10;19;17;0;2;-18;;0;;;**;;tgc
;0;180;8;23;18;1;9;-19;;1;;;;;
;0;190;11;17;19;2;3;-20;;2;;;;;
;0;200;7;3;20;0;7;-21;;0;;;;;
;0;210;14;16;21;1;7;-22;;0;;;;;
;0;220;9;14;22;1;6;-23;1;2;;;;;
;2;230;9;13;23;0;4;-24;;0;;;;;
;0;240;13;18;24;0;5;-25;;0;;;;;
;0;250;14;9;25;1;4;-26;;4;;;;;
;0;260;12;7;26;1;4;-27;;0;;;;;
;0;270;11;9;27;3;4;-28;;0;;;;;
;0;280;6;8;28;2;6;-29;;2;;;;;
;0;290;7;6;29;0;3;-30;;0;;;;;
;0;300;3;9;30;2;3;-31;;0;;;;;
;0;310;2;6;31;0;3;-32;;1;;;;;
1;0;320;6;3;32;0;5;-33;;0;;;;;
1;0;330;8;3;33;1;3;-34;;0;;;;;
;0;340;5;8;34;1;2;-35;;1;;;;;
;0;350;1;8;35;1;2;-36;;0;;;;;
;1;360;6;8;36;1;1;-37;;0;;;;;
;0;370;5;2;37;1;3;-38;;1;;;;;
;0;380;7;2;38;1;1;-39;1;0;;;;;
;0;390;3;5;39;2;2;-40;;1;;;;;
;0;400;4;2;40;0;5;-41;;0;;;;;
4;1;reste;71;63;reste;524;557;-42;;0;;;;;
8;5;total;561;828;total;561;828;-43;;0;;;;;
4;4;diagr;489;754;diagr;36;260;-44;;0;;;;;
1;0;t30;28;233;;;;-45;;0;;;;;
;;;;;;;;-46;;1;;;;;
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;1;0;;;;;
;x;560;14;1;575;;;-49;;0;;;;;
;c;817;171;11;999;;;-50;;3;;;;;
;;;;;1574;32;;reste;1;0;;;;;
;;;;;;1606;;total;14;171;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====vpb1 autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb1_autres_intercalaires_aas|vpb1 autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;vpb1;;;;;
deb;;CDS;32632;33159;454;*;
;;rRNA;33614;35166;89;*;1553
;;tRNA;35256;35331;2;*;gaa
;;tRNA;35334;35409;30;*;aaa
;;tRNA;35440;35515;319;*;gta
;;rRNA;35835;38725;91;*;2891
;;rRNA;38817;38932;110;*;116
fin;comp;CDS;39043;39933;;0;
deb;comp;CDS;49246;49659;337;*;
;;tRNA;49997;50073;32;*;cgg
;;tRNA;50106;50181;72;*;cac
;;tRNA;50254;50330;49;*;cac
;;tRNA;50380;50455;24;*;cac
;;tRNA;50480;50556;243;*;cac
fin;comp;CDS;50800;51525;;0;
deb;;CDS;330209;330847;37;*;
;;regulatory;330885;331020;72;*;
fin;;CDS;331093;332085;;;
deb;comp;CDS;398957;399760;284;*;
;comp;tRNA;400045;400120;140;*;atgi
fin;comp;CDS;400261;402123;;;
deb;;CDS;447282;448145;166;*;
;;ncRNA;448312;448741;175;*;
fin;;CDS;448917;449867;;;
deb;comp;CDS;503781;504251;439;*;
;;misc_f;504691;504810;54;*;
fin;;CDS;504865;507324;;;
deb;comp;CDS;568478;569656;13;*;
;comp;misc_f;569670;569792;107;*;
fin;comp;CDS;569900;570226;;;
deb;;CDS;574893;577466;504;*;
;;rRNA;577971;579523;97;*;1553
;;tRNA;579621;579696;12;*;gcc
;;tRNA;579709;579784;265;*;gaa
;;rRNA;580050;582940;91;*;2891
;;rRNA;583032;583147;30;*;116
;;tRNA;583178;583254;35;*;gac
;;tRNA;583290;583366;366;*;tgg
fin;;CDS;583733;584065;;;
deb;comp;CDS;670277;672010;111;*;
;comp;tmRNA;672122;672489;67;*;
fin;comp;CDS;672557;673042;;0;
deb;;CDS;768334;769509;139;*;
;comp;tRNA;769649;769733;29;*;cta
;comp;tRNA;769763;769847;47;*;cta
;comp;tRNA;769895;769971;24;*;atgj
;comp;tRNA;769996;770080;52;*;cta
;comp;tRNA;770133;770207;29;*;caa
;comp;tRNA;770237;770321;53;*;cta
;comp;tRNA;770375;770451;24;*;atgj
;comp;tRNA;770476;770560;52;*;cta
;comp;tRNA;770613;770687;29;*;caa
;comp;tRNA;770717;770801;54;*;cta
;comp;tRNA;770856;770930;29;*;caa
;comp;tRNA;770960;771044;35;*;cta
;comp;tRNA;771080;771154;48;*;caa
;comp;tRNA;771203;771287;31;*;cta
;comp;tRNA;771319;771403;77;*;cta
;comp;tRNA;771481;771557;77;*;atgj
;comp;tRNA;771635;771709;31;*;caa
;comp;tRNA;771741;771825;40;*;cta
;comp;tRNA;771866;771942;18;*;atgj
fin;comp;CDS;771961;772221;;;
deb;comp;CDS;786539;786679;259;*;
;;tRNA;786939;787015;290;*;cca
fin;comp;CDS;787306;788178;;0;
deb;comp;CDS;801540;802046;268;*;
;comp;tRNA;802315;802391;179;*;agg
fin;comp;CDS;802571;803704;;0;
deb;comp;CDS;909155;910015;203;*;
;;tRNA;910219;910295;50;*;aga
fin;;CDS;910346;910864;;;
deb;;CDS;980739;981611;477;*;
;comp;tRNA;982089;982173;81;*;tac
;comp;tRNA;982255;982339;81;*;tac
;comp;tRNA;982421;982505;81;*;tac
;comp;tRNA;982587;982671;282;*;tac
fin;;CDS;982954;984048;;;
deb;;CDS;997215;999218;137;*;
;;ncRNA;999356;999452;132;*;
fin;;CDS;999585;1000319;;0;
deb;comp;CDS;1081601;1082191;116;*;
;comp;regulatory;1082308;1082397;266;*;
fin;comp;CDS;1082664;1083668;;;
deb;;CDS;1124121;1124570;144;*;
;;tRNA;1124715;1124802;457;*;tcc
fin;;CDS;1125260;1126897;;;
deb;comp;CDS;1170475;1170882;597;*;
;;regulatory;1171480;1171660;113;*;
fin;;CDS;1171774;1173375;;0;
deb;comp;CDS;1176029;1176982;364;*;
;;misc_f;1177347;1177484;54;*;
fin;;CDS;1177539;1178435;;;
deb;;CDS;1417803;1418141;179;*;
;;tRNA;1418321;1418397;32;*;gtc
;;tRNA;1418430;1418506;95;*;gtc
fin;comp;CDS;1418602;1419771;;;
deb;comp;CDS;1803089;1803247;528;*;
;;regulatory;1803776;1803877;118;*;
fin;;CDS;1803996;1805372;;0;
deb;comp;CDS;1984514;1987390;736;*;
;comp;tRNA;1988127;1988202;10;*;ggc
;comp;tRNA;1988213;1988299;76;*;tta
;comp;tRNA;1988376;1988451;20;*;ggc
;comp;tRNA;1988472;1988545;390;*;tgc
fin;comp;CDS;1988936;1989493;;;
deb;;CDS;2000638;2000763;-54;*;
;;misc_f;2000710;2000813;125;*;
fin;;CDS;2000939;2002516;;;
deb;comp;CDS;2157175;2158164;-12;*;
;comp;regulatory;2158153;2158286;173;*;
fin;;CDS;2158460;2159353;;0;
deb;comp;CDS;2161464;2163494;587;*;
;;tRNA;2164082;2164157;327;*;aac
fin;;CDS;2164485;2165063;;;
deb;;CDS;2191631;2193439;153;*;
;;tRNA;2193593;2193683;168;*;tca
fin;comp;CDS;2193852;2194760;;0;
deb;comp;CDS;2547201;2547656;227;*;
;comp;tRNA;2547884;2547960;56;*;atgf
;comp;tRNA;2548017;2548100;15;*;ctc
fin;comp;CDS;2548116;2548454;;;
deb;comp;CDS;2651265;2651522;569;*;
;comp;tRNA;2652092;2652168;56;*;cgt
;comp;tRNA;2652225;2652301;57;*;cgt
;comp;tRNA;2652359;2652435;57;*;cgt
;comp;tRNA;2652493;2652569;57;*;cgt
;comp;tRNA;2652627;2652703;57;*;cgt
;comp;tRNA;2652761;2652837;56;*;cgt
;comp;tRNA;2652894;2652970;210;*;cgt
;comp;tRNA;2653181;2653257;31;*;cgt
;comp;tRNA;2653289;2653380;243;*;agc
deb;comp;CDS;2653624;2653689;11;*;
;comp;tRNA;2653701;2653777;31;*;cgt
;comp;tRNA;2653809;2653900;243;*;agc
fin;comp;CDS;2654144;2654341;;;
deb;;CDS;2699087;2699395;8;*;
;;ncRNA;2699404;2699588;4;*;
fin;;CDS;2699593;2700186;;;
deb;;CDS;2734457;2735596;100;*;
;;tRNA;2735697;2735772;64;*;ttc
;;tRNA;2735837;2735912;7;*;aca
;;tRNA;2735920;2735995;70;*;ttc
;;tRNA;2736066;2736141;71;*;aac
;;tRNA;2736213;2736288;7;*;aca
;;tRNA;2736296;2736371;43;*;ttc
;;tRNA;2736415;2736490;272;*;aac
deb;;CDS;2736763;2738388;234;*;
;;tRNA;2738623;2738698;51;*;ttc
;;tRNA;2738750;2738825;21;*;aca
;;tRNA;2738847;2738922;39;*;aac
;;tRNA;2738962;2739037;15;*;aca
;;tRNA;2739053;2739128;135;*;aac
deb;comp;CDS;2739264;2740697;565;*;
;comp;tRNA;2741263;2741339;31;*;gac
;comp;rRNA;2741371;2741487;57;*;117
;comp;tRNA;2741545;2741620;100;*;acc
;comp;rRNA;2741721;2741836;91;*;116
;comp;rRNA;2741928;2744818;264;*;2891
;comp;tRNA;2745083;2745158;41;*;gca
;comp;tRNA;2745200;2745276;65;*;atc
;comp;rRNA;2745342;2746894;487;*;1553
fin;comp;CDS;2747382;2748635;;;
deb;;CDS;2754342;2755625;302;*;
;comp;tRNA;2755928;2756012;190;*;ttg
fin;comp;CDS;2756203;2756868;;0;
deb;comp;CDS;2838215;2839336;326;*;
;;regulatory;2839663;2839841;102;*;
fin;;CDS;2839944;2841296;;0;
deb;;CDS;2847001;2847189;456;*;
;comp;tRNA;2847646;2847722;68;*;tgg
;comp;tRNA;2847791;2847867;30;*;gac
;comp;rRNA;2847898;2848013;91;*;116
;comp;rRNA;2848105;2850995;265;*;2891
;comp;tRNA;2851261;2851336;89;*;gaa
;comp;rRNA;2851426;2852978;575;*;1553
fin;comp;CDS;2853554;2854333;;;
deb;;CDS;2985737;2986864;620;*;
;comp;tRNA;2987485;2987561;56;*;atgf
;comp;tRNA;2987618;2987693;18;*;ggc
;comp;tRNA;2987712;2987788;35;*;atgf
;comp;tRNA;2987824;2987899;50;*;ggc
;comp;tRNA;2987950;2988025;49;*;ggc
;comp;tRNA;2988075;2988150;49;*;ggc
;comp;tRNA;2988200;2988275;30;*;ggc
;comp;tRNA;2988306;2988382;55;*;atgf
;comp;tRNA;2988438;2988513;30;*;ggc
;comp;tRNA;2988544;2988620;39;*;atgf
;comp;tRNA;2988660;2988735;19;*;ggc
;comp;tRNA;2988755;2988831;35;*;atgf
;comp;tRNA;2988867;2988942;156;*;ggc
fin;comp;CDS;2989099;2989644;;0;
deb;;CDS;3060116;3060827;96;*;
;comp;tRNA;3060924;3061000;68;*;tgg
;comp;tRNA;3061069;3061145;30;*;gac
;comp;rRNA;3061176;3061291;91;*;116
;comp;rRNA;3061383;3064273;264;*;2891
;comp;tRNA;3064538;3064613;14;*;gta
;comp;tRNA;3064628;3064703;32;*;gca
;comp;tRNA;3064736;3064811;2;*;aaa
;comp;tRNA;3064814;3064889;89;*;gaa
;comp;rRNA;3064979;3066531;319;*;1553
;comp;rRNA;3066851;3066966;91;*;116
;comp;rRNA;3067058;3069948;277;*;2891
;comp;rRNA;3070226;3071778;817;*;1553
fin;comp;CDS;3072596;3074731;;;
deb;comp;CDS;3103806;3104990;103;*;
;comp;tRNA;3105094;3105169;13;*;acc
;comp;tRNA;3105183;3105257;35;*;gga
;comp;tRNA;3105293;3105377;36;*;tac
;comp;tRNA;3105414;3105489;206;*;aca
fin;;CDS;3105696;3106619;;0;
deb;;CDS;3109235;3110575;497;*;
;comp;tRNA;3111073;3111149;30;*;gac
;comp;rRNA;3111180;3111295;91;*;116
;comp;rRNA;3111387;3114277;277;*;2891
;comp;rRNA;3114555;3116107;317;*;1553
;comp;rRNA;3116425;3116540;91;*;116
;comp;rRNA;3116632;3119522;277;*;2891
;comp;rRNA;3119800;3121352;556;*;1553
fin;;CDS;3121909;3122364;;1;
deb;comp;CDS;3123914;3125749;55;*;
;comp;regulatory;3125805;3126005;184;*;
fin;;CDS;3126190;3127299;;0;
deb;;CDS;3173798;3174979;964;*;
;comp;tRNA;3175944;3176034;69;*;tca
;comp;rRNA;3176104;3176219;91;*;116
;comp;rRNA;3176311;3179204;264;*;2894
;comp;tRNA;3179469;3179544;41;*;gca
;comp;tRNA;3179586;3179662;65;*;atc
;comp;rRNA;3179728;3181280;472;*;1553
fin;comp;CDS;3181753;3182466;;;
deb;comp;CDS;3213224;3215164;168;*;
;comp;regulatory;3215333;3215431;61;*;
fin;comp;CDS;3215493;3215876;;0;
deb;;CDS;3216111;3217093;93;*;
;comp;tRNA;3217187;3217263;30;*;gac
;comp;rRNA;3217294;3217409;91;*;116
;comp;rRNA;3217501;3220391;319;*;2891
;comp;tRNA;3220711;3220786;30;*;gta
;comp;tRNA;3220817;3220892;2;*;aaa
;comp;tRNA;3220895;3220970;89;*;gaa
;comp;rRNA;3221060;3222612;496;*;1553
fin;;CDS;3223109;3223657;;0;
&lt;/pre&gt;

=====vpb2 autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb2_autres_intercalaires_aas|vpb2 autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;vpb2;;;;;
deb;comp;CDS;126972;127829;96;*;
;comp;regulatory;127926;128033;312;*;
fin;;CDS;128346;129731;;;
deb;;CDS;131915;132439;468;*;
;;rRNA;132908;134460;89;*;1553
;;tRNA;134550;134625;2;*;gaa
;;tRNA;134628;134703;16;*;aaa
;;tRNA;134720;134795;14;*;gca
;;tRNA;134810;134885;263;*;gta
;;rRNA;135149;138041;91;*;2893
;;rRNA;138133;138248;69;*;116
;;tRNA;138318;138408;501;*;tca
fin;comp;CDS;138910;139266;;;
deb;comp;CDS;192242;192853;32;*;
;comp;tRNA;192886;192969;563;*;ctc
fin;;CDS;193533;194741;;0;
deb;;CDS;590953;591906;24;*;
;comp;tRNA;591931;592021;329;*;tca
fin;;CDS;592351;593031;;0;
deb;comp;CDS;1006811;1008613;843;*;
;comp;tRNA;1009457;1009530;73;*;tgc
;comp;tRNA;1009604;1009690;678;*;tta
fin;;CDS;1010369;1012618;;0;
deb;comp;CDS;1019688;1021211;356;*;
;comp;tRNA;1021568;1021641;73;*;tgc
;comp;tRNA;1021715;1021801;537;*;tta
fin;;CDS;1022339;1023970;;;
deb;comp;CDS;1028849;1029751;221;*;
;comp;tRNA;1029973;1030048;3;*;ggc
;comp;tRNA;1030052;1030125;222;*;tgc
fin;comp;CDS;1030348;1031802;;;
deb;comp;CDS;1124360;1124878;314;*;
;;tRNA;1125193;1125267;34;*;gga
fin;comp;CDS;1125302;1126159;;;
deb;;CDS;1291846;1292463;104;*;
;;regulatory;1292568;1292708;113;*;
fin;;CDS;1292822;1293478;;;
deb;;CDS;1311512;1311652;298;*;
;;regulatory;1311951;1312050;89;*;
fin;;CDS;1312140;1313153;;;
deb;;CDS;1632173;1633153;424;*;
;;regulatory;1633578;1633682;100;*;
fin;;CDS;1633783;1635246;;0;
&lt;/pre&gt;

===Escherichia albertii===
====eal opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_opérons|eal opérons]]
&lt;pre&gt;
49.6%GC;10.3.19 Paris;16s   7;89;doubles;intercalaires
Escherichia albertii;;;;;
;219063..219144;;tac;+;212
;219357..219438;;tac;2 tac;
;;;;;
;413135..413219;;tcc;;
;;;;;
;462888..462972;;tca;;
;;;;;
comp;489120..489191;;gga;;6
comp;489198..489270;;aca;;
;;;;;
;615149..615233;;tcc;;
;;;;;
comp;756823..756895;;aaa;+;5
comp;756901..756973;;gta;3 aaa ;48
comp;757022..757094;;aaa;2 gta;5
comp;757100..757172;;gta;;48
comp;757221..757293;;aaa;;
;;;;;
;834529..834602;;atgj;+;10
;834613..834694;;cta;2atgj ;26
;834721..834792;;caa;2caa ;37
;834830..834901;;caa;2 cag;18
;834920..834993;;atgj;;51
;835045..835116;;cag;;35
;835152..835223;;cag;;
;;;;;
comp;968958..969031;;aga;;
;;;;;
comp;1192416..1192488;;acg;;
;;;;;
comp;1269526..1269599;;gac;;
;;;;;
comp;1277040..1277113;;gac;;52
comp;1277166..1277285;;5s;@1;169
comp;1277455..1280377;;23s;;186
comp;1280564..1280636;;gca;;45
comp;1280682..1280755;;atc;;70
comp;1280826..1282367;;16s;;
;;;;;
;1567231..1567314;;ctg;+;31
;1567346..1567429;;ctg;3 ctg;35
;1567465..1567548;;ctg;;
;;;;;
comp;1657309..1657390;;ttg;;
;;;;;
comp;1765401..1765473;;ggc;+;159
comp;1765633..1765705;;ggc;2 ggc;
;;;;;
;1795516..1795588;;ttc;;
;;;;;
comp;2006002..2006121;;5s;;169
comp;2006291..2009214;;23s;;186
comp;2009401..2009473;;gca;;45
comp;2009519..2009592;;atc;;70
comp;2009663..2011202;;16s;;
;;;;;
comp;2042057..2043241;;tuf1;CDS 1185pb;117
comp;2043359..2043431;;acc;;9
comp;2043441..2043512;;gga;;119
comp;2043632..2043713;;tac;;11
comp;2043725..2043797;;aca;@3;
;;;;;
comp;2047429..2047548;;5s;;169
comp;2047718..2050648;;23s;;186
comp;2050835..2050907;;gca;;45
comp;2050953..2051026;;atc;;68
comp;2051095..2052636;;16s;;
;;;;;
comp;2208305..2208424;;5s;@2;169
comp;2208594..2211517;;23s;;198
comp;2211716..2211788;;gaa;;85
comp;2211874..2213418;;16s;;
;;;;;
comp;2267554..2267627;;cca;;43
comp;2267671..2267754;;ctg;;23
comp;2267778..2267850;;cac;;61
comp;2267912..2267985;;cgg;;
;;;;;
comp;2305358..2305430;;tgg;;11
comp;2305442..2305515;;gac;;52
comp;2305568..2305687;;5s;;169
comp;2305857..2308779;;23s;;198
comp;2308978..2309050;;gaa;;85
comp;2309136..2310676;;16s;;
;;;;;
comp;2426158..2426248;;tga;;
;;;;;
;2556305..2556378;;ccg;;
;;;;;
;2810766..2812307;;16s;;85
;2812393..2812465;;gaa;;198
;2812664..2815586;;23s;;169
;2815756..2815875;;5s;;151
;2816027..2816099;;acc;;40
;2816140..2816259;;5s;;
;;;;;
;2911129..2911212;;ctc;;
;;;;;
; 2913088..2913161;;atgf;;
;;;;;
comp;3010332..3010404;;atgi;;
;;;;;
comp;3177717..3177789;;ttc;;
;;;;;
;3301617..3301687;;ggg;;
;;;;;
comp;3366868..3366941;;atgf;+;37
comp;3366979..3367052;;atgf;3 atgf;37
comp;3367090..3367163;;atgf;;
;;;;;
;3469914..3470003;;agc;;6
;3470010..3470083;;cgt;+;201
;3470285..3470358;;cgt;3 cgt;200
; 3470559..3470632;;cgt;;
;;;;;
;3505321..3505393;;atgi;;
;;;;;
;3563056..3564598;;16s;;85
;3564684..3564756;;gaa;;198
;3564955..3567876;;23s;;169
;3568046..3568165;;5s;;
;;;;;
comp;3779750..3779822;;aaa;;7
comp;3779830..3779902;;gta;+;47
comp;3779950..3780022;;gta;2 gta;
;;;;;
;3782718..3782790;;gcc;+;42
;3782833..3782905;;gcc;2 gcc;
;;;;;
comp;3810369..3810440;;agg;;
;;;;;
comp;3993500..3993573;;ccc;;
;;;;;
comp;4232176..4232248;;aac;;
;;;;;
;4233996..4234068;;aac;;
;;;;;
comp;4242952..4243024;;aac;;
;;;;;
comp;4248342..4248414;;aac;;
;;;;;
;4249406..4249492;;tcg;;
;;;;;
;4256696..4256768;;atgi;;100
;4256869..4256942;;aga;;
;;;;;
;4317980..4318052;;ggc;;56
;4318109..4318179;;tgc;;14
;4318194..4318277;;tta;;
;;;;;
comp;4556753..4556826;;gtc;+;7
comp;4556834..4556907;;gtc;2 gtc;
&lt;/pre&gt;

====eal cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_cumuls|eal cumuls]]
&lt;pre&gt;
eal cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;7;1;0;-;1;;1;;100;
;16 23 5s 0;0;20;11;;50;;20;;200;
;16 atc gca;3;40;8;;100;;40;;300;
;16 23 5s a;0;60;7;;150;;60;;400;
;max a;3;80;1;;200;;80;;500;
;a doubles;0;100;1;;250;;100;;600;
;spéciaux;4;120;1;;300;;120;;700;
;total aas;13;140;0;;350;;140;;800;
sans ;opérons;38;160;1;;400;;160;;900;
;1 aa;23;180;0;;450;;180;;1000;
;max a;7;200;1;;500;;200;;1100;
;a doubles;10;;2;;;;;;;
;total aas;71;;33;0;;0;;0;;0
total aas;;84;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;53;;;;;;;
;;;variance;59;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;;;;;;;;
;;;variance;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====eal blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_blocs|eal blocs]]
&lt;pre&gt;
eal blocs;;;
16s;70;70;68
atc;45;45;45
gca;186;186;186
23s;169;169;169
5s;52;;
gac;;;
;;;
16s;85;85;85
gaa;198;198;198
23s;169;169;169
5s;52;;
gac;;;
;;;
16s;85;;
gaa;198;;
23s;169;;
5s;151;;
acc;40;;
5s;;;
&lt;/pre&gt;
====eal distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_distribution|eal distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;2;tct;;tat;;atgf;1;atgi 2a+&gt;a;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;atgi 2a+&gt;a;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;atgi 2a+&gt;a;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;;gta2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;gta2;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;gta2;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;4;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;ctg3;atc;;acc;;aac;;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;tac2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;tac2;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;2;tac2;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;1;caa2;tta;1;tca;;taa;;tga;;caa2;tta;;tca;;taa;;tga;;caa2;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;cag2;ata;;aca;2;aaa;4;aga;1;cag2;ata;;aca;;aaa;;aga;;cag2;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;atgf3;cta;1;cca;1;caa;;cga;;atgf3;cta;;cca;;caa;2;cga;;atgf3;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;cgt3;gta;2;gca;;gaa;;gga;2;cgt3;gta;2;gca;;gaa;;gga;;cgt3;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;ggc2;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc2;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc2;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;3;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;aaa (gta aaa)2;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
eal;;23;;;;;23;;eal;25;;;;;;25;;eal;23;;;;;;23;;eal;;;;4;;;4
&lt;/pre&gt;
====eal données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_données_intercalaires|eal données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;eal;fx;fc;eal;fx40;fc40;eal;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;12;18;0;12;18;-1;0;157;158;376;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;
;0;10;45;323;1;5;35;-2;4;0;294;233;2* 70;;atc;212;;tac
1;1;20;26;264;2;8;39;-3;0;0;162;276;68;;atc;**;;tac
;0;30;28;126;3;10;50;-4;39;250;479;441;4* 85;;gaa;6;;gga
1;0;40;60;94;4;4;29;-5;0;0;284;601;tRNA 23s;;;**;;aca
2;1;50;80;91;5;1;17;-6;2;0;170;156;3* 186;;gca;5;;aaa
3;0;60;55;106;6;4;15;-7;2;13;164;256;4* 198;;gaa;48;;gta
;0;70;43;83;7;2;18;-8;1;58;223;248;5s tRNA;;;5;;aaa
2;1;80;31;75;8;3;18;-9;3;0;114;17;2* 52;;gac;48;;gta
;0;90;42;75;9;3;47;-10;2;6;437;41;151;;acc;**;;aaa
2;3;100;38;74;10;5;55;-11;0;37;132;195;tRNA 5s;;;10;;atgj
1;3;110;40;77;11;2;42;-12;1;0;165;272;40;;acc;26;;cta
1;3;120;27;61;12;2;36;-13;0;2;189;120;tRNA tRNA;intra;;37;;caa
1;1;130;37;57;13;2;19;-14;10;17;189;37;3* 45;;atc gca;18;;caa
1;1;140;33;55;14;1;47;-15;1;0;210;92;tRNA tRNA;contig;;51;;atgj
;3;150;34;50;15;6;26;-16;2;2;106;184;11;;tgg;35;;cag
1;2;160;38;45;16;3;25;-17;3;8;117;347;**;;gac;**;;cag
1;5;170;26;31;17;3;18;-18;2;0;150;59;;;;31;;ctg
;0;180;24;37;18;4;14;-19;1;5;102;125;;;;35;;ctg
1;2;190;43;31;19;1;17;-20;2;10;167;78;;;;**;;ctg
1;2;200;21;30;20;2;20;-21;0;0;398;237;;;;159;;ggc
;2;210;24;30;21;2;18;-22;1;1;91;510;;;;**;;ggc
;0;220;36;33;22;3;18;-23;1;7;408;367;;;;9;;acc
;1;230;21;23;23;0;11;-24;3;0;14;235;;;;119;;gga
3;0;240;13;19;24;3;17;-25;2;4;203;135;;;;11;;tac
2;0;250;15;25;25;4;9;-26;4;6;200;243;;;;**;;aca
1;0;260;19;27;26;5;7;-27;1;0;105;102;;;;43;;cca
;0;270;18;25;27;2;12;-28;1;3;144;58;;;;23;;ctc
2;0;280;14;22;28;5;4;-29;2;6;345;162;;;;61;;cac
;2;290;10;23;29;3;8;-30;3;0;315;71;;;;**;;cgg
1;1;300;7;19;30;1;22;-31;1;2;283;324;;;;37;;atgf
;0;310;11;16;31;6;8;-32;0;5;150;41;;;;37;;atgf
;1;320;15;10;32;4;7;-33;2;0;123;93;;;;**;;atgf
1;0;330;13;12;33;3;11;-34;1;0;192;55;;;;6;;agc
;0;340;9;5;34;5;10;-35;1;5;74;298;;;;201;;cgt
1;1;350;3;12;35;3;8;-36;0;0;100;;;;;200;;cgt
;0;360;6;14;36;6;11;-37;0;0;655;;;;;**;;cgt
1;0;370;13;8;37;5;11;-38;1;2;100;;;;;7;;aaa
1;0;380;15;10;38;11;9;-39;2;0;49;;;;;47;;gta
;0;390;10;3;39;14;9;-40;0;1;502;;;;;**;;gta
;1;400;8;9;40;3;10;-41;2;2;151;;;;;42;;gcc
3;5;reste;122;138;reste;1014;1461;-42;0;0;111;;;;;**;;gcc
35;42;total;1185;2286;total;1185;2286;-43;0;2;CDS 16s;;;;;100;;atgi
32;37;diagr;1051;2130;diagr;159;807;-44;0;1;364;339;;;;**;;aga
1;1;t30;99;713;;;;-45;0;0;370;477;;;;56;;ggc
;;;;;;;;-46;1;1;161;467;;;;14;;tgc
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;2;0;;264;;;;**;;tta
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;3;0;23s 5s;;;;;7;;gtc
;x;1173;119;12;1304;;;-49;2;0;7* 169;;;;;**;;gtc
;c;2268;617;18;2903;;;-50;1;0;5s CDS;;;;;;;
;;;;;4207;537;;reste;7;4;300;113;;;;;;
;;;;;;4744;;total;119;617;56;98;;;;;;
;;;;;;;;;;;;460;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====eal autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_autres_intercalaires_aas|eal autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;eal;;;;;
deb;;CDS;1006;1392;99;*;
;comp;gene;1492;5941;-3070;*;
fin;;CDS;2872;2988;;;
deb;;CDS;3611;3976;-366;*;
;;mobile_el;3611;4839;-906;*;
fin;;CDS;3934;4839;;;
deb;;CDS;14985;15332;-348;*;
;;mobile_el;14985;16921;-1540;*;
;;gene;15382;16569;549;*;
fin;;CDS;17119;18501;;;
deb;comp;CDS;34568;34681;26;*;
;;gene;34708;38448;-4;*;
fin;;CDS;38445;39989;;;
deb;comp;CDS;99647;99793;-25;*;
;;gene;99769;99909;51;*;
fin;;CDS;99961;100896;;0;
deb;comp;CDS;102850;103833;195;*;
;;gene;104029;105320;30;*;
fin;comp;CDS;105351;105914;;0;
deb;;CDS;191840;192184;85;*;
;comp;gene;192270;193340;282;*;
fin;comp;CDS;193623;194339;;0;
deb;;CDS;199369;199794;-426;*;
;;mobile_el;199369;201785;-1995;*;
fin;;CDS;199791;200141;;;
deb;;CDS;218062;218904;158;*;
;;tRNA;219063;219144;212;*;tac
;;tRNA;219357;219438;376;*;tac
fin;comp;CDS;219815;220912;;;
deb;comp;CDS;239027;239722;104;*;
;comp;gene;239827;239964;271;*;
fin;;CDS;240236;241336;;0;
deb;comp;CDS;242534;244144;22;*;
;comp;gene;244167;244856;122;*;
deb;;CDS;244979;245305;-327;*;
;;mobile_el;244979;246192;-891;*;
fin;;CDS;245302;246192;;0;
deb;;CDS;277602;278456;130;*;
;;gene;278587;280453;49;*;
fin;comp;CDS;280503;280757;;0;
deb;comp;CDS;285209;286279;9;*;
;comp;gene;286289;287587;329;*;
fin;;CDS;287917;289449;;0;
deb;comp;CDS;297458;298864;-1407;*;
;comp;mobile_el;297458;299261;-348;*;
fin;comp;CDS;298914;299261;;;
deb;comp;CDS;300053;300712;71;*;
;comp;gene;300784;300984;220;*;
fin;;CDS;301205;301894;;;
deb;comp;CDS;303386;307822;-3485;*;
;;repeat_reg;304338;304360;-23;*;
;;misc_f;304338;304432;-72;*;
;;repeat_reg;304361;304409;0;*;
;;repeat_reg;304410;304432;3985;*;
fin;;CDS;308418;308762;;;
deb;;CDS;309802;310167;-366;*;
;;mobile_el;309802;311030;-906;*;
fin;;CDS;310125;311030;;;
deb;;CDS;313323;313712;-232;*;
;;repeat_reg;313481;313501;-21;*;
;;misc_f;313481;313581;-93;*;
;;repeat_reg;313489;313509;-13;*;
;;repeat_reg;313497;313517;-16;*;
;;repeat_reg;313502;313520;-11;*;
;;repeat_reg;313510;313528;276;*;
fin;comp;CDS;313805;314563;;;
deb;comp;CDS;316137;316262;245;*;
;;gene;316508;316948;113;*;
fin;comp;CDS;317062;318312;;1;
deb;;CDS;332934;333359;-426;*;
;;mobile_el;332934;335350;-1995;*;
fin;;CDS;333356;333706;;;
deb;comp;CDS;411963;412901;233;*;
;;tRNA;413135;413219;276;*;tcc
fin;comp;CDS;413496;414182;;;
deb;;CDS;422060;426022;39;*;
;comp;gene;426062;426701;264;*;
fin;;CDS;426966;427097;;;
deb;comp;CDS;461328;462446;441;*;
;;tRNA;462888;462972;601;*;tca
fin;comp;CDS;463574;463717;;0;
deb;;CDS;463890;464255;-366;*;
;;mobile_el;463890;465118;-906;*;
fin;;CDS;464213;465118;;;
deb;comp;CDS;488610;488825;294;*;
;comp;tRNA;489120;489191;6;*;gga
;comp;tRNA;489198;489270;162;*;aca
fin;comp;CDS;489433;489567;;;
deb;comp;CDS;522240;523853;-1614;*;
;comp;mobile_el;522240;524454;-605;*;
;comp;gene;523850;524032;-4;*;
fin;comp;CDS;524029;524454;;;
deb;comp;CDS;545508;546056;180;*;
;comp;gene;546237;548084;260;*;
fin;comp;CDS;548345;552805;;;
deb;;CDS;590349;590696;-348;*;
;;mobile_el;590349;592284;-1539;*;
fin;;CDS;590746;592284;;0;
deb;comp;CDS;603716;607669;-1361;*;
;;repeat_reg;606309;606328;-20;*;
;;misc_f;606309;606445;-117;*;
;;repeat_reg;606329;606347;0;*;
;;repeat_reg;606348;606367;0;*;
;;repeat_reg;606368;606386;0;*;
;;repeat_reg;606387;606406;0;*;
;;repeat_reg;606407;606425;0;*;
;;repeat_reg;606426;606445;1358;*;
fin;comp;CDS;607804;608298;;0;
deb;;CDS;614451;614669;479;*;
;;tRNA;615149;615233;284;*;tcc
fin;;CDS;615518;615646;;0;
deb;;CDS;625353;625628;-276;*;
;;mobile_el;625353;626050;-504;*;
fin;;CDS;625547;626050;;;
deb;comp;CDS;660139;661350;273;*;
;;gene;661624;662214;34;*;
fin;comp;CDS;662249;662533;;0;
deb;;CDS;664227;664940;-14;*;
;comp;gene;664927;666254;7;*;
fin;comp;CDS;666262;668610;;;
deb;comp;CDS;730722;731225;-504;*;
;comp;mobile_el;730722;731371;-228;*;
fin;comp;CDS;731144;731419;;0;
deb;comp;CDS;747736;748551;79;*;
;comp;gene;748631;749979;68;*;
fin;comp;CDS;750048;750362;;0;
deb;comp;CDS;756185;756652;170;*;
;comp;tRNA;756823;756895;5;*;aaa
;comp;tRNA;756901;756973;48;*;gta
;comp;tRNA;757022;757094;5;*;aaa
;comp;tRNA;757100;757172;48;*;gta
;comp;tRNA;757221;757293;164;*;aaa
fin;comp;CDS;757458;758249;;;
deb;;CDS;782199;782768;47;*;
;;gene;782816;785265;13;*;
fin;;CDS;785279;786010;;;
deb;comp;CDS;797253;797513;3;*;
;comp;gene;797517;798173;1830;*;
fin;comp;CDS;800004;803876;;;
deb;;CDS;832389;834305;223;*;
;;tRNA;834529;834602;10;*;atgj
;;tRNA;834613;834694;26;*;cta
;;tRNA;834721;834792;37;*;caa
;;tRNA;834830;834901;18;*;caa
;;tRNA;834920;834993;51;*;atgj
;;tRNA;835045;835116;35;*;cag
;;tRNA;835152;835223;156;*;cag
fin;comp;CDS;835380;836555;;0;
deb;comp;CDS;849004;850455;-4;*;
;comp;gene;850452;851159;103;*;
fin;;CDS;851263;851817;;0;
deb;comp;CDS;957178;958083;-906;*;
;comp;mobile_el;957178;958406;-366;*;
fin;comp;CDS;958041;958406;;;
deb;comp;CDS;958518;960056;-1539;*;
;comp;mobile_el;958518;960453;-348;*;
deb;comp;CDS;960106;960453;867;*;
;;gene;961321;961434;545;*;
fin;;CDS;961980;962675;;;
deb;;CDS;966714;967040;-327;*;
;;mobile_el;966714;967930;-894;*;
;;gene;967037;967156;84;*;
;;gene;967241;967930;273;*;
fin;;CDS;968204;968368;;;
deb;;CDS;968555;968701;256;*;
;comp;tRNA;968958;969031;248;*;aga
fin;;CDS;969280;969912;;0;
deb;;CDS;1004964;1006640;32;*;
;;repeat_reg;1006673;1006697;-25;*;
;;misc_f;1006673;1006819;-122;*;
;;repeat_reg;1006698;1006733;0;*;
;;repeat_reg;1006734;1006758;0;*;
;;repeat_reg;1006759;1006794;0;*;
;;repeat_reg;1006795;1006819;21;*;
fin;comp;CDS;1006841;1008145;;0;
deb;comp;CDS;1031529;1033142;-1614;*;
;comp;mobile_el;1031529;1033944;-772;*;
fin;comp;CDS;1033173;1033523;;;
deb;;CDS;1122706;1123071;-366;*;
;;mobile_el;1122706;1123934;-906;*;
fin;;CDS;1123029;1123934;;1;
deb;;CDS;1143090;1144676;107;*;
;comp;gene;1144784;1144987;240;*;
fin;comp;CDS;1145228;1145341;;0;
deb;;CDS;1146049;1146696;709;*;
;comp;gene;1147406;1148787;9;*;
fin;comp;CDS;1148797;1149747;;;
deb;;CDS;1172631;1172978;-348;*;
;;mobile_el;1172631;1174566;-1539;*;
fin;;CDS;1173028;1174566;;;
deb;;CDS;1177520;1178338;1243;*;
;;gene;1179582;1179752;41;*;
deb;comp;CDS;1179794;1180537;535;*;
;;gene;1181073;1182912;-1531;*;
deb;;CDS;1181382;1181747;-366;*;
;;mobile_el;1181382;1182610;-906;*;
fin;;CDS;1181705;1182610;;;
deb;;CDS;1183247;1186789;359;*;
;comp;gene;1187149;1187571;12;*;
deb;comp;CDS;1187584;1188423;-840;*;
;comp;mobile_el;1187584;1188752;-303;*;
fin;comp;CDS;1188450;1188752;;;
deb;;CDS;1191235;1192398;17;*;
;comp;tRNA;1192416;1192488;114;*;acg
fin;comp;CDS;1192603;1193856;;;
deb;comp;CDS;1206541;1207404;12;*;
;comp;gene;1207417;1208120;20;*;
fin;comp;CDS;1208141;1208605;;;
deb;comp;CDS;1220100;1220765;82;*;
;comp;gene;1220848;1221270;186;*;
fin;;CDS;1221457;1222881;;0;
deb;comp;CDS;1268423;1269088;437;*;
;comp;tRNA;1269526;1269599;132;*;gac
fin;comp;CDS;1269732;1270472;;0;
deb;comp;CDS;1276071;1276874;165;*;
;comp;tRNA;1277040;1277113;52;*;gac
;comp;rRNA;1277166;1277285;169;*;120
;comp;rRNA;1277455;1280377;186;*;2923
;comp;tRNA;1280564;1280636;45;*;gca
;comp;tRNA;1280682;1280755;70;*;atc
;comp;rRNA;1280826;1282367;364;*;1542
fin;comp;CDS;1282732;1283304;;0;
deb;comp;CDS;1465720;1466553;419;*;
;;gene;1466973;1468487;30;*;
fin;;CDS;1468518;1469660;;;
deb;comp;CDS;1480677;1481042;22;*;
;comp;gene;1481065;1481979;65;*;
fin;comp;CDS;1482045;1482995;;;
deb;;CDS;1544994;1546253;128;*;
;comp;gene;1546382;1546600;181;*;
fin;comp;CDS;1546782;1547699;;;
deb;;CDS;1554556;1554981;-426;*;
;;mobile_el;1554556;1556972;-1995;*;
fin;;CDS;1554978;1555328;;;
deb;comp;CDS;1561637;1562476;-840;*;
;comp;mobile_el;1561637;1562805;-303;*;
fin;comp;CDS;1562503;1562805;;;
deb;;CDS;1566010;1567041;189;*;
;;tRNA;1567231;1567314;31;*;ctg
;;tRNA;1567346;1567429;35;*;ctg
;;tRNA;1567465;1567548;41;*;ctg
fin;comp;CDS;1567590;1567892;;0;
deb;;CDS;1589588;1591177;-4;*;
;;gene;1591174;1592536;227;*;
fin;;CDS;1592764;1593105;;0;
deb;;CDS;1595539;1595655;142;*;
;comp;gene;1595798;1596613;86;*;
fin;;CDS;1596700;1598196;;;
deb;comp;CDS;1617593;1617817;51;*;
;comp;gene;1617869;1619230;24;*;
deb;comp;CDS;1619255;1620574;15;*;
;comp;gene;1620590;1621672;318;*;
fin;;CDS;1621991;1623061;;;
deb;;CDS;1643482;1644588;269;*;
;;gene;1644858;1645271;9;*;
fin;comp;CDS;1645281;1645400;;0;
deb;;CDS;1646137;1646484;-348;*;
;;mobile_el;1646137;1648072;-1539;*;
fin;;CDS;1646534;1648072;;;
deb;;CDS;1648204;1648569;-366;*;
;;mobile_el;1648204;1649432;-906;*;
fin;;CDS;1648527;1649432;;;
deb;;CDS;1652275;1652700;434;*;
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;;mobile_el;1653135;1654347;-891;*;
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&lt;/pre&gt;

===Escherichia coli===
====eco opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_opérons|eco opérons]]
&lt;pre&gt;
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655;;;;;;;
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;228756..228875;;5s;@1;52;« ;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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;;;;;;;
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comp;3427076..3427152;;atc;;68;ileU;[https://biocyc.org/gene?orgid=ECOLI&amp;id=EG30044]
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;;;;;;;
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comp;4606315..4606401;;ctg;;;« ;
&lt;/pre&gt;
====eco cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_cumuls|eco cumuls]]
&lt;pre&gt;
eco cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;7;1;0;-;1;;1;;100;
;16 23 5s 0;0;20;11;;50;;20;;200;
;16 atc gca;3;40;10;;100;;40;;300;
;16 23 5s a;0;60;6;;150;;60;;400;
;max a;3;80;1;;200;;80;;500;
;a doubles;0;100;0;;250;;100;;600;
;spéciaux;4;120;1;;300;;120;;700;
;total aas;14;140;2;;350;;140;;800;
sans ;opérons;36;160;2;;400;;160;;900;
;1 aa;23;180;0;;450;;180;;1000;
;max a;7;200;2;;500;;200;;1100;
;a doubles;10;;1;;;;;;;
;total aas;72;;36;0;;0;;0;;0
total aas;;86;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;57;;;;;;;
;;;variance;60;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;;;;;;;;
;;;variance;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====eco cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_cds|eco cds]]
&lt;pre&gt;
les CDS eco pour opérons;;;;;;;;;
clusters;6.8.19 Paris ;;;interca;cdsa;promoteur;terminateur;notes;
;222833..223408;;cds;362;192;sigma FIS;;;
;223771..225312;;16s;68;;;;;
;225381..225457;;atc;42;;;;;
;225500..225575;;gca;183;;;;;
;225759..228662;;23s;93;;;;;
;228756..228875;;5s;52;;;;;
;228928..229004;;gac;162;;Terminateur;+ sigma;;
;229167..229970;;cds;;268;;;;
;;;;;;;;;
comp;2724448..2725746;;cds;322;433;rien;début opéron ;rien;
comp;2726069..2726188;;5s;92;;;;;
comp;2726281..2729184;;23s;184;;;;;
comp;2729369..2729444;;gaa;171;;;;;
comp;2729616..2731157;;16s;442;;sigma FIS;;;
comp;2731600..2734173;;cds;;858;;;;
;;;;;;;;;
;3422436..3423194;;cds;228;253;Terminateur;fin opéron ;rien;
comp;3423423..3423542;;5s;37;;;;;
comp;3423580..3423655;;acc;12;;;;;
comp;3423668..3423787;;5s;92;;;;;
comp;3423880..3426783;;23s;174;;;;;
comp;3426958..3427033;;gca;42;;;;;
comp;3427076..3427152;;atc;68;;;;;
comp;3427221..3428762;;16s;473;;sigma FIS;;;
;3429236..3429790;;cds;;185;;;;
;;;;;;;;;
comp;3940635..3941327;;cds;480;231;sigma FIS;;;
;3941808..3943349;;16s;85;;;;;
;3943435..3943510;;gaa;193;;;;;
;3943704..3946607;;23s;92;;;;;
;3946700..3946819;;5s;52;;;;;
;3946872..3946948;;gac;8;;;;;
;3946957..3947032;;tgg;95;;Terminateur;fin opéron ;rien;
comp;3947128..3947967;;cds;;280;;;;
;;;;;;;;;
;4034608..4035153;;cds;377;182;Sigma Lrp-leu;;;
;4035531..4037072;;16s;68;;;;;
;4037141..4037217;;atc;42;;;;;
;4037260..4037335;;gca;183;;;;;
;4037519..4040423;;23s;93;;;;;
;4040517..4040636;;5s;228;;;;;
;4040865..4040900;;rprg;5;;pas de Term;fin opéron ;rien;
comp;4040906..4041433;;cds;;176;;;;
;;;;;;;;;
;4165428..4166285;;cds;373;286;Sigma Lrp-leu;;;
;4166659..4168200;;16s;171;;;;;
;4168372..4168447;;gaa;193;;;;;
;4168641..4171544;;23s;92;;;;;
;4171637..4171756;;5s;300;;Terminateur;début opéron ;rien;
;4172057..4173085;;cds;;343;;;;
;;;;;;;;;
comp;4205943..4207532;;cds;614;530;sigma FIS;;;
;4208147..4209688;;16s;85;;;;;
;4209774..4209849;;gaa;193;;;;;
;4210043..4212946;;23s;93;;;;;
;4213040..4213159;;5s;74;;Terminateur;début opéron ;rien;
;4213234..4213617;;cds;;128;;;;
;;;;;;;;;
;695101..696276;;cds;31;392;;;;
comp;696308..696378;;rprg;51;;Terminateur;fin opéron;rien;
comp;696430..696504;;cag;37;;;;;
comp;696542..696616;;cag;47;;;;;
comp;696664..696740;;atg;15;;;;;
comp;696756..696830;;caa;34;;;;;
comp;696865..696939;;caa;23;;;;;
comp;696963..697047;;cta;9;;;;;
comp;697057..697133;;atg;379;;sigma FIS;fin opéron;rien;
comp;697513..699177;;cds;;555;;;;
;;;;;;;;;
;779598..780389;;cds;164;264;sigma FIS;fin opéron;rien;
;780554..780629;;aaa;135;;;;;
;780765..780840;;gta;2;;;;;
;780843..780918;;aaa;149;;;;;
;781068..781143;;gta;3;;;;;
;781147..781222;;aaa;146;;;;;
;781369..781444;;aaa;132;;;;;
;781577..781652;;aaa;432;;Terminateur;début opéron;NadR pas sigma;
;782085..783128;;cds;;348;;;;
;;;;;;;;;
;1286709..1286984;;cds;81;92;Terminateur;;;
comp;1287066..1287236;;ncRNA;-150;;;;;
comp;1287087..1287176;;tpr ;67;30;;;;
comp;1287244..1287328;;tac;209;;;;;
comp;1287538..1287622;;tac;159;;sigma FIS;;;
comp;1287782..1288624;;cds;;281;;;;
;;;;;;;;;
solitaires;;;;promoteur;terminateur;interc avant;interc après;protéines;lien
;236931..237007;;gac;sigma FIS;Term 1;133;328;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=228513/245425]
;262871..262946;;acg;sigma FIS;rien;115;204;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=262297/263521]
;564723..564799;;aga;sigma FIS;rien;243;16;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=564149/565373]
comp;925884..925971;;InfA-tcc;sigma FIS;Term 1;344;254;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=EG30096&amp;chromosome=COLI-K12]
comp;1031625..1031712;;tca;sigma FIS;Term 2;207;427;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=1023213/1040125]
comp;1097565..1097652;;tcc;sigma FIS;Term 4;736;234;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=1089153/1106065]
comp;2043468..2043557;;tcg;sigma -;Term 1;570;94;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2035057/2051969]
;2044549..2044624;;aac;sigma -;Term 1;101;314;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2036131/2053043]
comp;2058027..2058102;;aac;sigma -;Term 1;453;101;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2049609/2066521]
; 2059851..2059926;;aac;sigma -;Term 1;5;38;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2051433/2068345]
;2062260..2062335;;aac;sigma NtrC;rien;327;56;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2053842/2070754]
;2286211..2286287;;ccc;sigma FIS;Term 1;75;103;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2277793/2294705]
;2466309..2466383;;agg;sigma -;Term 1;76;162;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2457890/2474802]
comp;2785762..2785837;;atgi;rien;rien;410;-37;évidence faible1;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2777344/2794256]
comp;2998984..2999057;;ggg;sigma FIS;rien;156;79;évidence faible;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=2990565/3007477]
;3110366..3110441;;ttc;sigma FIS;Term 1;106;149;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3101948/3118860]
;3215598..3215673;;atgi;sigma -;Term 1;125;54;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3207180/3224092]
comp;3318213..3318289;;atgf;sigma FIS;Term 2;207;348;protéines1;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3309795/3326707]
comp;3322072..3322158;;ctc;sigma -;Term 1;459;15;protéine2;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3313659/3330571]
comp;3708616..3708692;;ccg;sigma FIS;Term 2;911;92;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3700198/3717110]
;3836222..3836316;;tga;sigma -;rien;293;109;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=3827813/3844725]
comp;4362551..4362626;;ttc;sigma FIS;Term 1;198;107;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=4354133/4371045]
;4496405..4496489;;ttg;sigma FIS;Term 1;196;261;;[https://biocyc.org/ECOLI/NEW-IMAGE?type=LOCUS-POSITION&amp;object=NIL&amp;chromosome=COLI-K12&amp;orgids=ECOLI&amp;bp-range=4487991/4504903]
&lt;/pre&gt;
====eco blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_blocs|eco blocs]]
&lt;pre&gt;
eco blocs;;;;
16s;68;16s;68;68
atc;42;atc;42;42
gca;174;gca;183;183
23s;92;23s;93;93
5s;12;5s;52;
acc;37;gac;;
5s;;;;
;;;;
16s;85;171;171;85
gaa;193;184;193;193
23s;92;92;92;93
5s;52;;;
gac;;;;
&lt;/pre&gt;
====eco distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_distribution|eco distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;2;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;;gta3;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;gta3;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;gta3;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;4;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;ctg3;atc;;acc;;aac;;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;4;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;tac2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;tac2;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;3;tac2;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;1;aaa3;tta;1;tca;;taa;;tga;;aaa3;tta;;tca;;taa;;tga;;aaa3;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;caa2;ata;;aca;1;aaa;3;aga;;caa2;ata;;aca;;aaa;3;aga;;caa2;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;cag2;cta;1;cca;1;caa;;cga;;cag2;cta;;cca;;caa;2;cga;;cag2;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;atgf3;gta;2;gca;;gaa;;gga;1;atgf3;gta;3;gca;;gaa;;gga;;atgf3;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;cgt4;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;cgt4;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;cgt4;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;ggc3;atgj;2;acg;;aag;;agg;;ggc3;atgj;;acg;;aag;;agg;;ggc3;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;3;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(aaa gta)2 aaa3;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(aaa gta)2 aaa3;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
eco;;23;;;;;23;;eco;20;;;;;;20;;eco;;23;;4;;;29;;eco;;;;4;;;4
&lt;/pre&gt;
====eco données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_données_intercalaires|eco données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa
fxt;fct;eco;fx;fc;eco;fx40;fc40;eco;c-;x-;c;x;c;x;;c;x;
0;0;0;13;16;0;13;16;-1;162;0;162;242;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;
1;0;10;35;345;1;4;43;-2;0;2;132;153;2* 171;;gaa;37;;cag
0;1;20;10;265;2;6;51;-3;0;0;327;343;3* 68;;atc;47;;cag
0;0;30;18;135;3;10;44;-4;260;43;114;426;2* 85;;gaa;15;;atgj
2;0;40;63;79;4;5;27;-5;0;0;379;735;tRNA 23s;;;34;;caa
0;0;50;78;73;5;1;14;-6;0;0;164;233;184;;gaa;23;;caa
2;0;60;51;104;6;3;13;-7;14;1;432;307;174;;gca;9;;cta
0;1;70;37;89;7;3;24;-8;59;1;253;569;3* 193;;gaa;**;;atgj
1;3;80;21;88;8;1;15;-9;0;2;206;93;2* 183;;gca;135;;aaa
0;0;90;29;67;9;2;56;-10;6;0;67;452;5s tRNA;;;2;;gta
2;3;100;34;82;10;0;58;-11;34;0;159;4;12;;acc;149;;aaa
0;4;110;36;83;11;2;48;-12;0;1;107;37;2* 52;;gac;3;;gta
0;2;120;32;58;12;3;39;-13;3;0;151;326;tRNA 5s;;;146;;aaa
1;0;130;33;52;13;0;23;-14;14;5;100;55;37;;acc;132;;aaa
0;1;140;39;51;14;0;37;-15;0;0;313;235;tRNA tRNA;;intra;**;;aaa
1;1;150;28;50;15;1;23;-16;2;1;100;258;3* 42;;atc gca;209;;tac
1;3;160;39;41;16;2;20;-17;10;0;74;264;;;;**;;tac
0;2;170;32;41;17;1;19;-18;0;2;75;208;;;;4;;gtc
0;0;180;22;41;18;0;19;-19;4;1;208;73;;;;**;;gtc
0;0;190;30;37;19;0;14;-20;9;1;750;148;;;;12;;tta
1;0;200;29;31;20;1;23;-21;0;2;280;124;;;;54;;tgc
1;4;210;35;36;21;1;17;-22;3;0;315;53;;;;**;;ggc
0;0;220;29;37;22;0;18;-23;6;1;155;347;;;;39;;ggc
0;0;230;20;20;23;1;13;-24;0;2;78;292;;;;**;;ggc
2;1;240;24;18;24;6;19;-25;2;2;105;95;;;;44;;gta
1;0;250;24;17;25;0;10;-26;7;1;206;361;;;;46;;gta
1;1;260;22;26;26;1;14;-27;0;1;458;195;;;;4;;gta
1;1;270;14;14;27;0;14;-28;3;1;14;38;;;;**;;aaa
0;1;280;21;16;28;4;8;-29;4;1;910;;;;;198;;cgt
0;0;290;17;21;29;2;9;-30;0;1;91;;;;;62;;cgt
1;0;300;9;17;30;3;13;-31;1;0;102;;;;;198;;cgt
1;0;310;9;13;31;3;6;-32;5;1;146;;;;;3;;cgt
0;2;320;16;12;32;3;7;-33;0;1;114;;;;;**;;agc
1;1;330;7;11;33;2;7;-34;0;0;106;;;;;33;;atgf
0;0;340;11;6;34;7;8;-35;1;3;210;;;;;33;;atgf
2;0;350;2;9;35;5;7;-36;0;0;233;;;;;**;;atgf
0;0;360;11;10;36;4;15;-37;1;0;267;;;;;8;;gac
1;0;370;7;12;37;11;7;-38;1;1;CDS 16s ;;;;;**;;tgg
0;1;380;18;4;38;6;7;-39;0;1;362;473;;;;57;;cgg
0;0;390;6;3;39;14;8;-40;0;0;442;480;;;;20;;cac
0;0;400;6;10;40;8;7;-41;0;1;377;614;;;;42;;ctg
4;4;reste;57;64;reste;935;1364;-42;0;0;373;;;;;**;;cca
28;37;total;1074;2204;total;1074;2204;-43;8;0;23s 5s;;;;;8;;aca
24;33;diagr;1004;2124;diagr;126;824;-44;1;1;3* 93;;;;;116;;tac
1;1;t30;63;745;;;;-45;0;0;4* 92;;;;;6;;gga
;;;;;;;;-46;0;0;5s CDS;;;;;**;;acc
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;0;0;300;81;;;;36;;ggc
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;1;74;228;;;;35;;ggc
;x;1061;95;13;1169;;;-49;1;0;;269;;;;**;;ggc
;c;2188;647;16;2851;;;-50;1;0;;;;;;34;;ctg
;;;;;4020;712;;reste;25;13;;;;;;28;;ctg
;;;;;;4732;;total;647;95;;;;;;**;;ctg
&lt;/pre&gt;
=====eco autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_autres_intercalaires_aas|eco autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
;autres intercalaires;;eco27622;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre inter;aas
deb;;CDS;14168;15298;88;;
;;mobile_el;15387;16731;-1287;*;
fin;;CDS;15445;16557;;;
deb;comp;CDS;16751;16960;-9;;
;;ncRNA;16952;17010;478;*;
fin;;CDS;17489;18655;;;
deb;;CDS;18715;19620;175;;
;comp;mobile_el;19796;20563;-753;*;
fin;comp;CDS;19811;20314;;;
deb;comp;CDS;74497;75480;35;;
;comp;ncRNA;75516;75608;35;*;
deb;comp;CDS;75644;77299;67;;
;;ncRNA;77367;77593;-206;*;
fin;;CDS;77388;77519;;;
deb;;CDS;91413;93179;-695;;
;;ncRNA;92485;92658;507;*;
fin;;CDS;93166;94653;;;
deb;comp;CDS;188712;189506;205;;
;;ncRNA;189712;189847;26;*;
fin;;CDS;189874;190599;;;
deb;;CDS;193521;194717;66;;
;;ncRNA;194784;194844;58;*;
fin;;CDS;194903;195664;;;
deb;;CDS;222833;223408;362;;
16s;;rRNA;223771;225312;68;*;
;;tRNA;225381;225457;42;*;atc
23s;;tRNA;225500;225575;183;*;gca
5s;;rRNA;225759;228662;93;*;
;;rRNA;228756;228875;52;*;
;;tRNA;228928;229004;162;*;gac
fin;;CDS;229167;229970;;;
deb;;CDS;236067;236798;132;;
;;tRNA;236931;237007;327;*;gac
fin;;CDS;237335;238120;;;
deb;comp;CDS;238257;238736;9;;
;comp;gene;238746;239084;105;*;
;;gene;239190;239378;40;*;
fin;comp;CDS;239419;240189;;;
deb;;CDS;247637;248134;223;;
;comp;gene;248358;250070;1;*;
;;gene;250072;250827;70;*;
fin;;CDS;250898;251953;;;
deb;;CDS;252709;253161;305;;
;;gene;253467;253733;-32;*;
;;gene;253702;254202;56;*;
fin;comp;CDS;254259;255716;;;
deb;;CDS;256527;257771;57;;
;;misc_f;257829;257899;8;*;
;comp;mobile_el;257908;258675;-753;*;
fin;comp;CDS;257923;258426;;;
deb;comp;CDS;258345;258620;55;;
;;misc_f;258676;259006;38;*;
fin;comp;CDS;259045;260100;;;
deb;;CDS;261503;262756;114;;
;;tRNA;262871;262946;-49;*;acg
;;misc_f;262898;297205;-34056;*;
;comp;gene;263150;263212;115;*;
fin;comp;CDS;263328;263669;;;
deb;comp;CDS;266110;266553;-1;;
;comp;gene;266553;266774;1;*;
;comp;gene;266776;266967;216;*;
fin;comp;CDS;267184;268005;;;
deb;comp;CDS;269289;270182;23;;
;;mobile_el;270206;270540;-263;*;
;;misc_f;270278;270540;0;*;
;;mobile_el;270541;271761;-1159;*;
deb;;CDS;270603;271754;7;;
;;mobile_el;271762;272190;-427;*;
;;misc_f;271764;272190;389;*;
;;ncRNA;272580;272654;192;*;
deb;;CDS;272847;273992;-38;;
;comp;mobile_el;273955;275149;-1049;*;
fin;comp;CDS;274101;275081;;;
deb;comp;CDS;277756;278802;11;;
;comp;gene;278814;279162;0;*;
;comp;mobile_el;279163;279930;-753;*;
fin;comp;CDS;279178;279681;;;
deb;comp;CDS;279600;279875;55;;
;;gene;279931;280104;-174;*;
;;mobile_el;279931;280111;2;*;
;comp;gene;280114;280362;-249;*;
;comp;mobile_el;280114;280425;-41;*;
fin;comp;CDS;280385;280735;;;
deb;;CDS;290510;290638;-5;;
;comp;mobile_el;290634;291401;-753;*;
fin;comp;CDS;290649;291152;;;
deb;comp;CDS;313141;313242;473;;
;comp;gene;313716;313805;551;*;
;;gene;314357;315244;-16;*;
;;mobile_el;315229;316483;-1193;*;
fin;;CDS;315291;315590;;;
deb;;CDS;315587;316453;-4;;
;comp;gene;316450;317136;302;*;
;;gene;317439;317567;158;*;
fin;comp;CDS;317726;318319;;;
deb;comp;CDS;380069;380842;1;;
;comp;misc_f;380844;381260;-1;*;
;;mobile_el;381260;382590;-1240;*;
fin;;CDS;381351;381716;;;
deb;;CDS;381674;382579;11;;
;comp;misc_f;382591;382872;-134;*;
fin;comp;CDS;382739;383935;;;
deb;comp;CDS;388753;389727;523;;
;;misc_f;390251;391708;-117;*;
deb;comp;CDS;391592;391648;60;;
;comp;mobile_el;391709;392966;-1228;*;
fin;comp;CDS;391739;392605;;;
deb;comp;CDS;392602;392901;68;;
;;misc_f;392970;394418;87;*;
fin;;CDS;394506;395129;;;
deb;;CDS;408177;408461;147;;
;;gene;408609;408950;-4;*;
fin;;CDS;408947;409030;;;
deb;comp;CDS;475982;476371;76;;
;;ncRNA;476448;476561;110;*;
fin;;CDS;476672;477025;;;
deb;comp;CDS;506603;507082;121;;
;;ncRNA;507204;507287;-2;*;
fin;comp;CDS;507286;508080;;;
deb;;CDS;527581;527949;-1;;
;;gene;527949;528659;-20;*;
;;gene;528640;529130;366;*;
;;gene;529497;529592;52;*;
fin;comp;CDS;529645;530016;;;
deb;;CDS;533011;533826;-198;;
;;ncRNA;533629;533863;52;*;
fin;;CDS;533916;535697;;;
deb;comp;CDS;563848;564480;242;;
;;tRNA;564723;564799;-45;*;aga
;;misc_f;564755;586056;-21242;*;
deb;comp;CDS;564815;565978;-121;;
;comp;gene;565858;566079;18;*;
;comp;gene;566098;566361;14;*;
;;gene;566376;566687;-4;*;
;;misc_f;566684;566776;0;*;
;;mobile_el;566777;568034;-1193;*;
fin;;CDS;566842;567141;;;
deb;;CDS;567138;568004;30;;
;;misc_f;568035;568247;67;*;
fin;;CDS;568315;568647;;;
deb;;CDS;573956;574339;189;;
;comp;misc_f;574529;574586;4;*;
;comp;mobile_el;574591;575785;-1049;*;
deb;comp;CDS;574737;575717;68;;
;comp;misc_f;575786;576825;572;*;
fin;;CDS;577398;577613;;;
deb;;CDS;580834;581379;-26;;
;;gene;581354;581662;-129;*;
deb;;CDS;581534;582097;54;;
;comp;gene;582152;582806;68;*;
fin;;CDS;582875;583060;;;
deb;comp;CDS;606265;607383;349;;
;comp;ncRNA;607733;607792;43;*;
deb;;CDS;607836;607988;18;;
;;mobile_el;608007;609351;-1287;*;
fin;;CDS;608065;609177;;;
deb;comp;CDS;657555;657938;92;;
;;gene;658031;658818;128;*;
fin;;CDS;658947;659150;;;
deb;comp;CDS;685929;686669;11;;
;comp;ncRNA;686681;686843;-5;*;
deb;comp;CDS;686839;687747;103;;
;comp;mobile_el;687851;689045;-1049;*;
fin;comp;CDS;687997;688977;;;
deb;;CDS;695101;696276;153;;
;comp;tRNA;696430;696504;37;*;cag
;comp;tRNA;696542;696616;47;*;cag
;comp;tRNA;696664;696740;15;*;atgj
;comp;tRNA;696756;696830;34;*;caa
;comp;tRNA;696865;696939;23;*;caa
;comp;tRNA;696963;697047;9;*;cta
;comp;tRNA;697057;697133;379;*;atgj
fin;comp;CDS;697513;699177;;;
deb;;CDS;706093;707757;478;;
;;ncRNA;708236;708333;0;*;
fin;;CDS;708334;709740;;;
deb;;CDS;715412;715906;40;;
;comp;gene;715947;716597;123;*;
;comp;gene;716721;716870;75;*;
fin;comp;CDS;716946;718265;;;
deb;;CDS;733776;734102;117;;
;;gene;734220;735653;-4;*;
fin;;CDS;735650;736219;;;
deb;;CDS;736445;736699;200;;
;;gene;736900;737961;130;*;
fin;;CDS;738092;738853;;;
deb;;CDS;764180;765049;0;;
;;ncRNA;765050;765150;2;*;
fin;comp;CDS;765153;765875;;;
deb;;CDS;779598;780389;164;;
;;tRNA;780554;780629;135;*;aaa
;;tRNA;780765;780840;2;*;gta
;;tRNA;780843;780918;149;*;aaa
;;tRNA;781068;781143;3;*;gta
;;tRNA;781147;781222;146;*;aaa
;;tRNA;781369;781444;132;*;aaa
;;tRNA;781577;781652;432;*;aaa
fin;;CDS;782085;783128;;;
deb;;CDS;836351;837436;-2;;
;comp;ncRNA;837435;837531;-29;*;
fin;;CDS;837503;837562;;;
deb;comp;CDS;851014;852597;127;;
;comp;ncRNA;852725;853064;-196;*;
fin;comp;CDS;852869;852997;;;
deb;;CDS;887423;887959;19;;
;comp;ncRNA;887979;888057;76;*;
fin;comp;CDS;888134;889819;;;
deb;;CDS;923264;925540;343;;
;comp;tRNA;925884;925971;253;*;tcc
fin;comp;CDS;926225;926443;;;
deb;comp;CDS;1030759;1031418;206;;
;comp;tRNA;1031625;1031712;426;*;tca
fin;;CDS;1032139;1033257;;;
deb;comp;CDS;1049439;1049744;33;;
;;mobile_el;1049778;1050545;-713;*;
fin;;CDS;1049833;1050108;;;
deb;;CDS;1079305;1080813;542;;
;;gene;1081356;1082185;57;*;
fin;;CDS;1082243;1083370;;;
deb;;CDS;1092876;1094234;10;;
;comp;mobile_el;1094245;1095502;-1228;*;
fin;comp;CDS;1094275;1095141;;;
deb;comp;CDS;1095138;1095437;106;;
;;gene;1095544;1095846;-4;*;
deb;;CDS;1095843;1096829;735;;
;comp;tRNA;1097565;1097652;233;*;tcc
fin;;CDS;1097886;1098824;;;
deb;;CDS;1140033;1140986;-1;;
;;ncRNA;1140986;1141063;118;*;
fin;comp;CDS;1141182;1144367;;;
deb;comp;CDS;1146011;1146595;-7;;
;;ncRNA;1146589;1146757;36;*;
fin;;CDS;1146794;1147315;;;
deb;;CDS;1169073;1169330;-28;;
;;ncRNA;1169303;1169402;9;*;
fin;comp;CDS;1169412;1170374;;;
deb;;CDS;1195123;1196373;-165;;
;;misc_f;1196209;1211412;-14702;*;
;;ncRNA;1196711;1196782;84;*;
fin;comp;CDS;1196867;1197532;;;
deb;;CDS;1203822;1204160;9;;
;;gene;1204170;1204403;-234;*;
deb;;CDS;1204170;1205537;-1137;;
;;gene;1204401;1205537;11;*;
fin;;CDS;1205549;1205731;;;
deb;;CDS;1205731;1206204;-74;;
;;gene;1206131;1206922;-10;*;
fin;;CDS;1206913;1207497;;;
deb;comp;CDS;1208517;1209119;-1;;
;comp;gene;1209119;1209655;29;*;
fin;;CDS;1209685;1210239;;;
deb;;CDS;1210346;1211179;233;;
;;gene;1211413;1211577;102;*;
fin;comp;CDS;1211680;1212003;;;
deb;;CDS;1218983;1219201;399;;
;;gene;1219601;1222248;56;*;
fin;comp;CDS;1222305;1222634;;;
deb;;CDS;1223264;1223449;114;;
;;gene;1223564;1223907;371;*;
fin;comp;CDS;1224279;1224545;;;
deb;;CDS;1238879;1239949;238;;
;;mobile_el;1240188;1240289;-30;*;
fin;;CDS;1240260;1240463;;;
deb;comp;CDS;1269168;1269275;47;;
;;ncRNA;1269323;1269389;313;*;
deb;comp;CDS;1269703;1269810;47;;
;;ncRNA;1269858;1269923;314;*;
deb;comp;CDS;1270238;1270345;47;;
;;ncRNA;1270393;1270460;288;*;
fin;comp;CDS;1270749;1271849;;;
deb;;CDS;1277957;1279348;-12;;
;;ncRNA;1279337;1279520;343;*;
fin;;CDS;1279864;1283607;;;
deb;;CDS;1286709;1286984;81;;
;comp;ncRNA;1287066;1287236;-150;*;
deb;comp;CDS;1287087;1287176;67;;
;comp;tRNA;1287244;1287328;209;*;tac
;comp;tRNA;1287538;1287622;159;*;tac
fin;comp;CDS;1287782;1288624;;;
deb;;CDS;1293527;1294144;281;;
;comp;gene;1294426;1295322;-897;*;
;comp;mobile_el;1294426;1295405;40;*;
fin;comp;CDS;1295446;1298121;;;
deb;;CDS;1298598;1299245;253;;
;;mobile_el;1299499;1300693;-1127;*;
fin;;CDS;1299567;1300547;;;
deb;;CDS;1380148;1380807;13;;
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;;gene;4506861;4507109;15;*;
;;mobile_el;4507125;4507458;-262;*;
;;misc_f;4507197;4507451;7;*;
;comp;mobile_el;4507459;4508679;-1214;*;
deb;comp;CDS;4507466;4508617;62;;
;comp;mobile_el;4508680;4509006;-323;*;
;comp;gene;4508684;4508942;64;*;
;;mobile_el;4509007;4509801;-793;*;
;;misc_f;4509009;4509479;-1;*;
;;misc_f;4509479;4509793;10;*;
;;gene;4509804;4510133;556;*;
fin;comp;CDS;4510690;4511457;;;
deb;;CDS;4518372;4518440;31;;
;;mobile_el;4518472;4519239;-713;*;
deb;;CDS;4518527;4518802;-82;;
;;gene;4518721;4519224;113;*;
fin;comp;CDS;4519338;4520324;;;
deb;comp;CDS;4527549;4527980;-4;;
;;ncRNA;4527977;4528066;44;*;
fin;comp;CDS;4528111;4528917;;;
deb;comp;CDS;4530530;4531651;398;;
;comp;gene;4532050;4532310;126;*;
fin;comp;CDS;4532437;4533183;;;
deb;comp;CDS;4533796;4534053;376;;
;comp;gene;4534430;4534675;339;*;
;;gene;4535015;4536031;565;*;
fin;;CDS;4536597;4536695;;;
deb;comp;CDS;4568692;4568727;270;;
;;gene;4568998;4569918;243;*;
fin;comp;CDS;4570162;4571574;;;
deb;;CDS;4572414;4573931;203;;
;;gene;4574135;4576855;56;*;
fin;comp;CDS;4576912;4577958;;;
deb;comp;CDS;4579499;4579840;-6;;
;;ncRNA;4579835;4579911;156;*;
fin;comp;CDS;4580068;4581462;;;
deb;;CDS;4605804;4606040;38;;
;comp;tRNA;4606079;4606165;34;*;ctg
;comp;tRNA;4606200;4606286;28;*;ctg
;comp;tRNA;4606315;4606401;267;*;ctg
fin;comp;CDS;4606669;4607700;;;
&lt;/pre&gt;

====eco intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_entre_cds|eco intercalaires entre cds]]
*'''Le tableau'''
&lt;pre&gt;
eco;6.2.21 Paris;;eco 23-9-2020;;;;;;;
eco;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;738;18.3;'''négatif ;-9;14;-1 à -89;'''4 641 652;-1;738
;'''zéro;29;0.7;;;;;'''intercals;0;29
;'''1 à 200;2511;62.4;'''0 à 200;72;58;;'''421 229;5;203
;'''201 à 370;572;14.2;'''201 à 370;264;47;;'''9.1%;10;174
;'''371 à 600;142;3.5;'''371 à 600;440;60;;;15;176
;'''601 à max;32;0.8;'''601 à 1028;693;97;;;20;99
;'''total 4024;&lt;201;81.5;'''total 4004;103;126;-89 à 950;;25;85
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;67
4538785;1455;-1;738;-70;30;;0;29;35;56
2901896;1372;0;29;-60;2;;-1;°163;40;87
2876581;950;1;°47;-50;2;;-2;2;45;80
2405703;919;2;°57;-40;12;;-3;0;50;72
4077449;852;3;°54;-30;18;'''min à -1;-4;°303;55;82
767978;846;4;°31;-20;45;738;-5;0;60;72
1985139;796;5;14;-10;84;18.3%;-6;0;65;66
310746;775;6;16;0;574;;-7;15;70;60
1253085;768;7;°26;10;377;;-8;°60;75;57
1102546;754;8;16;20;275;;-9;2;80;52
3111266;728;9;°58;30;152;;-10;6;85;50
2303905;714;10;°58;40;143;'''1 à 100;-11;°34;90;49
2455083;680;11;°50;50;152;1701;-12;1;95;58
3353121;674;12;42;60;154;42.3%;-13;3;100;56
1907448;669;13;23;70;126;;-14;°20;105;56
2798091;668;14;°37;80;109;;-15;0;110;64
83622;659;15;24;90;99;;-16;3;115;40
2136104;658;16;22;100;114;;-17;°10;120;51
4325298;657;17;20;110;120;;-18;2;125;34
4294481;641;18;19;120;91;;-19;5;130;53
1299567;634;19;14;130;87;;-20;°9;135;41
2404629;630;20;°24;140;90;;-21;2;140;49
4502103;626;21;18;150;78;;-22;3;145;26
582875;620;22;18;160;81;;-23;°7;150;52
4602088;618;23;14;170;72;'''1 à 200;-24;2;155;51
3922060;616;24;°25;180;62;2511;-25;4;160;30
384059;615;25;10;190;68;62.4%;-26;°8;165;36
3550080;611;26;15;200;61;;-27;1;170;36
1711523;610;27;14;210;72;;-28;4;175;34
1292509;604;28;12;220;66;;-29;°5;180;28
985894;602;29;11;230;40;;-30;1;185;36
88028;601;30;15;240;41;'''0 à 200;-31;1;190;32
4150447;597;31;9;250;41;2540;-32;°7;195;31
654583;588;32;10;260;47;;;712;200;30
1089866;586;33;10;270;27;;reste;55;205;39
;;34;15;280;37;;total;767;210;33
;;35;12;290;38;;;;215;29
;;36;°19;300;26;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;220;37
;;37;18;310;22;;600;3992;225;16
;;38;13;320;29;;610;4;230;24
;;39;°22;330;18;;620;5;235;19
;;40;15;340;18;'''201 à 370;630;2;240;22
;;reste;2310;350;11;572;640;1;245;24
;;total;4024;360;20;14.2%;650;1;250;17
;;;;370;19;;660;3;255;19
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;380;23;;670;2;260;28
164730;-2400;cont;2400;390;9;;680;2;265;15
2731600;-2130;cont;2130;400;18;;690;0;270;12
492092;-1295;cont;1295;410;10;;700;0;275;23
4577958;-897;cont;897;420;7;;710;0;280;14
1179520;-729;cont;729;430;13;;720;1;285;21
3111128;-723;comp';'''20;440;8;;730;1;290;17
3838248;-530;comp';'''20;450;3;;740;0;295;17
10643;-527;comp';'''486;460;8;;750;0;300;9
1639030;-448;cont;'''255;470;4;;760;1;305;10
3796948;-436;comp';'''75;480;6;;770;1;310;12
578107;-242;cont;'''123;490;3;;780;1;315;14
508875;-212;cont;212;500;4;;790;0;320;15
3993739;-210;comp';210;510;1;;800;1;325;8
16751;-153;cont;153;520;5;;810;0;330;10
1240260;-129;comp';129;530;3;;820;0;335;10
4011076;-113;comp';113;540;3;'''371 à 600;830;0;340;8
1491922;-110;cont;110;550;4;142;840;0;345;7
3086145;-102;comp';102;560;3;3.5%;850;1;350;4
3519465;-89;cont;89;570;1;;860;1;355;13
1529922;-86;comp';86;580;3;'''601 à max;total;28;360;7
2475873;-85;cont;85;590;2;32;;;365;13
19811;-82;cont;82;600;1;0.8%;;;370;6
257923;-82;cont;82;reste;32;;reste;4;reste;174
279178;-82;cont;82;total;4024;;total;4024;total;4024
&lt;/pre&gt;

====eco  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_positifs_S+|eco intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
eco Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
cbn;min20;489;1701;2190;731;543;505;-38;-222;-114;271;;;
eco;min20;1003;2130;3133;735;296;440;144;-178;-64;287;;;
bsu;min10;1028;2444;3472;659;8;282;274;152;257;470;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
65;312;0.21;553;1940;2;5;17;86;56;620;-382;;;
63;348;0.18;1169;2855;11;6;80;226;126;821;-119;;;
140;333;0.42;1125;3091;2;8;31;186;302;936;-432;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
eco;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;22;-151;195;32;532;230;max50;-74;565;-1405;124;805;255;min50
31 à 400;;;;;;;;7.6;-18;-162;50;934;79;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;2 parties;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;94;44;-;489;dte;43;tm;197;65;-;540;poly;265;SF
31 à 400;;;;;;;;117;43;-;873;poly;61;tm
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50 60, '''t30 t60'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
25.1.22 Paris;;;;;;;;;;;;;
;400;200;250;;corrélation;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;-0.119;;;;;;;;
41-n;0.735;0.296;0.440;;;;;;;;;;
1-n;0.287;-0.178;-0.064;;;;;;;;25.1.22 Paris;;
eco;fx;fc;;fx40;fc40;eco;fx%;fc%;;x;eco;Sx-;Sc-
0;13;16;0;13;16;0;13;8;&gt;0;1062;-1;0;163
10;36;341;1;4;43;10;36;160;&lt;0;94;-2;2;0
20;11;264;2;6;51;20;11;124;zéro;13;-3;0;0
30;16;136;3;10;44;30;16;64;total;1169;-4;43;260
40;63;80;4;5;26;40;63;38;;c;-5;0;0
50;79;73;5;1;13;50;79;34;&gt;0;2195;-6;0;0
60;51;103;6;4;12;60;51;48;&lt;0;644;-7;1;14
70;37;89;7;3;23;70;37;42;zéro;16;-8;1;59
80;20;89;8;1;15;80;20;42;total;2855;-9;2;0
90;30;69;9;2;56;90;30;32;;;-10;0;6
100;32;82;10;0;58;100;32;38;total;4024;-11;0;34
110;36;84;11;2;48;110;36;39;;;-12;1;0
120;32;59;12;3;39;120;32;28;;;-13;0;3
130;34;53;13;1;22;130;34;25;;;-14;5;15
140;39;51;14;0;37;140;39;24;;;-15;0;0
150;29;49;15;1;23;150;29;23;;;-16;1;2
160;39;42;16;2;20;160;39;20;;;-17;0;10
170;32;40;17;1;19;170;32;19;;;-18;2;0
180;22;40;18;0;19;180;22;19;;;-19;1;4
190;30;38;19;0;14;190;30;18;;;-20;1;8
200;29;32;20;1;23;200;29;15;;;-21;2;0
210;35;37;21;1;17;210;35;17;;;-22;0;3
220;29;37;22;0;18;220;29;17;;;-23;1;6
230;21;19;23;1;13;230;21;9;;;-24;2;0
240;23;18;24;6;19;240;23;8;;;-25;2;2
250;24;17;25;0;10;250;24;8;;;-26;1;7
260;22;25;26;1;14;260;22;12;;;-27;1;0
270;12;15;27;0;14;270;12;7;;;-28;1;3
280;20;17;28;4;8;280;20;8;;;-29;1;4
290;17;21;29;2;9;290;17;10;;;-30;1;0
300;9;17;30;1;14;300;9;8;;;-31;0;1
310;9;13;31;2;7;310;9;6;;;-32;2;5
320;16;13;32;3;7;320;16;6;;;-33;1;0
330;8;10;33;3;7;330;8;5;;;-34;0;0
340;12;6;34;7;8;340;12;3;;;-35;3;1
350;2;9;35;5;7;350;2;4;;;-36;0;0
360;10;10;36;4;15;360;10;5;;;-37;0;1
370;6;13;37;11;7;370;6;6;;;-38;1;1
380;18;5;38;6;7;380;18;2;;;-39;1;0
390;6;3;39;14;8;390;6;1;;;-40;0;0
400;7;11;40;8;7;400;7;5;;;-41;1;0
reste;59;65;reste;936;1374;;;;;;-42;0;0
total;1075;2211;total;1075;2211;t30;63;348;;;-43;0;8
diagr;1003;2130;diagr;126;821;t60;218;302;;;-44;1;1
 - t30;940;1389;;;;;;;;;-45;0;0
 - t60;747;1133;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;-48;1;0
;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;-50;0;2
;;;;;;;;;;;reste;11;21
;;;;;;;;;;;total;94;644
&lt;/pre&gt;

====eco  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_négatifs_S-|eco intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
eco;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;-81;-82;-83;-84;-85;-86;-87;-88;-89;-90;-91;-92;-93;-94;-95;-96;-97;-98;-99;-100;;;
comp’;0;2;0;42;0;0;1;1;2;0;0;1;0;5;0;1;0;2;1;1;2;0;1;2;2;1;0;1;1;1;0;2;1;0;3;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;8;91;11
continu;163;0;0;261;0;0;14;59;0;6;34;0;3;15;0;2;10;0;4;8;0;3;6;0;2;7;1;3;4;0;1;5;0;0;1;0;1;1;1;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;7;0;0;1;0;0;0;1;;;;;;;;;;;;10;647;22
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;eco;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;2;0;43;0;0;1;1;2;0;0;1;0;5;0;1;0;2;1;1;2;0;1;2;2;1;1;1;1;1;0;2;1;0;3;0;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;11;94
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&lt;/pre&gt;

====eco autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_autres_intercalaires|eco autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;&amp;tRNA;781577;432;;;;&amp;tRNA;2062260;55;;;;gene;3281122;350;;;;gene;4506861;15;
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;mobile;1094245;-1228;;;;misc_f;2101396;4;;;;gene;3404495;0;;;;gene;4532050;126;
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;&amp;tRNA;1097565;233;comp;;deb;°CDS;2152469;182;;;fin;°CDS;3420134;;;;fin;°CDS;4536597;;
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;gene;1204401;11;;;deb;°CDS;2168712;81;;;;gene;3559848;16;;;;&amp;tRNA;4606079;34;comp
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;;;;;;;mobile;2170171;-1193;;;;;;;;;;&amp;tRNA;4606315;267;comp
;;;;;;fin;°CDS;2170236;;;;;;;;;;fin;°CDS;4606669;;comp
&lt;/pre&gt;

====eco intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_tRNA|eco intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
eco;intercalaires tRNAs;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
comp’;aas;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;162;;67;14;;
;;;132;;327;;74;78;;
;;;114;;;;75;91;'''deb;
;;comp’;242;;;;100;100;&lt;201;10
6 aas;37 47 15 34 23 9;comp’;153;;379;;102;106;total;17
6 aas;135 2 149 3 146 132;;164;;432;;105;107;taux;59%
;;comp’;343;;253;;114;114;;
;;;206;comp’;426;;128;146;'''fin;
;;comp’;735;comp’;233;;132;151;&lt;201;11
;209;;67;;159;;155;159;total;20
;4;comp’;307;;107;;164;162;taux;55%
;12 54;;-;;151;;206;235;;
;;comp’;569;comp’;93;;206;253;'''total;
;;;100;;313;;210;267;&lt;201;21
;;comp’;452;;100;;280;313;total;37
;;comp’;4;comp’;37;;458;315;taux;57%
;;comp’;326;comp’;55;;750;327;;
;;;74;;;;910;379;;
;;;75;;;;233;432;comp’;cumuls
;39;comp’;208;;235;;4;37;;
;44 46 4;comp’;258;comp’;264;;38;53;;
;;;750;;;;124;55;'''deb;
4 aas;198 62 198 3;;280;;315;;153;73;&lt;201;5
;;comp’;208;comp’;73;;195;93;total;17
;33 33;;155;;78;;208;95;taux;29%
;;;105;comp’;148;;208;148;;
;;comp’;124;comp’;53;;242;233;'''fin;
;;;206;comp’;347;;258;264;&lt;201;7
;;;458;;14;;292;347;total;11
;;;910;;91;;307;426;taux;64%
;;comp’;292;;;;326;'''-;;
;8;;;comp’;95;;343;'''-;'''total;
;57 20 42;;102;;146;;361;'''-;&lt;201;12
;8 116 6;comp’;361;;114;;452;'''-;total;28
;;;;;106;;569;'''-;taux;43%
;36 35;;210;;233;;735;'''-;;
;;comp’;195;;;;;;;
;34 28;comp’;38;;267;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;deb;fin;total
;;;;;;;&lt;201;15;18;33
;;;;;;;total;34;31;65
;;;;;;;taux;44%;58%;51%
&lt;/pre&gt;

===Escherichia coli Nissle 1917===
====ecoN opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_opérons|ecoN opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Esch_coli_Nissle_1917/eschColi_NISSLE_1917-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP007799.1;ecoN;;genome;;;;;;;;;
50%GC;21.8.19 Paris;16s  10 ;123 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;;
Escherichia coli Nissle 1917 ;;;;;;;;;;;;
;231864..232436;;CDS;;365;365;;;191;;D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase;*
;232802..234321;;16s;;73;;;;1520;;;
;234395..234471;;gaa;;12;;;12;;;;
;234484..234557;;gca;;174;;;;;;;
;234732..237319;;23s;;83;;;;2588;;;
;237403..237518;;5s;;54;;;;116;;;
;237573..237649;;gac;;162;162;;;;162;;
;237812..238615;;CDS;;;;;;268;;2,5-didehydrogluconate reductase DkgB;*
;;;;;;;;;;;;
;244934..245665;;CDS;;132;132;;;244;;DNA polymerase III subunit epsilon;*
;245798..245874;;gac;;120;120;;;;120;;
comp;245995..246852;;CDS;;;;;;286;;DUF4942 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
;367329..368582;;CDS;;114;114;;;418;114;glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase;*
;368697..368772;;acg;;154;154;;;;;;
;368927..369265;;CDS;;;;;;113;;DUF4102 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;631149..632015;;CDS;;270;270;;;289;;bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD;*
;632286..632362;;aga;;15;15;;;;15;;
comp;632378..632997;;CDS;;;;;;207;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;
;733188..734363;;CDS;;153;153;;;392;153;2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase;*
comp;734517..734591;;cag;+;37;;37;;;;;
comp;734629..734703;;cag;2 cag;48;;48;;;;;
comp;734752..734828;;atgj;2 atgj;15;;15;;;;;
comp;734844..734918;;caa;2 caa;34;;34;;;;;
comp;734953..735027;;caa;;23;;23;;;;;
comp;735051..735135;;cta;;10;;10;;;;;
comp;735146..735222;;atgj;;380;380;;;;;;
comp;735603..737267;;CDS;;;;;;555;;asparagine synthase B;*
;;;;;;;;;;;;
;807377..808169;;CDS;;164;164;;;264;164;Pseudo, cell division protein CpoB;*
;808334..808409;;aaa;+;35;;35;;;;;
;808445..808520;;gta;5 aaa;2;;2;;;;;
;808523..808598;;aaa;2 gta;51;;51;;;;;
;808650..808725;;gta;;3;;3;;;;;
;808729..808804;;aaa;;48;;48;;;;;
;808853..808928;;aaa;;33;;33;;;;;
;808962..809037;;aaa;;277;277;;;;;;
;809315..810358;;CDS;;;;;;348;;quinolinate synthase NadA;*
;;;;;;;;;;;;
;950069..952345;;CDS;;343;343;;;*759;343;ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA;*
comp;952689..952776;;tcc;;253;253;;;;;;
comp;953030..953248;;CDS;;;;;;73;;translation initiation factor IF-1;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1047224..1047883;;CDS;;206;206;;;220;206;FtsH protease modulator YccA;*
comp;1048090..1048177;;tca;;426;*426;;;;;;
;1048604..1049722;;CDS;;;;;;373;;hydrogenase 1 small subunit;*
;;;;;;;;;;;;
;1183656..1184018;;CDS;;463;*463;;;121;;hp;*
;1184482..1184558;;aga;;278;278;;;;278;;
&gt; comp;1184837..1185786;;CDS;;;;;;317;;Pseudo, IS4 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;
;1213982..1214809;;CDS;;165;165;;;276;165;DUF4942 domain-containing protein;*
comp;1214975..1215062;;tcc;;233;233;;;;;;
;1215296..1216234;;CDS;;;;;;313;;glyoxylate/hydroxypyruvate reductase GhrA;*
;;;;;;;;;;;;
;1216817..1217098;;CDS;;165;165;;;94;165;DUF4942 domain-containing protein;*
comp;1217264..1217351;;tcc;;234;234;;;;;;
;1217586..1218524;;CDS;;;;;;313;;glyoxylate/hydroxypyruvate reductase GhrA;*
;;;;;;;;;;;;
;1457038..1458129;;CDS;;16;16;;;364;16;acyl-CoA desaturase;*
comp;1458146..1458277;;ncRNA;;46;;;;44;;RtT sRNA;
comp;1458324..1458408;;tac;+;33;;33;;;;;
comp;1458442..1458526;;tac;2 tac;159;159;;;;;;
comp;1458686..1459528;;CDS;;;;;;281;;formyltetrahydrofolate deformylase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1829066..1830322;;CDS;;307;307;;;419;;hp;*
;1830630..1830706;;gtc;+;4;;4;;;;;
;1830711..1830787;;gtc;2 gtc;6;6;;;;6;;
&lt;;1830794..1831177;;CDS;@4;;;;;128;;Pseudo, multidrug efflux MATE transporter MdtK;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1831218..1832474;;CDS;;307;307;;;419;;hp;*
;1832782..1832858;;gtc;+;4;;4;;;;;
;1832863..1832939;;gtc;2 gtc;8;8;;;;8;;
&lt;;1832948..1833280;;CDS;;;;;;111;;Pseudo, MATE family efflux transporter;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1833321..1834577;;CDS;;307;307;;;419;;hp;*
;1834885..1834961;;gtc;+;4;;4;;;;;
;1834966..1835042;;gtc;2 gtc;108;108;;;;108;;
;1835151..1835456;;CDS;;;;;;102;;monooxygenase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2115794..2116459;;CDS;;195;195;;;222;;UPF0149 family protein YecA;*
comp;2116655..2116741;;tta;;12;;12;;;;;
comp;2116754..2116827;;tgc;;53;;53;;;;;
comp;2116881..2116956;;ggc;;151;151;;;;151;;
comp;2117108..2117656;;CDS;;;;;;183;;CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2191451..2192287;;CDS;;278;278;;;279;;hp;*
comp;2192566..2192655;;tcg;;93;93;;;;93;;
;2192749..2193546;;CDS;;100;100;;;266;100;DgsA anti-repressor MtfA;*
;2193647..2193722;;aac;;161;161;;;;;;
;2193884..2195146;;CDS;;;;;;421;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;
;2232607..2233323;;CDS;;453;*453;;;239;;YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator;*
comp;2233777..2233852;;acc;;326;326;;;;326;;
;2234179..2235096;;CDS;;;;;;306;;nitrogen assimilation transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
;2235198..2236148;;CDS;;37;37;;;317;;HTH-type transcriptional regulator Cbl;*
comp;2236186..2236261;;aac;;4;4;;;;4;;
;2236266..2237909;;CDS;;100;100;;;548;100;toxic metabolite efflux MATE transporter YeeO;*
;2238010..2238085;;aac;;161;161;;;;;;
;2238247..2239518;;CDS;;;;;;424;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;
;2546968..2548728;;CDS;;74;74;;;587;74;cardiolipin transport protein PbgA;*
;2548803..2548879;;ccc;;101;101;;;;;;
comp;2548981..2549136;;CDS;;;;;;52;;autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
;2717780..2718712;;CDS;;75;75;;;311;75;formate/nitrite transporter family protein;*
;2718788..2718862;;agg;;437;*437;;;;;;
comp;2719300..2719830;;CDS;;;;;;177;;OmpH family outer membrane protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2768744..2770933;;CDS;;206;206;;;*730;206;sensor domain-containing phosphodiesterase;*
comp;2771140..2771215;;gcc;+;39;;39;;;;;
comp;2771255..2771330;;gcc;2 gcc;220;220;;;;;;
;2771551..2771910;;CDS;;;;;;120;;putative DNA-binding transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2772355..2773770;;CDS;;258;258;;;472;;glutamate--tRNA ligase;*
;2774029..2774104;;gta;+;43;;43;;;;;
;2774148..2774223;;gta;3 gta;46;;46;;;;;
;2774270..2774345;;gta;;4;;4;;;;;
;2774350..2774425;;aaa;;110;110;;;;110;;
comp;2774536..2775420;;CDS;;;;;;295;;LysR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2959205..2960503;;CDS;;323;323;;;433;323;alpha-ketoglutarate permease;*
comp;2960827..2960942;;5s;;83;;;;116;;;
comp;2961026..2965477;;23s;;184;;;;4452;;;
comp;2965662..2965737;;gaa;;431;;;;;;;
comp;2966169..2967720;;16s;;441;*441;;;1552;;;
comp;2968162..2970735;;CDS;;;;;;*858;;ATP-dependent chaperone ClpB;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3027207..3027773;;CDS;;280;280;;;189;280;fructose-1-phosphate/6-phosphogluconate phosphatase;*
comp;3028054..3028130;;cgt;+;63;;63;;;;;
comp;3028194..3028270;;cgt;5 cgt;62;;62;;;;;
comp;3028333..3028409;;cgt;;62;;62;;;;;
comp;3028472..3028548;;cgt;;64;;64;;;;;
comp;3028613..3028689;;cgt;;3;;3;;;;;
comp;3028693..3028785;;agc;;315;315;;;;;;
comp;3029101..3029286;;CDS;;;;;;62;;carbon storage regulator CsrA;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3157337..3158434;;CDS;;208;208;;;366;208;murein transglycosylase A;*
;3158643..3158719;;atgf;+;33;;33;;;;;
;3158753..3158829;;atgf;3 atgf;33;;33;;;;;
;3158863..3158939;;atgf;;635;*635;;;;;;
;3159575..3160075;;CDS;;;;;;167;;type VI secretion system contractile sheath small subunit;*
;;;;;;;;;;;;
;3230172..3231401;;CDS;;316;316;;;410;;HAAAP family serine/threonine permease;*
comp;3231718..3231791;;ggg;;78;78;;;;78;;
comp;3231870..3232625;;CDS;;;;;;252;;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
;;;;;;;;;;;;
;3341048..3341755;;CDS;;105;105;;;236;105;DUF554 domain-containing protein;*
;3341861..3341936;;ttc;;197;197;;;;;;
;3342134..3343399;;CDS;;;;;;422;;integrase arm-type DNA-binding domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3569308..3569814;;CDS;;124;124;;;169;;G/U mismatch-specific DNA glycosylase;*
;3569939..3570014;;atgi;;53;53;;;;53;;
comp;3570068..3570832;;CDS;;;;;;255;;NADPH-dependent ferric chelate reductase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3670227..3670679;;CDS;;206;206;;;151;206;ribosome maturation factor RimP;*
comp;3670886..3670962;;atgf;;347;347;;;;;;
&gt;;3671310..3672155;;CDS;;;;;;282;;Pseudo, argininosuccinate synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3673935..3674387;;CDS;;206;206;;;151;206;ribosome maturation factor RimP;*
comp;3674594..3674670;;atgf;;347;347;;;;;;
&gt;;3675018..3675869;;CDS;;;;;;284;;Pseudo, argininosuccinate synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3677794..3678246;;CDS;;206;206;;;151;206;ribosome maturation factor RimP;*
comp;3678453..3678529;;atgf;;347;347;;;;;;
&gt;;3678877..3679722;;CDS;;;;;;282;;Pseudo, argininosuccinate synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3681532..3681984;;CDS;;206;206;;;151;206;ribosome maturation factor RimP;*
comp;3682191..3682267;;atgf;;347;347;;;;;;
;3682615..3683958;;CDS;;;;;;448;;argininosuccinate synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3683966..3685591;;CDS;;456;*456;;;542;;phosphoethanolamine transferase;*
comp;3686048..3686134;;ctc;;14;14;;;;14;;
comp;3686149..3686481;;CDS;;;;;;111;;preprotein translocase subunit SecG;*
;;;;;;;;;;;;
;3784553..3785311;;CDS;;62;62;;;253;62;amino acid ABC transporter ATP-binding protein;*
comp;3785374..3785489;;5s;@3;39;;;;116;;;
comp;3785529..3785605;;acc;;14;;;;;;;
comp;3785620..3785735;;5s;;777;;;;116;;;
comp;3786513..3786588;;acc;;14;;;;;;;
comp;3786603..3786718;;5s;;1834;;;;116;;;
comp;3788553..3788628;;gaa;;1360;*1360;;;;;;
;3789989..3790543;;CDS;;;;;;185;;gamma carbonic anhydrase family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4078635..4080242;;CDS;;743;*743;;;536;;dipeptide ABC transporter substrate-binding protein DppA;*
comp;4080986..4081062;;ccg;;91;91;;;;91;;
comp;4081154..4082845;;CDS;;;;;;564;;kdo(2)-lipid A phosphoethanolamine 7''-transferase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4205966..4207348;;CDS;;292;292;;;461;292;glycoside-pentoside-hexuronide family transporter;*
;4207641..4207735;;tga;;300;300;;;;;;
&gt;;4208036..4208857;;CDS;;;;;;274;;Pseudo, DUF4102 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4338643..4339335;;CDS;;479;*479;;;231;;FadR family transcriptional regulator;*
;4339815..4341342;;16s;;73;;;;1528;;;
;4341416..4341491;;gaa;;184;;;;;;;
;4341676..4344286;;23s;;83;;;;2611;;;
;4344370..4344485;;5s;;53;;;;116;;;
;4344539..4344615;;gac;;8;;;;;;;
;4344624..4344699;;tgg;;95;95;;;;95;;
comp;4344795..4345634;;CDS;;;;;;280;;HTH-type transcriptional regulator HdfR;*
;;;;;;;;;;;;
;4377681..4379066;;CDS;;102;102;;;462;102;amino acid permease;*
;4379169..4379245;;cgg;;58;;58;;;;;
;4379304..4379379;;cac;;20;;20;;;;;
;4379400..4379486;;ctg;;42;;42;;;;;
;4379529..4379605;;cca;;146;146;;;;;;
;4379752..4380987;;CDS;;;;;;412;;anaerobic sulfatase maturase;*
;;;;;;;;;;;;
;4460971..4461516;;CDS;;377;377;;;182;;menaquinone-dependent protoporphyrinogen IX dehydrogenase;*
;4461894..4463631;;16s;;56;;;;1738;;;
;4463688..4463764;;atc;;42;;;42;;;;
;4463807..4463882;;gca;;165;;;;;;;
;4464048..4467338;;23s;;83;;;;3291;;;
;4467422..4467537;;5s;;104;104;;;116;104;;
comp;4467642..4468169;;CDS;;;;;;176;;molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B;*
;;;;;;;;;;;;
;4605577..4606434;;CDS;;374;374;;;286;;glutamate racemase;*
;4606809..4608362;;16s;;363;;;;1554;;;
;4608726..4608801;;gaa;;1112;;;;;;;
;4609914..4610029;;5s;;136;136;;;116;136;;
;4610166..4611194;;CDS;;;;;;343;;UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4612185..4613135;;CDS;;361;361;;;317;;type I pantothenate kinase;*
;4613497..4613572;;aca;;8;;8;;;;;
;4613581..4613665;;tac;;116;;*116;;;;;
;4613782..4613856;;gga;;6;;6;;;;;
;4613863..4613938;;acc;;114;114;;;;114;;
;4614053..4615237;;CDS;;;;;;395;;elongation factor Tu;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4642984..4644573;;CDS;;616;*616;;;530;;bifunctional  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase ;*
;4645190..4646378;;16s’;@1;83;83;;;1189;83;;
;4646462..4648150;;CDS;;436;*436;;;563;;bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase;*
;4648587..4648662;;gaa;;185;;;;;;;
;4648848..4651319;;23s;;83;;;;2472;;;
;4651403..4651518;;5s;;76;76;;;116;76;;
;4651595..4651978;;CDS;;;;;;128;;hypothetical protein;*
;;;;;;;;;;;;
&lt; comp;4834504..4834961;;CDS;;197;197;;;153;;pseudo, integrase;*
comp;4835159..4835234;;ttc;;106;106;;;;106;;
comp;4835341..4835916;;CDS;;;;;;192;;transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
;4864628..4865173;;CDS;;210;210;;;182;210;oligoribonuclease;*
;4865384..4865459;;ggc;+;36;;36;;;;;
;4865496..4865571;;ggc;3 ggc;35;;35;;;;;
;4865607..4865682;;ggc;;233;233;;;;;;
;4865916..4865969;;CDS;;;;;;18;;hp;*
;;;;;;;;;;;;
comp;4974178..4975197;;CDS;;195;195;;;340;;NADPH-dependent aldehyde reductase Ahr;*
;4975393..4975477;;ttg;;39;39;;;;39;;
&lt;&gt; comp;4975517..4976055;;CDS;;;;;;180;;pseudo, IS630 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;
;5042527..5042763;;CDS;;38;38;;;79;38;DUF1435 domain-containing protein;*
comp;5042802..5042888;;ctg;+;34;;34;;;;;
comp;5042923..5043009;;ctg;3 ctg;28;;28;;;;;
comp;5043038..5043124;;ctg;;290;290;;;;;;
comp;5043415..5044446;;CDS;;;;;;344;;16S rRNA (guanine(1207)-N(2))-methyltransferase RsmC;*
;;;;;;;;;;;;
comp;5079375..5079581;;CDS;;117;117;;;69;117;AlpA family transcriptional regulator;*
;5079699..5081218;;16s;;73;;;;1520;;;
;5081292..5081368;;gaa;;12;;;12;;;;
;5081381..5081454;;gca;;366;366;;;;;;
;5081821..5082018;;CDS;;524;*524;;;66;;hypothetical protein;*
comp;5082543..5082754;;CDS;;;;;;71;;hypothetical protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;5090325..5090876;;CDS;;1808;*1808;;;184;;MarR family transcriptional regulator;*
comp;5092685..5092760;;gaa;;588;*588;;;;*588;;
&lt; comp ;5093349..5093474;;CDS;;592;*592;;;42;;sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter substrate-binding protein UgpB;*
;5094067..5094142;;gaa;+;1472;;;*1472;;;;
;5095615..5095691;;atc;3 gaa;42;;;42;;;;
;5095734..5095809;;atc;2 atc;1130;;;*1130;;;;
;5096940..5097015;;gaa;;1145;;;*1145;;;;
;5098161..5098236;;gaa;;185;;;;;;;
;5098422..5100893;;23s;;83;;;;2472;;;
;5100977..5101092;;5s;;76;76;;;116;76;;
;5101169..5101552;;CDS;;63;63;;;128;;hypothetical protein;*
comp;5101616..5102059;;CDS;;;;;;148;;acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
;5124754..5125197;;CDS;;63;63;;;148;;acetyltransferase;*
comp;5125261..5125644;;CDS;;76;76;;;128;;hypothetical protein;*
comp;5125721..5125836;;5s;;83;;;;116;;;
comp;5125920..5128366;;23s’;@2;-10;*-10;;;2447;*-10;;
&lt;;5128357..5128479;;CDS;;;;;;41;;pilus assembly protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;5252659..5253870;;CDS;;300;300;;;404;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;5254171..5254249;;tga;;292;292;;;;292;;
&gt;;5254542..5255171;;CDS;;;;;;210;;pseudo, glycoside-pentoside-hexuronide family transporter;*
;;;;;;;;;;;;
&gt; comp;5305902..5306228;;CDS;;0;0;;;109;0;pseudo, hp;*
comp;5306229..5306302;;atc;;1096;*1096;;;;;;
;5307399..5308450;;CDS;;;;;;351;;pseudo, bifunctional DNA-binding transcriptional regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase Ada;*
;;;;;;;;;;;;
comp;5321144..5321869;;CDS;;206;206;;;242;206;pseudo, histidine kinase;*
comp;5322076..5322151;;gcc;+;39;;39;;;;;
comp;5322191..5322266;;gcc;3 gcc;39;;39;;;;;
comp;5322306..5322381;;gcc;;220;220;;;;;;
;5322602..5322961;;CDS;;;;;;120;;putative DNA-binding transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
comp;5323406..5324821;;CDS;;258;258;;;472;;glutamate--tRNA ligase;*
;5325080..5325155;;gta;+;44;;44;;;;;
;5325200..5325275;;gta;2 gta;0;0;;;;0;;
&lt;;5325276..5325389;;CDS;;;;;;38;;pseudo, putative DNA-binding transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;
&gt;;5375524..5376270;;CDS;;891;*891;;;249;*891;pseudo, AI-2E family transporter;*
;5377162..5377237;;gaa;;1047;*1047;;;;;;
comp;5378285..5379589;;CDS;;;;;;435;;isocitrate lyase;*
;;;;;;;;;;;;
comp &gt;;5341397..5341492;;CDS;;-2;*-2;;;32;*-2;ABC transporter ATP-binding protein;*
comp;5341491..5344303;;23s;;174;;;;2813;;;
comp;5344478..5344553;;gca;;42;;;42;;;;
comp;5344596..5344672;;atc;;56;;;;;;;
comp;5344729..5346282;;16s;;1063;;;;1554;;;
comp;5347346..5347421;;gca;;42;;;42;;;;
comp;5347464..5347540;;atc;;56;;;;;;;
comp;5347597..5349150;;16s;;365;365;;;1554;;;
comp;5349516..5350088;;CDS;;187;187;;;191;;D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase;*
&gt;;5350276..5350914;;CDS;;;;;;213;;methionine ABC transporter ATP-binding protein MetN;*
;;;;;;;;;;;;
&gt; comp;5359583..5360512;;CDS;;120;120;;;310;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;5360633..5360708;;gca;;42;;;;;;;
comp;5360751..5360827;;atc;;56;;;;;;;
comp;5360884..5362138;;16s’;;1;1;;;1255;1;;
&lt; comp;5362140..5363543;;CDS;;;;;;468;;IS66 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;
;5425965..5426201;;CDS;;38;38;;;79;38;DUF1435 domain-containing protein;*
comp;5426240..5426325;;ctg;+;26;;26;;;;a disparu le 20.12.19;*
comp;5426352..5426438;;ctg;3 ctg;28;;28;;;;;
comp;5426467..5426553;;ctg;;63;63;;;;;;
&lt; comp;5426617..5427150;;CDS;;;;;;178;;pseudo, IS630-like element IS630 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;
&gt;;5433568..5433687;;CDS;;39;39;;;40;39;pseudo, nicotinamide-nucleotide amidase;*
comp;5433727..5433814;;tcc;;253;253;;;;;;
comp;5434068..5434286;;CDS;;;;;;73;;translation initiation factor IF-1;*
&lt;/pre&gt;

====ecoN cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_cumuls|ecoN cumuls]]
&lt;pre&gt;
ecoN cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;12;1;0;;1;5;1;5;100;16;1;0
;16 23 5s;0;20;13;2;50;11;40;10;200;34;30;1
;16 atc gca;2;40;17;;100;17;80;7;300;29;60;6
;16 gaa 235;2;60;9;4;150;16;120;16;400;18;90;8
;max a;5;80;4;;200;15;160;3;500;18;120;8
;a doubles;1;100;0;;250;14;200;4;600;8;150;7
;spéciaux;8;120;1;;300;14;240;9;700;0;180;11
;total aas;27;140;0;;350;12;280;2;800;2;210;11
sans ;opérons;50;160;0;;400;7;320;2;900;1;240;6
;1 aa;32;180;0;;450;4;360;3;1000;0;270;9
;max a;7;200;0;;500;4;400;0;1100;0;300;12
;a doubles;15;;0;;;11;;2;;0;;0
;total aas;94;;44;6;;130;;63;;126;;79
total aas;;121;;;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;33;32;;253;;142;;272;;172
;;;variance;23;15;;258;;145;;162;;79
sans jaune;;;moyenne;31;;;178;;127;;260;;
;;;variance;19;;;109;;91;;142;;
&lt;/pre&gt;
====ecoN blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_blocs|ecoN blocs]]
&lt;pre&gt;
ecoN blocs;;;;;;;;;;;;
gène;interca;pbs;cdsa;;;gène;interca;pbs;cdsa;;;rRNAs
cds;365;;191;D-glycero;;cds;374;;286;Glu race;;16s
16s;73;1520;;;;16s;363;1554;;;;1189
gaa;12;;;;;gaa;1112;;;;;1255
gca;174;;;;;5s;136;116;;;;1520
23s;83;2588;;;;cds;;;343;UDP-N;;1520
5s;54;116;;;;;;;;;;1528
gac;162;;;;;cds;117;;69;tr AlpA;;1552
cds;;;268;gluDkgB;;16s;73;1520;;;;1554
;;;;;;gaa;12;;;;;1554
cds;323;;433;glutarate pm;;gca;366;;;;;1554
5s;83;116;;;;cds;524;;66;hp-66;;1738
23s;184;4452;;;;cds;;;71;hp-71;;
gaa;431;;;;;;;;;;;
16s;441;1552;;;;cds;-2;;32;ABC 32;;23s
cds;;;858;ClpB dep;;23s;174;2813;;;;2447
;;;;;;gca;42;;;;;2472
cds;616;;530;AICAR2;;atc;56;;;;;2472
16s’;83;1189;;;;16s;1063;1554;;;;2588
cds;436;;563;kinase isocit;;gca;42;;;;;2611
gaa;185;;;;;atc;56;;;;;2813
23s;83;2472;;;;16s;365;1554;;;;3291
5s;76;116;;;;cds;187;;191;D-glycero;;4452
cds;;;128;hp-128;;cds;;;213;ABC MetN;;
;;;;;;;;;;;;5s
cds;62;;253;pu-ABC;;cds;120;;310;Tyr recb 310;;116 x 11
5s;39;116;;;;gca;42;;;;;
acc;14;;;;;atc;56;;;;;
5s;777;116;;;;16s’;1;1255;;;;
acc;14;;;;;cds;;;468;IS66;;
5s;1834;116;;;;;;;;;;
gaa;1360;;;;;cds;63;;148;transferase;;
cds;;;185;gc anhydrase;;cds;76;;128;hp-128;;
;;;;;;5s;83;116;;;;
cds;377;;182;porphyrine M;;23s’;-10;2447;;;;
16s;56;1738;;;;cds;;;41;pilus;;
atc;42;;;;;;;;;;;
gca;165;;;;;cds;1808;;184;MarR ;;
23s;83;3291;;;;gaa;588;;;;;
5s;104;116;;;;cds;592;;42;sn-glycerol;;
cds;;;176;Mlb pB;;gaa;1472;;;;;
;;;;;;atc;42;;;;;
cds;479;;231;FadR tr ;;atc;1130;;;;;
16s;73;1528;;;;gaa;1145;;;;;
gaa;184;;;;;gaa;185;;;;;
23s;83;2611;;;;23s;83;2472;;;;
5s;53;116;;;;5s;76;116;;;;
gac;8;;;;;cds;63;;128;hp-128;;
tgg;95;;;;;cds;;;148;transferase;;
cds;;;280;HdfR HTH;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====ecoN distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_distribution|ecoN distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;4;3 gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;3 gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;3 gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;4;tac;;tgc;;tac2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;tac2;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;tac2;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1;acc;1;aac;3;agc;;aaa3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;aaa3;atc;2;acc;;aac;;agc;;aaa3;atc;;acc;2;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;atgf3;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;atgf3;ctc;;ccc;;cac;;cgt;5;atgf3;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;ggc3;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;ggc3;gtc;6;gcc;5;gac;;ggc;3;ggc3;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;2;atc :;tta;1;tca;;taa;;tga;;atc :;tta;;tca;;taa;;tga;;atc :;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;2;4 16s atc2 aa;ata;;aca;1;aaa;3;aga;;4 16s atc2 aa;ata;;aca;;aaa;3;aga;;4 16s atc2 aa;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;gaa :;cta;1;cca;1;caa;;cga;;gaa :;cta;;cca;;caa;2;cga;;gaa :;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;4;gga;;7 16s 5s 4aa;gta;2;gca;;gaa;;gga;1;7 16s 5s 4aa;gta;5;gca;;gaa;;gga;;7 16s 5s 4aa;gta;;gca;;gaa;1;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;acc :;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;acc :;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;acc :;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;2 5s &gt;aa aa;atgj;2;acg;;aag;;agg;;2 5s &gt;aa aa;atgj;;acg;;aag;;agg;;2 5s &gt;aa aa;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;6;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ecoN;;34;;;;;34;;ecoN;20;;;;;;20;;ecoN;44;;;;;;44;;ecoN;;;;6;;;6
&lt;/pre&gt;

====ecoN eco====
=====ecoN eco tableaux=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_eco_tableaux|ecoN eco tableaux]]
&lt;pre&gt;
;;;;;;rouge;ff6600;$;jaune;ffff00;#;;;;;;;;;;;
;;eco ecoN;;;;orange;ffcc00;&amp;;cyan;66ffff;°;gris2;dddddd;];;;;;;;;
;;;;;;jaunev;ccff66;@;turquoise;33ff99;%;Jaunev 5;669900;(;;;;;;;;
;19.12.19 Paris;;pour les cds;;;bleu;00ccff;§;gris1;eeeeee;[;;;;;;;;;;;
;Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;eco;;;;;;;;ecoN;;;;;;;;;;;;;
cluster;sens;;gènes;interca;cdsa;cds;;cluster;sens;;gènes;interca;cdsa;cds;;ecoN suite;sens;;gènes;interca;cdsa;cds
eco1;;222833..223408;cds;362;192;@D-glycero;;ecoN1;;231864..232436;CDS;365;191;@D-glycero;;EcoN 48;comp;5079375..5079581;CDS;117;69;tr AlpA
;;223771..225312;$16s;68;&amp;1542;;;;;232802..234321;$16s;73;&amp;1520;;;ok;;5079699..5081218;$16s;73;&amp;1520;
;;225381..225457;atc;42;;;;;;234395..234471;gaa;12;;;;;;5081292..5081368;gaa;12;;
;;225500..225575;gca;183;;;;;;234484..234557;gca;174;;;;;;5081381..5081454;gca;366;;
;;225759..228662;$23s;93;&amp;2904;;;;;234732..237319;$23s;83;&amp;2588;;;;;5081821..5082018;CDS;524;66;hp-66
;;228756..228875;$5s;52;&amp;120;;;;;237403..237518;$5s;54;&amp;116;;;;comp;5082543..5082754;CDS;;71;hp-71
;;228928..229004;gac;162;;;;;;237573..237649;gac;162;;;;;;;;;;
;;229167..229970;cds;;268;@metDkgB;;;;237812..238615;CDS;;268;@gluDkgB;;eco1;;222833..223408;cds;[362;192;]D-glycero
;;;;;;;;;;;;;;;;;;223771..225312;$16s;[68;&amp;1542;
eco2;;236067..236798;cds;132;244;@DNAIIIe;;ecoN2;;244934..245665;CDS;132;244;@DNAIIIe;;;;225381..225457;atc;[42;;
;;236931..237007;gac;327;;;;;;245798..245874;gac;120;;;;;;225500..225575;gca;[183;;
;;237335..238120;cds;;262;§lipo YafT;;;comp;245995..246852;CDS;;286;§DUF4942;;;;225759..228662;$23s;93;&amp;2904;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;228756..228875;$5s;52;&amp;120;
eco3;;261503..262756;cds;114;418;@glu5dH;;ecoN3;;367329..368582;CDS;114;418;@glu5dH;;;;228928..229004;gac;162;;
;;262871..262946;acg;203;;;;;;368697..368772;acg;154;;;;;;229167..229970;cds;;268;@metDkgB
;comp;263150..263212;cds;;21;§YdiA;;;;368927..369265;CDS;;113;§DUF4102;;EcoN 56;comp &gt;;5341397..5341492;CDS;-2;32;]ABC 32
;;262898..297205;#phage;;11436;pp CP4-6;;;;;;;;;;ok;comp;5341491..5344303;$23s;]174;&amp;2813;
;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;5344478..5344553;gca;]42;;
eco4;comp;563848..564480;cds;242;211;§put FimZ;;ecoN4;comp;631149..632015;CDS;270;289;§cyclo FolD;;;comp;5344596..5344672;atc;]56;;
;;564723..564799;aga;15;;;;;;632286..632362;aga;15;;;;;comp;5344729..5346282;$16s;]1063;&amp;1554;
;comp;564815..565978;cds;;388;§put DLP12;;;comp;632378..632997;CDS;;207;§Tyr recb 207;;;comp;5347346..5347421;gca;[42;;
;;564755..586056;#phage;;7101;pp DLP12;;;;;;;;;;;comp;5347464..5347540;atc;[56;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;5347597..5349150;$16s;[365;&amp;1554;
eco5;;695101..696276;cds;31;392;@octaprenyl;;ecoN5;;733188..734363;CDS;153;392;@octaprenyl;;;comp;5349516..5350088;CDS;[187;191;]D-glycero
;comp;696308..696378;rpr;51;&amp;71;rpt71;;;comp;734517..734591;°cag;37;;;;;&gt;;5350276..5350914;CDS;;213;ABC MetN
;comp;696430..696504;°cag;37;;;;;comp;734629..734703;°cag;48;;;;eco35;eco;3422436..3423194;cds;228;253;pu-YhdZ
;comp;696542..696616;°cag;47;;;;;comp;734752..734828;atgj;15;;;;;comp;3423423..3423542;$5s;]37;&amp;120;
;comp;696664..696740;atg;15;;;;;comp;734844..734918;°caa;34;;;;;comp;3423580..3423655;acc;]12;;
;comp;696756..696830;°caa;34;;;;;comp;734953..735027;°caa;23;;;;;comp;3423668..3423787;$5s;]92;&amp;120;
;comp;696865..696939;°caa;23;;;;;comp;735051..735135;cta;10;;;;;comp;3423880..3426783;$23s;]174;&amp;2904;
;comp;696963..697047;cta;9;;;;;comp;735146..735222;°atgj;380;;;;;comp;3426958..3427033;gca;]42;;
;comp;697057..697133;°atg;379;;;;;comp;735603..737267;CDS;;555;@Asn B;;;comp;3427076..3427152;atc;]68;;
;comp;697513..699177;cds;;555;@Asn B;;;;;;;;;;;comp;3427221..3428762;$16s;]473;&amp;1542;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;3429236..3429790;cds;;185;%protein YrdA
eco6;;779598..780389;cds;164;264;@ cell CpoB;;ecoN6;;807377..808169;CDS;164;264;@ p-cell CpoB;;ecoN35;;3784553..3785311;CDS;62;253;]pu-ABC
;;780554..780629;°aaa;135;;;;;;808334..808409;°aaa;35;;;;;comp;3785374..3785489;$5s;]39;&amp;116;
;;780765..780840;gta;2;;;;;;808445..808520;gta;2;;;;;comp;3785529..3785605;acc;]14;;
;;780843..780918;°aaa;149;;;;;;808523..808598;°aaa;51;;;;;comp;3785620..3785735;$5s;]777;&amp;116;
;;781068..781143;gta;3;;;;;;808650..808725;gta;3;;;;;comp;3786513..3786588;acc;]14;;
;;781147..781222;°aaa;146;;;;;;808729..808804;°aaa;48;;;;;comp;3786603..3786718;$5s;]1834;&amp;116;
;;781369..781444;°aaa;132;;;;;;808853..808928;°aaa;33;;;;;comp;3788553..3788628;gaa;1360;;
;;781577..781652;°aaa;432;;;;;;808962..809037;°aaa;277;;;;;;3789989..3790543;CDS;;185;%gc anhydrase
;;782085..783128;cds;;348;@quino;;;;809315..810358;CDS;;348;@quino NadA;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco7;;923264..925540;cds;343;759;@ATP ClpA;;ecoN7;;950069..952345;CDS;343;759;@ATP ClpA;;EcoN 59;&gt;;5433568..5433687;CDS;39;40;§p-Nam
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco8;comp;1030759..1031418;cds;206;220;@FtsH;;ecoN8;comp;1047224..1047883;CDS;206;220;@FtsH YccA;;;;;;;;
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;;1032139..1033257;cds;;373;@Hnase1;;;;1048604..1049722;CDS;;373;@Hnase1;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco9;;;;;;;;ecoN9;;1183656..1184018;CDS;463;121;hp-121;;;;;;;;
;;;*****aga*****;;;;;;;1184482..1184558;aga;278;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;&gt; comp;1184837..1185786;CDS;;317;p-IS4;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco10;;1095843..1096829;cds;735;329;§un-YcdU;;ecoN10;;1213982..1214809;CDS;165;276;§DUF4942;;;;;;;;
;comp;1097565..1097652;tcc;233;;;;;comp;1214975..1215062;tcc;233;;;;;;;;;;
;;1097886..1098824;cds;;313;@glyoxylate A;;;;1215296..1216234;CDS;;313;@glyoxyl GhrA;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco11;;;;;;;;ecoN11;;1216817..1217098;CDS;165;94;§DUF4942;;;;;;;;
;;;*****tcc*****;;;;;;comp;1217264..1217351;tcc;234;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;1217586..1218524;CDS;;313;@glyoxyl GhrA;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco12;;1286709..1286984;cds;81;92;§p-un-YchS;;ecoN12;;1457038..1458129;CDS;16;364;§acyl-CoA ;;;;;;;;
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;comp;1287244..1287328;°tac;209;;;;;comp;1458442..1458526;°tac;159;;;;;;;;;;
;comp;1287538..1287622;°tac;159;;;;;comp;1458686..1459528;CDS;;281;@fTHF;;;;;;;;
;comp;1287782..1288624;cds;;281;@fTHF;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;ecoN13;comp;1829066..1830322;CDS;307;419;%hp-419;;;;;;;;
eco13;;;;;;;;;;1830630..1830706;°gtc;4;;;;;;;;;;
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;;;°gtc;;;;;;&lt;;1830794..1831177;CDS;;128;§p-MdtK;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;ecoN14;comp;1831218..1832474;CDS;307;419;%hp-419;;;;;;;;
eco14;;*****;°gtc;*****;;;;;;1832782..1832858;°gtc;4;;;;;;;;;;
;;;°gtc;;;;;;;1832863..1832939;°gtc;8;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;&lt;;1832948..1833280;CDS;;111;§p-MATE;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco15;comp;1744871..1746127;cds;307;419;%adhes YdhQ;;ecoN15;comp;1833321..1834577;CDS;307;419;%hp-419;;;;;;;;
;; 1746435..1746511;°gtc;4;;;;;;1834885..1834961;°gtc;4;;;;;;;;;;
;; 1746516..1746592;°gtc;107;;;;;;1834966..1835042;°gtc;108;;;;;;;;;;
;;1746700..1747005;cds;;102;@pu-YdhR;;;;1835151..1835456;CDS;;102;@mono-O2;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;comp;1991815..1991901;tta;12;;;;;comp;2116655..2116741;tta;12;;;;;;;;;;
;comp;1991914..1991987;tgc;54;;;;;comp;2116754..2116827;tgc;53;;;;;;;;;;
;comp;1992042..1992117;ggc;151;;;;;comp;2116881..2116956;ggc;151;;;;;;;;;;
;comp;1992269..1992817;cds;;183;@glycerolP;;;comp;2117108..2117656;CDS;;183;@CDP-diacyl;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco17;;2042368..2042898;cds;569;177;§pu-cytochrom;;ecoN17;comp;2191451..2192287;CDS;278;279;§hp-279;;;;;;;;
;comp;2043468..2043557;tcg;93;;;;;comp;2192566..2192655;tcg;93;;;;;;;;;;
;;2043651..2044448;cds;100;266;%Mtf;;;;2192749..2193546;CDS;100;266;%MtfA;;;;;;;;
;;2044549..2044624;aac;313;;;;;;2193647..2193722;aac;161;;;;;;;;;;
;;2044938..2052014;cds;;2359;§Inv-adhesin;;;;2193884..2195146;CDS;;421;§Tyr recb-421;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;; 2059851..2059926;aac;[37;;;;;;2235198..2236148;CDS;[37;317;@tr-Cbl;;;;;;;;
;comp;2059964..2060914;cds;[101;317;tact Cbl;;;comp;2236186..2236261;aac;[4;;;;;;;;;;
;comp;2061016..2061933;cds;[326;306;tr-Nac;;;;2236266..2237909;CDS;[100;548;trp-YeeO;;;;;;;;
;;2062260..2062335;aac;55;;;;;;2238010..2238085;aac;161;;;;;;;;;;
;comp;2062391..2063323;cds;;311;§ErfK;;;;2238247..2239518;CDS;;424;§Tyr recb 424;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;2286211..2286287;ccc;102;;;;;;2548803..2548879;ccc;101;;;;;;;;;;
;comp;2286390..2288914;cds;;842;§adhes YejO;;;comp;2548981..2549136;CDS;;52;§barrel;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;2466309..2466383;agg;161;;;;;;2718788..2718862;agg;437;;;;;;;;;;
;;2466545..2467702;cds;;386;§KpLE1;;;comp;2719300..2719830;CDS;;177;§OmpH;;;ecoN;;;;;
;;2466369..2476583;#phage;;3405;pp CPS-53;;;;;;;;;;EcoN 53;comp;5321144..5321869;CDS;206;242;§p-His kinase
;;;;;;;;ecoN21;comp;2768744..2770933;CDS;206;730;@sensor;;ok;comp;5322076..5322151;°gcc;39;;
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;comp;2518041..2518116;°gcc;39;;;;;comp;2771255..2771330;°gcc;220;;;;;comp;5322306..5322381;°gcc;220;;
;comp;2518156..2518231;°gcc;235;;;;;;2771551..2771910;CDS;;120;%pu-tr 120;;;;5322602..5322961;CDS;;120;%pu-tr 120
;;2518467..2518811;cds;;115;%pu- YfeC;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco22;comp;2519257..2520672;cds;258;472;@Glu ligase;;ecoN22;comp;2772355..2773770;CDS;258;472;@Glu ligase;;;ecoN;;;;;
;;2520931..2521006;°gta;44;;;;;;2774029..2774104;°gta;43;;;;EcoN 54;comp;5323406..5324821;CDS;258;472;@Glu ligase
;;2521051..2521126;°gta;46;;;;;;2774148..2774223;°gta;46;;;;ok;;5325080..5325155;°gta;44;;
;;2521173..2521248;°gta;4;;;;;;2774270..2774345;°gta;4;;;;;;5325200..5325275;°gta;0;;
;;2521253..2521328;aaa;210;;;;;;2774350..2774425;aaa;110;;;;;&lt;;5325276..5325389;CDS;;38;§p-pu-tr 38
;;2521539..2521567;rpr;25;&amp;29;rpt-29;;;comp;2774536..2775420;CDS;;295;@LysR;;;;;;;;
;comp;2521593..2522477;cds;;295; @XapR;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;comp;2726069..2726188;$5s;92;&amp;120;;;;comp;2960827..2960942;$5s;83;&amp;116;;;;;;;;;
;comp;2726281..2729184;$23s;184;&amp;2904;;;;comp;2961026..2965477;$23s;184;&amp;4452;;;;;;;;;
;comp;2729369..2729444;gaa;171;;;;;comp;2965662..2965737;gaa;431;;;;;;;;;;
;comp;2729616..2731157;$16s;442;&amp;1542;;;;comp;2966169..2967720;$16s;441;&amp;1552;;;;;;;;;
;comp;2731600..2734173;cds;;858;@ClpB;;;comp;2968162..2970735;CDS;;858;@ClpB dep;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco24;comp;2784529..2785011;cds;750;161;DUF5507;;ecoN24;;;;;;;;;;;;;;
;comp;2785762..2785837;atgi;559;;;;;;;****atgi*****;;;;;;;;;;;
;;2786397..2788649;cds;;751;pu-unYgaQ;;ecoN25;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;comp;3027207..3027773;CDS;280;189;@fructose 6;;;;;;;;
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;comp;2818059..2818135;°cgt;62;;;;;comp;3028333..3028409;°cgt;62;;;;;;;;;;
;comp;2818198..2818274;°cgt;198;;;;;comp;3028472..3028548;°cgt;64;;;;;;;;;;
;comp;2818473..2818549;°cgt;3;;;;;comp;3028613..3028689;°cgt;3;;;;;;;;;;
;comp;2818553..2818645;agc;315;;;;;comp;3028693..3028785;agc;315;;;;;;;;;;
;comp;2818961..2819146;cds;;62;@Csr;;;comp;3029101..3029286;CDS;;62;@CsrA;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;2947387..2947463;°atgf;33;;;;;;3158643..3158719;°atgf;33;;;;;;;;;;
;;2947497..2947573;°atgf;33;;;;;;3158753..3158829;°atgf;33;;;;;;;;;;
;;2947607..2947683;°atgf;73;;;;;;3158863..3158939;°atgf;635;;;;;;;;;;
;comp;2947757..2949010;cds;;418;§Ala C;;;;3159575..3160075;CDS;;167;§sscs VI;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;comp;3110590..3111126;cds;;179;§pu-ssM;;;;3342134..3343399;CDS;;422;§arm-type;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;&gt;;3671310..3672155;CDS;;282;§p-Arg-sc 282;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;comp;3674594..3674670;atgf;347;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;&gt;;3675018..3675869;CDS;;284;§p-Arg-sc 284;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco32;;;;;;;;ecoN32;comp;3677794..3678246;CDS;206;151;@RimP;;;;;;;;
;;;;;;;;;comp;3678453..3678529;atgf;347;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;&gt;;3678877..3679722;CDS;;282;§p-Arg-sc 282;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;3318637..3319980;cds;;448;@Arg-suc;;;;3682615..3683958;CDS;;448;@Arg-suc;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco34;comp;3319988..3321613;cds;458;542;%pu-hydrolase;;ecoN34;comp;3683966..3685591;CDS;456;542;%Pet;;;;;;;;
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;comp;322173..3322505;cds;;111;@SecG-t;;;comp;3686149..3686481;CDS;;111;@SecG-p;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;comp;3423423..3423542;$5s;37;&amp;120;;;;comp;3785374..3785489;$5s;39;&amp;116;;;;;;;;;
;comp;3423580..3423655;acc;12;;;;;comp;3785529..3785605;acc;14;;;;;;;;;;
;comp;3423668..3423787;$5s;92;&amp;120;;;;comp;3785620..3785735;$5s;777;&amp;116;;;;;;;;;
;comp;3423880..3426783;$23s;174;&amp;2904;;;;comp;3786513..3786588;acc;14;;;;;;;;;;
;comp;3426958..3427033;gca;42;;;;;comp;3786603..3786718;$5s;1834;&amp;116;;;;;;;;;
;comp;3427076..3427152;atc;68;;;;;comp;3788553..3788628;gaa;1360;;;;;;;;;;
;comp;3427221..3428762;$16s;473;&amp;1542;;;;;3789989..3790543;CDS;;185;%gc anhydrase;;;;;;;;
;;3429236..3429790;cds;;185;%protein YrdA;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;comp;3708273..3708306;rpr;16;&amp;34;rpt-34;;;;;;;;;;;;;;;;
;;3708323..3708358;rpr;257;&amp;36;rpt-36;;ecoN36;comp;4078635..4080242;CDS;743;536;@DppA;;;;;;;;
;comp;3708616..3708692;ccg;91;;;;;comp;4080986..4081062;ccg;91;;;;;;;;;;
;comp;3708784..3710475;cds;;564;@kdo2;;;comp;4081154..4082845;CDS;;564;@kdo2;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco37;comp;3834547..3835929;cds;292;461;%pu-YicJ;;;;;;;;;;;;;;;;
;;3836222..3836316;tga;108;;;;ecoN37;comp;4205966..4207348;CDS;[292;461;%glycoside-p5;;EcoN 51;comp;5252659..5253870;CDS;[300;404;(Tyr recb 404
;;3836425..3836556;pseudo;396;&amp;132;p-yicT;;;;4207641..4207735;tga;[300;;;;ok;comp;5254171..5254249;tga;[292;;
;;3836953..3838137;cds;;395;§pu-arabi;;;&gt;;4208036..4208857;CDS;;274;§p-DUF4102;;;&gt;;5254542..5255171;CDS;;210;p-glycoside
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco38;comp;3940635..3941327;cds;480;231;%pu-tr YieP;;ecoN38;comp;4338643..4339335;CDS;479;231;%FadR tr ;;;;;;;;
;;3941808..3943349;$16s;85;&amp;1542;;;;;4339815..4341342;$16s;73;&amp;1528;;;;;;;;;
;;3943435..3943510;gaa;193;;;;;;4341416..4341491;gaa;184;;;;;;;;;;
;;3943704..3946607;$23s;92;&amp;2904;;;;;4341676..4344286;$23s;83;&amp;2611;;;;;;;;;
;;3946700..3946819;$5s;52;&amp;120;;;;;4344370..4344485;$5s;53;&amp;116;;;;;;;;;
;;3946872..3946948;gac;8;;;;;;4344539..4344615;gac;8;;;;;;;;;;
;;3946957..3947032;tgg;95;;;;;;4344624..4344699;tgg;95;;;;;;;;;;
;comp;3947128..3947967;cds;;280;@HdfR;;;comp;4344795..4345634;CDS;;280;@HdfR HTH;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;EcoN 52;&gt; comp;5305902..5306228;CDS;0;109;p-hp
eco39;;3980887..3982272;cds;102;462;%pu-YifK;;ecoN39;;4377681..4379066;CDS;102;462;%aa permease;;;comp;5306229..5306302;atc;1096;;
;;3982375..3982451;cgg;57;;;;;;4379169..4379245;cgg;58;;;;ecoN ?;;5307399..5308450;CDS;;351;(p-Ada
;;3982509..3982585;cac;20;;;;;;4379304..4379379;cac;20;;;;;;;;;;
;;3982606..3982692;ctg;42;;;;;;4379400..4379486;ctg;42;;;;EcoN 57;&gt; comp;5359583..5360512;CDS;120;310;(Tyr recb 310
;;3982735..3982811;cca;146;;;;;;4379529..4379605;cca;146;;;;;comp;5360633..5360708;gca;[42;;
;;3982958..3984193;cds;;412;%pu-AslB;;;;4379752..4380987;CDS;;412;%ans maturase;;ecoN40;comp;5360751..5360827;atc;[56;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;5360884..5362138;°16s’;1;&amp;1255;
eco40;;4034608..4035153;cds;377;182;@porphyrine O;;ecoN40;;4460971..4461516;CDS;377;182;@porphyrine M;;;&lt; comp;5362140..5363543;CDS;;468;(IS66
;;4035531..4037072;$16s;68;&amp;1542;;;;;4461894..4463631;$16s;[56;&amp;1738;;;;;;;;;
;;4037141..4037217;atc;42;;;;;;4463688..4463764;atc;[42;;;;EcoN 55;&gt;;5375524..5376270;CDS;891;249;(p-AI-2E
;;4037260..4037335;gca;183;;;;;;4463807..4463882;gca;165;;;;;;5377162..5377237;gaa;1047;;eco 435
;;4037519..4040423;$23s;93;&amp;2905;;;;;4464048..4467338;$23s;83;&amp;3291;;;ecoN ?;comp;5378285..5379589;CDS;;435;isocitrate
;;4040517..4040636;$5s;228;&amp;120;;;;;4467422..4467537;$5s;104;&amp;116;;;;;;;;;
;;4040865..4040900;rpr;5;&amp;36;rpt-36;;;comp;4467642..4468169;CDS;;176;@Mlb pB;;EcoN 49;comp;5090325..5090876;CDS;1808;184;(MarR
;comp;4040906..4041433;cds;;176;@Mlb adapt;;;;;;;;;;;comp;5092685..5092760;gaa;588;;
;;;;;;;;;;;;;;;;ecoN ?;&lt; comp ;5093349..5093474;CDS;592;42;(sn-glycerol
eco41;;4165428..4166285;cds;373;286;@Glu race;;ecoN41;;4605577..4606434;CDS;374;286;@Glu race;;;;5094067..5094142;°gaa;1472;;
;;4166659..4168200;$16s;171;&amp;1542;;;;;4606809..4608362;$16s;363;&amp;1554;;;;;5095615..5095691;atc;42;;
;;4168372..4168447;gaa;193;;;;;;4608726..4608801;gaa;1112;;;;;;5095734..5095809;atc;1130;;
;;4168641..4171544;$23s;92;&amp;2904;;;;;4609914..4610029;$5s;136;&amp;116;;;;;5096940..5097015;°gaa;1145;;
;;4171637..4171756;$5s;300;&amp;120;;;;;4610166..4611194;CDS;;343;@UDP-N;;ok ecoN43;;5098161..5098236;°gaa;]185;;
;;4172057..4173085;cds;;343;@UDP-N;;;;;;;;;;;;5098422..5100893;$23s;]83;&amp;2472;
;;;;;;;;ecoN42;comp;4612185..4613135;CDS;361;317;@B5 kinase I;;;;5100977..5101092;$5s;]76;&amp;116;
eco42;comp;4174076..4175026;cds;361;317;@B5 kinase;;;;4613497..4613572;aca;8;;;;;;5101169..5101552;CDS;63;128;hp-128
;;4175388..4175463;aca;8;;;;;;4613581..4613665;tac;116;;;;;comp;5101616..5102059;CDS;;148;transferase
;;4175472..4175556;tac;116;;;;;;4613782..4613856;gga;6;;;;;;;;;;
;;4175673..4175747;gga;6;;;;;;4613863..4613938;acc;114;;;;EcoN 50;;5124754..5125197;CDS;63;148;transferase
;;4175754..4175829;acc;114;;;;;;4614053..4615237;CDS;;395;@tuf;;;comp;5125261..5125644;CDS;76;128;hp-128
;;4175944..4177128;cds;229;395;@tufb;;;;;;;;;;ecoN40;comp;5125721..5125836;$5s;83;&amp;116;
;;4177358..4177741;cds;;128;SecE;;ecoN43;comp;4642984..4644573;CDS;616;530;@AICAR2;;;comp;5125920..5128366;°23s’;-10;&amp;2447;
;;;;;;;;;;4645190..4646378;°16s’;83;&amp;1189;;;;&lt;;5128357..5128479;CDS;;41;(pilus
eco43;comp;4205943..4207532;cds;614;530;@AICAR1;;;;4646462..4648150;CDS;436;563;§kinase isocit;;;;;;;;
;;4208147..4209688;$16s;85;&amp;1542;;;;;4648587..4648662;gaa;]185;;;;;;;;;;
;;4209774..4209849;gaa;193;;;;;;4648848..4651319;$23s;]83;&amp;2472;;;;;;;;;
;;4210043..4212946;$23s;93;&amp;2904;;;;;4651403..4651518;$5s;]76;&amp;116;;;;;;;;;
;;4213040..4213159;$5s;74;&amp;120;;;;;4651595..4651978;CDS;;128;%hp-128;;;;;;;;
;;4213234..4213617;cds;;128;%stress;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;ecoN44;;;;;;;;;;;;;;
eco44;comp;4360396..4361934;cds;256;513;§CadC;;;&lt; comp;4834504..4834961;CDS;197;153;§pu-integrase;;;;;;;;
;comp;4362191..4362353;pseudo;197;&amp;163;yjdQ;;;comp;4835159..4835234;ttc;106;;;;;;;;;;
;comp;4362551..4362626;ttc;106;;;;;comp;4835341..4835916;CDS;;192;@tr 192;;;;;;;;
;comp;4362733..4363308;cds;;192;@pu-tr YjdC;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco45;;4391604..4392149;cds;210;182;@oligo-rnase;;ecoN45;;4864628..4865173;CDS;210;182;@oligo-rnase;;;;;;;;
;;4392360..4392435;°ggc;36;;;;;;4865384..4865459;°ggc;36;;;;;;;;;;
;;4392472..4392547;°ggc;35;;;;;;4865496..4865571;°ggc;35;;;;;;;;;;
;;4392583..4392658;°ggc;233;;;;;;4865607..4865682;°ggc;233;;;;;;;;;;
;;4392892..4392945;cds;;18;@un-YjeV;;;;4865916..4865969;CDS;;18;@hp-18;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco46;comp;4495190..4496209;cds;195;340;@NADPH- Ah;;ecoN46;comp;4974178..4975197;CDS;195;340;@NADPH- Ahr;;;;;;;;
;;4496405..4496489;ttg;260;;;;;;4975393..4975477;ttg;39;;;;;;;;;;
;;4496750..4497940;cds;;397;§pu-KpLE2;;;&lt;&gt; comp;4975517..4976055;CDS;;180;§p-IS630 ;;;;;;;;
;;4496675..4497940;#phage;;422;pp PR-Y;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco47;;4605804..4606040;cds;38;79;%protein YjjZ;;;;;;;;;;;;;;;;
;comp;4606079..4606165;°ctg;34;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;comp;4606200..4606286;°ctg;28;;;;ecoN47;;5042527..5042763;CDS;38;79;%DUF1435;;EcoN 58;;5425965..5426201;CDS;38;79;%DUF1435
;comp;4606315..4606401;°ctg;157;;;;;comp;5042802..5042888;°ctg;34;;;;ok;comp;5426240..5426325;°ctg;26;;
;;4606559..4606594;rpr;22;&amp;36;rpt 36;;;comp;5042923..5043009;°ctg;28;;;;;comp;5426352..5426438;°ctg;28;;
;comp;4606617..4606650;rpr;18;&amp;34;rpt 34;;;comp;5043038..5043124;°ctg;290;;;;;comp;5426467..5426553;°ctg;63;;
;comp;4606669..4607700;cds;;344;@G1207;;;comp;5043415..5044446;CDS;;344;@G1207 RsmC;;;&lt; comp;5426617..5427150;CDS;;178;p-IS630
&lt;/pre&gt;
=====ecoN eco noms cds=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_eco_noms_cds|ecoN eco noms cds]]
&lt;pre&gt;
fonction;Noms courts;Noms longs;;;;;
tr-regulator; XapR;DNA-binding transcriptional activator XapR;;;;;*
permease;aa permease;amino acid permease;;;;;*
ABC bind;ABC 32;ABC transporter ATP-binding protein;;;;;*
ABC bind;ABC MetN;methionine ABC transporter ATP-binding protein MetN;;;;;*
desaturase;acyl-CoA ;acyl-CoA desaturase;;;;;*
adhesin;adhes YdhQ;adhesin-like autotransporter YdhQ;;;;;*
adhesin;adhes YejO;adhesin-like autotransporter YejO, gene fragment 2 of yejO,  misc_feature ;;;;;*
hydrolase ;AICAR1;bifunctional AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase;;;;;*
hydrolase ;AICAR2;bifunctional  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase ;;;;;*
amidase;Ala C;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase C;;;;;*
maturase;ans maturase;anaerobic sulfatase maturase;;;;;*
synthetase;Arg-suc;argininosuccinate synthetase;;;;;*
integrase;arm-type;integrase arm-type DNA-binding domain-containing protein;;;;;*
synthetase;Asn B;asparagine synthetase B;;;;;*
protease b;ATP ClpA;ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA;;;;;*
kinase;B5 kinase;pantothenate kinase;;;;;*
kinase;B5 kinase I;type I pantothenate kinase;;;;;*
transporter;barrel;autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein;;;;;*
tr-regulator;CadC;DNA-binding transcriptional activator CadC;;;;;*
cardiolipin ;cardiolipine;cardiolipin transport protein PbgA;;;;;*
transferase;CDP-diacyl;CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase;;;;;*
division;cell CpoB;cell division coordinator CpoB;;;;;*
chaperone;ClpB;ClpB chaperone;;;;;*
chaperone;ClpB dep;ATP-dependent chaperone ClpB;;;;;*
storage;Csr;carbon storage regulator;;;;;*
storage;CsrA;carbon storage regulator CsrA;;;;;*
hydrolase ;cyclo FolD;bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD;;;;;*
phosphatase;D-glycero;D-glycero-beta-D-manno-heptose-1,7-bisphosphate 7-phosphatase;;;;;*
ABC bind;dip ABC;dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein;;;;;*
polymerase;DNAIIIe;DNA polymerase III subunit epsilon;;;;;*
ABC bind;DppA;dipeptide ABC transporter substrate-binding protein DppA;;;;;*
DUF;DUF1435;DUF1435 domain-containing protein;;;;;*
DUF;DUF4102;DUF4102 domain-containing protein;;;;;*
DUF;DUF4942;DUF4942 domain-containing protein;;;;;*
DUF;DUF5507;DUF5507 domain-containing protein YpjC;;;;;*
DUF;DUF554 ;DUF554 domain-containing protein;;;;;*
DUF;DUF554 Yqg;DUF554 domain-containing protein YqgA;;;;;*
peptidase;ErfK;L,D-transpeptidase ErfK;;;;;*
exporter;exporter;FMN/FAD exporter;;;;;*
tr-regulator;FadR tr ;FadR family transcriptional regulator;;;;;*
reductase;ferric ;NADPH-dependent ferric chelate reductase;;;;;*
phosphatase;fructose;fructose-1-phosphatase;;;;;*
phosphatase;fructose 6;fructose-1-phosphate/6-phosphogluconate phosphatase;;;;;*
deformylase;fTHF;formyltetrahydrofolate deformylase;;;;;*
protase;FtsH;modulator of FtsH protease;;;;;*
protease;FtsH YccA;FtsH protease modulator YccA;;;;;*
glycosylase;G/U;G/U mismatch-specific DNA glycosylase;;;;;*
glycosylase;G/U station;stationary phase mismatch/uracil DNA glycosylase;;;;;*
transferase;G1207;16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase;;;;;*
transferase;G1207 RsmC;16S rRNA (guanine(1207)-N(2))-methyltransferase RsmC;;;;;*
anhydrase;gc anhydrase;gamma carbonic anhydrase family protein;;;;;*
ligase;Glu ligase;glutamate--tRNA ligase;;;;;*
racemase;Glu race;glutamate racemase;;;;;*
dehydrogenase;glu5dH;glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase;;;;;*
reductase;gluDkgB;2,5-didehydrogluconate reductase DkgB;;;;;*
permease;glutarate pm;alpha-ketoglutarate permease;;;;;*
symporter;glutarate sm;alpha-ketoglutarate:H(+) symporter;;;;;*
peptidase;glycan DD;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;;;;;*
synthetase;glycerolP;phosphatidylglycerophosphate synthase;;;;;*
transporter;glycoside-p5;glycoside-pentoside-hexuronide family transporter;;;;;*
reductase;glyoxyl A;glyoxylate/hydroxypyruvate reductase A;;;;;*
reductase;glyoxyl GhrA;glyoxylate/hydroxypyruvate reductase GhrA;;;;;*
permease;HAAAP;HAAAP family serine/threonine permease;;;;;*
tr-regulator;HdfR;DNA-binding transcriptional dual regulator HdfR;;;;;*
tr-regulator;HdfR HTH;HTH-type transcriptional regulator HdfR;;;;;*
hydrogenase;Hnase1;hydrogenase 1 small subunit;;;;;*
hp;hp-121;hp-121;;;;;
hp;hp-128;hypothetical protein;;;;;*
hp;hp-18;hp-18;;;;;*
adhesin;Inv-adhesin;inverse autotransporter adhesin;;;;;*
transposase;IS66;IS66 family transposase;;;;;*
lyase;isocitrate;isocitrate lyase;;;;;*
transferase;kdo2;kdo(2)-lipid A phosphoethanolamine 7''-transferase;;;;;*
kinase/Pase;kinase isocit;bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase;;;;;*
prophage;KpLE1;CPS-53 (KpLE1) prophage, prophage CPS-53 integrase;;;;;*
lipoprotein;lipo YafT;lipoprotein YafT;;;;;*
tr-regulator;LysR;LysR family transcriptional regulator;;;;;*
tr-regulator;MarR;MarR family transcriptional regulator;;;;;*
reductase;metDkgB;methylglyoxal reductase DkgB;;;;;*
GDP;Mlb adapt;molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis adaptor protein;;;;;*
GDP;Mlb pB;molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B;;;;;*
oxygenase;mono-O2;monooxygenase;;;;;*
titration;Mtf;Mlc titration factor;;;;;*
tr-regulator;MtfA;DgsA anti-repressor MtfA;;;;;*
glycosylase;murein;murein transglycosylase A;;;;;*
glycosylase;murein lytic;membrane-bound lytic murein transglycosylase A;;;;;*
reductase;NADPH- Ah;aldehyde reductase, NADPH-dependent;;;;;*
reductase;NADPH- Ahr;NADPH-dependent aldehyde reductase Ahr;;;;;*
transporter;nitrite;formate/nitrite transporter family protein;;;;;*
hydroxylase;octaprenyl;2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase;;;;;*
rnase;oligo-rnase;oligoribonuclease;;;;;*
protein;OmpH;OmpH family outer membrane protein;;;;;*
transferase;p-Ada;pseudo, bifunctional DNA-binding transcriptional regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase Ada;;;;;*
transporter;p-AI-2E;pseudo, AI-2E family transporter;;;;;*
synthetase;p-Arg-sc 282;Pseudo, argininosuccinate synthase;;;;;*
synthetase;p-Arg-sc 284;Pseudo, argininosuccinate synthase;;;;;*
division;p-cell CpoB;Pseudo, cell division protein CpoB;;;;;*
DUF;p-DUF4102;Pseudo, DUF4102 domain-containing protein;;;;;*
transporter;p-glycoside;pseudo, glycoside-pentoside-hexuronide family transporter;;;;;*
kinase;p-His kinase;pseudo, histidine kinase;;;;;*
hp;p-hp;pseudo, hp 109;;;;;*
integrase;p-integrase;pseudo, integrase;;;;;*
transposase;p-IS4;Pseudo, IS4 family transposase;;;;;*
transposase;p-IS630 ;pseudo, IS630 family transposase;;;;;*
transporter;p-MATE;Pseudo, MATE family efflux transporter;;;;;*
transporter;p-MdtK;Pseudo, multidrug efflux MATE transporter MdtK;;;;;*
amidase;p-Nam;pseudo, nicotinamide-nucleotide amidase;;;;;*
tr-regulator;p-pu-tr 38;pseudo, putative DNA-binding transcriptional regulator;;;;;*
protein;p-un-YchS;putative uncharacterized protein YchS;;;;;*
gene;p-yicT;p-yicT;;;;;*
transferase;Pet;phosphoethanolamine transferase;;;;;*
protein;pilus;pilus assembly protein;;;;;*
dehydrogenase;porphyrine M;menaquinone-dependent protoporphyrinogen IX dehydrogenase;;;;;*
oxidase;porphyrine O;protoporphyrinogen oxidase;;;;;*
prophage;pp CP4-6;note=&quot;cryptic prophage CP4-6&quot;     misc_feature;;;;;*
prophage;pp CPS-53;cryptic prophage CPS-53, misc_feature;;;;;*
prophage;pp DLP12;note=&quot;cryptic prophage DLP12&quot;     misc_feature;;;;;*
prophage;pp PR-Y;cryptic prophage PR-Y;;;;;*
protein;protein YjjZ;protein YjjZ;;;;;*
protein;protein YrdA;protein YrdA;;;;;*
tr-regulator;pu- YfeC;putative DNA-binding transcriptional regulator YfeC;;;;;*
ABC bind;pu-ABC;amino acid ABC transporter ATP-binding protein;;;;;*
exporter;pu-arabi;putative arabinose exporter;;;;;*
sulfatase;pu-AslB;putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB;;;;;*
cardiolipin ;pu-cardiolip;putative cardiolipin transport protein;;;;;*
cytochrome;pu-cytochrom;putative cytochrome;;;;;*
hydrolase;pu-hydrolase;putative hydrolase, inner membrane;;;;;*
integrase;pu-KpLE2;KpLE2 phage-like element putative integrase;;;;;*
peptidase;pu-LysM;LysM domain-containing putative peptidase lipoprotein YgeR;;;;;*
GMP;pu-sensor;putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeA;;;;;*
protein;Pu-ssM;putative type II secretion system M-type protein;;;;;*
tr-regulator;pu-tr 120;putative DNA-binding transcriptional regulator;;;;;*
tr-regulator;pu-tr YieP;putative transcriptional regulator YieP;;;;;*
tr-regulator;pu-tr YjdC;putative DNA-binding transcriptional regulator YjdC;;;;;*
tr-regulator;pu-tr-YeeN;putative transcriptional regulator YeeN;;;;;*
protein;pu-unYgaQ;putative uncharacterized protein YgaQ;;;;;*
oxygenase;pu-YdhR;putative monooxygenase YdhR;;;;;*
ABC bind;pu-YhdZ;putative ABC transporter ATP-binding subunit YhdZ;;;;;*
transporter;pu-YicJ;putative xyloside transporter YicJ;;;;;*
transporter;pu-YifK;putative transporter YifK;;;;;*
prophage;put DLP12;DLP12 prophage putative integrase;;;;;*
tr-regulator;put FimZ;putative LuxR family transcriptional regulator FimZ;;;;;*
synthetase;quino;quinolinate synthase;;;;;*
synthetase;quino NadA;quinolinate synthase NadA;;;;;*
ribosome;RimP;ribosome maturation factor RimP;;;;;*
rpt;rpt-29;rpt-29;;;;;
rpt;rpt-34;rpt_type=other;;;;;*
rpt;rpt-36;rpt_type=other;;;;;*
rpt;rpt71;rpt_type=other  71;;;;;*
sRNA;RttR sRNA;small RNA RttR;;;;;*
translocase;SecE;Sec translocon subunit SecE;;;;;*
translocase;SecG-p;preprotein translocase subunit SecG;;;;;*
translocase;SecG-t;Sec translocon subunit SecG;;;;;*
esterase;sensor;sensor domain-containing phosphodiesterase;;;;;*
ABC bind;sn-glycerol;sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter substrate-binding protein UgpB;;;;;*
protein;sscs VI;type VI secretion system contractile sheath small subunit;;;;;*
protein;stress;stress response protein;;;;;*
tr-regulator;tact Cbl;DNA-binding transcriptional activator Cbl;;;;;*
translation;tif IF-1;translation initiation factor IF-1;;;;;*
protein;tpr;protamine-like protein;;;;;*
tr-regulator;tr 192;transcriptional regulator;;;;;*
tr-regulator;tr AlpA;AlpA family transcriptional regulator;;;;;*
tr-regulator;tr-Cbl;HTH-type transcriptional regulator Cbl;;;;;*
tr-regulator;tr-Nac;DNA-binding transcriptional dual regulator Nac;;;;;*
tr-regulator;tr-nitrogen;nitrogen assimilation transcriptional regulator;;;;;*
tr-regulator;tr-YebC;YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator;;;;;*
transferase;transferase;acetyltransferase;;;;;*
transporter;trp-YeeO;toxic metabolite efflux MATE transporter YeeO;;;;;*
translation;tuf;elongation factor Tu;;;;;*
translation;tufb;tufb, translation elongation factor Tu 2;;;;;*
integrase;Tyr recb 207;tyrosine-type recombinase/integrase;;;;;*
integrase;Tyr recb 404;tyrosine-type recombinase/integrase;;;;;*
integrase;Tyr recb 421;tyrosine-type recombinase/integrase;;;;;*
integrase;Tyr recb 424;tyrosine-type recombinase/integrase;;;;;*
reductase;UDP-N;UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase;;;;;*
protein;un-YcdU;uncharacterized protein YcdU;;;;;*
protein;un-YjeV;uncharacterized protein YjeV;;;;;*
protein;UPF0149 YecA;UPF0149 family protein YecA;;;;;*
protein;YdiA;YdiA family protein;;;;;*
protein;YfdC;inner membrane protein YfdC;;;;;*
protein;YgeQ;protein YgeQ;;;;;*
gene;yjdQ;gene=&quot;yjdQ&quot;;;;;;*
DUF;DUF1435;DUF1435 domain-containing protein;;;;;*
transposase;p-IS630;pseudo, IS630-like element IS630 family transposase;;;;;*
&lt;/pre&gt;
====ecoN données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_données_intercalaires|ecoN données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;aa;intercalaire;;aa
fxt;fct;ecoN;fx;fc;ecoN;fx40;fc40;ecoN;x-;c-;c;x;c;x;;c;x;
;2;0;18;29;0;18;29;-1;2;173;162;120;CDS 16s ;;;tRNA tRNA;;suite
1;2;10;44;403;1;10;51;-2;4;5;132;15;385;479;;33;;tac
1;1;20;22;337;2;9;61;-3;2;0;114;153;441;117;;**;;tac
;0;30;23;182;3;9;58;-4;39;328;154;343;377;;;4;;gtc
4;1;40;90;109;4;3;27;-5;2;2;32;426;374;;;**;;gtc
;0;50;95;113;5;2;18;-6;0;0;380;278;365;;;4;;gtc
1;0;60;69;147;6;4;17;-7;1;16;164;165;672;;;**;;gtc
;1;70;48;109;7;3;24;-8;2;81;277;233;23s 5s;;;4;;gtc
;3;80;36;110;8;1;16;-9;3;2;253;165;6* 95;;;**;;gtc
;0;90;39;112;9;1;66;-10;0;7;206;234;1881;;;12;;tta
2;3;100;43;99;10;2;65;-11;1;48;463;307;23s CDS;;;53;;tgc
1;4;110;36;96;11;1;53;-12;2;3;159;307;331;;;**;;ggc
1;3;120;38;70;12;7;53;-13;1;6;6;307;385;;;39;;gcc
2;0;130;37;63;13;0;29;-14;5;23;8;93;5s CDS;;;**;;gcc
;1;140;43;52;14;0;38;-15;0;0;108;453;323;62;;43;;gta
1;1;150;29;68;15;2;39;-16;1;3;195;326;136;104;;46;;gta
1;3;160;44;50;16;6;29;-17;1;11;151;37;3* 76;;;4;;gta
2;4;170;27;45;17;4;21;-18;3;0;278;4;16s tRNA;;;**;;aaa
;0;180;28;42;18;0;34;-19;2;4;100;125;3* 85;;gaa;63;;cgt
;0;190;38;44;19;1;18;-20;1;9;161;437;443;;gaa;62;;cgt
1;3;200;34;36;20;1;23;-21;0;0;100;220;375;;gaa;62;;cgt
1;8;210;31;36;21;1;24;-22;0;3;161;258;4* 68;;atc;64;;cgt
2;0;220;35;43;22;0;23;-23;0;8;74;110;tRNA 16s;;;3;;cgt
;0;230;26;30;23;2;11;-24;2;0;75;208;1063;;gca;**;;agc
2;1;240;21;25;24;4;27;-25;2;2;206;316;tRNA 23s;;;33;;atgf
;0;250;27;18;25;0;19;-26;1;9;280;124;269;;gaa;33;;atgf
2;2;260;27;24;26;1;15;-27;1;0;315;53;2* 193;;gaa;**;;atgf
;0;270;18;23;27;2;25;-28;1;3;635;347;2* 194;;gaa;58;;cgg
1;3;280;24;20;28;4;8;-29;4;5;78;347;174;;gca;20;;cac
;1;290;19;18;29;5;14;-30;4;0;105;347;183;;;42;;ctg
2;2;300;9;15;30;4;16;-31;0;0;197;347;5s tRNA;;;**;;cca
3;0;310;13;17;31;4;13;-32;1;7;206;1360;54;;gac;8;;aca
1;1;320;22;12;32;3;12;-33;0;0;206;292;2* 14;;acc;116;;tac
1;0;330;11;16;33;7;9;-34;0;0;206;95;53;;gac;6;;gga
;0;340;14;8;34;9;17;-35;2;4;206;361;tRNA 5s;;;**;;acc
5;0;350;5;15;35;11;8;-36;0;0;456;195;39;;acc;36;;ggc
;0;360;9;12;36;4;15;-37;1;3;14;39;777;;acc;35;;ggc
1;0;370;10;14;37;10;5;-38;2;1;743;38;1360;;gaa;**;;ggc
;1;380;19;12;38;12;7;-39;2;0;91;1174;1112;;gaa;34;;ctg
;0;390;10;9;39;13;10;-40;1;1;300;592;tRNA tRNA;;intra;28;;ctg
;0;400;9;14;40;17;13;-41;1;1;102;292;4* 42;;atc gca;**;;ctg
7;7;reste;142;125;reste;1185;1762;-42;0;0;146;1096;tRNA tRNA;;début;39;;gcc
46;58;total;1382;2822;total;1382;2822;-43;0;3;114;220;37;;cag;39;;gcc
39;49;diagr;1222;2668;diagr;179;1031;-44;1;0;436;258;48;;cag;**;;gcc
2;3;t30;89;922;;;;-45;0;0;197;150;15;;atgj;44;;gta
;;;;;;;;-46;0;0;106;39;34;;caa;**;;gta
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;1;0;210;;23;;caa;28;;ctg
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;1;0;233;;10;;cta;**;;ctg
;x;1364;105;18;1487;;;-49;0;0;290;;**;;atgj;tRNA tRNA;;contig
;c;2793;782;29;3604;;;-50;0;1;1537;;35;;aaa;8;;gac
;;;;;5091;217;;reste;5;10;588;;2;;gta;**;;tgg
;;;;;;5308;;total;105;782;300;;51;;aaa;1472;;gaa
;;;;;;;;;;;0;;3;;gta;42;;atc
;;;;;;;;;;;206;;48;;aaa;2351;;atc
;;;;;;;;;;;0;;33;;aaa;**;;gaa
;;;;;;;;;;;120;;**;;aaa;42;;gca
;;;;;;;;;;;63;;;;;**;;atc
;;;;;;;;;;;253;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ecoN autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_autres_intercalaires_aas|ecoN autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ecoN;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;231864;232436;365;*;
;;rRNA;232802;234309;85;*;16s
;;tRNA;234395;234471;269;*;gaa
;;rRNA;234741;237307;95;*;23s
;;rRNA;237403;237518;54;*;5s
;;tRNA;237573;237649;162;*;gac
fin;;CDS;237812;238615;;1;
deb;;CDS;244934;245665;132;*;
;;tRNA;245798;245874;120;*;gac
fin;comp;CDS;245995;246852;;0;
deb;;CDS;367329;368582;114;*;
;;tRNA;368697;368772;154;*;acg
fin;;CDS;368927;369265;;0;
deb;comp;CDS;555847;556158;162;*;
;;ncRNA;556321;556417;119;*;
fin;;CDS;556537;556890;;0;
deb;;CDS;632056;632253;32;*;
;;tRNA;632286;632362;15;*;aga
fin;comp;CDS;632378;632979;;0;
deb;;CDS;733188;734363;153;*;
;comp;tRNA;734517;734591;37;*;cag
;comp;tRNA;734629;734703;48;*;cag
;comp;tRNA;734752;734828;15;*;atgj
;comp;tRNA;734844;734918;34;*;caa
;comp;tRNA;734953;735027;23;*;caa
;comp;tRNA;735051;735135;10;*;cta
;comp;tRNA;735146;735222;380;*;atgj
fin;comp;CDS;735603;737267;;;
deb;;CDS;807377;808169;164;*;
;;tRNA;808334;808409;35;*;aaa
;;tRNA;808445;808520;2;*;gta
;;tRNA;808523;808598;51;*;aaa
;;tRNA;808650;808725;3;*;gta
;;tRNA;808729;808804;48;*;aaa
;;tRNA;808853;808928;33;*;aaa
;;tRNA;808962;809037;277;*;aaa
fin;;CDS;809315;810358;;;
deb;;CDS;950069;952345;343;*;
;comp;tRNA;952689;952776;253;*;tcc
fin;comp;CDS;953030;953248;;;
deb;comp;CDS;1047224;1047883;206;*;
;comp;tRNA;1048090;1048177;426;*;tca
fin;;CDS;1048604;1049722;;;
deb;;CDS;1183734;1184018;463;*;
;;tRNA;1184482;1184558;278;*;aga
fin;comp;CDS;1184837;1185786;;;
deb;;CDS;1213982;1214809;165;*;
;comp;tRNA;1214975;1215062;233;*;tcc
fin;;CDS;1215296;1216234;;;
deb;;CDS;1216586;1217098;165;*;
;comp;tRNA;1217264;1217351;234;*;tcc
fin;;CDS;1217586;1218524;;;
deb;;CDS;1457038;1458129;16;*;
;comp;ncRNA;1458146;1458277;46;*;
;comp;tRNA;1458324;1458408;33;*;tac
;comp;tRNA;1458442;1458526;159;*;tac
fin;comp;CDS;1458686;1459528;;;
deb;comp;CDS;1829066;1830322;307;*;
;;tRNA;1830630;1830706;4;*;gtc
;;tRNA;1830711;1830787;6;*;gtc
fin;;CDS;1830794;1831177;;0;
deb;comp;CDS;1831218;1832474;307;*;
;;tRNA;1832782;1832858;4;*;gtc
;;tRNA;1832863;1832939;8;*;gtc
fin;;CDS;1832948;1833280;;0;
deb;comp;CDS;1833321;1834577;307;*;
;;tRNA;1834885;1834961;4;*;gtc
;;tRNA;1834966;1835042;108;*;gtc
fin;;CDS;1835151;1835456;;;
deb;;CDS;1857352;1858464;185;*;
;;ncRNA;1858650;1858757;135;*;
fin;;CDS;1858893;1859249;;;
deb;comp;CDS;2115794;2116459;195;*;
;comp;tRNA;2116655;2116741;12;*;tta
;comp;tRNA;2116754;2116827;53;*;tgc
;comp;tRNA;2116881;2116956;151;*;ggc
fin;comp;CDS;2117108;2117656;;;
deb;comp;CDS;2191451;2192287;278;*;
;comp;tRNA;2192566;2192655;93;*;tcg
deb;;CDS;2192749;2193546;100;*;
;;tRNA;2193647;2193722;161;*;aac
fin;;CDS;2193884;2195146;;0;
deb;;CDS;2232607;2233323;453;*;
;comp;tRNA;2233777;2233852;326;*;acc
fin;;CDS;2234179;2235096;;;
deb;;CDS;2235198;2236148;37;*;
;comp;tRNA;2236186;2236261;4;*;aac
deb;;CDS;2236266;2237909;100;*;
;;tRNA;2238010;2238085;161;*;aac
fin;;CDS;2238247;2239518;;0;
deb;;CDS;2546968;2548728;74;*;
;;tRNA;2548803;2548879;125;*;ccc
fin;comp;CDS;2549005;2549919;;0;
deb;;CDS;2717780;2718712;75;*;
;;tRNA;2718788;2718862;437;*;agg
fin;comp;CDS;2719300;2719818;;;
deb;comp;CDS;2768744;2770933;206;*;
;comp;tRNA;2771140;2771215;39;*;gcc
;comp;tRNA;2771255;2771330;220;*;gcc
fin;;CDS;2771551;2771910;;;
deb;comp;CDS;2772355;2773770;258;*;
;;tRNA;2774029;2774104;43;*;gta
;;tRNA;2774148;2774223;46;*;gta
;;tRNA;2774270;2774345;4;*;gta
;;tRNA;2774350;2774425;110;*;aaa
fin;comp;CDS;2774536;2775420;;;
deb;comp;CDS;2959205;2960503;323;*;
;comp;rRNA;2960827;2960942;1881;*;5s
;comp;rRNA;2962824;2965468;193;*;23s
;comp;tRNA;2965662;2965737;443;*;gaa
;comp;rRNA;2966181;2967720;441;*;16s
fin;comp;CDS;2968162;2970735;;;
deb;;CDS;2991343;2991825;214;*;
;;tmRNA;2992040;2992402;88;*;
fin;comp;CDS;2992491;2992679;;;
deb;comp;CDS;3027207;3027773;280;*;
;comp;tRNA;3028054;3028130;63;*;cgt
;comp;tRNA;3028194;3028270;62;*;cgt
;comp;tRNA;3028333;3028409;62;*;cgt
;comp;tRNA;3028472;3028548;64;*;cgt
;comp;tRNA;3028613;3028689;3;*;cgt
;comp;tRNA;3028693;3028785;315;*;agc
fin;comp;CDS;3029101;3029286;;;
deb;comp;CDS;3157337;3158434;208;*;
;;tRNA;3158643;3158719;33;*;atgf
;;tRNA;3158753;3158829;33;*;atgf
;;tRNA;3158863;3158939;635;*;atgf
fin;;CDS;3159575;3160075;;;
deb;;CDS;3230172;3231401;316;*;
;comp;tRNA;3231718;3231791;78;*;ggg
fin;comp;CDS;3231870;3232625;;0;
deb;;CDS;3287195;3287524;41;*;
;;ncRNA;3287566;3287749;20;*;
fin;;CDS;3287770;3288372;;0;
deb;;CDS;3341048;3341755;105;*;
;;tRNA;3341861;3341936;197;*;ttc
fin;;CDS;3342134;3343399;;;
deb;comp;CDS;3569308;3569814;124;*;
;;tRNA;3569939;3570014;53;*;atgi
fin;comp;CDS;3570068;3570832;;0;
deb;;CDS;3620528;3620746;556;*;
;comp;ncRNA;3621303;3621679;32;*;
fin;comp;CDS;3621712;3622857;;;
deb;comp;CDS;3670227;3670679;206;*;
;comp;tRNA;3670886;3670962;347;*;atgf
fin;;CDS;3671310;3672155;;0;
deb;comp;CDS;3673935;3674387;206;*;
;comp;tRNA;3674594;3674670;347;*;atgf
fin;;CDS;3675018;3675869;;1;
deb;comp;CDS;3677794;3678246;206;*;
;comp;tRNA;3678453;3678529;347;*;atgf
fin;;CDS;3678877;3679722;;0;
deb;comp;CDS;3681532;3681984;206;*;
;comp;tRNA;3682191;3682267;347;*;atgf
fin;;CDS;3682615;3683958;;0;
deb;comp;CDS;3683966;3685591;456;*;
;comp;tRNA;3686048;3686134;14;*;ctc
fin;comp;CDS;3686149;3686481;;;
deb;;CDS;3784553;3785311;62;*;
;comp;rRNA;3785374;3785489;39;*;5s
;comp;tRNA;3785529;3785605;14;*;acc
;comp;rRNA;3785620;3785735;777;*;5s
;comp;tRNA;3786513;3786588;14;*;acc
;comp;rRNA;3786603;3786718;1834;*;5s
;comp;tRNA;3788553;3788628;1360;*;gaa
fin;;CDS;3789989;3790543;;1;
deb;comp;CDS;4078635;4080242;743;*;
;comp;tRNA;4080986;4081062;91;*;ccg
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deb;comp;CDS;4205966;4207348;292;*;
;;tRNA;4207641;4207735;300;*;tga
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;;rRNA;4651403;4651518;76;*;5s
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deb;comp;CDS;4834504;4834961;197;*;
;comp;tRNA;4835159;4835234;106;*;ttc
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;comp;tRNA;5092685;5092760;588;*;gaa
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deb;comp;CDS;5125261;5125644;76;*;
;comp;rRNA;5125721;5125836;95;*;5s
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fin;;CDS;5254542;5255171;;;
deb;comp;CDS;5305902;5306228;0;*;
;comp;tRNA;5306229;5306302;1096;*;atc
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deb;comp;CDS;5321441;5321869;206;*;
;comp;tRNA;5322076;5322151;39;*;gcc
;comp;tRNA;5322191;5322266;39;*;gcc
;comp;tRNA;5322306;5322381;220;*;gcc
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;comp;rRNA;5341405;5344294;183;*;23s
;comp;tRNA;5344478;5344553;42;*;gca
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;comp;tRNA;5347346;5347421;42;*;gca
;comp;tRNA;5347464;5347540;68;*;atc
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;comp;tRNA;5433727;5433814;253;*;tcc
fin;comp;CDS;5434068;5434286;;;
&lt;/pre&gt;

===Vibrio campbellii===
====vha opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha_opérons|vha opérons]]
&lt;pre&gt;
45.4%GC;26.7.19 Paris;16s 10;121;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Vibrio campbellii ATCC BAA-1116;;;;;;;;;;
comp;1..1384;;16s;@1;103;103;;;;
comp;1488..1604;;CDS;;102507;;;;39;
;;;;;;;;;;
;104112..105239;;CDS;;529;*529;;;*376;*529
comp;105769..105845;;atgf;+;158;;*158;;;
comp;106004..106079;;ggc;7 ggc;35;;35;;;
comp;106115..106190;;ggc;5 atgf;35;;35;;;
comp;106226..106301;;ggc;;18;;18;;;
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comp;106436..106511;;ggc;;90;;90;;;
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comp;106812..106888;;atgf;;39;;39;;;
comp;106928..107003;;ggc;;18;;18;;;
comp;107022..107098;;atgf;;39;;39;;;
comp;107138..107213;;ggc;;156;156;;;;156
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;;;;;;;;;;
;189680..190715;;CDS;;101;101;;;345;101
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;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;
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;249209..249664;;CDS;;60596;;;;*152;
;;;;;;;;;;
;310261..311296;;CDS;;121;121;;;345;121
comp;311418..311508;;tca;;91;;;;;
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comp;311825..314739;;23s;;289;;;;;
comp;315029..315104;;gca;;43;;;43;;
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comp;315281..316842;;16s;;471;*471;;;;*471
comp;317314..318027;;CDS;;40242;;;;*238;
;;;;;;;;;;
;358270..359305;;CDS;;147;147;;;345;
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comp;359561..359677;;5s;;108;;;;;
comp;359786..362700;;23s;;310;;;;;
comp;363011..363086;;gta;;30;;;30;;
comp;363117..363192;;aaa;;2;;;2;;
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comp;364998..365133;;CDS;;84252;;;;45;
;;;;;;;;;;
;449386..449521;;CDS;;83;83;;;45;83
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;451285..451360;;gaa;;2;;;2;;
;451363..451438;;aaa;;9;;;9;;
;451448..451523;;gca;;37;;;37;;
;451561..451636;;gta;;51;51;;;;51
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;454882..454998;;5s;;32;;;;;
;455031..455107;;gac;;162;162;;;;
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;;;;;;;;;;
comp;467252..467665;;CDS;;361;361;;;138;
;468027..468103;;cgg;;35;;35;;;
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;468554..468630;;cca;;194;194;;;;194
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;;;;;;;;;;
comp;835239..835550;;CDS;;138;138;;;104;138
comp;835689..835764;;atgi;;145;145;;;;
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;;;;;;;;;;
;1019964..1020128;;CDS;;119;119;;;55;
;1020248..1021805;;16s;;129;;;;;
;1021935..1022010;;gcc;;41;;;41;;
;1022052..1022127;;gaa;;55;55;;;;55
comp;1022183..1022368;;CDS;;16;16;;;62;16
;1022385..1025299;;23s;;111;;;;;
;1025411..1025527;;5s;;31;;;;;
;1025559..1025635;;gac;;35;;;35;;
;1025671..1025747;;tgg;;3;3;;;;3
comp;1025751..1025933;;CDS;;225465;;;;61;
;;;;;;;;;;
;1251399..1252574;;CDS;;158;158;;;392;
comp;1252733..1252817;;cta;+;54;;54;;;
comp;1252872..1252946;;caa;5 cta;46;;46;;;
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comp;1253099..1253183;;cta;2 caa;18;;18;;;
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comp;1253457..1253533;;atgj;;79;;79;;;
comp;1253613..1253687;;caa;;31;;31;;;
comp;1253719..1253803;;cta;;39;;39;;;
comp;1253843..1253919;;atgj;;26;26;;;;26
comp;1253946..1254157;;CDS;;14564;;;;71;
;;;;;;;;;;
comp;1268722..1268862;;CDS;;260;260;;;47;
;1269123..1269199;;cca;;243;243;;;;*243
comp;1269443..1269628;;CDS;;16361;;;;62;
;;;;;;;;;;
;1285990..1286571;;CDS;;88;88;;;194;
comp;1286660..1286736;;agg;;68;68;;;;68
comp;1286805..1287938;;CDS;;116753;;;;378;
;;;;;;;;;;
comp;1404692..1405552;;CDS;;204;204;;;287;*204
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;;;;;;;;;;
;1457636..1458508;;CDS;;407;407;;;291;
comp;1458916..1459000;;tac;+;100;;100;;;
comp;1459101..1459185;;tac;4 tac;100;;100;;;
comp;1459286..1459370;;tac;@7;100;;100;;;
comp;1459471..1459555;;tac;;282;282;;;;*282
;1459838..1460935;;CDS;;170368;;;;366;
;;;;;;;;;;
;1631304..1631753;;CDS;;144;144;;;150;144
;1631898..1631985;;tcc;;312;312;;;;
;1632298..1632684;;CDS;;550413;;;;129;
;;;;;;;;;;
;2183098..2183436;;CDS;;179;179;;;113;
;2183616..2183692;;gtc;+;46;;46;;;
;2183739..2183815;;gtc;2 gtc;149;149;;;;149
;2183965..2185344;;CDS;;578546;;;;460;
;;;;;;;;;;
comp;2763891..2766782;;CDS;;763;*763;;;*964;*763
comp;2767546..2767621;;ggc;+;11;;11;;;
comp;2767633..2767719;;tta;2 ggc;78;;78;;;
comp;2767798..2767873;;ggc;;37;;37;;;
comp;2767911..2767984;;tgc;;400;400;;;;*400
comp;2768385..2768942;;CDS;;82481;;;;186;
;;;;;;;;;;
;2851424..2851855;;CDS;;62;62;;;144;62
;2851918..2851992;;gga;;333;333;;;;
;2852326..2852970;;CDS;;133282;;;;215;
;;;;;;;;;;
comp;2986253..2986402;;CDS;;1;*1;;;50;1
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;2986852..2989149;;CDS;;60873;;;;766;
;;;;;;;;;;
;3050023..3051831;;CDS;;139;139;;;603;139
;3051971..3052061;;tca;;321;321;;;;
;3052383..3053693;;CDS;;384243;;;;437;
;;;;;;;;;;
comp;3437937..3438392;;CDS;;233;233;;;152;
comp;3438626..3438702;;atgf;;56;;56;;;
comp;3438759..3438842;;ctc;;18;18;;;;18
comp;3438861..3439199;;CDS;;113972;;;;113;
;;;;;;;;;;
comp;3553172..3554167;;CDS;;189;189;;;332;189
comp;3554357..3554433;;cgt;+;59;;59;;;
comp;3554493..3554569;;cgt;7 cgt;57;;57;;;
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comp;3554761..3554837;;cgt;;57;;57;;;
comp;3554895..3554971;;cgt;;57;;57;;;
comp;3555029..3555105;;cgt;;85;;85;;;
comp;3555191..3555282;;agc;;29;;29;;;
comp;3555312..3555388;;cgt;;31;;31;;;
comp;3555420..3555511;;agc;;243;243;;;;
comp;3555755..3555952;;CDS;;83212;;;;66;
;;;;;;;;;;
;3639165..3640295;;CDS;;108;108;;;377;108
;3640404..3640479;;ttc;+;51;;51;;;
;3640531..3640606;;aca;3 ttc;7;;7;;;
;3640614..3640689;;ttc;2 aca;43;;43;;;
;3640733..3640808;;aac;2 aac;69;;69;;;
;3640878..3640953;;aca;;10;;10;;;
;3640964..3641039;;ttc;;42;;42;;;
;3641082..3641158;;aac;;292;292;;;;
;3641451..3643076;;CDS;;233;233;;;542;
;3643310..3643385;;ttc;;51;;51;;;
;3643437..3643512;;aca;+;21;;21;;;
;3643534..3643609;;aac;2 aca;39;;39;;;
;3643649..3643724;;aca;2 aac;15;;15;;;
;3643740..3643815;;aac;;156;156;;;;156
comp;3643972..3645405;;CDS;;561;*561;;;*478;*561
comp;3645967..3646043;;gac;;31;;;;;
comp;3646075..3646191;;5s;;57;;;;;
comp;3646249..3646324;;acc;;100;;;;;
comp;3646425..3646541;;5s;;111;;;;;
comp;3646653..3649567;;23s;;-13;*-13;;;;*-13
comp;3649555..3649797;;CDS;@3;35;35;;;81;35
comp;3649833..3649908;;gca;;43;;;43;;
comp;3649952..3650028;;atc;;97;;;;;
comp;3650126..3651683;;16s;;557;*557;;;;*557
comp;3652241..3653491;;CDS;;9514;;;;*417;
;;;;;;;;;;
comp;3663006..3663598;;CDS;;181;181;;;198;
comp;3663780..3663864;;ttg;;177;177;;;;177
comp;3664042..3664707;;CDS;;93515;;;;222;
;;;;;;;;;;
;3758223..3759258;;CDS;;578;*578;;;*345;*578
comp;3759837..3759913;;gac;;68;;;;;
comp;3759982..3760098;;5s;;111;;;;;
comp;3760210..3763124;;23s;;290;;;;;
comp;3763415..3763490;;gca;;43;;;43;;
comp;3763534..3763610;;atc;;97;;;;;
comp;3763708..3765265;;16s;;86;;;;;
comp;3765351;;16s;début;;;;;;
Chromosome II;;;;;;;;;;
comp;673782..674186;;CDS;;358;358;;;135;
comp;674545..674635;;tca;;329;329;;;;*329
;674965..675645;;CDS;;205537;;;;227;
;;;;;;;;;;
;881183..882640;;CDS;;244;244;;;486;*244
;882885..882958;;tgc;;302;302;;;;
;883261..883725;;CDS;;1229;;;;155;
;;;;;;;;;;
;884955..886649;;CDS;;245;245;;;565;*245
;886895..886981;;tta;;97;;97;;;
;887079..887154;;ggc;;5;;5;;;
;887160..887233;;tgc;;317;317;;;;
;887551..889074;;CDS;;465;;;;508;
;;;;;;;;;;
comp;889540..890328;;CDS;;386;386;;;263;
;890715..890801;;tta;+;53;;53;;;
;890855..890928;;tgc;2 tgc;181;;*181;;;
;891110..891183;;tgc;;366;366;;;;*366
;891550..891891;;CDS;;443950;;;;114;
;;;;;;;;;;
;1335842..1336042;;CDS;;17;17;;;;17
;1336060..1336134;;gga;;272;272;;;;
comp;1336407..1337222;;CDS;;505333;;;;272;
;;;;;;;;;;
;1842556..1842741;;CDS;;-36;*-36;;;62;*-36
;1842706..1842789;;ctc;;29;29;;;;29
;1842819..1843430;;CDS;;77699;;;;204;
;;;;;;;;;;
;1921130..1921561;;CDS;;62;62;;;144;62
;1921624..1921698;;gga;;337;337;;;;
comp;1922036..1922209;;CDS;;15660;;;;58;
;;;;;;;;;;
comp;1937870..1939129;;CDS;;84;84;;;420;
comp;1939214..1939304;;tca;;90;;;;;
comp;1939395..1939511;;5s;;77;;;;;
comp;1939589..1942503;;23s;;306;;;;;
comp;1942810..1942885;;gta;;35;;;35;;
comp;1942921..1942996;;gca;;24;;;24;;
comp;1943021..1943096;;aaa;;2;;;2;;
comp;1943099..1943174;;gaa;;114;;;;;
comp;1943289..1944850;;16s;;83;83;;;;83
comp;1944934..1945071;;CDS;;;;;;46;
&lt;/pre&gt;

====vha cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha_cumuls|vha cumuls]]
&lt;pre&gt;
vha cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;11;1;0;0;1;3;1;1;100;17
;16 aas 23 5s ;3;20;10;5;50;8;20;5;200;17
;16 atc gca;4;40;17;6;100;10;40;3;300;10
;16 cds 23 5s ;3;60;16;6;150;12;60;2;400;13
;max a;5;80;6;1;200;9;80;3;500;6
;a doubles;0;100;6;0;250;9;100;3;600;4
;spéciaux;1;120;0;0;300;4;120;3;700;2
;total aas;37;140;0;0;350;7;140;3;800;2
sans ;opérons;27;160;1;0;400;6;160;4;900;0
;1 aa;14;180;0;0;450;1;180;1;1000;1
;max a;12;200;1;0;500;1;200;2;1100;0
;a doubles;10;;0;0;;8;;8;;0
;total aas;84;;57;18;;78;;38;;72
total aas;;121;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;30;;;;;;266
;;;variance;;19;;;;;;199
sans jaune;;;moyenne;46;;;183;;86;;240
;;;variance;25;;;114;;59;;178
&lt;/pre&gt;

====vha blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha_blocs|vha blocs]]
&lt;pre&gt;
vha blocs;;;;;;;
cds;853;cds;471;cds;103
$16s;97;$16s;56;$16s;&lt;u&gt;86
atc;43;atc;43;$16s;97
gca;290;gca;289;atc;43
$23s;77;$23s;108;gca;290
$5s;&lt;u&gt;371;$5s;91;$23s;111
$16s;97;tca;121;$5s;68
atc;43;cds;;gac;578
gca;290;;;cds;
$23s;107;;;;
$5s;101;;;;
cds;;;;;
;;;;;
cds;554;cds;83;cds;119
$16s;122;$16s;82;$16s;129
gaa;2;gaa;2;gcc;41
aaa;30;aaa;30;gaa;55
gta;310;gta;310;&amp;cds;16
$23s;117;$23s;108;$23s;111
$5s;32;$5s;31;$5s;31
gac;68;gac;147;gac;35
tgg;546;cds;;tgg;3
cds;;;;cds;
;;;;;
cds;83;cds;83;cds;557
$16s;114;$16s;122;$16s;97
gaa;2;gaa;2;atc;43
aaa;24;aaa;9;gca;35
gca;35;gca;37;&amp;cds;-13
gta;306;gta;51;$23s;111
$23s;77;&amp;cds;16;$5s;100
$5s;90;$23s;77;acc;57
tca;84;$5s;32;$5s;31
cds;;gac;162;gac;561
;;cds;;cds;
&lt;/pre&gt;

====vha distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha_distribution|vha distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;8;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;cta2;att;;act;;aat;;agt;;cta2;att;;act;;aat;;agt;;cta2;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;cgt6;ttc;4;tcc;;tac;1;tgc;2;cgt6;ttc;;tcc;;tac;4;tgc;2;cgt6;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;;ggc3;atc;;acc;1;aac;4;agc;2;ggc3;atc;;acc;;aac;;agc;;ggc3;atc;;acc;1;aac;;agc;
ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;2;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;6;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;acc 5s + 1 &gt;a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;5;acc 5s + 1 &gt;a;gtc;2;gcc;;gac;;ggc;3;acc 5s + 1 &gt;a;gtc;;gcc;;gac;6;ggc;
tta;;tca;2;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;tta;3;tca;;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;tta;;tca;;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;tta;;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;5;aaa;;aga;;gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;;aaa;;aga;;gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;3;cca;2;caa;2;cga;;;cta;2;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;3;séquences;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;2
atgj;;acg;;aag;;agg;1;(cac cca)2;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;cgt5 (cgt agc)2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;ttc (aca aac)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(atgf ggc) ggc2 (atgf ggc)4;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
vha;;14;;;;;14;ttc aca (ttc aac) aca (ttc aac);vha;51;;;;;;51;;vha;19;;;;;;19;;vha;;;;11;;;11
&lt;/pre&gt;
====vha1 données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha1_données_intercalaires|vha1 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;vha1;fx;fc;vha1;fx40;fc40;vha1;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;3;9;0;3;9;-1;0;98;cont;x;16s tRNA;;;tRNA tRNA;;suite
;0;10;11;246;1;1;30;-2;0;0;156;529;4* 102;;atc;13;;acc
;1;20;16;193;2;1;40;-3;0;2;101;206;65;;atc;35;;gga
;0;30;16;96;3;2;39;-4;9;141;546;121;2* 127;;gaa;52;;tac
;0;40;29;76;4;0;17;-5;0;1;138;147;91;;gaa;**;;aca
;0;50;22;55;5;1;25;-6;1;0;145;162;134;;gcc;35;;cgg
;0;60;37;90;6;0;11;-7;0;10;284;361;tRNA 23s;;;76;;cac
;2;70;64;61;7;1;13;-8;1;37;497;194;3* 297;;gca;46;;cca
;0;80;43;62;8;2;16;-9;1;0;68;260;2* 317;;gta;64;;cac
1;0;90;46;56;9;0;31;-10;0;2;159;158;296;;gca;**;;cca
;0;100;41;55;10;3;24;-11;1;26;144;260;272;;gca;54;;cta
;2;110;40;59;11;0;21;-12;0;0;312;88;260;;gta;46;;caa
;0;120;28;67;12;0;32;-13;0;4;179;204;264;;gaa;21;;cta
1;0;130;23;55;13;1;27;-14;0;20;149;407;5s tRNA;;;18;;cta
;2;140;24;54;14;2;27;-15;2;0;763;282;2* 32;;gac;23;;atgj
1;3;150;24;51;15;0;13;-16;0;3;400;558;3* 31;;gac;70;;cta
2;2;160;28;54;16;3;9;-17;0;11;62;321;68;;gac;79;;atgj
1;0;170;20;38;17;2;18;-18;0;0;363;156;91;;tca;31;;caa
;2;180;22;45;18;1;22;-19;0;4;372;578;100;;acc;39;;cta
;2;190;18;35;19;2;11;-20;0;13;139;;tRNA 5s;;;**;;atgj
1;0;200;17;30;20;5;13;-21;1;0;233;;57;;acc;100;;tac
2;0;210;15;38;21;1;15;-22;1;1;18;;tRNA tRNA;;intra;100;;tac
;0;220;17;25;22;4;8;-23;0;5;189;;5* 43;;gca;100;;tac
;0;230;15;27;23;1;11;-24;0;0;243;;**;;atc;**;;tac
;2;240;21;26;24;3;9;-25;0;1;108;;2* 30;;gta;46;;gtc
;1;250;10;21;25;0;9;-26;0;2;292;;2* 2;;aaa;**;;gtc
2;0;260;16;22;26;1;8;-27;0;0;233;;**;;gaa;11;;ggc
;0;270;10;16;27;2;12;-28;0;0;558;;2;;gaa;78;;tta
;0;280;14;16;28;2;8;-29;0;1;181;;9;;aaa;37;;ggc
1;1;290;12;15;29;1;7;-30;0;0;177;;37;;gca;**;;tgc
;1;300;15;17;30;1;9;-31;0;0;CDS 16s;;**;;gta;56;;atgf
;0;310;8;20;31;3;11;-32;1;5;631;554;41;;gcc;**;;ctc
;1;320;7;13;32;3;6;-33;0;0;853;492;**;;gaa;59;;cgt
1;0;330;15;9;33;3;6;-34;0;1;471;;tRNA tRNA;;contig;57;;cgt
;0;340;8;9;34;3;8;-35;0;5;451;;68;;tgg;57;;cgt
;0;350;15;7;35;1;6;-36;0;0;543;;**;;gac;57;;cgt
;0;360;7;7;36;1;8;-37;0;0;557;;35;;gac;57;;cgt
1;1;370;7;6;37;5;5;-38;1;3;16s 16s;;**;;tgg;85;;cgt
;1;380;4;7;38;5;9;-39;0;0;0;deb fin chr c;tRNA tRNA;;;29;;agc
;0;390;7;7;39;2;7;-40;0;1;5s 16s;;158;;atgf;31;;cgt
;1;400;14;4;40;3;10;-41;1;0;371;;35;;ggc;**;;agc
4;4;reste;125;146;reste;859;1325;-42;0;0;23s 5s;;35;;ggc;51;;ttc
18;29;total;934;1945;total;934;1945;-43;0;0;125;;18;;ggc;7;;aca
14;25;diagr;806;1790;diagr;72;611;-44;1;2;2* 95;;39;;atgf;43;;ttc
0;1;t30;43;535;;;;-45;0;0;135;;90;;ggc;69;;aac
;;;;;;;;-46;0;0;2* 126;;39;;atgf;10;;aca
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;0;0;3* 129;;18;;ggc;42;;ttc
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;2;0;5s CDS;;39;;atgf;**;;aac
;x;931;25;3;959;;;-49;0;0;;101;18;;ggc;51;;ttc
;c;1936;402;9;2347;;;-50;2;3;;;39;;atgf;21;;aca
;;;;;3306;190;;reste;0;0;;;**;;ggc;39;;aac
;;;;;;3496;;total;25;402;;;;;;15;;aca
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;aac
&lt;/pre&gt;

====vha1 autres intercalaires aas====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha1_autres_intercalaires_aas|autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;vha1;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
;comp;rRNA;1;1384;631;*;1384
fin;comp;CDS;2016;2795;;;
deb;;CDS;104112;105239;529;*;
;comp;tRNA;105769;105845;158;*;atgf
;comp;tRNA;106004;106079;35;*;ggc
;comp;tRNA;106115;106190;35;*;ggc
;comp;tRNA;106226;106301;18;*;ggc
;comp;tRNA;106320;106396;39;*;atgf
;comp;tRNA;106436;106511;90;*;ggc
;comp;tRNA;106602;106678;39;*;atgf
;comp;tRNA;106718;106793;18;*;ggc
;comp;tRNA;106812;106888;39;*;atgf
;comp;tRNA;106928;107003;18;*;ggc
;comp;tRNA;107022;107098;39;*;atgf
;comp;tRNA;107138;107213;156;*;ggc
fin;comp;CDS;107370;107915;;0;
deb;;CDS;189680;190715;101;*;
;comp;rRNA;190817;190933;125;*;117
;comp;rRNA;191059;193948;297;*;2890
;comp;tRNA;194246;194321;43;*;gca
;comp;tRNA;194365;194441;102;*;atc
;comp;rRNA;194544;196096;371;*;1553
;comp;rRNA;196468;196584;95;*;117
;comp;rRNA;196680;199569;297;*;2890
;comp;tRNA;199867;199942;43;*;gca
;comp;tRNA;199986;200062;102;*;atc
;comp;rRNA;200165;201717;853;*;1553
fin;comp;CDS;202571;204706;;;
deb;comp;CDS;234302;235486;101;*;
;comp;tRNA;235588;235663;13;*;acc
;comp;tRNA;235677;235751;35;*;gga
;comp;tRNA;235787;235871;52;*;tac
;comp;tRNA;235924;235999;206;*;aca
fin;;CDS;236206;237129;;0;
deb;comp;CDS;241274;242467;546;*;
;comp;tRNA;243014;243090;68;*;tgg
;comp;tRNA;243159;243235;32;*;gac
;comp;rRNA;243268;243384;135;*;117
;comp;rRNA;243520;246397;317;*;2878
;comp;tRNA;246715;246790;30;*;gta
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;comp;rRNA;247102;248654;554;*;1553
fin;;CDS;249209;249664;;1;
deb;comp;CDS;251637;253490;57;*;
;comp;regulatory;253548;253749;184;*;
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deb;;CDS;310261;311296;121;*;
;comp;tRNA;311418;311508;91;*;tca
;comp;rRNA;311600;311716;126;*;117
;comp;rRNA;311843;314732;296;*;2890
;comp;tRNA;315029;315104;43;*;gca
;comp;tRNA;315148;315224;65;*;atc
;comp;rRNA;315290;316842;471;*;1553
fin;comp;CDS;317314;318027;;;
deb;comp;CDS;352647;354587;165;*;
;comp;regulatory;354753;354851;61;*;
fin;comp;CDS;354913;355296;;;
deb;;CDS;358270;359305;147;*;
;comp;tRNA;359453;359529;31;*;gac
;comp;rRNA;359561;359677;126;*;117
;comp;rRNA;359804;362693;317;*;2890
;comp;tRNA;363011;363086;30;*;gta
;comp;tRNA;363117;363192;2;*;aaa
;comp;tRNA;363195;363270;91;*;gaa
;comp;rRNA;363362;364914;492;*;1553
fin;;CDS;365407;365958;;0;
deb;;CDS;448626;449153;451;*;
;;rRNA;449605;451157;127;*;1553
;;tRNA;451285;451360;2;*;gaa
;;tRNA;451363;451438;9;*;aaa
;;tRNA;451448;451523;37;*;gca
;;tRNA;451561;451636;260;*;gta
;;rRNA;451897;454786;95;*;2890
;;rRNA;454882;454998;32;*;117
;;tRNA;455031;455107;162;*;gac
fin;comp;CDS;455270;455566;;;
deb;comp;CDS;467252;467665;361;*;
;;tRNA;468027;468103;35;*;cgg
;;tRNA;468139;468214;76;*;cac
;;tRNA;468291;468367;46;*;cca
;;tRNA;468414;468489;64;*;cac
;;tRNA;468554;468630;194;*;cca
fin;comp;CDS;468825;469550;;0;
deb;;CDS;769806;770444;32;*;
;;regulatory;770477;770626;68;*;
fin;;CDS;770695;771687;;;
deb;comp;CDS;835239;835550;138;*;
;comp;tRNA;835689;835764;145;*;atgi
fin;comp;CDS;835910;837772;;;
deb;;CDS;883125;883988;533;*;
;;ncRNA;884522;884950;176;*;
fin;;CDS;885127;886077;;;
deb;comp;CDS;941166;941636;439;*;
;;misc_f;942076;942195;53;*;
fin;;CDS;942249;944708;;;
deb;comp;CDS;1010675;1011853;13;*;
;comp;misc_f;1011867;1011988;108;*;
fin;comp;CDS;1012097;1012423;;;
deb;;CDS;1017131;1019704;543;*;
;;rRNA;1020248;1021800;134;*;1553
;;tRNA;1021935;1022010;41;*;gcc
;;tRNA;1022052;1022127;264;*;gaa
;;rRNA;1022392;1025281;129;*;2890
;;rRNA;1025411;1025527;31;*;117
;;tRNA;1025559;1025635;35;*;gac
;;tRNA;1025671;1025747;260;*;tgg
fin;comp;CDS;1026008;1026983;;0;
deb;comp;CDS;1138561;1139793;183;*;
;comp;tmRNA;1139977;1140344;68;*;
fin;comp;CDS;1140413;1140898;;0;
deb;;CDS;1251399;1252574;158;*;
;comp;tRNA;1252733;1252817;54;*;cta
;comp;tRNA;1252872;1252946;46;*;caa
;comp;tRNA;1252993;1253077;21;*;cta
;comp;tRNA;1253099;1253183;18;*;cta
;comp;tRNA;1253202;1253278;23;*;atgj
;comp;tRNA;1253302;1253386;70;*;cta
;comp;tRNA;1253457;1253533;79;*;atgj
;comp;tRNA;1253613;1253687;31;*;caa
;comp;tRNA;1253719;1253803;39;*;cta
;comp;tRNA;1253843;1253919;284;*;atgj
fin;comp;CDS;1254204;1255295;;;
deb;comp;CDS;1268722;1268862;260;*;
;;tRNA;1269123;1269199;497;*;cca
fin;;CDS;1269697;1270497;;0;
deb;;CDS;1286065;1286571;88;*;
;comp;tRNA;1286660;1286736;68;*;agg
fin;comp;CDS;1286805;1287938;;0;
deb;comp;CDS;1404692;1405552;204;*;
;;tRNA;1405757;1405833;159;*;aga
fin;;CDS;1405993;1407685;;;
deb;;CDS;1457636;1458508;407;*;
;comp;tRNA;1458916;1459000;100;*;tac
;comp;tRNA;1459101;1459185;100;*;tac
;comp;tRNA;1459286;1459370;100;*;tac
;comp;tRNA;1459471;1459555;282;*;tac
fin;;CDS;1459838;1460935;;;
deb;;CDS;1470331;1472328;142;*;
;;ncRNA;1472471;1472567;143;*;
fin;;CDS;1472711;1473337;;;
deb;comp;CDS;1587286;1587876;116;*;
;comp;regulatory;1587993;1588082;279;*;
fin;comp;CDS;1588362;1589366;;;
deb;;CDS;1631304;1631753;144;*;
;;tRNA;1631898;1631985;312;*;tcc
fin;;CDS;1632298;1632684;;;
deb;;CDS;1842140;1843741;180;*;
;;misc_f;1843922;1844060;53;*;
fin;;CDS;1844114;1845010;;;
deb;;CDS;2183098;2183436;179;*;
;;tRNA;2183616;2183692;46;*;gtc
;;tRNA;2183739;2183815;149;*;gtc
fin;;CDS;2183965;2185344;;;
deb;comp;CDS;2484550;2484708;529;*;
;;regulatory;2485238;2485339;116;*;
fin;;CDS;2485456;2486832;;;
deb;comp;CDS;2763891;2766782;763;*;
;comp;tRNA;2767546;2767621;11;*;ggc
;comp;tRNA;2767633;2767719;78;*;tta
;comp;tRNA;2767798;2767873;37;*;ggc
;comp;tRNA;2767911;2767984;400;*;tgc
fin;comp;CDS;2768385;2768942;;;
deb;;CDS;2780030;2780155;-54;*;
;;misc_f;2780102;2780205;125;*;
fin;;CDS;2780331;2781896;;;
deb;;CDS;2851424;2851855;62;*;
;;tRNA;2851918;2851992;363;*;gga
fin;;CDS;2852356;2852970;;0;
deb;comp;CDS;2977057;2978046;-12;*;
;comp;regulatory;2978035;2978168;175;*;
fin;;CDS;2978344;2979249;;0;
deb;comp;CDS;2983815;2985845;558;*;
;;tRNA;2986404;2986479;372;*;aac
fin;;CDS;2986852;2989149;;;
deb;;CDS;3050023;3051831;139;*;
;;tRNA;3051971;3052061;321;*;tca
fin;comp;CDS;3052383;3053693;;;
deb;comp;CDS;3437937;3438392;233;*;
;comp;tRNA;3438626;3438702;56;*;atgf
;comp;tRNA;3438759;3438842;18;*;ctc
fin;comp;CDS;3438861;3439199;;;
deb;comp;CDS;3553172;3554167;189;*;
;comp;tRNA;3554357;3554433;59;*;cgt
;comp;tRNA;3554493;3554569;57;*;cgt
;comp;tRNA;3554627;3554703;57;*;cgt
;comp;tRNA;3554761;3554837;57;*;cgt
;comp;tRNA;3554895;3554971;57;*;cgt
;comp;tRNA;3555029;3555105;85;*;cgt
;comp;tRNA;3555191;3555282;29;*;agc
;comp;tRNA;3555312;3555388;31;*;cgt
;comp;tRNA;3555420;3555511;243;*;agc
fin;comp;CDS;3555755;3555952;;;
deb;;CDS;3603439;3603747;8;*;
;;ncRNA;3603756;3603940;5;*;
fin;;CDS;3603946;3604539;;;
deb;;CDS;3639165;3640295;108;*;
;;tRNA;3640404;3640479;51;*;ttc
;;tRNA;3640531;3640606;7;*;aca
;;tRNA;3640614;3640689;43;*;ttc
;;tRNA;3640733;3640808;69;*;aac
;;tRNA;3640878;3640953;10;*;aca
;;tRNA;3640964;3641039;42;*;ttc
;;tRNA;3641082;3641158;292;*;aac
deb;;CDS;3641451;3643076;233;*;
;;tRNA;3643310;3643385;51;*;ttc
;;tRNA;3643437;3643512;21;*;aca
;;tRNA;3643534;3643609;39;*;aac
;;tRNA;3643649;3643724;15;*;aca
;;tRNA;3643740;3643815;156;*;aac
deb;comp;CDS;3643972;3645408;558;*;
;comp;tRNA;3645967;3646043;31;*;gac
;comp;rRNA;3646075;3646191;57;*;117
;comp;tRNA;3646249;3646324;100;*;acc
;comp;rRNA;3646425;3646541;129;*;117
;comp;rRNA;3646671;3649560;272;*;2890
;comp;tRNA;3649833;3649908;43;*;gca
;comp;tRNA;3649952;3650028;102;*;atc
;comp;rRNA;3650131;3651683;557;*;1553
fin;comp;CDS;3652241;3653491;;;
deb;comp;CDS;3663006;3663598;181;*;
;comp;tRNA;3663780;3663864;177;*;ttg
fin;comp;CDS;3664042;3664707;;0;
deb;;CDS;3758223;3759258;578;*;
;comp;tRNA;3759837;3759913;68;*;gac
;comp;rRNA;3759982;3760098;129;*;117
;comp;rRNA;3760228;3763117;297;*;2890
;comp;tRNA;3763415;3763490;43;*;gca
;comp;tRNA;3763534;3763610;102;*;atc
;comp;rRNA;3763713;3765265;0;*;1553
&lt;/pre&gt;

====vha2 données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha2_données_intercalaires|vha2 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;vha2;fx;fc;vha2;fx40;fc40;vha2;x-;c-;c;x;c;x;aa
;1;0;1;16;0;1;16;-1;0;62;412;329;16s tRNA;;
;0;10;14;120;1;0;14;-2;2;0;244;386;123;;gaa
;0;20;14;97;2;2;14;-3;0;0;302;325;tRNA 23s;;
;1;30;14;53;3;0;13;-4;3;77;245;272;313;;gta
;0;40;15;19;4;1;13;-5;0;1;317;337;5s tRNA;;
;0;50;15;35;5;2;6;-6;2;0;366;;90;;tca
;0;60;25;50;6;1;5;-7;0;4;-36;;tRNA tRNA;;intra
;1;70;33;42;7;2;2;-8;0;22;29;;35;;gta
;0;80;38;39;8;1;11;-9;1;0;62;;24;;gca
;1;90;31;35;9;2;27;-10;0;2;84;;2;;aaa
;0;100;31;34;10;3;15;-11;4;17;CDS 16s;;**;;gaa
;0;110;26;25;11;1;18;-12;0;0;448;;tRNA tRNA;;
;0;120;31;48;12;2;25;-13;0;2;23s 5s;;97;;tta
;0;130;20;32;13;0;7;-14;0;11;95;;5;;ggc
;0;140;20;30;14;2;12;-15;1;0;;;**;;tgc
;0;150;21;24;15;1;8;-16;0;1;;;53;;tta
;0;160;12;21;16;0;7;-17;0;8;;;181;;tgc
;0;170;13;23;17;2;4;-18;0;0;;;**;;tgc
;0;180;13;21;18;0;6;-19;0;1;;;;;
;0;190;14;15;19;4;7;-20;1;1;;;;;
;0;200;13;11;20;2;3;-21;0;0;;;;;
;0;210;11;20;21;1;9;-22;0;0;;;;;
;0;220;12;20;22;2;10;-23;0;2;;;;;
;0;230;11;15;23;3;5;-24;0;0;;;;;
;0;240;15;14;24;1;3;-25;0;0;;;;;
;2;250;9;9;25;1;2;-26;0;3;;;;;
;0;260;11;12;26;2;9;-27;0;0;;;;;
;0;270;9;17;27;1;3;-28;0;0;;;;;
1;0;280;8;10;28;0;4;-29;1;2;;;;;
;0;290;13;13;29;3;4;-30;0;0;;;;;
;0;300;6;13;30;0;4;-31;1;1;;;;;
;1;310;14;7;31;0;3;-32;3;1;;;;;
;1;320;6;5;32;2;6;-33;0;0;;;;;
2;0;330;7;6;33;3;2;-34;0;1;;;;;
1;0;340;7;7;34;2;1;-35;0;4;;;;;
;0;350;7;5;35;3;2;-36;0;0;;;;;
;0;360;4;4;36;1;1;-37;0;0;;;;;
;1;370;9;5;37;2;1;-38;0;1;;;;;
;0;380;10;7;38;0;1;-39;1;0;;;;;
1;0;390;5;4;39;1;1;-40;0;0;;;;;
;0;400;5;8;40;1;1;-41;0;0;;;;;
;1;reste;96;84;reste;631;770;-42;0;0;;;;;
5;10;total;689;1075;total;689;1075;-43;0;0;;;;;
5;8;diagr;592;975;diagr;57;289;-44;0;0;;;;;
0;1;t30;42;270;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;2;0;;;;;
;x;688;25;1;714;;;-49;0;0;;;;;
;c;1059;227;16;1302;;;-50;3;3;;;;;
;;;;;2016;33;;reste;0;0;;;;;
;;;;;;2049;;total;25;227;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====vha2 autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha2_autres_intercalaires_aas|vha2 autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;vha2;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;545001;545657;173;*;
;comp;regulatory;545831;545971;122;*;
fin;comp;CDS;546094;546711;;;
deb;comp;CDS;673809;674132;412;*;
;comp;tRNA;674545;674635;329;*;tca
fin;;CDS;674965;675645;;;
deb;;CDS;881183;882640;244;*;
;;tRNA;882885;882958;302;*;tgc
fin;;CDS;883261;883725;;;
deb;;CDS;884955;886649;245;*;
;;tRNA;886895;886981;97;*;tta
;;tRNA;887079;887154;5;*;ggc
;;tRNA;887160;887233;317;*;tgc
fin;;CDS;887551;889074;;;
deb;comp;CDS;889540;890328;386;*;
;;tRNA;890715;890801;53;*;tta
;;tRNA;890855;890928;181;*;tgc
;;tRNA;891110;891183;366;*;tgc
fin;;CDS;891550;891992;;;
deb;comp;CDS;1335216;1335734;325;*;
;;tRNA;1336060;1336134;272;*;gga
fin;comp;CDS;1336407;1337222;;;
deb;;CDS;1582077;1582217;305;*;
;;regulatory;1582523;1582622;100;*;
fin;;CDS;1582723;1583730;;;
deb;;CDS;1842556;1842741;-36;*;
;;tRNA;1842706;1842789;29;*;ctc
fin;;CDS;1842819;1843430;;0;
deb;;CDS;1921130;1921561;62;*;
;;tRNA;1921624;1921698;337;*;gga
fin;comp;CDS;1922036;1922209;;;
deb;comp;CDS;1937870;1939129;84;*;
;comp;tRNA;1939214;1939304;90;*;tca
;comp;rRNA;1939395;1939511;95;*;117
;comp;rRNA;1939607;1942496;313;*;2890
;comp;tRNA;1942810;1942885;35;*;gta
;comp;tRNA;1942921;1942996;24;*;gca
;comp;tRNA;1943021;1943096;2;*;aaa
;comp;tRNA;1943099;1943174;123;*;gaa
;comp;rRNA;1943298;1944850;468;*;1553
fin;comp;CDS;1945319;1945843;;0;
deb;comp;CDS;1948023;1949408;356;*;
;;regulatory;1949765;1949875;108;*;
fin;;CDS;1949984;1950871;;;
&lt;/pre&gt;

===Aeromonas media WS===
====amed opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_opérons|amed opérons]]
&lt;pre&gt;
61.2%GC;25.7.19 Paris;16s ;126;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Aeromonas media WS;;;;;;;;;;
;6590..7159;;CDS;;3;;;;190;
;;;;;;;;;;
comp;7163..8359;;CDS;;512;*512;;;399;
;8872..10421;;16s;;66;;;;;
;10488..10564;;atc;;10;;;10;;
;10575..10650;;gca;;231;;;;;
;10882..13800;;23s;;98;;;;;
;13899..14013;;5s;;386;*386;;;;*386
;14400..14717;;CDS;;102422;;;;106;
;;;;;;;;;;
;117140..117850;;CDS;;47;47;;;237;47
;117898..117973;;ttc;;52;;52;;;
;118026..118101;;aca;;3;;3;;;
;118105..118180;;ttc;;45;;45;;;
;118226..118301;;aac;;252;252;;;;
;118554..119573;;CDS;;50489;;;;340;
;;;;;;;;;;
comp;170063..170329;;CDS;;103;103;;;89;103
comp;170433..170518;;ctg;+;71;;71;;;
comp;170590..170675;;ctg;5 ctg;46;;46;;;
comp;170722..170807;;ctg;;46;;46;;;
comp;170854..170939;;ctg;;51;;51;;;
comp;170991..171076;;ctg;;116;116;;;;
comp;171193..172653;;CDS;;146173;;;;487;
;;;;;;;;;;
;318827..320692;;CDS;;190;190;;;622;190
;320883..320959;;atgi;;244;244;;;;
comp;321204..323780;;CDS;;62601;;;;*859;
;;;;;;;;;;
;386382..386732;;CDS;;514;*514;;;117;
;387247..388802;;16s;;268;;;;;
;389071..389146;;gaa;;245;;;;;
;389392..392312;;23s;;104;;;;;
;392417..392531;;5s;;268;268;;;;268
comp;392800..394413;;CDS;;81847;;;;538;
;;;;;;;;;;
;476261..476482;;CDS;;64;64;;;74;64
comp;476547..476622;;aac;;5;;5;;;
comp;476628..476703;;ttc;;622;*622;;;;
;477326..477547;;CDS;;22721;;;;*74;
;;;;;;;;;;
;500269..500814;;CDS;;177;177;;;182;177
;500992..501067;;ggc;+;24;;24;;;
;501092..501167;;ggc;6 ggc;29;;29;;;
;501197..501272;;ggc;;38;;38;;;
;501311..501386;;ggc;;25;;25;;;
;501412..501487;;ggc;;23;;23;;;
;501511..501586;;ggc;;363;*363;;;;
comp;501950..502159;;CDS;;4810;;;;70;
;;;;;;;;;;
;506970..507110;;CDS;;236;236;;;47;236
;507347..507422;;gcc;+;28;;28;;;
;507451..507526;;gcc;5 gcc;66;;66;;;
;507593..507668;;gcc;;58;;58;;;
;507727..507802;;gcc;;40;;40;;;
;507843..507918;;gcc;;471;*471;;;;
;508390..508473;;riboswitch;@1;134002;;;;28;
;;;;;;;;;;
;642476..642802;;CDS;;9;9;;;109;9
;642812..642896;;ctc;;91;;91;;;
;642988..643064;;atgf;;166;166;;;;
;643231..643689;;CDS;;128528;;;;153;
;;;;;;;;;;
;772218..774050;;CDS;;195;195;;;611;195
comp;774246..774329;;cta;+;8;;8;;;
comp;774338..774414;;atg;3 atg;38;;38;;;
comp;774453..774527;;caa;4 caa;47;;47;;;
comp;774575..774649;;caa;;17;;17;;;
comp;774667..774743;;atg;;35;;35;;;
comp;774779..774853;;caa;;47;;47;;;
comp;774901..774975;;caa;;13;;13;;;
comp;774989..775065;;atg;;235;235;;;;
comp;775301..776392;;CDS;;3148;;;;364;
;;;;;;;;;;
comp;779541..780557;;CDS;;104;104;;;339;104
comp;780662..780736;;caa;;-21;*-21;;;;*-21
comp;780716..781612;;CDS;;373301;;;;299;
;;;;;;;;;;
comp;1154914..1155384;;CDS;;131;131;;;157;131
comp;1155516..1155592;;ccc;;226;226;;;;
comp;1155819..1157162;;CDS;;67691;;;;448;
;;;;;;;;;;
comp;1224854..1226290;;CDS;;301;301;;;479;
comp;1226592..1226667;;aac;;2;;2;;;
comp;1226670..1226744;;gga;;164;164;;;;164
comp;1226909..1227181;;CDS;;13604;;;;91;
;;;;;;;;;;
comp;1240786..1241733;;CDS;;350;*350;;;316;
comp;1242084..1242156;;aac;+;2;;2;;;
comp;1242159..1242234;;aac;2 aac;49;49;;;;49
;1242284..1242496;;CDS;;294;;;;71;
;;;;;;;;;;
;1242791..1244527;;CDS;;181;181;;;579;181
;1244709..1244796;;tcc;;407;*407;;;;
;1245204..1246064;;CDS;;161293;;;;287;
;;;;;;;;;;
comp;1407358..1408338;;CDS;;410;*410;;;327;
comp;1408749..1408836;;tcc;;177;177;;;;177
comp;1409014..1409631;;CDS;;34595;;;;206;
;;;;;;;;;;
;1444227..1444688;;CDS;;146;146;;;154;
;1444835..1444922;;tcc;;127;127;;;;127
;1445050..1446834;;CDS;;14349;;;;595;
;;;;;;;;;;
comp;1461184..1462401;;CDS;;163;163;;;406;163
comp;1462565..1462640;;cac;;124;;124;;;
comp;1462765..1462838;;aga;;240;240;;;;
comp;1463079..1464389;;CDS;;61984;;;;437;
;;;;;;;;;;
comp;1526374..1527606;;CDS;;151;151;;;411;151
comp;1527758..1527833;;cac;;123;;123;;;
comp;1527957..1528033;;aga;;36;;36;;;
comp;1528070..1528146;;cca;;203;203;;;;
;1528350..1529207;;CDS;;60230;;;;286;
;;;;;;;;;;
;1589438..1589644;;CDS;;138;138;;;69;
comp;1589783..1589858;;aac;;132;132;;;;132
;1589991..1592003;;CDS;;57434;;;;671;
;;;;;;;;;;
;1649438..1651867;;CDS;;104;104;;;*810;104
comp;1651972..1652048;;gtc;+;36;;36;;;
comp;1652085..1652161;;gtc;5 gtc;26;;26;;;
comp;1652188..1652264;;gtc;;15;;15;;;
comp;1652280..1652356;;gtc;;11;;11;;;
comp;1652368..1652444;;gtc;;170;170;;;;
comp;1652615..1653994;;CDS;;277443;;;;460;
;;;;;;;;;;
comp;1931438..1932934;;CDS;;145;145;;;499;145
comp;1933080..1933156;;atgf;+;110;;110;;;
comp;1933267..1933343;;atgf;9 atgf;102;;102;;;
comp;1933446..1933522;;atgf;@2;101;;101;;;
comp;1933624..1933700;;atgf;;101;;101;;;
comp;1933802..1933877;;atgf;;103;;103;;;
comp;1933981..1934057;;atgf;;102;;102;;;
comp;1934160..1934236;;atgf;;102;;102;;;
comp;1934339..1934415;;atgf;;92;;92;;;
comp;1934508..1934584;;atgf;;268;268;;;;
comp;1934853..1935572;;CDS;;490897;;;;240;
;;;;;;;;;;
comp;2426470..2427675;;CDS;;350;350;;;402;
comp;2428026..2428112;;tta;;40;;40;;;
comp;2428153..2428226;;tgc;;35;;35;;;
comp;2428262..2428337;;ggc;;181;181;;;;181
comp;2428519..2429073;;CDS;;117921;;;;185;
;;;;;;;;;;
comp;2546995..2547534;;CDS;;271;271;;;180;271
;2547806..2547882;;ccc;;1103;*1103;;;;
;2548986..2550593;;CDS;;107760;;;;*536;
;;;;;;;;;;
;2658354..2659094;;CDS;;87;87;;;247;87
;2659182..2659257;;acg;;108;108;;;;
&lt;  comp;2659366..2659705;;CDS;;198821;;;;113;
;;;;;;;;;;
comp;2858527..2859036;;CDS;;126;126;;;170;
;2859163..2859247;;tac;+;30;;30;;;
;2859278..2859362;;tac;2 tac;121;121;;;;121
comp;2859484..2863335;;CDS;;115303;;;;*1284;
;;;;;;;;;;
;2978639..2979358;;CDS;;119;119;;;240;119
comp;2979478..2979552;;gga;;104;;104;;;
comp;2979657..2979730;;ggg;;201;201;;;;
;2979932..2981701;;CDS;;41492;;;;590;
;;;;;;;;;;
;3023194..3023487;;CDS;;75;75;;;98;75
comp;3023563..3023636;;tgc;;57;;57;;;
comp;3023694..3023769;;ggc;;248;248;;;;
;3024018..3027455;;CDS;;17375;;;;*1146;
;;;;;;;;;;
;3044831..3045361;;CDS;;133;133;;;177;133
comp;3045495..3045584;;tcg;;380;*380;;;;
;3045965..3046882;;CDS;;221147;;;;306;
;;;;;;;;;;
comp;3268030..3268398;;CDS;;318;318;;;123;
comp;3268717..3268804;;tca;;198;198;;;;198
;3269003..3269752;;CDS;;20717;;;;250;
;;;;;;;;;;
;3290470..3291624;;CDS;;50;50;;;385;50
;3291675..3291751;;agg;;126;126;;;;
comp;3291878..3292804;;CDS;;41865;;;;309;
;;;;;;;;;;
;3334670..3335758;;CDS;;230;230;;;363;
;3335989..3336073;;tac;+;32;;32;;;
;3336106..3336190;;tac;3 tac;45;;45;;;
;3336236..3336320;;tac;;135;135;;;;135
;3336456..3336731;;CDS;;169091;;;;92;
;;;;;;;;;;
comp;3505823..3506272;;CDS;;275;275;;;150;275
comp;3506548..3506662;;5s;;101;;;;;
comp;3506764..3509682;;23s;;229;;;;;
comp;3509912..3509987;;gaa;;218;;;;;
comp;3510206..3511760;;16s;;592;*592;;;;
;3512353..3515220;;CDS;;161083;;;;*956;
;;;;;;;;;;
comp;3676304..3677323;;CDS;;113;113;;;340;
comp;3677437..3677521;;ttg;;49;49;;;;49
;3677571..3678182;;CDS;;9862;;;;204;
;;;;;;;;;;
;3688045..3688872;;CDS;;369;*369;;;276;
comp;3689242..3689318;;cgt;+;25;;25;;;
comp;3689344..3689420;;cgt;5 cgt;25;;25;;;
comp;3689446..3689522;;cgt;;26;;26;;;
comp;3689549..3689625;;cgt;;98;;98;;;
comp;3689724..3689800;;cgt;;4;;4;;;
comp;3689805..3689897;;agc;;213;213;;;;213
comp;3690111..3690299;;CDS;;196546;;;;63;
;;;;;;;;;;
;3886846..3887601;;CDS;;302;302;;;252;302
comp;3887904..3887980;;gac;;98;;;;;
comp;3888079..3888193;;5s;;105;;;;;
comp;3888299..3891217;;23s;;231;;;;;
comp;3891449..3891524;;gca;;10;;;10;;
comp;3891535..3891611;;atc;;66;;;;;
comp;3891678..3893232;;16s;;420;*420;;;;
comp;3893653..3894195;;CDS;;18750;;;;181;
;;;;;;;;;;
comp;3912946..3913317;;CDS;;60;60;;;124;
comp;3913378..3913454;;tgg;;52;52;;;;52
comp;3913507..3914691;;CDS;@3;171;171;;;395;171
comp;3914863..3914937;;gga;;38;;38;;;
comp;3914976..3915060;;tac;;263;263;;;;
;3915324..3916262;;CDS;;45900;;;;313;
;;;;;;;;;;
comp;3962163..3963533;;CDS;;306;306;;;457;
comp;3963840..3963916;;tgg;;202;202;;;;202
;3964119..3964703;;CDS;;59641;;;;195;
;;;;;;;;;;
comp;4024345..4026816;;CDS;;658;*658;;;*824;
comp;4027475..4027551;;ccg;;140;140;;;;140
comp;4027692..4028417;;CDS;;80995;;;;242;
;;;;;;;;;;
;4109413..4111986;;CDS;;99;99;;;*858;
comp;4112086..4112200;;5s;;101;;;;;
comp;4112302..4115220;;23s;;231;;;;;
comp;4115452..4115527;;gaa;;192;;;;;
comp;4115720..4117273;;16s;;94;94;;;;94
comp;4117368..4117547;;CDS;;32227;;;;60;
;;;;;;;;;;
comp;4149775..4150248;;CDS;;204;204;;;158;204
comp;4150453..4150529;;cca;;58;;58;;;
comp;4150588..4150673;;ctg;;20;;20;;;
comp;4150694..4150769;;cac;;49;;49;;;
comp;4150819..4150895;;cgg;;258;258;;;;
;4151154..4151744;;CDS;;74862;;;;197;
;;;;;;;;;;
;4226607..4227725;;CDS;;428;*428;;;373;
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;4233229..4233343;;5s;;106;;;;;
;4233450..4233525;;acc;;23;;;;;
;4233549..4233663;;5s;;164;164;;;;164
;4233828..4234793;;CDS;;119351;;;;322;
;;;;;;;;;;
comp;4354145..4355686;;CDS;;622;*622;;;*514;
;4356309..4357863;;16s;;268;;;;;
;4358132..4358207;;gaa;;230;;;;;
;4358438..4361364;;23s;;102;;;;;
;4361467..4361581;;5s;;106;;;;;
;4361688..4361763;;acc;;233;233;;;;233
;4361997..4363241;;CDS;;71363;;;;415;
;;;;;;;;;;
;4434605..4435198;;CDS;;465;*465;;;198;
;4435664..4437217;;16s;;219;;;;;
;4437437..4437512;;gaa;;229;;;;;
;4437742..4440657;;23s;;103;;;;;
;4440761..4440875;;5s;;98;;;;;
;4440974..4441050;;gac;;167;167;;;;167
;4441218..4442054;;CDS;;39919;;;;279;
;;;;;;;;;;
comp;4481974..4482513;;CDS;;477;*477;;;180;
;4482991..4484545;;16s;;513;;;;;
;4485059..4485549;;23s°;;37;;;;;
comp;4485587..4486115;;23s°;;229;;;;;
comp;4486345..4486419;;gaa;;218;;;;;
comp;4486638..4488193;;16s;;94;94;;;;94
comp;4488288..4488509;;CDS;;72132;;;;74;
;;;;;;;;;;
comp;4560642..4561676;;CDS;;192;192;;;345;
comp;4561869..4561944;;gta;+;18;;18;;;
comp;4561963..4562038;;aaa;7 gta;34;;34;;;
comp;4562073..4562148;;gta;5 aaa;18;;18;;;
comp;4562167..4562242;;aaa;2 aag;23;;23;;;
comp;4562266..4562341;;gta;;18;;18;;;
comp;4562360..4562435;;aaa;;23;;23;;;
comp;4562459..4562534;;gta;;18;;18;;;
comp;4562553..4562628;;aaa;;34;;34;;;
comp;4562663..4562738;;gta;;22;;22;;;
comp;4562761..4562836;;aag;;46;;46;;;
comp;4562883..4562958;;gta;;22;;22;;;
comp;4562981..4563056;;aag;;46;;46;;;
comp;4563103..4563178;;gta;;32;;32;;;
comp;4563211..4563286;;aaa;;174;174;;;;174
comp;4563461..4564276;;CDS;;70895;;;;272;
;;;;;;;;;;
comp;4635172..4636173;;CDS;;275;275;;;334;275
comp;4636449..4636525;;gac;;95;;;;;
comp;4636621..4636735;;5s;;101;;;;;
comp;4636837..4639756;;23s;;231;;;;;
comp;4639988..4640063;;gca;;10;;;10;;
comp;4640074..4640150;;atc;;66;;;;;
comp;4640217..4641771;;16s;;512;*512;;;;
;4642284..4643480;;CDS;;3;;;;399;
;;;;;;;;;;
comp;4643484..4644053;;CDS;;;;;;190;
&lt;/pre&gt;
====amed cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_cumuls|amed cumuls]]
&lt;pre&gt;
amed cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;10;1;0;-;1;1;40;1;100;14
;16 gaa 23 5s ;6;20;15;;50;5;60;5;200;21
;16 atc gca;3;40;27;;100;8;80;2;300;15
;16 23 5s ;0;60;14;;150;19;100;3;400;18
;max a;3;80;2;;200;17;120;4;500;11
;a doubles;0;100;3;;250;13;140;7;600;6
;spéciaux;1;120;8;;300;8;160;2;700;3
;total aas;18;140;2;;350;6;180;8;800;0
sans ;opérons;38;160;0;;400;4;200;5;900;4
;1 aa;16;180;0;;450;4;220;3;1000;1
;max a;14;200;0;;500;3;240;2;1100;0
;a doubles;12;;0;;;8;;6;;2
;total aas;109;;71;0;;96;;48;;95
total aas;;127;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;49;;;;;156;;
;;;variance;34;;;;;77;;
sans jaune;;;moyenne;;;;214;;;;274
;;;variance;;;;122;;;;157
&lt;/pre&gt;

====amed blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_blocs|amed blocs]]
&lt;pre&gt;
amed blocs;;;;;
cds;512;cds;302;cds;275
16s;66;gac;98;gac;95
atc;10;5s;105;5s;101
gca;231;23s;231;23s;231
23s;98;gca;10;gca;10
5s;386;atc;66;atc;66
;;16s;420;16s;512
;;;;;
cds;514;275;99;;
16s;268;101;101;;
gaa;245;229;231;;
23s;104;218;192;;
5s;268;592;94;;
;;;;;
cds;428;CDS;622;cds;465
16s;192;16s;268;16s;219
gaa;229;gaa;230;gaa;229
23s;104;23s;102;23s;103
5s;106;5s;106;5s;98
acc;23;acc;233;gac;167
5s;164;;;;
&lt;/pre&gt;
====amed distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_distribution|amed distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;amed;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;amed;atgi;;tct;;tat;;atgf;9;amed;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;gtc5;att;;act;;aat;;agt;;gtc5;att;;act;;aat;;agt;;gtc5;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;3;tac;;tgc;;tac3+2;ttc;3;tcc;;tac;1;tgc;2;tac3+2;ttc;;tcc;;tac;5;tgc;;tac3+2;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;;aac2;atc;;acc;;aac;3;agc;1;aac2;atc;;acc;;aac;2;agc;;aac2;atc;;acc;2;aac;;agc;
ctc;;ccc;2;cac;;cgt;;caa2+2;ctc;1;ccc;;cac;3;cgt;;caa2+2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;5;caa2+2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;atgf9;gtc;;gcc;;gac;;ggc;2;atgf9;gtc;5;gcc;5;gac;;ggc;6;atgf9;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;;cgt5;tta;1;tca;;taa;;tga;;cgt5;tta;;tca;;taa;;tga;;cgt5;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;ggc6;ata;;aca;1;aaa;5;aga;2;ggc6;ata;;aca;;aaa;;aga;;ggc6;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;1;cca;2;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;4;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;7;gca;;gaa;;gga;3;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;séquences;atgj;3;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;5;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;(atgj caa2)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(gta aaa)4 (gta aag)2 gta aaa;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
amed;;16;;;;;16;;amed;47;;;;;;47;;amed;46;;;;;;46;;amed;;;;5;;;5
&lt;/pre&gt;
====amed autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_autres_intercalaires|amed autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;amed;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;7163;8359;516;*;
;;rRNA;8876;10415;72;*;1540
;;tRNA;10488;10564;10;*;atc
;;tRNA;10575;10650;238;*;gca
;;rRNA;10889;13778;120;*;2890
;;rRNA;13899;14013;386;*;115
fin;;CDS;14400;14717;;;
deb;;CDS;45743;46576;187;*;
;;ncRNA;46764;47150;46;*;
fin;;CDS;47197;48777;;0;
deb;;CDS;117188;117850;47;*;
;;tRNA;117898;117973;52;*;ttc
;;tRNA;118026;118101;3;*;aca
;;tRNA;118105;118180;45;*;ttc
;;tRNA;118226;118301;252;*;aac
fin;;CDS;118554;119573;;;
deb;comp;CDS;170063;170329;103;*;
;comp;tRNA;170433;170518;71;*;ctg
;comp;tRNA;170590;170675;46;*;ctg
;comp;tRNA;170722;170807;46;*;ctg
;comp;tRNA;170854;170939;51;*;ctg
;comp;tRNA;170991;171076;116;*;ctg
fin;comp;CDS;171193;172653;;;
deb;;CDS;318836;320692;190;*;
;;tRNA;320883;320959;244;*;atgi
fin;comp;CDS;321204;323780;;;
deb;;CDS;386382;386732;518;*;
;;rRNA;387251;388796;274;*;1546
;;tRNA;389071;389146;252;*;gaa
;;rRNA;389399;392290;126;*;2892
;;rRNA;392417;392531;268;*;115
fin;comp;CDS;392800;394413;;0;
deb;;CDS;476261;476482;64;*;
;comp;tRNA;476547;476622;5;*;aac
;comp;tRNA;476628;476703;881;*;ttc
fin;comp;CDS;477585;478565;;;
deb;;CDS;500269;500814;177;*;
;;tRNA;500992;501067;24;*;ggc
;;tRNA;501092;501167;29;*;ggc
;;tRNA;501197;501272;38;*;ggc
;;tRNA;501311;501386;25;*;ggc
;;tRNA;501412;501487;23;*;ggc
;;tRNA;501511;501586;363;*;ggc
fin;comp;CDS;501950;502159;;;
deb;;CDS;505552;507110;236;*;
;;tRNA;507347;507422;28;*;gcc
;;tRNA;507451;507526;66;*;gcc
;;tRNA;507593;507668;58;*;gcc
;;tRNA;507727;507802;40;*;gcc
;;tRNA;507843;507918;471;*;gcc
;;regulatory;508390;508473;148;*;
fin;;CDS;508622;511627;;0;
deb;;CDS;642476;642802;9;*;
;;tRNA;642812;642896;91;*;ctc
;;tRNA;642988;643064;166;*;atgf
fin;;CDS;643231;643689;;;
deb;;CDS;772218;774050;195;*;
;comp;tRNA;774246;774329;8;*;cta
;comp;tRNA;774338;774414;38;*;atgj
;comp;tRNA;774453;774527;47;*;caa
;comp;tRNA;774575;774649;17;*;caa
;comp;tRNA;774667;774743;35;*;atgj
;comp;tRNA;774779;774853;47;*;caa
;comp;tRNA;774901;774975;13;*;caa
;comp;tRNA;774989;775065;235;*;atgj
fin;comp;CDS;775301;776392;;;
deb;comp;CDS;779541;780488;173;*;
;comp;tRNA;780662;780736;-21;*;caa
fin;comp;CDS;780716;781630;;;
deb;comp;CDS;1154914;1155384;131;*;
;comp;tRNA;1155516;1155592;226;*;ccc
fin;comp;CDS;1155819;1157162;;0;
deb;comp;CDS;1224854;1226290;301;*;
;comp;tRNA;1226592;1226667;2;*;aac
;comp;tRNA;1226670;1226744;460;*;gga
fin;comp;CDS;1227205;1228818;;;
deb;comp;CDS;1240786;1241733;425;*;
;comp;tRNA;1242159;1242234;556;*;aac
deb;;CDS;1242791;1244527;181;*;
;;tRNA;1244709;1244796;83;*;tcc
fin;;CDS;1244880;1246145;;0;
deb;comp;CDS;1407358;1408665;83;*;
;comp;tRNA;1408749;1408836;177;*;tcc
fin;comp;CDS;1409014;1409631;;;
deb;;CDS;1444233;1444688;146;*;
;;tRNA;1444835;1444922;127;*;tcc
fin;;CDS;1445050;1446834;;;
deb;comp;CDS;1461184;1462401;163;*;
;comp;tRNA;1462565;1462640;438;*;cac
fin;comp;CDS;1463079;1464389;;;
deb;comp;CDS;1526374;1527606;151;*;
;comp;tRNA;1527758;1527833;123;*;cac
;comp;tRNA;1527957;1528033;36;*;aga
;comp;tRNA;1528070;1528146;203;*;cca
fin;;CDS;1528350;1529207;;0;
deb;comp;CDS;1587325;1589010;772;*;
;comp;tRNA;1589783;1589858;132;*;aac
fin;;CDS;1589991;1592003;;;
deb;;CDS;1649438;1651867;104;*;
;comp;tRNA;1651972;1652048;36;*;gtc
;comp;tRNA;1652085;1652161;26;*;gtc
;comp;tRNA;1652188;1652264;15;*;gtc
;comp;tRNA;1652280;1652356;11;*;gtc
;comp;tRNA;1652368;1652444;170;*;gtc
fin;comp;CDS;1652615;1653994;;;
deb;comp;CDS;1734629;1735525;28;*;
;comp;misc_f;1735554;1735678;185;*;
fin;;CDS;1735864;1736109;;;
deb;comp;CDS;1931438;1932934;145;*;
;comp;tRNA;1933080;1933156;110;*;atgf
;comp;tRNA;1933267;1933343;102;*;atgf
;comp;tRNA;1933446;1933522;101;*;atgf
;comp;tRNA;1933624;1933700;101;*;atgf
;comp;tRNA;1933802;1933877;103;*;atgf
;comp;tRNA;1933981;1934057;102;*;atgf
;comp;tRNA;1934160;1934236;102;*;atgf
;comp;tRNA;1934339;1934415;92;*;atgf
;comp;tRNA;1934508;1934584;268;*;atgf
fin;comp;CDS;1934853;1935572;;;
deb;;CDS;1977322;1978332;353;*;
;comp;ncRNA;1978686;1978779;94;*;
fin;;CDS;1978874;1979143;;0;
deb;comp;CDS;1980394;1981206;97;*;
;comp;ncRNA;1981304;1981397;269;*;
fin;;CDS;1981667;1981849;;0;
deb;comp;CDS;1997119;1998258;85;*;
;comp;ncRNA;1998344;1998440;102;*;
fin;comp;CDS;1998543;1999331;;;
deb;;CDS;2154455;2154631;277;*;
;;ncRNA;2154909;2155037;-9;*;
fin;comp;CDS;2155029;2155319;;0;
deb;;CDS;2234810;2235142;16;*;
;;ncRNA;2235159;2235341;133;*;
fin;comp;CDS;2235475;2236674;;;
deb;comp;CDS;2426470;2427675;350;*;
;comp;tRNA;2428026;2428112;40;*;tta
;comp;tRNA;2428153;2428226;35;*;tgc
;comp;tRNA;2428262;2428337;181;*;ggc
fin;comp;CDS;2428519;2429073;;;
deb;comp;CDS;2546995;2547534;271;*;
;;tRNA;2547806;2547882;259;*;ccc
fin;;CDS;2548142;2548282;;;
deb;;CDS;2658354;2659094;87;*;
;;tRNA;2659182;2659257;114;*;acg
fin;;CDS;2659372;2659665;;0;
deb;comp;CDS;2827175;2828170;-13;*;
;comp;regulatory;2828158;2828297;79;*;
fin;;CDS;2828377;2830089;;;
deb;comp;CDS;2858527;2859036;126;*;
;;tRNA;2859163;2859247;30;*;tac
;;tRNA;2859278;2859362;121;*;tac
fin;comp;CDS;2859484;2863335;;;
deb;;CDS;2953473;2953961;121;*;
;;tmRNA;2954083;2954442;177;*;
fin;;CDS;2954620;2955903;;;
deb;;CDS;2978639;2979358;119;*;
;comp;tRNA;2979478;2979552;104;*;gga
;comp;tRNA;2979657;2979730;201;*;ggg
fin;;CDS;2979932;2981701;;;
deb;;CDS;3023194;3023487;75;*;
;comp;tRNA;3023563;3023636;57;*;tgc
;comp;tRNA;3023694;3023769;248;*;ggc
fin;;CDS;3024018;3027455;;0;
deb;;CDS;3044891;3045361;133;*;
;comp;tRNA;3045495;3045584;380;*;tcg
fin;;CDS;3045965;3046882;;;
deb;comp;CDS;3052964;3053617;105;*;
;comp;regulatory;3053723;3053869;209;*;
fin;;CDS;3054079;3054915;;0;
deb;comp;CDS;3093394;3094776;249;*;
;comp;regulatory;3095026;3095141;508;*;
fin;;CDS;3095650;3096798;;0;
deb;comp;CDS;3268030;3268398;318;*;
;comp;tRNA;3268717;3268804;198;*;tca
fin;;CDS;3269003;3269752;;0;
deb;comp;CDS;3286866;3287465;164;*;
;;misc_f;3287630;3287752;38;*;
fin;;CDS;3287791;3288963;;0;
deb;;CDS;3290470;3291624;50;*;
;;tRNA;3291675;3291751;126;*;agg
fin;comp;CDS;3291878;3292798;;0;
deb;;CDS;3334670;3335758;230;*;
;;tRNA;3335989;3336073;32;*;tac
;;tRNA;3336106;3336190;45;*;tac
;;tRNA;3336236;3336320;135;*;tac
fin;;CDS;3336456;3336731;;;
deb;comp;CDS;3382564;3385161;111;*;
;comp;regulatory;3385273;3385359;203;*;
fin;comp;CDS;3385563;3389024;;;
deb;comp;CDS;3497173;3497463;91;*;
;;regulatory;3497555;3497645;99;*;
fin;;CDS;3497745;3498725;;;
deb;comp;CDS;3505823;3506272;275;*;
;comp;rRNA;3506548;3506662;123;*;115
;comp;rRNA;3506786;3509675;236;*;2890
;comp;tRNA;3509912;3509987;224;*;gaa
;comp;rRNA;3510212;3511756;596;*;1545
fin;;CDS;3512353;3515220;;;
deb;comp;CDS;3676304;3677323;113;*;
;comp;tRNA;3677437;3677521;142;*;ttg
fin;;CDS;3677664;3678182;;0;
deb;;CDS;3688045;3688872;369;*;
;comp;tRNA;3689242;3689318;25;*;cgt
;comp;tRNA;3689344;3689420;25;*;cgt
;comp;tRNA;3689446;3689522;26;*;cgt
;comp;tRNA;3689549;3689625;98;*;cgt
;comp;tRNA;3689724;3689800;4;*;cgt
;comp;tRNA;3689805;3689897;213;*;agc
fin;comp;CDS;3690111;3690299;;;
deb;;CDS;3886846;3887601;302;*;
;comp;tRNA;3887904;3887980;98;*;gac
;comp;rRNA;3888079;3888193;127;*;115
;comp;rRNA;3888321;3891210;238;*;2890
;comp;tRNA;3891449;3891524;10;*;gca
;comp;tRNA;3891535;3891611;72;*;atc
;comp;rRNA;3891684;3893228;424;*;1545
fin;comp;CDS;3893653;3894195;;;
deb;comp;CDS;3912946;3913317;60;*;
;comp;tRNA;3913378;3913454;52;*;tgg
deb;comp;CDS;3913507;3914691;171;*;
;comp;tRNA;3914863;3914937;38;*;gga
;comp;tRNA;3914976;3915060;263;*;tac
fin;;CDS;3915324;3916262;;0;
deb;comp;CDS;3962163;3963533;306;*;
;comp;tRNA;3963840;3963916;202;*;tgg
fin;;CDS;3964119;3964703;;;
deb;comp;CDS;4024345;4026816;658;*;
;comp;tRNA;4027475;4027551;140;*;ccg
fin;comp;CDS;4027692;4028417;;;
deb;;CDS;4109413;4111986;99;*;
;comp;rRNA;4112086;4112200;123;*;115
;comp;rRNA;4112324;4115213;238;*;2890
;comp;tRNA;4115452;4115527;198;*;gaa
;comp;rRNA;4115726;4117269;627;*;1544
fin;;CDS;4117897;4118388;;0;
deb;comp;CDS;4119290;4121155;51;*;
;comp;regulatory;4121207;4121385;207;*;
fin;;CDS;4121593;4122102;;;
deb;comp;CDS;4149775;4150278;174;*;
;comp;tRNA;4150453;4150529;58;*;cca
;comp;tRNA;4150588;4150673;20;*;ctg
;comp;tRNA;4150694;4150769;49;*;cac
;comp;tRNA;4150819;4150895;258;*;cgg
fin;;CDS;4151154;4151744;;;
deb;;CDS;4226547;4227725;432;*;
;;rRNA;4228158;4229702;198;*;1545
;;tRNA;4229901;4229976;236;*;gaa
;;rRNA;4230213;4233102;126;*;2890
;;rRNA;4233229;4233343;106;*;115
;;tRNA;4233450;4233525;23;*;acc
;;rRNA;4233549;4233663;164;*;115
fin;;CDS;4233828;4234793;;;
deb;comp;CDS;4354145;4355686;626;*;
;;rRNA;4356313;4357857;274;*;1545
;;tRNA;4358132;4358207;237;*;gaa
;;rRNA;4358445;4361342;124;*;2898
;;rRNA;4361467;4361581;106;*;115
;;tRNA;4361688;4361763;233;*;acc
fin;;CDS;4361997;4363241;;;
deb;;CDS;4434674;4435198;469;*;
;;rRNA;4435668;4437211;225;*;1544
;;tRNA;4437437;4437512;236;*;gaa
;;rRNA;4437749;4440638;122;*;2890
;;rRNA;4440761;4440875;98;*;115
;;tRNA;4440974;4441050;167;*;gac
fin;;CDS;4441218;4442054;;0;
deb;comp;CDS;4481974;4482513;481;*;
;;rRNA;4482995;4484539;547;*;1545
;;misc_f;4485087;4486108;236;*;
;comp;tRNA;4486345;4486419;224;*;gaa
;comp;rRNA;4486644;4488189;559;*;1546
fin;comp;CDS;4488749;4489795;;;
deb;comp;CDS;4560642;4561715;153;*;
;comp;tRNA;4561869;4561944;18;*;gta
;comp;tRNA;4561963;4562038;34;*;aaa
;comp;tRNA;4562073;4562148;18;*;gta
;comp;tRNA;4562167;4562242;23;*;aaa
;comp;tRNA;4562266;4562341;18;*;gta
;comp;tRNA;4562360;4562435;23;*;aaa
;comp;tRNA;4562459;4562534;18;*;gta
;comp;tRNA;4562553;4562628;34;*;aaa
;comp;tRNA;4562663;4562738;22;*;gta
;comp;tRNA;4562761;4562836;46;*;aag
;comp;tRNA;4562883;4562958;22;*;gta
;comp;tRNA;4562981;4563056;46;*;aag
;comp;tRNA;4563103;4563178;32;*;gta
;comp;tRNA;4563211;4563286;174;*;aaa
fin;comp;CDS;4563461;4564267;;;
deb;;CDS;4626091;4627785;262;*;
;;regulatory;4628048;4628133;65;*;
fin;;CDS;4628199;4629623;;;
deb;comp;CDS;4635172;4636104;344;*;
;comp;tRNA;4636449;4636525;95;*;gac
;comp;rRNA;4636621;4636735;120;*;115
;comp;rRNA;4636856;4639749;238;*;2894
;comp;tRNA;4639988;4640063;10;*;gca
;comp;tRNA;4640074;4640150;72;*;atc
;comp;rRNA;4640223;4641767;516;*;1545
fin;;CDS;4642284;4643480;;0;
deb;comp;CDS;4698779;4700680;360;*;
;comp;regulatory;4701041;4701154;88;*;
fin;;CDS;4701243;4702160;;;
&lt;/pre&gt;

====amed données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_données_intercalaires|amed données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;amed;fx;fc;amed;fx40;fc40;amed;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
;1;0;2;12;0;2;12;-1;0;91;47;244;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;suite
;1;10;38;225;1;2;26;-2;1;0;252;64;518;516;;52;;ttc;40;;tta
;0;20;20;167;2;0;41;-3;0;0;103;363;424;596;;3;;aca;35;;tgc
;0;30;23;110;3;4;34;-4;8;212;116;195;432;627;;45;;ttc;**;;ggc
;0;40;34;92;4;9;18;-5;0;0;190;556;469;626;;**;;aac;30;;tac
;2;50;43;75;5;0;12;-6;1;0;881;203;599;481;;71;;ctg;**;;tac
;2;60;76;92;6;6;6;-7;0;10;177;132;;516;;46;;ctg;104;;gga
1;0;70;90;111;7;4;12;-8;3;47;236;104;23s 5s;;;46;;ctg;**;;ggg
1;0;80;100;99;8;6;17;-9;1;0;9;271;2* 120;;;51;;ctg;57;;tgc
;3;90;59;120;9;3;34;-10;0;2;166;126;2* 126;;;**;;ctg;**;;ggc
;0;100;54;90;10;4;25;-11;2;31;235;121;2* 123;;;5;;aac;32;;tac
1;1;110;58;112;11;1;21;-12;0;0;173;119;127;;;**;;ttc;45;;tac
1;3;120;50;96;12;3;18;-13;2;6;-21;201;124;;;24;;ggc;**;;tac
3;1;130;35;81;13;2;20;-14;1;7;131;75;122;;;29;;ggc;25;;cgt
2;3;140;30;74;14;2;22;-15;1;0;226;248;5s CDS;;;38;;ggc;25;;cgt
1;2;150;25;72;15;1;14;-16;0;8;301;133;386;268;;25;;ggc;26;;cgt
;2;160;33;70;16;3;13;-17;0;4;460;380;275;99;;23;;ggc;98;;cgt
;4;170;29;32;17;2;20;-18;1;0;425;198;164;;;**;;ggc;4;;cgt
;6;180;35;50;18;1;17;-19;1;1;181;126;16s tRNA;;;28;;gcc;**;;agc
;3;190;25;44;19;2;6;-20;1;7;83;142;3* 72;;atc;66;;gcc;38;;gga
2;0;200;37;53;20;3;16;-21;1;0;83;369;2* 274;;gaa;58;;gcc;**;;tac
3;0;210;39;48;21;3;11;-22;2;1;177;302;2* 198;;gaa;40;;gcc;58;;cca
;1;220;25;34;22;0;8;-23;0;1;146;263;2* 224;;gaa;**;;gcc;20;;ctg
;2;230;30;26;23;1;16;-24;0;0;127;202;225;;gaa;91;;ctc;49;;cac
;3;240;26;30;24;3;10;-25;1;2;163;258;tRNA 23s;;;**;;atgf;**;;cgg
2;0;250;20;26;25;3;13;-26;0;1;438;;3* 238;;gca;8;;cta;18;;gta
1;2;260;21;25;26;1;7;-27;0;0;151;;252;;gaa;38;;atgj;34;;aaa
1;1;270;22;36;27;4;10;-28;0;0;772;;3* 236;;gaa;47;;caa;18;;gta
1;0;280;25;28;28;2;11;-29;1;1;170;;237;;gaa;17;;caa;23;;aaa
;0;290;13;24;29;2;15;-30;0;0;145;;238;;gaa;35;;atgj;18;;gta
;0;300;8;14;30;4;9;-31;0;1;268;;5s tRNA;;;47;;caa;23;;aaa
1;2;310;19;17;31;3;9;-32;0;0;350;;98;;gac;13;;caa;18;;gta
;1;320;12;14;32;3;11;-33;2;0;181;;2* 106;;acc;**;;atgj;34;;aaa
;0;330;8;15;33;4;11;-34;0;2;259;;98;;gac;2;;aac;22;;gta
;0;340;9;8;34;1;9;-35;2;2;87;;95;;gac;**;;gga;46;;aag
;2;350;13;13;35;1;12;-36;1;0;114;;tRNA 5s;;;123;;cac;22;;gta
;0;360;15;8;36;1;5;-37;0;0;318;;23;;acc;36;;aga;46;;aag
2;0;370;7;5;37;5;4;-38;1;0;50;;tRNA tRNA;;intra;**;;cca;32;;gta
1;0;380;8;7;38;7;13;-39;0;0;230;;3* 10;;atc;36;;gtc;**;;aaa
;0;390;7;9;39;7;10;-40;0;0;135;;**;;gca;26;;gtc;;;
;0;400;10;9;40;2;8;-41;0;0;113;;;;;15;;gtc;;;
1;6;reste;110;109;reste;1226;1776;-42;0;0;213;;;;;11;;gtc;;;
25;54;total;1343;2382;total;1343;2382;-43;0;0;60;;;;;**;;gtc;;;
24;47;diagr;1231;2261;diagr;115;594;-44;0;1;52;;;;;110;;atgf;;;
0;1;t30;81;502;;;;-45;0;0;171;;;;;102;;atgf;;;
;;;;;;;;-46;3;0;306;;;;;101;;atgf;;;
;Récapitulatif des effectifs;;;;;;;-47;0;0;658;;;;;101;;atgf;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;140;;;;;103;;atgf;;;
;x;1341;42;2;1385;;;-49;0;0;174;;;;;102;;atgf;;;
;c;2370;444;12;2826;;;-50;1;0;233;;;;;102;;atgf;;;
;;;;;4211;239;;reste;4;6;167;;;;;92;;atgf;;;
;;;;;;4450;;total;42;444;153;;;;;**;;atgf;;;
;;;;;;;;;;;174;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;344;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====amed autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_autres_intercalaires_aas|amed autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;amed;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;7163;8359;516;*;
;;rRNA;8876;10415;72;*;1540
;;tRNA;10488;10564;10;*;atc
;;tRNA;10575;10650;238;*;gca
;;rRNA;10889;13778;120;*;2890
;;rRNA;13899;14013;386;*;115
fin;;CDS;14400;14717;;;
deb;;CDS;45743;46576;187;*;
;;ncRNA;46764;47150;46;*;
fin;;CDS;47197;48777;;0;
deb;;CDS;117188;117850;47;*;
;;tRNA;117898;117973;52;*;ttc
;;tRNA;118026;118101;3;*;aca
;;tRNA;118105;118180;45;*;ttc
;;tRNA;118226;118301;252;*;aac
fin;;CDS;118554;119573;;;
deb;comp;CDS;170063;170329;103;*;
;comp;tRNA;170433;170518;71;*;ctg
;comp;tRNA;170590;170675;46;*;ctg
;comp;tRNA;170722;170807;46;*;ctg
;comp;tRNA;170854;170939;51;*;ctg
;comp;tRNA;170991;171076;116;*;ctg
fin;comp;CDS;171193;172653;;;
deb;;CDS;318836;320692;190;*;
;;tRNA;320883;320959;244;*;atgi
fin;comp;CDS;321204;323780;;;
deb;;CDS;386382;386732;518;*;
;;rRNA;387251;388796;274;*;1546
;;tRNA;389071;389146;252;*;gaa
;;rRNA;389399;392290;126;*;2892
;;rRNA;392417;392531;268;*;115
fin;comp;CDS;392800;394413;;0;
deb;;CDS;476261;476482;64;*;
;comp;tRNA;476547;476622;5;*;aac
;comp;tRNA;476628;476703;881;*;ttc
fin;comp;CDS;477585;478565;;;
deb;;CDS;500269;500814;177;*;
;;tRNA;500992;501067;24;*;ggc
;;tRNA;501092;501167;29;*;ggc
;;tRNA;501197;501272;38;*;ggc
;;tRNA;501311;501386;25;*;ggc
;;tRNA;501412;501487;23;*;ggc
;;tRNA;501511;501586;363;*;ggc
fin;comp;CDS;501950;502159;;;
deb;;CDS;505552;507110;236;*;
;;tRNA;507347;507422;28;*;gcc
;;tRNA;507451;507526;66;*;gcc
;;tRNA;507593;507668;58;*;gcc
;;tRNA;507727;507802;40;*;gcc
;;tRNA;507843;507918;471;*;gcc
;;regulatory;508390;508473;148;*;
fin;;CDS;508622;511627;;0;
deb;;CDS;642476;642802;9;*;
;;tRNA;642812;642896;91;*;ctc
;;tRNA;642988;643064;166;*;atgf
fin;;CDS;643231;643689;;;
deb;;CDS;772218;774050;195;*;
;comp;tRNA;774246;774329;8;*;cta
;comp;tRNA;774338;774414;38;*;atgj
;comp;tRNA;774453;774527;47;*;caa
;comp;tRNA;774575;774649;17;*;caa
;comp;tRNA;774667;774743;35;*;atgj
;comp;tRNA;774779;774853;47;*;caa
;comp;tRNA;774901;774975;13;*;caa
;comp;tRNA;774989;775065;235;*;atgj
fin;comp;CDS;775301;776392;;;
deb;comp;CDS;779541;780488;173;*;
;comp;tRNA;780662;780736;-21;*;caa
fin;comp;CDS;780716;781630;;;
deb;comp;CDS;1154914;1155384;131;*;
;comp;tRNA;1155516;1155592;226;*;ccc
fin;comp;CDS;1155819;1157162;;0;
deb;comp;CDS;1224854;1226290;301;*;
;comp;tRNA;1226592;1226667;2;*;aac
;comp;tRNA;1226670;1226744;460;*;gga
fin;comp;CDS;1227205;1228818;;;
deb;comp;CDS;1240786;1241733;425;*;
;comp;tRNA;1242159;1242234;556;*;aac
deb;;CDS;1242791;1244527;181;*;
;;tRNA;1244709;1244796;83;*;tcc
fin;;CDS;1244880;1246145;;0;
deb;comp;CDS;1407358;1408665;83;*;
;comp;tRNA;1408749;1408836;177;*;tcc
fin;comp;CDS;1409014;1409631;;;
deb;;CDS;1444233;1444688;146;*;
;;tRNA;1444835;1444922;127;*;tcc
fin;;CDS;1445050;1446834;;;
deb;comp;CDS;1461184;1462401;163;*;
;comp;tRNA;1462565;1462640;438;*;cac
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;comp;tRNA;1527758;1527833;123;*;cac
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;comp;tRNA;1651972;1652048;36;*;gtc
;comp;tRNA;1652085;1652161;26;*;gtc
;comp;tRNA;1652188;1652264;15;*;gtc
;comp;tRNA;1652280;1652356;11;*;gtc
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deb;comp;CDS;1734629;1735525;28;*;
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;comp;tRNA;1933080;1933156;110;*;atgf
;comp;tRNA;1933267;1933343;102;*;atgf
;comp;tRNA;1933446;1933522;101;*;atgf
;comp;tRNA;1933624;1933700;101;*;atgf
;comp;tRNA;1933802;1933877;103;*;atgf
;comp;tRNA;1933981;1934057;102;*;atgf
;comp;tRNA;1934160;1934236;102;*;atgf
;comp;tRNA;1934339;1934415;92;*;atgf
;comp;tRNA;1934508;1934584;268;*;atgf
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deb;;CDS;1977322;1978332;353;*;
;comp;ncRNA;1978686;1978779;94;*;
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;comp;ncRNA;1981304;1981397;269;*;
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;comp;ncRNA;1998344;1998440;102;*;
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deb;;CDS;2154455;2154631;277;*;
;;ncRNA;2154909;2155037;-9;*;
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;comp;tRNA;2428026;2428112;40;*;tta
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;comp;tRNA;2428262;2428337;181;*;ggc
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deb;comp;CDS;2546995;2547534;271;*;
;;tRNA;2547806;2547882;259;*;ccc
fin;;CDS;2548142;2548282;;;
deb;;CDS;2658354;2659094;87;*;
;;tRNA;2659182;2659257;114;*;acg
fin;;CDS;2659372;2659665;;0;
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;comp;regulatory;2828158;2828297;79;*;
fin;;CDS;2828377;2830089;;;
deb;comp;CDS;2858527;2859036;126;*;
;;tRNA;2859163;2859247;30;*;tac
;;tRNA;2859278;2859362;121;*;tac
fin;comp;CDS;2859484;2863335;;;
deb;;CDS;2953473;2953961;121;*;
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;comp;tRNA;2979478;2979552;104;*;gga
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fin;;CDS;2979932;2981701;;;
deb;;CDS;3023194;3023487;75;*;
;comp;tRNA;3023563;3023636;57;*;tgc
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fin;;CDS;3024018;3027455;;0;
deb;;CDS;3044891;3045361;133;*;
;comp;tRNA;3045495;3045584;380;*;tcg
fin;;CDS;3045965;3046882;;;
deb;comp;CDS;3052964;3053617;105;*;
;comp;regulatory;3053723;3053869;209;*;
fin;;CDS;3054079;3054915;;0;
deb;comp;CDS;3093394;3094776;249;*;
;comp;regulatory;3095026;3095141;508;*;
fin;;CDS;3095650;3096798;;0;
deb;comp;CDS;3268030;3268398;318;*;
;comp;tRNA;3268717;3268804;198;*;tca
fin;;CDS;3269003;3269752;;0;
deb;comp;CDS;3286866;3287465;164;*;
;;misc_f;3287630;3287752;38;*;
fin;;CDS;3287791;3288963;;0;
deb;;CDS;3290470;3291624;50;*;
;;tRNA;3291675;3291751;126;*;agg
fin;comp;CDS;3291878;3292798;;0;
deb;;CDS;3334670;3335758;230;*;
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fin;;CDS;3336456;3336731;;;
deb;comp;CDS;3382564;3385161;111;*;
;comp;regulatory;3385273;3385359;203;*;
fin;comp;CDS;3385563;3389024;;;
deb;comp;CDS;3497173;3497463;91;*;
;;regulatory;3497555;3497645;99;*;
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deb;comp;CDS;3505823;3506272;275;*;
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;comp;tRNA;3509912;3509987;224;*;gaa
;comp;rRNA;3510212;3511756;596;*;1545
fin;;CDS;3512353;3515220;;;
deb;comp;CDS;3676304;3677323;113;*;
;comp;tRNA;3677437;3677521;142;*;ttg
fin;;CDS;3677664;3678182;;0;
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;comp;tRNA;3689242;3689318;25;*;cgt
;comp;tRNA;3689344;3689420;25;*;cgt
;comp;tRNA;3689446;3689522;26;*;cgt
;comp;tRNA;3689549;3689625;98;*;cgt
;comp;tRNA;3689724;3689800;4;*;cgt
;comp;tRNA;3689805;3689897;213;*;agc
fin;comp;CDS;3690111;3690299;;;
deb;;CDS;3886846;3887601;302;*;
;comp;tRNA;3887904;3887980;98;*;gac
;comp;rRNA;3888079;3888193;127;*;115
;comp;rRNA;3888321;3891210;238;*;2890
;comp;tRNA;3891449;3891524;10;*;gca
;comp;tRNA;3891535;3891611;72;*;atc
;comp;rRNA;3891684;3893228;424;*;1545
fin;comp;CDS;3893653;3894195;;;
deb;comp;CDS;3912946;3913317;60;*;
;comp;tRNA;3913378;3913454;52;*;tgg
deb;comp;CDS;3913507;3914691;171;*;
;comp;tRNA;3914863;3914937;38;*;gga
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fin;;CDS;3915324;3916262;;0;
deb;comp;CDS;3962163;3963533;306;*;
;comp;tRNA;3963840;3963916;202;*;tgg
fin;;CDS;3964119;3964703;;;
deb;comp;CDS;4024345;4026816;658;*;
;comp;tRNA;4027475;4027551;140;*;ccg
fin;comp;CDS;4027692;4028417;;;
deb;;CDS;4109413;4111986;99;*;
;comp;rRNA;4112086;4112200;123;*;115
;comp;rRNA;4112324;4115213;238;*;2890
;comp;tRNA;4115452;4115527;198;*;gaa
;comp;rRNA;4115726;4117269;627;*;1544
fin;;CDS;4117897;4118388;;0;
deb;comp;CDS;4119290;4121155;51;*;
;comp;regulatory;4121207;4121385;207;*;
fin;;CDS;4121593;4122102;;;
deb;comp;CDS;4149775;4150278;174;*;
;comp;tRNA;4150453;4150529;58;*;cca
;comp;tRNA;4150588;4150673;20;*;ctg
;comp;tRNA;4150694;4150769;49;*;cac
;comp;tRNA;4150819;4150895;258;*;cgg
fin;;CDS;4151154;4151744;;;
deb;;CDS;4226547;4227725;432;*;
;;rRNA;4228158;4229702;198;*;1545
;;tRNA;4229901;4229976;236;*;gaa
;;rRNA;4230213;4233102;126;*;2890
;;rRNA;4233229;4233343;106;*;115
;;tRNA;4233450;4233525;23;*;acc
;;rRNA;4233549;4233663;164;*;115
fin;;CDS;4233828;4234793;;;
deb;comp;CDS;4354145;4355686;626;*;
;;rRNA;4356313;4357857;274;*;1545
;;tRNA;4358132;4358207;237;*;gaa
;;rRNA;4358445;4361342;124;*;2898
;;rRNA;4361467;4361581;106;*;115
;;tRNA;4361688;4361763;233;*;acc
fin;;CDS;4361997;4363241;;;
deb;;CDS;4434674;4435198;469;*;
;;rRNA;4435668;4437211;225;*;1544
;;tRNA;4437437;4437512;236;*;gaa
;;rRNA;4437749;4440638;122;*;2890
;;rRNA;4440761;4440875;98;*;115
;;tRNA;4440974;4441050;167;*;gac
fin;;CDS;4441218;4442054;;0;
deb;comp;CDS;4481974;4482513;481;*;
;;rRNA;4482995;4484539;547;*;1545
;;misc_f;4485087;4486108;236;*;
;comp;tRNA;4486345;4486419;224;*;gaa
;comp;rRNA;4486644;4488189;559;*;1546
fin;comp;CDS;4488749;4489795;;;
deb;comp;CDS;4560642;4561715;153;*;
;comp;tRNA;4561869;4561944;18;*;gta
;comp;tRNA;4561963;4562038;34;*;aaa
;comp;tRNA;4562073;4562148;18;*;gta
;comp;tRNA;4562167;4562242;23;*;aaa
;comp;tRNA;4562266;4562341;18;*;gta
;comp;tRNA;4562360;4562435;23;*;aaa
;comp;tRNA;4562459;4562534;18;*;gta
;comp;tRNA;4562553;4562628;34;*;aaa
;comp;tRNA;4562663;4562738;22;*;gta
;comp;tRNA;4562761;4562836;46;*;aag
;comp;tRNA;4562883;4562958;22;*;gta
;comp;tRNA;4562981;4563056;46;*;aag
;comp;tRNA;4563103;4563178;32;*;gta
;comp;tRNA;4563211;4563286;174;*;aaa
fin;comp;CDS;4563461;4564267;;;
deb;;CDS;4626091;4627785;262;*;
;;regulatory;4628048;4628133;65;*;
fin;;CDS;4628199;4629623;;;
deb;comp;CDS;4635172;4636104;344;*;
;comp;tRNA;4636449;4636525;95;*;gac
;comp;rRNA;4636621;4636735;120;*;115
;comp;rRNA;4636856;4639749;238;*;2894
;comp;tRNA;4639988;4640063;10;*;gca
;comp;tRNA;4640074;4640150;72;*;atc
;comp;rRNA;4640223;4641767;516;*;1545
fin;;CDS;4642284;4643480;;0;
deb;comp;CDS;4698779;4700680;360;*;
;comp;regulatory;4701041;4701154;88;*;
fin;;CDS;4701243;4702160;;;
&lt;/pre&gt;

===gamma synthèse===
====gamma distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#gamma_distribution_par_génome|gamma distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
spl;46;8;;;;6;79;3;142
vpb;60;11;;;;21;22;12;126
vha;51;14;;;;26;19;11;121
amed;47;16;;;;13;46;5;127
eal;25;23;;;;10;23;4;85
eco;20;23;;;;10;29;4;86
ecoN;20;34;;;;17;44;6;121
;;;;;;;;;
total;269;129;0;0;0;103;262;45;808
&lt;/pre&gt;

====gamma distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#gamma_distribution_du_total|gamma distribution du total]]
&lt;pre&gt;
gama7;;;;;;;660;;gamma7;;;;;;;148
atgi;11;tct;;tat;;atgf;48;;atgi;;tct;;tat;;atgf;0
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;21;tcc;14;tac;30;tgc;18;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;3;acc;6;aac;34;agc;11;;atc;23;acc;9;aac;;agc;
ctc;9;ccc;6;cac;12;cgt;40;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;21;gcc;16;gac;7;ggc;46;;gtc;;gcc;2;gac;23;ggc;
tta;14;tca;12;taa;;tga;4;;tta;;tca;4;taa;;tga;
ata;;aca;19;aaa;33;aga;10;;ata;;aca;;aaa;8;aga;
cta;24;cca;14;caa;23;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;34;gca;;gaa;17;gga;14;;gta;8;gca;29;gaa;34;gga;
ttg;7;tcg;4;tag;;tgg;4;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;8
atgj;19;acg;4;aag;2;agg;7;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;21;ccg;4;cag;6;cgg;7;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;4;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;531;129;0;0;0;0;660;;1-3aas;;;;45;;103;148
&lt;/pre&gt;

====gamma distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#gamma_distribution_par_type|gamma distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
gama7;;;;;;;660;;gama7;;;;;;;129;;gama7;;;;;;;269;;gama7;;;;;;;262;;gama7;;;;;;;45
atgi;11;tct;0;tat;0;atgf;48;;atgi;9;tct;;tat;;atgf;6;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;18;;atgi;;tct;;tat;;atgf;24;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;21;tcc;14;tac;30;tgc;18;;ttc;7;tcc;14;tac;;tgc;1;;ttc;14;tcc;;tac;6;tgc;15;;ttc;;tcc;;tac;24;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;3;acc;6;aac;34;agc;11;;atc;1;acc;1;aac;14;agc;;;atc;;acc;5;aac;11;agc;11;;atc;2;acc;;aac;9;agc;;;atc;;acc;9;aac;;agc;
ctc;9;ccc;6;cac;12;cgt;40;;ctc;5;ccc;6;cac;;cgt;;;ctc;4;ccc;;cac;12;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;38;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;21;gcc;16;gac;7;ggc;46;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;;;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;17;;gtc;19;gcc;14;gac;4;ggc;29;;gtc;;gcc;;gac;23;ggc;
tta;14;tca;12;taa;0;tga;4;;tta;;tca;10;taa;;tga;4;;tta;14;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;4;taa;;tga;
ata;0;aca;19;aaa;33;aga;10;;ata;;aca;;aaa;;aga;6;;ata;;aca;19;aaa;15;aga;4;;ata;;aca;;aaa;18;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;24;cca;14;caa;23;cga;0;;cta;;cca;2;caa;1;cga;;;cta;18;cca;10;caa;12;cga;;;cta;6;cca;2;caa;10;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;34;gca;0;gaa;17;gga;14;;gta;;gca;;gaa;4;gga;4;;gta;13;gca;;gaa;;gga;10;;gta;21;gca;;gaa;13;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;
ttg;7;tcg;4;tag;0;tgg;4;;ttg;7;tcg;4;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;8
atgj;19;acg;4;aag;2;agg;7;;atgj;;acg;4;aag;;agg;7;;atgj;19;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;21;ccg;4;cag;6;cgg;7;;ctg;;ccg;4;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;;cag;;cgg;7;;ctg;17;ccg;;cag;6;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;4;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;3;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;;;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;1-3aas;;;;45;;;
&lt;/pre&gt;

====gamma par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#gamma_par_rapport_au_groupe_de_référence|gamma par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;gama7;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;37;18;39;;;2;96;
16;moyen;51;104;31;;21;52;259;
14;fort;41;147;192;;24;49;453;
; ;129;269;262;;45;103;808;
10;g+cga;15;3;6;;;;24;
2;agg+cgg;7;7;;;;;14;
4;carre ccc;11;8;33;;;2;54;
5;autres;4;;;;;;4;
;;37;18;39;;;2;96;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;gama7;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;gama  ‰;ref. ‰
21;faible;46;22;48;;;2;119;26
16;moyen;63;129;38;;26;64;321;324
14;fort;51;182;238;;30;61;561;650
;;160;333;324;;56;127;808;729
10;g+cga;19;4;7;;;;30;10
2;agg+cgg;9;9;;;;;17;
4;carre ccc;14;10;41;;;2;67;16
5;autres;5;;;;;;5;
;;46;22;48;;;2;119;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;gama7;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;56;27;59;142;26;29;7;15
16;moyen;77;158;47;282;324;40;39;12
14;fort;62;223;291;576;650;32;55;73
;;195;408;397;660;729;129;269;262
10;g+cga;23;5;9;36;10;41;;15
2;agg+cgg;11;11;;21;;19;;
4;carre ccc;17;12;50;79;16;30;;85
5;autres;6;;;6;;11;;
;;56;27;59;142;;37;;39
&lt;/pre&gt;
====gamma, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#gamma,_estimation_des_-rRNAs|gamma, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
gamma;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
144 génomes total avec rRNA;;;;gama;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;gama;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;144;1536; ; ;;indices;;;;144;1067;0;0;;gama7;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;660
atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;11;tct;;tat;;atgf;48
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;3;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;21;tcc;14;tac;30;tgc;18
atc;373;acc;57;aac;;agc;3;;atc;259;acc;40;aac;;agc;2;;atc;3;acc;6;aac;34;agc;11
ctc;;ccc;;cac;10;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;7;cgt;;;ctc;9;ccc;6;cac;12;cgt;40
gtc;;gcc;3;gac;151;ggc;;;gtc;;gcc;2;gac;105;ggc;;;gtc;21;gcc;16;gac;7;ggc;46
tta;1;tca;3;taa;;tga;;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;14;tca;12;taa;;tga;4
ata;;aca;;aaa;13;aga;;;ata;;aca;;aaa;9;aga;;;ata;;aca;19;aaa;33;aga;10
cta;;cca;14;caa;;cga;;;cta;;cca;10;caa;;cga;;;cta;24;cca;14;caa;23;cga;
gta;14;gca;378;gaa;423;gga;;;gta;10;gca;263;gaa;294;gga;;;gta;34;gca;;gaa;17;gga;14
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;73;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;51;;ttg;7;tcg;4;tag;;tgg;4
atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;19;acg;4;aag;2;agg;7
ctg;;ccg;;cag;;cgg;11;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;8;;ctg;21;ccg;4;cag;6;cgg;7
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;4
;;900;;622;;14;1536;;;;625;;432;;10;1067;;;;186;;380;;94;660
27.5.20 Tanger;;;;gama;total;ttt;tgt;;27.5.20 Tanger;;;;gama;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;86713;1.5;0;;avec +16s;;;;1183;86713;1.5;0;;gama7;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;130;tct;1.7;tat;1.3;atgf;290;;atgi;130;tct;1.7;tat;1.3;atgf;292;;atgi;157;tct;;tat;;atgf;686
att;0.1;act;0.5;aat;0.2;agt;;;att;0.1;act;0.5;aat;0.2;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0.9;cct;;cat;;cgc;;;ctt;0.9;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.5;gct;;gat;;ggt;0.5;;gtt;0.5;gct;;gat;;ggt;0.5;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;173;tcc;152;tac;226;tgc;114;;ttc;175;tcc;152;tac;227;tgc;114;;ttc;300;tcc;200;tac;429;tgc;257
atc;26;acc;115;aac;311;agc;104;;atc;285;acc;155;aac;311;agc;106;;atc;43;acc;86;aac;486;agc;157
ctc;102;ccc;86;cac;108;cgt;298;;ctc;102;ccc;86;cac;115;cgt;298;;ctc;129;ccc;86;cac;171;cgt;571
gtc;173;gcc;165;gac;184;ggc;351;;gtc;173;gcc;167;gac;289;ggc;351;;gtc;300;gcc;229;gac;100;ggc;657
tta;119;tca;138;taa;1.0;tga;64;;tta;120;tca;140;taa;1.0;tga;64;;tta;200;tca;171;taa;;tga;57
ata;0.8;aca;141;aaa;368;aga;151;;ata;0.8;aca;141;aaa;377;aga;151;;ata;;aca;271;aaa;471;aga;143
cta;128;cca;131;caa;189;cga;13;;cta;128;cca;141;caa;189;cga;13;;cta;343;cca;200;caa;329;cga;
gta;311;gca;21;gaa;30;gga;114;;gta;321;gca;283;gaa;324;gga;114;;gta;486;gca;;gaa;243;gga;200
ttg;102;tcg;83;tag;2.7;tgg;62;;ttg;103;tcg;83;tag;2.7;tgg;113;;ttg;100;tcg;57;tag;;tgg;57
atgj;169;acg;71;aag;24;agg;110;;atgj;170;acg;71;aag;24;agg;110;;atgj;271;acg;57;aag;29;agg;100
ctg;252;ccg;62;cag;102;cgg;92;;ctg;252;ccg;62;cag;102;cgg;100;;ctg;300;ccg;57;cag;86;cgg;100
gtg;8.3;gcg;6.9;gag;7.6;ggg;72;;gtg;8.3;gcg;6.9;gag;7.6;ggg;72;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;57
;;1892;;3118;;1244;6254;;;;2517;;3550;;1254;7321;;;;2657;;5429;;1343;9429
rapports;;75;;88;;99;85;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;gama7;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;99;;fiches;57.882;;;fréquences;;;;;atgi;17;tct;100;tat;100;atgf;58
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;8335;;;0/0;;;;;att;100;act;100;aat;100;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;avec;1401;;;10;7;;;;ctt;100;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;144;;;20;7;;;;gtt;100;gct;;gat;;ggt;100
ttc;99;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;6;;;;ttc;42;tcc;24;tac;47;tgc;56
atc;9;acc;74;aac;100;agc;98;;gama7;94.2857142857143;;;40;8;;;;atc;39;acc;26;aac;36;agc;34
ctc;100;ccc;100;cac;94;cgt;100;;sans;660;;;50;10;38;;;ctc;21;ccc;0;cac;37;cgt;48
gtc;100;gcc;99;gac;64;ggc;100;;avec;148;;;60;2;;;;gtc;42;gcc;28;gac;46;ggc;47
tta;99;tca;99;taa;;tga;100;;genom;7;;;70;1;;;;tta;40;tca;20;taa;100;tga;11
ata;100;aca;100;aaa;98;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;48;aaa;22;aga;5
cta;100;cca;93;caa;100;cga;100;;L’estimation par gama7;;;;90;1;;;;cta;63;cca;34;caa;42;cga;100
gta;97;gca;7;gaa;9;gga;100;;est  62% au dessus;;;;100;6;;;;gta;36;gca;100;gaa;88;gga;43
ttg;99;tcg;100;tag;100;tgg;55;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;2;tcg;31;tag;100;tgg;8
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;38;acg;20;aag;16;agg;9
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;92;;;;;;;;;;;ctg;16;ccg;8;cag;16;cgg;8
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;21
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;425;;656;;229;1310
&lt;/pre&gt;

==alpha==
===rtb===
====rtb opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_opérons|rtb opérons]]
&lt;pre&gt;
29.0%GC;31.12.19 Paris;16s  1 ;33 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Rickettsia typhi str. B9991CWPP ;;;;;;;;;;;;
comp;7429..8469;;cds;;381;381;;;347;;UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase;*
comp;8851..8926;;ttc;;368;368;;;;;;*
;9295..10278;;cds;;;;;;328;;tRNA dihydrouridine synthase DusB;*
;;;;;;;;;;;;*
;14663..18055;;cds;;108;108;;;1131;;autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein;*
;18164..18238;;gaa;;1394;*1394;;;;;;*
comp;19633..20106;;cds;;;;;;158;;crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;48065..48709;;cds;;278;278;;;215;;YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein;*
comp;48988..49064;;atgf;;110;110;;;;;;*
comp;49175..49411;;cds;;;;;;79;;50S ribosomal protein L31;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;73627..73929;;cds;;17;17;;;101;;preprotein translocase subunit SecG;*
comp;73947..74021;;acc;;139;139;;;;;;*
comp;74161..75417;;cds;;;;;;419;;MFS transporter;*
;;;;;;;;;;;;*
;155064..157163;;cds;;143;143;;;700;;elongation factor G;*
;157307..157382;;tgg;;167;167;;;;;;*
;157550..157750;;cds;;;;;;67;;preprotein translocase subunit SecE;*
;;;;;;;;;;;;*
;189197..189400;;cds;;889;*889;;;68;;DUF2674 domain-containing protein;*
comp;190290..190365;;acg;;142;142;;;;;;*
comp;190508..192814;;cds;;;;;;769;;outer membrane protein assembly factor BamA;*
;;;;;;;;;;;;*
;255010..255921;;cds;;732;*732;;;304;;methionyl-tRNA formyltransferase;*
;256654..259439;;23s;;206;;;;2786;;;*
;259646..259760;;5s;;173;173;;;115;;;*
comp;259934..261007;;cds;;;;;;358;;cell division protein ZapE;*
;;;;;;;;;;;;*
;291358..291843;;cds;;35;35;;;162;;30S ribosomal protein S9;*
;291879..291955;;atgj;;1364;*1364;;;;;;*
comp;293320..293805;;cds;;;;;;162;;RNA pyrophosphohydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;335194..336996;;cds;;402;402;;;601;;elongation factor 4;*
;337399..337473;;aac;;633;*633;;;;;;*
comp;338107..338793;;cds;;;;;;229;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;440466..440933;;cds;;496;496;;;156;;DUF2155 domain-containing protein;*
;441430..441504;;tgc;;31;31;;;;;;*
;441536..442456;;cds;;;;;;307;;site-specific tyrosine recombinase XerD;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;469056..469781;;cds;;218;218;;;242;;3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase;*
;470000..470075;;aaa;;15;;15;;;;;*
;470091..470167;;atc;;1922;*1922;;;;;;*
;472090..472662;;cds;;;;;;191;;GTP cyclohydrolase I FolE;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;564534..565562;;cds;;1530;*1530;;;343;;type 2 isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase;*
comp;567093..567180;;tcc;;218;218;;;;;;*
comp;567399..568145;;cds;;;;;;249;;NTP transferase domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;583250..584149;;cds;;1278;*1278;;;300;;hydroxymethylbilane synthase;*
comp;585428..585518;;tca;;58;58;;;;;;*
comp;585577..586569;;cds;;;;;;331;;tryptophan--tRNA ligase;*
;;;;;;;;;;;;*
;598723..599706;;cds;;26;26;;;328;;polyprenyl synthetase family protein;*
;599733..599809;;cgg;;60;;60;;;;;*
comp;599870..599944;;caa;;62;62;;;;;;*
comp;600007..601779;;cds;;;;;;591;;aminopeptidase P family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;644357..644745;;cds;;499;499;;;130;;p-ribosome-associated translation inhibitor RaiA;*
;645245..645321;;gac;@1;1051;;1051;;;;;*
comp;646373..646448;;gcc;;222;222;;;;;;*
comp;646671..647276;;cds;;;;;;202;;ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;649389..650048;;cds;;452;452;;;220;;(d)CMP kinase;*
;650501..650577;;gtc;;1274;*1274;;;;;;*
comp;651852..652094;;cds;;;;;;81;;HU family DNA-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;696163..697398;;cds;;1535;*1535;;;412;;tyrosine--tRNA ligase;*
;698934..699010;;cgt;;1028;*1028;;;;;;*
;700039..705720;;cds;;;;;;1894;;alpha-2-macroglobulin family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;727560..728087;;cds;;1164;*1164;;;176;;copper chaperone Pcu(A)C;*
comp;729252..729326;;gca;;32;32;;;;;;*
comp;729359..729574;;cds;;;;;;72;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;739215..740075;;cds;;181;181;;;287;;TIGR01459 family HAD-type hydrolase;*
;740257..740343;;ctc;;246;246;;;;;;*
;740590..741960;;cds;;1199;*1199;;;457;;magnesium transporter;*
;743160..743234;;ggc;;1090;*1090;;;;;;*
;744325..744753;;cds;;;;;;143;;preprotein translocase subunit YajC;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;775944..777866;;cds;;2465;*2465;;;641;;hp;*
comp;780332..781831;;16s;;1854;*1854;;;1500;;;*
comp;783686..785485;;cds;;;;;;600;;PAS domain-containing sensor histidine kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;814590..814823;;cds;;349;349;;;78;;hp;*
comp;815173..815248;;gta;;68;68;;;;;;*
comp;815317..815589;;cds;;;;;;91;;30S ribosomal protein S20;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;829300..830484;;cds;;82;82;;;395;;elongation factor Tu;*
comp;830567..830640;;gga;;95;;95;;;;;*
comp;830736..830821;;tac;;183;183;;;;;;*
;831005..831733;;cds;;;;;;243;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;;;;;;;;;;;;*
;839841..839969;;cds;;145;145;;;43;;dimethyladenosine transferase;*
;840115..840200;;tta;;2009;*2009;;;;;;*
;842210..842446;;cds;;;;;;79;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;876906..877589;;cds;;401;401;;;228;;7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC;*
;877991..878067;;cac;;145;145;;;;;;*
;878213..879943;;cds;;;;;;577;;ATP-binding cassette domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;918938..919882;;cds;;951;*951;;;315;;ACP S-malonyltransferase;*
;920834..920925;;agc;;1945;*1945;;;;;;*
comp;922871..924049;;cds;;;;;;393;;acetyl-CoA C-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;961209..962297;;cds;;41;41;;;363;;YjgP/YjgQ family permease;*
comp;962339..962415;;atgi;;390;390;;;;;;*
comp;962806..963273;;cds;;;;;;156;;peptidoglycan-associated lipoprotein Pal;*
;;;;;;;;;;;;*
;1023375..1023626;;cds;;1585;*1585;;;84;;BolA family transcriptional regulator;*
;1025212..1025288;;cca;;17;17;;;;;;*
;1025306..1025521;;cds;;;;;;72;;translation initiation factor IF-1;*
;;;;;;;;;;;;*
;1053321..1054139;;cds;;2191;*2191;;;273;;alpha/beta hydrolase;*
comp;1056331..1056407;;aga;;98;98;;;;;;*
;1056506..1056823;;cds;;;;;;106;;DUF167 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1098776..1099240;;cds;;40;40;;;155;;DNA polymerase III subunit chi;*
comp;1099281..1099365;;cta;;145;145;;;;;;*
comp;1099511..1100662;;cds;;;;;;384;;succinyl-diaminopimelate desuccinylase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1102351..1102980;;cds;;475;475;;;210;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
comp;1103456..1103530;;aca;;130;130;;;;;;*
comp;1103661..1103996;;cds;;;;;;112;;30S ribosomal protein S16;*
&lt;/pre&gt;

====rtb cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_cumuls|rtb cumuls]]
&lt;pre&gt;
rtb cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;2;1;;-;1;0;1;;100;11;30;0
;23s5s;1;20;1;;50;8;40;;200;13;60;1
;16s;1;40;;;100;5;80;;300;12;90;9
;16s23s;0;60;1;;150;9;120;;400;13;120;4
;max a;0;80;;;200;4;160;;500;3;150;2
;a doubles;0;100;1;;250;4;200;;600;3;180;7
;spéciaux;0;120;;;300;1;240;;700;3;210;3
;total aas;0;140;;;350;1;280;;800;1;240;4
sans ;opérons;29;160;;;400;3;320;;900;0;270;3
;1 aa;25;180;;;450;2;360;;1000;0;300;3
;max a;2;200;;;500;4;400;;1100;0;330;5
;a doubles;0;;1;;;21;;;;2;;20
;total aas;33;;4;0;;62;;0;;61;;61
total aas;;33;;;;21;1430;;;;;;
remarques;;1;;;;;491;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;612;;;;310;;
;;;variance;;;;665;;;;291;;
sans jaune;;;moyenne;57;;;193;;;;269;;176
;;;variance;40;;;148;;;;176;;86
&lt;/pre&gt;

====rtb blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_blocs|rtb blocs]]
====rtb distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_distribution|rtb distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;
cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;
gta;1;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
rtb;;25;;;;;25;;rtb;8;;;;;;8
&lt;/pre&gt;
====rtb données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_données_intercalaires|rtb données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;rtb;fx;fc;rtb;fx40;fc40;rtb;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;4;0;1;4;-1;0;10;381;368;tRNA tRNA;;
;0;10;2;64;1;0;10;-2;1;0;108;1394;15;;aaa
;2;20;3;37;2;0;7;-3;0;0;278;411;**;;atc
;1;30;1;17;3;0;8;-4;0;33;110;633;;60;cgg
;4;40;2;13;4;0;13;-5;0;0;17;496;**;;caa
;1;50;3;7;5;2;2;-6;0;0;139;218;;1051;gac
;1;60;4;9;6;0;5;-7;0;2;143;1278;**;;gcc
;2;70;6;16;7;0;3;-8;0;16;167;499;95;;gga
;0;80;12;9;8;0;7;-9;0;0;142;452;**;;tac
;1;90;6;7;9;0;7;-10;0;1;35;1274;;;
1;0;100;5;20;10;0;2;-11;0;2;1364;1535;;;
;2;110;6;17;11;1;5;-12;0;0;402;183;;;
;0;120;3;17;12;0;5;-13;0;3;31;401;;;
;1;130;3;18;13;0;3;-14;1;6;1922;1945;;;
;1;140;5;21;14;1;4;-15;0;0;1530;2191;;;
;4;150;3;14;15;0;5;-16;0;1;218;98;;;
;0;160;4;13;16;1;5;-17;0;7;58;;;;
;1;170;4;17;17;0;1;-18;0;0;26;;;;
;0;180;4;12;18;0;3;-19;0;0;62;;;;
1;1;190;4;11;19;0;3;-20;0;2;222;;;;
;0;200;2;9;20;0;3;-21;0;0;1028;;;;
;0;210;3;4;21;0;2;-22;0;1;1164;;;;
1;1;220;3;4;22;0;2;-23;0;3;32;;;;
;1;230;4;7;23;1;0;-24;0;0;181;;;;
;0;240;3;5;24;0;4;-25;0;1;246;;;;
;1;250;3;6;25;0;3;-26;0;5;1199;;;;
;0;260;4;5;26;0;2;-27;0;0;1090;;;;
;0;270;4;2;27;0;0;-28;0;0;349;;;;
;1;280;3;0;28;0;2;-29;0;0;68;;;;
;0;290;4;2;29;0;2;-30;0;0;82;;;;
;0;300;0;1;30;0;0;-31;0;0;382;;;;
;0;310;2;1;31;0;0;-32;0;1;2009;;;;
;0;320;0;3;32;1;2;-33;0;0;145;;;;
;0;330;0;2;33;0;3;-34;0;0;951;;;;
;0;340;1;1;34;0;0;-35;1;1;41;;;;
;1;350;1;2;35;0;1;-36;0;0;390;;;;
;0;360;0;2;36;0;1;-37;0;0;1585;;;;
1;0;370;0;2;37;0;2;-38;0;2;17;;;;
;0;380;0;0;38;0;0;-39;0;0;40;;;;
;3;390;0;1;39;0;2;-40;0;0;145;;;;
;0;400;2;3;40;1;2;-41;0;1;475;;;;
12;12;reste;66;100;reste;177;370;-42;0;0;130;;;;
16;42;total;186;505;total;186;505;-43;0;0;CDS 16s;;;;
4;30;diagr;118;402;diagr;8;131;-44;0;0;1854;;;;
0;3; t30;6;118;;;;-45;0;0;16s CDS;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;2466;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;CDS 23s;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;736;;;;
;x;185;4;1;190;;;-49;0;0;23s 5s;;;;
;c;501;98;4;603;;;-50;1;0;228;;;;
;;;;;793;75;;reste;0;0;5s CDS;;;;
;;;;;;868;;total;4;98;;173;;;
&lt;/pre&gt;
=====rtb autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_autres_intercalaires_aas|rtb autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;rtb;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;7429;8469;381;*;
;comp;tRNA;8851;8926;368;*;ttc
fin;;CDS;9295;10278;;;
deb;;CDS;14663;18055;108;*;
;;tRNA;18164;18238;1394;*;gaa
fin;comp;CDS;19633;20106;;;
deb;comp;CDS;48065;48709;278;*;
;comp;tRNA;48988;49064;110;*;atgf
fin;comp;CDS;49175;49411;;;
deb;comp;CDS;73627;73929;17;*;
;comp;tRNA;73947;74021;139;*;acc
fin;comp;CDS;74161;75417;;;
deb;;CDS;155064;157163;143;*;
;;tRNA;157307;157382;167;*;tgg
fin;;CDS;157550;157750;;;
deb;comp;CDS;189738;189878;411;*;
;comp;tRNA;190290;190365;142;*;acg
fin;comp;CDS;190508;192814;;;
deb;;CDS;255010;255921;736;*;
;;rRNA;256658;259417;228;*;23s
;;rRNA;259646;259760;173;*;5s
fin;comp;CDS;259934;261007;;;
deb;;CDS;291358;291843;35;*;
;;tRNA;291879;291955;1364;*;atgj
fin;comp;CDS;293320;293805;;;
deb;;CDS;335194;336996;402;*;
;;tRNA;337399;337473;633;*;aac
fin;comp;CDS;338107;338793;;;
deb;comp;CDS;440466;440933;496;*;
;;tRNA;441430;441504;31;*;tgc
fin;;CDS;441536;442456;;;
deb;comp;CDS;469056;469781;218;*;
;;tRNA;470000;470075;15;*;aaa
;;tRNA;470091;470167;1922;*;atc
fin;;CDS;472090;472662;;;
deb;comp;CDS;564534;565562;1530;*;
;comp;tRNA;567093;567180;218;*;tcc
fin;comp;CDS;567399;568145;;;
deb;;CDS;583250;584149;1278;*;
;comp;tRNA;585428;585518;58;*;tca
fin;comp;CDS;585577;586569;;0;
deb;;CDS;598723;599706;26;*;
;;tRNA;599733;599809;60;*;cgg
;comp;tRNA;599870;599944;62;*;caa
fin;comp;CDS;600007;601779;;;
deb;comp;CDS;608541;609209;176;*;
;comp;ncRNA;609386;609769;248;*;
fin;;CDS;610018;612660;;;
deb;comp;CDS;644395;644745;499;*;
;;tRNA;645245;645321;1051;*;gac
;comp;tRNA;646373;646448;222;*;gcc
fin;comp;CDS;646671;647276;;;
deb;comp;CDS;649389;650048;452;*;
;;tRNA;650501;650577;1274;*;gtc
fin;comp;CDS;651852;652094;;;
deb;comp;CDS;696163;697398;1535;*;
;;tRNA;698934;699010;1028;*;cgt
fin;;CDS;700039;705720;;0;
deb;comp;CDS;727560;728087;1164;*;
;comp;tRNA;729252;729326;32;*;cga
fin;comp;CDS;729359;729574;;;
deb;;CDS;739215;740075;181;*;
;;tRNA;740257;740343;246;*;ctc
deb;;CDS;740590;741960;1199;*;
;;tRNA;743160;743234;1090;*;ggc
fin;;CDS;744325;744753;;;
deb;comp;CDS;775944;777866;2466;*;
;comp;rRNA;780333;781831;1854;*;16s
fin;comp;CDS;783686;785485;;;
deb;comp;CDS;814590;814823;349;*;
;comp;tRNA;815173;815248;68;*;gta
fin;comp;CDS;815317;815589;;;
deb;comp;CDS;829300;830484;82;*;
;comp;tRNA;830567;830640;95;*;gga
;comp;tRNA;830736;830821;183;*;tac
fin;;CDS;831005;831733;;;
deb;comp;CDS;839520;839732;382;*;
;;tRNA;840115;840200;2009;*;tta
fin;;CDS;842210;842446;;;
deb;comp;CDS;876906;877589;401;*;
;;tRNA;877991;878067;145;*;cac
fin;;CDS;878213;879943;;;
deb;comp;CDS;911079;911558;179;*;
;comp;tmRNA;911738;912287;74;*;
fin;;CDS;912362;913186;;;
deb;;CDS;918938;919882;951;*;
;;tRNA;920834;920925;1945;*;agc
fin;comp;CDS;922871;924049;;;
deb;comp;CDS;941489;942730;156;*;
;comp;ncRNA;942887;943045;9;*;
fin;comp;CDS;943055;943372;;;
deb;comp;CDS;961209;962297;41;*;
;comp;tRNA;962339;962415;390;*;atgi
fin;comp;CDS;962806;963273;;;
deb;;CDS;1023375;1023626;1585;*;
;;tRNA;1025212;1025288;17;*;cca
fin;;CDS;1025306;1025521;;;
deb;;CDS;1053321;1054139;2191;*;
;comp;tRNA;1056331;1056407;98;*;aga
fin;;CDS;1056506;1056823;;;
deb;;CDS;1090984;1091625;14;*;
;;ncRNA;1091640;1091733;152;*;
fin;;CDS;1091886;1093411;;;
deb;comp;CDS;1098776;1099240;40;*;
;comp;tRNA;1099281;1099365;145;*;cta
fin;comp;CDS;1099511;1100662;;;
deb;comp;CDS;1102351;1102980;475;*;
;comp;tRNA;1103456;1103530;130;*;aca
fin;comp;CDS;1103661;1103996;;;
&lt;/pre&gt;

====rtb intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_entre_cds|rtb intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
rtb;28.1.21 Paris;NCBI;7.12.2020;;;;;;;;;
rtb;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;frequence5;intercal;frequencez
;'''négatif;102;12.9;'''négatif ;-11;10;-50 à -1;'''1 112 957;-1;102;610;1
;'''zéro;5;0.6;;;;;'''intercals;0;5;620;2
;'''1 à 200;430;54.2;'''0 à 200;85;61;;'''224 467;5;42;630;1
;'''201 à 370;84;10.6;'''201 à 370;261;43;;'''20.2%;10;24;640;3
;'''371 à 600;52;6.6;'''371 à 600;481;63;;;15;24;650;2
;'''601 à max;120;15.1;'''601 à 1028;1173;515;;;20;16;660;3
;'''total 793;&lt;201;67.7;'''total 793;282;445;-50 à 3216;;25;12;670;0
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul, %;intercal;fréquence;30;6;680;7
665700;3216;-1;102;-70;0;;0;5;35;7;690;0
1032528;3065;0;5;-60;0;;-1;°10;40;8;700;1
506416;2624;1;°10;-50;1;;-2;1;45;2;710;1
64385;2360;2;7;-40;1;;-3;0;50;8;720;2
801292;2313;3;8;-30;5;'''min à -1;-4;°33;55;5;730;2
272796;2262;4;°13;-20;12;102;-5;0;60;8;740;0
131965;2171;5;4;-10;21;12.9%;-6;0;65;10;750;1
763244;2078;6;5;0;67;;-7;2;70;12;760;1
101695;2071;7;3;10;66;;-8;°16;75;9;770;2
446016;1893;8;°7;20;40;;-9;0;80;12;780;2
905133;1870;9;°7;30;18;;-10;1;85;9;790;0
141270;1858;10;2;40;15;'''1 à 100;-11;°2;90;4;800;1
570117;1846;11;°6;50;10;243;-12;0;95;10;810;3
129767;1794;12;5;60;13;30.6%;-13;3;100;15;820;0
378376;1765;13;3;70;22;;-14;°7;105;11;830;4
232652;1743;14;5;80;21;;-15;0;110;12;840;0
871293;1715;15;5;90;13;;-16;1;115;10;850;1
998041;1656;16;°6;100;25;;-17;°7;120;10;860;1
359936;1637;17;1;110;23;;-18;0;125;13;870;0
1014216;1621;18;3;120;20;;-19;0;130;8;880;1
847537;1581;19;3;130;21;;-20;°2;135;16;890;1
338816;1539;20;3;140;26;;-21;0;140;10;900;1
808693;1532;21;2;150;17;;-22;1;145;10;910;2
950532;1524;22;2;160;17;'''1 à 200;-23;°3;150;7;920;1
969491;1524;23;1;170;21;430;-24;0;155;8;930;1
706435;1485;24;°4;180;16;54%;-25;1;160;9;940;1
536071;1468;25;3;190;15;;-26;°5;165;12;950;3
638208;1464;26;2;200;11;;-27;0;170;9;960;0
597131;1463;27;0;210;7;;;100;175;9;970;0
544938;1446;28;2;220;7;;reste;7;180;7;980;1
235220;1444;29;2;230;11;;total;107;185;8;990;0
90984;1401;30;0;240;8;;;;190;7;1000;1
693395;1374;31;0;250;9;;'''intercal;'''&lt;u&gt;fréquencef;195;6;1010;1
422301;1373;32;3;260;9;'''0 à 200;600;673;200;5;1020;1
678698;1370;33;3;270;6;435;650;9;205;3;1030;1
476675;1354;34;0;280;3;;700;11;210;4;1040;1
1079428;1335;35;1;290;6;;750;6;215;3;1050;2
270767;1318;36;1;300;1;;800;6;220;4;1060;2
687447;1302;37;2;310;3;;850;8;225;5;1070;1
49408;1282;38;0;320;3;;900;4;230;6;1080;1
247450;1266;39;2;330;2;;950;8;235;5;1090;0
398128;1260;40;3;340;2;;1000;2;240;3;1100;0
577310;1255;reste;547;350;3;;1050;6;245;6;1110;2
676898;1227;total;793;360;2;'''201 à 370;1100;4;250;3;1120;2
425653;1184;;;370;2;84;1150;7;255;5;1130;1
915284;1182;;;380;0;10.6%;1200;5;260;4;1140;0
;;;;390;1;;1250;1;265;4;1150;2
;;;;400;5;;1300;4;270;2;1160;0
;;;;410;4;;1350;3;275;1;1170;2
;;;;420;3;;1400;4;280;2;1180;1
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;430;2;;1450;3;285;3;1190;2
384083;-50;comp;;440;2;;1500;4;290;3;1200;0
523034;-41;shift2;646;450;3;;1550;4;295;1;reste;44
362986;-38;shift2;850;460;2;;1600;1;300;0;total;793
864784;-38;shift2;2407;470;1;;1650;2;305;3;;
628502;-35;shift2;571;480;2;;1700;1;310;0;;
1068153;-35;comp;;490;3;;1750;2;315;1;;
1110540;-32;shift2;997;500;3;;1800;2;320;2;;
511489;-26;shift2;;510;4;'''371 à 600;1850;1;325;2;;
661241;-26;shift2;;520;3;52;1900;3;330;0;;
710083;-26;shift2;;530;3;6.6%;1950;0;335;1;;
899806;-26;shift2;;540;0;;2000;0;340;1;;
1089393;-26;shift2;;550;0;;2050;0;345;2;;
417665;-25;shift2;;560;3;;2100;2;350;1;;
276966;-23;shift2;;570;3;;2150;0;355;1;;
480829;-23;shift2;;580;1;'''601 à max;2200;1;360;1;;
981350;-23;shift2;;590;1;120;;114;365;1;;
110015;-22;shift2;;600;3;15.1%;;;370;1;;
415433;-20;shift2;;reste;120;;reste;6;reste;172;;
748256;-20;shift2;;total;793;;total;793;total;793;;
&lt;/pre&gt;

====rtb  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_positifs_S+|rtb intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
rtb Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
bsu;min10;1028;2444;3472;659;8;282;274;152;257;470;;;
rtb;min30;118;402;520;536;-105;148;253;-277;-165;202;;;
afn;min10;328;1323;1651;603;-26;101;127;-468;-407;-9;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
140;333;0.42;1125;3091;2;8;31;186;302;936;-432;;;
51;294;0.17;189;604;5;7;21;162;8;131;-81;;;
46;402;0.11;350;1689;6;5;11;179;36;580;-369;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
rtb;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;45;-332;590;12;496;246;max80;&amp;-36;279;-782;91;569;258;min50
31 à 400;;;;;;;;&amp;70;-478;827;-4.5;788;228;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;2 parties;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;91;44;-;304;poly;191;tF;&amp;174;61;-;487;poly;82;Sm
31 à 400;;;;;;;;&amp;-36;44;-;598;poly;190;tF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;corrélation;;;;;;
41-n;0.536;-0.105;0.148;;;;;-0.081;;;;;;
1-n;0.202;-0.277;-0.165;;;;;;;;;14.8.21 Paris;;
rtb;fx;fc;;rtb;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;rtb;Sx-;Sc-
0;1;4;;0;8;10;0;1;4;&gt;0;184;-1;0;10
10;2;64;;10;17;159;1;0;10;&lt;0;4;-2;1;0
20;3;37;;20;25;92;2;0;7;zéro;1;-3;0;0
30;1;17;;30;8;42;3;0;8;total;189;-4;0;33
40;2;13;;40;17;32;4;0;13;;c;-5;0;0
50;3;7;;50;25;17;5;2;2;&gt;0;502;-6;0;0
60;4;9;;60;34;22;6;0;5;&lt;0;98;-7;0;2
70;6;16;;70;51;40;7;0;3;zéro;4;-8;0;16
80;12;9;;80;102;22;8;0;7;total;604;-9;0;0
90;6;7;;90;51;17;9;0;7;;;-10;0;1
100;5;20;;100;42;50;10;0;2;;;-11;0;2
110;6;17;;110;51;42;11;1;5;;;-12;0;0
120;3;17;;120;25;42;12;0;5;;;-13;0;3
130;3;18;;130;25;45;13;0;3;;;-14;1;6
140;5;21;;140;42;52;14;1;4;;;-15;0;0
150;3;14;;150;25;35;15;0;5;;;-16;0;1
160;4;13;;160;34;32;16;1;5;;;-17;0;7
170;4;17;;170;34;42;17;0;1;;;-18;0;0
180;4;12;;180;34;30;18;0;3;;;-19;0;0
190;4;11;;190;34;27;19;0;3;;;-20;0;2
200;2;9;;200;17;22;20;0;3;;;-21;0;0
210;3;4;;210;25;10;21;0;2;;;-22;0;1
220;3;4;;220;25;10;22;0;2;;;-23;0;3
230;3;8;;230;25;20;23;1;0;;;-24;0;0
240;3;5;;240;25;12;24;0;4;;;-25;0;1
250;3;6;;250;25;15;25;0;3;;;-26;0;5
260;4;5;;260;34;12;26;0;2;;;-27;0;0
270;4;2;;270;34;5;27;0;0;;;-28;0;0
280;3;0;;280;25;0;28;0;2;;;-29;0;0
290;4;2;;290;34;5;29;0;2;;;-30;0;0
300;0;1;;300;0;2;30;0;0;;;-31;0;0
310;2;1;;310;17;2;31;0;0;;;-32;0;1
320;0;3;;320;0;7;32;1;2;;;-33;0;0
330;0;2;;330;0;5;33;0;3;;;-34;0;0
340;1;1;;340;8;2;34;0;0;;;-35;1;1
350;1;2;;350;8;5;35;0;1;;;-36;0;0
360;0;2;;360;0;5;36;0;1;;;-37;0;0
370;0;2;;370;0;5;37;0;2;;;-38;0;2
380;0;0;;380;0;0;38;0;0;;;-39;0;0
390;0;1;;390;0;2;39;0;2;;;-40;0;0
400;2;3;;400;17;7;40;1;2;;;-41;0;1
reste;66;100;;;;;reste;176;371;;;-42;0;0
total;185;506;;t30;51;294;total;185;506;;;-43;0;0
diagr;118;402;;;;;diagr;8;131;;;-44;0;0
 - t30;112;284;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;1;0
;;;;;;;;;;;;reste;0;0
;;;;;;;;;;;;total;4;98
&lt;/pre&gt;

====rtb  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_négatifs_S-|rtb intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
rtb;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;1;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;0;3
continu;10;0;0;33;0;0;2;16;0;1;2;0;3;6;0;1;7;0;0;2;0;1;3;0;1;5;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;99
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;rtb;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4
;Sc-;10;0;0;33;0;0;2;16;0;1;2;0;3;6;0;1;7;0;0;2;0;1;3;0;1;5;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;98
&lt;/pre&gt;

====rtb autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_autres_intercalaires|rtb autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
rtb;les autres intercalaires;;adresses1;;;rtb;les autres intercalaires;;adresses2;;;rtb;les autres intercalaires;;adresses3;
deb;     °CDS;7429;381;comp;;deb;     °CDS;564534;1530;comp;;deb;     °CDS;829300;82;comp
;     &amp;tRNA;8851;368;comp;;;     &amp;tRNA;567093;218;comp;;;     &amp;tRNA;830567;95;comp
fin;     °CDS;9295;;;;fin;     °CDS;567399;;comp;;;     &amp;tRNA;830736;183;comp
deb;     °CDS;14663;108;;;deb;     °CDS;583250;1278;;;fin;     °CDS;831005;;
;     &amp;tRNA;18164;1394;;;;     &amp;tRNA;585428;58;comp;;deb;     °CDS;839520;382;
fin;     °CDS;19633;;comp;;fin;     °CDS;585577;;comp;;;     &amp;tRNA;840115;2009;
deb;     °CDS;48065;278;comp;;deb;     °CDS;598723;26;;;fin;     °CDS;842210;;
;     &amp;tRNA;48988;110;comp;;;     &amp;tRNA;599733;60;;;deb;     °CDS;876906;401;comp
fin;     °CDS;49175;;comp;;;     &amp;tRNA;599870;62;comp;;;     &amp;tRNA;877991;145;
deb;     °CDS;73627;17;comp;;fin;     °CDS;600007;;comp;;fin;     °CDS;878213;;
;     &amp;tRNA;73947;139;comp;;deb;     °CDS;608541;176;comp;;deb;     °CDS;911079;179;comp
fin;     °CDS;74161;;comp;;;     ncRNA;609386;248;comp;;;     tmRNA;911738;74;comp
deb;     °CDS;155064;143;;;fin;     °CDS;610018;;;;fin;     °CDS;912362;;
;     &amp;tRNA;157307;167;;;deb;     °CDS;644395;499;comp;;deb;     °CDS;918938;951;
fin;     °CDS;157550;;;;;     &amp;tRNA;645245;1051;;;;     &amp;tRNA;920834;1945;
deb;     °CDS;189738;411;;;;     &amp;tRNA;646373;222;comp;;fin;     °CDS;922871;;comp
;     &amp;tRNA;190290;142;comp;;fin;     °CDS;646671;;comp;;deb;     °CDS;941489;156;comp
fin;     °CDS;190508;;comp;;deb;     °CDS;649389;452;comp;;;     ncRNA;942887;9;comp
deb;     °CDS;255010;736;;;;     &amp;tRNA;650501;1274;;;fin;     °CDS;943055;;comp
23s;     $rRNA;256658;228;;;fin;     °CDS;651852;;comp;;deb;     °CDS;961209;41;comp
5s;     $rRNA;259646;173;;;deb;     °CDS;696163;1535;comp;;;     &amp;tRNA;962339;390;comp
fin;     °CDS;259934;;comp;;;     &amp;tRNA;698934;1028;;;fin;     °CDS;962806;;comp
deb;     °CDS;291358;35;;;fin;     °CDS;700039;;;;deb;     °CDS;1023375;1585;
;     &amp;tRNA;291879;1364;;;deb;     °CDS;727560;1164;comp;;;     &amp;tRNA;1025212;17;
fin;     °CDS;293320;;;;;     &amp;tRNA;729252;32;comp;;fin;     °CDS;1025306;;
deb;     °CDS;335194;402;;;fin;     °CDS;729359;;comp;;deb;     °CDS;1053321;2191;
;     &amp;tRNA;337399;633;;;deb;     °CDS;739215;181;;;;     &amp;tRNA;1056331;98;comp
fin;     °CDS;338107;;comp;;;     &amp;tRNA;740257;246;;;fin;     °CDS;1056506;;
deb;     °CDS;440466;496;comp;;deb;     °CDS;740590;1199;;;deb;     °CDS;1090984;14;
;     &amp;tRNA;441430;31;;;;     &amp;tRNA;743160;1090;;;;     ncRNA;1091640;152;
fin;     °CDS;441536;;;;fin;     °CDS;744325;;;;fin;     °CDS;1091886;;
deb;     °CDS;469056;218;comp;;deb;     °CDS;775944;2466;comp;;deb;     °CDS;1098776;40;comp
;     &amp;tRNA;470000;15;;;16s;     $rRNA;780333;1854;comp;;;     &amp;tRNA;1099281;145;comp
;     &amp;tRNA;470091;1922;;;fin;     °CDS;783686;;comp;;fin;     °CDS;1099511;;comp
fin;     °CDS;472090;;;;deb;     °CDS;814590;349;comp;;deb;     °CDS;1102351;475;comp
;;;;;;;     &amp;tRNA;815173;68;comp;;;     &amp;tRNA;1103456;130;comp
;;;;;;fin;     °CDS;815317;;comp;;fin;     °CDS;1103661;;comp
&lt;/pre&gt;
====rtb intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_tRNA|rtb intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
;entre aas;;cds aa deb;;cds aa fin ;;cds aa deb;cds aa fin ;;
;;;;;;;;;;
;15;;381;comp’;368;;17;31;'''deb;
comp’;60;;108;comp’;1394;;26;32;&lt;201;9
comp’;1051;;278;;110;;35;58;total;19
;95;;17;;139;;40;62;taux;47%
;;;143;;167;;82;68;;
;;comp’;411;;142;;108;110;'''fin;
;;;;;;;143;130;&lt;201;12
;;;35;;1364;;176;139;total;21
;;;402;comp’;633;;181;142;taux;57%
;;comp’;496;;31;;278;145;;
;;comp’;218;;1922;;349;145;'''total;
;;;1530;;218;;381;167;&lt;201;21
;;comp’;1278;;58;;382;218;total;40
;;;26;;62;;402;222;taux;53%
;;;176;;248;;475;246;;
;;comp’;499;;222;;951;248;;
;;comp’;452;comp’;1274;;1164;1028;;
;;comp’;1535;;1028;;1199;1090;;
;;;1164;;32;;1530;1364;;
;;;181;;246;;'''-;1922;;
;;;1199;;1090;;'''-;2009;'''comp’;'''cumuls
;;;349;;68;;218;98;'''deb;9
;;;82;comp’;183;;401;183;&lt;201;0
;;;382;;2009;;411;368;'''fin;7
;;comp’;401;;145;;452;633;&lt;201;2
;;;951;comp’;1945;;496;1274;;
;;comp’;2191;comp’;98;;499;1394;'''total;
;;;40;;145;;1278;1945;&lt;201;2
;;;475;;130;;1535;'''-;total;16
;;;;;;;2191;'''-;taux;13%
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;deb;fin;total;;;;;
;;&lt;201;9;14;23;;;;;
;;total;28;28;56;;;;;
;;taux;32%;50%;41%;;;;;
&lt;/pre&gt;

===rpl===
====rpl opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_opérons|rpl opérons]]
&lt;pre&gt;
29.0%GC;30.12.19 Paris;16s  1 ;33 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Rickettsia prowazekii str. Breinl ;;;;;;;;;;;;
comp;31462..31892;;cds;;263;263;;;144;;p-preprotein translocase subunit YajC;*
comp;32156..32181;;rpr;;870;870;;;26;;tandem;*
comp;33052..33126;;ggc;;1253;1253;;;;;;*
comp;34380..35750;;cds;;256;256;;;;;magnesium transporter;*
comp;36007..36093;;ctc;;190;190;;;;;;*
comp;36284..37144;;cds;;;;;;287;;TIGR01459 family HAD-type hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;46825..47040;;cds;;31;31;;;72;;hp;*
;47072..47146;;gca;;1964;1964;;;;;;*
;49111..49650;;cds;;;;;;180;;copper chaperone Pcu(A)C;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;71150..76816;;cds;;933;933;;;1889;;alpha-2-macroglobulin family protein;*
comp;77750..77826;;cgt;;1179;1179;;;;;;*
;79006..80241;;cds;;;;;;412;;tyrosine--tRNA ligase;*
;;;;;;;;;;;;*
;121704..121946;;cds;;984;984;;;81;;HU family DNA-binding protein;*
comp;122931..123007;;gtc;;446;446;;;;;;*
;123454..124113;;cds;;;;;;220;;(d)CMP kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
;126222..126827;;cds;;236;236;;;202;;ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP;*
;127064..127139;;gcc;@1;830;;830;;;;;*
comp;127970..128046;;gac;;365;365;;;;;;*
;128412..128843;;cds;;;;;;144;;ribosome-associated translation inhibitor RaiA;*
;;;;;;;;;;;;*
;171237..173012;;cds;;50;50;;;592;;aminopeptidase P family protein;*
;173063..173137;;caa;;49;;49;;;;;*
comp;173187..173263;;cgg;;18;18;;;;;;*
comp;173282..174265;;cds;;;;;;328;;polyprenyl synthetase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;186344..187336;;cds;;58;58;;;331;;tryptophan--tRNA ligase;*
;187395..187484;;tca;;354;354;;;;;;*
comp;187839..188738;;cds;;;;;;300;;hydroxymethylbilane synthase;*
;;;;;;;;;;;;*
;203097..203846;;cds;;219;219;;;250;;bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase;*
;204066..204153;;tcc;;1457;1457;;;;;;*
;205611..206639;;cds;;;;;;343;;type 2 isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;299321..300853;;cds;;419;419;;;511;;hp;*
comp;301273..301349;;atc;;15;;15;;;;;*
comp;301365..301440;;aaa;;219;219;;;;;;*
;301660..302400;;cds;;;;;;247;;3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;328700..329635;;cds;;22;22;;;312;;site-specific tyrosine recombinase XerD;*
comp;329658..329732;;tgc;;499;499;;;;;;*
;330232..330699;;cds;;;;;;156;;DUF2155 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;429121..429807;;cds;;723;723;;;229;;hp;*
comp;430531..430605;;aac;;359;359;;;;;;*
comp;430965..432767;;cds;;;;;;601;;elongation factor 4;*
;;;;;;;;;;;;*
;473867..474352;;cds;;928;928;;;162;;RNA pyrophosphohydrolase;*
comp;475281..475357;;atgj;;40;40;;;;;;*
comp;475398..475883;;cds;;;;;;162;;30S ribosomal protein S9;*
;;;;;;;;;;;;*
;506934..508007;;cds;;183;183;;;358;;cell division protein ZapE;*
comp;508191..508305;;5s;;240;;;;115;;;*
comp;508546..511330;;23s;;716;716;;;2785;;;*
comp;512047..512958;;cds;;;;;;304;;methionyl-tRNA formyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;577419..579725;;cds;;138;138;;;769;;outer membrane protein assembly factor BamA;*
;579864..579939;;acg;;1026;1026;;;;;;*
comp;580966..581169;;cds;;;;;;68;;DUF2674 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;612439..612639;;cds;;143;143;;;67;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;612783..612858;;tgg;;143;143;;;;;;*
comp;613002..615101;;cds;;;;;;700;;elongation factor G;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;656226..656870;;cds;;296;296;;;215;;YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein;*
comp;657167..657243;;atgf;;119;119;;;;;;*
comp;657363..657599;;cds;;;;;;79;;50S ribosomal protein L31;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;678911..679213;;cds;;19;19;;;101;;preprotein translocase subunit SecG;*
comp;679233..679307;;acc;;159;159;;;;;;*
comp;679467..680723;;cds;;;;;;419;;MFS transporter;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;746326..746529;;cds;;1664;1664;;;68;;hp;*
comp;748194..748268;;gaa;;109;109;;;;;;*
comp;748378..749421;;cds;;;;;;348;;autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;756703..757686;;cds;;363;363;;;328;;tRNA dihydrouridine synthase DusB;*
;758050..758125;;ttc;;564;564;;;;;;*
;758690..759730;;cds;;;;;;347;;UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;776202..776537;;cds;;154;154;;;112;;30S ribosomal protein S16;*
;776692..776766;;aca;;467;467;;;;;;*
;777234..777863;;cds;;;;;;210;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
;;;;;;;;;;;;*
;779197..780348;;cds;;140;140;;;384;;succinyl-diaminopimelate desuccinylase;*
;780489..780573;;cta;;37;37;;;;;;*
;780611..781075;;cds;;;;;;155;;DNA polymerase III subunit chi;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;823242..823559;;cds;;98;98;;;106;;DUF167 domain-containing protein;*
;823658..823734;;aga;;1364;1364;;;;;;*
comp;825099..825230;;cds;;;;;;44;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;854241..854456;;cds;;17;17;;;72;;translation initiation factor IF-1;*
comp;854474..854550;;cca;;1573;1573;;;;;;*
comp;856124..856357;;cds;;;;;;78;;BolA family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;915034..915501;;cds;;391;391;;;156;;peptidoglycan-associated lipoprotein Pal;*
;915893..915969;;atgi;;41;41;;;;;;*
;916011..917099;;cds;;;;;;363;;YjgP/YjgQ family permease;*
;;;;;;;;;;;;*
;953564..954742;;cds;;696;696;;;393;;acetyl-CoA C-acetyltransferase;*
comp;955439..955530;;agc;;898;898;;;;;;*
comp;956429..957373;;cds;;;;;;315;;ACP S-malonyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1009435..1011165;;cds;;142;142;;;577;;ATP-binding cassette domain-containing protein;*
comp;1011308..1011384;;cac;;346;346;;;;;;*
;1011731..1012414;;cds;;;;;;228;;7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1045414..1045656;;cds;;2381;2381;;;81;;hp;*
comp;1048038..1048123;;tta;;135;135;;;;;;*
comp;1048259..1048387;;cds;;;;;;43;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1056245..1056973;;cds;;188;188;;;243;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;1057162..1057247;;tac;;105;;105;;;;;*
;1057353..1057426;;gga;;82;82;;;;;;*
;1057509..1058693;;cds;;;;;;395;;elongation factor Tu;*
;;;;;;;;;;;;*
;1072391..1072663;;cds;;62;62;;;91;;30S ribosomal protein S20;*
;1072726..1072801;;gta;;1181;1181;;;;;;*
comp;1073983..1074648;;cds;;;;;;222;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1102136..1103935;;cds;;1458;1462;;;600;;PAS domain-containing sensor histidine kinase;*
;1105394..1106893;;16s;;1462;1462;;;1500;;;*
;1108356..1109301,1..184;;cds;;;;;;377;;P-hp;*
&lt;/pre&gt;

====rpl cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_cumuls|rpl cumuls]]
&lt;pre&gt;
rpl cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;2;1;;-;1;0;1;;100;12;30;0
;23s5s;1;20;1;;50;9;40;;200;11;60;2
;16s;1;40;;;100;4;80;;300;12;90;9
;16s23s;0;60;1;;150;8;120;;400;15;120;4
;max a;0;80;;;200;5;160;;500;2;150;2
;a doubles;0;100;;;250;3;200;;600;4;180;6
;spéciaux;0;120;1;;300;3;240;;700;2;210;2
;total aas;0;140;;;350;1;280;;800;1;240;5
sans ;opérons;29;160;;;400;5;320;;900;0;270;3
;1 aa;25;180;;;450;2;360;;1000;0;300;2
;max a;2;200;;;500;2;400;;1100;0;330;5
;a doubles;0;;1;;;21;;;;1;;20
;total aas;33;;4;0;;63;;0;;60;;60
total aas;;33;;;;21;1204;;;;;;
remarques;;1;;;;;453;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;528;;;;293;;
;;;variance;;;;558;;;;271;;
sans jaune;;;moyenne;56;;;191;;;;243;;172
;;;variance;45;;;140;;;;145;;89
&lt;/pre&gt;

====rpl blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_blocs|rpl blocs]]
====rpl distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_distribution|rpl distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;
cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;
gta;1;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
rpl;;25;;;;;25;;rpl;8;;;;;;8
&lt;/pre&gt;
====rpl données intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_données_intercalaires|rpl données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;rpl;fx;fc;rpl;fx40;fc40;rpl;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;0;5;0;0;5;-1;;10;1159;1179;tRNA tRNA;;
;0;10;2;64;1;0;8;-2;1;0;1253;984;;830;gcc
;3;20;4;35;2;0;10;-3;;0;256;446;**;;gac
;1;30;2;19;3;0;9;-4;;35;190;365;;49;caa
;3;40;4;11;4;0;11;-5;;0;31;354;**;;cgg
;2;50;1;8;5;2;4;-6;;0;1964;219;15;;atc
;1;60;4;10;6;0;4;-7;;2;933;499;**;;aaa
;1;70;5;14;7;0;3;-8;;17;236;723;105;;tac
;0;80;12;13;8;0;6;-9;;0;50;928;**;;gga
;1;90;7;18;9;0;6;-10;;1;18;1026;;;
1;0;100;4;16;10;0;3;-11;;2;58;1999;;;
;1;110;3;19;11;0;3;-12;;0;219;363;;;
;1;120;7;17;12;1;7;-13;;3;1457;98;;;
;0;130;4;21;13;0;3;-14;1;7;419;1971;;;
;2;140;3;17;14;1;2;-15;;0;22;696;;;
;3;150;3;14;15;1;3;-16;;1;359;346;;;
;2;160;3;22;16;1;4;-17;;6;40;373;;;
;0;170;4;16;17;0;2;-18;;0;138;188;;;
;0;180;6;8;18;0;4;-19;;0;143;1181;;;
1;1;190;4;10;19;0;4;-20;;1;143;;;;
;0;200;2;9;20;0;3;-21;;0;296;;;;
;0;210;3;4;21;0;5;-22;;1;119;;;;
1;1;220;6;5;22;0;1;-23;;5;19;;;;
;0;230;3;9;23;1;1;-24;;0;159;;;;
;1;240;0;5;24;0;6;-25;;1;109;;;;
;0;250;5;8;25;0;3;-26;;4;564;;;;
;1;260;4;5;26;0;1;-27;;0;154;;;;
;0;270;4;1;27;1;0;-28;;0;467;;;;
;0;280;0;4;28;0;1;-29;;0;140;;;;
;0;290;1;0;29;0;0;-30;;0;37;;;;
;1;300;1;0;30;0;1;-31;;0;17;;;;
;0;310;1;3;31;0;0;-32;;1;1573;;;;
;0;320;1;3;32;1;4;-33;;0;391;;;;
;0;330;0;1;33;1;3;-34;;0;41;;;;
;0;340;0;0;34;0;2;-35;1;1;898;;;;
1;0;350;3;4;35;1;0;-36;;0;142;;;;
1;1;360;0;1;36;0;0;-37;;0;2381;;;;
2;0;370;1;4;37;0;1;-38;;3;82;;;;
1;0;380;2;1;38;0;0;-39;;0;62;;;;
;0;390;4;1;39;1;1;-40;;0;CDS 16s;;;;
;1;400;1;0;40;0;0;-41;;1;1458;;;;
11;11;reste;59;102;reste;171;393;-42;;0;16s CDS;;;;
19;39;total;183;527;total;183;527;-43;;0;1463;;;;
8;28;diagr;124;420;diagr;12;129;-44;;1;CDS 23s;;;;
0;4; t30;8;118;;;;-45;;0;719;;;;
;;;;;;;;-46;;0;23s 5s;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;261;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;5s CDS;;;;
;x;183;5;0;188;;;-49;;0;-;183;;;
;c;522;103;5;630;;;-50;1;0;;;;;
;;;;;818;75;;reste;1;0;;;;;
;;;;;;893;;total;5;103;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====rpl autres intercalaires aas=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpl_autres_intercalaires_aas|rpl autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires ;;rpl;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;31462;31892;1159;*;
;comp;tRNA;33052;33126;1253;*;ggc
deb;comp;CDS;34380;35750;256;*;
;comp;tRNA;36007;36093;190;*;ctc
fin;comp;CDS;36284;37144;;0;
deb;;CDS;46825;47040;31;*;
;;tRNA;47072;47146;1964;*;gca
fin;;CDS;49111;49650;;;
deb;comp;CDS;71150;76816;933;*;
;comp;tRNA;77750;77826;1179;*;cgt
fin;;CDS;79006;80241;;;
deb;;CDS;121704;121946;984;*;
;comp;tRNA;122931;123007;446;*;gtc
fin;;CDS;123454;124113;;;
deb;;CDS;126222;126827;236;*;
;;tRNA;127064;127139;830;*;gcc
;comp;tRNA;127970;128046;365;*;gac
fin;;CDS;128412;128915;;;
deb;comp;CDS;160532;163174;244;*;
;;ncRNA;163419;163803;171;*;
fin;;CDS;163975;164643;;;
deb;;CDS;171237;173012;50;*;
;;tRNA;173063;173137;49;*;caa
;comp;tRNA;173187;173263;18;*;cgg
fin;comp;CDS;173282;174265;;;
deb;;CDS;186344;187336;58;*;
;;tRNA;187395;187484;354;*;tca
fin;comp;CDS;187839;188738;;;
deb;;CDS;203097;203846;219;*;
;;tRNA;204066;204153;1457;*;tcc
fin;;CDS;205611;206639;;0;
deb;comp;CDS;299321;300853;419;*;
;comp;tRNA;301273;301349;15;*;atc
;comp;tRNA;301365;301440;219;*;aaa
fin;;CDS;301660;302400;;;
deb;comp;CDS;328700;329635;22;*;
;comp;tRNA;329658;329732;499;*;tgc
fin;;CDS;330232;330699;;;
deb;;CDS;429121;429807;723;*;
;comp;tRNA;430531;430605;359;*;aac
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;comp;tRNA;475281;475357;40;*;atgj
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deb;;CDS;506934;508007;183;*;
;comp;rRNA;508191;508305;261;*;115
;comp;rRNA;508567;511327;719;*;2761
fin;comp;CDS;512047;512958;;;
deb;;CDS;577419;579725;138;*;
;;tRNA;579864;579939;1026;*;acg
fin;comp;CDS;580966;581169;;0;
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;comp;tRNA;612783;612858;143;*;tgg
fin;comp;CDS;613002;615101;;;
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;comp;tRNA;657167;657243;119;*;atgf
fin;comp;CDS;657363;657599;;;
deb;comp;CDS;678911;679213;19;*;
;comp;tRNA;679233;679307;159;*;acc
fin;comp;CDS;679467;680723;;;
deb;;CDS;745691;746194;1999;*;
;comp;tRNA;748194;748268;109;*;gaa
fin;comp;CDS;748378;749594;;;
deb;comp;CDS;756703;757686;363;*;
;;tRNA;758050;758125;564;*;ttc
fin;;CDS;758690;759730;;;
deb;;CDS;776202;776537;154;*;
;;tRNA;776692;776766;467;*;aca
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deb;;CDS;779197;780348;140;*;
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fin;;CDS;780611;781075;;0;
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;comp;ncRNA;788126;788219;14;*;
fin;comp;CDS;788234;788875;;0;
deb;comp;CDS;823242;823559;98;*;
;;tRNA;823658;823734;1971;*;aga
fin;comp;CDS;825706;826527;;;
deb;comp;CDS;854241;854456;17;*;
;comp;tRNA;854474;854550;1573;*;cca
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deb;;CDS;915034;915501;391;*;
;;tRNA;915893;915969;41;*;atgi
fin;;CDS;916011;917099;;;
deb;;CDS;934616;934933;9;*;
;;ncRNA;934943;935101;153;*;
fin;;CDS;935255;936496;;0;
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;comp;tRNA;955439;955530;898;*;agc
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deb;comp;CDS;963044;963856;74;*;
;;tmRNA;963931;964460;185;*;
fin;;CDS;964646;965125;;;
deb;comp;CDS;1009435;1011165;142;*;
;comp;tRNA;1011308;1011384;346;*;cac
fin;;CDS;1011731;1012414;;;
deb;comp;CDS;1045414;1045656;2381;*;
;comp;tRNA;1048038;1048123;373;*;tta
fin;;CDS;1048497;1048709;;;
deb;comp;CDS;1056245;1056973;188;*;
;;tRNA;1057162;1057247;105;*;tac
;;tRNA;1057353;1057426;82;*;gga
fin;;CDS;1057509;1058693;;;
deb;;CDS;1072391;1072663;62;*;
;;tRNA;1072726;1072801;1181;*;gta
fin;comp;CDS;1073983;1074648;;;
deb;;CDS;1102136;1103935;1458;*;
;;rRNA;1105394;1106892;1463;*;1499
fin;;CDS;1108356;17;;;
&lt;/pre&gt;

===rpm===
====rpm opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_opérons|rpm opérons]]
&lt;pre&gt;
;20   m23s;17  m16s;;;;;;;;;;
;;9 m16s seuls;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Rhod_phot_DSM_122/rhodPhot_DSM122-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_017059.1;rpm;;genome;24.12.19;;;;;;;;
64.7%GC;26.12.19 Paris;16s  7;95 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Rhodospirillum photometricum DSM 122;;;;;;;;;;;;
comp;3322..4194;;cds;;30;30;;;291;;LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein;*
comp;4225..4821;;23s°;@1;196;;;;595;;;*
comp;5018..5093;;gca;;182;;;;;;;*
comp;5276..5684;;16s°;;38;38;;;407;;;*
;5723..6664;;cds;;;;;;314;;SEL1-like repeat protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp &lt;;12458..13198;;cds;;242;242;;;247;;p-transposase;*
comp;13441..13555;;5s;@2;72;;;;113;;;*
comp;13628..13880;;23s°;;-7;*-7;;;251;;;*
comp;13874..15127;;cds;;;;;;418;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;21325..22362;;cds;;586;*586;;;346;;hp;*
;22949..23237;;16s°;;85;85;;;287;;;*
comp;23323..23490;;cds;;;;;;56;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;24015..24287;;cds;;250;250;;;91;;TraYdomain-containingprotein;*
comp;24538..24652;;5s;;71;;;;113;;;*
comp;24724..27490;;23s;;212;;;;2765;;;*
comp;27703..27779;;atc;;112;;;;;;;*
comp;27892..28378;;16s°;;18;18;;;485;;;*
&lt;&gt;;28397..29119;;cds;;;;;;241;;p-EscV/YscV/HrcVfamilytypeIIIsecretionsystemexportapparatusprotein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;32782..33759;;cds;;190;190;;;326;;glycosyltransferase;*
;33950..34357;;16s°;;112;;;;406;;;*
;34470..34546;;atc;;216;;;;;;;*
;34763..35591;;23s°;;44;;;;827;;;*
comp;35636..35750;;5s;;72;;;;113;;;*
comp;35823..38589;;23s;;215;;;;2765;;;*
comp;38805..38881;;atc;;112;;;;;;;*
comp;38994..40502;;16s;;260;;;;1507;;;*
comp;40763..42629;;23s°;;-15;;;;1865;;;*
;42615..42903;;16s°;;112;;;;287;;;*
;43016..43092;;atc;;213;;;;;;;*
;43306..44132;;23s°;;-1;;;;825;;;*
comp;44132..44835;;23s°;;-5;*-5;;;702;;;*
;44831..45121;;cds;;;;;;97;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;;45496..45768;;cds;;553;*553;;;91;;p-glycosyl transferase family 1;*
;46322..47040;;16s°;;0;*0;;;717;;;*
comp;47041..47433;;cds;;;;;;131;;winged helix-turn-helix domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;49761..51017;;cds;;128;128;;;419;;glycosyltransferase;*
comp;51146..51221;;23s°;;214;;;;74;;;*
comp;51436..51512;;atc;;112;;;;;;;*
comp;51625..52017;;16s°;;-7;;;;391;;;*
;52011..52881;;23s°;;106;106;;;869;;;*
;52988..53464;;cds;;-37;*-37;;;159;;hp;*
&gt;;53428..53694;;cds;;86;86;;;89;;p-glycosyltransferase;*
comp;53781..54709;;23s°;;26;;;;927;;;*
;54736..54898;;16s°;;112;;;;161;;;*
;55011..55087;;atc;;216;;;;;;;*
;55304..55741;;23s°;;438;*438;;;436;;;*
;56180..56440;;cds;;;;;;87;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;82891..83088;;cds;;116;116;;;66;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;83205..83280;;tgg;;199;199;;;;;;*
&gt;comp;83480..84178;;cds;;;;;;233;;p-elongation factor Tu;*
;;;;;;;;;;;;*
;417242..417412;;cds;;142;142;;;57;;tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase;*
;417555..417631;;atgj;+;24;;24;;;;;*
;417656..417732;;atgj;2 atgj;38;38;;;;;;*
comp;417771..418796;;cds;;;;;;342;;tRNA epoxyqueuosine(34) reductase QueG;*
;;;;;;;;;;;;*
;434306..435142;;cds;;512;*512;;;279;;CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase;*
;435655..435842;;16s°;;-6;;;;186;;;*
;435837..436075;;23s°;;72;;;;237;;;*
;436148..436262;;5s;;51;;;;113;;;*
;436314..436390;;atgf;;196;196;;;;;;*
;436587..436883;;cds;;;;;;99;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;467261..468370;;cds;;167;167;;;370;;3-isopropylmalate dehydrogenase;*
;468538..468667;;23s°;;72;;;;128;;;*
;468740..468854;;5s;;51;;;;113;;;*
;468906..468982;;atgf;;125;125;;;;;;*
;469108..469863;;cds;;;;;;252;;SAM-dependent chlorinase/fluorinase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;534521..536161;;cds;;367;367;;;547;;glucose-6-phosphate isomerase;*
;536529..536603;;acg;;92;92;;;;;;*
comp;536696..537778;;cds;;;;;;361;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;658467..658931;;cds;;110;110;;;155;;GNAT family N-acetyltransferase;*
comp;659042..659116;;gtc;;155;155;;;;;;*
;659272..660159;;cds;;106;106;;;296;;N-formylglutamate amidohydrolase;*
;660266..660340;;gtc;;648;*648;;;;;;*
comp;660989..661800;;cds;;;;;;271;;p-N-formylglutamate amidohydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;684188..685141;;cds;;323;323;;;318;;cation transporter;*
comp;685465..685539;;gtg;+;25;;25;;;;;*
comp;685565..685639;;gtg;2 gtg;195;195;;;;;;*
;685835..686251;;cds;;;;;;139;;NUDIX hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;691078..691773;;cds;;4;4;;;232;;ComF family protein;*
;691778..691897;;23s°;;72;;;;118;;;*
;691970..692084;;5s;;114;114;;;113;;;*
comp;692199..694505;;cds;;;;;;769;;VWA domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;750262..751398;;cds;;161;161;;;379;;[FeFe] hydrogenase H-cluster radical SAM maturase HydE;*
comp;751560..751674;;5s;;72;;;;113;;;*
comp;751747..752005;;23s°;;597;*597;;;257;;;*
;752603..752814;;rpr;@4;388;*388;;;21;;CRISPR;*
;753203..753760;;cds;;;;;;186;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;839981..840214;;cds;;4;4;;;78;;hp;*
comp;840219..840478;;16s°;;568;*568;;;258;;;*
comp;841047..844388;;cds;;;;;;1114;;response regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;874585..875391;;cds;;88;88;;;269;;phosphoadenylyl-sulfate reductase;*
;875480..875556;;cac;;81;81;;;;;;*
;875638..876117;;cds;;;;;;160;;CreA family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;885688..886299;;cds;;176;176;;;204;;LysE family translocator;*
;886476..886552;;ccc;;144;144;;;;;;*
comp;886697..887233;;cds;;;;;;179;;helix-turn-helix transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;932708..934243;;cds;;93;93;;;512;;Fic family protein;*
comp;934337..934413;;cgt;+;35;;35;;;;;*
comp;934449..934525;;cgt;3 cgt;44;;44;;;;;*
comp;934570..934646;;cgt;;449;*449;;;;;;*
;935096..936175;;cds;;;;;;360;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;978995..979396;;cds;;138;138;;;134;;MFS transporter;*
comp;979535..979609;;ggc;+;23;;23;;;;;*
comp;979633..979707;;ggc;4 ggc;45;;45;;;;;*
comp;979753..979827;;ggc;;29;;29;;;;;*
comp;979857..979931;;ggc;;206;206;;;;;;*
;980138..981679;;cds;;;;;;514;;murein biosynthesis integral membrane protein MurJ;*
;;;;;;;;;;;;*
;997575..997898;;cds;;95;95;;;108;;DUF1476 domain-containing protein;*
comp;997994..998067;;cag;+;54;;54;;;;;*
comp;998122..998195;;cag;2 cag;168;168;;;;;;*
;998364..999509;;cds;;;;;;382;;Ppx/GppA family phosphatase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1050081..1051028;;cds;;60;60;;;316;;NnrS family protein;*
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comp;1051180..1051254;;acc;3 acc;18;;18;;;;;*
comp;1051273..1051347;;acc;;170;170;;;;;;*
comp;1051518..1053305;;cds;;;;;;596;;EAL domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1197836..1199341;;cds;;197;197;;;502;;aldehyde dehydrogenase;*
;1199539..1199623;;cta;;126;126;;;;;;*
;1199750..1201090;;cds;;;;;;447;;trigger factor;*
;;;;;;;;;;;;*
;1206196..1206501;;cds;;93;93;;;102;;HU family DNA-binding protein;*
;1206595..1206670;;gta;;50;50;;;;;;*
;1206721..1207092;;cds;;;;;;124;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1213113..1214459;;cds;;210;210;;;449;;acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit;*
comp;1214670..1214874;;16s°;;600;*600;;;203;;;*
comp;1215475..1216716;;cds;;;;;;414;;polyphosphate kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1349719..1350132;;cds;;109;109;;;138;;NAD(P) transhydrogenase subunit alpha;*
comp;1350242..1350608;;23s°;;212;;;;365;;;*
comp;1350821..1350897;;atc;;115;;;;;;;*
comp;1351013..1351438;;16s°;;23;23;;;424;;;*
&lt; comp;1351462..1352160;;cds;;;;;;233;;p-tetratricopeptide repeat protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1359745..1360302;;cds;;176;176;;;186;;hp;*
;1360479..1360555;;gac;+;37;;37;;;;;*
;1360593..1360669;;gac;2 gac;274;274;;;;;;*
;1360944..1361204;;cds;;;;;;87;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1416615..1417769;;cds;;214;214;;;385;;glycosyltransferase family 61 protein;*
;1417984..1418074;;tcc;;154;154;;;;;;*
comp;1418229..1419095;;cds;;;;;;289;;LysR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1472421..1473403;;cds;;250;250;;;328;;biotin synthase BioB;*
comp;1473654..1473740;;ttg;;77;77;;;;;;*
comp;1473818..1474678;;cds;;;;;;287;;homocysteine S-methyltransferase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1735298..1736380;;cds;;209;209;;;361;;DUF262 domain-containing protein;*
;1736590..1736859;;23s°;;72;;;;268;;;*
;1736932..1737046;;5s;;52;;;;113;;;*
;1737099..1737175;;atgf;;93;93;;;;;;*
comp;1737269..1737694;;cds;;;;;;142;;type II toxin-antitoxin system VapC family toxin;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1812365..1813924;;cds;;894;*894;;;520;;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
;1814819..1815040;;16s°;;-7;*-7;;;222;;;*
&lt;comp;1815034..1815837;;cds;;80;80;;;268;;p-elongation factor Tu;*
comp;1815918..1815991;;gga;;34;;34;;;;;*
comp;1816026..1816111;;tac;;144;144;;;;;;*
;1816256..1817143;;cds;;;;;;296;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1833109..1833603;;cds;;83;83;;;165;;MBL fold metallo-hydrolase;*
comp;1833687..1833762;;aag;+;24;;24;;;;;*
comp;1833787..1833862;;aag;2 aag;198;198;;;;;;*
comp;1834061..1835224;;cds;;;;;;388;;rod shape-determining protein RodA;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;;1941413..1943059;;cds;;-30;*-30;;;549;;p-recombinase family protein;*
comp;1943030..1943121;;agc;;160;160;;;;;;*
comp;1943282..1944133;;cds;;;;;;284;;FAD-dependent thymidylate synthase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2087696..2090938;;cds;;705;*705;;;1081;;PAS domain-containing protein;*
;2091644..2091826;;16s°;;7;7;;;181;;;*
;2091834..2092247;;cds;;;;;;138;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2095044..2095490;;cds;;48;48;;;149;;hp;*
comp;2095539..2095733;;16s°;;614;*614;;;193;;;*
comp;2096348..2097337;;cds;;;;;;330;;trypsin-like serine protease;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2113248..2114603;;cds;;219;219;;;452;;hp;*
comp;2114823..2114899;;aga;;55;55;;;;;;*
comp;2114955..2115251;;cds;;71;71;;;99;;ETC complex I subunit;*
comp;2115323..2115399;;cca;;261;261;;;;;;*
comp;2115661..2115960;;cds;;;;;;100;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2144042..2146288;;cds;;308;308;;;749;;HAMP domain-containing protein;*
;2146597..2147256;;23s°;;72;;;;658;;;*
;2147329..2147443;;5s;;52;;;;113;;;*
;2147496..2147572;;atgf;;645;*645;;;;;;*
comp;2148218..2148664;;cds;;;;;;149;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2268003..2268461;;cds;;87;87;;;153;;23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH;*
comp;2268549..2268625;;ccg;+;165;;*165;;;;;*
comp;2268791..2268867;;ccg;2 ccg;56;56;;;;;;*
comp;2268924..2269910;;cds;;;;;;329;;farnesyltranstransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2321621..2322145;;cds;;332;332;;;175;;hp;*
;2322478..2322554;;ccc;;225;225;;;;;;*
;2322780..2322974;;cds;;;;;;65;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2393295..2396009;;cds;@3;1003;*1003;;;905;;CRISPR-associated helicase/endonuclease Cas3;*
;2397013..2397919;;16s°;;2;2;;;905;;;*
;2397922..2400888;;cds;;;;;;989;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2517845..2520559;;cds;;229;229;;;905;;phosphoenolpyruvate carboxylase;*
comp;2520789..2520903;;5s;;72;;;;113;;;*
comp;2520976..2521339;;23s°;;189;189;;;362;;;*
comp;2521529..2522152;;cds;;;;;;208;;3-isopropylmalate dehydratase small subunit;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2596508..2596738;;cds;;989;989;;;77;;motility twitching protein PilT;*
comp;2597728..2597815;;tca;;194;194;;;;;;*
;2598010..2599204;;cds;;;;;;398;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2621435..2622058;;cds;;106;106;;;208;;helix-turn-helix transcriptional regulator;*
comp;2622165..2622251;;ctc;;202;202;;;;;;*
;2622454..2623107;;cds;;;;;;218;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
;;;;;;;;;;;;*
;2631201..2631554;;cds;;192;192;;;118;;hp;*
;2631747..2631822;;gcc;+;70;;70;;;;;*
;2631893..2631968;;gcc;4 gcc;69;;69;;;;;*
;2632038..2632113;;gcc;;57;;57;;;;;*
;2632171..2632246;;gcc;;166;166;;;;;;*
&lt;;2632413..2632965;;cds;;-41;*-41;;;184;;p-IS256 family transposase;*
;2632925..2633473;;cds;;30;30;;;183;;hp;*
comp;2633504..2633579;;aca;;93;93;;;;;;*
comp;2633673..2634200;;cds;;271;271;;;176;;N-acetyltransferase;*
comp;2634472..2634561;;tcg;;155;155;;;;;;*
;2634717..2635742;;cds;;;;;;342;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2655872..2656489;;cds;;182;182;;;206;;YitT family protein;*
comp;2656672..2656747;;gag;;141;141;;;;;;*
comp;2656889..2657674;;cds;;;;;;262;;MetQ/NlpA family ABC transporter substrate-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2758160..2758312;;cds;;110;110;;;51;;light-harvesting protein;*
comp;2758423..2758509;;tta;;94;94;;;;;;*
comp;2758604..2759899;;cds;;;;;;432;;bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;;2768823..2769518;;cds;;-12;*-12;;;232;;methyltransferase;*
;2769507..2769776;;23s°;;71;;;;268;;;*
;2769848..2769962;;5s;;118;118;;;113;;;*
comp;2770081..2771016;;cds;;;;;;312;;tetratricopeptide repeat protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2792922..2794778;;cds;;129;129;;;619;;glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB;*
;2794908..2794982;;caa;;92;92;;;;;;*
comp;2795075..2795686;;cds;;;;;;204;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2862755..2862982;;cds;;123;123;;;76;;hp;*
;2863106..2863182;;cca;;117;;*117;;;;;*
;2863300..2863374;;atgi;;373;;*373;;;;;*
;2863748..2863823;;gca;;157;;*157;;;;;*
;2863981..2864056;;aca;;15;;;;;;;*
;2864072..2864317;;cds;;8;;;;82;;DUF2829 domain-containing protein;*
;2864326..2864401;;aaa;;250;250;;;;;;*
&gt;;2864652..2865041;;cds;;;;;;130;;p-hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2867066..2868112;;cds;;76;76;;;349;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;2868189..2868264;;aaa;;99;99;;;;;;*
comp;2868364..2868870;;cds;;;;;;169;;peptidylprolyl isomerase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2893891..2894430;;cds;;25;25;;;180;;phage portal protein;*
;2894456..2894570;;5s;;51;;;;113;;;*
;2894622..2894698;;atgf;;285;285;;;;;;*
;2894984..2895400;;cds;;;;;;139;;p-hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3034652..3035092;;cds;;250;250;;;147;;hp;*
comp;3035343..3035418;;aaa;;8;8;;;;;;*
comp;3035427..3035986;;cds;;;;;;187;;DUF2829 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3305068..3306534;;cds;;379;*379;;;489;;S8 family serine peptidase;*
comp;3306914..3306989;;ttc;+;29;;29;;;;;*
comp;3307019..3307094;;ttc;4 ttc;34;;34;;;;;*
comp;3307129..3307204;;ttc;;33;;33;;;;;*
comp;3307238..3307313;;ttc;;60;60;;;;;;*
comp;3307374..3308864;;cds;;;;;;497;;RimK family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3332977..3334356;;cds;;54;54;;;460;;type II secretion system protein;*
;3334411..3334487;;cgg;;176;176;;;;;;*
&lt; comp;3334664..3335983;;cds;;;;;;440;;p-hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3408217..3409026;;cds;;91;91;;;270;;hp;*
comp;3409118..3409232;;5s;;71;;;;113;;;*
comp;3409304..3409410;;23s°;;1;*1;;;105;;;*
&lt;;3409412..3409711;;cds;;;;;;100;;p-IS5/IS1182 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3456276..3461666;;cds;;387;*387;;;1797;;alpha-2-macroglobulin family protein;*
;3462054..3462130;;agg;;29;29;;;;;;*
;3462160..3462951;;cds;;;;;;264;;amino acid ABC transporter substrate-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3500025..3500675;;cds;;210;210;;;217;;protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;*
;3500886..3500959;;tgc;+;27;;27;;;;;*
;3500987..3501061;;aac;2 aac;31;;31;;;;;*
;3501093..3501167;;aac;;84;84;;;;;;*
comp;3501252..3501659;;cds;;;;;;136;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3639978..3641276;;cds;;172;172;;;433;;outer membrane efflux protein;*
;3641449..3641525;;gcg;+;70;;70;;;;;*
;3641596..3641671;;gcg;3 gcg;33;;33;;;;;*
;3641705..3641780;;gcg;;389;*389;;;;;;*
;3642170..3644392;;cds;;;;;;741;;sigma-54-dependent Fis family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;3651524..3652711;;cds;;55;55;;;396;;aminotransferase;*
;3652767..3652843;;cac;;202;202;;;;;;*
&lt;comp;3653046..3653543;;cds;;;;;;166;;arsenical-resistance protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;3710072..3710840;;cds;;126;126;;;256;;TonB family protein;*
comp;3710967..3711042;;gaa;+;214;;*214;;;;;*
comp;3711257..3711332;;gaa;2 gaa;125;125;;;;;;*
comp;3711458..3711664;;cds;;;;;;69;;cold-shock protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3727874..3729085;;cds;;828;*828;;;404;;hp;*
;3729914..3730068;;16s°;;87;87;;;153;;;*
;3730156..3730545;;cds;;;;;;130;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3804728..3805231;;cds;;118;118;;;168;;response regulator;*
comp;3805350..3805425;;gag;;241;241;;;;;;*
comp;3805667..3806140;;cds;;;;;;158;;transcription elongation factor GreA;*
;;;;;;;;;;;;*
;3813820..3815895;;cds;;138;138;;;692;;RNA polymerase sigma factor RpoD;*
;3816034..3816109;;atgi;;94;94;;;;;;*
;3816204..3818993;;cds;;;;;;930;;diguanylate cyclase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3827982..3828878;;cds;;90;90;;;299;;phosphoserine phosphatase SerB;*
comp;3828969..3829042;;ggg;@5;292;292;;;;;;*
;3829335..3830670;;cds;;;;;;445;;chemotaxis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3832305..3833264;;cds;;311;311;;;320;;complex I NDUFA9 subunit family protein;*
;3833576..3833662;;ctg;+;47;;47;;;;;*
;3833710..3833796;;ctg;5 ctg;153;;*153;;;;;*
;3833950..3834036;;ctg;;48;;48;;;;;*
;3834085..3834171;;ctg;;47;;47;;;;;*
;3834219..3834305;;ctg;;113;113;;;;;;*
;3834419..3835039;;cds;;;;;;207;;ribonuclease D;*
&lt;/pre&gt;

====rpm cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_cumuls|rpm cumuls]]
&lt;pre&gt;
rpm cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cds 300
avec rRNA;opérons;27;1;0;;1;9;1;;100;20;1;0
;16s°atc23s°;7;20;2;;50;15;40;;200;35;30;0
;16s°gca23s°;1;40;14;;100;30;80;;300;30;60;3
;16s°23s°;1;60;7;;150;24;120;;400;23;90;10
;max a;1;80;3;;200;23;160;;500;14;120;10
;a doubles;0;100;0;;250;16;200;;600;7;150;14
;spéciaux;18;120;1;;300;5;240;;700;2;180;13
;total aas;13;140;0;;350;4;280;;800;3;210;11
sans ;opérons;47;160;2;;400;5;320;;900;0;240;6
;1 aa;30;180;1;;450;2;360;;1000;4;270;9
;max a;5;200;0;;500;0;400;;1100;1;300;9
;a doubles;15;;2;;;14;;;;2;;56
;total aas;79;;32;0;;147;;0;;141;;141
total aas;;92;;;;;;;;;;;
remarques;;5;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;69;;;194;;;;310;;
;;;variance;75;;;197;;;;248;;
sans jaune;;;moyenne;39;;;147;;;;252;;170
;;;variance;16;;;112;;;;134;;71
&lt;/pre&gt;

====rpm blocs====
====rpm blocs protéines====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_blocs_protéines|rpm blocs protéines]]
&lt;pre&gt;
23s;23s rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB
3-isop;3-isopropylmalate dehydrogenase
3-isop-sub;3-isopropylmalate dehydratase small subunit
acetyl;acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit
cas3;CRISPR-associated helicase/endonuclease Cas3
CDP;CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase
ComF;ComF family protein
CRISPR;CRISPR
DUF262;DUF262 domain-containing protein
FeFe;[FeFe] hydrogenase H-cluster radical SAM maturase HydE
glyco;glycosyltransferase
HAMP;HAMP domain-containing protein
LysM ;LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
methyl;methyltransferase
NAD;NAD(P) transhydrogenase subunit alpha
p-elon;p-elongation factor Tu
p-EscV;p-EscV/YscV/HrcVfamilytypeIIIsecretionsystemexportapparatusprotein
p-glyco;p-glycosyltransferase
P-glyco1;p-glycosyl transferase family 1
p-IS5;p-IS5/IS1182 family transposase
p-tetra;p-tetratricopeptide repeat protein
p-trans;p-transposase
PAS;PAS domain-containing protein
peptido;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein
phage;phage portal protein
phospho;phosphoenolpyruvate carboxylase
polypho;polyphosphate kinase
respons;response regulator
SAM;SAM-dependent chlorinase/fluorinase
SEL1;SEL1-like repeat protein
tetra;tetratricopeptide repeat protein
TraY;TraY domain-containing protein
trypsin;trypsin-like serine protease
type II;type II toxin-antitoxin system VapC family toxin
VWA;VWA domain-containing protein
winged ;winged helix-turn-helix domain-containing protein
&lt;/pre&gt;
====rpm blocs construits====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_blocs_construits|rpm blocs construits]]
*Notes: J'ai gardé les symboles de coloration. Il suffit de les rechercher et les remplacer et sans désélectionner colorer comme suite:
*: - '''*''' jaune, ffff00
*: - '''$''' orange, ff6600
*: - '''?''' cyan, 66ffff
*: - '''§''' vert, 99ff33
*: - '''&amp;''' bleu, 00ccff
*: - '''(''' gris, dddddd
*: - enlever le '''gras''', et &lt;u&gt;surligne&lt;/u&gt;.
&lt;pre&gt;
rpm blocs;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;9 blocs 16s° solitaires, 6 blocs atc gca;;;;;;;;;;9 blocs 23s°5s, 3 blocs complets;;;;;;
sens;adresse;;bloc;interca;cdsa;protéine;rRNA°;ordre fait;;sens;adresse;;bloc;interca;cdsa;protéine;rRNA°;ordre fait
;21325..22362;;cds;586;346;hp;1493;;;comp;13874..15127;;cds;-7;418;hp;1505;
;22949..23237;;*16s°;85;§287;;;;;comp;13628..13880;;*23s°;?72;§251;;;
comp;23323..23490;;cds;;56;hp;;b3;;comp;13441..13555;;$5s;242;§113;;;
;;;;;;;;;;comp &lt;;12458..13198;;cds;;247;p-trans;;b5
&lt;;45496..45768;;cds;553;91;p-glyco1;1383;;;;;;;;;;;
;46322..47040;;*16s°;0;§717;;;;;comp;691078..691773;;cds;4;232;ComF;814;
comp;47041..47433;;cds;;131;winged ;;b4;;;691778..691897;;*23s°;?72;§118;;;
;;;;;;;;;;;691970..692084;;$5s;114;§113;;;
comp;839981..840214;;cds;4;78;hp;492;;;comp;692199..694505;;cds;;769;VWA;;b9
comp;840219..840478;;*16s°;568;§258;;;;;;;;;;;;;
comp;841047..844388;;cds;;1114;&amp;respons;;b7;;;753203..753760;;cds;388;186;hp;1028;
;;;;;;;;;;;752603..752814;;rpr;597;71;CRISPR;;
;1213113..1214459;;cds;210;449;&amp;acetyl;'''1445;;;comp;751747..752005;;*23s°;?72;§257;;;
comp;1214670..1214874;;*16s°;600;§203;;;;;comp;751560..751674;;$5s;161;§113;;;
comp;1215475..1216716;;cds;;414;&amp;polypho;;;;;750262..751398;;cds;;379;&amp;FeFe;;b8
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
comp;1812365..1813924;;cds;894;520;&amp;peptido;1026;;;comp;2521529..2522152;;cds;189;208;&amp;3-isop-sub;986;
;1814819..1815040;;*16s°;-7;§222;;;;;comp;2520976..2521339;;*23s°;?72;§362;;;
&lt;comp;1815034..1815837;;cds;;268;p-elon;;b5;;comp;2520789..2520903;;$5s;229;§113;;;
;;;;;;;;;;comp;2517845..2520559;;cds;;905;&amp;phospho;;b7
comp;2087696..2090938;;cds;705;1081;PAS;595;;;;;;;;;;;
;2091644..2091826;;*16s°;7;§181;;;;;&gt;;2768823..2769518;;cds;-12;232;&amp;methyl;964;
;2091834..2092247;;cds;;138;hp;;b9;;;2769507..2769776;;*23s°;?71;§268;;;
;;;;;;;;;;;2769848..2769962;;$5s;118;§113;;;
comp;2095044..2095490;;cds;48;149;hp;640;;;comp;2770081..2771016;;cds;;312;tetra;;b6
comp;2095539..2095733;;*16s°;614;§193;;;;;;;;;;;;;
comp;2096348..2097337;;cds;;330;&amp;trypsin;;b8;;&lt;;3409412..3409711;;cds;1;100;p-IS5;405;
;;;;;;;;;;comp;3409304..3409410;;*23s°;?71;§105;;;
comp;2393295..2396009;;cds;1003;905;&amp;cas3;;;;comp;3409118..3409232;;$5s;91;§113;;;
;2397013..2397919;;*16s°;2;§905;;905;;;;3408217..3409026;;cds;;270;hp;;b4
;2397922..2400888;;cds;;989;hp;;b10;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;comp;467261..468370;;cds;167;370;&amp;3-isop;'''1238;
comp;3727874..3729085;;cds;828;404;hp;1755;;;;468538..468667;;*23s°;?72;§128;;;
;3729914..3730068;;*16s°;87;§153;;;;;;468740..468854;;$5s;?51;§113;;;
;3730156..3730545;;cds;;130;hp;;b2;;;468906..468982;;atgf;125;;;;
;;;;;;;;;;;469108..469863;;cds;;252;&amp;SAM;;
;434306..435142;;cds;512;279;&amp;CDP;;;;;;;;;;;;
;435655..435842;;*16s°;-6;§186;;'''1023;;;comp;1735298..1736380;;cds;209;361;DUF262;1351;
;;;;;;;;;;;1736590..1736859;;*23s°;?72;§268;;;
comp;3322..4194;;cds;30;291;LysM ;;;;;1736932..1737046;;$5s;?52;§113;;;
comp;4225..4821;;*23s°;?196;§595;;1468;;;;1737099..1737175;;atgf;93;;;;
comp;5018..5093;;gca;?182;;;;;;comp;1737269..1737694;;cds;;142;type II;;b10
comp;5276..5684;;*16s°;38;§407;;;;;;;;;;;;;
;5723..6664;;cds;;314;SEL1;;b6;;comp;2144042..2146288;;cds;308;749;HAMP;2905;
;;;;;;;;;;;2146597..2147256;;*23s°;?72;§658;;;
comp;32782..33759;;cds;190;326;&amp;glyco;;;;;2147329..2147443;;$5s;?52;§113;;;
;33950..34357;;*16s°;?112;§406;;;;;;2147496..2147572;;atgf;645;;;;
;34470..34546;;atc;?216;;;;;;comp;2148218..2148664;;cds;;149;hp;;b2
;34763..35591;;*23s°;44;§827;;827;b7;;;;;;;;;;
comp;35636..35750;;$5s;72;§113;;;;;comp;24015..24287;;cds;250;91;TraY;;
comp;35823..38589;;$23s;?215;§2765;;;;;comp;24538..24652;;$5s;?71;§113;;;
comp;38805..38881;;atc;?112;;;;;;comp;24724..27490;;$23s;?212;§2765;;;
comp;38994..40502;;$16s;260;§1507;;;b0;;comp;27703..27779;;atc;?112;;;;
comp;40763..42629;;*23s°;-15;§1865;;1865;b4;;comp;27892..28378;;*16s°;18;§485;;;
;42615..42903;;*16s°;?112;§287;;;;;&lt;&gt;;28397..29119;;cds;;241;p-EscV;;b1
;43016..43092;;atc;?213;;;;;;;;;;;;;;
;43306..44132;;*23s°;-1;§825;;825;b8;;comp;35636..35750;;$5s;?72;§113;;;
comp;44132..44835;;*23s°;-5;§702;;993;;;comp;35823..38589;;$23s;?215;§2765;;;
;44831..45121;;cds;;97;hp;;b5;;comp;38805..38881;;atc;?112;;;;
;;;;;;;;;;comp;38994..40502;;$16s;260;§1507;;;b0
comp;49761..51017;;cds;128;419;&amp;glyco;1331;;;;;;;;;;;
comp;51146..51221;;*23s°;?214;§74;;;;;;434306..435142;;cds;512;279;&amp;CDP;;
comp;51436..51512;;atc;?112;;;;;;;435655..435842;;*16s°;-6;§186;;'''1023;
comp;51625..52017;;*16s°;-7;§391;;;b9;;;435837..436075;;*23s°;?72;§237;;;
;52011..52881;;*23s°;106;§869;;1346;;;;436148..436262;;$5s;?51;§113;;237;
;52988..53464;;cds;-37;159;hp;;;;;436314..436390;;atgf;196;;;;
&gt;;53428..53694;;cds;86;89;p-glyco;;;;;436587..436883;;cds;;99;hp;;b3
comp;53781..54709;;*23s°;26;§927;;1194;b3;;;;;;;;;;
;54736..54898;;*16s°;?112;§161;;;;;;2893891..2894430;;cds;25;180;&amp;phage;;
;55011..55087;;atc;?216;;;697;;;;2894456..2894570;;$5s;?51;§113;;'''540;
;55304..55741;;*23s°;438;§436;;;;;;2894622..2894698;;atgf;285;;;;
;56180..56440;;cds;;87;hp;;b10;;;2894984..2895400;;cds;;139;p-hp;;
;;;Fait: 4 blocs sans aas;;;;;;;;;;;Fait: 5 blocs atc, gca;;;;
sens;adresse;;bloc;interca;cdsa;protéine;rRNA°;ordre fait;;sens;adresse;;bloc;interca;cdsa;protéine;rRNA°;ordre fait
comp;35636..35750;;$5s;?72;§113;;;b0;;;5723..6664;;cds;;314;SEL1;'''1349;b6
comp;35823..38589;;$23s;?215;§2765;;'''2765;;;comp;5276..5684;;*16s°;38;§407;;;
comp;38805..38881;;atc;?112;;;;;;comp;5018..5093;;gca;?182;;;;
comp;38994..40502;;$16s;260;§1507;;'''1507;;;comp;4225..4821;;*23s°;?196;§595;;;
;;;;;;;;;;comp;3322..4194;;cds;30;291;LysM ;1468;
comp;24015..24287;;cds;250;91;TraY;;b1;;&gt;;2768823..2769518;;cds;-12;(232;&amp;methyl;964;
comp;24538..24652;;$5s;?71;§113;;;;;;2769507..2769776;;*23s°;?71;§268;;;
comp;24724..27490;;$23s;?212;§2765;;'''2765;;;;2769848..2769962;;$5s;118;§113;;;
comp;27703..27779;;atc;?112;;;;;;comp;2770081..2771016;;cds;;312;tetra;'''2432;
comp;27892..28378;;*16s°;18;§485;;'''1208;;;;;;;;;;;
&lt;&gt;;28397..29119;;cds;;241;p-EscV;;;;comp;841047..844388;;cds;;1114;&amp;respons;'''898;b7
;;;;;;;;;;comp;840219..840478;;*16s°;568;§258;;492;
comp;3727874..3729085;;cds;828;404;hp;'''1755;b2;;comp;839981..840214;;cds;4;78;hp;;
;3729914..3730068;;*16s°;87;§153;;&lt;u&gt;1365;;;comp;32782..33759;;cds;190;326;&amp;glyco;;
;3730156..3730545;;cds;;130;hp;;;;;33950..34357;;*16s°;?112;§406;;406;
comp;2144042..2146288;;cds;308;749;HAMP;;;;;34470..34546;;atc;?216;;;;
;2146597..2147256;;*23s°;?72;§658;;;;;;34763..35591;;*23s°;44;§827;;827;
;2147329..2147443;;$5s;?52;§113;;;;;comp;2521529..2522152;;cds;189;(208;&amp;3-isop-sub;986;
;2147496..2147572;;atgf;645;;;;;;comp;2520976..2521339;;*23s°;?72;§362;;;
comp;2148218..2148664;;cds;;149;hp;'''2905;;;comp;2520789..2520903;;$5s;229;§113;;&lt;u&gt;1238;
;;;;;;;;;;comp;2517845..2520559;;cds;;905;&amp;phospho;'''1813;
;21325..22362;;cds;586;346;hp;'''1493;b3;;;;;;;;;;
;22949..23237;;*16s°;85;§287;;&lt;u&gt;1325;;;;;;;;;;;
comp;23323..23490;;cds;;56;hp;;;;comp;2096348..2097337;;cds;;330;&amp;trypsin;'''927;b8
;52011..52881;;*23s°;106;§869;;1346;;;comp;2095539..2095733;;*16s°;614;§193;;640;
;52988..53464;;cds;-37;159;hp;;;;comp;2095044..2095490;;cds;48;149;hp;;
&gt;;53428..53694;;cds;86;89;p-glyco;;;;;42615..42903;;*16s°;?112;§287;;287;
comp;53781..54709;;*23s°;26;§927;;1194;;;;43016..43092;;atc;?213;;;;
;435837..436075;;*23s°;?72;§237;;237;;;;43306..44132;;*23s°;-1;§825;;825;
;436148..436262;;$5s;?51;§113;;;;;;753203..753760;;cds;388;186;hp;;
;436314..436390;;atgf;196;;;;;;;752603..752814;;rpr;597;71;CRISPR;1028;
;436587..436883;;cds;;99;hp;'''2777;;;comp;751747..752005;;*23s°;?72;§257;;;
;;;;;;;;;;comp;751560..751674;;$5s;161;§113;;;
&lt;;45496..45768;;cds;553;91;p-glyco1;'''1383;b4;;;750262..751398;;cds;;379;&amp;FeFe;'''1853;
;46322..47040;;*16s°;0;§717;;;;;;;;;;;;;
comp;47041..47433;;cds;;131;winged ;;;;comp;2087696..2090938;;cds;705;1081;PAS;'''986;b9
comp;40763..42629;;*23s°;-15;§1865;;1865;;;;2091644..2091826;;*16s°;7;§181;;595;
&lt;;3409412..3409711;;cds;1;100;p-IS5;;;;;2091834..2092247;;cds;;138;hp;;
comp;3409304..3409410;;*23s°;?71;§105;;405;;;comp;51625..52017;;*16s°;-7;§391;;391;
comp;3409118..3409232;;$5s;91;§113;;;;;comp;51436..51512;;atc;?112;;;;
;3408217..3409026;;cds;;270;hp;'''2270;;;comp;51146..51221;;*23s°;?214;§74;;;
;;;;;;;;;;comp;49761..51017;;cds;128;(419;&amp;glyco;1331;
comp;1812365..1813924;;cds;894;520;&amp;peptido;;b5;;comp;691078..691773;;cds;4;232;ComF;;
;1814819..1815040;;*16s°;-7;§222;;'''1026;;;;691778..691897;;*23s°;?72;§118;;814;
&lt;comp;1815034..1815837;;cds;;268;p-elon;;;;;691970..692084;;$5s;114;§113;;;
comp;44132..44835;;*23s°;-5;§702;;993;;;comp;692199..694505;;cds;;769;VWA;'''2145;
;44831..45121;;cds;;97;hp;;;;;;;;;;;;
comp;13874..15127;;cds;-7;418;hp;1505;;;comp;2393295..2396009;;cds;1003;905;&amp;cas3;'''1066;b10
comp;13628..13880;;*23s°;?72;§251;;;;;;2397013..2397919;;*16s°;2;§905;;905;
comp;13441..13555;;$5s;242;§113;;;;;;2397922..2400888;;cds;;989;hp;;
comp &lt;;12458..13198;;cds;;247;p-trans;'''2498;;;;54736..54898;;*16s°;?112;§161;;161;
;;;;;;;;;;;55011..55087;;atc;?216;;;;
;;;;;;;;;;;55304..55741;;*23s°;438;§436;;;
;2893891..2894430;;cds;25;180;&amp;phage;;;;;56180..56440;;cds;;87;hp;697;
;2894456..2894570;;$5s;?51;§113;;(540;;;comp;1735298..1736380;;cds;209;361;DUF262;1351;
;2894622..2894698;;atgf;285;;;;;;;1736590..1736859;;*23s°;?72;§268;;;
;2894984..2895400;;cds;;139;p-hp;;;;;1736932..1737046;;$5s;?52;§113;;;
;;;;;;;;;;;1737099..1737175;;atgf;93;;;;
;1213113..1214459;;cds;210;449;&amp;acetyl;(1445;;;comp;1737269..1737694;;cds;;142;type II;'''2048;
comp;1214670..1214874;;*16s°;600;§203;;;;;;;;;;;;;
comp;1215475..1216716;;cds;;414;&amp;polypho;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;434306..435142;;cds;512;279;&amp;CDP;;
comp;467261..468370;;cds;167;370;&amp;3-isop;(1238;;;;435655..435842;;*16s°;-6;§186;;(1023;
;468538..468667;;*23s°;?72;§128;;;;;;435837..436075;;*23s°;?72;§237;;;
;468740..468854;;$5s;?51;§113;;;;;;436148..436262;;$5s;?51;§113;;237;
;468906..468982;;atgf;125;;;;;;;436314..436390;;atgf;196;;;;
;469108..469863;;cds;;252;&amp;SAM;;;;;436587..436883;;cds;;99;hp;;
&lt;/pre&gt;
====rpm distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_distribution|rpm distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;5
att;;act;;aat;;agt;;aac2;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;aag2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;acc3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;atgj2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;4;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;;agc;1;cag2;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;3;aac;2;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;2;cac;2;cgt;;ccg2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;2;gcc;;gac;;ggc;;cgt3;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;4;gac;2;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;ctg5;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;3;aga;1;gaa2;ata;;aca;1;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;gac2;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;gcc4;gta;;gca;1;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;gcg3;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;ggc4;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;gtg2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;5;ccg;2;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;1;ttc4;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;2;gcg;3;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;gca &gt;1 16s;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
rpm;;30;;;;;30;;rpm;7;;;;;;7;;rpm;42;;;;;;42;;rpm;;;;5;;;5
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5 1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====rpm données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_données_intercalaires|rpm données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;rpm;fx;fc;rpm;fx40;fc40;rpm;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;4;9;0;4;9;-1;0;65;418;38; CDS 16s;;;tRNA tRNA;;
;2;10;14;213;1;2;30;-2;3;1;116;367;;1026;;24;;atgj
;1;20;6;171;2;1;36;-3;0;0;199;92;5s CDS;;;**;;atgj
;1;30;8;116;3;2;23;-4;7;338;142;155;173;114;;25;;gtg
1;0;40;27;74;4;2;31;-5;0;0;196;648;250;161;;**;;gtg
;1;50;95;61;5;2;22;-6;0;0;125;195;229;118;;35;;cgt
2;4;60;78;63;6;1;8;-7;0;3;110;144;25;91;;44;;cgt
;0;70;47;80;7;0;11;-8;1;40;106;93;23s 5s;;;**;;cgt
2;3;80;30;75;8;2;18;-9;1;0;350;449;68;;;23;;ggc
2;4;90;21;69;9;0;20;-10;0;6;88;206;autre ss;;;45;;ggc
5;4;100;27;59;10;2;14;-11;0;18;81;95;16s CDS;;;29;;ggc
1;3;110;24;54;11;0;18;-12;0;0;176;168;-3;;;**;;ggc
;3;120;25;53;12;1;29;-13;1;8;138;60;16s tRNA;;;54;;cag
1;5;130;18;63;13;0;19;-14;1;20;170;154;116;;atc;**;;cag
;2;140;25;50;14;2;16;-15;0;0;197;93;tRNA 23s;;;16;;acc
1;3;150;21;57;15;1;22;-16;0;2;126;195;240;;atc;18;;acc
3;1;160;16;56;16;0;21;-17;0;10;93;645;243;;atc;**;;acc
1;2;170;16;42;17;1;16;-18;3;0;50;87;5s tRNA;;;37;;gac
1;3;180;18;38;18;1;12;-19;1;3;176;74;51;;atgf;**;;gac
1;1;190;16;37;19;0;13;-20;1;5;274;194;51;;atgf;34;;gga
3;5;200;19;32;20;0;5;-21;0;0;214;205;52;;atgf;**;;tac
3;0;210;19;37;21;1;17;-22;0;1;250;538;52;;atgf;24;;aag
;3;220;8;25;22;0;13;-23;0;5;77;155;51;;atgf;**;;aag
;1;230;21;27;23;1;11;-24;0;0;80;110;;;;165;;ccg
;0;240;12;29;24;1;13;-25;0;1;83;92;;;;**;;ccg
;4;250;13;36;25;1;11;-26;3;5;198;76;;;;70;;gcc
;0;260;17;12;26;0;9;-27;0;0;141;54;;;;69;;gcc
;1;270;15;16;27;0;8;-28;0;2;160;176;;;;57;;gcc
;2;280;26;10;28;1;14;-29;2;5;219;387;;;;**;;gcc
;1;290;14;13;29;1;12;-30;0;0;55;210;;;;117;;cca
1;0;300;13;11;30;2;8;-31;0;5;71;84;;;;373;;atgi
;0;310;15;12;31;0;7;-32;0;2;261;184;;;;157;;gca
1;0;320;9;9;32;2;10;-33;0;0;56;126;;;;**;;aca
;0;330;8;12;33;1;12;-34;0;3;225;292;;;;29;;ttc
;0;340;8;8;34;5;4;-35;0;1;989;311;;;;34;;ttc
;1;350;9;8;35;0;4;-36;0;0;106;;;;;33;;ttc
;0;360;6;8;36;3;9;-37;0;2;192;;;;;**;;ttc
1;0;370;8;9;37;3;10;-38;0;5;166;;;;;27;;tgc
;1;380;4;5;38;5;5;-39;0;0;93;;;;;31;;aac
1;1;390;6;8;39;4;6;-40;0;1;271;;;;;**;;aac
;0;400;13;4;40;4;7;-41;0;2;182;suite c;;;;70;;gcg
4;2;reste;107;76;reste;847;1264;-42;1;0;141;60;;;;33;;gcg
35;65;total;906;1847;total;906;1847;-43;0;4;94;29;;;;**;;gcg
31;63;diagr;795;1762;diagr;55;574;-44;1;2;129;172;;;;214;;gaa
0;4; t30;28;500;;;;-45;0;0;123;389;;;;**;;gaa
;;;;;;;;-46;0;0;15;55;;;;47;;ctg
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;2;2;8;125;;;;153;;ctg
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;250;118;;;;48;;ctg
;x;902;46;4;952;;;-49;2;2;99;241;;;;47;;ctg
;c;1838;603;9;2450;;;-50;0;2;285;138;;;;**;;ctg
;;;;;3402;243;;reste;16;32;250;220;;;;;;
;;;;;;3645;;total;46;603;8;90;;;;;;
;;;;;;;;;;;379;113;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====rpm autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_autres_intercalaires_aas|rpm autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;rpm;;;;
deb fin;comp;gen;adresse1;adresse2;intercalaire;aas
deb;comp;CDS;3322;4086;198;
;comp;misc_f;4285;4778;239;
;comp;tRNA;5018;5093;199;gca
;comp;misc_f;5293;5425;62;
;comp;misc_f;5488;5583;7;
fin;;CDS;5591;6664;;
deb;comp;CDS;12473;13267;173;
;comp;rRNA;13441;13555;82;115
;comp;misc_f;13638;13881;-8;
fin;comp;CDS;13874;15127;;
deb;;CDS;21325;22362;656;
;;misc_f;23019;23290;32;
fin;comp;CDS;23323;23490;;
deb;comp;CDS;24015;24287;250;
;comp;rRNA;24538;24652;68;115
;comp;rRNA;24721;27462;240;2742
;comp;tRNA;27703;27779;129;atc
;comp;misc_f;27909;28041;5;
;comp;misc_f;28047;28494;-14;
fin;;CDS;28481;29194;;
deb;comp;CDS;32782;33759;290;
;;misc_f;34050;34145;62;
;;misc_f;34208;34340;129;
;;tRNA;34470;34546;259;atc
;;misc_f;34806;35299;7;
;comp;misc_f;35307;35750;69;
;comp;rRNA;35820;38561;243;2742
;comp;tRNA;38805;38881;116;atc
;comp;rRNA;38998;40479;268;1482
;;misc_f;40748;45159;-2406;
;;misc_f;42754;42886;129;
;;tRNA;43016;43092;256;atc
;;misc_f;43349;43842;7;
;;misc_f;43850;44142;601;
fin;;CDS;44744;45121;;
deb;;CDS;45496;45768;576;
;;misc_f;46345;47084;10;
fin;comp;CDS;47095;47433;;
deb;comp;CDS;49761;51017;418;
;comp;tRNA;51436;51512;129;atc
;comp;misc_f;51642;51774;62;
;comp;misc_f;51837;51932;84;
;;misc_f;52017;52217;76;
;;misc_f;52294;52918;69;
fin;;CDS;52988;53464;;
deb;;CDS;53428;53694;87;
;comp;misc_f;53782;53921;72;
;comp;misc_f;53994;54619;90;
;;misc_f;54710;54881;129;
;;tRNA;55011;55087;289;atc
;;misc_f;55377;55746;433;
fin;;CDS;56180;56440;;
deb;comp;CDS;82891;83088;116;
;comp;tRNA;83205;83280;199;tgg
fin;comp;CDS;83480;84178;;
deb;;CDS;417242;417412;142;
;;tRNA;417555;417631;24;atgj
;;tRNA;417656;417732;38;atgj
fin;comp;CDS;417771;418820;;
deb;;CDS;434306;435142;672;
;;misc_f;435815;436065;82;
;;rRNA;436148;436262;51;115
;;tRNA;436314;436390;196;atgf
fin;;CDS;436587;436883;;
deb;comp;CDS;467261;468367;193;
;;misc_f;468561;468657;82;
;;rRNA;468740;468854;51;115
;;tRNA;468906;468982;125;atgf
fin;;CDS;469108;469863;;
deb;comp;CDS;534521;536161;367;
;;tRNA;536529;536603;92;acg
fin;comp;CDS;536696;537778;;
deb;;CDS;619174;620157;82;
;;regulatory;620240;620316;45;
fin;;CDS;620362;621558;;
deb;comp;CDS;658467;658931;110;
;comp;tRNA;659042;659116;155;gtc
deb;;CDS;659272;660159;106;
;;tRNA;660266;660340;648;gtc
fin;comp;CDS;660989;661800;;
deb;comp;CDS;684188;685114;350;
;comp;tRNA;685465;685539;25;gtg
;comp;tRNA;685565;685639;195;gtg
fin;;CDS;685835;686251;;
deb;comp;CDS;691078;691803;-14;
;;misc_f;691790;691887;82;
;;rRNA;691970;692084;114;115
fin;comp;CDS;692199;694505;;
deb;;CDS;750262;751398;161;
;comp;rRNA;751560;751674;82;115
;comp;misc_f;751757;752004;598;
;;repeat_region;752603;752814;388;
fin;;CDS;753203;753760;;
deb;comp;CDS;839402;839962;163;
;comp;misc_f;840126;840415;631;
fin;comp;CDS;841047;844388;;
deb;;CDS;874585;875391;88;
;;tRNA;875480;875556;81;cac
fin;;CDS;875638;876117;;
deb;;CDS;885688;886299;176;
;;tRNA;886476;886552;144;ccc
fin;comp;CDS;886697;887233;;
deb;;CDS;932708;934243;93;
;comp;tRNA;934337;934413;35;cgt
;comp;tRNA;934449;934525;44;cgt
;comp;tRNA;934570;934646;449;cgt
fin;;CDS;935096;936175;;
deb;comp;CDS;978995;979396;138;
;comp;tRNA;979535;979609;23;ggc
;comp;tRNA;979633;979707;45;ggc
;comp;tRNA;979753;979827;29;ggc
;comp;tRNA;979857;979931;206;ggc
fin;;CDS;980138;981679;;
deb;;CDS;997575;997898;95;
;comp;tRNA;997994;998067;54;cag
;comp;tRNA;998122;998195;168;cag
fin;;CDS;998364;999509;;
deb;comp;CDS;1016768;1017427;130;
;comp;regulatory;1017558;1017770;123;
fin;comp;CDS;1017894;1019260;;
deb;;CDS;1050081;1051028;60;
;comp;tRNA;1051089;1051163;16;acc
;comp;tRNA;1051180;1051254;18;acc
;comp;tRNA;1051273;1051347;170;acc
fin;comp;CDS;1051518;1052885;;
deb;;CDS;1197836;1199341;197;
;;tRNA;1199539;1199623;126;cta
fin;;CDS;1199750;1201090;;
deb;;CDS;1206196;1206501;93;
;;tRNA;1206595;1206670;50;gta
fin;;CDS;1206721;1207092;;
deb;comp;CDS;1349719;1350132;81;
;comp;misc_f;1350214;1350534;286;
;comp;tRNA;1350821;1350897;129;atc
;comp;misc_f;1351027;1351159;11;
;comp;misc_f;1351171;1351556;-2;
fin;comp;CDS;1351555;1351782;;
deb;;CDS;1359745;1360302;176;
;;tRNA;1360479;1360555;37;gac
;;tRNA;1360593;1360669;274;gac
fin;;CDS;1360944;1361204;;
deb;;CDS;1416615;1417769;214;
;;tRNA;1417984;1418074;154;tcc
fin;comp;CDS;1418229;1419095;;
deb;comp;CDS;1454756;1457068;311;
;;ncRNA;1457380;1457769;111;
fin;;CDS;1457881;1458696;;
deb;comp;CDS;1472421;1473403;250;
;comp;tRNA;1473654;1473740;77;ttg
fin;comp;CDS;1473818;1474678;;
deb;comp;CDS;1576267;1577118;334;
;;repeat_region;1577453;1577846;905;
fin;comp;CDS;1578752;1579339;;
deb;comp;CDS;1731863;1733557;53;
;comp;regulatory;1733611;1733729;167;
fin;comp;CDS;1733897;1734196;;
deb;comp;CDS;1735298;1736380;219;
;;misc_f;1736600;1736849;82;
;;rRNA;1736932;1737046;52;115
;;tRNA;1737099;1737175;93;atgf
fin;comp;CDS;1737269;1737694;;
deb;comp;CDS;1770487;1770918;236;
;;ncRNA;1771155;1771251;22;
fin;;CDS;1771274;1773061;;
deb;comp;CDS;1812365;1813924;963;
;;misc_f;1814888;1815202;26;
deb;comp;CDS;1815229;1815837;80;
;comp;tRNA;1815918;1815991;34;gga
;comp;tRNA;1816026;1816111;195;tac
fin;;CDS;1816307;1817143;;
deb;comp;CDS;1833109;1833603;83;
;comp;tRNA;1833687;1833762;24;aag
;comp;tRNA;1833787;1833862;198;aag
fin;comp;CDS;1834061;1835224;;
deb;comp;CDS;1942676;1942888;141;
;comp;tRNA;1943030;1943121;160;agc
fin;comp;CDS;1943282;1944133;;
deb;comp;CDS;2087696;2090938;775;
;;misc_f;2091714;2091942;35;
fin;;CDS;2091978;2092247;;
deb;comp;CDS;2113248;2114603;219;
;comp;tRNA;2114823;2114899;55;aga
deb;comp;CDS;2114955;2115251;71;
;comp;tRNA;2115323;2115399;261;cca
fin;comp;CDS;2115661;2116041;;
deb;comp;CDS;2144042;2146288;185;
;;misc_f;2146474;2147259;69;
;;rRNA;2147329;2147443;52;115
;;tRNA;2147496;2147572;645;atgf
fin;comp;CDS;2148218;2148664;;
deb;;CDS;2268003;2268461;87;
;comp;tRNA;2268549;2268625;165;ccg
;comp;tRNA;2268791;2268867;56;ccg
fin;comp;CDS;2268924;2269910;;
deb;comp;CDS;2321621;2322403;74;
;;tRNA;2322478;2322554;225;ccc
fin;;CDS;2322780;2322974;;
deb;comp;CDS;2383763;2385853;216;
;;repeat_region;2386070;2386891;67;
fin;comp;CDS;2386959;2387270;;
deb;comp;CDS;2393295;2396009;1026;
;16s°;rRNA;2397036;2398062;-3;1027
fin;;CDS;2398060;2400888;;
deb;comp;CDS;2517845;2520559;229;
;comp;rRNA;2520789;2520903;82;115
;comp;misc_f;2520986;2521235;19;
;comp;misc_f;2521255;2521355;173;
fin;comp;CDS;2521529;2522152;;
deb;comp;CDS;2596508;2596738;989;
;comp;tRNA;2597728;2597815;194;tca
fin;;CDS;2598010;2599204;;
deb;comp;CDS;2621435;2622058;106;
;comp;tRNA;2622165;2622251;205;ctc
fin;;CDS;2622457;2623107;;
deb;;CDS;2631201;2631554;192;
;;tRNA;2631747;2631822;70;gcc
;;tRNA;2631893;2631968;69;gcc
;;tRNA;2632038;2632113;57;gcc
;;tRNA;2632171;2632246;166;gcc
deb;;CDS;2632413;2632965;538;
;comp;tRNA;2633504;2633579;93;aca
deb;comp;CDS;2633673;2634200;271;
;comp;tRNA;2634472;2634561;155;tcg
fin;;CDS;2634717;2635742;;
deb;comp;CDS;2655872;2656489;182;
;comp;tRNA;2656672;2656747;141;gag
fin;comp;CDS;2656889;2657674;;
deb;;CDS;2758160;2758312;110;
;comp;tRNA;2758423;2758509;94;tta
fin;comp;CDS;2758604;2759899;;
deb;;CDS;2768823;2769530;-11;
;;misc_f;2769520;2769766;81;
;;rRNA;2769848;2769962;118;115
fin;comp;CDS;2770081;2771016;;
deb;;CDS;2792922;2794778;129;
;;tRNA;2794908;2794982;92;caa
fin;comp;CDS;2795075;2795686;;
deb;;CDS;2862755;2862982;123;
;;tRNA;2863106;2863182;117;cca
;;tRNA;2863300;2863374;373;atgi
;;tRNA;2863748;2863823;157;gca
;;tRNA;2863981;2864056;15;aca
deb;;CDS;2864072;2864317;8;
;;tRNA;2864326;2864401;250;aaa
fin;;CDS;2864652;2865125;;
deb;;CDS;2867066;2868112;76;
;comp;tRNA;2868189;2868264;99;aaa
fin;comp;CDS;2868364;2868870;;
deb;comp;CDS;2887107;2888297;134;
;comp;regulatory;2888432;2888534;423;
fin;;CDS;2888958;2890178;;
deb;;CDS;2893891;2894430;25;
;;rRNA;2894456;2894570;51;115
;;tRNA;2894622;2894698;285;atgf
fin;;CDS;2894984;2895400;;
deb;comp;CDS;3034652;3035092;250;
;comp;tRNA;3035343;3035418;8;aaa
fin;comp;CDS;3035427;3035582;;
deb;comp;CDS;3252110;3252280;201;
;;repeat_region;3252482;3252814;354;
fin;comp;CDS;3253169;3254368;;
deb;comp;CDS;3305068;3306534;379;
;comp;tRNA;3306914;3306989;29;ttc
;comp;tRNA;3307019;3307094;34;ttc
;comp;tRNA;3307129;3307204;33;ttc
;comp;tRNA;3307238;3307313;60;ttc
fin;comp;CDS;3307374;3308864;;
deb;comp;CDS;3332977;3334356;54;
;;tRNA;3334411;3334487;176;cgg
fin;comp;CDS;3334664;3335983;;
deb;;CDS;3408217;3409026;91;
;comp;rRNA;3409118;3409232;81;115
;comp;misc_f;3409314;3409410;1;
fin;;CDS;3409412;3409711;;
deb;comp;CDS;3442569;3444509;193;
;comp;regulatory;3444703;3444904;173;
fin;;CDS;3445078;3445920;;
deb;comp;CDS;3456276;3461666;387;
;;tRNA;3462054;3462130;29;agg
fin;;CDS;3462160;3462951;;
deb;comp;CDS;3484140;3484604;331;
;comp;tmRNA;3484936;3485254;73;
fin;comp;CDS;3485328;3486527;;
deb;comp;CDS;3500025;3500675;210;
;;tRNA;3500886;3500959;27;tgc
;;tRNA;3500987;3501061;31;aac
;;tRNA;3501093;3501167;84;aac
fin;comp;CDS;3501252;3501659;;
deb;;CDS;3639978;3641276;172;
;;tRNA;3641449;3641525;70;gcg
;;tRNA;3641596;3641671;33;gcg
;;tRNA;3641705;3641780;389;gcg
fin;;CDS;3642170;3644392;;
deb;;CDS;3651524;3652711;55;
;;tRNA;3652767;3652843;184;cac
fin;comp;CDS;3653028;3653543;;
deb;;CDS;3710072;3710840;126;
;comp;tRNA;3710967;3711042;214;gaa
;comp;tRNA;3711257;3711332;125;gaa
fin;comp;CDS;3711458;3711664;;
deb;comp;CDS;3801285;3802196;44;
;comp;regulatory;3802241;3802347;126;
fin;;CDS;3802474;3803130;;
deb;comp;CDS;3804728;3805231;118;
;comp;tRNA;3805350;3805425;241;gag
fin;comp;CDS;3805667;3806140;;
deb;;CDS;3813820;3815895;138;
;;tRNA;3816034;3816109;220;atgi
fin;;CDS;3816330;3818993;;
deb;comp;CDS;3827982;3828878;90;
;comp;tRNA;3828969;3829042;292;ggg
fin;;CDS;3829335;3830670;;
deb;comp;CDS;3832305;3833264;311;
;;tRNA;3833576;3833662;47;ctg
;;tRNA;3833710;3833796;153;ctg
;;tRNA;3833950;3834036;48;ctg
;;tRNA;3834085;3834171;47;ctg
;;tRNA;3834219;3834305;113;ctg
fin;;CDS;3834419;3835039;;
&lt;/pre&gt;

====rpm remarques====
=====rpm remarques texte=====
=====rpm listes=====
=====alpha codes=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha_codes|alpha codes]]
&lt;pre&gt;
rpm;25;;;;;95;88;;rru;12;;;;;55;51;;rpl;2;;;;;33;31
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;1;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;4;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;7;acc;3;aac;2;agc;1;;atc;4;acc;2;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;2;cac;2;cgt;3;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;1;ccc;0;cac;1;cgt;1
gtc;2;gcc;4;gac;2;ggc;4;;gtc;1;gcc;2;gac;1;ggc;1;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;2;aca;2;aaa;4;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0
gta;1;gca;2;gaa;2;gga;1;;gta;1;gca;4;gaa;1;gga;1;;gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;;tgg;1
atg;5/2;acg;1;aag;3;agg;1;;atg;3/1;acg;1;aag;1;agg;1;;atg;1/1;acg;1;aag;0;agg;0
ctg;5;ccg;2;cag;2;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;1
gtg;2;gcg;3;gag;2;ggg;1;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
abq;20;;;;;88;83;;oan;11;;;;;61;52;;rtb;2;;;;;33;31
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;8;acc;2;aac;3;agc;1;;atc;4;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;2;ccc;1;cac;2;cgt;2;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;1;ccc;0;cac;1;cgt;1
gtc;2;gcc;3;gac;4;ggc;4;;gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;2;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;1;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0
gta;1;gca;8;gaa;1;gga;1;;gta;1;gca;4;gaa;2;gga;1;;gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;;tgg;1
atg;3/1;acg;1;aag;2;agg;1;;atg;5/2;acg;1;aag;1;agg;1;;atg;1/1;acg;1;aag;0;agg;0
ctg;3;ccg;2;cag;2;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;1
gtg;2;gcg;2;gag;2;ggg;1;;gtg;1;gcg;0;gag;1;ggg;1;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
abs;20;;;;;85;76;;agr;9;;;;;58;51;;aua;12;;;;;55;55
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;4;acc;2;aac;3;agc;1;;atc;5;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;2;ccc;1;cac;2;cgt;2;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;2;ccc;1;cac;1;cgt;2
gtc;2;gcc;3;gac;4;ggc;4;;gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;2;;gtc;3;gcc;1;gac;2;ggc;2
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;0
gta;1;gca;4;gaa;1;gga;2;;gta;1;gca;5;gaa;2;gga;1;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atg;5/1;acg;1;aag;2;agg;1;;atg;6/1;acg;1;aag;1;agg;0;;atg;4;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;3;ccg;2;cag;2;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;2;gcg;2;gag;2;ggg;1;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;1;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
&lt;/pre&gt;

=====gamma codes=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#gamma_codes|gamma codes]]
&lt;pre&gt;
19/01/20;Paris;;;;;;
gamma;10500;1161;;;;88462;86720
ttt;18;tct;20;tat;15;tgt;2
att;1;act;6;aat;2;agt;0
ctt;11;cct;1;cat;3;cgc;0
gtt;6;gct;0;gat;0;ggt;6
ttc;2,075;tcc;1,795;tac;2,687;tgc;1,345
atc;3,369;acc;1,829;aac;3,679;agc;1,256
ctc;1,204;ccc;1,012;cac;1,369;cgt;3,520
gtc;2,046;gcc;1,973;gac;3,421;ggc;4,151
tta;1,422;tca;1,662;taa;12;tga;762
ata;10;aca;1,666;aaa;4,457;aga;1,784
cta;1,516;cca;1,671;caa;2,239;cga;156
gta;3,798;gca;3,342;gaa;3,829;gga;1,347
ttg;1,214;tcg;984;tag;32;tgg;1,340
atg;7,009;acg;845;aag;282;agg;1,298
ctg;2,977;ccg;729;cag;1,208;cgg;1,182
gtg;98;gcg;82;gag;90;ggg;855
;;;;;;;
indices;;;;;;;
gamma;904;1161;;;;88462;7469
ttt;1.55;tct;1.72;tat;1.29;tgt;0.17
att;0.09;act;0.52;aat;0.17;agt;0
ctt;0.95;cct;0.09;cat;0.26;cgc;0
gtt;0.52;gct;0;gat;0;ggt;0.52
ttc;179;tcc;155;tac;231;tgc;116
atc;290;acc;158;aac;317;agc;108
ctc;104;ccc;87;cac;118;cgt;303
gtc;176;gcc;170;gac;295;ggc;358
tta;122;tca;143;taa;1.03;tga;66
ata;0.86;aca;143;aaa;384;aga;154
cta;131;cca;144;caa;193;cga;13.4
gta;327;gca;288;gaa;330;gga;116
ttg;105;tcg;85;tag;2.76;tgg;115
atg;604;acg;73;aag;24.3;agg;112
ctg;256;ccg;63;cag;104;cgg;102
gtg;8.4;gcg;7.1;gag;7.8;ggg;74
&lt;/pre&gt;

===rru===
====rru opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_opérons|rru opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Rhod_rubr_ATCC_11170/rhodRubr_ATCC11170-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_007643.1;rru;;genome;3.8.16;;;;;;;;
64.97%GC;26.12.19 Paris;16s  4 ;55 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Rhodospirillum rubrum ATCC 11170;;;;;;;;;;;;
chromosome;;;;;;;;;;;;
comp;16232..16852;;cds;;163;163;;;207;;3'-5' exonuclease;*
comp;17016..17102;;ctg;;253;253;;;;;;*
;17356..18378;;cds;;;;;;341;;3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase;*
;;;;;;;;;;;;*
;117072..117287;;cds;;37;37;;;72;;slyX;*
comp;117325..117401;;agg;;341;341;;;;;;*
;117743..123022;;cds;;;;;;*1760;;alpha-2-macroglobulin-like protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;149921..151015;;cds;;225;225;;;365;;hp;*
;151241..151317;;cgg;;136;136;;;;;;*
comp;151454..152929;;cds;;;;;;492;;chemotaxis sensory transducer protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;189941..191668;;cds;;859;*859;;;576;;sulfate transporter/antisigma-factor antagonist;*
;192528..194004;;16s;;184;;;;1477;;;*
;194189..194265;;atc;;66;;;66;;;;*
;194332..194407;;gca;;362;;;;;;;*
;194770..197527;;23s;;119;;;;2758;;;*
;197647..197761;;5s;;96;;;;115;;;*
;197858..197934;;atgf;;287;287;;;;;;*
comp;198222..198455;;cds;;;;;;78;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;305449..306648;;cds;;257;257;;;400;;Ppx/GppA phosphatase;*
;306906..306979;;cag;;319;319;;;;;;*
comp;307299..308303;;cds;;;;;;335;;LacI family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;322896..323807;;cds;;292;292;;;304;;hp;*
comp;324100..324174;;caa;;98;98;;;;;;*
comp;324273..325601;;cds;;;;;;443;;chemotaxis sensory transducer protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;362552..362881;;cds;;224;224;;;110;;hp;*
;363106..363181;;gcc;+;202;;202;;;;;*
;363384..363459;;gcc;2 gcc;43;43;;;;;;*
comp;363503..364531;;cds;;;;;;343;;esterase;*
;;;;;;;;;;;;*
;407067..407606;;cds;;92;92;;;180;;YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;*
;407699..407790;;agc;;141;141;;;;;;*
;407932..408774;;cds;;;;;;281;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;466945..467925;;cds;;115;115;;;327;;hp;*
comp;468041..468126;;tta;;83;83;;;;;;*
comp;468210..468458;;cds;;;;;;83;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;559038..559610;;cds;;86;86;;;191;;OsmC-like protein;*
;559697..559772;;aag;;140;140;;;;;;*
;559913..560608;;cds;;;;;;232;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;794877..795188;;cds;;-81;*-81;;;104;;hp;*
comp;795108..795188;;Sig-pep;;217;217;;;27;;hp;*
;795406..795496;;tcc;;44;44;;;;;;*
;795541..795846;;cds;;;;;;102;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;908584..910185;;cds;;-102;*-102;;;534;;peptidase M23B;*
comp;910084..910185;;Sig-pep;@1;1212;*1212;;;34;;hp;*
;911398..912874;;16s;;182;;;;1477;;;*
;913057..913133;;atc;;66;;;66;;;;*
;913200..913275;;gca;;361;;;;;;;*
;913637..916394;;23s;;118;;;;2758;;;*
;916513..916627;;5s;;95;;;;115;;;*
;916723..916799;;atgf;;573;*573;;;;;;*
;917373..921860;;cds;;;;;;*1496;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1159249..1160091;;cds;;71;71;;;281;;Linocin_M18 bacteriocin protein;*
;1160163..1160238;;gag;;117;117;;;;;;*
;1160356..1160613;;cds;;;;;;86;;prevent-host-death protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1464820..1465122;;cds;;283;283;;;101;;50S ribosomal protein L21;*
;1465406..1465495;;tcg;;139;139;;;;;;*
comp;1465635..1466303;;cds;;;;;;223;;cytochrome B561;*
;;;;;;;;;;;;*
;1791953..1792159;;cds;;116;116;;;69;;hp;*
comp;1792276..1792351;;gaa;;131;131;;;;;;*
comp;1792483..1792689;;cds;;;;;;69;;cold-shock DNA-binding protein family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1824302..1825738;;cds;;98;98;;;479;;malonyl-CoA decarboxylase;*
;1825837..1825921;;cta;;102;102;;;;;;*
;1826024..1827415;;cds;;;;;;464;;trigger factor;*
;;;;;;;;;;;;*
;1833133..1833408;;cds;;284;284;;;92;;histone-like DNA-binding protein;*
;1833693..1833768;;gta;;70;70;;;;;;*
comp;1833839..1835326;;cds;;;;;;496;;methyl-accepting chemotaxis sensory transducer;*
;;;;;;;;;;;;*
;1933506..1934138;;cds;;-633;*-633;;;211;;hp;*
;1933506..1933652;;Sig-pep;;571;*571;;;49;;hp;*
;1934224..1934300;;cca;;63;63;;;;;;*
;1934364..1934663;;cds;;12;12;;;100;;ETC complex I subunit region;*
;1934676..1934752;;aga;;396;*396;;;;;;*
;1935149..1939624;;cds;;;;;;*1492;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1959133..1959858;;cds;;175;175;;;242;;MerR family transcriptional regulator;*
;1960034..1960110;;ccc;@2;1062;*1062;;;;;;*
;1961173..1961367;;cds;;;;;;65;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1996760..1998124;;cds;;-120;*-120;;;455;;lytic murein transglycosylase;*
comp;1998005..1998124;;Sig-pep;;119;119;;;40;;hp;*
;1998244..1998333;;tca;;927;*927;;;;;;*
comp;1999261..1999929;;cds;;;;;;223;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2032027..2032863;;cds;;123;123;;;279;;phage integrase;*
comp;2032987..2033062;;aaa;;186;186;;;;;;*
comp;2033249..2033755;;cds;;;;;;169;;peptidyl-prolyl isomerase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2093327..2093977;;cds;;295;295;;;217;;protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase;*
;2094273..2094346;;tgc;;81;;81;;;;;*
;2094428..2094502;;aac;;150;150;;;;;;*
;2094653..2094916;;cds;;;;;;88;;prevent-host-death protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2304404..2305834;;cds;;89;89;;;477;;divalent cation transporter;*
comp;2305924..2306010;;ctc;;178;178;;;;;;*
;2306189..2306839;;cds;;;;;;217;;lipoate-protein ligase B;*
;;;;;;;;;;;;*
;2331183..2331521;;cds;;73;73;;;113;;hp;*
;2331595..2331671;;atgj;;126;126;;;;;;*
comp;2331798..2332040;;cds;;;;;;81;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2411337..2411804;;cds;;-72;*-72;;;156;;CreA;*
comp;2411733..2411804;;Sig-pep;;202;202;;;24;;hp;*
comp;2412007..2412083;;cac;;75;75;;;;;;*
comp;2412159..2413343;;cds;;;;;;395;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2729598..2731271;;cds;;449;*449;;;558;;macrocin-O-methyltransferase;*
comp;2731721..2731797;;atgf;;95;;;;;;;*
comp;2731893..2732007;;5s;;119;;;115;;;;*
comp;2732127..2734884;;23s;;362;;;2758;;;;*
comp;2735247..2735322;;gca;;66;;;66;;;;*
comp;2735389..2735465;;atc;;184;;;;;;;*
comp;2735650..2737126;;16s;;606;*606;;1477;;;;*
comp;2737733..2738110;;cds;;;;;;126;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2959802..2961874;;cds;;354;*354;;;*691;;chemotaxis sensory transducer protein;*
comp;2962229..2962303;;gtc;;123;123;;;;;;*
;2962427..2963359;;cds;;;;;;311;;N-formylglutamate amidohydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3124836..3125033;;cds;;151;151;;;66;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;3125185..3125260;;tgg;;343;343;;;;;;*
comp;3125604..3126794;;cds;;93;93;;;397;;elongation factor Tu;*
comp;3126888..3126961;;gga;;27;;27;;;;;*
comp;3126989..3127074;;tac;;37;37;;;;;;*
;3127112..3128158;;cds;;57;57;;;349;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;3128216..3128291;;aca;;127;127;;;;;;*
;3128419..3128652;;cds;;;;;;78;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3193350..3194507;;cds;;430;*430;;;386;;acyltransferase;*
comp;3194938..3195013;;ttc;;103;103;;;;;;*
comp;3195117..3195635;;cds;;;;;;173;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3320745..3322115;;cds;;-1371;*-1371;;;457;;virulence protein;*
;3320745..3320816;;Sig-pep;;1389;*1389;;;24;;hp;*
comp;3322206..3322281;;atgi;;60;60;;;;;;*
comp;3322342..3324432;;cds;;;;;;*697;;RNA polymerase sigma factor RpoD;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3377932..3378114;;cds;;140;140;;;61;;hp;*
;3378255..3378329;;acc;+;165;;165;;;;;*
;3378495..3378569;;acc;2 acc;237;237;;;;;;*
;3378807..3379370;;cds;;234;234;;;188;;hp;*
;3379605..3379681;;gac;;77;77;;;;;;*
comp;3379759..3380517;;cds;;;;;;253;;diguanylate phosphodiesterase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3399207..3399494;;cds;;262;262;;;96;;hp;*
comp;3399757..3399833;;ccg;;56;56;;;;;;*
comp;3399890..3400972;;cds;;;;;;361;;farnesyltranstransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;3490378..3491148;;cds;;84;84;;;257;;2-phosphoglycolate phosphatase;*
;3491233..3491307;;gtg;;407;*407;;;;;;*
;3491715..3492080;;cds;;;;;;122;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3719367..3719753;;cds;;163;163;;;129;;hp;*
comp;3719917..3719990;;ggg;;95;95;;;;;;*
comp;3720086..3720859;;cds;;;;;;258;;enoyl-ACP reductase;*
;;;;;;;;;;;;*
;3805869..3806813;;cds;;130;130;;;315;;inner-membrane translocator;*
comp;3806944..3807058;;5s;;116;;;;115;;;*
comp;3807175..3809932;;23s;;362;;;;2758;;;*
comp;3810295..3810370;;gca;;66;;;66;;;;*
comp;3810437..3810513;;atc;;184;;;;;;;*
comp;3810698..3812174;;16s;;1227;*1227;;;1477;;;*
;3813402..3814118;;cds;;;;;;239;;transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3824154..3825854;;cds;;76;76;;;567;;phage integrase;*
comp;3825931..3826007;;cgt;;387;*387;;;;;;*
;3826395..3827531;;cds;;;;;;379;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;4021982..4023163;;cds;;27;27;;;394;;diguanylate phosphodiesterase;*
comp;4023191..4023277;;ttg;;224;224;;;;;;*
;4023502..4023855;;cds;;;;;;118;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4058818..4059117;;cds;;187;187;;;100;;hp;*
;4059305..4059380;;gcg;;179;179;;;;;;*
comp;4059560..4060126;;cds;;;;;;189;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4105626..4107317;;cds;;-114;*-114;;;564;;chemotaxis sensory transducer;*
comp;4107204..4107317;;Sig-pep;;721;*721;;;38;;hp;*
comp;4108039..4108113;;acg;;148;148;;;;;;*
;4108262..4108843;;cds;;;;;;194;;D-alpha,beta-D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4261100..4262038;;cds;;269;269;;;313;;thioredoxin-like protein;*
;4262308..4262382;;ggc;;118;118;;;;;;*
;4262501..4263136;;cds;;;;;;212;;lysine exporter protein LysE/YggA;*
&lt;/pre&gt;

====rru cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_cumuls|rru cumuls]]
&lt;pre&gt;
rru cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cds 300
avec rRNA;opérons;4;1;;;1;7;1;;100;23;1;0
;16atcgca235;1;20;;;50;6;40;;200;17;30;3
;Id-atgf;3;40;1;;100;19;80;;300;16;60;4
;-;;60;;;150;20;120;;400;17;90;12
;max a;3;80;;4;200;8;160;;500;8;120;10
;a doubles;0;100;1;;250;7;200;;600;5;150;3
;spéciaux;0;120;;;300;9;240;;700;2;180;4
;total aas;11;140;;;350;3;280;;800;0;210;5
sans ;opérons;40;160;;;400;3;320;;900;0;240;8
;1 aa;36;180;1;;450;3;360;;1000;0;270;4
;max a;2;200;;;500;0;400;;1100;0;300;3
;a doubles;2;;1;;;10;;;;3;;35
;total aas;44;;4;4;;95;;0;;91;;91
total aas;;55;;;;;;;;;;;
remarques;;;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;119;66;;208;;;;292;;
;;;variance;79;0;;333;;;;187;;
sans jaune;;;moyenne;;;;148;;;;237;;140
;;;variance;;;;83;;;;132;;69
&lt;/pre&gt;

====rru blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_blocs|rru blocs]]
&lt;pre&gt;
rru blocs;;;;;;;
cds;859;576;sulfate;cds;606;126;hp
16s;184;1477;;16s;184;1477;
atc;66;;;atc;66;;
gca;362;;;gca;362;;
23s;119;2758;;23s;119;2758;
5s;96;115;;5s;95;115;
atgf;287;;;atgf;449;;
cds;;78;hp;cds;;558;macrocin
;;;;;;;
cds;-102;534;peptidase;;;;
Sig-pep;1212;34;hp;cds;1227;239;transposase
16s;182;1477;;16s;184;1477;
atc;66;;;atc;66;;
gca;361;;;gca;362;;
23s;118;2758;;23s;116;2758;
5s;95;115;;5s;130;115;
atgf;573;;;cds;;315;inner
cds;;1496;hp;;;;
;;;;;;;
sulfate;sulfate transporter/antisigma-factor antagonist;;;;;;
inner;inner-membrane translocator;;;;;;
macrocin;macrocin-O-methyltransferase;;;;;;
peptidase;peptidase M23B;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====rru distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_distribution|rru distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;2;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;2;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
rru;;36;;;;;36;;rru;4;;;;;;4;;rru;4;;;;;;4;;rru;;;;3;;;3
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3 1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====rru données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_données_intercalaires|rru données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;rru;fx;fc;rru;fx40;fc40;rru;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;12;0;1;12;-1;0;81;163;253;CDS 16s ;;
;0;10;45;244;1;4;21;-2;1;0;406;37;841;1193;
;1;20;50;189;2;2;32;-3;0;0;98;299;972;999;
1;0;30;52;115;3;3;38;-4;27;394;224;147;5s CDS;;
1;0;40;27;83;4;4;43;-5;0;0;92;136;;130;
1;0;50;23;99;5;4;29;-6;2;0;141;287;23s 5s;;
;3;60;34;100;6;1;19;-7;0;5;83;257;2* 119;;
1;1;70;31;82;7;5;11;-8;0;42;170;319;118;;
1;3;80;24;87;8;5;22;-9;0;0;86;43;116;;
1;5;90;29;93;9;6;14;-10;3;6;738;115;16s tRNA;;atc
;5;100;30;96;10;11;15;-11;4;22;71;239;180;;
;2;110;38;64;11;7;34;-12;0;0;117;217;178;;
2;2;120;27;67;12;7;30;-13;0;4;131;283;180;;
2;1;130;30;59;13;2;26;-14;2;11;98;139;180;;
3;1;140;25;67;14;2;26;-15;1;0;150;116;tRNA 23s;;gca
2;3;150;27;56;15;8;13;-16;1;2;284;70;347;;
;1;160;27;60;16;3;13;-17;3;11;85;164;346;;
2;3;170;28;64;17;9;16;-18;0;0;63;396;347;;
3;1;180;16;46;18;7;9;-19;1;4;12;123;347;;
1;1;190;32;36;19;3;10;-20;4;3;261;295;5s tRNA;;
;0;200;24;42;20;2;12;-21;1;0;175;178;96;;atgf
;1;210;18;27;21;8;5;-22;1;0;215;126;95;;atgf
1;1;220;21;35;22;8;12;-23;1;1;186;449;95;;atgf
1;1;230;15;32;23;4;11;-24;0;0;150;171;tRNA tRNA;;intra
1;2;240;15;24;24;8;9;-25;1;1;89;166;4*66;;atc gca
;0;250;19;20;25;5;16;-26;2;2;73;90;tRNA tRNA;;
2;0;260;16;27;26;2;8;-27;1;0;202;140;202;;gcc
1;2;270;18;15;27;5;13;-28;0;0;75;77;**;;gcc
;0;280;13;20;28;4;16;-29;1;2;354;387;81;;tgc
2;1;290;17;14;29;3;14;-30;0;0;151;27;**;;aac
2;0;300;17;12;30;5;11;-31;0;2;343;224;27;;gga
;0;310;15;18;31;1;9;-32;0;1;93;187;**;;tac
1;0;320;14;8;32;4;10;-33;0;0;57;179;165;;acc
;0;330;9;6;33;3;7;-34;0;1;127;148;**;;acc
;0;340;7;12;34;2;11;-35;1;0;430;269;;;
;1;350;10;7;35;3;4;-36;0;0;103;;;;
;1;360;11;3;36;3;7;-37;0;0;60;;;;
;0;370;10;10;37;3;10;-38;1;0;237;;;;
;0;380;3;6;38;5;6;-39;0;0;234;;;;
1;0;390;4;5;39;1;9;-40;2;0;262;;;;
1;0;400;5;4;40;2;10;-41;1;2;56;;;;
1;5;reste;90;70;reste;792;1493;-42;0;0;84;;;;
35;48;total;967;2136;total;967;2136;-43;0;1;407;;;;
34;43;diagr;876;2054;diagr;174;631;-44;0;0;163;;;;
1;1; t30;147;548;;;;-45;1;0;95;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;103;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;721;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;118;;;;
;x;966;74;1;1041;;;-49;1;0;;;;;
;c;2124;609;12;2745;;;-50;1;0;;;;;
;;;;;3786;160;;reste;9;11;;;;;
;;;;;;3946;;total;74;609;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====rru autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_autres_intercalaires_aas|rru autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;rru;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;16232;16852;163;*;
;comp;tRNA;17016;17102;253;*;ctg
fin;;CDS;17356;18378;;0;
deb;;CDS;117072;117287;37;*;
;comp;tRNA;117325;117401;299;*;agg
fin;;CDS;117701;123022;;;
deb;comp;CDS;149921;151093;147;*;
;;tRNA;151241;151317;136;*;cgg
fin;comp;CDS;151454;152929;;0;
deb;;CDS;189941;191668;841;*;
;;rRNA;192510;194008;180;*;1477
;;tRNA;194189;194265;66;*;atc
;;tRNA;194332;194407;347;*;gca
;;rRNA;194755;197527;119;*;2758
;;rRNA;197647;197761;96;*;115
;;tRNA;197858;197934;287;*;atgf
deb;comp;CDS;198222;198455;222;*;
;;rpr;198678;199866;145;*;
fin;comp;CDS;200012;200305;;;
deb;comp;CDS;211593;213335;261;*;
;;rpr;213597;214174;128;*;
fin;comp;CDS;214303;215160;;;
deb;comp;CDS;305449;306648;257;*;
;;tRNA;306906;306979;319;*;cag
fin;comp;CDS;307299;308303;;;
deb;comp;CDS;322896;323693;406;*;
;comp;tRNA;324100;324174;98;*;caa
fin;comp;CDS;324273;325601;;;
deb;;CDS;362552;362881;224;*;
;;tRNA;363106;363181;202;*;gcc
;;tRNA;363384;363459;43;*;gcc
fin;comp;CDS;363503;364531;;;
deb;;CDS;407067;407606;92;*;
;;tRNA;407699;407790;141;*;agc
fin;;CDS;407932;408774;;0;
deb;;CDS;419952;420275;57;*;
;;rpr;420333;422803;228;*;
fin;comp;CDS;423032;423388;;0;
deb;;CDS;466945;467925;115;*;
;comp;tRNA;468041;468126;83;*;tta
fin;comp;CDS;468210;468458;;;
deb;;CDS;529650;529988;67;*;
;;rpr;530056;530553;180;*;
fin;comp;CDS;530734;534255;;0;
deb;comp;CDS;536858;537154;111;*;
;;regulatory;537266;537472;38;*;
fin;;CDS;537511;538188;;;
deb;comp;CDS;559038;559457;239;*;
;;tRNA;559697;559772;170;*;aag
fin;;CDS;559943;560608;;0;
deb;;CDS;571949;572881;20;*;
;;regulatory;572902;573134;194;*;
fin;;CDS;573329;575266;;;
deb;comp;CDS;794877;795188;217;*;
;;tRNA;795406;795496;86;*;tcc
fin;;CDS;795583;795846;;;
deb;comp;CDS;908584;910185;1193;*;
;;rRNA;911379;912878;178;*;1477
;;tRNA;913057;913133;66;*;atc
;;tRNA;913200;913275;346;*;gca
;;rRNA;913622;916394;118;*;2758
;;rRNA;916513;916627;95;*;115
;;tRNA;916723;916799;738;*;atgf
fin;;CDS;917538;921860;;0;
deb;;CDS;988887;989177;204;*;
;;rpr;989382;991847;533;*;
fin;comp;CDS;992381;992809;;;
deb;comp;CDS;1144656;1145123;314;*;
;comp;ncRNA;1145438;1145866;15;*;
fin;comp;CDS;1145882;1146607;;;
deb;;CDS;1159249;1160091;71;*;
;;tRNA;1160163;1160238;117;*;gag
fin;;CDS;1160356;1160613;;0;
deb;;CDS;1339162;1340364;168;*;
;;regulatory;1340533;1340749;238;*;
fin;;CDS;1340988;1342007;;;
deb;comp;CDS;1362782;1363687;177;*;
;;rpr;1363865;1364439;208;*;
fin;comp;CDS;1364648;1365022;;;
deb;comp;CDS;1464820;1465122;283;*;
;;tRNA;1465406;1465495;139;*;tcg
fin;comp;CDS;1465635;1466303;;;
deb;comp;CDS;1499517;1501538;136;*;
;comp;regulatory;1501675;1501900;100;*;
fin;;CDS;1502001;1504436;;;
deb;;CDS;1578910;1579551;1039;*;
;;rpr;1580591;1581961;284;*;
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;;rpr;1694053;1695967;193;*;
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deb;comp;CDS;1706399;1707355;230;*;
;;regulatory;1707586;1707782;93;*;
fin;;CDS;1707876;1709765;;;
deb;;CDS;1791953;1792159;116;*;
;comp;tRNA;1792276;1792351;131;*;gaa
fin;comp;CDS;1792483;1792689;;;
deb;;CDS;1824299;1825738;98;*;
;;tRNA;1825837;1825921;150;*;cta
fin;;CDS;1826072;1827415;;;
deb;;CDS;1833133;1833408;284;*;
;;tRNA;1833693;1833768;70;*;gta
fin;comp;CDS;1833839;1835326;;0;
deb;;CDS;1933548;1934138;85;*;
;;tRNA;1934224;1934300;63;*;cca
deb;;CDS;1934364;1934663;12;*;
;;tRNA;1934676;1934752;396;*;aga
fin;comp;CDS;1935149;1939624;;0;
deb;;CDS;1959133;1959858;175;*;
;;tRNA;1960034;1960110;215;*;ccc
fin;;CDS;1960326;1960439;;;
deb;comp;CDS;1996760;1998079;164;*;
;;tRNA;1998244;1998333;261;*;tca
fin;;CDS;1998595;2002550;;0;
deb;comp;CDS;2008544;2008912;206;*;
;;regulatory;2009119;2009340;129;*;
fin;;CDS;2009470;2011794;;;
deb;;CDS;2031997;2032863;123;*;
;comp;tRNA;2032987;2033062;186;*;aaa
fin;comp;CDS;2033249;2033809;;;
deb;comp;CDS;2093327;2093977;295;*;
;;tRNA;2094273;2094346;81;*;tgc
;;tRNA;2094428;2094502;150;*;aac
fin;;CDS;2094653;2094916;;;
deb;comp;CDS;2304404;2305834;89;*;
;comp;tRNA;2305924;2306010;178;*;ctc
fin;;CDS;2306189;2306839;;;
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;;regulatory;2319857;2319989;73;*;
fin;;CDS;2320063;2321928;;;
deb;;CDS;2331183;2331521;73;*;
;;tRNA;2331595;2331671;126;*;atgj
fin;comp;CDS;2331798;2332040;;0;
deb;comp;CDS;2411337;2411804;202;*;
;comp;tRNA;2412007;2412083;75;*;cac
fin;comp;CDS;2412159;2413343;;0;
deb;comp;CDS;2550773;2550985;186;*;
;;regulatory;2551172;2551329;147;*;
fin;;CDS;2551477;2552121;;0;
deb;;CDS;2559473;2560621;36;*;
;;tmRNA;2560658;2560994;131;*;
fin;;CDS;2561126;2561716;;;
deb;;CDS;2667051;2667758;354;*;
;;rpr;2668113;2669657;204;*;
fin;comp;CDS;2669862;2670212;;;
deb;;CDS;2714978;2715835;129;*;
;;rpr;2715965;2716300;262;*;
fin;;CDS;2716563;2717564;;0;
deb;;CDS;2729598;2731271;449;*;
;comp;tRNA;2731721;2731797;95;*;atgf
;comp;rRNA;2731893;2732007;119;*;115
;comp;rRNA;2732127;2734899;347;*;2758
;comp;tRNA;2735247;2735322;66;*;gca
;comp;tRNA;2735389;2735465;180;*;atc
;comp;rRNA;2735646;2737144;972;*;1477
fin;comp;CDS;2738117;2739718;;0;
deb;comp;CDS;2959802;2961874;354;*;
;comp;tRNA;2962229;2962303;171;*;gtc
fin;;CDS;2962475;2963359;;;
deb;comp;CDS;3124836;3125033;151;*;
;comp;tRNA;3125185;3125260;343;*;tgg
deb;comp;CDS;3125604;3126794;93;*;
;comp;tRNA;3126888;3126961;27;*;gga
;comp;tRNA;3126989;3127074;166;*;tac
deb;;CDS;3127241;3128158;57;*;
;;tRNA;3128216;3128291;127;*;aca
fin;;CDS;3128419;3128652;;;
deb;comp;CDS;3193350;3194507;430;*;
;comp;tRNA;3194938;3195013;103;*;ttc
fin;comp;CDS;3195117;3195512;;;
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;comp;tRNA;3322206;3322281;60;*;atgi
fin;comp;CDS;3322342;3324432;;;
deb;comp;CDS;3377932;3378114;140;*;
;;tRNA;3378255;3378329;165;*;acc
;;tRNA;3378495;3378569;237;*;acc
deb;;CDS;3378807;3379370;234;*;
;;tRNA;3379605;3379681;77;*;gac
fin;comp;CDS;3379759;3380517;;;
deb;comp;CDS;3399207;3399494;262;*;
;comp;tRNA;3399757;3399833;56;*;ccg
fin;comp;CDS;3399890;3400915;;0;
deb;;CDS;3490378;3491148;84;*;
;;tRNA;3491233;3491307;407;*;gtg
fin;;CDS;3491715;3492080;;;
deb;comp;CDS;3514107;3515234;56;*;
;comp;regulatory;3515291;3515396;4;*;
;comp;regulatory;3515401;3515512;88;*;
fin;comp;CDS;3515601;3516149;;0;
deb;;CDS;3523910;3524125;371;*;
;;rpr;3524497;3525372;79;*;
fin;comp;CDS;3525452;3526372;;;
deb;comp;CDS;3705744;3706985;56;*;
;comp;regulatory;3707042;3707118;399;*;
fin;;CDS;3707518;3707919;;;
deb;comp;CDS;3719367;3719753;163;*;
;comp;tRNA;3719917;3719990;95;*;ggg
fin;comp;CDS;3720086;3720859;;;
deb;;CDS;3805869;3806813;130;*;
;comp;rRNA;3806944;3807058;116;*;115
;comp;rRNA;3807175;3809947;347;*;2758
;comp;tRNA;3810295;3810370;66;*;gca
;comp;tRNA;3810437;3810513;180;*;atc
;comp;rRNA;3810694;3812192;999;*;1477
fin;;CDS;3813192;3814118;;;
deb;comp;CDS;3824154;3825827;103;*;
;comp;tRNA;3825931;3826007;387;*;cgt
fin;;CDS;3826395;3827531;;0;
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;comp;ncRNA;3998598;3998695;106;*;
fin;comp;CDS;3998802;3999287;;0;
deb;;CDS;4021982;4023163;27;*;
;comp;tRNA;4023191;4023277;224;*;ttg
fin;;CDS;4023502;4023855;;0;
deb;comp;CDS;4058818;4059117;187;*;
;;tRNA;4059305;4059380;179;*;gcg
fin;comp;CDS;4059560;4060126;;;
deb;comp;CDS;4105626;4107317;721;*;
;comp;tRNA;4108039;4108113;148;*;acg
fin;;CDS;4108262;4108843;;0;
deb;comp;CDS;4261100;4262038;269;*;
;;tRNA;4262308;4262382;118;*;ggc
fin;;CDS;4262501;4263136;;;
&lt;/pre&gt;

====rru intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_entre_cds|rru intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
rru;27.1.21 paris;NCBI;10.3.20;;;;;;;;;
rru;intercalaires;total;%;intercalaires;moyennes;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;frequencez
;'''négatif;683;18.0;'''négatif ;-8;15;-73 à -1;'''4 352 825;-1;683;610;1
;'''zéro;13;0.3;;;;;'''intercals;0;13;620;0
;'''1 à 200;2368;62.5;'''0 à 200;78;58;;'''429 144;5;180;630;5
;'''201 à 370;535;14.1;'''201 à 370;268;46;;'''9.9%;10;109;640;6
;'''371 à 600;139;3.7;'''371 à 600;453;60;;;15;155;650;1
;'''601 à max;48;1.3;'''601 à 1028;733;105;;;20;84;660;4
;'''total 3786;&lt;201;80.9;'''total 3779;112;136;-73 à 995;;25;86;670;3
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;81;680;1
3818575;1469;-1;683;-70;8;;0;13;35;54;690;2
844364;995;0;13;-60;5;;-1;°81;40;56;700;1
3816901;954;1;25;-50;8;;-2;1;45;59;710;1
3134490;938;2;34;-40;8;;-3;0;50;63;720;0
3477618;929;3;°41;-30;6;'''min à -1;-4;°421;55;67;730;0
1097019;885;4;°47;-20;21;683;-5;0;60;67;740;3
3856065;884;5;°33;-10;75;18.0%;-6;2;65;61;750;0
566184;881;6;20;0;565;;-7;5;70;52;760;1
1833839;873;7;16;10;289;;-8;°42;75;59;770;2
3136049;866;8;°27;20;239;;-9;0;80;52;780;3
2475546;802;9;20;30;167;;-10;9;85;58;790;3
93164;788;10;26;40;110;;-11;°26;90;64;800;0
409696;787;11;°41;50;122;;-12;0;95;51;810;1
400635;785;12;37;60;134;;-13;4;100;75;820;0
1366462;777;13;28;70;113;;-14;°13;105;49;830;0
3456663;777;14;°28;80;111;;-15;1;110;53;840;0
3312945;771;15;21;90;122;'''1 à 100;-16;3;115;49;850;0
550038;769;16;16;100;126;1533;-17;°14;120;45;860;0
2493887;767;17;°25;110;102;41%;-18;0;125;44;870;1
1410707;755;18;16;120;94;;-19;5;130;45;880;1
1423514;739;19;13;130;89;;-20;°7;135;48;890;3
2688282;734;20;°14;140;92;;-21;1;140;44;900;0
3627241;732;21;13;150;83;;-22;1;145;41;910;0
2706640;702;22;°20;160;87;;-23;°2;150;42;920;0
3937050;697;23;15;170;92;;-24;0;155;44;930;1
1011650;686;24;17;180;62;;-25;2;160;43;940;1
742860;682;25;°21;190;68;'''1 à 200;-26;°4;165;42;950;0
3424033;675;26;10;200;66;2368;-27;1;170;50;960;1
139185;669;27;18;210;45;62.5%;-28;0;175;31;970;0
880072;663;28;°20;220;56;;-29;°3;180;31;980;0
1976647;662;29;17;230;47;;-30;0;185;28;990;0
2640270;659;30;16;240;39;;-31;2;190;40;1000;1
90214;657;31;10;250;39;;-32;1;195;39;1010;0
961964;656;32;°14;260;43;;;664;200;27;1020;0
1209394;652;33;10;270;33;'''0 à 200;reste;32;205;19;1030;0
2536913;650;34;13;280;33;2381;total;696;210;26;1040;0
2591508;639;35;7;290;31;;;;215;25;1050;0
55947;637;36;10;300;29;;intercal;&lt;u&gt;frequencef;220;31;1060;0
1786743;636;37;°13;310;33;;600;3738;225;25;1070;0
2231609;636;38;11;320;22;;620;1;230;22;1080;0
3609912;633;39;10;330;15;;640;11;235;18;1090;0
3187318;631;40;°12;340;19;;660;5;240;21;1100;0
;;reste;2285;350;17;;680;4;245;24;1110;0
;;total;3786;360;14;'''201 à 370;700;3;250;15;1120;0
;;;;370;20;535;720;1;255;21;1130;0
;;;;380;9;14.1%;740;3;260;22;1140;0
;;;;390;9;;760;1;265;23;1150;0
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;400;9;;780;5;270;10;1160;0
2068001;-137;shift2;1009;410;14;;800;3;275;15;1170;0
651352;-122;comp;;420;14;;820;1;280;18;1180;0
2462962;-120;comp;;430;9;;840;0;285;13;1190;0
1155908;-106;comp;;440;4;;860;0;290;18;1200;0
2381188;-104;comp;;450;15;;880;2;295;14;reste;1
3871151;-104;comp;;460;5;;900;3;300;15;total;3786
4292550;-73;shift2;662;470;5;'''371 à 600;920;0;305;18;;
664620;-70;comp;;480;4;139;940;2;310;15;;
3822351;-68;shift2;682;490;4;3.7%;960;1;315;10;;
3867765;-65;shift2;451;500;5;;980;0;320;12;;
1091959;-64;shift2;1268;510;7;;1000;1;325;8;;
3289914;-62;shift2;;520;1;;;47;330;7;;
1568904;-61;shift2;;530;3;;;;335;11;;
465562;-59;comp;;540;4;;;;340;8;;
2309068;-59;shift2;;550;7;;;;345;12;;
780196;-58;shift2;;560;2;;;;350;5;;
2759874;-55;comp;;570;1;;;;355;7;;
3267314;-53;shift2;;580;5;'''601 à max;;;360;7;;
210683;-52;shift2;;590;1;48;;;365;7;;
1365051;-52;shift2;;600;2;1.3%;;;370;13;;
622208;-50;comp;;reste;48;;reste;1;reste;187;;
2342888;-49;comp;;total;3786;;total;3786;total;3786;;
&lt;/pre&gt;

====rru  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_positifs_S+|rru intercalaires positifs S+]]
*Légende: 
*Tableaux
&lt;pre&gt;
rru. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
spl;min10;1071;2215;3286;884;735;784;49;-353;-202;172;;;
rru;min40;874;2056;2930;829;193;611;418;722;792;861;;;
mja;min30;406;1047;1453;776;326;571;245;844;857;881;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
37;270;0.14;1313;2900;1;6;9;143;69;683;-342;;;
169;266;0.64;1037;2749;1;4;71;222;175;630;17;;;
239;405;0.59;495;1234;20;9;113;132;113;474;502;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
rru;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-13;90;-272;53;818;231;min50;-34;275;-804;94;878;270;min40
31 à 400;12;-97;135;28;833;269;2 parties;13;-61;-91;52;957;156;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;103;46;-;798;dte;20;Sf;181;62;-;739;poly;139;SF
31 à 400;86;41;-;797;dte;36;tf;137;50;-;916;dte;41;tf
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;0.017;;;;;
41-n;0.829;0.193;0.611;;;;;;;;;;;
1-n;0.861;0.722;0.792;;;;;;;;;14.8.21 Paqris;;
rru;fx;fc;;rru;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;rru;Sx-;Sc-
0;1;12;;0;1;6;0;1;12;&gt;0;962;-1;0;81
10;47;242;;10;54;118;1;4;21;&lt;0;74;-2;1;0
20;50;189;;20;57;92;2;3;31;zéro;1;-3;0;0
30;51;116;;30;58;56;3;3;38;total;1037;-4;27;394
40;27;83;;40;31;40;4;4;43;;c;-5;0;0
50;23;99;;50;26;48;5;4;29;&gt;0;2128;-6;2;0
60;34;100;;60;39;49;6;2;18;&lt;0;609;-7;0;5
70;31;82;;70;35;40;7;5;11;zéro;12;-8;0;42
80;24;87;;80;27;42;8;5;22;total;2749;-9;0;0
90;29;93;;90;33;45;9;6;14;;;-10;3;6
100;30;96;;100;34;47;10;11;15;;;-11;4;22
110;38;64;;110;43;31;11;7;34;;;-12;0;0
120;27;67;;120;31;33;12;7;30;;;-13;0;4
130;30;59;;130;34;29;13;2;26;;;-14;2;11
140;25;67;;140;29;33;14;2;26;;;-15;1;0
150;28;55;;150;32;27;15;8;13;;;-16;1;2
160;27;60;;160;31;29;16;3;13;;;-17;3;11
170;28;64;;170;32;31;17;9;16;;;-18;0;0
180;16;46;;180;18;22;18;7;9;;;-19;1;4
190;32;36;;190;37;18;19;3;10;;;-20;4;3
200;23;43;;200;26;21;20;2;12;;;-21;1;0
210;18;27;;210;21;13;21;8;5;;;-22;1;0
220;21;35;;220;24;17;22;8;12;;;-23;1;1
230;15;32;;230;17;16;23;4;11;;;-24;0;0
240;15;24;;240;17;12;24;7;10;;;-25;1;1
250;16;23;;250;18;11;25;5;16;;;-26;2;2
260;16;27;;260;18;13;26;2;8;;;-27;1;0
270;18;15;;270;21;7;27;5;13;;;-28;0;0
280;13;20;;280;15;10;28;4;16;;;-29;1;2
290;17;14;;290;19;7;29;3;14;;;-30;0;0
300;17;12;;300;19;6;30;5;11;;;-31;0;2
310;15;18;;310;17;9;31;1;9;;;-32;0;1
320;14;8;;320;16;4;32;4;10;;;-33;0;0
330;9;6;;330;10;3;33;3;7;;;-34;0;1
340;7;12;;340;8;6;34;2;11;;;-35;1;0
350;10;7;;350;11;3;35;3;4;;;-36;0;0
360;11;3;;360;13;1;36;3;7;;;-37;0;0
370;10;10;;370;11;5;37;3;10;;;-38;1;0
380;3;6;;380;3;3;38;5;6;;;-39;0;0
390;4;5;;390;5;2;39;1;9;;;-40;2;0
400;5;4;;400;6;2;40;2;10;;;-41;1;2
reste;88;72;;;;;reste;787;1498;;;-42;0;0
total;963;2140;;t30;169;266;total;963;2140;;;-43;0;1
diagr;874;2056;;;;;diagr;175;630;;;-44;0;0
 - t30;726;1509;;;;;;;;;;-45;1;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;1;0
;;;;;;;;;;;;-50;1;0
;;;;;;;;;;;;reste;9;11
;;;;;;;;;;;;total;74;609
&lt;/pre&gt;

====rru  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_négatifs_S-|rru intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
rru;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;;;
comp’;0;1;0;25;0;2;0;0;0;3;4;0;0;2;1;1;3;0;1;4;1;1;0;0;1;2;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;4;69;7
continu;81;0;0;396;0;0;5;42;0;6;22;0;4;11;0;2;11;0;4;3;0;0;2;0;1;2;0;0;2;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;1;1;0;1;1;0;1;1;0;0;1;0;0;3;614;13
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;rru;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;1;0;27;0;2;0;0;0;3;4;0;0;2;1;1;3;0;1;4;1;1;1;0;1;2;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;1;1;9;74
;Sc-;81;0;0;394;0;0;5;42;0;6;22;0;4;11;0;2;11;0;4;3;0;0;1;0;1;2;0;0;2;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;11;609
&lt;/pre&gt;

====rru autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_autres_intercalaires|rru autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
rru;autres intercalaires;;adresses1;;;rru;autres intercalaires;;adresses2;;;rru;autres intercalaires;;adresses2;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;16232;163;comp;;deb;°CDS;1362782;177;comp;;deb;°CDS;2729598;449;
;&amp;tRNA;17016;253;comp;;;repeat_region;1363865;208;;;;&amp;tRNA;2731721;95;comp
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;&amp;tRNA;117325;299;comp;;;&amp;tRNA;1465406;139;;;;&amp;tRNA;2735247;66;comp
fin;°CDS;117701;;;;fin;°CDS;1465635;;comp;;;&amp;tRNA;2735389;180;comp
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;&amp;tRNA;151241;136;;;;regulatory;1501675;100;comp;;fin;°CDS;2738117;;comp
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;&amp;tRNA;194189;66;;;fin;°CDS;1582246;;comp;;deb;°CDS;3124836;151;comp
;&amp;tRNA;194332;347;;;deb;°CDS;1692844;162;comp;;;&amp;tRNA;3125185;343;comp
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;&amp;tRNA;197858;287;;;deb;°CDS;1706399;230;comp;;;&amp;tRNA;3126989;166;comp
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;&amp;tRNA;913200;346;;;fin;°CDS;2412159;;comp;;fin;°CDS;3826395;;
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;&amp;tRNA;1160163;117;;;fin;°CDS;2716563;;;;fin;°CDS;4108262;;
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&lt;/pre&gt;
====rru intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_tRNA|rru intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
rru;intercalaires tRNA;;;;;;;;;
comp’;entre aas;;cds aa deb;;cds aa fin ;;deb;fin;;
;;;;;;;;;;
;66;;163;comp’;253;;12;56;'''deb;
;202;comp’;37;comp’;299;;57;60;&lt;201;15
;66;comp’;147;comp’;136;;71;63;total;24
;81;;;;287;;73;75;taux;63%
;66;comp’;257;comp’;319;;84;83;;
;27;;406;;98;;85;86;'''fin;
;165;;224;comp’;43;;89;95;&lt;201;18
;66;;92;;141;;92;98;total;25
;;comp’;115;;83;;93;103;taux;72%
;;comp’;239;;170;;98;117;;
;;comp’;217;;86;;103;118;'''total;
;;;;;738;;151;127;&lt;201;33
;;;71;;117;;163;131;total;49
;;comp’;283;comp’;139;;163;141;taux;67%
;;comp’;116;;131;;175;150;;
;;;98;;150;;202;150;;
;;;284;comp’;70;;224;170;;
;;;85;;63;;234;186;;
;;;12;;396;;262;215;;
;;;175;;215;;284;237;;
;;comp’;164;comp’;261;;354;287;;
;;comp’;123;;186;;406;343;;
;;comp’;295;;150;;430;396;;
;;;89;comp’;178;;721;407;;
;;;73;comp’;126;;'''-;738;'''comp’;'''cumuls
;;;202;;75;;27;43;;
;;comp’;449;;;;37;70;'''deb;
;;;354;comp’;171;;90;77;&lt;201;10
;;;151;;343;;115;126;total;17
;;;93;comp’;166;;116;136;taux;59%
;;;57;;127;;123;139;;
;;;430;;103;;140;148;'''fin;
;;comp’;90;;60;;147;166;&lt;201;11
;;comp’;140;;237;;164;171;total;17
;;;234;comp’;77;;187;178;taux;65%
;;;262;;56;;217;179;;
;;;84;;407;;239;224;'''total;
;;;163;;95;;257;253;&lt;201;21
;;;103;comp’;387;;269;261;total;34
;;comp’;27;comp’;224;;283;299;taux;62%
;;comp’;187;comp’;179;;295;319;;
;;;721;comp’;148;;449;387;;
;;comp’;269;;118;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;deb;fin;total;;;;;
;;&lt;201;25;29;54;;;;;
;;total;41;42;83;;;;;
;;taux;61%;69%;65%;;;;;
&lt;/pre&gt;

===oan===
====oan opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_opérons|oan opérons]]
&lt;pre&gt;
;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
;oan;;genome;;;;;;;;;
56.1%GC;27.12.19 Paris;16s  4 ;61 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 ;;;;;;;;;;;;
chromosom1;;;;;;;;;;;;
;34057..34446;;cds;;224;224;;;130;;TIGR02300 family protein;*
;34671..34746;;gcc;@1;-40;*-40;;;;;;*
;34707..35480;;cds;;;;;;258;;glutathione S-transferase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;223549..224394;;cds;;164;164;;;282;;3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase CysQ;*
;224559..224635;;ccg;;109;109;;;;;;*
comp;224745..225806;;cds;;;;;;354;;site-specific integrase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;337757..338197;;cds;;158;158;;;147;;DMT family transporter;*
comp;338356..338431;;ttc;;171;171;;;;;;*
comp;338603..338818;;cds;;;;;;72;;DNA gyrase inhibitor YacG;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;344419..344598;;cds;;147;147;;;60;;hp;*
;344746..344820;;acc;;397;397;;;;;;*
;345218..346030;;cds;;;;;;271;;DUF2189 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;351922..353328;;cds;;167;167;;;469;;deoxyribodipyrimidine photo-lyase;*
comp;353496..353572;;cgt;;159;159;;;;;;*
comp;353732..355285;;cds;;;;;;*518;;HAMP domain-containing histidine kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;725472..726479;;cds;;219;219;;;336;;glycosyltransferase family 4 protein;*
;726699..726773;;caa;;61;61;;;;;;*
comp;726835..727413;;cds;;;;;;193;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;934613..934987;;cds;;333;333;;;125;;transposase;*
comp;935321..935397;;agg;;114;114;;;;;;*
comp;935512..936675;;cds;;;;;;388;;amidohydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1049919..1051202;;cds;;24;24;;;428;;cystathionine gamma-synthase family protein;*
comp;1051227..1051311;;ttg;@2;593;*593;;;;;;*
comp;1051905..1053539;;cds;;;;;;*545;;phosphoethanolamine transferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1081066..1083021;;cds;;998;*998;;;*652;;M23 family metallopeptidase;*
;1084020..1085508;;16s;;268;;;;1489;;;*
;1085777..1085853;;atc;;11;;;11;;;;*
;1085865..1085940;;gca;;39;39;;;;;;*
&gt;comp;1085980..1086168;;cds;@3;38;38;;;63;;P-hp;*
;1086207..1089125;;23s;;186;;;;2919;;;*
;1089312..1089426;;5s;;54;;;;115;;;*
;1089481..1089557;;atgf;;363;363;;;;;;*
;1089921..1090091;;cds;;;;;;57;;LysR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1096454..1096912;;cds;;7;7;;;153;;hp;*
comp;1096920..1097009;;tcg;;352;352;;;;;;*
;1097362..1097751;;cds;;;;;;130;;50S ribosomal protein L21;*
;;;;;;;;;;;;*
;1311344..1311823;;cds;;211;211;;;160;;hp;*
;1312035..1312109;;gag;;88;88;;;;;;*
;1312198..1312467;;cds;;;;;;90;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1344750..1345565;;cds;;677;*677;;;272;;IclR family transcriptional regulator;*
;1346243..1347731;;16s;;268;;;;1489;;;*
;1348000..1348076;;atc;;11;;;11;;;;*
;1348088..1348163;;gca;;39;39;;;;;;*
&gt;comp;1348203..1348391;;cds;;38;38;;;63;;P-hp;*
;1348430..1351348;;23s;;186;;;;2919;;;*
;1351535..1351649;;5s;;54;;;;115;;;*
;1351704..1351780;;atgf;;360;360;;;;;;*
;1352141..1353082;;cds;;;;;;314;;LysR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1354558..1355604;;cds;;85;85;;;349;;polysaccharide deacetylase family protein;*
comp;1355690..1355764;;ggc;;136;136;;;;;;*
comp;1355901..1357280;;cds;;;;;;460;;MFS transporter;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1386666..1387982;;cds;;819;*819;;;439;;hp;*
comp;1388802..1388891;;tcc;;374;374;;;;;;*
;1389266..1389589;;cds;;;;;;108;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1405236..1405859;;cds;;139;139;;;208;;5,6-dimethylbenzimidazole synthase;*
comp;1405999..1406085;;ctg;;146;146;;;;;;*
comp;1406232..1406852;;cds;;;;;;207;;2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1604615..1604854;;cds;;26;26;;;80;;hp;*
comp;1604881..1604958;;atgj;;10;10;;;;;;*
comp;1604969..1605214;;cds;;;;;;82;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1639492..1640289;;cds;;-44;*-44;;;266;;hp;*
comp;1640246..1640322;;atgj;;55;55;;;;;;*
;1640378..1640572;;cds;;;;;;65;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1778816..1779571;;cds;;385;385;;;252;;SIMPL domain-containing protein;*
;1779957..1780033;;atgi;;265;265;;;;;;*
;1780299..1780844;;cds;;;;;;182;;sigma-70 family RNA polymerase sigma factor;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;;1945985..1946374;;cds;;721;*721;;;130;;P-hp;*
comp;1947096..1947171;;aag;;-38;*-38;;;;;;*
comp;1947134..1947319;;cds;;;;;;62;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2014813..2015097;;cds;;103;103;;;95;;DUF2218 domain-containing protein;*
comp;2015201..2015275;;gaa;+;146;;146;;;;;*
comp;2015422..2015496;;gaa;2 gaa;200;200;;;;;;*
comp;2015697..2016962;;cds;;;;;;422;;DUF882 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2040234..2040453;;cds;;91;91;;;73;;hp;*
;2040545..2040629;;tac;;24;;24;;;;;*
;2040654..2040727;;gga;;6;6;;;;;;*
comp;2040734..2040916;;cds;;-50;*-50;;;61;;hp;*
;2040867..2042042;;cds;;65;65;;;392;;elongation factor Tu;*
;2042108..2042183;;tgg;;420;*420;;;;;;*
;2042604..2042804;;cds;;;;;;67;;preprotein translocase subunit SecE;*
;;;;;;;;;;;;*
;2168416..2168658;;cds;;28;28;;;81;;PepSY domain-containing protein;*
comp;2168687..2168760;;ggg;;289;289;;;;;;*
;2169050..2169946;;cds;;;;;;299;;lipid kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2244184..2245050;;cds;;112;112;;;289;;mechanosensitive ion channel;*
comp;2245163..2245248;;tta;;200;200;;;;;;*
;2245449..2246705;;cds;;;;;;419;;threonine ammonia-lyase IlvA;*
;;;;;;;;;;;;*
;2267888..2268835;;cds;;305;305;;;316;;patatin family protein;*
;2269141..2269225;;ctc;;66;66;;;;;;*
comp;2269292..2270185;;cds;;;;;;298;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2332394..2333530;;cds;;393;393;;;379;;glycosyltransferase family 2 protein;*
comp;2333924..2334000;;cgg;;169;169;;;;;;*
comp;2334170..2335792;;cds;;;;;;*541;;ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2339396..2340514;;cds;;1650;*1650;;;373;;porin;*
comp;2342165..2342239;;gtg;;178;178;;;;;;*
comp;2342418..2344424;;cds;;;;;;*669;;murein L,D-transpeptidase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2369668..2370441;;cds;;152;152;;;258;;NAD kinase;*
;2370594..2370669;;aca;;987;*987;;;;;;*
comp;2371657..2372076;;cds;;;;;;140;;SUF system Fe-S cluster assembly protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2442729..2443145;;cds;;299;299;;;139;;hp;*
comp;2443445..2443519;;atgf;;70;70;;;;;;*
&lt;comp;2443590..2443799;;cds;;;;;;70;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2449947..2451311;;cds;;156;156;;;455;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;2451468..2451550;;cta;;236;236;;;;;;*
comp;2451787..2452356;;cds;;;;;;190;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2548914..2550098;;cds;;513;*513;;;395;;alpha/beta hydrolase;*
comp;2550612..2550688;;gac;+;245;;245;;;;;*
comp;2550934..2551010;;gac;2 gac;328;328;;;;;;*
;2551339..2551956;;cds;;;;;;206;;TetR/AcrR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;2604616..2605908;;cds;;824;*824;;;431;;FAD-binding oxidoreductase;*
comp;2606733..2606808;;gta;;264;264;;;;;;*
comp;2607073..2607996;;cds;;;;;;308;;sugar kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2641040..2641360;;cds;;97;97;;;107;;YnfA family protein;*
;2641458..2641534;;ccc;;94;94;;;;;;*
;2641629..2642357;;cds;;;;;;243;;SDR family oxidoreductase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2696299..2697183;;cds;;54;54;;;295;;transcriptional regulator GcvA;*
comp;2697238..2697314;;aga;;123;123;;;;;;*
comp;2697438..2697743;;cds;;156;156;;;102;;ETC complex I subunit;*
comp;2697900..2697976;;cca;;186;186;;;;;;*
;2698163..2698309;;cds;;;;;;49;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2771579..2772697;;cds;;584;*584;;;373;;porin;*
;2773282..2773372;;agc;;203;203;;;;;;*
;2773576..2774643;;cds;;;;;;356;;porin;*
chromosom2;;;;;;;;;;;;*
;149537..151504;;cds;;355;355;;;*656;;selenocysteine-specific translation elongation factor;*
;151860..151955;;tga;;14;14;;;;;;*
comp;151970..152605;;cds;;;;;;212;;lipase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;298403..299422;;cds;;300;300;;;340;;TerC family protein;*
comp;299723..299796;;cag;;361;361;;;;;;*
comp;300158..300460;;cds;;;;;;101;;DUF1127 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;455428..456111;;cds;;713;*713;;;228;;FkbM family methyltransferase;*
;456825..458313;;16s;;268;;;;1489;;;*
;458582..458658;;atc;;11;;;11;;;;*
;458670..458745;;gca;;39;39;;;;;;*
&gt;comp;458785..458973;;cds;;38;38;;;63;;P-hp;*
;459012..461930;;23s;;186;;;;2919;;;*
;462117..462231;;5s;;54;;;;115;;;*
;462286..462362;;atgf;;-44;*-44;;;;;;*
comp;462319..463974;;cds;;;;;;*552;;recombinase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;572059..572721;;cds;;545;*545;;;221;;response regulator transcription factor;*
comp;573267..573357;;other;@4;620;*620;;;;;;*
comp;573978..575285;;cds;;;;;;436;;SidA/IucD/PvdA family monooxygenase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;611464..611742;;cds;;88;88;;;93;;hp;*
comp;611831..611905;;ggc;;387;387;;;;;;*
;612293..612814;;cds;;;;;;174;;prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;991265..991999;;cds;;217;217;;;245;;alpha/beta hydrolase;*
comp;992217..992306;;tca;;323;323;;;;;;*
;992630..992884;;cds;;;;;;85;;DUF2171 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1031528..1032946;;cds;;607;*607;;;473;;PepSY domain-containing protein;*
comp;1033554..1033629;;aaa;;327;327;;;;;;*
;1033957..1035651;;cds;;;;;;*565;;membrane protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1067405..1068742;;cds;;131;131;;;446;;DNA polymerase IV;*
;1068874..1068947;;tgc;;739;*739;;;;;;*
;1069687..1069905;;cds;;;;;;73;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1081639..1082031;;cds;;103;103;;;131;;hp;*
comp;1082135..1082209;;aac;;168;168;;;;;;*
;1082378..1082653;;cds;;;;;;92;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1333375..1333587;;cds;;209;209;;;71;;hp;*
comp;1333797..1333873;;cac;;352;352;;;;;;*
;1334226..1337393;;cds;;;;;;*1056;;PAS domain S-box protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1473437..1474405;;cds;;269;269;;;323;;nitronate monooxygenase;*
;1474675..1474750;;acg;;156;156;;;;;;*
&gt;comp;1474907..1475239;;cds;;;;;;111;;DNA adenine methylase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1597496..1597666;;cds;;363;363;;;57;;LysR family transcriptional regulator;*
comp;1598030..1598106;;atgf;;54;;;;;;;*
comp;1598161..1598275;;5s;;186;;;;115;;;*
comp;1598462..1601380;;23s;;38;38;;;2919;;;*
&lt;;1601419..1601607;;cds;;39;39;;;63;;P-hp;*
comp;1601647..1601722;;gca;;11;;;11;;;;*
comp;1601734..1601810;;atc;;268;;;;;;;*
comp;1602079..1603567;;16s;;743;*743;;;1489;;;*
;1604311..1605192;;cds;;;;;;294;;ATPase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1720169..1720531;;cds;;113;113;;;121;;response regulator;*
;1720645..1720719;;gtc;;465;*465;;;;;;*
;1721185..1721838;;cds;;;;;;218;;protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase;*
&lt;/pre&gt;

====oan cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_cumuls|oan cumuls]]
&lt;pre&gt;
oan cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;4;1;;4;1;5;1;;100;25;1;0
;16atcgca-cds;4;20;;;50;15;40;;200;20;30;0
;-;;40;1;;100;12;80;;300;21;60;4
;-;;60;;;150;12;120;;400;15;90;18
;max a;3;80;;;200;15;160;;500;11;120;8
;a doubles;0;100;;;250;7;200;;600;5;150;9
;spéciaux;0;120;;;300;6;240;;700;3;180;3
;total aas;12;140;;;350;5;280;;800;0;210;6
sans ;opérons;45;160;1;;400;12;320;;900;0;240;4
;1 aa;42;180;;;450;1;360;;1000;0;270;6
;max a;2;200;;;500;1;400;;1100;1;300;8
;a doubles;2;;1;;;16;;;;0;;35
;total aas;48;;3;4;;107;;0;;101;;101
total aas;;60;;;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;138;11;;258;;;;256;;
;;;variance;111;0;;268;;;;180;;
sans jaune;;;moyenne;;;;174;;;;218;;150
;;;variance;;;;117;;;;132;;81
&lt;/pre&gt;

====oan blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_blocs|oan blocs]]
&lt;pre&gt;
oan blocs;;;;
Constantes;;;;
cds;;intercal;cdsa;
16s;;268;1489;
atc;;11;;
gca;;39;;
cds;;38;63;P-hp
23s;;186;2919;
5s;;54;115;
atgf;;;;
cds;;;;
Variations;;;;
blocs 16s;;intercal;cdsa;
1084020..1085508;;998;652;M23 family metallopeptidase
;;363;57;LysR family transcriptional regulator
;;;;
1346243..1347731;;677;272;IclR family transcriptional regulator
;;360;314;LysR family transcriptional regulator
;;;;
456825..458313;;713;228;FkbM family methyltransferase
;;-44;552;recombinase family protein
;;;;
1602079..1603567;;743;294;ATPase
;;363;57;LysR family transcriptional regulator
&lt;/pre&gt;
*Détails
&lt;pre&gt;
cds;743’;713;677;998’
16s;268;268;268;268
atc;11;11;11;11
gca;39’;39’;39’;39’
cds;38’;38’;38’;38’
23s;186;186;186;186
5s;54;54;54;54
atgf;363;-44';360;363
cds;;;;
&lt;/pre&gt;

====oan distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_distribution|oan distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;4
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;2;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;2;gga;1;;;;;;;;;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
oan;;41;;;;;41;;oan;6;;;;;;6;;;;;;;;;;;oan;;;;4;;;4
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4 1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====oan1 données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan1_données_intercalaires|oan1 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;oan1;fx;fc;oan1;fx40;fc40;oan1;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;0;0;12;9;0;12;9;-1;0;93;224;109;CDS 16s;;
1;1;10;42;226;1;3;24;-2;1;0;95;147;678;999;
;0;20;29;119;2;4;45;-3;0;0;164;219;23s 5s;;
2;1;30;16;70;3;5;30;-4;22;215;158;24;2* 194;;
;0;40;21;48;4;4;22;-5;0;0;171;7;16s tRNA;;
;0;50;33;45;5;5;21;-6;1;0;397;352;2*273;;atc
1;0;60;43;49;6;5;12;-7;4;3;167;85;tRNA 23s;;
1;2;70;31;61;7;5;10;-8;2;27;159;374;2* 270;;gca
;0;80;28;67;8;3;20;-9;1;0;172;-44;5s tRNA;;
1;1;90;23;43;9;4;14;-10;1;3;333;186;2* 54;;atgf
;3;100;25;51;10;4;28;-11;2;20;114;385;tRNA tRNA;;intra
1;1;110;20;43;11;4;16;-12;2;0;593;721;2* 11;;atc gca
;2;120;12;52;12;2;16;-13;3;3;363;578;tRNA tRNA;;
;1;130;13;45;13;3;15;-14;2;9;211;318;146;;gaa
;3;140;25;36;14;4;19;-15;3;0;88;28;**;;gaa
1;1;150;23;48;15;1;13;-16;0;1;363;289;24;;tac
1;4;160;24;32;16;3;9;-17;2;4;136;197;**;;gga
;3;170;27;33;17;3;9;-18;1;0;819;66;245;;gac
;3;180;14;34;18;3;12;-19;0;1;139;393;**;;gac
2;0;190;24;30;19;4;4;-20;1;6;146;152;;;
1;1;200;12;32;20;2;6;-21;0;1;26;987;;;
;1;210;14;29;21;2;10;-22;0;2;10;328;;;
1;1;220;22;20;22;3;6;-23;0;2;265;824;;;
;1;230;18;19;23;1;11;-24;0;0;103;54;;;
;1;240;15;27;24;2;6;-25;0;0;200;186;;;
;0;250;15;15;25;1;5;-26;1;4;139;584;;;
;0;260;6;12;26;1;4;-27;0;1;65;;;;
;2;270;12;17;27;3;6;-28;0;0;420;;;;
;0;280;8;16;28;0;6;-29;0;2;112;;;;
1;0;290;9;7;29;1;9;-30;0;0;305;;;;
;1;300;12;17;30;2;7;-31;2;0;169;;;;
;1;310;8;12;31;1;3;-32;0;0;1650;;;;
1;0;320;8;5;32;1;4;-33;0;0;178;;;;
1;0;330;13;14;33;1;8;-34;0;0;299;;;;
;1;340;7;14;34;1;9;-35;0;0;70;;;;
;0;350;9;16;35;2;6;-36;1;0;156;;;;
1;0;360;6;5;36;3;2;-37;0;0;236;;;;
;2;370;6;7;37;3;3;-38;0;1;513;;;;
1;0;380;5;8;38;2;9;-39;0;0;264;;;;
1;0;390;7;5;39;4;1;-40;0;0;97;;;;
1;1;400;4;9;40;3;3;-41;0;0;94;;;;
5;5;reste;70;70;reste;651;1045;-42;0;0;123;;;;
26;44;total;771;1517;total;771;1517;-43;0;0;156;;;;
20;39;diagr;689;1438;diagr;108;463;-44;0;0;203;;;;
3;2; t30;87;415;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;759;55;12;826;;;-49;0;0;;;;;
;c;1508;402;9;1919;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;2745;105;;reste;3;4;;;;;
;;;;;;2850;;total;55;402;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====oan1 autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan1_autres_intercalaires_aas|oan1 autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;oan1;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;aas
deb;comp;CDS;20987;21391;93;
;;ncRNA;21485;21582;117;
fin;;CDS;21700;23517;;
deb;;CDS;34057;34446;224;
;;tRNA;34671;34746;95;gcc
fin;;CDS;34842;35480;;
deb;comp;CDS;36750;37604;244;
;comp;regulatory;37849;38001;259;
fin;;CDS;38261;40249;;
deb;;CDS;223549;224394;164;
;;tRNA;224559;224635;109;ccg
fin;comp;CDS;224745;225806;;
deb;comp;CDS;295366;296238;86;
;comp;regulatory;296325;296481;233;
fin;;CDS;296715;298838;;
deb;comp;CDS;337757;338197;158;
;comp;tRNA;338356;338431;171;ttc
fin;comp;CDS;338603;338818;;
deb;comp;CDS;344419;344598;147;
;;tRNA;344746;344820;397;acc
fin;;CDS;345218;346030;;
deb;comp;CDS;351922;353328;167;
;comp;tRNA;353496;353572;159;cgt
fin;comp;CDS;353732;355285;;
deb;comp;CDS;424109;425302;91;
;comp;regulatory;425394;425473;298;
fin;;CDS;425772;426863;;
deb;comp;CDS;725472;726479;219;
;;tRNA;726699;726773;172;caa
fin;;CDS;726946;729048;;
deb;comp;CDS;934613;934987;333;
;comp;tRNA;935321;935397;114;agg
fin;comp;CDS;935512;936675;;
deb;;CDS;1049919;1051202;24;
;comp;tRNA;1051227;1051311;593;ttg
fin;comp;CDS;1051905;1053539;;
deb;comp;CDS;1081066;1083021;999;
;;rRNA;1084021;1085503;273;1483
;;tRNA;1085777;1085853;11;atc
;;tRNA;1085865;1085940;270;gca
;;rRNA;1086211;1089117;194;2907
;;rRNA;1089312;1089426;54;115
;;tRNA;1089481;1089557;363;atgj   f
fin;;CDS;1089921;1090091;;
deb;;CDS;1096454;1096912;7;
;comp;tRNA;1096920;1097009;352;tcg
fin;;CDS;1097362;1097751;;
deb;comp;CDS;1202605;1203609;41;
;comp;regulatory;1203651;1203765;95;
fin;;CDS;1203861;1204517;;
deb;;CDS;1263516;1263881;88;
;;ncRNA;1263970;1264128;99;
fin;;CDS;1264228;1265223;;
deb;;CDS;1311344;1311823;211;
;;tRNA;1312035;1312109;88;gag
fin;;CDS;1312198;1312467;;
deb;;CDS;1344750;1345565;678;
;;rRNA;1346244;1347726;273;1483
;;tRNA;1348000;1348076;11;atc
;;tRNA;1348088;1348163;270;gca
;;rRNA;1348434;1351340;194;2907
;;rRNA;1351535;1351649;54;115
;;tRNA;1351704;1351780;363;atgj   f
fin;;CDS;1352144;1353082;;
deb;;CDS;1354558;1355604;85;
;comp;tRNA;1355690;1355764;136;ggc
fin;comp;CDS;1355901;1357280;;
deb;comp;CDS;1386666;1387982;819;
;comp;tRNA;1388802;1388891;374;tcc
fin;;CDS;1389266;1389589;;
deb;comp;CDS;1405236;1405859;139;
;comp;tRNA;1405999;1406085;146;ctg
fin;comp;CDS;1406232;1406852;;
deb;comp;CDS;1604615;1604854;26;
;comp;tRNA;1604881;1604958;10;atgj  j
fin;comp;CDS;1604969;1605214;;
deb;;CDS;1639492;1640289;-44;
;comp;tRNA;1640246;1640322;186;atgj  j
fin;;CDS;1640509;1641465;;
deb;comp;CDS;1778816;1779571;385;
;;tRNA;1779957;1780033;265;atgi
fin;;CDS;1780299;1780844;;
deb;;CDS;1818096;1818755;175;
;;ncRNA;1818931;1819358;205;
fin;;CDS;1819564;1820313;;
deb;;CDS;1881047;1881754;33;
;comp;tmRNA;1881788;1882155;188;
fin;;CDS;1882344;1882655;;
deb;;CDS;1917737;1918849;108;
;;regulatory;1918958;1919182;154;
fin;;CDS;1919337;1921202;;
deb;;CDS;1945985;1946374;721;
;comp;tRNA;1947096;1947171;578;aag
fin;;CDS;1947750;1948412;;
deb;;CDS;1973835;1975286;48;
;;regulatory;1975335;1975573;50;
fin;;CDS;1975624;1975812;;
deb;comp;CDS;2014813;2015097;103;
;comp;tRNA;2015201;2015275;146;gaa
;comp;tRNA;2015422;2015496;200;gaa
fin;comp;CDS;2015697;2016962;;
deb;comp;CDS;2039366;2040226;318;
;;tRNA;2040545;2040629;24;tac
;;tRNA;2040654;2040727;139;gga
deb;;CDS;2040867;2042042;65;
;;tRNA;2042108;2042183;420;tgg
fin;;CDS;2042604;2042804;;
deb;;CDS;2168416;2168658;28;
;comp;tRNA;2168687;2168760;289;ggg
fin;;CDS;2169050;2169946;;
deb;comp;CDS;2244184;2245050;112;
;comp;tRNA;2245163;2245248;197;tta
fin;;CDS;2245446;2246705;;
deb;;CDS;2267888;2268835;305;
;;tRNA;2269141;2269225;66;ctc
fin;comp;CDS;2269292;2270185;;
deb;;CDS;2332394;2333530;393;
;comp;tRNA;2333924;2334000;169;cgg
fin;comp;CDS;2334170;2335792;;
deb;comp;CDS;2339396;2340514;1650;
;comp;tRNA;2342165;2342239;178;gtg
fin;comp;CDS;2342418;2344424;;
deb;comp;CDS;2369668;2370441;152;
;;tRNA;2370594;2370669;987;aca
fin;comp;CDS;2371657;2372076;;
deb;comp;CDS;2442729;2443145;299;
;comp;tRNA;2443445;2443519;70;atgj   f
fin;comp;CDS;2443590;2443781;;
deb;comp;CDS;2449947;2451311;156;
;comp;tRNA;2451468;2451550;236;cta
fin;comp;CDS;2451787;2452356;;
deb;comp;CDS;2548914;2550098;513;
;comp;tRNA;2550612;2550688;245;gac
;comp;tRNA;2550934;2551010;328;gac
fin;;CDS;2551339;2551956;;
deb;;CDS;2604616;2605908;824;
;comp;tRNA;2606733;2606808;264;gta
fin;comp;CDS;2607073;2607996;;
deb;;CDS;2641040;2641360;97;
;;tRNA;2641458;2641534;94;ccc
fin;;CDS;2641629;2642357;;
deb;;CDS;2696299;2697183;54;
;comp;tRNA;2697238;2697314;123;aga
deb;comp;CDS;2697438;2697743;156;
;comp;tRNA;2697900;2697976;186;cca
fin;;CDS;2698163;2698309;;
deb;comp;CDS;2771579;2772697;584;
;;tRNA;2773282;2773372;203;agc
fin;;CDS;2773576;2774643;;
&lt;/pre&gt;

====oan2 données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan2_données_intercalaires|oan2 données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;oan2;fx;fc;oan2;fx40;fc40;oan2;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;0;0;2;1;0;2;1;-1;0;48;355;14;CDS 16s ;;
;0;10;29;159;1;2;26;-2;1;0;300;-44;714;744;
1;0;20;25;104;2;3;23;-3;1;0;361;387;23s 5s;;
;0;30;9;49;3;8;18;-4;12;195;545;217;2* 194;;
;0;40;21;49;4;4;17;-5;0;0;620;323;16s tRNA;;
;0;50;15;25;5;2;14;-6;0;0;88;327;2* 273;;atc
;0;60;17;29;6;3;4;-7;0;2;607;103;tRNA 23s;;
;0;70;13;45;7;5;8;-8;1;16;131;168;2* 270;;gca
;0;80;13;35;8;1;15;-9;0;0;739;352;5s tRNA;;
;1;90;18;32;9;1;12;-10;0;2;209;156;2* 54;;atgf
;0;100;13;31;10;0;22;-11;0;8;269;;tRNA tRNA;;intra
1;0;110;25;29;11;4;26;-12;1;0;363;;2* 11;;atc gca
;1;120;7;32;12;4;19;-13;1;0;113;;;;
;0;130;16;20;13;2;12;-14;0;6;465;;;;
;1;140;12;30;14;2;10;-15;0;0;;;;;
;0;150;10;17;15;2;6;-16;2;0;;;;;
1;0;160;15;20;16;0;6;-17;0;1;;;;;
1;0;170;13;14;17;4;3;-18;1;0;;;;;
;0;180;13;12;18;3;4;-19;1;0;;;;;
;0;190;11;18;19;2;8;-20;0;3;;;;;
;0;200;10;10;20;2;10;-21;1;0;;;;;
;1;210;9;7;21;1;6;-22;0;0;;;;;
1;0;220;10;10;22;2;5;-23;0;1;;;;;
;0;230;5;16;23;0;7;-24;0;0;;;;;
;0;240;6;10;24;2;7;-25;0;1;;;;;
;0;250;7;12;25;1;1;-26;0;0;;;;;
;0;260;6;7;26;0;9;-27;1;0;;;;;
;1;270;5;8;27;0;4;-28;0;1;;;;;
;0;280;6;2;28;3;1;-29;0;1;;;;;
;0;290;2;7;29;0;3;-30;0;0;;;;;
;1;300;6;3;30;0;6;-31;0;0;;;;;
;0;310;8;7;31;0;4;-32;0;2;;;;;
;0;320;3;7;32;1;4;-33;0;0;;;;;
2;0;330;7;4;33;3;7;-34;0;0;;;;;
;0;340;4;5;34;0;3;-35;0;1;;;;;
;0;350;8;1;35;1;5;-36;0;0;;;;;
1;1;360;3;4;36;2;9;-37;0;0;;;;;
;2;370;7;3;37;4;6;-38;0;0;;;;;
;0;380;6;2;38;3;3;-39;0;0;;;;;
1;0;390;3;5;39;4;6;-40;0;0;;;;;
;0;400;2;1;40;3;2;-41;2;0;;;;;
;5;reste;40;32;reste;374;552;-42;0;0;;;;;
10;14;total;460;914;total;460;914;-43;0;0;;;;;
9;9;diagr;418;881;diagr;84;361;-44;0;0;;;;;
1;0; t30;63;312;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;1;2;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;458;28;2;488;;;-49;0;0;;;;;
;c;913;292;1;1206;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1694;46;;reste;2;2;;;;;
;;;;;;1740;;total;28;292;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====oan2 autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan2_autres_intercalaires_aas|oan2 autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires ;;oan2;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;149537;151504;355;*;
;;tRNA;151860;151955;14;*;tga
fin;comp;CDS;151970;152605;;;
deb;;CDS;249965;250795;64;*;
;;regulatory;250860;251074;365;*;
fin;;CDS;251440;251661;;;
deb;comp;CDS;298403;299422;300;*;
;comp;tRNA;299723;299796;361;*;cag
fin;comp;CDS;300158;300460;;;
deb;;CDS;455428;456111;714;*;
;;rRNA;456826;458308;273;*;1483
;;tRNA;458582;458658;11;*;atc
;;tRNA;458670;458745;270;*;gca
;;rRNA;459016;461922;194;*;2907
;;rRNA;462117;462231;54;*;115
;;tRNA;462286;462362;-44;*;atgf
fin;comp;CDS;462319;463974;;;
deb;comp;CDS;572059;572721;545;*;
;comp;tRNA;573267;573357;620;*;other
fin;comp;CDS;573978;575285;;;
deb;comp;CDS;611464;611742;88;*;
;comp;tRNA;611831;611905;387;*;ggc
fin;;CDS;612293;612814;;;
deb;;CDS;850872;851594;138;*;
;;regulatory;851733;851842;43;*;
fin;;CDS;851886;852806;;;
deb;;CDS;991265;991999;217;*;
;comp;tRNA;992217;992306;323;*;tca
fin;;CDS;992630;992884;;;
deb;comp;CDS;1031528;1032946;607;*;
;comp;tRNA;1033554;1033629;327;*;aaa
fin;;CDS;1033957;1035651;;;
deb;;CDS;1067405;1068742;131;*;
;;tRNA;1068874;1068947;739;*;tgc
fin;;CDS;1069687;1069905;;;
deb;;CDS;1081639;1082031;103;*;
;comp;tRNA;1082135;1082209;168;*;aac
fin;;CDS;1082378;1082653;;;
deb;comp;CDS;1215924;1217189;597;*;
;;regulatory;1217787;1217947;76;*;
fin;;CDS;1218024;1218500;;;
deb;comp;CDS;1273601;1274704;142;*;
;comp;regulatory;1274847;1274930;495;*;
fin;;CDS;1275426;1275572;;;
deb;comp;CDS;1327333;1328361;180;*;
;comp;regulatory;1328542;1328776;221;*;
fin;;CDS;1328998;1329948;;;
deb;comp;CDS;1333375;1333587;209;*;
;comp;tRNA;1333797;1333873;352;*;cac
fin;;CDS;1334226;1337393;;;
deb;;CDS;1473437;1474405;269;*;
;;tRNA;1474675;1474750;156;*;acg
fin;comp;CDS;1474907;1475239;;;
deb;comp;CDS;1597496;1597666;363;*;
;comp;tRNA;1598030;1598106;54;*;atgf
;comp;rRNA;1598161;1598275;194;*;115
;comp;rRNA;1598470;1601376;270;*;2907
;comp;tRNA;1601647;1601722;11;*;gca
;comp;tRNA;1601734;1601810;273;*;atc
;comp;rRNA;1602084;1603566;744;*;1483
fin;;CDS;1604311;1605192;;;
deb;;CDS;1720169;1720531;113;*;
;;tRNA;1720645;1720719;465;*;gtc
fin;;CDS;1721185;1721838;;;
&lt;/pre&gt;

===abq===
====abq opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_opérons|abq opérons]]
&lt;pre&gt;
;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
;abq;;genome;;;;;;;;;
68.45%GC;29.12.19 Paris;16s  9 ;88 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Azospirillum brasilense strain Az39;;;;;;;;;;;;
chromosome;;;;;;;;;;;;
;125527..126444;;cds;;127;127;;;306;;restriction endonuclease;*
comp;126572..126647;;gcg;;206;206;;;;;;*
;126854..127138;;cds;;;;;;95;;YggT family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;163237..164982;;cds;;175;175;;;582;;hydrogenase maturation nickel metallochaperone HypA;*
;165158..165234;;agg;;59;59;;;;;;*
;165294..166022;;cds;;;;;;243;;SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;188235..189860;;cds;;42;42;;;542;;glycosyltransferase;*
comp;189903..189977;;acg;;81;81;;;;;;*
comp;190059..191987;;cds;;;;;;643;;DNA helicase RecQ;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;250833..251111;;cds;;169;169;;;93;;hp;*
comp;251281..251356;;gcc;;141;141;;;;;;*
comp;251498..251893;;cds;;;;;;132;;TIGR02300 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;458142..458459;;cds;;209;209;;;106;;50S ribosomal protein L21;*
;458669..458758;;tcg;;63;63;;;;;;*
comp;458822..459664;;cds;;;;;;281;;alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;496776..497171;;cds;;162;162;;;132;;cupin domain-containing protein;*
comp;497334..497420;;ttg;;137;137;;;;;;*
;497558..498085;;cds;;;;;;176;;disulfide bond formation protein B;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;615937..616350;;cds;;121;121;;;138;;hp;*
comp;616472..616548;;ccg;+;206;;206;;;;;*
comp;616755..616831;;ccg;2 ccg;109;109;;;;;;*
comp;616941..617957;;cds;;;;;;339;;farnesyltranstransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;748703..749161;;cds;;38;38;;;153;;hp;*
comp;749200..749275;;aca;;91;91;;;;;;*
comp;749367..750221;;cds;;144;144;;;285;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;750366..750451;;tac;;60;;60;;;;;*
;750512..750585;;gga;;81;81;;;;;;*
;750667..751857;;cds;;153;153;;;397;;elongation factor Tu;*
;752011..752086;;tgg;;69;69;;;;;;*
;752156..752353;;cds;;;;;;66;;preprotein translocase subunit SecE;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;794457..795983;;cds;;296;296;;;509;;methyltransferase domain-containing protein;*
;796280..796355;;aag;+;76;;76;;;;;*
;796432..796507;;aag;2 aag;109;109;;;;;;*
comp;796617..797057;;cds;;;;;;147;;MaoC family dehydratase;*
;;;;;;;;;;;;*
;870412..872373;;cds;;159;159;;;654;;RNA polymerase sigma factor RpoD;*
;872533..872608;;atgi;;5;5;;;;;;*
comp;872614..873093;;cds;;134;134;;;160;;GNAT family N-acetyltransferase;*
comp;873228..873304;;cgt;;212;212;;;;;;*
;873517..874023;;cds;;;;;;169;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;931962..933011;;cds;;68;68;;;350;;low specificity L-threonine aldolase;*
;933080..933155;;gag;+;38;;38;;;;;*
;933194..933269;;gag;2 gag;72;72;;;;;;*
comp;933342..934340;;cds;;;;;;333;;transglycosylase SLT domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;997881..998357;;cds;;246;246;;;159;;peptidoglycan-associated lipoprotein Pal;*
comp;998604..998678;;acc;;175;175;;;;;;*
comp;998854..1000815;;cds;;;;;;654;;polysaccharide biosynthesis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1164137..1165048;;cds;;159;159;;;304;;DUF3108 domain-containing protein;*
;1165208..1165282;;gtg;+;132;;132;;;;;*
;1165415..1165489;;gtg;2 gtg;231;231;;;;;;*
;1165721..1165885;;cds;;;;;;55;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1242416..1242919;;cds;;85;85;;;168;;MerR family transcriptional regulator;*
;1243005..1243081;;ccc;;139;139;;;;;;*
comp;1243221..1244999;;cds;;;;;;593;;cyclic nucleotide-binding domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1353398..1353895;;cds;;118;118;;;166;;hp;*
;1354014..1354091;;cca;;49;49;;;;;;*
;1354141..1354437;;cds;;10;10;;;99;;ETC complex I subunit;*
;1354448..1354524;;aga;;443;*443;;;;;;*
;1354968..1355213;;cds;;;;;;82;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1370270..1370500;;cds;;196;196;;;77;;hp;*
comp;1370697..1370772;;aac;@2;220;;220;;;;;*
comp;1370993..1371066;;tgc;;218;218;;;;;;*
;1371285..1371941;;cds;;;;;;219;;protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1427443..1427733;;cds;;236;236;;;97;;YkgJ family cysteine cluster protein;*
comp;1427970..1428085;;5s;;129;;;;116;;;*
comp;1428215..1430967;;23s;;266;;;;2753;;;*
comp;1431234..1431309;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;1431340..1431416;;atc;;108;;;;;;;*
comp;1431525..1433015;;16s;;779;*779;;;1491;;;*
;1433795..1437778;;cds;;;;;;1328;;non-ribosomal peptide synthetase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1576457..1577296;;cds;;243;243;;;280;;aldo/keto reductase;*
comp;1577540..1577615;;gaa;;123;123;;;;;;*
comp;1577739..1579538;;cds;;;;;;600;;single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1723089..1723457;;cds;;344;344;;;123;;NADH-quinone oxidoreductase subunit A;*
comp;1723802..1723878;;gac;;164;;164;;;;;*
comp;1724043..1724117;;gta;;106;106;;;;;;*
comp;1724224..1724496;;cds;;;;;;91;;HU family DNA-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1730385..1731719;;cds;;91;91;;;445;;trigger factor;*
comp;1731811..1731895;;cta;;173;173;;;;;;*
comp;1732069..1733634;;cds;;;;;;522;;malonyl-CoA decarboxylase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1733741..1735207;;cds;;129;129;;;489;;bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase;*
comp;1735337..1735412;;cac;+;109;;109;;;;;*
comp;1735522..1735597;;cac;2 cac;337;337;;;;;;*
;1735935..1736273;;cds;;;;;;113;;P-II family nitrogen regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1951126..1951752;;cds;;149;149;;;209;;nitrogen fixation protein NifQ;*
;1951902..1951987;;tac;;74;74;;;;;;*
comp;1952062..1952424;;cds;;;;;;121;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1996903..1997244;;cds;;595;*595;;;114;;hp;*
comp;1997840..1997914;;atgj;;131;131;;;;;;*
comp;1998046..1999179;;cds;;;;;;378;;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA;*
;;;;;;;;;;;;*
;2086487..2088658;;cds;;156;156;;;724;;malate synthase G;*
comp;2088815..2088889;;gtc;;234;234;;;;;;*
;2089124..2090002;;cds;;;;;;293;;N-formylglutamate amidohydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2303404..2303880;;cds;;414;*414;;;159;;bacterioferritin;*
comp;2304295..2304377;;tta;;406;*406;;;;;;*
comp;2304784..2305029;;cds;;;;;;82;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2482875..2484518;;cds;;365;*365;;;548;;recombinase family protein;*
comp;2484884..2484974;;tcc;;120;120;;;;;;*
comp;2485095..2485898;;cds;;;;;;268;;alpha/beta hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2640759..2641325;;cds;;149;149;;;189;;prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;*
;2641475..2641549;;ggc;;688;*688;;;;;;*
;2642238..2642915;;cds;;;;;;226;;dimethylmenaquinone methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2764482..2765567;;cds;;659;*659;;;362;;hp;*
comp;2766227..2766300;;ggg;;35;35;;;;;;*
comp;2766336..2766995;;cds;;;;;;220;;N-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2781933..2783774;;cds;;187;187;;;614;;EAL and GGDEF domain-containing protein;*
comp;2783962..2784077;;5s;;129;;;;116;;;*
comp;2784207..2786959;;23s;;255;;;;2753;;;*
comp;2787215..2787290;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;2787321..2787397;;atc;;108;;;;;;;*
comp;2787506..2789006;;16s;;496;*496;;;1501;;;*
comp;2789503..2790207;;cds;;;;;;235;;phosphatase PAP2 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2843264..2843443;;cds;;77;77;;;60;;hp;*
comp;2843521..2843597;;cgt;;170;170;;;;;;*
;2843768..2844268;;cds;;;;;;167;;xanthine phosphoribosyltransferase;*
plasmide2;;;;;;;;;;;;*
comp;51090..51836;;cds;;481;*481;;;249;;sigma-70 family RNA polymerase sigma factor;*
comp;52318..52393;;tgg;;363;*363;;;;;;*
;52757..53587;;cds;;;;;;277;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;809229..810019;;cds;;870;*870;;;264;;IS5 family transposase;*
comp;810890..810966;;atgf;;96;;;;;;;*
comp;811063..811178;;5s;;127;;;;116;;;*
comp;811306..814058;;23s;;266;;;;2753;;;*
comp;814325..814400;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;814431..814507;;atc;;108;;;;;;;*
comp;814616..816106;;16s;;452;*452;;;1491;;;*
comp;816559..817443;;cds;;;;;;295;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
plasmide4;;;;;;;;;;;;*
;196992..199346;;cds;;148;148;;;785;;mechanosensitive ion channel;*
;199495..199581;;ctg;;30;;30;;;;;*
;199612..199687;;gcc;;188;188;;;;;;*
;199876..201333;;cds;;;;;;486;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;237538..238578;;cds;;92;92;;;347;;response regulator;*
comp;238671..238747;;cgg;;96;96;;;;;;*
comp;238844..239821;;cds;;;;;;326;;alpha/beta hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;257739..258470;;cds;;125;125;;;244;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
;258596..258682;;ctc;;123;123;;;;;;*
comp;258806..259108;;cds;;;;;;101;;STAS domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;399367..400527;;cds;;278;278;;;387;;PQQ-dependent sugar dehydrogenase;*
comp;400806..400921;;5s;;129;;;;116;;;*
comp;401051..403803;;23s;;255;;;;2753;;;*
comp;404059..404134;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;404165..404241;;atc;;108;;;;;;;*
comp;404350..405850;;16s;;502;*502;;;1501;;;*
comp;406353..406547;;cds;;;;;;65;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;504531..504893;;cds;;82;82;;;121;;response regulator;*
;504976..505051;;aac;;3;;3;;;;;*
;505055..505131;;gac;;4;;4;;;;;*
;505136..505210;;ggc;;102;102;;;;;;*
comp;505313..506080;;cds;;83;83;;;256;;helix-turn-helix transcriptional regulator;*
;506164..506790;;cds;;202;202;;;209;;pyridoxamine 5'-phosphate oxidase;*
comp;506993..507108;;5s;;127;;;;116;;;*
comp;507236..509988;;23s;;266;;;;2753;;;*
comp;510255..510330;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;510361..510437;;atc;;110;;;;;;;*
comp;510548..512038;;16s;;615;*615;;;1491;;;*
;512654..513568;;cds;;;;;;305;;lytic transglycosylase domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;588108..590768;;cds;;340;340;;;887;;bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase;*
;591109..591184;;ttc;;286;286;;;;;;*
;591471..592979;;cds;;;;;;503;;FAD-binding oxidoreductase;*
plasmide5;;;;;;;;;;;;*
;86421..87089;;cds;;455;*455;;;223;;RraA family protein;*
;87545..87619;;ggc;;193;193;;;;;;*
;87813..88865;;cds;;;;;;351;;UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting);*
plasmide1;;;;@3;;;;;;;;*
&gt;comp;115594..115896;;cds;;394;*394;;;101;;P-IS5/IS1182 family transposase;*
comp;116291..116367;;atgf;;96;;;;;;;*
comp;116464..116579;;5s;;129;;;;116;;;*
comp;116709..119461;;23s;;255;;;;2753;;;*
comp;119717..119792;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;119823..119899;;atc;;108;;;;;;;*
comp;120008..121498;;16s;;740;*740;;;1491;;;*
;122239..123597;;cds;;;;;;453;;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;217550..218176;;cds;;123;123;;;209;;ribonuclease D;*
comp;218300..218386;;ctg;;228;228;;;;;;*
;218615..219604;;cds;;;;;;330;;complex I NDUFA9 subunit family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;300477..301733;;cds;;472;*472;;;419;;exonuclease subunit SbcD;*
;302206..303696;;16s;;108;;;;1491;;;*
;303805..303881;;atc;;30;;;30;;;;*
;303912..303987;;gca;;255;;;;;;;*
;304243..306995;;23s;;129;;;;2753;;;*
;307125..307240;;5s;;96;;;;116;;;*
;307337..307413;;atgf;;161;161;;;;;;*
&lt;comp;307575..307805;;cds;;;;;;77;;p-ATP-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;466493..467710;;cds;;231;231;;;406;;site-specific integrase;*
comp;467942..468031;;tca;;205;205;;;;;;*
comp;468237..468809;;cds;;;;;;191;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;512242..512790;;cds;;136;136;;;183;;pantetheine-phosphate adenylyltransferase;*
;512927..513002;;aaa;;209;209;;;;;;*
;513212..514036;;cds;;;;;;275;;DUF3618 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;931813..933912;;cds;;79;79;;;700;;membrane protein;*
;933992..934066;;caa;;382;*382;;;;;;*
comp;934449..935270;;cds;;;;;;274;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;948715..949743;;cds;;199;199;;;343;;Ppx/GppA family phosphatase;*
;949943..950016;;cag;;246;246;;;;;;*
comp;950263..950829;;cds;;;;;;189;;IS3 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;;971260..971532;;cds;;493;*493;;;91;;P-hp;*
comp;972026..972119;;agc;;197;197;;;;;;*
;972317..972550;;cds;;;;;;78;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1302373..1303350;;cds;;166;166;;;326;;alpha-1,3-fucosyltransferase;*
comp;1303517..1303592;;ttc;;98;98;;;;;;*
comp;1303691..1303876;;cds;;;;;;62;;DNA gyrase inhibitor YacG;*
;;;;;;;;;;;;*
;1349823..1350929;;cds;;145;145;;;369;;GNAT family N-acetyltransferase;*
comp;1351075..1353828;;23s;;262;;;;2754;;;*
comp;1354091..1355591;;16s;@1;676;*676;;;1501;;;*
;1356268..1356726;;cds;;;;;;153;;MarR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1441708..1443066;;cds;;153;153;;;453;;hp;*
;1443220..1443294;;acc;;1;;1;;;;;*
;1443296..1443371;;gcg;;99;;99;;;;;*
;1443471..1443547;;gac;;44;;44;;;;;*
;1443592..1443666;;gtc;;1;;1;;;;;*
;1443668..1443741;;cag;;137;137;;;;;;*
comp;1443879..1446428;;cds;;;;;;850;;dipeptide ABC transporter ATP-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1566394..1566612;;cds;;193;193;;;73;;hp;*
comp;1566806..1566921;;5s;;128;;;;116;;;*
comp;1567050..1569802;;23s;;254;;;;2753;;;*
comp;1570057..1570132;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;1570163..1570239;;atc;;94;;;;;;;*
comp;1570334..1571834;;16s;;444;*444;;;1501;;;*
comp;1572279..1572707;;cds;;;;;;143;;DUF1489 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1723583..1724962;;cds;;94;94;;;460;;hp;*
comp;1725057..1725143;;ctc;;475;*475;;;;;;*
;1725619..1726311;;cds;;;;;;231;;FadR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1757680..1760568;;cds;;308;308;;;963;;PAS domain-containing protein;*
;1760877..1760963;;ctg;;29;;29;;;;;*
;1760993..1761068;;gcc;;247;247;;;;;;*
comp;1761316..1761840;;cds;;;;;;175;;helix-turn-helix transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1854042..1855049;;cds;;135;135;;;336;;inorganic phosphate transporter;*
comp;1855185..1855259;;ggc;;243;243;;;;;;*
;1855503..1858685;;cds;;;;;;1061;;AAA family ATPase;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;comp;1883235..1883816;;cds;;210;210;;;194;;P-hp;*
;1884027..1884102;;aac;;4;;4;;;;;*
;1884107..1884183;;gac;;32;32;;;;;;*
comp;1884216..1884821;;cds;;;;;;202;;hp;*
&lt;/pre&gt;

====abq cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_cumuls|abq cumuls]]
&lt;pre&gt;
abq cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;cdsa 30-300;
avec rRNA;opérons;9;1;2;;1;0;1;;100;17;1;0
;16atcgca235;5;20;3;;50;7;40;;200;29;30;0
;Id-atgf;3;40;3;8;100;19;80;;300;24;60;2
;16s23s;1;60;2;;150;26;120;;400;18;90;9
;max a;3;80;1;;200;20;160;;500;8;120;11
;a doubles;0;100;1;;250;18;200;;600;8;150;8
;spéciaux;0;120;1;;300;3;240;;700;5;180;11
;total aas;19;140;1;;350;4;280;;800;2;210;9
sans ;opérons;51;160;0;;400;4;320;;900;2;240;6
;1 aa;38;180;1;;450;4;360;;1000;1;270;6
;max a;5;200;0;;500;7;400;;1100;1;300;8
;a doubles;5;;2;;;9;;;;1;;46
;total aas;68;;17;8;;121;;0;;116;;116
total aas;;87;;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;72;30;;227;;;;308;;
;;;variance;72;0;;175;;;;230;;
sans jaune;;;moyenne;;;;153;;;;249;;166
;;;variance;;;;74;;;;142;;71
&lt;/pre&gt;

====abq blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_blocs|abq blocs]]
&lt;pre&gt;
abq blocs;;;;;;;;;;;;;;;
bloc;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;
cds;779;1328;non ribosom;496;235;PAP2 fam;502;65;hp;615;305;lytic dom;444;143;DUF1489
$16s;108;§1491;;108;§1501;;108;§1501;;110;1491;;94;§1501;
atc;30;;;30;;;30;;;30;;;30;;
gca;266;;;255;;;255;;;266;;;254;;
$23s;129;§2753;;129;§2753;;129;§2753;;127;2753;;128;§2753;
$5s;236;§116;;187;§116;;278;§116;;202;116;;193;§116;
cds;;97;YkgJ fam;;614;EAL &amp; GGDEF;;387;PQQ;;209;pyridoxamine;;73;hp
;;;;;;;;;;;;;;;
cds;452;295;Hx-t-Hx;740;453;peptido fam;472;419;exo SbcD;;;;;;
$16s;108;§1491;;108;§1491;;108;§1491;;;;;;;
atc;30;;;30;;;30;;;;;;;;
gca;266;;;255;;;255;;;;cds;676;153;MarR fam;
$23s;127;§2753;;129;§2753;;129;§2753;;;$16s;262;§1501;;
$5s;96;§116;;96;§116;;96;§116;;;$23s;145;§2754;;
atgf;870;;;394;;;161;;;;cds;;369;GNAT fam;
cds;;264;IS5 fam;;101;p-IS5/IS1182;;77;p-ATP-bind;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====abq distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_distribution|abq distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;aag2;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;cac2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;ccg2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;;gag2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;;agc;1;gtg2;atc;;acc;1;aac;3;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;1;cac;;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;3;ggc;gtc;1;gcc;2;gac;3;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;3 1aa;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;1 &gt;1aa;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;1;;ctg;2;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;2;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;2;gcg;;gag;2;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
abq;;38;;;;;38;;abq;20;;;;;;20;;abq;10;;;;;;10;;abq;;;;3;;;3
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3 1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====abq données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_données_intercalaires|abq données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;abq;fx;fc;abq;fx40;fc40;abq;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;2;4;0;2;4;-1;0;61;59;127;16s tRNA;;
1;1;10;65;170;1;4;13;-2;1;0;42;206;2* 114;;atc
;0;20;54;138;2;4;15;-3;0;0;81;175;tRNA 23s;;
;0;30;57;90;3;10;20;-4;6;199;169;209;267;;gca
;2;40;17;65;4;11;26;-5;0;0;141;63;256;;gca
;2;50;24;74;5;6;24;-6;1;0;162;137;tRNA tRNA;;intra
;1;60;21;59;6;7;12;-7;1;1;121;144;2* 30;;atc gca
1;2;70;24;47;7;8;15;-8;1;20;109;296;tRNA tRNA;;
3;0;80;31;67;8;4;16;-9;0;0;38;109;206;;ccg
;3;90;24;68;9;6;8;-10;1;1;91;5;**;;ccg
;2;100;29;70;10;5;21;-11;1;6;81;212;60;;tac
1;2;110;29;61;11;3;17;-12;0;0;153;72;**;;gga
1;1;120;23;59;12;6;14;-13;0;4;69;246;76;;aag
1;3;130;26;56;13;6;22;-14;1;3;159;165;**;;aag
2;2;140;21;50;14;2;21;-15;0;0;134;139;38;;gag
2;2;150;27;44;15;8;14;-16;0;1;68;118;**;;gag
1;2;160;25;47;16;11;14;-17;3;2;175;218;132;;gtg
2;2;170;33;37;17;1;8;-18;0;1;231;337;**;;gtg
1;2;180;15;41;18;3;7;-19;0;1;85;74;220;;aac
1;0;190;22;24;19;8;13;-20;0;7;49;595;**;;tgc
;1;200;24;36;20;6;8;-21;0;0;10;156;164;;gac
2;0;210;27;24;21;10;8;-22;0;0;443;234;**;;gta
2;0;220;13;24;22;9;8;-23;3;3;196;187;109;;cac
;0;230;18;16;23;5;3;-24;1;0;243;365;**;;cac
1;1;240;17;19;24;4;9;-25;0;1;123;149;;;
1;1;250;14;17;25;7;11;-26;1;2;344;77;;;
;0;260;16;15;26;6;13;-27;0;0;106;170;;;
;0;270;19;17;27;5;11;-28;0;0;91;;;;
;0;280;15;7;28;3;8;-29;3;2;173;;;;
;0;290;9;2;29;0;8;-30;0;0;129;;;;
1;0;300;6;8;30;8;11;-31;0;4;149;;;;
;0;310;7;9;31;0;11;-32;1;0;131;;;;
;0;320;9;7;32;3;5;-33;0;0;414;;;;
;0;330;8;5;33;2;8;-34;0;0;120;;;;
1;0;340;9;3;34;5;6;-35;0;0;688;;;;
;1;350;3;3;35;3;7;-36;0;0;659;;;;
;0;360;5;3;36;1;9;-37;0;0;35;;;;
1;0;370;8;9;37;1;5;-38;3;0;CDS 16s;;;;
;0;380;6;2;38;0;3;-39;0;0;496;779;;;
;0;390;2;7;39;1;4;-40;0;0;23s 5s;;;;
;0;400;4;4;40;1;7;-41;2;1;2* 134;;;;
1;4;reste;82;57;reste;695;1098;-42;0;0;5s CDS;;;;
27;37;total;890;1565;total;890;1565;-43;0;1;236;187;;;
26;33;diagr;806;1504;diagr;193;463;-44;0;0;;;;;
1;1; t30;176;398;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;1;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;2;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;888;37;2;927;;;-49;1;0;;;;;
;c;1561;330;4;1895;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;2822;104;;reste;5;7;;;;;
;;;;;;2926;;total;37;330;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====abq autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_autres_intercalaires_aas|abq autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;abq;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;125527;126444;127;*;
;comp;tRNA;126572;126647;206;*;gcg
fin;;CDS;126854;127138;;;
deb;comp;CDS;163237;164982;175;*;
;;tRNA;165158;165234;59;*;agg
fin;;CDS;165294;166022;;;
deb;comp;CDS;188235;189860;42;*;
;comp;tRNA;189903;189977;81;*;acg
fin;comp;CDS;190059;191987;;;
deb;comp;CDS;250833;251111;169;*;
;comp;tRNA;251281;251356;141;*;gcc
fin;comp;CDS;251498;251893;;0;
deb;;CDS;409912;410451;134;*;
;;ncRNA;410586;410683;99;*;
fin;;CDS;410783;412645;;;
deb;comp;CDS;458142;458459;209;*;
;;tRNA;458669;458758;63;*;tcg
fin;comp;CDS;458822;459664;;;
deb;comp;CDS;496776;497171;162;*;
;comp;tRNA;497334;497420;137;*;ttg
fin;;CDS;497558;498085;;;
deb;comp;CDS;599094;599591;554;*;
;comp;ncRNA;600146;600563;62;*;
fin;comp;CDS;600626;601336;;;
deb;comp;CDS;615937;616350;121;*;
;comp;tRNA;616472;616548;206;*;ccg
;comp;tRNA;616755;616831;109;*;ccg
fin;comp;CDS;616941;617957;;0;
deb;comp;CDS;748703;749161;38;*;
;comp;tRNA;749200;749275;91;*;aca
deb;comp;CDS;749367;750221;144;*;
;;tRNA;750366;750451;60;*;tac
;;tRNA;750512;750585;81;*;gga
deb;;CDS;750667;751857;153;*;
;;tRNA;752011;752086;69;*;tgg
fin;;CDS;752156;752353;;;
deb;comp;CDS;794457;795983;296;*;
;;tRNA;796280;796355;76;*;aag
;;tRNA;796432;796507;109;*;aag
fin;comp;CDS;796617;797057;;;
deb;;CDS;870412;872373;159;*;
;;tRNA;872533;872608;5;*;atgi
deb;comp;CDS;872614;873093;134;*;
;comp;tRNA;873228;873304;212;*;cgt
fin;;CDS;873517;874023;;;
deb;;CDS;931977;933011;68;*;
;;tRNA;933080;933155;38;*;gag
;;tRNA;933194;933269;72;*;gag
fin;comp;CDS;933342;934340;;0;
deb;;CDS;965995;966240;85;*;
;;regulatory;966326;966425;175;*;
fin;;CDS;966601;967713;;;
deb;;CDS;987790;988104;13;*;
;;ncRNA;988118;988277;39;*;
fin;;CDS;988317;988940;;;
deb;;CDS;997881;998357;246;*;
;comp;tRNA;998604;998678;175;*;acc
fin;comp;CDS;998854;1000815;;;
deb;comp;CDS;1164137;1165042;165;*;
;;tRNA;1165208;1165282;132;*;gtg
;;tRNA;1165415;1165489;231;*;gtg
fin;;CDS;1165721;1165885;;;
deb;;CDS;1242416;1242919;85;*;
;;tRNA;1243005;1243081;139;*;ccc
fin;comp;CDS;1243221;1244972;;0;
deb;comp;CDS;1353398;1353895;118;*;
;;tRNA;1354014;1354091;49;*;cca
deb;;CDS;1354141;1354437;10;*;
;;tRNA;1354448;1354524;443;*;aga
fin;;CDS;1354968;1355213;;0;
deb;comp;CDS;1370270;1370500;196;*;
;comp;tRNA;1370697;1370772;220;*;aac
;comp;tRNA;1370993;1371066;218;*;tgc
fin;;CDS;1371285;1371941;;;
deb;comp;CDS;1427443;1427733;236;*;
;comp;rRNA;1427970;1428085;134;*;116
;comp;rRNA;1428220;1430966;267;*;2747
;comp;tRNA;1431234;1431309;30;*;gca
;comp;tRNA;1431340;1431416;114;*;atc
;comp;rRNA;1431531;1433015;779;*;1485
fin;;CDS;1433795;1437778;;;
deb;comp;CDS;1553335;1555176;116;*;
;comp;regulatory;1555293;1555405;204;*;
fin;;CDS;1555610;1555798;;0;
deb;comp;CDS;1576457;1577296;243;*;
;comp;tRNA;1577540;1577615;123;*;gaa
fin;comp;CDS;1577739;1579538;;;
deb;comp;CDS;1723089;1723457;344;*;
;comp;tRNA;1723802;1723878;164;*;gac
;comp;tRNA;1724043;1724117;106;*;gta
fin;comp;CDS;1724224;1724496;;;
deb;comp;CDS;1730385;1731719;91;*;
;comp;tRNA;1731811;1731895;173;*;cta
fin;comp;CDS;1732069;1733634;;;
deb;comp;CDS;1733741;1735207;129;*;
;comp;tRNA;1735337;1735412;109;*;cac
;comp;tRNA;1735522;1735597;337;*;cac
fin;;CDS;1735935;1736273;;;
deb;comp;CDS;1819331;1820473;69;*;
;comp;regulatory;1820543;1820640;161;*;
fin;;CDS;1820802;1821179;;0;
deb;comp;CDS;1862505;1863443;95;*;
;;tmRNA;1863539;1863915;31;*;
fin;;CDS;1863947;1864516;;;
deb;;CDS;1951126;1951752;149;*;
;;tRNA;1951902;1951987;74;*;tac
fin;comp;CDS;1952062;1952424;;;
deb;;CDS;1996903;1997244;595;*;
;comp;tRNA;1997840;1997914;131;*;atgj
fin;comp;CDS;1998046;1999179;;;
deb;;CDS;2086487;2088658;156;*;
;comp;tRNA;2088815;2088889;234;*;gtc
fin;;CDS;2089124;2090002;;;
deb;comp;CDS;2281336;2282022;151;*;
;comp;regulatory;2282174;2282326;63;*;
fin;comp;CDS;2282390;2284078;;0;
deb;comp;CDS;2303404;2303880;414;*;
;comp;tRNA;2304295;2304377;187;*;tta
fin;;CDS;2304565;2304732;;0;
deb;;CDS;2482875;2484518;365;*;
;comp;tRNA;2484884;2484974;120;*;tcc
fin;comp;CDS;2485095;2485898;;0;
deb;;CDS;2526814;2528505;73;*;
;;regulatory;2528579;2528683;49;*;
fin;;CDS;2528733;2529680;;1;
deb;comp;CDS;2640759;2641325;149;*;
;;tRNA;2641475;2641549;688;*;ggc
fin;;CDS;2642238;2642915;;;
deb;comp;CDS;2764482;2765567;659;*;
;comp;tRNA;2766227;2766300;35;*;ggg
fin;comp;CDS;2766336;2766995;;0;
deb;;CDS;2781933;2783774;187;*;
;comp;rRNA;2783962;2784077;134;*;116
;comp;rRNA;2784212;2786958;256;*;2747
;comp;tRNA;2787215;2787290;30;*;gca
;comp;tRNA;2787321;2787397;114;*;atc
;comp;rRNA;2787512;2789006;496;*;1495
fin;comp;CDS;2789503;2790207;;;
deb;;CDS;2843264;2843443;77;*;
;comp;tRNA;2843521;2843597;170;*;cgt
fin;;CDS;2843768;2844268;;0;
deb;comp;CDS;2886497;2887705;76;*;
;comp;regulatory;2887782;2887861;126;*;
fin;;CDS;2887988;2888500;;;
&lt;/pre&gt;

====abqp données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abqp_données_intercalaires|abqp données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;abqp;fx;fc;abqp;fx40;fc40;abqp;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;2;0;1;2;-1;0;30;394;228;16s tRNA;;atc
;0;10;35;82;1;7;10;-2;1;0;123;161;2* 114;;
1;0;20;32;85;2;0;10;-3;0;0;231;382;100;;
;0;30;28;64;3;2;10;-4;1;143;205;199;tRNA 23s;;gca
1;0;40;5;60;4;3;10;-5;0;0;136;246;2* 256;;
;0;50;16;34;5;2;7;-6;0;0;209;19;255;;
;0;60;13;39;6;3;8;-7;0;4;79;197;5s tRNA;;
;0;70;14;41;7;4;8;-8;1;11;166;177;2* 96;;atgf
;1;80;16;38;8;1;7;-9;0;0;98;137;tRNA tRNA;;intra
;0;90;9;28;9;2;6;-10;1;1;308;94;3* 30;;atc gca
1;1;100;15;40;10;11;6;-11;2;12;;418;tRNA tRNA;;
;0;110;15;33;11;2;14;-12;1;0;;247;29;;ctg
;0;120;14;24;12;4;6;-13;0;2;;135;**;;gcc
;1;130;15;23;13;9;15;-14;0;3;;351;4;;aac
2;1;140;17;32;14;0;12;-15;0;1;;213;**;;gac
;0;150;21;29;15;2;5;-16;1;2;;32;1;;acc
;0;160;13;30;16;3;10;-17;1;3;CDS 16s;;99;;gcg
1;1;170;20;25;17;2;6;-18;0;0;444;734;44;;gac
1;0;180;11;15;18;3;9;-19;0;1;;472;1;;gtc
;0;190;14;17;19;4;6;-20;0;1;;643;**;;cag
2;0;200;8;17;20;3;2;-21;0;0;5s CDS;;;;
;2;210;9;16;21;5;8;-22;0;1;-;193;;;
1;0;220;12;19;22;5;5;-23;1;3;23s CDS;;;;
1;0;230;6;10;23;4;5;-24;0;0;-;151;;;
;1;240;8;11;24;1;6;-25;0;1;23s 5s;;;;
2;0;250;14;6;25;3;6;-26;1;4;2* 134;;;;
;0;260;8;7;26;0;8;-27;0;0;133;;;;
;0;270;8;3;27;4;7;-28;1;1;16s 23s;;;;
;0;280;8;6;28;3;7;-29;0;3;269;;;;
;0;290;7;5;29;2;7;-30;0;0;;;;;
;0;300;6;6;30;1;5;-31;1;0;;;;;
;1;310;4;4;31;2;9;-32;1;0;;;;;
;0;320;5;3;32;0;7;-33;1;0;;;;;
;0;330;4;6;33;2;5;-34;0;0;;;;;
;0;340;5;6;34;0;4;-35;0;0;;;;;
;0;350;6;0;35;0;11;-36;0;0;;;;;
1;0;360;4;2;36;0;5;-37;1;0;;;;;
;0;370;1;3;37;0;1;-38;0;0;;;;;
;0;380;1;1;38;0;8;-39;0;0;;;;;
1;0;390;1;3;39;0;5;-40;0;0;;;;;
;1;400;5;0;40;1;5;-41;1;0;;;;;
1;0;reste;43;46;reste;396;628;-42;0;0;;;;;
16;10;total;497;921;total;497;921;-43;1;0;;;;;
15;10;diagr;453;873;diagr;100;291;-44;1;0;;;;;
1;0; t30;95;231;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;1;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;496;26;1;523;;;-49;0;1;;;;;
;c;919;235;2;1156;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1679;65;;reste;6;7;;;;;
;;;;;;1744;;total;26;235;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====abqp autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abqp_autres_intercalaires_aas|abqp autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;abqp;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;115594;115896;394;*;
;comp;tRNA;116291;116367;96;*;atgf
;comp;rRNA;116464;116579;134;*;116
;comp;rRNA;116714;119460;256;*;2747
;comp;tRNA;119717;119792;30;*;gca
;comp;tRNA;119823;119899;114;*;atc
;comp;rRNA;120014;121498;734;*;1485
fin;;CDS;122233;123597;;0;
deb;;CDS;138420;138878;54;*;
;;regulatory;138933;139152;115;*;
fin;;CDS;139268;141196;;;
deb;comp;CDS;217550;218176;123;*;
;comp;tRNA;218300;218386;228;*;ctg
fin;;CDS;218615;219604;;;
deb;comp;CDS;241293;242384;76;*;
;comp;regulatory;242461;242590;232;*;
fin;comp;CDS;242823;243398;;;
deb;comp;CDS;300477;301733;472;*;
;;rRNA;302206;303690;114;*;1485
;;tRNA;303805;303881;30;*;atc
;;tRNA;303912;303987;256;*;gca
;;rRNA;304244;306990;134;*;2747
;;rRNA;307125;307240;96;*;116
;;tRNA;307337;307413;161;*;atgf
fin;comp;CDS;307575;307805;;0;
deb;;CDS;353736;354107;193;*;
;;regulatory;354301;354527;305;*;
fin;;CDS;354833;355231;;;
deb;comp;CDS;358353;360380;175;*;
;;regulatory;360556;360807;103;*;
fin;;CDS;360911;361297;;0;
deb;;CDS;366313;366825;113;*;
;;regulatory;366939;367191;109;*;
fin;;CDS;367301;369220;;;
deb;comp;CDS;466493;467710;231;*;
;comp;tRNA;467942;468031;205;*;tca
fin;comp;CDS;468237;468809;;;
deb;;CDS;512242;512790;136;*;
;;tRNA;512927;513002;209;*;aaa
fin;;CDS;513212;514036;;;
deb;;CDS;931813;933912;79;*;
;;tRNA;933992;934066;382;*;caa
fin;comp;CDS;934449;935270;;;
deb;comp;CDS;948715;949743;199;*;
;;tRNA;949943;950016;246;*;cag
fin;comp;CDS;950263;950616;;;
deb;;CDS;970933;972006;19;*;
;comp;tRNA;972026;972119;197;*;agc
fin;;CDS;972317;972550;;0;
deb;comp;CDS;1161686;1162450;290;*;
;;regulatory;1162741;1162957;38;*;
fin;;CDS;1162996;1164069;;;
deb;comp;CDS;1302373;1303350;166;*;
;comp;tRNA;1303517;1303592;98;*;ttc
fin;comp;CDS;1303691;1303876;;;
deb;;CDS;1349865;1350929;151;*;
;comp;rRNA;1351081;1353827;269;*;2747
;comp;rRNA;1354097;1355591;643;*;1495
fin;;CDS;1356235;1356726;;;
deb;comp;CDS;1441708;1443042;177;*;
;;tRNA;1443220;1443294;1;*;acc
;;tRNA;1443296;1443371;99;*;gcg
;;tRNA;1443471;1443547;44;*;gac
;;tRNA;1443592;1443666;1;*;gtc
;;tRNA;1443668;1443741;137;*;cag
fin;comp;CDS;1443879;1444727;;;
deb;;CDS;1566394;1566612;193;*;
;comp;rRNA;1566806;1566921;133;*;116
;comp;rRNA;1567055;1569801;255;*;2747
;comp;tRNA;1570057;1570132;30;*;gca
;comp;tRNA;1570163;1570239;100;*;atc
;comp;rRNA;1570340;1571834;444;*;1495
fin;comp;CDS;1572279;1572707;;;
deb;;CDS;1722755;1724962;94;*;
;comp;tRNA;1725057;1725143;418;*;ctc
fin;;CDS;1725562;1726311;;;
deb;;CDS;1757680;1760568;308;*;
;;tRNA;1760877;1760963;29;*;ctg
;;tRNA;1760993;1761068;247;*;gcc
fin;comp;CDS;1761316;1761840;;0;
deb;;CDS;1854042;1855049;135;*;
;comp;tRNA;1855185;1855259;351;*;ggc
fin;;CDS;1855611;1858685;;0;
deb;comp;CDS;1883235;1883813;213;*;
;;tRNA;1884027;1884102;4;*;aac
;;tRNA;1884107;1884183;32;*;gac
fin;comp;CDS;1884216;1884821;;;
&lt;/pre&gt;

===abs===
====abs opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_opérons|abs opérons]]
&lt;pre&gt;
;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
;abs;;genome;;;;;;;;;
68.45%GC;10.1.20 Paris;16s  5 ;80 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Azospirillum brasilense strain Sp245;;;;;;;;;;;;
chromosome;;;;;;;;;;;;
comp;16414..16980;;cds;;163;163;;;189;;prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;*
;17144..17218;;ggc;;670;*670;;;;;;*
;17889..18566;;cds;;;;;;226;;demethylmenaquinone methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;84790..85017;;cds;;114;114;;;76;;osmotically-inducible lipoprotein B;*
comp;85132..85205;;ggg;;35;35;;;;;;*
comp;85241..85900;;cds;;;;;;220;;N-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;93530..94258;;cds;;60;60;;;243;;SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase;*
comp;94319..94395;;agg;;175;175;;;;;;*
;94571..96262;;cds;;;;;;564;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;131833..132117;;cds;;206;206;;;95;;YggT family protein;*
;132324..132399;;gcg;;140;140;;;;;;*
comp;132540..133586;;cds;;;;;;349;;DMT family transporter;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;483582..484082;;cds;;170;170;;;167;;xanthine phosphoribosyltransferase;*
;484253..484329;;cgt;;77;77;;;;;;*
comp;484407..484586;;cds;;;;;;60;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;536869..537573;;cds;;495;*495;;;235;;phosphatase PAP2 family protein;*
;538069..539152;;16s’;@1;189;;;;1084;;;*
;539342..540019;;23s°;;127;;;;678;;;*
;540147..540262;;5s;;153;153;;;116;;;*
comp;540416..542290;;cds;;;;;;*625;;GGDEF domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;600048..601079;;cds;;79;79;;;344;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;601159..601233;;acg;;81;81;;;;;;*
comp;601315..603243;;cds;;;;;;*643;;DNA helicase RecQ;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;656242..656520;;cds;;169;169;;;93;;hp;*
comp;656690..656765;;gcc;;141;141;;;;;;*
comp;656907..657305;;cds;;;;;;133;;TIGR02300 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;864141..864458;;cds;;209;209;;;106;;50S ribosomal protein L21;*
;864668..864757;;tcg;;79;79;;;;;;*
comp;864837..865679;;cds;;;;;;281;;alpha/beta hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;927651..927896;;cds;;392;*392;;;82;;hp;*
;928289..928371;;tta;;175;175;;;;;;*
;928547..929164;;cds;;;;;;206;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1148345..1149223;;cds;;234;234;;;293;;N-formylglutamate amidohydrolase;*
;1149458..1149532;;gtc;;106;106;;;;;;*
comp;1149639..1151516;;cds;;;;;;*626;;methyl-accepting chemotaxis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1243974..1245108;;cds;;131;131;;;378;;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA;*
;1245240..1245314;;atgj;;354;*354;;;;;;*
comp;1245669..1246637;;cds;;;;;;323;;NAD(+) diphosphatase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1279875..1280237;;cds;;74;74;;;121;;hp;*
comp;1280312..1280397;;tac;;148;148;;;;;;*
comp;1280546..1281172;;cds;;;;;;209;;nitrogen fixation protein NifQ;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1500772..1501110;;cds;;338;338;;;113;;P-II family nitrogen regulator;*
;1501449..1501524;;cac;+;109;;109;;;;;*
;1501634..1501709;;cac;2 cac;129;129;;;;;;*
;1501839..1503305;;cds;;106;106;;;489;;bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase;*
;1503412..1504977;;cds;;173;173;;;522;;malonyl-CoA decarboxylase;*
;1505151..1505235;;cta;;91;91;;;;;;*
;1505327..1506661;;cds;;;;;;445;;trigger factor;*
;;;;;;;;;;;;*
;1511745..1512017;;cds;;105;105;;;91;;HU family DNA-binding protein;*
;1512123..1512197;;gta;;163;;163;;;;;*
;1512361..1512437;;gac;;344;344;;;;;;*
;1512782..1513150;;cds;;;;;;123;;NADH-quinone oxidoreductase subunit A;*
;;;;;;;;;;;;*
;1657596..1659397;;cds;;123;123;;;*601;;p-single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;*
;1659521..1659596;;gaa;;234;234;;;;;;*
;1659831..1660671;;cds;;;;;;280;;aldo/keto reductase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1808199..1808735;;cds;;79;79;;;179;;hp;*
;1808815..1808892;;cca;;49;49;;;;;;*
;1808942..1809238;;cds;;10;10;;;99;;ETC complex I subunit;*
;1809249..1809325;;aga;;442;*442;;;;;;*
;1809768..1810013;;cds;;;;;;82;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1825075..1825305;;cds;;210;210;;;77;;hp;*
comp;1825516..1825591;;aac;@2;219;;219;;;;;*
comp;1825811..1825884;;tgc;;217;217;;;;;;*
;1826102..1826758;;cds;;;;;;219;;protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1878424..1878714;;cds;;244;244;;;97;;YkgJ family cysteine cluster protein;*
comp;1878959..1879074;;5s;;123;;;;116;;;*
comp;1879198..1881950;;23s;;272;;;;2753;;;*
comp;1882223..1882298;;gca;;32;;;32;;;;*
comp;1882331..1882407;;atc;;110;;;;;;;*
comp;1882518..1883224;;16s°;;100;100;;;707;;;*
&lt;comp;1883325..1883763;;cds;;;;;;146;;p-erythrose-4-phosphate dehydrogenase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1896604..1897080;;cds;;192;192;;;159;;peptidoglycan-associated lipoprotein Pal;*
comp;1897273..1897347;;acc;;162;162;;;;;;*
comp;1897510..1899495;;cds;;;;;;*662;;polysaccharide biosynthesis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2032701..2033588;;cds;;165;165;;;296;;DUF3108 domain-containing protein;*
;2033754..2033828;;gtg;+;132;;132;;;;;*
;2033961..2034035;;gtg;2 gtg;231;231;;;;;;*
;2034267..2034431;;cds;;;;;;55;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2113098..2113601;;cds;;85;85;;;168;;MerR family transcriptional regulator;*
;2113687..2113763;;ccc;;140;140;;;;;;*
comp;2113904..2115682;;cds;;;;;;593;;cyclic nucleotide-binding domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2163405..2167388;;cds;;775;*775;;;*1328;;non-ribosomal peptide synthetase;*
;2168164..2168552;;16s°;;100;;;;389;;;*
comp;2168653..2169323;;16s°;;522;*522;;;671;;;*
comp;2169846..2170325;;cds;;;;;;160;;DUF2141 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2176963..2177427;;cds;;107;107;;;155;;membrane protein;*
comp;2177535..2177610;;gcc;;30;;30;;;;;*
comp;2177641..2177727;;ctg;;135;135;;;;;;*
comp;2177863..2180208;;cds;;;;;;*782;;mechanosensitive ion channel;*
;;;;;;;;;;;;*
;2233677..2234435;;cds;;92;92;;;253;;hp;*
comp;2234528..2234603;;gag;+;38;;38;;;;;*
comp;2234642..2234717;;gag;2 gag;68;68;;;;;;*
comp;2234786..2235836;;cds;;;;;;350;;p-low specificity L-threonine aldolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2293087..2293593;;cds;;211;211;;;169;;hp;*
;2293805..2293881;;cgt;;137;137;;;;;;*
;2294019..2294495;;cds;;5;5;;;159;;GNAT family N-acetyltransferase;*
comp;2294501..2294576;;atgi;;145;145;;;;;;*
comp;2294722..2296683;;cds;;;;;;*654;;RNA polymerase sigma factor RpoD;*
;;;;;;;;;;;;*
;2372946..2373401;;cds;;86;86;;;152;;MaoC family dehydratase;*
comp;2373488..2373563;;aag;+;74;;74;;;;;*
comp;2373638..2373713;;aag;2 aag;309;309;;;;;;*
;2374023..2375549;;cds;;;;;;509;;methyltransferase domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2418203..2418400;;cds;;69;69;;;66;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;2418470..2418545;;tgg;;152;152;;;;;;*
comp;2418698..2419888;;cds;;81;81;;;397;;elongation factor Tu;*
comp;2419970..2420043;;gga;;60;;60;;;;;*
comp;2420104..2420189;;tac;;144;144;;;;;;*
;2420334..2421188;;cds;;91;91;;;285;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;2421280..2421355;;aca;;137;137;;;;;;*
;2421493..2423187;;cds;;;;;;565;;site-specific integrase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2561207..2562223;;cds;;109;109;;;339;;farnesyltranstransferase;*
;2562333..2562409;;ccg;+;205;;205;;;;;*
;2562615..2562691;;ccg;2 ccg;136;136;;;;;;*
;2562828..2563241;;cds;;;;;;138;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2680406..2680930;;cds;;140;140;;;175;;disulfide bond formation protein B;*
;2681071..2681157;;ttg;;162;162;;;;;;*
;2681320..2681715;;cds;;;;;;132;;cupin domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2856509..2858152;;cds;;365;*365;;;548;;recombinase family protein;*
comp;2858518..2858608;;tcc;;118;118;;;;;;*
comp;2858727..2859530;;cds;;;;;;268;;alpha/beta hydrolase;*
plasmide1;;;@3;;;;;;;;;*
;198109..199200;;cds;;84;84;;;364;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;199285..199360;;aaa;;135;135;;;;;;*
comp;199496..200044;;cds;;;;;;183;;pantetheine-phosphate adenylyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;243776..244348;;cds;;205;205;;;191;;hp;*
;244554..244643;;tca;;143;143;;;;;;*
;244787..245683;;cds;;;;;;299;;diguanylate cyclase;*
;;;;;;;;;;;;*
;338004..339383;;cds;;116;116;;;460;;hp;*
comp;339500..339586;;ctc;;257;257;;;;;;*
comp;339844..340836;;cds;;;;;;331;;alpha/beta hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;364473..365501;;cds;;200;200;;;343;;Ppx/GppA family phosphatase;*
;365702..365775;;cag;;746;*746;;;;;;*
;366522..367214;;cds;;;;;;231;;FadR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;474173..477079;;cds;;298;298;;;*969;;PAS domain-containing protein;*
;477378..477464;;ctg;;30;;30;;;;;*
;477495..477570;;gcc;;238;238;;;;;;*
;477809..478123;;cds;;;;;;105;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;599223..600230;;cds;;245;245;;;336;;inorganic phosphate transporter;*
comp;600476..600550;;ggc;;351;*351;;;;;;*
;600902..602071;;cds;;;;;;390;;adenylate/guanylate cyclase domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;629856..631229;;cds;;154;154;;;458;;tetratricopeptide repeat protein;*
;631384..631458;;acc;;1;;1;;;;;*
;631460..631535;;gcg;;99;;99;;;;;*
;631635..631711;;gac;;35;;35;;;;;*
;631747..631821;;gtc;;1;;1;;;;;*
;631823..631896;;cag;;153;153;;;;;;*
;632050..632259;;cds;;;;;;70;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;comp;699265..699846;;cds;;210;210;;;194;;P-hp;*
;700057..700132;;aac;;4;;4;;;;;*
;700137..700213;;gac;;32;32;;;;;;*
comp;700246..700851;;cds;;;;;;202;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;909530..909766;;cds;;153;153;;;79;;hp;*
comp;909920..910035;;5s;;127;;;;116;;;*
comp;910163..912915;;23s;;271;;;;2753;;;*
comp;913187..913262;;gca;;30;;;30;;;;*
comp;913293..913369;;atc;;110;;;;;;;*
comp;913480..914970;;16s;;486;*486;;;1491;;;*
;915457..916713;;cds;;;;;;419;;exonuclease subunit SbcD;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;998160..999149;;cds;;229;229;;;330;;complex I NDUFA9 subunit family protein;*
;999379..999465;;ctg;;123;123;;;;;;*
;999589..1000215;;cds;;;;;;209;;ribonuclease D;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1098197..1098655;;cds;;675;*675;;;153;;MarR family transcriptional regulator;*
;1099331..1100821;;16s;;107;;;;1491;;;*
;1100929..1101005;;atc;;31;;;31;;;;*
;1101037..1101112;;gca;;271;;;;;;;*
;1101384..1104136;;23s;;147;147;;;2753;;;*
comp;1104284..1105390;;cds;;;;;;369;;GNAT family N-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1157171..1157356;;cds;;98;98;;;62;;DNA gyrase inhibitor YacG;*
;1157455..1157530;;ttc;;178;178;;;;;;*
;1157709..1158686;;cds;;;;;;326;;alpha-(1,3)-fucosyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1394614..1396740;;cds;;453;*453;;;*709;;PAS domain S-box protein;*
;1397194..1397287;;agc;;52;52;;;;;;*
comp;1397340..1397858;;cds;;;;;;173;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1399009..1399830;;cds;;301;301;;;274;;hp;*
comp;1400132..1400206;;caa;;79;79;;;;;;*
comp;1400286..1402379;;cds;;;;;;*698;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1577667..1578095;;cds;;457;*457;;;143;;DUF1489 domain-containing protein;*
;1578553..1580043;;16s;;110;;;;1491;;;*
;1580154..1580230;;atc;;31;;;31;;;;*
;1580262..1580337;;gca;;269;;;;;;;*
;1580607..1581986;;23s°;;100;;;;1380;;;*
;1582087..1582616;;23s°;;123;;;;530;;;*
;1582740..1582855;;5s;;100;;;;116;;;*
;1582956..1583032;;atgf;;706;*706;;;;;;*
;1583739..1585157;;cds;;;;;;473;;pyruvate kinase;*
plasmide2;;;;;;;;;;;;*
;271302..272090;;cds;;529;*529;;;263;;ATP-binding cassette domain-containing protein;*
;272620..272695;;tgg;;480;*480;;;;;;*
;273176..273922;;cds;;;;;;249;;sigma-70 family RNA polymerase sigma factor;*
;;;;;;;;;;;;*
;449562..450338;;cds;;465;*465;;;259;;IclR family transcriptional regulator;*
;450804..452289;;16s;;584;;;;1486;;;*
;452874..453640;;23s°;;128;;;;767;;;*
;453769..453884;;5s;;101;;;;116;;;*
;453986..454062;;atgf;;359;*359;;;;;;*
comp;454422..457751;;cds;;;;;;*1110;;NERD domain-containing protein;*
plasmide4;;;;;;;;;;;;*
&gt;comp;131140..131621;;cds;;193;193;;;161;;p-erythrose-4-phosphate dehydrogenase;*
;131815..131891;;atgf;;202;202;;;;;;*
comp;132094..132276;;cds;;;;;;61;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;197300..198643;;cds;;738;*738;;;448;;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
;199382..199953;;16s°;;193;;;;572;;;*
;200147..200223;;atgf;;437;*437;;;;;;*
comp;200661..202571;;cds;;;;;;*637;;PAS domain-containing sensor histidine kinase;*
;;;;;;;;;;;;*
;246777..248687;;cds;;208;208;;;*637;;RNA-directed DNA polymerase;*
comp;248896..248972;;cgg;;96;96;;;;;;*
comp;249069..249983;;cds;;;;;;305;;alpha/beta hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;319641..319943;;cds;;134;134;;;101;;STAS domain-containing protein;*
comp;320078..320164;;ctc;;125;125;;;;;;*
;320290..321018;;cds;;;;;;243;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;401067..402227;;cds;;281;281;;;387;;PQQ-dependent sugar dehydrogenase;*
comp;402509..402624;;5s;;129;;;;116;;;*
comp;402754..403402;;23s°;;106;;;;649;;;*
comp;403509..403880;;16s°;;502;*502;;;372;;;*
comp;404383..404577;;cds;;;;;;65;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;501394..501756;;cds;;95;95;;;121;;response regulator;*
;501852..501927;;aac;;4;;4;;;;;*
;501932..502008;;gac;;4;;4;;;;;*
;502013..502087;;ggc;;102;102;;;;;;*
comp;502190..502957;;cds;;;;;;256;;helix-turn-helix transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;503041..503667;;cds;;249;249;;;209;;pyridoxamine 5'-phosphate oxidase;*
comp;503917..504474;;16s°;;547;*547;;;558;;;*
;505022..506005;;cds;;;;;;328;;lytic transglycosylase domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;601019..603679;;cds;;358;*358;;;*887;;bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase;*
;604038..604113;;ttc;;318;318;;;;;;*
&gt;;604432..605613;;cds;;;;;;394;;site-specific integrase;*
plasmide6;;;;;;;;;;;;*
;88804..89472;;cds;;397;*397;;;223;;RraA family protein;*
;89870..89944;;ggc;;249;249;;;;;;*
;90194..91186;;cds;;;;;;331;;UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting);*
&lt;/pre&gt;

====abs cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_cumuls|abs cumuls]]
&lt;pre&gt;
abs cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;cdsa 30-300;
avec rRNA;opérons;10;1;2;;1;0;1;;100;18;1;0
;16atcgca235;1;20;3;;50;5;40;;200;29;30;0
;Id-23s°-atgf;1;40;4;4;100;22;80;;300;26;60;3
;1623s°5atgf;1;60;1;;150;29;120;;400;20;90;10
;max a;3;80;1;;200;18;160;;500;7;120;9
;a doubles;0;100;1;;250;18;200;;600;6;150;8
;autres;7;120;1;;300;3;240;;700;9;180;13
;total aas;10;140;1;;350;5;280;;800;2;210;9
sans ;opérons;51;160;0;;400;7;320;;900;1;240;6
;1 aa;39;180;1;;450;2;360;;1000;1;270;8
;max a;5;200;0;;500;6;400;;1100;0;300;7
;a doubles;5;;2;;;10;;;;2;;48
;total aas;67;;17;4;;125;;0;;121;;121
total aas;;;;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;71;31;;221;;;;308;;
;;;variance;72;1;;168;;;;230;;
sans jaune;;;moyenne;;;;151;;;;242;;166
;;;variance;;;;72;;;;137;;72
&lt;/pre&gt;

====abs blocs====
=====abs blocs abrégé=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_blocs_abrégé|abs blocs abrégé]]
&lt;pre&gt;
abs abq;;;
abrégé;nom;;
23s RlmB;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;;*
50s L21;50S ribosomal protein L21;;*
AAA fam;AAA family ATPase;;*
ab hydrolase;alpha/beta hydrolase;;*
ab hydrolase f;alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein;;*
AG cyclase;adenylate/guanylate cyclase domain-containing protein;;*
ak reductase;aldo/keto reductase;;*
ATP bind;ATP-binding cassette domain-containing protein;;*
bacteriofer;bacterioferritin;;*
bif CoA;bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase;;*
bif NAD;bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase;;*
chemotaxis p;methyl-accepting chemotaxis protein;;*
cupin dom;cupin domain-containing protein;;*
cyclicN bind;cyclic nucleotide-binding domain-containing protein;;*
diG cyclase;diguanylate cyclase;;*
dip ABC;dipeptide ABC transporter ATP-binding protein;;*
disulfide;disulfide bond formation protein B;;*
DMT fam;DMT family transporter;;*
DUF1489;DUF1489 domain-containing protein;;*
DUF2141;DUF2141 domain-containing protein;;*
DUF3108;DUF3108 domain-containing protein;;*
DUF3618;DUF3618 domain-containing protein;;*
EAL &amp; GGDEF;EAL and GGDEF domain-containing protein;;*
elonga Tu;elongation factor Tu;;*
ETC complex;ETC complex I subunit;;*
exo SbcD;exonuclease subunit SbcD;;*
FAD bind;FAD-binding oxidoreductase;;*
FadR fam;FadR family transcriptional regulator;;*
farnesyl;farnesyltranstransferase;;*
fucosyl;alpha-1,3-fucosyltransferase;;*
GGDEF dom;GGDEF domain-containing protein;;*
glycosyl;glycosyltransferase;;*
GNAT fam;GNAT family N-acetyltransferase;;*
gyrase YacG;DNA gyrase inhibitor YacG;;*
Hase HypA;hydrogenase maturation nickel metallochaperone HypA;;*
helicas RecQ;DNA helicase RecQ;;*
HU bind;HU family DNA-binding protein;;*
Hx-t-Hx;helix-turn-helix transcriptional regulator;;*
Hx-t-Hx dom;helix-turn-helix domain-containing protein;;*
IclR fam;IclR family transcriptional regulator;;*
inorganic  P;inorganic phosphate transporter;;*
IS3 fam;IS3 family transposase;;*
IS5 fam;IS5 family transposase;;*
L-iso-Asp;protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;;*
lipoyl LipB;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;;*
low Thr;low specificity L-threonine aldolase;;*
lytic dom;lytic transglycosylase domain-containing protein;;*
malate G;malate synthase G;;*
malonyl CoA;malonyl-CoA decarboxylase;;*
MaoC fam;MaoC family dehydratase;;*
MarR fam;MarR family transcriptional regulator;;*
mecano ion;mechanosensitive ion channel;;*
membrane p;membrane protein;;*
menaquinone;dimethylmenaquinone methyltransferase;;*
MerR fam;MerR family transcriptional regulator;;*
methyl trans;methyltransferase domain-containing protein;;*
N-acetyl trans;N-acetyltransferase;;*
N-formyl Glu;N-formylglutamate amidohydrolase;;*
NAD diP;NAD(+) diphosphatase;;*
NADH-quinone;NADH-quinone oxidoreductase subunit A;;*
NDUFA9;complex I NDUFA9 subunit family protein;;*
NERD dom;NERD domain-containing protein;;*
nitrogen NifQ;nitrogen fixation protein NifQ;;*
non ribosom;non-ribosomal peptide synthetase;;*
osmose LipB;osmotically-inducible lipoprotein B;;*
p-ATP-bind;p-ATP-binding protein;;*
p-erythrose;p-erythrose-4-phosphate dehydrogenase;;*
P-II nitrogen;P-II family nitrogen regulator;;*
p-IS5/IS1182;P-IS5/IS1182 family transposase;;*
p-low Thr;p-low specificity L-threonine aldolase;;*
p-ssDNA exo;p-single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;;*
pantetheine;pantetheine-phosphate adenylyltransferase;;*
PAP2 fam;phosphatase PAP2 family protein;;*
PAS dom;PAS domain-containing protein;;*
PAS kinase;PAS domain-containing sensor histidine kinase;;*
PAS S-box;PAS domain S-box protein;;*
peptido fam;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;;*
peptido Pal;peptidoglycan-associated lipoprotein Pal;;*
polymerase;RNA-directed DNA polymerase;;*
polysacchard;polysaccharide biosynthesis protein;;*
Ppx/GppA;Ppx/GppA family phosphatase;;*
PQQ;PQQ-dependent sugar dehydrogenase;;*
Prolyl-tRNA;prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;;*
pyridoxamine;pyridoxamine 5'-phosphate oxidase;;*
pyruvate kin;pyruvate kinase;;*
recombinase;recombinase family protein;;*
response reg;response regulator;;*
restriction end;restriction endonuclease;;*
ribonucleaseD;ribonuclease D;;*
RraA fam;RraA family protein;;*
SDR fam;SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase;;*
sigma RpoD;RNA polymerase sigma factor RpoD;;*
sigma-70 fam;sigma-70 family RNA polymerase sigma factor;;*
SLT dom;transglycosylase SLT domain-containing protein;;*
ss integrase;site-specific integrase;;*
Ss-DNA;single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;;*
STAS dom;STAS domain-containing protein;;*
subunit SecE;preprotein translocase subunit SecE;;*
tetratricopep;tetratricopeptide repeat protein;;*
TIGR02300;TIGR02300 family protein;;*
trigger factor;trigger factor;;*
tRNA MnmA;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA;;*
Tyr rec/int;tyrosine-type recombinase/integrase;;*
UDP-N-acetyl;UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting);;*
xanthine;xanthine phosphoribosyltransferase;;*
YggT fam;YggT family protein;;*
YkgJ fam;YkgJ family cysteine cluster protein;;*
&lt;/pre&gt;

=====abs blocs tableau=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_blocs_tableau|abs blocs tableau]]
&lt;pre&gt;
abs blocs;;;;;;;;;;;
gène;inter;long;abrégé;gène;inter;long;abrégé;gène;inter;long;abrégé
cds;486;419;SbcD;cds;100;146;P-eryt;cds;675;153;MarR
16s;110;1491;;16s°;110;707;;16s;107;1491;
atc;30;;;atc;32;;;atc;31;;
gca;271;;;gca;272;;;gca;271;;
23s;127;2753;;23s;123;2753;;23s;147;2753;
5s;153;116;;5s;244;116;;cds;;369;GNAT
cds;;79;hp;cds;;97;YkgJ;;;;
;;;;;;;;;;;
cds;457;143;DUF1489;;;;;;;;
16s;110;1491;;;;;;;;;
atc;31;;;;;;;;;;
gca;269;;;;;10 cds &lt; 259 sur 20;;;;;
23s°;100;1380;;;;Dont 2 hp + 1 p;;;;;
23s°;123;530;;;;;;;;;
5s;100;116;;;;;;;;;
atgf;706;;;;;;;;;;
cds;;473;pyruvat;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
cds;465;259;IclR;cds;502;65;hp;cds;495;235;PAP2
16s;584;1486;;16s°;106;372;;16s’;189;1084;
23s°;128;767;;23s°;129;649;;23s°;127;678;
5s;101;116;;5s;281;116;;5s;153;116;
atgf;359;;;cds;;387;PQQ;cds;;625;GGDEF
cds;;1110;NERD;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
cds;775;1328;non-rib;cds;738;448;peptido;cds;249;209;pyridox
16s°;100;389;;16s°;193;;;16s°;547;558;
16s°;522;671;;atgf;437;;;cds;;328;lytic
cds;;160;DUF2141;cds;;637;PAS;;;;
&lt;/pre&gt;

=====abs abq blocs=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_abq_blocs|abs abq blocs]]
*Note: attention pour les couleurs de &amp; (EAL &amp; GDDEF) et de ? (d'où?) 3 fois
&lt;pre&gt;
;gtRNAdb;;;;;;;;;;gtRNAdb;;;;;
;abs;genome;;;;;;;;;abq;genome;;;;
68.45%GC;10.1.20 Paris;80 aas;intercalaires;cdsa;protéines;;;;;68.45%GC;29.12.19 Paris;88 aas;intercalaires;cdsa;protéines;
Azospirillum brasilense strain Sp245;;;;;;;;;;Azospirillum brasilense strain Az39;;;;;;
chromosome;;;;;;;;;;chromosome;;;;;;
;2856509..2858152;cds;365;548;recombinase;*    CHA1;;*  comp;;;2482875..2484518;cds;365;548;recombinase;*    CHA1
comp;2858518..2858608;tcc;118;;;*;;*  hp caracter;;comp;2484884..2484974;tcc;120;;;*
comp;2858727..2859530;cds;;268;ab hydrolase;* ;;*  modif;;comp;2485095..2485898;cds;;268;ab hydrolase;*
;;;;;;;;*  déplacé;;;;;;;;*
comp;16414..16980;cds;163;189;Prolyl-tRNA;*   ;;*   d’où?;;comp;2640759..2641325;cds;149;189;Prolyl-tRNA;*
;17144..17218;ggc;670;;;*;;*   recomb;;;2641475..2641549;ggc;688;;;*
;17889..18566;cds;;226;menaquinone;*;;*  insertion;;;2642238..2642915;cds;;226;menaquinone;*
;;;;;;*;;*  bloc?;;;;;;;;*
;84790..85017;cds;114;76;@osmose LipB;*  comp;;*  réunion;;comp;2764482..2765567;cds;659;362;@hp;*
comp;85132..85205;ggg;35;;;*;;*  recombi;;comp;2766227..2766300;ggg;35;;;*
comp;85241..85900;cds;;220;N-acetyl trans;*;;;;comp;2766336..2766995;cds;;220;N-acetyl trans;*
;;;;;;;;;;;;;;;;
comp;93530..94258;cds;60;243;SDR fam;*  CHA;;;;;2781933..2783774;cds;187;614;EAL &amp; GGDEF;*    CHA
comp;94319..94395;agg;175;;;*;;;;comp;2783962..2784077;$5s;129;§116;;*
;94571..96262;cds;;564;@hp;*  hp caracter;;;;comp;2784207..2786959;$23s;255;§2753;;*
;;;;;;*;;;;comp;2787215..2787290;gca;30;;;*
comp;131833..132117;cds;206;95;YggT fam;*;;;;comp;2787321..2787397;atc;108;;;*
;132324..132399;gcg;140;;;*;;;;comp;2787506..2789006;$16s;496;§1501;;*
comp;132540..133586;cds;;349;@DMT fam;*  modif;;;;comp;2789503..2790207;cds;;235;PAP2 fam;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
comp;483582..484082;cds;170;167;xanthine;*;;;;;2843264..2843443;cds;77;60;hp;*
;484253..484329;cgt;77;;;*;;;;comp;2843521..2843597;cgt;170;;;*
comp;484407..484586;cds;;60;hp;*;;;;;2843768..2844268;cds;;167;xanthine;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;
;536869..537573;cds;495;235;PAP2 fam;*;;;;;125527..126444;cds;127;306;@restriction end;*    
;538069..539152;?16s’;189;§1084;;*;;;;comp;126572..126647;gcg;206;;;*
;539342..540019;&amp;23s°;127;§678;;*;;;;;126854..127138;cds;;95;YggT fam;*
;540147..540262;$5s;153;§116;;*;;;;;;;;;;*
comp;540416..542290;cds;;625;GGDEF dom;*;;;;comp;163237..164982;cds;175;582;@Hase HypA;*
;;;;;;;;;;;165158..165234;agg;59;;;*
;;;;;;;;;;;165294..166022;cds;;243;SDR fam;*
;;;;;;;;;;;;;;;;
;600048..601079;cds;79;344;@Tyr rec/int;*    comp;;;;comp;188235..189860;cds;42;542;@glycosyl;*    CHB
comp;601159..601233;acg;81;;;*;;;;comp;189903..189977;acg;81;;;*
comp;601315..603243;cds;;643;helicas RecQ;*;;;;comp;190059..191987;cds;;643;helicas RecQ;*
;;;;;;*  CHB;;;;;;;;;;*
comp;656242..656520;cds;169;93;hp;*;;;;comp;250833..251111;cds;169;93;hp;*
comp;656690..656765;gcc;141;;;*;;;;comp;251281..251356;gcc;141;;;*
comp;656907..657305;cds;;133;TIGR02300;*;;;;comp;251498..251893;cds;;132;TIGR02300;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
comp;864141..864458;cds;209;106;50s L21;*;;;;comp;458142..458459;cds;209;106;50s L21;*
;864668..864757;tcg;79;;;*;;;;;458669..458758;tcg;63;;;*
comp;864837..865679;cds;;281;ab hydrolase;*;;;;comp;458822..459664;cds;;281;ab hydrolase f;*
;;;;;;;;;;;;;;;;
;2233677..2234435;cds;92;253;@hp;*    recomb;;;;comp;496776..497171;cds;162;132;cupin dom;*    CHC
comp;2234528..2234603;?gag;38;;;*;;;;comp;497334..497420;ttg;137;;;*
comp;2234642..2234717;?gag;68;;;*;;;;;497558..498085;cds;;176;disulfide;*
comp;2234786..2235836;cds;;350;@p-low Thr;*  modif;;;;;;;;;;*
;;;;;;*;;;;comp;615937..616350;cds;121;138;hp;*
comp;2293087..2293593;cds;211;169;hp;*  CHC;;;;comp;616472..616548;?ccg;206;;;*
;2293805..2293881;cgt;137;;;*;;;;comp;616755..616831;?ccg;109;;;*
;2294019..2294495;cds;5;159;GNAT fam;*;;;;comp;616941..617957;cds;;339;farnesyl;*
comp;2294501..2294576;atgi;145;;;*;;;;;;;;;;*
comp;2294722..2296683;cds;;654;sigma RpoD;*;;;;comp;748703..749161;cds;38;153;@hp;*
;;;;;;*;;;;comp;749200..749275;aca;91;;;*
;2372946..2373401;cds;86;152;MaoC fam;*;;;;comp;749367..750221;cds;144;285;23s RlmB;*
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;2374023..2375549;cds;;509;methyl trans;*;;;;;750667..751857;cds;153;397;elonga Tu;*
;;;;;;*;;;;;752011..752086;tgg;69;;;*
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comp;2418470..2418545;tgg;152;;;*;;;;;;;;;;*
comp;2418698..2419888;cds;81;397;elonga Tu;*;;;;comp;794457..795983;cds;296;509;methyl trans;*
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;2420334..2421188;cds;91;285;23s RlmB;*;;;;comp;796617..797057;cds;;147;MaoC fam;*
;2421280..2421355;aca;137;;;*;;;;;;;;;;*
;2421493..2423187;cds;;565;@ss integrase;*    recombi;;;;;870412..872373;cds;159;654;sigma RpoD;*
;;;;;;*;;;;;872533..872608;atgi;5;;;*
;2561207..2562223;cds;109;339;farnesyl;*;;;;comp;872614..873093;cds;134;160;GNAT fam;*
;2562333..2562409;?ccg;205;;;*;;;;comp;873228..873304;cgt;212;;;*
;2562615..2562691;?ccg;136;;;*;;;;;873517..874023;cds;;169;hp;*
;2562828..2563241;cds;;138;hp;*;;;;;;;;;;*
;;;;;;*;;;;;931962..933011;cds;68;350;@low Thr;*
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;2681320..2681715;cds;;132;cupin dom;*;;;;comp;933342..934340;cds;;333;@SLT dom;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;
;1896604..1897080;cds;192;159;peptido Pal;*    CHD;;;;;997881..998357;cds;246;159;peptido Pal;*    CHD
comp;1897273..1897347;acc;162;;;*;;;;comp;998604..998678;acc;175;;;*
comp;1897510..1899495;cds;;662;polysacchard;*;;;;comp;998854..1000815;cds;;654;polysacchard;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
comp;2032701..2033588;cds;165;296;DUF3108;*;;;;comp;1164137..1165048;cds;159;304;DUF3108;*
;2033754..2033828;?gtg;132;;;*;;;;;1165208..1165282;?gtg;132;;;*
;2033961..2034035;?gtg;231;;;*;;;;;1165415..1165489;?gtg;231;;;*
;2034267..2034431;cds;;55;hp;*;;;;;1165721..1165885;cds;;55;hp;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
;2113098..2113601;cds;85;168;MerR fam;*;;;;;1242416..1242919;cds;85;168;MerR fam;*
;2113687..2113763;ccc;140;;;*;;;;;1243005..1243081;ccc;139;;;*
comp;2113904..2115682;cds;;593;cyclicN bind;*;;;;comp;1243221..1244999;cds;;593;cyclicN bind;*
;;;;;;;;;;;;;;;;*
comp;1808199..1808735;cds;79;179;hp;*    CHE;;;;comp;1353398..1353895;cds;118;166;hp;*    CHE
;1808815..1808892;cca;49;;;*;;;;;1354014..1354091;cca;49;;;*
;1808942..1809238;cds;10;99;ETC complex;*;;;;;1354141..1354437;cds;10;99;ETC complex;*
;1809249..1809325;aga;442;;;*;;;;;1354448..1354524;aga;443;;;*
;1809768..1810013;cds;;82;hp;*;;;;;1354968..1355213;cds;;82;hp;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
comp;1825075..1825305;cds;210;77;hp;*;;;;comp;1370270..1370500;cds;196;77;hp;*
comp;1825516..1825591;aac;219;;;*;;;;comp;1370697..1370772;aac;220;;;*
comp;1825811..1825884;tgc;217;;;*;;;;comp;1370993..1371066;tgc;218;;;*
;1826102..1826758;cds;;219;L-iso-Asp;*;;;;;1371285..1371941;cds;;219;L-iso-Asp;*
;;;;;;*;;;;;;;;;;*
comp;1878424..1878714;cds;244;97;YkgJ fam;*;;;;comp;1427443..1427733;cds;236;97;YkgJ fam;*
comp;1878959..1879074;$5s;123;§116;;*;;;;comp;1427970..1428085;$5s;129;§116;;*
comp;1879198..1881950;$23s;272;§2753;;*;;;;comp;1428215..1430967;$23s;266;§2753;;*
comp;1882223..1882298;gca;32;;;*;;;;comp;1431234..1431309;gca;30;;;*
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;503041..503667;cds;249;209;pyridoxamine;*;;;;;505136..505210;ggc;102;;;*
comp;503917..504474;&amp;16s°;547;§558;;*;;;;comp;505313..506080;cds;83;256;Hx-t-Hx;*
;505022..506005;cds;;328;@lytic dom;*    modif;;;;;506164..506790;cds;202;209;pyridoxamine;*
;;;;;;*;;;;comp;506993..507108;$5s;127;§116;;*
comp;601019..603679;cds;358;887;bif CoA;*;;;;comp;507236..509988;$23s;266;§2753;;*
;604038..604113;ttc;318;;;*;;;;comp;510255..510330;gca;30;;;*
&gt;;604432..605613;cds;;394;@ss integrase;*   recomb;;;;comp;510361..510437;atc;110;;;*
;;;;;;;;;;comp;510548..512038;$16s;615;§1491;;*
&gt;comp;131140..131621;cds;193;161;p-erythrose;*   ;;;;;512654..513568;cds;;305;@lytic dom;*
;131815..131891;atgf;202;;@ ;*  d’où?;;;;;;;;;;*
comp;132094..132276;cds;;61;hp;*;;;;comp;588108..590768;cds;340;887;bif CoA;*
;;;;;;;;;;;591109..591184;ttc;286;;;*
;;;;;;;;;;;591471..592979;cds;;503;@FAD bind;*
plasmide6;;;;;;;;;;plasmide5;;;;;;*
;88804..89472;cds;397;223;RraA fam;*;;;;;86421..87089;cds;455;223;RraA fam;*
;89870..89944;ggc;249;;;*;;;;;87545..87619;ggc;193;;;*
;90194..91186;cds;;331;UDP-N-acetyl;*;;;;;87813..88865;cds;;351;UDP-N-acetyl;*
&lt;/pre&gt;
====abs distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_distribution|abs distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;aag2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;cac2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;;ccg2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;;agc;1;gag2;atc;;acc;1;aac;3;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;1;cac;;cgt;2;gtg2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;3;;gtc;1;gcc;2;gac;4;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;ggc;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;3 1aa;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;1 &gt;1aa;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;1;;ctg;2;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;2;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;2;gcg;;gag;2;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
abs;;39;;;;;;;abs;20;;;;;;20;;abs;10;;;;;;10;;abs;;;;3;;;3
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3 1-3aas;;;
&lt;/pre&gt;
====abs données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_données_intercalaires|abs données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;abs;fx;fc;abs;fx40;fc40;abs;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;2;6;0;2;6;-1;0;55;670;163;tRNA 23s;;
1;1;10;65;167;1;4;12;-2;1;0;35;114;272;;gca
;0;20;41;134;2;1;18;-3;0;0;60;175;tRNA tRNA;;contig
;0;30;61;89;3;13;20;-4;3;194;81;206;32;;atc gca
;1;40;24;76;4;13;21;-5;0;0;169;140;tRNA tRNA;;
;1;50;27;62;5;2;24;-6;1;0;141;170;109;;cac
;1;60;25;63;6;14;9;-7;1;4;175;77;**;;cac
;2;70;16;52;7;9;14;-8;0;23;131;79;163;;gta
5;0;80;34;64;8;1;17;-9;0;0;148;209;**;;gac
1;3;90;28;70;9;6;11;-10;1;2;129;79;219;;aac
1;2;100;32;71;10;2;21;-11;0;7;173;187;**;;tgc
2;2;110;29;52;11;3;20;-12;0;0;91;234;132;;gtg
1;1;120;22;59;12;5;13;-13;0;3;105;106;**;;gtg
;2;130;24;59;13;4;23;-14;0;4;344;354;30;;gcc
3;5;140;25;54;14;4;15;-15;1;0;123;74;**;;ctg
1;3;150;21;52;15;4;17;-16;0;1;234;338;38;;gag
;1;160;29;37;16;4;9;-17;4;2;49;79;**;;gag
3;3;170;30;36;17;1;6;-18;0;1;10;217;74;;aag
1;2;180;24;43;18;5;6;-19;1;1;442;192;**;;aag
1;0;190;19;35;19;9;13;-20;1;4;210;165;60;;gga
1;0;200;17;34;20;2;12;-21;0;1;162;140;**;;tac
2;1;210;13;17;21;12;5;-22;0;0;231;107;205;;ccg
2;0;220;23;23;22;12;7;-23;2;3;85;92;**;;ccg
;0;230;13;22;23;3;7;-24;1;0;135;211;;;
1;2;240;13;15;24;9;11;-25;1;2;68;5;;;
;0;250;17;15;25;6;11;-26;0;2;134;86;;;
;0;260;9;15;26;0;9;-27;0;0;145;309;;;
;0;270;18;18;27;5;10;-28;0;0;69;144;;;
;0;280;10;11;28;6;12;-29;5;1;152;140;;;
;0;290;9;10;29;2;9;-30;0;0;81;365;;;
;0;300;10;7;30;6;8;-31;1;2;91;;;;
1;0;310;6;10;31;1;11;-32;1;0;137;;;;
;0;320;7;9;32;1;7;-33;0;0;109;;;;
;0;330;10;3;33;4;10;-34;0;0;136;;;;
1;0;340;11;2;34;4;5;-35;1;1;162;;;;
;1;350;4;2;35;4;6;-36;0;0;118;;;;
1;0;360;5;5;36;1;5;-37;0;0;23s 5s;;;;
1;0;370;8;7;37;6;8;-38;1;0;128;;;;
;0;380;2;3;38;1;8;-39;0;0;5s CDS;;;;
;0;390;4;2;39;2;10;-40;0;0;244;153;;;
;0;400;6;4;40;0;6;-41;0;0;;;;;
;2;reste;90;55;reste;690;1098;-42;0;0;;;;;
30;36;total;883;1570;total;883;1570;-43;0;0;;;;;
30;34;diagr;791;1509;diagr;191;466;-44;0;0;;;;;
1;1; t30;167;390;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;1;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;2;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;881;34;2;917;;;-49;1;0;;;;;
;c;1564;324;6;1894;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;2811;110;;reste;3;11;;;;;
;;;;;;2921;;total;34;324;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====abs autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_autres_intercalaires_aas|abs autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;abs;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;16414;16980;163;*;
;;tRNA;17144;17218;670;*;ggc
fin;;CDS;17889;18566;;;
deb;;CDS;84790;85017;114;*;
;comp;tRNA;85132;85205;35;*;ggg
fin;comp;CDS;85241;85900;;0;
deb;comp;CDS;93530;94258;60;*;
;comp;tRNA;94319;94395;175;*;agg
fin;;CDS;94571;96262;;0;
deb;comp;CDS;131833;132117;206;*;
;;tRNA;132324;132399;140;*;gcg
fin;comp;CDS;132540;133586;;;
deb;comp;CDS;440193;440705;127;*;
;;regulatory;440833;440912;76;*;
fin;;CDS;440989;442197;;;
deb;comp;CDS;483582;484082;170;*;
;;tRNA;484253;484329;77;*;cgt
fin;comp;CDS;484407;484586;;0;
deb;;CDS;536869;537573;506;*;
;;misc_f;538080;538894;491;*;
;;misc_f;539386;539554;19;*;
;;misc_f;539574;539733;19;*;
;;misc_f;539753;540001;145;*;
;;rRNA;540147;540262;153;*;116
fin;comp;CDS;540416;542290;;0;
deb;;CDS;600048;601079;79;*;
;comp;tRNA;601159;601233;81;*;acg
fin;comp;CDS;601315;603243;;;
deb;comp;CDS;656242;656520;169;*;
;comp;tRNA;656690;656765;141;*;gcc
fin;comp;CDS;656907;657305;;0;
deb;;CDS;815905;816444;135;*;
;;ncRNA;816580;816677;99;*;
fin;;CDS;816777;818633;;;
deb;comp;CDS;864141;864458;209;*;
;;tRNA;864668;864757;79;*;tcg
fin;comp;CDS;864837;865679;;;
deb;comp;CDS;927934;928101;187;*;
;;tRNA;928289;928371;175;*;tta
fin;;CDS;928547;929164;;;
deb;;CDS;946069;947757;64;*;
;;regulatory;947822;947974;151;*;
fin;;CDS;948126;948812;;;
deb;comp;CDS;1148345;1149223;234;*;
;;tRNA;1149458;1149532;106;*;gtc
fin;comp;CDS;1149639;1151516;;;
deb;;CDS;1244040;1245108;131;*;
;;tRNA;1245240;1245314;354;*;atgj
fin;comp;CDS;1245669;1246637;;;
deb;;CDS;1279875;1280237;74;*;
;comp;tRNA;1280312;1280397;148;*;tac
fin;comp;CDS;1280546;1281172;;;
deb;comp;CDS;1369782;1370351;31;*;
;comp;tmRNA;1370383;1370759;95;*;
fin;;CDS;1370855;1371793;;;
deb;comp;CDS;1414313;1414690;160;*;
;;regulatory;1414851;1414948;69;*;
fin;;CDS;1415018;1416172;;;
deb;comp;CDS;1500772;1501110;338;*;
;;tRNA;1501449;1501524;109;*;cac
;;tRNA;1501634;1501709;129;*;cac
fin;;CDS;1501839;1503305;;;
deb;;CDS;1503412;1504977;173;*;
;;tRNA;1505151;1505235;91;*;cta
fin;;CDS;1505327;1506661;;;
deb;;CDS;1511745;1512017;105;*;
;;tRNA;1512123;1512197;163;*;gta
;;tRNA;1512361;1512437;344;*;gac
fin;;CDS;1512782;1513150;;;
deb;;CDS;1657596;1659397;123;*;
;;tRNA;1659521;1659596;234;*;gaa
fin;;CDS;1659831;1660671;;;
deb;comp;CDS;1671855;1672043;204;*;
;;regulatory;1672248;1672360;116;*;
fin;;CDS;1672477;1674318;;0;
deb;comp;CDS;1808199;1808735;79;*;
;;tRNA;1808815;1808892;49;*;cca
deb;;CDS;1808942;1809238;10;*;
;;tRNA;1809249;1809325;442;*;aga
fin;;CDS;1809768;1810013;;0;
deb;comp;CDS;1825075;1825305;210;*;
;comp;tRNA;1825516;1825591;219;*;aac
;comp;tRNA;1825811;1825884;217;*;tgc
fin;;CDS;1826102;1826758;;;
deb;comp;CDS;1878424;1878714;244;*;
;comp;rRNA;1878959;1879074;128;*;116
;comp;rRNA;1879203;1881950;272;*;2748
;comp;tRNA;1882223;1882298;32;*;gca
;comp;tRNA;1882331;1882407;129;*;atc
;comp;misc_f;1882537;1883185;139;*;
fin;comp;CDS;1883325;1883763;;;
deb;;CDS;1886482;1886796;13;*;
;;ncRNA;1886810;1886969;39;*;
fin;;CDS;1887009;1887617;;;
deb;;CDS;1896604;1897080;192;*;
;comp;tRNA;1897273;1897347;162;*;acc
fin;comp;CDS;1897510;1899495;;;
deb;comp;CDS;2032701;2033588;165;*;
;;tRNA;2033754;2033828;132;*;gtg
;;tRNA;2033961;2034035;231;*;gtg
fin;;CDS;2034267;2034431;;;
deb;;CDS;2113098;2113601;85;*;
;;tRNA;2113687;2113763;140;*;ccc
fin;comp;CDS;2113904;2115682;;0;
deb;comp;CDS;2163405;2167388;813;*;
;;misc_f;2168202;2168532;294;*;
;comp;misc_f;2168827;2169315;530;*;
fin;comp;CDS;2169846;2170325;;;
deb;;CDS;2176963;2177427;107;*;
;comp;tRNA;2177535;2177610;30;*;gcc
;comp;tRNA;2177641;2177727;135;*;ctg
fin;comp;CDS;2177863;2180208;;0;
deb;comp;CDS;2197944;2199056;175;*;
;comp;regulatory;2199232;2199345;72;*;
fin;comp;CDS;2199418;2199663;;0;
deb;;CDS;2233677;2234435;92;*;
;comp;tRNA;2234528;2234603;38;*;gag
;comp;tRNA;2234642;2234717;68;*;gag
fin;comp;CDS;2234786;2235821;;;
deb;comp;CDS;2293087;2293593;211;*;
;;tRNA;2293805;2293881;134;*;cgt
deb;;CDS;2294016;2294495;5;*;
;comp;tRNA;2294501;2294576;145;*;atgi
fin;comp;CDS;2294722;2296683;;;
deb;;CDS;2372946;2373401;86;*;
;comp;tRNA;2373488;2373563;74;*;aag
;comp;tRNA;2373638;2373713;309;*;aag
fin;;CDS;2374023;2375549;;1;
deb;comp;CDS;2418203;2418400;69;*;
;comp;tRNA;2418470;2418545;152;*;tgg
deb;comp;CDS;2418698;2419888;81;*;
;comp;tRNA;2419970;2420043;60;*;gga
;comp;tRNA;2420104;2420189;144;*;tac
deb;;CDS;2420334;2421188;91;*;
;;tRNA;2421280;2421355;137;*;aca
fin;;CDS;2421493;2423187;;;
deb;;CDS;2561207;2562223;109;*;
;;tRNA;2562333;2562409;205;*;ccg
;;tRNA;2562615;2562691;136;*;ccg
fin;;CDS;2562828;2563241;;0;
deb;;CDS;2577826;2578533;62;*;
;;ncRNA;2578596;2578998;554;*;
fin;;CDS;2579553;2580050;;;
deb;comp;CDS;2680406;2680930;140;*;
;;tRNA;2681071;2681157;162;*;ttg
fin;;CDS;2681320;2681715;;;
deb;;CDS;2856509;2858152;365;*;
;comp;tRNA;2858518;2858608;118;*;tcc
fin;comp;CDS;2858727;2859530;;0;
deb;;CDS;2940550;2940948;67;*;
;;regulatory;2941016;2941120;49;*;
fin;;CDS;2941170;2942093;;0;
&lt;/pre&gt;

====absp données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#absp_données_intercalaires|absp données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;absp;fx;fc;absp;fx40;fc40;absp;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;0;0;0;0;0;-1;0;26;135;84;16s tRNA;;
;0;10;38;87;1;4;8;-2;2;0;205;116;2* 116;;atc
;0;20;28;81;2;1;9;-3;0;0;143;200;113;;atc
;0;30;27;59;3;4;16;-4;2;124;257;245;tRNA 23s;;
1;0;40;12;44;4;7;10;-5;0;0;746;351;2* 272;;gca
;0;50;15;38;5;3;7;-6;0;0;298;178;270;;gca
1;0;60;8;39;6;2;3;-7;0;1;238;213;5s tRNA;;
;0;70;14;33;7;7;7;-8;1;12;153;32;100;;atgf
;1;80;15;31;8;0;11;-9;0;0;123;229;tRNA tRNA;;intra
1;0;90;14;23;9;2;5;-10;1;0;98;52;30;;atc gca
;1;100;9;41;10;8;11;-11;1;6;178;301;2* 31;;atc gca
;0;110;13;29;11;1;7;-12;1;0;453;;tRNA tRNA;;
1;0;120;18;28;12;0;6;-13;0;2;79;;30;;ctg
;1;130;12;24;13;5;14;-14;0;4;706;;**;;gcc
;1;140;15;34;14;1;15;-15;0;0;CDS 16s;;1;;acc
;1;150;18;25;15;3;3;-16;1;1;457;486;99;;gcg
;1;160;8;22;16;4;9;-17;0;2;;642;35;;gac
;0;170;26;30;17;3;6;-18;0;0;23s 5s;;1;;gtc
1;1;180;8;19;18;4;10;-19;0;1;128;;**;;cag
;0;190;10;14;19;3;7;-20;3;1;132;;4;;aac
1;0;200;6;12;20;4;4;-21;0;0;23s CDS;;**;;gac
;1;210;6;10;21;1;6;-22;0;0;-;151;;;
1;0;220;12;17;22;8;3;-23;0;1;5s CDS;;;;
1;0;230;6;9;23;5;5;-24;0;0;-;153;;;
;1;240;12;11;24;1;3;-25;0;1;;;;;
1;0;250;6;13;25;4;9;-26;1;2;;;;;
;1;260;6;8;26;4;9;-27;0;0;;;;;
;0;270;11;9;27;1;8;-28;1;1;;;;;
;0;280;9;5;28;1;8;-29;0;1;;;;;
;0;290;4;3;29;2;4;-30;0;0;;;;;
;1;300;5;5;30;0;4;-31;1;0;;;;;
1;0;310;2;3;31;1;3;-32;0;0;;;;;
;0;320;6;3;32;2;3;-33;0;0;;;;;
;0;330;4;2;33;1;3;-34;0;0;;;;;
;0;340;5;7;34;2;7;-35;0;2;;;;;
;0;350;6;1;35;1;8;-36;0;0;;;;;
1;0;360;2;3;36;1;4;-37;1;0;;;;;
;0;370;1;4;37;1;3;-38;0;2;;;;;
;0;380;0;1;38;0;5;-39;0;0;;;;;
;0;390;1;0;39;2;6;-40;0;0;;;;;
;0;400;2;2;40;1;2;-41;1;1;;;;;
;3;reste;52;44;reste;367;602;-42;0;0;;;;;
11;14;total;472;873;total;472;873;-43;1;0;;;;;
11;11;diagr;420;829;diagr;105;271;-44;1;0;;;;;
0;0; t30;93;227;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;1;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;472;25;0;497;;;-49;0;1;;;;;
;c;873;206;0;1079;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1576;54;;reste;5;14;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====absp autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#absp_autres_intercalaires_aas|absp autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;absp;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;198109;199200;84;*;
;comp;tRNA;199285;199360;135;*;aaa
fin;comp;CDS;199496;200044;;;
deb;;CDS;243776;244348;205;*;
;;tRNA;244554;244643;143;*;tca
fin;;CDS;244787;245683;;0;
deb;;CDS;338004;339383;116;*;
;comp;tRNA;339500;339586;257;*;ctc
fin;comp;CDS;339844;340836;;;
deb;comp;CDS;364473;365501;200;*;
;;tRNA;365702;365775;746;*;cag
fin;;CDS;366522;367214;;;
deb;;CDS;474173;477079;298;*;
;;tRNA;477378;477464;30;*;ctg
;;tRNA;477495;477570;238;*;gcc
fin;;CDS;477809;478123;;;
deb;comp;CDS;496623;497399;289;*;
;;regulatory;497689;497905;38;*;
fin;;CDS;497944;499011;;;
deb;;CDS;599223;600230;245;*;
;comp;tRNA;600476;600550;351;*;ggc
fin;;CDS;600902;602071;;;
deb;comp;CDS;629856;631205;178;*;
;;tRNA;631384;631458;1;*;acc
;;tRNA;631460;631535;99;*;gcg
;;tRNA;631635;631711;35;*;gac
;;tRNA;631747;631821;1;*;gtc
;;tRNA;631823;631896;153;*;cag
fin;;CDS;632050;632259;;;
deb;comp;CDS;699265;699843;213;*;
;;tRNA;700057;700132;4;*;aac
;;tRNA;700137;700213;32;*;gac
fin;comp;CDS;700246;700851;;;
deb;;CDS;909530;909766;153;*;
;comp;rRNA;909920;910035;132;*;116
;comp;rRNA;910168;912914;272;*;2747
;comp;tRNA;913187;913262;30;*;gca
;comp;tRNA;913293;913369;116;*;atc
;comp;rRNA;913486;914970;486;*;1485
fin;;CDS;915457;916713;;;
deb;comp;CDS;975367;977091;141;*;
;;regulatory;977233;977362;74;*;
fin;;CDS;977437;978516;;;
deb;comp;CDS;998160;999149;229;*;
;;tRNA;999379;999465;123;*;ctg
fin;;CDS;999589;1000215;;;
deb;comp;CDS;1066729;1068657;115;*;
;comp;regulatory;1068773;1068992;54;*;
fin;comp;CDS;1069047;1069505;;0;
deb;comp;CDS;1098197;1098688;642;*;
;;rRNA;1099331;1100815;113;*;1485
;;tRNA;1100929;1101005;31;*;atc
;;tRNA;1101037;1101112;272;*;gca
;;rRNA;1101385;1104132;151;*;2748
fin;comp;CDS;1104284;1105390;;;
deb;;CDS;1157171;1157356;98;*;
;;tRNA;1157455;1157530;178;*;ttc
fin;;CDS;1157709;1158686;;;
deb;;CDS;1394614;1396740;453;*;
;;tRNA;1397194;1397287;52;*;agc
fin;comp;CDS;1397340;1397858;;;
deb;;CDS;1399009;1399830;301;*;
;comp;tRNA;1400132;1400206;79;*;caa
fin;comp;CDS;1400286;1402385;;;
deb;;CDS;1577667;1578095;457;*;
;;rRNA;1578553;1580037;116;*;1485
;;tRNA;1580154;1580230;31;*;atc
;;tRNA;1580262;1580337;270;*;gca
;;rRNA;1580608;1582611;128;*;2004
;;rRNA;1582740;1582855;100;*;116
;;tRNA;1582956;1583032;706;*;atgf
fin;;CDS;1583739;1585157;;0;
&lt;/pre&gt;

===agr===
====agr opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_opérons|agr opérons]]
&lt;pre&gt;
59.3%GC;29.12.19 Paris;16s  5 ;58 aas;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Agrobacterium sp. H13-3 ;;;;;;;;;;;;
chromosoml;;;;;;;;;;;;
comp;1064633..1065274;;cds;;296;296;;;214;;hp;*
;1065571..1065655;;ttg;;266;266;;;;;;*
;1065922..1066437;;cds;;;;;;172;;disulfide bond formation protein B;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1178605..1179114;;cds;;256;256;;;170;;prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein;*
;1179371..1179445;;ggc;@1;793;;793;;;;;*
comp;1180239..1180315;;atgj;;135;135;;;;;;*
comp;1180451..1181647;;cds;;;;;;399;;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1320644..1321006;;cds;;318;318;;;121;;hp;*
comp;1321325..1321414;;tcg;;197;197;;;;;;*
comp;1321612..1322493;;cds;;;;;;294;;dihydrodipicolinate synthase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1361929..1362942;;cds;;554;*554;;;338;;sugar ABC transporter substrate-binding protein;*
comp;1363497..1363571;;gtc;;81;81;;;;;;*
comp;1363653..1364015;;cds;;;;;;121;;response regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;1426814..1427137;;cds;;105;105;;;108;;hp;*
;1427243..1428733;;16s;;337;;;;1491;;;*
;1429071..1429147;;atc;;59;;;59;;;;*
;1429207..1429282;;gca;;146;146;;;;;;*
&lt;comp;1429429..1429626;;cds;@2;241;241;;;66;;P-hp;*
;1429868..1432681;;23s;;242;;;;2814;;;*
;1432924..1433038;;5s;;257;;;;115;;;*
;1433296..1433372;;atgf;;311;311;;;;;;*
;1433684..1434118;;cds;;;;;;145;;acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit;*
;;;;;;;;;;;;*
;1503534..1504520;;cds;;122;122;;;329;;beta-ketoacyl-ACP synthase III;*
comp;1504643..1504716;;cag;;123;123;;;;;;*
comp;1504840..1505277;;cds;;;;;;146;;Lrp/AsnC family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1605356..1605856;;cds;;71;71;;;167;;hp;*
comp;1605928..1606003;;gcc;;152;152;;;;;;*
comp;1606156..1606545;;cds;;;;;;130;;TIGR02300 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;1687683..1688015;;cds;;105;105;;;111;;hp;*
;1688121..1689611;;16s;;337;;;;1491;;;*
;1689949..1690025;;atc;;59;;;59;;;;*
;1690085..1690160;;gca;;146;146;;;;;;*
&lt;comp;1690307..1690504;;cds;;241;241;;;66;;P-hp;*
;1690746..1693559;;23s;;242;;;;2814;;;*
;1693802..1693916;;5s;;257;;;;115;;;*
;1694174..1694250;;atgf;;203;203;;;;;;*
comp;1694454..1694645;;cds;;;;;;64;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;2103153..2103404;;cds;;105;105;;;84;;P-hp;*
;2103510..2105000;;16s;;337;;;;1491;;;*
;2105338..2105414;;atc;;59;;;59;;;;*
;2105474..2105549;;gca;;146;146;;;;;;*
&lt;comp;2105696..2105893;;cds;;241;241;;;66;;P-hp;*
;2106135..2108948;;23s;;242;;;;2814;;;*
;2109191..2109305;;5s;;257;;;;115;;;*
;2109563..2109639;;atgf;;633;*633;;;;;;*
;2110273..2110680;;cds;;;;;;136;;membrane protein;*
chromosomc;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;56862..57137;;cds;;105;105;;;92;;P-hp;*
;57243..58733;;16s;;337;;;;1491;;;*
;59071..59147;;atc;;59;;;59;;;;*
;59207..59282;;gca;;146;146;;;;;;*
&lt;comp;59429..59626;;cds;;241;241;;;66;;P-hp;*
;59868..62681;;23s;;242;;;;2814;;;*
;62924..63038;;5s;;257;;;;115;;;*
;63296..63372;;atgf;;196;196;;;;;;*
;63569..65377;;cds;;;;;;*603;;DNA helicase RecQ;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;125821..127722;;cds;;287;287;;;*634;;molecular chaperone DnaK;*
comp;128010..128099;;tcc;;220;220;;;;;;*
;128320..128637;;cds;;;;;;106;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;227621..228004;;cds;;240;240;;;128;;membrane protein;*
comp;228245..228331;;ctg;;120;120;;;;;;*
comp;228452..228757;;cds;;;;;;102;;SelT/SelW/SelH family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;;378307..378396;;cds;;40;40;;;30;;P-hp;*
;378437..378513;;cgt;;174;174;;;;;;*
;378688..379500;;cds;;;;;;271;;class I SAM-dependent methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;407277..407435;;cds;;167;167;;;53;;YqaE/Pmp3 family membrane protein;*
comp;407603..407678;;acg;;137;137;;;;;;*
comp;407816..408778;;cds;;;;;;321;;nitronate monooxygenase;*
;;;;;;;;;;;;*
;425990..427087;;cds;;56;56;;;366;;2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase;*
;427144..427217;;ggg;;154;154;;;;;;*
;427372..428058;;cds;;;;;;229;;aquaporin Z;*
;;;;;;;;;;;;*
;458659..459081;;cds;;285;285;;;141;;hp;*
;459367..459442;;ttc;;246;246;;;;;;*
comp;459689..460033;;cds;;;;;;115;;cation:proton antiporter;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;493759..494025;;cds;;155;155;;;89;;hp;*
;494181..494255;;acc;;195;195;;;;;;*
comp;494451..495686;;cds;;;;;;412;;flagellin;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;564938..568684;;cds;;361;*361;;;*1249;;PAS domain S-box protein;*
;569046..569122;;cac;;79;79;;;;;;*
;569202..570920;;cds;;;;;;573;;Ppx/GppA family phosphatase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;763448..764356;;cds;;202;202;;;303;;MBL fold metallo-hydrolase;*
;764559..764633;;caa;;263;263;;;;;;*
comp;764897..766549;;cds;;;;;;551;;malate dehydrogenase (quinone);*
;;;;;;;;;;;;*
comp;767020..767439;;cds;;264;264;;;140;;hp;*
;767704..767780;;ccg;;159;159;;;;;;*
comp;767940..768260;;cds;;;;;;107;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;960360..960701;;cds;;163;163;;;114;;hp;*
;960865..960955;;agc;;500;*500;;;;;;*
comp;961456..961671;;cds;;;;;;72;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1123408..1124136;;cds;;141;141;;;243;;hp;*
;1124278..1124363;;tta;;241;241;;;;;;*
;1124605..1127115;;cds;;;;;;*837;;copper-translocating P-type ATPase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1154411..1154803;;cds;;91;91;;;131;;DUF2934 domain-containing protein;*
comp;1154895..1154969;;aac;;176;176;;;;;;*
;1155146..1155424;;cds;;;;;;93;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1162767..1163027;;cds;;138;138;;;87;;hp;*
comp;1163166..1163242;;ccc;;218;218;;;;;;*
;1163461..1163997;;cds;;;;;;179;;DUF1269 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1192452..1194650;;cds;;660;*660;;;*733;;esterase-like activity of phytase family protein;*
comp;1195311..1195386;;gta;+;446;;446;;;;;*
;1195833..1195909;;gac;2 gac;41;;41;;;;;*
;1195951..1196027;;gac;;435;*435;;;;;;*
;1196463..1196828;;cds;;;;;;122;;NADH-quinone oxidoreductase subunit A;*
;;;;;;;;;;;;*
;1421863..1422201;;cds;;134;134;;;113;;hp;*
comp;1422336..1422425;;tca;;88;88;;;;;;*
comp;1422514..1422678;;cds;;;;;;55;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1468229..1469110;;cds;;180;180;;;294;;HNH endonuclease;*
comp;1469291..1469367;;atgf;;132;132;;;;;;*
comp;1469500..1470450;;cds;;;;;;317;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1508458..1508883;;cds;;558;*558;;;142;;PAS domain-containing protein;*
comp;1509442..1509526;;ctc;;189;189;;;;;;*
;1509716..1510447;;cds;;;;;;244;;lipoyl(octanoyl) transferase LipB;*
;;;;;;;;;;;;*
;1531160..1531933;;cds;;447;*447;;;258;;amino acid ABC transporter ATP-binding protein;*
;1532381..1532455;;gaa;;121;121;;;;;;*
;1532577..1532818;;cds;;89;89;;;81;;P-hp;*
;1532908..1532982;;gaa;;129;129;;;;;;*
comp;1533112..1534920;;cds;;;;;;*603;;single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;*
;;;;;;;;;;;;*
;1584509..1584763;;cds;;155;155;;;85;;GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein;*
;1584919..1584994;;aag;;134;134;;;;;;*
comp;1585129..1585575;;cds;;;;;;149;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1612420..1613898;;cds;;240;240;;;493;;trigger factor;*
comp;1614139..1614221;;cta;;447;*447;;;;;;*
&lt;;1614669..1614876;;cds;;;;;;69;;P-hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1672216..1672887;;cds;;245;245;;;224;;protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;*
comp;1673133..1673206;;tgc;;240;240;;;;;;*
comp;1673447..1673599;;cds;;;;;;51;;DUF3309 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1744688..1745434;;cds;;341;341;;;249;;cytochrome c biogenesis protein CcdA;*
;1745776..1745851;;aaa;;310;310;;;;;;*
;1746162..1746743;;cds;;;;;;194;;DUF1003 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1770727..1772280;;cds;;91;91;;;518;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;1772372..1772448;;cca;;265;265;;;;;;*
;1772714..1773019;;cds;;51;51;;;102;;ETC complex I subunit;*
;1773071..1773147;;aga;;7;7;;;;;;*
comp;1773155..1773892;;cds;;;;;;246;;DUF429 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1902337..1902537;;cds;;184;184;;;67;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;1902722..1902797;;tgg;;241;241;;;;;;*
comp;1903039..1903845;;cds;;;;;;269;;glycosyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1908698..1908892;;cds;;70;70;;;65;;hp;*
comp;1908963..1909036;;gga;;26;26;26;;;;;*
comp;1909063..1909147;;tac;;209;209;;;;;;*
;1909357..1910244;;cds;;;;;;296;;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;;;;;;;;;;;;*
;1922447..1922800;;cds;;55;55;;;118;;hp;*
comp;1922856..1922931;;aca;;207;207;;;;;;*
;1923139..1924878;;cds;;;;;;580;;GGDEF domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2079925..2080287;;cds;;156;156;;;121;;hp;*
comp;2080444..2080519;;atgi;;178;178;;;;;;*
;2080698..2081441;;cds;;;;;;248;;SIMPL domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2275632..2276138;;cds;;522;*522;;;169;;winged helix-turn-helix transcriptional regulator;*
;2276661..2276737;;cgg;;287;287;;;;;;*
;2277025..2277264;;cds;;;;;;80;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2388300..2388497;;cds;;87;87;;;66;;hp;*
;2388585..2388659;;ggc;;361;*361;;;;;;*
;2389021..2391024;;cds;;;;;;*668;;methyl-accepting chemotaxis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2490745..2491854;;cds;;535;*535;;;370;;2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein;*
comp;2492390..2492466;;atgf;;287;;;;115;;;*
comp;2492754..2492868;;5s;;242;;;;2814;;;*
comp;2493111..2495924;;23s;;241;241;;;;;;*
&gt;;2496166..2496363;;cds;;146;146;;;66;;P-hp;*
comp;2496510..2496585;;gca;;59;;;59;;;;*
comp;2496645..2496721;;atc;;337;;;;;;;*
comp;2497059..2498549;;16s;;105;105;;;1491;;;*
&gt;;2498655..2498930;;cds;;;;;;92;;P-hp;*
&lt;/pre&gt;

====agr cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_cumuls|agr cumuls]]
&lt;pre&gt;
agr cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;5;1;;;1;0;1;;100;24;1;0
;16atcgca235;0;20;;;50;3;40;;200;30;30;1
;Id-atgf;5;40;1;;100;12;80;;300;14;60;3
;16s23s;0;60;1;5;150;22;120;;400;8;90;17
;max a;3;80;;;200;17;160;;500;2;120;13
;a doubles;0;100;;;250;18;200;;600;4;150;14
;spéciaux;0;120;;;300;9;240;;700;4;180;5
;total aas;15;140;;;350;4;280;;800;1;210;1
sans ;opérons;38;160;;;400;2;320;;900;1;240;3
;1 aa;35;180;;;450;3;360;;1000;0;270;7
;max a;3;200;;;500;1;400;;1100;0;300;4
;a doubles;1;;2;;;6;;;;1;;21
;total aas;42;;4;5;;97;;0;;89;;89
total aas;;57;;;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;59;;213;;;;230;;
;;;variance;;0;;134;;;;209;;
sans jaune;;;moyenne;33;;;172;;;;185;;137
;;;variance;;;;76;;;;131;;71
&lt;/pre&gt;

====agr blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_blocs|agr blocs]]
&lt;pre&gt;
agr blocs;;;;;;;;;
chromoml;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;;intercal;cdsa;
cds;105;108;hp;105;111;hp;105;84;P-hp
16s;337;1491;;337;1491;;337;1491;
atc;59;;;59;;;59;;
gca;146;;;146;;;146;;
cds;241;66;P-hp;241;66;P-hp;241;66;P-hp
23s;242;2814;;242;2814;;242;2814;
5s;257;115;;257;115;;257;115;
atgf;311;;;203;;;633;;
cds;;145;CoA;;64;hp;;136;membrane
chromosomc;;;;;;;;;
cds;105;92;P-hp;105;92;P-hp;;;
16s;337;1491;;337;1491;;;;
atc;59;;;59;;;;;
gca;146;;;146;;;;;
cds;241;66;P-hp;241;66;P-hp;;;
23s;242;2814;;242;2814;;;;
5s;257;115;;287;115;;;;
atgf;196;;;535;;;;;
cds;;603;helicase;;370;2Fe-2S;;;
;;;;;;;;;
;;;;;;;;;
CoA;acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit;;;;;;;;
helicase;DNA helicase RecQ;;;;;;;;
2Fe-2S;2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein;;;;;;;;
membrane;membrane protein;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====agr distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_distribution|agr distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;5
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;2;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;1;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
agr;;35;;;;;35;;agr;5;;;;;;5;;agr;2;;;;;;;;agr;;;;5;;;5
&lt;/pre&gt;
====agrc données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agrc_données_intercalaires|agrc données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;agrc;fx;fc;agrc;fx40;fc40;agrc;x-;c-;cont;x;cont;x;aa
;0;0;9;3;0;9;3;-1;;57;196;220;16s tRNA;;
1;0;10;42;173;1;2;26;-2;5;0;287;240;2* 342;;atc
;0;20;36;142;2;2;20;-3;;0;120;246;tRNA 23s;;
;0;30;28;69;3;11;32;-4;6;226;217;155;2* 585;;gca
;0;40;22;56;4;6;26;-5;;1;174;195;5s tRNA;;
1;0;50;31;39;5;2;11;-6;;0;167;361;257;;atgf
1;2;60;41;42;6;6;14;-7;;2;137;202;287;;atgf
1;0;70;30;63;7;5;8;-8;3;21;56;263;tRNA tRNA;;intra
;0;80;33;53;8;0;6;-9;1;0;154;264;2* 59;;atc gca
;0;90;17;62;9;6;13;-10;;2;285;159;tRNA tRNA;;
1;1;100;21;54;10;2;17;-11;;14;166;163;41;;gac
;0;110;30;55;11;3;25;-12;;0;778;91;**;;gac
;1;120;23;65;12;5;28;-13;;3;141;176;452;;gaa
1;1;130;23;56;13;4;10;-14;1;3;247;218;**;;gaa
2;3;140;21;47;14;3;17;-15;;0;138;41;26;;gga
;1;150;32;41;15;6;13;-16;;0;311;134;**;;tac
3;2;160;16;50;16;4;13;-17;1;5;123;189;;;
1;2;170;19;43;17;1;11;-18;;0;435;129;;;
2;1;180;23;21;18;4;4;-19;3;0;584;134;;;
1;1;190;16;36;19;4;10;-20;1;2;1054;657;;;
1;1;200;17;35;20;2;11;-21;;0;132;341;;;
2;0;210;24;25;21;4;13;-22;1;1;597;265;;;
2;1;220;16;26;22;5;6;-23;1;1;447;7;;;
;0;230;18;15;23;2;8;-24;;0;155;70;;;
1;2;240;19;19;24;3;5;-25;1;0;240;209;;;
1;3;250;13;16;25;2;4;-26;;1;245;55;;;
;0;260;15;11;26;4;9;-27;;0;240;270;;;
4;0;270;12;20;27;4;7;-28;;0;310;156;;;
;0;280;11;11;28;2;4;-29;;1;91;178;;;
;3;290;10;7;29;1;6;-30;1;0;51;522;;;
;0;300;8;16;30;1;7;-31;;0;184;373;;;
;1;310;10;10;31;4;10;-32;1;1;241;;;;
;1;320;10;3;32;2;3;-33;;0;287;;;;
;0;330;5;6;33;2;9;-34;1;0;403;;;;
;0;340;10;6;34;1;8;-35;1;1;535;;;;
1;0;350;6;5;35;2;2;-36;;;CDS 16s;;;;
;0;360;5;5;36;0;9;-37;;;;689;;;
1;0;370;5;5;37;3;5;-38;;;;585;;;
1;0;380;3;7;38;3;1;-39;;;23s 5s;;;;
;0;390;4;9;39;2;3;-40;;;2* 249;;;;
;0;400;5;5;40;3;6;-41;1;1;;;;;
2;8;reste;57;34;reste;659;1023;-42;;;;;;;
31;35;total;796;1466;total;796;1466;-43;;;;;;;
29;27;diagr;730;1429;diagr;128;440;-44;;;;;;;
1;0; t30;106;384;;;;-45;1;;;;;;
;;;;;;;;-46;1;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;2;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;;;;;;
;x;787;35;9;831;;;-49;1;;;;;;
;c;1463;345;3;1811;;;-50;;;;;;;
;;;;;2642;109;;reste;1;2;;;;;
;;;;;;2751;;total;35;345;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====agrc autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agrc_autres_intercalaires_aas|agrc autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;agr-c;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;54088;56574;669;*;
;;rRNA;57244;58728;342;*;1485
;;tRNA;59071;59147;59;*;atc
;;tRNA;59207;59282;585;*;gca
;;rRNA;59868;62674;249;*;2807
;;rRNA;62924;63038;257;*;115
;;tRNA;63296;63372;196;*;atgf
fin;;CDS;63569;65377;;;
deb;;CDS;70038;70667;131;*;
;;regulatory;70799;71023;255;*;
fin;;CDS;71279;71500;;;
deb;comp;CDS;99269;101146;162;*;
;comp;ncRNA;101309;101405;77;*;
fin;;CDS;101483;101899;;;
deb;comp;CDS;125821;127722;287;*;
;comp;tRNA;128010;128099;220;*;tcc
fin;;CDS;128320;128637;;;
deb;;CDS;227621;228004;240;*;
;comp;tRNA;228245;228331;120;*;ctg
fin;comp;CDS;228452;228757;;;
deb;;CDS;376801;378219;217;*;
;;tRNA;378437;378513;174;*;cgt
fin;;CDS;378688;379500;;;
deb;comp;CDS;407277;407435;167;*;
;comp;tRNA;407603;407678;137;*;acg
fin;comp;CDS;407816;408778;;;
deb;comp;CDS;424611;425795;42;*;
;comp;regulatory;425838;425916;73;*;
deb;;CDS;425990;427087;56;*;
;;tRNA;427144;427217;154;*;ggg
fin;;CDS;427372;428058;;;
deb;;CDS;458659;459081;285;*;
;;tRNA;459367;459442;246;*;ttc
fin;comp;CDS;459689;460033;;;
deb;comp;CDS;493759;494025;155;*;
;;tRNA;494181;494255;195;*;acc
fin;comp;CDS;494451;495686;;;
deb;comp;CDS;564938;568684;361;*;
;;tRNA;569046;569122;166;*;cac
fin;;CDS;569289;570920;;;
deb;comp;CDS;763448;764356;202;*;
;;tRNA;764559;764633;263;*;caa
fin;comp;CDS;764897;766630;;;
deb;comp;CDS;767020;767439;264;*;
;;tRNA;767704;767780;159;*;ccg
fin;comp;CDS;767940;768260;;;
deb;;CDS;829597;830517;91;*;
;;regulatory;830609;830834;165;*;
fin;;CDS;831000;831182;;;
deb;comp;CDS;960360;960701;163;*;
;;tRNA;960865;960955;778;*;agc
fin;;CDS;961734;962801;;;
deb;;CDS;1095507;1096961;76;*;
;;misc_f;1097038;1097093;74;*;
fin;;CDS;1097168;1098649;;;
deb;;CDS;1123408;1124136;141;*;
;;tRNA;1124278;1124363;247;*;tta
fin;;CDS;1124611;1127115;;;
deb;;CDS;1154411;1154803;91;*;
;comp;tRNA;1154895;1154969;176;*;aac
fin;;CDS;1155146;1155424;;;
deb;comp;CDS;1162767;1163027;138;*;
;comp;tRNA;1163166;1163242;218;*;ccc
fin;;CDS;1163461;1163997;;;
deb;comp;CDS;1194859;1194999;311;*;
;comp;tRNA;1195311;1195386;41;*;gta
deb;;CDS;1195428;1195709;123;*;
;;tRNA;1195833;1195909;41;*;gac
;;tRNA;1195951;1196027;435;*;gac
fin;;CDS;1196463;1196828;;;
deb;comp;CDS;1367095;1368234;154;*;
;comp;regulatory;1368389;1368476;124;*;
fin;comp;CDS;1368601;1368786;;;
deb;;CDS;1421863;1422201;134;*;
;comp;tRNA;1422336;1422425;584;*;tca
fin;comp;CDS;1423010;1423237;;;
deb;;CDS;1440191;1441231;40;*;
;comp;regulatory;1441272;1441350;365;*;
fin;;CDS;1441716;1441916;;;
deb;comp;CDS;1467928;1468236;1054;*;
;comp;tRNA;1469291;1469367;132;*;atgf
fin;comp;CDS;1469500;1470450;;;
deb;comp;CDS;1508458;1508844;597;*;
;comp;tRNA;1509442;1509526;189;*;ctc
fin;;CDS;1509716;1510447;;;
deb;;CDS;1531160;1531933;447;*;
;;tRNA;1532381;1532455;452;*;gaa
;;tRNA;1532908;1532982;129;*;gaa
fin;comp;CDS;1533112;1534914;;;
deb;;CDS;1584509;1584763;155;*;
;;tRNA;1584919;1584994;134;*;aag
fin;comp;CDS;1585129;1585674;;;
deb;comp;CDS;1600224;1600940;97;*;
;comp;regulatory;1601038;1601224;128;*;
fin;comp;CDS;1601353;1602183;;;
deb;comp;CDS;1612420;1613898;240;*;
;comp;tRNA;1614139;1614221;657;*;cta
fin;;CDS;1614879;1615025;;;
deb;comp;CDS;1672216;1672887;245;*;
;comp;tRNA;1673133;1673206;240;*;tgc
fin;comp;CDS;1673447;1673599;;;
deb;comp;CDS;1744688;1745434;341;*;
;;tRNA;1745776;1745851;310;*;aaa
fin;;CDS;1746162;1746743;;;
deb;comp;CDS;1770727;1772280;91;*;
;comp;tRNA;1772372;1772448;265;*;cca
deb;;CDS;1772714;1773019;51;*;
;;tRNA;1773071;1773147;7;*;aga
fin;comp;CDS;1773155;1773892;;;
deb;comp;CDS;1902337;1902537;184;*;
;comp;tRNA;1902722;1902797;241;*;tgg
fin;comp;CDS;1903039;1903845;;;
deb;;CDS;1908698;1908892;70;*;
;comp;tRNA;1908963;1909036;26;*;gga
;comp;tRNA;1909063;1909147;209;*;tac
fin;;CDS;1909357;1910244;;;
deb;;CDS;1922447;1922800;55;*;
;comp;tRNA;1922856;1922931;270;*;aca
fin;;CDS;1923202;1924878;;;
deb;comp;CDS;1963129;1963437;141;*;
;;tmRNA;1963579;1963951;229;*;
fin;;CDS;1964181;1964693;;;
deb;comp;CDS;2025879;2026319;399;*;
;comp;ncRNA;2026719;2027124;56;*;
fin;comp;CDS;2027181;2028371;;;
deb;;CDS;2079925;2080287;156;*;
;comp;tRNA;2080444;2080519;178;*;atgi
fin;;CDS;2080698;2081441;;;
deb;comp;CDS;2275632;2276138;522;*;
;;tRNA;2276661;2276737;287;*;cgg
fin;;CDS;2277025;2277264;;;
deb;comp;CDS;2387990;2388211;373;*;
;;tRNA;2388585;2388659;403;*;ggc
fin;;CDS;2389063;2391024;;;
deb;comp;CDS;2490745;2491854;535;*;
;comp;tRNA;2492390;2492466;287;*;atgf
;comp;rRNA;2492754;2492868;249;*;115
;comp;rRNA;2493118;2495924;585;*;2807
;comp;tRNA;2496510;2496585;59;*;gca
;comp;tRNA;2496645;2496721;342;*;atc
;comp;rRNA;2497064;2498548;585;*;1485
fin;;CDS;2499134;2500084;;;
deb;comp;CDS;2519640;2521463;94;*;
;comp;regulatory;2521558;2521669;180;*;
fin;;CDS;2521850;2522101;;;
deb;comp;CDS;2681110;2682123;37;*;
;comp;regulatory;2682161;2682271;45;*;
fin;comp;CDS;2682317;2682709;;;
deb;comp;CDS;2684632;2685285;90;*;
;;regulatory;2685376;2685452;82;*;
fin;;CDS;2685535;2686461;;;
deb;comp;CDS;2791781;2792167;154;*;
;comp;regulatory;2792322;2792537;127;*;
fin;;CDS;2792665;2793282;;;
&lt;/pre&gt;

====agrl données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agrl_données_intercalaires|agrl données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;agrl;fx;fc;agrl;fx40;fc40;agrl;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;2;0;1;2;-1;0;46;266;296;16s tRNA;;
;0;10;21;151;1;1;25;-2;1;0;135;256;3* 342;;atc
;0;20;19;126;2;1;19;-3;0;0;318;122;tRNA 23s;;
;0;30;20;63;3;5;18;-4;9;199;197;71;3* 585;;gca
;0;40;19;34;4;4;24;-5;0;0;554;203;5s tRNA;;
;0;50;19;39;5;2;12;-6;1;0;81;;3* 257;;atgf
;0;60;20;50;6;3;8;-7;2;4;311;;tRNA tRNA;;intra
;0;70;18;56;7;1;10;-8;0;23;123;;3* 59;;atc gca
1;0;80;12;39;8;2;11;-9;0;0;152;;tRNA tRNA;;
;1;90;20;30;9;0;8;-10;1;1;633;;-;793;ggc
;0;100;20;32;10;2;16;-11;0;9;CDS 16s;;**;;atgj
;0;110;11;29;11;2;14;-12;0;0;561;714;;;
;0;120;20;30;12;4;20;-13;0;1;2136;;;;
1;1;130;13;27;13;0;20;-14;2;8;23s 5s;;;;
;1;140;15;26;14;1;10;-15;0;0;3* 249;;;;
;0;150;10;26;15;3;9;-16;0;2;;;;;
;1;160;9;21;16;2;10;-17;0;3;;;;;
;0;170;7;20;17;0;13;-18;1;0;;;;;
;0;180;16;14;18;3;15;-19;0;0;;;;;
;0;190;10;19;19;3;11;-20;0;4;;;;;
;1;200;18;17;20;1;4;-21;0;0;;;;;
1;0;210;11;17;21;4;4;-22;0;1;;;;;
;0;220;16;19;22;0;8;-23;0;4;;;;;
;0;230;7;11;23;2;7;-24;0;0;;;;;
;0;240;9;14;24;5;5;-25;0;0;;;;;
;0;250;10;9;25;2;6;-26;0;1;;;;;
1;0;260;7;9;26;1;6;-27;0;0;;;;;
;1;270;10;11;27;1;4;-28;1;0;;;;;
;0;280;3;3;28;1;5;-29;1;1;;;;;
;0;290;7;6;29;2;7;-30;0;0;;;;;
1;0;300;5;11;30;2;11;-31;1;0;;;;;
;0;310;9;5;31;4;5;-32;2;0;;;;;
;2;320;9;5;32;0;4;-33;1;0;;;;;
;0;330;6;3;33;1;1;-34;0;0;;;;;
;0;340;5;5;34;1;3;-35;0;0;;;;;
;0;350;4;1;35;0;5;-36;0;0;;;;;
;0;360;3;2;36;2;3;-37;1;0;;;;;
;0;370;3;6;37;2;8;-38;0;0;;;;;
;0;380;5;6;38;5;5;-39;1;0;;;;;
;0;390;5;2;39;0;0;-40;0;0;;;;;
;0;400;5;3;40;4;0;-41;0;0;;;;;
;2;reste;42;41;reste;419;664;-42;0;0;;;;;
5;10;total;499;1040;total;499;1040;-43;0;0;;;;;
5;8;diagr;456;997;diagr;79;374;-44;0;0;;;;;
0;0; t30;60;340;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;498;25;1;524;;;-49;0;0;;;;;
;c;1038;308;2;1348;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1872;40;;reste;0;1;;;;;
;;;;;;1912;;total;25;308;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====agrl autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agrl_autres_intercalaires_aas|agrl autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;agrl;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;784904;786193;181;*;
;;regulatory;786375;786477;128;*;
fin;;CDS;786606;787391;;;
deb;comp;CDS;928915;929946;164;*;
;comp;regulatory;930111;930346;39;*;
fin;comp;CDS;930386;931264;;0;
deb;comp;CDS;1064633;1065274;296;*;
;;tRNA;1065571;1065655;266;*;ttg
fin;;CDS;1065922;1066437;;0;
deb;comp;CDS;1178605;1179114;256;*;
;;tRNA;1179371;1179445;793;*;ggc
;comp;tRNA;1180239;1180315;135;*;atgj
fin;comp;CDS;1180451;1181647;;;
deb;comp;CDS;1212291;1213553;234;*;
;comp;ncRNA;1213788;1213946;78;*;
fin;comp;CDS;1214025;1214402;;;
deb;comp;CDS;1320644;1321006;318;*;
;comp;tRNA;1321325;1321414;197;*;tcg
fin;comp;CDS;1321612;1322493;;;
deb;comp;CDS;1361929;1362942;554;*;
;comp;tRNA;1363497;1363571;81;*;gtc
fin;comp;CDS;1363653;1364015;;0;
deb;;CDS;1425957;1426682;561;*;
;;rRNA;1427244;1428728;342;*;1485
;;tRNA;1429071;1429147;59;*;atc
;;tRNA;1429207;1429282;585;*;gca
;;rRNA;1429868;1432674;249;*;2807
;;rRNA;1432924;1433038;257;*;115
;;tRNA;1433296;1433372;311;*;atgf
fin;;CDS;1433684;1434118;;;
deb;;CDS;1503534;1504520;122;*;
;comp;tRNA;1504643;1504716;123;*;cag
fin;comp;CDS;1504840;1505277;;0;
deb;;CDS;1605356;1605856;71;*;
;comp;tRNA;1605928;1606003;152;*;gcc
fin;comp;CDS;1606156;1606545;;0;
deb;comp;CDS;1685461;1687407;714;*;
;;rRNA;1688122;1689606;342;*;1485
;;tRNA;1689949;1690025;59;*;atc
;;tRNA;1690085;1690160;585;*;gca
;;rRNA;1690746;1693552;249;*;2807
;;rRNA;1693802;1693916;257;*;115
;;tRNA;1694174;1694250;203;*;atgf
fin;comp;CDS;1694454;1694645;;;
deb;;CDS;2101066;2101374;2136;*;
;;rRNA;2103511;2104995;342;*;1485
;;tRNA;2105338;2105414;59;*;atc
;;tRNA;2105474;2105549;585;*;gca
;;rRNA;2106135;2108941;249;*;2807
;;rRNA;2109191;2109305;257;*;115
;;tRNA;2109563;2109639;633;*;atgf
fin;;CDS;2110273;2110680;;;
&lt;/pre&gt;

===aua===
====aua opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_opérons|aua opérons]]
&lt;pre&gt;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP006367.1;aua;;genome;;pau20rrn;;;;;;;
67%GC;8.8.19 Paris;16s 1;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;aas;cdsd;protéines;
Aureimonas sp. AU20;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
pAU20rrn;;;;;;;;;;;;
;324..1028;;CDS rep;;461;;;;235;;replication initiation protein;*
comp;1490..1604;;5s;@1;82;;;;115;;;
comp;1687..4515;;23s;;-15;;;;2829;;;
comp;4501..4851;;CDS hp;;142;;;;117;;hp;
comp;4994..5069;;gca;;33;;;33;;;;
comp;5103..5179;;atc;;233;;;;;;;
comp;5413..6898;;16s;;1752;;;;1486;;;
comp;8651..9109;;CDS hp;;;;;;153;;hp;
;;;;;;;;;;;;
Chromosome;;;;;;;;;;;;
comp;170900..171925;;CDS;;368;368;;;342;;;
;172294..172378;;ctg;;130;130;;;;130;;
;172509..172772;;CDS;;;;;;88;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;330094..330690;;CDS;;338;338;;;199;;;
;331029..331103;;ggc;@2;404;;*404;;;;;
comp;331508..331584;;atgf;+;44;;44;;;;;
comp;331629..331705;;atgf;2 atg;255;255;;;;255;;
comp;331961..333217;;CDS;;;;;;419;;;
;;;;;;;;;;;;
;344949..346025;;CDS;;589;589;;;359;589;;
;346615..346704;;tcg;;609;609;;;;;;
;347314..348471;;CDS;;;;;;386;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;393335..395356;;CDS;;800;*800;;;*674;;;
comp;396157..396232;;gcc;;439;439;;;;439;;
comp;396672..397094;;CDS;;;;;;141;;;
;;;;;;;;;;;;
;635177..637537;;CDS;;640;640;;;*787;;;
comp;638178..638253;;gcg;;182;182;;;;182;;
;638436..638738;;CDS;;;;;;101;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;924507..925466;;CDS;;529;529;;;320;;;
comp;925996..926085;;tcc;;349;349;;;;349;;
;926435..926767;;CDS;;;;;;111;;;
;;;;;;;;;;;;
;1216789..1217439;;CDS;;60;60;;;217;60;;
;1217500..1217576;;agg;;68;68;;;;;;
comp;1217645..1218760;;CDS;;;;;;372;;;
;;;;;;;;;;;;
;1350534..1352180;;CDS;@4;-30;*-30;;;*549;;;
comp;1352151..1352227;;cgt;+;51;;51;;;;;
comp;1352279..1352355;;cgt;2 cgt;169;169;;;;;;
comp;1352525..1353967;;CDS;;;;;;*481;;;
;;;;;;;;;;;;
;1401921..1402442;;CDS;;142;142;;;174;142;;
;1402585..1402661;;cac;;585;585;;;;;;
;1403247..1404875;;CDS;;;;;;*543;;;
;;;;;;;;;;;;
;1544580..1546277;;CDS;;455;455;;;*566;;;
comp;1546733..1546808;;ttc;@2;161;;161;;;;;
;1546970..1547044;;acc;;414;414;;;;414;;
;1547459..1549516;;CDS;;;;;;*686;;;
;;;;;;;;;;;;
;1609269..1610216;;CDS;;278;278;;;316;;;
comp;1610495..1610571;;cgg;;121;121;;;;121;;
comp;1610693..1611427;;CDS;;;;;;245;;;
;;;;;;;;;;;;
&gt;;1683255..1683581;;CDS;;209;209;;;109;209;;
comp;1683791..1683864;;cag;;580;580;;;;;;
;1684445..1685734;;CDS;;;;;;430;;;
;;;;;;;;;;;;
;1700827..1701852;;CDS;;300;300;;;342;;;
comp;1702153..1702227;;gtc;+;128;;128;;;;;
comp;1702356..1702430;;gtc;3 gtc;186;;186;;;;;
comp;1702617..1702691;;gtc;;68;68;;;;68;;
comp;1702760..1703125;;CDS;;;;;;122;;;
;;;;;;;;;;;;
;1946715..1946936;;CDS;;6;6;;;74;6;;
comp;1946943..1947018;;atgi;;105;105;;;;;;
;1947124..1947345;;CDS;;;;;;74;;;
;;;;;;;;;;;;
;1981934..1983139;;CDS;;139;139;;;402;139;;
;1983279..1983368;;agc;;825;*825;;;;;;
;1984194..1985339;;CDS;;;;;;382;;;
;;;;;;;;;;;;
;1996083..1997171;;CDS;;243;243;;;363;;;
comp;1997415..1997490;;acg;;112;112;;;;112;;
comp;1997603..1998583;;CDS;;;;;;327;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2263930..2264781;;CDS;;30;30;;;284;30;;
comp;2264812..2264886;;gtg;;111;111;;;;;;
comp;2264998..2265768;;CDS;;;;;;257;;;
;;;;;;;;;;;;
;2363764..2364786;;CDS;;18;18;;;341;18;;
comp;2364805..2364879;;gaa;+;140;;140;;;;;
comp;2365020..2365094;;gaa;2 gaa;69;69;;;;69;;
comp;2365164..2366144;;CDS;;;;;;327;;;
;;;;;;;;;;;;
;2367774..2368247;;CDS;;105;105;;;158;;;
;2368353..2368429;;cca;@3;43;43;;;;43;;
;2368473..2368778;;CDS;;36;36;;;102;36;;
;2368815..2368890;;aga;;448;448;;;;;;
;2369339..2369929;;CDS;;;;;;197;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2401620..2402732;;CDS;;155;155;;;371;155;;
comp;2402888..2402963;;aaa;;169;169;;;;;;
;2403133..2403870;;CDS;;;;;;246;;;
;;;;;;;;;;;;
;2419689..2420852;;CDS;;13;13;;;388;13;;
;2420866..2420955;;tca;;238;238;;;;;;
;2421194..2421934;;CDS;;;;;;247;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2601493..2601858;;CDS;;287;287;;;122;287;;
comp;2602146..2602222;;gac;+;58;;58;;;;;
comp;2602281..2602357;;gac;2 gac;270;;270;;;;;
;2602628..2602703;;gta;@2;330;330;;;;;;
comp;2603034..2603312;;CDS;;;;;;93;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2608494..2609852;;CDS;;73;73;;;*453;73;;
comp;2609926..2610009;;cta;;307;307;;;;;;
;2610317..2610460;;CDS;;;;;;48;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2641174..2641824;;CDS;@3;125;125;;;217;125;;
comp;2641950..2642023;;tgc;;153;153;;;;;;
comp &lt;;2642177..2642443;;CDS;;296;296;;;89;;;
;2642740..2642814;;aac;;269;269;;;;269;;
;2643084..2644127;;CDS;;;;;;348;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2651145..2652935;;CDS;;239;239;;;*597;239;;
;2653175..2653259;;tta;;265;265;;;;;;
;2653525..2653725;;CDS;;;;;;67;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2749758..2750318;;CDS;;3102;*3102;;;187;;;
comp;2753421..2753497;;atgf;;83;83;;;;83;;
comp;2753581..2754180;;CDS;;;;;;200;;;
;;;;;;;;;;;;
;2768127..2769224;;CDS;;63;63;;;366;63;;
comp;2769288..2769364;;ccg;@2;173;;173;;;;;
;2769538..2769612;;caa;;528;528;;;;;;
comp;2770141..2770566;;CDS;;;;;;142;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2787112..2788920;;CDS;;217;217;;;*603;217;;
comp;2789138..2789214;;ccc;;265;265;;;;;;
comp;2789480..2790022;;CDS;;;;;;181;;;
;;;;;;;;;;;;
;2927857..2928789;;CDS;;136;136;;;311;136;;
comp;2928926..2929010;;ctc;+;132;;132;;;;;
comp;2929143..2929227;;ctc;2 ctc;175;175;;;;;;
;2929403..2930164;;CDS;;;;;;254;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2971057..2971257;;CDS;;130;130;;;67;;;
comp;2971388..2971463;;tgg;;53;53;;;;53;;
comp;2971517..2972374;;CDS;;;;;;286;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2973322..2974497;;CDS;;291;291;;;392;;;
comp;2974789..2974862;;gga;;24;;24;;;;;
comp;2974887..2974971;;tac;;259;259;;;;259;;
;2975231..2976097;;CDS;;;;;;289;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;2979955..2981049;;CDS;;221;221;;;365;;;
;2981271..2981346;;aca;;55;55;;;;55;;
comp;2981402..2981752;;CDS;;;;;;117;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;3063743..3064045;;CDS;;106;106;;;101;106;;
comp;3064152..3064227;;aag;;147;147;;;;;;
comp;3064375..3064803;;CDS;;;;;;143;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;3194307..3194906;;CDS;;249;249;;;200;;;
;3195156..3195232;;atgj;;173;173;;;;173;;
;3195406..3196356;;CDS;;;;;;317;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;3206006..3206455;;CDS;;743;*743;;;150;;;
comp;3207199..3207273;;gag;;50;50;;;;50;;
comp;3207324..3207689;;CDS;;;;;;122;;;
;;;;;;;;;;;;
;3398165..3399901;;CDS;;554;554;;;*579;;;
;3400456..3400530;;aac;;115;115;;;;115;;
;3400646..3400924;;CDS;;;;;;93;;;
;;;;;;;;;;;;
;3401737..3403497;;CDS;;227;227;;;*587;;;
comp;3403725..3403799;;ggc;;208;;208;;;;;
comp;3404008..3404082;;ggg;;74;74;;;;74;;
comp;3404157..3404819;;CDS;;;;;;221;;;
;;;;;;;;;;;;
comp;3597872..3598414;;CDS;;370;370;;;181;;;
;3598785..3598869;;ttg;;151;151;;;;151;;
comp;3599021..3599251;;CDS;;;;;;77;;;
&lt;/pre&gt;

====aua cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_cumuls|aua cumuls]]
&lt;pre&gt;
aua cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds chromosome;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;1;1;0;-;1;1;1;0;100;10;1;0
;16 aas 23 5s ;0;20;0;;50;7;40;7;200;22;30;0
;16 atc gca hp;1;40;1;;100;10;80;9;300;11;60;1
;16 cds 23 5s ;0;60;3;;150;14;120;9;400;20;90;7
;max a;2;80;0;;200;8;160;4;500;5;120;8
;a doubles;0;100;0;;250;8;200;3;600;6;150;7
;spéciaux;0;120;0;;300;10;240;4;700;3;180;2
;total aas;2;140;3;;350;4;280;1;800;1;210;7
sans ;opérons;38;160;0;;400;2;320;0;900;0;240;3
;1 aa;26;180;2;;450;3;360;2;1000;0;270;5
;max a;3;200;1;;500;1;400;0;1100;0;300;3
;a doubles;6;;3;;;12;;1;;0;;35
;total aas;53;;13;0;;80;;40;;78;;78
total aas;;55;;;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;;;;;;;
;;;variance;;;;;;;;;;
sans jaune;;;moyenne;131;;;226;;153;;235;;158
;;;variance;75;;;165;;128;;125;;69
&lt;/pre&gt;

====aua blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_blocs|aua blocs]]
&lt;pre&gt;
CDS ;1752;153;hp
16s;233;1486;
atc;33;;
gca;142;;
CDS;-15;117;hp
23s;82;2829;
5s;461;115;
CDS ;;235;replication initiation protein
&lt;/pre&gt;
====aua distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_distribution|aua distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;aua;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;ctc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;gtc3;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;2;agc;1;gac2;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;1;cgt;;gaa2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;1;gac;;ggc;;cgt2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;2;;gtc;3;gcc;;gac;2;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;atgf2;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
aua;;30;;;;;30;;aua;10;;;;;;10;;aua;13;;;;;;13
&lt;/pre&gt;
====aua données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_données_intercalaires|aua données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
*Attention les rRNA sont dans le plasmide uniquement
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;aua;fx;fc;aua;fx40;fc40;aua;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;0;0;3;0;0;3;0;-1;0;87;130;368;16s tRNA;;
1;0;10;50;230;1;1;32;-2;1;0;255;338;233;;atc
1;2;20;38;127;2;1;24;-3;0;0;589;640;tRNA 23s;;
;2;30;38;96;3;9;36;-4;14;345;660;182;478;;gca
;1;40;23;58;4;8;33;-5;0;1;812;349;tRNA tRNA;;intra
;2;50;29;57;5;2;32;-6;1;0;439;68;33;;atc gca
1;2;60;48;59;6;11;13;-7;1;0;529;-30;tRNA tRNA;;
2;2;70;41;77;7;3;11;-8;3;27;60;455;-;404;ggc
;3;80;33;80;8;3;17;-9;0;1;169;278;44;;atgf
;1;90;39;71;9;10;12;-10;0;2;142;209;**;;atgf
;0;100;35;71;10;2;20;-11;0;16;175;580;51;;cgt
;2;110;24;63;11;3;22;-12;1;0;414;300;**;;cgt
;2;120;25;52;12;4;31;-13;1;5;121;6;-;161;ttc
1;4;130;21;63;13;3;12;-14;2;4;68;126;**;;acc
1;1;140;23;57;14;0;13;-15;0;1;139;234;128;;gtc
;2;150;31;69;15;7;8;-16;1;1;112;243;186;;gtc
1;1;160;19;44;16;1;5;-17;0;4;30;18;**;;gtc
1;2;170;21;37;17;3;14;-18;2;0;111;177;140;;gaa
2;2;180;18;35;18;4;6;-19;0;3;69;169;**;;gaa
1;0;190;23;34;19;11;6;-20;1;6;105;330;58;;gac
;0;200;30;32;20;2;10;-21;0;0;43;307;-;270;gac
1;0;210;29;33;21;8;9;-22;0;0;36;296;**;;gta
;0;220;20;35;22;3;15;-23;3;1;170;239;-;173;ccg
2;0;230;21;26;23;3;11;-24;0;0;13;63;**;;caa
2;0;240;22;25;24;5;7;-25;2;0;277;528;132;;ctc
2;0;250;11;26;25;2;13;-26;1;2;287;136;**;;ctc
1;1;260;14;23;26;2;12;-27;1;0;76;175;24;;gga
;3;270;23;19;27;5;10;-28;1;0;125;259;**;;tac
1;1;280;13;10;28;6;5;-29;1;3;72;221;208;;ggc
;1;290;13;19;29;0;8;-30;0;0;269;55;**;;ggg
2;1;300;15;9;30;4;6;-31;1;0;265;249;;;
1;0;310;13;14;31;2;8;-32;1;0;24;311;;;
1;0;320;13;12;32;2;9;-33;0;0;83;227;;;
1;0;330;9;10;33;4;4;-34;0;0;16;370;;;
1;0;340;9;6;34;1;6;-35;0;1;265;151;;;
1;0;350;11;6;35;1;6;-36;1;0;130;;;;
;0;360;8;8;36;5;1;-37;0;0;53;;;;
2;0;370;6;5;37;3;2;-38;1;0;291;;;;
;0;380;7;5;38;1;7;-39;0;0;106;;;;
;0;390;4;7;39;3;6;-40;1;0;147;;;;
;0;400;5;1;40;1;9;-41;0;1;173;;;;
4;7;reste;97;92;reste;823;1292;-42;0;0;743;;;;
35;45;total;975;1803;total;975;1803;-43;0;1;50;;;;
30;38;diagr;875;1711;diagr;149;511;-44;0;0;154;;;;
2;4; t30;126;453;;;;-45;0;0;74;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;CDS 16s;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;2;1;1752;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;23s 5s;;;;
;x;972;55;3;1030;;;-49;1;0;82;;;;
;c;1803;523;0;2326;;;-50;1;0;5s CDS;;;;
;;;;;3356;117;;reste;9;10;-;461;;;
;;;;;;3473;;total;55;523;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====aua autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_autres_intercalaires_aas|aua autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
*Attention les rRNA sont dans le plasmide uniquement
&lt;pre&gt;
autres intercalaires ;;aua;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;157474;158811;438;*;
;;regulatory;159250;159351;138;*;
fin;;CDS;159490;160275;;;
deb;comp;CDS;170900;171925;368;*;
;;tRNA;172294;172378;130;*;ctg
fin;;CDS;172509;172772;;;
deb;comp;CDS;330094;330690;338;*;
;;tRNA;331029;331103;404;*;ggc
;comp;tRNA;331508;331584;44;*;atgf
;comp;tRNA;331629;331705;255;*;atgf
fin;comp;CDS;331961;333217;;0;
deb;;CDS;344949;346025;589;*;
;;tRNA;346615;346704;660;*;tcg
fin;;CDS;347365;348471;;0;
deb;comp;CDS;393335;395344;812;*;
;comp;tRNA;396157;396232;439;*;gcc
fin;comp;CDS;396672;397094;;0;
deb;;CDS;636089;637537;640;*;
;comp;tRNA;638178;638253;182;*;gcg
fin;;CDS;638436;638738;;;
deb;;CDS;680871;681065;46;*;
;;regulatory;681112;681214;62;*;
fin;;CDS;681277;683100;;;
deb;comp;CDS;762422;762607;31;*;
;comp;regulatory;762639;762877;116;*;
fin;comp;CDS;762994;763371;;;
deb;;CDS;894578;894772;102;*;
;;regulatory;894875;895098;119;*;
fin;;CDS;895218;896204;;;
deb;comp;CDS;924507;925466;529;*;
;comp;tRNA;925996;926085;349;*;tcc
fin;;CDS;926435;926767;;;
deb;comp;CDS;973959;974375;30;*;
;;ncRNA;974406;974502;208;*;
fin;comp;CDS;974711;975313;;0;
deb;comp;CDS;1215259;1216272;45;*;
;comp;regulatory;1216318;1216420;368;*;
deb;;CDS;1216789;1217439;60;*;
;;tRNA;1217500;1217576;68;*;agg
fin;comp;CDS;1217645;1218760;;;
deb;;CDS;1350534;1352180;-30;*;
;comp;tRNA;1352151;1352227;51;*;cgt
;comp;tRNA;1352279;1352355;169;*;cgt
fin;comp;CDS;1352525;1353967;;0;
deb;;CDS;1401921;1402442;142;*;
;;tRNA;1402585;1402661;175;*;cac
fin;;CDS;1402837;1402989;;;
deb;;CDS;1544580;1546277;455;*;
;comp;tRNA;1546733;1546808;161;*;ttc
;;tRNA;1546970;1547044;414;*;acc
fin;;CDS;1547459;1549516;;0;
deb;;CDS;1609269;1610216;278;*;
;comp;tRNA;1610495;1610571;121;*;cgg
fin;comp;CDS;1610693;1611427;;;
deb;;CDS;1619798;1621321;102;*;
;;regulatory;1621424;1621513;147;*;
fin;;CDS;1621661;1622968;;;
deb;;CDS;1683255;1683581;209;*;
;comp;tRNA;1683791;1683864;580;*;cag
fin;;CDS;1684445;1685734;;;
deb;;CDS;1700827;1701852;300;*;
;comp;tRNA;1702153;1702227;128;*;gtc
;comp;tRNA;1702356;1702430;186;*;gtc
;comp;tRNA;1702617;1702691;68;*;gtc
fin;comp;CDS;1702760;1703125;;0;
deb;;CDS;1946715;1946936;6;*;
;comp;tRNA;1946943;1947018;126;*;atgi
fin;;CDS;1947145;1947345;;0;
deb;;CDS;1981934;1983139;139;*;
;;tRNA;1983279;1983368;234;*;agc
fin;comp;CDS;1983603;1984061;;0;
deb;;CDS;1996083;1997171;243;*;
;comp;tRNA;1997415;1997490;112;*;acg
fin;comp;CDS;1997603;1998583;;0;
deb;;CDS;2082120;2083970;0;*;
;;regulatory;2083971;2084083;157;*;
fin;;CDS;2084241;2085203;;;
deb;comp;CDS;2263930;2264781;30;*;
;comp;tRNA;2264812;2264886;111;*;gtg
fin;comp;CDS;2264998;2265768;;0;
deb;;CDS;2363764;2364786;18;*;
;comp;tRNA;2364805;2364879;140;*;gaa
;comp;tRNA;2365020;2365094;69;*;gaa
fin;comp;CDS;2365164;2366240;;;
deb;;CDS;2367774;2368247;105;*;
;;tRNA;2368353;2368429;43;*;cca
deb;;CDS;2368473;2368778;36;*;
;;tRNA;2368815;2368890;177;*;aga
fin;comp;CDS;2369068;2369220;;0;
deb;comp;CDS;2401620;2402717;170;*;
;comp;tRNA;2402888;2402963;169;*;aaa
fin;;CDS;2403133;2403870;;;
deb;;CDS;2419602;2420852;13;*;
;;tRNA;2420866;2420955;277;*;tca
fin;;CDS;2421233;2421934;;;
deb;comp;CDS;2601493;2601858;287;*;
;comp;tRNA;2602146;2602222;58;*;gac
;comp;tRNA;2602281;2602357;270;*;gac
;;tRNA;2602628;2602703;330;*;gta
fin;comp;CDS;2603034;2603312;;;
deb;comp;CDS;2608494;2609849;76;*;
;comp;tRNA;2609926;2610009;307;*;cta
fin;;CDS;2610317;2610460;;;
deb;comp;CDS;2641174;2641824;125;*;
;comp;tRNA;2641950;2642023;72;*;tgc
deb;comp;CDS;2642096;2642443;296;*;
;;tRNA;2642740;2642814;269;*;aac
fin;;CDS;2643084;2644127;;;
deb;comp;CDS;2651145;2652935;239;*;
;;tRNA;2653175;2653259;265;*;tta
fin;;CDS;2653525;2653725;;0;
deb;comp;CDS;2753154;2753396;24;*;
;comp;tRNA;2753421;2753497;83;*;atgf
fin;comp;CDS;2753581;2754180;;;
deb;;CDS;2768127;2769224;63;*;
;comp;tRNA;2769288;2769364;173;*;ccg
;;tRNA;2769538;2769612;528;*;caa
fin;comp;CDS;2770141;2770566;;0;
deb;comp;CDS;2787112;2789121;16;*;
;comp;tRNA;2789138;2789214;265;*;ccc
fin;comp;CDS;2789480;2790022;;;
deb;;CDS;2927857;2928789;136;*;
;comp;tRNA;2928926;2929010;132;*;ctc
;comp;tRNA;2929143;2929227;175;*;ctc
fin;;CDS;2929403;2930164;;;
deb;comp;CDS;2971057;2971257;130;*;
;comp;tRNA;2971388;2971463;53;*;tgg
fin;comp;CDS;2971517;2972374;;;
deb;comp;CDS;2973322;2974497;291;*;
;comp;tRNA;2974789;2974862;24;*;gga
;comp;tRNA;2974887;2974971;259;*;tac
fin;;CDS;2975231;2976097;;0;
deb;comp;CDS;2979955;2981049;221;*;
;;tRNA;2981271;2981346;55;*;aca
fin;comp;CDS;2981402;2981752;;;
deb;comp;CDS;3063743;3064045;106;*;
;comp;tRNA;3064152;3064227;147;*;aag
fin;comp;CDS;3064375;3064803;;;
deb;;CDS;3082739;3084151;84;*;
;;tmRNA;3084236;3084602;54;*;
fin;;CDS;3084657;3085265;;;
deb;comp;CDS;3194307;3194906;249;*;
;;tRNA;3195156;3195232;173;*;atgj
fin;;CDS;3195406;3196356;;0;
deb;comp;CDS;3206006;3206455;743;*;
;comp;tRNA;3207199;3207273;50;*;gag
fin;comp;CDS;3207324;3207689;;1;
deb;;CDS;3243122;3243553;99;*;
;comp;ncRNA;3243653;3243811;80;*;
fin;comp;CDS;3243892;3244527;;;
deb;comp;CDS;3301324;3301785;705;*;
;comp;ncRNA;3302491;3302881;111;*;
fin;comp;CDS;3302993;3303622;;;
deb;comp;CDS;3399971;3400144;311;*;
;;tRNA;3400456;3400530;154;*;aac
fin;;CDS;3400685;3400924;;;
deb;;CDS;3401737;3403497;227;*;
;comp;tRNA;3403725;3403799;208;*;ggc
;comp;tRNA;3404008;3404082;74;*;ggg
fin;comp;CDS;3404157;3404834;;;
deb;comp;CDS;3404854;3405936;125;*;
;;regulatory;3406062;3406139;56;*;
fin;;CDS;3406196;3407389;;;
deb;comp;CDS;3597872;3598414;370;*;
;;tRNA;3598785;3598869;151;*;ttg
fin;comp;CDS;3599021;3599251;;0;
&lt;/pre&gt;

===alpha synthèse===
====alpha distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha_distribution_par_génome|alpha distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
alpha8;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
rtb;8;25;;;;0;;;33
rpm;7;30;;;;8;42;5;92
rru;4;36;;;;8;4;3;55
oan;6;41;;;;8;;4;59
abq;20;38;;;;16;10;3;87
abs;20;39;;;;8;10;3;80
agr;5;35;;;;10;2;5;57
aua;10;30;;;;2;13;;55
;;;;;;;;;
total;80;274;0;0;0;60;81;23;518
&lt;/pre&gt;

====alpha distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha_distribution_du_total|alpha distribution du total]]
&lt;pre&gt;
alpha8;;;;;;;435;;alpha8;;;;;;;83
atgi;9;tct;;tat;;atgf;7;;atgi;;tct;;tat;;atgf;23
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;13;tcc;8;tac;10;tgc;8;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1;acc;13;aac;14;agc;8;;atc;33;acc;0;aac;;agc;
ctc;11;ccc;8;cac;11;cgt;13;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;13;gcc;16;gac;17;ggc;22;;gtc;;gcc;;gac;0;ggc;
tta;8;tca;8;taa;;tga;1;;tta;;tca;0;taa;;tga;
ata;;aca;9;aaa;10;aga;8;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;8;cca;9;caa;8;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;7;gca;2;gaa;12;gga;8;;gta;;gca;27;gaa;;gga;
ttg;7;tcg;7;tag;;tgg;10;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;0
atgj;10;acg;8;aag;10;agg;6;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;15;ccg;10;cag;10;cgg;8;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;9;gcg;9;gag;9;ggg;7;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
total;161;274;0;0;0;0;435;;1-3aas;;;;23;;60;83
&lt;/pre&gt;

====alpha distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha_distribution_par_type|alpha distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
alpha8;;;;;;;435;;alpha8;;;;;;;274;;alpha8;;;;;;;80;;alpha8;;;;;;;81;;alpha6;;;;;;;
atgi;9;tct;0;tat;0;atgf;7;;atgi;8;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;23
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;13;tcc;8;tac;10;tgc;8;;ttc;8;tcc;8;tac;2;tgc;4;;ttc;1;tcc;;tac;8;tgc;4;;ttc;4;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1;acc;13;aac;14;agc;8;;atc;;acc;5;aac;5;agc;8;;atc;1;acc;3;aac;7;agc;;;atc;;acc;5;aac;2;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;11;ccc;8;cac;11;cgt;13;;ctc;9;ccc;8;cac;7;cgt;8;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;;cac;4;cgt;5;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;13;gcc;16;gac;17;ggc;22;;gtc;8;gcc;5;gac;1;ggc;11;;gtc;2;gcc;5;gac;10;ggc;7;;gtc;3;gcc;6;gac;6;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;8;tca;8;taa;0;tga;1;;tta;8;tca;8;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;0;aca;9;aaa;10;aga;8;;ata;;aca;8;aaa;9;aga;8;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;8;cca;9;caa;8;cga;0;;cta;8;cca;8;caa;6;cga;;;cta;;cca;1;caa;2;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;7;gca;2;gaa;12;gga;8;;gta;4;gca;1;gaa;6;gga;;;gta;3;gca;1;gaa;2;gga;8;;gta;;gca;;gaa;4;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;7;tcg;7;tag;0;tgg;10;;ttg;7;tcg;7;tag;;tgg;10;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;10;acg;8;aag;10;agg;6;;atgj;7;acg;8;aag;4;agg;6;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;6;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;15;ccg;10;cag;10;cgg;8;;ctg;6;ccg;3;cag;6;cgg;7;;ctg;4;ccg;1;cag;2;cgg;1;;ctg;5;ccg;6;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;9;gcg;9;gag;9;ggg;7;;gtg;3;gcg;4;gag;5;ggg;6;;gtg;;gcg;2;gag;;ggg;1;;gtg;6;gcg;3;gag;4;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha 6;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;;;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;1-3aas;;;;23;;;
&lt;/pre&gt;

====alpha par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha_par_rapport_au_groupe_de_référence|alpha par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;90;14;38;;;;142;
16;moyen;103;15;16;;;60;134;
14;fort;81;51;27;;23;;182;
; ;274;80;81;;23;60;518;
10;g+cga;46;6;27;;;;79;
2;agg+cgg;13;1;;;;;14;
4;carre ccc;30;7;11;;;;48;
5;autres;1;;;;;;1;
;;90;14;38;;;;142;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;alpha  ‰;ref. ‰
21;faible;174;27;73;;;;274;26
16;moyen;199;29;31;;;116;259;324
14;fort;156;98;52;;44;;351;650
;;529;154;156;;44;116;518;729
10;g+cga;89;12;52;;;;153;10
2;agg+cgg;25;2;0;;;;27;
4;carre ccc;58;14;21;;;;93;16
5;autres;2;0;0;;;;2;
;;174;27;73;;;;274;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;207;32;87;326;26;33;18;47
16;moyen;237;34;37;308;324;38;19;20
14;fort;186;117;62;366;650;30;64;33
;;630;184;186;435;729;274;80;81
10;g+cga;106;14;62;182;10;51;;71
2;agg+cgg;30;2;0;32;;14;;
4;carre ccc;69;16;25;110;16;33;;29
5;autres;2;0;0;2;;1;;
;;207;32;87;326;;90;;38
&lt;/pre&gt;
====alpha, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#alpha,_estimation_des_-rRNAs|alpha, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
alpha;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
70 génomes total avec rRNA;;;;alpha8;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;alpha;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;sans +16s;;;70;525; ; ;;indices;;;;70;750;0;0;;alpha8;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;435
atgi;;tct;;tat;;atgf;144;;atgi;;tct;;tat;;atgf;206;;atgi;9;tct;;tat;;atgf;7
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;13;tcc;8;tac;10;tgc;8
atc;189;acc;;aac;;agc;;;atc;270;acc;;aac;;agc;;;atc;1;acc;13;aac;14;agc;8
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;11;ccc;8;cac;11;cgt;13
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;13;gcc;16;gac;17;ggc;22
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;8;tca;8;taa;;tga;1
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;9;aaa;10;aga;8
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;8;cca;9;caa;8;cga;
gta;;gca;191;gaa;;gga;;;gta;;gca;273;gaa;;gga;;;gta;7;gca;2;gaa;12;gga;8
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;7;tcg;7;tag;;tgg;10
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;10;acg;8;aag;10;agg;6
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1.4;;ctg;15;ccg;10;cag;10;cgg;8
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;9;gcg;9;gag;9;ggg;7
;;380;;144;;1;525;;;;543;;206;;1;750;;;;134;;159;;142;435
27.5.20 Tanger;;;;alpha;total;ttt;tgt;;30.5.20 Tanger;;;;alpha;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;16935;0.6;0.3;;indices;sans +16s;;;347;16935;0,6;0,3;;alpha8;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;106;tct;;tat;0.9;atgf;30;;atgi;106;tct;;tat;0.9;atgf;236;;atgi;113;tct;;tat;;atgf;88
att;;act;0.3;aat;;agt;;;att;;act;0.3;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1.2;cct;0.3;cat;;cgc;0.3;;ctt;1.2;cct;0.3;cat;;cgc;0.3;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;0.6;ggt;;;gtt;;gct;;gat;0.6;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;109;tcc;101;tac;104;tgc;105;;ttc;109;tcc;101;tac;104;tgc;105;;ttc;163;tcc;100;tac;125;tgc;100
atc;-1;acc;108;aac;111;agc;101;;atc;269;acc;108;aac;111;agc;101;;atc;13;acc;163;aac;175;agc;100
ctc;116;ccc;82;cac;102;cgt;112;;ctc;116;ccc;82;cac;102;cgt;112;;ctc;138;ccc;100;cac;138;cgt;163
gtc;105;gcc;97;gac;150;ggc;133;;gtc;105;gcc;97;gac;150;ggc;133;;gtc;163;gcc;200;gac;213;ggc;275
tta;94;tca;102;taa;1.2;tga;10;;tta;94;tca;102;taa;1.2;tga;10;;tta;100;tca;100;taa;;tga;13
ata;1.7;aca;107;aaa;106;aga;103;;ata;1.7;aca;107;aaa;106;aga;103;;ata;;aca;113;aaa;125;aga;100
cta;103;cca;104;caa;113;cga;9.2;;cta;103;cca;104;caa;113;cga;9.2;;cta;100;cca;113;caa;100;cga;
gta;105;gca;-2;gaa;141;gga;104;;gta;105;gca;271;gaa;141;gga;104;;gta;88;gca;25;gaa;150;gga;100
ttg;91;tcg;89;tag;0.3;tgg;102;;ttg;91;tcg;89;tag;0.3;tgg;102;;ttg;88;tcg;88;tag;;tgg;125
atgj;116;acg;91;aag;80;agg;75;;atgj;116;acg;91;aag;80;agg;75;;atgj;125;acg;100;aag;125;agg;75
ctg;90;ccg;71;cag;65;cgg;106;;ctg;90;ccg;71;cag;65;cgg;107;;ctg;188;ccg;125;cag;125;cgg;100
gtg;59;gcg;59;gag;54;ggg;70;;gtg;59;gcg;59;gag;54;ggg;70;;gtg;113;gcg;113;gag;113;ggg;88
;;1421;;1529;;1241;4191;;;;1964;;1735;;1242;4941;;;;1675;;1988;;1775;5438
rapports;;72;;88;;100;85;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;alpha8;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;13;;fiches;45.571;;;fréquences;;;;;atgi;6;tct;;tat;100;atgf;66
att;;act;100;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;3190;;;0/0;;;;;att;;act;100;aat;;agt;
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;525;;;10;18;;;;ctt;100;cct;100;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;70;;;20;9;;;;gtt;;gct;;gat;100;ggt;
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;2;;;;ttc;33;tcc;1;tac;17;tgc;5
atc;0;acc;100;aac;100;agc;100;;alpha8;54.375;;;40;6;;;;atc;108;acc;34;aac;37;agc;1
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100;;sans;435;;;50;4;39;;;ctc;16;ccc;18;cac;26;cgt;31
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;205;;;60;4;;;;gtc;35;gcc;52;gac;29;ggc;52
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;8;;;70;1;;;;tta;6;tca;2;taa;100;tga;20
ata;100;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;5;aaa;15;aga;3
cta;100;cca;100;caa;100;cga;100;;L’estimation par alpha8;;;;90;0;;;;cta;3;cca;8;caa;12;cga;100
gta;100;gca;-1;gaa;100;gga;100;;est  19 % au dessus;;;;100;2;;;;gta;17;gca;107;gaa;6;gga;4
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;2;;;;ttg;4;tcg;2;tag;100;tgg;18
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;70;;100;;;48;;;;atgj;7;acg;9;aag;36;agg;0
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;99;;atc;189;269;;;;;;;ctg;52;ccg;43;cag;48;cgg;5
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;gca;191;271;;;;;;;gtg;48;gcg;48;gag;52;ggg;20
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;178;;330;;451;959
&lt;/pre&gt;

===cvi===
====cvi opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_opérons|cvi opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Chro_viol_ATCC_12472/chroViol-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_005085.1;cvi;genome;;;
65%GC;30.6.19 Paris;16s  8;98;doubles;intercalaires
;Chromobacterium violaceum ATCC 12472;;;;
;421217..422762;;16s;@1;179
;422942..423018;;atc;;86
;423105..423180;;gca;;249
;423430..426324;;23s;;125
;426450..426564;;5s;;
;;;;;
;502182..503727;;16s;;79
;503807..503883;;atc;;12
;503896..503971;;gca;;250
;504222..507116;;23s;;122
;507239..507353;;5s;;
;;;;;
comp;682034..682118;;ttg;;
;;;;;
;759824..759908;;tac;;
;;;;;
comp;878775..878849;;agg;;
;;;;;
;955155..955230;;gcg;;
;;;;;
;975612..975696;;ctc;;
;;;;;
;1006822..1006897;;ttc;+;6
;1006904..1006979;;ttc;2 ttc;
;;;;;
;1058518..1058611;;agc;;6
;1058618..1058694;;cgt;;3
;1058698..1058772;;gaa;;
;;;;;
comp;1061741..1061815;;gaa;+;3
comp;1061819..1061895;;cgt;2 gaa;7
comp;1061903..1061977;;gaa;2cgt;5
comp;1061983..1062059;;cgt;;
;;;;;
;1154020..1155565;;16s;;179
;1155745..1155821;;atc;;86
;1155908..1155983;;gca;;250
;1156234..1159128;;23s;;122
;1159251..1159365;;5s;;
;;;;;
comp;1263556..1263645;;tcg;;
;;;;;
;1273710..1273786;;atgf;;
;;;;;
;1377435..1377510;;ggc;+;23
;1377534..1377609;;ggc;5 ggc;22
;1377632..1377707;;ggc;;24
;1377732..1377807;;ggc;;29
;1377837..1377912;;ggc;;45
;1377958..1378031;;tgc;;
;;;;;
;1387010..1387094;;tta;;
;;;;;
;1420085..1420161;;gtc;;
;;;;;
;1427771..1427847;;ccc;;
;;;;;
comp;1433244..1433319;;aac;+;32
comp;1433352..1433427;;aac;3 aac;31
comp;1433459..1433534;;aac;;
;;;;;
;1646821..1648366;;16s;;179
;1648546..1648622;;atc;;86
;1648709..1648784;;gca;;249
;1649034..1651928;;23s;;122
;1652051..1652165;;5s;;89
;1652255..1652369;;5s;;
;;;;;
;1746117..1746207;;tcc;+;53
;1746261..1746351;;tcc;2 tcc;
;;;;;
;1978844..1978919;;aac;;
;;;;;
comp;2094372..2094447;;cac;+;26
comp;2094474..2094549;;cac;3 cac;45
comp;2094595..2094670;;cac;;27
comp;2094698..2094774;;aga;;18
comp;2094793..2094869;;cca;;
;;;;;
comp;2511625..2511712;;tca;;
;;;;;
comp;2747299..2747375;;gac;;7
comp;2747383..2747458;;gta;;
;;;;;
;2853221..2853305;;cta;;
;;;;;
;3187082..3187157;;aca;;
;;;;;
;3257362..3257437;;gcc;;
;;;;;
;3262246..3262321;;gcc;+;8
;3262330..3262405;;gaa;2 gcc;11
;3262417..3262492;;gcc;;
;;;;;
comp;3371478..3371592;;5s;;122
comp;3371715..3374609;;23s;;250
comp;3374860..3374935;;gca;;12
comp;3374948..3375024;;atc;;79
comp;3375104..3376649;;16s;;
;;;;;
;3472822..3472897;;gta;+;12
;3472910..3472986;;gac;5 gta;26
;3473013..3473088;;gta;6 gac;12
;3473101..3473177;;gac;1gtg;26
;3473204..3473279;;gta;;12
;3473292..3473368;;gac;;26
;3473395..3473470;;gta;;12
;3473483..3473559;;gac;;27
;3473587..3473663;;gtg;;6
;3473670..3473746;;gac;;27
;3473774..3473850;;gtg;;6
;3473857..3473933;;gac;;
;;;;;
;3622292..3622365;;ggg;;
;;;;;
comp;3820120..3820234;;5s;;122
comp;3820357..3823251;;23s;;249
comp;3823501..3823576;;gca;;86
comp;3823663..3823739;;atc;;179
comp;3823919..3825464;;16s;;
;;;;;
;3828836..3828922;;ctg;+;51
;3828974..3829060;;ctg;4 ctg;33
;3829094..3829180;;ctg;;57
;3829238..3829324;;ctg;;
;;;;;
;3854547..3854622;;caa;@2;*557
;3855180..3855255;;acg;;61
;3855317..3855393;;ccg;+;78
;3855472..3855548;;ccg;2 ccg;
;;;;;
comp;4059834..4059912;;atgi;;
;;;;;
comp;4244591..4244705;;5s;;122
comp;4244828..4247722;;23s;;249
comp;4247972..4248047;;gca;;86
comp;4248134..4248210;;atc;;179
comp;4248390..4249935;;16s;;
;;;;;
comp;4325718..4325794;;atgf;;
;;;;;
comp;4389268..4389342;;caa;;
;;;;;
;4402077..4402153;;cgg;;
;;;;;
comp;4434130..4434244;;5s;;122
comp;4434367..4437261;;23s;;249
comp;4437511..4437586;;gca;;86
comp;4437673..4437749;;atc;;179
comp;4437929..4439474;;16s;;
;;;;;
;4474196..4474272;;atg;+;35
;4474308..4474384;;atg;2 atg;
;;;;;
comp;4529616..4529690;;acc;;
;;;;;
comp;4532053..4532128;;tgg;;
;;;;;
comp;4533370..4533444;;acc;;24
comp;4533469..4533542;;gga;;52
comp;4533595..4533679;;tac;;
;;;;;
comp;4586712..4586787;;aaa;+;38
comp;4586826..4586901;;aag;3 aaa;35
comp;4586937..4587012;;aaa;2 aag;28
comp;4587041..4587116;;aag;;37
comp;4587154..4587229;;aaa;;
&lt;/pre&gt;

====cvi cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_cumuls|cvi cumuls]]
&lt;pre&gt;
cvi cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;8;1;0;-
;16 23 5s 0;0;20;16;2
;16 atc gca;8;40;20;
;16 23 5s a;0;60;6;
;max a;2;80;2;
;a doubles;0;100;0;6
;spéciaux;0;120;0;
;total aas;16;140;0;
sans ;opérons;37;160;0;
;1 aa;22;180;0;
;max a;12;200;0;
;a doubles;12;;1;
;total aas;82;;45;8
total aas;;98;;;
remarques;;2;;;
avec jaune;;;moyenne;;
;;;variance;;
sans jaune;;;moyenne;26;86
;;;variance;18;0
&lt;/pre&gt;

====cvi blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_blocs|cvi blocs]]
&lt;pre&gt;
cvi blocs;;;;;;
16s;179;1546;79;1546;179;1546
atc;86;;12;;86;
gca;249;;250;;250;
23s;125;2895;122;2895;122;2895
5s;;115;;115;;115
;;;;;;
;;;;;;
5s;122;115;122;115;122;115
23s;250;2895;249;2895;249;2895
gca;12;;86;;86;
atc;79;;179;;179;
16s;;1546;;1546;;1546
;;;;;;
16s;179;1546;;5s;122;115
atc;86;;;23s;249;2895
gca;249;;;gca;86;
23s;122;2895;;atc;179;
5s;89;115;;16s;;1546
5s;;115;;;;
&lt;/pre&gt;
====cvi distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_distribution|cvi distribution]]
&lt;pre&gt;
beta1;;;;;;;82;;beta1;;;;;;;22;;beta1;;;;;;;37;;beta1;;;;;;;23
atgi;1;tct;0;tat;0;atgf;2;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;
atc;0;acc;1;aac;4;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;3;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;3;cgt;3;;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;
gtc;1;gcc;3;gac;7;ggc;5;;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;2;gac;7;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;5
tta;1;tca;1;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;0;aca;1;aaa;3;aga;1;;ata;;aca;1;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;3;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;2;cga;0;;cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;6;gca;0;gaa;4;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;6;gca;;gaa;4;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;0;tgg;1;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;;acg;1;aag;2;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;4;ccg;2;cag;0;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;2;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;2;gag;0;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;;;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====cvi données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_données_intercalaires|cvi données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;cvi;fx;fc;cvi;fx40;fc40;cvi;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
0;0;0;5;10;0;5;10;-1;0;118;177;152;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;suite
0;2;10;62;334;1;7;58;-2;3;0;58;57;447;506;;7;;gac
0;3;20;33;245;2;3;44;-3;0;0;858;51;370;450;;**;;gta
0;2;30;18;120;3;10;42;-4;22;375;19;110;439;391;;8;;gcc
0;1;40;19;114;4;6;30;-5;0;0;49;46;439;;;11;;gaa
2;3;50;43;99;5;2;25;-6;2;0;329;190;437;;;**;;gcc
2;3;60;71;107;6;8;13;-7;2;10;19;180;23s 5s;;;12;;gta
2;2;70;92;154;7;6;18;-8;0;56;91;425;127;;;26;;gac
1;1;80;58;138;8;5;13;-9;1;0;155;707;7* 124;;;12;;gta
0;3;90;32;83;9;8;41;-10;0;6;62;136;5s CDS;;;26;;gac
1;4;100;52;95;10;7;50;-11;4;31;173;211;280;137;;12;;gta
2;1;110;36;81;11;2;42;-12;1;0;120;66;189;154;;26;;gac
0;1;120;44;73;12;6;26;-13;2;10;435;225;415;101;;12;;gta
0;3;130;46;81;13;4;35;-14;0;21;101;182;213;206;;27;;gac
2;1;140;32;60;14;3;25;-15;0;0;183;70;5s 5s;;;6;;gta
0;0;150;21;50;15;4;21;-16;0;4;182;49;89;;;27;;gac
2;2;160;32;49;16;5;28;-17;3;16;30;205;16s tRNA;;;6;;gtg
0;2;170;22;50;17;0;19;-18;0;0;204;151;6* 182;;atc;**;;gac
1;3;180;20;43;18;3;17;-19;2;3;98;303;2* 82;;atc;51;;ctg
2;2;190;28;39;19;5;18;-20;1;12;59;106;tRNA 23s;;;33;;ctg
0;1;200;38;28;20;1;14;-21;1;0;360;212;3* 254;;gca;57;;ctg
1;2;210;24;34;21;1;16;-22;1;1;25;73;5* 253;;gca;**;;ctg
2;0;220;12;26;22;2;13;-23;1;4;15;651;tRNA tRNA;;intra;61;;acg
1;1;230;17;25;23;1;7;-24;1;0;93;97;6* 86;;atc gca;78;;ccg
0;0;240;23;14;24;3;18;-25;1;2;230;137;2* 12;;atc gca;;;ccg
0;0;250;11;11;25;1;10;-26;0;3;130;265;tRNA tRNA;;;35;;atgj
0;0;260;16;13;26;2;13;-27;0;0;46;;6;;ttc;**;;atgj
1;0;270;16;21;27;3;7;-28;1;0;71;;**;;ttc;24;;acc
0;0;280;17;14;28;2;12;-29;1;2;48;;6;;agc;52;;gga
0;0;290;17;11;29;2;13;-30;0;0;411;;3;;cgt;**;;tac
0;0;300;7;15;30;1;11;-31;3;1;163;;**;;gaa;38;;aaa
1;0;310;12;9;31;1;17;-32;2;0;170;;3;;gaa;35;;aag
0;0;320;6;14;32;0;12;-33;0;0;55;;7;;cgt;28;;aaa
0;1;330;2;9;33;5;12;-34;0;0;770;;5;;gaa;37;;aag
0;0;340;10;9;34;0;11;-35;2;1;201;;**;;cgt;**;;aaa
0;0;350;6;5;35;1;9;-36;0;0;92;;23;;ggc;;;
0;1;360;6;5;36;1;11;-37;1;0;747;;22;;ggc;;;
0;0;370;7;11;37;5;9;-38;0;2;151;;24;;ggc;;;
0;0;380;4;6;38;1;9;-39;0;0;89;;29;;ggc;;;
0;0;390;3;7;39;3;10;-40;0;1;6;;45;;ggc;;;
0;0;400;5;6;40;2;14;-41;2;1;87;;**;;tgc;;;
3;5;reste;89;94;reste;977;1589;-42;0;0;125;;32;;aac;;;
26;50;total;1114;2412;total;1114;2412;-43;1;0;86;;31;;aac;;;
23;45;diagr;1020;2308;diagr;132;813;-44;0;3;179;;**;;aac;;;
0;7; t30;113;699;;;;-45;0;0;64;;53;;tcc;;;
;;;;;;;;-46;0;0;10;;**;;tcc;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;40;;26;;cac;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;139;;45;;cac;;;
;x;1109;69;5;1183;;;-49;1;0;194;;27;;cac;;;
;c;2402;687;10;3099;;;-50;1;0;130;;18;;aga;;;
;;;;;4282;205;;reste;6;4;;;**;;cca;;;
;;;;;;4487;;total;69;687;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====cvi autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_autres_intercalaires_aas|cvi autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;cvi;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;242272;242931;116;*;
;;regulatory;243048;243195;76;*;
fin;;CDS;243272;245170;;;
deb;comp;CDS;419401;420717;506;*;
;;rRNA;421224;422759;182;*;16s
;;tRNA;422942;423018;86;*;atc
;;tRNA;423105;423180;253;*;gca
;;rRNA;423434;426322;127;*;23s
;;rRNA;426450;426564;137;*;5s
fin;comp;CDS;426702;427856;;;
deb;;CDS;500524;501741;447;*;
;;rRNA;502189;503724;82;*;16s
;;tRNA;503807;503883;12;*;atc
;;tRNA;503896;503971;254;*;gca
;;rRNA;504226;507114;124;*;23s
;;rRNA;507239;507353;280;*;5s
fin;;CDS;507634;508074;;;
deb;comp;CDS;521304;522338;119;*;
;;regulatory;522458;522723;124;*;
fin;;CDS;522848;524695;;;
deb;;CDS;526333;526644;31;*;
;;ncRNA;526676;526859;12;*;
fin;;CDS;526872;527483;;;
deb;comp;CDS;578634;581798;106;*;
;;ncRNA;581905;582364;130;*;
fin;;CDS;582495;583553;;;
deb;comp;CDS;680663;681856;177;*;
;comp;tRNA;682034;682118;58;*;ttg
fin;comp;CDS;682177;684003;;1;
deb;comp;CDS;758940;759671;152;*;
;;tRNA;759824;759908;57;*;tac
fin;comp;CDS;759966;760805;;;
deb;comp;CDS;877002;877916;858;*;
;comp;tRNA;878775;878849;19;*;agg
fin;comp;CDS;878869;879849;;0;
deb;;CDS;952811;955105;49;*;
;;tRNA;955155;955230;329;*;gcg
fin;;CDS;955560;956537;;;
deb;;CDS;975236;975592;19;*;
;;tRNA;975612;975696;91;*;ctc
fin;;CDS;975788;976144;;;
deb;comp;CDS;996781;998367;89;*;
;;regulatory;998457;998548;72;*;
fin;;CDS;998621;1000021;;;
deb;;CDS;1006022;1006666;155;*;
;;tRNA;1006822;1006897;6;*;ttc
;;tRNA;1006904;1006979;51;*;ttc
fin;comp;CDS;1007031;1008230;;;
deb;;CDS;1057229;1058455;62;*;
;;tRNA;1058518;1058611;6;*;agc
;;tRNA;1058618;1058694;3;*;cgt
;;tRNA;1058698;1058772;110;*;gaa
deb;comp;CDS;1058883;1061567;173;*;
;comp;tRNA;1061741;1061815;3;*;gaa
;comp;tRNA;1061819;1061895;7;*;cgt
;comp;tRNA;1061903;1061977;5;*;gaa
;comp;tRNA;1061983;1062059;46;*;cgt
fin;;CDS;1062106;1063701;;1;
deb;;CDS;1153105;1153656;370;*;
;;rRNA;1154027;1155562;182;*;16s
;;tRNA;1155745;1155821;86;*;atc
;;tRNA;1155908;1155983;254;*;gca
;;rRNA;1156238;1159126;124;*;23s
;;rRNA;1159251;1159365;189;*;5s
fin;;CDS;1159555;1160445;;0;
deb;;CDS;1262223;1263365;190;*;
;comp;tRNA;1263556;1263645;120;*;tcg
fin;comp;CDS;1263766;1264999;;;
deb;;CDS;1272648;1273274;435;*;
;;tRNA;1273710;1273786;180;*;atgf
fin;comp;CDS;1273967;1274848;;;
deb;;CDS;1292860;1293150;191;*;
;;rpr;1293342;1295116;324;*;
fin;;CDS;1295441;1297966;;;
deb;;CDS;1376752;1377333;101;*;
;;tRNA;1377435;1377510;23;*;ggc
;;tRNA;1377534;1377609;22;*;ggc
;;tRNA;1377632;1377707;24;*;ggc
;;tRNA;1377732;1377807;29;*;ggc
;;tRNA;1377837;1377912;45;*;ggc
;;tRNA;1377958;1378031;425;*;tgc
fin;comp;CDS;1378457;1378696;;1;
deb;comp;CDS;1385508;1386302;707;*;
;;tRNA;1387010;1387094;183;*;tta
fin;;CDS;1387278;1387724;;;
deb;comp;CDS;1418833;1419948;136;*;
;;tRNA;1420085;1420161;182;*;gtc
fin;;CDS;1420344;1422245;;;
deb;;CDS;1427387;1427740;30;*;
;;tRNA;1427771;1427847;204;*;ccc
fin;;CDS;1428052;1428429;;;
deb;comp;CDS;1432303;1433145;98;*;
;comp;tRNA;1433244;1433319;32;*;aac
;comp;tRNA;1433352;1433427;31;*;aac
;comp;tRNA;1433459;1433534;211;*;aac
fin;;CDS;1433746;1434780;;;
deb;comp;CDS;1451057;1452388;323;*;
;;rpr;1452712;1454024;105;*;
fin;comp;CDS;1454130;1454693;;;
deb;;CDS;1458879;1461128;179;*;
;;rpr;1461308;1462500;144;*;
fin;;CDS;1462645;1463904;;;
deb;;CDS;1644076;1646388;439;*;
;;rRNA;1646828;1648363;182;*;16s
;;tRNA;1648546;1648622;86;*;atc
;;tRNA;1648709;1648784;253;*;gca
;;rRNA;1649038;1651926;124;*;23s
;;rRNA;1652051;1652165;89;*;5s
;;rRNA;1652255;1652369;154;*;5s
fin;comp;CDS;1652524;1652721;;0;
deb;comp;CDS;1689363;1690409;107;*;
;comp;regulatory;1690517;1690702;42;*;
fin;comp;CDS;1690745;1691731;;;
deb;;CDS;1744930;1746057;59;*;
;;tRNA;1746117;1746207;53;*;tcc
;;tRNA;1746261;1746351;360;*;tcc
fin;;CDS;1746712;1748223;;;
deb;;CDS;1786722;1786937;25;*;
;;tRNA;1786963;1787055;15;*;other
fin;;CDS;1787071;1788270;;;
deb;;CDS;1899096;1900754;223;*;
;;rpr;1900978;1902570;157;*;
fin;comp;CDS;1902728;1903315;;;
deb;;CDS;1975805;1978750;93;*;
;;tRNA;1978844;1978919;66;*;aac
fin;comp;CDS;1978986;1979954;;0;
deb;comp;CDS;2093021;2094141;230;*;
;comp;tRNA;2094372;2094447;26;*;cac
;comp;tRNA;2094474;2094549;45;*;cac
;comp;tRNA;2094595;2094670;27;*;cac
;comp;tRNA;2094698;2094774;18;*;aga
;comp;tRNA;2094793;2094869;225;*;cca
fin;;CDS;2095095;2095946;;;
deb;;CDS;2186305;2186922;69;*;
;;tmRNA;2186992;2187356;205;*;
fin;;CDS;2187562;2187735;;;
deb;comp;CDS;2192639;2193253;145;*;
;comp;regulatory;2193399;2193497;4;*;
;comp;regulatory;2193502;2193587;65;*;
fin;comp;CDS;2193653;2196067;;;
deb;;CDS;2337863;2338135;-1;*;
;;ncRNA;2338135;2338209;0;*;
fin;;CDS;2338210;2338812;;;
deb;comp;CDS;2511015;2511494;130;*;
;comp;tRNA;2511625;2511712;46;*;tca
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deb;comp;CDS;2560167;2560490;264;*;
;comp;ncRNA;2560755;2560853;168;*;
fin;;CDS;2561022;2562185;;;
deb;comp;CDS;2745389;2747227;71;*;
;comp;tRNA;2747299;2747375;7;*;gac
;comp;tRNA;2747383;2747458;48;*;gta
fin;comp;CDS;2747507;2747776;;;
deb;comp;CDS;2852349;2853038;182;*;
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deb;comp;CDS;3186574;3187032;49;*;
;;tRNA;3187082;3187157;411;*;aca
fin;;CDS;3187569;3188321;;0;
deb;comp;CDS;3256344;3257156;205;*;
;;tRNA;3257362;3257437;151;*;gcc
fin;comp;CDS;3257589;3259631;;;
deb;comp;CDS;3261178;3261942;303;*;
;;tRNA;3262246;3262321;8;*;gcc
;;tRNA;3262330;3262405;11;*;gaa
;;tRNA;3262417;3262492;106;*;gcc
fin;comp;CDS;3262599;3263309;;;
deb;comp;CDS;3368966;3371062;415;*;
;comp;rRNA;3371478;3371592;124;*;5s
;comp;rRNA;3371717;3374605;254;*;23s
;comp;tRNA;3374860;3374935;12;*;gca
;comp;tRNA;3374948;3375024;82;*;atc
;comp;rRNA;3375107;3376642;439;*;16s
fin;comp;CDS;3377082;3377729;;;
deb;comp;CDS;3447322;3448338;50;*;
;comp;regulatory;3448389;3448483;124;*;
fin;;CDS;3448608;3450053;;;
deb;comp;CDS;3471644;3472609;212;*;
;;tRNA;3472822;3472897;12;*;gta
;;tRNA;3472910;3472986;26;*;gac
;;tRNA;3473013;3473088;12;*;gta
;;tRNA;3473101;3473177;26;*;gac
;;tRNA;3473204;3473279;12;*;gta
;;tRNA;3473292;3473368;26;*;gac
;;tRNA;3473395;3473470;12;*;gta
;;tRNA;3473483;3473559;27;*;gac
;;tRNA;3473587;3473663;6;*;gta
;;tRNA;3473670;3473746;27;*;gac
;;tRNA;3473774;3473850;6;*;gtg
;;tRNA;3473857;3473933;163;*;gac
fin;;CDS;3474097;3475629;;;
deb;;CDS;3621600;3622121;170;*;
;;tRNA;3622292;3622365;55;*;ggg
fin;;CDS;3622421;3624571;;0;
deb;comp;CDS;3727029;3728117;40;*;
;comp;regulatory;3728158;3728256;14;*;
;comp;regulatory;3728271;3728361;172;*;
fin;comp;CDS;3728534;3729817;;;
deb;comp;CDS;3818863;3819906;213;*;
;comp;rRNA;3820120;3820234;124;*;5s
;comp;rRNA;3820359;3823247;253;*;23s
;comp;tRNA;3823501;3823576;86;*;gca
;comp;tRNA;3823663;3823739;182;*;atc
;comp;rRNA;3823922;3825457;437;*;16s
deb;comp;CDS;3825895;3828762;73;*;
;;tRNA;3828836;3828922;51;*;ctg
;;tRNA;3828974;3829060;33;*;ctg
;;tRNA;3829094;3829180;57;*;ctg
;;tRNA;3829238;3829324;651;*;ctg
fin;comp;CDS;3829976;3831349;;;
deb;comp;CDS;3854191;3854409;770;*;
;comp;tRNA;3855180;3855255;61;*;acg
;comp;tRNA;3855317;3855393;78;*;ccg
;comp;tRNA;3855472;3855548;97;*;ccg
fin;;CDS;3855646;3856641;;;
deb;comp;CDS;4058859;4059632;201;*;
;comp;tRNA;4059834;4059912;92;*;atgi
fin;comp;CDS;4060005;4061936;;;
deb;;CDS;4244169;4244489;101;*;
;comp;rRNA;4244591;4244705;124;*;5s
;comp;rRNA;4244830;4247718;253;*;23s
;comp;tRNA;4247972;4248047;86;*;gca
;comp;tRNA;4248134;4248210;182;*;atc
;comp;rRNA;4248393;4249928;450;*;16s
fin;;CDS;4250379;4251968;;;
deb;comp;CDS;4324029;4324970;747;*;
;comp;tRNA;4325718;4325794;151;*;atgf
fin;comp;CDS;4325946;4326557;;;
deb;comp;CDS;4388195;4389178;89;*;
;comp;tRNA;4389268;4389342;6;*;caa
fin;comp;CDS;4389349;4390203;;;
deb;comp;CDS;4401196;4401939;137;*;
;;tRNA;4402077;4402153;265;*;cgg
fin;comp;CDS;4402419;4404281;;;
deb;;CDS;4433423;4433923;206;*;
;comp;rRNA;4434130;4434244;124;*;5s
;comp;rRNA;4434369;4437257;253;*;23s
;comp;tRNA;4437511;4437586;86;*;gca
;comp;tRNA;4437673;4437749;182;*;atc
;comp;rRNA;4437932;4439467;391;*;16s
fin;;CDS;4439859;4440494;;0;
deb;;CDS;4472951;4474108;87;*;
;;tRNA;4474196;4474272;35;*;atgj
;;tRNA;4474308;4474384;125;*;atgj
fin;;CDS;4474510;4474914;;;
deb;comp;CDS;4529035;4529529;86;*;
;comp;tRNA;4529616;4529690;179;*;acc
fin;comp;CDS;4529870;4530565;;;
deb;comp;CDS;4531632;4531988;64;*;
;comp;tRNA;4532053;4532128;10;*;tgg
deb;comp;CDS;4532139;4533329;40;*;
;comp;tRNA;4533370;4533444;24;*;acc
;comp;tRNA;4533469;4533542;52;*;gga
;comp;tRNA;4533595;4533679;139;*;tac
fin;comp;CDS;4533819;4534070;;;
deb;comp;CDS;4549877;4550914;87;*;
;;regulatory;4551002;4551150;131;*;
fin;;CDS;4551282;4551914;;;
deb;comp;CDS;4586188;4586517;194;*;
;comp;tRNA;4586712;4586787;38;*;aaa
;comp;tRNA;4586826;4586901;35;*;aag
;comp;tRNA;4586937;4587012;28;*;aaa
;comp;tRNA;4587041;4587116;37;*;aag
;comp;tRNA;4587154;4587229;130;*;aaa
fin;comp;CDS;4587360;4587695;;0;
&lt;/pre&gt;

====cvi intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_entre_cds|cvi intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
cvi;4.2.21 Paris;;cvi 25.12.20;;;;;;;;;
cvi;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;'''frequence5;intercal;&lt;u&gt;'''frequencez
;'''négatif;756;17.7;'''négatif ;-8;11;-1 à -102;'''4 751 080;-1;756;610;2
;'''zéro;15;0.4;;;;;'''intercals;0;15;620;1
;'''1 à 200;2842;66.4;'''0 à 200;74;55;;'''452 650;5;227;630;2
;'''201 à 370;455;10.6;'''201 à 370;266;47;;'''9.5%;10;169;640;1
;'''371 à 600;147;3.4;'''371 à 600;453;59;;;15;168;650;1
;'''601 à max;67;1.6;'''601 à 1309;795;172;;;20;110;660;4
;'''total 4282;&lt;201;84.4;'''total 4281;104;142;-102 à 1309;;25;72;670;4
adresse;intercalx;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence1;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence6;cumul,t %;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence-1;30;66;680;2
1407250;1977;-1;756;-70;6;;0;15;35;68;690;3
2476400;1309;0;15;-60;1;;-1;°118;40;65;700;5
667844;1253;1;°65;-50;4;;-2;3;45;75;710;2
448587;1220;2;47;-40;9;;-3;0;50;67;720;1
357760;1187;3;°52;-30;12;'''min à -1;-4;°397;55;84;730;5
707510;1165;4;36;-20;32;756;-5;0;60;94;740;2
139762;1148;5;27;-10;103;17.7%;-6;2;65;120;750;1
1309853;1098;6;21;0;604;;-7;12;70;126;760;2
2457295;1068;7;°24;10;396;;-8;°56;75;114;770;1
669869;1004;8;18;20;278;;-9;1;80;82;780;1
2288697;984;9;49;30;138;;-10;6;85;62;790;1
1828489;968;10;°57;40;133;'''1 à 100;-11;°35;90;53;800;4
3613803;905;11;44;50;142;1969;-12;1;95;81;810;1
2465473;902;12;32;60;178;46.0%;-13;12;100;66;820;2
2025387;900;13;°39;70;246;;-14;°21;105;60;830;0
869124;888;14;28;80;196;;-15;0;110;57;840;1
2030614;865;15;25;90;115;;-16;4;115;69;850;0
664864;858;16;°33;100;147;;-17;°19;120;48;860;1
2442265;838;17;19;110;117;;-18;0;125;58;870;1
561508;819;18;20;120;117;;-19;5;130;69;880;0
1345805;811;19;°23;130;127;;-20;°13;135;48;890;1
27453;809;20;15;140;92;;-21;1;140;44;900;1
3009727;799;21;°17;150;71;;-22;2;145;41;910;2
914899;796;22;15;160;81;;-23;°5;150;30;920;0
344593;793;23;8;170;72;'''1 à 200;-24;1;155;46;930;0
1783705;791;24;°21;180;63;2842;-25;3;160;35;940;0
1569417;787;25;11;190;67;66.4%;-26;°3;165;41;950;0
3000804;771;26;°15;200;66;;-27;0;170;31;960;0
34255;767;27;10;210;58;;-28;1;175;37;970;1
136535;759;28;°14;220;38;;-29;°3;180;26;980;0
2126902;751;29;15;230;42;;-30;0;185;39;990;1
1360178;742;30;12;240;37;;-31;4;190;28;1000;0
3310655;736;31;°18;250;22;'''0 à 200;-32;2;195;34;1010;1
2140607;733;32;12;260;29;2857;total;75;200;32;1020;0
;;33;°17;270;37;;reste;26;205;32;1030;0
;;34;11;280;31;;total;771;210;26;1040;0
;;35;10;290;28;;;;215;19;1050;0
;;36;12;300;22;;intercal;&lt;u&gt;'''frequencef;220;19;1060;0
;;37;°14;310;21;;600;4215;225;21;1070;1
;;38;10;320;20;;620;3;230;21;1080;0
;;39;13;330;11;;640;3;235;17;1090;0
;;40;°16;340;19;'''201 à 370;660;5;240;20;1100;1
;;reste;2566;350;11;455;680;6;245;11;1110;0
;;total;4282;360;11;10.6%;700;8;250;11;1120;0
;;;;370;18;;720;3;255;9;1130;0
;;;;380;10;;740;7;260;20;1140;0
;;;;390;10;;760;3;265;17;1150;1
'''adresses;'''intercaln;'''décalage;'''long;400;11;;780;2;270;20;1160;0
4014450;-102;comp;;410;11;;800;5;275;15;1170;1
1765439;-97;shift2;1671;420;9;;820;3;280;16;1180;0
1246857;-94;shift2;798;430;12;;840;1;285;17;1190;1
4426186;-80;comp;;440;14;;860;1;290;11;1200;0
3511064;-73;shift2;1;450;9;;880;1;295;14;reste;4
3199809;-71;shift2;494;460;5;;900;2;300;8;total;4282
3580355;-61;comp;;470;6;;920;2;305;14;;
4088183;-59;comp;;480;6;;940;;310;7;;
2599768;-57;comp;;490;5;;960;;315;14;;
1062106;-56;comp;;500;1;;980;1;320;6;;
3542032;-50;comp;;510;10;;1000;1;325;5;;
834886;-49;comp;;520;5;;1020;1;330;6;;
2603937;-44;shift2;;530;4;;1040;;335;13;;
2822032;-44;shift2;;540;2;'''371 à 600;1060;;340;6;;
4104968;-44;shift2;;550;4;147;1080;1;345;6;;
283435;-43;comp;;560;3;3.4%;1100;1;350;5;;
226851;-41;comp;;570;5;;1120;;355;6;;
387678;-41;comp;;580;3;'''601 à max;1140;;360;5;;
1796583;-41;shift2;;590;0;67;1160;1;365;10;;
4120154;-40;shift2;;600;2;1.6%;;61;370;8;;
3951302;-38;shift2;;reste;67;;reste;6;reste;214;;
4595659;-38;shift2;;total;4282;;total;4282;total;4282;;
&lt;/pre&gt;

====cvi  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_positifs_S+|cvi intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
cvi;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;29;-174;154;42;611;200;max70;&amp;-44;372;-1071;112;852;282;min50
31 à 400;;;;;;;;&amp;5.3;22;-332;69;915;-138;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;131;52;-;581;dte;30;tf;&amp;204;67;;649;poly;203;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;149;52;-;808;poly;107;tF
corrélations
cvi. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400
ase;min40;2398;3558;5956;959;922;940;18;646;725;814
cvi;min30;1008;2320;3328;931;858;891;33;434;549;696
abra;min10;256;934;1190;874;716;797;81;-163;59;312
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+
135;264;0.51;3031;5166;7;3;116;252;389;1165;346
112;301;0.37;1171;3111;4;3;59;221;130;815;582
94;413;0.23;279;1388;4;9;29;295;41;420;-243
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50 60 70, '''t30 t70'''.
*Corrélations, diagrammes 1-40, les intercalaires négatifs, totaux.
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;0.582;;;;;
41-n;0.931;0.858;0.891;;;;;;;;;;;;
1-n;0.696;0.434;0.549;;;;;;;;;;14.8.21 Paris;;
cvi;fx;fc;;cvi;fx%;fc%;;;fx40;fc40;;;cvi;Sx-;Sc-
0;5;10;;0;5;4;;0;5;10;;x;-1;0;118
10;62;334;;10;62;144;;1;7;58;&gt;0;1097;-2;3;0
20;33;245;;20;33;106;;2;3;44;&lt;0;69;-3;0;0
30;18;120;;30;18;52;;3;10;42;zéro;5;-4;22;375
40;17;116;;40;17;50;;4;6;30;total;1171;-5;0;0
50;43;99;;50;43;43;;5;2;25;;c;-6;2;0
60;71;107;;60;70;46;;6;8;13;&gt;0;2414;-7;2;10
70;92;154;;70;91;66;;7;6;18;&lt;0;687;-8;0;56
80;56;140;;80;56;60;;8;5;13;zéro;10;-9;1;0
90;32;83;;90;32;36;;9;8;41;total;3111;-10;0;6
100;52;95;;100;52;41;;10;7;50;;;-11;4;31
110;35;82;;110;35;35;;11;2;42;;;-12;1;0
120;44;73;;120;44;31;;12;6;26;;;-13;2;10
130;43;84;;130;43;36;;13;4;35;;;-14;0;21
140;32;60;;140;32;26;;14;3;25;;;-15;0;0
150;20;51;;150;20;22;;15;4;21;;;-16;0;4
160;32;49;;160;32;21;;16;5;28;;;-17;3;16
170;22;50;;170;22;22;;17;0;19;;;-18;0;0
180;20;43;;180;20;19;;18;3;17;;;-19;2;3
190;28;39;;190;28;17;;19;5;18;;;-20;1;12
200;36;30;;200;36;13;;20;1;14;;;-21;1;0
210;23;35;;210;23;15;;21;1;16;;;-22;1;1
220;12;26;;220;12;11;;22;2;13;;;-23;1;4
230;17;25;;230;17;11;;23;1;7;;;-24;1;0
240;23;14;;240;23;6;;24;3;18;;;-25;1;2
250;11;11;;250;11;5;;25;1;10;;;-26;0;3
260;16;13;;260;16;6;;26;2;13;;;-27;0;0
270;16;21;;270;16;9;;27;3;7;;;-28;1;0
280;17;14;;280;17;6;;28;2;12;;;-29;1;2
290;17;11;;290;17;5;;29;2;13;;;-30;0;0
300;7;15;;300;7;6;;30;1;11;;;-31;3;1
310;12;9;;310;12;4;;31;1;17;;;-32;2;0
320;6;14;;320;6;6;;32;0;12;;;-33;0;0
330;2;9;;330;2;4;;33;4;13;;;-34;0;0
340;10;9;;340;10;4;;34;0;11;;;-35;2;1
350;6;5;;350;6;2;;35;1;9;;;-36;0;0
360;6;5;;360;6;2;;36;1;11;;;-37;1;0
370;7;11;;370;7;5;;37;5;9;;;-38;0;2
380;4;6;;380;4;3;;38;1;9;;;-39;0;0
390;3;7;;390;3;3;;39;3;10;;;-40;0;1
400;5;6;;400;5;3;;40;1;15;;;-41;2;1
reste;89;94;;;;;;reste;967;1599;;;-42;0;0
total;1102;2424;;t30;112;301;;total;1102;2424;;;-43;1;0
diagr;1008;2320;;t70;333;506;;diagr;130;815;;;-44;0;3
 - t30;895;1621;;;;;;;;;;;-45;0;0
 - t70;672;1145;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;1;0
;;;;;;;;;;;;;-50;1;0
;;;;;;;;;;;;;reste;6;4
;;;;;;;;;;;;;total;69;687
&lt;/pre&gt;

====cvi  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_négatifs_S-|cvi intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
cvi;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;;;
comp’;0;3;0;20;0;2;2;0;1;0;3;0;2;0;0;0;2;0;2;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;2;1;0;0;2;0;1;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;1;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;62;6
continu;118;0;0;377;0;0;10;56;0;6;32;1;10;21;0;4;17;0;3;12;0;1;4;0;2;3;0;0;2;0;2;1;0;0;1;0;0;2;0;1;1;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;694;4
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;cvi;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;3;0;22;0;2;2;0;1;0;4;1;2;0;0;0;3;0;2;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;3;2;0;0;2;0;1;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;6;69
;Sc-;118;0;0;375;0;0;10;56;0;6;31;0;10;21;0;4;16;0;3;12;0;1;4;0;2;3;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;2;0;1;1;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;687
&lt;/pre&gt;

====cvi autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_autres_intercalaires|cvi autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
;cvi;autres intercalaires;;adresses1;;cvi;autres intercalaires;;adresses2;;;cvi;autres intercalaires;;adresses3;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;242272;116;comp;;deb;°CDS;1427387;30;;;deb;°CDS;3471644;212;comp
;regulatory;243048;76;;;;&amp;tRNA;1427771;204;;;;&amp;tRNA;3472822;12;
fin;°CDS;243272;;;;fin;°CDS;1428052;;;;;&amp;tRNA;3472910;26;
deb;°CDS;419401;506;comp;;deb;°CDS;1432303;98;comp;;;&amp;tRNA;3473013;12;
;$rRNA;421224;182;;;;&amp;tRNA;1433244;32;comp;;;&amp;tRNA;3473101;26;
;&amp;tRNA;422942;86;;;;&amp;tRNA;1433352;31;comp;;;&amp;tRNA;3473204;12;
;&amp;tRNA;423105;253;;;;&amp;tRNA;1433459;211;comp;;;&amp;tRNA;3473292;26;
;$rRNA;423434;127;;;fin;°CDS;1433746;;;;;&amp;tRNA;3473395;12;
;$rRNA;426450;137;;;deb;°CDS;1451057;323;comp;;;&amp;tRNA;3473483;27;
fin;°CDS;426702;;comp;;;repeat_region;1452712;105;;;;&amp;tRNA;3473587;6;
deb;°CDS;500524;447;;;fin;°CDS;1454130;;comp;;;&amp;tRNA;3473670;27;
;$rRNA;502189;82;;;deb;°CDS;1458879;179;;;;&amp;tRNA;3473774;6;
;&amp;tRNA;503807;12;;;;repeat_region;1461308;144;;;;&amp;tRNA;3473857;163;
;&amp;tRNA;503896;254;;;fin;°CDS;1462645;;;;fin;°CDS;3474097;;
;$rRNA;504226;124;;;deb;°CDS;1644076;439;;;deb;°CDS;3621600;170;
;$rRNA;507239;280;;;;$rRNA;1646828;182;;;;&amp;tRNA;3622292;55;
fin;°CDS;507634;;;;;&amp;tRNA;1648546;86;;;fin;°CDS;3622421;;
deb;°CDS;521304;119;comp;;;&amp;tRNA;1648709;253;;;deb;°CDS;3727029;40;comp
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;&amp;tRNA;975612;91;;;;&amp;tRNA;2094372;26;;;;&amp;tRNA;4059834;92;comp
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;&amp;tRNA;1006904;51;;;;tmRNA;2186992;205;;;;$rRNA;4248393;450;comp
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;&amp;tRNA;1058698;110;;;fin;°CDS;2193653;;comp;;deb;°CDS;4388195;89;comp
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;&amp;tRNA;1061819;7;comp;;fin;°CDS;2338210;;;;deb;°CDS;4401196;137;comp
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;&amp;tRNA;1155908;254;;;deb;°CDS;2745389;71;comp;;;&amp;tRNA;4437673;182;comp
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;$rRNA;1159251;189;;;;&amp;tRNA;2747383;48;comp;;fin;°CDS;4439859;;
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;&amp;tRNA;1263556;120;comp;;;&amp;tRNA;2853221;70;;;;&amp;tRNA;4474308;125;
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;&amp;tRNA;1273710;180;;;;&amp;tRNA;3187082;411;;;;&amp;tRNA;4529616;179;comp
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;repeat_region;1293342;324;;;;&amp;tRNA;3257362;151;;;;&amp;tRNA;4532053;10;comp
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;&amp;tRNA;1377435;23;;;;&amp;tRNA;3262246;8;;;;&amp;tRNA;4533469;52;comp
;&amp;tRNA;1377534;22;;;;&amp;tRNA;3262330;11;;;;&amp;tRNA;4533595;139;comp
;&amp;tRNA;1377632;24;;;;&amp;tRNA;3262417;106;;;fin;°CDS;4533819;;comp
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;&amp;tRNA;1377958;425;;;;$rRNA;3371478;124;comp;;fin;°CDS;4551282;;
fin;°CDS;1378457;;comp;;;$rRNA;3371717;254;comp;;deb;°CDS;4586188;194;comp
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;&amp;tRNA;1387010;183;;;;&amp;tRNA;3374948;82;comp;;;&amp;tRNA;4586826;35;comp
fin;°CDS;1387278;;;;;$rRNA;3375107;439;comp;;;&amp;tRNA;4586937;28;comp
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;&amp;tRNA;1420085;182;;;deb;°CDS;3447322;50;comp;;;&amp;tRNA;4587154;130;comp
fin;°CDS;1420344;;;;;regulatory;3448389;124;comp;;fin;°CDS;4587360;;comp
;;;;;;fin;°CDS;3448608;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====cvi intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_tRNA|cvi intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
cvi intercalaires tRNA ;;;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;;;177;;58;;19;6;deb;
;;comp’;152;comp’;57;;25;10;&lt;201;22
;;;858;;19;;30;15;total;27
;;;49;;329;;40;19;taux;81%
;;;19;;91;;49;46;;
;6;;155;;51;;59;48;fin;
;6  3;;62;comp’;110;;62;51;&lt;201;20
;3 7 5;;173;comp’;46;;64;55;total;25
;;comp’;190;;120;;71;58;taux;80%
;;;435;comp’;180;;86;91;;
;;;191;;324;;87;92;total;
;23 22 24 29 45;;101;comp’;425;;89;120;&lt;201;42
;;comp’;707;;183;;93;125;total;52
;;comp’;136;;182;;98;130;taux;81%
;;;30;;204;;101;139;;
;32 31;;98;comp’;211;;130;151;;
;53;;59;;360;;155;163;;
;;;25;;15;;170;179;;
;;;93;comp’;66;;173;182;;
;26 45 27 18;;230;comp’;225;;177;183;;
;;;130;;46;;191;204;;
;7;;71;;48;;194;324;;
;;comp’;182;comp’;70;;201;329;;
;;comp’;49;;411;;230;360;;
;;comp’;205;comp’;151;;435;411;;
;8  11;comp’;303;comp’;106;;747;;;
;12 26 12 26 12 26;comp’;212;;163;;858;;comp’;cumuls
;12 27 6 27 6;;;;;;49;46;deb;
;;;170;;55;;73;57;&lt;201;7
;51 33 57;comp’;73;comp’;651;;136;66;total;12
;61 78;;770;comp’;97;;137;70;taux;58%
;;;201;;92;;152;97;;
;;;747;;151;;182;106;fin;
;;;89;;6;;190;110;&lt;201;9
;;comp’;137;comp’;265;;205;151;total;14
;35;;87;;125;;212;180;taux;64%
;;;86;;179;;303;211;;
;;;64;;10;;707;225;total;
;24 52;;40;;139;;770;265;&lt;201;16
;38 35 28 37;;194;;130;;-;425;total;26
;;;;;;;-;651;taux;62%
;;;;;;;;;;
continu + comp’;;;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;;;
&lt;201;29;29;58;;;;;;;
total;39;39;78;;;;;;;
taux;74%;74%;74%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====cvi par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_par_rapport_au_groupe_de_référence|cvi par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;cvi;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;9;7;2;;;;18;
16;moyen;7;3;11;;;16;37;
14;fort;6;27;10;;;;43;
; ;22;37;23;;;16;98;
10;g+cga;3;5;2;;;;10;
2;agg+cgg;2;;;;;;2;
4;carre ccc;4;2;;;;;6;
5;autres;;;;;;;0;
;;9;7;2;;;;18;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;cvi;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;92;71;20;;;;184;26
16;moyen;71;31;112;;;163;378;324
14;fort;61;276;102;;;;439;650
; ;224;378;235;;;163;98;729
10;g+cgg;31;51;20;;;;102;10
2;agg+cga;20;;;;;;20;
4;carre ccc;41;20;;;;;61;16
5;autres;;;;;;;0;
;;92;71;20;;;;184;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;cvi;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;110;85;24;220;26;41;19;9
16;moyen;85;37;134;256;324;32;8;48
14;fort;73;329;122;524;650;27;73;43
; ;268;451;280;82;729;22;37;23
10;g+cgg;37;61;24;122;10;;;
2;agg+cga;24;;;24;;;;
4;carre ccc;49;24;;73;16;;;
5;autres;;;;;;;;
;;110;85;24;220;;;;
&lt;/pre&gt;

====beta, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#beta,_estimation_des_-rRNAs|beta, estimation des -rRNAs]] 
&lt;pre&gt;
44 génomes total avec rRNA;;;;beta;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;beta;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;44;351; ; ;;indices;;;;44;798;0;0;;beta1;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;82
atgi;;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;10;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;23;tgc;;;ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;1
atc;159;acc;10;aac;;agc;1;;atc;361;acc;23;aac;;agc;2;;atc;;acc;1;aac;4;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;1;cac;3;cgt;3
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;1;gcc;3;gac;7;ggc;5
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;3;aga;1
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;2;cga;
gta;;gca;159;gaa;;gga;10;;gta;;gca;361;gaa;;gga;23;;gta;6;gca;;gaa;4;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;2;cag;;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;2;gag;;ggg;1
;;329;;22;;0;351;;;;748;;50;;0;798;;;;21;;43;;18;82
11.1.21 Paris;;;;beta;total;ttt;tgt;;11.1.21 Paris;;;;beta;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;268;15707;5.2;0;;indices;;;;268;15707;5.2;0;;beta1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;99;tct;0.4;tat;;atgf;172;;atgi;99;tct;0.4;tat;;atgf;177;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;200
att;1.1;act;0.7;aat;0.4;agt;0.4;;att;1.1;act;0.7;aat;0.4;agt;0.4;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;2.2;cct;;cat;;cgc;0.7;;ctt;2.2;cct;;cat;;cgc;0.7;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.7;gct;;gat;;ggt;;;gtt;0.7;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;108;tcc;101;tac;84;tgc;142;;ttc;108;tcc;101;tac;107;tgc;142;;ttc;200;tcc;200;tac;200;tgc;100
atc;6;acc;79;aac;184;agc;99;;atc;367;acc;102;aac;184;agc;101;;atc;;acc;100;aac;400;agc;100
ctc;143;ccc;100;cac;109;cgt;187;;ctc;143;ccc;100;cac;109;cgt;187;;ctc;100;ccc;100;cac;300;cgt;300
gtc;150;gcc;124;gac;246;ggc;224;;gtc;150;gcc;124;gac;246;ggc;224;;gtc;100;gcc;300;gac;700;ggc;500
tta;55;tca;99;taa;;tga;60;;tta;55;tca;99;taa;;tga;60;;tta;100;tca;100;taa;;tga;
ata;0.4;aca;114;aaa;121;aga;114;;ata;0.4;aca;114;aaa;121;aga;114;;ata;;aca;100;aaa;300;aga;100
cta;101;cca;137;caa;123;cga;0;;cta;101;cca;137;caa;123;cga;;;cta;100;cca;100;caa;200;cga;
gta;118;gca;12;gaa;202;gga;78;;gta;118;gca;373;gaa;202;gga;101;;gta;600;gca;;gaa;400;gga;100
ttg;102;tcg;111;tag;2.6;tgg;102;;ttg;102;tcg;111;tag;3;tgg;102;;ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100
atgj;107;acg;96;aag;103;agg;99;;atgj;107;acg;96;aag;103;agg;99;;atgj;200;acg;100;aag;200;agg;100
ctg;191;ccg;92;cag;0.7;cgg;107;;ctg;191;ccg;92;cag;0.7;cgg;107;;ctg;400;ccg;200;cag;;cgg;100
gtg;90;gcg;79;gag;0.4;ggg;82;;gtg;90;gcg;79;gag;0.4;ggg;82;;gtg;100;gcg;200;gag;;ggg;100
;;1517;;2099;;1440;5057;;;;2265;;2149;;1440;5854;;;;2100;;4300;;1800;8200
rapports;;67;;98;;100;86;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;beta1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;97;;fiches;54.068;;;fréquences;;;;;atgi;1;tct;100;tat;;atgf;14
att;;act;100;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;2379;;;0/0;1;;;;att;100;act;100;aat;100;agt;100
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;353;;;10;12;;;;ctt;100;cct;;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;44;;;20;4;;;;gtt;100;gct;;gat;;ggt;
ttc;100;tcc;100;tac;79;tgc;100;;;;;;30;4;;;;ttc;46;tcc;50;tac;58;tgc;30
atc;2;acc;78;aac;100;agc;98;;beta1;82;;;40;4;;;;atc;100;acc;21;aac;54;agc;1
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100;;sans;82;;;50;6;30;;;ctc;30;ccc;0;cac;64;cgt;38
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;16;;;60;7;;;;gtc;33;gcc;59;gac;65;ggc;55
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;1;;;70;3;;;;tta;45;tca;1;taa;;tga;100
ata;100;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;12;aaa;60;aga;12
cta;100;cca;100;caa;100;cga;;;L’estimation par beta ;;;;90;1;;;;cta;1;cca;27;caa;39;cga;
gta;100;gca;3;gaa;100;gga;77;;est  52% en dessous;;;;100;6;;;;gta;80;gca;100;gaa;50;gga;22
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;2;tcg;10;tag;;tgg;2
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;47;acg;4;aag;49;agg;1
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;52;ccg;54;cag;100;cgg;7
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;10;gcg;61;gag;100;ggg;18
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;328;;618;;335;1281
&lt;/pre&gt;

====cvi remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_remarques|cvi remarques]]
*code génétique cvi
&lt;pre&gt;
cvi;;;;;98;;99
atgi;1;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;1
atc;8;acc;2;aac;4;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;3;cgt;3
gtc;1;gcc;3;gac;7;ggc;5
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;3;aga;1
cta;1;cca;1;caa;2;cga;
gta;5;gca;8;gaa;4;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1
ctg;4;ccg;2;cag;;cgg;1
gtg;2;gcg;1;gag;;ggg;1
&lt;/pre&gt;

===ade===
====ade opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_opérons|ade opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Anae_deha_2CP_C/anaeDeha_2CP_C-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_011891.1;ade;genome;;;
75%GC;30.6.19 Paris;16s  2;49;doubles;intercalaires
;Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C;;;;
;8147..8220;;caa;;
;;;;;
;21040..21112;;ttc;;
;;;;;
comp;433303..433378;;ggg;;
;;;;;
comp;666509..666585;;gac;;6
comp;666592..666666;;gta;;
;;;;;
comp;693146..693229;;ctg;;
;;;;;
;851483..851555;;atg;;
;;;;;
comp;1057311..1057386;;gcg;;
;;;;;
comp;1306222..1306295;;ccc;;
;;;;;
;1442379..1442450;;tgc;;
;;;;;
;1495545..1497102;;16s;@1;187
;1497290..1497367;;atc;;22
;1497390..1497465;;gca;;194
;1497660..1500648;;23s;;152
;1500801..1500917;;5s;;
;;;;;
;1509186..1509259;;cag;;60
;1509320..1509394;;gag;;
;;;;;
;1691085..1691160;;gcc;;
;;;;;
;819377..1819453;;atg;;
;;;;;
;2235670..2235741;;gtc;;
;;;;;
comp;2314981..2315079;;tga;;
;;;;;
comp;2337031..2337104;;atg;;
;;;;;
;2376009..2376080;;gtg;;
;;;;;
comp;2429718..2429790;;acg;;
;;;;;
comp;2623942..2624017;;tgg;;
;;;;;
comp;2625463..2625535;;acc;;22
comp;2625558..2625633;;gga;;63
comp;2625697..2625779;;tac;;46
comp;2625826..2625898;;aca;;
;;;;;
;2653452..2653535;;ttg;;
;;;;;
;2680790..2680871;;ctc;;
;;;;;
comp;2747806..2747879;;agg;;
;;;;;
;3029047..3029122;;aac;;
;;;;;
comp;3076236..3076352;;5s;;152
comp;3076505..3079493;;23s;;194
comp;3079688..3079763;;gca;;22
comp;3079786..3079863;;atc;;187
comp;3080051..3081608;;16s;;
;;;;;
comp;3144286..3144357;;aaa;;
;;;;;
;3156732..3156804;;gaa;;
;;;;;
;3253990..3254063;;cgg;;
;;;;;
comp;3793996..3794069;;ccg;;
;;;;;
;3806164..3806249;;tta;;
;;;;;
comp;3915708..3915789;;cta;;
;;;;;
comp;3920245..3920317;;aag;@2;*248
comp;3920566..3920639;;aga;;*140
comp;3920780..3920854;;cac;;18
comp;3920873..3920946;;cga;;*134
comp;3921081..3921154;;cca;;
;;;;;
comp;4121675..4121749;;ggc;;
;;;;;
comp;4195371..4195460;;tcc;;*278
comp;4195739..4195829;;tcg;;
;;;;;
;4456675..4456764;;tca;;27
;4456792..4456883;;agc;;73
;4456957..4457033;;cgt;;
&lt;/pre&gt;

====ade cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_cumuls|ade cumuls]]
&lt;pre&gt;
cvi cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;2;1;0;
;16 23 5s 0;0;20;2;
;16 atc gca;2;40;2;2
;16 23 5s a;0;60;2;
;max a;2;80;2;
;a doubles;0;100;0;
;spéciaux;0;120;0;
;total aas;4;140;2;
sans ;opérons;33;160;0;
;1 aa;27;180;0;
;max a;5;200;0;
;a doubles;0;;2;
;total aas;45;;12;2
total aas;;49;;;
remarques;;2;;;
avec jaune;;;moyenne;93;
;;;variance;90;
sans jaune;;;moyenne;39;22
;;;variance;24;0
&lt;/pre&gt;

====ade blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_blocs|ade blocs]]
&lt;pre&gt;
ade blocs;;;;;
16s;187;1558;5s;152;117
atc;22;;23s;194;2989
gca;194;;gca;22;
23s;152;2989;atc;187;
5s;;117;16s;;1558
&lt;/pre&gt;
====ade distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_distribution|ade distribution]]
&lt;pre&gt;
delta1;;;;;;;49;;delta1;;;;;;;27;;delta1;;;;;;;18
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;1;tac;1;tgc;
atc;2;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;1;;tta;1;tca;;taa;;tga;1;;tta;;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;1;aaa;;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1;;cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;1;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;1;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;18;27;;;;4;49;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====ade données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_données_intercalaires|ade données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;ade;fx;fc;ade;fx40;fc40;ade;x-;c-;c;x;c;x;aa
0;0;0;12;17;0;12;17;-1;0;70;91;220;CDS 16s;;
0;2;10;102;373;1;10;35;-2;3;0;44;157;691;;
0;2;20;105;250;2;5;63;-3;0;0;158;333;590;;
0;0;30;65;128;3;18;55;-4;33;537;119;68;23s 5s;;
2;2;40;33;124;4;14;25;-5;0;0;79;105;2* 152;;
0;2;50;21;94;5;7;19;-6;2;0;456;130;5s CDS;;
0;3;60;52;104;6;10;24;-7;1;6;157;96;167;75;
2;2;70;49;129;7;9;26;-8;5;20;53;38;16s tRNA;;
0;4;80;59;106;8;8;37;-9;0;0;36;222;2* 187;;atc
0;1;90;49;98;9;14;51;-10;1;2;350;190;tRNA 23s;;
2;4;100;43;84;10;7;38;-11;4;17;105;111;2* 194;;gca
2;4;110;49;75;11;4;32;-12;1;0;14;124;tRNA tRNA;;intra
1;3;120;44;84;12;13;41;-13;3;7;111;110;2* 22;;atc gca
3;1;130;49;67;13;10;39;-14;4;12;3;94;tRNA tRNA;;
0;0;140;47;62;14;7;28;-15;1;0;9;161;6;;gac
0;0;150;37;53;15;14;26;-16;1;3;110;193;**;;gta
1;2;160;30;37;16;13;23;-17;7;4;53;226;60;;cag
1;0;170;28;47;17;7;16;-18;0;0;38;127;**;;gag
0;1;180;33;41;18;16;19;-19;0;2;77;63;22;;acc
1;1;190;31;50;19;15;14;-20;1;3;92;34;63;;gga
1;0;200;34;21;20;6;12;-21;0;0;406;246;46;;tac
0;0;210;30;27;21;7;12;-22;0;2;53;715;**;;aca
1;0;220;28;20;22;8;17;-23;2;6;437;;248;;aag
2;1;230;27;18;23;11;13;-24;0;0;62;;142;;aga
0;0;240;17;17;24;10;8;-25;1;0;15;;18;;cac
1;0;250;27;12;25;4;14;-26;1;5;65;;134;;cga
0;0;260;28;19;26;8;14;-27;0;0;105;;**;;cca
0;0;270;15;15;27;7;9;-28;1;0;100;;278;;tcc
0;0;280;17;10;28;7;20;-29;2;2;91;;**;;tcg
0;0;290;11;9;29;2;7;-30;0;0;106;;27;;tca
0;0;300;11;9;30;1;14;-31;0;0;184;;73;;agc
0;1;310;10;11;31;2;13;-32;2;1;230;;**;;cgt
0;0;320;8;10;32;1;14;-33;0;0;306;;;;
0;0;330;10;5;33;7;15;-34;2;2;78;;;;
1;0;340;3;8;34;7;19;-35;1;1;694;;;;
0;1;350;6;3;35;2;11;-36;0;0;130;;;;
0;0;360;10;7;36;4;9;-37;1;1;386;;;;
0;0;370;5;1;37;2;15;-38;1;0;111;;;;
0;0;380;5;4;38;1;8;-39;0;0;81;;;;
0;1;390;2;3;39;2;6;-40;1;0;179;;;;
0;0;400;3;3;40;5;14;-41;2;0;76;;;;
1;5;reste;69;80;reste;997;1443;-42;0;0;50;;;;
22;43;total;1314;2335;total;1314;2335;-43;0;0;492;;;;
21;38;diagr;1233;2238;diagr;305;875;-44;0;0;;;;;
0;4; t30;272;751;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;2;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;1;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;1302;103;12;1417;;;-49;1;0;;;;;
;c;2318;712;17;3047;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;4464;105;;reste;15;9;;;;;
;;;;;;4569;;total;103;712;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ade autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_autres_intercalaires_aas|ade autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ade;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;7060;8055;91;*;
;;tRNA;8147;8220;44;*;caa
fin;;CDS;8265;8786;;;
deb;;CDS;20441;20881;158;*;
;;tRNA;21040;21112;220;*;ttc
fin;comp;CDS;21333;22034;;;
deb;comp;CDS;432722;433183;119;*;
;comp;tRNA;433303;433378;79;*;ggg
fin;comp;CDS;433458;435416;;0;
deb;comp;CDS;664814;666052;456;*;
;comp;tRNA;666509;666585;6;*;gac
;comp;tRNA;666592;666666;157;*;gta
fin;;CDS;666824;669520;;0;
deb;comp;CDS;691951;692988;157;*;
;comp;tRNA;693146;693229;333;*;ctg
fin;;CDS;693563;694450;;0;
deb;;CDS;849021;851429;53;*;
;;tRNA;851483;851555;36;*;atgi
fin;;CDS;851592;852335;;;
deb;;CDS;883315;883644;64;*;
;;rpr;883709;886604;98;*;
fin;comp;CDS;886703;887395;;;
deb;comp;CDS;887392;888668;77;*;
;;rpr;888746;892491;95;*;
fin;;CDS;892587;893286;;;
deb;;CDS;1055941;1057242;68;*;
;comp;tRNA;1057311;1057386;105;*;gcg
fin;;CDS;1057492;1059753;;;
deb;comp;CDS;1305647;1305871;350;*;
;comp;tRNA;1306222;1306295;105;*;ccc
fin;comp;CDS;1306401;1306958;;;
deb;comp;CDS;1311419;1312015;33;*;
;comp;ncRNA;1312049;1312239;302;*;
fin;;CDS;1312542;1313453;;0;
deb;;CDS;1441648;1442364;14;*;
;;tRNA;1442379;1442450;111;*;tgc
fin;;CDS;1442562;1443500;;0;
deb;;CDS;1492304;1494853;691;*;
;;rRNA;1495545;1497102;187;*;16s
;;tRNA;1497290;1497367;22;*;atc
;;tRNA;1497390;1497465;194;*;gca
;;rRNA;1497660;1500648;152;*;23s
;;rRNA;1500801;1500917;75;*;5s
fin;comp;CDS;1500993;1501436;;0;
deb;;CDS;1508769;1509182;3;*;
;;tRNA;1509186;1509259;60;*;cag
;;tRNA;1509320;1509394;130;*;gag
fin;comp;CDS;1509525;1511858;;;
deb;;CDS;1690794;1691075;9;*;
;;tRNA;1691085;1691157;96;*;gcc
fin;comp;CDS;1691254;1691583;;0;
deb;;CDS;1818424;1819266;110;*;
;;tRNA;1819377;1819453;53;*;atgf
fin;;CDS;1819507;1820262;;;
deb;;CDS;1968293;1969147;141;*;
;;regulatory;1969289;1969371;108;*;
fin;;CDS;1969480;1970796;;;
deb;;CDS;2235017;2235631;38;*;
;;tRNA;2235670;2235741;77;*;gtc
fin;;CDS;2235819;2237771;;;
deb;;CDS;2313926;2314942;38;*;
;comp;tRNA;2314981;2315079;92;*;tga
fin;comp;CDS;2315172;2317013;;;
deb;comp;CDS;2335260;2336624;406;*;
;comp;tRNA;2337031;2337104;222;*;atgj
fin;;CDS;2337327;2339093;;;
deb;;CDS;2375620;2375955;53;*;
;;tRNA;2376009;2376080;437;*;gtg
fin;;CDS;2376518;2377108;;;
deb;;CDS;2429105;2429527;190;*;
;comp;tRNA;2429718;2429790;111;*;acg
fin;;CDS;2429902;2430240;;0;
deb;comp;CDS;2623487;2623879;62;*;
;comp;tRNA;2623942;2624017;15;*;tgg
fin;comp;CDS;2624033;2624191;;;
deb;comp;CDS;2624207;2625397;65;*;
;comp;tRNA;2625463;2625535;22;*;acc
;comp;tRNA;2625558;2625633;63;*;gga
;comp;tRNA;2625697;2625779;46;*;tac
;comp;tRNA;2625826;2625898;105;*;aca
fin;comp;CDS;2626004;2626774;;;
deb;comp;CDS;2652965;2653327;124;*;
;;tRNA;2653452;2653535;100;*;ttg
fin;;CDS;2653636;2654361;;0;
deb;;CDS;2680375;2680698;91;*;
;;tRNA;2680790;2680871;110;*;ctc
fin;comp;CDS;2680982;2681350;;;
deb;;CDS;2747439;2747711;94;*;
;comp;tRNA;2747806;2747879;106;*;agg
fin;comp;CDS;2747986;2748264;;0;
deb;comp;CDS;3027884;3028885;161;*;
;;tRNA;3029047;3029122;184;*;aac
fin;;CDS;3029307;3029750;;;
deb;comp;CDS;3075187;3076068;167;*;
;comp;rRNA;3076236;3076352;152;*;5s
;comp;rRNA;3076505;3079493;194;*;23s
;comp;tRNA;3079688;3079763;22;*;gca
;comp;tRNA;3079786;3079863;187;*;atc
;comp;rRNA;3080051;3081608;590;*;16s
fin;comp;CDS;3082199;3082876;;;
deb;comp;CDS;3143759;3144055;230;*;
;comp;tRNA;3144286;3144357;306;*;aaa
fin;comp;CDS;3144664;3145676;;;
deb;;CDS;3155946;3156653;78;*;
;;tRNA;3156732;3156804;694;*;gaa
fin;;CDS;3157499;3158125;;;
deb;comp;CDS;3253083;3253796;193;*;
;;tRNA;3253990;3254063;130;*;cgg
fin;;CDS;3254194;3254382;;;
deb;;CDS;3372825;3372986;107;*;
;;tmRNA;3373094;3373444;219;*;
fin;;CDS;3373664;3374548;;;
deb;;CDS;3793550;3793769;226;*;
;comp;tRNA;3793996;3794069;386;*;ccg
fin;comp;CDS;3794456;3795775;;;
deb;;CDS;3805030;3806052;111;*;
;;tRNA;3806164;3806249;127;*;tta
fin;comp;CDS;3806377;3806679;;0;
deb;comp;CDS;3914337;3915626;81;*;
;comp;tRNA;3915708;3915789;63;*;cta
fin;;CDS;3915853;3916260;;1;
deb;comp;CDS;3919322;3920065;179;*;
;comp;tRNA;3920245;3920317;248;*;aag
;comp;tRNA;3920566;3920639;142;*;aga
;comp;tRNA;3920782;3920854;18;*;cac
;comp;tRNA;3920873;3920946;134;*;cga
;comp;tRNA;3921081;3921154;76;*;cca
fin;comp;CDS;3921231;3921950;;;
deb;;CDS;4031625;4031963;149;*;
;;regulatory;4032113;4032269;67;*;
fin;;CDS;4032337;4034331;;;
deb;;CDS;4120462;4121640;34;*;
;comp;tRNA;4121675;4121749;246;*;ggc
fin;;CDS;4121996;4123084;;0;
deb;;CDS;4164508;4166256;430;*;
;comp;ncRNA;4166687;4167096;43;*;
fin;comp;CDS;4167140;4167832;;0;
deb;comp;CDS;4193348;4195153;55;*;
;comp;ncRNA;4195209;4195302;68;*;
;comp;tRNA;4195371;4195460;278;*;tcc
;comp;tRNA;4195739;4195829;50;*;tcg
fin;comp;CDS;4195880;4196344;;0;
deb;comp;CDS;4454313;4455959;715;*;
;;tRNA;4456675;4456764;27;*;tca
;;tRNA;4456792;4456883;73;*;agc
;;tRNA;4456957;4457033;492;*;cgt
fin;;CDS;4457526;4459313;;;
&lt;/pre&gt;

====ade intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_entre_cds|ade intercalaires entre cds]]
*'''Intercalaires entre cds, Tableau'''
&lt;pre&gt;
ade;4.2.21 Paris;;ade 16.7.20;;;;;;;;;
ade;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;'''frequence5;intercal;&lt;u&gt;'''frequencez
;'''négatif;815;18.3;'''négatif ;-8;15;-1 à -116;'''5 029 329;-1;815;610;5
;'''zéro;29;0.6;;;;;'''intercals;0;29;620;3
;'''1 à 200;2987;66.9;'''0 à 200;70;57;;'''42 8947;5;251;630;2
;'''201 à 370;464;10.4;'''201 à 370;260;44;;'''8.5%;10;224;640;0
;'''371 à 600;124;2.8;'''371 à 600;469;63;;;15;214;650;3
;'''601 à max;45;1.0;'''601 à 1160;771;157;;;20;141;660;1
;'''total 4464;&lt;201;85.8;'''total 4461;93;127;-116 à 1160;;25;104;670;0
adresse;intercal;intercal;&lt;u&gt;'''frequence1;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence6;cumul, %;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence-1;30;89;680;1
4491815;1915;-1;815;-70;14;;0;29;35;91;690;1
3576176;1774;0;29;-60;8;;-1;°70;40;66;700;1
4068576;1388;1;45;-50;2;;-2;3;45;58;710;1
3337295;1160;2;68;-40;7;;-3;0;50;57;720;2
3373664;1119;3;°73;-30;12;'''min à -1;-4;°570;55;74;730;1
2044486;1080;4;39;-20;26;815;-5;0;60;82;740;2
4163005;1080;5;26;-10;69;18.3%;-6;2;65;92;750;2
1981544;1014;6;°34;0;706;;-7;7;70;86;760;0
427780;984;7;35;10;475;;-8;°25;75;87;770;0
540538;963;8;45;20;355;;-9;0;80;78;780;0
1223737;917;9;°65;30;193;;-10;3;85;70;790;1
1005799;900;10;45;40;157;'''1 à 100;-11;°21;90;77;800;1
4943119;860;11;36;50;115;2068;-12;1;95;66;810;1
4581242;849;12;°54;60;156;46.3%;-13;10;100;61;820;1
104609;834;13;49;70;178;;-14;°16;105;69;830;1
4846209;821;14;35;80;165;;-15;1;110;55;840;1
1084460;817;15;°40;90;147;;-16;4;115;65;850;1
2814006;807;16;36;100;127;;-17;°11;120;63;860;1
2386981;793;17;23;110;124;;-18;0;125;60;870;0
3422997;788;18;°35;120;128;;-19;2;130;56;880;0
494107;749;19;29;130;116;;-20;°4;135;64;890;0
3820597;741;20;18;140;109;;-21;0;140;45;900;1
4073584;732;21;19;150;90;;-22;2;145;50;910;0
1445527;731;22;°25;160;67;;-23;°8;150;40;920;1
3757399;730;23;24;170;75;'''1 à 200;-24;0;155;36;930;0
4117240;719;24;18;180;74;2987;-25;1;160;31;940;0
3533685;715;25;18;190;81;67%;-26;°6;165;34;950;0
3631148;704;26;°22;200;55;;-27;0;170;41;960;0
2060112;697;27;16;210;57;;-28;1;175;36;970;1
1026522;689;28;°27;220;48;;-29;°4;180;38;980;0
4180297;676;29;9;230;45;;-30;0;185;40;990;1
3200409;660;30;15;240;34;;-31;0;190;41;1000;0
1266186;649;31;15;250;39;;-32;°3;195;29;1010;0
4553826;643;32;15;260;47;;total;66;200;26;1020;1
4101937;641;33;22;270;30;'''0 à 200;reste;40;205;27;1030;0
;;34;°26;280;27;3016;;844;210;30;1040;0
;;35;13;290;20;;;;215;26;1050;0
;;36;13;300;20;;intercal;&lt;u&gt;'''frequencef;220;22;1060;0
;;37;17;310;21;;600;4419;225;28;1070;0
;;38;9;320;18;;620;8;230;17;1080;2
;;39;8;330;15;;640;2;235;13;1090;0
;;40;°19;340;11;'''201 à 370;660;4;240;21;1100;0
;;reste;2440;350;9;464;680;1;245;18;1110;0
;;total;4464;360;17;10.4%;700;2;250;21;1120;1
;;;;370;6;;720;3;255;23;1130;0
adresse;intercaln;décalage;long;380;9;;740;3;260;24;1140;0
3295433;-116;comp;;390;5;;760;2;265;17;1150;0
4579158;-110;comp;;400;6;;780;;270;13;1160;1
1556750;-109;shift2;738;410;10;;800;2;275;16;1170;0
4555636;-109;comp;;420;4;;820;2;280;11;1180;0
4916430;-107;comp;;430;2;;840;2;285;13;1190;0
3210093;-106;shift2;1146;440;11;;860;2;290;7;1200;0
3997874;-104;comp;;450;5;;880;;295;10;reste;3
2946107;-101;comp;;460;8;;900;1;300;10;total;4464
3213081;-100;shift2;279;470;8;;920;1;305;10;;
1033174;-98;comp;;480;6;;940;;310;11;;
4178347;-86;comp;;490;4;;960;;315;13;;
1150010;-82;comp;;500;4;;980;1;320;5;;
526736;-79;comp;;510;8;;1000;1;325;9;;
1558055;-74;comp;;520;4;;1020;1;330;6;;
178866;-68;shift2;797;530;4;;1040;;335;6;;
4625265;-68;shift2;869;540;7;'''371 à 600;1060;;340;5;;
1268795;-67;;;550;3;124;1080;2;345;6;;
1590849;-67;;;560;6;2.8%;1100;;350;3;;
1222168;-65;;;570;3;;1120;1;355;11;;
3832496;-65;;;580;1;'''601 à max;1140;;360;6;;
23880;-61;;;590;3;45;1160;1;365;5;;
157893;-61;;;600;3;1.0%;;42;370;1;;
4881610;-59;;;reste;45;;reste;3;;169;;
3182922;-55;;;total;4464;;total;4464;;4464;;
&lt;/pre&gt;

====ade  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_positifs_S+|ade intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
ade;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-20;145;-446;69;782;242;min50;&amp;-61;489;-1310;125;843;267;min50
31 à 400;32;-228;356;20;874;238;2 parties;&amp;2.5;38;-356;69;957;-507;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;144;54;-;743;dte;39;Sf;&amp;218;70;-;610;poly;232;SF
31 à 400;112;46;-;807;poly;67;tm;&amp;149;51;-;854;poly;103;tF
;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ade. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
pmg;min40;559;895;1454;856;728;802;74;904;915;928;;;
ade;min50;1229;2242;3471;867;624;758;134;879;897;903;;;
ase;min40;2398;3558;5956;959;922;940;18;646;725;814;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
326;430;0.76;692;1108;16;31;137;143;196;449;703;;;
221;335;0.66;1412;3052;8;6;72;234;304;876;459;;;
135;264;0.51;3031;5166;7;3;116;252;389;1165;346;;;
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50, '''t30 t50'''.
*Corrélations, diagrammes 1-40, les intercalaires négatifs, totaux.
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;14.8.21 Paris;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;0.459;;;ade;Sx-;Sc-
41-n;0.867;0.624;0.758;;;;;;;;;;-1;0;70
1-n;0.903;0.879;0.897;;;;;;;;;;-2;3;0
ade;fx;fc;;ade;fx%;fc%;;;fx40;fc40;;x;-3;0;0
0;12;17;;0;10;8;;0;12;17;&gt;0;1298;-4;33;537
10;102;373;;10;83;166;;1;10;35;&lt;0;102;-5;0;0
20;104;251;;20;85;112;;2;5;63;zéro;12;-6;2;0
30;65;128;;30;53;57;;3;18;55;total;1412;-7;1;6
40;33;124;;40;27;55;;4;14;25;;c;-8;5;20
50;22;93;;50;18;41;;5;7;19;&gt;0;2322;-9;0;0
60;52;104;;60;42;46;;6;10;24;&lt;0;713;-10;1;2
70;49;129;;70;40;58;;7;9;26;zéro;17;-11;4;17
80;59;106;;80;48;47;;8;8;37;total;3052;-12;1;0
90;48;99;;90;39;44;;9;14;51;;;-13;3;7
100;43;84;;100;35;37;;10;7;38;;;-14;4;12
110;48;76;;110;39;34;;11;4;32;;;-15;1;0
120;44;84;;120;36;37;;12;12;42;;;-16;1;3
130;49;67;;130;40;30;;13;10;39;;;-17;7;4
140;46;63;;140;37;28;;14;7;28;;;-18;0;0
150;37;53;;150;30;24;;15;14;26;;;-19;0;2
160;30;37;;160;24;17;;16;13;23;;;-20;1;3
170;28;47;;170;23;21;;17;7;16;;;-21;0;0
180;33;41;;180;27;18;;18;16;19;;;-22;0;2
190;31;50;;190;25;22;;19;15;14;;;-23;2;6
200;33;22;;200;27;10;;20;6;12;;;-24;0;0
210;30;27;;210;24;12;;21;7;12;;;-25;1;0
220;28;20;;220;23;9;;22;8;17;;;-26;0;6
230;27;18;;230;22;8;;23;11;13;;;-27;0;0
240;17;17;;240;14;8;;24;10;8;;;-28;1;0
250;27;12;;250;22;5;;25;4;14;;;-29;2;2
260;28;19;;260;23;8;;26;8;14;;;-30;0;0
270;15;15;;270;12;7;;27;7;9;;;-31;0;0
280;17;10;;280;14;4;;28;7;20;;;-32;2;1
290;11;9;;290;9;4;;29;2;7;;;-33;0;0
300;11;9;;300;9;4;;30;1;14;;;-34;2;2
310;10;11;;310;8;5;;31;2;13;;;-35;1;1
320;8;10;;320;7;4;;32;1;14;;;-36;0;0
330;10;5;;330;8;2;;33;7;15;;;-37;1;1
340;3;8;;340;2;4;;34;7;19;;;-38;1;0
350;6;3;;350;5;1;;35;2;11;;;-39;0;0
360;10;7;;360;8;3;;36;4;9;;;-40;1;0
370;5;1;;370;4;0;;37;2;15;;;-41;2;0
380;5;4;;380;4;2;;38;1;8;;;-42;0;0
390;2;3;;390;2;1;;39;2;6;;;-43;0;0
400;3;3;;400;2;1;;40;5;14;;;-44;0;0
reste;69;80;;;;;;;994;1446;;;-45;0;0
total;1310;2339;;t30;221;335;;;1310;2339;;;-46;2;0
diagr;1229;2242;;t50;265;432;;;304;876;;;-47;1;0
 - t30;958;1490;;;;;;;;;;;-48;0;0
 - t50;903;1273;;;;;;;;;;;-49;1;0
;;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;;reste;15;9
;;;;;;;;;;;;;total;102;713
&lt;/pre&gt;

====ade  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_négatifs_S-|ade intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
ade;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;;;
comp’;0;3;0;30;0;2;1;4;0;1;4;1;3;4;1;1;7;0;0;1;0;0;2;0;1;0;0;1;2;0;0;2;0;2;1;0;1;1;0;1;2;0;0;0;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;8;97;14
continu;70;0;0;540;0;0;6;21;0;2;17;0;7;12;0;3;4;0;2;3;0;2;6;0;0;6;0;0;2;0;0;1;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;718;10
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;ade;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;3;0;33;0;2;1;5;0;1;4;1;3;4;1;1;7;0;0;1;0;0;2;0;1;0;0;1;2;0;0;2;0;2;1;0;1;1;0;1;2;0;0;0;0;2;1;0;1;0;15;102
;Sc-;70;0;0;537;0;0;6;20;0;2;17;0;7;12;0;3;4;0;2;3;0;2;6;0;0;6;0;0;2;0;0;1;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;713
&lt;/pre&gt;

====ade autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_autres_intercalaires|ade autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
deb;°CDS;7060;91;;;deb;°CDS;1818424;110;;;deb;°CDS;3143759;230;comp
;&amp;tRNA;8147;44;;;;&amp;tRNA;1819377;53;;;;&amp;tRNA;3144286;306;comp
fin;°CDS;8265;;;;fin;°CDS;1819507;;;;fin;°CDS;3144664;;comp
deb;°CDS;20441;158;;;deb;°CDS;1968293;141;;;deb;°CDS;3155946;78;
;&amp;tRNA;21040;220;;;;regulatory;1969289;108;;;;&amp;tRNA;3156732;694;
fin;°CDS;21333;;comp;;fin;°CDS;1969480;;;;fin;°CDS;3157499;;
deb;°CDS;432722;119;comp;;deb;°CDS;2235017;38;;;deb;°CDS;3253083;193;comp
;&amp;tRNA;433303;79;comp;;;&amp;tRNA;2235670;77;;;;&amp;tRNA;3253990;130;
fin;°CDS;433458;;comp;;fin;°CDS;2235819;;;;fin;°CDS;3254194;;
deb;°CDS;664814;456;comp;;deb;°CDS;2313926;38;;;deb;°CDS;3372825;107;
;&amp;tRNA;666509;6;comp;;;&amp;tRNA;2314981;92;comp;;;tmRNA;3373094;219;
;&amp;tRNA;666592;157;comp;;fin;°CDS;2315172;;comp;;fin;°CDS;3373664;;
fin;°CDS;666824;;;;deb;°CDS;2335260;406;comp;;deb;°CDS;3793550;226;
deb;°CDS;691951;157;comp;;;&amp;tRNA;2337031;222;comp;;;&amp;tRNA;3793996;386;comp
;&amp;tRNA;693146;333;comp;;fin;°CDS;2337327;;;;fin;°CDS;3794456;;comp
fin;°CDS;693563;;;;deb;°CDS;2375620;53;;;deb;°CDS;3805030;111;
deb;°CDS;849021;53;;;;&amp;tRNA;2376009;437;;;;&amp;tRNA;3806164;127;
;&amp;tRNA;851483;36;;;fin;°CDS;2376518;;;;fin;°CDS;3806377;;comp
fin;°CDS;851592;;;;deb;°CDS;2429105;190;;;deb;°CDS;3914337;81;comp
deb;°CDS;883315;64;;;;&amp;tRNA;2429718;111;comp;;;&amp;tRNA;3915708;63;comp
;repeat_region;883709;98;;;fin;°CDS;2429902;;;;fin;°CDS;3915853;;
fin;°CDS;886703;;comp;;deb;°CDS;2623487;62;comp;;deb;°CDS;3919322;179;comp
deb;°CDS;887392;77;comp;;;&amp;tRNA;2623942;15;comp;;;&amp;tRNA;3920245;248;comp
;repeat_region;888746;95;;;fin;°CDS;2624033;;comp;;;&amp;tRNA;3920566;142;comp
fin;°CDS;892587;;;;deb;°CDS;2624207;65;comp;;;&amp;tRNA;3920782;18;comp
deb;°CDS;1055941;68;;;;&amp;tRNA;2625463;22;comp;;;&amp;tRNA;3920873;134;comp
;&amp;tRNA;1057311;105;comp;;;&amp;tRNA;2625558;63;comp;;;&amp;tRNA;3921081;76;comp
fin;°CDS;1057492;;;;;&amp;tRNA;2625697;46;comp;;fin;°CDS;3921231;;comp
deb;°CDS;1305647;350;comp;;;&amp;tRNA;2625826;105;comp;;deb;°CDS;4031625;149;
;&amp;tRNA;1306222;105;comp;;fin;°CDS;2626004;;comp;;;regulatory;4032113;67;
fin;°CDS;1306401;;comp;;deb;°CDS;2652965;124;comp;;fin;°CDS;4032337;;
deb;°CDS;1311419;33;comp;;;&amp;tRNA;2653452;100;;;deb;°CDS;4120462;34;
;ncRNA;1312049;302;comp;;fin;°CDS;2653636;;;;;&amp;tRNA;4121675;246;comp
fin;°CDS;1312542;;;;deb;°CDS;2680375;91;;;fin;°CDS;4121996;;
deb;°CDS;1441648;14;;;;&amp;tRNA;2680790;110;;;deb;°CDS;4164508;430;
;&amp;tRNA;1442379;111;;;fin;°CDS;2680982;;comp;;;ncRNA;4166687;43;comp
fin;°CDS;1442562;;;;deb;°CDS;2747439;94;;;fin;°CDS;4167140;;comp
deb;°CDS;1492304;691;;;;&amp;tRNA;2747806;106;comp;;deb;°CDS;4193348;55;comp
;$rRNA;1495545;187;;;fin;°CDS;2747986;;comp;;;ncRNA;4195209;68;comp
;&amp;tRNA;1497290;22;;;deb;°CDS;3027884;161;comp;;;&amp;tRNA;4195371;278;comp
;&amp;tRNA;1497390;194;;;;&amp;tRNA;3029047;184;;;;&amp;tRNA;4195739;50;comp
;$rRNA;1497660;152;;;fin;°CDS;3029307;;;;fin;°CDS;4195880;;comp
;$rRNA;1500801;75;;;deb;°CDS;3075187;167;comp;;deb;°CDS;4454313;715;comp
fin;°CDS;1500993;;comp;;;$rRNA;3076236;152;comp;;;&amp;tRNA;4456675;27;
deb;°CDS;1508769;3;;;;$rRNA;3076505;194;comp;;;&amp;tRNA;4456792;73;
;&amp;tRNA;1509186;60;;;;&amp;tRNA;3079688;22;comp;;;&amp;tRNA;4456957;492;
;&amp;tRNA;1509320;130;;;;&amp;tRNA;3079786;187;comp;;fin;°CDS;4457526;;
fin;°CDS;1509525;;comp;;;$rRNA;3080051;590;comp;;;;;;
deb;°CDS;1690794;9;;;fin;°CDS;3082199;;comp;;;;;;
;&amp;tRNA;1691085;96;;;;;;;;;;;;;
fin;°CDS;1691254;;comp;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====ade intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_tRNA|ade intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
ade intercalaires tRNA;;;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;;;91;;44;;3;15;deb;
;;;158;comp’;220;;9;36;&lt;201;20
;;;119;;79;;14;43;total;25
;6;;456;comp’;156;;38;44;taux;80%
;;;157;comp’;353;;38;50;;
;;;53;;36;;53;53;fin;
;;comp’;68;comp’;105;;53;76;&lt;201;16
;;;350;;105;;62;77;total;22
;;;14;;111;;65;79;taux;73%
;60;;3;comp’;130;;78;100;;
;;;9;comp’;96;;81;105;total;
;;;110;;53;;91;105;&lt;201;36
;;;38;;77;;91;106;total;47
;;;38;comp’;92;;107;111;taux;77%
;;;406;comp’;222;;110;130;;
;;;53;;437;;111;184;;
;;comp’;190;comp’;111;;119;219;;
;;;62;;15;;157;306;;
;22 63 46;;65;;105;;158;386;;
;;comp’;124;;100;;179;437;;
;;;91;comp’;110;;230;492;;
;;comp’;94;;106;;350;694;;
;;comp’;161;;184;;406;-;;
;;;230;;306;;430;-;;
;;;78;;694;;456;-;comp’;cumuls
;;comp’;193;;130;;34;63;deb;
;;;107;;219;;68;92;&lt;201;7
;;comp’;226;;386;;94;96;total;9
;;;111;comp’;127;;124;105;taux;78%
;;;81;comp’;63;;161;110;fin;
;248 142 18 134;;179;;76;;190;111;&lt;201;9
;;comp’;34;comp’;246;;193;127;total;13
;;;430;;43;;226;130;taux;69%
;278;;;;50;;715;156;;
;27 73;comp’;715;;492;;-;220;total;
;;;;;;;-;222;&lt;201;16
;;;;;;;-;246;total;22
;;;;;;;-;353;taux;73%
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;;;
&lt;201;29;25;54;;;;;;;
total;34;35;69;;;;;;;
taux;85%;71%;78%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====ade par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_par_rapport_au_groupe_de_référence|ade par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;ade;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;12;5;;;;;17;
16;moyen;9;6;;;;4;19;
14;fort;6;7;;;;;13;
; ;27;18;;;;4;49;
10;g+cga;5;5;;;;;10;
2;agg+cgg;2;;;;;;2;
4;carre ccc;4;;;;;;4;
5;autres;1;;;;;;1;
;;12;5;;;;;17;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;245;102;;;;;347;26
16;moyen;184;122;;;;82;388;324
14;fort;122;143;;;;;265;650
; ;551;367;;;;82;49;729
10;g+cgg;102;102;;;;;204;10
2;agg+cga;41;;;;;;41;
4;carre ccc;82;;;;;;82;16
5;autres;20;;;;;;20;
;;245;102;;;;;347;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;ade;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;267;111;;378;26;44;28;
16;moyen;200;133;;333;324;33;33;
14;fort;133;156;;289;650;22;39;
; ;600;400;;45;729;27;18;
10;g+cgg;111;111;;222;10;42;;
2;agg+cga;44;;;44;;17;;
4;carre ccc;89;;;89;16;33;;
5;autres;22;;;22;;8;;
;;267;111;;378;;12;;
&lt;/pre&gt;
====delta, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#delta,_estimation_des_-rRNAs|delta, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
delta;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
19 génomes total avec rRNA;;;;delta;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;delta;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;19;90; ; ;;indices;;;;19;474;0;0;;delta1;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;à faire;45
atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;45;acc;;aac;;agc;;;atc;237;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;1
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;;gca;44;gaa;;gga;;;gta;;gca;232;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;14;;14;;17;45
11.1.21 Paris;;;;delta;total;ttt;tgt;;11.1.21 Paris;;;;delta;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;65;3550;1.4;0;;indices;;;;65;3550;1.4;0;;delta1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;4500
atgi;97;tct;;tat;;atgf;144;;atgi;97;tct;;tat;;atgf;149;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;100
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1.5;cct;;cat;;cgc;9.0;;ctt;1.5;cct;;cat;;cgc;9.0;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;122;tcc;109;tac;118;tgc;108;;ttc;122;tcc;109;tac;118;tgc;108;;ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100
atc;6;acc;118;aac;122;agc;105;;atc;243;acc;118;aac;122;agc;105;;atc;;acc;100;aac;100;agc;100
ctc;129;ccc;106;cac;111;cgt;134;;ctc;129;ccc;106;cac;111;cgt;134;;ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100
gtc;100;gcc;131;gac;165;ggc;175;;gtc;100;gcc;131;gac;165;ggc;175;;gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100
tta;108;tca;108;taa;;tga;86;;tta;108;tca;108;taa;3.1;tga;86;;tta;100;tca;100;taa;;tga;100
ata;0.0;aca;102;aaa;118;aga;106;;ata;;aca;102;aaa;118;aga;106;;ata;;aca;100;aaa;100;aga;100
cta;108;cca;105;caa;111;cga;65;;cta;108;cca;105;caa;111;cga;65;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;100
gta;115;gca;2;gaa;180;gga;105;;gta;115;gca;234;gaa;180;gga;105;;gta;100;gca;;gaa;100;gga;100
ttg;126;tcg;106;tag;1.5;tgg;111;;ttg;126;tcg;106;tag;1.5;tgg;111;;ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100
atgj;112;acg;98;aag;85;agg;100;;atgj;112;acg;98;aag;85;agg;100;;atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100
ctg;122;ccg;98;cag;88;cgg;92;;ctg;122;ccg;98;cag;88;cgg;92;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100
gtg;83;gcg;78;gag;40;ggg;94;;gtg;83;gcg;78;gag;40;ggg;94;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100
;;1558;;1816;;1581;4954;;;;2026;;1821;;1581;5428;;;;1400;;1400;;1700;4500
rapports;;77;;100;;100;91;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;delta1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;96;;fiches;57.737;;;fréquences;;;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;30
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;1097;;;0/0;1;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;89;;;10;22;;;;ctt;100;cct;;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;19;;;20;12;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;5;;;;ttc;18;tcc;8;tac;15;tgc;7
atc;3;acc;100;aac;100;agc;100;;delta1;45;;;40;3;;;;atc;100;acc;15;aac;18;agc;5
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100;;sans;45;;;50;2;;;;ctc;22;ccc;6;cac;10;cgt;25
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;4;;;60;1;;;;gtc;0;gcc;24;gac;39;ggc;43
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;1;;;70;0;;;;tta;7;tca;7;taa;;tga;14
ata;;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;;aca;2;aaa;15;aga;6
cta;100;cca;100;caa;100;cga;100;;L’estimation par delta;;;;90;0;;;;cta;7;cca;5;caa;10;cga;35
gta;100;gca;1;gaa;100;gga;100;;est  22% en dessous;;;;100;3;;;;gta;13;gca;100;gaa;44;gga;5
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;21;tcg;6;tag;;tgg;10
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;49;;;;atgj;11;acg;2;aag;15;agg;0
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;18;ccg;2;cag;12;cgg;8
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;17;gcg;22;gag;60;ggg;6
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;136;;284;;250;670
&lt;/pre&gt;

====ade remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_remarques|ade remarques]]
*code génétique ade
&lt;pre&gt;
ade;;;;;;;49
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;2;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;1
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
&lt;/pre&gt;

==epsilon==
===Arcobacter nitrofigilis DSM 7299===
====ant opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_opérons|ant opérons]]
*notes: * devant un nombre pour les jaunes et dans une cellule pour limiter la protéine dans calc.
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Arco_nitr_DSM_7299/arcoNitr_DSM7299-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_014166.1;ant;génome;;;;;;;;;;
28.4%GC;12.1.21 Paris;16s 4;55;;;;;;;cds dirigé;;
Arcobacter nitrofigilis DSM 7299;;;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéine;
;167574..168434;;cds;;66;66;;;287;66;4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase;*
;168501..168577;;cga;@1;447;*447;;;;;;
;169025..169261;;cds;;;;;;79;;DNA-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;
;237275..237622;;cds;;305;305;;;116;*305;nucleotide pyrophosphohydrolase;*
;237928..239444;;16s;;111;;;111;;;;
;239556..239632;;atc;;19;;19;;;;;
;239652..239727;;gca;;301;;;301;;;;
;240029..242945;;23s;;202;;;;;;;
;243148..243263;;5s;;354;354;;;;;;
comp;243618..244301;;cds;;;;;;228;;bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP diphosphatase HisIE;*
;;;;;;;;;;;;
comp;302333..303160;;cds;;155;155;;;276;;AraC family transcriptional regulator;*
;303316..303393;;cca;;10;;10;;;;;
;303404..303480;;cac;;16;;16;;;;;
;303497..303573;;aga;;61;;61;;;;;
;303635..303719;;cta;;96;;96;;;;;
;303816..303892;;atgf;;70;70;;;;70;;
;303963..304103;;cds;;;;;;47;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;316375..317343;;cds;;110;110;;;323;;glycine betaine/L-proline ABC transporter substrate-binding protein ProX&quot;;*
;317454..317530;;atgf;;109;109;;;;109;;
;317640..318416;;cds;;;;;;259;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
;373519..375741;;cds;;120;120;;;*741;;PAS domain-containing protein;*
;375862..375937;;ttc;;5;;5;;;;;
;375943..376027;;tac;;65;65;;;;65;;
;376093..376725;;cds;;;;;;211;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;597419..598486;;cds;;47;47;;;356;47;class II fructose-bisphosphate aldolase;*
;598534..598618;;ttg;;208;208;;;;;;
;598827..600107;;cds;;;;;;427;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;751446..752990;;cds;@2;73;73;;;515;;cache domain-containing protein;*
comp;753064..753140;;gac;+;16;;16;;;;;
comp;753157..753232;;gta;2 gac gta gaa;3;;3;;;;;
comp;753236..753310;;gaa;2 aaa;31;;31;;;;;
comp;753342..753417;;aaa;;8;;8;;;;;
comp;753426..753502;;gac;;22;;22;;;;;
comp;753525..753600;;gta;;3;;3;;;;;
comp;753604..753678;;gaa;;42;;42;;;;;
comp;753721..753796;;aaa;;40;40;;;;40;;
comp;753837..754343;;cds;;;;;;169;;CinA family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;833388..833978;;cds;;142;142;;;197;;LemA family protein;*
comp;834121..834204;;ctc;;93;93;;;;93;;
comp;834298..836409;;cds;;;;;;*704;;methyl-accepting chemotaxis protein;*
;;;;;;;;;;;;
;1445917..1449822;;cds;;93;93;;;*1302;93;hemolysin-type calcium-binding region;*
;1449916..1449991;;gaa;;270;270;;;;;;
;1450262..1450510;;cds;;;;;;83;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;1615201..1615542;;cds;;29;29;;;114;29;hp;
;1615572..1615647;;gtc;;99;99;;;;;;
;1615747..1616595;;cds;;;;;;283;;universal stress protein;*
;;;;;;;;;;;;
;1703617..1703835;;cds;;1;1;;;73;1;hp;
comp;1703837..1703913;;atgf;;12;;12;;;;;
comp;1703926..1704000;;caa;;117;117;;;;;;
;1704118..1705149;;cds;;;;;;344;;bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2221719..2222525;;cds;+;242;242;;;269;;hp;
comp;2222768..2222842;;aac;2 aac;33;;33;;;;;
comp;2222876..2222950;;aac;;72;72;;;;72;;
comp;2223023..2223931;;cds;@3;;;;;303;;radical SAM protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2282678..2283442;;cds;;349;349;;;255;;oxidoreductase;*
comp;2283792..2283880;;tcc;;81;;81;;;;;
comp;2283962..2284038;;gga;;39;;39;;;;;
comp;2284078..2284154;;atgi;;15;;15;;;;;
comp;2284170..2284259;;agc;;102;102;;;;102;;
comp;2284362..2285048;;cds;;;;;;229;;orotidine-5'-phosphate decarboxylase;*
;;;;;;;;;;;;
;2323802..2324866;;cds;@4;12;12;;;355;12;methyltransferase domain-containing protein;*
comp;2324879..2324954;;acc;;167;;;167;;;;
comp;2325122..2325237;;5s;;202;;;;;;;
comp;2325440..2328356;;23s;;300;;;300;;;;
comp;2328657..2328732;;gca;;19;;19;;;;;
comp;2328752..2328828;;atc;;111;;;111;;;;
comp;2328940..2330456;;16s;;378;378;;;;;;
comp;2330835..2331530;;cds;;;;;;232;;5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2581821..2582840;;cds;;192;192;;;340;;UDP-glucose 4-epimerase GalE;*
comp;2583033..2583108;;tgc;;45;;45;;;;;
comp;2583154..2583242;;tca;;16;;16;;;;;
comp;2583259..2583345;;tta;;143;143;;;;*143;;
;2583489..2585177;;cds;;;;;;563;;dihydroxy-acid dehydratase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2637277..2637459;;cds;;81;81;;;61;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;2637541..2637616;;tgg;;31;31;;;;31;;
comp;2637648..2637815;;cds;;;;;;56;;50S ribosomal protein L33;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2637824..2639032;;cds;;240;240;;;403;;elongation factor Tu;*
comp;2639273..2639349;;gga;;8;;8;;;;;
comp;2639358..2639442;;tac;;69;;69;;;;;
comp;2639512..2639588;;aca;;21;;21;;;;;
comp;2639610..2639685;;ttc;;41;41;;;;41;;
comp;2639727..2640881;;cds;;;;;;385;;UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine—D-glutamate ligase;*
;;;;;;;;;;;;
;2656033..2656263;;cds;;231;231;;;77;*231;transcriptional antiterminator Rof;*
comp;2656495..2656610;;5s;;223;;;;;;;
comp;2656834..2659750;;23s;;301;;;301;;;;
comp;2660052..2660127;;gca;;19;;19;;;;;
comp;2660147..2660223;;atc;;111;;;111;;;;
comp;2660335..2661851;;16s;;292;292;;;;;;
comp;2662144..2662782;;cds;;;;;;213;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;2693436..2695451;;cds;;95;95;;;*672;;dynamin family protein;*
;2695547..2695621;;caa;;16;;16;;;;;
;2695638..2695724;;tta;;7;;7;;;;;
;2695732..2695808;;gga;;14;;14;;;;;
;2695823..2695898;;aaa;;16;;16;;;;;
;2695915..2695991;;atgf;;14;;14;;;;;
;2696006..2696082;;atgj;;12;;12;;;;;
;2696095..2696171;;aca;;30;;30;;;;;
;2696202..2696290;;tca;;90;90;;;;90;;
;2696381..2696893;;cds;;;;;;171;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;3082950..3083174;;cds;;143;143;;;75;*143;CcoQ/FixQ family Cbb3-type cytochrome c oxidase assembly chaperone;*
comp;3083318..3083393;;acc;;173;;;173;;;;
comp;3083567..3083682;;5s;;202;;;;;;;
comp;3083885..3086801;;23s;;273;;;273;;;;
comp;3087075..3087150;;gca;;19;;19;;;;;
comp;3087170..3087246;;atc;;111;;;111;;;;
comp;3087358..3088874;;16s;;462;*462;;;;;;
;3089337..3090032;;cds;;;;;;232;;Bax inhibitor-1/YccA family protein;*
&lt;/pre&gt;

====ant cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_cumuls|ant cumuls]]
*Notes: * pour les jaunes
&lt;pre&gt;
ant cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;4;1;0;;1;1;1;1;100;8
;16 23 5s 0;;20;21;;50;6;20;1;200;5
;16 atc gca;4;40;6;;100;11;40;3;300;12
;16 23 5s a;;60;2;;150;8;60;2;400;7
;max a;3;80;2;;200;2;80;4;500;2
;a doubles;;100;2;;250;4;100;3;600;2
;autres;;120;;4;300;2;120;2;700;*1
;total aas;10;140;;0;350;2;140;0;800;*2
sans ;opérons;16;160;;0;400;2;160;*2;900;0
;1 aa;7;180;;2;450;*1;180;0;1000;0
;max a;8;200;;0;500;*1;200;0;1100;0
;a doubles;2;;;4;;0;;*2;;*1
;total aas;45;;33;10;;40;;20;;40
total aas;;55;;;;;;;;;
remarques;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;25;196;;155;;89;;301
;;;variance;22;88;;121;;73;;240
sans jaune;;;moyenne;;;;139;;60;;239
;;;variance;;;;102;;33;;132
&lt;/pre&gt;

====ant blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_blocs|ant blocs]]
&lt;pre&gt;
Blocs 16s ant;;;;;;;;
cds;143;12;;cds;231;;cds;305
acc;173;167;;5s;223;;16s;111
5s;202;202;;23s;301;;atc;19
23s;273;300;;gca;19;;gca;301
gca;19;19;;atc;111;;23s;202
atc;111;111;;16s;292;;5s;354
16s;462;378;;cds;;;cds;
cds;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====ant remarques====
====ant distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_distribution|ant distribution]]
*Notes: atgf gaa ont chacun un 1aa le reste &gt;1aa. aac est un double.
&lt;pre&gt;
distribution;ant;;;;;;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;4
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;1
atc;4;acc;2;aac;2;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;2;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;3;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;2;gca;4;gaa;3;gga;3
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
total;38;7;;2;;8;55
;;;;;;;
;;;;;;;
distribution;ant;;;;;;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;4
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;1
atc;4;acc;2;aac;2;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;2;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;3;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;2;gca;4;gaa;3;gga;3
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;inter;;max;;min;;total
;24;;28;;3;;55
&lt;/pre&gt;

====ant données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_données_intercalaires|ant données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;ant;fx;fc;ant;fx40;fc40;ant;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
;0;0;9;56;0;9;56;-1;0;164;66;155;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;
1;0;10;81;480;1;11;109;-2;0;0;447;1;305;462;;10;;cca
1;0;20;51;231;2;15;55;-3;0;0;70;117;378;;;16;;cac
;1;30;35;74;3;3;56;-4;42;219;110;12;292;;;61;;aga
;2;40;17;53;4;7;24;-5;0;2;109;143;23s 5s;;;96;;cta
;2;50;16;62;5;11;22;-6;7;0;120;143;3* 202;;;**;;atgf
;0;60;18;73;6;8;18;-7;0;12;65;;223;;;5;;ttc
;3;70;19;83;7;7;14;-8;6;97;47;;5s CDS;;;**;;tac
;2;80;20;83;8;4;46;-9;3;0;208;;-;354;;16;;gac
;2;90;35;77;9;6;88;-10;1;7;73;;-;231;;3;;gta
;4;100;24;54;10;9;48;-11;3;46;40;;16s tRNA;;;31;;gaa
;3;110;32;40;11;5;43;-12;4;0;142;;4* 111;;atc;8;;aaa
1;1;120;26;50;12;7;45;-13;0;9;93;;tRNA 23s;;;22;;gac
;0;130;28;34;13;7;32;-14;3;32;93;;2* 301;;gca;3;;gta
;0;140;26;31;14;7;15;-15;3;0;270;;300;;gca;42;;gaa
2;1;150;19;29;15;2;19;-16;1;0;29;;273;;gca;**;;aaa
1;0;160;32;21;16;2;19;-17;2;24;99;;5s tRNA;;;12;;atgf
;0;170;9;11;17;3;12;-18;0;0;242;;167;;acc;**;;caa
;0;180;8;22;18;4;22;-19;0;2;72;;173;;acc;33;;aac
;0;190;19;11;19;10;16;-20;1;19;349;;tRNA tRNA;;intra;**;;aac
;1;200;11;15;20;4;8;-21;1;0;102;;4* 19;;atc gca;81;;tcc
;1;210;11;9;21;6;16;-22;0;0;192;;;;;39;;gga
;0;220;9;9;22;4;7;-23;0;9;81;;;;;15;;atgi
;0;230;3;10;23;5;6;-24;1;0;31;;;;;**;;agc
;1;240;6;10;24;2;4;-25;0;2;240;;;;;45;;tgc
;1;250;5;4;25;4;4;-26;1;5;41;;;;;16;;tca
;0;260;8;5;26;2;10;-27;2;0;95;;;;;**;;tta
;1;270;7;2;27;3;5;-28;0;0;90;;;;;8;;gga
;0;280;2;7;28;2;4;-29;1;7;;;;;;69;;tac
;0;290;3;2;29;4;12;-30;0;0;;;;;;21;;aca
;0;300;9;3;30;3;6;-31;0;1;;;;;;**;;ttc
;0;310;4;1;31;3;8;-32;1;5;;;;;;16;;caa
;0;320;1;2;32;1;1;-33;0;0;;;;;;7;;tta
;0;330;3;4;33;2;8;-34;0;0;;;;;;14;;gga
;0;340;0;4;34;1;5;-35;1;2;;;;;;16;;aaa
;1;350;1;1;35;2;5;-36;0;0;;;;;;14;;atgf
;0;360;0;3;36;1;5;-37;0;0;;;;;;12;;atgj
;0;370;1;1;37;1;6;-38;2;2;;;;;;30;;aca
;0;380;1;0;38;2;4;-39;0;0;;;;;;**;;tca
;0;390;1;3;39;2;7;-40;0;0;;;;;;;;
;0;400;1;1;40;2;4;-41;1;0;;;;;;;;
;1;reste;22;29;reste;440;806;-42;0;0;;;;;;;;
6;28;total;633;1700;total;633;1700;-43;1;0;;;;;;;;
6;27;diagr;602;1615;diagr;184;838;-44;0;0;;;;;;;;
2;1; t30;167;785;;;;-45;0;0;;;;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;;;;
;x;624;90;9;723;;;-49;1;0;;;;;;;;
;c;1644;672;56;2372;;;-50;0;0;;;;;;;;
;;;;;3095;95;;reste;1;6;;;;;;;;
;;;;;;3190;;total;90;672;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ant autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_autres_intercalaires_aas|ant autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ant;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;167574;168434;66;*;
;;tRNA;168501;168577;447;*;cga
fin;;CDS;169025;169261;;;
deb;;CDS;237275;237622;305;*;
;;rRNA;237928;239444;111;*;16s
;;tRNA;239556;239632;19;*;atc
;;tRNA;239652;239727;301;*;gca
;;rRNA;240029;242945;202;*;23s
;;rRNA;243148;243263;354;*;5s
fin;comp;CDS;243618;244301;;;
deb;comp;CDS;302333;303160;155;*;
;;tRNA;303316;303393;10;*;cca
;;tRNA;303404;303480;16;*;cac
;;tRNA;303497;303573;61;*;aga
;;tRNA;303635;303719;96;*;cta
;;tRNA;303816;303892;70;*;atgf
fin;;CDS;303963;304103;;0;
deb;;CDS;316375;317343;110;*;
;;tRNA;317454;317530;109;*;atgf
fin;;CDS;317640;318416;;;
deb;comp;CDS;373519;375741;120;*;
;comp;tRNA;375862;375937;5;*;ttc
;comp;tRNA;375943;376027;65;*;tac
fin;comp;CDS;376093;376725;;;
deb;;CDS;597419;598486;47;*;
;;tRNA;598534;598618;208;*;ttg
fin;;CDS;598827;600107;;;
deb;comp;CDS;751446;752990;73;*;
;comp;tRNA;753064;753140;16;*;gac
;comp;tRNA;753157;753232;3;*;gta
;comp;tRNA;753236;753310;31;*;gaa
;comp;tRNA;753342;753417;8;*;aaa
;comp;tRNA;753426;753502;22;*;gac
;comp;tRNA;753525;753600;3;*;gta
;comp;tRNA;753604;753678;42;*;gaa
;comp;tRNA;753721;753796;40;*;aaa
fin;comp;CDS;753837;754343;;;
deb;comp;CDS;833388;833978;142;*;
;comp;tRNA;834121;834204;93;*;ctc
fin;comp;CDS;834298;836409;;0;
deb;;CDS;1445917;1449822;93;*;
;;tRNA;1449916;1449991;270;*;gaa
fin;;CDS;1450262;1450510;;;
deb;;CDS;1615201;1615542;29;*;
;;tRNA;1615572;1615647;99;*;gtc
fin;;CDS;1615747;1616595;;;
deb;;CDS;1703617;1703835;1;*;
;comp;tRNA;1703837;1703913;12;*;atgf
;comp;tRNA;1703926;1704000;117;*;caa
fin;;CDS;1704118;1705149;;0;
deb;;CDS;1907982;1908272;-5;*;
;comp;ncRNA;1908268;1908590;28;*;
fin;comp;CDS;1908619;1909146;;0;
deb;comp;CDS;2221719;2222525;242;*;
;comp;tRNA;2222768;2222842;33;*;aac
;comp;tRNA;2222876;2222950;72;*;aac
fin;comp;CDS;2223023;2223931;;;
deb;comp;CDS;2282678;2283442;349;*;
;comp;tRNA;2283792;2283880;81;*;tcc
;comp;tRNA;2283962;2284038;39;*;gga
;comp;tRNA;2284078;2284154;15;*;atgi
;comp;tRNA;2284170;2284259;102;*;agc
fin;comp;CDS;2284362;2285048;;;
deb;;CDS;2323802;2324866;12;*;
;comp;tRNA;2324879;2324954;167;*;acc
;comp;rRNA;2325122;2325237;202;*;5s
;comp;rRNA;2325440;2328356;300;*;23s
;comp;tRNA;2328657;2328732;19;*;gca
;comp;tRNA;2328752;2328828;111;*;atc
;comp;rRNA;2328940;2330456;378;*;16s
fin;comp;CDS;2330835;2331530;;;
deb;comp;CDS;2425110;2427044;353;*;
;;tmRNA;2427398;2427792;181;*;
fin;;CDS;2427974;2428249;;;
deb;comp;CDS;2581821;2582840;192;*;
;comp;tRNA;2583033;2583108;45;*;tgc
;comp;tRNA;2583154;2583242;16;*;tca
;comp;tRNA;2583259;2583345;143;*;tta
fin;;CDS;2583489;2585177;;;
deb;comp;CDS;2637277;2637459;81;*;
;comp;tRNA;2637541;2637616;31;*;tgg
fin;comp;CDS;2637648;2637815;;;
deb;comp;CDS;2637824;2639032;240;*;
;comp;tRNA;2639273;2639349;8;*;gga
;comp;tRNA;2639358;2639442;69;*;tac
;comp;tRNA;2639512;2639588;21;*;aca
;comp;tRNA;2639610;2639685;41;*;ttc
fin;comp;CDS;2639727;2640881;;;
deb;;CDS;2656033;2656263;231;*;
;comp;rRNA;2656495;2656610;223;*;5s
;comp;rRNA;2656834;2659750;301;*;23s
;comp;tRNA;2660052;2660127;19;*;gca
;comp;tRNA;2660147;2660223;111;*;atc
;comp;rRNA;2660335;2661851;292;*;16s
fin;comp;CDS;2662144;2662782;;;
deb;;CDS;2693436;2695451;95;*;
;;tRNA;2695547;2695621;16;*;caa
;;tRNA;2695638;2695724;7;*;tta
;;tRNA;2695732;2695808;14;*;gga
;;tRNA;2695823;2695898;16;*;aaa
;;tRNA;2695915;2695991;14;*;atgf
;;tRNA;2696006;2696082;12;*;atgj
;;tRNA;2696095;2696171;30;*;aca
;;tRNA;2696202;2696290;90;*;tca
fin;;CDS;2696381;2696893;;;
deb;comp;CDS;2739487;2740119;88;*;
;comp;regulatory;2740208;2740350;48;*;
fin;comp;CDS;2740399;2740944;;;
deb;;CDS;2825449;2825763;163;*;
;;rpr;2825927;2827069;233;*;
fin;;CDS;2827303;2828151;;;
deb;;CDS;3082950;3083174;143;*;
;comp;tRNA;3083318;3083393;173;*;acc
;comp;rRNA;3083567;3083682;202;*;5s
;comp;rRNA;3083885;3086801;273;*;23s
;comp;tRNA;3087075;3087150;19;*;gca
;comp;tRNA;3087170;3087246;111;*;atc
;comp;rRNA;3087358;3088874;462;*;16s
fin;;CDS;3089337;3090032;;;
&lt;/pre&gt;

====ant intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_entre_cds|ant intercalaires entre cds]]
*'''Le tableau'''
&lt;pre&gt;
ant;5.2.21 Paris;;ant 24.9.20;;;;;;;
ant;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;'''frequence5
;'''négatif;762;24.6;'''négatif ;-8;9;-1 à -79;'''3 192 235;-1;762
;'''zéro;65;2.1;;;;;'''intercals;0;65
;'''1 à 200;2060;66.6;'''0 à 200;56;54;;'''192 251;5;313
;'''201 à 370;150;4.8;'''201 à 370;258;43;;'''6.0%;10;248
;'''371 à 600;33;1.1;'''371 à 600;470;68;;;15;182
;'''601 à max;25;0.8;'''601 à 1028;769;128;;;20;100
;'''total 3095;&lt;201;93.3;'''total 3094;60;105;-79 à 1028;;25;58
adresse;intercalx;intercal;&lt;u&gt;'''frequence1;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence6;Cumul, %;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence-1;30;51
184238;1181;-1;762;-70;2;;0;65;35;36
2384649;1028;0;65;-60;1;;-1;°164;40;34
710835;984;1;°120;-50;4;;-2;0;45;33
982825;947;2;70;-40;3;;-3;0;50;45
3045330;924;3;59;-30;14;'''min à -1;-4;°261;55;47
1534263;916;4;31;-20;49;762;-5;2;60;44
2391806;863;5;°33;-10;137;24.6%;-6;7;65;60
269108;850;6;26;0;617;;-7;12;70;42
1454453;848;7;21;10;561;;-8;°103;75;54
1174364;789;8;50;20;282;;-9;3;80;49
1115863;783;9;°94;30;109;;-10;8;85;56
2054584;776;10;57;40;70;'''1 à 100;-11;°49;90;56
2920637;773;11;48;50;78;1586;-12;4;95;31
1754154;772;12;°52;60;91;51.2%;-13;9;100;47
997474;739;13;39;70;102;;-14;°35;105;38
1906747;712;14;22;80;103;;-15;3;110;34
1172194;702;15;°21;90;112;;-16;1;115;45
606029;672;16;21;100;78;;-17;°26;120;31
1071807;649;17;15;110;72;;-18;0;125;35
1204569;642;18;°26;120;76;;-19;2;130;27
792914;628;19;26;130;62;;-20;°20;135;33
2100174;625;20;12;140;57;;-21;1;140;24
949485;617;21;°22;150;48;;-22;0;145;24
2733159;613;22;11;160;53;;-23;°9;150;24
2042643;612;23;11;170;20;'''1 à 200;-24;1;155;21
2270147;596;24;6;180;30;2060;-25;2;160;32
3006396;587;25;8;190;30;66.6%;-26;°6;165;16
2176130;583;26;°12;200;26;;-27;2;170;4
27717;575;27;8;210;20;;-28;0;175;15
1024897;562;28;6;220;18;;-29;°8;180;15
715253;551;29;°16;230;13;;-30;0;185;15
2128182;532;30;9;240;16;;-31;1;190;15
1829788;526;31;°11;250;9;;-32;°6;195;14
1763296;520;32;2;260;13;'''0 à 200;;810;200;12
;;33;°10;270;9;2125;reste;17;205;11
;;34;6;280;9;;total;827;210;9
;;35;7;290;5;;;;215;10
;;36;6;300;12;;'''intercal;&lt;u&gt;'''frequencef;220;8
;;37;7;310;5;;600;3070;225;5
;;38;6;320;3;;620;3;230;8
;;39;°9;330;7;;640;2;235;6
;;40;6;340;4;'''201 à 370;660;2;240;10
;;;1246;350;2;150;680;1;245;6
;;;3095;360;3;4.8%;700;;250;3
;;;;370;2;;720;2;255;7
;;;;380;1;;740;1;260;6
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;390;4;;760;;265;5
3067823;-79;comp;;400;2;;780;3;270;4
2531271;-71;shift2;1430;410;3;;800;2;275;5
1382616;-65;shift2;248;420;1;;820;;280;4
1058996;-59;shift2;389;430;0;;840;;285;3
2237436;-56;shift2;872;440;0;;860;2;290;2
641645;-55;shift2;861;450;3;;880;1;295;5
1374304;-53;shift2;1223;460;4;;900;;300;7
3090072;-49;;;470;0;;920;1;305;1
542837;-43;;;480;1;;940;1;310;4
2236436;-41;;;490;1;;960;1;315;3
907463;-38;;;500;1;;980;;320;0
984116;-38;;;510;2;;1000;1;325;3
1476725;-38;;;520;2;;1020;;330;4
1904926;-38;;;530;1;;1040;1;335;3
1716281;-35;;;540;1;'''371 à 600;;24;340;1
2233985;-35;;;550;0;33;;;345;0
3184884;-35;;;560;1;1.1%;;;350;2
531215;-32;;;570;1;;;;355;2
642505;-32;;;580;1;'''601 à max;;;360;1
1843228;-32;;;590;2;25;;;365;1
2546649;-32;;;600;1;0.8%;;;370;1
2808157;-32;;;reste;25;;reste;1;reste;58
3127986;-32;;;total;3095;;total;3095;total;3095
&lt;/pre&gt;

====ant  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_positifs_S+|ant intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
ant;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-25;209;-664;88;680;279;min40;-135;1021;-2424;183;664;252;min40
31 à 400;60;-400;637;9.8;785;222;2 parties;4.8;28;-332;62;888;-194;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;183;63;-;609;poly;70;SF;262;79;-;358;poly;306;SF
31 à 400;132;48;-;673;poly;112;tF;130;43;-;746;poly;142;tF
;;;;;;;;;;;;;;
ant. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
mja;min30;406;1047;1453;776;326;571;245;844;857;881;;;
ant;min40;601;1616;2217;730;271;538;267;892;886;876;;;
blo;min20;448;993;1441;820;406;537;131;0.038;0.255;0.669;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
239;405;0.59;495;1234;20;9;113;132;113;474;502;;;
281;485;0.58;714;2381;13;24;116;285;186;836;575;;;
89;208;0.43;518;1255;4;1;35;167;54;241;-109;;;
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50 60, '''t30 t60'''.
*Corrélations et fréquences faibles 
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;0.575;;;;;
;0.730;0.271;0.538;;;;;;;;;;;;
;0.876;0.892;0.886;;;;;;;;;;;;
ant;fx;fc;;ant;fx%;fc%;;fre;fx40;fc40;;x;ant;comp’;continu
0;9;56;;0;15;35;;0;9;56;&gt;0;622;-1;0;164
10;82;479;;10;136;296;;1;11;109;&lt;0;83;-2;0;0
20;52;230;;20;87;142;;2;16;54;zéro;9;-3;0;0
30;35;74;;30;58;46;;3;3;56;total;714;-4;40;221
40;17;53;;40;28;33;;4;7;24;;c;-5;0;2
50;15;63;;50;25;39;;5;11;22;&gt;0;1646;-6;7;0
60;18;73;;60;30;45;;6;8;18;&lt;0;679;-7;0;12
70;19;83;;70;32;51;;7;7;14;zéro;56;-8;5;98
80;20;83;;80;33;51;;8;4;46;total;2381;-9;3;0
90;35;77;;90;58;48;;9;6;88;;;-10;1;7
100;24;54;;100;40;33;;10;9;48;;;-11;3;46
110;32;40;;110;53;25;;11;5;43;;;-12;3;1
120;25;51;;120;42;32;;12;7;45;;;-13;0;9
130;27;35;;130;45;22;;13;8;31;;;-14;1;34
140;26;31;;140;43;19;;14;7;15;;;-15;3;0
150;19;29;;150;32;18;;15;2;19;;;-16;1;0
160;32;21;;160;53;13;;16;2;19;;;-17;2;24
170;9;11;;170;15;7;;17;3;12;;;-18;0;0
180;8;22;;180;13;14;;18;4;22;;;-19;0;2
190;19;11;;190;32;7;;19;10;16;;;-20;1;19
200;11;15;;200;18;9;;20;4;8;;;-21;1;0
210;11;9;;210;18;6;;21;6;16;;;-22;0;0
220;9;9;;220;15;6;;22;4;7;;;-23;0;9
230;3;10;;230;5;6;;23;5;6;;;-24;1;0
240;6;10;;240;10;6;;24;2;4;;;-25;0;2
250;5;4;;250;8;2;;25;4;4;;;-26;1;5
260;8;5;;260;13;3;;26;2;10;;;-27;2;0
270;7;2;;270;12;1;;27;3;5;;;-28;0;0
280;2;7;;280;3;4;;28;2;4;;;-29;1;7
290;3;2;;290;5;1;;29;4;12;;;-30;0;0
300;9;3;;300;15;2;;30;3;6;;;-31;0;1
310;4;1;;310;7;1;;31;3;8;;;-32;1;5
320;1;2;;320;2;1;;32;1;1;;;-33;0;0
330;3;4;;330;5;2;;33;2;8;;;-34;0;0
340;0;4;;340;0;2;;34;1;5;;;-35;1;2
350;1;1;;350;2;1;;35;2;5;;;-36;0;0
360;0;3;;360;0;2;;36;1;5;;;-37;0;0
370;1;1;;370;2;1;;37;1;6;;;-38;1;3
380;1;0;;380;2;0;;38;2;4;;;-39;0;0
390;1;3;;390;2;2;;39;2;7;;;-40;0;0
400;1;1;;400;2;1;;40;2;4;;;-41;1;0
reste;21;30;;;;;;reste;436;810;;;-42;0;0
total;631;1702;;t30;281;485;;total;631;1702;;;-43;1;0
diagr;601;1616;;t60;364;601;;diagr;186;836;;;-44;0;0
 - t30;432;833;;;;;;;;;;;-45;0;0
 - t60;382;644;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;1;0
;;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;;reste;1;6
;;;;;;;;;;;;;total;83;679
&lt;/pre&gt;

====ant  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_négatifs_S-|ant intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
ant;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;;
comp’;0;0;0;40;0;7;0;5;3;1;3;3;0;1;3;1;2;0;0;1;1;0;0;1;0;1;2;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;83;1
continu;164;0;0;221;2;0;12;98;0;7;46;1;9;34;0;0;24;0;2;19;0;0;9;0;2;5;0;0;7;0;1;5;0;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;679;6
&lt;/pre&gt;
*14.8.21 
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;ant;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
Sx-;;0;0;0;40;0;7;0;5;3;1;3;3;0;1;3;1;2;0;0;1;1;0;0;1;0;1;2;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;83
Sc-;;164;0;0;221;2;0;12;98;0;7;46;1;9;34;0;0;24;0;2;19;0;0;9;0;2;5;0;0;7;0;1;5;0;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;679
&lt;/pre&gt;

====ant autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_autres_intercalaires|ant autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
ant;autres intercalaires;;adresses1;;;ant;autres intercalaires;;adresses2;;;ant;autres intercalaires;;adresses3;
deb;°CDS;167574;66;;;deb;°CDS;1445917;93;;;deb;°CDS;2637277;81;comp
;&amp;tRNA;168501;447;;;;&amp;tRNA;1449916;270;;;;&amp;tRNA;2637541;31;comp
fin;°CDS;169025;;;;fin;°CDS;1450262;;;;fin;°CDS;2637648;;comp
deb;°CDS;237275;305;;;deb;°CDS;1615201;29;;;deb;°CDS;2637824;240;comp
;$rRNA;237928;111;;;;&amp;tRNA;1615572;99;;;;&amp;tRNA;2639273;8;comp
;&amp;tRNA;239556;19;;;fin;°CDS;1615747;;;;;&amp;tRNA;2639358;69;comp
;&amp;tRNA;239652;301;;;deb;°CDS;1703617;1;;;;&amp;tRNA;2639512;21;comp
;$rRNA;240029;202;;;;&amp;tRNA;1703837;12;comp;;;&amp;tRNA;2639610;41;comp
;$rRNA;243148;354;;;;&amp;tRNA;1703926;117;comp;;fin;°CDS;2639727;;comp
fin;°CDS;243618;;comp;;fin;°CDS;1704118;;;;deb;°CDS;2656033;231;
deb;°CDS;302333;155;comp;;deb;°CDS;1907982;-5;;;;$rRNA;2656495;223;comp
;&amp;tRNA;303316;10;;;;ncRNA;1908268;28;comp;;;$rRNA;2656834;301;comp
;&amp;tRNA;303404;16;;;fin;°CDS;1908619;;comp;;;&amp;tRNA;2660052;19;comp
;&amp;tRNA;303497;61;;;deb;°CDS;2221719;242;comp;;;&amp;tRNA;2660147;111;comp
;&amp;tRNA;303635;96;;;;&amp;tRNA;2222768;33;comp;;;$rRNA;2660335;292;comp
;&amp;tRNA;303816;70;;;;&amp;tRNA;2222876;72;comp;;fin;°CDS;2662144;;comp
fin;°CDS;303963;;;;fin;°CDS;2223023;;comp;;deb;°CDS;2693436;95;
deb;°CDS;316375;110;;;deb;°CDS;2282678;349;comp;;;&amp;tRNA;2695547;16;
;&amp;tRNA;317454;109;;;;&amp;tRNA;2283792;81;comp;;;&amp;tRNA;2695638;7;
fin;°CDS;317640;;;;;&amp;tRNA;2283962;39;comp;;;&amp;tRNA;2695732;14;
deb;°CDS;373519;120;;;;&amp;tRNA;2284078;15;comp;;;&amp;tRNA;2695823;16;
;&amp;tRNA;375862;5;;;;&amp;tRNA;2284170;102;comp;;;&amp;tRNA;2695915;14;
;&amp;tRNA;375943;65;;;fin;°CDS;2284362;;comp;;;&amp;tRNA;2696006;12;
fin;°CDS;376093;;;;deb;°CDS;2323802;12;;;;&amp;tRNA;2696095;30;
deb;°CDS;597419;47;;;;&amp;tRNA;2324879;167;comp;;;&amp;tRNA;2696202;90;
;&amp;tRNA;598534;208;;;;$rRNA;2325122;202;comp;;fin;°CDS;2696381;;
fin;°CDS;598827;;;;;$rRNA;2325440;300;comp;;deb;°CDS;2739487;88;comp
deb;°CDS;751446;73;comp;;;&amp;tRNA;2328657;19;comp;;;Regulatory;2740208;48;comp
;&amp;tRNA;753064;16;comp;;;&amp;tRNA;2328752;111;comp;;fin;°CDS;2740399;;comp
;&amp;tRNA;753157;3;comp;;;$rRNA;2328940;378;comp;;deb;°CDS;2825449;163;
;&amp;tRNA;753236;31;comp;;fin;°CDS;2330835;;comp;;;repeat_region;2825927;233;
;&amp;tRNA;753342;8;comp;;deb;°CDS;2425110;353;;;fin;°CDS;2827303;;
;&amp;tRNA;753426;22;comp;;;tmRNA;2427398;181;comp;;deb;°CDS;3082950;143;
;&amp;tRNA;753525;3;comp;;fin;°CDS;2427974;;comp;;;&amp;tRNA;3083318;173;comp
;&amp;tRNA;753604;42;comp;;deb;°CDS;2581821;192;comp;;;$rRNA;3083567;202;comp
;&amp;tRNA;753721;40;comp;;;&amp;tRNA;2583033;45;comp;;;$rRNA;3083885;273;comp
fin;°CDS;753837;;comp;;;&amp;tRNA;2583154;16;comp;;;&amp;tRNA;3087075;19;comp
deb;°CDS;833388;142;comp;;;&amp;tRNA;2583259;143;comp;;;&amp;tRNA;3087170;111;comp
;&amp;tRNA;834121;93;comp;;fin;°CDS;2583489;;;;;$rRNA;3087358;462;comp
fin;°CDS;834298;;comp;;;;;;;;fin;°CDS;3089337;;
&lt;/pre&gt;
====ant intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_tRNA|ant intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
ant ;intercalaires tRNA;;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;;;66;;447;;29;31;'''deb;
;10 16 61 96;comp’;155;;70;;47;40;&lt;201;11
;;;110;;109;;66;41;total;14
;5;;120;;65;;73;65;taux;79%
;;;47;;208;;81;70;'''fin;
;16 3 31 8 22 3 42;;73;;40;;93;73;&lt;201;12
;;;142;;93;;95;90;total;15
;;;93;;270;;110;93;taux;80%
;;;29;;99;;120;99;'''total;
;12;comp’;1;;117;;142;102;&lt;201;23
;33;;242;;73;;192;109;total;29
;81 39 15;;349;;102;;240;117;taux;79%
;;comp’;12;;;;242;208;;
;45 16;;192;comp’;143;;349;270;;
;;;81;;31;;'''-;447;'''comp’;'''cumuls
;8 69 21;;240;;41;;1;143;'''deb;100%
;16 7 14 16 14 12 30;;95;;90;;12;-;'''fin;100%
;;comp’;143;;;;143;-;'''total;100%
;;;;;;;155;-;;
;;;;;;;;;;
comp’+continu;;;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;;;
&lt;201;15;13;28;;;;;;;
total;18;16;34;;;;;;;
%;83%;81%;82%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====ant par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_par_rapport_au_groupe_de_référence|ant par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;ant;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;3;;;;;;3;
16;moyen;2;12;;;2;8;24;
14;fort;2;24;2;;;;28;
; ;7;36;2;0;2;8;55;
10;g+cga;1;;;;;;1;
2;agg+cgg;;;;;;;0;
4;carre ccc;2;;;;;;2;
5;autres;;;;;;;0;
;;3;0;0;0;0;0;3;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;alpha  ‰;ref. ‰
21;faible;55;;;;;;55;26
16;moyen;36;218;0;;36;145;436;324
14;fort;36;436;36;;;;509;650
;;127;655;36;0;36;145;55;729
10;g+cga;18;;;;;;18;10
2;agg+cgg;;;;;;;;
4;carre ccc;36;;;;;;36;16
5;autres;;;;;;;;
;;55;0;0;0;0;0;55;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;67;;;67;26;;0;
16;moyen;44;267;;311;324;;33;
14;fort;44;533;44;622;650;;67;
;;156;800;44;45;729;;36;
10;g+cga;22;;;22;10;;;
2;agg+cgg;;;;;;;;
4;carre ccc;44;;;44;16;;;
5;autres;;;;;;;;
;;67;;;67;;;;
&lt;/pre&gt;

====epsilon, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#epsilon,_estimation_des_-rRNAs|epsilon, estimation des -rRNAs]] 
&lt;pre&gt;
epsilon;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
40 génomes total avec rRNA;;;;epsilon;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;epsilon;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;40;187; ; ;;indices;;;;40;468;0;0;;epsi1;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;45
atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;4
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1;;ctt;;cct;;cat;;cgc;3;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;1
atc;80;acc;3;aac;3;agc;;;atc;200;acc;8;aac;8;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;
gtc;;gcc;;gac;2;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;5;ggc;;;gtc;1;gcc;;gac;2;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;3;aga;;;ata;;aca;;aaa;8;aga;;;ata;;aca;2;aaa;3;aga;1
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;3;caa;;cga;;;cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;2;gca;89;gaa;;gga;;;gta;5;gca;223;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;3;gga;3
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;3;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;3;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;172;;13;;2;187;;;;430;;33;;5;468;;;;14;;28;;3;45
11.1.21 Paris;;;;epsilon;total;ttt;tgt;;11.1.21 Paris;;;;epsilon;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;161;6531;0;0;;indices;;;;161;6531;0;0;;epsi1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;4500
atgi;99;tct;;tat;0.6;atgf;104;;atgi;99;tct;;tat;0.6;atgf;106;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;400
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;95;;ctt;;cct;;cat;;cgc;97;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;1.2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;1.2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;107;tcc;97;tac;103;tgc;101;;ttc;107;tcc;97;tac;103;tgc;101;;ttc;200;tcc;100;tac;200;tgc;100
atc;-9;acc;92;aac;105;agc;101;;atc;191;acc;99;aac;112;agc;101;;atc;;acc;;aac;200;agc;100
ctc;101;ccc;55;cac;100;cgt;0;;ctc;101;ccc;55;cac;100;cgt;0;;ctc;100;ccc;;cac;100;cgt;
gtc;98;gcc;95;gac;134;ggc;140;;gtc;98;gcc;95;gac;139;ggc;140;;gtc;100;gcc;;gac;200;ggc;
tta;104;tca;101;taa;;tga;60;;tta;104;tca;101;taa;;tga;60;;tta;200;tca;200;taa;;tga;
ata;0.0;aca;108;aaa;143;aga;124;;ata;;aca;108;aaa;150;aga;124;;ata;;aca;200;aaa;300;aga;100
cta;101;cca;99;caa;109;cga;100;;cta;101;cca;101;caa;109;cga;100;;cta;100;cca;200;caa;100;cga;100
gta;134;gca;-24;gaa;173;gga;111;;gta;139;gca;199;gaa;173;gga;111;;gta;200;gca;;gaa;300;gga;300
ttg;101;tcg;0.6;tag;0.6;tgg;100;;ttg;101;tcg;0.6;tag;0.6;tgg;100;;ttg;100;tcg;;tag;;tgg;100
atgj;98;acg;1.9;aag;6.5;agg;96;;atgj;98;acg;1.9;aag;9.0;agg;96;;atgj;100;acg;;aag;;agg;
ctg;1.2;ccg;0.6;cag;0.6;cgg;1.2;;ctg;1.2;ccg;0.6;cag;0.6;cgg;1.2;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;0;gcg;0;gag;23;ggg;1.9;;gtg;;gcg;;gag;25;ggg;1.9;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;1287;;1663;;641;3591;;;;1717;;1695;;646;4058;;;;1400;;2800;;300;4500
rapports;;75;;98;;99;88;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;epsi1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;98;;fiches;39.7;;;fréquences;;;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;74
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;1588;;;0/0;4;cgt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;97;;avec;188;;;10;13;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;40;;;20;1;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;0;;;;ttc;47;tcc;3;tac;49;tgc;1
atc;-5;acc;92;aac;93;agc;100;;epsi1;45;;;40;2;;;;atc;100;acc;100;aac;48;agc;1
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;;;sans;45;;;50;7;23;;;ctc;1;ccc;100;cac;0;cgt;
gtc;100;gcc;100;gac;96;ggc;100;;avec;10;;;60;2;;;;gtc;2;gcc;100;gac;33;ggc;100
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;1;;;70;1;;;;tta;48;tca;50;taa;;tga;100
ata;;aca;100;aaa;95;aga;100;;;;;;80;1;;;;ata;;aca;46;aaa;53;aga;19
cta;100;cca;98;caa;100;cga;100;;L’estimation par epsilon;;;;90;0;;;;cta;1;cca;51;caa;8;cga;0
gta;96;gca;-12;gaa;100;gga;100;;est  13% au dessu;;;;100;18;;;;gta;33;gca;100;gaa;42;gga;63
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;1;tcg;100;tag;;tgg;0
atgj;100;acg;100;aag;72;agg;100;;;;;;;49;;;;atgj;2;acg;100;aag;100;agg;100
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100
gtg;;gcg;;gag;90;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;100;ggg;100
;;75;;98;;99;88;;;;;;;;;;;;;127;;546;;3;676
&lt;/pre&gt;
===pub===
====pub opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_opérons|pub opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Cand_Pela_ubique_HTCC1062/candPela_UBIQUE_HTCC1062-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_007205.1;ant;génome;;;;;;;;;;
29.2%GC;30.1.21 Paris;16s 1;31;;;;;;;cds dirigé;;
Pelagibacter ubique;;;;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéine;
;41060..41653;;cds;;20;20;;;198;;ABC transporter substrate-binding protein;*
comp;41674..41750;;atgi;;66;;66;;;;;
comp;41817..41891;;gtc;;8;8;;;;8;;
comp;41900..43723;;cds;;;;;;*608;;RNA polymerase sigma factor RpoD;*
;;;;;;;;;;;;
comp;114873..116147;;cds;;3;3;;;425;3;CCA tRNA nucleotidyltransferase;*
comp;116151..116224;;caa;;32;32;;;;;;
comp;116257..117102;;cds;;;;;;282;;4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;319204..319548;;cds;;22;22;;;115;22;4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase;*
comp;319571..319645;;ggc;;97;97;;;;;;
;319743..320384;;cds;;;;;;214;;LON peptidase substrate-binding domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;407852..408448;;cds;;68;68;;;199;;DedA family protein;*
;408517..408601;;ttg;;7;7;;;;7;;
;408609..410315;;cds;;;;;;*569;;AMP-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;414886..415407;;cds;;26;26;;;174;26;PaaI family thioesterase;*
comp;415434..415510;;cgt;;75;75;;;;;;
;415586..416773;;cds;;;;;;396;;acetyl-CoA C-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
;438405..440213;;cds;;2;2;;;*603;2;elongation factor 4;*
;440216..440305;;tcc;;5;5;;;;5;;
comp;440311..441081;;cds;;;;;;257;;FkbM family methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
;461643..462362;;cds;;2;2;;;240;2;VTT domain-containing protein;*
comp;462365..462438;;acc;;101;101;;;;;;
;462540..462737;;cds;;;;;;66;;hp;*
;;;;;;;;;;;;
;466335..466550;;cds;;5;5;;;72;5;translation initiation factor IF-1;*
;466556..466631;;ttc;;88;88;;;;;;
;466720..466932;;cds;;235;235;;;71;;cold-shock protein;*
;467168..467242;;cac;;5;5;;;;5;;
;467248..468645;;cds;;;;;;466;;histidine--tRNA ligase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;509729..511027;;cds;;330;*330;;;433;*330;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
;511358..512832;;16s;@1;98;;;;;;;
;512931..513007;;atc;;9;;;9;;;;
;513017..513092;;gca;;149;;;;;;;
;513242..515995;;23s;;446;*446;;;;;;
;516442..516975;;cds;;46625;;;;178;;WbuC family cupin fold metalloprotein;*
;;;;;;;;;;;;
;563601..564479;;cds;;52;52;;;293;;NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein;*
;564532..564646;;5s;;13;13;;;;13;;
;564660..564785;;cds;;;;;;42;;type B 50S ribosomal protein L36;*
;;;;;;;;;;;;
;567715..568413;;cds;;18;18;;;233;;transaldolase;*
comp;568432..568508;;atgf;;6;6;;;;6;;
comp;568515..568709;;cds;;;;;;65;;30S ribosomal protein S21;*
;;;;;;;;;;;;
comp;593396..594376;;cds;;23;23;;;327;;RluA family pseudouridine synthase;*
;594400..594476;;cga;@2;16;16;;;;16;;
comp;594493..595425;;cds;;;;;;311;;threonylcarbamoyl-AMP synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;842772..843023;;cds;;101;101;;;84;;DUF1289 domain-containing protein;*
;843125..843209;;cta;;16;16;;;;16;;
;843226..844659;;cds;;;;;;478;;trigger factor;*
;;;;;;;;;;;;
;846722..849106;;cds;;49;49;;;*795;49;endopeptidase La;*
;849156..849231;;gta;;13;;13;;;;;
;849245..849321;;gac;;88;88;;;;;;
;849410..849778;;cds;;;;;;123;;NADH-quinone oxidoreductase subunit A;*
;;;;;;;;;;;;
;934654..936063;;cds;;31;31;;;470;31;potassium transporter Trk;*
;936095..936171;;aga;;170;170;;;;;;
;936342..937382;;cds;;;;;;347;;amino acid ABC transporter substrate-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;
;941232..942389;;cds;;19;19;;;386;19;hp;*
comp;942409..942484;;aac;;52;;52;;;;;
comp;942537..942610;;tgc;;128;128;;;;;;
;942739..945366;;cds;;;;;;*876;;valine--tRNA ligase;*
;;;;;;;;;;;;
;970015..971127;;cds;;200;200;;;371;;tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt;*
;971328..971403;;aaa;;20;20;;;;20;;
comp;971424..972251;;cds;;;;;;276;;M48 family metallopeptidase;*
;;;;;;;;;;;;
;975062..975328;;cds;;0;0;;;89;0;succinate dehydrogenase assembly factor 2;*
comp;975329..975418;;tca;;92;92;;;;;;
;975511..976392;;cds;;;;;;294;;EamA family transporter RarD;*
;;;;;;;;;;;;
comp;985615..986127;;cds;;93;93;;;171;;zinc-ribbon domain-containing protein;*
;986221..986297;;cca;;4;4;;;;4;;
;986302..986583;;cds;;;;;;94;;ETC complex I subunit;*
;;;;;;;;;;;;
;988522..990216;;cds;;50;50;;;*565;;single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ;*
;990267..990341;;gaa;;23;23;;;;23;;
;990365..990598;;cds;;;;;;78;;GIY-YIG nuclease family protein;*
;;;;;;;;;;;;
;1029539..1031752;;cds;;0;0;;;*738;0;lytic transglycosylase domain-containing protein;*
comp;1031753..1031844;;agc;;68;68;;;;;;
;1031913..1033166;;cds;;;;;;418;;sarcosine oxidase subunit beta family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1085222..1085413;;cds;;19;19;;;64;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;1085433..1085508;;tgg;;7;7;;;;7;;
comp;1085516..1086706;;cds;;47;47;;;397;47;elongation factor Tu;*
comp;1086754..1086827;;gga;;46;;46;;;;;
comp;1086874..1086959;;tac;;131;131;;;;;;
;1087091..1087834;;cds;;33;33;;;248;33;23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB;*
;1087868..1087943;;aca;;4;4;;;;4;;
comp;1087948..1088727;;cds;;4;4;;;260;4;NAD kinase;*
comp;1088732..1088816;;tta;;79;79;;;;;;
comp;1088896..1089312;;cds;;;;;;139;;Gamma-glutamylcyclotransferase;*
;;;;;;;;;;;;
;1165696..1166454;;cds;;141;141;;;253;;pilin;*
comp;1166596..1166672;;atgj;;64;64;;;;64;;
comp;1166737..1166964;;cds;;;;;;76;;hp;*
&lt;/pre&gt;

====pub cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_cumuls|pub cumuls]]
&lt;pre&gt;
pub cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;1;1;;;1;2;1;2;100;11
;16 atcgca 23;1;20;1;1;50;31;20;18;200;8
;16 atc23s5s;;40;;;100;11;40;5;300;11
;16gca23s5s;;60;2;;150;5;60;2;400;7
;max a;2;80;1;;200;2;80;1;500;6
;a doubles;;100;;;250;1;100;;600;2
;autres;;120;;;300;;120;;700;2
;total aas;2;140;;;350;1;140;;800;2
sans ;opérons;25;160;;;400;;160;;900;1
;1 aa;21;180;;;450;1;180;;1000;
;max a;2;200;;;500;;200;;1100;
;a doubles;0;;;;;;;1;;
;total aas;29;;4;1;;54;;29;;50
total aas;;31;;;;;;;;;
remarques;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;44;9;;63;;27;;299
;;;variance;22;0;;85;;61;;203
sans jaune;;;moyenne;;;;50;;16;;237
;;;variance;;;;55;;16;;134
&lt;/pre&gt;
====pub blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_blocs|pub blocs]]
&lt;pre&gt;
Blocs 16s pub;;;;
cds;330;433;peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein;*
16s;98;1475;;
atc;9;77;;
gca;149;76;;
23s;446;2754;;
cds;46625;178;WbuC family cupin fold metalloprotein;*
;;;;
cds;52;293;NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein;*
5s;13;115;;
cds;;42;type B 50S ribosomal protein L36;*
&lt;/pre&gt;

====pub distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_distribution|pub distribution]]
&lt;pre&gt;
distribution;pub;;;;;;31
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
total;8;21;;;;2;31
;;1aa;1;11;9;;
;;&gt;1aa;1;2;5;;
distribution;scc;;min;inter;max;;29
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;inter;;max;;min;;total
;13;;14;;2;;29
&lt;/pre&gt;
====pub données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_données_intercalaires|pub données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;pub;fx;fc;pub;fx40;fc40;pub;x-;c-;c;x;c;x;aa
2;0;0;13;58;0;13;58;-1;0;152;8;20;CDS 16s;;
3;10;10;39;256;1;4;52;-2;3;0;3;97;;330;
5;2;20;15;51;2;11;58;-3;0;0;32;68;23s CDS;;
1;3;30;15;30;3;6;37;-4;44;79;22;75;446;;
;3;40;19;30;4;5;25;-5;0;1;7;5;5s CDS;;
;3;50;17;32;5;4;26;-6;2;0;26;2;13;;
;0;60;19;29;6;2;13;-7;1;2;2;101;CDS 5s;;
2;1;70;10;18;7;3;12;-8;14;42;5;18;52;;
1;1;80;15;15;8;2;13;-9;7;0;88;23;16s tRNA;;
;2;90;6;18;9;2;12;-10;0;2;235;16;98;;
3;0;100;7;9;10;0;8;-11;5;30;5;101;tRNA 23s;;
2;0;110;5;7;11;3;5;-12;4;0;6;19;149;;
;0;120;9;8;12;0;7;-13;1;2;16;128;tRNA tRNA;;intra
1;0;130;7;6;13;0;6;-14;2;18;49;20;9;;atc gca
1;0;140;4;6;14;2;10;-15;0;0;88;0;tRNA tRNA;;
1;0;150;3;3;15;0;2;-16;0;2;31;92;66;;atgi
;0;160;6;1;16;2;3;-17;1;9;170;93;**;;gtc
;1;170;3;2;17;3;3;-18;2;0;200;0;13;;gta
;0;180;2;3;18;2;6;-19;0;1;4;68;**;;gac
;0;190;1;6;19;0;4;-20;3;10;50;131;52;;aac
;1;200;4;1;20;3;5;-21;0;0;23;4;**;;tgc
;0;210;1;1;21;5;4;-22;0;1;19;141;46;;gga
;0;220;2;1;22;1;4;-23;1;5;7;;**;;tac
;0;230;1;2;23;0;3;-24;3;0;47;;;;
;1;240;1;0;24;3;5;-25;0;1;33;;;;
;0;250;0;1;25;2;2;-26;0;3;4;;;;
;0;260;1;0;26;0;3;-27;0;0;79;;;;
;0;270;1;0;27;2;2;-28;0;1;64;;;;
;0;280;0;1;28;2;2;-29;0;1;;;;;
;0;290;1;0;29;0;3;-30;1;0;;;;;
;0;300;0;0;30;0;2;-31;0;1;;;;;
;0;310;1;0;31;0;3;-32;0;1;;;;;
;0;320;0;2;32;3;5;-33;0;0;;;;;
;0;330;0;0;33;4;1;-34;0;1;;;;;
;0;340;1;0;34;0;2;-35;0;2;;;;;
;0;350;0;0;35;4;4;-36;0;0;;;;;
;0;360;1;0;36;3;4;-37;0;0;;;;;
;0;370;0;0;37;2;3;-38;0;2;;;;;
;0;380;0;0;38;1;1;-39;0;0;;;;;
;0;390;0;0;39;2;4;-40;0;0;;;;;
;0;400;0;0;40;0;3;-41;0;2;;;;;
;0;reste;4;4;reste;135;175;-42;0;0;;;;;
22;28;total;234;601;total;236;600;-43;1;0;;;;;
20;28;diagr;217;539;diagr;88;367;-44;0;1;;;;;
9;15; t30;69;337;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;2;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;221;95;13;329;;;-49;0;0;;;;;
;c;543;377;58;978;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1307;79;;reste;0;3;;;;;
;;;;;;1386;;total;95;377;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====pub autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_autres_intercalaires_aas|pub autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;pub;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;9267;10214;4;*;
;;tmRNA;10219;10520;-2;*;
fin;comp;CDS;10519;10890;;0;
deb;comp;CDS;38328;38795;255;*;
;comp;ncRNA;39051;39405;42;*;
fin;comp;CDS;39448;40191;;;
deb;;CDS;41060;41653;20;*;
;comp;tRNA;41674;41750;66;*;atgi
;comp;tRNA;41817;41891;8;*;gtc
fin;comp;CDS;41900;43723;;;
deb;comp;CDS;114873;116147;3;*;
;comp;tRNA;116151;116224;32;*;caa
fin;comp;CDS;116257;117102;;0;
deb;comp;CDS;319204;319548;22;*;
;comp;tRNA;319571;319645;97;*;ggc
fin;;CDS;319743;320384;;0;
deb;comp;CDS;407852;408448;68;*;
;;tRNA;408517;408601;7;*;ttg
fin;;CDS;408609;410315;;;
deb;comp;CDS;414886;415407;26;*;
;comp;tRNA;415434;415510;75;*;cgt
fin;;CDS;415586;416773;;;
deb;;CDS;438405;440213;2;*;
;;tRNA;440216;440305;5;*;tcc
fin;comp;CDS;440311;441081;;;
deb;;CDS;461643;462362;2;*;
;comp;tRNA;462365;462438;101;*;acc
fin;;CDS;462540;462737;;;
deb;;CDS;466335;466550;5;*;
;;tRNA;466556;466631;88;*;ttc
deb;;CDS;466720;466932;235;*;
;;tRNA;467168;467242;5;*;cac
fin;;CDS;467248;468645;;;
deb;comp;CDS;496262;498457;70;*;
;comp;regulatory;498528;498615;91;*;
fin;;CDS;498707;499813;;1;
deb;comp;CDS;509729;511027;330;*;
;;rRNA;511358;512832;98;*;1475
;;tRNA;512931;513007;9;*;atc
;;tRNA;513017;513092;149;*;gca
;;rRNA;513242;515995;446;*;2754
fin;;CDS;516442;516975;;;
deb;;CDS;563601;564479;52;*;
;;rRNA;564532;564646;13;*;115
fin;;CDS;564660;564785;;;
deb;;CDS;567715;568413;18;*;
;comp;tRNA;568432;568508;6;*;atgf
fin;comp;CDS;568515;568709;;;
deb;comp;CDS;593396;594376;23;*;
;;tRNA;594400;594476;16;*;cga
fin;comp;CDS;594493;595425;;;
deb;;CDS;648881;649762;24;*;
;;regulatory;649787;649876;77;*;
fin;;CDS;649954;651060;;;
deb;comp;CDS;731869;732777;9;*;
;comp;regulatory;732787;732850;88;*;
fin;comp;CDS;732939;733529;;0;
deb;;CDS;785951;786466;32;*;
;;regulatory;786499;786587;-13;*;
fin;;CDS;786575;788023;;;
deb;comp;CDS;842772;843023;101;*;
;;tRNA;843125;843209;16;*;cta
fin;;CDS;843226;844659;;;
deb;;CDS;846722;849106;49;*;
;;tRNA;849156;849231;13;*;gta
;;tRNA;849245;849321;88;*;gac
fin;;CDS;849410;849778;;;
deb;;CDS;934654;936063;31;*;
;;tRNA;936095;936171;170;*;aga
fin;;CDS;936342;937382;;;
deb;;CDS;941232;942389;19;*;
;comp;tRNA;942409;942484;52;*;aac
;comp;tRNA;942537;942610;128;*;tgc
fin;;CDS;942739;945366;;;
deb;;CDS;970015;971127;200;*;
;;tRNA;971328;971403;20;*;aaa
fin;comp;CDS;971424;972251;;0;
deb;;CDS;975062;975328;0;*;
;comp;tRNA;975329;975418;92;*;tca
fin;;CDS;975511;976392;;;
deb;comp;CDS;985615;986127;93;*;
;;tRNA;986221;986297;4;*;cca
fin;;CDS;986302;986583;;;
deb;;CDS;988522;990216;50;*;
;;tRNA;990267;990341;23;*;gaa
fin;;CDS;990365;990598;;;
deb;comp;CDS;1005217;1005678;139;*;
;;regulatory;1005818;1005886;4;*;
fin;;CDS;1005891;1007219;;1;
deb;;CDS;1029539;1031752;0;*;
;comp;tRNA;1031753;1031844;68;*;agc
fin;;CDS;1031913;1033166;;;
deb;comp;CDS;1085222;1085413;19;*;
;comp;tRNA;1085433;1085508;7;*;tgg
deb;comp;CDS;1085516;1086706;47;*;
;comp;tRNA;1086754;1086827;46;*;gga
;comp;tRNA;1086874;1086959;131;*;tac
deb;;CDS;1087091;1087834;33;*;
;;tRNA;1087868;1087943;4;*;aca
deb;comp;CDS;1087948;1088727;4;*;
;comp;tRNA;1088732;1088816;79;*;tta
fin;comp;CDS;1088896;1089312;;1;
deb;comp;CDS;1125607;1126158;4;*;
;comp;regulatory;1126163;1126227;3;*;
deb;comp;CDS;1126231;1127292;66;*;
;comp;regulatory;1127359;1127423;295;*;
fin;comp;CDS;1127719;1127925;;;
deb;;CDS;1165696;1166454;141;*;
;comp;tRNA;1166596;1166672;64;*;atgj
fin;comp;CDS;1166737;1166964;;;
&lt;/pre&gt;

====pub intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_entre_cds|pub intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
28.1.21 paris;24.1.21;1380;pilM ;Pseudo : incomplete, partial in the middle of a contig, missing N-terminus;;;;;;
pub;intercalaires;total;%;intercalaires;;;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;'''frequence5
;'''négatif;473;36.2;'''négatif ;-8;9;-65 à -1;'''1 308 759;-1;473
;'''zéro;71;5.4;;;;;'''intercals;0;71
;'''1 à 200;736;56.3;'''0 à 200;37;45;;'''39 179;5;228
;'''201 à 370;19;1.5;'''201 à 370;260;47;;'''3.0%;10;67
;'''371 à 600;7;0.5;'''371 à 600;475;70;;;15;35
;'''601 à max;1;0.1;'''601 et +;-;;;;20;31
;'''total 1307;&lt;201;97.9;'''total 1306;26;61;-65 à 596;;25;29
adresse;intercalx;intercal;&lt;u&gt;'''frequence1;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence6;cumul, %;intercal;&lt;u&gt;'''fréquence-1;30;16
73227;1380;-1;473;-70;0;;0;71;35;26
999551;596;0;71;-60;1;;-1;°152;40;23
1162229;549;1;56;-50;2;;-2;3;45;33
537246;464;2;°69;-40;6;'''-65 à -1;-3;0;50;16
1119848;445;3;43;-30;8;473;-4;°123;55;23
1180952;435;4;30;-20;29;36%;-5;2;60;25
193367;434;5;°30;-10;79;;-6;2;65;15
398173;403;6;15;0;419;;-7;3;70;13
408609;356;7;15;10;295;;-8;°56;75;17
762333;335;8;°15;20;66;;-9;7;80;12
1122717;318;9;14;30;45;'''1 à 100;-10;2;85;10
338267;317;10;8;40;49;649;-11;°35;90;14
997872;304;11;°8;50;49;49.7%;-12;4;95;7
334628;284;12;7;60;48;;-13;3;100;9
675167;279;13;6;70;28;;-14;°20;105;8
1135181;268;14;°12;80;29;;-15;0;110;4
627169;255;15;2;90;24;;-16;2;115;9
1118568;248;16;5;100;16;;-17;°10;120;8
79392;239;17;6;110;12;'''1 à 200;-18;2;125;7
807867;230;18;°8;120;17;736;-19;1;130;6
58997;223;19;4;130;13;56.3%;-20;°13;135;5
1152723;221;20;8;140;10;;-21;0;140;5
761553;219;21;°9;150;6;;-22;1;145;1
782276;217;22;5;160;7;;-23;°6;150;5
612190;216;23;3;170;5;;-24;3;155;2
351261;209;24;°8;180;5;;-25;1;160;5
838936;201;25;4;190;7;'''0 à 200;-26;°3;165;3
744621;200;26;3;200;5;807;-27;0;170;2
166432;195;27;°4;210;2;;-28;1;175;4
625822;195;28;4;220;3;;-29;1;180;1
164576;191;29;3;230;3;;-30;1;185;6
217060;191;30;2;240;1;;-31;1;190;1
1163621;188;31;3;250;1;;-32;1;195;4
798049;185;32;°8;260;1;;;530;200;1
422106;184;33;5;270;1;;reste;14;205;1
288782;182;34;2;280;1;'''201 à 370;total;544;210;1
560488;182;35;°8;290;1;19;;;215;0
262705;181;36;7;300;0;1.5%;;;220;3
469675;181;37;5;310;1;;;;225;2
832239;177;38;2;320;2;;;;230;1
939877;174;39;°6;330;0;;;;235;0
;;40;3;340;1;;;;240;1
;;reste;308;350;0;;;;245;0
;;total;1307;360;1;;;;250;1
;;;;370;0;;;;255;1
;;;;380;0;;;;260;0
;;;;390;0;;;;265;0
;;;;400;0;;;;270;1
;;;;410;1;;;;275;0
;;;;420;0;;;;280;1
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;430;0;;;;285;1
817687;-65;shift2;2521;440;2;;;;290;0
410672;-59;shift2;856;450;1;;;;295;0
1196013;-56;shift2;445;460;0;;;;300;0
474189;-47;shift2;1222;470;1;;;;305;1
682918;-47;shift2;1435;480;0;;;;310;0
1025350;-44;shift2;544;490;0;;;;315;0
1197066;-43;comp;;500;0;'''371 à 600;;;320;2
584040;-41;shift2;934;510;0;7;;;325;0
707855;-41;shift2;319;520;0;0.5%;;;330;0
802906;-38;shift2;;530;0;;;;335;1
1038898;-38;shift2;;540;0;;;;340;0
279711;-35;shift2;;550;1;;;;345;0
1027659;-35;shift2;;560;0;;;;350;0
928018;-34;shift2;;570;0;;;;355;0
803426;-32;shift2;;580;0;;;;360;1
1176246;-31;shift2;;590;0;'''max;;;365;0
429007;-30;comp;;600;1;1380;;;370;0
992704;-29;shift2;;reste;1;;;;reste;8
1233832;-28;shift2;;total;1307;;;;total;1307
&lt;/pre&gt;

====pub  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_positifs_S+|pub intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
Maj 25.1.22;;;;;;;;;;;;;;
pub. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
pub;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-58;495;-1405;136;853;284;min20;&amp;-236;1732;-3869;256;559;245;min30
31 à 400;-49;437;-1304;133;918;297;2 parties;&amp;-48;403;-1093;97;945;280;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;243;75;-;604;poly;249;SF;&amp;308;88;;221;poly;338;SF
31 à 400;190;60;-;662;poly;256;SF;&amp;117;36;-;580;poly;365;SF
;;;;;;;;;;;;;;
pub. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
pub;min20;218;537;755;908;857;883;26;866;852;840;;;
pmg;min40;559;895;1454;856;728;802;74;904;915;928;;;
ade;min50;1229;2242;3471;867;624;758;134;879;897;903;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
317;628;0.50;327;980;40;59;281;389;88;367;715;;;
326;430;0.76;692;1108;16;31;137;143;196;449;703;;;
221;335;0.66;1412;3052;8;6;72;234;304;876;459;;;
&lt;/pre&gt;
*Diagrammes 400: Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations, diagrammes 1-40, les intercalaires négatifs, totaux.
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;26.1.22 Paris;;;;;;corrélation;;14.8.21 Paris;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;;0.715;;pub;Sx-;Sc-
41-400;0.908;0.857;0.883;;;;;;;;;;-1;0;152
1-400;0.840;0.866;0.852;;;;;;;;;;-2;3;0
pub;fx;fc;;pub;fx%;fc%;;x;;fx40;fc40;;-3;0;0
0;13;58;;0;60;108;&gt;0;222;0;13;58;;-4;43;80
10;39;256;;10;179;477;&lt;0;92;1;4;52;;-5;1;1
20;15;51;;20;69;95;zéro;13;2;11;58;;-6;1;1
30;15;30;;30;69;56;total;327;3;6;37;;-7;1;2
40;19;30;;40;87;56;;c;4;5;25;;-8;14;42
50;17;32;;50;78;60;&gt;0;541;5;4;26;;-9;7;0
60;19;29;;60;87;54;&lt;0;381;6;2;13;;-10;0;2
70;10;18;;70;46;34;zéro;58;7;3;12;;-11;4;31
80;15;14;;80;69;26;total;980;8;2;13;;-12;3;1
90;6;18;;90;28;34;;;9;2;12;;-13;1;2
100;7;9;;100;32;17;total;1307;10;0;8;;-14;2;18
110;6;6;;110;28;11;;;11;3;5;;-15;0;0
120;9;8;;120;41;15;;;12;0;7;;-16;0;2
130;7;6;;130;32;11;;;13;0;6;;-17;1;9
140;4;6;;140;18;11;;;14;2;10;;-18;2;0
150;3;3;;150;14;6;;;15;0;2;;-19;0;1
160;6;1;;160;28;2;;;16;2;3;;-20;3;10
170;3;2;;170;14;4;;;17;3;3;;-21;0;0
180;2;3;;180;9;6;;;18;2;6;;-22;0;1
190;1;6;;190;5;11;;;19;0;4;;-23;1;5
200;4;1;;200;18;2;;;20;3;5;;-24;3;0
210;1;1;;210;5;2;;;21;5;4;;-25;0;1
220;2;1;;220;9;2;;;22;1;4;;-26;0;3
230;1;2;;230;5;4;;;23;0;3;;-27;0;0
240;1;0;;240;5;0;;;24;3;5;;-28;0;1
250;0;1;;250;0;2;;;25;2;2;;-29;0;1
260;1;0;;260;5;0;;;26;0;3;;-30;1;0
270;1;0;;270;5;0;;;27;2;2;;-31;0;1
280;0;1;;280;0;2;;;28;2;2;;-32;0;1
290;1;0;;290;5;0;;;29;0;3;;-33;0;0
300;0;0;;300;0;0;;;30;0;2;;-34;0;1
310;1;0;;310;5;0;;;31;0;3;;-35;0;2
320;0;2;;320;0;4;;;32;3;5;;-36;0;0
330;0;0;;330;0;0;;;33;4;1;;-37;0;0
340;1;0;;340;5;0;;;34;0;2;;-38;0;2
350;0;0;;350;0;0;;;35;4;4;;-39;0;0
360;1;0;;360;5;0;;;36;3;4;;-40;0;0
370;0;0;;370;0;0;;;37;2;3;;-41;0;2
380;0;0;;380;0;0;;;38;1;1;;-42;0;0
390;0;0;;390;0;0;;;39;2;4;;-43;1;0
400;0;0;;400;0;0;;;40;0;3;;-44;0;1
reste;4;4;;;;;;;reste;135;175;;-45;0;0
total;235;599;;t30;317;628;;;total;236;600;;-46;0;0
diagr;218;537;;;;;;;diagr;88;367;;-47;0;2
 - t30;149;200;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;;reste;0;3
;;;;;;;;;;;;;total;92;381
&lt;/pre&gt;

====pub  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_négatifs_S-|pub intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
pub;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;0;3;0;42;1;1;1;14;7;0;4;3;1;2;0;0;1;2;0;2;0;0;1;3;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;90
continu;152;0;0;81;1;1;2;42;0;2;31;1;2;18;0;2;9;0;1;11;0;1;5;0;1;3;0;1;1;0;1;1;0;1;2;0;0;2;0;0;2;0;0;1;0;0;2;0;0;0;3;383
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;pub;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;3;0;43;1;1;1;14;7;0;4;3;1;2;0;0;1;2;0;3;0;0;1;3;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;92
;Sc-;152;0;0;80;1;1;2;42;0;2;31;1;2;18;0;2;9;0;1;10;0;1;5;0;1;3;0;1;1;0;1;1;0;1;2;0;0;2;0;0;2;0;0;1;0;0;2;0;0;0;3;381
&lt;/pre&gt;

====pub autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_autres_intercalaires|pub autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
pub;autres intercalaires;;adresses1;;;pub;autres intercalaires;;adresses2;;;pub;autres intercalaires;;adresses3;
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;tmRNA;10219;-2;;;;$rRNA;511358;98;;;;&amp;tRNA;971328;20;
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;ncRNA;39051;42;comp;;;$rRNA;513242;446;;;;&amp;tRNA;975329;92;comp
fin;°CDS;39448;;comp;;fin;°CDS;516442;;;;fin;°CDS;975511;;
deb;°CDS;41060;20;;;deb;°CDS;563601;52;;;deb;°CDS;985615;93;comp
;&amp;tRNA;41674;66;comp;;;$rRNA;564532;13;;;;&amp;tRNA;986221;4;
;&amp;tRNA;41817;8;comp;;fin;°CDS;564660;;;;fin;°CDS;986302;;
fin;°CDS;41900;;comp;;deb;°CDS;567715;18;;;deb;°CDS;988522;50;
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;&amp;tRNA;408517;7;;;fin;°CDS;649954;;;;fin;°CDS;1031913;;
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;&amp;tRNA;415434;75;comp;;fin;°CDS;732939;;comp;;deb;°CDS;1085516;47;comp
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;&amp;tRNA;440216;5;;;fin;°CDS;786575;;;;deb;°CDS;1087091;33;
fin;°CDS;440311;;comp;;deb;°CDS;842772;101;comp;;;&amp;tRNA;1087868;4;
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;&amp;tRNA;462365;101;comp;;fin;°CDS;843226;;;;;&amp;tRNA;1088732;79;comp
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deb;°CDS;466335;5;;;;&amp;tRNA;849156;13;;;deb;°CDS;1125607;4;comp
;&amp;tRNA;466556;88;;;;&amp;tRNA;849245;88;;;;regulatory;1126163;3;comp
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;&amp;tRNA;467168;5;;;deb;°CDS;934654;31;;;;regulatory;1127359;295;comp
fin;°CDS;467248;;;;;&amp;tRNA;936095;170;;;fin;°CDS;1127719;;comp
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;regulatory;498528;91;comp;;deb;°CDS;941232;19;;;;&amp;tRNA;1166596;64;comp
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;;;;;;;&amp;tRNA;942537;128;comp;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;942739;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====pub intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_tRNA|pub intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
pub;intercalaires tRNA;;;;;;;;;
;entre aas;;cds aa deb;;cds aa fin ;;deb;fin;;
;;;;;;;;;;
;66;comp’;20;;8;;2;4;deb;
;9;;3;;32;;3;5;&lt;201;13
;13;;22;comp’;97;;4;6;total;14
comp’;52;comp’;68;;7;;5;7;taux;93%
;46;;26;comp’;75;;19;7;fin;
;;;2;comp’;5;;22;8;&lt;201;14
;;comp’;2;comp’;101;;26;16;total;14
;;;5;;88;;31;23;taux;100%
;;;235;;5;;33;32;total;
;;comp’;18;;6;;47;64;&lt;201;27
;;comp’;23;comp’;16;;49;79;total;28
;;comp’;101;;16;;50;88;taux;96%
;;;49;;88;;200;88;;
;;;31;;170;;235;170;comp’;cumuls
;;comp’;19;comp’;128;;0;4;;
;;;200;comp’;20;;0;5;deb;11
;;comp’;0;comp’;92;;2;16;&lt;201;100%
;;comp’;93;;4;;18;20;;
;;;50;;23;;19;68;fin;11
;;comp’;0;comp’;68;;20;75;&lt;201;100%
;;;19;;7;;23;92;;
;;;47;comp’;131;;68;97;total;
;;;33;comp’;4;;93;101;&lt;201;22
;;;4;;79;;101;128;total;22
;;comp’;141;;64;;141;131;taux;100%
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
;;;deb;fin;total;;;;;
;;&lt;201;24;25;49;;;;;
;;total;25;25;50;;;;;
;;taux;96%;100%;98%;;;;;
&lt;/pre&gt;

==actino==
===Actinoplanes sp. SE50/110===
====ase opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_opérons|ase opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Acti_SE50_110/actiSp_SE50_110-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_017803.1;ase;;genome;;;;;;;;
71.15%GC;13.8.19 Paris;16s 6;;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Actinoplanes sp. SE50/110;;;;;;;;;;;
;12658..13392;;CDS;;78;78;;;245;;
;13471..13547;;atc;@1;242;;*242;;;;
;13790..13862;;gca;;202;202;;;;;
comp;14065..14607;;CDS;;;;;;181;;
;;;;;;;;;;;
;153733..155094;;CDS;;556;*556;;;454;;
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;157483..160591;;23s;;99;;;;3109;;
;160691..160807;;5s;;134;134;;;117;;
comp;160942..161988;;CDS;;;;;;349;;
;;;;;;;;;;;
comp;45153..45968;;CDS;;276;276;;;272;;
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;46588..47385;;CDS;;;;;;266;;
;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;164809..164883;;aaa;;250;250;;;;;
;165134..166444;;CDS;;;;;;437;;
;;;;;;;;;;;
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comp;459025..460758;;CDS;;;;;;*578;;
;;;;;;;;;;;
;627485..628396;;CDS;;42;42;;;304;;
;628439..628515;;gac;;5;5;;;;;
comp;628521..629174;;CDS;;;;;;218;;
;;;;;;;;;;;
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comp;646309..648462;;CDS;;;;;;*718;;
;;;;;;;;;;;
;747312..748337;;CDS;;430;*430;;;342;;
comp;748768..748851;;tac;;148;148;;;;;
;749000..749491;;CDS;;;;;;164;;
;;;;;;;;;;;
;752175..754703;;CDS;;94;94;;;*843;;
;754798..754873;;acc;;44;;44;;;;
;754918..754990;;atgj;;138;138;;;;;
;755129..755296;;CDS;;;;;;56;;
;;;;;;;;;;;
;755829..756224;;CDS;;79;79;;;132;;
;756304..756376;;tgg;;103;103;;;;;
;756480..756857;;CDS;;;;;;126;;
;;;;;;;;;;;
;940643..942004;;CDS;;55;55;;;454;;
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;942364..943218;;CDS;;;;;;285;;
;;;;;;;;;;;
comp;1155560..1155901;;CDS;;200;200;;;114;;
comp;1156102..1156177;;gcc;;89;89;;;;;
comp;1156267..1156824;;CDS;;;;;;186;;
;;;;;;;;;;;
;1222705..1223634;;CDS;;259;259;;;310;;
comp;1223894..1223980;;cta;;244;244;;;;;
comp;1224225..1224701;;CDS;;;;;;159;;
;;;;;;;;;;;
;1237525..1238115;;CDS;;91;91;;;197;;
;1238207..1238282;;cac;;54;54;;;;;
comp;1238337..1238684;;CDS;;;;;;116;;
;;;;;;;;;;;
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;1249399..1249474;;aag;+;118;;*118;;;;
;1249593..1249668;;aag;2 aag;-15;*-15;;;;;
comp;1249654..1249878;;CDS;@2;;;;;75;;
;;;;;;;;;;;
;1335812..1336096;;CDS;;296;296;;;95;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
comp;1519931..1520254;;CDS;;217;217;;;108;;
;1520472..1520544;;aac;;315;315;;;;;
;1520860..1522122;;CDS;;236;236;;;421;;
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&lt; comp;1523530..1523919;;CDS;;;;;;130;;
;;;;;;;;;;;
;1604562..1605026;;CDS;;38;38;;;155;;
;1605065..1605139;;gta;;357;357;;;;;
&lt;&gt;;1605497..1605583;;CDS;;;;;;29;;
;;;;;;;;;;;
comp;1935668..1936510;;CDS;;317;317;;;281;;
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;;;;;;;;;;;
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;2435813..2438881;;CDS;;;;;;*1023;;
;;;;;;;;;;;
comp;2570204..2570824;;CDS;;794;*794;;;207;;
;2571619..2573141;;16s;;315;;;;1523;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;6401781..6401854;;atc;;6;6;;;;;
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;6402806..6402879;;gaa;;5;;5;;;;
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;6403003..6403088;;tcc;;1;;1;;;;
;6403090..6403163;;gtg;;2;;2;;;;
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;6403333..6403405;;other;;411;*411;;;;;
comp;6403817..6404185;;CDS;;;;;;123;;
;;;;;;;;;;;
;6543230..6543619;;CDS;;412;*412;;;130;;
;6544032..6544106;;ctg;;152;;*152;;;;
;6544259..6544331;;gca;;410;*410;;;;;
;6544742..6545917;;CDS;;;;;;392;;
;;;;;;;;;;;
;6934653..6935819;;CDS;;69;69;;;389;;
comp;6935889..6935962;;ccc;;51;51;;;;;
comp;6936014..6937450;;CDS;;;;;;479;;
;;;;;;;;;;;
comp;6991952..6992437;;CDS;;174;174;;;162;;
comp;6992612..6992728;;5s;;170;;;;117;;
comp;6992899..6996006;;23s;;307;;;;3108;;
comp;6996314..6997836;;16s;;531;*531;;;1523;;
comp;6998368..6999624;;CDS;;;;;;419;;
;;;;;;;;;;;
;7455514..7456608;;CDS;;167;167;;;365;;
comp;7456776..7456847;;gtg;;55;55;;;;;
comp;7456903..7457310;;CDS;;;;;;136;;
;;;;;;;;;;;
;7481671..7483989;;CDS;;83;83;;;*773;;
comp;7484073..7484189;;5s;;169;;;;117;;
comp;7484359..7487466;;23s;;315;;;;3108;;
comp;7487782..7489304;;16s;;800;*800;;;1523;;
comp;7490105..7490731;;CDS;;;;;;209;;
;;;;;;;;;;;
;7670534..7671652;;CDS;;136;136;;;373;;
comp;7671789..7671863;;gtc;;18;;18;;;;
comp;7671882..7671952;;tgc;;38;;38;;;;
comp;7671991..7672063;;ggc;;116;116;;;;;
comp;7672180..7674045;;CDS;;;;;;*622;;
;;;;;;;;;;;
;7710075..7711193;;CDS;;136;136;;;373;;
comp;7711330..7711404;;gtc;;28;;28;;;;
comp;7711433..7711503;;tgc;;38;;38;;;;
comp;7711542..7711614;;ggc;;112;112;;;;;
;7711727..7712905;;CDS;;;;;;393;;
;;;;;;;;;;;
;8111157..8111843;;CDS;;546;*546;;;229;;
comp;8112390..8112465;;gag;+;532;;*532;;;;
comp;8112998..8113070;;gag;2 gag;57;;57;;;;
comp;8113128..8113199;;cag;;451;*451;;;;;
comp;8113651..8114457;;CDS;;;;;;269;;
;;;;;;;;;;;
;8275151..8275810;;CDS;;65;65;;;220;;
;8275876..8275950;;cgg;;416;*416;;;;;
comp;8276367..8276921;;CDS;;;;;;185;;
;;;;;;;;;;;
comp;8391343..8392530;;CDS;;255;255;;;396;;
comp;8392786..8392862;;atgf;;296;296;;;;;
comp;8393159..8394607;;CDS;;;;;;483;;
;;;;;;;;;;;
comp;8397029..8399113;;CDS;;596;*596;;;*695;;
comp;8399710..8399786;;atgf;;71;71;;;;;
comp;8399858..8402857;;CDS;;;;;;*1000;;
;;;;;;;;;;;
comp;8601686..8603128;;CDS;;81;81;;;481;;
comp;8603210..8603280;;caa;;37;37;;;;;
comp;8603318..8604199;;CDS;;;;;;294;;
;;;;;;;;;;;
;8623005..8623730;;CDS;;64;64;;;242;;
comp;8623795..8623871;;gcg;;171;171;;;;;
comp;8624043..8624792;;CDS;;;;;;250;;
;;;;;;;;;;;
comp;8821061..8822146;;CDS;;136;136;;;362;;
;8822283..8822356;;aca;;175;175;;;;;
comp;8822532..8824421;;CDS;;;;;;*630;;
;;;;;;;;;;;
;8945870..8946763;;CDS;;190;190;;;298;;
;8946954..8947030;;ccg;;204;204;;;;;
comp;8947235..8947531;;CDS;;;;;;99;;
;;;;;;;;;;;
comp;8963177..8966704;;CDS;;104;104;;;*1176;;
comp;8966809..8966904;;ncRNA;;83;83;*83;;;;
;8966988..8967075;;tcc;;270;270;;;;;
comp;8967346..8967687;;CDS;;;;;;114;;
;;;;;;;;;;;
;8968639..8969070;;CDS;;521;*521;;;144;;
comp;8969592..8969681;;tcg;;116;116;;;;;
;8969798..8970505;;CDS;;;;;;236;;
;;;;;;;;;;;
;9077764..9078855;;CDS;;326;326;;;364;;
comp;9079182..9079256;;cgt;;370;370;;;;;
comp;9079627..9082830;;CDS;;;;;;*1068;;
;;;;;;;;;;;
comp;9084051..9086675;;CDS;;560;*560;;;*875;;
comp;9087236..9087311;;cgt;;40;;40;;;;
comp;9087352..9087442;;agc;;399;399;;;;;
;9087842..9089017;;CDS;;;;;;392;;
;;;;;;;;;;;
comp;9100587..9101549;;CDS;;77;77;;;321;;
;9101627..9101714;;tca;;144;144;;;;;
comp;9101859..9102145;;CDS;;;;;;96;;
&lt;/pre&gt;

====ase cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_cumuls|ase cumuls]]
&lt;pre&gt;
ase cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;6;1;8;-;1;1;1;;100;8;30;1
;16 23 5s 0;6;20;19;;50;16;20;;200;29;60;1
;16 atc gca;0;40;6;;100;19;40;;300;19;90;3
;16 23 5s a;0;60;4;;150;17;60;;400;19;120;10
;max a;0;80;3;;200;9;80;;500;14;150;9
;a doubles;0;100;2;;250;9;100;;600;3;180;8
;autres;0;120;2;;300;7;120;;700;3;210;8
;total aas;0;140;1;;350;4;140;;800;2;240;5
sans ;opérons;45;160;2;;400;5;160;;900;2;270;6
;1 aa;31;180;0;;450;6;180;;1000;1;300;5
;max a;29;200;1;;500;3;200;;1100;2;330;4
;a doubles;2;;3;;;13;;;;1;;43
;total aas;98;;51;0;;109;;0;;103;;103
total aas;;98;;;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;58;;;229;;;;328;;
;;;variance;98;;;206;;;;173;;
sans jaune;;;moyenne;19;;;147;;;;254;;179
;;;variance;21;;;104;;;;111;;62
&lt;/pre&gt;

====ase blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_blocs|ase blocs]]
&lt;pre&gt;
ase blocs;;;;;;
CDS;556;454;492;125;586;72
16s;308;1524;308;1523;307;1523
23s;99;3109;108;3109;99;3109
5s;134;117;245;117;122;117
CDS;;349;;477;;266
;;;;;;
CDS;794;207;531;419;800;209
16s;315;1523;307;1523;315;1523
23s;98;3106;170;3108;169;3108
5s;247;117;174;117;83;117
CDS;;146;;162;;773
&lt;/pre&gt;
====ase remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_remarques|ase remarques]]
====ase distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_distribution|ase distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;1;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;3;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;2;acc;2;aac;1;agc;3;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;1;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;1;gac;2;ggc;;;gtc;3;gcc;2;gac;2;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;2;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;2;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;3;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;3;ccg;;cag;3;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;1;gcg;2;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;3;ggg;
actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ase; ;32;;;;;;;ase;58;;;;;;;;ase;6;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====ase données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_données_intercalaires|ase données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;ase;fx;fc;ase;fx40;fc40;ase;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
1;0;0;22;13;0;22;13;-1;0;168;78;202;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;suite
1;0;10;141;464;1;20;60;-2;18;0;279;257;555;585;;245;;atc;97;;cgt
1;3;20;93;279;2;5;59;-3;0;0;151;387;491;793;;**;;gca;14;;aag
;2;30;92;196;3;23;38;-4;91;885;595;185;530;;;15;;ttc;11;;aga
1;6;40;63;226;4;21;48;-5;0;1;338;74;799;;;62;;gac;1;;aaa
1;2;50;101;178;5;10;43;-6;2;0;92;8;16s 23s;;;**;;gaa;1;;atgf
1;3;60;130;183;6;12;28;-7;11;18;274;459;2* 345;;;47;;acc;1;;gtc
2;1;70;137;193;7;12;31;-8;6;71;434;430;2* 344;;;**;;atgj;5;;gaa
2;3;80;126;160;8;9;37;-9;2;1;817;148;2* 352;;;118;;aag;44;;aac
;2;90;104;171;9;17;53;-10;4;9;42;262;23s 5s;;;**;;aag;1;;tcc
1;3;100;101;126;10;12;67;-11;17;22;1343;54;2* 105;;;-;130;gga;2;;gtg
1;1;110;95;122;11;9;49;-12;5;0;94;132;114;;;**;;cca;96;;cac
2;2;120;82;98;12;11;33;-13;6;12;138;-12;100;;;29;;tgc;**;;other
;0;130;96;96;13;8;33;-14;18;12;79;296;176;;;**;;gcg;152;;ctg
5;2;140;89;88;14;5;26;-15;11;1;103;217;175;;;20;;ctc;**;;gca
1;0;150;62;78;15;11;23;-16;4;5;55;827;5s CDS;;;**;;tac;18;;gtc
1;1;160;73;82;16;17;28;-17;12;6;221;1132;245;377;;9;;cgg;38;;tgc
1;0;170;66;71;17;6;23;-18;4;0;203;131;983;122;;17;;cca;**;;ggc
2;1;180;59;57;18;8;12;-19;6;5;89;19;;247;;5;;agc;28;;gtc
1;1;190;61;70;19;10;17;-20;5;6;244;151;;83;;4;;ctg;38;;tgc
;0;200;65;58;20;8;35;-21;1;0;91;278;;;;11;;cag;**;;ggc
2;1;210;55;45;21;15;20;-22;2;3;13;32;;;;4;;ggc;532;;gag
1;0;220;39;46;22;11;24;-23;8;7;373;104;tRNA CDS;suite;;3;;cgt;57;;gag
;1;230;42;53;23;7;23;-24;7;0;38;43;34;77;;43;;gcc;**;;cag
;0;240;39;37;24;10;14;-25;1;5;315;345;35;1017;;**;;tgg;40;;cgt
;1;250;41;48;25;11;18;-26;8;5;47;411;412;;;199;;tgg;**;;agc
1;0;260;36;17;26;2;24;-27;0;1;38;178;380;;;157;;ggg;;;
1;0;270;43;33;27;17;14;-28;3;4;362;69;113;;;64;;gcc;;;
2;2;280;34;33;28;6;14;-29;3;4;19;167;51;;;81;;gag;;;
;0;290;23;29;29;4;28;-30;2;0;19;136;55;;;141;;gga;;;
1;1;300;22;29;30;9;17;-31;4;1;23;136;116;;;144;;caa;;;
;0;310;31;21;31;1;22;-32;7;4;31;112;451;;;1;;ttg;;;
;2;320;22;22;32;6;34;-33;2;0;22;546;65;;;5;;acc;;;
1;0;330;16;20;33;10;20;-34;3;1;409;419;135;;;**;;ggc;;;
;1;340;20;32;34;4;23;-35;6;0;317;64;296;;;110;;cag;;;
1;0;350;22;24;35;4;22;-36;1;0;699;136;599;;;4;;ctc;;;
;0;360;24;19;36;7;19;-37;1;2;;175;71;;;1;;acg;;;
;2;370;14;16;37;7;23;-38;5;0;;204;81;;;5;;ctg;;;
;2;380;11;14;38;7;29;-39;0;0;;273;37;;;30;;gcg;;;
1;0;390;13;14;39;7;14;-40;2;1;;91;171;;;5;;gac;;;
;0;400;15;10;40;10;20;-41;0;3;;116;190;;;1;;agc;;;
9;10;reste;259;295;reste;2268;2688;-42;2;0;;329;370;;;**;;atc;;;
45;56;total;2679;3866;total;2679;3866;-43;2;1;;408;524;;;;;;;;
35;46;diagr;2398;3558;diagr;389;1165;-44;2;4;;;;;;;;;;;
2;5; t30;326;939;;;;-45;0;0;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;-46;0;1;;;;;;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;2;1;;;;;;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;;;;;;;
;x;2669;352;22;3043;;;-49;0;2;;;;;;;;;;;
;c;3841;1300;13;5154;;;-50;3;0;;;;;;;;;;;
;;;;;8197;183;;reste;53;28;;;;;;;;;;;
;;;;;;8380;;total;352;1300;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ase autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_autres_intercalaires_aas|ase autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ase;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;12497;13392;78;*;
;;tRNA;13471;13544;245;*;atc
;;tRNA;13790;13862;202;*;gca
fin;comp;CDS;14065;14607;;;
deb;comp;CDS;45153;45968;279;*;
;comp;tRNA;46248;46330;257;*;ctg
fin;;CDS;46588;47385;;;
deb;;CDS;65469;66323;387;*;
;comp;tRNA;66711;66784;151;*;ggg
fin;comp;CDS;66936;67442;;0;
deb;comp;CDS;145264;145572;595;*;
;comp;tRNA;146168;146244;15;*;ttc
;comp;tRNA;146260;146333;62;*;gac
;comp;tRNA;146396;146468;338;*;gaa
fin;comp;CDS;146807;147778;;;
deb;;CDS;153733;155094;555;*;
;;rRNA;155650;157166;345;*;16s
;;rRNA;157512;160585;105;*;23s
;;rRNA;160691;160807;377;*;5s
fin;comp;CDS;161185;161988;;0;
deb;;CDS;164168;164716;92;*;
;;tRNA;164809;164883;274;*;aaa
fin;;CDS;165158;166444;;;
deb;;CDS;261106;261627;434;*;
;;tRNA;262062;262130;817;*;aaa
fin;;CDS;262948;263811;;0;
deb;comp;CDS;457033;458691;185;*;
;;tRNA;458877;458950;74;*;acg
fin;comp;CDS;459025;460683;;0;
deb;;CDS;568633;569007;491;*;
;;rRNA;569499;571014;345;*;16s
;;rRNA;571360;574433;114;*;23s
;;rRNA;574548;574664;245;*;5s
fin;;CDS;574910;576340;;;
deb;;CDS;627485;628396;42;*;
;;tRNA;628439;628512;8;*;gac
fin;comp;CDS;628521;629174;;0;
deb;;CDS;643285;644433;1343;*;
;;tRNA;645777;645849;459;*;agg
fin;comp;CDS;646309;648462;;;
deb;;CDS;747348;748337;430;*;
;comp;tRNA;748768;748851;148;*;tac
fin;;CDS;749000;749491;;;
deb;;CDS;752175;754703;94;*;
;;tRNA;754798;754870;47;*;acc
;;tRNA;754918;754990;138;*;atgj
fin;;CDS;755129;755296;;;
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;;tRNA;9101627;9101711;1017;*;tca
fin;comp;CDS;9102729;9103751;;0;
&lt;/pre&gt;

====ase intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_entre_cds|ase intercalaires entre cds]]
*'''Tableau'''
&lt;pre&gt;
ase;2.2.21 Paris;;ase 17.12.20;;;;;;;;;
ase;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;frequencez
;'''négatif;1652;20.2;'''négatif ;-11;18;-1 à -120;'''9 239 851;-1;1652;610;9
;'''zéro;35;0.4;;;;;'''intercals;0;35;620;10
;'''1 à 200;4832;58.9;'''0 à 200;76;56;;'''1 063 558;5;327;630;11
;'''201 à 370;1047;12.8;'''201 à 370;270;48;;'''11.5%;10;278;640;9
;'''371 à 600;399;4.9;'''371 à 600;466;64;;;15;208;650;8
;'''601 à max;232;2.8;'''601 à 1028;901;335;;;20;164;660;5
;'''total 8197;&lt;201;79.5;'''total 8191;125;189;-120 à 2272;;25;153;670;10
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;135;680;7
3108649;3760;-1;1652;-70;42;;0;35;35;146;690;2
5950001;3290;0;35;-60;13;;-1;°168;40;143;700;3
9227973;3263;1;°80;-50;29;;-2;18;45;135;710;4
5776402;3118;2;64;-40;23;;-3;0;50;144;720;4
6218652;2918;3;61;-30;39;'''min à -1;-4;°976;55;169;730;4
2517961;2663;4;°69;-20;73;1652;-5;1;60;144;740;5
7134889;2272;5;53;-10;159;20.2%;-6;2;65;154;750;6
355339;2255;6;40;0;1309;;-7;29;70;176;760;4
6142216;2155;7;43;10;605;;-8;°77;75;138;770;5
744687;2103;8;46;20;372;;-9;3;80;148;780;3
7132107;2080;9;70;30;288;;-10;13;85;145;790;4
713737;2014;10;°79;40;289;'''1 à 100;-11;°39;90;130;800;5
56486;1991;11;58;50;279;3264;-12;5;95;123;810;3
7915401;1920;12;44;60;313;39.8%;-13;18;100;104;820;5
1728815;1782;13;41;70;330;;-14;°30;105;106;830;3
6917877;1616;14;31;80;286;;-15;12;110;111;840;5
3627392;1532;15;34;90;275;;-16;9;115;101;850;3
6902269;1526;16;°45;100;227;;-17;°18;120;79;860;1
7156539;1508;17;29;110;217;;-18;4;125;101;870;4
4817485;1484;18;20;120;180;;-19;11;130;91;880;4
3228912;1467;19;27;130;192;;-20;°11;135;89;890;4
1528987;1458;20;°43;140;177;;-21;1;140;88;900;1
8078456;1411;21;35;150;140;;-22;5;145;76;910;1
8199307;1409;22;35;160;155;;-23;°15;150;64;920;1
5463416;1395;23;30;170;137;'''1 à 200;-24;7;155;89;930;1
1188761;1392;24;24;180;116;4832;-25;6;160;66;940;1
9239126;1338;25;29;190;131;58.9%;-26;°13;165;76;950;2
3240125;1331;26;26;200;123;;-27;1;170;61;960;0
1083604;1320;27;31;210;100;;-28;7;175;58;970;7
6788001;1297;28;20;220;85;;-29;°7;180;58;980;0
3417418;1292;29;32;230;95;;-30;2;185;67;990;3
6304514;1289;30;26;240;76;'''0 à 200;-31;5;190;64;1000;4
8425004;1285;31;23;250;89;4867;-32;°11;195;72;1010;0
5338257;1267;32;°40;260;53;;;1559;200;51;1020;1
204079;1263;33;30;270;76;;reste;128;205;54;1030;1
6897972;1260;34;27;280;67;;total;1687;210;46;1040;2
;;35;26;290;52;;;;215;45;1050;3
;;36;26;300;51;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequence5;220;40;1060;2
;;37;30;310;52;;600;7965;225;50;1070;0
;;38;°36;320;44;;650;47;230;45;1080;0
;;39;21;330;36;;700;27;235;43;1090;3
;;40;30;340;52;'''201 à 370;750;23;240;33;1100;0
;;reste;4956;350;46;1047;800;21;245;45;1110;1
;;total;8197;360;43;12.8%;850;19;250;44;1120;1
;;;;370;30;;900;14;255;28;1130;1
;;;;380;25;;950;6;260;25;1140;0
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;390;27;;1000;14;265;34;1150;0
1905626;-120;comp;;400;25;;1050;7;270;42;1160;0
1623585;-119;shift2;1160;410;16;;1100;5;275;37;1170;0
3648339;-119;comp;;420;36;;1150;3;280;30;1180;2
5459717;-119;shift2;533;430;19;;1200;4;285;23;1190;1
2592786;-111;comp;;440;20;;1250;2;290;29;1200;1
7166313;-110;shift2;3494;450;19;;1300;11;295;24;reste;42
2954690;-109;;;460;19;;1350;3;300;27;total;8197
3376872;-109;;;470;16;;1400;2;305;28;;
1386988;-107;;;480;20;;1450;2;310;24;;
1241468;-106;;;490;21;;1500;3;315;23;;
2667462;-106;;;500;13;;1550;3;320;21;;
5582768;-106;;;510;22;;1600;0;325;19;;
4986287;-105;;;520;14;;1650;1;330;17;;
5304717;-101;;;530;4;;1700;0;335;33;;
3730598;-100;;;540;16;'''371 à 600;1750;0;340;19;;
5353721;-97;;;550;11;399;1800;1;345;22;;
6351308;-97;;;560;10;4.9%;1850;0;350;24;;
9179797;-95;;;570;12;;1900;0;355;21;;
594603;-94;;;580;14;'''601 à max;1950;1;360;22;;
6906822;-94;;;590;12;232;2000;1;365;12;;
323356;-93;;;600;8;2.8%;;220;370;18;;
1310874;-93;;;reste;232;;reste;12;reste;631;;
5450079;-91;;;total;8197;;total;8197;total;8197;;
&lt;/pre&gt;

====ase  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_positifs_S+|ase intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
corrélations;;;;;;;;;;;;;;
ase. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
ade;min50;1229;2242;3471;867;624;758;134;879;897;903;;;
ase;min40;2398;3558;5956;959;922;940;18;646;725;814;;;
cvi;min30;1008;2320;3328;931;858;891;33;434;549;696;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
221;335;0.66;1412;3052;8;6;72;234;304;876;459;;;
135;264;0.51;3031;5166;7;3;116;252;389;1165;346;;;
112;301;0.37;1171;3111;4;3;59;221;130;815;582;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
ase;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;19;-108;35;46;872;189;max70;&amp;-43;352;-987;104;910;273;min50
31 à 400;22;-129;74;44;881;195;2 parties;&amp;-18;182;-637;85;976;337;2 parties
droite;-a;cste; -;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste; -;R2;note;R2’;
1 à 400;125;51; -;847;dte;25;tf;&amp;184;63; -;694;poly;216;SF
31 à 400;129;52; -;849;dte;32;tf;&amp;141;51; -;827;poly;149;SF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50, '''t30 t50'''.
*Corrélations, diagrammes 1-40, les intercalaires négatifs, totaux.
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;corrélation;;;;;;;;;;;;;
41-n;0.959;0.922;0.940;;0.346;;;;;;;;;;;;;
1-n;0.814;0.646;0.725;;;;;;;;;;14.8.21 paris;;;;;
ase;fx;fc;;fx40;fc40;;ase;fx%;fc%;;x;;ase;comp’;continu;ase;comp’;continu
0;22;13;0;22;13;;0;9;4;&gt;0;2657;;-1;0;168;-51;3;0
10;141;464;1;20;60;;10;59;130;&lt;0;352;;-2;18;0;-52;0;3
20;93;279;2;5;59;;20;39;78;zéro;22;;-3;0;0;-53;4;0
30;92;196;3;23;38;;30;38;55;total;3031;;-4;91;885;-54;1;0
40;63;226;4;21;48;;40;26;64;;c;;-5;0;1;-55;0;1
50;101;178;5;10;43;;50;42;50;&gt;0;3853;;-6;2;0;-56;4;0
60;130;183;6;12;28;;60;54;51;&lt;0;1300;;-7;11;18;-57;1;0
70;137;193;7;12;31;;70;57;54;zéro;13;;-8;6;71;-58;3;0
80;126;160;8;9;37;;80;53;45;total;5166;;-9;2;1;-59;4;2
90;104;171;9;17;53;;90;43;48;;;;-10;4;9;-60;0;0
100;101;126;10;12;67;;100;42;35;;;;-11;17;22;-61;0;0
110;95;122;11;9;49;;110;40;34;;;;-12;5;0;-62;2;0
120;82;98;12;11;33;;120;34;28;;;;-13;6;12;-63;0;0
130;96;96;13;8;33;;130;40;27;;;;-14;18;12;-64;1;0
140;89;88;14;5;26;;140;37;25;;;;-15;11;1;-65;3;0
150;62;78;15;11;23;;150;26;22;;;;-16;4;5;-66;1;0
160;73;82;16;17;28;;160;30;23;;;;-17;12;6;-67;2;1
170;66;71;17;6;23;;170;28;20;;;;-18;4;0;-68;2;0
180;59;57;18;8;12;;180;25;16;;;;-19;6;5;-69;1;0
190;61;70;19;10;17;;190;25;20;;;;-20;5;6;-70;0;2
200;65;58;20;8;35;;200;27;16;;;;-21;1;0;-71;0;0
210;55;45;21;15;20;;210;23;13;;;;-22;2;3;-72;2;0
220;39;46;22;11;24;;220;16;13;;;;-23;8;7;-73;0;0
230;42;53;23;7;23;;230;18;15;;;;-24;7;0;-74;1;1
240;39;37;24;10;14;;240;16;10;;;;-25;1;5;-75;0;0
250;41;48;25;11;18;;250;17;13;;;;-26;8;5;-76;0;1
260;36;17;26;2;24;;260;15;5;;;;-27;0;1;-77;0;0
270;43;33;27;17;14;;270;18;9;;;;-28;3;4;-78;0;0
280;34;33;28;6;14;;280;14;9;;;;-29;3;4;-79;0;1
290;23;29;29;4;28;;290;10;8;;;;-30;2;0;-80;1;0
300;22;29;30;9;17;;300;9;8;;;;-31;4;1;-81;1;0
310;31;21;31;1;22;;310;13;6;;;;-32;7;4;-82;2;1
320;22;22;32;6;34;;320;9;6;;;;-33;2;0;-83;0;0
330;16;20;33;10;20;;330;7;6;;;;-34;3;1;-84;0;0
340;20;32;34;4;23;;340;8;9;;;;-35;6;0;-85;0;0
350;22;24;35;4;22;;350;9;7;;;;-36;1;0;-86;2;1
360;24;19;36;7;19;;360;10;5;;;;-37;1;2;-87;1;0
370;14;16;37;7;23;;370;6;4;;;;-38;5;0;-88;1;0
380;11;14;38;7;29;;380;5;4;;;;-39;0;0;-89;0;1
390;13;14;39;7;14;;390;5;4;;;;-40;2;1;-90;0;0
400;15;10;40;10;20;;400;6;3;;;;-41;0;3;-91;0;1
reste;259;295;;2268;2688;;;;;;;;-42;2;0;-92;0;0
total;2679;3866;;2679;3866;;t30;136;264;;;;-43;2;1;-93;2;0
diagr;2398;3558;;389;1165;;t50;204;377;;;;-44;2;4;-94;0;2
 - t30;2072;2619;;;;;;;;;;;-45;0;0;-95;0;1
 - t50;1908;2215;;;;;;;;;;;-46;0;1;-96;0;0
;;;;;;;;;;;;;-47;2;1;-97;0;2
;;;;;;;;;;;;;-48;0;0;-98;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;0;2;-99;0;0
;;;;;;;;;;;;;-50;3;0;-100;0;0
;;;;;;;;;;;;;reste;53;28;reste;8;7
;;;;;;;;;;;;;total;352;1300;total;53;28
&lt;/pre&gt;

====ase  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_négatifs_S-|ase intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
ase;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;-81;-82;-83;-84;-85;-86;-87;-88;-89;-90;-91;-92;-93;-94;-95;-96;-97;-98;-99;-100;;;
comp’;0;18;0;84;0;2;10;5;2;4;15;4;4;17;10;4;11;4;5;5;1;2;7;6;1;8;0;2;3;1;3;5;2;3;5;1;1;5;0;1;0;2;2;1;0;0;2;0;0;2;2;0;3;1;0;4;0;2;4;0;0;2;0;1;3;1;2;2;1;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;2;0;0;0;2;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;8;319;49
continu;168;0;0;892;1;0;19;72;1;9;24;1;14;13;2;5;7;0;6;6;0;3;8;1;5;5;1;5;4;1;2;6;0;1;1;0;2;0;0;2;3;0;1;5;0;1;1;0;2;1;1;3;1;0;1;0;1;1;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;2;0;0;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;2;1;0;2;0;0;1;6;1333;32
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;ase;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total;-51;-52;-53;-54;-55;-56;-57;-58;-59;-60;-61;-62;-63;-64;-65;-66;-67;-68;-69;-70;-71;-72;-73;-74;-75;-76;-77;-78;-79;-80;-81;-82;-83;-84;-85;-86;-87;-88;-89;-90;-91;-92;-93;-94;-95;-96;-97;-98;-99;-100;reste;total
;comp’;0;18;0;91;0;2;11;6;2;4;17;5;6;18;11;4;12;4;6;5;1;2;8;7;1;8;0;3;3;2;4;7;2;3;6;1;1;5;0;2;0;2;2;2;0;0;2;0;0;3;53;352;3;0;4;1;0;4;1;3;4;0;0;2;0;1;3;1;2;2;1;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;2;0;0;0;2;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;8;53
;continu;168;0;0;885;1;0;18;71;1;9;22;0;12;12;1;5;6;0;5;6;0;3;7;0;5;5;1;4;4;0;1;4;0;1;0;0;2;0;0;1;3;0;1;4;0;1;1;0;2;0;28;1300;0;3;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;2;0;0;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;2;1;0;2;0;0;0;7;28
&lt;/pre&gt;

====ase autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_autres_intercalaires|ase autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
ase;autres intercalaires;;adresses1;;;ase;autres intercalaires;;adresses2;;;ase;autres intercalaires;;adresses3;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;12497;78;;;deb;°CDS;1519931;217;comp;;deb;°CDS;6543191;412;
;&amp;tRNA;13471;245;;;;&amp;tRNA;1520472;315;;;;&amp;tRNA;6544032;152;
;&amp;tRNA;13790;202;;;fin;°CDS;1520860;;;;;&amp;tRNA;6544259;380;
fin;°CDS;14065;;comp;;deb;°CDS;1522138;47;;;deb;°CDS;6544712;113;
deb;°CDS;45153;279;comp;;;&amp;tRNA;1522359;827;;;;&amp;tRNA;6546031;178;
;&amp;tRNA;46248;257;comp;;fin;°CDS;1523260;;comp;;fin;°CDS;6546284;;
fin;°CDS;46588;;;;deb;°CDS;1604562;38;;;deb;°CDS;6934653;69;
deb;°CDS;65469;387;comp;;;&amp;tRNA;1605065;1132;;;;&amp;tRNA;6935889;51;comp
;&amp;tRNA;66711;151;comp;;fin;°CDS;1606269;;;;fin;°CDS;6936014;;comp
fin;°CDS;66936;;comp;;deb;°CDS;1618796;261;comp;;deb;°CDS;6991353;983;comp
deb;°CDS;145264;595;comp;;;ncRNA;1619690;61;comp;;;$rRNA;6992612;176;comp
;&amp;tRNA;146168;15;comp;;fin;°CDS;1620155;;;;;$rRNA;6992905;344;comp
;&amp;tRNA;146260;62;comp;;deb;°CDS;1935668;362;comp;;;$rRNA;6996322;530;comp
;&amp;tRNA;146396;338;comp;;;&amp;tRNA;1936828;131;comp;;fin;°CDS;6998368;;comp
fin;°CDS;146807;;comp;;fin;°CDS;1937036;;;;deb;°CDS;7455514;167;
deb;°CDS;153733;555;;;deb;°CDS;2434657;19;;;;&amp;tRNA;7456776;55;comp
;$rRNA;155650;345;;;;&amp;tRNA;2435579;151;comp;;fin;°CDS;7456903;;comp
;$rRNA;157512;105;;;fin;°CDS;2435813;;;;deb;°CDS;7481701;83;
;$rRNA;160691;377;;;deb;°CDS;2570204;793;comp;;;$rRNA;7484073;175;comp
fin;°CDS;161185;;comp;;;$rRNA;2571618;352;;;;$rRNA;7484365;352;comp
deb;°CDS;164168;92;;;;$rRNA;2573486;100;;;;$rRNA;7487790;799;comp
;&amp;tRNA;164809;274;;;;$rRNA;2576661;247;;;fin;°CDS;7490105;;comp
fin;°CDS;165158;;;;fin;°CDS;2577025;;comp;;deb;°CDS;7670534;136;
deb;°CDS;261106;434;;;deb;°CDS;4900233;19;comp;;;&amp;tRNA;7671789;18;comp
;&amp;tRNA;262062;817;;;;&amp;tRNA;4901800;29;comp;;;&amp;tRNA;7671882;38;comp
fin;°CDS;262948;;;;;&amp;tRNA;4901908;19;comp;;;&amp;tRNA;7671991;116;comp
deb;°CDS;457033;185;comp;;deb;°CDS;4902001;23;comp;;fin;°CDS;7672180;;comp
;&amp;tRNA;458877;74;;;;&amp;tRNA;4902345;31;comp;;deb;°CDS;7710075;136;
fin;°CDS;459025;;comp;;fin;°CDS;4902449;;comp;;;&amp;tRNA;7711330;28;comp
deb;°CDS;568633;491;;;deb;°CDS;4989030;22;;;;&amp;tRNA;7711433;38;comp
;$rRNA;569499;345;;;;&amp;tRNA;4989784;278;;;;&amp;tRNA;7711542;112;comp
;$rRNA;571360;114;;;fin;°CDS;4990157;;comp;;fin;°CDS;7711727;;
;$rRNA;574548;245;;;deb;°CDS;5443888;409;;;deb;°CDS;8111157;546;
fin;°CDS;574910;;;;;&amp;tRNA;5444936;20;;;;&amp;tRNA;8112390;532;comp
deb;°CDS;627485;42;;;;&amp;tRNA;5445030;32;;;;&amp;tRNA;8112998;57;comp
;&amp;tRNA;628439;8;;;fin;°CDS;5445144;;comp;;;&amp;tRNA;8113128;451;comp
fin;°CDS;628521;;comp;;deb;°CDS;6208479;104;;;fin;°CDS;8113651;;comp
deb;°CDS;643285;1343;;;;&amp;tRNA;6209594;9;comp;;deb;°CDS;8275151;65;
;&amp;tRNA;645777;459;;;;&amp;tRNA;6209676;17;comp;;;&amp;tRNA;8275876;419;
fin;°CDS;646309;;comp;;;&amp;tRNA;6209767;5;comp;;fin;°CDS;8276367;;comp
deb;°CDS;747348;430;;;;&amp;tRNA;6209865;4;comp;;deb;°CDS;8391343;135;comp
;&amp;tRNA;748768;148;comp;;;&amp;tRNA;6209944;11;comp;;;&amp;tRNA;8392786;296;comp
fin;°CDS;749000;;;;;&amp;tRNA;6210027;4;comp;;fin;°CDS;8393159;;comp
deb;°CDS;752175;94;;;;&amp;tRNA;6210105;3;comp;;deb;°CDS;8397029;599;comp
;&amp;tRNA;754798;47;;;;&amp;tRNA;6210181;43;comp;;;&amp;tRNA;8399713;71;comp
;&amp;tRNA;754918;138;;;;&amp;tRNA;6210298;345;comp;;fin;°CDS;8399858;;comp
fin;°CDS;755129;;;;fin;°CDS;6210715;;comp;;deb;°CDS;8601686;81;comp
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;&amp;tRNA;756304;103;;;;&amp;tRNA;6290910;43;comp;;fin;°CDS;8603318;;comp
fin;°CDS;756480;;;;fin;°CDS;6291049;;;;deb;°CDS;8623005;64;
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;&amp;tRNA;942060;221;;;;&amp;tRNA;6399123;199;;;fin;°CDS;8624043;;comp
fin;°CDS;942364;;;;;&amp;tRNA;6399396;157;;;deb;°CDS;8821061;136;comp
deb;°CDS;1120784;33;;;;&amp;tRNA;6399626;64;;;;&amp;tRNA;8822283;175;
;tmRNA;1121477;553;;;;&amp;tRNA;6399763;81;;;fin;°CDS;8822532;;comp
fin;°CDS;1122412;;comp;;;&amp;tRNA;6399916;141;;;deb;°CDS;8945870;190;
deb;°CDS;1155560;203;comp;;;&amp;tRNA;6400131;144;;;;&amp;tRNA;8946954;204;
;&amp;tRNA;1156105;89;comp;;;&amp;tRNA;6400352;1;;;fin;°CDS;8947235;;comp
fin;°CDS;1156267;;comp;;;&amp;tRNA;6400428;5;;;deb;°CDS;8963177;104;comp
deb;°CDS;1222705;262;;;;&amp;tRNA;6400506;34;;;;ncRNA;8966809;83;comp
;&amp;tRNA;1223897;244;comp;;deb;°CDS;6400612;35;;;;&amp;tRNA;8966988;273;
fin;°CDS;1224225;;comp;;;&amp;tRNA;6401091;110;;;fin;°CDS;8967346;;comp
deb;°CDS;1237525;91;;;;&amp;tRNA;6401274;4;;;deb;°CDS;8969168;91;
;&amp;tRNA;1238207;54;;;;&amp;tRNA;6401352;1;;;;&amp;tRNA;8969592;116;comp
fin;°CDS;1238337;;comp;;;&amp;tRNA;6401429;5;;;fin;°CDS;8969798;;
deb;°CDS;1248040;132;comp;;;&amp;tRNA;6401509;30;;;deb;°CDS;9077764;329;
;&amp;tRNA;1249399;118;;;;&amp;tRNA;6401615;5;;;;&amp;tRNA;9079185;370;comp
;&amp;tRNA;1249593;-12;;;;&amp;tRNA;6401692;1;;;fin;°CDS;9079627;;comp
fin;°CDS;1249654;;comp;;;&amp;tRNA;6401781;6;;;deb;°CDS;9084051;524;comp
deb;°CDS;1335812;296;;;;ncRNA;6401861;7;;;;&amp;tRNA;9087239;40;comp
;&amp;tRNA;1336393;13;comp;;;&amp;tRNA;6402235;97;;;;&amp;tRNA;9087352;408;comp
fin;°CDS;1336479;;comp;;;&amp;tRNA;6402407;14;;;fin;°CDS;9087851;;
deb;°CDS;1399552;373;comp;;;&amp;tRNA;6402492;11;;;deb;°CDS;9100587;77;comp
;&amp;tRNA;1400450;130;comp;;;&amp;tRNA;6402577;1;;;;&amp;tRNA;9101627;1017;
;&amp;tRNA;1400651;38;;;;&amp;tRNA;6402652;1;;;fin;°CDS;9102729;;comp
fin;°CDS;1400763;;;;;&amp;tRNA;6402729;1;;;;;;;
deb;°CDS;1406634;585;comp;;;&amp;tRNA;6402806;5;;;;;;;
;$rRNA;1407435;344;;;;&amp;tRNA;6402885;44;;;;;;;
;$rRNA;1409295;105;;;;&amp;tRNA;6403003;1;;;;;;;
;$rRNA;1412474;122;;;;&amp;tRNA;6403090;2;;;;;;;
fin;°CDS;1412713;;comp;;;&amp;tRNA;6403166;96;;;;;;;
;;;;;;;&amp;tRNA;6403333;411;;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;6403817;;comp;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====ase intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_tRNA|ase intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
comp’;aas;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;245;;78;comp’;202;;19;13;;
;;;279;comp’;257;;22;19;'''deb;
;;;387;;151;;23;31;&lt;201;18
;15;;595;;338;;35;34;total;32
;62;;;;;;38;37;taux;56%
;;;92;;274;;42;38;;
;;;434;;817;;47;51;'''fin;
;;comp’;185;comp’;74;;55;55;&lt;201;16
;;;42;comp’;8;;65;71;total;28
;;;1343;comp’;459;;78;89;taux;57%
;;comp’;430;comp’;148;;79;103;;
;47;;94;;138;;81;116;'''total;
;;;79;;103;;91;138;&lt;201;34
;;;55;;221;;92;151;total;60
;;;203;;89;;94;171;taux;57%
;;comp’;262;;244;;113;178;;
;;;91;comp’;54;;135;221;;
;118;comp’;132;comp’;-12;;190;244;;
;;comp’;296;;13;;203;274;;
comp’;130;;373;;38;;279;296;;
;;comp’;217;;315;;317;315;;
;;;47;comp’;827;;362;338;;
;;;38;;1132;;373;345;;
;;;362;comp’;131;;387;370;;
;;comp’;19;comp’;151;;409;380;;
;29;;19;;19;;412;451;;
;;;23;;31;;434;817;;
;;;22;comp’;278;;524;1132;;
;20;;409;comp’;32;;595;'''-;;
5aas;9 17 5 4 11 ;comp’;104;;345;;599;'''-;;
3aas;4 3 43;;;;;;699;'''-;;
;;;317;comp’;43;;1343;'''-;'''comp’;'''cumuls
8aas;199 157 64 81 141 144 1 5;;699;;34;;19;'''-12;;
7aas;110 4 1 5 30 5 1 6ncRNA7;;35;comp’;411;;64;8;'''deb;
11aas ;97 14 11 1 1 1 5 44 1 2 96;;;;;;69;32;&lt;201;12
;152;;412;;380;;77;43;total;18
;;;113;;178;;91;54;taux;67%
;;comp’;69;;51;;104;74;;
;;comp’;167;;55;;132;112;'''fin;
;18 38;comp’;136;;116;;136;116;&lt;201;12
;28 38;comp’;136;comp’;112;;136;131;total;23
;532 57;comp’;546;;451;;136;148;taux;34%
;;;65;comp’;419;;167;151;;
;;;135;;296;;185;175;'''total;
;;;599;;71;;217;202;&lt;201;24
;;;81;;37;;262;204;total;41
;;comp’;64;;171;;296;257;taux;59%
;;comp’;136;comp’;175;;329;273;;
;;;190;comp’;204;;430;278;;
;;;;comp’;273;;546;408;;
;;comp’;91;comp’;116;;'''-;411;;
;;comp’;329;;370;;'''-;419;;
;40;;524;comp’;408;;'''-;459;;
;;comp’;77;comp’;1017;;'''-;827;;
;;;;;;;'''-;1017;;
;;;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;;;
&lt;201;30;28;58;;;;;;;
total;50;51;101;;;;;;;
taux;60%;55%;57%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===blo===
====blo opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_opérons|blo opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Bifi_long_NCC2705/bifiLong-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_004307.2;blo;genome;57;;;
60%GC;30.6.19 Paris;16s  4;NCBI;gtRNAdb;doubles;intercalaires
;Bifidobacterium longum NCC2705;;;;;
;115187..115260;;val;gta;;
;;;;;;
;159243..160772;;16s;;@1;430
;161203..164268;;23s;;;168
;164437..164556;;5s;;;
;;;;;;
comp;207382..207457;;tgg;tgg;;
;;;;;;
comp;382849..382924;;aac;aac;+;43
comp;382968..383040;;aac;aac;2 aac;
;;;;;;
comp;440078..440150;;aac;aac;;
;;;;;;
;503549..503624;;gly;ggc;+;24
;503649..503719;;tgc;tgc;2 ggc;41
;503761..503835;;val;gtc;;45
;503881..503953;;val;gtg;;31
;503985..504060;;gly;ggc;;
;;;;;;
;521008..521084;;pro;ccc;;
;;;;;;
;648764..648851;;leu;ctc;;
;;;;;;
comp;747296..747369;;arg;cgt;+;29
comp;747399..747472;;arg;cgt;2 cgt;
;;;;;;
;775646..775716;;gln;caa;;
;;;;;;
;778709..778784;;ala;gcc;+;86
;778871..778946;;ala;gcc;2 gcc;
;;;;;;
;793729..793805;;pro;cca;;
;;;;;;
comp;804390..804463;;leu;ttg;;
;;;;;;
comp;841055..841136;;leu;tta;;
;;;;;;
;937056..937131;;cac;cac;;
;;;;;;
comp;981177..981253;;arg;aga;;
;;;;;;
;1202433..1202505;;thr;acg;;87
;1202593..1202676;;leu;cta;;
;;;;;;
;1208139..1208211;;thr;acg;;
;;;;;;
comp;1264390..1264465;;val;gtg;;48
comp;1264514..1264585;;val;gtc;;46
comp;1264632..1264704;;gly;ggc;;
;;;;;;
comp;1280591..1280666;;arg;cgg;;
;;;;;;
;1295466..1295542;;atg;atgf;;
;;;;;;
comp;1350001..1350074;;lys;aag;;
;;;;;;
comp;1388875..1388950;;lys;aaa;;
;;;;;;
;1410594..1410681;;ser;tcc;;
;;;;;;
comp;1424793..1424867;;gln;cag;;36
comp;1424904..1424979;;glu;gag;;
;;;;;;
comp;1524142..1524215;;gly;ggg;;
;;;;;;
;1534802..1534887;;leu;ctg;;
;;;;;;
;1606163..1606236;;ile;atc;;42
;1606279..1606351;;ala;gca;;
;;;;;;
comp;1646835..1646911;;thr;aca;;
;;;;;;
;1705902..1707431;;16s;;;429
;1707861..1710926;;23s;;;168
;1711095..1711215;;5s;;;
;;;;;;
;1712083..1713614;;16s;;;422
;1714037..1717102;;23s;;;168
;1717271..1717390;;5s;;;
;;;;;;
;1769952..1770027;;ala;gcg;;
;;;;;;
;1905665..1905740;;tgg;tgg;;
;;;;;;
;1908902..1910431;;16s;;;428
;1910860..1913926;;23s;;;168
;1914095..1914214;;5s;;;
;;;;;;
;1936132..1936205;;gly;gga;;
;;;;;;
;1971396..1971477;;tac;tac;;1
;1971479..1971550;;thr;acc;;4
;1971555..1971631;;atg;atgj;;
;;;;;;
;1979312..1979401;;ser;agc;;
;;;;;;
;2016025..2016112;;ser;tcg;;
;;;;;;
;2047072..2047159;;ser;tca;;
;;;;;;
comp;2068637..2068713;;pro;ccg;;
;;;;;;
comp;2085402..2085473;;glu;gaa;;
;;;;;;
;2087969..2088042;;gac;gac;;47
;2088090..2088165;;ttc;ttc;;
;;;;;;
;2110850..2110926;;gac;gac;;
;;;;;;
;2130626..2130699;;atg;atgi;;
;;;;;;
;2171440..2171512;;arg;agg;;
&lt;/pre&gt;

====blo cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_cumuls|blo cumuls]]
&lt;pre&gt;
blo cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;4;1;1;-
;16 23 5s 0;4;20;1;
;16 atc gca;0;40;4;
;16 23 5s a;0;60;7;
;max a;0;80;0;
;a doubles;0;100;2;
;spéciaux;0;120;0;
;total aas;0;140;0;
sans ;opérons;41;160;0;
;1 aa;31;180;0;
;max a;5;200;0;
;a doubles;4;;0;
;total aas;55;;15;0
total aas;;55;;;
remarques;;1;;;
avec jaune;;;moyenne;41;
;;;variance;24;
sans jaune;;;moyenne;34;
;;;variance;16;
&lt;/pre&gt;

====blo blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_blocs|blo blocs]]
&lt;pre&gt;
blo blocs;;;;
16s;430;1530;422;1532
23s;168;3066;168;3066
5s;;120;;120
;;;;
16s;429;1530;428;1530
23s;168;3066;168;3067
5s;;121;;120
&lt;/pre&gt;
====blo remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_remarques|blo remarques]]

====blo distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_distribution|blo distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;gtc;2;gcc;;gac;1;ggc;3;;gtc;;gcc;2;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;1;caa;1;cga;;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;1;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;2;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
blo;;31;;;;;;;blo;19;;;;;;;;blo;6;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====blo données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_données_intercalaires|blo données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;blo;fx;fc;blo;fx40;fc40;blo;x-;c-;c;x;c;x;aa
2;1;0;2;1;0;2;1;-1;;52;163;190;CDS 16s;;
;0;10;17;87;1;1;12;-2;1;0;231;284;618;518;
;0;20;8;70;2;1;15;-3;;0;-17;-39;573;;
;0;30;15;50;3;1;8;-4;2;109;154;558;5s 16s;;
;1;40;14;34;4;2;5;-5;;0;148;159;866;;
;0;50;16;40;5;3;9;-6;;1;64;95;16s 23s;;
;2;60;17;51;6;1;9;-7;;1;216;204;432;;
1;4;70;16;43;7;1;4;-8;2;8;60;336;3* 431;;
1;3;80;18;40;8;1;8;-9;;0;187;76;23s 5s;;
;0;90;27;47;9;4;6;-10;;3;117;288;4* 170;;
2;1;100;14;34;10;2;11;-11;;9;116;206;5s CDS;;
;1;110;15;42;11;1;10;-12;;0;94;167;375;188;
;4;120;17;40;12;0;7;-13;;0;218;193;;251;
;2;130;18;38;13;1;7;-14;1;10;206;97;tRNA tRNA;;
;1;140;16;38;14;2;3;-15;;0;272;215;43;;aac
;3;150;15;30;15;1;14;-16;;1;467;175;**;;aac
1;3;160;24;25;16;0;8;-17;1;7;67;580;27;;ggc
1;1;170;12;43;17;0;9;-18;;0;192;469;41;;tgc
1;2;180;20;33;18;1;5;-19;1;2;158;-8;48;;gtc
1;1;190;8;15;19;1;3;-20;1;1;149;62;31;;gtg
1;3;200;10;24;20;1;4;-21;;0;251;356;**;;ggc
3;1;210;15;14;21;0;7;-22;1;0;192;309;29;;cgt
1;2;220;16;16;22;2;6;-23;;0;256;204;**;;cgt
;2;230;12;11;23;2;8;-24;;0;365;519;89;;gcc
;1;240;5;17;24;3;4;-25;1;0;433;333;**;;gcc
;1;250;9;12;25;1;6;-26;;1;113;253;87;;acg
1;2;260;6;11;26;3;7;-27;;0;199;;**;;cta
;0;270;6;17;27;1;3;-28;1;1;75;;48;;gtg
;2;280;11;11;28;1;3;-29;;0;142;;46;;gtc
2;0;290;4;3;29;1;4;-30;;0;74;;**;;ggc
;0;300;5;12;30;1;2;-31;;1;306;;39;;cag
1;1;310;6;7;31;2;6;-32;1;0;871;;**;;gag
;1;320;5;11;32;1;3;-33;;0;102;;42;;atc
;2;330;3;3;33;4;2;-34;;0;314;;**;;gca
2;0;340;7;5;34;1;4;-35;1;0;130;;1;;tac
;0;350;2;3;35;0;2;-36;;0;55;;4;;acc
1;0;360;6;6;36;1;3;-37;;0;329;;**;;atgj
;1;370;3;1;37;1;3;-38;1;0;130;;47;;gac
;1;380;5;4;38;1;2;-39;1;0;37;;**;;ttc
;0;390;2;2;39;1;9;-40;;0;178;;;;
;1;400;3;3;40;2;0;-41;;0;519;;;;
4;5;reste;49;51;reste;443;803;-42;;0;61;;;;
26;56;total;499;1045;total;499;1045;-43;;1;71;;;;
20;50;diagr;448;993;diagr;54;241;-44;;0;376;;;;
0;0; t30;40;207;;;;-45;;0;397;;;;
;;;;;;;;-46;;0;327;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;179;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;245;;;;
;x;497;18;2;517;;;-49;;0;222;;;;
;c;1044;210;1;1255;;;-50;;0;271;;;;
;;;;;1772;128;;reste;2;2;69;;;;
;;;;;;1900;;total;18;210;224;;;;
;;;;;;;;;;;422;;;;
;;;;;;;;;;;117;;;;
;;;;;;;;;;;137;;;;
;;;;;;;;;;;156;;;;
&lt;/pre&gt;
=====blo autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_autres_intercalaires_aas|blo autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;blo;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;54774;55427;6;*;
;comp;regulatory;55434;55585;84;*;
fin;;CDS;55670;56692;;0;
deb;;CDS;114598;115023;163;*;
;;tRNA;115187;115260;231;*;gta
fin;;CDS;115492;117195;;;
deb;comp;CDS;139965;140909;-10;*;
;comp;regulatory;140900;141008;336;*;
fin;;CDS;141345;142817;;;
deb;;CDS;158126;158626;618;*;
;;rRNA;159245;160770;432;*;16s
;;rRNA;161203;164268;170;*;23s
;;rRNA;164439;164555;188;*;5s
fin;comp;CDS;164744;165571;;0;
deb;;CDS;205431;206360;187;*;
;;tmRNA;206548;206944;238;*;
deb;comp;CDS;207183;207404;-17;*;
;comp;tRNA;207388;207457;154;*;tgg
fin;comp;CDS;207612;207896;;;
deb;;CDS;327271;327864;8;*;
;comp;ncRNA;327873;328247;493;*;
fin;;CDS;328741;329403;;;
deb;;CDS;381615;382658;190;*;
;comp;tRNA;382849;382924;43;*;aac
;comp;tRNA;382968;383040;284;*;aac
fin;;CDS;383325;384260;;0;
deb;;CDS;439838;440116;-39;*;
;comp;tRNA;440078;440150;558;*;aac
fin;;CDS;440709;441398;;0;
deb;comp;CDS;502556;503389;159;*;
;;tRNA;503549;503621;27;*;ggc
;;tRNA;503649;503719;41;*;tgc
;;tRNA;503761;503832;48;*;gtc
;;tRNA;503881;503953;31;*;gtg
;;tRNA;503985;504060;148;*;ggc
fin;;CDS;504209;506242;;;
deb;;CDS;518814;520943;64;*;
;;tRNA;521008;521081;216;*;ccc
fin;;CDS;521298;522827;;;
deb;comp;CDS;647871;648668;95;*;
;;tRNA;648764;648851;60;*;ctc
fin;;CDS;648912;649790;;;
deb;comp;CDS;745690;747108;187;*;
;comp;tRNA;747296;747369;29;*;cgt
;comp;tRNA;747399;747472;117;*;cgt
fin;comp;CDS;747590;749008;;;
deb;;CDS;774507;775529;116;*;
;;tRNA;775646;775716;94;*;caa
fin;;CDS;775811;777193;;;
deb;;CDS;777792;778490;218;*;
;;tRNA;778709;778781;89;*;gcc
;;tRNA;778871;778943;206;*;gcc
fin;;CDS;779150;780820;;;
deb;;CDS;790385;793456;272;*;
;;tRNA;793729;793802;467;*;cca
fin;;CDS;794270;795018;;1;
deb;comp;CDS;803537;804322;67;*;
;comp;tRNA;804390;804463;204;*;ttg
fin;;CDS;804668;805267;;0;
deb;comp;CDS;840296;840865;192;*;
;comp;tRNA;841058;841136;158;*;tta
fin;comp;CDS;841295;842296;;;
deb;comp;CDS;884674;884868;174;*;
;comp;regulatory;885043;885146;70;*;
fin;comp;CDS;885217;886689;;0;
deb;comp;CDS;902480;903079;104;*;
;comp;regulatory;903184;903288;90;*;
fin;comp;CDS;903379;904746;;0;
deb;comp;CDS;935658;936719;336;*;
;;tRNA;937056;937131;149;*;cac
fin;;CDS;937281;938306;;0;
deb;comp;CDS;980173;980928;251;*;
;comp;tRNA;981180;981253;76;*;aga
fin;;CDS;981330;982538;;0;
deb;comp;CDS;1200444;1202144;288;*;
;;tRNA;1202433;1202505;87;*;acg
;;tRNA;1202593;1202673;192;*;cta
fin;;CDS;1202866;1203867;;0;
deb;comp;CDS;1206664;1207932;206;*;
;;tRNA;1208139;1208211;167;*;acg
fin;comp;CDS;1208379;1209137;;;
deb;comp;CDS;1263240;1264136;256;*;
;comp;tRNA;1264393;1264465;48;*;gtg
;comp;tRNA;1264514;1264585;46;*;gtc
;comp;tRNA;1264632;1264704;193;*;ggc
fin;;CDS;1264898;1265449;;;
deb;comp;CDS;1279836;1280225;365;*;
;comp;tRNA;1280591;1280666;97;*;cgg
fin;;CDS;1280764;1281390;;0;
deb;comp;CDS;1294216;1295250;215;*;
;;tRNA;1295466;1295542;433;*;atgf
fin;;CDS;1295976;1296182;;;
deb;comp;CDS;1349627;1349887;113;*;
;comp;tRNA;1350001;1350074;199;*;aag
fin;comp;CDS;1350274;1350720;;;
deb;comp;CDS;1387168;1388802;75;*;
;comp;tRNA;1388878;1388950;175;*;aaa
fin;;CDS;1389126;1390664;;;
deb;comp;CDS;1408202;1410013;580;*;
;;tRNA;1410594;1410678;469;*;tcc
fin;comp;CDS;1411148;1411789;;0;
deb;comp;CDS;1424162;1424650;142;*;
;comp;tRNA;1424793;1424867;39;*;cag
;comp;tRNA;1424907;1424979;-8;*;gag
fin;;CDS;1424972;1425556;;0;
deb;comp;CDS;1446913;1448064;71;*;
;comp;ncRNA;1448136;1448230;433;*;
fin;;CDS;1448664;1450847;;0;
deb;comp;CDS;1477877;1479229;47;*;
;comp;regulatory;1479277;1479373;128;*;
fin;comp;CDS;1479502;1480089;;;
deb;;CDS;1523012;1524079;62;*;
;comp;tRNA;1524142;1524215;74;*;ggg
fin;comp;CDS;1524290;1525228;;;
deb;;CDS;1533182;1534495;306;*;
;;tRNA;1534802;1534887;871;*;ctg
fin;;CDS;1535759;1536615;;0;
deb;;CDS;1605867;1606060;102;*;
;;tRNA;1606163;1606236;42;*;atc
;;tRNA;1606279;1606351;356;*;gca
fin;comp;CDS;1606708;1606953;;;
deb;comp;CDS;1645027;1646523;314;*;
;comp;tRNA;1646838;1646911;130;*;aca
fin;comp;CDS;1647042;1648019;;;
deb;comp;CDS;1704570;1705325;578;*;
;;rRNA;1705904;1707429;431;*;16s
;;rRNA;1707861;1710926;170;*;23s
;;rRNA;1711097;1711213;866;*;5s
;;rRNA;1712080;1713605;431;*;16s
;;rRNA;1714037;1717102;170;*;23s
;;rRNA;1717273;1717389;251;*;5s
fin;comp;CDS;1717641;1718426;;;
deb;;CDS;1769786;1769896;55;*;
;;tRNA;1769952;1770024;329;*;gcg
fin;;CDS;1770354;1771364;;0;
deb;;CDS;1904329;1905534;130;*;
;;tRNA;1905665;1905740;37;*;tgg
fin;;CDS;1905778;1906005;;;
deb;;CDS;1907638;1908330;573;*;
;;rRNA;1908904;1910429;431;*;16s
;;rRNA;1910861;1913926;170;*;23s
;;rRNA;1914097;1914213;375;*;5s
fin;;CDS;1914589;1915422;;;
deb;;CDS;1935774;1935953;178;*;
;;tRNA;1936132;1936205;519;*;gga
fin;;CDS;1936725;1939109;;;
deb;comp;CDS;1969854;1971086;309;*;
;;tRNA;1971396;1971477;1;*;tac
;;tRNA;1971479;1971550;4;*;acc
;;tRNA;1971555;1971628;61;*;atgj
fin;;CDS;1971690;1971857;;;
deb;;CDS;1978293;1979240;71;*;
;;tRNA;1979312;1979398;376;*;agc
fin;;CDS;1979775;1981118;;;
deb;;CDS;2014827;2015627;397;*;
;;tRNA;2016025;2016109;327;*;tcg
fin;;CDS;2016437;2018005;;;
deb;;CDS;2045606;2046892;179;*;
;;tRNA;2047072;2047156;245;*;tca
fin;;CDS;2047402;2047542;;;
deb;comp;CDS;2067227;2068417;222;*;
;comp;tRNA;2068640;2068713;204;*;ccg
fin;;CDS;2068918;2070600;;;
deb;comp;CDS;2084303;2085130;271;*;
;comp;tRNA;2085402;2085473;69;*;gaa
fin;comp;CDS;2085543;2086448;;0;
deb;;CDS;2086731;2087744;224;*;
;;tRNA;2087969;2088042;47;*;gac
;;tRNA;2088090;2088165;519;*;ttc
fin;comp;CDS;2088685;2089989;;0;
deb;comp;CDS;2108837;2110516;333;*;
;;tRNA;2110850;2110926;422;*;gac
fin;;CDS;2111349;2112299;;0;
deb;;CDS;2129279;2130508;117;*;
;;tRNA;2130626;2130699;137;*;atgi
fin;;CDS;2130837;2131049;;;
deb;comp;CDS;2170074;2171186;253;*;
;;tRNA;2171440;2171512;156;*;agg
fin;;CDS;2171669;2171887;;;
&lt;/pre&gt;

====blo intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_entre_cds|blo intercalaires entre cds]]
*'''Tableau'''
&lt;pre&gt;
blo;2.2.21 Paris;;blo 25.10.20;;;;;;;
blo;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;228;12.9;'''négatif ;-8;13;-1 à -102;'''2 256 640;-1;228
;'''zéro;3;0.2;;;;;'''intercals;0;3
;'''1 à 200;1141;64.4;'''0 à 200;88;57;;'''240 201;5;57
;'''201 à 370;281;15.9;'''201 à 370;265;46;;'''10.6%;10;47
;'''371 à 600;85;4.8;'''371 à 600;459;65;;;15;46
;'''601 à max;34;1.9;'''601 à 1028;732;131;;;20;32
;'''total 1772;&lt;201;77.4;'''total 1770;133;145;-102 à 1039;;25;39
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;26
1260892;1331;-1;228;-70;3;;0;3;35;25
249292;1253;0;3;-60;0;;-1;°52;40;23
620443;1039;1;13;-50;1;;-2;1;45;27
1772723;1037;2;°16;-40;1;;-3;0;50;29
605939;1003;3;9;-30;5;'''min à -1;-4;°111;55;26
1482011;982;4;7;-20;7;228;-5;0;60;42
2120197;922;5;°12;-10;35;12.9%;-6;1;65;34
1612791;831;6;10;0;179;;-7;1;70;25
1661121;780;7;5;10;104;;-8;°10;75;29
1176021;773;8;9;20;78;;-9;0;80;29
934521;765;9;10;30;65;;-10;3;85;31
1783600;752;10;°13;40;48;'''1 à 100;-11;°9;90;43
1589918;746;11;11;50;56;658;-12;0;95;20
550195;745;12;7;60;68;37.1%;-13;0;100;28
1622403;735;13;8;70;59;;-14;°11;105;34
2035292;729;14;5;80;58;;-15;0;110;23
1358695;698;15;°15;90;74;;-16;1;115;36
1450919;688;16;8;100;48;;-17;°8;120;21
1873696;679;17;9;110;57;;-18;0;125;32
1968887;673;18;6;120;57;;-19;3;130;24
1571609;667;19;4;130;56;;-20;°2;135;33
2192649;666;20;5;140;54;;-21;0;140;21
543951;653;21;7;150;45;;-22;1;145;20
551929;649;22;8;160;49;;-23;0;150;25
1166018;635;23;°10;170;55;'''1 à 200;-24;0;155;24
1199447;631;24;7;180;53;1141;-25;1;160;25
132442;628;25;7;190;23;64.4%;-26;1;165;27
1498961;627;26;°10;200;34;;-27;0;170;28
24634;626;27;4;210;29;;-28;°2;175;28
1942663;620;28;4;220;32;;-29;0;180;25
1750223;618;29;5;230;23;;-30;0;185;10
1648197;606;30;3;240;22;;-31;1;190;13
716378;605;31;8;250;21;'''0 à 200;-32;1;195;20
1804621;603;32;4;260;17;1144;;223;200;14
2208591;593;33;6;270;23;;reste;8;205;17
332770;589;34;5;280;22;;total;231;210;12
1653948;587;35;2;290;7;;;;215;17
618810;586;36;4;300;17;;;;220;15
598849;559;37;4;310;13;;intercal;&lt;u&gt;frequencef;225;12
1698789;559;38;3;320;16;;600;1738;230;11
1425641;557;39;°10;330;6;;620;5;235;14
1925114;557;40;2;340;12;'''201 à 370;640;5;240;8
1592846;554;reste;1246;350;5;281;660;2;245;11
733957;552;total;1 772;360;12;15.9%;680;4;250;10
986367;549;;;370;4;;700;2;255;9
1178750;549;;;380;9;;720;;260;8
1832484;546;;;390;4;;740;2;265;11
;;;;400;6;;760;3;270;12
;;;;410;5;;780;3;275;15
;;;;420;11;;800;;280;7
;;;;430;3;;820;;285;4
;;;;440;3;;840;1;290;3
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;450;2;;860;;295;8
516682;-102;comp;;460;4;;880;;300;9
267103;-86;shift2;131;470;3;;900;;305;8
822434;-85;comp;;480;3;;920;;310;5
513572;-53;comp;;490;5;;940;1;315;7
287052;-43;shift2;936;500;3;;960;;320;9
398186;-39;comp;;510;2;;980;;325;2
1553080;-38;;;520;3;;1000;1;330;4
1313073;-35;;;530;3;;1020;1;335;5
1110610;-32;;;540;3;'''371 à 600;1040;2;340;7
2249673;-31;;;550;3;85;;32;345;1
946203;-28;;;560;6;4.8%;;;350;4
2164932;-28;;;570;0;;;;355;7
1823782;-26;;;580;0;'''601 à max;;;360;5
794270;-25;;;590;3;34;;;365;2
2058333;-22;;;600;1;1.9%;;;370;2
268522;-20;;;reste;34;;reste;2;reste;119
1310253;-20;;;total;1772;;total;1772;total;1772
&lt;/pre&gt;

====blo  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_positifs_S+|blo intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
blo Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
ant;min40;601;1616;2217;730;271;538;267;892;886;876;;;
blo;min20;448;993;1441;820;406;537;131;38;255;669;;;
scc;min10;416;961;1377;748;440;530;90;-88;49;367;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
281;485;0.58;714;2381;13;24;116;285;186;836;575;;;
89;208;0.43;518;1255;4;1;35;167;54;241;-109;;;
118;353;0.33;485;1320;4;5;58;242;60;389;-177;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
blo;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;33;-233;362;24;728;235;min20;&amp;-5.7;69;-354;69;868;404;min40
31 à 400;;;;;;;2 parties;&amp;28;-174;163;38;897;207;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;93;44;-;590;poly;138;tF;&amp;159;58;;827;dte;41;Sf
31 à 400;;;;;;;;&amp;136;51;-;861;dte;36;tf
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;corrélation;;;;;;
;400;200;250;;;;;-0.109;;;;;;
41-n;0.820;0.406;0.537;;;;;;;;;;;
1-n;0.669;0.038;0.255;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
blo;fx;fc;;blo;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;blo;Sx-;Sc-
0;2;1;;0;4;1;0;2;1;&gt;0;497;-1;0;52
10;17;87;;10;38;88;1;1;12;&lt;0;18;-2;1;0
20;8;70;;20;18;70;2;1;15;zéro;2;-3;0;0
30;15;50;;30;33;50;3;1;8;total;517;-4;2;109
40;14;34;;40;31;34;4;2;5;;c;-5;0;0
50;16;40;;50;36;40;5;3;9;&gt;0;1044;-6;0;1
60;17;51;;60;38;51;6;1;9;&lt;0;210;-7;0;1
70;16;43;;70;36;43;7;1;4;zéro;1;-8;2;8
80;18;40;;80;40;40;8;1;8;total;1255;-9;0;0
90;27;47;;90;60;47;9;4;6;;;-10;0;3
100;14;34;;100;31;34;10;2;11;total;1772;-11;0;9
110;15;42;;110;33;42;11;1;10;;;-12;0;0
120;17;40;;120;38;40;12;0;7;;;-13;0;0
130;18;38;;130;40;38;13;1;7;;;-14;1;10
140;16;38;;140;36;38;14;2;3;;;-15;0;0
150;15;30;;150;33;30;15;1;14;;;-16;0;1
160;24;25;;160;54;25;16;0;8;;;-17;1;7
170;12;43;;170;27;43;17;0;9;;;-18;0;0
180;20;33;;180;45;33;18;1;5;;;-19;1;2
190;8;15;;190;18;15;19;1;3;;;-20;1;1
200;10;24;;200;22;24;20;1;4;;;-21;0;0
210;15;14;;210;33;14;21;0;7;;;-22;1;0
220;16;16;;220;36;16;22;2;6;;;-23;0;0
230;12;11;;230;27;11;23;2;8;;;-24;0;0
240;5;17;;240;11;17;24;3;4;;;-25;1;0
250;9;12;;250;20;12;25;1;6;;;-26;0;1
260;6;11;;260;13;11;26;3;7;;;-27;0;0
270;6;17;;270;13;17;27;1;3;;;-28;1;1
280;11;11;;280;25;11;28;1;3;;;-29;0;0
290;4;3;;290;9;3;29;1;4;;;-30;0;0
300;5;12;;300;11;12;30;1;2;;;-31;0;1
310;6;7;;310;13;7;31;2;6;;;-32;1;0
320;5;11;;320;11;11;32;1;3;;;-33;0;0
330;3;3;;330;7;3;33;4;2;;;-34;0;0
340;7;5;;340;16;5;34;1;4;;;-35;1;0
350;2;3;;350;4;3;35;0;2;;;-36;0;0
360;6;6;;360;13;6;36;1;3;;;-37;0;0
370;3;1;;370;7;1;37;1;3;;;-38;1;0
380;5;4;;380;11;4;38;1;2;;;-39;1;0
390;2;2;;390;4;2;39;1;9;;;-40;0;0
400;3;3;;400;7;3;40;2;0;;;-41;0;0
reste;49;51;;;;;reste;443;803;;;-42;0;0
total;499;1045;;t30;89;208;total;499;1045;;;-43;0;1
diagr;448;993;;;;;diagr;54;241;;;-44;0;0
 - t30;408;786;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;reste;2;2
;;;;;;;;;;;;total;18;210
&lt;/pre&gt;

====blo  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_négatifs_S-|blo intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
blo;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;1;;2;;;;2;;;;;;1;;;1;;1;;;1;;;;;;1;;;;1;;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;2;16
continu;52;0;0;109;0;1;1;8;0;3;9;0;0;10;0;1;7;0;2;2;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;212
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;blo;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;1;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;18
;Sc-;52;0;0;109;0;1;1;8;0;3;9;0;0;10;0;1;7;0;2;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;210
&lt;/pre&gt;

====blo autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_autres_intercalaires|blo autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
blo;autres intercalaires;;adresses1;;;blo;autres intercalaires;;adresses2;;;blo;autres intercalaires;;adresses3;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;54774;6;comp;;deb;°CDS;840296;192;comp;;deb;°CDS;1645027;314;comp
;regulatory;55434;84;comp;;;&amp;tRNA;841058;158;comp;;;&amp;tRNA;1646838;130;comp
fin;°CDS;55670;;;;fin;°CDS;841295;;comp;;fin;°CDS;1647042;;comp
deb;°CDS;114598;163;;;deb;°CDS;884674;174;comp;;deb;°CDS;1704570;578;comp
;&amp;tRNA;115187;231;;;;regulatory;885043;70;comp;;;$rRNA;1705904;431;
fin;°CDS;115492;;;;fin;°CDS;885217;;comp;;;$rRNA;1707861;170;
deb;°CDS;139965;-10;comp;;deb;°CDS;902480;104;comp;;;$rRNA;1711097;866;
;regulatory;140900;336;comp;;;regulatory;903184;90;comp;;;$rRNA;1712080;431;
fin;°CDS;141345;;;;fin;°CDS;903379;;comp;;;$rRNA;1714037;170;
deb;°CDS;158126;618;;;deb;°CDS;935658;336;comp;;;$rRNA;1717273;251;
;$rRNA;159245;432;;;;&amp;tRNA;937056;149;;;fin;°CDS;1717641;;comp
;$rRNA;161203;170;;;fin;°CDS;937281;;;;deb;°CDS;1769786;55;
;$rRNA;164439;188;;;deb;°CDS;980173;251;comp;;;&amp;tRNA;1769952;329;
fin;°CDS;164744;;comp;;;&amp;tRNA;981180;76;comp;;fin;°CDS;1770354;;
deb;°CDS;205431;187;;;fin;°CDS;981330;;;;deb;°CDS;1904329;130;
;tmRNA;206548;238;;;deb;°CDS;1200444;288;comp;;;&amp;tRNA;1905665;37;
deb;°CDS;207183;-17;comp;;;&amp;tRNA;1202433;87;;;fin;°CDS;1905778;;
;&amp;tRNA;207388;154;comp;;;&amp;tRNA;1202593;192;;;deb;°CDS;1907638;573;
fin;°CDS;207612;;comp;;fin;°CDS;1202866;;;;;$rRNA;1908904;431;
deb;°CDS;327271;8;;;deb;°CDS;1206664;206;comp;;;$rRNA;1910861;170;
;ncRNA;327873;493;comp;;;&amp;tRNA;1208139;167;;;;$rRNA;1914097;375;
fin;°CDS;328741;;;;fin;°CDS;1208379;;comp;;fin;°CDS;1914589;;
deb;°CDS;381615;190;;;deb;°CDS;1263240;256;comp;;deb;°CDS;1935774;178;
;&amp;tRNA;382849;43;comp;;;&amp;tRNA;1264393;48;comp;;;&amp;tRNA;1936132;519;
;&amp;tRNA;382968;284;comp;;;&amp;tRNA;1264514;46;comp;;fin;°CDS;1936725;;
fin;°CDS;383325;;;;;&amp;tRNA;1264632;193;comp;;deb;°CDS;1969854;309;comp
deb;°CDS;439838;-39;;;fin;°CDS;1264898;;;;;&amp;tRNA;1971396;1;
;&amp;tRNA;440078;558;comp;;deb;°CDS;1279836;365;comp;;;&amp;tRNA;1971479;4;
fin;°CDS;440709;;;;;&amp;tRNA;1280591;97;comp;;;&amp;tRNA;1971555;61;
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;&amp;tRNA;503549;27;;;deb;°CDS;1294216;215;comp;;deb;°CDS;1978293;71;
;&amp;tRNA;503649;41;;;;&amp;tRNA;1295466;433;;;;&amp;tRNA;1979312;376;
;&amp;tRNA;503761;48;;;fin;°CDS;1295976;;;;fin;°CDS;1979775;;
;&amp;tRNA;503881;31;;;deb;°CDS;1349627;113;comp;;deb;°CDS;2014827;397;
;&amp;tRNA;503985;148;;;;&amp;tRNA;1350001;199;comp;;;&amp;tRNA;2016025;327;
fin;°CDS;504209;;;;fin;°CDS;1350274;;comp;;fin;°CDS;2016437;;
deb;°CDS;518814;64;;;deb;°CDS;1387168;75;comp;;deb;°CDS;2045606;179;
;&amp;tRNA;521008;216;;;;&amp;tRNA;1388878;175;comp;;;&amp;tRNA;2047072;245;
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;&amp;tRNA;648764;60;;;;&amp;tRNA;1410594;469;;;;&amp;tRNA;2068640;204;comp
fin;°CDS;648912;;;;fin;°CDS;1411148;;comp;;fin;°CDS;2068918;;
deb;°CDS;745690;187;comp;;deb;°CDS;1424162;142;comp;;deb;°CDS;2084303;271;comp
;&amp;tRNA;747296;29;comp;;;&amp;tRNA;1424793;39;comp;;;&amp;tRNA;2085402;69;comp
;&amp;tRNA;747399;117;comp;;;&amp;tRNA;1424907;-8;comp;;fin;°CDS;2085543;;comp
fin;°CDS;747590;;comp;;fin;°CDS;1424972;;;;deb;°CDS;2086731;224;
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;&amp;tRNA;775646;94;;;;ncRNA;1448136;433;comp;;;&amp;tRNA;2088090;519;
fin;°CDS;775811;;;;fin;°CDS;1448664;;;;fin;°CDS;2088685;;comp
deb;°CDS;777792;218;;;deb;°CDS;1477877;47;comp;;deb;°CDS;2108837;333;comp
;&amp;tRNA;778709;89;;;;regulatory;1479277;128;comp;;;&amp;tRNA;2110850;422;
;&amp;tRNA;778871;206;;;fin;°CDS;1479502;;comp;;fin;°CDS;2111349;;
fin;°CDS;779150;;;;deb;°CDS;1523012;62;;;deb;°CDS;2129279;117;
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;&amp;tRNA;793729;467;;;fin;°CDS;1524290;;comp;;fin;°CDS;2130837;;
fin;°CDS;794270;;;;deb;°CDS;1533182;306;;;deb;°CDS;2170074;253;comp
deb;°CDS;803537;67;comp;;;&amp;tRNA;1534802;871;;;;&amp;tRNA;2171440;156;
;&amp;tRNA;804390;204;comp;;fin;°CDS;1535759;;;;fin;°CDS;2171669;;
fin;°CDS;804668;;;;deb;°CDS;1605867;102;;;;;;;
;;;;;;;&amp;tRNA;1606163;42;;;;;;;
;;;;;;;&amp;tRNA;1606279;356;;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;1606708;;comp;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====blo intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_tRNA|blo intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
comp’;aas;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
*;;;163;;231;;'''-17;60;;
;;;-17;;154;;24;61;'''deb;
;43;comp’;190;comp’;284;;65;69;&lt;201;15
;;comp’;-39;comp’;558;;67;74;total;26
;27 41 48 31;comp’;159;;148;;71;94;taux;58%
;;;24;;216;;75;117;;
;;comp’;95;;60;;102;130;'''fin;
;29;;187;;117;;113;137;&lt;201;15
;;;116;;94;;116;148;total;26
;89;;218;;206;;117;149;taux;58%
;;;212;;467;;142;154;;
;;;67;comp’;204;;163;156;'''total;
;;;192;;158;;179;158;&lt;201;30
;;comp’;336;;149;;187;192;total;52
;;;251;comp’;76;;192;199;taux;58%
;87;comp’;288;;192;;212;206;;
;;comp’;206;comp’;167;;218;216;;
;48 46;;256;comp’;193;;222;231;;
;;;365;comp’;97;;224;245;;
;;comp’;215;;433;;251;327;;
;;;113;;199;;256;329;;
;;;75;comp’;175;;271;376;;
;;comp’;580;comp’;469;;306;422;;
;39;;142;comp’;-8;;314;433;;
;;comp’;62;;74;;365;467;;
;;;306;;871;;397;871;'''comp’;'''cumuls
;42;;102;comp’;356;;'''-39;'''-8;'''deb;
;;;314;;130;;62;76;&lt;201;5
;;;65;;329;;95;97;total;13
;1  4;comp’;309;;61;;159;167;taux;38%
;;;71;;376;;190;175;'''fin;
;;;397;;327;;206;193;&lt;201;6
;;;179;;245;;215;204;total;13
;;;222;comp’;204;;253;204;taux;46%
;;;271;;69;;288;284;;
;47;;224;comp’;519;;309;356;'''total;
;;comp’;333;;422;;333;469;&lt;201;11
;;;117;;137;;336;519;total;26
;;comp’;253;;156;;580;558;taux;42%
;;;;;;;;;;
;;deb;fin;total;;;;;;
;&lt;201;20;21;41;;;;;;
;total;39;39;78;;;;;;
;taux;51%;54%;53%;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===sma===
====sma opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_opérons|sma opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Stre_aver_MA_4680_NBRC_14893/streAver_MA_4680_NBRC_14893-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_003155.5;sma;;;;
70%GC;30.6.19 Paris;16s  6;74;doubles;intercalaires
;Streptomyces avermitilis MA-4680;;;;
;357776..357847;;gtg;;
;;;;;
comp;1219274..1219346;;gga;;
;;;;;
comp;1225751..1225823;;gga;;
;;;;;
;1675869..1675942;;atgf;;
;;;;;
comp;1965347..1965423;;ccc;;
;;;;;
comp;1992012..1992088;;ccc;;
;;;;;
comp;2222599..2222686;;ctc;;
;;;;;
comp;3072632..3072707;;acc;;
;;;;;
comp;3073568..3073684;;5s;@1;84
comp;3073769..3076918;;23s;;288
comp;3077207..3078737;;16s;;
;;;;;
comp;3295252..3295324;;gag;+;20
comp;3295345..3295416;;cag;3 gag ;21
comp;3295438..3295510;;gag;2 cag;62
comp;3295573..3295645;;gag;;42
comp;3295688..3295759;;cag;;
;;;;;
;3655871..3655942;;cgg;;
;;;;;
comp;3813093..3813166;;atgf;;
;;;;;
comp;3815457..3815530;;atgf;;
;;;;;
comp;4362610..4362695;;tta;;
;;;;;
;4410534..4410608;;caa;;
;;;;;
comp;4542466..4542542;;gcg;;
;;;;;
;4589760..4589835;;agg;;
;;;;;
comp;4886830..4886906;;aca;;
;;;;;
comp;5024109..5024225;;5s;;84
comp;5024310..5027458;;23s;;288
comp;5027747..5029277;;16s;;
;;;;;
comp;5051970..5052043;;atgf;;
;;;;;
comp;5055486..5055561;;aaa;;
;;;;;
;5063087..5063159;;gaa;;47
;5063207..5063281;;gac;;24
;5063306..5063382;;ttc;;
;;;;;
;5068123..5068197;;gac;;
;;;;;
;5081640..5081711;;gga;;79
;5081791..5081866;;ggc;;
;;;;;
;5085779..5085854;;ggc;;
;;;;;
;5095224..5095311;;tcc;;
;;;;;
;5129698..5129782;;tcg;;
;;;;;
comp;5154937..5155009;;cgt;;205
comp;5155215..5155305;;agc;;
;;;;;
comp;5177691..5177777;;tca;;
;;;;;
comp;5206939..5207028;;agc;;
;;;;;
comp;5299302..5299378;;atc;;
;;;;;
;5304905..5304977;;gca;;
;;;;;
;5322106..5322192;;ctg;;
;;;;;
comp;5452769..5452842;;ggg;;
;;;;;
comp;5594481..5594554;;ccg;;
;;;;;
;5650316..5650389;;acg;;
;;;;;
;5759342..5760872;;16s;;288
;5761161..5764309;;23s;;84
;5764394..5764510;;5s;;
;;;;;
;5950170..5950251;;tac;;
;;;;;
;5956602..5956674;;acc;;46
;5956721..5956793;;atg;;
;;;;;
;5964532..5964607;;tgg;;
;;;;;
;6124386..6125916;;16s;;288
;6126205..6129353;;23s;;84
;6129438..6129554;;5s;;
;;;;;
comp;6242261..6242335;;tgc;;
;;;;;
comp;6279029..6279112;;cta;;
;;;;;
comp;6329202..6329278;;aag;;
;;;;;
comp;6335068..6335141;;aag;;
;;;;;
comp;6349312..6349385;;aag;;
;;;;;
comp;6372705..6372777;;cac;;
;;;;;
comp;6501509..6501584;;aga;;
;;;;;
comp;6604435..6604508;;gga;;153
comp;6604662..6604738;;cca;;
;;;;;
;6653846..6653918;;gcc;;
;;;;;
;6658303..6658375;;gcc;;
;;;;;
;6875603..6875675;;aac;+;5
;6875681..6875753;;aac;2 aac;166
;6875920..6875996;;atgi;;
;;;;;
;7021984..7022058;;gta;;
;;;;;
;7025336..7025415;;gtg;;
;;;;;
comp;7471270..7471342;;ttg;;
;;;;;
;7765513..7767043;;16s;;284
;7767328..7770477;;23s;;133
;7770611..7770727;;5s;;
;;;;;
comp;7937463..7937550;;ctc;;
;;;;;
comp;8122352..8122426;;gtc;+;40
comp;8122467..8122538;;gtc;3 gtc;19
comp;8122558..8122629;;gtc;;1
comp;8122631..8122704;;tgc;;38
comp;8122743..8122815;;ggc;;
;;;;;
;8129564..8129635;;gtg;;
;;;;;
;8139938..8140012;;gtg;;
;;;;;
;8328596..8330126;;16s;;288
;8330415..8333563;;23s;;84
;8333648..8333764;;5s;;
;;;;;
;8576989..8577062;;ccc;;
&lt;/pre&gt;

====sma cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_cumuls|sma cumuls]]
&lt;pre&gt;
sma cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;6;1;1;-
;16 23 5s 0;6;20;3;
;16 atc gca;0;40;4;
;16 23 5s a;0;60;3;
;max a;0;80;2;
;a doubles;0;100;0;
;spéciaux;0;120;0;
;total aas;0;140;0;
sans ;opérons;56;160;1;
;1 aa;48;180;1;
;max a;5;200;0;
;a doubles;3;;1;
;total aas;72;;16;0
total aas;;72;;;
remarques;;1;;;
avec jaune;;;moyenne;61;
;;;variance;61;
sans jaune;;;moyenne;34;
;;;variance;22;
&lt;/pre&gt;

====sma blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_blocs|sma blocs]]
&lt;pre&gt;
sma blocs;;;;;;
5s;84;117;84;117;288;1531
23s;288;3150;288;3149;84;3149
16s;;1531;;1531;;117
;;;;;;
16s;288;1531;284;1531;288;1531
23s;84;3149;133;3150;84;3149
5s;;117;;117;;117
&lt;/pre&gt;
====sma remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_remarques|sma remarques]]

====sma données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_données_intercalaires|sma données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;sma;fx;fc;sma;fx40;fc40;sma;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;1;0;9;11;0;9;11;-1;0;126;116;509;CDS 16s;;
;0;10;75;332;1;10;35;-2;4;0;467;132;615;852;
;0;20;67;220;2;3;44;-3;0;0;1265;480;653;675;
;1;30;85;143;3;13;35;-4;15;752;179;36;607;;
2;2;40;73;167;4;14;34;-5;0;0;403;84;641;;
3;1;50;86;141;5;3;47;-6;2;1;430;99;16s 23s;;
5;0;60;86;121;6;9;25;-7;2;12;563;198;5* 312;;
;3;70;78;135;7;9;22;-8;5;56;83;682;308;;
3;0;80;101;144;8;7;27;-9;0;0;91;176;23s 5s;;
1;2;90;101;123;9;3;27;-10;1;7;210;58;5* 89;;
4;3;100;85;131;10;4;36;-11;9;20;229;49;138;;
2;4;110;86;144;11;5;29;-12;0;0;44;57;5s CDS;;
1;6;120;83;122;12;9;22;-13;3;7;112;387;114;114;
2;0;130;91;136;13;5;25;-14;12;9;568;-3;134;;
4;1;140;77;123;14;3;32;-15;3;0;118;183;77;;
1;3;150;84;119;15;10;21;-16;1;5;416;422;144;;
1;0;160;71;111;16;5;21;-17;3;8;426;376;150;;
1;1;170;71;94;17;4;15;-18;3;0;504;56;tRNA tRNA;;
1;1;180;62;75;18;13;13;-19;4;5;112;236;37;;other
4;4;190;73;79;19;6;27;-20;7;11;218;51;37;;other
1;2;200;61;72;20;7;15;-21;0;0;143;116;34;;other
;1;210;59;68;21;11;15;-22;4;1;149;216;**;;tct
1;1;220;41;62;22;6;17;-23;4;4;186;133;20;;gag
2;1;230;45;58;23;7;13;-24;1;0;94;136;21;;cag
1;0;240;52;61;24;12;14;-25;0;4;186;40;62;;gag
1;0;250;51;69;25;8;12;-26;2;3;200;334;42;;gag
;1;260;54;40;26;7;21;-27;0;0;170;182;**;;cag
2;2;270;45;45;27;10;13;-28;0;2;23;408;47;;gaa
;0;280;32;34;28;12;13;-29;2;2;270;520;24;;gac
;1;290;31;50;29;8;18;-30;1;0;65;131;**;;ttc
;1;300;28;40;30;4;7;-31;2;2;183;340;79;;gga
2;0;310;31;41;31;7;17;-32;2;1;294;269;**;;ggc
;0;320;30;30;32;3;23;-33;1;0;63;719;205;;cgt
;0;330;24;41;33;8;16;-34;2;2;256;50;**;;agc
2;0;340;24;31;34;7;20;-35;2;1;120;223;46;;acc
;0;350;27;19;35;4;22;-36;2;0;33;372;**;;atgj
;0;360;20;29;36;7;17;-37;0;1;108;249;-;153;gga
;0;370;20;23;37;9;11;-38;1;1;1408;80;**;;cca
3;0;380;24;25;38;5;13;-39;3;0;88;305;5;;aac
1;0;390;25;33;39;13;13;-40;2;1;107;44;166;;aac
;1;400;13;23;40;10;15;-41;3;1;148;229;**;;atgi
7;12;reste;300;329;reste;2272;3021;-42;1;0;64;58;40;;gtc
59;56;total;2581;3894;total;2581;3894;-43;2;1;131;104;19;;gtc
51;43;diagr;2272;3554;diagr;300;862;-44;0;1;-10;166;1;;gtc
0;1; t30;227;695;;;;-45;0;0;191;310;38;;tgc
;;;;;;;;-46;1;0;117;377;**;;ggc
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;185;97;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;97;147;;;
;x;2572;135;9;2716;;;-49;0;2;424;128;;;
;c;3883;1077;11;4971;;;-50;0;3;400;181;;;
;;;;;7687;164;;reste;23;24;105;267;;;
;;;;;;7851;;total;135;1077;261;92;;;
;;;;;;;;;;;105;97;;;
;;;;;;;;;;;544;101;;;
;;;;;;;;;;;39;187;;;
;;;;;;;;;;;285;127;;;
;;;;;;;;;;;;155;;;
;;;;;;;;;;;;76;;;
;;;;;;;;;;;;76;;;
&lt;/pre&gt;
=====sma autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_autres_intercalaires_aas|sma autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;sma;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;357102;357266;509;*;
;;tRNA;357776;357847;116;*;gtg
fin;;CDS;357964;359805;;;
deb;;CDS;615881;616378;467;*;
;;tRNA;616846;616941;1265;*;tcg
fin;;CDS;618207;618728;;;
deb;;CDS;1218971;1219141;132;*;
;comp;tRNA;1219274;1219346;480;*;gga
fin;;CDS;1219827;1220234;;;
deb;;CDS;1674937;1675689;179;*;
;;tRNA;1675869;1675942;36;*;atgf
fin;comp;CDS;1675979;1676188;;0;
deb;;CDS;1964411;1965265;84;*;
;comp;tRNA;1965350;1965423;99;*;ccc
fin;;CDS;1965523;1966050;;;
deb;comp;CDS;1990145;1991611;403;*;
;comp;tRNA;1992015;1992088;198;*;ccc
fin;;CDS;1992287;1992997;;;
deb;comp;CDS;2220285;2222168;430;*;
;comp;tRNA;2222599;2222686;682;*;ctc
fin;;CDS;2223369;2223569;;0;
deb;comp;CDS;2801738;2802733;176;*;
;;tRNA;2802910;2803004;37;*;other
;;tRNA;2803042;2803136;37;*;other
;;tRNA;2803174;2803268;34;*;other
;;tRNA;2803303;2803400;563;*;tct
fin;;CDS;2803964;2804761;;;
deb;;CDS;3069826;3072573;58;*;
;comp;tRNA;3072632;3072707;83;*;acc
deb;comp;CDS;3072791;3073453;114;*;
;comp;rRNA;3073568;3073684;89;*;117
;comp;rRNA;3073774;3076897;312;*;3124
;comp;rRNA;3077210;3078735;615;*;1526
fin;comp;CDS;3079351;3081036;;;
deb;;CDS;3294558;3295202;49;*;
;comp;tRNA;3295252;3295324;20;*;gag
;comp;tRNA;3295345;3295416;21;*;cag
;comp;tRNA;3295438;3295510;62;*;gag
;comp;tRNA;3295573;3295645;42;*;gag
;comp;tRNA;3295688;3295759;91;*;cag
fin;comp;CDS;3295851;3296585;;;
deb;comp;CDS;3655220;3655813;57;*;
;;tRNA;3655871;3655942;387;*;cgg
fin;comp;CDS;3656330;3657742;;;
deb;;CDS;3812904;3813095;-3;*;
;comp;tRNA;3813093;3813166;210;*;atgf
deb;comp;CDS;3813377;3815227;229;*;
;comp;tRNA;3815457;3815530;44;*;atgf
fin;comp;CDS;3815575;3818571;;0;
deb;;CDS;4361587;4362429;183;*;
;comp;tRNA;4362613;4362695;422;*;tta
fin;;CDS;4363118;4363888;;;
deb;comp;CDS;4408838;4410157;376;*;
;;tRNA;4410534;4410605;112;*;caa
fin;;CDS;4410718;4412166;;;
deb;comp;CDS;4541721;4541900;568;*;
;comp;tRNA;4542469;4542542;118;*;gcg
fin;comp;CDS;4542661;4544010;;;
deb;;CDS;4588309;4589343;416;*;
;;tRNA;4589760;4589835;426;*;agg
fin;;CDS;4590262;4590483;;0;
deb;;CDS;4885883;4886776;56;*;
;comp;tRNA;4886833;4886906;236;*;aca
fin;;CDS;4887143;4888279;;;
deb;comp;CDS;5023429;5023974;134;*;
;comp;rRNA;5024109;5024225;89;*;117
;comp;rRNA;5024315;5027437;312;*;3123
;comp;rRNA;5027750;5029275;653;*;1526
fin;comp;CDS;5029929;5030477;;0;
deb;comp;CDS;5050422;5051465;504;*;
;comp;tRNA;5051970;5052043;112;*;atgf
fin;comp;CDS;5052156;5053286;;0;
deb;comp;CDS;5054956;5055270;218;*;
;comp;tRNA;5055489;5055561;143;*;aaa
fin;comp;CDS;5055705;5057240;;;
deb;;CDS;5061300;5062937;149;*;
;;tRNA;5063087;5063159;47;*;gaa
;;tRNA;5063207;5063281;24;*;gac
;;tRNA;5063306;5063379;186;*;ttc
fin;;CDS;5063566;5063820;;;
deb;;CDS;5064051;5068028;94;*;
;;tRNA;5068123;5068197;186;*;gac
fin;;CDS;5068384;5068575;;0;
deb;;CDS;5081122;5081439;200;*;
;;tRNA;5081640;5081711;79;*;gga
;;tRNA;5081791;5081866;170;*;ggc
fin;;CDS;5082037;5083050;;;
deb;;CDS;5085108;5085755;23;*;
;;tRNA;5085779;5085854;51;*;ggc
fin;comp;CDS;5085906;5086805;;;
deb;comp;CDS;5092525;5094970;83;*;
;comp;ncRNA;5095054;5095152;71;*;
;;tRNA;5095224;5095311;270;*;tcc
fin;;CDS;5095582;5098305;;;
deb;;CDS;5129099;5129632;65;*;
;;tRNA;5129698;5129782;183;*;tcg
fin;;CDS;5129966;5130373;;;
deb;;CDS;5154416;5154820;116;*;
;comp;tRNA;5154937;5155009;205;*;cgt
;comp;tRNA;5155215;5155305;216;*;agc
fin;;CDS;5155522;5155989;;;
deb;;CDS;5170356;5170676;133;*;
;comp;tRNA;5170810;5170919;294;*;tca
fin;comp;CDS;5171214;5171450;;;
deb;;CDS;5177342;5177554;136;*;
;comp;tRNA;5177691;5177777;63;*;tca
fin;comp;CDS;5177841;5179259;;0;
deb;;CDS;5206071;5206901;40;*;
;comp;tRNA;5206942;5207028;256;*;agc
fin;comp;CDS;5207285;5207524;;;
deb;;CDS;5298444;5299181;120;*;
;;tRNA;5299302;5299378;334;*;atc
fin;comp;CDS;5299713;5300060;;0;
deb;comp;CDS;5304174;5304722;182;*;
;;tRNA;5304905;5304977;408;*;gca
fin;comp;CDS;5305386;5306087;;0;
deb;comp;CDS;5320728;5321585;520;*;
;;tRNA;5322106;5322189;131;*;ctg
fin;comp;CDS;5322321;5322974;;0;
deb;;CDS;5451109;5452428;340;*;
;comp;tRNA;5452769;5452842;269;*;ggg
fin;;CDS;5453112;5453279;;;
deb;;CDS;5593279;5593761;719;*;
;comp;tRNA;5594481;5594554;33;*;ccg
fin;comp;CDS;5594588;5595373;;;
deb;;CDS;5648606;5650207;108;*;
;;tRNA;5650316;5650389;50;*;acg
fin;comp;CDS;5650440;5651066;;0;
deb;comp;CDS;5757496;5758491;852;*;
;;rRNA;5759344;5760869;312;*;1526
;;rRNA;5761182;5764304;89;*;3123
;;rRNA;5764394;5764510;77;*;117
fin;;CDS;5764588;5765232;;;
deb;comp;CDS;5949458;5949946;223;*;
;;tRNA;5950170;5950251;1408;*;tac
fin;;CDS;5951660;5951977;;0;
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;;tRNA;5956602;5956674;46;*;acc
;;tRNA;5956721;5956793;88;*;atgj
fin;;CDS;5956882;5957046;;;
deb;comp;CDS;5963056;5964282;249;*;
;;tRNA;5964532;5964604;107;*;tgg
fin;;CDS;5964712;5964999;;;
deb;;CDS;6122773;6123780;607;*;
;;rRNA;6124388;6125913;312;*;1526
;;rRNA;6126226;6129348;89;*;3123
;;rRNA;6129438;6129554;114;*;117
fin;comp;CDS;6129669;6130979;;;
deb;;CDS;6202121;6202654;102;*;
;;tmRNA;6202757;6203145;383;*;
fin;;CDS;6203529;6204158;;0;
deb;;CDS;6240993;6242183;80;*;
;comp;tRNA;6242264;6242335;305;*;tgc
fin;;CDS;6242641;6244095;;;
deb;;CDS;6278382;6278984;44;*;
;comp;tRNA;6279029;6279112;148;*;cta
fin;comp;CDS;6279261;6280244;;0;
deb;comp;CDS;6328439;6329140;64;*;
;comp;tRNA;6329205;6329278;229;*;aag
fin;;CDS;6329508;6330707;;;
deb;;CDS;6333360;6335009;58;*;
;comp;tRNA;6335068;6335141;131;*;aag
fin;comp;CDS;6335273;6336031;;;
deb;;CDS;6347684;6349207;104;*;
;comp;tRNA;6349312;6349385;-10;*;aag
fin;comp;CDS;6349376;6350023;;;
deb;comp;CDS;6372118;6372513;191;*;
;comp;tRNA;6372705;6372777;117;*;cac
fin;comp;CDS;6372895;6373497;;;
deb;;CDS;6500479;6501345;166;*;
;comp;tRNA;6501512;6501584;310;*;aga
fin;;CDS;6501895;6503502;;;
deb;;CDS;6603863;6604057;377;*;
;comp;tRNA;6604435;6604508;153;*;gga
;;tRNA;6604662;6604738;185;*;cca
fin;;CDS;6604924;6606315;;;
deb;;CDS;6653086;6653748;97;*;
;;tRNA;6653846;6653918;97;*;gcc
fin;comp;CDS;6654016;6654909;;0;
deb;comp;CDS;6656953;6658155;147;*;
;;tRNA;6658303;6658375;128;*;gcc
fin;comp;CDS;6658504;6660114;;;
deb;comp;CDS;6875107;6875421;181;*;
;;tRNA;6875603;6875675;5;*;aac
;;tRNA;6875681;6875753;166;*;aac
;;tRNA;6875920;6875993;424;*;atgi
fin;;CDS;6876418;6876726;;0;
deb;comp;CDS;7020916;7021716;267;*;
;;tRNA;7021984;7022058;92;*;gta
fin;comp;CDS;7022151;7022579;;0;
deb;;CDS;7024786;7024941;400;*;
;;tRNA;7025342;7025415;97;*;gtg
fin;comp;CDS;7025513;7025833;;;
deb;;CDS;7092672;7093520;145;*;
;;ncRNA;7093666;7094071;529;*;
fin;comp;CDS;7094601;7095764;;;
deb;comp;CDS;7470385;7471164;105;*;
;comp;tRNA;7471270;7471342;101;*;ttg
fin;;CDS;7471444;7472100;;0;
deb;;CDS;7764232;7764873;641;*;
;;rRNA;7765515;7767040;308;*;1526
;;rRNA;7767349;7770472;138;*;3124
;;rRNA;7770611;7770727;144;*;117
fin;;CDS;7770872;7772263;;;
deb;comp;CDS;7933326;7937201;261;*;
;comp;tRNA;7937463;7937550;187;*;ctc
fin;;CDS;7937738;7939063;;;
deb;;CDS;8121931;8122224;127;*;
;comp;tRNA;8122352;8122426;40;*;gtc
;comp;tRNA;8122467;8122538;19;*;gtc
;comp;tRNA;8122558;8122629;1;*;gtc
;comp;tRNA;8122631;8122704;38;*;tgc
;comp;tRNA;8122743;8122815;155;*;ggc
fin;;CDS;8122971;8124014;;;
deb;;CDS;8129024;8129458;105;*;
;;tRNA;8129564;8129635;544;*;gtg
fin;;CDS;8130180;8131466;;;
deb;;CDS;8139440;8139898;39;*;
;;tRNA;8139938;8140009;76;*;gtg
fin;comp;CDS;8140086;8140811;;0;
deb;comp;CDS;8327473;8327922;675;*;
;;rRNA;8328598;8330123;312;*;1526
;;rRNA;8330436;8333558;89;*;3123
;;rRNA;8333648;8333764;150;*;117
fin;;CDS;8333915;8334523;;;
deb;;CDS;8575186;8576703;285;*;
;;tRNA;8576989;8577062;76;*;ccc
fin;comp;CDS;8577139;8577675;;0;
&lt;/pre&gt;

====sma distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#sma_distribution|sma distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;4;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;2;ccc;3;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;2;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;2;;gtc;3;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;1;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;1;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;3;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;4;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;2;ggg;
actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
sma;;48;;;;;;;sma;17;;;;;;;;sma;7;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===ksk===
====ksk opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_opérons|ksk opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Kita_seta_KM_6054/kitaSeta_KM_6054-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_016109.1;ksk;;;;
72%GC;30.6.19 Paris;16s  9;74;doubles;intercalaires
;Kitasatospora setae KM-6054;;;;
comp;631024..631098;;act;;
;;;;;
;976172..976245;;tgc;;
;;;;;
comp;1615691..1615765;;gtg;+;206
comp;1615972..1616046;;gtg;2 gtg;
;;;;;
;1621501..1621576;;ggc;;76
;1621653..1621726;;tgc;;36
;1621763..1621834;;gtc;+;34
;1621869..1621940;;gtc;3 gtc;37
;1621978..1622052;;gtc;;
;;;;;
comp;1707344..1707460;;5s;@1;73
comp;1707534..1710667;;23s;;267
comp;1710935..1712463;;16s;;
;;;;;
comp;1888620..1888736;;5s;;73
comp;1888810..1891942;;23s;;267
comp;1892210..1893738;;16s;;
;;;;;
;1970574..1970661;;ctc;;
;;;;;
;2264495..2264580;;ttg;;
;;;;;
comp;2741186..2741257;;gta;;
;;;;;
comp;2788071..2788147;;atgi;;
;;;;;
comp;2790422..2790494;;aac;+;5
comp;2790500..2790572;;aac;2 aac;
;;;;;
comp;2887231..2887303;;gcc;+;269
comp;2887573..2887645;;gcc;3 gcc;38
comp;2887684..2887756;;gcc;@2;
;;;;;
comp;2932411..2932487;;cca;;151
direct;2932639..2932712;;gga;;
;;;;;
comp;2982955..2983071;;5s;;73
comp;2983145..2986276;;23s;;266
comp;2986543..2988071;;16s;;
;;;;;
;3018063..3018138;;cac;;
;;;;;
;3036654..3036730;;aag;;
;;;;;
;3044201..3044277;;aag;;
;;;;;
;3111827..3111900;;aag;;129
;3112030..3112103;;aag;;
;;;;;
;3157748..3157834;;cta;;
;;;;;
;3210241..3210315;;tgc;;
;;;;;
comp;3289891..3290007;;5s;;73
comp;3290081..3293213;;23s;;267
comp;3293481..3295009;;16s;;
;;;;;
comp;3608705..3608777;;tgg;;
;;;;;
comp;3616894..3616969;;atgj;;42
comp;3617012..3617084;;acc;;
;;;;;
comp;3618677..3618757;;tac;;
;;;;;
comp;3851412..3851488;;aca;;
;;;;;
comp;3987214..3987290;;acg;;
;;;;;
;4071208..4071281;;ccg;;
;;;;;
;4095099..4095186;;tcc;;
;;;;;
;4142544..4142633;;tcg;;
;;;;;
comp;4160864..4160939;;cgt;+;35
comp;4160975..4161050;;cgt;2 cgt;240
comp;4161291..4161381;;agc;@;
;;;;;
comp;4177523..4177608;;tca;;
;;;;;
comp;4240397..4240470;;ggg;;
;;;;;
;4285828..4285900;;ggc;+;51
;4285952..4286027;;ggc;2 ggc;
;;;;;
;4383368..4383444;;atc;;
;;;;;
;4385556..4385631;;gca;;
;;;;;
;4401492..4401575;;ctg;;
;;;;;
comp;4622975..4623048;;gac;;
;;;;;
comp;4640883..4640959;;ttc;;34
comp;4640994..4641067;;gac;;42
comp;4641110..4641182;;gaa;;
;;;;;
;4651832..4651904;;aaa;;
;;;;;
comp;4773547..4773620;;atgf;;
;;;;;
comp;4774128..4774201;;atgf;;
;;;;;
;4796510..4798038;;16s;;267
;4798306..4801439;;23s;;71
;4801511..4801627;;5s;;
;;;;;
;5027433..5027508;;agg;;
;;;;;
;5076388..5076464;;gcg;;
;;;;;
;5123784..5123856;;acc;;
;;;;;
;5132819..5132892;;caa;;
;;;;;
comp;5216466..5216550;;tta;;
;;;;;
;5430075..5430148;;atgf;;
;;;;;
comp;5530949..5531020;;cgg;;
;;;;;
;5714968..5715039;;cag;;21
;5715061..5715133;;gag;+;38
;5715172..5715244;;gag;3 gag;13
;5715258..5715330;;gag;2 cag;4
;5715335..5715409;;cag;;
;;;;;
;5853168..5854696;;16s;;256
;5854953..5858085;;23s;;73
;5858159..5858275;;5s;;
;;;;;
;5932168..5933696;;16s;;256
;5933953..5937085;;23s;;71
;5937157..5937273;;5s;;
;;;;;
;6074082..6075610;;16s;;264
;6075875..6079006;;23s; ;73
;6079080..6079196;;5s;;
;;;;;
comp;6104344..6104419;;aga;;
;;;;;
;6400221..6401749;;16s;;267
;6402017..6405146;;23s; ;106
;6405253..6405369;;5s;;
;;;;;
;6485836..6485909;;ccc;;
;;;;;
;7355279..7355354;;tgc;;19
;7355374..7355449;;ggc;;
;;;;;
comp;7461078..7461165;;ctc;;
&lt;/pre&gt;

====ksk cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_cumuls|ksk cumuls]]
&lt;pre&gt;
ksk cumuls;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs
avec rRNA;opérons;9;1;0;-
;16 23 5s 0;9;20;4;
;16 atc gca;0;40;8;
;16 23 5s a;0;60;3;
;max a;0;80;1;
;a doubles;0;100;0;
;spéciaux;0;120;0;
;total aas;0;140;1;
sans ;opérons;49;160;1;
;1 aa;37;180;0;
;max a;5;200;0;
;a doubles;7;;3;
;total aas;70;;21;0
total aas;;70;;;
remarques;;2;;;
avec jaune;;;moyenne;72;
;;;variance;79;
sans jaune;;;moyenne;33;
;;;variance;18;
&lt;/pre&gt;

====ksk blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_blocs|ksk blocs]]
&lt;pre&gt;
ksk blocs;;;;;;
;;;;;;
5s;73;117;73;117;73;117
23s;267;3134;267;3133;266;3132
16s;;1529;;1529;;1529
;;;;;;
16s;73;117;267;1529;256;1529
23s;267;3133;71;3134;73;3133
5s;;1529;;117;;117
;;;;;;
16s;256;1529;264;1529;267;1529
23s;71;3133;73;3132;106;3130
5s;;117;;117;;117
&lt;/pre&gt;
====ksk remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_remarques|ksk remarques]]

====ksk données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_données_intercalaires|ksk données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;ksk;fx;fc;ksk;fx40;fc40;ksk;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa
1;1;0;7;4;0;7;4;-1;0;107;188;214;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;
1;0;10;98;244;1;2;28;-2;1;0;140;967;619;672;;35;;other
;1;20;92;147;2;1;40;-3;0;1;66;108;525;734;;**;;other
;1;30;100;126;3;4;26;-4;12;663;71;462;645;;;209;;gtg
;1;40;93;170;4;4;29;-5;0;0;108;303;553;;;**;;gtg
2;0;50;75;173;5;3;38;-6;0;1;92;240;452;;;79;;ggc
;3;60;101;159;6;10;16;-7;7;10;156;551;405;;;36;;tgc
3;2;70;104;153;7;47;13;-8;1;45;254;1;611;;;34;;gtc
5;2;80;118;172;8;3;12;-9;1;0;114;92;16s 23s;;;37;;gtc
;3;90;97;176;9;13;19;-10;3;9;176;79;5* 291;;;**;;gtc
3;1;100;102;157;10;11;23;-11;4;22;108;172;290;;;5;;aac
1;5;110;92;183;11;3;27;-12;0;0;101;292;2* 280;;;**;;aac
2;4;120;74;130;12;8;12;-13;4;9;70;299;288;;;269;;gcc
;2;130;70;171;13;9;13;-14;2;16;84;119;23s 5s;;;38;;gcc
2;2;140;68;123;14;3;22;-15;0;1;312;309;6* 78;;;**;;gcc
;3;150;63;112;15;9;10;-16;3;3;139;151;2* 76;;;-;151;cca
2;3;160;74;110;16;9;12;-17;3;12;83;112;108;;;**;;gga
;2;170;62;135;17;9;16;-18;1;0;748;66;5s CDS;;;18;;cga
3;1;180;56;95;18;13;7;-19;0;5;117;176;101;82;;18;;cga
1;1;190;48;106;19;16;13;-20;3;7;88;252;182;;;18;;other
;1;200;48;87;20;13;15;-21;1;0;402;70;251;;;18;;cga
1;0;210;45;69;21;13;7;-22;1;2;329;463;553;;;**;;other
2;0;220;54;57;22;14;14;-23;3;6;52;1447;205;;;129;;aag
;0;230;45;77;23;11;18;-24;1;0;159;310;271;;;**;;aag
1;0;240;44;60;24;11;8;-25;1;1;278;263;3080;;;42;;atgj
1;1;250;40;57;25;12;8;-26;1;3;252;75;239;;;**;;acc
2;3;260;44;43;26;4;13;-27;1;0;58;214;;;;35;;cgt
2;0;270;42;51;27;8;9;-28;4;3;1021;93;;;;240;;cgt
;1;280;36;37;28;9;15;-29;4;2;154;314;;;;**;;agc
;1;290;36;45;29;7;23;-30;2;0;161;201;;;;51;;ggc
2;0;300;30;36;30;11;11;-31;0;2;16;157;;;;**;;ggc
3;0;310;36;33;31;8;18;-32;2;0;285;76;;;;34;;ttc
1;2;320;25;22;32;5;14;-33;0;0;110;353;;;;42;;gac
;1;330;28;22;33;7;11;-34;2;1;116;47;;;;**;;gaa
;0;340;20;22;34;15;19;-35;2;1;109;405;;;;21;;cag
1;0;350;19;23;35;14;19;-36;1;0;145;75;;;;38;;gag
1;0;360;26;20;36;6;17;-37;0;0;122;-3;;;;13;;gag
;0;370;12;20;37;12;18;-38;0;1;245;70;;;;4;;gag
;0;380;18;10;38;8;30;-39;0;0;849;46;;;;**;;gag
;0;390;13;22;39;8;13;-40;2;1;71;180;;;;22;;tgc
;0;400;12;20;40;10;11;-41;0;1;113;246;;;;**;;ggc
8;4;reste;297;316;reste;2174;3304;-42;0;0;149;350;;;;;;
51;52;total;2564;3995;total;2564;3995;-43;0;1;167;80;;;;;;
42;47;diagr;2260;3675;diagr;383;687;-44;0;0;124;183;;;;;;
1;2; t30;290;517;;;;-45;2;0;318;135;;;;;;
;;;;;;;;-46;1;0;57;140;;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;259;749;;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;199;819;;;;;;
;x;2557;93;7;2657;;;-49;1;1;148;251;;;;;;
;c;3991;959;4;4954;;;-50;2;1;-13;94;;;;;;
;;;;;7611;171;;reste;14;21;25;270;;;;;;
;;;;;;7782;;total;93;959;32;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====ksk autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_autres_intercalaires_aas|ksk autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;ksk;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;629741;630835;188;*;
;comp;tRNA;631024;631098;140;*;act
fin;comp;CDS;631239;632909;;;
deb;comp;CDS;975508;975957;214;*;
;;tRNA;976172;976242;66;*;tgc
fin;;CDS;976309;977706;;0;
deb;comp;CDS;1013242;1014198;71;*;
;comp;tRNA;1014270;1014354;35;*;other
;comp;tRNA;1014390;1014474;967;*;other
fin;;CDS;1015442;1015951;;;
deb;;CDS;1614812;1615585;108;*;
;comp;tRNA;1615694;1615765;209;*;gtg
;comp;tRNA;1615975;1616046;462;*;gtg
fin;;CDS;1616509;1616922;;;
deb;comp;CDS;1620154;1621197;303;*;
;;tRNA;1621501;1621573;79;*;ggc
;;tRNA;1621653;1621726;36;*;tgc
;;tRNA;1621763;1621834;34;*;gtc
;;tRNA;1621869;1621940;37;*;gtc
;;tRNA;1621978;1622052;240;*;gtc
fin;comp;CDS;1622293;1622469;;0;
deb;comp;CDS;1706631;1707242;101;*;
;comp;rRNA;1707344;1707460;78;*;117
;comp;rRNA;1707539;1710646;291;*;3108
;comp;rRNA;1710938;1712461;672;*;1524
fin;;CDS;1713134;1713583;;;
deb;;CDS;1888172;1888537;82;*;
;comp;rRNA;1888620;1888736;78;*;117
;comp;rRNA;1888815;1891921;291;*;3107
;comp;rRNA;1892213;1893736;619;*;1524
fin;comp;CDS;1894356;1895450;;;
deb;comp;CDS;1969567;1970022;551;*;
;;tRNA;1970574;1970661;1;*;ctc
fin;comp;CDS;1970663;1971622;;0;
deb;comp;CDS;2263749;2264402;92;*;
;;tRNA;2264495;2264577;108;*;ttg
fin;;CDS;2264686;2265490;;0;
deb;;CDS;2661716;2662345;70;*;
;comp;ncRNA;2662416;2662817;52;*;
fin;comp;CDS;2662870;2663124;;1;
deb;;CDS;2740927;2741106;79;*;
;comp;tRNA;2741186;2741257;172;*;gta
fin;;CDS;2741430;2742695;;;
deb;;CDS;2785520;2787781;292;*;
;comp;tRNA;2788074;2788147;299;*;atgi
fin;;CDS;2788447;2789340;;;
deb;;CDS;2789514;2790302;119;*;
;comp;tRNA;2790422;2790494;5;*;aac
;comp;tRNA;2790500;2790572;309;*;aac
fin;;CDS;2790882;2791175;;;
deb;comp;CDS;2885846;2887138;92;*;
;comp;tRNA;2887231;2887303;269;*;gcc
;comp;tRNA;2887573;2887645;38;*;gcc
;comp;tRNA;2887684;2887756;156;*;gcc
fin;comp;CDS;2887913;2888560;;;
deb;comp;CDS;2930765;2932159;254;*;
;comp;tRNA;2932414;2932487;151;*;cca
;;tRNA;2932639;2932712;151;*;gga
fin;comp;CDS;2932864;2933883;;;
deb;comp;CDS;2982257;2982772;182;*;
;comp;rRNA;2982955;2983071;78;*;117
;comp;rRNA;2983150;2986255;290;*;3106
;comp;rRNA;2986546;2988069;525;*;1524
fin;comp;CDS;2988595;2989311;;;
deb;;CDS;3017346;3017948;114;*;
;;tRNA;3018063;3018138;176;*;cac
fin;;CDS;3018315;3018761;;0;
deb;;CDS;3036003;3036545;108;*;
;;tRNA;3036654;3036727;101;*;aag
fin;;CDS;3036829;3037074;;1;
deb;comp;CDS;3042508;3044088;112;*;
;;tRNA;3044201;3044274;66;*;aag
fin;comp;CDS;3044341;3044712;;0;
deb;comp;CDS;3073276;3074226;70;*;
;comp;tRNA;3074297;3074387;18;*;cga
;comp;tRNA;3074406;3074496;18;*;cga
;comp;tRNA;3074515;3074605;18;*;other
;comp;tRNA;3074624;3074714;18;*;cga
;comp;tRNA;3074733;3074823;176;*;other
fin;;CDS;3075000;3076004;;;
deb;;CDS;3110984;3111742;84;*;
;;tRNA;3111827;3111900;129;*;aag
;;tRNA;3112030;3112103;312;*;aag
fin;;CDS;3112416;3114647;;;
deb;comp;CDS;3155159;3157495;252;*;
;;tRNA;3157748;3157831;70;*;cta
fin;comp;CDS;3157902;3158507;;;
deb;comp;CDS;3209463;3209777;463;*;
;;tRNA;3210241;3210315;1447;*;tgc
fin;comp;CDS;3211763;3211972;;;
deb;comp;CDS;3232464;3233834;193;*;
;comp;tmRNA;3234028;3234406;122;*;
fin;comp;CDS;3234529;3235011;;;
deb;comp;CDS;3289487;3289639;251;*;
;comp;rRNA;3289891;3290007;78;*;117
;comp;rRNA;3290086;3293192;291;*;3107
;comp;rRNA;3293484;3295007;645;*;1524
fin;comp;CDS;3295653;3296657;;0;
deb;comp;CDS;3608197;3608565;139;*;
;comp;tRNA;3608705;3608777;310;*;tgg
fin;;CDS;3609088;3610326;;;
deb;comp;CDS;3616649;3616813;83;*;
;comp;tRNA;3616897;3616969;42;*;atgj
;comp;tRNA;3617012;3617084;263;*;acc
deb;;CDS;3617348;3618601;75;*;
;comp;tRNA;3618677;3618757;214;*;tac
fin;;CDS;3618972;3619460;;;
deb;;CDS;3848397;3851321;93;*;
;comp;tRNA;3851415;3851488;314;*;aca
fin;;CDS;3851803;3852900;;;
deb;comp;CDS;3985689;3986465;748;*;
;comp;tRNA;3987214;3987290;117;*;acg
fin;comp;CDS;3987408;3988070;;;
deb;;CDS;4070175;4071119;88;*;
;;tRNA;4071208;4071281;402;*;ccg
fin;;CDS;4071684;4073162;;;
deb;comp;CDS;4092593;4094809;66;*;
;comp;ncRNA;4094876;4094966;132;*;
;;tRNA;4095099;4095183;329;*;tcc
fin;;CDS;4095513;4095974;;;
deb;;CDS;4142060;4142491;52;*;
;;tRNA;4142544;4142633;159;*;tcg
fin;;CDS;4142793;4143458;;0;
deb;comp;CDS;4160403;4160585;278;*;
;comp;tRNA;4160864;4160939;35;*;cgt
;comp;tRNA;4160975;4161050;240;*;cgt
;comp;tRNA;4161291;4161381;201;*;agc
fin;;CDS;4161583;4164981;;0;
deb;comp;CDS;4176515;4177270;252;*;
;comp;tRNA;4177523;4177608;58;*;tca
fin;comp;CDS;4177667;4178776;;0;
deb;comp;CDS;4235119;4239375;1021;*;
;comp;tRNA;4240397;4240470;157;*;ggg
fin;;CDS;4240628;4240849;;;
deb;;CDS;4285356;4285673;154;*;
;;tRNA;4285828;4285900;51;*;ggc
;;tRNA;4285952;4286024;161;*;ggc
fin;;CDS;4286186;4287187;;;
deb;;CDS;4381966;4383351;16;*;
;;tRNA;4383368;4383441;285;*;atc
fin;;CDS;4383727;4384749;;;
deb;;CDS;4385317;4385445;110;*;
;;tRNA;4385556;4385628;76;*;gca
fin;comp;CDS;4385705;4386631;;0;
deb;comp;CDS;4400257;4401138;353;*;
;;tRNA;4401492;4401575;47;*;ctg
fin;comp;CDS;4401623;4402147;;0;
deb;;CDS;4622363;4622569;405;*;
;comp;tRNA;4622975;4623048;116;*;gac
fin;comp;CDS;4623165;4627139;;0;
deb;comp;CDS;4640228;4640773;109;*;
;comp;tRNA;4640883;4640959;34;*;ttc
;comp;tRNA;4640994;4641067;42;*;gac
;comp;tRNA;4641110;4641182;145;*;gaa
fin;comp;CDS;4641328;4641669;;0;
deb;;CDS;4651026;4651709;122;*;
;;tRNA;4651832;4651904;245;*;aaa
fin;;CDS;4652150;4652317;;0;
deb;comp;CDS;4770979;4772697;849;*;
;comp;tRNA;4773547;4773620;75;*;atgf
deb;;CDS;4773696;4774130;-3;*;
;comp;tRNA;4774128;4774201;71;*;atgf
fin;comp;CDS;4774273;4775532;;0;
deb;;CDS;4794735;4795958;553;*;
;;rRNA;4796512;4798035;291;*;1524
;;rRNA;4798327;4801434;76;*;3108
;;rRNA;4801511;4801627;280;*;117
fin;;CDS;4801908;4802828;;;
deb;;CDS;5026285;5027319;113;*;
;;tRNA;5027433;5027505;70;*;agg
fin;comp;CDS;5027576;5028037;;1;
deb;;CDS;5075303;5076238;149;*;
;;tRNA;5076388;5076464;46;*;gcg
fin;comp;CDS;5076511;5077533;;0;
deb;comp;CDS;5121699;5123603;180;*;
;;tRNA;5123784;5123856;167;*;acc
fin;;CDS;5124024;5124683;;;
deb;comp;CDS;5131586;5132572;246;*;
;;tRNA;5132819;5132889;124;*;caa
fin;;CDS;5133014;5134459;;;
deb;comp;CDS;5215779;5216147;318;*;
;comp;tRNA;5216466;5216550;350;*;tta
fin;;CDS;5216901;5217674;;;
deb;;CDS;5427006;5430017;57;*;
;;tRNA;5430075;5430148;259;*;atgf
fin;;CDS;5430408;5432459;;;
deb;;CDS;5530116;5530868;80;*;
;comp;tRNA;5530949;5531020;183;*;cgg
fin;;CDS;5531204;5531737;;;
deb;;CDS;5713254;5714768;199;*;
;;tRNA;5714968;5715039;21;*;cag
;;tRNA;5715061;5715133;38;*;gag
;;tRNA;5715172;5715244;13;*;gag
;;tRNA;5715258;5715330;4;*;gag
;;tRNA;5715335;5715409;135;*;gag
fin;comp;CDS;5715545;5716258;;0;
deb;comp;CDS;5851701;5852435;734;*;
;;rRNA;5853170;5854693;280;*;1524
;;rRNA;5854974;5858080;78;*;3107
;;rRNA;5858159;5858275;205;*;117
fin;;CDS;5858481;5859890;;;
deb;;CDS;5930032;5931717;452;*;
;;rRNA;5932170;5933693;280;*;1524
;;rRNA;5933974;5937080;76;*;3107
;;rRNA;5937157;5937273;271;*;117
fin;;CDS;5937545;5938228;;0;
deb;;CDS;6072887;6073678;405;*;
;;rRNA;6074084;6075607;288;*;1524
;;rRNA;6075896;6079001;78;*;3106
;;rRNA;6079080;6079196;3080;*;117
fin;;CDS;6082277;6082420;;;
deb;;CDS;6103592;6104206;140;*;
;comp;tRNA;6104347;6104419;749;*;aga
fin;;CDS;6105169;6105423;;;
deb;;CDS;6398346;6399611;611;*;
;;rRNA;6400223;6401746;291;*;1524
;;rRNA;6402038;6405144;108;*;3107
;;rRNA;6405253;6405369;239;*;117
fin;;CDS;6405609;6406436;;;
deb;;CDS;6484449;6485687;148;*;
;;tRNA;6485836;6485909;819;*;ccc
fin;comp;CDS;6486729;6487430;;;
deb;comp;CDS;7351591;7353366;251;*;
;;tRNA;7353618;7353693;-13;*;gcc
fin;;CDS;7353681;7353821;;;
deb;;CDS;7353841;7355253;25;*;
;;tRNA;7355279;7355351;22;*;tgc
;;tRNA;7355374;7355446;32;*;ggc
fin;;CDS;7355479;7356687;;0;
deb;;CDS;7459688;7460983;94;*;
;comp;tRNA;7461078;7461165;270;*;ctc
fin;;CDS;7461436;7462761;;;
&lt;/pre&gt;

====ksk distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ksk_distribution|ksk distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;2;ccc;1;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;2;;gtc;3;gcc;3;gac;;ggc;2
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;1;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;2;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;2;gcg;;gag;3;ggg;
actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
ksk;;37;;;;;;;ksk;14;;;;;;;;ksk;19;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===actino synthèse===
====actino distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#actino_distribution_par_génome|actino distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
ase;58;32;;;;0;6;;96
blo;19;31;;;;0;6;;56
sma;17;48;;;;0;7;;72
ksk;14;37;;;;0;19;;70
total;108;148;0;0;0;0;38;0;294
&lt;/pre&gt;

====actino distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#actino_distribution_du_total|actino distribution du total]]
&lt;pre&gt;
actino4;;;;;;;294
atgi;4;tct;;tat;;atgf;11
att;;act;1;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;5;tcc;5;tac;5;tgc;10
atc;5;acc;7;aac;9;agc;7
ctc;8;ccc;6;cac;5;cgt;9
gtc;11;gcc;10;gac;10;ggc;14
tta;4;tca;4;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;5;aga;5
cta;4;cca;6;caa;3;cga;
gta;4;gca;5;gaa;5;gga;7
ttg;5;tcg;4;tag;;tgg;7
atgj;4;acg;6;aag;11;agg;4
ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;5
gtg;10;gcg;6;gag;10;ggg;5
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;146;148;;;;0;295
&lt;/pre&gt;

====actino distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#actino_distribution_par_type|actino distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
actino4;;;;;;;294;;actino4;;;;;;;148;;actino4;;;;;;;108;;actino4;;;;;;;38
atgi;4;tct;;tat;;atgf;11;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;10;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;5;tcc;5;tac;5;tgc;10;;ttc;1;tcc;4;tac;3;tgc;3;;ttc;4;tcc;1;tac;2;tgc;7;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;5;acc;7;aac;9;agc;7;;atc;2;acc;2;aac;2;agc;2;;atc;3;acc;5;aac;1;agc;5;;atc;;acc;;aac;6;agc;
ctc;8;ccc;6;cac;5;cgt;9;;ctc;6;ccc;6;cac;4;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;1;cgt;4;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;4
gtc;11;gcc;10;gac;10;ggc;14;;gtc;;gcc;3;gac;5;ggc;1;;gtc;5;gcc;2;gac;5;ggc;11;;gtc;6;gcc;5;gac;;ggc;2
tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;5;aga;5;;ata;;aca;4;aaa;4;aga;4;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;4;cca;6;caa;3;cga;;;cta;3;cca;2;caa;3;cga;;;cta;1;cca;4;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;4;gca;5;gaa;5;gga;7;;gta;4;gca;2;gaa;1;gga;2;;gta;;gca;3;gaa;4;gga;5;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;5;tcg;4;tag;;tgg;7;;ttg;4;tcg;4;tag;;tgg;5;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;4;acg;6;aag;11;agg;4;;atgj;;acg;4;aag;6;agg;4;;atgj;4;acg;2;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;5;agg;
ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;5;;ctg;4;ccg;4;cag;;cgg;4;;ctg;3;ccg;;cag;8;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;10;gcg;6;gag;10;ggg;5;;gtg;5;gcg;4;gag;;ggg;4;;gtg;3;gcg;2;gag;2;ggg;1;;gtg;2;gcg;;gag;8;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;146;148;;;;0;295;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====actino par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#actino_par_rapport_au_groupe_de_référence|actino par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;actino4;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;55;28;26;;;;109;
16;moyen;50;38;;;;;88;
14;fort;43;42;12;;;;97;
; ;148;108;38;;;;294;
10;g+cga;31;18;15;;;;64;
2;agg+cgg;8;1;;;;;9;
4;carre ccc;15;9;11;;;;35;
5;autres;1;;;;;;1;
;;55;28;26;;;;109;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;actino4;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;187;95;88;;;;371;26
16;moyen;170;129;;;;;299;324
14;fort;146;143;41;;;;330;650
; ;503;367;129;;;;294;729
10;g+cga;105;61;51;;;;218;10
2;agg+cgg;27;3;;;;;31;
4;carre ccc;51;31;37;;;;119;16
5;autres;3;;;;;;3;
;;187;95;88;;;;371;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;actino4;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;187;95;88;371;26;37;26;68
16;moyen;170;129;;299;324;34;35; 
14;fort;146;143;41;330;650;29;39;32
; ;503;367;129;294;729;148;108;38
10;g+cga;105;61;51;218;10;56;64;58
2;agg+cgg;27;3;;31;;15;4;
4;carre ccc;51;31;37;119;16;27;32;42
5;autres;3;;;3;;2;;
;;187;95;88;371;;55;28;26
&lt;/pre&gt;
====actinobacteria, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#actinobacteria,_estimation_des_-rRNAs|actinobacteria, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
actino;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
99 génomes total avec rRNA;;;;actino;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;actino;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;99;2; ; ;;indices;;;;99;2;0;0;;actino4;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;294
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;4;tct;;tat;;atgf;11
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;1;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;2;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;2;tac;;tgc;;;ttc;5;tcc;5;tac;5;tgc;10
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;5;acc;7;aac;9;agc;7
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;8;ccc;6;cac;5;cgt;9
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;11;gcc;10;gac;10;ggc;14
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;5;aga;5
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;4;cca;6;caa;3;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;4;gca;5;gaa;5;gga;7
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;5;tcg;4;tag;;tgg;7
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;4;acg;6;aag;11;agg;4
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;5
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;10;gcg;6;gag;10;ggg;5
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88;;97;;109;294
26.5.20 Tanger;;;;actino;total;ttt;tgt;;26.5.20 Tanger;;;;actino;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;86713;0.5;0.2;;;;;;618;21937;0,5;0,2;;actino;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;104;tct;0.2;tat;;atgf;135;;atgi;104;tct;0.2;tat;;atgf;135;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;275
att;;act;0.7;aat;;agt;0.2;;att;;act;0.7;aat;;agt;0.2;;att;;act;25;aat;;agt;
ctt;0.9;cct;0.5;cat;0.9;cgc;1.4;;ctt;0.9;cct;0.5;cat;0.9;cgc;1.4;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.2;gct;0.2;gat;0.9;ggt;0.2;;gtt;0.2;gct;0.2;gat;0.9;ggt;0.2;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;106;tcc;98;tac;104;tgc;118;;ttc;106;tcc;100;tac;104;tgc;118;;ttc;125;tcc;125;tac;125;tgc;250
atc;104;acc;111;aac;126;agc;104;;atc;104;acc;111;aac;126;agc;104;;atc;125;acc;175;aac;225;agc;175
ctc;113;ccc;106;cac;100;cgt;131;;ctc;113;ccc;106;cac;100;cgt;131;;ctc;200;ccc;150;cac;125;cgt;225
gtc;145;gcc;129;gac;138;ggc;184;;gtc;145;gcc;129;gac;138;ggc;184;;gtc;275;gcc;250;gac;250;ggc;350
tta;100;tca;100;taa;;tga;19;;tta;100;tca;100;taa;;tga;19;;tta;100;tca;100;taa;;tga;
ata;1.2;aca;100;aaa;104;aga;103;;ata;1.2;aca;100;aaa;104;aga;103;;ata;;aca;100;aaa;125;aga;125
cta;100;cca;100;caa;99;cga;1;;cta;100;cca;100;caa;99;cga;1.4;;cta;100;cca;150;caa;75;cga;
gta;98;gca;119;gaa;101;gga;108;;gta;98;gca;119;gaa;101;gga;108;;gta;100;gca;125;gaa;125;gga;175
ttg;105;tcg;125;tag;0.9;tgg;109;;ttg;105;tcg;125;tag;0.9;tgg;109;;ttg;125;tcg;100;tag;;tgg;175
atgj;102;acg;104;aag;126;agg;104;;atgj;102;acg;104;aag;126;agg;104;;atgj;100;acg;150;aag;275;agg;100
ctg;100;ccg;99;cag;110;cgg;105;;ctg;100;ccg;99;cag;110;cgg;105;;ctg;175;ccg;100;cag;200;cgg;125
gtg;114;gcg;86;gag;143;ggg;104;;gtg;114;gcg;86;gag;143;ggg;104;;gtg;250;gcg;150;gag;250;ggg;125
;;1677;;1634;;1736;5047;;;;1679;;1634;;1736;5049;;;;2200;;2425;;2725;7350
rapports;;100;;100;;100;100;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;actino;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;100.0;;fiches;54.081;;;fréquences;;;;;atgi;4;tct;100;tat;;atgf;51
att;;act;100;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;5354;;;0/0;;;;;att;;act;97;aat;;agt;100
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;2;;;10;10;;;;ctt;100;cct;100;cat;100;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;99;;;20;12;;;;gtt;100;gct;100;gat;100;ggt;100
ttc;100;tcc;98;tac;100;tgc;100;;;;;;30;2;;;;ttc;15;tcc;22;tac;17;tgc;53
atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;actino;73.5;;;40;5;;;;atc;17;acc;37;aac;44;agc;41
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100;;sans;294;;;50;12;41;;;ctc;44;ccc;29;cac;20;cgt;42
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;0;;;60;4;;;;gtc;47;gcc;48;gac;45;ggc;47
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;4;;;70;0;;;;tta;0;tca;0;taa;;tga;100
ata;100;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;0;aaa;17;aga;18
cta;100;cca;100.0;caa;100;cga;100;;L’estimation par actino ;;;;90;0;;;;cta;0;cca;33;caa;24;cga;100
gta;100;gca;100;gaa;100;gga;100;;est  36% au dessus;;;;100;3;;;;gta;2;gca;5;gaa;19;gga;38
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;16;tcg;20;tag;100;tgg;38
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;2;acg;31;aag;54;agg;4
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;43;ccg;1;cag;45;cgg;16
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;54;gcg;43;gag;43;ggg;17
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;313;;395;;593;1301
&lt;/pre&gt;

==cyano==
===npu===
====npu opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_opérons|npu opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Nost_punc_PCC_73102_ATCC_29133/nostPunc_PCC_73102_ATCC29133-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_010628.1;npu;;genome;;;;;;;;
41.4%GC;12.8.19 Paris;16s 4;79;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Nostoc punctiforme PCC 73102 ATCC 29133 ;;;;;;;;;;;
;199270..199464;;CDS;;237;237;;;65;;
comp;199702..199775;;agg;;33;33;;;;;
comp;199809..200906;;CDS;;;;;;366;;
;;;;;;;;;;;
comp;352653..353060;;CDS;;690;*690;;;136;;
comp;353751..353822;;ggc;;147;147;;;;;
comp;353970..354548;;CDS;;;;;;193;;
;;;;;;;;;;;
;503259..503606;;CDS;;145;145;;;116;;
;503752..503827;;atgj;+;-1;;*-1;;;;
;503827..503901;;atgj;2 atg;397;397;;;;;
;504299..505384;;CDS;@1;;;;;362;;
;;;;;;;;;;;
comp;777899..778429;;CDS;;34;34;;;177;;
;778464..778537;;cgt;;38;38;;;;;
comp;778576..779829;;CDS;;;;;;418;;
;;;;;;;;;;;
;878016..878609;;CDS;;384;384;;;198;;
;878994..879064;;tgc;;205;205;;;;;
;879270..879491;;CDS;;;;;;74;;
;;;;;;;;;;;
comp;951559..952671;;CDS;;53;53;;;371;;
;952725..952796;;acc;;310;310;;;;;
comp;953107..953340;;CDS;;;;;;78;;
;;;;;;;;;;;
comp;954493..955170;;CDS;;72;72;;;226;;
comp;955243..955315;;aga;;356;356;;;;;
;955672..956331;;CDS;;;;;;220;;
;;;;;;;;;;;
; 1054005..1054811;;CDS;;290;290;;;269;;
comp;1055102..1055172;;gga;;50;50;;;;;
comp;1055223..1056383;;CDS;;;;;;387;;
;;;;;;;;;;;
comp;1175326..1175523;;CDS;;247;247;;;66;;
comp;1175771..1175844;;ccg;;138;138;;;;;
;1175983..1176855;;CDS;;;;;;291;;
;;;;;;;;;;;
;1380042..1380593;;CDS;;226;226;;;184;;
comp;1380820..1380904;;tcc;;107;107;;;;;
;1381012..1381380;;CDS;;;;;;123;;
;;;;;;;;;;;
;1442145..1442867;;CDS;;32;32;;;241;;
;1442900..1442974;;ttc;;362;362;;;;;
;1443337..1444770;;CDS;;;;;;478;;
;;;;;;;;;;;
comp;1650791..1652236;;CDS;;133;133;;;482;;
comp;1652370..1652443;;gac;;111;111;;;;;
comp;1652555..1653088;;CDS;;;;;;178;;
;;;;;;;;;;;
comp;2020233..2021171;;CDS;;317;317;;;313;;
;2021489..2022985;;16s;;123;;;;1497;;
;2023109..2023185;;atc;;79;;;79;;;
;2023265..2023340;;gca;;249;;;;;;
;2023590..2026486;;23s;;59;;;;2897;;
;2026546..2026663;;5s;;230;230;;;118;;
&gt; comp;2026894..2027373;;CDS;;;;;;160;;
;;;;;;;;;;;
comp;2303766..2304149;;CDS;;124;124;;;128;;
;2304274..2304349;;cac;;1362;*1362;;;;;
;2305712..2308132;;CDS;;;;;;*807;;
;;;;;;;;;;;
comp;3372671..3373291;;CDS;;143;143;;;207;;
;3373435..3373507;;gta;;415;*415;;;;;
;3373923..3374555;;CDS;;;;;;211;;
;;;;;;;;;;;
comp;3434121..3435443;;CDS;;204;204;;;441;;
comp;3435648..3435739;;agc;;141;141;;;;;
comp;3435881..3436813;;CDS;;;;;;311;;
;;;;;;;;;;;
;3439846..3440202;;CDS;@2;-19;*-19;;;119;;
comp;3440184..3440257;;gca;;48;;48;;;;
comp;3440306..3440378;;aca;+;8;;8;;;;
comp;3440387..3440462;;atgf;2 aca;11;;11;;;;
comp;3440474..3440546;;cta;;4;;4;;;;
comp;3440551..3440623;;ccg;;6;;6;;;;
comp;3440630..3440706;;ctc;;2;;2;;;;
comp;3440709..3440785;;ctg;;3;;3;;;;
comp;3440789..3440861;;cca;;1;;1;;;;
comp;3440863..3440940;;tta;;6;;6;;;;
comp;3440947..3441023;;ttg;;6;;6;;;;
comp;3441030..3441105;;caa;;3;;3;;;;
comp;3441109..3441181;;cag;;5;;5;;;;
comp;3441187..3441261;;aac;;6;;6;;;;
comp;3441268..3441365;;aca;;81;;*81;;;;
comp;3441447..3441521;;cgt;;4;;4;;;;
comp;3441526..3441615;;agc;;113;;*113;;;;
comp;3441729..3441800;;gaa;;58;;58;;;;
comp;3441859..3441933;;tgg;;88;;*88;;;;
comp;3442022..3442095;;tgc;;132;;*132;;;;
comp;3442228..3442301;;gac;;118;118;;;;;
comp;3442420..3442614;;CDS;;;;;;65;;
;;;;;;;;;;;
;3448311..3448919;;CDS;;80;80;;;203;;
comp;3449000..3449072;;gaa;;120;120;;;;;
;3449193..3449375;;CDS;;;;;;61;;
;;;;;;;;;;;
;4538041..4538745;;CDS;;151;151;;;235;;
;4538897..4538981;;tcg;;194;194;;;;;
;4539176..4540357;;CDS;;;;;;394;;
;;;;;;;;;;;
comp;4869164..4869988;;CDS;;584;*584;;;275;;
comp;4870573..4870646;;cca;;298;298;;;;;
comp;4870945..4871493;;CDS;;;;;;183;;
;;;;;;;;;;;
comp;5426384..5427841;;CDS;;100;100;;;486;;
comp;5427942..5428018;;atgf;;46;46;;;;;
comp;5428065..5429018;;CDS;;;;;;318;;
;;;;;;;;;;;
comp;5480844..5481563;;CDS;;407;*407;;;240;;
comp;5481971..5482043;;gcc;;94;94;;;;;
comp;5482138..5482332;;CDS;;;;;;65;;
;;;;;;;;;;;
;5510568..5511620;;CDS;;319;319;;;351;;
comp;5511940..5512057;;5s;;59;;;;118;;
comp;5512117..5515016;;23s;;249;;;;2900;;
comp;5515266..5515341;;gca;;82;;;82;;;
comp;5515424..5515497;;atc;;123;;;;;;
comp;5515621..5517117;;16s;;682;*682;;;1497;;
comp;5517800..5519035;;CDS;;;;;;412;;
;;;;;;;;;;;
comp;5572068..5572769;;CDS;;290;290;;;234;;
;5573060..5573132;;atgi;;153;153;;;;;
comp;5573286..5573720;;CDS;;;;;;145;;
;;;;;;;;;;;
;5573827..5574450;;CDS;;93;93;;;208;;
comp;5574544..5574615;;aca;;345;345;;;;;
;5574961..5575881;;CDS;;;;;;307;;
;;;;;;;;;;;
&lt; comp;5655591..5655800;;CDS;;21;21;;;70;;
comp;5655822..5655893;;aac;;144;144;;;;;
comp;5656038..5656589;;CDS;;;;;;184;;
;;;;;;;;;;;
;5688669..5689538;;CDS;;75;75;;;290;;
;5689614..5689689;;ttc;;663;*663;;;;;
comp;5690353..5692080;;CDS;;;;;;*576;;
;;;;;;;;;;;
;5756596..5757801;;CDS;;66;66;;;402;;
;5757868..5757940;;cgg;;400;400;;;;;
comp;5758341..5759045;;CDS;;;;;;235;;
;;;;;;;;;;;
comp;6075820..6077016;;CDS;;175;175;;;399;;
comp;6077192..6077263;;ggg;;171;171;;;;;
comp;6077435..6078052;;CDS;;;;;;206;;
;;;;;;;;;;;
comp;6083633..6084493;;CDS;;676;*676;;;287;;
;6085170..6086666;;16s;;123;;;;1497;;
;6086790..6086866;;atc;;79;;;79;;;
;6086946..6087021;;gca;;249;;;;;;
;6087271..6090169;;23s;;59;;;;2899;;
;6090229..6090346;;5s;;176;176;;;118;;
comp;6090523..6090720;;CDS;;;;;;66;;
;;;;;;;;;;;
comp;6498176..6499135;;CDS;;149;149;;;320;;
comp;6499285..6499402;;5s;;59;;;;118;;
comp;6499462..6502360;;23s;;249;;;;2899;;
comp;6502610..6502685;;gca;;79;;;79;;;
comp;6502765..6502841;;atc;;123;;;;;;
comp;6502965..6504461;;16s;;315;315;;;1497;;
;6504777..6505643;;CDS;;;;;;289;;
;;;;;;;;;;;
;6889916..6890785;;CDS;;61;61;;;290;;
;6890847..6890918;;aaa;;294;294;;;;;
comp;6891213..6892148;;CDS;;;;;;312;;
;;;;;;;;;;;
;6948457..6949644;;CDS;;162;162;;;396;;
;6949807..6949888;;cta;;400;400;;;;;
;6950289..6950609;;CDS;;;;;;107;;
;;;;;;;;;;;
comp;6980662..6982233;;CDS;;171;171;;;*524;;
;6982405..6982478;;gtc;;1521;*1521;;;;;
comp;6984000..6985919;;CDS;;;;;;*640;;
;;;;;;;;;;;
;7066111..7067829;;CDS;;232;232;;;*573;;
comp;7068062..7068133;;caa;;270;270;;;;;
comp;7068404..7069606;;CDS;;;;;;401;;
;;;;;;;;;;;
comp;7071719..7071991;;CDS;;39;39;;;91;;
comp;7072031..7072114;;ttg;;109;109;;;;;
comp;7072224..7073345;;CDS;;;;;;374;;
;;;;;;;;;;;
comp;7074644..7076011;;CDS;;409;*409;;;456;;
;7076421..7076502;;ctg;;95;95;;;;;
;7076598..7077374;;CDS;;;;;;259;;
;;;;;;;;;;;
;7130044..7131132;;CDS;;131;131;;;363;;
comp;7131264..7131335;;acg;;33;33;;;;;
;7131369..7131662;;CDS;;;;;;98;;
;;;;;;;;;;;
;7224805..7225167;;CDS;;146;146;;;121;;
;7225314..7225386;;tgg;;378;378;;;;;
;7225765..7225986;;CDS;;;;;;74;;
;;;;;;;;;;;
comp;7346902..7348245;;CDS;;396;396;;;448;;
;7348642..7348724;;ctc;;127;127;;;;;
;7348852..7349475;;CDS;;;;;;208;;
;;;;;;;;;;;
;7506243..7506593;;CDS;;747;*747;;;117;;
comp;7507341..7507414;;ccc;;50;50;;;;;
comp;7507465..7507830;;CDS;;;;;;122;;
;;;;;;;;;;;
;7517008..7519347;;CDS;;167;167;;;*780;;
;7519515..7519588;;atgj;;213;213;;;;;
&lt;&gt; comp;7519802..7520109;;CDS;;;;;;103;;
;;;;;;;;;;;
comp;7571389..7571706;;CDS;;895;*895;;;106;;
comp;7572602..7572676;;aag;;63;63;;;;;
comp;7572740..7574992;;CDS;;;;;;*751;;
;;;;;;;;;;;
comp;7610323..7610769;;CDS;;481;*481;;;149;;
comp;7611251..7611323;;gca;;71;71;;;;;
;7611395..7612312;;CDS;;;;;;306;;
;;;;;;;;;;;
;7936008..7936736;;CDS;;65;65;;;243;;
;7936802..7936874;;gcg;;437;*437;;;;;
;7937312..7938874;;CDS;;;;;;*521;;
;;;;;;;;;;;
;7972961..7973239;;CDS;;313;313;;;93;;
comp;7973553..7973624;;acc;;88;;*88;;;;
comp;7973713..7973798;;tac;;124;124;;;;;
comp;7973923..7974897;;CDS;;;;;;325;;
;;;;;;;;;;;
;7975047..7975976;;CDS;;100;100;;;310;;
;7976077..7976161;;tca;;374;374;;;;;
;7976536..7978545;;CDS;;;;;;*670;;
&lt;/pre&gt;

====npu cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_cumuls|npu cumuls]]
&lt;pre&gt;
npu cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds chromosome;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;4;1;2;;1;1;1;;100;13;30;0
;16 23 5s 0;0;20;12;;50;10;40;;200;21;60;0
;16 atc gca;4;40;0;;100;14;80;;300;22;90;10
;16 23 5s a;0;60;2;;150;18;120;;400;19;120;9
;max a;2;80;0;3;200;9;160;;500;10;150;7
;a doubles;0;100;3;1;250;8;200;;600;4;180;3
;autres;0;120;1;;300;5;240;;700;2;210;10
;total aas;8;140;1;;350;6;280;;800;2;240;7
sans ;opérons;43;160;0;;400;9;320;;900;1;270;4
;1 aa;40;180;0;;450;4;360;;1000;0;300;6
;max a;20;200;0;;500;1;400;;1100;0;330;9
;a doubles;2;;0;;;9;;;;0;;29
;total aas;64;;21;4;;94;;0;;94;;94
total aas;;72;;;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;32;79;;254;;;;279;;
;;;variance;43;0;;254;;;;171;;
sans jaune;;;moyenne;11;;;176;;;;240;;188
;;;variance;17;;;111;;;;122;;85
&lt;/pre&gt;

====npu blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_blocs|npu blocs]]
&lt;pre&gt;
npu blocs;;;;
CDS;317;313;676;287
16s;123;1497;123;1497
atc;79;;79;
gca;249;;249;
23s;59;2897;59;2899
5s;230;118;176;118
CDS;;160;;66
;;;;
CDS;319;351;149;320
5s;59;118;59;118
23s;249;2900;249;2899
gca;82;;79;
atc;123;;123;
16s;682;1497;315;1497
CDS;;412;;289
&lt;/pre&gt;
====npu remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_remarques|npu remarques]]
&lt;pre&gt;
gtRNAdb;;;;;;;79;;cumuls;;;;;;;72
atgi;2;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;2;;ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;2
atc;4;acc;1;aac;2;agc;2;;atc;4;acc;2;aac;2;agc;2
ctc;2;ccc;2;cac;2;cgt;2;;ctc;2;ccc;1;cac;1;cgt;2
gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;1;;gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;1
tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;1;aca;2;aaa;2;aga;1;;ata;;aca;3;aaa;1;aga;1
cta;2;cca;2;caa;2;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;
gta;1;gca;6;gaa;2;gga;1;;gta;1;gca;6;gaa;2;gga;1
ttg;3;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;2;tcg;1;tag;;tgg;2
atgj;3;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;3;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;1;;ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;1
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1
&lt;/pre&gt;
====npu distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_distribution|npu distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;2;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
cyano;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;cyano;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;cyano;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
npu;;39;;;;;;;npu;21;;;;;;;;npu;4;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====npu données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_données_intercalaires|npu données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;npu;fx;fc;npu;fx40;fc40;npu;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;4;15;0;4;15;-1;0;54;33;237;CDS 16s;;
;1;10;50;188;1;2;22;-2;6;0;690;34;;317;
;0;20;52;152;2;4;24;-3;0;1;147;38;;317;
;1;30;43;135;3;8;22;-4;15;135;145;356;;676;
3;4;40;53;132;4;8;16;-5;1;0;397;290;;315;
;3;50;54;142;5;10;25;-6;2;0;216;518;23s 5s;;
1;0;60;63;142;6;3;17;-7;1;8;615;138;4* 61;;
1;4;70;74;115;7;2;17;-8;1;34;5;226;5s CDS;;
2;2;80;59;146;8;6;16;-9;1;0;231;107;149;68;
;0;90;64;129;9;5;12;-10;1;6;384;124;;319;
1;4;100;59;129;10;2;17;-11;0;27;205;143;;176;
2;1;110;63;168;11;8;15;-12;0;0;72;102;16s tRNA;;
;2;120;61;138;12;3;17;-13;0;11;50;80;4* 131;;atc
1;2;130;56;101;13;5;15;-14;2;23;37;327;tRNA 23s;;
3;1;140;84;119;14;8;23;-15;1;1;247;51;4* 260;;gca
1;6;150;63;107;15;4;15;-16;0;5;705;290;tRNA tRNA;;intra
1;1;160;60;99;16;3;9;-17;0;15;145;153;4* 82;;atc gca
;2;170;49;104;17;4;16;-18;2;0;32;93;tRNA tRNA;;
1;2;180;49;81;18;2;9;-19;1;1;368;345;-1;;atgj
;0;190;47;79;19;10;19;-20;1;10;133;666;**;;atgj
;1;200;49;73;20;5;14;-21;1;0;111;137;44;;other
;2;210;60;55;21;3;15;-22;0;2;1365;427;**;;other
;1;220;33;65;22;7;5;-23;2;6;415;294;156;;aaa
1;0;230;29;69;23;3;11;-24;0;0;204;171;7;;other
2;1;240;38;54;24;4;10;-25;0;2;141;1521;6;;cac
;1;250;39;63;25;3;11;-26;2;8;118;232;48;;gca
;0;260;31;74;26;4;19;-27;1;0;409;409;8;;aca
;2;270;33;53;27;7;15;-28;2;4;151;131;10;;atgf
;0;280;31;53;28;5;18;-29;3;1;194;33;4;;cta
2;0;290;34;47;29;3;16;-30;0;0;599;396;6;;ccg
1;1;300;42;48;30;4;15;-31;0;2;298;747;5;;ctc
1;0;310;25;42;31;6;13;-32;0;4;100;301;3;;ctg
;1;320;27;42;32;3;12;-33;2;0;46;71;1;;cca
1;0;330;26;33;33;6;12;-34;0;0;407;70;6;;tta
;0;340;22;37;34;4;7;-35;0;6;94;;6;;ttg
1;0;350;34;43;35;3;10;-36;0;0;24;;3;;caa
1;0;360;27;42;36;10;16;-37;1;4;144;;5;;cag
;1;370;15;20;37;4;13;-38;2;5;75;;6;;aac
;2;380;36;33;38;5;17;-39;0;0;66;;81;;aca
;1;390;18;17;39;10;19;-40;0;1;268;;4;;cgt
1;1;400;16;29;40;2;13;-41;0;1;175;tRNA CDS;4;;agc
6;11;reste;535;586;reste;2105;3377;-42;0;0;171;suite;7;;tac
34;62;total;2307;3999;total;2307;3999;-43;0;1;61;50;62;;gaa
28;51;diagr;1768;3398;diagr;198;607;-44;1;1;162;167;3;;tgg
0;2; t30;145;475;;;;-45;0;0;313;898;11;;atgi
;;;;;;;;-46;1;0;270;63;3;;tgc
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;1;1;39;481;4;;other
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;1;0;109;65;**;;gac
;x;2303;67;4;2374;;;-49;0;0;95;437;88;;acc
;c;3984;402;15;4401;;;-50;0;0;146;124;**;;tac
;;;;;6775;156;;reste;12;22;378;100;;;
;;;;;;6931;;total;67;402;127;374;;;
&lt;/pre&gt;
=====npu autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#npu_autres_intercalaires_aas|npu autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;npu;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;199270;199464;237;*;
;comp;tRNA;199702;199775;33;*;agg
fin;comp;CDS;199809;200906;;0;
deb;comp;CDS;352653;353060;690;*;
;comp;tRNA;353751;353822;147;*;ggc
fin;comp;CDS;353970;354548;;;
deb;;CDS;503259;503606;145;*;
;;tRNA;503752;503827;-1;*;atgj
;;tRNA;503827;503901;397;*;atgj
deb;;CDS;504299;505384;216;*;
;;tRNA;505601;505673;615;*;ata
fin;;CDS;506289;507815;;;
deb;;CDS;727418;728587;5;*;
;;tRNA;728593;728664;231;*;other
fin;;CDS;728896;730239;;;
deb;comp;CDS;777899;778429;34;*;
;;tRNA;778464;778537;38;*;cgt
fin;comp;CDS;778576;779829;;;
deb;;CDS;878016;878609;384;*;
;;tRNA;878994;879064;205;*;tgc
fin;;CDS;879270;879491;;;
deb;comp;CDS;954493;955170;72;*;
;comp;tRNA;955243;955315;356;*;aga
fin;;CDS;955672;956331;;;
deb;;CDS;1054005;1054811;290;*;
;comp;tRNA;1055102;1055172;50;*;gga
fin;comp;CDS;1055223;1056383;;;
deb;comp;CDS;1081601;1082335;518;*;
;;tRNA;1082854;1082983;44;*;other
;;tRNA;1083028;1083149;37;*;other
fin;;CDS;1083187;1084788;;;
deb;comp;CDS;1175326;1175523;247;*;
;comp;tRNA;1175771;1175844;138;*;ccg
fin;;CDS;1175983;1176855;;;
deb;;CDS;1380042;1380593;226;*;
;comp;tRNA;1380820;1380904;107;*;tcc
fin;;CDS;1381012;1381380;;;
deb;;CDS;1440092;1440529;705;*;
;;tRNA;1441235;1441304;145;*;other
fin;;CDS;1441450;1441650;;;
deb;;CDS;1442145;1442867;32;*;
;;tRNA;1442900;1442968;368;*;ttc
fin;;CDS;1443337;1444770;;;
deb;;CDS;1484155;1484853;46;*;
;;ncRNA;1484900;1485316;115;*;
fin;;CDS;1485432;1486151;;;
deb;comp;CDS;1650791;1652236;133;*;
;comp;tRNA;1652370;1652443;111;*;gac
fin;comp;CDS;1652555;1653130;;0;
deb;comp;CDS;2020233;2021171;317;*;
;;rRNA;2021489;2022977;131;*;1489
;;tRNA;2023109;2023182;82;*;atc
;;tRNA;2023265;2023337;260;*;gca
;;rRNA;2023598;2026484;61;*;2887
;;rRNA;2026546;2026663;68;*;118
fin;comp;CDS;2026732;2026957;;;
deb;comp;CDS;2303766;2304149;124;*;
;;tRNA;2304274;2304346;1365;*;cac
fin;;CDS;2305712;2308132;;0;
deb;comp;CDS;3372671;3373291;143;*;
;;tRNA;3373435;3373507;415;*;gta
fin;;CDS;3373923;3374555;;;
deb;comp;CDS;3434121;3435443;204;*;
;comp;tRNA;3435648;3435739;141;*;agc
fin;comp;CDS;3435881;3436813;;;
deb;;CDS;3438597;3439685;102;*;
;comp;tRNA;3439788;3439858;156;*;aaa
;comp;tRNA;3440015;3440097;7;*;other
;comp;tRNA;3440105;3440177;6;*;cac
;comp;tRNA;3440184;3440257;48;*;gca
;comp;tRNA;3440306;3440378;8;*;aca
;comp;tRNA;3440387;3440463;10;*;atgf
;comp;tRNA;3440474;3440546;4;*;cta
;comp;tRNA;3440551;3440623;6;*;ccg
;comp;tRNA;3440630;3440706;5;*;ctc
;comp;tRNA;3440712;3440785;3;*;ctg
;comp;tRNA;3440789;3440861;1;*;cca
;comp;tRNA;3440863;3440940;6;*;tta
;comp;tRNA;3440947;3441023;6;*;ttg
;comp;tRNA;3441030;3441105;3;*;caa
;comp;tRNA;3441109;3441181;5;*;cag
;comp;tRNA;3441187;3441261;6;*;aac
;comp;tRNA;3441268;3441365;81;*;aca
;comp;tRNA;3441447;3441521;4;*;cgt
;comp;tRNA;3441526;3441615;4;*;agc
;comp;tRNA;3441620;3441721;7;*;tac
;comp;tRNA;3441729;3441799;62;*;gaa
;comp;tRNA;3441862;3441933;3;*;tgg
;comp;tRNA;3441937;3442010;11;*;atgi
;comp;tRNA;3442022;3442095;3;*;tgc
;comp;tRNA;3442099;3442223;4;*;other
;comp;tRNA;3442228;3442301;118;*;gac
fin;comp;CDS;3442420;3442614;;0;
deb;;CDS;3448311;3448919;80;*;
;comp;tRNA;3449000;3449072;327;*;gaa
fin;;CDS;3449400;3451319;;;
deb;;CDS;3675128;3675659;409;*;
;;tRNA;3676069;3676151;51;*;tca
fin;comp;CDS;3676203;3676421;;;
deb;;CDS;4538041;4538745;151;*;
;;tRNA;4538897;4538981;194;*;tcg
fin;;CDS;4539176;4540357;;0;
deb;comp;CDS;4869164;4869973;599;*;
;comp;tRNA;4870573;4870646;298;*;cca
fin;comp;CDS;4870945;4871493;;0;
deb;comp;CDS;5108061;5113469;362;*;
;comp;ncRNA;5113832;5114015;60;*;
fin;comp;CDS;5114076;5115230;;;
deb;comp;CDS;5426384;5427841;100;*;
;comp;tRNA;5427942;5428018;46;*;atgf
fin;comp;CDS;5428065;5429018;;;
deb;comp;CDS;5480844;5481563;407;*;
;comp;tRNA;5481971;5482043;94;*;gcc
fin;comp;CDS;5482138;5482332;;;
deb;;CDS;5510568;5511620;319;*;
;comp;rRNA;5511940;5512057;61;*;118
;comp;rRNA;5512119;5515008;260;*;2890
;comp;tRNA;5515269;5515341;82;*;gca
;comp;tRNA;5515424;5515497;131;*;atc
;comp;rRNA;5515629;5517117;317;*;1489
fin;;CDS;5517435;5517515;;0;
deb;comp;CDS;5572068;5572769;290;*;
;;tRNA;5573060;5573132;153;*;atgi
fin;comp;CDS;5573286;5573720;;0;
deb;;CDS;5573827;5574450;93;*;
;comp;tRNA;5574544;5574615;345;*;aca
fin;;CDS;5574961;5575881;;;
deb;comp;CDS;5655654;5655797;24;*;
;comp;tRNA;5655822;5655893;144;*;aac
fin;comp;CDS;5656038;5656589;;;
deb;;CDS;5688669;5689538;75;*;
;;tRNA;5689614;5689686;666;*;ttc
fin;comp;CDS;5690353;5692080;;;
deb;;CDS;5756596;5757801;66;*;
;;tRNA;5757868;5757940;137;*;cgg
fin;comp;CDS;5758078;5758233;;;
deb;;CDS;6022666;6023613;294;*;
;;tmRNA;6023908;6024297;537;*;
fin;comp;CDS;6024835;6025290;;0;
deb;comp;CDS;6048961;6050142;268;*;
;comp;tRNA;6050411;6050520;427;*;other
fin;;CDS;6050948;6051328;;;
deb;comp;CDS;6075820;6077016;175;*;
;comp;tRNA;6077192;6077263;171;*;ggg
fin;comp;CDS;6077435;6078040;;;
deb;comp;CDS;6083633;6084493;676;*;
;;rRNA;6085170;6086658;131;*;1489
;;tRNA;6086790;6086863;82;*;atc
;;tRNA;6086946;6087018;260;*;gca
;;rRNA;6087279;6090167;61;*;2889
;;rRNA;6090229;6090346;176;*;118
fin;comp;CDS;6090523;6090720;;;
deb;comp;CDS;6498176;6499135;149;*;
;comp;rRNA;6499285;6499402;61;*;118
;comp;rRNA;6499464;6502352;260;*;2889
;comp;tRNA;6502613;6502685;82;*;gca
;comp;tRNA;6502768;6502841;131;*;atc
;comp;rRNA;6502973;6504461;315;*;1489
fin;;CDS;6504777;6505643;;0;
deb;;CDS;6889916;6890785;61;*;
;;tRNA;6890847;6890918;294;*;aaa
fin;comp;CDS;6891213;6892148;;;
deb;;CDS;6948457;6949644;162;*;
;;tRNA;6949807;6949888;313;*;cta
fin;;CDS;6950202;6950609;;0;
deb;comp;CDS;6980662;6982233;171;*;
;;tRNA;6982405;6982478;1521;*;gtc
fin;comp;CDS;6984000;6985919;;0;
deb;;CDS;7066111;7067829;232;*;
;comp;tRNA;7068062;7068133;270;*;caa
fin;comp;CDS;7068404;7069606;;;
deb;comp;CDS;7071719;7071991;39;*;
;comp;tRNA;7072031;7072114;109;*;ttg
fin;comp;CDS;7072224;7073345;;;
deb;comp;CDS;7074644;7076011;409;*;
;;tRNA;7076421;7076502;95;*;ctg
fin;;CDS;7076598;7077374;;0;
deb;;CDS;7130044;7131132;131;*;
;comp;tRNA;7131264;7131335;33;*;acg
fin;;CDS;7131369;7131662;;0;
deb;;CDS;7224805;7225167;146;*;
;;tRNA;7225314;7225386;378;*;tgg
fin;;CDS;7225765;7225986;;;
deb;comp;CDS;7324019;7324405;25;*;
;comp;ncRNA;7324431;7324527;37;*;
fin;comp;CDS;7324565;7324831;;0;
deb;comp;CDS;7346902;7348245;396;*;
;;tRNA;7348642;7348724;127;*;ctc
fin;;CDS;7348852;7349475;;;
deb;;CDS;7506243;7506593;747;*;
;comp;tRNA;7507341;7507414;50;*;ccc
fin;comp;CDS;7507465;7507830;;;
deb;;CDS;7517041;7519347;167;*;
;;tRNA;7519515;7519588;301;*;atgj
fin;comp;CDS;7519890;7520066;;;
deb;comp;CDS;7571389;7571706;898;*;
;comp;tRNA;7572605;7572676;63;*;aag
fin;comp;CDS;7572740;7574992;;;
deb;comp;CDS;7610323;7610769;481;*;
;comp;tRNA;7611251;7611323;71;*;gca
fin;;CDS;7611395;7612312;;0;
deb;;CDS;7936008;7936736;65;*;
;;tRNA;7936802;7936874;437;*;gcg
fin;;CDS;7937312;7938874;;;
deb;;CDS;7973321;7973482;70;*;
;comp;tRNA;7973553;7973624;88;*;acc
;comp;tRNA;7973713;7973798;124;*;tac
fin;comp;CDS;7973923;7974897;;0;
deb;;CDS;7975047;7975976;100;*;
;;tRNA;7976077;7976161;374;*;tca
fin;;CDS;7976536;7978545;;;
&lt;/pre&gt;

===pmg===
====pmg opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_opérons|pmg opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Proc_mari_MIT_9301/procMari_MIT_9301-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_009091.1;pmg;;genome;;;;;;;;
31.3%GC;13.8.19 Paris;16s 1;37;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Prochlorococcus marinus str. MIT 9301;;;;;;;;;;;
comp;74235..75521;;CDS;;4;4;;;429;;
comp;75526..75607;;ctt;;259;259;;;;;
;75867..77216;;CDS;;;;;;450;;
;;;;;;;;;;;
;132034..132708;;CDS;;49;49;;;225;;
;132758..132829;;aac;;566;*566;;;;;
;133396..133845;;CDS;;;;;;150;;
;;;;;;;;;;;
comp;239249..240268;;CDS;;170;170;;;340;;
comp;240439..240520;;cta;;71;71;;;;;
;240592..241041;;CDS;;;;;;150;;
;;;;;;;;;;;
comp;257573..258844;;CDS;;77;77;;;424;;
comp;258922..258995;;cgt;;86;86;;;;;
;259082..259333;;CDS;;;;;;84;;
;;;;;;;;;;;
comp;272771..274039;;CDS;;18;18;;;423;;
comp;274058..274130;;atgi;;141;141;;;;;
;274272..274832;;CDS;;;;;;187;;
;;;;;;;;;;;
;305431..305850;;CDS;;84;84;;;140;;
comp;305935..306010;;ttc;;91;91;;;;;
comp;306102..307331;;CDS;;;;;;410;;
;;;;;;;;;;;
;313891..314472;;CDS;;178;178;;;194;;
comp;314651..314722;;aca;;65;65;;;;;
comp;314788..315120;;CDS;;;;;;111;;
;;;;;;;;;;;
comp;320549..321988;;CDS;;603;*603;;;480;;
;322592..324074;;16s;;125;;;;;;
;324200..324273;;atc;;12;;;12;;;
;324286..324358;;gca;;256;;;;;;
;324615..327496;;23s;;60;;;;;;
;327557..327673;;5s;;43;43;;;;;
comp;327717..328595;;CDS;;;;;;293;;
;;;;;;;;;;;
comp;354976..355167;;CDS;;88;88;;;64;;
comp;355256..355327;;acc;;10;;10;;;;
comp;355338..355419;;tac;;102;102;;;;;
;355522..355962;;CDS;;;;;;147;;
;;;;;;;;;;;
comp;434230..435660;;CDS;;17;17;;;477;;
comp;435678..435751;;gac;;149;149;;;;;
comp;435901..436095;;CDS;;35;35;;;65;;
comp;436131..436203;;tgg;;53;53;;;;;
comp;436257..436727;;CDS;;;;;;157;;
;;;;;;;;;;;
;521448..522497;;CDS;;99;99;;;350;;
;522597..522682;;tta;;78;78;;;;;
;522761..522994;;CDS;;;;;;78;;
;;;;;;;;;;;
comp;609397..609897;;CDS;;249;249;;;167;;
comp;610147..610233;;tca;;404;*404;;;;;
;610638..611399;;CDS;;;;;;254;;
;;;;;;;;;;;
;774440..775240;;CDS;;210;210;;;267;;
comp;775451..775524;;ccc;;27;27;;;;;
comp;775552..776280;;CDS;;;;;;243;;
;;;;;;;;;;;
comp;828018..828392;;CDS;;49;49;;;125;;
;828442..828528;;tcc;;214;214;;;;;
;828743..830740;;CDS;;;;;;*666;;
;;;;;;;;;;;
;868731..869213;;CDS;;29;29;;;161;;
;869243..869316;;atgj;;67;67;;;;;
;869384..869671;;CDS;;;;;;96;;
;;;;;;;;;;;
;909742..910707;;CDS;;45;45;;;322;;
;910753..910829;;atgf;;591;*591;;;;;
;911421..911810;;CDS;;;;;;130;;
;;;;;;;;;;;
;996073..996609;;CDS;;16;16;;;179;;
comp;996626..996698;;gaa;;41;41;;;;;
comp;996740..997858;;CDS;;;;;;373;;
;;;;;;;;;;;
comp;1040019..1040135;;CDS;;177;177;;;39;;
;1040313..1040384;;aaa;;512;*512;;;;;
;1040897..1041004;;CDS;;;;;;36;;
;;;;;;;;;;;
;1044863..1045423;;CDS;;276;276;;;187;;
;1045700..1045773;;cca;;188;188;;;;;
comp;1045962..1046666;;CDS;;;;;;235;;
;;;;;;;;;;;
;1134197..1134427;;CDS;;251;251;;;77;;
comp;1134679..1134763;;tcg;;63;63;;;;;
comp;1134827..1135849;;CDS;;;;;;341;;
;;;;;;;;;;;
comp;1163424..1164092;;CDS;;138;138;;;223;;
;1164231..1164304;;aga;;27;27;;;;;
;1164332..1165600;;CDS;;;;;;423;;
;;;;;;;;;;;
;1212124..1212894;;CDS;;58;58;;;257;;
comp;1212953..1213025;;gcc;;129;129;;;;;
comp;1213155..1214180;;CDS;;;;;;342;;
;;;;;;;;;;;
;1253753..1255123;;CDS;;525;*525;;;457;;
;1255649..1255730;;ttg;;5;5;;;;;
;1255736..1256911;;CDS;;;;;;392;;
;;;;;;;;;;;
comp;1259549..1260784;;CDS;;131;131;;;412;;
;1260916..1260988;;cac;;72;72;;;;;
;1261061..1262455;;CDS;;;;;;465;;
;;;;;;;;;;;
;1275239..1277272;;CDS;;0;*0;;;*678;;
comp;1277273..1277343;;gga;;112;112;;;;;
;1277456..1278802;;CDS;;;;;;449;;
;;;;;;;;;;;
;1308006..1308797;;CDS;;50;50;;;264;;
;1308848..1308919;;gtc;;67;67;;;;;
;1308987..1309604;;CDS;;;;;;206;;
;;;;;;;;;;;
comp;1419657..1419893;;CDS;;54;54;;;79;;
;1419948..1420019;;acg;;100;100;;;;;
;1420120..1420440;;CDS;;;;;;107;;
;;;;;;;;;;;
;1453287..1454075;;CDS;;35;35;;;263;;
comp;1454111..1454199;;agc;;61;61;;;;;
comp;1454261..1455460;;CDS;;;;;;400;;
;;;;;;;;;;;
;1472925..1473932;;CDS;;94;94;;;336;;
;1474027..1474098;;caa;;16;16;;;;;
;1474115..1474891;;CDS;;;;;;259;;
;;;;;;;;;;;
comp;1485558..1486649;;CDS;;77;77;;;364;;
;1486727..1486800;;cgg;;11;11;;;;;
comp;1486812..1487258;;CDS;;;;;;149;;
;;;;;;;;;;;
comp;1500099..1501325;;CDS;;42;42;;;409;;
;1501368..1501438;;tgc;@1;364;364;;;;;
comp;1501803..1502447;;CDS;;;;;;215;;
;;;;;;;;;;;
comp;1517796..1518128;;CDS;;78;78;;;111;;
comp;1518207..1518280;;agg;;38;38;;;;;
;1518319..1518700;;ncRNA;;21;21;;;;;
;1518722..1519471;;CDS;;;;;;250;;
;;;;;;;;;;;
comp;1554202..1554633;;CDS;;45;45;;;144;;
comp;1554679..1554750;;ggc;;61;61;;;;;
comp;1554812..1555288;;CDS;;;;;;159;;
;;;;;;;;;;;
comp;1600898..1601284;;CDS;@2;-30;*-30;;;129;;
comp;1601255..1601326;;gta;;98;98;;;;;
;1601425..1602279;;CDS;;;;;;285;;
&lt;/pre&gt;

====pmg cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_cumuls|pmg cumuls]]
&lt;pre&gt;
pmg cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds chromosome;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 300
avec rRNA;opérons;1;1;;;1;2;1;;100;9;30;0
;16 23 5s 0;0;20;1;1;50;22;40;;200;20;60;2
;16 atc gca;1;40;;;100;23;80;;300;15;90;6
;16 23 5s a;0;60;;;150;7;120;;400;10;120;4
;max a;2;80;;;200;4;160;;500;13;150;9
;a doubles;0;100;;;250;3;200;;600;0;180;5
;autres;0;120;;;300;3;240;;700;2;210;4
;total aas;2;140;;;350;0;280;;800;0;240;4
sans ;opérons;34;160;;;400;1;320;;900;0;270;8
;1 aa;33;180;;;450;1;360;;1000;0;300;2
;max a;2;200;;;500;0;400;;1100;0;330;1
;a doubles;0;;;;;5;;;;0;;24
;total aas;35;;1;1;;71;;0;;69;;69
total aas;;37;;;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;10;12;;127;;;;260;;
;;;variance;0;0;;146;;;;147;;
sans jaune;;;moyenne;;;;93;;;;248;;170
;;;variance;;;;76;;;;130;;74
&lt;/pre&gt;

====pmg blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_blocs|pmg blocs]]
&lt;pre&gt;
pmg bloc;;
CDS;603;480
16s;125;1483
atc;12;
gca;256;
23s;60;2882
5s;43;117
CDS;;293
&lt;/pre&gt;

====pmg remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_remarques|pmg remarques]]
*code génétique de pmg
&lt;pre&gt;
Remarques;;;;;;;37
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc; 
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata; ;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;
gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====pmg distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_distribution|pmg distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
cyano;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;cyano;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;cyano;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
pmg;;33;;;;;;;pmg;2;;;;;;;;pmg;0;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====pmg données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_données_intercalaires|pmg données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;pmg;fx;fc;pmg;fx40;fc40;pmg;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;1;0;11;34;0;11;34;-1;1;35;4;259;16s tRNA;;
;2;10;116;199;1;18;17;-2;0;0;49;185;125;;atc
2;3;20;39;116;2;16;27;-3;0;0;566;86;tRNA 23s;;
;2;30;26;71;3;22;25;-4;40;69;71;141;258;;gca
1;1;40;14;64;4;11;26;-5;0;0;77;87;tRNA tRNA;;intra
2;5;50;23;50;5;9;18;-6;2;0;18;178;12;;atc gca
2;1;60;22;45;6;12;23;-7;0;1;91;102;tRNA tRNA;;
;6;70;22;50;7;8;11;-8;11;13;65;404;10;;acc
1;5;80;34;46;8;8;11;-9;1;0;88;210;**;;tac
2;1;90;21;42;9;6;27;-10;0;2;17;49;;;
1;4;100;28;31;10;6;14;-11;3;11;149;16;;;
1;0;110;16;27;11;1;19;-12;2;0;35;177;;;
1;0;120;12;23;12;2;14;-13;0;3;53;188;;;
;1;130;14;17;13;5;14;-14;3;6;99;251;;;
2;0;140;26;17;14;6;6;-15;3;0;78;138;;;
1;1;150;15;7;15;5;12;-16;3;2;249;58;;;
;0;160;14;13;16;4;10;-17;4;3;27;131;;;
;0;170;9;9;17;5;11;-18;1;0;214;0;;;
2;0;180;12;9;18;6;11;-19;0;0;29;112;;;
2;0;190;13;5;19;2;6;-20;3;1;67;54;;;
;0;200;8;1;20;3;13;-21;2;0;45;35;;;
2;0;210;7;5;21;2;2;-22;2;0;591;77;;;
;1;220;6;5;22;4;7;-23;2;0;41;11;;;
;0;230;6;8;23;4;4;-24;2;0;512;42;;;
;0;240;3;3;24;5;8;-25;0;2;276;210;;;
;1;250;5;2;25;0;5;-26;1;3;63;98;;;
2;0;260;6;2;26;2;6;-27;1;0;342;;;;
;0;270;4;2;27;4;11;-28;1;0;129;;;;
;1;280;3;1;28;3;9;-29;0;0;525;;;;
;0;290;4;2;29;0;8;-30;1;0;5;;;;
;0;300;8;3;30;2;11;-31;0;0;72;;;;
;0;310;2;1;31;4;3;-32;1;0;50;;;;
;0;320;2;4;32;1;9;-33;0;0;67;;;;
;0;330;5;3;33;1;7;-34;0;0;100;;;;
;0;340;6;2;34;1;1;-35;1;0;61;;;;
;1;350;5;0;35;1;7;-36;0;0;94;;;;
;0;360;0;1;36;1;11;-37;0;0;16;;;;
;0;370;2;2;37;0;6;-38;1;0;78;;;;
;0;380;1;3;38;2;6;-39;0;0;45;;;;
;0;390;1;0;39;1;6;-40;0;0;61;;;;
;0;400;1;2;40;2;8;-41;0;1;-30;;;;
1;4;reste;27;21;reste;393;464;-42;1;0;CDS 16s;;;;
26;41;total;599;948;total;599;948;-43;1;0;-;601;;;
24;36;diagr;561;893;diagr;195;450;-44;0;1;23s 5s;;;;
2;7; t30;181;386;;;;-45;0;0;64;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;5s CDS;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;-;43;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;588;96;11;695;;;-49;0;0;;;;;
;c;914;157;34;1105;;;-50;0;2;;;;;
;;;;;1800;84;;reste;2;2;;;;;
;;;;;;1884;;total;96;157;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====pmg autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_autres_intercalaires_aas|pmg autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;pmg;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;65120;66082;306;*;
;comp;tmRNA;66389;66662;44;*;
fin;;CDS;66707;67831;;0;
deb;comp;CDS;74235;75521;4;*;
;comp;tRNA;75526;75607;259;*;ctt
fin;;CDS;75867;77216;;0;
deb;;CDS;132034;132708;49;*;
;;tRNA;132758;132829;566;*;aac
fin;;CDS;133396;133845;;;
deb;comp;CDS;239249;240253;185;*;
;;tRNA;240439;240520;71;*;cta
fin;;CDS;240592;241041;;;
deb;comp;CDS;257573;258844;77;*;
;comp;tRNA;258922;258995;86;*;cgt
fin;;CDS;259082;259333;;;
deb;comp;CDS;272771;274039;18;*;
;comp;tRNA;274058;274130;141;*;atgi
fin;;CDS;274272;274832;;;
deb;;CDS;305431;305850;87;*;
;comp;tRNA;305938;306010;91;*;ttc
fin;comp;CDS;306102;307331;;;
deb;;CDS;313891;314472;178;*;
;comp;tRNA;314651;314722;65;*;aca
fin;comp;CDS;314788;315123;;;
deb;comp;CDS;320549;321988;601;*;
;;rRNA;322590;324074;125;*;1483
;;tRNA;324200;324273;12;*;atc
;;tRNA;324286;324358;258;*;gca
;;rRNA;324617;327492;64;*;2882
;;rRNA;327557;327673;43;*;117
fin;comp;CDS;327717;328595;;;
deb;comp;CDS;354976;355167;88;*;
;comp;tRNA;355256;355327;10;*;acc
;comp;tRNA;355338;355419;102;*;tac
fin;;CDS;355522;355962;;;
deb;comp;CDS;434230;435660;17;*;
;comp;tRNA;435678;435751;149;*;gac
deb;comp;CDS;435901;436095;35;*;
;comp;tRNA;436131;436203;53;*;tgg
fin;comp;CDS;436257;436595;;;
deb;;CDS;521448;522497;99;*;
;;tRNA;522597;522682;78;*;tta
fin;;CDS;522761;522994;;;
deb;comp;CDS;609397;609897;249;*;
;comp;tRNA;610147;610233;404;*;tca
fin;;CDS;610638;611399;;0;
deb;;CDS;656308;657498;17;*;
;;ncRNA;657516;657700;162;*;
fin;;CDS;657863;658162;;;
deb;;CDS;774440;775240;210;*;
;comp;tRNA;775451;775524;27;*;ccc
fin;comp;CDS;775552;776280;;;
deb;comp;CDS;828018;828392;49;*;
;;tRNA;828442;828528;214;*;tcc
fin;;CDS;828743;830740;;;
deb;;CDS;868731;869213;29;*;
;;tRNA;869243;869316;67;*;atgj
fin;;CDS;869384;869671;;;
deb;;CDS;909742;910707;45;*;
;;tRNA;910753;910829;591;*;atgf
fin;;CDS;911421;911810;;;
deb;;CDS;996073;996609;16;*;
;comp;tRNA;996626;996698;41;*;gaa
fin;comp;CDS;996740;997858;;0;
deb;comp;CDS;1040019;1040135;177;*;
;;tRNA;1040313;1040384;512;*;aaa
fin;;CDS;1040897;1041004;;0;
deb;;CDS;1044863;1045423;276;*;
;;tRNA;1045700;1045773;188;*;cca
fin;comp;CDS;1045962;1046666;;;
deb;;CDS;1134197;1134427;251;*;
;comp;tRNA;1134679;1134763;63;*;tcg
fin;comp;CDS;1134827;1135849;;0;
deb;comp;CDS;1163424;1164092;138;*;
;;tRNA;1164231;1164304;342;*;aga
fin;;CDS;1164647;1165600;;0;
deb;;CDS;1212124;1212894;58;*;
;comp;tRNA;1212953;1213025;129;*;gcc
fin;comp;CDS;1213155;1214180;;0;
deb;;CDS;1253753;1255123;525;*;
;;tRNA;1255649;1255730;5;*;ttg
fin;;CDS;1255736;1256911;;;
deb;comp;CDS;1259549;1260784;131;*;
;;tRNA;1260916;1260988;72;*;cac
fin;;CDS;1261061;1262455;;;
deb;;CDS;1264859;1265974;12;*;
;comp;ncRNA;1265987;1266083;47;*;
fin;;CDS;1266131;1266904;;1;
deb;;CDS;1275239;1277272;0;*;
;comp;tRNA;1277273;1277343;112;*;gga
fin;;CDS;1277456;1278802;;;
deb;;CDS;1308006;1308797;50;*;
;;tRNA;1308848;1308919;67;*;gtc
fin;;CDS;1308987;1309604;;;
deb;comp;CDS;1419657;1419893;54;*;
;;tRNA;1419948;1420019;100;*;acg
fin;;CDS;1420120;1420440;;;
deb;;CDS;1453287;1454075;35;*;
;comp;tRNA;1454111;1454199;61;*;agc
fin;comp;CDS;1454261;1455460;;0;
deb;;CDS;1472925;1473932;94;*;
;;tRNA;1474027;1474098;16;*;caa
fin;;CDS;1474115;1474891;;;
deb;comp;CDS;1485558;1486649;77;*;
;;tRNA;1486727;1486800;11;*;cgg
fin;comp;CDS;1486812;1487258;;;
deb;comp;CDS;1500099;1501325;42;*;
;;tRNA;1501368;1501438;210;*;tgc
fin;comp;CDS;1501649;1501816;;;
deb;comp;CDS;1517796;1518128;78;*;
;comp;tRNA;1518207;1518280;38;*;agg
;;ncRNA;1518319;1518700;21;*;
fin;;CDS;1518722;1519471;;0;
deb;comp;CDS;1526173;1527543;34;*;
;comp;regulatory;1527578;1527676;66;*;
fin;comp;CDS;1527743;1527955;;;
deb;comp;CDS;1554202;1554633;45;*;
;comp;tRNA;1554679;1554750;61;*;ggc
fin;comp;CDS;1554812;1555288;;;
deb;comp;CDS;1600898;1601284;-30;*;
;comp;tRNA;1601255;1601326;98;*;gta
fin;;CDS;1601425;1602279;;;
&lt;/pre&gt;

====pmg intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_intercalaires_entre_cds|pmg intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
pmg;9.2.21 Paris;;Pmg 8.2.21;;;;;;;
;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;253;14.1;'''négatif ;-10;11;-1 à -67;'''1641879;-1;253
;'''zéro;45;2.5;;;;;'''intercals;0;45
;'''1 à 200;1326;73.7;'''0 à 200;55;51;;'''139122;5;189
;'''201 à 370;120;6.7;'''201 à 370;270;48;;'''8.5%;10;126
;'''371 à 600;42;2.3;'''371 à 600;452;60;;;15;84
;'''601 à max;14;0.8;'''601 à  1051;778;154;;;20;71
;'''total 1800;&lt;201;90.2;'''total  1798;74;114;-67 à 1051;;25;41
adresse;intercal;intercal;&lt;u&gt;fréquence1;intercal;&lt;u&gt;fréquence6;cumul, %;intercal;&lt;u&gt;fréquence-1;30;56
1337910;1643;-1;253;-70;0;;0;45;35;35
344859;1208;0;°45;-60;3;;-1;°36;40;43
1131068;1051;1;35;-50;3;;-2;0;45;34
1332255;987;2;43;-40;4;;-3;0;50;39
666029;950;3;°47;-30;4;'''min à -1;-4;°109;55;34
1046608;901;4;37;-20;20;253;-5;0;60;33
873756;800;5;27;-10;46;14.1%;-6;2;65;30
1082452;696;6;°35;0;218;;-7;1;70;42
1073300;690;7;19;10;315;;-8;°24;75;36
1086818;679;8;19;20;155;;-9;1;80;44
1350077;676;9;°33;30;97;;-10;2;85;36
947641;638;10;20;40;78;'''1 à 100;-11;°14;90;27
1340696;638;11;20;50;73;1059;-12;2;95;22
1274338;625;12;16;60;67;58.8%;-13;3;100;37
1330270;579;13;°19;70;72;;-14;°9;105;20
1040897;574;14;12;80;80;;-15;3;110;23
39429;566;15;17;90;63;;-16;5;115;19
956617;560;16;14;100;59;;-17;°7;120;16
1328069;560;17;16;110;43;;-18;1;125;15
1331574;540;18;°17;120;35;;-19;0;130;16
1071397;523;19;8;130;31;;-20;°4;135;23
661816;518;20;16;140;43;;-21;2;140;20
1341490;508;21;4;150;22;;-22;2;145;14
660601;495;22;11;160;27;;-23;°2;150;8
872185;484;23;8;170;18;'''1 à 200;-24;2;155;18
353338;478;24;°13;180;21;1326;-25;2;160;9
134240;471;25;5;190;18;74%;-26;°4;165;8
1198984;467;26;8;200;9;;-27;1;170;10
332235;461;27;°15;210;12;;-28;1;175;8
892293;459;28;12;220;11;;-29;0;180;13
948687;458;29;8;230;14;;-30;1;185;9
1321313;450;30;°13;240;6;;-31;0;190;9
924950;449;31;7;250;7;'''0 à 200;-32;1;195;6
914728;448;32;10;260;8;1371;;77;200;3
1066510;445;33;°8;270;6;;reste;12;205;7
938157;441;34;2;280;4;;total;298;210;5
226447;435;35;8;290;6;;;;215;4
1188279;430;36;°12;300;11;;intercal;&lt;u&gt;frequencef;220;7
773451;421;37;6;310;3;;600;1786;225;8
858898;421;38;8;320;6;;620;;230;6
;;39;7;330;8;;640;3;235;3
;;40;10;340;8;'''201 à 370;660;;240;3
;;reste;857;350;5;120;680;2;245;3
;;total;1527;360;1;6.7%;700;2;250;4
;;;;370;4;;720;;255;4
;;;;380;4;;740;;260;4
1631675;-67;comp;;390;1;;760;;265;3
701382;-65;shfit2;592;400;3;;780;;270;3
886946;-61;comp;;410;6;;800;1;275;3
1045962;-59;shfit2;646;420;1;;820;;280;1
828743;-50;shfit2;1948;430;4;;840;;285;5
1349614;-50;shfit2;463;440;1;;860;;290;1
1425201;-44;shfit2;1765;450;5;;880;;295;6
1539296;-43;comp;;460;2;;900;;300;5
1249293;-42;comp;;470;2;;920;1;305;1
244064;-41;shfit2;295;480;2;;940;;310;2
162356;-38;;;490;1;;960;1;315;3
20410;-35;;;500;1;;980;;320;3
427059;-32;;;510;1;;1000;1;325;7
587323;-30;;;520;1;;1020;;330;1
1611400;-28;;;530;1;;1040;;335;3
744978;-27;;;540;1;'''371 à 600;1060;1;340;5
303832;-26;;;550;0;42;;12;345;3
489984;-26;;;560;2;2.3%;;;350;2
808548;-26;;;570;1;;;;355;1
1223639;-26;;;580;2;'''601 à max;;;360;0
1181603;-25;;;590;0;14;;;365;3
1209844;-25;;;600;0;0.8%;;;370;1
27867;-24;;;reste;14;;reste;2;reste;56
975566;-24;;;total;1800;;total;1800;total;1800
&lt;/pre&gt;

====pmg   intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg _intercalaires_positifs_S+|pmg  intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
pmg. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
pmg;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-67;515;-1295;119;607;256;min40;&amp;-107;844;-2106;170;869;263;min60
31 à 400;23;-124;47;41;774;180;2 parties;&amp;-35;327;-1017;107;973;311;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;194;65;-;428;poly;179;SF;&amp;78;69;;501;poly;368;SF
31 à 400;122;45;-;726;dte;48;tm;&amp;153;49;-;687;poly;286;SF
;;;;;;;;;;;;;;
pmg. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
pub;min20;218;537;755;908;857;883;26;866;852;840;;;
pmg;min40;559;895;1454;856;728;802;74;904;915;928;;;
ade;min50;1229;2242;3471;867;624;758;134;879;897;903;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
317;628;0.50;327;980;40;59;281;389;88;367;715;;;
326;430;0.76;692;1108;16;31;137;143;196;449;703;;;
221;335;0.66;1412;3052;8;6;72;234;304;876;459;;;
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations, diagrammes 1-40, les intercalaires négatifs, totaux.
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;24.1.22 paris;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;0.703;;;pmg;Sx-;Sc-
41-n;0.856;0.728;0.802;;;;;;;;;;-1;0;36
1-n;0.928;0.904;0.915;;;;;;;;;;-2;0;0
pmg;fx;fc;;pmg;fx%;fc%;;pmg;fx40;fc40;;x;-3;0;0
0;11;34;;0;20;38;;0;11;34;&gt;0;586;-4;40;69
10;117;198;;10;209;221;;1;18;17;&lt;0;95;-5;0;0
20;39;116;;20;70;130;;2;16;27;zéro;11;-6;2;0
30;26;71;;30;47;79;;3;22;25;total;692;-7;0;1
40;14;64;;40;25;72;;4;11;26;;c;-8;11;13
50;22;51;;50;39;57;;5;9;18;&gt;0;916;-9;1;0
60;22;45;;60;39;50;;6;12;23;&lt;0;158;-10;0;2
70;22;50;;70;39;56;;7;9;10;zéro;34;-11;3;11
80;34;46;;80;61;51;;8;8;11;total;1108;-12;2;0
90;21;42;;90;38;47;;9;6;27;;;-13;0;3
100;28;31;;100;50;35;;10;6;14;total;1800;-14;3;6
110;16;27;;110;29;30;;11;1;19;;;-15;3;0
120;12;23;;120;21;26;;12;2;14;;;-16;3;2
130;14;17;;130;25;19;;13;5;14;;;-17;4;3
140;26;17;;140;47;19;;14;6;6;;;-18;1;0
150;15;7;;150;27;8;;15;5;12;;;-19;0;0
160;14;13;;160;25;15;;16;4;10;;;-20;3;1
170;9;9;;170;16;10;;17;5;11;;;-21;2;0
180;12;9;;180;21;10;;18;6;11;;;-22;2;0
190;13;5;;190;23;6;;19;2;6;;;-23;2;0
200;8;1;;200;14;1;;20;3;13;;;-24;2;0
210;7;5;;210;13;6;;21;2;2;;;-25;0;2
220;6;5;;220;11;6;;22;4;7;;;-26;1;3
230;6;8;;230;11;9;;23;4;4;;;-27;1;0
240;3;3;;240;5;3;;24;5;8;;;-28;1;0
250;5;2;;250;9;2;;25;0;5;;;-29;0;0
260;6;2;;260;11;2;;26;2;6;;;-30;1;0
270;3;3;;270;5;3;;27;4;11;;;-31;0;0
280;3;1;;280;5;1;;28;3;9;;;-32;1;0
290;3;3;;290;5;3;;29;0;8;;;-33;0;0
300;8;3;;300;14;3;;30;2;11;;;-34;0;0
310;2;1;;310;4;1;;31;4;3;;;-35;1;0
320;2;4;;320;4;4;;32;1;9;;;-36;0;0
330;5;3;;330;9;3;;33;1;7;;;-37;0;0
340;6;2;;340;11;2;;34;1;1;;;-38;1;0
350;5;0;;350;9;0;;35;1;7;;;-39;0;0
360;0;1;;360;0;1;;36;1;11;;;-40;0;0
370;2;2;;370;4;2;;37;0;6;;;-41;0;1
380;1;3;;380;2;3;;38;2;6;;;-42;1;0
390;1;0;;390;2;0;;39;1;6;;;-43;1;0
400;1;2;;400;2;2;;40;2;8;;;-44;0;1
reste;27;21;;;;;;reste;390;467;;;-45;0;0
total;597;950;;t30;326;430;;total;597;950;;;-46;0;0
diagr;559;895;;;;;;diagr;196;449;;;-47;0;0
 - t30;377;510;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;;-50;0;2
;;;;;;;;;;;;;reste;2;2
;;;;;;;;;;;;;total;95;158
&lt;/pre&gt;

====pmg   intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg _intercalaires_négatifs_S-|pmg  intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
pmg;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp';0;0;0;37;0;2;0;10;1;0;3;2;0;3;3;3;4;1;0;3;2;2;2;2;0;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;2;91
continu;36;0;0;72;0;0;1;14;0;2;11;0;3;6;0;2;3;0;0;1;0;0;0;0;2;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;2;2;162
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;pmg;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;33;0;2;0;11;1;0;3;2;0;3;3;3;4;1;0;3;2;2;2;2;0;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;2;88
;Sc-;36;0;0;69;0;0;1;13;0;2;11;0;3;6;0;2;3;0;0;1;0;0;0;0;2;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;2;3;159
&lt;/pre&gt;

====pmg autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_autres_intercalaires|pmg autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
deb-fin;gène;adresse;intercal;brin;;deb-fin;gène;adresse;intercal;brin;;deb-fin;gène;adresse;intercal;brin
deb;°CDS;65120;306;;;deb;°CDS;521448;99;;;deb;°CDS;1259549;131;comp
;tmRNA;66389;44;comp;;;&amp;tRNA;522597;78;;;;&amp;tRNA;1260916;72;
fin;°CDS;66707;;;;fin;°CDS;522761;;;;fin;°CDS;1261061;;
deb;°CDS;74235;4;comp;;deb;°CDS;609397;249;comp;;deb;°CDS;1264859;12;
;&amp;tRNA;75526;259;comp;;;&amp;tRNA;610147;404;comp;;;ncRNA;1265987;47;comp
fin;°CDS;75867;;;;fin;°CDS;610638;;;;fin;°CDS;1266131;;
deb;°CDS;132034;49;;;deb;°CDS;656308;17;;;deb;°CDS;1275239;0;
;&amp;tRNA;132758;566;;;;ncRNA;657516;162;;;;&amp;tRNA;1277273;112;comp
fin;°CDS;133396;;;;fin;°CDS;657863;;;;fin;°CDS;1277456;;
deb;°CDS;239249;185;comp;;deb;°CDS;774440;210;;;deb;°CDS;1308006;50;
;&amp;tRNA;240439;71;comp;;;&amp;tRNA;775451;27;comp;;;&amp;tRNA;1308848;67;
fin;°CDS;240592;;;;fin;°CDS;775552;;comp;;fin;°CDS;1308987;;
deb;°CDS;257573;77;comp;;deb;°CDS;828018;49;comp;;deb;°CDS;1419657;54;comp
;&amp;tRNA;258922;86;comp;;;&amp;tRNA;828442;214;;;;&amp;tRNA;1419948;100;
fin;°CDS;259082;;;;fin;°CDS;828743;;;;fin;°CDS;1420120;;
deb;°CDS;272771;18;comp;;deb;°CDS;868731;29;;;deb;°CDS;1453287;35;
;&amp;tRNA;274058;141;comp;;;&amp;tRNA;869243;67;;;;&amp;tRNA;1454111;61;comp
fin;°CDS;274272;;;;fin;°CDS;869384;;;;fin;°CDS;1454261;;comp
deb;°CDS;305431;87;;;deb;°CDS;909742;45;;;deb;°CDS;1472925;94;
;&amp;tRNA;305938;91;comp;;;&amp;tRNA;910753;591;;;;&amp;tRNA;1474027;16;
fin;°CDS;306102;;comp;;fin;°CDS;911421;;;;fin;°CDS;1474115;;
deb;°CDS;313891;178;;;deb;°CDS;996073;16;;;deb;°CDS;1485558;77;comp
;&amp;tRNA;314651;65;comp;;;&amp;tRNA;996626;41;comp;;;&amp;tRNA;1486727;11;
fin;°CDS;314788;;comp;;fin;°CDS;996740;;comp;;fin;°CDS;1486812;;comp
deb;°CDS;320549;601;comp;;deb;°CDS;1040019;177;comp;;deb;°CDS;1500099;42;comp
;$rRNA;322590;125;;;;&amp;tRNA;1040313;512;;;;&amp;tRNA;1501368;210;
;&amp;tRNA;324200;12;;;fin;°CDS;1040897;;;;fin;°CDS;1501649;;comp
;&amp;tRNA;324286;258;;;deb;°CDS;1044863;276;;;deb;°CDS;1517796;78;comp
;$rRNA;324617;64;;;;&amp;tRNA;1045700;188;;;;&amp;tRNA;1518207;38;comp
;$rRNA;327557;43;;;fin;°CDS;1045962;;comp;;;ncRNA;1518319;21;
fin;°CDS;327717;;comp;;deb;°CDS;1134197;251;;;fin;°CDS;1518722;;
deb;°CDS;354976;88;comp;;;&amp;tRNA;1134679;63;comp;;deb;°CDS;1526173;34;comp
;&amp;tRNA;355256;10;comp;;fin;°CDS;1134827;;comp;;;regulatory;1527578;66;comp
;&amp;tRNA;355338;102;comp;;deb;°CDS;1163424;138;comp;;fin;°CDS;1527743;;comp
fin;°CDS;355522;;;;;&amp;tRNA;1164231;342;;;deb;°CDS;1554202;45;comp
deb;°CDS;434230;17;comp;;fin;°CDS;1164647;;;;;&amp;tRNA;1554679;61;comp
;&amp;tRNA;435678;149;comp;;deb;°CDS;1212124;58;;;fin;°CDS;1554812;;comp
deb;°CDS;435901;35;comp;;;&amp;tRNA;1212953;129;comp;;deb;°CDS;1600898;-30;comp
;&amp;tRNA;436131;53;comp;;fin;°CDS;1213155;;comp;;;&amp;tRNA;1601255;98;comp
fin;°CDS;436257;;comp;;deb;°CDS;1253753;525;;;fin;°CDS;1601425;;
;;;;;;&amp;tRNA;1255649;5;;; ;;;;
 ;;;;;;fin;°CDS;1255736;;;; ;;;
&lt;/pre&gt;
====pmg intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_intercalaires_tRNA|pmg intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
pmg;relevés;;;;;;proportion des intercalaires &lt;201;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls;;;deb;fin;total
;;;;;;;;;;;;&lt;201;29;25;54
;;;4;comp’;259;;-30;5;deb;;;total;34;33;67
;;;49;;566;;4;16;&lt;201;16;;taux;85%;76%;81%
;;;185;comp’;71;;17;27;total;19;;;;;
;;;77;comp’;86;;18;41;%;84%;;;;;
;;;18;comp’;141;;29;53;;;;;;;
;;comp’;87;;91;;35;61;fin;;;;;;
;;comp’;178;;65;;45;61;&lt;201;17;;;;;
;10;;88;comp’;102;;45;63;total;22;;;;;
;;;17;;149;;49;65;%;77%;;;;;
;;;35;;53;;50;67;;;;;;;
;;;99;;78;;77;67;total;;;;;;
;;;249;comp’;404;;78;72;&lt;201;33;;;;;
;;comp’;210;;27;;88;78;total;41;;;;;
;;comp’;49;;214;;94;91;%;80%;;;;;
;;;29;;67;;99;100;;;;;;;
;;;45;;591;;185;129;;;;;;;
;;comp’;16;;41;;249;149;;;;;;;
;;comp’;177;;512;;276;214;;;;;;;
;;;276;comp’;188;;525;342;;;;;;;
;;comp’;251;;63;;-;512;;;;;;;
;;comp’;138;;342;;-;566;;;;;;;
;;comp’;58;;129;;-;591;comp’;cumuls;;;;;
;;;525;;5;;0;11;deb;;;;;;
;;comp’;131;;72;;16;71;&lt;201;13;;;;;
;;comp’;0;comp’;112;;35;86;total;15;;;;;
;;;50;;67;;42;98;%;87%;;;;;
;;comp’;54;;100;;49;102;;;;;;;
;;comp’;35;;61;;54;112;fin;;;;;;
;;;94;;16;;58;141;&lt;201;8;;;;;
;;comp’;77;comp’;11;;77;188;total;11;;;;;
;;comp’;42;comp’;210;;87;210;%;73%;;;;;
;;;78;;;;131;259;;;;;;;
;;;45;;61;;138;404;total;;;;;;
;;;-30;comp’;98;;177;-;&lt;201;21;;;;;
;;;;;;;178;-;total;26;;;;;
;;;;;;;210;-;%;81%;;;;;
;;;;;;;251;-;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===cyano synthèse===
====cyano distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#cyano_distribution_par_génome|cyano distribution par génome]]

====cyano distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#cyano_distribution_du_total|cyano distribution du total]]
&lt;pre&gt;
cyano2;;;;;;;99
atgi;3;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;3
atc;;acc;3;aac;3;agc;3
ctc;2;ccc;2;cac;2;cgt;3
gtc;2;gcc;2;gac;3;ggc;2
tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;2;aga;2
cta;3;cca;3;caa;3;cga;
gta;2;gca;2;gaa;3;gga;2
ttg;3;tcg;2;tag;;tgg;3
atgj;4;acg;2;aag;1;agg;2
ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;27;72;;;;;99
;;;;;;;
cyano2;;;;;;;
atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;5;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;5;gaa;;gga;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;dupli;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;4;;;;;10;10
&lt;/pre&gt;

====cyano distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#cyano_distribution_par_type|cyano distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
cyano2;;;;;;;99;;cyano2;;;;;;;72;;cyano2;;;;;;;23;;cyano2;;;;;;;4
atgi;3;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;3;;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;3;aac;3;agc;3;;atc;;acc;1;aac;2;agc;2;;atc;;acc;2;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;2;cac;2;cgt;3;;ctc;1;ccc;2;cac;2;cgt;2;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;2;gcc;2;gac;3;ggc;2;;gtc;2;gcc;1;gac;2;ggc;2;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;;aga;
cta;3;cca;3;caa;3;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;2;gaa;3;gga;2;;gta;2;gca;1;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;3;tcg;2;tag;;tgg;3;;ttg;2;tcg;2;tag;;tgg;2;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;4;acg;2;aag;1;agg;2;;atgj;2;acg;2;aag;1;agg;2;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;2;;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;2;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;27;72;;;;;99;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====cyano par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#cyano_par_rapport_au_groupe_de_référence|cyano par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;cyano2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;19;4;;;;;23;
16;moyen;27;10;2;;;10;49;
14;fort;26;9;2;;;;37;
; ;72;23;4;;;10;109;
10;g+cga;8;2;;;;;10;
2;agg+cgg;4;;;;;;4;
4;carre ccc;6;2;;;;;8;
5;autres;1;;;;;;1;
;;19;4;;;;;23;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;cyano2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;174;37;;;;;211;26
16;moyen;248;92;18;;;92;450;324
14;fort;239;83;18;;;;339;650
; ;661;211;37;;;92;109;729
10;g+cgg;73;18;;;;;92;10
2;agg+cga;37;;;;;;37;
4;carre ccc;55;18;;;;;73;16
5;autres;9;;;;;;9;
;;174;37;;;;;211;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;cyano2;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;192;40;;232;26;26;17;
16;moyen;273;101;20;394;324;38;43;
14;fort;263;91;20;374;650;36;39;
; ;727;232;40;99;729;72;23;
10;g+cgg;81;20;;101;10;42;;
2;agg+cga;40;;;40;;21;;
4;carre ccc;61;20;;81;16;32;;
5;autres;10;;;10;;5;;
;;192;40;;232;;19;;
&lt;/pre&gt;
====cyano, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#cyano,_estimation_des_-rRNAs|cyano, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
actino;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
31 génomes total avec rRNA;;;;cyano;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;cyano;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;31;103; ; ;;indices;;;;31;332;0;0;;cyano2;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;99
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;3
atc;58;acc;;aac;;agc;;;atc;187;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;3;aac;3;agc;3
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;2;cac;2;cgt;3
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;2;gcc;2;gac;3;ggc;2
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;2;aga;2
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;3;cca;3;caa;3;cga;
gta;;gca;45;gaa;;gga;;;gta;;gca;145;gaa;;gga;;;gta;2;gca;2;gaa;3;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;3;tcg;2;tag;;tgg;3
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;4;acg;2;aag;1;agg;2
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;39;;37;;23;99
27.5.20 Tanger;;;;cyano;total;ttt;tgt;;25.11.20 Paris;;;;cyano;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;3959;3.6;0.0;;;;;;84;3959;3.6;0.0;;cyano2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;105;tct;0.2;tat;;atgf;98;;atgi;105;tct;;tat;;atgf;98;;atgi;150;tct;;tat;;atgf;150
att;;act;0.7;aat;;agt;0.2;;att;7.1;act;2.4;aat;3.6;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0.9;cct;0.5;cat;0.9;cgc;1.4;;ctt;17;cct;2.4;cat;2.4;cgc;1.2;;ctt;50;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.2;gct;0.2;gat;0.9;ggt;0.2;;gtt;;gct;1.2;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;123;tcc;102;tac;118;tgc;113;;ttc;123;tcc;102;tac;118;tgc;113;;ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;150
atc;8;acc;106;aac;117;agc;114;;atc;195;acc;106;aac;117;agc;114;;atc;;acc;150;aac;150;agc;150
ctc;94;ccc;101;cac;110;cgt;111;;ctc;94;ccc;101;cac;110;cgt;111;;ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;150
gtc;102;gcc;108;gac;119;ggc;108;;gtc;102;gcc;108;gac;119;ggc;108;;gtc;100;gcc;100;gac;150;ggc;100
tta;83;tca;114;taa;;tga;0;;tta;83;tca;114;taa;2.4;tga;;;tta;100;tca;100;taa;;tga;
ata;9.5;aca;114;aaa;115;aga;114;;ata;9.5;aca;114;aaa;115;aga;114;;ata;;aca;200;aaa;100;aga;100
cta;118;cca;130;caa;114;cga;2;;cta;118;cca;130;caa;114;cga;2.4;;cta;150;cca;150;caa;150;cga;
gta;111;gca;48;gaa;118;gga;111;;gta;111;gca;193;gaa;118;gga;111;;gta;100;gca;100;gaa;150;gga;100
ttg;119;tcg;113;tag;2.4;tgg;110;;ttg;119;tcg;113;tag;2.4;tgg;110;;ttg;150;tcg;100;tag;;tgg;150
atgj;118;acg;102;aag;38;agg;77;;atgj;118;acg;102;aag;38;agg;77;;atgj;200;acg;100;aag;50;agg;100
ctg;92;ccg;85;cag;13;cgg;100;;ctg;92;ccg;85;cag;13;cgg;100;;ctg;100;ccg;100;cag;50;cgg;100
gtg;43;gcg;82;gag;8;ggg;76;;gtg;43;gcg;82;gag;8.3;ggg;76;;gtg;;gcg;50;gag;;ggg;50
;;1574;;1607;;1156;4337;;;;1906;;1607;;1171;4684;;;;1950;;1850;;1150;4950
rapports;;83;;100;;99;93;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;cyano2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;100;;fiches;48.549;;;fréquences;;;;;atgi;30;tct;100;tat;;atgf;35
att;;act;29;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;1505;;;0/0;1;;;;att;;act;100;aat;;agt;100
ctt;5;cct;;cat;;cgc;;;avec;119;;;10;12;;;;ctt;98;cct;100;cat;100;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;31;;;20;9;;;;gtt;100;gct;100;gat;100;ggt;100
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;14;;;;ttc;19;tcc;2;tac;15;tgc;25
atc;4;acc;100;aac;100;agc;100;;cyano2;49.5;;;40;3;;;;atc;100;acc;29;aac;22;agc;24
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;100;;sans;99;;;50;2;40;;;ctc;6;ccc;1;cac;9;cgt;26
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;10;;;60;1;;;;gtc;2;gcc;7;gac;21;ggc;7
tta;100;tca;100;taa;;tga;;;genom;2;;;70;0;;;;tta;17;tca;12;taa;;tga;
ata;100;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;1;;;;ata;100;aca;43;aaa;13;aga;12
cta;100;cca;100.0;caa;100;cga;100;;L’estimation par bact ;;;;90;0;;;;cta;21;cca;13;caa;24;cga;100
gta;100;gca;25;gaa;100;gga;100;;est  2% au dessus;;;;100;5;;;;gta;10;gca;52;gaa;21;gga;10
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;21;tcg;12;tag;100;tgg;27
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;41;acg;2;aag;24;agg;23
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;8;ccg;15;cag;74;cgg;0
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;100;gcg;39;gag;100;ggg;34
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;330;;279;;337;946
&lt;/pre&gt;

==bacteroide==
===myr===
====myr opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_opérons|myr opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Myro_A21/myroSp_A21-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP010327.1;myr;;genome;;;;;;;
34.1%GC;14.8.19 Paris;16s 8;101;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd
Myroides sp. A21;;;;;;;;;;
comp;151454..152776;;CDS;;270;270;;;441;
comp;153047..153134;;tca;;208;208;;;;
comp;153343..154476;;CDS;;;;;;378;
;;;;;;;;;;
;211346..212332;;CDS;;123;123;;;329;
comp;212456..212530;;gta;+;27;;27;;;
comp;212558..212635;;gta;5 gta;27;;27;;;
comp;212663..212740;;gta;;27;;27;;;
comp;212768..212845;;gta;;42;;42;;;
comp;212888..212965;;gta;;92;92;;;;
comp;213058..214275;;CDS;;;;;;406;
;;;;;;;;;;
comp;294948..295334;;CDS;;146;146;;;129;
comp;295481..295554;;aga;;28;;28;;;
comp;295583..295660;;cca;;7;;7;;;
comp;295668..295751;;agc;;280;280;;;;
;296032..297210;;CDS;;;;;;393;
;;;;;;;;;;
;327067..328053;;CDS;;112;112;;;329;
comp;328166..328241;;aaa;+;698;;*698;;;
comp;328940..329021;;ctc;6 aaa;87;;*87;;;
comp;329109..329184;;aaa;@1;31;;31;;;
comp;329216..329291;;aaa;;36;;36;;;
comp;329328..329403;;aaa;;45;;45;;;
comp;329449..329524;;aaa;;33;;33;;;
comp;329558..329633;;aaa;;129;129;;;;
;329763..330281;;CDS;;;;;;173;
;;;;;;;;;;
comp;353908..354384;;CDS;;259;259;;;159;
comp;354644..354753;;5s;;107;;;;110;
comp;354861..357744;;23s;;150;;;;2884;
comp;357895..357971;;gca;;88;;;88;;
comp;358060..358136;;atc;;75;;;;;
comp;358212..359735;;16s;;265;;;;1524;
comp;360001..360110;;5s;;103;;;;110;
comp;360214..363107;;23s;;150;;;;2894;
comp;363258..363334;;gca;;88;;;88;;
comp;363423..363499;;atc;;75;;;;;
comp;363575..365098;;16s;;687;*687;;;1524;
comp;365786..366973;;CDS;;;;;;396;
;;;;;;;;;;
comp;407344..408819;;CDS;;141;141;;;492;
comp;408961..409037;;aca;+;33;;33;;;
comp;409071..409147;;aca;5 aca;38;;38;;;
comp;409186..409262;;aca;;39;;39;;;
comp;409302..409378;;aca;;41;;41;;;
comp;409420..409493;;aca;;81;81;;;;
comp;409575..409838;;CDS;;;;;;88;
;;;;;;;;;;
comp;550792..551043;;CDS;;37;37;;;84;
comp;551081..551155;;gaa;+;40;;40;;;
comp;551196..551267;;gaa;6 gaa;37;;37;;;
comp;551305..551376;;gaa;;38;;38;;;
comp;551415..551486;;gaa;;35;;35;;;
comp;551522..551596;;gaa;;38;;38;;;
comp;551635..551706;;gaa;;75;75;;;;
comp;551782..553257;;CDS;;;;;;492;
;;;;;;;;;;
comp;571079..574315;;CDS;;165;165;;;*1079;
comp;574481..574590;;5s;;107;;;;110;
comp;574698..577581;;23s;;118;;;;2884;
comp;577700..577776;;gca;;88;;;88;;
comp;577865..577941;;atc;;76;;;;;
comp;578018..579541;;16s;;264;;;;1524;
comp;579806..579915;;5s;;106;;;;110;
comp;580022..582915;;23s;;150;;;;2894;
comp;583066..583142;;gca;;88;;;88;;
comp;583231..583307;;atc;;77;;;;;
comp;583385..584908;;16s;;1070;*1070;;;1524;
comp;585979..586545;;CDS;;;;;;189;
;;;;;;;;;;
comp;719558..719755;;CDS;;13;13;;;66;
comp;719769..719842;;tgg;;60;60;;;;
comp;719903..721090;;CDS;;58;58;;;396;
comp;721149..721220;;acc;;20;;20;;;
comp;721241..721321;;tac;;27;;27;;;
comp;721349..721425;;aca;;93;93;;;;
comp;721519..721818;;CDS;;;;;;100;
;;;;;;;;;;
;781522..782178;;CDS;;76;76;;;219;
;782255..782330;;atgf;;93;93;;;;
;782424..782978;;CDS;;;;;;185;
;;;;;;;;;;
comp;783008..783451;;CDS;;332;332;;;148;
;783784..783859;;atgf;;110;110;;;;
comp;783970..785886;;CDS;;;;;;*639;
;;;;;;;;;;
comp;814859..815281;;CDS;;541;*541;;;141;
comp;815823..815899;;cga;;10;10;;;;
comp;815910..816362;;CDS;;;;;;151;
;;;;;;;;;;
;868515..869267;;CDS;;37;37;;;251;
comp;869305..869380;;gga;+;34;;34;;;
comp;869415..869490;;gga;6 gga;34;;34;;;
comp;869525..869600;;gga;;34;;34;;;
comp;869635..869710;;gga;;34;;34;;;
comp;869745..869820;;gga;;37;;37;;;
comp;869858..869930;;gga;;242;242;;;;
;870173..870646;;CDS;;;;;;158;
;;;;;;;;;;
;1010425..1011210;;CDS;;92;92;;;262;
comp;1011303..1011376;;caa;+;221;;*221;;;
comp;1011598..1011668;;caa;2 caa;183;183;;;;
;1011852..1015055;;CDS;;;;;;*1068;
;;;;;;;;;;
comp;1110980..1111921;;CDS;;158;158;;;314;
;1112080..1112162;;ttg;;44;44;;;;
comp;1112207..1112701;;CDS;;;;;;165;
;;;;;;;;;;
;1113809..1114273;;CDS;;158;158;;;155;
comp;1114432..1114541;;5s;;105;;;;110;
comp;1114647..1117530;;23s;;150;;;;2884;
comp;1117681..1117757;;gca;;88;;;88;;
comp;1117846..1117922;;atc;;75;;;;;
comp;1117998..1119521;;16s;;266;;;;1524;
comp;1119788..1119897;;5s;;105;;;;110;
comp;1120003..1122896;;23s;;150;;;;2894;
comp;1123047..1123123;;gca;;88;;;88;;
comp;1123212..1123288;;atc;;77;;;;;
comp;1123366..1124889;;16s;;77;;;;1524;
comp;1126238..1126311;;aac;;90;90;;;;
comp;1126402..1127745;;CDS;;;;;;448;
;;;;;;;;;;
;1214932..1215615;;CDS;;101;101;;;228;
comp;1215717..1215790;;tgc;;88;88;;;;
comp;1215879..1216235;;CDS;;;;;;119;
;;;;;;;;;;
;1391184..1391825;;CDS;;85;85;;;214;
;1391911..1391987;;aac;+;370;;*370;;;
;1392358..1392434;;aac;2 aac;590;*590;;;;
comp;1393025..1393459;;CDS;;;;;;145;
;;;;;;;;;;
;1597909..1598226;;CDS;;635;*635;;;106;
;1598862..1598938;;gac;+;148;;*148;;;
;1599087..1599163;;gac;3 gac;202;;*202;;;
;1599366..1599442;;gac;;169;169;;;;
comp;1599612..1600157;;CDS;;;;;;182;
;;;;;;;;;;
comp;1643091..1644479;;CDS;;132;132;;;463;
;1644612..1644696;;cta;+;183;;*183;;;
;1644880..1644961;;cta;2 cta;314;314;;;;
;1645276..1646115;;CDS;;;;;;280;
;;;;;;;;;;
;1721814..1722689;;CDS;;66;66;;;292;
comp;1722756..1722826;;tgg;;51;51;;;;
comp;1722878..1723252;;CDS;;;;;;125;
;;;;;;;;;;
comp;1738209..1739033;;CDS;;183;183;;;275;
comp;1739217..1739293;;atgi;+;24;;24;;;
comp;1739318..1739394;;atgi;2 atgi;69;69;;;;
comp;1739464..1739865;;CDS;;;;;;134;
;;;;;;;;;;
&gt;;1924596..1926158;;CDS;+;-41;*-41;;;*521;
comp;1926118..1926206;;tta;2 tta;341;;*341;;;
comp;1926548..1926633;;tta;@2;320;320;;;;
&lt;;1926954..1927025;;CDS;;;;;;24;
;;;;;;;;;;
;1928728..1929714;;CDS;;125;125;;;329;
comp;1929840..1929925;;tta;;147;147;;;;
comp;1930073..1930444;;CDS;;108;108;;;124;
comp;1930553..1930638;;tta;;6;;6;;;
comp;1930645..1930720;;ggc;;201;201;;;;
comp;1930922..1933519;;CDS;;;;;;*866;
;;;;;;;;;;
comp;1961822..1962571;;CDS;;128;128;;;250;
;1962700..1962775;;ttc;+;32;;32;;;
;1962808..1962883;;ttc;3 ttc;23;;23;;;
;1962907..1962982;;ttc;;97;97;;;;
comp;1963080..1964066;;CDS;;;;;;329;
;;;;;;;;;;
;2082191..2082733;;CDS;;1103;*1103;;;181;
;2083837..2085360;;16s;;77;;;;1524;
;2085438..2085514;;atc;;88;;;88;;
;2085603..2085679;;gca;;150;;;;;
;2085830..2088713;;23s;;106;;;;2884;
;2088820..2088929;;5s;;156;156;;;110;
;2089086..2089943;;CDS;;;;;;286;
;;;;;;;;;;
;2147912..2148241;;CDS;;286;286;;;110;
;2148528..2148604;;cgt;+;49;;49;;;
;2148654..2148730;;cgt;2 cgt;69;69;;;;
;2148800..2149288;;CDS;;;;;;163;
;;;;;;;;;;
comp;2207990..2208685;;CDS;;111;111;;;232;
comp;2208797..2208872;;atgf;;106;106;;;;
comp;2208979..2209605;;CDS;;147;147;;;209;
comp;2209753..2209829;;atgj;;145;145;;;;
;2209975..2210361;;CDS;;;;;;129;
;;;;;;;;;;
comp;2425634..2426896;;CDS;;299;299;;;421;
comp;2427196..2427270;;cca;;353;353;;;;
;2427624..2428565;;CDS;;;;;;314;
;;;;;;;;;;
comp;2434061..2435053;;CDS;;125;125;;;331;
comp;2435179..2435252;;atgj;;366;366;;;;
;2435619..2436269;;CDS;;;;;;217;
;;;;;;;;;;
;2561350..2563341;;CDS;;1072;*1072;;;*664;
;2564414..2565937;;16s;;74;;;;1524;
;2566012..2566088;;atc;;90;;;90;;
;2566179..2566255;;gca;;118;;;;;
;2566374..2569256;;23s;;105;;;;2883;
;2569362..2569471;;5s;;279;279;;;110;
;2569751..2571682;;CDS;;;;;;*610;
;;;;;;;;;;
comp;2676791..2678620;;CDS;;235;235;;;*610;
comp;2678856..2678940;;tca;;497;*497;;;;
;2679438..2681390;;CDS;;;;;;*651;
;;;;;;;;;;
comp;2977513..2977920;;CDS;;497;*497;;;136;
comp;2978418..2978492;;gta;;61;61;;;;
comp;2978554..2978928;;CDS;;;;;;125;
;;;;;;;;;;
;3228192..3228908;;CDS;;79;79;;;239;
;3228988..3229064;;cac;+;23;;23;;;
;3229088..3229164;;cac;4 cac;22;;22;;;
;3229187..3229263;;cac;;21;;21;;;
;3229285..3229361;;cac;;40;40;;;;
comp;3229402..3230577;;CDS;;;;;;392;
;;;;;;;;;;
comp;3394869..3395093;;CDS;;90;90;;;75;
comp;3395184..3395268;;tca;;215;215;;;;
comp;3395484..3396884;;CDS;;;;;;467;
;;;;;;;;;;
;3457542..3458360;;CDS;;150;150;;;273;
;3458511..3458594;;tac;+;49;;49;;;
;3458644..3458727;;tac;4 tac;48;;48;;;
;3458776..3458859;;tac;;41;;41;;;
;3458901..3458984;;tac;;309;309;;;;
comp;3459294..3460415;;CDS;;;;;;374;
;;;;;;;;;;
;3951958..3953367;;CDS;;595;*595;;;470;
;3953963..3954039;;aga;+;80;;80;;;
;3954120..3954196;;aga;2 aga;36;36;;;;
comp;3954233..3954712;;CDS;;;;;;160;
;;;;;;;;;;
;3975219..3976205;;CDS;;99;99;;;329;
comp;3976305..3976379;;cca;+;36;;36;;;
comp;3976416..3976493;;cca;2 cca;7;;7;;;
comp;3976501..3976587;;agc;;965;*965;;;;
;3977553..3978161;;CDS;;;;;;203;
&lt;/pre&gt;

====myr cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_cumuls|myr cumuls]]
&lt;pre&gt;
myr cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;8;1;0;;1;1;1;;100;6;30;1
;16 23 5s 0;0;20;4;;50;7;20;;200;25;60;0
;16 atc gca;8;40;28;;100;21;40;;300;16;90;4
;16 23 5s a;0;60;7;;150;18;60;;400;14;120;4
;max a;2;80;1;;200;7;80;;500;9;150;10
;a doubles;0;100;1;8;250;5;100;;600;1;180;8
;autres;0;120;0;;300;6;120;;700;5;210;6
;total aas;16;140;0;;350;4;140;;800;0;240;6
sans ;opérons;34;160;1;;400;2;160;;900;1;270;3
;1 aa;13;180;0;;450;0;180;;1000;0;300;5
;max a;7;200;1;;500;2;200;;1100;2;330;6
;a doubles;17;;5;;;9;;;;0;;26
;total aas;85;;48;8;;82;;0;;79;;79
total aas;;101;;;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;74;88;;223;;;;302;;
;;;variance;120;0;;242;;;;209;;
sans jaune;;;moyenne;33;;;144;;;;244;;189
;;;variance;13;;;90;;;;122;;78
&lt;/pre&gt;

====myr blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_blocs|myr blocs]]
&lt;pre&gt;
myr blocs;;;;;;;
CDS;259;159;165;1079;CDS;158;155
5s;107;110;107;110;5s;105;110
23s;150;2884;118;2884;23s;150;2884
gca;88;;88;;gca;88;
atc;75;;76;;atc;75;
16s;265;1524;264;1524;16s;266;1524
5s;103;110;106;110;5s;105;110
23s;150;2894;150;2894;23s;150;2894
gca;88;;88;;gca;88;
atc;75;;77;;atc;77;
16s;687;1524;1070;1524;16s;77;1524
CDS;;396;;189;aac;90;
;;;;;CDS;;448
;;;;;;;
CDS;1103;181;1072;664;;;
16s;77;1524;74;1524;;;
atc;88;;90;;;;
gca;150;;118;;;;
23s;106;2884;105;2883;;;
5s;156;110;279;110;;;
CDS;;286;;644;;;
&lt;/pre&gt;

====myr remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_remarques|myr remarques]]
*code génétique de myr
&lt;pre&gt;
myr;;;;;;;101
atgi;2;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;3;tcc;;tac;5;tgc;1
atc;8;acc;1;aac;3;agc;2
ctc;1;ccc;;cac;4;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;3;ggc;1
tta;4;tca;3;taa;;tga;
ata;;aca;6;aaa;6;aga;3
cta;2;cca;4;caa;2;cga;1
gta;6;gca;8;gaa;6;gga;6
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2
atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====myr distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_distribution|myr distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;3;tcc;;tac;4;tgc;
atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;0;agc;2;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;4;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;
tta;1;tca;3;taa;;tga;;;tta;0;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;5;aaa;5;aga;2
cta;;cca;1;caa;;cga;1;;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;5;gca;;gaa;6;gga;6
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
bact;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;bact;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;bact;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
myr;;16;;;;;;;myr;11;;;;;;;;myr;57;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====myr données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_données_intercalaires|myr données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;;intercalaire;;;intercalaire;;
fxt;fct;myr;fx;fc;myr;fx40;fc40;myr;x-;c-;c;x;c;x;aa;c;x;aa;c;x;aa
1;0;0;5;13;0;5;13;-1;0;71;273;123;CDS 16s;;;tRNA tRNA;;;tRNA tRNA;;suite
;1;10;26;435;1;0;66;-2;0;0;208;280;688;;;30;;gta;52;;cgt
;2;20;12;251;2;5;78;-3;0;2;92;115;1071;;;30;;gta;**;;cgt
;0;30;21;130;3;5;61;-4;9;60;146;466;1104;;;30;;gta;22;;tgc
2;2;40;38;83;4;3;56;-5;0;0;144;73;1073;;;42;;gta;22;;tgc
2;0;50;51;68;5;1;29;-6;3;0;81;129;5s 16s;;;**;;gta;22;;tgc
;3;60;47;69;6;1;42;-7;0;10;209;332;266;;;31;;aga;22;;tgc
1;2;70;54;98;7;4;23;-8;0;34;32;113;265;;;7;;cca;**;;tgc
1;4;80;51;80;8;2;32;-9;0;0;40;40;267;;;**;;agc;26;;cac
;5;90;29;96;9;1;25;-10;0;3;75;95;23s 5s;;;90;;ctc;25;;cac
3;3;100;35;88;10;4;23;-11;2;28;16;183;2* 109;;;34;;aaa;24;;cac
1;2;110;22;73;11;1;41;-12;0;0;60;158;105;;;39;;aaa;**;;cac
2;1;120;32;67;12;2;46;-13;1;1;58;47;2* 108;;;48;;aaa;49;;tac
4;1;130;28;42;13;0;19;-14;0;22;93;104;3* 107;;;36;;aaa;51;;tac
1;0;140;22;49;14;1;27;-15;1;0;76;593;5s CDS;;;**;;aaa;44;;tac
1;5;150;28;51;15;2;16;-16;0;2;96;169;259;158;;36;;aca;**;;tac
1;0;160;30;30;16;1;19;-17;1;15;544;132;165;;;41;;aca;83;;aga
1;0;170;26;32;17;1;24;-18;1;0;10;66;156;;;42;;aca;**;;aga
;0;180;21;33;18;2;19;-19;0;1;90;242;279;;;41;;aca;39;;cca
1;1;190;22;29;19;1;21;-20;1;6;88;-38;16s tRNA;;;**;;aca;10;;cca
;0;200;20;24;20;1;19;-21;0;0;85;381;3* 80;;atc;40;;gaa;**;;agc
;3;210;19;22;21;0;15;-22;0;0;635;125;81;;atc;37;;gaa;;;
;1;220;12;21;22;4;15;-23;0;7;314;128;3* 82;;atc;38;;gaa;;;
;0;230;17;17;23;0;15;-24;0;0;51;100;79;;atc;38;;gaa;;;
;1;240;19;20;24;0;18;-25;0;1;186;145;tRNA 23s;;;38;;gaa;;;
1;0;250;16;15;25;0;14;-26;0;4;69;353;6*151;;gca;**;;gaa;;;
;0;260;14;16;26;2;10;-27;0;0;147;366;2* 119;;gca;20;;acc;;;
;0;270;17;22;27;5;9;-28;0;0;108;497;tRNA 16s;;;30;;tac;;;
1;1;280;9;8;28;4;12;-29;0;3;201;43;90;;aac;**;;aca;;;
;1;290;11;14;29;4;10;-30;0;0;286;312;tRNA tRNA;;intra;37;;gga;;;
;2;300;12;8;30;2;12;-31;0;0;72;39;7* 91;;atc gca;37;;gga;;;
;0;310;12;12;31;4;8;-32;0;1;114;99;93;;atc gca;37;;gga;;;
1;1;320;10;16;32;1;14;-33;0;0;106;965;;;;37;;gga;;;
;0;330;10;11;33;3;5;-34;0;3;150;;;;;37;;gga;;;
1;0;340;5;7;34;5;9;-35;0;1;299;;;;;**;;gga;;;
;0;350;4;12;35;2;3;-36;0;0;125;;;;;221;;caa;;;
1;0;360;11;9;36;7;10;-37;0;0;235;;;;;**;;caa;;;
1;0;370;6;6;37;3;8;-38;0;2;20;;;;;373;;aac;;;
;0;380;2;7;38;2;7;-39;0;0;294;;;;;**;;aac;;;
1;0;390;3;5;39;5;13;-40;0;0;497;;;;;151;;gac;;;
;0;400;5;4;40;6;6;-41;0;2;61;;;;;202;;gac;;;
4;4;reste;146;180;reste;877;1362;-42;0;0;79;;;;;**;;gac;;;
33;46;total;980;2273;total;979;2274;-43;0;0;90;;;;;186;;cta;;;
28;42;diagr;829;2080;diagr;97;899;-44;0;1;215;;;;;**;;cta;;;
0;3; t30;59;816;;;;-45;0;0;;;;;;24;;atgi;;;
;;;;;;;;-46;0;1;;;;;;**;;atgi;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;;;;;;341;;tta;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;;**;;tta;;;
;x;975;20;5;1000;;;-49;0;0;;;;;;9;;tta;;;
;c;2260;282;13;2555;;;-50;0;0;;;;;;**;;ggc;;;
;;;;;3555;199;;reste;1;0;;;;;;35;;ttc;;;
;;;;;;3754;;total;20;282;;;;;;26;;ttc;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;**;;ttc;;;
&lt;/pre&gt;
=====myr autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_autres_intercalaires_aas|myr autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;myr;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;151454;152776;273;*;
;comp;tRNA;153050;153134;208;*;tca
fin;comp;CDS;153343;154476;;;
deb;comp;CDS;171836;174145;177;*;
;comp;regulatory;174323;174510;162;*;
fin;;CDS;174673;175134;;0;
deb;;CDS;211346;212332;123;*;
;comp;tRNA;212456;212530;30;*;gta
;comp;tRNA;212561;212635;30;*;gta
;comp;tRNA;212666;212740;30;*;gta
;comp;tRNA;212771;212845;42;*;gta
;comp;tRNA;212888;212965;92;*;gta
fin;comp;CDS;213058;214275;;;
deb;comp;CDS;294948;295334;146;*;
;comp;tRNA;295481;295554;31;*;aga
;comp;tRNA;295586;295660;7;*;cca
;comp;tRNA;295668;295751;280;*;agc
fin;;CDS;296032;297210;;;
deb;;CDS;327067;328053;115;*;
;comp;tRNA;328169;328241;466;*;aaa
deb;;CDS;328708;328866;73;*;
;comp;tRNA;328940;329021;90;*;ctc
;comp;tRNA;329112;329184;34;*;aaa
;comp;tRNA;329219;329291;39;*;aaa
;comp;tRNA;329331;329403;48;*;aaa
;comp;tRNA;329452;329524;36;*;aaa
;comp;tRNA;329561;329633;129;*;aaa
fin;;CDS;329763;330281;;1;
deb;comp;CDS;353908;354384;259;*;
;comp;rRNA;354644;354753;109;*;5s
;comp;rRNA;354863;357746;151;*;23s
;comp;tRNA;357898;357971;91;*;gca
;comp;tRNA;358063;358136;80;*;atc
;comp;rRNA;358217;359734;266;*;16s
;comp;rRNA;360001;360110;105;*;5s
;comp;rRNA;360216;363109;151;*;23s
;comp;tRNA;363261;363334;91;*;gca
;comp;tRNA;363426;363499;80;*;atc
;comp;rRNA;363580;365097;688;*;16s
fin;comp;CDS;365786;366973;;;
deb;comp;CDS;407344;408819;144;*;
;comp;tRNA;408964;409037;36;*;aca
;comp;tRNA;409074;409147;41;*;aca
;comp;tRNA;409189;409262;42;*;aca
;comp;tRNA;409305;409378;41;*;aca
;comp;tRNA;409420;409493;81;*;aca
fin;comp;CDS;409575;409838;;;
deb;comp;CDS;539601;541829;209;*;
;comp;tRNA;542039;542158;32;*;other
fin;comp;CDS;542191;543285;;0;
deb;comp;CDS;550792;551043;40;*;
;comp;tRNA;551084;551155;40;*;gaa
;comp;tRNA;551196;551267;37;*;gaa
;comp;tRNA;551305;551376;38;*;gaa
;comp;tRNA;551415;551486;38;*;gaa
;comp;tRNA;551525;551596;38;*;gaa
;comp;tRNA;551635;551706;75;*;gaa
fin;comp;CDS;551782;553257;;0;
deb;comp;CDS;571079;574315;165;*;
;comp;rRNA;574481;574590;109;*;5s
;comp;rRNA;574700;577583;119;*;23s
;comp;tRNA;577703;577776;91;*;gca
;comp;tRNA;577868;577941;81;*;atc
;comp;rRNA;578023;579540;265;*;16s
;comp;rRNA;579806;579915;108;*;5s
;comp;rRNA;580024;582917;151;*;23s
;comp;tRNA;583069;583142;91;*;gca
;comp;tRNA;583234;583307;82;*;atc
;comp;rRNA;583390;584907;1071;*;16s
fin;comp;CDS;585979;586545;;;
deb;comp;CDS;719558;719755;16;*;
;comp;tRNA;719772;719842;60;*;tgg
deb;comp;CDS;719903;721090;58;*;
;comp;tRNA;721149;721220;20;*;acc
;comp;tRNA;721241;721321;30;*;tac
;comp;tRNA;721352;721425;93;*;aca
fin;comp;CDS;721519;721818;;;
deb;;CDS;781522;782178;76;*;
;;tRNA;782255;782327;96;*;atgf
fin;;CDS;782424;782978;;0;
deb;comp;CDS;783008;783451;332;*;
;;tRNA;783784;783856;113;*;atgf
fin;comp;CDS;783970;785886;;;
deb;comp;CDS;814859;815281;544;*;
;comp;tRNA;815826;815899;10;*;cga
fin;comp;CDS;815910;816362;;0;
deb;;CDS;868515;869267;40;*;
;comp;tRNA;869308;869380;37;*;gga
;comp;tRNA;869418;869490;37;*;gga
;comp;tRNA;869528;869600;37;*;gga
;comp;tRNA;869638;869710;37;*;gga
;comp;tRNA;869748;869820;37;*;gga
;comp;tRNA;869858;869930;242;*;gga
fin;;CDS;870173;870646;;;
deb;;CDS;887776;888255;96;*;
;;regulatory;888352;888451;64;*;
fin;;CDS;888516;888722;;;
deb;comp;CDS;900643;902784;77;*;
;comp;regulatory;902862;902950;75;*;
fin;comp;CDS;903026;903424;;;
deb;;CDS;1010425;1011210;95;*;
;comp;tRNA;1011306;1011376;221;*;caa
;comp;tRNA;1011598;1011668;183;*;caa
fin;;CDS;1011852;1015055;;;
deb;comp;CDS;1110980;1111921;158;*;
;;tRNA;1112080;1112159;47;*;ttg
fin;comp;CDS;1112207;1112701;;0;
deb;;CDS;1113809;1114273;158;*;
;comp;rRNA;1114432;1114541;107;*;5s
;comp;rRNA;1114649;1117532;151;*;23s
;comp;tRNA;1117684;1117757;91;*;gca
;comp;tRNA;1117849;1117922;80;*;atc
;comp;rRNA;1118003;1119520;267;*;16s
;comp;rRNA;1119788;1119897;107;*;5s
;comp;rRNA;1120005;1122898;151;*;23s
;comp;tRNA;1123050;1123123;91;*;gca
;comp;tRNA;1123215;1123288;82;*;atc
;comp;rRNA;1123371;1124888;1349;*;16s
;comp;tRNA;1126238;1126311;90;*;aac
fin;comp;CDS;1126402;1127745;;0;
deb;;CDS;1214932;1215615;104;*;
;comp;tRNA;1215720;1215790;88;*;tgc
fin;comp;CDS;1215879;1216235;;0;
deb;;CDS;1391184;1391825;85;*;
;;tRNA;1391911;1391984;373;*;aac
;;tRNA;1392358;1392431;593;*;aac
fin;comp;CDS;1393025;1393459;;0;
deb;;CDS;1597909;1598226;635;*;
;;tRNA;1598862;1598935;151;*;gac
;;tRNA;1599087;1599163;202;*;gac
;;tRNA;1599366;1599442;169;*;gac
fin;comp;CDS;1599612;1600157;;;
deb;comp;CDS;1604664;1606733;112;*;
;comp;regulatory;1606846;1607027;57;*;
fin;comp;CDS;1607085;1607525;;;
deb;comp;CDS;1643091;1644479;132;*;
;;tRNA;1644612;1644693;186;*;cta
;;tRNA;1644880;1644961;314;*;cta
fin;;CDS;1645276;1646115;;;
deb;;CDS;1721814;1722689;66;*;
;comp;tRNA;1722756;1722826;51;*;tgg
fin;comp;CDS;1722878;1723252;;;
deb;comp;CDS;1738209;1739033;186;*;
;comp;tRNA;1739220;1739293;24;*;atgi
;comp;tRNA;1739318;1739394;69;*;atgi
fin;comp;CDS;1739464;1739865;;0;
deb;;CDS;1924596;1926158;-38;*;
;comp;tRNA;1926121;1926206;341;*;tta
;comp;tRNA;1926548;1926633;381;*;tta
fin;;CDS;1927015;1927368;;;
deb;;CDS;1928728;1929714;125;*;
;comp;tRNA;1929840;1929925;147;*;tta
deb;comp;CDS;1930073;1930444;108;*;
;comp;tRNA;1930553;1930638;9;*;tta
;comp;tRNA;1930648;1930720;201;*;ggc
fin;comp;CDS;1930922;1933519;;;
deb;comp;CDS;1961822;1962571;128;*;
;;tRNA;1962700;1962772;35;*;ttc
;;tRNA;1962808;1962880;26;*;ttc
;;tRNA;1962907;1962979;100;*;ttc
fin;comp;CDS;1963080;1964066;;;
deb;;CDS;2082191;2082733;1104;*;
;;rRNA;2083838;2085355;82;*;16s
;;tRNA;2085438;2085511;91;*;atc
;;tRNA;2085603;2085676;151;*;gca
;;rRNA;2085828;2088711;108;*;23s
;;rRNA;2088820;2088929;156;*;5s
fin;;CDS;2089086;2089943;;;
deb;;CDS;2147912;2148241;286;*;
;;tRNA;2148528;2148601;52;*;cgt
;;tRNA;2148654;2148727;72;*;cgt
fin;;CDS;2148800;2149288;;;
deb;comp;CDS;2207990;2208685;114;*;
;comp;tRNA;2208800;2208872;106;*;atgf
deb;comp;CDS;2208979;2209605;150;*;
;comp;tRNA;2209756;2209829;145;*;atgj
fin;;CDS;2209975;2210361;;;
deb;comp;CDS;2224025;2225590;53;*;
;comp;ncRNA;2225644;2225751;58;*;
fin;comp;CDS;2225810;2226118;;;
deb;;CDS;2302059;2303552;133;*;
;;regulatory;2303686;2303879;199;*;
fin;;CDS;2304079;2304477;;;
deb;comp;CDS;2425634;2426896;299;*;
;comp;tRNA;2427196;2427270;353;*;cca
fin;;CDS;2427624;2428565;;;
deb;comp;CDS;2434061;2435053;125;*;
;comp;tRNA;2435179;2435252;366;*;atgj
fin;;CDS;2435619;2436269;;0;
deb;comp;CDS;2505104;2506201;88;*;
;;ncRNA;2506290;2506388;93;*;
fin;comp;CDS;2506482;2507468;;;
deb;;CDS;2561350;2563341;1073;*;
;;rRNA;2564415;2565932;79;*;16s
;;tRNA;2566012;2566085;93;*;atc
;;tRNA;2566179;2566252;119;*;gca
;;rRNA;2566372;2569254;107;*;23s
;;rRNA;2569362;2569471;279;*;5s
fin;;CDS;2569751;2571682;;1;
deb;comp;CDS;2640485;2640910;167;*;
;comp;regulatory;2641078;2641223;541;*;
fin;;CDS;2641765;2642745;;;
deb;comp;CDS;2676791;2678620;235;*;
;comp;tRNA;2678856;2678940;497;*;tca
fin;;CDS;2679438;2681390;;;
deb;;CDS;2729998;2731122;20;*;
;;tRNA;2731143;2731213;22;*;tgc
;;tRNA;2731236;2731306;22;*;tgc
;;tRNA;2731329;2731399;22;*;tgc
;;tRNA;2731422;2731492;22;*;tgc
;;tRNA;2731515;2731585;294;*;tgc
fin;;CDS;2731880;2732548;;1;
deb;comp;CDS;2977513;2977920;497;*;
;comp;tRNA;2978418;2978492;61;*;gta
fin;comp;CDS;2978554;2978928;;;
deb;;CDS;3228192;3228908;79;*;
;;tRNA;3228988;3229061;26;*;cac
;;tRNA;3229088;3229161;25;*;cac
;;tRNA;3229187;3229260;24;*;cac
;;tRNA;3229285;3229358;43;*;cac
fin;comp;CDS;3229402;3230577;;0;
deb;;CDS;3299472;3300458;99;*;
;comp;tmRNA;3300558;3300956;220;*;
fin;;CDS;3301177;3302400;;;
deb;comp;CDS;3394869;3395093;90;*;
;comp;tRNA;3395184;3395268;215;*;tca
fin;comp;CDS;3395484;3396884;;0;
deb;;CDS;3457542;3458360;150;*;
;;tRNA;3458511;3458594;49;*;tac
;;tRNA;3458644;3458724;51;*;tac
;;tRNA;3458776;3458856;44;*;tac
;;tRNA;3458901;3458981;312;*;tac
fin;comp;CDS;3459294;3460415;;0;
deb;comp;CDS;3475368;3476669;61;*;
;comp;regulatory;3476731;3476839;337;*;
fin;;CDS;3477177;3479327;;0;
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;comp;regulatory;3489832;3489940;337;*;
fin;;CDS;3490278;3492428;;0;
deb;;CDS;3951958;3953367;595;*;
;;tRNA;3953963;3954036;83;*;aga
;;tRNA;3954120;3954193;39;*;aga
fin;comp;CDS;3954233;3954712;;0;
deb;;CDS;3975219;3976205;99;*;
;comp;tRNA;3976305;3976379;39;*;cca
;comp;tRNA;3976419;3976493;10;*;cca
;comp;tRNA;3976504;3976587;965;*;agc
fin;;CDS;3977553;3978161;;;
deb;;CDS;4054689;4055261;76;*;
;comp;ncRNA;4055338;4055652;275;*;
fin;;CDS;4055928;4056746;;;
&lt;/pre&gt;

====myr intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_entre_cds|myr intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
myr;2.2.21 Paris;;Myr 18.1.21;;;;;;;;;
myr;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;fréquencez
;'''négatif;302;8.5;'''négatif ;-9;10;-1 à -68;'''4 155 464;-1;302;610;6
;'''zéro;18;0.5;;;;;'''intercals;0;18;620;2
;'''1 à 200;2443;68.7;'''0 à 200;67;56;;'''507 186;5;304;630;6
;'''201 à 370;440;12.4;'''201 à 370;271;47;;'''12.2%;10;157;640;4
;'''371 à 600;202;5.7;'''371 à 600;470;61;;;15;155;650;2
;'''601 à max;150;4.2;'''601 à  1353;802;166;;;20;108;660;8
;'''total 3555;&lt;201;77.7;'''total  3549;139;188;-68 à 1353;;25;81;670;5
adresse;intercalx;intercal;&lt;u&gt;fréquence1;intercal;&lt;u&gt;fréquence6;cumul, %;intercal;&lt;u&gt;eréquence-1;30;70;680;3
1253774;2764;-1;302;-70;0;;0;18;35;54;690;3
4076145;2069;0;18;-60;1;;-1;°71;40;67;700;2
3818684;1978;1;66;-50;0;;-2;0;45;52;710;10
3657182;1824;2;°83;-40;5;;-3;2;50;67;720;4
4012754;1661;3;66;-30;7;'''min à -1;-4;°69;55;67;730;2
3629577;1544;4;59;-20;22;302;-5;0;60;49;740;10
2952529;1353;5;30;-10;78;8.5%;-6;3;65;78;750;2
3023352;1312;6;°43;0;207;;-7;10;70;74;760;6
3091776;1283;7;27;10;461;;-8;°34;75;64;770;4
3063256;1274;8;34;20;263;;-9;0;80;67;780;5
792903;1218;9;26;30;151;;-10;3;85;56;790;4
128855;1210;10;27;40;121;'''1 à 100;-11;°30;90;69;800;5
1814854;1180;11;42;50;119;1762;-12;0;95;73;810;3
2893024;1157;12;°48;60;116;49.6%;-13;2;100;50;820;2
3791894;1149;13;19;70;152;;-14;°22;105;50;830;2
1764716;1121;14;28;80;131;;-15;1;110;45;840;3
3858117;1092;15;18;90;125;;-16;2;115;55;850;1
2631119;1079;16;20;100;123;;-17;°16;120;44;860;1
3204160;1074;17;°25;110;95;;-18;1;125;38;870;0
3970791;1045;18;21;120;99;;-19;1;130;32;880;1
638891;1022;19;22;130;70;;-20;°7;135;37;890;3
3392036;1020;20;20;140;71;;-21;0;140;34;900;1
3864400;1007;21;15;150;79;;-22;0;145;40;910;3
1410445;1003;22;°19;160;60;;-23;°7;150;39;920;2
3966467;1001;23;15;170;58;'''1 à 200;-24;0;155;36;930;2
180046;997;24;18;180;54;2443;-25;1;160;24;940;1
226066;997;25;°14;190;51;69%;-26;°4;165;38;950;0
102898;986;26;12;200;44;;-27;0;170;20;960;2
1232294;981;27;14;210;41;;-28;0;175;25;970;0
66244;978;28;°16;220;33;;-29;°3;180;29;980;1
1851963;956;29;14;230;34;;-30;0;185;24;990;2
2836755;953;30;14;240;39;;-31;0;190;27;1000;2
3339204;937;31;12;250;31;;-32;1;195;23;1010;3
485591;928;32;°15;260;30;;;308;200;21;1020;1
1163082;925;33;8;270;39;;reste;12;205;21;1030;1
2704567;918;34;14;280;17;;total;320;210;20;1040;0
1624776;912;35;5;290;25;;;;215;19;1050;1
1989125;909;36;°17;300;20;;intercal;&lt;u&gt;fréquencef;220;14;1060;0
2763942;909;37;11;310;24;;600;3405;225;17;1070;0
3941959;907;38;9;320;26;;650;20;230;17;1080;2
3569216;896;39;°18;330;21;;700;21;235;16;1090;0
3279840;890;40;12;340;12;'''201 à 370;750;28;240;23;1100;1
3713046;890;reste;2239;350;16;440;800;24;245;16;1110;0
1258251;888;total;3555;360;20;12%;850;11;250;15;1120;0
3954233;874;;;370;12;;900;6;255;14;1130;1
248335;860;;;380;9;;950;8;260;16;1140;0
;;;;390;8;;1000;7;265;17;1150;1
;;;;400;9;;1050;6;270;22;1160;1
adresse;intercaln;décalage;long;410;15;;1100;3;275;14;1170;0
849554;-68;comp;;420;12;;1150;2;280;3;1180;1
3465496;-47;shift2;473;430;11;;1200;2;285;14;1190;0
3335648;-46;shift2;705;440;9;;1250;2;290;11;1200;0
1686663;-44;shift2;464;450;18;;1300;2;295;11;reste;12
626279;-41;;;460;9;;1350;1;300;9;total;150
3285379;-41;;;470;14;;1400;1;305;18;;
569581;-38;;;480;10;;1450;0;310;6;;
3645168;-38;;;490;11;;1500;0;315;11;;
3007311;-35;;;500;5;;1550;1;320;15;;
890595;-34;;;510;9;;1600;0;325;10;;
1138331;-34;;;520;5;;1650;0;330;11;;
1639425;-34;;;530;9;;1700;1;335;4;;
1509236;-32;;;540;3;'''371 à 600;;146;340;8;;
2356195;-29;;;550;7;202;;;345;11;;
2927121;-29;;;560;6;5.7%;;;350;5;;
3218460;-29;;;570;7;;;;355;11;;
74410;-26;;;580;4;'''601 à max;;;360;9;;
1241101;-26;;;590;6;150;;;365;6;;
1964711;-26;;;600;6;4.2%;;;370;6;;
3675717;-26;;;reste;150;;reste;4;reste;352;;
424302;-25;;;total;3555;;toal;3555;toal;3555;;
&lt;/pre&gt;

====myr  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_positifs_S+|myr intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
myr. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
abra;min10;256;934;1190;874;716;797;81;-163;59;312;;;
myr;min20;828;2081;2909;872;649;764;115;-143;41;323;;;
spl;min10;1071;2215;3286;884;735;784;49;-353;-202;172;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
94;413;0.23;279;1388;4;9;29;295;41;420;-243;;;
71;392;0.18;999;2556;5;5;20;110;97;899;-78;;;
37;270;0.14;1313;2900;1;6;9;143;69;683;-342;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
myr;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;33;-213;270;32;708;215;max70;&amp;-94;717;-1739;143;742;254;min50
31 à 400;;;;;;;;&amp;7.8;-12;-192;52;897;51;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-7;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;112;48;-;640;poly;68;tm;&amp;215;69;;452;poly;290;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;117;42;-;811;poly;86;tF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30 40 50 60, '''t30 t60'''.
*Corrélations et fréquences faibles 
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;-0.078;;;;;
41-n;0.872;0.649;0.764;;;;;;;;;;;;
1-n;0.323;-0.143;0.041;;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
myr;fx;fc;;myr;fx%;fc%;;;fx40;fc40;;x;myr;Sx-;Sc-
0;5;13;;0;6;6;;0;5;13;&gt;0;974;-1;0;71
10;26;435;;10;31;209;;1;0;66;&lt;0;20;-2;0;0
20;12;251;;20;14;121;;2;5;78;zéro;5;-3;0;2
30;21;130;;30;25;62;;3;5;61;total;999;-4;9;60
40;38;83;;40;46;40;;4;3;56;;c;-5;0;0
50;50;69;;50;60;33;;5;1;29;&gt;0;2261;-6;3;0
60;47;69;;60;57;33;;6;1;42;&lt;0;282;-7;0;10
70;54;98;;70;65;47;;7;4;23;zéro;13;-8;0;34
80;51;80;;80;62;38;;8;2;32;total;2556;-9;0;0
90;29;96;;90;35;46;;9;1;25;;;-10;0;3
100;35;88;;100;42;42;;10;4;23;;;-11;2;28
110;22;73;;110;27;35;;11;1;41;;;-12;0;0
120;32;67;;120;39;32;;12;2;46;;;-13;1;1
130;28;42;;130;34;20;;13;0;19;;;-14;0;22
140;22;49;;140;27;24;;14;1;27;;;-15;1;0
150;28;51;;150;34;25;;15;2;16;;;-16;0;2
160;30;30;;160;36;14;;16;1;19;;;-17;1;15
170;26;32;;170;31;15;;17;1;24;;;-18;1;0
180;21;33;;180;25;16;;18;2;19;;;-19;0;1
190;22;29;;190;27;14;;19;1;21;;;-20;1;6
200;20;24;;200;24;12;;20;1;19;;;-21;0;0
210;19;22;;210;23;11;;21;0;15;;;-22;0;0
220;12;21;;220;14;10;;22;4;15;;;-23;0;7
230;17;17;;230;21;8;;23;0;15;;;-24;0;0
240;19;20;;240;23;10;;24;0;18;;;-25;0;1
250;16;15;;250;19;7;;25;0;14;;;-26;0;4
260;14;16;;260;17;8;;26;2;10;;;-27;0;0
270;17;22;;270;21;11;;27;5;9;;;-28;0;0
280;9;8;;280;11;4;;28;4;12;;;-29;0;3
290;11;14;;290;13;7;;29;4;10;;;-30;0;0
300;12;8;;300;14;4;;30;2;12;;;-31;0;0
310;12;12;;310;14;6;;31;4;8;;;-32;0;1
320;10;16;;320;12;8;;32;1;14;;;-33;0;0
330;10;11;;330;12;5;;33;3;5;;;-34;0;3
340;5;7;;340;6;3;;34;5;9;;;-35;0;1
350;4;12;;350;5;6;;35;2;3;;;-36;0;0
360;11;9;;360;13;4;;36;7;10;;;-37;0;0
370;6;6;;370;7;3;;37;3;8;;;-38;0;2
380;2;7;;380;2;3;;38;2;7;;;-39;0;0
390;3;5;;390;4;2;;39;5;13;;;-40;0;0
400;5;4;;400;6;2;;40;6;6;;;-41;0;2
reste;146;180;;;;;;reste;877;1362;;;-42;0;0
total;979;2274;;t30;71;392;;total;979;2274;;;-43;0;0
diagr;828;2081;;t60;234;498;;diagr;97;899;;;-44;0;1
 - t30;769;1265;;;;;;;;;;;-45;0;0
 - t60;634;1044;;;;;;;;;;;-46;0;1
;;;;;;;;;;;;;-47;0;1
;;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;;reste;1;0
;;;;;;;;;;;;;total;20;282
&lt;/pre&gt;

====myr  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_négatifs_S-|myr intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
myr;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;;;9;;3;;;;;2;;1;;1;;1;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;20
continu;71;0;2;60;0;0;10;34;0;3;28;0;1;22;0;2;15;0;1;6;0;0;7;0;1;4;0;0;3;0;0;1;0;3;1;0;0;2;0;0;2;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;282
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;myr;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;9;0;3;0;0;0;0;2;0;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;20
;Sc-;71;0;2;60;0;0;10;34;0;3;28;0;1;22;0;2;15;0;1;6;0;0;7;0;1;4;0;0;3;0;0;1;0;3;1;0;0;2;0;0;2;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;282
&lt;/pre&gt;

====myr autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_autres_intercalaires|myr autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
myr1 ;adresse1;;;;;myr2 ;adresse2;;;;;myr3;adresse3;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;151454;273;comp;;deb;°CDS;814859;544;comp;;deb;°CDS;2147912;286;
;&amp;tRNA;153050;208;comp;;;&amp;tRNA;815826;10;comp;;;&amp;tRNA;2148528;52;
fin;°CDS;153343;;comp;;fin;°CDS;815910;;comp;;;&amp;tRNA;2148654;72;
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;regulatory;174323;162;;;;&amp;tRNA;869308;37;comp;;deb;°CDS;2207990;114;comp
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;;;;;;;$rRNA;2088820;156;;;;;;;
;;;;;;fin;°CDS;2089086;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====myr intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_tRNA|myr intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
myr intercalaires tRNA;;;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;;;;
;;;;;;;deb;fin;continu;cumuls
;;;273;;208;;;;;
;30*3  42;comp’;123;;92;;16;10;'''deb;
;31  7;;146;comp’;280;;20;32;&lt;201;18
;;comp’;115;comp’;466;;40;51;total;26
;90 34 39 48 36;comp’;73;comp’;129;;54;60;%;69%
;36 41 42 41;;144;;81;;58;61;;
;;;209;;32;;76;69;'''fin;
;40 37 38*3;;40;;75;;79;72;&lt;201;15
;;;16;;60;;85;75;total;22
;20 30;;58;;93;;90;81;%;68%
;;;76;;96;;90;88;;
;;comp’;332;comp’;113;;108;92;'''total;
;;;54;;10;;114;93;&lt;201;33
;37*5;comp’;40;;242;;125;96;total;48
;221;comp’;95;comp’;183;;144;106;%;69%
;;comp’;158;comp’;47;;146;147;;
;;;;comp’;90;;150;201;;
;;comp’;104;;88;;150;208;;
;373;;85;comp’;593;;186;215;;
;151 202;;635;comp’;169;;209;220;;
;186;comp’;132;;314;;235;242;;
;;comp’;66;;51;;273;294;;
;24;;186;;69;;286;314;;
;341;comp’;-38;comp’;381;;299;-;;
;;comp’;125;;147;;497;-;;
;9;;108;;201;;595;-;;
;35 26;comp’;128;comp’;100;;635;-;'''comp’;'''cumuls
;52;;286;;72;;'''-38;39;'''deb;
;;;114;;106;;40;43;&lt;201;12
;;;150;comp’;145;;66;47;total;13
;;;299;comp’;353;;73;90;%;92%
;;;125;comp’;366;;95;100;;
;;;235;comp’;497;;104;113;'''fin;
;22*4;;20;;294;;115;129;&lt;201;10
;;;497;;61;;123;145;total;18
;26 25 24;;79;comp’;43;;125;169;%;56%
;;;90;;220;;128;183;;
;;;90;;215;;132;280;'''total;
;49 51 44;;150;comp’;312;;158;312;&lt;201;22
;83;;595;comp’;39;;332;353;total;31
;;;;;;;_;366;%;71%
;;;;;;;_;381;;
;;;;;;;_;466;;
;;;;;;;_;497;;
;;;;;;;_;593;;
;;deb;fin;total;;;;;;
;&lt;201;30;25;55;;;;;;
;total;39;40;79;;;;;;
;taux;77%;63%;70%;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===fps===
====fps opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_opérons|fps opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Flav_psyc_JIP02_86/flavPsyc-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_009613.3;fps;;genome;;;;;;;;
32.4%GC;14.8.19 Paris;16s 6;49;doubles;intercalaires;cds;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86;;;;;;;;;;;
;3517..4200;;CDS;;43;43;;;228;;
comp;4244..4317;;tgc;;104;104;;;;;
comp;4422..4781;;CDS;;;;;;120;;
;;;;;;;;;;;
;113561..114154;;CDS;;107;107;;;198;;
comp;114262..114335;;aac;;147;147;;;;;
comp;114483..115817;;CDS;;;;;;445;;
;;;;;;;;;;;
comp;190346..191287;;CDS;;175;175;;;314;;
;191463..191545;;ttg;@1;290;;*290;;;;
comp;191836..191920;;cta;;132;132;;;;;
;192053..193441;;CDS;;;;;;463;;
;;;;;;;;;;;
comp;295744..295950;;CDS;;179;179;;;69;;
comp;296130..296203;;atgi;;86;86;;;;;
comp;296290..296694;;CDS;;;;;;135;;
;;;;;;;;;;;
comp;318122..319414;;CDS;;896;*896;;;431;;
comp;320311..320387;;gac;;86;86;;;;;
comp;320474..321400;;CDS;;;;;;309;;
;;;;;;;;;;;
comp;371118..374348;;CDS;;154;154;;;1077;;
;374503..374576;;caa;;47;47;;;;;
comp;374624..375631;;CDS;;;;;;336;;
;;;;;;;;;;;
comp;464114..466717;;CDS;;125;125;;;868;;
comp;466843..466920;;cca;;163;163;;;;;
;467084..468346;;CDS;;;;;;421;;
;;;;;;;;;;;
;507944..508621;;CDS;;1042;*1042;;;226;;
;509664..511163;;16s;;110;;;;1500;;
;511274..511350;;atc;;158;;;158;;;
;511509..511585;;gca;;213;;;;;;
;511799..514683;;23s;;156;;;;2885;;
;514840..514945;;5s;;204;204;;;106;;
;515150..515902;;CDS;;;;;;251;;
;;;;;;;;;;;
;596537..597679;;CDS;;312;312;;;381;;
comp;597992..598074;;ctc;+;40;;40;;;;
comp;598115..598190;;aaa;2 aaa;23;;23;;;;
comp;598214..598289;;aaa;;128;128;;;;;
;598418..598936;;CDS;;;;;;173;;
;;;;;;;;;;;
;642117..643595;;CDS;;91;91;;;493;;
;643687..643758;;gaa;+;31;;31;;;;
;643790..643864;;gaa;2 gaa;162;162;;;;;
;644027..644278;;CDS;;1149;*1149;;;84;;
;645428..646927;;16s;;110;;;;1500;;
;647038..647114;;atc;;158;;;158;;;
;647273..647349;;gca;;213;;;;;;
;647563..650447;;23s;;156;;;;2885;;
;650604..650709;;5s;;931;*931;;;106;;
;651641..653437;;CDS;;;;;;599;;
;;;;;;;;;;;
;726614..727399;;CDS;;207;207;;;262;;
comp;727607..727684;;gta;;81;81;;;;;
comp;727766..728980;;CDS;;;;;;405;;
;;;;;;;;;;;
;852715..853170;;CDS;;128;128;;;152;;
comp;853299..853375;;cac;;75;75;;;;;
comp;853451..854167;;CDS;;;;;;239;;
;;;;;;;;;;;
;897041..897184;;CDS;;75;75;;;48;;
;897260..897336;;cgt;;46;46;;;;;
;897383..897955;;CDS;;;;;;191;;
;;;;;;;;;;;
comp;982868..984043;;CDS;;254;254;;;392;;
;984298..984384;;agc;;15;;15;;;;
;984400..984477;;cca;;30;;30;;;;
;984508..984584;;aga;;93;93;;;;;
;984678..985880;;CDS;;;;;;401;;
;;;;;;;;;;;
comp;1110660..1112606;;CDS;;1082;*1082;;;649;;
;1113689..1115188;;16s;;110;;;;1500;;
;1115299..1115375;;atc;;158;;;158;;;
;1115534..1115610;;gca;;213;;;;;;
;1115824..1118708;;23s;;156;;;;2885;;
;1118865..1118970;;5s;;282;282;;;106;;
comp;1119253..1120218;;CDS;;;;;;322;;
;;;;;;;;;;;
comp;1123344..1124324;;CDS;;-981;*-981;;;327;;
comp;1123344..1124324;;rpr;@2;191;191;;;981;;
comp;1124516..1124698;;rpr;;20;20;;;183;;
comp;1124719..1124862;;rpr;;289;289;;;144;;
comp;1125152..1125229;;gta;;82;82;;;;;
comp;1125312..1125686;;CDS;;;;;;125;;
;;;;;;;;;;;
;1285199..1285477;;CDS;;148;148;;;93;;
;1285626..1285710;;tac;;473;*473;;;;;
;1286184..1286810;;CDS;;;;;;209;;
;;;;;;;;;;;
;1309373..1310833;;CDS;;1079;*1079;;;487;;
comp;1311913..1312018;;5s;;156;;;;106;;
comp;1312175..1315059;;23s;;213;;;;2885;;
comp;1315273..1315349;;gca;;158;;;158;;;
comp;1315508..1315584;;atc;;110;;;;;;
comp;1315695..1317194;;16s;;1276;*1276;;;1500;;
;1318471..1319160;;CDS;;;;;;230;;
;;;;;;;;;;;
comp;1395138..1395728;;CDS;;73;73;;;197;;
comp;1395802..1396536;;rpr;;93;93;;;735;;
comp;1396630..1397052;;rpr;;248;248;;;423;;
comp;1397301..1397388;;tca;;135;135;;;;;
comp;1397524..1398660;;CDS;;;;;;379;;
;;;;;;;;;;;
comp;1622342..1622755;;CDS;;100;100;;;138;;
comp;1622856..1622929;;aca;;79;79;;;;;
comp;1623009..1623275;;CDS;;;;;;89;;
;;;;;;;;;;;
comp;1815453..1816334;;CDS;;239;239;;;294;;
;1816574..1816649;;atgf;+;31;;31;;;;
;1816681..1816756;;atgf;2 atgf;591;*591;;;;;
;1817348..1817794;;CDS;;;;;;149;;
;;;;;;;;;;;
;1859580..1860149;;CDS;;305;305;;;190;;
comp;1860455..1860531;;atgj;;143;143;;;;;
;1860675..1861067;;CDS;;;;;;131;;
;;;;;;;;;;;
comp;1904719..1905537;;CDS;;26;26;;;273;;
comp;1905564..1905637;;cga;;70;70;;;;;
comp;1905708..1906157;;CDS;;;;;;150;;
;;;;;;;;;;;
;1995546..1996253;;CDS;;35;35;;;236;;
comp;1996289..1996361;;gga;;281;281;;;;;
;1996643..1997074;;CDS;;;;;;144;;
;;;;;;;;;;;
;2088032..2088418;;CDS;;105;105;;;129;;
;2088524..2089369;;rpr;;116;;;;846;;
comp;2089486..2089591;;5s;;156;;;;106;;
comp;2089748..2092632;;23s;;213;;;;2885;;
comp;2092846..2092922;;gca;;158;;;158;;;
comp;2093081..2093157;;atc;;110;;;;;;
comp;2093268..2094767;;16s;;1570;*1570;;;1500;;
comp;2096338..2099241;;CDS;;;;;;968;;
;;;;;;;;;;;
;2182840..2185440;;CDS;;138;138;;;867;;
;2185579..2185654;;ggc;;40;;40;;;;
;2185695..2185782;;tta;;93;93;;;;;
comp;2185876..2190132;;CDS;;;;;;1419;;
;;;;;;;;;;;
comp;2295987..2296184;;CDS;;14;14;;;66;;
comp;2296199..2296272;;tgg;;61;61;;;;;
comp;2296334..2297521;;CDS;;55;55;;;396;;
comp;2297577..2297651;;acc;;83;;*83;;;;
comp;2297735..2297818;;tac;;138;;*138;;;;
comp;2297957..2298033;;aca;;90;90;;;;;
comp;2298124..2298426;;CDS;;;;;;101;;
;;;;;;;;;;;
;2506720..2507055;;CDS;;288;288;;;112;;
comp;2507344..2507449;;5s;;156;;;;106;;
comp;2507606..2510490;;23s;;213;;;;2885;;
comp;2510704..2510780;;gca;;158;;;158;;;
comp;2510939..2511015;;atc;;110;;;;;;
comp;2511126..2512625;;16s;;1010;*1010;;;1500;;
comp;2513636..2514889;;CDS;;;;;;418;;
;;;;;;;;;;;
;2632307..2633335;;CDS;;53;53;;;343;;
;2633389..2633476;;tcc;;246;246;;;;;
;2633723..2634982;;CDS;;;;;;420;;
;;;;;;;;;;;
comp;2752993..2753322;;CDS;;64;64;;;110;;
;2753387..2753463;;gcc;;105;105;;;;;
comp;2753569..2757033;;CDS;;;;;;1155;;
;;;;;;;;;;;
comp;2800796..2801521;;CDS;;98;98;;;242;;
;2801620..2801695;;ttc;;299;299;;;;;
comp;2801995..2802723;;gene;@3;406;*406;;;243;;
comp;2803130..2803444;;CDS;;;;;;105;;
&lt;/pre&gt;

====fps cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_cumuls|fps cumuls]]
&lt;pre&gt;
fps cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;6;1;0;;1;1;1;;100;6;30;0
;16 23 5s 0;0;20;1;;50;7;20;;200;19;60;1
;16 atc gca;6;40;6;;100;20;40;;300;12;90;4
;16 23 5s a;0;60;0;;150;13;60;;400;10;120;6
;max a;2;80;0;;200;6;80;;500;10;150;8
;a doubles;0;100;1;;250;5;100;;600;1;180;2
;autres;0;120;0;;300;6;120;;700;1;210;5
;total aas;12;140;1;;350;2;140;;800;0;240;5
sans ;opérons;26;160;0;6;400;0;160;;900;2;270;4
;1 aa;19;180;0;;450;1;180;;1000;1;300;2
;max a;3;200;0;;500;1;200;;1100;1;330;4
;a doubles;3;;1;;;10;;;;2;;24
;total aas;37;;10;6;;72;;0;;65;;65
total aas;;49;;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;72;158;;257;;;;333;;
;;;variance;85;0;;374;;;;276;;
sans jaune;;;moyenne;30;;;135;;;;246;;181
;;;variance;9;;;82;;;;126;;78
&lt;/pre&gt;

====fps blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_blocs|fps blocs]]
&lt;pre&gt;
fps blocs;;;;;;
CDS;1042;226;1149;84;1082;649
16s;110;1500;110;1500;110;1500
atc;158;;158;;158;
gca;213;;213;;213;
23s;156;2885;156;2885;156;2885
5s;204;106;931;106;282;106
CDS;;251;;599;;322
;;;;;;
;;;105;129;;
CDS;1079;487;116;846;288;112
5s;156;106;156;106;156;106
23s;213;2885;213;2885;213;2885
gca;158;;158;;158;
atc;110;;110;;110;
16s;1276;1500;1570;1500;1010;1500
CDS;;230;;968;;418
&lt;/pre&gt;

====fps remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_remarques|fps remarques]]
*code génétique fps
&lt;pre&gt;
fps;;;;;;;49
atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;2;tgc;1
atc;6;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;2;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;2;gca;6;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====fps données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_données_intercalaires|fps données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;fps;fx;fc;fps;fx40;fc40;fps;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;7;15;0;7;15;-1;0;60;104;46;16s tRNA;;
;0;10;18;323;1;0;60;-2;1;0;147;107;6* 105;;atc
;1;20;9;108;2;5;50;-3;0;0;86;175;tRNA 23s;;
;1;30;17;53;3;2;38;-4;22;46;899;132;6* 214;;gca
1;0;40;13;77;4;0;29;-5;0;0;86;133;tRNA tRNA;;intra
2;1;50;11;76;5;1;33;-6;2;0;128;151;6* 161;;atc gca
;2;60;23;65;6;2;31;-7;0;3;91;50;tRNA tRNA;;
1;2;70;16;67;7;2;17;-8;0;28;165;163;-;296;ttg
;3;80;25;79;8;2;16;-9;3;0;81;312;**;;cta
;5;90;24;72;9;1;18;-10;0;3;75;128;43;;ctc
2;2;100;32;56;10;3;31;-11;2;17;75;210;26;;aaa
2;1;110;29;50;11;2;14;-12;2;0;49;131;**;;aaa
;0;120;14;46;12;3;14;-13;1;3;96;254;31;;gaa
1;1;130;19;31;13;0;11;-14;1;14;456;239;**;;gaa
3;2;140;13;28;14;1;11;-15;0;0;82;308;15;;agc
1;2;150;15;35;15;1;15;-16;0;1;148;143;33;;cca
1;0;160;16;37;16;0;6;-17;1;10;476;35;**;;aga
1;1;170;20;34;17;0;14;-18;1;0;248;281;34;;atgf
1;0;180;13;23;18;1;7;-19;1;2;135;96;**;;atgf
;0;190;13;25;19;1;5;-20;1;3;259;64;43;;ggc
;0;200;13;13;20;0;11;-21;0;0;79;108;**;;tta
1;0;210;7;19;21;2;4;-22;0;0;594;98;86;;acc
;0;220;6;12;22;6;8;-23;0;4;26;302;141;;tac
;0;230;12;19;23;0;5;-24;0;0;70;;**;;aca
1;0;240;5;17;24;1;9;-25;0;0;138;;;;
;2;250;8;17;25;2;3;-26;0;4;17;;;;
1;1;260;7;9;26;2;9;-27;1;0;61;;;;
;0;270;5;14;27;0;4;-28;0;1;58;;;;
;0;280;6;14;28;0;2;-29;1;1;90;;;;
1;0;290;6;12;29;1;2;-30;1;0;53;;;;
;0;300;10;13;30;3;7;-31;0;1;249;;;;
2;0;310;8;12;31;1;10;-32;0;1;CDS 16s;;;;
1;0;320;9;10;32;0;11;-33;0;0;1035;1075;;;
;0;330;10;12;33;0;9;-34;1;0;1142;1269;;;
;0;340;5;10;34;2;5;-35;0;2;1563;;;;
;0;350;4;5;35;1;5;-36;0;0;1003;;;;
;0;360;1;7;36;4;6;-37;0;0;23s 5s;;;;
;0;370;3;3;37;0;1;-38;0;0;6* 154;;;;
;0;380;5;4;38;3;5;-39;0;0;5s CDS;;;;
;0;390;5;3;39;0;8;-40;0;1;202;268;;;
;0;400;3;2;40;2;17;-41;0;0;;280;;;
;4;reste;75;101;reste;496;1052;-42;0;0;;268;;;
23;31;total;560;1628;total;560;1628;-43;0;0;;114;;;
23;27;diagr;478;1512;diagr;57;561;-44;0;0;;286;;;
0;2; t30;44;484;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;553;42;7;602;;;-49;0;0;;;;;
;c;1613;206;15;1834;;;-50;0;1;;;;;
;;;;;2436;114;;reste;0;0;;;;;
;;;;;;2550;;total;42;206;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====fps autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_autres_intercalaires_aas|fps autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;fps;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;3517;4200;46;*;
;comp;tRNA;4247;4317;104;*;tga
fin;comp;CDS;4422;4781;;0;
deb;;CDS;113561;114154;107;*;
;comp;tRNA;114262;114335;147;*;aac
fin;comp;CDS;114483;115817;;;
deb;comp;CDS;190346;191287;175;*;
;;tRNA;191463;191542;296;*;ttg
;comp;tRNA;191839;191920;132;*;cta
fin;;CDS;192053;193441;;;
deb;;CDS;295793;295996;133;*;
;comp;tRNA;296130;296203;86;*;atgi
fin;comp;CDS;296290;296694;;0;
deb;comp;CDS;318122;319414;899;*;
;comp;tRNA;320314;320387;86;*;gac
fin;comp;CDS;320474;321400;;;
deb;comp;CDS;371118;374351;151;*;
;;tRNA;374503;374573;50;*;caa
fin;comp;CDS;374624;375631;;0;
deb;comp;CDS;431782;433344;51;*;
;comp;ncRNA;433396;433502;51;*;
fin;comp;CDS;433554;433847;;;
deb;comp;CDS;464114;466717;128;*;
;comp;tRNA;466846;466920;163;*;cca
fin;;CDS;467084;468346;;0;
deb;;CDS;507944;508621;1035;*;
;;rRNA;509657;511168;105;*;1512
;;tRNA;511274;511347;161;*;atc
;;tRNA;511509;511582;214;*;gca
;;rRNA;511797;514683;154;*;2887
;;rRNA;514838;514947;202;*;110
fin;;CDS;515150;515902;;;
deb;;CDS;586281;586805;94;*;
;;regulatory;586900;587164;29;*;
fin;;CDS;587194;589056;;;
deb;;CDS;596537;597679;312;*;
;comp;tRNA;597992;598074;43;*;ctc
;comp;tRNA;598118;598190;26;*;aaa
;comp;tRNA;598217;598289;128;*;aaa
fin;;CDS;598418;598936;;1;
deb;;CDS;642117;643595;91;*;
;;tRNA;643687;643758;31;*;gaa
;;tRNA;643790;643861;165;*;gaa
deb;;CDS;644027;644278;1142;*;
;;rRNA;645421;646932;105;*;1512
;;tRNA;647038;647111;161;*;atc
;;tRNA;647273;647346;214;*;gca
;;rRNA;647561;650447;154;*;2887
;;rRNA;650602;650711;268;*;110
fin;comp;CDS;650980;651266;;0;
deb;;CDS;659297;660505;37;*;
;;tmRNA;660543;660939;63;*;
fin;comp;CDS;661003;661833;;;
deb;;CDS;726614;727399;210;*;
;comp;tRNA;727610;727684;81;*;gta
fin;comp;CDS;727766;728980;;0;
deb;;CDS;852715;853170;131;*;
;comp;tRNA;853302;853375;75;*;cac
fin;comp;CDS;853451;854167;;0;
deb;;CDS;897041;897184;75;*;
;;tRNA;897260;897333;49;*;cgt
fin;;CDS;897383;897955;;0;
deb;comp;CDS;982868;984043;254;*;
;;tRNA;984298;984384;15;*;agc
;;tRNA;984400;984474;33;*;cca
;;tRNA;984508;984581;96;*;aga
fin;;CDS;984678;985880;;1;
deb;comp;CDS;1110660;1112606;1075;*;
;;rRNA;1113682;1115193;105;*;1512
;;tRNA;1115299;1115372;161;*;atc
;;tRNA;1115534;1115607;214;*;gca
;;rRNA;1115822;1118708;154;*;2887
;;rRNA;1118863;1118972;280;*;110
fin;comp;CDS;1119253;1120218;;;
deb;comp;CDS;1124516;1124698;456;*;
;comp;tRNA;1125155;1125229;82;*;gta
fin;comp;CDS;1125312;1125686;;;
deb;comp;CDS;1141104;1142156;88;*;
;;ncRNA;1142245;1142342;13;*;
fin;;CDS;1142356;1142553;;;
deb;;CDS;1285061;1285477;148;*;
;;tRNA;1285626;1285707;476;*;tac
fin;;CDS;1286184;1286810;;;
deb;;CDS;1311356;1311642;268;*;
;comp;rRNA;1311911;1312020;154;*;110
;comp;rRNA;1312175;1315061;214;*;2887
;comp;tRNA;1315276;1315349;161;*;gca
;comp;tRNA;1315511;1315584;105;*;atc
;comp;rRNA;1315690;1317201;1269;*;1512
deb;;CDS;1318471;1319160;0;*;
;comp;ncRNA;1319161;1319480;341;*;
fin;;CDS;1319822;1323886;;;
deb;;CDS;1325084;1325431;419;*;
;;repeat_region;1325851;1326881;279;*;
fin;comp;CDS;1327161;1328027;;0;
deb;comp;CDS;1395802;1397052;248;*;
;comp;tRNA;1397301;1397388;135;*;tca
fin;comp;CDS;1397524;1398660;;;
deb;comp;CDS;1622342;1622596;259;*;
;comp;tRNA;1622856;1622929;79;*;aca
fin;comp;CDS;1623009;1623275;;;
deb;comp;CDS;1815453;1816334;239;*;
;;tRNA;1816574;1816646;34;*;atgf
;;tRNA;1816681;1816753;594;*;atgf
fin;;CDS;1817348;1817794;;;
deb;;CDS;1859580;1860149;308;*;
;comp;tRNA;1860458;1860531;143;*;atgj
fin;;CDS;1860675;1861067;;;
deb;comp;CDS;1904719;1905537;26;*;
;comp;tRNA;1905564;1905637;70;*;cga
fin;comp;CDS;1905708;1906157;;;
deb;;CDS;1995546;1996253;35;*;
;comp;tRNA;1996289;1996361;281;*;gga
fin;;CDS;1996643;1997074;;;
deb;;CDS;2088524;2089369;114;*;
;comp;rRNA;2089484;2089593;154;*;110
;comp;rRNA;2089748;2092634;214;*;2887
;comp;tRNA;2092849;2092922;161;*;gca
;comp;tRNA;2093084;2093157;105;*;atc
;comp;rRNA;2093263;2094774;1563;*;1512
fin;comp;CDS;2096338;2099241;;;
deb;comp;CDS;2145831;2146037;66;*;
;comp;regulatory;2146104;2146199;493;*;
fin;comp;CDS;2146693;2148675;;;
deb;;CDS;2182840;2185440;138;*;
;;tRNA;2185579;2185651;43;*;ggc
;;tRNA;2185695;2185779;96;*;tta
fin;comp;CDS;2185876;2190132;;;
deb;comp;CDS;2295987;2296184;17;*;
;comp;tRNA;2296202;2296272;61;*;tgg
deb;comp;CDS;2296334;2297521;58;*;
;comp;tRNA;2297580;2297651;86;*;acc
;comp;tRNA;2297738;2297818;141;*;tac
;comp;tRNA;2297960;2298033;90;*;aca
fin;comp;CDS;2298124;2298426;;;
deb;;CDS;2506720;2507055;286;*;
;comp;rRNA;2507342;2507451;154;*;110
;comp;rRNA;2507606;2510492;214;*;2887
;comp;tRNA;2510707;2510780;161;*;gca
;comp;tRNA;2510942;2511015;105;*;atc
;comp;rRNA;2511121;2512632;1003;*;1512
fin;comp;CDS;2513636;2514889;;0;
deb;;CDS;2632307;2633335;53;*;
;;tRNA;2633389;2633473;249;*;tcc
fin;;CDS;2633723;2634982;;;
deb;comp;CDS;2752993;2753322;64;*;
;;tRNA;2753387;2753460;108;*;gcc
fin;comp;CDS;2753569;2757033;;;
deb;comp;CDS;2800796;2801521;98;*;
;;tRNA;2801620;2801692;302;*;ttc
fin;comp;CDS;2801995;2802585;;;
&lt;/pre&gt;

====fps distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#fps_distribution|fps distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;2;aga;
cta;;cca;1;caa;1;cga;1;;cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;2;gga;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
bact;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;bact;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;bact;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
fps;;20;;;;;;;fps;11;;;;;;;;fps;6;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===bacteroide synthèse===
====bacteroide distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#bacteroide_distribution_par_génome|bacteroide distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
bact;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
myr;11;16;;;1;16;57;;101
fps;11;20;;;;12;6;;49
total;22;36;0;0;1;28;63;0;150
&lt;/pre&gt;

====bacteroide distribution du total====
*Lien tableur: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#bacteroide_distribution_du_total|bacteroide distribution du total]]
&lt;pre&gt;
bact2;;;;;;;150
atgi;3;tct;;tat;;atgf;5
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;4;tcc;1;tac;8;tgc;2
atc;14;acc;2;aac;3;agc;3
ctc;2;ccc;;cac;5;cgt;3
gtc;;gcc;1;gac;4;ggc;2
tta;4;tca;4;taa;;tga;
ata;;aca;8;aaa;8;aga;4
cta;3;cca;6;caa;3;cga;2
gta;9;gca;14;gaa;8;gga;7
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;3
atgj;3;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;85;36;;;1 -16s tac;28;150
&lt;/pre&gt;

====bacteroide distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#bacteroide_distribution_par_type|bacteroide distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
bact2;;;;;;;150;;bact2;;;;;;;36;;bact2;;;;;;;22;;bact2;;;;;;;63
atgi;3;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;4;tcc;1;tac;8;tgc;2;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;3;tcc;;tac;4;tgc;
atc;14;acc;2;aac;3;agc;3;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;2;aac;;agc;3;;atc;;acc;;aac;2;agc;
ctc;2;ccc;;cac;5;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;4;cgt;2
gtc;;gcc;1;gac;4;ggc;2;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;2;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;
tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;1;tca;4;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;8;aaa;8;aga;4;;ata;;aca;1;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;1;aga;2;;ata;;aca;5;aaa;7;aga;2
cta;3;cca;6;caa;3;cga;2;;cta;;cca;2;caa;1;cga;2;;cta;1;cca;2;caa;;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;
gta;9;gca;14;gaa;8;gga;7;;gta;3;gca;;gaa;;gga;1;;gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;5;gca;;gaa;8;gga;6
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;3;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;3;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;1 -16s tac;28;150;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====bacteroide par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#bacteroide_par_rapport_au_groupe_de_référence|bacteroide par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;bact2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;3;2;0;;;;5;
16;moyen;16;10;12;;;28;66;
14;fort;17;10;51;;;1;79;
; ;36;22;63;;;29;150;
10;g+cga;2;;;;;;2;
2;agg+cgg;;;;;;;;
4;carre ccc;1;2;;;;;3;
5;autres;;;;;;;;
;;3;2;;;;;5;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;bact2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;20;13;;;;;33;26
16;moyen;107;67;80;;;187;440;324
14;fort;113;67;340;;;7;527;650
; ;240;147;420;;;193;150;729
10;g+cgg;13;;;;;;13;10
2;agg+cga;;;;;;;;
4;carre ccc;7;13;;;;;20;16
5;autres;;;;;;;;
;;20;13;;;;;33;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;bact2;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;25;17;;41;26;8;9;
16;moyen;132;83;99;314;324;44;45;19
14;fort;140;83;421;645;650;47;45;81
; ;298;182;521;121;729;36;22;63
10;g+cgg;17;;;17;10;;;
2;agg+cga;;;;;;;;
4;carre ccc;8;17;;25;16;;;
5;autres;;;;;;;;
;;25;17;;41;;;;
&lt;/pre&gt;
====bacteroide, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#bacteroide,_estimation_des_-rRNAs|bacteroide, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
bacteroide;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
29 génomes total avec rRNA;;;;bact;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;bact;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;29;210; ; ;;indices;;;;29;725;0;0;;bact2;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;121
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;5
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;4;tcc;1;tac;7;tgc;2
atc;104;acc;;aac;1;agc;;;atc;359;acc;;aac;3.4;agc;;;atc;;acc;2;aac;3;agc;3
ctc;;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3.4;;ctc;2;ccc;;cac;5;cgt;3
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;1;gac;4;ggc;2
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;3.4;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;8;aaa;8;aga;4
cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;3.4;caa;;cga;;;cta;3;cca;6;caa;3;cga;2
gta;;gca;102;gaa;;gga;;;gta;;gca;352;gaa;;gga;;;gta;9;gca;;gaa;8;gga;7
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;3
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;207;;3;;0;210;;;;714;;10;;0;725;;;;39;;77;;5;121
27.5.20 Tanger;;;;bact;total;ttt;tgt;;27.5.20 Tanger;;;;bact;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;100;7096;1.4;0.7;;;;;;146;7096;1.4;0.7;;bact2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;105;tct;0.2;tat;;atgf;129;;atgi;105;tct;0.7;tat;0.7;atgf;129;;atgi;150;tct;;tat;;atgf;250
att;;act;0.7;aat;;agt;0.2;;att;0.7;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0.9;cct;0.5;cat;0.9;cgc;1.4;;ctt;0.7;cct;1.4;cat;;cgc;1.4;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0.2;gct;0.2;gat;0.9;ggt;0.2;;gtt;0.7;gct;;gat;;ggt;0.7;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;129;tcc;98;tac;152;tgc;119;;ttc;129;tcc;98;tac;152;tgc;119;;ttc;200;tcc;50;tac;350;tgc;100
atc;-64;acc;102;aac;127;agc;110;;atc;295;acc;102;aac;130;agc;110;;atc;;acc;100;aac;150;agc;150
ctc;99;ccc;58;cac;114;cgt;131;;ctc;99;ccc;58;cac;114;cgt;134;;ctc;100;ccc;;cac;250;cgt;150
gtc;35;gcc;83;gac;173;ggc;151;;gtc;35;gcc;83;gac;173;ggc;151;;gtc;;gcc;50;gac;200;ggc;100
tta;112;tca;122;taa;6.2;tga;2;;tta;112;tca;125;taa;6.2;tga;2.1;;tta;200;tca;200;taa;;tga;
ata;0.7;aca;161;aaa;186;aga;108;;ata;0.7;aca;161;aaa;186;aga;108;;ata;;aca;400;aaa;400;aga;200
cta;109;cca;146;caa;113;cga;42;;cta;109;cca;149;caa;113;cga;42;;cta;150;cca;300;caa;150;cga;100
gta;184;gca;-66;gaa;181;gga;141;;gta;184;gca;286;gaa;181;gga;141;;gta;450;gca;;gaa;400;gga;350
ttg;101;tcg;21;tag;0.7;tgg;117;;ttg;101;tcg;21;tag;0.7;tgg;117;;ttg;100;tcg;;tag;;tgg;150
atgj;114;acg;32;aag;47;agg;68;;atgj;114;acg;32;aag;47;agg;68;;atgj;150;acg;;aag;;agg;
ctg;49;ccg;30;cag;29;cgg;55;;ctg;49;ccg;30;cag;29;cgg;55;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;3;gcg;4.1;gag;25;ggg;34;;gtg;3.4;gcg;4.1;gag;25;ggg;34;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;1350;;2103;;670;4122;;;;2064;;2113;;669;4846;;;;1950;;3850;;250;6050
rapports;;65;;100;;100;85;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;bact2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;100.0;;fiches;53.759;;;fréquences;;;;;atgi;30;tct;100;tat;;atgf;48
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;1559;;;0/0;;;;;att;;act;100;aat;;agt;100
ctt;129;cct;;cat;;cgc;;;avec;218;;;10;3;;;;ctt;100;cct;100;cat;100;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;29;;;20;4;;;;gtt;100;gct;100;gat;100;ggt;100
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;6;;;;ttc;36;tcc;49;tac;57;tgc;16
atc;-22;acc;100;aac;97;agc;100;;bact2;60.5;;;40;4;;;;atc;100;acc;2;aac;16;agc;27
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;97;;sans;121;;;50;4;21;;;ctc;1;ccc;100;cac;54;cgt;13
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;29;;;60;9;;;;gtc;100;gcc;40;gac;14;ggc;34
tta;100;tca;97;taa;;tga;100;;genom;2;;;70;0;;;;tta;44;tca;39;taa;;tga;100
ata;100;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;60;aaa;54;aga;46
cta;100;cca;98;caa;100;cga;100;;L’estimation par bact ;;;;90;0;;;;cta;27;cca;51;caa;25;cga;58
gta;100;gca;-23;gaa;100;gga;100;;est  12% au dessus;;;;100;18;;;;gta;59;gca;100;gaa;55;gga;60
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;1;tcg;100;tag;100;tgg;22
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;24;acg;100;aag;100;agg;100
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100
gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;381;;579;;99;1059
&lt;/pre&gt;

==tenericutes==
===abra===
====abra opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_opérons|abra opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Acho_bras_O502/achoBras_O502-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_022549.1;abra;;genome;;;;;;;;
35.8%GC;15.8.19 Paris;16s 4;45;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Acholeplasma brassicae;;;;;;;;;;;
;253257..253430;;CDS;;86;86;;;58;;
;253517..253601;;tac;;214;;;;;;
;253816..255351;;16s;;137;;;;1536;;
;255489..255565;;atc;;88;;;;;;
;255654..258507;;23s;;34;;;;2854;;
;258542..258652;;5s;;11;;;;111;;
;258664..258740;;aac;;149;;;;;;
;258890..259000;;5s;;11;;;;111;;
;259012..259088;;aac;;860;*860;;;;;
;259949..260053;;CDS;;432;;;;35;;
;260486..262021;;16s;;137;;;;1536;;
;262159..262235;;atc;;88;;;;;;
;262324..265177;;23s;;34;;;;2854;;
;265212..265322;;5s;@1;14;;;;111;;
;265337..265412;;gta;;44;;;44;;;
;265457..265532;;aca;;11;;;11;;;
;265544..265619;;aaa;;7;;;7;;;
;265627..265713;;tta;;8;;;8;;;
;265722..265797;;gca;;72;;;72;;;
;265870..265946;;atgj;;7;;;7;;;
;265954..266030;;atgi;;44;;;44;;;
;266075..266165;;tca;;8;;;8;;;
;266174..266250;;atgf;;4;;;4;;;
;266255..266330;;gac;;11;;;11;;;
;266342..266417;;ttc;;137;137;;;;;
;266555..267409;;CDS;;;;;;285;;
;;;;;;;;;;;
;582446..584125;;CDS;;49;49;;;*560;;
;584175..584260;;ctc;;170;170;;;;;
;584431..586110;;CDS;;;;;;*560;;
;;;;;;;;;;;
;625631..626317;;CDS;;84;84;;;229;;
comp;626402..626476;;ggc;;66;;66;;;;
comp;626543..626619;;cca;;17;;17;;;;
comp;626637..626713;;cga;;13;;13;;;;
comp;626727..626802;;gac;;149;149;;;;;
;626952..627599;;CDS;;;;;;216;;
;;;;;;;;;;;
;633526..634710;;CDS;;63;63;;;395;;
comp;634774..634847;;acc;;76;76;;;;;
;634924..636651;;CDS;;;;;;*576;;
;;;;;;;;;;;
;755442..756548;;CDS;;64;64;;;369;;
comp;756613..756688;;aag;;130;130;;;;;
;756819..757373;;CDS;;;;;;185;;
;;;;;;;;;;;
;807788..808216;;CDS;;108;108;;;143;;
;808325..808401;;aga;;216;216;;;;;
;808618..808854;;CDS;;;;;;79;;
;;;;;;;;;;;
;829563..829871;;CDS;;155;155;;;103;;
;830027..830102;;agg;;27;27;;;;;
;830130..831458;;CDS;;;;;;443;;
;;;;;;;;;;;
comp;1176200..1176799;;CDS;;398;398;;;200;;
comp;1177198..1177291;;tcg;;8;;8;;;;
comp;1177300..1177375;;gcc;;569;*569;;;;;
comp;1177945..1179252;;CDS;;;;;;436;;
;;;;;;;;;;;
;1187918..1188148;;CDS;;382;382;;;77;;
;1188531..1188621;;tcc;;66;66;;;;;
;1188688..1189761;;CDS;;;;;;358;;
;;;;;;;;;;;
comp;1194077..1194568;;CDS;;206;206;;;164;;
comp;1194775..1194859;;ttg;;10;10;;;;;
comp;1194870..1196045;;CDS;;;;;;392;;
;;;;;;;;;;;
comp;1251487..1252329;;CDS;;68;68;;;281;;
;1252398..1252472;;gtc;;44;44;;;;;
comp;1252517..1252873;;CDS;;;;;;119;;
;;;;;;;;;;;
comp;1416224..1416484;;CDS;;301;301;;;87;;
comp;1416786..1416859;;tgc;;92;92;;;;;
comp;1416952..1418427;;CDS;;;;;;492;;
;;;;;;;;;;;
comp;1427372..1427890;;CDS;@2;379;379;;;173;;
comp;1428270..1428343;;gga;;9;;9;;;;
comp;1428353..1428429;;cca;;1;;1;;;;
comp;1428431..1428507;;cgt;;8;;8;;;;
comp;1428516..1428591;;gaa;;73;73;;;;;
comp;1428665..1429210;;CDS;;;;;;182;;
;;;;;;;;;;;
comp;1431948..1432259;;CDS;;96;96;;;104;;
comp;1432356..1432432;;aac;;11;;;;;;
comp;1432444..1432554;;5s;;34;;;;111;;
comp;1432589..1435442;;23s;;158;;;;2854;;
comp;1435601..1437135;;16s;;432;;;;1535;;
comp;1437568..1437672;;CDS;;860;*860;;;35;;
comp;1438533..1438609;;aac;;11;;;;;;
comp;1438621..1438731;;5s;@3;149;;;;111;;
comp;1438881..1438957;;aac;;11;;;;;;
comp;1438969..1439079;;5s;;34;;;;111;;
comp;1439114..1441967;;23s;;159;;;;2854;;
comp;1442127..1443662;;16s;;431;*431;;;1536;;
comp;1444094..1444624;;CDS;;;;;;177;;
;;;;;;;;;;;
comp;1532381..1533052;;CDS;;262;262;;;224;;
comp;1533315..1533399;;cta;;46;46;;;;;
comp;1533446..1535560;;CDS;;;;;;*705;;
;;;;;;;;;;;
comp;1540295..1540534;;CDS;;171;171;;;80;;
comp;1540706..1540780;;tgg;;47;47;;;;;
comp;1540828..1541754;;CDS;;137;137;;;;;
;1541892..1541967;;cac;;63;;63;;;;
;1542031..1542104;;caa;;37;37;;;;;
comp;1542142..1542357;;CDS;;;;;;72;;
;;;;;;;;;;;
comp;1716869..1717186;;CDS;;854;*854;;;106;;
comp;1718041..1718116;;acg;;87;87;;;;;
comp;1718204..1718947;;CDS;;;;;;248;;
;;;;;;;;;;;
comp;1742909..1743664;;CDS;;487;*487;;;252;;
comp;1744152..1744227;;gaa;;109;109;;;;;
comp;1744337..1744720;;CDS;;;;;;128;;
;;;;;;;;;;;
comp;1747424..1747726;;CDS;;100;100;;;101;;
comp;1747827..1747919;;agc;;102;102;;;;;
comp;1748022..1750199;;CDS;;;;;;*726;;
&lt;/pre&gt;

====abra cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_cumuls|abra cumuls]]
&lt;pre&gt;
abra cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;4;1;1;0;1;0;1;;100;8;30;0
;16 23 5s 0;0;20;5;7;50;7;20;;200;13;60;3
;16 atc 235 a;2;40;0;0;100;12;40;;300;7;90;5
;16 23 5s a;2;60;0;2;150;7;60;;400;4;120;5
;max a;12;80;2;1;200;3;80;;500;3;150;2
;a doubles;0;100;0;0;250;2;100;;600;3;180;3
;autres;0;120;0;0;300;1;120;;700;0;210;3
;total aas;19;140;0;0;350;1;140;;800;2;240;3
sans ;opérons;18;160;0;0;400;3;160;;900;0;270;2
;1 aa;14;180;0;0;450;1;180;;1000;0;300;2
;max a;4;200;0;0;500;1;200;;1100;0;330;0
;a doubles;0;;0;0;;4;;;;0;;12
;total aas;26;;8;10;;42;;0;;40;;40
total aas;;45;;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;209;;;;254;;
;;;variance;;;;226;;;;187;;
sans jaune;;;moyenne;23;22;;131;;;;201;;148
;;;variance;26;23;;101;;;;127;;74
&lt;/pre&gt;

====abra blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_blocs|abra blocs]]
&lt;pre&gt;
abra blocs;;
CDS;86;58
tac;214;
16s;137;1536
atc;88;
23s;34;2854
5s;11;111
aac;149;
5s;11;111
aac;860;
CDS;432;35
16s;137;1536
atc;88;
23s;34;2854
5s;14;111
gta;44;
;;
CDS;96;104
aac;11;
5s;34;111
23s;158;2854
16s;432;1535
CDS;860;35
aac;11;
5s;149;111
aac;11;
5s;34;111
23s;159;2854
16s;431;1536
CDS;;177
&lt;/pre&gt;

====abra remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_remarques|abra remarques]]
*code génétique abra
&lt;pre&gt;
abra;;;;;;;45
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;2;acc;1;aac;5;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====abra distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_distribution|abra distribution]]
*code génétique abra
&lt;pre&gt;
tenericutes;sans rRNA;&gt;1 aas 12;1aas  ;avant 16s;après 5s;après 16s;
abra;;gac gaa;14;1;16;2;45
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;2;acc;1;aac;5;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;2;caa;1;cga;1
gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====abra données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_données_intercalaires|abra données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;abra;fx;fc;abra;fx40;fc40;abra;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;1;12;0;1;12;-1;0;68;86;84;tRNA 16s;;
;1;10;5;208;1;0;58;-2;0;0;860;149;215;;tac
;0;20;9;127;2;1;40;-3;0;0;140;63;16s tRNA;;
;1;30;10;51;3;1;21;-4;2;141;49;76;2* 145;;atc
;0;40;17;34;4;0;29;-5;0;2;170;64;tRNA 23s;;
1;3;50;19;35;5;0;7;-6;0;0;108;130;2* 89;;atc
;0;60;18;31;6;0;6;-7;0;1;216;68;5s tRNA;;
3;1;70;15;42;7;0;4;-8;0;70;155;44;5* 11;;aac
1;1;80;14;35;8;0;15;-9;1;0;27;137;14;;gta
1;2;90;9;32;9;2;16;-10;0;3;434;714;tRNA 5s;;
;3;100;10;23;10;1;12;-11;0;34;569;;2* 149;;aac
;3;110;8;35;11;0;19;-12;1;0;382;;tRNA tRNA;;contig
;0;120;16;29;12;1;33;-13;0;1;66;;44;;gta
1;0;130;12;31;13;0;13;-14;1;24;206;;11;;aca
1;1;140;7;24;14;3;11;-15;0;0;10;;7;;aaa
1;0;150;10;30;15;1;13;-16;0;1;301;;8;;tta
;1;160;10;26;16;0;7;-17;1;16;92;;72;;gca
;1;170;2;13;17;1;6;-18;0;0;415;;7;;atgj
;1;180;8;14;18;0;11;-19;0;1;73;;44;;atgi
;0;190;9;14;19;1;7;-20;0;12;96;;8;;tca
;0;200;4;9;20;2;7;-21;0;0;860;;4;;atgf
;1;210;4;7;21;2;5;-22;0;1;262;;11;;gac
;1;220;3;13;22;0;7;-23;0;6;46;;**;;ttc
;0;230;2;8;23;1;14;-24;1;0;171;;tRNA tRNA;;
;0;240;7;3;24;2;4;-25;0;1;47;;66;;ggc
;0;250;1;6;25;0;5;-26;1;4;854;;17;;cca
;0;260;3;8;26;2;5;-27;0;0;87;;13;;cga
;1;270;3;7;27;2;3;-28;0;0;493;;**;;gac
;0;280;2;6;28;1;1;-29;0;1;109;;8;;tcg
;0;290;1;3;29;0;3;-30;0;0;100;;**;;gcc
;0;300;4;1;30;0;4;-31;0;1;CDS 16s;;9;;gga
;1;310;0;1;31;0;4;-32;0;1;433;;1;;cca
;0;320;2;8;32;2;6;-33;0;0;433;;8;;cgt
;0;330;2;2;33;1;3;-34;0;0;432;;**;;gaa
;0;340;0;1;34;3;1;-35;0;2;16s 23s;;63;;cac
;0;350;2;1;35;1;3;-36;0;0;167;;**;;caa
;0;360;2;2;36;3;6;-37;0;0;168;;;;
;0;370;0;6;37;2;4;-38;0;2;23s 5s;;;;
;0;380;1;4;38;3;3;-39;0;0;4* 35;;;;
;1;390;0;4;39;1;2;-40;0;0;;;;;
;0;400;4;1;40;1;2;-41;0;0;;;;;
1;7;reste;14;33;reste;229;547;-42;0;0;;;;;
10;31;total;270;980;total;271;979;-43;0;0;;;;;
9;24;diagr;255;935;diagr;41;420;-44;0;0;;;;;
0;2; t30;24;386;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;269;8;1;278;;;-49;0;1;;;;;
;c;968;409;12;1389;;;-50;0;1;;;;;
;;;;;1667;128;;reste;0;13;;;;;
;;;;;;1795;;total;8;409;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====abra autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_autres_intercalaires_aas|abra autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;abra;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;6032;8602;39;*;
;;misc_binding;8642;8842;66;*;
fin;;CDS;8909;10186;;;
deb;;CDS;58474;59019;199;*;
;;misc_binding;59219;59468;96;*;
fin;;CDS;59565;60740;;;
deb;;CDS;175843;176448;64;*;
;;regulatory;176513;176610;67;*;
fin;;CDS;176678;178138;;;
deb;;CDS;226433;226846;115;*;
;;regulatory;226962;227062;128;*;
fin;;CDS;227191;228555;;;
deb;;CDS;241700;242158;14;*;
;;ncRNA;242173;242267;222;*;
fin;;CDS;242490;243404;;;
deb;;CDS;253260;253430;86;*;
;;tRNA;253517;253601;215;*;tac
;;rRNA;253817;255343;145;*;16s
;;tRNA;255489;255565;89;*;atc
;;rRNA;255655;258506;35;*;23s
;;rRNA;258542;258652;11;*;5s
;;tRNA;258664;258740;149;*;aac
;;rRNA;258890;259000;11;*;5s
;;tRNA;259012;259088;860;*;aac
deb;;CDS;259949;260053;433;*;
;;rRNA;260487;262013;145;*;16s
;;tRNA;262159;262235;89;*;atc
;;rRNA;262325;265176;35;*;23s
;;rRNA;265212;265322;14;*;5s
;;tRNA;265337;265412;44;*;gta
;;tRNA;265457;265532;11;*;aca
;;tRNA;265544;265619;7;*;aaa
;;tRNA;265627;265713;8;*;tta
;;tRNA;265722;265797;72;*;gca
;;tRNA;265870;265946;7;*;atgj
;;tRNA;265954;266030;44;*;atgi
;;tRNA;266075;266165;8;*;tca
;;tRNA;266174;266250;4;*;atgf
;;tRNA;266255;266330;11;*;gac
;;tRNA;266342;266417;140;*;ttc
fin;;CDS;266558;267409;;;
deb;;CDS;296513;297367;98;*;
;;misc_binding;297466;297674;30;*;
fin;;CDS;297705;299270;;;
deb;;CDS;326721;327413;0;*;
;;misc_feature;327414;327533;18;*;
fin;;CDS;327552;328049;;;
deb;;CDS;574175;574945;-5;*;
;;misc_binding;574941;575144;43;*;
fin;;CDS;575188;576195;;;
deb;;CDS;582446;584125;49;*;
;;tRNA;584175;584260;170;*;ctc
fin;;CDS;584431;586110;;;
deb;;CDS;625631;626317;84;*;
;comp;tRNA;626402;626476;66;*;ggc
;comp;tRNA;626543;626619;17;*;cca
;comp;tRNA;626637;626713;13;*;cga
;comp;tRNA;626727;626802;149;*;gac
fin;;CDS;626952;627599;;;
deb;;CDS;633550;634710;63;*;
;comp;tRNA;634774;634847;76;*;acc
fin;;CDS;634924;636651;;;
deb;;CDS;690994;692286;64;*;
;;regulatory;692351;692446;55;*;
fin;;CDS;692502;693653;;;
deb;;CDS;755442;756548;64;*;
;comp;tRNA;756613;756688;130;*;aag
fin;;CDS;756819;757373;;;
deb;;CDS;807788;808216;108;*;
;;tRNA;808325;808401;216;*;aga
fin;;CDS;808618;808854;;0;
deb;comp;CDS;818257;818448;29;*;
;comp;ncRNA;818478;818549;-2;*;
fin;comp;CDS;818548;818796;;;
deb;;CDS;829563;829871;155;*;
;;tRNA;830027;830102;27;*;agg
fin;;CDS;830130;831458;;;
deb;;CDS;862237;863004;104;*;
;;regulatory;863109;863206;46;*;
fin;;CDS;863253;863771;;1;
deb;;CDS;951162;951842;56;*;
;;misc_feature;951899;952022;10;*;
fin;;CDS;952033;952593;;;
deb;;CDS;979156;980118;92;*;
;comp;ncRNA;980211;980543;41;*;
fin;comp;CDS;980585;980917;;;
deb;comp;CDS;1000286;1000837;45;*;
;comp;misc_binding;1000883;1001091;36;*;
fin;comp;CDS;1001128;1001976;;;
deb;comp;CDS;1033802;1034467;48;*;
;comp;regulatory;1034516;1034590;41;*;
;comp;regulatory;1034632;1034706;43;*;
fin;comp;CDS;1034750;1035400;;;
deb;comp;CDS;1043459;1044169;55;*;
;comp;regulatory;1044225;1044298;61;*;
fin;comp;CDS;1044360;1045796;;;
deb;comp;CDS;1055719;1056522;197;*;
;comp;misc_binding;1056720;1056926;146;*;
fin;;CDS;1057073;1058293;;;
deb;comp;CDS;1125033;1127627;53;*;
;comp;misc_binding;1127681;1127864;34;*;
fin;comp;CDS;1127899;1128741;;;
deb;comp;CDS;1135303;1135953;71;*;
;comp;regulatory;1136025;1136141;48;*;
fin;comp;CDS;1136190;1137014;;0;
deb;comp;CDS;1176200;1176763;434;*;
;comp;tRNA;1177198;1177291;8;*;tcg
;comp;tRNA;1177300;1177375;569;*;gcc
fin;comp;CDS;1177945;1179252;;;
deb;comp;CDS;1187918;1188148;382;*;
;comp;tRNA;1188531;1188621;66;*;tcc
fin;comp;CDS;1188688;1189704;;;
deb;comp;CDS;1194077;1194568;206;*;
;comp;tRNA;1194775;1194859;10;*;ttg
fin;comp;CDS;1194870;1196045;;;
deb;comp;CDS;1221355;1222416;217;*;
;;tmRNA;1222634;1222981;262;*;
fin;;CDS;1223244;1223657;;;
deb;comp;CDS;1251487;1252329;68;*;
;;tRNA;1252398;1252472;44;*;gtc
fin;comp;CDS;1252517;1252873;;0;
deb;comp;CDS;1416224;1416484;301;*;
;comp;tRNA;1416786;1416859;92;*;tgc
fin;comp;CDS;1416952;1418427;;0;
deb;comp;CDS;1427372;1427854;415;*;
;comp;tRNA;1428270;1428343;9;*;gga
;comp;tRNA;1428353;1428429;1;*;cca
;comp;tRNA;1428431;1428507;8;*;cgt
;comp;tRNA;1428516;1428591;73;*;gaa
fin;comp;CDS;1428665;1429210;;;
deb;comp;CDS;1431948;1432259;96;*;
;comp;tRNA;1432356;1432432;11;*;aac
;comp;rRNA;1432444;1432554;35;*;5s
;comp;rRNA;1432590;1435441;167;*;23s
;comp;rRNA;1435609;1437134;433;*;16s
deb;comp;CDS;1437568;1437672;860;*;
;comp;tRNA;1438533;1438609;11;*;aac
;comp;rRNA;1438621;1438731;149;*;5s
;comp;tRNA;1438881;1438957;11;*;aac
;comp;rRNA;1438969;1439079;35;*;5s
;comp;rRNA;1439115;1441966;168;*;23s
;comp;rRNA;1442135;1443661;432;*;16s
fin;comp;CDS;1444094;1444618;;;
deb;comp;CDS;1453717;1454874;96;*;
;comp;regulatory;1454971;1455142;38;*;
fin;comp;CDS;1455181;1455630;;;
deb;comp;CDS;1532381;1533052;262;*;
;comp;tRNA;1533315;1533399;46;*;cta
fin;comp;CDS;1533446;1535560;;;
deb;comp;CDS;1540295;1540534;171;*;
;comp;tRNA;1540706;1540780;47;*;tgg
deb;comp;CDS;1540828;1541754;137;*;
;;tRNA;1541892;1541967;63;*;cac
;;tRNA;1542031;1542104;714;*;caa
fin;comp;CDS;1542819;1544120;;0;
deb;comp;CDS;1716869;1717186;854;*;
;comp;tRNA;1718041;1718116;87;*;acg
fin;comp;CDS;1718204;1718947;;;
deb;comp;CDS;1729328;1729618;30;*;
;comp;regulatory;1729649;1729758;73;*;
fin;comp;CDS;1729832;1730329;;;
deb;comp;CDS;1742909;1743658;493;*;
;comp;tRNA;1744152;1744227;109;*;gaa
fin;comp;CDS;1744337;1744720;;;
deb;comp;CDS;1747424;1747726;100;*;
;comp;tRNA;1747827;1747919;102;*;agc
fin;comp;CDS;1748022;1750199;;;
deb;comp;CDS;1796937;1799234;102;*;
;comp;regulatory;1799337;1799515;112;*;
fin;comp;CDS;1799628;1800182;;0;
&lt;/pre&gt;

====abra intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_entre_cds|abra intercalaires entre cds]]
*'''intercalaires entre cds''', tableau.
&lt;pre&gt;
abra;3.2.21 Paris;;abra 13.12.20;;;;;;;
abra;intercalaires;total;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;frequence5
;négatif;417;25.0;négatif ;-10;12;-1 à -73;1,877,792;-1;417
;zéro;13;0.8;;;;;intercals;0;13
;1 à 200;1055;63.3;0 à 200;65;57;;135,857;5;157
;201 à 370;121;7.3;201 à 370;265;48;;7%;10;56
;371 à 600;42;2.5;371 à 600;442;62;;;15;94
;601 à max;19;1.1;601 à 1230;852;195;;;20;42
;Total 1667;&lt;201;89.1;Total 1665;79;132;-73 à 1230;;25;40
adresse;intercalx;intercal;fréquence1;intercal;fréquence6;cumul et %;intercal;fréquence-1;30;21
1537782;1230;-1;417;-70;3;;0;13;35;24
1707618;1229;0;13;-60;9;;-1;°68;40;27
1578501;1176;1;°58;-50;2;;-2;0;45;26
1526950;1027;2;41;-40;2;;-3;0;50;28
87364;968;3;22;-30;6;min à -1;-4;°143;55;29
826414;926;4;°29;-20;27;417;-5;2;60;20
171283;878;5;7;-10;83;25.0%;-6;0;65;30
1768322;822;6;6;0;298;;-7;1;70;27
819242;821;7;4;10;213;;-8;°70;75;22
1769594;816;8;15;20;136;;-9;1;80;27
158518;793;9;°18;30;61;;-10;3;85;22
1412625;756;10;13;40;51;1 à 100;-11;°34;90;19
968622;741;11;19;50;54;744;-12;1;95;16
1738100;729;12;°34;60;49;44.6%;-13;1;100;17
816181;706;13;13;70;57;;-14;°25;105;17
1683910;675;14;14;80;49;;-15;0;110;26
1186776;646;15;°14;90;41;;-16;1;115;25
1529536;628;16;7;100;33;;-17;°17;120;20
133841;619;17;7;110;43;;-18;0;125;26
1183129;595;18;°11;120;45;;-19;1;130;17
1861159;579;19;8;130;43;;-20;°12;135;18
615740;575;20;9;140;31;;-21;0;140;13
1171702;555;21;7;150;40;;-22;1;145;21
1525837;555;22;7;160;36;;-23;°6;150;19
153593;526;23;°15;170;15;1 à 200;-24;1;155;20
1714960;500;24;6;180;22;1055;-25;1;160;16
1842150;494;25;5;190;23;63.3%;-26;°5;165;7
1168850;483;26;7;200;13;;-27;0;170;8
1834829;483;27;5;210;11;;-28;0;175;10
556334;476;28;2;220;16;;-29;1;180;12
151602;474;29;3;230;10;;-30;0;185;13
493661;465;30;4;240;10;0 à 200;-31;1;190;10
1274718;449;31;4;250;7;1068;-32;1;195;10
1681282;446;32;°8;260;11;;total;410;200;3
1503782;443;33;4;270;10;;reste;20;205;5
178131;441;34;4;280;8;;;430;210;6
1728410;438;35;4;290;4;;;;215;12
1022865;434;36;°9;300;5;;intercal;fréquencef;220;4
36959;428;37;6;310;1;;600;1648;225;1
;;38;6;320;10;;620;1;230;9
;;39;3;330;4;;640;1;235;7
;;40;3;340;1;201 à 370;660;1;240;3
;;reste;776;350;3;121;680;1;245;2
;;total;1471;360;4;7.3%;700;;250;5
;;;;370;6;;720;1;255;8
adresse;intercaln;décalage;long;380;5;;740;1;260;3
1040608;-92;shift2;815;390;4;;760;2;265;7
1766313;-86;shift2;1001;400;5;;780;;270;3
1083669;-73;shift2;816;410;4;;800;1;275;7
169623;-67;shift2;654;420;2;;820;1;280;1
353304;-67;shift2;864;430;3;;840;2;285;1
758070;-67;shift2;864;440;2;;860;;290;3
891412;-67;shift2;864;450;4;;880;1;295;3
1155286;-67;shift2;654;460;0;;900;;300;2
1646854;-67;shift2;864;470;1;;920;;305;0
1690631;-67;shift2;654;480;2;;940;1;310;1
1714097;-67;shift2;864;490;2;;960;;315;7
1793555;-67;shift2;654;500;2;;980;1;320;3
1485635;-59;shift2;629;510;0;;1000;;325;1
738923;-50;shift2;293;520;0;;1020;;330;3
1668172;-49;shift2;315;530;1;;1040;1;335;0
1847532;-47;shift2;227;540;0;371 à 600;;16;340;1
904492;-38;shift2;962;550;0;42;;;345;1
1129734;-38;shift2;413;560;2;2.5%;;;350;2
844539;-35;shift2;;570;0;;;;355;4
986747;-35;shift2;;580;2;601 à max;;;360;0
1114675;-32;shift2;;590;0;19;;;365;3
526681;-31;shift2;;600;1;1.1%;;;370;3
1072749;-29;shift2;;reste;19;;reste;3;reste;61
251649;-26;shift2;;total;1667;;total;1667;total;1667
&lt;/pre&gt;

====abra  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_positifs_S+|abra intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
corrélations et fréquences faibles;;;;;;;;;;;;;;
abra. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
cvi;min30;1008;2320;3328;931;858;891;33;434;549;696;;;
abra;min10;256;934;1190;874;716;797;81;-163;59;312;;;
myr;min20;828;2081;2909;872;649;764;115;-143;41;323;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
112;301;0.37;1171;3111;4;3;59;221;130;815;582;;;
94;413;0.23;279;1388;4;9;29;295;41;420;-243;;;
71;392;0.18;999;2556;5;5;20;110;97;899;-78;;;
;;;;;;;;;;;;;;
diagrammes;;;;;;;;;;;;;;
abra;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;53;-314;342;39;734;197;max50;&amp;-99;750;-1818;148;702;253;min60
31 à 400;;;;;;;;&amp;21;-104;-7.3;42;912;165;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;148;55;-;638;poly;96;tF;&amp;223;71;;425;poly;277;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;118;42;-;827;poly;85;tF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et faibles fréquences
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;-0.243;;;;;
41-n;0.874;0.716;0.797;;;;;;;;;;;;
1-n;0.312;-0.163;0.059;;;;;;;;;;14.8.21 Paris;;
abra;fx;fc;;abra;fx%;fc%;;;fx40;fc40;;x;abra;Sx-;Sc-
0;1;12;;0;4;13;;0;1;12;&gt;0;270;-1;0;68
10;5;208;;10;20;223;;1;0;58;&lt;0;8;-2;0;0
20;9;127;;20;35;136;;2;1;40;zéro;1;-3;0;0
30;10;51;;30;39;55;;3;1;21;total;279;-4;2;141
40;17;34;;40;66;36;;4;0;29;;c;-5;0;2
50;19;35;;50;74;37;;5;0;7;&gt;0;967;-6;0;0
60;18;31;;60;70;33;;6;0;6;&lt;0;409;-7;0;1
70;15;42;;70;59;45;;7;0;4;zéro;12;-8;0;70
80;15;34;;80;59;36;;8;0;15;total;1388;-9;1;0
90;9;32;;90;35;34;;9;2;16;;;-10;0;3
100;10;23;;100;39;25;;10;1;12;;;-11;0;34
110;8;35;;110;31;37;;11;0;19;;;-12;1;0
120;16;29;;120;63;31;;12;1;33;;;-13;0;1
130;12;31;;130;47;33;;13;0;13;;;-14;1;24
140;7;24;;140;27;26;;14;3;11;;;-15;0;0
150;10;30;;150;39;32;;15;1;13;;;-16;0;1
160;10;26;;160;39;28;;16;0;7;;;-17;1;16
170;2;13;;170;8;14;;17;1;6;;;-18;0;0
180;8;14;;180;31;15;;18;0;11;;;-19;0;1
190;9;14;;190;35;15;;19;1;7;;;-20;0;12
200;4;9;;200;16;10;;20;2;7;;;-21;0;0
210;4;7;;210;16;7;;21;2;5;;;-22;0;1
220;3;13;;220;12;14;;22;0;7;;;-23;0;6
230;2;8;;230;8;9;;23;1;14;;;-24;1;0
240;7;3;;240;27;3;;24;2;4;;;-25;0;1
250;1;6;;250;4;6;;25;0;5;;;-26;1;4
260;3;8;;260;12;9;;26;2;5;;;-27;0;0
270;3;7;;270;12;7;;27;2;3;;;-28;0;0
280;2;6;;280;8;6;;28;1;1;;;-29;0;1
290;1;3;;290;4;3;;29;0;3;;;-30;0;0
300;4;1;;300;16;1;;30;0;4;;;-31;0;1
310;0;1;;310;0;1;;31;0;4;;;-32;0;1
320;2;8;;320;8;9;;32;2;6;;;-33;0;0
330;2;2;;330;8;2;;33;1;3;;;-34;0;0
340;0;1;;340;0;1;;34;3;1;;;-35;0;2
350;2;1;;350;8;1;;35;1;3;;;-36;0;0
360;2;2;;360;8;2;;36;3;6;;;-37;0;0
370;0;6;;370;0;6;;37;2;4;;;-38;0;2
380;1;4;;380;4;4;;38;3;3;;;-39;0;0
390;0;4;;390;0;4;;39;1;2;;;-40;0;0
400;4;1;;400;16;1;;40;1;2;;;-41;0;0
reste;14;33;;;;;;reste;229;547;;;-42;0;0
total;271;979;;t30;94;413;;total;271;979;;;-43;0;0
diagr;256;934;;;;;;diagr;41;420;;;-44;0;0
 - t30;232;548;;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;;-47;0;1
;;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;;-49;0;1
;;;;;;;;;;;;;-50;0;1
;;;;;;;;;;;;;reste;0;13
;;;;;;;;;;;;;total;8;409
&lt;/pre&gt;

====abra  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_négatifs_S-|abra intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
;;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
abra;comp’;;;;1;;;;;1;;;1;;1;;;1;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;6
;continu;68;0;0;142;2;0;1;70;0;3;34;0;1;24;0;1;16;0;1;12;0;1;6;0;1;5;0;0;1;0;1;1;0;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;13;411
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 Paris;abra;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8
;Sc-;68;0;0;141;2;0;1;70;0;3;34;0;1;24;0;1;16;0;1;12;0;1;6;0;1;4;0;0;1;0;1;1;0;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;13;409
&lt;/pre&gt;

====abra autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_autres_intercalaires|abra autres intercalaires]]
*Légende: ° pour cyan, &amp; pour jaune, $ pour rouge.
&lt;pre&gt;
deb-fin;gènes;adresses;intercal;sens;;deb-fin;gènes;adresses;intercal;sens;;deb-fin;gènes;adresses;intercal;sens
deb;°CDS;6032;39;;;deb;°CDS;633550;63;;;deb;°CDS;1221355;217;comp
;misc_binding;8642;66;;;;&amp;tRNA;634774;76;comp;;;tmRNA;1222634;262;
fin;°CDS;8909;;;;fin;°CDS;634924;;;;fin;°CDS;1223244;;
deb;°CDS;58474;199;;;deb;°CDS;690994;64;;;deb;°CDS;1251487;68;comp
;misc_binding;59219;96;;;;regulatory;692351;55;;;;&amp;tRNA;1252398;44;
fin;°CDS;59565;;;;fin;°CDS;692502;;;;fin;°CDS;1252517;;comp
deb;°CDS;175843;64;;;deb;°CDS;755442;64;;;deb;°CDS;1416224;301;comp
;regulatory;176513;67;;;;&amp;tRNA;756613;130;comp;;;&amp;tRNA;1416786;92;comp
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deb;°CDS;226433;115;;;deb;°CDS;807788;108;;;deb;°CDS;1427372;415;comp
;regulatory;226962;128;;;;&amp;tRNA;808325;216;;;;&amp;tRNA;1428270;9;comp
fin;°CDS;227191;;;;fin;°CDS;808618;;;;;&amp;tRNA;1428353;1;comp
deb;°CDS;241700;14;;;deb;°CDS;818257;29;comp;;;&amp;tRNA;1428431;8;comp
;ncRNA;242173;222;;;;ncRNA;818478;-2;comp;;;&amp;tRNA;1428516;73;comp
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;&amp;tRNA;253517;215;;;;&amp;tRNA;830027;27;;;;&amp;tRNA;1432356;11;comp
;$rRNA;253817;145;;;fin;°CDS;830130;;;;;$rRNA;1432444;35;comp
;&amp;tRNA;255489;89;;;deb;°CDS;862237;104;;;;$rRNA;1432590;167;comp
;$rRNA;255655;35;;;;regulatory;863109;46;;;;$rRNA;1435609;433;comp
;$rRNA;258542;11;;;fin;°CDS;863253;;;;deb;°CDS;1437568;860;comp
;&amp;tRNA;258664;149;;;deb;°CDS;951162;56;;;;&amp;tRNA;1438533;11;comp
;$rRNA;258890;11;;;;misc_feature;951899;10;;;;$rRNA;1438621;149;comp
;&amp;tRNA;259012;860;;;fin;°CDS;952033;;;;;&amp;tRNA;1438881;11;comp
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;$rRNA;260487;145;;;;ncRNA;980211;41;comp;;;$rRNA;1439115;168;comp
;&amp;tRNA;262159;89;;;fin;°CDS;980585;;comp;;;$rRNA;1442135;432;comp
;$rRNA;262325;35;;;deb;°CDS;1000286;45;comp;;fin;°CDS;1444094;;comp
;$rRNA;265212;14;;;;misc_binding;1000883;36;comp;;deb;°CDS;1453717;96;comp
;&amp;tRNA;265337;44;;;fin;°CDS;1001128;;comp;;;regulatory;1454971;38;comp
;&amp;tRNA;265457;11;;;deb;°CDS;1033802;48;comp;;fin;°CDS;1455181;;comp
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;&amp;tRNA;265722;72;;;fin;°CDS;1034750;;comp;;fin;°CDS;1533446;;comp
;&amp;tRNA;265870;7;;;deb;°CDS;1043459;55;comp;;deb;°CDS;1540295;171;comp
;&amp;tRNA;265954;44;;;;regulatory;1044225;61;comp;;;&amp;tRNA;1540706;47;comp
;&amp;tRNA;266075;8;;;fin;°CDS;1044360;;comp;;deb;°CDS;1540828;137;comp
;&amp;tRNA;266174;4;;;deb;°CDS;1055719;197;comp;;;&amp;tRNA;1541892;63;
;&amp;tRNA;266255;11;;;;misc_binding;1056720;146;comp;;;&amp;tRNA;1542031;714;
;&amp;tRNA;266342;140;;;fin;°CDS;1057073;;;;fin;°CDS;1542819;;comp
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;misc_binding;574941;43;;;;&amp;tRNA;1177300;569;comp;;fin;°CDS;1744337;;comp
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;&amp;tRNA;584175;170;;;;&amp;tRNA;1188531;66;;;fin;°CDS;1748022;;comp
fin;°CDS;584431;;;;fin;°CDS;1188688;;;;deb;°CDS;1796937;102;comp
deb;°CDS;625631;84;;;deb;°CDS;1194077;206;comp;;;regulatory;1799337;112;comp
;&amp;tRNA;626402;66;comp;;;&amp;tRNA;1194775;10;comp;;fin;°CDS;1799628;;comp
;&amp;tRNA;626543;17;comp;;fin;°CDS;1194870;;comp;;;;;;
;&amp;tRNA;626637;13;comp;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;626727;149;comp;;;;;;;;;;;;
fin;CDS;626952;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====abra intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_tRNA|abra intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
abra;intercalaires tRNA;;;;;;proportion des intercalaires &lt;201;;;
comp’;entre tRNAs;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;44 11 7 8 72 ;;86;;860;;49;10;deb;
;7 44 8 4 11;;;;140;;86;27;&lt;201;7
;;;49;;170;;96;46;total;15
;66 17 13;comp’;84;comp’;149;;100;47;%;47%
;;comp’;63;comp’;76;;108;66;;
;;comp’;64;comp’;130;;155;73;fin;
;;;108;;216;;171;87;&lt;201;12
;;;155;;27;;206;92;total;16
;8;;424;;569;;262;102;%;75%
;;;382;;66;;301;109;;
;;;206;;10;;382;140;total;
;;comp’;68;comp’;44;;415;170;&lt;201;19
;;;301;;92;;424;216;total;31
;9 1 8;;415;;73;;493;569;%;61%
;;;96;;860;;854;860;;
;;;262;;46;;-;860;comp’;cumuls
;;;171;;47;;63;44;deb;100%
;63;comp’;137;comp’;714;;64;76;;
;;;854;;87;;68;130;fin;80%
;;;493;;109;;84;149;;
;;;100;;102;;137;714;total;90%
&lt;/pre&gt;

===apal===
====apal opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_opérons|apal opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Acho_palm_J233/achoPalm_J233-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_022538.1;apal;;genome;;;;;;;;
29%GC;16.8.19 Paris;16s  2 ;35;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Acholeplasma palmae J233;;;;;;;;;;;
;161706..162593;;CDS;;132;132;;;296;;
;162726..162816;;agc;;9;;9;;;;
;162826..162901;;gaa;;126;126;;;;;
;163028..163522;;CDS;;;;;;165;;
;;;;;;;;;;;
comp;205002..205226;;CDS;;72;72;;;75;;
comp;205299..205373;;tgg;;73;73;;;;;
comp;205447..206382;;CDS;;133;133;;;;;
;206516..206591;;cac;;14;;14;;;;
;206606..206680;;caa;;34;;34;;;;
;206715..206797;;cta;;168;168;;;;;
;206966..207208;;CDS;;;;;;81;;
;;;;;;;;;;;
;294770..296290;;CDS;;347;347;;;*507;;
;296638..298160;;16s;;128;;;;1523;;
;298289..301126;;23s;;34;;;;2838;;
;301161..301268;;5s;;51;;;;108;;
;301320..301396;;aac;;118;118;;;;;
;301515..301835;;CDS;;;;;;107;;
;;;;;;;;;;;
;303638..304993;;CDS;;70;70;;;452;;
;305064..305139;;gaa;@1;9;;9;;;;
;305149..305225;;cgt;;71;;71;;;;
;305297..305373;;cca;;13;;13;;;;
;305387..305461;;gga;;86;86;;;;;
;305548..308184;;CDS;;;;;;*879;;
;;;;;;;;;;;
;326174..327313;;CDS;;91;91;;;380;;
;327405..327478;;tgc;;527;*527;;;;;
comp;328006..328539;;CDS;;;;;;178;;
;;;;;;;;;;;
;435096..436751;;CDS;;48;48;;;*552;;
;436800..436885;;ctc;;214;214;;;;;
;437100..438890;;CDS;;;;;;*597;;
;;;;;;;;;;;
;441323..442294;;CDS;;38;38;;;324;;
comp;442333..442407;;ggc;;100;100;;;;;
;442508..443650;;CDS;;;;;;381;;
;;;;;;;;;;;
;443640..444197;;CDS;;93;93;;;186;;
comp;444291..444364;;acc;;133;133;;;;;
;444498..444695;;CDS;;;;;;66;;
;;;;;;;;;;;
;644468..646315;;CDS;;124;124;;;*616;;
;646440..646516;;aga;;251;251;;;;;
;646768..647322;;CDS;;;;;;185;;
;;;;;;;;;;;
;669786..670511;;CDS;;45;45;;;242;;
;670557..670632;;cgg;;1;;;;;;
;670634..670722;;tcc;;133;133;;;;;
;670856..671359;;CDS;;;;;;168;;
;;;;;;;;;;;
comp;837575..837796;;CDS;;157;157;;;74;;
comp;837954..838029;;aag;;214;214;;;;;
;838244..838888;;CDS;;;;;;215;;
;;;;;;;;;;;
comp;1172026..1173090;;CDS;;112;112;;;355;;
comp;1173203..1173285;;ttg;;82;82;;;;;
comp;1173368..1175038;;CDS;;;;;;*557;;
;;;;;;;;;;;
comp;1456398..1457315;;CDS;;72;72;;;306;;
comp;1457388..1457463;;gac;;40;40;;;;;
comp;1457504..1458355;;CDS;;154;154;;;284;;
comp;1458510..1458585;;ttc;;7;;;7;;;
comp;1458593..1458668;;gac;;4;;;4;;;
comp;1458673..1458749;;atgf;;55;;;55;;;
comp;1458805..1458895;;tca;;22;;;22;;;
comp;1458918..1458994;;atgi;;4;;;4;;;
comp;1458999..1459075;;atgj;;45;;;45;;;
comp;1459121..1459196;;gca;;5;;;5;;;
comp;1459202..1459286;;tta;;20;;;20;;;
comp;1459307..1459382;;aaa;;6;;;6;;;
comp;1459389..1459464;;aca;;15;;;15;;;
comp;1459480..1459555;;gta;;21;;;;;;
comp;1459577..1459684;;5s;@2;34;;;;108;;
comp;1459719..1462556;;23s;;50;;;;2838;;
comp;1462607..1462682;;gca;;6;;;6;;;
comp;1462689..1462765;;atc;;110;;;;;;
comp;1462876..1464398;;16s;;206;;;;1523;;
comp;1464605..1464688;;tac;;114;114;;;;;
comp;1464803..1464973;;cds;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====apal cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_cumuls|apal cumuls]]
&lt;pre&gt;
apal cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;2;1;0;0;1;0;1;;100;5;30;0
;16 23 5s 0;0;20;4;8;50;4;20;;200;6;60;1
;16 atc gca;1;40;1;1;100;9;40;;300;4;90;4
;16 23 5s a;1;60;0;2;150;9;60;;400;5;120;1
;max a;14;80;1;0;200;3;80;;500;1;150;0
;a doubles;0;100;0;0;250;2;100;;600;4;180;3
;autres;0;120;0;0;300;1;120;;700;1;210;2
;total aas;15;140;0;0;350;1;140;;800;0;240;1
sans ;opérons;14;160;0;0;400;0;160;;900;1;270;1
;1 aa;9;180;0;0;450;0;180;;1000;0;300;2
;max a;4;200;0;0;500;0;200;;1100;0;330;2
;a doubles;0;;0;0;;1;;;;0;;10
;total aas;20;;6;11;;30;;0;;27;;27
total aas;;35;;;;;;;;;;;
remarques;;2;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;;;;136;;;;307;;
;;;variance;;;;100;;;;208;;
sans jaune;;;moyenne;25;17;;122;;;;218;;177
;;;variance;24;18;;68;;;;120;;91
&lt;/pre&gt;

====apal blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_blocs|apal blocs]]
&lt;pre&gt;
apal blocs;;;;;
gta;21;;CDS;347;
5s;34;108;16s;128;1523
23s;50;2838;23s;34;2838
gca;6;;5s;51;108
atc;110;;aac;118;
16s;206;1523;CDS;;
tac;114;;;;
CDS;;;;;
&lt;/pre&gt;

====apal remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_remarques|apal remarques]]
*code génétique apal
&lt;pre&gt;
apal;;;;;;;35
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1
gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;
gta;1;gca;2;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;1;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====apal distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_distribution|apal distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;2;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
tener;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;tener;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;tener;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
apal;;9; ;;;;;;apal;9;;;;;;;;apal;0;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====apal données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_données_intercalaires|apal données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;apal;fx;fc;apal;fx40;fc40;apal;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;0;10;0;0;10;-1;;43;132;133;16s tRNA;;
;0;10;6;163;1;0;42;-2;;0;126;527;118;;atc
;0;20;4;157;2;0;26;-3;;0;72;38;tRNA 16s;;
;0;30;11;37;3;0;17;-4;2;102;73;100;206;;tac
1;1;40;9;34;4;0;14;-5;;0;168;93;tRNA 23s;;gca
;2;50;8;35;5;0;10;-6;1;0;139;133;51;;
;0;60;12;41;6;2;4;-7;;1;70;214;5s tRNA;;
;1;70;7;37;7;2;6;-8;2;44;137;;51;;aac
;2;80;8;29;8;1;10;-9;;0;91;;21;;gta
;1;90;6;31;9;1;15;-10;;1;48;;tRNA tRNA;;intra
2;1;100;11;33;10;0;19;-11;1;33;214;;6;;atc gca
;0;110;6;24;11;0;18;-12;;0;124;;tRNA tRNA;;contig
;2;120;14;31;12;0;23;-13;;2;251;;7;;ttc
;2;130;9;23;13;2;15;-14;;17;45;;4;;gac
2;5;140;11;26;14;0;16;-15;;0;133;;55;;atgf
;0;150;4;17;15;0;18;-16;;1;157;;22;;tca
;2;160;7;16;16;0;9;-17;;13;112;;4;;atgi
;1;170;10;11;17;0;15;-18;;0;82;;45;;atgj
;0;180;6;13;18;1;18;-19;;0;138;;5;;gca
;0;190;4;14;19;0;13;-20;;8;40;;20;;tta
;0;200;3;11;20;1;12;-21;;0;154;;6;;aaa
;0;210;4;10;21;2;1;-22;;0;114;;15;;aca
1;1;220;4;7;22;2;5;-23;;5;CDS 16s;;**;;gta
;0;230;4;5;23;0;5;-24;;0;347;;tRNA tRNA;;
;0;240;3;7;24;3;6;-25;;1;206;;9;;agc
;0;250;1;6;25;0;7;-26;;9;16s 23s;;**;;gaa
;1;260;0;9;26;0;7;-27;;0;137;;14;;cac
;0;270;3;6;27;1;3;-28;;0;23s 5s;;34;;caa
;0;280;0;5;28;1;0;-29;;5;35;;**;;cta
;0;290;1;0;29;0;0;-30;;0;;;9;;gaa
;0;300;1;3;30;2;3;-31;;0;;;71;;cgt
;0;310;0;1;31;1;3;-32;;3;;;13;;cca
;0;320;1;6;32;1;6;-33;;0;;;**;;gga
;0;330;4;4;33;1;2;-34;;0;;;1;;cgg
;0;340;2;2;34;0;5;-35;;2;;;**;;tcc
;0;350;1;4;35;1;1;-36;;0;;;;;
;0;360;0;0;36;0;1;-37;;0;;;;;
;0;370;1;2;37;0;2;-38;;1;;;;;
;0;380;0;3;38;1;6;-39;;0;;;;;
;0;390;0;5;39;3;4;-40;;1;;;;;
;0;400;0;3;40;1;4;-41;;0;;;;;
1;0;reste;5;38;reste;161;518;-42;;0;;;;;
7;22;total;191;919;total;191;919;-43;;0;;;;;
6;22;diagr;186;871;diagr;30;391;-44;;0;;;;;
0;0; t30;21;357;;;;-45;;0;;;;;
;;;;;;;;-46;;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;
;x;191;6;0;197;;;-49;;0;;;;;
;c;909;294;10;1213;;;-50;;0;;;;;
;;;;;1410;96;;reste;;2;;;;;
;;;;;;1506;;total;6;294;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====apal autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_autres_intercalaires_aas|apal autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;apal;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
fin;;CDS;292;1638;;;
deb;;CDS;82590;85343;109;*;
;;regulatory;85453;85552;216;*;
fin;;CDS;85769;86557;;;
deb;;CDS;86565;87845;35;*;
;;misc_binding;87881;88073;51;*;
fin;;CDS;88125;89402;;;
deb;;CDS;161706;162593;132;*;
;;tRNA;162726;162816;9;*;agc
;;tRNA;162826;162901;126;*;gaa
fin;;CDS;163028;163522;;;
deb;comp;CDS;205002;205226;72;*;
;comp;tRNA;205299;205373;73;*;tgg
deb;comp;CDS;205447;206382;133;*;
;;tRNA;206516;206591;14;*;cac
;;tRNA;206606;206680;34;*;caa
;;tRNA;206715;206797;168;*;cta
fin;;CDS;206966;207208;;;
deb;comp;CDS;278906;279901;56;*;
;comp;misc_binding;279958;280136;8;*;
fin;comp;CDS;280145;281908;;0;
deb;;CDS;294770;296290;347;*;
;;rRNA;296638;298152;137;*;1515
;;rRNA;298290;301125;35;*;2836
;;rRNA;301161;301268;51;*;108
;;tRNA;301320;301396;139;*;aac
fin;;CDS;301536;301835;;;
deb;;CDS;303638;304993;70;*;
;;tRNA;305064;305139;9;*;gaa
;;tRNA;305149;305225;71;*;cgt
;;tRNA;305297;305373;13;*;cca
;;tRNA;305387;305461;137;*;gga
fin;;CDS;305599;308184;;;
deb;;CDS;310206;311093;42;*;
;;repeat_region;311136;314336;391;*;
fin;;CDS;314728;315327;;;
deb;;CDS;326174;327313;91;*;
;;tRNA;327405;327478;527;*;tgc
fin;comp;CDS;328006;328539;;0;
deb;;CDS;426740;427501;5;*;
;;misc_binding;427507;427707;40;*;
fin;;CDS;427748;428767;;;
deb;;CDS;435096;436751;48;*;
;;tRNA;436800;436885;214;*;ctc
fin;;CDS;437100;438890;;;
deb;;CDS;441323;442294;38;*;
;comp;tRNA;442333;442407;100;*;ggc
fin;;CDS;442508;443650;;;
deb;;CDS;443640;444197;93;*;
;comp;tRNA;444291;444364;133;*;acc
fin;;CDS;444498;444695;;;
deb;;CDS;480393;481697;56;*;
;;regulatory;481754;481850;51;*;
fin;;CDS;481902;483050;;;
deb;;CDS;575929;577302;54;*;
;;regulatory;577357;577432;44;*;
fin;;CDS;577477;578175;;;
deb;;CDS;583894;584502;19;*;
;;regulatory;584522;584597;56;*;
fin;;CDS;584654;585274;;;
deb;;CDS;644468;646315;124;*;
;;tRNA;646440;646516;251;*;aga
fin;;CDS;646768;647322;;;
deb;;CDS;669786;670511;45;*;
;;tRNA;670557;670632;1;*;cgg
;;tRNA;670634;670722;133;*;tcc
fin;;CDS;670856;671359;;;
deb;;CDS;778517;780295;54;*;
;;misc_binding;780350;780540;55;*;
fin;;CDS;780596;783169;;;
deb;comp;CDS;837575;837796;157;*;
;comp;tRNA;837954;838029;214;*;aag
fin;;CDS;838244;838888;;;
deb;comp;CDS;859225;859602;141;*;
;;regulatory;859744;859842;69;*;
fin;;CDS;859912;860478;;0;
deb;;CDS;900888;901286;41;*;
;;ncRNA;901328;901664;157;*;
fin;;CDS;901822;906708;;;
deb;;CDS;930603;931235;52;*;
;;tmRNA;931288;931628;154;*;
fin;;CDS;931783;934152;;;
deb;comp;CDS;997671;998201;47;*;
;comp;misc_binding;998249;998458;29;*;
fin;comp;CDS;998488;998940;;;
deb;comp;CDS;1099021;1099650;75;*;
;comp;regulatory;1099726;1099840;44;*;
fin;comp;CDS;1099885;1100643;;0;
deb;comp;CDS;1172026;1173090;112;*;
;comp;tRNA;1173203;1173285;82;*;ttg
fin;comp;CDS;1173368;1175038;;;
deb;comp;CDS;1296140;1297378;79;*;
;comp;regulatory;1297458;1297558;175;*;
fin;;CDS;1297734;1298978;;;
deb;comp;CDS;1395785;1396276;13;*;
;comp;misc_feature;1396290;1396409;2;*;
fin;comp;CDS;1396412;1397101;;;
deb;comp;CDS;1420757;1422160;117;*;
;comp;regulatory;1422278;1422379;175;*;
fin;comp;CDS;1422555;1422713;;0;
deb;comp;CDS;1424704;1426260;38;*;
;comp;misc_binding;1426299;1426505;43;*;
fin;comp;CDS;1426549;1427391;;;
deb;comp;CDS;1456398;1457249;138;*;
;comp;tRNA;1457388;1457463;40;*;gac
deb;comp;CDS;1457504;1458355;154;*;
;comp;tRNA;1458510;1458585;7;*;ttc
;comp;tRNA;1458593;1458668;4;*;gac
;comp;tRNA;1458673;1458749;55;*;atgf
;comp;tRNA;1458805;1458895;22;*;tca
;comp;tRNA;1458918;1458994;4;*;atgi
;comp;tRNA;1458999;1459075;45;*;atgj
;comp;tRNA;1459121;1459196;5;*;gca
;comp;tRNA;1459202;1459286;20;*;tta
;comp;tRNA;1459307;1459382;6;*;aaa
;comp;tRNA;1459389;1459464;15;*;aca
;comp;tRNA;1459480;1459555;21;*;gta
;comp;rRNA;1459577;1459684;35;*;108
;comp;rRNA;1459720;1462555;51;*;2836
;comp;tRNA;1462607;1462682;6;*;gca
;comp;tRNA;1462689;1462765;118;*;atc
;comp;rRNA;1462884;1464398;206;*;1515
;comp;tRNA;1464605;1464688;114;*;tac
fin;comp;CDS;1464803;1464973;;;
deb;comp;CDS;1471917;1474742;32;*;
;comp;ncRNA;1474775;1474868;9;*;
fin;comp;CDS;1474878;1475336;;;
deb;comp;CDS;1547053;1548444;47;*;
;comp;misc_binding;1548492;1548707;39;*;
fin;comp;CDS;1548747;1549406;;;
deb;comp;CDS;1554025;1554159;291;*;
&lt;/pre&gt;

===tenericutes synthèse===
====tenericutes distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#tenericutes_distribution_par_génome|tenericutes distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
tener;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
abra;12;14; ;11;1;2;;5;45
apal;9;9; ;11;1;4;;1;35
total;21;23;0;22;2;6;0;6;80
&lt;/pre&gt;

====tenericutes distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#tenericutes_distribution_du_total|tenericutes distribution du total]]
&lt;pre&gt;
tener2;;;;;;;66
atgi;2;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;;tgc;2
atc;;acc;2;aac;;agc;2
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;2
gtc;1;gcc;1;gac;4;ggc;2
tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;2;aga;2
cta;2;cca;3;caa;2;cga;1
gta;2;gca;2;gaa;4;gga;2
ttg;2;tcg;1;tag;;tgg;2
atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;21;23;;22;;;66
;;;;;;;
tener2;;;;;;;14
atgi; ;tct;;tat;;atgf; 
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;2;tgc;
atc;4;acc;;aac;6;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;2;gaa;;gga;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj; ;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;6 1-3aas;2;6;66
&lt;/pre&gt;

====tenericutes distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#tenericutes_distribution_par_type|tenericutes distribution par type]]
*Note: voir construction des [[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|sous totaux]]. Ce sous total peux contenir quelques erreurs.
&lt;pre&gt;
tener2;;;;;;;66;;tener2;;;;;;;23;;tener2;;;;;;;21;;tener2;;;;;;;22
atgi;2;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;2;aac;;agc;2;;atc;;acc;2;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;2;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;4;ggc;2;;gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;
cta;2;cca;3;caa;2;cga;1;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;3;caa;2;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;2;gaa;4;gga;2;;gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;3;gga;2;;gta;2;gca;2;gaa;;gga;
ttg;2;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;21;23;;22;;;66;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;*;;;
&lt;/pre&gt;

====tenericutes par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#tenericutes_par_rapport_au_groupe_de_référence|tenericutes par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;tener2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;7;3;;;;;10;
16;moyen;13;4;;10;;6;33;
14;fort;3;14;;12;6;2;37;
; ;23;21;;22;6;8;80;
10;g+cga;3;2;;;;;5;
2;agg+cgg;1;;;;;;1;
4;carre ccc;3;1;;;;;4;
5;autres;;;;;;;;
;;7;3;;;;;10;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;tener2;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;88;38;;;;;125;26
16;moyen;163;50;;125;;75;413;324
14;fort;38;175;;150;75;25;463;650
; ;288;263;;275;75;100;80;729
10;g+cgg;38;25;;;;;63;10
2;agg+cga;13;;;;;;13;
4;carre ccc;38;13;;;;;50;16
5;autres;;;;;;;;
;;88;38;;;;;125;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;tener2;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;159;68;;227;26;30;14;
16;moyen;295;91;;386;324;57;19;
14;fort;68;318;;386;650;13;67;
; ;523;477;;44;729;23;21;
10;g+cgg;68;45;;114;10;;;
2;agg+cga;23;;;23;;;;
4;carre ccc;68;23;;91;16;;;
5;autres;;;;;;;;
;;159;68;;227;;;;
&lt;/pre&gt;
====tenericutes, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#tenericutes,_estimation_des_-rRNAs|tenericutes, estimation des -rRNAs]]
&lt;pre&gt;
tenericutes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
20 génomes total avec rRNA;;;;tener;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;tener;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;20;93; ; ;;indices;;;;20;465;0;0;;tener2;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;44
atgi;5;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;25;tct;;tat;;atgf;25;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;5;tcc;;tac;5;tgc;;;ttc;25;tcc;;tac;25;tgc;;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;2
atc;10;acc;;aac;11;agc;;;atc;50;acc;;aac;55;agc;;;atc;;acc;2;aac;;agc;2
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;5;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;25;ggc;;;gtc;1;gcc;1;gac;2;ggc;2
tta;5;tca;5;taa;;tga;;;tta;25;tca;25;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;6;aaa;7;aga;;;ata;;aca;30;aaa;35;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;2
cta;2;cca;;caa;;cga;;;cta;10;cca;;caa;;cga;;;cta;2;cca;3;caa;2;cga;1
gta;8;gca;7;gaa;2;gga;;;gta;40;gca;35;gaa;10;gga;;;gta;;gca;;gaa;4;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;2;tcg;1;tag;;tgg;2
atgj;5;acg;;aag;;agg;;;atgj;25;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;39;;54;;0;93;;;;195;;270;;0;465;;;;17;;17;;10;44
27.5.20 Tanger;;;;tener;total;ttt;tgt;;10.1.21 Paris;;;;tener;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;112;3535;0.9;0;;;;;;112;3535;0.9;0;;tener2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;
atgi;62;tct;;tat;;atgf;71;;atgi;87;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;0.9;act;20;aat;;agt;;;att;0.9;act;20;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;13;cct;;cat;;cgc;38;;ctt;13;cct;;cat;;cgc;38;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;0.9;;gtt;;gct;;gat;;ggt;0.9;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;79;tcc;40;tac;75;tgc;99;;ttc;104;tcc;40;tac;100;tgc;99;;ttc;;tcc;50;tac;;tgc;100
atc;53;acc;71;aac;49;agc;99;;atc;103;acc;71;aac;104;agc;99;;atc;;acc;100;aac;;agc;100
ctc;32;ccc;0.0;cac;100;cgt;72;;ctc;32;ccc;;cac;100;cgt;72;;ctc;100;ccc;;cac;100;cgt;100
gtc;1.8;gcc;0.9;gac;77;ggc;56;;gtc;1.8;gcc;0.9;gac;102;ggc;56;;gtc;50;gcc;50;gac;100;ggc;100
tta;73;tca;75;taa;;tga;90;;tta;98;tca;100;taa;;tga;90;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;8;aca;73;aaa;86;aga;103;;ata;8.0;aca;103;aaa;121;aga;103;;ata;;aca;;aaa;;aga;100
cta;90;cca;99;caa;103;cga;38;;cta;100;cca;99;caa;103;cga;38;;cta;100;cca;150;caa;100;cga;50
gta;65;gca;69;gaa;94;gga;102;;gta;105;gca;104;gaa;104;gga;102;;gta;;gca;;gaa;200;gga;100
ttg;98;tcg;33;tag;0.0;tgg;100;;ttg;98;tcg;33;tag;;tgg;100;;ttg;100;tcg;50;tag;;tgg;100
atgj;69;acg;25;aag;62;agg;22;;atgj;94;acg;25;aag;62;agg;22;;atgj;;acg;50;aag;100;agg;50
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;2.7;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;2.7;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0.9;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;0.9;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;1201;;1101;;349;2651;;;;1396;;1371;;329;3096;;;;850;;850;;500;2200
rapports;;86;;80;;106;86;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;tener2;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;71;tct;;tat;;atgf;74;;fiches;28.45;;;fréquences;;;;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;100
att;;act;100;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;569;;;0/0;7;;;;att;100;act;100;aat;;agt;
ctt;100;cct;;cat;;cgc;;;avec;93;;;10;9;;;;ctt;100;cct;;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;20;;;20;1;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;100
ttc;76;tcc;100;tac;75;tgc;100;;;;;;30;4;;;;ttc;100;tcc;20;tac;100;tgc;1
atc;51;acc;100;aac;47;agc;100;;tener2;22;;;40;3;;;;atc;100;acc;29;aac;100;agc;1
ctc;100;ccc;;cac;100;cgt;100;;sans;44;;;50;2;19;;;ctc;68;ccc;;cac;0;cgt;28
gtc;100;gcc;100;gac;75;ggc;100;;avec;36;;;60;2;;;;gtc;96;gcc;98;gac;23;ggc;44
tta;74;tca;75;taa;;tga;100;;genom;2;;;70;1;;;;tta;100;tca;100;taa;;tga;100
ata;100;aca;71;aaa;71;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;100;aca;100;aaa;100;aga;3
cta;90;cca;100;caa;100;cga;100;;L’estimation par tener;;;;90;0;;;;cta;10;cca;34;caa;3;cga;24
gta;62;gca;66;gaa;90;gga;100;;est  23% en dessous;;;;100;19;;;;gta;100;gca;100;gaa;53;gga;2
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;2;tcg;34;tag;;tgg;0
atgj;73;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;100;acg;50;aag;38;agg;56
ctg;;ccg;;cag;;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;100
gtg;;gcg;;gag;;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;100
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;66;;187;;441;693
&lt;/pre&gt;

==spirochète==
===Sphaerochaeta coccoides DSM 17374===
====scc opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_opérons|scc opérons]]
*Notes: * devant un nombre pour les jaunes et dans une cellule pour limiter la protéine dans calc.
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Spha_cocc_DSM_17374/sphaCocc_DSM17374-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_015436.1;scc;génome;;;;;;;;;;
50.6%GC;12.1.21 Paris;16s 3;47;;;;;;;cds dirigé;;
Sphaerochaeta coccoides DSM 17374 ;;;;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéine;
comp;215073..215231;;cds;;1194;*1194;;;53;;hp;
comp;216426..216498;;gcg;@1;369;369;;;;*369;;
comp;216868..217047;;cds;;;;;;60;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;243358..244170;;cds;@2;812;*812;;;271;;HAD-IIB family hydrolase;*
;244983..246519;;16s;;132;;;132;;;;
;246652..246725;;atc;;79;;;79;;;;
;246805..249778;;23s;;72;;;;;;;
;249851..249962;;5s;;175;175;;;;175;;
;250138..250947;;cds;;;;;;270;;metal ABC transporter permease;*
;;;;;;;;;;;;
;300128..301798;;cds;;669;*669;;;557;;formate--tetrahydrofolate ligase;*
;302468..302539;;ggg;;452;*452;;;;*452;;
;302992..304032;;cds;;;;;;347;;ABC transporter substrate-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;316296..317216;;cds;;152;152;;;307;152;phosphatase PAP2 family protein;*
;317369..317442;;gac;;176;176;;;;;;
;317619..318692;;cds;;;;;;358;;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA;*
;;;;;;;;;;;;
;330207..331004;;cds;;16;16;;;266;16;class I SAM-dependent methyltransferase;*
comp;331021..331104;;ttg;;251;251;;;;;;
;331356..333446;;cds;;;;;;*697;;patatin-like phospholipase family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;345290..346216;;cds;;228;228;;;309;;hp;
comp;346445..346517;;ccg;;182;182;;;;182;;
comp;346700..347059;;cds;;;;;;120;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;422975..424363;;cds;;71;71;;;463;71;sulfatase-like hydrolase/transferase;*
comp;424435..424506;;gtc;;252;252;;;;;;
;424759..426600;;cds;;;;;;614;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;436852..438168;;cds;;237;237;;;439;;MFS transporter;*
comp;438406..438477;;gtg;;202;202;;;;202;;
;438680..440152;;cds;;;;;;491;;hp;
;;;;;;;;;;;;
comp;481186..482484;;cds;;180;180;;;433;;HD domain-containing protein;*
;482665..482737;;atgj;;82;82;;;;82;;
;482820..483494;;cds;;;;;;225;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;530805..532313;;cds;;82;82;;;503;82;IMP dehydrogenase;*
;532396..532467;;gta;;310;310;;;;;;
;532778..533485;;cds;;;;;;236;;YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme;*
;;;;;;;;;;;;
;568939..569700;;cds;;102;102;;;254;102;NAD-dependent deacetylase;*
;569803..569874;;gga;;412;412;;;;;;
;570287..570952;;cds;;;;;;222;;hp;
;;;;;;;;;;;;
;636017..636391;;cds;;52;52;;;125;52;chorismate mutase;*
;636444..636517;;aca;;334;334;;;;;;
comp;636852..637013;;cds;;;;;;54;;hp;
;;;;;;;;;;;;
comp;717326..717772;;cds;;66;66;;;149;66;YkgJ family cysteine cluster protein;*
comp;717839..717920;;tac;;230;230;;;;;;
;718151..719386;;cds;;;;;;412;;aminopeptidase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;721419..723056;;cds;@3;67;67;;;546;67;ATP-binding cassette domain-containing protein;*
comp;723124..723195;;gag;;10;;10;;;;;
comp;723206..723276;;cag;;104;104;;;;;;
comp;723381..723911;;cds;;;;;;177;;adenine phosphoribosyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;724974..725225;;cds;;236;236;;;84;;hp;
comp;725462..725533;;acg;;124;124;;;;124;;
comp;725658..728366;;cds;;;;;;*903;;pyruvate, phosphate dikinase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;767509..768549;;cds;;350;350;;;347;*350;DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein;*
comp;768900..769011;;5s;;72;;;;;;;
comp;769084..772057;;23s;;40;;;40;;;;
comp;772098..772171;;gca;;137;;;137;;;;
comp;772309..773845;;16s;;535;*535;;;;;;
;774381..774947;;cds;;;;;;189;;peroxiredoxin;*
;;;;;;;;;;;;
;783089..784627;;cds;;273;273;;;513;;glycoside hydrolase family 43 protein;*
comp;784901..784972;;gaa;;43;;43;;;;;
comp;785016..785088;;aaa;;223;223;;;;223;;
;785312..787483;;cds;;;;;;*724;;cadmium-translocating P-type ATPase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;877367..879202;;cds;;447;447;;;612;*447;translational GTPase TypA;*
comp;879650..879761;;5s;;72;;;;;;;
comp;879834..882807;;23s;;40;;;40;;;;
comp;882848..882921;;gca;;137;;;137;;;;
comp;883059..884595;;16s;;648;*648;;;;;;
;885244..885867;;cds;;;;;;208;;GNAT family N-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;
;900855..901490;;cds;;73;73;;;212;73;Fic family protein;*
comp;901564..901637;;ccc;;214;214;;;;;;
;901852..903519;;cds;;;;;;556;;Alpha-glucosidase;*
;;;;;;;;;;;;
;928254..930545;;cds;;138;138;;;*764;138;AAA family ATPase;*
;930684..930755;;cac;;32;;32;;;;;
;930788..930861;;cga;;38;;38;;;;;
;930900..930972;;aag;;37;;37;;;;;
;931010..931091;;cta;;36;;36;;;;;
;931128..931199;;ggc;;423;423;;;;;;
;931623..932981;;cds;;;;;;453;;trigger factor;*
;;;;;;;;;;;;
;937885..939693;;cds;;171;171;;;603;171;oligoendopeptidase F;*
;939865..939938;;aga;;437;437;;;;;;
;940376..940579;;cds;;;;;;68;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;974079..974468;;cds;@4;223;223;;;130;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;974692..974775;;ctc;;153;153;;;;153;;
comp;974929..975384;;cds;;112;112;;;152;;VOC family protein;*
comp;975497..975569;;cca;;95;95;;;;95;;
;975665..976339;;cds;;;;;;225;;endonuclease III;*
;;;;;;;;;;;;
;1069506..1069922;;cds;;81;81;;;139;;hp;
comp;1070004..1070087;;tta;;78;78;;;;78;;
;1070166..1070981;;cds;;;;;;272;;TatD family hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1113338..1113928;;cds;;247;247;;;197;247;NAD(P)H-dependent oxidoreductase;*
;1114176..1114248;;aac;;247;247;;;;;;
comp;1114496..1117318;;cds;;;;;;*941;;5'-nucleotidase C-terminal domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1126672..1127604;;cds;;173;173;;;311;173;DUF362 domain-containing protein;*
;1127778..1127850;;caa;;193;193;;;;;;
comp;1128044..1128334;;cds;;;;;;97;;septation regulator SpoVG;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1257969..1258763;;cds;;140;140;;;265;;nucleotidyltransferase domain-containing protein;*
;1258904..1258977;;agg;;79;79;;;;79;;
;1259057..1259779;;cds;;;;;;241;;nitroreductase family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1273039..1273944;;cds;;217;217;;;302;;DNA-protecting protein DprA;*
;1274162..1274234;;ttc;;103;103;;;;103;;
comp;1274338..1274865;;cds;;;;;;176;;cysteine hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1363097..1364389;;cds;;432;432;;;431;;H(+)-transporting two-sector ATPase;*
;1364822..1364894;;atgf;;213;213;;;;213;;
;1365108..1366457;;cds;;;;;;450;;Trk system potassium transporter TrkA;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1478531..1479448;;cds;;196;196;;;306;196;hp;
;1479645..1479718;;cgg;;256;256;;;;;;
comp;1479975..1481738;;cds;;;;;;588;;ABC transporter ATP-binding protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1522454..1523143;;cds;;86;86;;;230;;hp;
;1523230..1523301;;tgc;;34;34;;;;34;;
comp;1523336..1523890;;cds;;;;;;185;;hp;
;;;;;;;;;;;;
comp;1540671..1541807;;cds;;186;186;;;379;186;DUF2974 domain-containing protein;*
comp;1541994..1542066;;gcc;;351;351;;;;;;
;1542418..1544223;;cds;;;;;;602;;IS1634 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;
;1691238..1692578;;cds;;189;189;;;447;189;sn-glycerol-1-phosphate dehydrogenase;*
;1692768..1692851;;ctg;;564;*564;;;;;;
;1693416..1693646;;cds;;;;;;77;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1760709..1761905;;cds;;185;185;;;399;185;hp;
;1762091..1762164;;atgi;;316;316;;;;;;
comp;1762481..1765135;;cds;;;;;;*885;;valine--tRNA ligase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2034849..2035028;;cds;@4;32;32;;;60;;preprotein translocase subunit SecE;*
comp;2035061..2035134;;tgg;;26;26;;;;26;;
comp;2035161..2035337;;cds;;64;64;;;59;64;50S ribosomal protein L33;*
comp;2035402..2035474;;acc;;246;246;;;;;;
;2035721..2036506;;cds;;;;;;262;;HAD family hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;
;2185380..2186171;;cds;@5;84;84;;;264;84;16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase;*
;2186256..2186340;;tca;;40;;40;;;;;
;2186381..2186467;;agc;;25;;25;;;;;
;2186493..2186566;;cgc;;16;;16;;;;;
;2186583..2186669;;tcg;;40;;40;;;;;
;2186710..2186795;;tcc;;13;;;;;;;
;2186809..2186906;;ncRNA;;133;133;;;*33;;;
comp;2187040..2188236;;cds;;;;;;399;;transposase;*
&lt;/pre&gt;

====scc cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_cumuls|scc cumuls]]
*Notes: * pour le nombre de jaunes
&lt;pre&gt;
scc cumuls;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa
avec rRNA;opérons;3;1;0;;1;0;1;0;100;9
;16 23 5s 0;;20;2;;50;4;20;1;200;11
;16 atc23s5s;1;40;7;2;100;14;40;2;300;16
;16gca23s5s;2;60;1;0;150;8;60;1;400;11
;max a;1;80;;1;200;13;80;7;500;9
;a doubles;;100;;0;250;13;100;4;600;6
;autres;;120;;0;300;4;120;2;700;5
;total aas;3;140;;3;350;4;140;2;800;*2
sans ;opérons;34;160;;;400;2;160;2;900;*1
;1 aa;30;180;;;450;5;180;3;1000;*2
;max a;5;200;;;500;*1;200;5;1100;
;a doubles;0;;;;;*6;;*4;;
;total aas;44;;10;6;;74;;33;;72
total aas;;47;;;;;;;*4;;*6
remarques;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;32;94;;236;;154;;343
;;;variance;11;47;;196;;108;;215
sans jaune;;;moyenne;;;;188;;124;;299
;;;variance;;;;110;;64;;164
&lt;/pre&gt;

====scc blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_blocs|scc blocs]]
&lt;pre&gt;
cds;812;;cds;350;447
16s;132;;5s;72;72
atc;79;;23s;40;40
23s;72;;gca;137;137
5s;175;;16s;535;648
cds;;;cds;;
&lt;/pre&gt;

====scc remarques====
====scc distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_distribution|scc distribution]]
&lt;pre&gt;
distribution;scc;;;;;;47
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;0
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
total;14;30;;;;3;47
;;;;;;;
;;;;;;;
distribution;scc;;;;;;47
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;0
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
;inter;;max;;min;;total
;17;;13;;17;;47
&lt;/pre&gt;

====scc données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_données_intercalaires|scc données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;scc;fx;fc;scc;fx40;fc40;scc;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;2;6;0;2;6;-1;0;39;1194;152;16s tRNA;;
;0;10;9;164;1;1;31;-2;1;0;369;16;132;;atc
1;0;20;15;120;2;0;27;-3;0;0;669;251;2* 137;;gca
;1;30;25;55;3;3;23;-4;2;156;452;71;tRNA 23s;;
1;1;40;12;49;4;1;7;-5;0;0;176;252;79;;atc
;0;50;20;52;5;0;13;-6;2;0;228;237;2* 40;;gca
;1;60;10;31;6;0;4;-7;0;6;182;202;tRNA tRNA;;
;3;70;18;44;7;2;8;-8;0;31;82;180;10;;gag
3;1;80;15;38;8;0;11;-9;2;0;82;334;**;;cag
2;3;90;17;36;9;1;20;-10;0;5;310;273;43;;gaa
1;0;100;26;29;10;1;20;-11;4;15;102;223;**;;aaa
1;2;110;13;31;11;0;12;-12;2;0;412;73;32;;cac
;1;120;18;23;12;2;15;-13;1;2;52;214;38;;cga
;1;130;17;21;13;2;16;-14;0;17;66;95;37;;aag
1;1;140;16;23;14;2;16;-15;1;0;67;230;36;;cta
;0;150;10;20;15;1;12;-16;1;4;104;81;**;;ggc
1;1;160;12;18;16;0;8;-17;2;7;236;78;40;;tca
;0;170;16;11;17;1;7;-18;1;0;124;247;25;;agc
2;2;180;14;14;18;0;15;-19;0;0;138;247;16;;cgc
1;3;190;9;13;19;4;7;-20;0;10;423;173;40;;tcg
2;0;200;11;17;20;3;12;-21;0;0;171;193;**;;tcc
1;0;210;6;15;21;2;5;-22;0;0;437;140;;;
2;1;220;13;14;22;0;6;-23;2;2;223;217;;;
2;2;230;10;9;23;1;9;-24;1;1;153;103;;;
1;1;240;14;8;24;4;8;-25;0;2;112;432;;;
3;0;250;10;7;25;3;6;-26;2;5;79;196;;;
3;0;260;5;7;26;3;9;-27;0;0;213;256;;;
;0;270;6;9;27;4;3;-28;0;0;186;86;;;
1;0;280;3;7;28;0;5;-29;0;2;189;34;;;
;0;290;7;8;29;3;3;-30;0;0;564;351;;;
;0;300;4;8;30;5;1;-31;1;1;32;185;;;
;1;310;3;8;31;2;7;-32;1;2;26;316;;;
1;0;320;6;10;32;1;2;-33;0;0;64;246;;;
;0;330;2;6;33;1;3;-34;0;1;84;;;;
1;0;340;8;3;34;0;8;-35;0;0;CDS 16s;;;;
;0;350;1;6;35;1;5;-36;0;0;812;;;;
1;0;360;5;7;36;1;5;-37;0;0;350;;;;
;1;370;1;5;37;2;2;-38;0;0;447;;;;
;0;380;3;5;38;2;7;-39;0;0;23s 5s;;;;
;0;390;5;5;39;2;8;-40;0;0;3* 72;;;;
;0;400;2;4;40;0;2;-41;0;2;5s CDS;;;;
1;7;reste;39;34;reste;395;606;-42;0;0;350;175;;;
32;35;total;458;1000;total;458;1000;-43;0;0;447;;;;
31;28;diagr;417;960;diagr;61;388;-44;0;2;;;;;
1;1; t30;49;339;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;1;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;1;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;;;;;
;x;456;28;2;486;;;-49;0;0;;;;;
;c;994;319;6;1319;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1805;104;;reste;1;6;;;;;
;;;;;;1909;;total;28;319;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====scc autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_autres_intercalaires_aas|scc autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;scc;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;215073;215231;1194;*;
;comp;tRNA;216426;216498;369;*;gcg
fin;comp;CDS;216868;217047;;0;
deb;;CDS;243358;244170;812;*;
;;rRNA;244983;246519;132;*;16s
;;tRNA;246652;246725;79;*;atc
;;rRNA;246805;249778;72;*;23s
;;rRNA;249851;249962;175;*;5s
fin;comp;CDS;250138;250947;;;
deb;;CDS;300128;301798;669;*;
;;tRNA;302468;302539;452;*;ggg
fin;;CDS;302992;304032;;;
deb;comp;CDS;316296;317216;152;*;
;;tRNA;317369;317442;176;*;gac
fin;;CDS;317619;318692;;;
deb;;CDS;330207;331004;16;*;
;comp;tRNA;331021;331104;251;*;ttg
fin;;CDS;331356;333446;;1;
deb;comp;CDS;345290;346216;228;*;
;comp;tRNA;346445;346517;182;*;ccg
fin;comp;CDS;346700;347059;;0;
deb;;CDS;422975;424363;71;*;
;comp;tRNA;424435;424506;252;*;gtc
fin;;CDS;424759;426600;;;
deb;;CDS;436852;438168;237;*;
;comp;tRNA;438406;438477;202;*;gtg
fin;;CDS;438680;440152;;1;
deb;comp;CDS;481186;482484;180;*;
;;tRNA;482665;482737;82;*;atgj
fin;;CDS;482820;483494;;;
deb;;CDS;530805;532313;82;*;
;;tRNA;532396;532467;310;*;gta
fin;;CDS;532778;533485;;;
deb;;CDS;568939;569700;102;*;
;;tRNA;569803;569874;412;*;gga
fin;;CDS;570287;570952;;;
deb;;CDS;636017;636391;52;*;
;;tRNA;636444;636517;334;*;aca
fin;comp;CDS;636852;637013;;0;
deb;;CDS;640192;640530;79;*;
;;tmRNA;640610;640987;334;*;
fin;comp;CDS;641322;642209;;0;
deb;;CDS;711173;712012;51;*;
;comp;ncRNA;712064;712406;10;*;
fin;comp;CDS;712417;713229;;;
deb;comp;CDS;717326;717772;66;*;
;comp;tRNA;717839;717920;230;*;tac
fin;;CDS;718151;719386;;;
deb;comp;CDS;721419;723056;67;*;
;comp;tRNA;723124;723195;10;*;gag
;comp;tRNA;723206;723276;104;*;cag
fin;comp;CDS;723381;723911;;;
deb;comp;CDS;724974;725225;236;*;
;comp;tRNA;725462;725533;124;*;acg
fin;comp;CDS;725658;728366;;;
deb;comp;CDS;767509;768549;350;*;
;comp;rRNA;768900;769011;72;*;5s
;comp;rRNA;769084;772057;40;*;23s
;comp;tRNA;772098;772171;137;*;gca
;comp;rRNA;772309;773845;535;*;16s
fin;;CDS;774381;774947;;;
deb;;CDS;783089;784627;273;*;
;comp;tRNA;784901;784972;43;*;gaa
;comp;tRNA;785016;785088;223;*;aaa
fin;;CDS;785312;787483;;;
deb;comp;CDS;877367;879202;447;*;
;comp;rRNA;879650;879761;72;*;5s
;comp;rRNA;879834;882807;40;*;23s
;comp;tRNA;882848;882921;137;*;gca
;comp;rRNA;883059;884595;648;*;16s
fin;;CDS;885244;885867;;0;
deb;;CDS;900855;901490;73;*;
;comp;tRNA;901564;901637;214;*;ccc
fin;;CDS;901852;903519;;;
deb;;CDS;928254;930545;138;*;
;;tRNA;930684;930755;32;*;cac
;;tRNA;930788;930861;38;*;cga
;;tRNA;930900;930972;37;*;aag
;;tRNA;931010;931091;36;*;cta
;;tRNA;931128;931199;423;*;ggc
fin;;CDS;931623;932981;;;
deb;;CDS;937885;939693;171;*;
;;tRNA;939865;939938;437;*;aga
fin;;CDS;940376;940579;;0;
deb;comp;CDS;974079;974468;223;*;
;comp;tRNA;974692;974775;153;*;ctc
deb;comp;CDS;974929;975384;112;*;
;comp;tRNA;975497;975569;95;*;cca
fin;;CDS;975665;976339;;0;
deb;;CDS;1069506;1069922;81;*;
;comp;tRNA;1070004;1070087;78;*;tta
fin;;CDS;1070166;1070981;;;
deb;;CDS;1084097;1084510;24;*;
;;regulatory;1084535;1084630;39;*;
fin;;CDS;1084670;1085716;;;
deb;comp;CDS;1113338;1113928;247;*;
;;tRNA;1114176;1114248;247;*;aac
fin;comp;CDS;1114496;1117318;;;
deb;comp;CDS;1126672;1127604;173;*;
;;tRNA;1127778;1127850;193;*;caa
fin;comp;CDS;1128044;1128334;;;
deb;comp;CDS;1257969;1258763;140;*;
;;tRNA;1258904;1258977;79;*;agg
fin;;CDS;1259057;1259779;;0;
deb;comp;CDS;1273039;1273944;217;*;
;;tRNA;1274162;1274234;103;*;ttc
fin;comp;CDS;1274338;1274865;;1;
deb;;CDS;1301674;1301952;54;*;
;;rpr;1302007;1306491;4;*;
fin;;CDS;1306496;1306978;;;
deb;;CDS;1319568;1319912;73;*;
;;rpr;1319986;1322002;84;*;
fin;comp;CDS;1322087;1322668;;;
deb;comp;CDS;1363097;1364389;432;*;
;;tRNA;1364822;1364894;213;*;atgf
fin;;CDS;1365108;1366457;;;
deb;comp;CDS;1478531;1479448;196;*;
;;tRNA;1479645;1479718;256;*;cgg
fin;comp;CDS;1479975;1481738;;;
deb;comp;CDS;1522454;1523143;86;*;
;;tRNA;1523230;1523301;34;*;tgc
fin;comp;CDS;1523336;1523890;;;
deb;comp;CDS;1540671;1541807;186;*;
;comp;tRNA;1541994;1542066;351;*;gcc
fin;;CDS;1542418;1544223;;0;
deb;;CDS;1691238;1692578;189;*;
;;tRNA;1692768;1692851;564;*;ctg
fin;;CDS;1693416;1693646;;;
deb;comp;CDS;1760709;1761905;185;*;
;;tRNA;1762091;1762164;316;*;atgi
fin;comp;CDS;1762481;1765135;;;
deb;comp;CDS;2034849;2035028;32;*;
;comp;tRNA;2035061;2035134;26;*;tgg
deb;comp;CDS;2035161;2035337;64;*;
;comp;tRNA;2035402;2035474;246;*;acc
fin;;CDS;2035721;2036506;;0;
deb;;CDS;2185380;2186171;84;*;
;;tRNA;2186256;2186340;40;*;tca
;;tRNA;2186381;2186467;25;*;agc
;;tRNA;2186493;2186566;16;*;cgc
;;tRNA;2186583;2186669;40;*;tcg
;;tRNA;2186710;2186795;13;*;tcc
;;ncRNA;2186809;2186906;133;*;
fin;comp;CDS;2187040;2188236;;;
&lt;/pre&gt;

====scc intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_entre_cds|scc intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
scc;3.2.21 Paris;;scc 16.7.20;;;;;;;
scc;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5
;'''négatif;347;19.2;'''négatif ;-10;13;-1 à -74;'''2 227 296;-1;347
;'''zéro;8;0.4;;;;;'''intercals;0;8
;'''1 à 200;1112;61.6;'''0 à 200;69;57;;'''195 310;5;106
;'''201 à 370;241;13.4;'''201 à 370;269;49;;'''8.8%;10;67
;'''371 à 600;78;4.3;'''371 à 600;445;63;;;15;78
;'''601 à max;19;1.1;'''601 à 1048;779;145;;;20;57
;'''total 1805;&lt;201;81;'''total 1800;103;136;-74 à 1048;;25;44
adresse;intercal;intercal;&lt;u&gt;fréquence1;intercal;&lt;u&gt;fréquence6;cumul, %;intercal;&lt;u&gt;fréquence-1;30;36
1398976;1670;-1;347;-70;2;;0;8;35;30
1167746;1666;0;8;-60;2;;-1;°39;40;31
1943263;1598;1;°32;-50;3;;-2;1;45;39
2221165;1229;2;27;-40;6;;-3;0;50;33
940376;1048;3;26;-30;6;'''min à -1;-4;°158;55;27
2116721;960;4;8;-20;27;347;-5;0;60;14
1197192;959;5;°13;-10;62;19.2%;-6;2;65;36
1728512;916;6;4;0;247;;-7;6;70;26
1917725;874;7;10;10;173;;-8;°31;75;22
972954;867;8;11;20;135;;-9;2;80;31
1554925;775;9;°21;30;80;;-10;5;85;26
1997696;715;10;21;40;61;'''1 à 100;-11;°19;90;27
1693573;700;11;12;50;72;785;-12;2;95;33
1314184;671;12;°17;60;41;43.5%;-13;3;100;22
1528150;655;13;18;70;62;;-14;°17;105;23
1659099;643;14;18;80;53;;-15;1;110;21
1773078;643;15;°13;90;53;;-16;5;115;20
1732369;635;16;8;100;55;'''0 à 200;-17;°9;120;21
356981;617;17;8;110;44;1120;-18;1;125;20
137346;590;18;°15;120;41;;-19;0;130;18
1639500;590;19;11;130;38;;-20;°10;135;20
977451;580;20;°15;140;39;;-21;0;140;19
661808;579;21;7;150;30;;-22;0;145;16
1611095;565;22;6;160;30;;-23;°4;150;14
1590201;563;23;°10;170;27;'''1 à 200;-24;2;155;17
1330173;561;24;12;180;28;1112;-25;2;160;13
379215;558;25;9;190;22;62%;-26;°7;165;15
1755945;548;26;°12;200;28;;-27;0;170;12
191845;527;27;7;210;21;;-28;0;175;12
1897378;525;28;5;220;27;;-29;°2;180;16
72886;522;29;6;230;19;;-30;0;185;12
1978592;521;30;6;240;22;;-31;2;190;10
511329;515;31;°9;250;17;;-32;°3;195;14
220737;512;32;3;260;12;;;42;200;14
1410834;511;33;4;270;15;;reste;14;205;11
;;34;8;280;10;;total;355;210;10
;;35;6;290;15;;;;215;20
;;36;6;300;12;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;220;7
;;37;4;310;11;;600;1786;225;11
;;38;9;320;16;;620;1;230;8
;;39;°10;330;8;;640;1;235;10
;;40;2;340;11;'''201 à 370;660;3;240;12
;;reste;1 001;350;7;241;680;1;245;8
;;total;1 805;360;12;13.4%;700;1;250;9
;;;;370;6;;720;1;255;7
;;;;380;8;;740;;260;5
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;390;10;;760;;265;8
438680;-120;comp;;400;6;;780;1;270;7
1693416;-74;shift2;158;410;7;;800;;275;4
277564;-68;shift2;1487;420;8;;820;;280;6
1935981;-68;shift2;686;430;4;;840;;285;6
964418;-59;shift2;296;440;4;;860;;290;9
1721260;-59;shift2;1127;450;1;;880;2;295;8
482820;-53;shift2;623;460;1;;900;;300;4
1283977;-47;comp;;470;5;;920;1;305;6
1310625;-46;shift2;417;480;3;;940;;310;5
1544483;-44;shift2;374;490;2;;960;2;315;9
1705959;-44;shift2;1007;500;2;;980;;320;7
950419;-41;;;510;1;;1000;;325;4
1249575;-41;;;520;3;;1020;;330;4
2054241;-34;;;530;4;;1040;;335;4
937251;-32;;;540;0;'''371 à 600;1060;1;340;7
1154295;-32;;;550;1;78;;15;345;2
1972305;-32;;;560;1;4.3%;;;350;5
485333;-31;;;570;3;;;;355;4
1666650;-31;;;580;2;'''601 à max;;;360;8
952193;-29;;;590;2;19;;;365;4
1123783;-29;;;600;0;1.1%;;;370;2
669889;-26;;;reste;19;;reste;4;reste;97
733006;-26;;;total;1805;;total;1805;total;1805
&lt;/pre&gt;

====scc  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_positifs_S+|scc intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
scc Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
blo;min20;448;993;1441;820;406;537;131;38;255;669;;;
scc;min10;416;961;1377;748;440;530;90;-88;49;367;;;
cbn;min20;489;1701;2190;731;543;505;-38;-222;-114;271;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
89;208;0.43;518;1255;4;1;35;167;54;241;-109;;;
118;353;0.33;485;1320;4;5;58;242;60;389;-177;;;
65;312;0.21;553;1940;2;5;17;86;56;620;-382;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
scc;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;30;-200;266;31;690;222;max30;&amp;-86;660;-1605;134;830;256;min60
31 à 400;;;;;;;2 parties;&amp;-7;162;-551;72;949;318;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;104;46;-;619;poly;71;tF;&amp;197;65;;499;poly;331;SF
31 à 400;;;;;;;;&amp;114;43;-;787;poly;162;SF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;corrélation;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;-0.177;;;;;;
41-n;0.748;0.440;0.530;;;;;;;;;;;
1-n;0.367;-0.088;0.049;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
scc;fx;fc;;scc;fx%;fc%;scc;fx40;fc40;;x;scc;Sx-;Sc-
0;2;6;;0;5;6;0;2;6;&gt;0;455;-1;0;39
10;9;164;;10;22;171;1;1;31;&lt;0;28;-2;1;0
20;15;120;;20;36;125;2;0;27;zéro;2;-3;0;0
30;25;55;;30;60;57;3;3;23;total;485;-4;2;156
40;11;50;;40;26;52;4;1;7;;c;-5;0;0
50;20;52;;50;48;54;5;0;13;&gt;0;995;-6;2;0
60;10;31;;60;24;32;6;0;4;&lt;0;319;-7;0;6
70;18;44;;70;43;46;7;2;8;zéro;6;-8;0;31
80;15;38;;80;36;40;8;0;11;total;1320;-9;2;0
90;17;36;;90;41;37;9;1;20;;;-10;0;5
100;27;28;;100;65;29;10;1;20;;;-11;4;15
110;13;31;;110;31;32;11;0;12;;;-12;2;0
120;18;23;;120;43;24;12;2;15;;;-13;1;2
130;17;21;;130;41;22;13;2;16;;;-14;0;17
140;16;23;;140;38;24;14;2;16;;;-15;1;0
150;10;20;;150;24;21;15;1;12;;;-16;1;4
160;12;18;;160;29;19;16;0;8;;;-17;2;7
170;15;12;;170;36;12;17;1;7;;;-18;1;0
180;14;14;;180;34;15;18;0;15;;;-19;0;0
190;9;13;;190;22;14;19;4;7;;;-20;0;10
200;11;17;;200;26;18;20;3;12;;;-21;0;0
210;6;15;;210;14;16;21;2;5;;;-22;0;0
220;13;14;;220;31;15;22;0;6;;;-23;2;2
230;10;9;;230;24;9;23;1;9;;;-24;1;1
240;14;8;;240;34;8;24;4;8;;;-25;0;2
250;10;7;;250;24;7;25;3;6;;;-26;2;5
260;5;7;;260;12;7;26;3;9;;;-27;0;0
270;6;9;;270;14;9;27;4;3;;;-28;0;0
280;3;7;;280;7;7;28;0;5;;;-29;0;2
290;7;8;;290;17;8;29;3;3;;;-30;0;0
300;4;8;;300;10;8;30;5;1;;;-31;1;1
310;3;8;;310;7;8;31;2;7;;;-32;1;2
320;6;10;;320;14;10;32;1;2;;;-33;0;0
330;2;6;;330;5;6;33;1;3;;;-34;0;1
340;8;3;;340;19;3;34;0;8;;;-35;0;0
350;1;6;;350;2;6;35;1;5;;;-36;0;0
360;5;7;;360;12;7;36;1;5;;;-37;0;0
370;1;5;;370;2;5;37;2;2;;;-38;0;0
380;3;5;;380;7;5;38;2;7;;;-39;0;0
390;5;5;;390;12;5;39;1;9;;;-40;0;0
400;2;4;;400;5;4;40;0;2;;;-41;0;2
reste;39;34;;;;;reste;395;606;;;-42;0;0
total;457;1001;;t30;118;353;total;457;1001;;;-43;0;0
diagr;416;961;;;;;diagr;60;389;;;-44;0;2
 - t30;367;622;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;1
;;;;;;;;;;;;-47;1;0
;;;;;;;;;;;;-48;0;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;0
;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;reste;1;6
;;;;;;;;;;;;total;28;319
&lt;/pre&gt;

====scc  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_négatifs_S-|scc intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
scc;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
continu;39;0;0;156;0;0;6;31;0;5;16;0;2;17;0;4;7;0;0;10;0;0;2;1;2;5;0;0;2;0;1;2;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;2;0;1;0;0;0;0;6;320
comp';0;1;0;2;0;2;0;0;2;0;3;2;1;0;1;1;2;1;0;0;0;0;2;1;0;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;27
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;scc;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;1;0;2;0;2;0;0;2;0;4;2;1;0;1;1;2;1;0;0;0;0;2;1;0;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;28
;Sc-;39;0;0;156;0;0;6;31;0;5;15;0;2;17;0;4;7;0;0;10;0;0;2;1;2;5;0;0;2;0;1;2;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;2;0;1;0;0;0;0;6;319
&lt;/pre&gt;

====scc autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_autres_intercalaires|scc autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
;scc;autres intercalaires;;adresses1;;;scc;autres intercalaires;;adresses2;;;scc;autres intercalaires;;adresses3
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;215073;1194;comp;;deb;°CDS;721419;67;comp;;deb;°CDS;1113338;247;comp
;&amp;tRNA;216426;369;comp;;;&amp;tRNA;723124;10;comp;;;&amp;tRNA;1114176;247;
fin;°CDS;216868;;comp;;;&amp;tRNA;723206;104;comp;;fin;°CDS;1114496;;comp
deb;°CDS;243358;812;;;fin;°CDS;723381;;comp;;deb;°CDS;1126672;173;comp
;$rRNA;244983;132;;;deb;°CDS;724974;236;comp;;;&amp;tRNA;1127778;193;
;&amp;tRNA;246652;79;;;;&amp;tRNA;725462;124;comp;;fin;°CDS;1128044;;comp
;$rRNA;246805;72;;;fin;°CDS;725658;;comp;;deb;°CDS;1257969;140;comp
;$rRNA;249851;175;;;deb;°CDS;767509;350;comp;;;&amp;tRNA;1258904;79;
fin;°CDS;250138;;comp;;;$rRNA;768900;72;comp;;fin;°CDS;1259057;;
deb;°CDS;300128;669;;;;$rRNA;769084;40;comp;;deb;°CDS;1273039;217;comp
;&amp;tRNA;302468;452;;;;&amp;tRNA;772098;137;comp;;;&amp;tRNA;1274162;103;
fin;°CDS;302992;;;;;$rRNA;772309;535;comp;;fin;°CDS;1274338;;comp
deb;°CDS;316296;152;comp;;fin;°CDS;774381;;;;deb;°CDS;1301674;54;
;&amp;tRNA;317369;176;;;deb;°CDS;783089;273;;;;repeat_region;1302007;4;
fin;°CDS;317619;;;;;&amp;tRNA;784901;43;comp;;fin;°CDS;1306496;;
deb;°CDS;330207;16;;;;&amp;tRNA;785016;223;comp;;deb;°CDS;1319568;73;
;&amp;tRNA;331021;251;comp;;fin;°CDS;785312;;;;;repeat_region;1319986;84;
fin;°CDS;331356;;;;deb;°CDS;877367;447;comp;;fin;°CDS;1322087;;comp
deb;°CDS;345290;228;comp;;;$rRNA;879650;72;comp;;deb;°CDS;1363097;432;comp
;&amp;tRNA;346445;182;comp;;;$rRNA;879834;40;comp;;;&amp;tRNA;1364822;213;
fin;°CDS;346700;;comp;;;&amp;tRNA;882848;137;comp;;fin;°CDS;1365108;;
deb;°CDS;422975;71;;;;$rRNA;883059;648;comp;;deb;°CDS;1478531;196;comp
;&amp;tRNA;424435;252;comp;;fin;°CDS;885244;;;;;&amp;tRNA;1479645;256;
fin;°CDS;424759;;;;deb;°CDS;900855;73;;;fin;°CDS;1479975;;comp
deb;°CDS;436852;237;;;;&amp;tRNA;901564;214;comp;;deb;°CDS;1522454;86;comp
;&amp;tRNA;438406;202;comp;;fin;°CDS;901852;;;;;&amp;tRNA;1523230;34;
fin;°CDS;438680;;;;deb;°CDS;928254;138;;;fin;°CDS;1523336;;comp
deb;°CDS;481186;180;comp;;;&amp;tRNA;930684;32;;;deb;°CDS;1540671;186;comp
;&amp;tRNA;482665;82;;;;&amp;tRNA;930788;38;;;;&amp;tRNA;1541994;351;comp
fin;°CDS;482820;;;;;&amp;tRNA;930900;37;;;fin;°CDS;1542418;;
deb;°CDS;530805;82;;;;&amp;tRNA;931010;36;;;deb;°CDS;1691238;189;
;&amp;tRNA;532396;310;;;;&amp;tRNA;931128;423;;;;&amp;tRNA;1692768;564;
fin;°CDS;532778;;;;fin;°CDS;931623;;;;fin;°CDS;1693416;;
deb;°CDS;568939;102;;;deb;°CDS;937885;171;;;deb;°CDS;1760709;185;comp
;&amp;tRNA;569803;412;;;;&amp;tRNA;939865;437;;;;&amp;tRNA;1762091;316;
fin;°CDS;570287;;;;fin;°CDS;940376;;;;fin;°CDS;1762481;;comp
deb;°CDS;636017;52;;;deb;°CDS;974079;223;comp;;deb;°CDS;2034849;32;comp
;&amp;tRNA;636444;334;;;;&amp;tRNA;974692;153;comp;;;&amp;tRNA;2035061;26;comp
fin;°CDS;636852;;comp;;deb;°CDS;974929;112;comp;;deb;°CDS;2035161;64;comp
deb;°CDS;640192;79;;;;&amp;tRNA;975497;95;comp;;;&amp;tRNA;2035402;246;comp
;tmRNA;640610;334;;;fin;°CDS;975665;;;;fin;°CDS;2035721;;
fin;°CDS;641322;;comp;;deb;°CDS;1069506;81;;;deb;°CDS;2185380;84;
deb;°CDS;711173;51;;;;&amp;tRNA;1070004;78;comp;;;&amp;tRNA;2186256;40;
;ncRNA;712064;10;comp;;fin;°CDS;1070166;;;;;&amp;tRNA;2186381;25;
fin;°CDS;712417;;comp;;deb;°CDS;1084097;24;;;;&amp;tRNA;2186493;16;
deb;°CDS;717326;66;;;;regulatory;1084535;39;;;;&amp;tRNA;2186583;40;
;&amp;tRNA;717839;230;;;fin;°CDS;1084670;;;;;&amp;tRNA;2186710;13;
fin;°CDS;718151;;;;;;;;;;;ncRNA;2186809;133;
;;;;;;;;;;;;fin;°CDS;2187040;;comp
&lt;/pre&gt;
====scc intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_tRNA|scc intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
scc;intercalaires tRNA;;;;;;;;;
comp’;aa;comp’;deb;comp’;fin;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;;;1194;;369;;32;26;deb;
;;;669;;452;;52;79;&lt;201;13
;;comp’;152;;176;;64;82;total;18
;;comp’;16;comp’;251;;66;104;taux;72%
;;;228;;182;;67;124;;
;;comp’;71;comp’;252;;82;153;fin;
;;comp’;237;comp’;202;;84;176;&lt;201;8
;;comp’;180;;82;;102;182;total;17
;;;82;;310;;112;213;taux;47%
;;;102;;412;;138;230;;
;;;52;comp’;334;;171;310;total;
;;;66;;230;;186;369;&lt;201;21
;10;;67;;104;;189;412;total;35
;;;236;;124;;223;423;taux;60%
;43;comp’;273;comp’;223;;228;437;;
;;comp’;73;comp’;214;;236;452;;
;32 38 37 36;;138;;423;;669;564;;
;;;171;;437;;1194;;comp’;cumuls
;;;223;;153;;16;34;deb;
;;;112;comp’;95;;71;78;&lt;201;11
;;comp’;81;comp’;78;;73;95;total;16
;;comp’;247;comp’;247;;81;103;taux;69%
;;comp’;173;comp’;193;;86;193;;
;;comp’;140;;79;;140;202;fin;
;;comp’;217;comp’;103;;152;214;&lt;201;5
;;comp’;432;;213;;173;223;total;16
;;comp’;196;comp’;256;;180;246;taux;31%
;;comp’;86;comp’;34;;185;247;;
;;;186;comp’;351;;196;251;total;
;;;189;;564;;217;252;&lt;201;16
;;comp’;185;comp’;316;;237;256;total;32
;;;32;;26;;247;316;taux;50%
;;;64;comp’;246;;273;334;;
;40 25 16 40 13;;84;;;;432;351;;
;;;;;;;;;;
;deb;fin;total;;;;;;;
&lt;201;24;13;37;;;;;;;
total;34;33;67;;;;;;;
taux;71%;39%;55%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====scc par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_par_rapport_au_groupe_de_référence|scc par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;scc;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;11;6;;;;;17;
16;moyen;9;5;;;;3;17;
14;fort;10;3;;;;;13;
; ;30;14;0;0;0;3;47;
10;g+cga;5;6;;;;;11;
2;agg+cgg;2;;;;;;2;
4;carre ccc;4;;;;;;4;
5;autres;;;;;;;0;
;;11;6;0;0;0;0;17;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;alpha  ‰;ref. ‰
21;faible;234;128;;;;;362;26
16;moyen;191;106;;;;64;362;324
14;fort;213;64;;;;;277;650
;;638;298;;;;64;47;729
10;g+cga;106;128;;;;;234;10
2;agg+cgg;43;;;;;;43;
4;carre ccc;85;;;;;;85;16
5;autres;;;;;;;;
;;234;128;;;;;362;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;alpha8;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;250;136;;386;26;37;43;
16;moyen;205;114;;318;324;30;36;
14;fort;227;68;;295;650;33;21;
;;682;318;;44;729;30;14;
10;g+cga;114;136;;250;10;45;100;
2;agg+cgg;45;;;45;;18;;
4;carre ccc;91;;;91;16;36;;
5;autres;;;;;;;;
;;250;136;;386;;11;6;
&lt;/pre&gt;
===spirochetes, estimation des -rRNAs===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#spirochetes,_estimation_des_-rRNAs|spirochetes, estimation des -rRNAs]] 
&lt;pre&gt;
spirochetes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
13 génomes total avec rRNA;;;;spiro;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;spiro;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;13;21; ; ;;indices;;;;13;162;0;0;;spiro1;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;44
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;9;acc;;aac;;agc;;;atc;69;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;;gca;12;gaa;;gga;;;gta;;gca;92;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
;;;;;;;;;;;162;;0;;0;162;;;;14;;14;;16;44
11.1.21 Paris;;;;spiro;total;ttt;tgt;;11.1.21 Paris;;;;spiro;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;73;2823;0;0;;indices;;;;73;2823;0;0;;spiro1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;4400
atgi;96;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;96;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;100;tct;;tat;;atgf;100
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;90;;ctt;;cct;;cat;;cgc;90;;ctt;;cct;;cat;;cgc;100
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;125;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;125;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100
atc;31;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;;acc;100;aac;100;agc;100
ctc;103;ccc;55;cac;100;cgt;12;;ctc;103;ccc;55;cac;100;cgt;12;;ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;
gtc;55;gcc;59;gac;107;ggc;103;;gtc;55;gcc;59;gac;107;ggc;103;;gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100
tta;100;tca;100;taa;;tga;16;;tta;100;tca;100;taa;;tga;16;;tta;100;tca;100;taa;;tga;
ata;1.0;aca;100;aaa;100;aga;101;;ata;1.0;aca;100;aaa;100;aga;101;;ata;;aca;100;aaa;100;aga;100
cta;100;cca;100;caa;100;cga;92;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;92;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;100
gta;101;gca;22;gaa;82;gga;100;;gta;101;gca;114;gaa;82;gga;100;;gta;100;gca;;gaa;100;gga;100
ttg;100;tcg;41;tag;0;tgg;100;;ttg;100;tcg;41;tag;;tgg;100;;ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100
atgj;97;acg;58;aag;78;agg;66;;atgj;97;acg;58;aag;78;agg;66;;atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100
ctg;52;ccg;42;cag;42;cgg;47;;ctg;52;ccg;42;cag;42;cgg;47;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100
gtg;34;gcg;41;gag;40;ggg;21;;gtg;34;gcg;41;gag;40;ggg;21;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100
;;1398;;1326;;891;3615;;;;1560;;1326;;891;3777;;;;1400;;1400;;1600;4400
rapports;;90;;100;;100;96;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;spiro1;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;100;;fiches;37.31;;;fréquences;;;;;atgi;4;tct;;tat;;atgf;4
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;485;;;0/0;;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;100;;avec;22;;;10;27;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;10
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;genom;13;;;20;2;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;;;;;30;1;;;;ttc;20;tcc;0;tac;0;tgc;0
atc;31;acc;100;aac;100;agc;100;;spiro1;44;;;40;1;;;;atc;100;acc;0;aac;0;agc;0
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgt;;;sans;44;;;50;5;36;;;ctc;3;ccc;45;cac;0;cgt;100
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;3;;;60;6;;;;gtc;45;gcc;41;gac;7;ggc;3
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;1;;;70;1;;;;tta;0;tca;0;taa;;tga;100
ata;;aca;100;aaa;100;aga;100;;;;;;80;1;;;;ata;100;aca;0;aaa;0;aga;1
cta;100;cca;100;caa;100;cga;100;;L’estimation par spiro;;;;90;0;;;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;8
gta;100;gca;19;gaa;100;gga;100;;est  18% au dessus;;;;100;5;;;;gta;1;gca;100;gaa;18;gga;0
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;0;;;;ttg;0;tcg;59;tag;;tgg;0
atgj;100;acg;100;aag;100;agg;100;;;;;;;49;;;;atgj;3;acg;42;aag;22;agg;34
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100;;;;;;;;;;;ctg;48;ccg;58;cag;58;cgg;53
gtg;;gcg;;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;66;gcg;59;gag;60;ggg;79
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;56;;62;;732;850
&lt;/pre&gt;

==archeo==
===mfi===
====mfi opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_opérons|mfi opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/archaea/Meth_form/methForm-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_LN515531.1;mfi;;genome;;;;;;;;
41.2%GC;17.8.19 Paris;16s  2 ;47;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Methanobacterium formicicum DSM1535;;;;;;;;;;;
;157153..157563;;CDS;;36;36;;;137;;
comp;157600..157683;;ctc;;246;246;;;;;
;157930..158232;;CDS;;;;;;101;;
;;;;;;;;;;;
comp;211693..213681;;CDS;;206;206;;;*663;;
;213888..213971;;tcg;;281;281;;;;;
;214253..215677;;CDS;;;;;;475;;
;;;;;;;;;;;
comp;314088..314264;;CDS;;50;50;;;59;;
comp;314315..314487;;caa;@1;-1;*-1;;;;;
comp;314487..314654;;CDS;;;;;;56;;
;;;;;;;;;;;
comp;317759..318211;;CDS;;198;198;;;151;;
comp;318410..318494;;tcc;;177;177;;;;;
comp;318672..319634;;CDS;;;;;;321;;
;;;;;;;;;;;
comp;419250..419975;;CDS;;156;156;;;242;;
comp;420132..420204;;aac;;29;29;;;;;
comp;420234..420545;;CDS;;;;;;104;;
;;;;;;;;;;;
comp;466570..467484;;CDS;;223;223;;;305;;
comp;467708..467792;;agc;;186;186;;;;;
comp;467979..468294;;ncRNA;@2;122;122;;;316;;
;468417..469397;;CDS;;;;;;327;;
;;;;;;;;;;;
;681116..681676;;CDS;;37;37;;;187;;
comp;681714..681786;;gcg;;195;195;;;;;
comp;681982..682488;;CDS;;;;;;169;;
;;;;;;;;;;;
;695936..696538;;CDS;;939;*939;;;201;;
comp;697478..697600;;5s;;305;;;;123;;
comp;697906..700772;;23s;;233;;;;2867;;
comp;701006..701079;;gca;;87;;;;;;
comp;701167..702646;;16s;;724;*724;;;1480;;
;703371..704336;;CDS;;;;;;322;;
;;;;;;;;;;;
comp;746487..747290;;CDS;;155;155;;;268;;
comp;747446..747518;;acc;;85;;*85;;;;
comp;747604..747686;;tta;;303;303;;;;;
;747990..748163;;CDS;;;;;;58;;
;;;;;;;;;;;
comp;800615..801820;;CDS;;43;43;;;402;;
comp;801864..801935;;caa;;72;72;;;;;
comp;802008..802697;;CDS;;;;;;230;;
;;;;;;;;;;;
comp;963425..964432;;CDS;;273;273;;;336;;
;964706..964778;;aac;;5;;5;;;;
;964784..964857;;atgi;;58;;58;;;;
;964916..964990;;gaa;;53;;53;;;;
;965044..965127;;cta;;29;;29;;;;
;965157..965232;;cac;;146;146;;;;;
;965379..965717;;CDS;;;;;;113;;
;;;;;;;;;;;
comp;974621..974842;;CDS;;564;*564;;;74;;
;975407..975480;;aag;;90;;*90;;;;
;975571..975653;;ttg;;504;;*504;;;;
;976158..976231;;aaa;;148;148;;;;;
comp;976380..976679;;CDS;;;;;;100;;
;;;;;;;;;;;
comp;1006329..1008095;;CDS;;397;397;;;*589;;
;1008493..1008614;;5s;@3;748;;;;122;;
;1009363..1009485;;5s;;286;;;;123;;
;1009772..1012638;;23s;;233;;;;2867;;
;1012872..1012945;;gca;;72;;;;;;
;1013018..1014497;;16s;;454;*454;;;1480;;
;1014952..1016097;;CDS;;;;;;382;;
;;;;;;;;;;;
comp;1088211..1088831;;CDS;;53;53;;;207;;
comp;1088885..1089038;;tgg;@1;40;;40;;;;
comp;1089079..1089150;;tgc;;212;212;;;;;
comp;1089363..1089746;;CDS;;;;;;128;;
;;;;;;;;;;;
;1143658..1144137;;CDS;;166;166;;;160;;
comp;1144304..1144610;;ncRNA;@2;14;14;;;307;;
comp;1144625..1144699;;atgf;;139;139;;;;;
comp;1144839..1145162;;CDS;;;;;;108;;
;;;;;;;;;;;
;1153368..1154087;;CDS;;56;56;;;240;;
;1154144..1154217;;aga;;62;;62;;;;
;1154280..1154354;;agg;;552;*552;;;;;
comp;1154907..1156157;;CDS;;;;;;417;;
;;;;;;;;;;;
;1247204..1247659;;CDS;;4;4;;;152;;
comp;1247664..1247739;;cga;;133;133;;;;;
comp;1247873..1248481;;CDS;;;;;;203;;
;;;;;;;;;;;
comp;1320721..1321641;;CDS;;183;183;;;307;;
;1321825..1321896;;gta;;99;;*99;;;;
;1321996..1322067;;gtg;;228;228;;;;;
comp;1322296..1323084;;CDS;;;;;;263;;
;;;;;;;;;;;
comp;1403886..1409507;;CDS;;351;351;;;*1874;;
comp;1409859..1409930;;cgc;;222;222;;;;;
comp;1410153..1410620;;CDS;;;;;;156;;
;;;;;;;;;;;
;1532795..1533088;;CDS;;127;127;;;98;;
comp;1533216..1533325;;atgj;@1;246;246;;;;;
;1533572..1534402;;CDS;;;;;;277;;
;;;;;;;;;;;
;1541929..1542321;;CDS;;127;127;;;131;;
;1542449..1542522;;ggg;;1;*1;;;;;
comp;1542524..1543528;;CDS;;;;;;335;;
;;;;;;;;;;;
;1602054..1603277;;CDS;;257;257;;;408;;
;1603535..1603608;;aca;;76;;76;;;;
;1603685..1603759;;cca;;44;;44;;;;
;1603804..1603877;;tac;;170;;*170;;;;
;1604048..1604119;;gac;;7;;7;;;;
;1604127..1604200;;aaa;;24;24;;;;;
;1604225..1604461;;CDS;;;;;;79;;
;;;;;;;;;;;
;1617553..1617861;;CDS;;187;187;;;103;;
;1618049..1618133;;tca;;252;252;;;;;
;1618386..1619444;;CDS;;;;;;353;;
;;;;;;;;;;;
comp;1692202..1692552;;CDS;;271;271;;;117;;
comp;1692824..1692895;;cag;;156;156;;;;;
comp;1693052..1693972;;CDS;;;;;;307;;
;;;;;;;;;;;
;1887796..1888038;;CDS;;136;136;;;81;;
;1888175..1888257;;ctg;;193;193;;;;;
;1888451..1891267;;CDS;;;;;;*939;;
;;;;;;;;;;;
;2057488..2057883;;CDS;;230;230;;;132;;
;2058114..2058184;;tgc;;143;143;;;;;
;2058328..2059713;;CDS;;;;;;462;;
;;;;;;;;;;;
;2128536..2129312;;CDS;;123;123;;;259;;
;2129436..2129509;;acg;;362;362;;;;;
comp;2129872..2130963;;CDS;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
comp;2204492..2204932;;CDS;;178;178;;;147;;
;2205111..2205182;;gtc;;4;;4;;;;
;2205187..2205259;;ttc;;283;283;;;;;
comp;2205543..2205875;;CDS;;;;;;111;;
;;;;;;;;;;;
;2317208..2317498;;CDS;;271;271;;;97;;
;2317770..2317842;;atc;;460;*460;;;;;
;2318303..2318863;;CDS;;;;;;187;;
;;;;;;;;;;;
comp;2414821..2415903;;CDS;;491;*491;;;361;;
;2416395..2416468;;gcc;;303;303;;;;;
comp;2416772..2417797;;CDS;;;;;;342;;
;;;;;;;;;;;
comp;2432399..2432848;;CDS;;537;*537;;;150;;
;2433386..2433459;;ggc;;2;;2;;;;
;2433462..2433535;;gga;;326;326;;;;;
comp;2433862..2434263;;CDS;;;;;;134;;
&lt;/pre&gt;

====mfi cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_cumuls|mfi cumuls]]
&lt;pre&gt;
mfi cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;2;1;0;-;1;2;1;;100;9;30;0
;16 23 5s 0;0;20;4;;50;8;20;;200;21;60;3
;16 gca 235;2;40;2;;100;3;40;;300;10;90;3
;16 23 5s a;0;60;3;;150;10;60;;400;12;120;10
;max a;1;80;2;;200;12;80;;500;5;150;7
;a doubles;0;100;3;;250;8;100;;600;1;180;5
;autres;2;120;0;;300;7;120;;700;1;210;5
;total aas;2;140;0;;350;3;140;;800;0;240;2
sans ;opérons;29;160;0;;400;3;160;;900;0;270;4
;1 aa;20;180;1;;450;0;180;;1000;1;300;1
;max a;5;200;0;;500;3;200;;1100;0;330;6
;a doubles;0;;1;;;5;;;;1;;15
;total aas;45;;16;0;;64;;0;;61;;61
total aas;;47;;;;;;;;;;;
remarques;;3;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;83;;;224;;;;266;;
;;;variance;121;;;176;;;;265;;
sans jaune;;;moyenne;35;;;178;;;;213;;171
;;;variance;27;;;96;;;;115;;81
&lt;/pre&gt;

====mfi blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_blocs|mfi blocs]]
&lt;pre&gt;
mfi blocs;;
CDS;939;201
5s;305;123
23s;233;2867
gca;87;
16s;724;1480
CDS;;322
;;
CDS;397;589
5s;748;122
5s;286;123
23s;233;2867
gca;72;
16s;454;1480
CDS;;382
&lt;/pre&gt;

====mfi remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_remarques|mfi remarques]]
&lt;pre&gt;
mfi;;;;;;;47
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;2
atc;1;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;1;ccc;;cac;1;cgc;1
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;2;aga;1
cta;1;cca;1;caa;2;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;1;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1
&lt;/pre&gt;
====mfi distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_distribution|mfi distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;;;;;;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;;;;;;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;;;;;;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;;;;;;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;;;;;;
atc;1;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;;;;;;
ctc;1;ccc;;cac;;cgc;1;;ctc;;ccc;;cac;1;cgc;;;ctc;;;;;;;
gtc;;gcc;1;gac;;ggc;;;gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;;;;;;
tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;;;;;;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;2;aga;1;;ata;;;;;;;
cta;;cca;;caa;2;cga;1;;cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;;;;;;
gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;;;;;;
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;;;;;;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;1;agg;1;;atgj;;;;;;;
ctg;1;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;;;;;;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;;;;;;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
mfi;;20;;;;;;;mfi;25;;;;;2;47;;mfi;0;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====mfi données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_données_intercalaires|mfi données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;mfi;fx;fc;mfi;fx40;fc40;mfi;x-;c-;c;x;c;x;aa
;1;0;0;29;0;0;29;-1;;22;281;36;16s tRNA;;
2;0;10;12;146;1;0;20;-2;;0;50;246;87;;gca
;0;20;6;108;2;1;25;-3;;0;-1;206;72;;gca
;2;30;18;58;3;0;14;-4;1;70;198;37;tRNA 23s;;
2;0;40;14;56;4;1;20;-5;;0;177;303;2* 233;;gca
;2;50;11;53;5;1;14;-6;1;0;156;273;tRNA tRNA;;
;2;60;15;58;6;2;7;-7;;0;29;564;85;;acc
;0;70;17;61;7;0;8;-8;1;27;223;148;**;;tta
;1;80;14;57;8;1;10;-9;;0;195;552;5;;aac
;0;90;21;61;9;4;14;-10;;3;155;4;58;;atgi
;0;100;16;67;10;2;14;-11;;11;43;183;53;;gaa
;0;110;10;46;11;0;17;-12;;0;72;228;29;;cta
;0;120;23;51;12;1;12;-13;;4;146;127;**;;cac
1;2;130;22;52;13;0;18;-14;;3;53;246;90;;aag
;3;140;21;40;14;0;16;-15;;0;212;1;504;;ttg
1;2;150;23;47;15;0;3;-16;;1;139;362;**;;aaa
;3;160;21;39;16;0;10;-17;;3;56;178;40;;tgg
;0;170;15;28;17;1;8;-18;;0;133;283;**;;tgc
1;1;180;17;27;18;2;12;-19;;1;351;491;62;;aga
1;1;190;20;34;19;2;5;-20;;1;222;303;**;;agg
;3;200;16;27;20;0;7;-21;;0;127;537;99;;gta
1;0;210;13;28;21;2;6;-22;;0;257;326;**;;gtg
;1;220;17;21;22;3;4;-23;;2;24;;76;;aca
1;3;230;11;30;23;2;8;-24;;0;187;;44;;cca
;0;240;14;24;24;0;12;-25;;0;252;;170;;tac
2;0;250;9;22;25;1;6;-26;;0;271;;7;;gac
;2;260;7;17;26;2;0;-27;;0;156;;**;;aaa
;0;270;17;18;27;2;9;-28;;0;136;;4;;gtc
1;2;280;10;16;28;2;5;-29;;1;193;;**;;ttc
1;1;290;5;12;29;3;4;-30;;0;230;;2;;ggc
;0;300;5;14;30;1;4;-31;;0;143;;**;;gga
2;0;310;13;14;31;1;6;-32;;2;123;;;;
;0;320;12;14;32;5;5;-33;;0;271;;;;
1;0;330;11;17;33;2;10;-34;;1;460;;;;
;0;340;8;6;34;1;5;-35;;2;CDS 16s;;;;
;0;350;7;8;35;2;5;-36;;0;454;724;;;
;1;360;7;10;36;0;3;-37;;0;23s 5s;;;;
1;0;370;9;7;37;0;5;-38;;1;305;;;;
;0;380;6;11;38;0;7;-39;;0;286;;;;
;0;390;9;8;39;0;8;-40;;0;5s 5s;;;;
;0;400;5;10;40;3;2;-41;;0;748;;;;
4;1;reste;99;93;reste;576;1148;-42;;0;5s CDS;;;;
22;34;total;626;1545;total;626;1545;-43;;1;;939;;;
18;32;diagr;527;1423;diagr;50;368;-44;;2;;397;;;
2;2; t30;36;312;;;;-45;;0;;;;;
;;;;;;;;-46;;2;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;;;;;
;x;626;5;0;631;;;-49;;0;;;;;
;c;1516;167;29;1712;;;-50;;0;;;;;
;;;;;2343;87;;reste;2;7;;;;;
;;;;;;2430;;total;5;167;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====mfi autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfi_autres_intercalaires_aas|mfi autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;mfi;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;;CDS;157153;157563;36;*;
;comp;tRNA;157600;157683;246;*;ctc
fin;;CDS;157930;158232;;0;
deb;comp;CDS;211693;213681;206;*;
;;tRNA;213888;213971;281;*;tcg
fin;;CDS;214253;215677;;0;
deb;comp;CDS;314088;314264;50;*;
;comp;tRNA;314315;314487;-1;*;caa
fin;comp;CDS;314487;314654;;;
deb;comp;CDS;317759;318211;198;*;
;comp;tRNA;318410;318494;177;*;tcc
fin;comp;CDS;318672;319634;;;
deb;comp;CDS;419250;419975;156;*;
;comp;tRNA;420132;420204;29;*;aac
fin;comp;CDS;420234;420545;;;
deb;comp;CDS;466570;467484;223;*;
;comp;tRNA;467708;467792;186;*;agc
;comp;ncRNA;467979;468294;122;*;
fin;;CDS;468417;469397;;;
deb;;CDS;681116;681676;37;*;
;comp;tRNA;681714;681786;195;*;gcg
fin;comp;CDS;681982;682488;;0;
deb;;CDS;695936;696538;939;*;
;comp;rRNA;697478;697600;305;*;123
;comp;rRNA;697906;700772;233;*;2867
;comp;tRNA;701006;701079;87;*;gca
;comp;rRNA;701167;702646;724;*;1480
fin;;CDS;703371;704336;;0;
deb;comp;CDS;746487;747290;155;*;
;comp;tRNA;747446;747518;85;*;acc
;comp;tRNA;747604;747686;303;*;tta
fin;;CDS;747990;748163;;;
deb;comp;CDS;800615;801820;43;*;
;comp;tRNA;801864;801935;72;*;caa
fin;comp;CDS;802008;802697;;;
deb;comp;CDS;963425;964432;273;*;
;;tRNA;964706;964778;5;*;aac
;;tRNA;964784;964857;58;*;atgi
;;tRNA;964916;964990;53;*;gaa
;;tRNA;965044;965127;29;*;cta
;;tRNA;965157;965232;146;*;cac
fin;;CDS;965379;965717;;;
deb;comp;CDS;974621;974842;564;*;
;;tRNA;975407;975480;90;*;aag
;;tRNA;975571;975653;504;*;ttg
;;tRNA;976158;976231;148;*;aaa
fin;comp;CDS;976380;976679;;0;
deb;;CDS;1006329;1008095;397;*;
;comp;rRNA;1008493;1008614;748;*;122
;comp;rRNA;1009363;1009485;286;*;123
;comp;rRNA;1009772;1012638;233;*;2867
;comp;tRNA;1012872;1012945;72;*;gca
;comp;rRNA;1013018;1014497;454;*;1480
fin;comp;CDS;1014952;1016097;;;
deb;comp;CDS;1088211;1088831;53;*;
;comp;tRNA;1088885;1089038;40;*;tgg
;comp;tRNA;1089079;1089150;212;*;tgc
fin;comp;CDS;1089363;1089746;;0;
deb;;CDS;1143658;1144137;166;*;
;comp;ncRNA;1144304;1144610;14;*;
;comp;tRNA;1144625;1144699;139;*;atgf
fin;comp;CDS;1144839;1145162;;;
deb;;CDS;1153368;1154087;56;*;
;;tRNA;1154144;1154217;62;*;aga
;;tRNA;1154280;1154354;552;*;agg
fin;comp;CDS;1154907;1156157;;;
deb;;CDS;1247204;1247659;4;*;
;comp;tRNA;1247664;1247739;133;*;cga
fin;comp;CDS;1247873;1248481;;;
deb;comp;CDS;1320721;1321641;183;*;
;;tRNA;1321825;1321896;99;*;gta
;;tRNA;1321996;1322067;228;*;gtg
fin;comp;CDS;1322296;1323084;;0;
deb;comp;CDS;1403886;1409507;351;*;
;comp;tRNA;1409859;1409930;222;*;cgc
fin;comp;CDS;1410153;1410620;;;
deb;;CDS;1532795;1533088;127;*;
;comp;tRNA;1533216;1533325;246;*;atgj
fin;;CDS;1533572;1534402;;0;
deb;;CDS;1541929;1542321;127;*;
;;tRNA;1542449;1542522;1;*;ggg
fin;comp;CDS;1542524;1543528;;;
deb;;CDS;1602054;1603277;257;*;
;;tRNA;1603535;1603608;76;*;aca
;;tRNA;1603685;1603759;44;*;cca
;;tRNA;1603804;1603877;170;*;tac
;;tRNA;1604048;1604119;7;*;gac
;;tRNA;1604127;1604200;24;*;aaa
fin;;CDS;1604225;1604461;;;
deb;;CDS;1617553;1617861;187;*;
;;tRNA;1618049;1618133;252;*;tca
fin;;CDS;1618386;1619444;;0;
deb;comp;CDS;1692202;1692552;271;*;
;comp;tRNA;1692824;1692895;156;*;cag
fin;comp;CDS;1693052;1693972;;;
deb;;CDS;1887796;1888038;136;*;
;;tRNA;1888175;1888257;193;*;ctg
fin;;CDS;1888451;1891267;;;
deb;;CDS;2057488;2057883;230;*;
;;tRNA;2058114;2058184;143;*;tgc
fin;;CDS;2058328;2059713;;;
deb;;CDS;2128536;2129312;123;*;
;;tRNA;2129436;2129509;362;*;acg
fin;comp;CDS;2129872;2130963;;;
deb;comp;CDS;2204492;2204932;178;*;
;;tRNA;2205111;2205182;4;*;gtc
;;tRNA;2205187;2205259;283;*;ttc
fin;comp;CDS;2205543;2205875;;;
deb;;CDS;2317208;2317498;271;*;
;;tRNA;2317770;2317842;460;*;atc
fin;;CDS;2318303;2318863;;0;
deb;comp;CDS;2414821;2415903;491;*;
;;tRNA;2416395;2416468;303;*;gcc
fin;comp;CDS;2416772;2417797;;;
deb;comp;CDS;2432399;2432848;537;*;
;;tRNA;2433386;2433459;2;*;ggc
;;tRNA;2433462;2433535;326;*;gga
fin;comp;CDS;2433862;2434263;;0;
&lt;/pre&gt;

===mja===
====mja opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_opérons|mja opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/archaea/Meth_jann_DSM_2661/methJann1-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000909.1;mja;;genome;;;;;;;;
31.3%GC;17.8.19 Paris;16s  2 ;37;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines
Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661;;;;;;;;;;;
comp;96499..97053;;CDS;;372;372;;;185;;
comp;97426..97537;;atgj;@1;91;;*91;;;;
;97629..97716;;ctc;;241;241;;;;;
;97958..99259;;CDS;;;;;;434;;
;;;;;;;;;;;
comp;110328..111545;;CDS;;222;222;;;406;;
;111768..111852;;tga ;;21;21;;;;;
;111874..112785;;CDS;;;;;;304;;
;;;;;;;;;;;
;137244..138245;;CDS;;98;98;;;334;;
comp;138344..138419;;gtg;;59;59;;;;;
comp;138479..138781;;CDS;;;;;;101;;
;;;;;;;;;;;
;153070..154479;;CDS;;182;182;;;470;;
comp;154662..157639;;23s;;207;;;;2978;;
comp;157847..157919;;gca;;64;;;;;;
comp;157984..159463;;16s;;340;340;;;1480;;
;159804..160085;;CDS;;;;;;94;;
;;;;;;;;;;;
comp;185874..186671;;CDS;;306;306;;;266;;
;186978..187066;;tcc;;71;71;;;;;
;187138..187590;;CDS;;;;;;151;;
;;;;;;;;;;;
;190579..190800;;CDS;;31;31;;;74;;
;190832..190908;;ccc;;32;32;;;;;
;190941..191114;;CDS;;;;;;58;;
;;;;;;;;;;;
comp;214560..215060;;CDS;;149;149;;;167;;
;215210..215297;;tta;;154;154;;;;;
;215452..216240;;CDS;;;;;;263;;
;;;;;;;;;;;
;226386..227639;;CDS;;64;64;;;418;;
comp;227704..227780;;gcc;;239;239;;;;;
;228020..229720;;CDS;;;;;;*567;;
;;;;;;;;;;;
;303613..303927;;CDS;;64;64;;;105;;
;303992..304081;;tca;;230;230;;;;;
comp;304312..304752;;CDS;;;;;;147;;
;;;;;;;;;;;
comp;357984..358547;;CDS;;220;220;;;188;;
;358768..358845;;aga;;23;;23;;;;
;358869..358943;;gaa;;164;164;;;;;
;359108..359923;;CDS;;;;;;272;;
;;;;;;;;;;;
;359108..359923;;CDS;;48;48;;;272;;
comp;359972..360047;;atgf;;103;103;;;;;
comp;360151..361485;;CDS;;;;;;445;;
;;;;;;;;;;;
;401945..402796;;CDS;;171;171;;;284;;
comp;402968..403044;;gtc;;229;229;;;;;
;403274..403834;;CDS;;;;;;187;;
;;;;;;;;;;;
comp;618311..618757;;CDS;;402;*402;;;149;;
comp;619160..619234;;tgc;;63;63;;;;;
comp;619298..619915;;CDS;;;;;;206;;
;;;;;;;;;;;
;636394..637449;;CDS;;133;133;;;352;;
;637583..637659;;ttc;;7;;;7;;;
;637667..637742;;aac;;29;;;29;;;
;637772..637849;;atgi;;18;;;18;;;
;637868..637942;;gaa;;39;;;39;;;
;637982..638069;;cta;;11;;;11;;;
;638081..638152;;cac;;295;;;;;;
;638448..639930;;16s;;64;;;;1483;;
;639995..640067;;gca;;207;;;;;;
;640275..643254;;23s;;78;;;;2980;;
;643333..643447;;5s;;56;;;;115;;
;643504..643761;;ncRNA;@2;232;232;;;258;;
;643994..644962;;CDS;;;;;;323;;
;;;;;;;;;;;
;762859..763608;;CDS;;157;157;;;250;;
comp;763766..763842;;acc;;178;;*178;;;;
;764021..764096;;caa;;50;50;;;;;
;764147..764818;;CDS;;;;;;224;;
;;;;;;;;;;;
;862207..862410;;CDS;;179;179;;;68;;
;862590..862661;;cga;;41;41;;;;;
;862703..863392;;CDS;;86;86;;;230;;
;863479..863555;;aca;;14;;;14;;;
;863570..863647;;cca;;8;;;8;;;
;863656..863732;;tac;;83;;;83;;;
;863816..863889;;aaa;;13;;;;;;
;863903..864017;;5s;@3;46;;;;115;;
;864064..864141;;gac;;80;80;;;;;
;864222..864842;;CDS;;;;;;207;;
;;;;;;;;;;;
;871492..873447;;CDS;;238;238;;;*652;;
comp;873686..873763;;atc;;102;102;;;;;
comp;873866..875110;;CDS;;;;;;415;;
;;;;;;;;;;;
comp;882566..883615;;CDS;;65;65;;;350;;
;883681..883754;;gta;;123;123;;;;;
comp;883878..884297;;CDS;;;;;;140;;
;;;;;;;;;;;
comp;1037197..1038504;;CDS;;39;39;;;436;;
comp;1038544..1038620;;cgc;@4;1;*1;;;;;
comp;1038622..1039386;;CDS;;;;;;255;;
;;;;;;;;;;;
comp;1148669..1149934;;CDS;;210;210;;;422;;
;1150145..1150220;;ggc;;34;;34;;;;
;1150255..1150330;;gga;;243;243;;;;;
;1150574..1151254;;CDS;;;;;;227;;
;;;;;;;;;;;
comp;1188906..1189772;;CDS;;172;172;;;289;;
;1189945..1190055;;tgg;@1;95;95;;;;;
;1190151..1190684;;CDS;;;;;;178;;
;;;;;;;;;;;
comp;1312335..1312781;;CDS;;383;383;;;149;;
;1313165..1313249;;agc;;177;177;;;;;
;1313427..1314617;;CDS;;;;;;397;;
&lt;/pre&gt;

====mja cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_cumuls|mja cumuls]]
&lt;pre&gt;
mja cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;2;1;0;0;1;1;1;;100;4;30;0
;16 23 5s 0;0;20;0;5;50;7;20;;200;12;60;1
;16 atc gca;0;40;2;2;100;10;40;;300;13;90;2
;16 23 5s a;0;60;0;0;150;5;60;;400;6;120;3
;max a;7;80;0;0;200;8;80;;500;8;150;4
;a doubles;0;100;1;1;250;10;100;;600;1;180;3
;autres;2;120;0;0;300;0;120;;700;1;210;5
;total aas;13;140;0;0;350;2;140;;800;0;240;3
sans ;opérons;20;160;0;0;400;2;160;;900;0;270;4
;1 aa;16;180;1;0;450;1;180;;1000;0;300;4
;max a;2;200;0;0;500;0;200;;1100;0;330;2
;a doubles;0;;0;0;;0;;;;0;;14
;total aas;24;;4;8;;46;;0;;45;;45
total aas;;37;;;;;;;;;;;
remarques;;4;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;82;26;;154;;;;269;;
;;;variance;71;25;;102;;;;137;;
sans jaune;;;moyenne;29;18;;152;;;;253;;194
;;;variance;8;12;;95;;;;117;;74
&lt;/pre&gt;

====mja blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_blocs|mja blocs]]
&lt;pre&gt;
mja blocs;;
CDS;182;
23s;207;2978
gca;64;
16s;340;1480
CDS;;
;;
cac;295;
16s;64;1483
gca;207;
23s;78;2980
5s;56;115
ncRNA;232;258
CDS;;
;;
aaa;13;
5s;46;115
gac;80;
CDS;;
&lt;/pre&gt;

====mja remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_remarques|mja remarques]]
&lt;pre&gt;
mja;;;;;;;37
atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1
atc;1;acc;1;aac;1;agc;1
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;1
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1
tta;1;tca;1;taa;;tga;1
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;2;gaa;2;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;
&lt;/pre&gt;
====mja distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_distribution|mja distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;;;;;;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;;;;;;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;;;;;;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;;;;;;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;;;;;;
atc;1;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;;;;;;
ctc;;ccc;1;cac;;cgc;1;;ctc;1;ccc;;cac;;cgc;;;ctc;;;;;;;
gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;;;;;;
tta;1;tca;1;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;;;;;;
ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;;;;;;
cta;;cca;;caa;;cga;1;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;;;;;;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;;;;;;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;;;;;;
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;;;;;;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;;;;;;
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;;;;;;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
mja;;16;;;;;;;mja;8;;;;;;;;mja;0;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====mja données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_données_intercalaires|mja données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;mja;fx;fc;mja;fx40;fc40;mja;x-;c-;c;x;c;x;aa
;0;0;10;11;0;10;11;-1;0;25;372;250;tRNA 16s;;
;1;10;49;179;1;12;18;-2;0;0;241;98;295;;cac
;1;20;31;154;2;12;28;-3;0;0;19;306;16s tRNA;;
;0;30;17;91;3;3;6;-4;26;51;59;149;2* 64;;gca
;3;40;16;50;4;6;32;-5;0;2;71;64;tRNA 23s;;
1;2;50;11;50;5;0;11;-6;4;0;31;239;2* 207;;gca
;1;60;10;45;6;5;4;-7;2;1;32;230;5s tRNA;;
2;2;70;14;44;7;2;5;-8;2;12;154;220;80;;gac
;2;80;14;34;8;5;15;-9;3;0;64;48;tRNA 5s;;
;1;90;28;43;9;3;32;-10;0;1;164;171;13;;aaa
1;1;100;19;36;10;1;28;-11;2;10;103;229;tRNA tRNA;;contig
;2;110;10;28;11;7;16;-12;3;0;402;157;7;;ttc
;0;120;16;30;12;4;22;-13;0;4;63;238;29;;aac
1;0;130;14;28;13;3;17;-14;1;9;133;65;18;;atgi
;1;140;19;32;14;5;13;-15;3;0;50;123;39;;gaa
1;0;150;7;27;15;2;13;-16;0;2;179;210;11;;cta
1;1;160;13;18;16;1;14;-17;0;5;41;172;**;;cac
;1;170;9;12;17;2;10;-18;2;0;86;383;14;;aca
2;2;180;14;14;18;2;17;-19;0;2;80;;8;;cca
;0;190;13;11;19;3;18;-20;0;6;102;;83;;tac
;0;200;10;15;20;2;14;-21;1;0;39;;**;;aaa
1;0;210;5;10;21;4;16;-22;0;0;1;;tRNA tRNA;;
1;0;220;11;11;22;4;11;-23;1;6;243;;91;;atgj
2;0;230;7;10;23;1;9;-24;1;0;95;;**;;ctc
2;0;240;3;9;24;3;11;-25;1;3;177;;23;;aga
1;2;250;3;9;25;2;12;-26;0;1;5s 16s;;**;;gaa
;0;260;0;7;26;1;9;-27;0;0;-;340;178;;acc
;0;270;6;7;27;2;6;-28;0;1;CDS 23s;;**;;caa
;0;280;2;7;28;0;3;-29;1;3;-;182;34;;ggc
;0;290;4;10;29;0;6;-30;0;0;23s 5s;;**;;gga
;0;300;3;1;30;0;8;-31;0;0;78;;;;
1;0;310;2;3;31;3;4;-32;0;3;;;;;
;0;320;6;6;32;2;4;-33;0;0;;;;;
;0;330;1;2;33;1;11;-34;0;2;;;;;
;0;340;3;3;34;2;11;-35;0;1;;;;;
;0;350;2;1;35;0;1;-36;0;0;;;;;
;0;360;3;3;36;1;4;-37;0;0;;;;;
;0;370;3;3;37;1;3;-38;0;3;;;;;
;1;380;3;2;38;1;5;-39;1;0;;;;;
1;0;390;3;0;39;4;7;-40;0;0;;;;;
;0;400;3;1;40;1;0;-41;0;2;;;;;
;1;reste;24;12;reste;318;584;-42;0;0;;;;;
18;25;total;441;1069;total;441;1069;-43;0;0;;;;;
18;24;diagr;407;1046;diagr;113;474;-44;0;1;;;;;
0;2; t30;97;424;;;;-45;0;0;;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;0;;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;1;0;;;;;
;x;431;56;10;497;;;-49;0;1;;;;;
;c;1058;163;11;1232;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;1729;99;;reste;1;6;;;;;
;;;;;;1828;;total;56;163;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====mja autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_autres_intercalaires_aas|mja autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
*'''Attention''': Correction erreur fin de génome
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;mja;;;;;
deb fin;comp;gene;adress1;adresse2;intercalaire;autre;aas
;;rpr;378;2126;89;*;
fin;comp;CDS;2216;3343;;;
deb;comp;CDS;96499;97053;372;*;
;comp;tRNA;97426;97537;91;*;atgj
;;tRNA;97629;97716;241;*;ctc
fin;;CDS;97958;99259;;;
deb;comp;CDS;110328;111515;250;*;
;;tRNA;111766;111854;19;*;tga
fin;;CDS;111874;112785;;1;
deb;;CDS;131467;132552;369;*;
;;rpr;132922;133999;114;*;
fin;comp;CDS;134114;134959;;;
deb;;CDS;137244;138245;98;*;
;comp;tRNA;138344;138419;59;*;gtg
fin;comp;CDS;138479;138781;;0;
deb;;CDS;153070;154479;182;*;
;comp;rRNA;154662;157639;207;*;23s
;comp;tRNA;157847;157919;64;*;gca
;comp;rRNA;157984;159463;340;*;16s
fin;;CDS;159804;160085;;;
deb;comp;CDS;185874;186671;306;*;
;;tRNA;186978;187066;71;*;tcc
fin;;CDS;187138;187590;;;
deb;;CDS;190579;190800;31;*;
;;tRNA;190832;190908;32;*;ccc
fin;;CDS;190941;191114;;;
deb;comp;CDS;214560;215060;149;*;
;;tRNA;215210;215297;154;*;tta
fin;;CDS;215452;216240;;;
deb;;CDS;226386;227639;64;*;
;comp;tRNA;227704;227780;239;*;gcc
fin;;CDS;228020;229720;;;
deb;;CDS;235984;236169;394;*;
;;rpr;236564;238184;97;*;
fin;comp;CDS;238282;238725;;0;
deb;;CDS;303622;303927;64;*;
;;tRNA;303992;304081;230;*;tca
fin;comp;CDS;304312;304752;;;
deb;comp;CDS;351301;351564;129;*;
;;rpr;351694;352468;374;*;
fin;comp;CDS;352843;353142;;;
deb;comp;CDS;357984;358547;220;*;
;;tRNA;358768;358845;23;*;aga
;;tRNA;358869;358943;164;*;gaa
deb;;CDS;359108;359923;48;*;
;comp;tRNA;359972;360047;103;*;atgf
fin;comp;CDS;360151;361485;;0;
deb;;CDS;401945;402796;171;*;
;comp;tRNA;402968;403044;229;*;gtc
fin;;CDS;403274;403834;;;
deb;;CDS;427091;428104;467;*;
;;rpr;428572;429636;39;*;
fin;comp;CDS;429676;430632;;0;
deb;comp;CDS;498208;500886;604;*;
;;rpr;501491;501989;52;*;
fin;comp;CDS;502042;502485;;;
deb;comp;CDS;506108;506779;484;*;
;;rpr;507264;508115;282;*;
fin;;CDS;508398;509819;;;
deb;comp;CDS;551189;552289;251;*;
;;ncRNA;552541;552856;28;*;
fin;;CDS;552885;553364;;;
deb;comp;CDS;618311;618757;402;*;
;comp;tRNA;619160;619234;63;*;tgc
fin;comp;CDS;619298;619915;;0;
deb;;CDS;636394;637449;133;*;
;;tRNA;637583;637659;7;*;ttc
;;tRNA;637667;637742;29;*;aac
;;tRNA;637772;637849;18;*;atgi
;;tRNA;637868;637942;39;*;gaa
;;tRNA;637982;638069;11;*;cta
;;tRNA;638081;638152;295;*;cac
;;rRNA;638448;639930;64;*;16s
;;tRNA;639995;640067;207;*;gca
;;rRNA;640275;643254;78;*;23s
;;rRNA;643333;643447;56;*;5s
;;ncRNA;643504;643761;232;*;
fin;;CDS;643994;644962;;1;
deb;;CDS;762859;763608;157;*;
;comp;tRNA;763766;763842;178;*;acc
;;tRNA;764021;764096;50;*;caa
fin;;CDS;764147;764818;;0;
deb;comp;CDS;857400;857993;118;*;
;;rpr;858112;858343;532;*;
fin;;CDS;858876;860228;;;
deb;;CDS;862207;862410;179;*;
;;tRNA;862590;862661;41;*;cga
deb;;CDS;862703;863392;86;*;
;;tRNA;863479;863555;14;*;aca
;;tRNA;863570;863647;8;*;cca
;;tRNA;863656;863732;83;*;tac
;;tRNA;863816;863889;13;*;aaa
;;rRNA;863903;864017;46;*;5s
;;tRNA;864064;864141;80;*;gac
fin;;CDS;864222;864842;;;
deb;;CDS;871492;873447;238;*;
;comp;tRNA;873686;873763;102;*;atc
fin;comp;CDS;873866;875110;;0;
deb;comp;CDS;882566;883615;65;*;
;;tRNA;883681;883754;123;*;gta
fin;comp;CDS;883878;884297;;0;
deb;comp;CDS;1033083;1034345;474;*;
;;rpr;1034820;1035754;93;*;
fin;comp;CDS;1035848;1036873;;;
deb;comp;CDS;1037197;1038504;39;*;
;comp;tRNA;1038544;1038620;1;*;cgc
fin;comp;CDS;1038622;1039386;;;
deb;comp;CDS;1047158;1048804;568;*;
;;rpr;1049373;1050302;181;*;
fin;;CDS;1050484;1051014;;0;
deb;comp;CDS;1148669;1149934;210;*;
;;tRNA;1150145;1150220;34;*;ggc
;;tRNA;1150255;1150330;243;*;gga
fin;;CDS;1150574;1151254;;;
deb;comp;CDS;1188906;1189772;172;*;
;;tRNA;1189945;1190055;95;*;tgg
fin;;CDS;1190151;1190684;;0;
deb;;CDS;1218598;1219764;79;*;
;;rpr;1219844;1220165;479;*;
fin;comp;CDS;1220645;1222306;;;
deb;;CDS;1266436;1266561;484;*;
;;rpr;1267046;1267714;79;*;
fin;comp;CDS;1267794;1268189;;;
deb;comp;CDS;1312335;1312781;383;*;
;;tRNA;1313165;1313249;177;*;agc
fin;;CDS;1313427;1314617;;;
deb;;CDS;1455222;1456646;68;*;
;;rpr;1456715;1457335;384;*;
fin;comp;CDS;1457720;1458889;;0;
deb;;CDS;1568600;1569889;484;*;
;;rpr;1570374;1570895;121;*;
fin;comp;CDS;1571017;1572063;;;
deb;;CDS;1574035;1575045;473;*;
;;rpr;1575519;1576383;223;*;
fin;;CDS;1576607;1577287;;0;
deb;comp;CDS;1664008;1664862;377;*;
&lt;/pre&gt;

====mja intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_entre_cds|mja intercalaires entre cds]]
*'''Les intercalaires négatifs:'''
&lt;pre&gt;
mja;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;0;0;0;25;0;4;2;2;3;0;2;3;0;1;2;0;0;2;0;0;1;0;1;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;53
continu;25;0;0;52;2;0;1;12;0;1;10;0;4;9;1;2;5;0;2;6;0;0;6;0;3;1;0;1;3;0;0;3;0;2;1;0;0;3;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;1;0;7;166
&lt;/pre&gt;
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
mja;4.2.21 Paris;;mja 9.4.20;;;;;;;
;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;fréquence5
;'''négatif;219;12.7;'''négatif ;-13;14;-1 à -83;'''1 664 970;-1;219
;'''zéro;21;1.2;;;;;'''intercals;0;21
;'''1 à 200;1275;73.7;'''0 à 200;64;56;;'''151 580;5;128
;'''201 à 370;166;9.6;'''201 à 370;265;47;;'''9.1%;10;100
;'''371 à 600;36;2.1;'''371 à 600;438;51;;;15;102
;'''601 à max;12;0.7;'''601 à 1028;675;39;;;20;83
;'''total 1729;&lt;201;88;'''total 1727;85;109;-83 à 724;;25;73
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;35
470326;1019;-1;219;-70;3;;0;21;35;39
47370;859;0;21;-60;3;;-1;°25;40;27
451281;848;1;30;-50;1;;-2;0;45;36
449897;724;2;°40;-40;5;;-3;0;50;25
291222;711;3;9;-30;10;'''min à -1;-4;°77;55;18
623421;694;4;°38;-20;25;219;-5;2;60;37
1432395;694;5;11;-10;44;12.7%;-6;4;65;22
694012;687;6;9;0;149;;-7;3;70;36
1461617;685;7;7;10;228;;-8;°14;75;21
1176472;629;8;20;20;185;;-9;3;80;27
328329;625;9;°35;30;108;;-10;1;85;27
911715;622;10;29;40;66;'''1 à 100;-11;°12;90;44
106958;542;11;23;50;61;935;-12;3;95;22
91672;527;12;26;60;55;54.0%;-13;4;100;33
692428;522;13;20;70;58;;-14;°10;105;21
256182;501;14;18;80;48;;-15;3;110;17
1370826;495;15;15;90;71;;-16;2;115;21
15863;490;16;15;100;55;;-17;°5;120;25
424100;489;17;12;110;38;;-18;2;125;22
1547813;489;18;19;120;46;;-19;2;130;20
73799;487;19;°21;130;42;;-20;°6;135;25
1128054;479;20;16;140;51;;-21;1;140;26
777753;478;21;°20;150;34;;-22;0;145;18
983847;478;22;15;160;31;;-23;°7;150;16
1338520;474;23;10;170;21;'''1 à 200;-24;1;155;15
518562;472;24;°14;180;28;1275;-25;4;160;16
410085;456;25;14;190;24;74%;-26;°1;165;11
1291124;450;26;10;200;25;;-27;0;170;10
1607321;446;27;8;210;15;;-28;1;175;16
1596121;439;28;3;220;22;;-29;°4;180;12
439827;431;29;6;230;17;;-30;0;185;10
489906;417;30;8;240;12;;-31;0;190;14
966335;417;31;7;250;12;'''0 à 200;-32;°5;195;16
7338;412;32;6;260;7;1296;;223;200;9
325298;411;33;12;270;13;;reste;17;205;6
1119539;406;34;°13;280;9;;total;240;210;9
258119;400;35;1;290;14;;;;215;11
;;36;5;300;4;;;;220;11
;;37;4;310;5;;;;225;5
;;38;6;320;12;;;;230;12
;;39;°11;330;3;;;;235;5
;;40;1;340;6;'''201 à 370;;;240;7
;;reste;902;350;3;166;;;245;6
;;total;1729;360;6;9.6%;;;250;6
;;;;370;6;;;;255;4
;;;;380;5;;;;260;3
;;;;390;3;;;;265;7
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;400;4;;;;270;6
349543;-83;shift2;635;410;1;;;;275;7
541115;-73;shift2;498;420;4;;;;280;2
575292;-71;shift2;146;430;0;;;;285;9
125178;-64;shift2;246;440;2;;;;290;5
1600078;-62;comp;;450;2;;;;295;3
1611178;-62;shift2;1499;460;1;;;;300;1
28018;-59;shift2;497;470;0;;;;305;4
316817;-49;shift2;495;480;5;;;;310;1
1478759;-48;comp;;490;4;;;;315;6
739648;-44;shift2;851;500;1;;;;320;6
875683;-41;shift2;635;510;1;;;;325;3
1378478;-41;shift2;1910;520;0;;;;330;0
12869;-39;;;530;2;;;;335;5
1051112;-38;;;540;0;'''371 à 600;;;340;1
1285398;-38;;;550;1;36;;;345;2
1623026;-38;;;560;0;2.1%;;;350;1
697374;-35;;;570;0;;;;355;3
1152607;-34;;;580;0;'''601 à max;;;360;3
1328814;-34;;;590;0;12;;;365;4
139527;-32;;;600;0;0.7%;;;370;2
312088;-32;;;reste;12;;;;reste;49
352843;-32;;;total;1729;;;;total;1729
&lt;/pre&gt;

====mja  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_positifs_S+|mja intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
mja;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;&amp;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;-16;150;-532;77;660;313;min50;&amp;-94;719;-1762;147;856;255;min40
31 à 400;47;-300;424;21;711;213;2 parties;&amp;-6.2;87;-410;65;964;468;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;&amp;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;154;57;-;582;poly;78;SF;&amp;227;71;;537;poly;319;SF
31 à 400;115;46;-;623;poly;88;tF;&amp;128;44;-;859;poly;105;SF
;;;;;;;;;;;;;;
mja. Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
rru;min40;874;2056;2930;829;193;611;418;722;792;861;;;
mja;min30;406;1047;1453;776;326;571;245;844;857;881;;;
ant;min40;601;1616;2217;730;271;538;267;892;886;876;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
169;266;0.64;1037;2749;1;4;71;222;175;630;17;;;
239;405;0.59;495;1234;20;9;113;132;113;474;502;;;
281;485;0.58;714;2381;13;24;116;285;186;836;575;;;
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélations et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;;;;;;corrélation;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;0.502;;;;;
41-n;0.776;0.326;0.571;;;;;;;;;;;
1-n;0.881;0.844;0.857;;;;;;;;;14.8.21 paris;;
mja;fx;fc;;mja;fx%;fc%;;fx40;fc40;;x;mja;Sx-;Sc-
0;10;11;;0;25;11;0;10;11;&gt;0;429;-1;0;25
10;49;179;;10;121;171;1;12;18;&lt;0;56;-2;0;0
20;31;154;;20;76;147;2;12;28;zéro;10;-3;0;0
30;17;91;;30;42;87;3;3;6;total;495;-4;26;51
40;16;50;;40;39;48;4;6;32;;c;-5;0;2
50;11;50;;50;27;48;5;0;11;&gt;0;1060;-6;4;0
60;10;45;;60;25;43;6;5;4;&lt;0;163;-7;2;1
70;14;44;;70;34;42;7;2;5;zéro;11;-8;2;12
80;14;34;;80;34;32;8;5;15;total;1234;-9;3;0
90;28;43;;90;69;41;9;3;32;;;-10;0;1
100;19;36;;100;47;34;10;1;28;total;1729;-11;2;10
110;10;28;;110;25;27;11;7;16;;;-12;3;0
120;16;30;;120;39;29;12;4;22;;;-13;0;4
130;14;28;;130;34;27;13;3;17;;;-14;1;9
140;19;32;;140;47;31;14;5;13;;;-15;3;0
150;7;27;;150;17;26;15;2;13;;;-16;0;2
160;13;18;;160;32;17;16;1;14;;;-17;0;5
170;9;12;;170;22;11;17;2;10;;;-18;2;0
180;14;14;;180;34;13;18;2;17;;;-19;0;2
190;13;11;;190;32;11;19;3;18;;;-20;0;6
200;10;15;;200;25;14;20;2;14;;;-21;1;0
210;5;10;;210;12;10;21;4;16;;;-22;0;0
220;11;11;;220;27;11;22;4;11;;;-23;1;6
230;7;10;;230;17;10;23;1;9;;;-24;1;0
240;3;9;;240;7;9;24;3;11;;;-25;1;3
250;3;9;;250;7;9;25;2;12;;;-26;0;1
260;0;7;;260;0;7;26;1;9;;;-27;0;0
270;6;7;;270;15;7;27;2;6;;;-28;0;1
280;2;7;;280;5;7;28;0;3;;;-29;1;3
290;4;10;;290;10;10;29;0;6;;;-30;0;0
300;3;1;;300;7;1;30;0;8;;;-31;0;0
310;2;3;;310;5;3;31;3;4;;;-32;0;3
320;6;6;;320;15;6;32;2;4;;;-33;0;0
330;0;3;;330;0;3;33;1;11;;;-34;0;2
340;3;3;;340;7;3;34;2;11;;;-35;0;1
350;2;1;;350;5;1;35;0;1;;;-36;0;0
360;3;3;;360;7;3;36;1;4;;;-37;0;0
370;3;3;;370;7;3;37;1;3;;;-38;0;3
380;3;2;;380;7;2;38;1;5;;;-39;1;0
390;3;0;;390;7;0;39;4;7;;;-40;0;0
400;3;1;;400;7;1;40;1;0;;;-41;0;2
reste;23;13;;;;;reste;316;586;;;-42;0;0
total;439;1071;;t30;239;405;total;439;1071;;;-43;0;0
diagr;406;1047;;;;;diagr;113;474;;;-44;0;1
 - t30;309;623;;;;;;;;;;-45;0;0
;;;;;;;;;;;;-46;0;0
;;;;;;;;;;;;-47;0;0
;;;;;;;;;;;;-48;1;0
;;;;;;;;;;;;-49;0;1
;;;;;;;;;;;;-50;0;0
;;;;;;;;;;;;reste;1;6
;;;;;;;;;;;;total;56;163
&lt;/pre&gt;

====mja  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_négatifs_S-|mja intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
scc;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
continu;39;0;0;156;0;0;6;31;0;5;16;0;2;17;0;4;7;0;0;10;0;0;2;1;2;5;0;0;2;0;1;2;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;2;0;1;0;0;0;0;6;320
comp';0;1;0;2;0;2;0;0;2;0;3;2;1;0;1;1;2;1;0;0;0;0;2;1;0;2;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;27
&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;mja;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
;Sx-;0;0;0;26;0;4;2;2;3;0;2;3;0;1;3;0;0;2;0;0;1;0;1;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;56
;Sc-;25;0;0;51;2;0;1;12;0;1;10;0;4;9;0;2;5;0;2;6;0;0;6;0;3;1;0;1;3;0;0;3;0;2;1;0;0;3;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;1;0;6;163
&lt;/pre&gt;

====mja autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_autres_intercalaires|mja autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
mja;autres intercalaires;;adresses1;;;mja;autres intercalaires;;adresses2;;;mja;autres intercalaires;;adresses3;
;;;;;;;;;;;;;;;;
deb;°CDS;1664008;?;comp;;deb;°CDS;862207;179;;;deb;°CDS;857400;118;comp
;repeat_region;378;89;;;;&amp;tRNA;862590;41;;;;repeat_region;858112;532;
fin;°CDS;2216;;comp;;deb;°CDS;862703;86;;;fin;°CDS;858876;;
deb;°CDS;96499;372;comp;;;&amp;tRNA;863479;14;;;deb;°CDS;871492;238;
;&amp;tRNA;97426;91;comp;;;&amp;tRNA;863570;8;;;;&amp;tRNA;873686;102;comp
;&amp;tRNA;97629;241;;;;&amp;tRNA;863656;83;;;fin;°CDS;873866;;comp
fin;°CDS;97958;;;;;&amp;tRNA;863816;13;;;deb;°CDS;882566;65;comp
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;&amp;tRNA;111766;19;;;;&amp;tRNA;864064;80;;;fin;°CDS;883878;;comp
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;&amp;tRNA;138344;59;comp;;;repeat_region;428572;39;;;fin;°CDS;1038622;;comp
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;&amp;tRNA;157847;64;comp;;fin;°CDS;502042;;comp;;deb;°CDS;1148669;210;comp
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;&amp;tRNA;186978;71;;;deb;°CDS;551189;251;comp;;deb;°CDS;1188906;172;comp
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;&amp;tRNA;190832;32;;;deb;°CDS;618311;402;comp;;deb;°CDS;1218598;79;
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;&amp;tRNA;215210;154;;;deb;°CDS;636394;133;;;deb;°CDS;1266436;484;
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;&amp;tRNA;227704;239;comp;;;&amp;tRNA;637772;18;;;deb;°CDS;1312335;383;comp
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;repeat_region;236564;97;;;;&amp;tRNA;638081;295;;;deb;°CDS;1455222;68;
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;&amp;tRNA;303992;230;;;;$rRNA;640275;78;;;deb;°CDS;1568600;484;
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;repeat_region;351694;374;;;fin;°CDS;643994;;;;deb;°CDS;1574035;473;
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;&amp;tRNA;358768;23;;;;&amp;tRNA;764021;50;;;;;;;
;&amp;tRNA;358869;164;;;fin;°CDS;764147;;;;;;;;
deb;°CDS;359108;48;;;;;;;;;;;;;
;&amp;tRNA;359972;103;comp;;;;;;;;;;;;
fin;°CDS;360151;;comp;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====mja intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_tRNA|mja intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
mja;intercalaires tRNA;;;;;;;;;
;entre aas;;cds aa deb;;cds aa fin ;;cds aa deb;cds aa fin ;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
comp’;91;;372;;241;;31;1;'''deb;
;23;comp’;250;;19;;39;19;&lt;201;6
;7;comp’;98;;59;;64;32;total;8
;29;comp’;306;;71;;86;41;taux;75%
;18;;31;;32;;133;50;;
;39;comp’;149;;154;;179;59;'''fin;
;11;comp’;64;comp’;239;;372;63;&lt;201;15
comp’;178;;64;comp’;230;;402;71;total;17
;14;comp’;220;;164;;'''-;80;taux;88%
;8;comp’;48;;103;;'''-;95;;
;83;comp’;171;comp’;229;;'''-;102;'''total;
;34;;402;;63;;'''-;103;&lt;201;21
;;;133;;;;'''-;154;total;25
;;comp’;157;;50;;'''-;164;taux;84%
;;;179;;41;;'''-;177;;
;;;86;;80;;'''-;241;;
;;comp’;238;;102;;'''-;243;'''comp’;'''cumuls
;;comp’;65;comp’;123;;48;123;'''deb;
;;;39;;1;;64;229;&lt;201;8
;;comp’;210;;243;;65;230;total;14
;;comp’;172;;95;;98;239;taux;57%
;;comp’;383;;177;;149;'''-;;
;;;;;;;157;'''-;'''fin;
;;;;;;;171;'''-;&lt;201;1
;;;;;;;172;'''-;total;4
;;;;;;;210;'''-;taux;25%
;;;;;;;220;'''-;;
;;;;;;;238;'''-;'''total;
;;;;;;;250;'''-;&lt;201;9
;;;;;;;306;'''-;total;18
;;;;;;;383;'''-;taux;50%
;;;;;;;;;;
;;;;;deb;fin;total;;;
;;;;&lt;201;14;16;30;;;
;;;;total;22;21;43;;;
;;;;taux;64%;76%;70%;;;
&lt;/pre&gt;

===mba===
====mba opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_opérons|mba opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/archaea/Meth_bark_Fusaro/methBark1-tRNAs.fa;gtRNAdb;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_007355.1;mba;;genome;;;;;;;;;
39.2%GC;2.2.20 Paris;16s 3 ;62;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Methanosarcina barkeri str. Fusaro;;;;;;;;;;;;
;91192..91938;;cds;;137;137;;;249;;DUF429 domain-containing protein;*
comp;92076..92160;;ctc;+;132;;*132;;;;;*
comp;92293..92377;;ctc;2 ctc;298;298;;;;;;*
comp;92676..93476;;cds;;;;;;267;;DNA-directed RNA polymerase subunit D;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;98630..99337;;cds;;535;*535;;;236;;ABC transporter ATP-binding protein;*
comp;99873..99955;;tcc;;222;222;;;;;;*
comp;100178..101194;;cds;;;;;;339;;RNA-guided pseudouridylation complex pseudouridine synthase subunit Cbf5;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;146979..147518;;cds;;80;80;;;180;;tyrosine-type recombinase/integrase;*
comp;147599..147670;;acc;;198;198;;;;;;*
comp;147869..148381;;cds;;;;;;171;;DUF98 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;199345..200268;;cds;;492;*492;;;308;;aldolase;*
comp;200761..200833;;aac;+;71;;71;;;;;*
comp;200905..200979;;atgi;2 aac;119;;*119;;;;;*
comp;201099..201171;;aac;;964;*964;;;;;;*
;202136..202366;;cds;;;;;;77;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;260990..261532;;cds;;173;173;;;181;;nitroreductase family protein&quot;;*
;261706..261777;;cgg;;673;*673;;;;;;*
;262451..262960;;cds;;;;;;170;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;463836..464723;;cds;;2075;*2075;;;296;;polyprenyl synthetase family protein;*
;466799..466870;;gga;;94;;*94;;;;;*
;466965..467049;;cta;;221;221;;;;;;*
comp;467271..468818;;cds;;;;;;*516;;MBL fold metallo-hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;473154..473723;;cds;;298;298;;;190;;hp;*
comp;474022..474096;;gag;;246;246;;;;;;*
comp;474343..475584;;cds;;;;;;414;;proteasome-activating nucleotidase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;692109..692987;;cds;;349;349;;;293;;branched-chain-amino-acid transaminase;*
;693337..693411;;aga;;400;400;;;;;;*
comp;693812..694420;;cds;;;;;;203;;sulfite exporter TauE/SafE family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;703446..703958;;cds;;488;*488;;;171;;biotin transporter BioY;*
;704447..704521;;agg;;283;283;;;;;;*
;704805..705284;;cds;;;;;;160;;N-acetyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;800463..800642;;cds;;799;*799;;;60;;hp;*
comp;801442..801526;;agc;;137;137;;;;;;*
comp;801664..801978;;ncRNA;@1;327;327;;;315;;;*
;802306..803931;;cds;;;;;;*542;;methylamine methyltransferase corrinoid protein reductive activase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1109819..1110013;;cds;;15;15;;;65;;hp;*
;1110029..1110103;;atgf;+;63;;63;;;;;*
;1110167..1110241;;atgf;3 atg;63;;63;;;;;*
;1110305..1110379;;atgf;;273;273;;;;;;*
;1110653..1111984;;cds;;;;;;444;;signal recognition particle protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1134460..1135074;;cds;;235;235;;;205;;endonuclease III;*
comp;1135310..1135381;;tgc;+;65;;65;;;;;*
comp;1135447..1135518;;tgc;2 tgc;126;126;;;;;;*
comp;1135645..1136277;;cds;;;;;;211;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1137210..1137680;;cds;;488;*488;;;157;;P-bacterioferritin;*
comp;1138169..1138290;;5s;;129;;;;122;;;*
comp;1138420..1141252;;23s;;222;;;;2833;;;*
comp;1141475..1142963;;16s;;830;*830;;;1489;;;*
;1143794..1145302;;cds;;;;;;*503;;2-isopropylmalate synthase;*
;;;;;;;;;;;;
comp;1249870..1250040;;cds;;423;*423;;;57;;CopG family transcriptional regulator;*
comp;1250464..1250537;;aag;;546;*546;;;;;;*
;1251084..1251290;;cds;;;;;;69;;TRAM domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1315521..1315691;;cds;@2;-12;*-12;;;57;;hp;*
comp;1315680..1315751;;cgc;;174;174;;;;;;*
;1315926..1317110;;cds;;;;;;395;;redox-regulated ATPase YchF;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;1514831..1515373;;cds;;1133;*1133;;;181;;ArsR family transcriptional regulator;*
;1516507..1516579;;caa;;760;*760;;;;;;*
comp;1517340..1517663;;cds;;;;;;108;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1538879..1539286;;cds;;36;36;;;136;;sensor histidine kinase;*
comp;1539323..1539395;;other;@3;1249;*1249;;;73;;;*
&gt;comp;1540645..1540794;;cds;;;;;;50;;PKD domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1546247..1547791;;cds;;576;*576;;;*515;;aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme;*
comp;1548368..1548441;;aca;;448;*448;;;;;;*
&lt;;1548890..1549093;;cds;;;;;;68;;matrixin family metalloprotease;*
;;;;;;;;;;;;*
;1550566..1550760;;cds;;745;*745;;;65;;DeoR family transcriptional regulator;*
comp;1551506..1551579;;aca;;506;*506;;;;;;*
;1552086..1552640;;cds;;;;;;185;;YkgJ family cysteine cluster protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1621639..1622835;;cds;;433;*433;;;399;;methionine adenosyltransferase;*
;1623269..1623384;;tac;@4;112;;*112;;;;;*
;1623497..1623569;;gac;;300;300;;;;;;*
comp;1623870..1624067;;cds;;;;;;66;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1714788..1715069;;cds;;154;154;;;94;;hp;*
comp;1715224..1715295;;acg;;187;187;;;;;;*
comp;1715483..1716493;;cds;;;;;;337;;class I SAM-dependent methyltransferase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1755811..1755993;;cds;;113;113;;;61;;DNA-directed RNA polymerase subunit K;*
comp;1756107..1756181;;ccg;@5;0;*0;;;;;;*
comp;1756182..1756370;;cds;;;;;;63;;DNA-directed RNA polymerase subunit N;*
;;;;;;;;;;;;*
;1842058..1842195;;cds;;16;16;;;46;;hp;*
comp;1842212..1842285;;gtg;;717;*717;;;;;;*
;1843003..1843767;;cds;;;;;;255;;peptidase A24;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1852573..1852896;;cds;;1364;*1364;;;108;;PadR family transcriptional regulator;*
comp;1854261..1854338;;ccc;;198;198;;;;;;*
comp;1854537..1855097;;cds;;;;;;187;;CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1908225..1908989;;cds;;349;349;;;255;;hp;*
comp;1909339..1909530;;tgg;;445;*445;;;;;;*
&gt;;1909976..1910152;;cds;;;;;;59;;nitrogenase reductase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1926717..1927178;;cds;;183;183;;;154;;DUF4145 domain-containing protein;*
comp;1927362..1927445;;tcg;;125;125;;;;;;*
comp;1927571..1928944;;cds;;;;;;458;;endonuclease Q family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2005431..2007053;;cds;;2315;*2315;;;*541;;PKD domain-containing protein;*
comp;2009369..2009443;;cca;;199;199;;;;;;*
comp;2009643..2010194;;cds;;;;;;184;;UbiX family flavin prenyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2026807..2028456;;cds;;314;314;;;*550;;ATP-dependent DNA ligase;*
;2028771..2028842;;ggg;;513;*513;;;;;;*
comp;2029356..2029766;;cds;;;;;;137;;PaaI family thioesterase;*
;;;;;;;;;;;;*
;2157926..2158684;;cds;;567;*567;;;253;;hp;*
;2159252..2159362;;atgj;;349;349;;;;;;*
;2159712..2160225;;cds;;;;;;171;;amidohydrolase family protein;*
;;;;;;;;;;;;
comp;2194967..2195302;;cds;;713;*713;;;112;;translation initiation factor eIF-1A;*
;2196016..2197504;;16s;;222;;;;1489;;;*
;2197727..2200559;;23s;;129;;;;2833;;;*
;2200689..2200810;;5s;;607;*607;;;122;;;*
comp;2201418..2201615;;cds;;;;;;66;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
&gt;comp;2434335..2434609;;cds;;603;*603;;;92;;nucleoside deaminase;*
comp;2435213..2435284;;gcc;;223;;*223;;;;;*
;2435508..2435584;;atc;+;74;;74;;;;;*
;2435659..2435735;;atc;2 atc;241;241;;;;;;*
comp;2435977..2436390;;cds;;;;;;138;;transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;2622097..2624025;;cds;;1489;*1489;;;*643;;replication factor C large subunit;*
;2625515..2625588;;gta;;1102;*1102;;;;;;*
;2626691..2626918;;cds;;;;;;76;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2650514..2651296;;cds;;164;164;;;261;;thiazole biosynthesis protein;*
;2651461..2651532;;cac;;218;218;;;;;;*
;2651751..2653460;;cds;;;;;;*570;;radical SAM protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;2663547..2664668;;cds;;318;318;;;374;;PGF-pre-PGF domain-containing protein;*
comp;2664987..2665058;;ggc;;263;263;;;;;;*
;2665322..2666563;;cds;;;;;;414;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;2856552..2857409;;cds;;134;134;;;286;;hp;*
comp;2857544..2857628;;tca;;153;153;;;;;;*
comp;2857782..2858546;;cds;;;;;;255;;peptidylprolyl isomerase;*
;;;;;;;;;;;;*
;3326036..3326557;;cds;;539;*539;;;174;;hp;*
;3327097..3327168;;tgc;;995;*995;;;;;;*
;3328164..3328898;;cds;;;;;;245;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3994472..3994921;;cds;;514;*514;;;150;;IS200/IS605 family transposase;*
comp;3995436..3995529;;cga;;477;*477;;;;;;*
;3996007..3996714;;cds;;;;;;236;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;4005709..4006026;;cds;;269;269;;;106;;divalent-cation tolerance protein CutA;*
;4006296..4006378;;ttg;;860;*860;;;;;;*
;4007239..4009012;;rpr;@6;169;169;;;1774;;Family CRISPR;*
comp;4009182..4009478;;cds;;;;;;99;;CRISPR-associated endonuclease Cas2;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4031590..4031871;;cds;;1075;*1075;;;94;;hp;*
;4032947..4033019;;cag;;182;182;;;;;;*
comp;4033202..4033765;;cds;;;;;;188;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4041205..4041960;;cds;;96;96;;;252;;MBL fold metallo-hydrolase;*
;4042057..4042141;;tta;;375;375;;;;;;*
comp;4042517..4044976;;cds;;;;;;*820;;beta-propeller fold lactonase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4045359..4048274;;cds;;718;*718;;;*972;;PKD domain-containing protein;*
;4048993..4049077;;tta;;35;35;;;;;;*
comp;4049113..4052403;;cds;;241;241;;;*1097;;PGF-pre-PGF domain-containing protein;*
;4052645..4052729;;tta;;177;177;;;;;;*
comp;4052907..4053395;;cds;;;;;;163;;MarR family transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;4407561..4407830;;cds;;64;64;;;90;;elongation factor 1-beta;*
;4407895..4407966;;gcg;;675;*675;;;;;;*
comp;4408642..4409715;;cds;;;;;;358;;radical SAM protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4504139..4504300;;cds;;536;*536;;;54;;hp;*
comp;4504837..4504921;;ctg;;220;220;;;;;;*
comp;4505142..4506050;;cds;;;;;;303;;ornithine carbamoyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4551177..4551851;;cds;;566;*566;;;225;;MBL fold metallo-hydrolase;*
;4552418..4552491;;gtc;+;94;;*94;;;;;*
;4552586..4552660;;ttc;2 gtc;7;;7;;;;;*
;4552668..4552739;;ggc;2 ttc;61;;61;;;;;*
;4552801..4552874;;gtc;2 ggc;94;;*94;;;;;*
;4552969..4553043;;ttc;;7;;7;;;;;*
;4553051..4553122;;ggc;;717;*717;;;;;;*
;4553840..4554052;;cds;;;;;;71;;MoaD/ThiS family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;4617920..4618339;;cds;;200;200;;;140;;hp;*
;4618540..4618617;;gaa;;351;351;;;;;;*
;4618969..4619190;;cds;;377;377;;;74;;hp;*
;4619568..4619645;;gaa;;214;214;;;;;;*
comp;4619860..4620678;;cds;;;;;;273;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;4673041..4673643;;cds;;289;289;;;201;;adenosylcobinamide amidohydrolase;*
comp;4673933..4674054;;5s;;129;;;;122;;;*
comp;4674184..4677016;;23s;;135;;;;2833;;;*
comp;4677152..4677224;;gca;;79;;;;;;;*
comp;4677304..4678792;;16s;;1242;*1242;;;1489;;;*
;4680035..4680817;;cds;;;;;;261;;methanol-5-hydroxybenzimidazolylcobamide methyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;4759174..4759410;;cds;;89;89;;;79;;DNA-directed RNA polymerase subunit H;*
comp;4759500..4759576;;aaa;;655;*655;;;;;;*
comp;4760232..4760801;;cds;;;;;;190;;DJ-1/PfpI family protein;*
&lt;/pre&gt;

====mba cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_cumuls|mba cumuls]]
&lt;pre&gt;
mba cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;3;1;0;-;1;2;1;;100;25;30;0
;16 23 5s 0;2;20;2;;50;4;20;;200;27;60;7
;16 gca 235;1;40;0;;100;4;40;;300;21;90;14
;16 23 5s a;0;60;0;;150;6;60;;400;8;120;8
;max a;1;80;6;;200;14;80;;500;4;150;5
;a doubles;0;100;3;;250;9;100;;600;7;180;10
;autres;0;120;2;;300;8;120;;700;1;210;11
;total aas;1;140;1;;350;6;140;;800;0;240;4
sans ;opérons;44;160;0;;400;4;160;;900;1;270;10
;1 aa;37;180;0;;450;4;180;;1000;1;300;4
;max a;6;200;0;;500;4;200;;1100;1;330;2
;a doubles;6;;1;;;35;;;;0;;21
;total aas;61;;15;0;;100;;0;;96;;96
total aas;;62;;;;;;;;;;;
remarques;;6;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;85;;;457;;;;240;;
;;;variance;52;;;407;;;;194;;
sans jaune;;;moyenne;51;;;210;;;;186;;158
;;;variance;28;;;98;;;;106;;78
&lt;/pre&gt;

====mba blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_blocs|mba blocs]]
&lt;pre&gt;
mba blocs;;;;
cds;289;201;adenosylcobinamide amidohydrolase;*
5s;129;122;;*
23s;135;2833;;*
gca;79;;;*
16s;1242;1489;;*
cds;;261;methanol-5-hydroxybenzimidazolylcobamide methyltransferase;*
;;;;
cds;713;112;translation initiation factor eIF-1A;*
16s;222;1489;;*
23s;129;2833;;*
5s;607;122;;*
cds;;66;hp;*
;;;;
cds;488;157;P-bacterioferritin;*
5s;129;122;;*
23s;222;2833;;*
16s;830;1489;;*
cds;;503;2-isopropylmalate synthase;*
&lt;/pre&gt;

====mba remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_remarques|mba remarques]]
&lt;pre&gt;
mba;;;;;;62;62
atgi;1;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;4
atc;2;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;2;ccc;1;cac;1;cgc;1
gtc;2;gcc;1;gac;1;ggc;3
tta;3;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
&lt;/pre&gt;
====mba distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_distribution|mba distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;2;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2
atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;2;agc;;;atc;2;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;1;cgc;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgc;;;ctc;2;ccc;;cac;;cgc;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;2;gcc;1;gac;1;ggc;2;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;3;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;1;caa;1;cga;1;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
mba;;37;;;;;;;mba;14;;;;;;;;mba;9;;;;;;
&lt;/pre&gt;

====mba données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_données_intercalaires|mba données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;mba;fx;fc;mba;fx40;fc40;mba;x-;c-;c;x;c;x;aa
1;1;0;1;21;0;1;21;-1;0;33;298;137;CDS 16s;;
;0;10;8;155;1;0;22;-2;2;0;535;790;;835;
1;1;20;13;127;2;2;31;-3;0;2;222;2075;;718;
;0;30;11;72;3;0;12;-4;3;117;80;221;;1247;
1;1;40;19;74;4;2;17;-5;1;0;198;298;16s 23s;;
;0;50;12;54;5;1;23;-6;2;0;492;349;2*209;;
;0;60;18;61;6;0;15;-7;0;5;173;400;23s 5s;;
;1;70;12;47;7;0;4;-8;0;33;673;488;3*74;;
;1;80;16;54;8;2;4;-9;0;1;246;546;5s CDS;;
;1;90;18;53;9;0;8;-10;0;4;307;-12;;488;
1;0;100;17;37;10;1;19;-11;0;13;799;174;;607;
;0;110;16;38;11;2;16;-12;0;0;15;286;;289;
;1;120;29;44;12;0;8;-13;1;4;273;760;16s tRNA;;
;2;130;11;39;13;0;19;-14;3;15;235;448;85;;gca
2;0;140;20;35;14;2;13;-15;0;0;126;745;tRNA 23s;;
;0;150;19;52;15;1;12;-16;0;5;423;506;116;;gca
1;1;160;22;25;16;1;13;-17;1;11;36;300;tRNA tRNA;;
;1;170;14;44;17;0;11;-18;0;5;1249;154;132;;ctc
2;1;180;24;36;18;3;13;-19;0;4;576;16;**;;ctc
2;1;190;29;46;19;1;7;-20;1;7;433;717;71;;aac
;4;200;27;30;20;3;15;-21;0;0;187;445;119;;atgi
;0;210;18;21;21;1;8;-22;0;1;113;183;**;;aac
1;2;220;31;43;22;4;8;-23;1;5;0;314;94;;gga
1;1;230;19;32;23;2;4;-24;0;0;1379;513;**;;cta
;1;240;15;32;24;0;14;-25;0;5;198;241;63;;atgf
2;1;250;25;26;25;1;4;-26;1;8;349;318;63;;atgf
;0;260;25;34;26;0;6;-27;0;1;125;263;**;;atgf
1;1;270;18;35;27;1;10;-28;0;3;2315;134;65;;tgc
;1;280;18;37;28;1;4;-29;0;1;199;514;**;;tgc
1;0;290;16;26;29;1;4;-30;0;0;567;477;112;;tac
2;1;300;12;23;30;0;10;-31;0;0;349;1075;**;;gac
;1;310;19;24;31;1;2;-32;0;4;603;182;223;;gcc
2;0;320;17;27;32;0;6;-33;0;0;1489;96;74;;atc
;0;330;14;23;33;0;8;-34;1;0;1102;375;**;;atc
;0;340;27;22;34;3;7;-35;1;5;164;718;94;;gtc
1;2;350;12;28;35;1;11;-36;0;0;218;35;7;;ttc
;1;360;14;18;36;6;8;-37;0;0;153;241;61;;ggc
;0;370;11;20;37;0;9;-38;0;3;539;177;94;;gtc
1;1;380;12;24;38;0;11;-39;0;0;995;675;7;;ttc
;0;390;8;15;39;4;6;-40;0;0;269;566;**;;ggc
1;0;400;19;18;40;4;6;-41;1;1;64;214;;;
17;19;reste;529;707;reste;1183;1930;-42;0;0;536;;;;
41;49;total;1235;2379;total;1235;2379;-43;0;0;220;;;;
23;29;diagr;705;1651;diagr;51;428;-44;0;1;717;;;;
1;1; t30;32;354;;;;-45;0;0;200;;;;
;;;;;;;;-46;0;0;351;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;0;1;377;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;0;0;89;;;;
;x;1234;22;1;1257;;;-49;0;3;655;;;;
;c;2358;307;21;2686;;;-50;0;0;;;;;
;;;;;3943;128;;reste;3;6;;;;;
;;;;;;4071;;total;22;307;;;;;
&lt;/pre&gt;

====mba intercalaires entre cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_entre_cds|mba intercalaires entre cds]]
*'''Le Tableau'''
&lt;pre&gt;
mba;4.2.21 Paris;;mba 17.12.20;;;;;;;;;
mba;intercalaires;;%;intercalaires;moyenne;ecartype;plage;ADN;intercal;&lt;u&gt;frequence5;intercal;&lt;u&gt;frequencez
;'''négatif;329;8.3;'''négatif ;-12;13;-1 à -74;'''4 837 408;-1;329;610;21
;'''zéro;22;0.6;;;;;'''intercals;0;22;620;23
;'''1 à 200;1478;37.5;'''0 à 200;85;62;;'''1 292 909;5;110;630;21
;'''201 à 370;782;19.8;'''201 à 370;278;48;;'''26.7%;10;53;640;20
;'''371 à 600;643;16.3;'''371 à 600;475;66;;;15;73;650;14
;'''601 à max;689;17.5;'''601 à 1028;920;310;;;20;67;660;22
;'''total 3943;&lt;201;46;'''total 3938;324;341;-74 à 2323;;25;46;670;14
adresse;intercal;intercal;fréquence1;intercal;fréquence;cumul et %;intercal;fréquence;30;37;680;28
3095040;2919;-1;329;-70;1;;0;22;35;39;690;6
526434;2894;0;22;-60;0;;-1;°33;40;54;700;11
1788553;2705;1;22;-50;8;;-2;2;45;35;710;20
2002090;2693;2;°33;-40;7;;-3;2;50;31;720;14
4631335;2517;3;12;-30;14;'''min à -1;-4;°120;55;34;730;7
818173;2323;4;19;-20;34;329;-5;1;60;45;740;16
2797830;2322;5;°24;-10;66;8.3%;-6;2;65;34;750;20
3799612;2309;6;15;0;221;;-7;5;70;25;760;12
376145;2299;7;4;10;163;;-8;°33;75;34;770;18
3653740;2282;8;6;20;140;;-9;1;80;36;780;12
4809596;2233;9;8;30;83;;-10;4;85;41;790;8
1187952;2165;10;°20;40;93;'''1 à 100;-11;°13;90;30;800;7
4415180;2161;11;18;50;66;878;-12;0;95;27;810;6
3268995;2076;12;8;60;79;22.3%;-13;5;100;27;820;8
372411;1964;13;°19;70;59;;-14;°18;105;23;830;8
3552425;1946;14;15;80;70;;-15;0;110;31;840;9
3151269;1901;15;13;90;71;;-16;5;115;32;850;13
3603917;1870;16;°14;100;54;;-17;°12;120;41;860;6
542032;1854;17;11;110;54;;-18;5;125;25;870;18
682785;1848;18;°16;120;73;;-19;4;130;25;880;8
3195397;1797;19;8;130;50;;-20;°8;135;24;890;10
2484625;1761;20;°18;140;55;;-21;0;140;31;900;9
3100209;1754;21;9;150;71;;-22;1;145;42;910;7
2724177;1733;22;°12;160;47;;-23;°6;150;29;920;5
912406;1712;23;6;170;58;'''1 à 200;-24;0;155;23;930;4
2448660;1707;24;°14;180;60;1478;-25;5;160;24;940;7
2750853;1677;25;5;190;75;37.5%;-26;°9;165;22;950;15
4703857;1624;26;6;200;57;;-27;1;170;36;960;9
974831;1613;27;°11;210;39;;-28;3;175;29;970;5
4637075;1600;28;5;220;74;;-29;°1;180;31;980;9
2503952;1596;29;5;230;51;;-30;0;185;39;990;8
511626;1595;30;°10;240;47;;-31;0;190;36;1000;9
2705610;1569;31;3;250;51;'''0 à 200;-32;°4;195;33;1010;3
3908084;1568;32;6;260;59;1500;;325;200;24;1020;9
2490112;1557;33;8;270;53;;reste;26;205;19;1030;4
63786;1555;34;10;280;55;;total;351;210;20;1040;7
136653;1553;35;12;290;42;;;;215;46;1050;3
958597;1549;36;°14;300;35;;;;220;28;1060;7
301149;1548;37;9;310;43;;;;225;29;1070;10
1165546;1516;38;°11;320;44;;'''intercal;'''&lt;u&gt;frequencef;230;22;1080;5
;;39;10;330;37;;600;3254;235;24;1090;3
;;40;10;340;49;'''201 à 370;700;180;240;23;1100;1
;;reste;3113;350;40;782;800;134;245;29;1110;8
;;total;3943;360;32;19.8%;900;95;250;22;1120;4
;;;;370;31;;1000;78;255;30;1130;3
'''adresse;'''intercaln;'''décalage;'''long;380;36;;1100;52;260;29;1140;4
4403838;-74;comp;;390;23;;1200;41;265;26;1150;3
1874377;-59;shift2;688;400;37;;1300;30;270;27;1160;5
4136612;-59;shift2;694;410;34;;1400;22;275;22;1170;4
493240;-56;shift2;127;420;31;;1500;15;280;33;1180;3
942901;-56;shift2;601;430;43;;1600;13;285;20;1190;3
4169341;-56;shift2;238;440;34;;1700;3;290;22;1200;4
4335751;-56;shift2;445;450;30;;1800;6;295;20;;580
4374865;-55;comp;;460;27;;1900;3;300;15;reste;109
2801727;-51;comp;;470;31;;2000;3;305;18;total;3943
1742959;-49;shift2;2660;480;28;;2100;1;310;25;;
2882494;-49;shift2;1325;490;28;;2200;2;315;24;;
3292321;-49;shift2;101;500;26;;2300;3;320;20;;
2440972;-47;shift2;664;510;22;;2400;3;325;19;;
4561346;-44;shift2;1744;520;32;;2500;0;330;18;;
1057681;-41;shift2;394;530;25;;2600;1;335;21;;
1723225;-41;comp;;540;20;'''371 à 600;2700;1;340;28;;
82489;-38;;;550;23;643;2800;1;345;21;;
222695;-38;;;560;22;16.3%;2900;1;350;19;;
3533580;-38;;;570;22;;3000;1;355;19;;
1573832;-35;;;580;28;'''601 à max;;689;360;13;;
1931905;-35;;;590;18;689;;;365;15;;
3122151;-35;;;600;23;17.5%;;;370;16;;
3337334;-35;;;reste;689;;reste;0;reste;1332;;
4054645;-35;;;total;3943;;total;3943;total;3943;;
&lt;/pre&gt;

====mba  intercalaires positifs S+====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_positifs_S+|mba intercalaires positifs S+]]
*Tableaux
&lt;pre&gt;
mba Sx+ Sc+ Les diagrammes 400. Corrélations et fréquences faibles 1-30;;;;;;;;;;;;;;
;;effectifs diagramme;;;corrélation x+ c+, 41-n;;;;corrélation x+ c+, 1-n;;;;;
gen;minima;x+;c+;total;400;200;250;diff;200;250;400;;;
afn;min10;328;1322;1650;607;-17;108;125;-467;-407;-8;;;
mba;min10;705;1651;2356;154;-330;-221;109;-512;-477;-223;;;
cbei;min10;950;3395;4345;402;-509;-375;134;-649;-648;-290;;;
1-30  ‰ ;;;effectifs;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;effectifs 1-40;;corel;;;
1-30 x+;1-30 c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+;c+;x+/c+;;;
46;402;0.11;350;1688;6;5;11;180;36;580;-369;;;
45;214;0.21;1255;2688;1;8;18;114;51;428;-74;;;
26;244;0.11;1212;4400;0;4;8;89;35;954;272;;;
;;;;;;;;;;;;;;
Diagrammes 400;;;;;;;;;;;;;;
mba;Sx+;;;;;;;Sc+;;;;;;
Poly3;-7;-5;-3;1;R2;flex x+;comment.;-7;-5;-3;1;R2;flex c+;comment.
1 à 400;4.9;-71;219;11;350;483;min10;-50;359;-832;80;823;239;min50
1 à 600;5.8;-62;170;7.4;465;354;2 parties;-6.7;100;-498;10;789;495;2 parties
droite;-a;cste;-;R2;note;R2’;;-a;cste;-;R2;note;R2’;
1 à 400;2;25;-;1;poly;348;tF;104;46;;536;poly;287;SF
1 à 600;14;20;-;156;poly;309;tF;80;59;-;580;poly;209;SF
&lt;/pre&gt;
*Effectifs et pourcentages par rapport au total du diagramme, '''diagr'''. Total des pourcentages des fréquences 10 20 30, '''t30'''.
*Corrélation et fréquences faibles
&lt;pre&gt;
;400;200;250;800;;;;;;;;;;;;;;;;;
;coefficient de corrélation fx fc;;;;;;;;;;corrélation;;;;;;;;complément à 800;;
41-n;0.154;-0.330;-0.221;0.639;;;;;;;-0.074;;;;;;;;effectifs;;
1-n;-0.223;-0.512;-0.477;;;;;;;;;;;;14.8.21 paris;;;;;;
mba;fx;fc;;mba;fx%;fc%;mba;fx;fc;;fx40;fc40;;x;mba;Sx-;Sc-;;mba;fx;fc
0;1;21;;0;1;13;;;;0;1;21;&gt;0;1232;-1;0;33;;410;13;21
10;8;155;;10;11;94;410;13;21;1;0;22;&lt;0;22;-2;2;0;;420;13;18
20;13;127;;20;18;77;420;13;18;2;2;31;zéro;1;-3;0;2;;430;19;24
30;11;72;;30;16;44;430;19;24;3;0;12;total;1255;-4;3;117;;440;15;19
40;19;74;;40;27;45;440;15;19;4;2;17;;c;-5;1;0;;450;14;16
50;12;54;;50;17;33;450;14;16;5;1;23;&gt;0;2360;-6;2;0;;460;7;20
60;18;61;;60;26;37;460;7;20;6;0;15;&lt;0;307;-7;0;5;;470;11;20
70;11;48;;70;16;29;470;11;20;7;0;4;zéro;21;-8;0;33;;480;7;21
80;16;54;;80;23;33;480;7;21;8;2;4;total;2688;-9;0;1;;490;14;14
90;18;53;;90;26;32;490;14;14;9;0;8;;;-10;0;4;;500;12;14
100;17;37;;100;24;22;500;12;14;10;1;19;;;-11;0;13;;510;5;17
110;16;38;;110;23;23;510;5;17;11;2;16;;;-12;0;0;;520;15;17
120;30;43;;120;43;26;520;15;17;12;0;8;;;-13;1;4;;530;8;17
130;11;39;;130;16;24;530;8;17;13;0;19;;;-14;3;15;;540;6;14
140;20;35;;140;28;21;540;6;14;14;2;13;;;-15;0;0;;550;15;8
150;19;52;;150;27;31;550;15;8;15;1;12;;;-16;0;5;;560;10;12
160;22;25;;160;31;15;560;10;12;16;1;13;;;-17;1;11;;570;14;8
170;14;44;;170;20;27;570;14;8;17;0;11;;;-18;0;5;;580;13;15
180;24;36;;180;34;22;580;13;15;18;3;13;;;-19;0;4;;590;8;10
190;29;46;;190;41;28;590;8;10;19;1;7;;;-20;1;7;;600;13;10
200;27;30;;200;38;18;600;13;10;20;3;15;;;-21;0;0;;610;10;11
210;18;21;;210;26;13;610;10;11;21;1;8;;;-22;0;1;;620;7;16
220;31;43;;220;44;26;620;7;16;22;4;8;;;-23;1;5;;630;9;12
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260;25;34;;260;35;21;660;8;14;26;0;6;;;-27;0;1;;670;4;10
270;18;35;;270;26;21;670;4;10;27;1;10;;;-28;0;3;;680;12;16
280;18;37;;280;26;22;680;12;16;28;1;4;;;-29;0;1;;690;2;4
290;16;26;;290;23;16;690;2;4;29;1;4;;;-30;0;0;;700;5;6
300;12;23;;300;17;14;700;5;6;30;0;10;;;-31;0;0;;710;8;12
310;19;24;;310;27;15;710;8;12;31;1;2;;;-32;0;4;;720;5;9
320;17;27;;320;24;16;720;5;9;32;0;6;;;-33;0;0;;730;3;4
330;14;23;;330;20;14;730;3;4;33;0;8;;;-34;1;0;;740;5;11
340;27;22;;340;38;13;740;5;11;34;3;7;;;-35;1;5;;750;9;11
350;12;28;;350;17;17;750;9;11;35;1;11;;;-36;0;0;;760;6;6
360;14;18;;360;20;11;760;6;6;36;6;8;;;-37;0;0;;770;10;8
370;11;20;;370;16;12;770;10;8;37;0;9;;;-38;0;3;;780;3;9
380;12;24;;380;17;15;780;3;9;38;0;11;;;-39;0;0;;790;5;3
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 - t30;673;1297;;;;;;;;;;;;;-45;0;0;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;-46;0;0;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;-47;0;1;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;-48;0;0;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;-49;0;3;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;-50;0;0;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;reste;3;6;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;total;22;307;;;;
&lt;/pre&gt;

====mba  intercalaires négatifs S-====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_négatifs_S-|mba intercalaires négatifs S-]]
*9.6.21
&lt;pre&gt;
mba;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;;
comp’;;2;;1;1;2;;;;;;;1;3;;;1;;;1;;;;;;1;;;;;;;;1;1;;;;;;1;;;;;;;;;;2;18
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&lt;/pre&gt;
*14.8.21
&lt;pre&gt;
14.8.21 paris;mba;-1;-2;-3;-4;-5;-6;-7;-8;-9;-10;-11;-12;-13;-14;-15;-16;-17;-18;-19;-20;-21;-22;-23;-24;-25;-26;-27;-28;-29;-30;-31;-32;-33;-34;-35;-36;-37;-38;-39;-40;-41;-42;-43;-44;-45;-46;-47;-48;-49;-50;reste;total
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;Sc-;33;0;2;117;0;0;5;33;1;4;13;0;4;15;0;5;11;5;4;7;0;1;5;0;5;8;1;3;1;0;0;4;0;0;5;0;0;3;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;3;0;6;307
&lt;/pre&gt;

====mba autres intercalaires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_autres_intercalaires|mba autres intercalaires]]
&lt;pre&gt;
;mba;autres intercalaires;;adresses1;;mba;autres intercalaires;;adresses2;;;mba;autres intercalaires;;adresses3;
;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;&amp;tRNA;4759500;655;comp
;;;;;;;;;;;;fin;°CDS;4760232;;comp
&lt;/pre&gt;
====mba intercalaires tRNA====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_tRNA|mba intercalaires tRNA]]
&lt;pre&gt;
comp’;aa;comp’;cds aa deb;comp’;cds aa fin ;;deb;fin;continu;cumuls
;;;;;;;;;;
;132;comp’;137;;298;;15;0;'''deb;
;;;535;;222;;36;125;&lt;201;9
;;;80;;198;;64;126;total;25
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;;;173;;673;;89;187;;
;94;comp’;2075;comp’;221;;113;198;'''fin;
;;comp’;298;;246;;164;198;&lt;201;8
;;comp’;349;comp’;400;;173;199;total;23
;;comp’;488;;307;;200;218;taux;35%
;;;799;;;;235;220;;
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;65;;235;;126;;349;246;&lt;201;17
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;;;36;;1249;;535;349;;
;;;576;comp’;448;;536;351;;
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;;comp’;16;comp’;717;;799;1102;;
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;;;349;comp’;445;;1489;-;;
;;comp’;183;;125;;2315;-;'''comp’;'''cumuls
;;;2315;;199;;'''-12;35;;
;;comp’;314;comp’;513;;16;174;'''deb;
;;;567;;349;;96;177;&lt;201;7
'''comp’;'''223;;603;comp’;241;;134;182;total;21
;'''74;;;;;;137;214;taux;33%
;;;1489;;1102;;154;221;;
;;;164;;218;;183;241;'''fin;
;;comp’;318;comp’;263;;241;263;&lt;201;4
;;comp’;134;;153;;286;300;total;21
;;;539;;995;;298;375;taux;19%
;;comp’;514;comp’;477;;314;400;;
;;;269;;;;318;445;'''total;
;;comp’;1075;comp’;182;;349;448;&lt;201;11
;;comp’;96;comp’;375;;488;477;total;42
;;comp’;718;comp’;35;;492;506;taux;26%
;;comp’;241;comp’;177;;514;513;;
;;;64;comp’;675;;566;546;;
;;;536;;220;;718;675;;
;94 7 61 94 7;comp’;566;;717;;745;717;;
;;;200;;351;;1075;760;;
;;;377;comp’;214;;2075;790;;
;;;89;;655;; ;;;
;;;;;;;;;;
;deb;fin;toal;;;;;;;
&lt;201;16;12;28;;;;;;;
total;46;44;90;;;;;;;
taux;35%;27%;31%;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===mfe===
====mfe opérons====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_opérons|mfe opérons]]
&lt;pre&gt;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/archaea/Meth_WH1/methSp_WH1-tRNAs.fa;gtRNAdb;;%GC;41.80%;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP009504.1;mfe;;genome;;;;;;;;;
40.2%GC;3.2.20 Paris;16s  3;56;doubles;intercalaires;CDS;aa;avec aa;cdsa;cdsd;protéines;
Methanosarcina sp. WH1;;;;;;;;;;;;
comp;38726..40264;;cds;;698;*698;;;*513;;2-isopropylmalate synthase;*
;40963..42450;;16s;;208;;;;1488;;;*
;42659..45491;;23s;;130;;;;2833;;;*
;45622..45743;;5s;;857;*857;;;122;;;*
;46601..47164;;cds;;102;102;;;188;;hp;*
;47267..47338;;tgc;+;72;;72;;;;;*
;47411..47482;;tgc;2 tgc;411;*411;;;;;;*
;47894..48508;;cds;;;;;;205;;endonuclease III;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;71092..72423;;cds;;384;384;;;444;;signal recognition particle protein;*
comp;72808..72882;;atgf;+;89;;*89;;;;;*
comp;72972..73046;;atgf;2 atgf;234;234;;;;;;*
;73281..73472;;cds;;;;;;64;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;175573..176153;;cds;;163;163;;;194;;hp;*
comp;176317..176389;;gac;;111;;*111;;;;;*
comp;176501..176614;;tac;@1;295;295;;;;;;*
;176910..177248;;cds;;;;;;113;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;214884..215966;;cds;;801;*801;;;361;;hp;*
comp;216768..216841;;aca;;150;150;;;;;;*
;216992..217582;;cds;;;;;;197;;aldolase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;372219..373091;;cds;;558;*558;;;291;;hp;*
comp;373650..373723;;gtg;;340;340;;;;;;*
;374064..374828;;cds;;;;;;255;;peptidase A24;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;379248..381950;;cds;;1076;*1076;;;*901;;DNA mismatch repair protein MutS;*
comp;383027..383104;;ccc;;193;193;;;;;;*
comp;383298..383882;;cds;;;;;;195;;CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;532751..533176;;cds;;356;356;;;142;;hp;*
comp;533533..533607;;cca;;149;149;;;;;;*
comp;533757..534308;;cds;;;;;;184;;UbiX family flavin prenyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;598666..599850;;cds;;170;170;;;395;;redox-regulated ATPase YchF;*
;600021..600092;;cgc;;341;341;;;;;;*
;600434..600868;;cds;;;;;;145;;cell surface lipoprotein;*
;;;;;;;;;;;;*
;680493..681734;;cds;;185;185;;;414;;proteasome-activating nucleotidase;*
;681920..681994;;gag;;242;242;;;;;;*
&gt;;682237..682560;;cds;;;;;;108;;p-IS200/IS605 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
;689062..689631;;cds;;36;36;;;190;;phosphatase PAP2 family protein;*
comp;689668..689752;;cta;;73;;73;;;;;*
comp;689826..689897;;gga;;1481;*1481;;;;;;*
;691379..691483;;cds;;;;;;35;;CcmD family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;793563..795017;;cds;;111;111;;;485;;p-IS66 family transposase;*
comp;795129..795213;;ctc;+;117;;*117;;;;;*
comp;795331..795418;;ctc;2 ctc;235;235;;;;;;*
comp;795654..796454;;cds;;;;;;267;;DNA-directed RNA polymerase subunit D;*
;;;;;;;;;;;;*
;810088..810471;;cds;;861;*861;;;128;;hp;*
comp;811333..811415;;tcc;;123;123;;;;;;*
comp;811539..812555;;cds;;;;;;339;;RNA-guided pseudouridylation complex pseudouridine synthase subunit Cbf5;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;893309..894232;;cds;;391;391;;;308;;aldolase;*
comp;894624..894696;;aac;+;87;;*87;;;;;*
comp;894784..894858;;atgi;2 aac;110;;*110;;;;;*
comp;894969..895041;;aac;;1415;*1415;;;;;;*
comp;896457..897506;;cds;;;;;;350;;TIGR00303 family protein;*
;;;;;;;;;;;;*
;949570..950112;;cds;;208;208;;;181;;nitroreductase family protein;*
;950321..950392;;cgg;;498;*498;;;;;;*
comp;950891..952300;;cds;;;;;;470;;NADPH-dependent glutamate synthase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1088496..1090946;;cds;;360;360;;;*817;;PGF-pre-PGF domain-containing protein;*
comp;1091307..1091378;;gcc;;227;;*227;;;;;*
;1091606..1091682;;atc;+;62;;62;;;;;*
;1091745..1091818;;atc;2 atc;353;353;;;;;;*
comp;1092172..1092585;;cds;;;;;;138;;transcriptional regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1155736..1156137;;cds;;210;210;;;134;;AsnC family transcriptional regulator;*
;1156348..1156425;;gaa;+;718;;*718;;;;;*
;1157144..1157221;;gaa;2 gaa;233;233;;;;;;*
comp;1157455..1158645;;cds;@4;;;;;397;;ISH3 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1199367..1200149;;cds;;967;*967;;;261;;methanol-5-hydroxybenzimidazolylcobamide methyltransferase;*
;1201117..1202604;;16s;;80;;;;1488;;;*
;1202685..1202757;;gca;;135;;;;;;;*
;1202893..1205725;;23s;;130;;;;2833;;;*
;1205856..1205977;;5s;;5;5;;;122;;;*
comp;1205983..1206231;;cds;;;;;;83;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;1207508..1211485;;cds;;12;12;;;*1326;;PAS domain S-box protein;*
comp;1211498..1211582;;ctg;;190;190;;;;;;*
comp;1211773..1212681;;cds;;;;;;303;;ornithine carbamoyltransferase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1220571..1220783;;cds;;596;*596;;;71;;MoaD/ThiS family protein;*
comp;1221380..1221451;;ggc;+;25;;25;;;;;*
comp;1221477..1221551;;ttc;2 ggc;57;;57;;;;;*
comp;1221609..1221682;;gtc;2 ttc;71;;71;;;;;*
comp;1221754..1221825;;ggc;2 gtc;25;;25;;;;;*
comp;1221851..1221925;;ttc;;118;;*118;;;;;*
comp;1222044..1222117;;gtc;;358;358;;;;;;*
;1222476..1223792;;cds;;;;;;439;;methanogenesis marker 16 metalloprotein;*
;;;;;;;;;;;;*
;1400830..1401773;;cds;;914;*914;;;315;;helix-turn-helix domain-containing protein;*
;1402688..1402761;;gta;;287;287;;;;;;*
;1403049..1403276;;cds;;;;;;76;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;1504221..1505630;;cds;;686;*686;;;470;;F0F1 ATP synthase subunit beta;*
comp;1506317..1506410;;cga;;750;*750;;;;;;*
;1507161..1508039;;cds;;;;;;293;;response regulator;*
;;;;;;;;;;;;*
;1513245..1513562;;cds;;213;213;;;106;;divalent-cation tolerance protein CutA;*
;1513776..1513858;;ttg;;268;268;;;;;;*
&gt;;1514127..1514647;;cds;;;;;;174;;p-IS1634 family transposase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1887880..1888338;;cds;;392;392;;;153;;pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein;*
comp;1888731..1888802;;ggc;;378;378;;;;;;*
;1889181..1890518;;cds;;;;;;446;;DHH family phosphoesterase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1962666..1963553;;cds;;130;130;;;296;;hp;*
comp;1963684..1963768;;tta;;235;235;;;;;;*
;1964004..1964759;;cds;;;;;;252;;MBL fold metallo-hydrolase;*
;;;;;;;;;;;;*
;1971331..1971852;;cds;;319;319;;;174;;hp;*
comp;1972172..1972244;;cag;;204;204;;;;;;*
comp;1972449..1972850;;cds;;;;;;134;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2170713..2172446;;cds;;156;156;;;*578;;radical SAM protein;*
comp;2172603..2172674;;cac;;174;174;;;;;;*
comp;2172849..2173631;;cds;;;;;;261;;thiazole biosynthesis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
&lt;comp;2320809..2321131;;cds;;141;141;;;108;;p-IS200/IS605 family transposase;*
comp;2321273..2321344;;gcg;;65;65;;;;;;*
comp;2321410..2321679;;cds;;;;;;90;;elongation factor 1-beta;*
;;;;;;;;;;;;*
;2387890..2388675;;cds;;150;150;;;262;;peptidylprolyl isomerase;*
;2388826..2388911;;tca;;326;326;;;;;;*
comp;2389238..2389453;;cds;;;;;;72;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;2678132..2678368;;cds;;85;85;;;79;;DNA-directed RNA polymerase subunit H;*
comp;2678454..2678530;;aaa;;824;*824;;;;;;*
comp;2679355..2679537;;cds;;;;;;61;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3091524..3091754;;cds;;271;271;;;77;;hp;*
comp;3092026..3092147;;5s;;130;;;;122;;;*
comp;3092278..3095110;;23s;;208;;;;2833;;;*
comp;3095319..3096806;;16s;;839;*839;;;1488;;;*
;3097646..3097975;;cds;;;;;;110;;translation initiation factor eIF-1A;*
;;;;;;;;;;;;
comp;3153517..3155214;;cds;;599;*599;;;*566;;diguanylate phosphodiesterase;*
comp;3155814..3155923;;atgj;;799;*799;;;;;;*
;3156723..3157106;;cds;;;;;;128;;tRNA CCA-pyrophosphorylase;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3241682..3242944;;cds;;473;*473;;;421;;diaminopimelate decarboxylase;*
;3243418..3243489;;ggg;;377;377;;;;;;*
;3243867..3244073;;cds;;;;;;69;;hp;*
;;;;;;;;;;;;*
;3341829..3342017;;cds;@2;0;*0;;;63;;DNA-directed RNA polymerase subunit N;*
;3342018..3342092;;ccg;;112;112;;;;;;*
;3342205..3342387;;cds;;;;;;61;;DNA-directed RNA polymerase subunit K;*
;;;;;;;;;;;;*
;3358176..3359186;;cds;;533;*533;;;337;;class I SAM-dependent methyltransferase family protein;*
;3359720..3359791;;acg;;52;52;;;;;;*
comp;3359844..3360305;;cds;;;;;;154;;peroxiredoxin;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3397316..3398947;;cds;;422;*422;;;*544;;methylamine methyltransferase corrinoid protein reductive activase;*
;3399370..3399684;;ncRNA;@3;149;149;;;315;;;*
;3399834..3399918;;agc;;230;230;;;;;;*
;3400149..3400847;;cds;;;;;;233;;ATPase;*
;;;;;;;;;;;;*
;3435506..3436918;;cds;;181;181;;;471;;phosphotransferase;*
;3437100..3437183;;tcg;;273;273;;;;;;*
;3437457..3437948;;cds;;870;*870;;;164;;rubrerythrin family protein;*
;3438819..3438989;;cds;;107;107;;;57;;hp;*
;3439097..3439289;;tgg;;42;42;;;;;;*
comp;3439332..3439484;;cds;;;;;;51;;hp MLELDILDLDILDLDILDLKILELEILELEVLELEILELEILELEVLVQS;*
;;;;;;;;;;;;*
;3456114..3456473;;cds;;260;260;;;120;;hp;*
comp;3456734..3456805;;acc;;200;200;;;;;;*
comp;3457006..3457518;;cds;;;;;;171;;DUF98 domain-containing protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3583589..3584044;;cds;;295;295;;;152;;N-acetyltransferase;*
comp;3584340..3584414;;agg;;339;339;;;;;;*
;3584754..3585317;;cds;;;;;;188;;biotin transporter BioY;*
;;;;;;;;;;;;*
;3593430..3593861;;cds;;343;343;;;144;;PspC domain-containing protein;*
comp;3594205..3594279;;aga;;348;348;;;;;;*
;3594628..3595506;;cds;;;;;;293;;branched-chain-amino-acid transaminase;*
;;;;;;;;;;;;*
;3603458..3603697;;cds;;389;389;;;80;;type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin;*
;3604087..3604159;;caa;;633;*633;;;;;;*
comp;3604793..3606301;;cds;;;;;;*503;;lipopolysaccharide biosynthesis protein;*
;;;;;;;;;;;;*
comp;3856073..3856279;;cds;;402;*402;;;69;;TRAM domain-containing protein;*
;3856682..3856755;;aag;;498;*498;;;;;;*
;3857254..3857424;;cds;;;;;;57;;CopG family transcriptional regulator;*
&lt;/pre&gt;

====mfe cumuls====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_cumuls|mfe cumuls]]
&lt;pre&gt;
mfe cumuls;;;;;;;;;;;;;
;opérons;;Fréquences intercalaires tRNAs;;;Fréquences intercalaires cds;;;;Fréquences aas cds;;;
;;effectif;gammes;sans rRNAs;avec rRNAs;gammes;cds;gammes;cdsd;gammes;cdsa;gammes;cdsa 330
avec rRNA;opérons;3;1;0;-;1;1;1;;100;18;30;0
;16 23 5s 0;2;20;0;;50;4;20;;200;29;60;4
;16 gca 235;1;40;2;;100;3;40;;300;12;90;14
;16 23 5s a;0;60;1;;150;11;60;;400;9;120;6
;max a;1;80;4;;200;9;80;;500;9;150;8
;a doubles;0;100;2;;250;10;100;;600;5;180;7
;autres;0;120;4;;300;7;120;;700;0;210;9
;total aas;1;140;0;;350;7;140;;800;0;240;1
sans ;opérons;40;160;0;;400;10;160;;900;1;270;6
;1 aa;31;180;0;;450;3;180;;1000;1;300;4
;max a;6;200;0;;500;3;200;;1100;0;330;3
;a doubles;7;;2;;;20;;;;1;;23
;total aas;55;;15;0;;88;;0;;85;;85
total aas;;56;;;;;;;;;;;
remarques;;;;;;;;;;;;;
avec jaune;;;moyenne;131;;;376;;;;255;;
;;;variance;169;;;299;;;;210;;
sans jaune;;;moyenne;55;;;223;;;;207;;157
;;;variance;21;;;108;;;;127;;80
&lt;/pre&gt;

====mfe blocs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_blocs|mfe blocs]]
&lt;pre&gt;
mfe blocs;;;;
cds;698;513;2-isopropylmalate synthase;*
16s;208;1488;;*
23s;130;2833;;*
5s;857;122;;*
cds;102;188;hp;*
;;;;
cds;967;261;methanol-5-hydroxybenzimidazolylcobamide methyltransferase;*
16s;80;1488;;*
gca;135;;;*
23s;130;2833;;*
5s;5;122;;*
cds;;83;hp;*
;;;;
cds;271;77;hp;*
5s;130;122;;*
23s;208;2833;;*
16s;839;1488;;*
cds;;110;translation initiation factor eIF-1A;*
&lt;/pre&gt;

====mfe remarques====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_remarques|mfe remarques]]
&lt;pre&gt;
mfe;;;;;;56;56
atgi;1;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;1;tgc;2
atc;2;acc;1;aac;2;agc;1
ctc;2;ccc;1;cac;1;cgc;1
gtc;2;gcc;1;gac;1;ggc;3
tta;1;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1
cta;1;cca;1;caa;1;cga;1
gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1
&lt;/pre&gt;
====mfe distribution====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_distribution|mfe distribution]]
&lt;pre&gt;
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;1;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2
atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;2;agc;;;atc;2;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;1;cac;1;cgc;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgc;;;ctc;2;ccc;;cac;;cgc;
gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;2;gcc;1;gac;1;ggc;2;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;1;caa;1;cga;1;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;arch;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
mfe;;31;;;;;;;mfe;14;;;;;;;;mfe;10;;;;;;
&lt;/pre&gt;
====mfe données intercalaires==== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_données_intercalaires|mfe données intercalaires]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
CDS-tRNA;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;CDS-CDS;;;tRNA CDS;;rRNA tRNA;;
effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;frequence;effectif;;intercalaire;;intercalaire;;
fxt;fct;mfe;fx;fc;mfe;fx40;fc40;mfe;x-;c-;c;x;c;x;aa
;1;0;1;17;0;1;17;-1;;26;102;207;CDS 16s;;
;0;10;11;152;1;2;28;-2;1;0;411;295;;704;
1;0;20;15;94;2;0;29;-3;;0;384;150;;973;
;0;30;21;74;3;1;16;-4;4;116;225;340;;845;
1;0;40;22;60;4;1;15;-5;;0;801;170;16s 23s;;
1;0;50;24;58;5;1;18;-6;;0;558;36;2* 196;;
1;0;60;11;41;6;1;14;-7;;4;1076;1611;23s 5s;;
;1;70;18;55;7;2;3;-8;;27;193;861;3* 74;;
;0;80;23;52;8;1;7;-9;2;0;356;498;5s CDS;;
;1;90;24;43;9;1;8;-10;2;6;149;360;857;5;
;0;100;18;41;10;1;14;-11;;10;332;353;;271;
;2;110;25;48;11;2;15;-12;1;0;185;233;16s tRNA;;
;2;120;24;44;12;0;11;-13;;5;296;12;84;;gca
1;1;130;30;46;13;2;12;-14;1;11;111;358;tRNA 23s;;
;0;140;10;40;14;3;8;-15;;1;235;774;119;;gca
1;3;150;25;36;15;3;10;-16;;1;123;392;tRNA tRNA;;
;1;160;13;41;16;2;3;-17;1;9;391;378;72;;tgc
1;0;170;25;35;17;1;7;-18;;1;1415;130;**;;tgc
;1;180;22;31;18;0;8;-19;;1;208;235;89;;atgf
;3;190;14;38;19;2;12;-20;;5;210;319;**;;atgf
;2;200;11;28;20;0;8;-21;;0;190;326;111;;gac
1;3;210;17;42;21;0;11;-22;;1;596;799;**;;tac
;1;220;27;29;22;0;3;-23;;3;914;473;73;;cta
;2;230;24;32;23;3;9;-24;;1;287;52;**;;gga
2;1;240;18;34;24;2;12;-25;;3;686;42;117;;ctc
;0;250;10;20;25;0;8;-26;;2;213;260;**;;ctc
1;0;260;18;34;26;0;10;-27;;0;268;339;87;;aac
;1;270;14;26;27;1;5;-28;;1;204;343;110;;atgi
;1;280;16;21;28;11;10;-29;;0;156;348;**;;aac
;1;290;16;20;29;1;2;-30;;0;174;633;-;227;gcc
1;2;300;19;25;30;3;4;-31;;0;141;402;62;;atc
;0;310;10;21;31;2;6;-32;;1;65;;**;;atc
1;0;320;14;24;32;2;3;-33;1;0;150;;718;;gaa
1;0;330;15;23;33;1;1;-34;;0;85;;**;;gaa
2;1;340;12;20;34;2;7;-35;;6;824;;25;;ggc
2;0;350;13;22;35;2;4;-36;;0;599;;57;;ttc
3;1;360;13;14;36;2;4;-37;;0;377;;71;;gtc
;0;370;13;13;37;1;10;-38;;0;0;;25;;ggc
1;1;380;15;17;38;3;5;-39;1;0;112;;118;;ttc
;2;390;12;18;39;4;8;-40;;0;533;;**;;gtc
1;1;400;12;15;40;3;12;-41;;4;230;;;;
8;12;reste;372;467;reste;997;1614;-42;;0;181;;;;
31;48;total;1067;2011;total;1067;2011;-43;;0;273;;;;
23;35;diagr;694;1527;diagr;69;380;-44;;0;107;;;;
1;0; t30;47;320;;;;-45;;0;200;;;;
;;;;;;;;-46;;0;295;;;;
;;Récapitulatif des effectifs;;;;;;-47;;2;389;;;;
;;&gt;0;&lt;0;zéro;total;*;;-48;;0;498;;;;
;x;1066;17;1;1084;;;-49;;0;;;;;
;c;1994;250;17;2261;;;-50;;0;;;;;
;;;;;3345;122;;reste;3;3;;;;;
;;;;;;3467;;total;17;250;;;;;
&lt;/pre&gt;
=====mfe autres intercalaires aas===== 
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mfe_autres_intercalaires_aas|mfe autres intercalaires aas]]
*Note: Ne contient que les données en effectifs des fréquences CDS-CDS et les autres intercalaires. Pour refaire les courbes il faut copier dans un tableur et formater.
&lt;pre&gt;
autres intercalaires;;mfe;;;;;
deb fin;comp;gene;adresse1;adresse2;intercalaire;autre;aas
deb;comp;CDS;38726;40264;704;*;
;;rRNA;40969;42446;196;*;1478
;;rRNA;42643;45547;74;*;2905
;;rRNA;45622;45743;857;*;122
deb;;CDS;46601;47164;102;*;
;;tRNA;47267;47338;72;*;tgc
;;tRNA;47411;47482;411;*;tgc
fin;;CDS;47894;48508;;;
deb;comp;CDS;71092;72423;384;*;
;comp;tRNA;72808;72882;89;*;atgf
;comp;tRNA;72972;73046;207;*;atgf
fin;;CDS;73254;73472;;0;
deb;comp;CDS;175573;176091;225;*;
;comp;tRNA;176317;176389;111;*;gac
;comp;tRNA;176501;176614;295;*;tac
fin;;CDS;176910;177248;;0;
deb;comp;CDS;214884;215966;801;*;
;comp;tRNA;216768;216841;150;*;aca
fin;;CDS;216992;217582;;;
deb;comp;CDS;372219;373091;558;*;
;comp;tRNA;373650;373723;340;*;gtg
fin;;CDS;374064;374828;;0;
deb;comp;CDS;379248;381950;1076;*;
;comp;tRNA;383027;383104;193;*;ccc
fin;comp;CDS;383298;383828;;;
deb;;CDS;508114;509238;100;*;
;comp;ncRNA;509339;509698;415;*;
fin;;CDS;510114;511253;;;
deb;comp;CDS;532751;533176;356;*;
;comp;tRNA;533533;533607;149;*;cca
fin;comp;CDS;533757;534308;;;
deb;comp;CDS;598666;599850;170;*;
;;tRNA;600021;600092;332;*;cgc
fin;;CDS;600425;600868;;0;
deb;;CDS;680493;681734;185;*;
;;tRNA;681920;681994;296;*;gag
fin;;CDS;682291;682578;;0;
deb;;CDS;689098;689631;36;*;
;comp;tRNA;689668;689752;73;*;cta
;comp;tRNA;689826;689897;1611;*;gga
fin;;CDS;691509;691889;;;
deb;comp;CDS;793563;795017;111;*;
;comp;tRNA;795129;795213;117;*;ctc
;comp;tRNA;795331;795418;235;*;ctc
fin;comp;CDS;795654;796454;;;
deb;;CDS;810088;810471;861;*;
;comp;tRNA;811333;811415;123;*;tcc
fin;comp;CDS;811539;812555;;;
deb;comp;CDS;893309;894232;391;*;
;comp;tRNA;894624;894696;87;*;aac
;comp;tRNA;894784;894858;110;*;atgi
;comp;tRNA;894969;895041;1415;*;aac
fin;comp;CDS;896457;897506;;;
deb;;CDS;949570;950112;208;*;
;;tRNA;950321;950392;498;*;cgg
fin;comp;CDS;950891;952300;;;
deb;;CDS;1088496;1090946;360;*;
;comp;tRNA;1091307;1091378;227;*;gcc
;;tRNA;1091606;1091682;62;*;atc
;;tRNA;1091745;1091818;353;*;atc
fin;comp;CDS;1092172;1092585;;;
deb;;CDS;1155748;1156137;210;*;
;;tRNA;1156348;1156425;718;*;gaa
;;tRNA;1157144;1157221;233;*;gaa
fin;comp;CDS;1157455;1158645;;;
deb;comp;CDS;1199367;1200149;973;*;
;;rRNA;1201123;1202600;84;*;1478
;;tRNA;1202685;1202757;119;*;gca
;;rRNA;1202877;1205781;74;*;2905
;;rRNA;1205856;1205977;5;*;122
fin;comp;CDS;1205983;1206231;;;
deb;;CDS;1207508;1211485;12;*;
;comp;tRNA;1211498;1211582;190;*;ctg
fin;comp;CDS;1211773;1212681;;;
deb;comp;CDS;1220571;1220783;596;*;
;comp;tRNA;1221380;1221451;25;*;ggc
;comp;tRNA;1221477;1221551;57;*;ttc
;comp;tRNA;1221609;1221682;71;*;gtc
;comp;tRNA;1221754;1221825;25;*;ggc
;comp;tRNA;1221851;1221925;118;*;ttc
;comp;tRNA;1222044;1222117;358;*;gtc
fin;;CDS;1222476;1223792;;0;
deb;;CDS;1400830;1401773;914;*;
;;tRNA;1402688;1402761;287;*;gta
fin;;CDS;1403049;1403276;;;
deb;comp;CDS;1504221;1505630;686;*;
;comp;tRNA;1506317;1506410;774;*;cga
fin;;CDS;1507185;1508039;;0;
deb;;CDS;1513245;1513562;213;*;
;;tRNA;1513776;1513858;268;*;ttg
fin;;CDS;1514127;1514647;;;
deb;;CDS;1887880;1888338;392;*;
;comp;tRNA;1888731;1888802;378;*;ggc
fin;;CDS;1889181;1890518;;;
deb;;CDS;1962666;1963553;130;*;
;comp;tRNA;1963684;1963768;235;*;tta
fin;;CDS;1964004;1964759;;;
deb;;CDS;1971373;1971852;319;*;
;comp;tRNA;1972172;1972244;204;*;cag
fin;comp;CDS;1972449;1972850;;;
deb;comp;CDS;2066516;2069038;121;*;
;;repeat_region;2069160;2069707;535;*;
fin;;CDS;2070243;2071250;;;
deb;comp;CDS;2073346;2074599;417;*;
;;repeat_region;2075017;2076588;535;*;
fin;;CDS;2077124;2077771;;0;
deb;comp;CDS;2170713;2172446;156;*;
;comp;tRNA;2172603;2172674;174;*;cac
fin;comp;CDS;2172849;2173631;;;
deb;;CDS;2231846;2232133;164;*;
;;repeat_region;2232298;2233846;77;*;
fin;;CDS;2233924;2235552;;0;
deb;comp;CDS;2320856;2321131;141;*;
;comp;tRNA;2321273;2321344;65;*;gcg
fin;comp;CDS;2321410;2321679;;;
deb;;CDS;2387890;2388675;150;*;
;;tRNA;2388826;2388911;326;*;tca
fin;comp;CDS;2389238;2389453;;;
deb;comp;CDS;2678132;2678368;85;*;
;comp;tRNA;2678454;2678530;824;*;aaa
fin;comp;CDS;2679355;2679537;;;
deb;;CDS;2969291;2969554;306;*;
;;repeat_region;2969861;2971629;480;*;
fin;;CDS;2972110;2973468;;;
deb;;CDS;2979566;2980078;280;*;
;;repeat_region;2980359;2981568;343;*;
;;repeat_region;2981912;2982974;5;*;
fin;;CDS;2982980;2983372;;;
deb;;CDS;3091533;3091754;271;*;
;comp;rRNA;3092026;3092147;74;*;122
;comp;rRNA;3092222;3095126;196;*;2905
;comp;rRNA;3095323;3096800;845;*;1478
fin;;CDS;3097646;3097975;;;
deb;comp;CDS;3153517;3155214;599;*;
;comp;tRNA;3155814;3155923;799;*;atgj
fin;;CDS;3156723;3157106;;;
deb;comp;CDS;3241682;3242944;473;*;
;;tRNA;3243418;3243489;377;*;ggg
fin;;CDS;3243867;3244073;;0;
deb;;CDS;3341829;3342017;0;*;
;;tRNA;3342018;3342092;112;*;ccg
fin;;CDS;3342205;3342387;;;
deb;;CDS;3358176;3359186;533;*;
;;tRNA;3359720;3359791;52;*;acg
fin;comp;CDS;3359844;3360305;;;
deb;comp;CDS;3397316;3398947;422;*;
;;ncRNA;3399370;3399684;149;*;
;;tRNA;3399834;3399918;230;*;agc
fin;;CDS;3400149;3400847;;;
deb;;CDS;3435506;3436918;181;*;
;;tRNA;3437100;3437183;273;*;tcg
fin;;CDS;3437457;3437948;;;
deb;;CDS;3438819;3438989;107;*;
;;tRNA;3439097;3439289;42;*;tgg
fin;comp;CDS;3439332;3439484;;0;
deb;;CDS;3456114;3456473;260;*;
;comp;tRNA;3456734;3456805;200;*;acc
fin;comp;CDS;3457006;3457518;;;
deb;comp;CDS;3583589;3584044;295;*;
;comp;tRNA;3584340;3584414;339;*;agg
fin;;CDS;3584754;3585317;;;
deb;;CDS;3593430;3593861;343;*;
;comp;tRNA;3594205;3594279;348;*;aga
fin;;CDS;3594628;3595506;;;
deb;;CDS;3603458;3603697;389;*;
;;tRNA;3604087;3604159;633;*;caa
fin;comp;CDS;3604793;3606301;;;
deb;comp;CDS;3856073;3856279;402;*;
;;tRNA;3856682;3856755;498;*;aag
fin;;CDS;3857254;3857424;;0;
&lt;/pre&gt;

===archées synthèse===
====archées distribution par génome====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#archées_distribution_par_génome|archées distribution par génome]]
&lt;pre&gt;
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
mba;14;37;;;;1;9;;61
mfe;14;31;;;;1;10;;56
mfi;25;20;;;;2;;;47
mja;8;16;1;4;6;2;;;37
total;61;104;1;4;6;6;19;0;201
;;;-5s et +5s sont inversés;;1 seul bloc;;;;
&lt;/pre&gt;

====archées distribution du total====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#archées_distribution_du_total|archées distribution du total]]
&lt;pre&gt;
atgi;4;tct;;tat;;atgf;7
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;6;tcc;4;tac;4;tgc;8
atc;6;acc;4;aac;7;agc;4
ctc;6;ccc;3;cac;4;cgc;4
gtc;6;gcc;4;gac;4;ggc;8
tta;6;tca;4;taa;;tga;1
ata;;aca;5;aaa;5;aga;4
cta;4;cca;4;caa;5;cga;4
gta;4;gca;6;gaa;7;gga;4
ttg;3;tcg;3;tag;;tgg;4
atgj;4;acg;3;aag;3;agg;3
ctg;3;ccg;2;cag;3;cgg;2
gtg;4;gcg;3;gag;2;ggg;3
arch;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
total;80;104;1;4;6;6;201
;;;-5s et +5s sont inversés;;1 seul bloc;;
&lt;/pre&gt;

====archées distribution par type====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#archées_distribution_par_type|archées distribution par type]]
&lt;pre&gt;
;;;;;;;104;;;;;;;;;61;;;;;;;;;19
atgi;;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;5
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;4;tac;;tgc;3;;ttc;5;tcc;;tac;3;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;4
atc;2;acc;2;aac;1;agc;4;;atc;;acc;2;aac;5;agc;;;atc;4;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;3;cac;2;cgc;4;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgc;;;ctc;4;ccc;;cac;;cgc;
gtc;1;gcc;2;gac;;ggc;2;;gtc;5;gcc;2;gac;3;ggc;6;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;5;tca;4;taa;;tga;1;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;3;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;1;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;2;caa;4;cga;4;;cta;3;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;3;gca;;gaa;2;gga;;;gta;1;gca;;gaa;2;gga;4;;gta;;gca;;gaa;2;gga;
ttg;2;tcg;3;tag;;tgg;3;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;3;acg;3;aag;2;agg;2;;atgj;1;acg;;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;3;ccg;2;cag;3;cgg;2;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;3;gcg;3;gag;2;ggg;3;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
archées;1aa;104;;;;;;;archées;&gt;1aa;61;;;;;;;archées;duplica;19;;;;;
;;4;4;;;;;;;;37;61;;;;;;;;0;0;;;;
;;68;65;;;;;;;;7;11;;;;;;;;4;21;;;;
;;32;31;;;;;;;;17;28;;;;;;;;15;79;;;;
&lt;/pre&gt;

====archées par rapport au groupe de référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#archées_par_rapport_au_groupe_de_référence|archées par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;archeo4;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;40;11;4;;;;55;
16;moyen;39;16;8;;;9;72;
14;fort;25;34;7;4;;4;74;
; ;104;61;19;4;;13;201;
10;g+cgg;26;2;;;;;28;
2;agg+cga;6;1;;;;;7;
4;carre ccc;7;8;4;;;;19;
5;autres;1;;;;;;1;
;;40;11;4;;;;55;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;archeo4;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;199;55;20;;;;274;26
16;moyen;194;80;40;;;45;358;324
14;fort;124;169;35;20;;20;368;650
; ;517;303;95;20;;65;201;729
10;g+cgg;129;10;;;;;139;10
2;agg+cga;30;5;;;;;35;
4;carre ccc;35;40;20;;;;95;16
5;autres;5;;;;;;5;
;;199;55;20;;;;274;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;archeo4;1aa;&gt;1aa;dup;;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;217;60;22;299;26;38;18;
16;moyen;212;87;43;342;324;38;26;
14;fort;136;185;38;359;650;24;56;
; ;565;332;103;184;729;104;61;
10;g+cgg;141;11;;152;10;65;;
2;agg+cga;33;5;;38;;15;;
4;carre ccc;38;43;22;103;16;18;;
5;autres;5;;;5;;3;;
;;217;60;22;299;;40;;
&lt;/pre&gt;
====euryarchaeota, estimation des -rRNAs====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#euryarchaeota,_estimation_des_-rRNAs|euryarchaeota, estimation des -rRNAs]] 
&lt;pre&gt;
euryarchaeota;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
63 génomes total avec rRNA;;;;archeo;total;ttt;tgt;;100 génomes total avec rRNA;;;;archeo;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
effectifs;avec +16s;;;63;124; ; ;;indices;;;;63;197;0;0;;eury4;effectifs;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;184
atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;7
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;2;tac;;tgc;28;;ttc;;tcc;3;tac;;tgc;44;;ttc;5;tcc;4;tac;3;tgc;8
atc;1;acc;;aac;;agc;;;atc;2;acc;;aac;;agc;;;atc;6;acc;4;aac;6;agc;4
ctc;;ccc;;cac;;cgc;;;ctc;;ccc;;cac;;cgc;;;ctc;6;ccc;3;cac;3;cgc;4
gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;6;gcc;4;gac;3;ggc;8
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;6;tca;4;taa;;tga;1
ata;;aca;;aaa;3;aga;;;ata;;aca;;aaa;5;aga;;;ata;;aca;4;aaa;4;aga;4
cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;3;cca;3;caa;5;cga;4
gta;;gca;87;gaa;;gga;;;gta;;gca;138;gaa;;gga;;;gta;4;gca;;gaa;6;gga;4
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;3;tcg;3;tag;;tgg;4
atgj;;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;2;agg;;;atgj;4;acg;3;aag;3;agg;3
ctg;;ccg;;cag;;cgg;2;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;3;;ctg;3;ccg;2;cag;3;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;4;gcg;3;gag;2;ggg;3
;;118;;3;;3;124;;;;187;;4.76190476190476;;5;197;;;;63;;66;;55;184
11.1.21 Paris;;;;eury;total;ttt;tgt;;16.1.21 Paris;;;;eury;total;ttt;tgt;;;;;;;;;
estimation 1aa+&gt;1aa+dup;;;;143;6935;0;0;;indices;;;;143;6935;0;0;;eury4;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;;;4600
atgi;99;tct;;tat;;atgf;127;;atgi;99;tct;;tat;;atgf;127;;atgi;75;tct;;tat;;atgf;175
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0.7;cct;;cat;;cgt;0.7;;ctt;0.7;cct;;cat;;cgt;0.7;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;0.7;;gtt;;gct;;gat;;ggt;0.7;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;122;tcc;102;tac;104;tgc;137;;ttc;122;tcc;106;tac;104;tgc;181;;ttc;125;tcc;100;tac;75;tgc;200
atc;119;acc;104;aac;122;agc;104;;atc;121;acc;104;aac;122;agc;104;;atc;150;acc;100;aac;150;agc;100
ctc;122;ccc;93;cac;101;cgc;102;;ctc;122;ccc;93;cac;101;cgc;102;;ctc;150;ccc;75;cac;75;cgc;100
gtc;121;gcc;101;gac;124;ggc;141;;gtc;121;gcc;101;gac;124;ggc;141;;gtc;150;gcc;100;gac;75;ggc;200
tta;107;tca;101;taa;;tga;13;;tta;107;tca;101;taa;;tga;13;;tta;150;tca;100;taa;;tga;25
ata;;aca;110;aaa;106;aga;103;;ata;;aca;110;aaa;110;aga;103;;ata;;aca;100;aaa;100;aga;100
cta;103;cca;102;caa;108;cga;103;;cta;103;cca;102;caa;108;cga;103;;cta;75;cca;75;caa;125;cga;100
gta;103;gca;13;gaa;132;gga;103;;gta;103;gca;151;gaa;132;gga;103;;gta;100;gca;;gaa;150;gga;100
ttg;87;tcg;87;tag;;tgg;102;;ttg;87;tcg;87;tag;;tgg;102;;ttg;75;tcg;75;tag;;tgg;100
atgj;101;acg;90;aag;85;agg;88;;atgj;101;acg;90;aag;87;agg;88;;atgj;100;acg;75;aag;75;agg;75
ctg;85;ccg;78;cag;87;cgg;68;;ctg;85;ccg;78;cag;87;cgg;71;;ctg;75;ccg;50;cag;75;cgg;50
gtg;91;gcg;84;gag;84;ggg;79;;gtg;91;gcg;84;gag;84;ggg;79;;gtg;100;gcg;75;gag;50;ggg;75
;;1569;;1607;;1475;4651;;;;1757;;1612;;1480;4848;;;;1575;;1650;;1375;4600
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;Les écarts;;en %;;;;;
rapports;;;;;;;;;;;;;;;;;;eury4;indices;;1aa+&gt;1aa+dup;;différence;;
atgi;100;tct;;tat;;atgf;100;;fiches;41.778;;;fréquences;;;;;atgi;24;tct;;tat;;atgf;28
att;;act;;aat;;agt;;;total des aas sans rRNA;2632;;;0/0;1;;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgt;100;;avec;150;;;10;17;;;;ctt;;cct;;cat;;cgt;
gtt;;gct;;gat;;ggt;100;;genom;63;;;20;14;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;100;tcc;97;tac;100;tgc;75;;;;;;30;10;;;;ttc;2;tcc;2;tac;28;tgc;32
atc;99;acc;100;aac;100;agc;100;;archeo;46;;;40;3;;;;atc;20;acc;4;aac;19;agc;4
ctc;100;ccc;100;cac;100;cgc;;;sans;184;;;50;2;46;;;ctc;19;ccc;19;cac;26;cgc;2
gtc;100;gcc;100;gac;100;ggc;100;;avec;17;;;60;0;;;;gtc;19;gcc;1;gac;39;ggc;29
tta;100;tca;100;taa;;tga;100;;genom;4;;;70;0;;;;tta;29;tca;1;taa;;tga;50
ata;;aca;100;aaa;96;aga;100;;;;;;80;0;;;;ata;;aca;9;aaa;5;aga;3
cta;100;cca;100;caa;100;cga;100;;L’estimation par archeo;;;;90;0;;;;cta;27;cca;27;caa;13;cga;3
gta;100;gca;9;gaa;100;gga;100;;est  10% au dessus;;;;100;0;;;;gta;3;gca;100;gaa;12;gga;3
ttg;100;tcg;100;tag;;tgg;100;;des aas sans;;;;;1;;;;ttg;14;tcg;14;tag;;tgg;2
atgj;100;acg;100;aag;98;agg;100;;;;;;;48;;;;atgj;1;acg;17;aag;12;agg;15
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;96;;;;;;;;;;;ctg;12;ccg;36;cag;14;cgg;27
gtg;;gcg;;gag;100;ggg;100;;;;;;;;;;;gtg;9;gcg;11;gag;40;ggg;5
rapports;;89;;100;;100;96;;;;;;;;;;;diff;;301;;220;;311;832
&lt;/pre&gt;

==génomes synthèse==
===Les intercalaires entre cds d'un génome===
====Fréquences des intercalaires cds-cds, courbes puissance====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Fréquences_des_intercalaires_cds-cds,_courbes_puissance|puissance]]
*Puissance. Synthèse des fréquences cds-cds. Ordre classe
&lt;pre&gt;
;;Puissance 600;;;;;Puissance 1200;;;P1200-P600;
gen;cds;K6;'- a6;R2;K6 %0;;K12;'- a12;R2;k12/k6;a%
;;;;;;;;;;;
pub;1,307;19,910;&amp;1.63;89;&amp;15,233;;;;;;
ant;3,095;158,387;&amp;'''1.80;85;&amp;'''51,175;;;;;;
abra;1,667;17,186;&amp;1.41;81;10,310;;;;;;
pmg;1,800;48,983;&amp;1.62;85;&amp;27,213;;;;;;
mja;1,729;25,564;&amp;1.45;81;&amp;14,777;;;;;;
fin rang faible;;;1.00;;2,121;;;;;5.0;1
rang moyen;;;1.18;;4,599;;;;;9.9;16
;;;1.33;;12,201;;;;;17.6;31
rru;3,786;46,193;&amp;1.4;73;12,201;;157,774;1.66;79;3.4;16
eco;4,024;64,507;&amp;1.46;74;&amp;16,031;;;;;;
cvi;4,282;5,941;&amp;1.42;79;1,387;;272,330;1.76;85;&amp;'''45.8;19
ade;4,464;83,541;&amp;1.51;81;&amp;18,714;;344,171;1.81;86;4.1;17
bsu;4,213;110,979;&amp;1.58;79;&amp;26,323;;;;;;
cbn;2,491;24,707;1.33;74;9,919;;;;;;
afn;2,038;16,580;1.32;74;8,131;;;;;;
ase;8,197;38,168;1.20;82;4,656;;537,079;1.74;84;14.1;31
scc;1,805;13,461;1.30;77;7,458;;;;;;
Début rang fort;;;1.40;;14,777;;;;;30.0;39
rtb;793;1,117;°0.97;68;°1,409;;1,119;0.98;75;°'''1.0;°'''1
spl;4,213;6,234;°0.93;79;°1,480;;109,920;1.52;79;17.6;&amp;39
pmq;7,223;15,320;°1.00;72;°2,121;;459,123;1.70;80;&amp;30.0;&amp;41
cbei;5,623;3,288;°0.73;79;°585;;111,913;1.45;75;&amp;34.0;&amp;50
blo;1,772;8,149;1.18;71;4,599;;;;;;
myr;3,555;19,289;1.22;87;5,426;;97,139;1.55;87;°5.0;21
mba;3,943;561;°'''0.47;80;°'''142;;5,558;0.93;71;9.9;&amp;49
&lt;/pre&gt;
*Puissance. Synthèse des fréquences cds-cds. Ordre pente a37
&lt;pre&gt;
;;Puissance 600;;;;;Puissance 1200;;;P1200-P600;
gen;cds;K;-a;R2;K %;;K;-a;R2;k12/k6;a%
pub;1 307;19 910;&amp;1,63;89;&amp;15 233;;;;;;
rtb;793;1 117;°0,97;68;°1 409;;1 119;0,98;75;°1,0;°1
rru;3 786;46 193;&amp;1,40;73;12 201;;157 774;1,66;79;°3,4;16
;;;;;;;;;;;
eco;4 024;64 507;&amp;1,46;74;&amp;16 031;;;;;;
spl;4 213;6 234;°0,93;79;°1 480;;109 920;1,52;79;17,6;&amp;39
;;;;;;;;;;;
bsu;4 216;110 979;&amp;1,58;79;&amp;26 323;;;;;;
pmq;7 223;15 320;°1,00;72;°2 121;;459 123;1,70;80;&amp;30,0;&amp;41
;;;;;;;;;;;
cbn;2 491;24 707;1,33;74;9 919;;;;;;
cbei;5 623;3 288;°0,73;79;°585;;111 913;1,45;75;&amp;34,0;&amp;50
;;;;;;;;;;;
ase;8 197;38 168;1,20;82;4 656;;537 079;1,74;84;14,1;31
blo;1 772;8 149;1,18;71;4 599;;;;;;
;;;;;;;;;;;
myr;3 555;19 289;1,22;87;5 426;;97 139;1,55;87;°5,0;21
pmg;1 800;48 983;&amp;1,62;85;&amp;27 213;;;;;;
abra;1 667;17 186;&amp;1,41;81;10 310;;;;;;
cvi;4 282;5 941;&amp;1,42;79;°1 387;;272 330;1,76;85;&amp;45,8;19
ade;4 464;83 541;&amp;1,51;81;&amp;18 714;;344 171;1,81;86;°4,1;17
ant;3 095;158 387;&amp;1,80;85;&amp;51 175;;;;;;
afn;2 039;16 580;1,32;74;8 131;;;;;;
scc;1 805;13 461;1,30;77;7 458;;;;;;
mja;1 730;25 564;&amp;1,45;81;&amp;14 777;;;;;;
mba;3 943;561;°0,47;80;°142;;5 558;0,93;71;9,9;&amp;49
&lt;/pre&gt;

====Fréquences des intercalaires cds-cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Fréquences_des_intercalaires_cds-cds|cds-cds]]
&lt;pre&gt;
génome;nombre cds;intercalaires;200;rapport;26-370;;;total;;;;;;;;génome;;;;;;;
gen;n-cds;inter%;moy;rap;a37;b37;R2;cds;&lt;0;100;200;370;600;max;freq5;gen;&lt;0;100;200;370;600;max;freq5
pub;1,343;3.0;37;14;5.93;17.15;63;1307;473;720;87;19;7;1;365;pub;362;551;67;15;5;1;''438
rtb;828;20.2;85;109;3.05;11.85;58;793;102;248;187;84;52;120;396;rtb;129;313;236;106;66;151;''573
rru;3,854;9.9;78;89;18.99;71.15;91;3786;683;1546;835;535;139;48;2 289;rru;180;408;221;141;37;13;'''738
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
eco;4,285;9.1;72;76;20.08;74.15;88;4024;738;1730;810;572;142;32;2 346;eco;183;430;201;142;35;8;714
spl;4,269;14.1;82;105;17.06;72.54;76;4213;426;1561;905;776;378;167;2 651;spl;101;371;215;184;90;40;700
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
bsu;4,325;9.5;72;64;29.29;'''96.38;81;4213;608;2086;971;412;118;18;2 606;bsu;144;495;230;98;28;4;'''723
pmq;7,258;13.8;88;130;28.46;'''126.75;90;7223;795;2448;1722;1520;506;232;4 818;pmq;110;339;238;210;70;32;'''750
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cbn;2,521;11.3;71;79;14.59;53.49;82;2491;176;1201;577;394;117;26;1 678;cbn;71;482;232;158;47;10;'''725
cbei;5,665;17.9;83;136;14.71;'''79.19;83;5622;400;1788;1188;1240;713;293;3 434;cbei;71;318;211;221;127;52;658
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ase;8,256;11.5;76;79;43.46;'''155.74;88;8197;1652;3299;1568;1047;399;232;4 749;ase;202;402;191;128;49;28;'''726
blo;1,824;10.6;88;116;9.53;36.46;78;1772;228;661;483;281;85;34;1 201;blo;129;373;273;159;48;19;'''778
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
myr;3,611;12.2;67;63;19.62;69.35;84;3555;302;1780;681;440;202;150;2 078;myr;85;501;192;124;57;42;639
pmg;1,839;8.5;55;35;11.99;37.52;76;1800;253;1104;267;120;42;14;935;pmg;141;613;148;67;23;8;''604
abra;1,712;7.2;65;57;8.52;28.44;82;1667;417;757;311;121;42;19;787;abra;250;454;187;73;25;11;630
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cvi;4,345;9.5;74;67;26.50;'''89.98;78;4282;756;1984;873;455;147;67;2 551;cvi;177;463;204;106;34;16;'''723
ade;4,506;8.5;70;66;25.60;'''87.68;90;4464;815;2097;919;464;124;45;2 517;ade;183;470;206;104;28;10;690
ant;3,119;6.0;56;38;16.12;51.22;81;3095;762;1651;474;150;33;25;1 309;ant;246;533;153;48;11;8;''561
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
afn;2,093;9.5;66;75;8.68;33.73;77;2038;307;934;401;304;69;23;1 128;afn;151;458;197;149;34;11;652
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
scc;1,847;8.8;69;72;8.68;31.86;82;1805;347;793;327;241;78;19;1 001;scc;192;439;181;134;43;11;687
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
mja;1,768;9.1;64;53;9.96;33.76;80;1729;219;956;340;166;36;12;955;mja;127;553;197;96;20;7;632
mba;3,995;26.7;85;154;5.54;38.77;46;3943;329;900;600;782;643;689;1 911;mba;83;228;152;198;163;175;''529
rang;X1 000;;;;;;;;;;;;;;;rang;;;;;;;
faible;1350-2500;3-7;37-55;14-64;3-6;12-17;46-63;;;;;;;;;faible;70-100;230-375;65-150;15-70;5-25;4-15;438-604
moyen;3100-4500;8.5 -11.5;64-72;66-109;9-17;28-74;76-84;;;;;;;;;moyen;110-180;400-500;180-210;100-150;30-60;20-50;630-714
fort;5700-8300;12-27;78-88;116-154;19-43;79-156;88-91;;;;;;;;;fort;190-360;530-610;220-270;160-220;70-160;150-175;723-778
effectif;9   9   3;3  12  6;3  11  7;7  10  4;3  10  8;2  13  6;3  13  5;;;;;;;;;effectif;5  11  5;6  11  4;4  11  6;4  11  6;5  11  5;13  6  2; 5  9  7
&lt;/pre&gt;

====Classement des génomes cds-cds====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Classement_des_génomes_cds-cds|Classement]]
&lt;pre&gt;
gen;n-cds;%;moy;rap;a37;R2;;&lt;0;100;200;370;600;max
'''pub;1m;''3;''37;''14;''5.93;''63;;'''362;'''551;''67;''15;''5;''1
'''ant;3m;''6;''56;''38;°16.12;°81;;'''246;'''533;''153;''48;''11;''8
'''abra;2m;''7;&lt;u&gt;65;''57;''8.52;°82;;'''250;°454;°187;''73;''25;&lt;u&gt;11
'''pmg;2m;&lt;u&gt;8,5;''55;''35;&lt;u&gt;11.99;°76;;°141;'''613;''148;''67;''23;''8
'''mja;2m;°9;&lt;u&gt;64;''53;''9.96;°80;;°127;'''553;°197;°96;''20;''7
;;;;;;;;;;;;;
fin rang faible;;''7,2;''56;''64;''10;''63;;''101;''375;''153;''73;''25;''8
;;;;;;;;;;;;;
rang moyen;;8.5;64;66;12;76;;110;402;181;96;28;10
;;11.5;72;109;20;84;;183;502;211;149;57;16
;;;;;;;;;;;;;
'''rru;4M;°10;&lt;u&gt;'''78;°89;°18.99;'''91;;°180;°408;&lt;u&gt;'''221;°141;°37;°13
'''eco;4M;°9;°72;°76;°20.08;'''88;;°183;°430;°201;°142;°35;&lt;u&gt;''8
'''cvi;4M;°9,5;°74;°67;'''26.50;°78;;°177;°463;°204;°106;°34;°16
'''ade;4M;°8,5;°70;°66;'''25.60;'''90;;°183;°470;°206;°104;°28;°10
'''bsu;4M;°9,5;°72;&lt;u&gt;''64;'''29.29;°81;;°144;°495;&lt;u&gt;'''230;°98;°28;''4
'''cbn;2m;°11;°71;°79;°14.59;°82;;''71;°482;&lt;u&gt;'''232;&lt;u&gt;'''158;°47;°10
'''afn;2m;°9,5;°66;°75;''8.68;°77;;°151;°458;°197;°149;°34;°11
'''ase;'''8M;°11,5;°76;°79;'''43.46;'''88;;'''202;°402;°191;°128;°49;'''28
'''scc;2m;°9;°69;°72;''8.68;°82;;&lt;u&gt;'''192;°439;°181;°134;°43;°11
;;;;;;;;;;;;;
Début rang fort;;'''12,2;'''78;'''116;'''25.6;'''88;;'''192;'''533;'''221;'''158;'''66;'''19
;;;;;;;;;;;;;
'''rtb;1m;'''20;'''85;&lt;u&gt;109;''3.05;''58;;°129;''313;'''236;°106;'''66;'''151
'''spl;4M;'''14;'''82;&lt;u&gt;105;°17.06;°76;;''101;''371;&lt;u&gt;215;'''184;'''90;'''40
&amp;'''pmq;'''7M;'''14;'''88;'''130;'''28.46;'''90;;&lt;u&gt;110;''339;'''238;'''210;'''70;'''32
&amp;'''cbei;'''6M;'''18;'''83;'''136;°14.71;°83;;''71;''318;&lt;u&gt;211;'''221;'''127;'''52
'''blo;2m;&lt;u&gt;11;'''88;'''116;''9.53;°78;;°129;''373;'''273;'''159;°48;'''19
'''myr;4M;'''12;°67;''63;°19.62;°84;;''85;°501;°192;°124;&lt;u&gt;57;'''42
&amp;'''mba;4M;'''27;'''85;'''154;''5.54;''46;;''83;''228;''152;'''198;'''163;'''175
&lt;/pre&gt;

====Les intercalaires tRNAs-cds====
=====comparaison continu-discontinu=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#comparaison_continu-discontinu|comparaison continu-discontinu]]
*Total des nuls cds-cds
&lt;pre&gt;
gen;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl;total
nuls;13;29;11;65;35;3;27;19;11;15;29;22;21;18;46;31;71;13;5;8;18;510
&lt;/pre&gt;
*tableau
&lt;pre&gt;
;détail;tRNA-cds positifs;;;;ensemble;cds-cds négatifs;;;;
gen;deb;fin;deb’;fin’;total;cds;&lt;0;reste32;reste32%;comp’/&lt;0%;min’-min%
abra;7;12;5;4;41;1 667;417;20;4,8;1,4;117
ade;20;16;7;9;69;4 464;815;40;4,9;11,9;6
afn;20;17;2;5;53;2 038;307;21;6,8;1,3;31
ant;11;12;4;1;34;3 095;762;17;2,2;10,9;11
ase;18;16;12;12;101;8 197;1 652;128;7,7;19,3;1
blo;15;15;5;6;78;1 772;228;8;3,5;7,0;17
bsu;3;5;7;5;28;4 213;608;52;8,6;3,9;182
cbei;9;5;4;1;47;5 622;400;24;6,0;2,8;59
cbn;12;12;2;2;40;2 491;176;6;3,4;4,5;54
cvi;22;20;7;9;78;4 282;756;26;3,4;8,2;5
eco;10;11;5;7;65;4 024;738;55;7,5;12,3;107
mba;9;8;7;4;90;3 943;329;26;7,9;5,5;23
mja;6;15;8;1;43;1 729;219;17;7,8;24,2;29
myr;18;15;12;10;79;3 555;302;12;4,0;6,6;37
pmg;16;17;13;8;67;1 800;253;12;4,7;36,0;3
pmq;8;11;2;5;42;7 223;795;52;6,5;4,3;45
pub;13;14;11;11;50;1 307;473;14;3,0;19,0;41
rru;15;18;10;11;83;3 786;683;32;4,7;10,1;12
rtb;9;12;0;2;56;793;102;7;6,9;2,9;35
scc;13;8;11;5;67;1 805;347;14;4,0;7,8;47
spl;9;9;4;3;62;4 213;426;10;2,3;2,8;61
total;263;268;138;121;1273;72 023;10 788;593;5,5;11,8;
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
10,6,21;con;;cds-cds négatifs continus;;;;;comp’;cds-cds négatifs discontinus;;
gen;total;min;con1;con4;c1/c4;reste50;reste50 %;total;min;reste50;reste50 %
abra;411;-92;68;142;0,48;13;3,2;6;-24;0;
ade;718;-109;70;540;0,13;10;1,4;97;-116;14;14,4
afn;303;-113;38;129;0,29;9;3,0;4;-83;1;25,0
ant;679;-71;164;221;0,74;6;0,9;83;-79;1;1,2
ase;1333;-119;168;892;0,19;32;2,4;319;-120;49;15,4
blo;212;-86;52;109;0,48;2;0,9;16;-102;2;12,5
bsu;578;-7 616;72;233;0,31;17;2,9;30;-361;7;23,3
cbei;389;-110;71;82;0,87;4;1,0;11;-60;1;9,1
cbn;168;-47;34;28;1,21;0;;8;-27;0;
cvi;694;-97;118;377;0,31;4;0,6;62;-102;6;9,7
eco;647;-2 400;163;261;0,62;22;3,4;91;-723;11;12,1
mba;311;-59;33;119;0,28;7;2,3;18;-74;2;11,1
mja;166;-83;25;52;0,48;7;4,2;53;-62;0;
myr;282;-47;71;60;1,18;0;;20;-68;1;5,0
pmg;162;-65;36;72;0,50;2;1,2;91;-67;2;2,2
pmq;761;-119;80;387;0,21;17;2,2;34;-75;4;11,8
pub;383;-65;152;81;1,88;3;0,8;90;-43;0;
rru;614;-137;81;396;0,20;13;2,1;69;-122;7;10,1
rtb;99;-50;10;33;0,30;0;;3;-35;0;
scc;320;-74;39;156;0,25;6;1,9;27;-120;1;3,7
spl;414;-98;126;136;0,93;5;1,2;12;-52;1;8,3
total;9 644;;1 671;4 506;0,37;179;1,9;1 144;;110;9,6
&lt;/pre&gt;

=====Rareté des tRNA-cds négatifs et petits positifs=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Rareté_des_tRNA-cds_négatifs_et_petits_positifs|Rareté des tRNA-cds négatifs et petits positifs]]
*Total des '''tRNAs-cds des 22 génomes''' qui regroupent 11 négatifs: Ci-dessous le total des blocs de tRNAs sans rRNAs (ligne &quot;opérons sans&quot; dans &quot;genome.opérons&quot;). Multiplié par 2 il donne le total des tRNA-cds sans les tRNAs-cds des blocs avec rRNA. J'ai estimé le total de ces derniers à 5% des 1ers. Donc le total des tRNA-cds estimé pour ces 22 génomes est de 1340 + 67 = 1407.
&lt;pre&gt;
tRNA-cds;ecoN;vha;amed;rpl;rpm;oan;abq;abs;agr;aua;ppm;lbu;ban;psor;cdc;cdc;hmo;fps;npu;apal;mfi;mfe;total
opérons;50;27;38;29;47;45;51;51;38;38;29;23;9;8;5;6;24;26;43;14;29;40;670
&lt;/pre&gt;
*'''Tableau'''
&lt;pre&gt;
tRNA-cds négatifs;;;
genome;adresse;tRNA;inter
Intercalaire continu nc;;;
vha chr2;1842556;ctc;-36
amed;779541;caa;-21
oan;1945985;aag;-38
oan;34057;gcc;-40
ppm plasm;7953;gac;-24
hmo;2497882;gtg;-10
mfi;314088;caa;-1
pmg;1600898;gta;-30
blo;207388;tgg;-17
Intercalaire discontinu xc comp’;;;
rpm;1941413;agc;-30
oan;1639492;atgj;-44
aua;1350534;cgt;-30
npu;3439846;gca;-19
mba;1315521;cgc;-12
spl;552630;tga*;-23
myr;1926118;tta;-38
ase;1249593;aag;-12
blo;440078;aac;-39
blo;1424907;gag;-8
total;;19;

cds-cds;cds 40;tRNA-cds;;;;;;
gen;S40%;total;R40;R40%;taux;Rc+;Rx+;
abra;&amp;37,3;41;2;4,9;&amp;7,6;2;;
ade;32,6;69;8;11,6;2,8;7;1;
afn;&amp;35,8;53;4;7,5;4,7;4;;
ant;&amp;45,1;34;5;14,7;3,1;3;2;
ase;23,9;100;14;14,0;1,7;11;3;
blo;19,1;75;1;1,3;&amp;14,4;1;;
bsu;34,6;28;0;0;&amp;'''9,7;;;
cbei;19,0;47;3;6,4;3,0;1;2;
cbn;29,3;40;0;0;&amp;'''11,7;;;
cvi;26,9;78;8;10,3;2,6;8;;
eco;29,1;65;4;6,2;4,7;1;3;
mba;°13,3;88;4;4,5;2,9;2;2;
mja;&amp;39,4;43;5;11,6;3,4;5;;
myr;30,8;78;7;9,0;3,4;5;2;
pmg;&amp;42,9;65;11;16,9;2,5;8;3;
pmq;19,1;42;1;2,4;&amp;8,0;1;;
pub;&amp;'''59,6;48;27;'''56,3;°'''1,1;18;9;
rru;26,1;83;3;3,6;&amp;7,2;1;3;
rtb;20,3;56;6;10,7;1,9;6;;
scc;31,0;67;4;6,0;5,2;2;2;
spl;20,0;61;1;1,6;&amp;12,2;;1;
total;27,1;1261;118;9,4;2,9;86;33;
;;;;;;;;
;27±7;;;;3,4±1,7;;Rx+%;% 27,7
&lt;/pre&gt;

=====Les cds-cds positif-négatif=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_cds-cds_positif-négatif|Les cds-cds positif-négatif]]
&lt;pre&gt;
taux de 1-40;;;;;;;;
gen;&lt;0 %;&lt;1;reste;total;1-40;&gt;0;1-40 %;1-32 %
abra;;430;776;1 667;461;1237;37;95
ade;18;844;2440;4464;1180;3620;33;95
afn;15;318;1104;2038;616;1720;36;93
ant;25;827;1246;3095;1022;2268;45;98
ase;20;1687;4956;8197;1554;6510;24;92
blo;13;231;1246;1772;295;1541;19;97
bsu;14;635;2341;4213;1237;3578;35;91
cbei;7;419;4214;5622;989;5203;19;94
cbn;7;187;1628;2491;676;2304;29;97
cvi;18;771;2566;4282;945;3511;27;97
eco;18;767;2310;4024;947;3257;29;93
mba;8;351;3113;3943;479;3592;13;92
mja;13;240;903;1730;587;1490;39;92
myr;9;320;2239;3555;996;3235;31;96
pmg;14;298;857;1800;645;1502;43;95
pmq;11;826;5173;7223;1224;6397;19;94
pub;36;544;308;1307;455;763;60;97
rru;18;696;2285;3786;805;3090;26;95
rtb;13;107;547;793;139;686;20;93
scc;19;355;1001;1805;449;1450;31;96
spl;10;444;3017;4213;752;3769;20;98
total;;11297;;72019;16453;60722;27;94,5
écart;;;;;;;27±7;95±3

22.2.22;génomes. Les intercalaires cds-cds, continu – discontinu;;;;;;;;;;;;
lien a;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_autres_intercalaires|abra]];;;;;;;;;;22.2.22;;
lien S;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/Atableur#abra_intercalaires_positifs_S+|abra]];;;;;;;;;;;;
lien a;total;nc;ac;ax;lien S;Sc-;Sx-;Sx-%;Sc+;Sx+;Sx+%;S-%;total S
abra;1795;37;78;13;abra;409;8;°1.9;979;271;°22;&amp;25;1667
ade;4569;22;57;26;ade;713;102;12.5;2339;1310;&amp;36;18;4464
afn;2192;44;88;22;afn;303;4;°1.3;1385;346;20;15;2038
ant;3190;47;37;11;ant;679;83;10.9;1702;631;27;&amp;25;3095
ase;8380;65;69;49;ase;1300;352;21.3;3866;2679;&amp;41;20;8197
blo;1900;24;71;33;blo;210;18;7.9;1045;499;32;13;1772
bsu;4537;&amp;99;&amp;205;20;bsu;573;35;5.8;2515;1090;30;14;4213
cbei;5814;&amp;106;68;18;cbei;390;10;°2.5;4010;1212;23;°7;5622
cbn;2638;87;45;15;cbn;167;9;5.1;1773;542;°23;°7;2491
cvi;4487;79;85;41;cvi;687;69;9.1;2424;1102;31;18;4282
eco;4700;65;&amp;580;31;eco;644;94;12.7;2211;1075;33;18;4024
mba;4071;22;54;52;mba;307;22;6.7;2381;1233;34;°8;3943
mja;1828;21;41;37;mja;163;56;&amp;25.6;1071;439;29;13;1729
myr;3754;87;69;43;myr;282;20;6.6;2274;979;30;°8;3555
pmg;1884;v5;45;34;pmg;158;95;&amp;37.5;950;597;&amp;39;14;1800
pmq;7479;&amp;185;51;20;pmq;753;42;5.3;4543;1885;29;11;7223
pub;1386;°7;44;28;pub;381;92;19.5;599;235;28;&amp;36;1307
rru;3946;23;79;58;rru;614;69;10.1;2140;963;31;18;3786
rtb;868;°5;51;19;rtb;98;4;°3.9;506;185;27;13;793
scc;1909;20;47;37;scc;319;28;8.1;1001;457;31;19;1805
spl;4466;&amp;141;70;42;spl;414;12;°2.8;2486;1301;34;10;4213
total;75793;1191;1934;649;;9564;1224;11.3;42200;19031;31;15;72019
écart;;;;;;;;10±9;;;30±5;16±7;

tRNA-cds continu-discontinu;;;
gen;nc+;  xc+;xc+%
abra;31;10;24
ade;47;22;32
afn;43;10;19
ant;29;5;15
ase*;60;41;41
blo*;52;26;33
bsu;12;16;57
cbei;35;12;26
cbn;30;10;25
cvi;52;26;33
eco;37;28;43
mba;48;42;47
mja;25;18;42
myr*;48;31;39
pmg*;41;26;39
pmq;27;15;36
pub;28;22;44
rru;49;34;41
rtb;40;16;29
scc;35;32;48
spl*;39;23;37
total;808;465;37
écart;;;37±7
&lt;/pre&gt;

=====comparaison cds-cds et tRNA-cds=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#comparaison_cds-cds_et_tRNA-cds|comparaison cds-cds et tRNA-cds]]
&lt;pre&gt;
;caractéristiques;;;;;;petit;;grand;
gen;p;cds;tRNAs;petit;grand;&lt;0;inf;sup;inf;sup
abra;0,854;1712;40;27;13;;-8,87;-6.14;-2.37;5.57
ant;0,911;3119;32;16;10;;-0,84;0,58;0,27;6,28
mja;0,858;1768;42;19;10;;0,28;2,87;1,41;9,49
pmg;0,886;1839;66;31;20;1;-0,69;1,86;0,49;9,78
pub;0,866;1343;50;25;17;;-1,78;0,88;-2,60;6,07
;;;;;;;;;;
ade;0,827;4506;68;30;21;;0,98;4,97;-3,20;7,65
afn;0,771;2093;52;26;17;;-3,63;0,91;-6,54;3,48
ase;0,744;8256;100;39;17;1;3,31;10,25;3,14;17,06
bsu;0,848;4325;26;11;8;;0,62;2,78;-1,88;4,59
cbn;0,768;2521;34;13;8;;1,22;4,95;-2,03;6,08
cvi;0,810;4345;78;38;20;;-2,73;1,92;-0,33;11,54
eco;0,773;4285;56;20;7;;4,22;8,90;4,54;14,92
rru;0,767;3854;80;39;15;;-4,03;1,70;2,33;14,78
spl;0,651;4269;60;19;5;1;2,95;9,99;1,97;12,62
;;;;;;;;;;
blo;0,741;1824;78;27;11;3;3,58;9,59;2,79;14,73
cbei;0,570;5665;40;13;5;;-0,17;6,77;-2,69;5,68
mba;0,415;3995;88;21;5;1;1,06;13,51;-2,54;7,36
myr;0,757;3611;78;35;18;1;-2,16;3,66;-2,35;9,85
pmq;0,649;7258;32;15;5;;-3,61;1,66;-2,22;5,68
rtb;0,630;828;56;18;5;;2,52;9,80;0,92;11,27
scc;0,768;1847;66;27;9;;1,64;6,82;4,82;16,12

;fréquence;;moyenne;;;;;pourcentage;;
gen;cds-cds;ADN;cds-cds;tRNA-cds;diff;grd;pet;grd%;pet%;taux
abra;1250;135857;109;224;115;358;91;'''229;20;'''2,5
ant;2333;192251;82;126;44;184;68;123;21;1,4
mja;1511;151580;100;148;48;203;94;102;7;1,1
pmg;1547;139122;90;128;38;196;61;118;47;1,5
pub;834;39179;47;51;4;86;16;83;'''201;1,5
;;;;;;;;;;
ade;3649;428947;118;164;46;225;102;92;16;1,1
afn;1732;220467;127;144;17;199;89;56;43;0,9
ase;6545;1063558;162;239;76;346;130;113;25;1,3
bsu;3607;401590;111;188;77;241;135;116;'''-18;0,9
cbn;2315;313764;136;181;45;234;127;73;7;'''0,8
cvi;3526;452650;128;178;50;270;86;111;49;1,4
eco;3286;421229;128;228;100;326;129;'''154;-1,0;1,5
rru;3103;429144;138;176;38;247;106;78;30;1,0
spl;3787;730981;'''193;'''358;165;'''484;'''228;'''151;'''-15;1,3
;;;;;;;;;;
blo;1544;240201;156;227;71;292;155;88;0,2;0,9
cbei;5223;1159420;222;262;40;346;178;56;25;'''0,8
mba;3614;1292909;'''358;'''437;79;'''618;'''252;73;42;1,0
myr;3253;507186;156;173;17;247;96;59;63;1,0
pmq;6428;1202544;187;201;14;275;127;47;47;'''0,8
rtb;691;224467;'''325;'''551;226;'''854;'''248;'''163;31;'''1,9
scc;1458;195310;134;217;83;293;141;118;'''-5;1,1
&lt;/pre&gt;

=====Les intercalaires tRNAs-cds sans cds-cds=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les intercalaires_tRNAs-cds_sans_cds-cds|Les intercalaires tRNAs-cds sans cds-cds]]
*'''Le tableau'''
&lt;pre&gt;
;&lt;201 sans -;pub;afn;cvi;'''pmq;'''myr;'''mba;'''cbei;total ok;'''classe 3
;p;0,866;0,771;0,810;0,649;0,757;0,415;0,570;;
genome;cds;1 343;2 093;4 345;7 258;3 611;3 995;5 665;;
vha;5 432;*;*;*;*;*;ok;ok;2;&quot;
amed;4 285;*;*;*;ok;*;*;ok;2;&quot;
ecoN;5 157;*;*;*;*;*;ok;*;1;&quot;
rpm;3 484;*;ok;*;ok;ok;*;*;3;
oan;4 900;*;*;*;*-;*;*;ok;1;&quot;
abq;6 576;*;*;*;ok;*;*;ok;2;&quot;
abs;6 817;*;*;*;ok;ok;*;ok;3;&quot;
agr;5 159;*;*;*;*-;*;*;ok;1;&quot;
aua;4 721;*;*;*;*;*;ok;ok;2;&quot;
rpl;850;*;*;*;*;*;ok;ok;2;&quot;
ppm;5 384;*;*;*;*;*;ok;ok;2;&quot;
lbu;1 838;*;ok;ok;ok;ok;*;ok;5;
ban;5 700;*;*-;*;ok;*-;ok;ok;3;&quot;
psor;3 368;*-;ok;ok;ok;ok;*-;ok;5;
cdc;3 614;*;ok;*-;ok;ok;ok;ok;5; 
hmo;2 707;*;*-;*;ok;ok;*;ok;3;&quot;
fps;2 478;*-;ok;ok;ok;ok;*;*;4;
npu;7 484;*;*;*;*;*;*;ok;1;&quot;
apal;1 453;ok;ok;ok;ok;ok;*;*;5;
mfi;3 381;*;*;*;ok;*;ok;ok;3;&quot;
mfe;2 374;*;*;*;*;*;ok;*;1;&quot;
;total ok;1;6;4;12;8;9;16;;
&lt;/pre&gt;
*'''Les résultats'''
&lt;pre&gt;
cvi;-2,73;1,92;;-0,33;11,54;;pmq;-3,6;1,7;;-2,2;5,7;;mba;1,1;13,5;;-3,5;6,4;;afn;-3,6;0,9;;-6,5;3,5
vha;5,2;9,0;;7,2;16,9;;vha;1,4;8,1;;0,9;11,0;;vha;-5,7;3,9;;-4,4;3,3;;vha;4,4;8,9;;5,5;15,5
amed;1,4;5,9;;7,5;19,1;;amed;-3,6;4,4;;-1,4;10,6;;amed;-13,4;-1,9;;-9,2;0,0;;amed;0,4;5,8;;5,0;17,0
ecoN;12,6;17,8;;12,1;25,5;;ecoN;6,2;15,5;;0,1;14,0;;ecoN;-6,8;6,6;;-10,7;0,0;;ecoN;11,2;17,5;;8,8;22,7
rpm;-3,1;1,9;;1,6;14,2;;rpm;-8,8;-0,1;;-9,0;4,1;;rpm;-20,3;-7,8;;-18,4;-8,4;;rpm;-4,3;1,7;;-1,3;11,7
oan;6,1;10,9;;7,4;19,7;;oan;0,6;9,1;;-2,7;10,1;;oan;-10,5;1,8;;-11,7;-1,9;;oan;4,9;10,7;;4,6;17,4
abq;0,7;5,9;;6,9;20,1;;abq;-5,5;3,6;;-4,6;9,0;;abq;-18,0;-4,8;;-15,0;-4,5;;abq;-0,6;5,6;;3,8;17,4
abs;1,4;6,8;;4,3;18,0;;abs;-5,2;4,3;;-8,2;6,0;;abs;-18,6;-5,0;;-19,5;-8,6;;abs;0,1;6,5;;0,9;15,0
agr;5,3;9,9;;6,1;17,8;;agr;0,3;8,4;;-3,1;9,1;;agr;-9,9;1,8;;-11,1;-1,8;;agr;4,3;9,8;;3,6;15,7
aua;7,3;11,9;;8,7;20,5;;aua;2,1;10,3;;-0,8;11,6;;aua;-8,3;3,6;;-9,0;0,4;;aua;6,2;11,7;;6,1;18,3
rpl;6,0;10,0;;8,4;18,4;;rpl;2,1;9,0;;1,6;12,0;;rpl;-5,6;4,4;;-4,2;3,8;;rpl;5,2;9,9;;6,5;16,9
ppm;5,0;9,0;;7,4;17,4;;ppm;1,1;8,0;;0,6;11,0;;ppm;-6,6;3,4;;-5,2;2,8;;ppm;4,2;8,9;;5,5;15,9
lbu;-0,6;3,0;;-0,5;8,7;;lbu;-4,0;2,3;;-6,1;3,4;;lbu;-10,4;-1,3;;-10,7;-3,4;;lbu;-1,3;2,9;;-2,0;7,4
ban;0,7;2,8;;0,6;5,9;;ban;-0,8;2,9;;-1,4;4,2;;ban;-3,4;1,9;;-2,8;1,5;;ban;0,3;2,8;;0,0;5,5
psor;-0,4;1,8;;-0,9;4,8;;psor;-2,1;1,9;;-3,2;2,7;;psor;-4,9;0,8;;-4,7;-0,2;;psor;-0,8;1,9;;-1,6;4,3
cdc;0,0;1,7;;0,2;4,4;;cdc;-1,1;1,9;;-1,1;3,3;;cdc;-2,8;1,4;;-1,8;1,6;;cdc;-0,3;1,7;;-0,2;4,2
hmo;0,5;4,0;;2,0;10,9;;hmo;-2,8;3,4;;-3,4;5,9;;hmo;-9,0;-0,1;;-7,8;-0,7;;hmo;-0,2;3,9;;0,5;9,7
fps;-1,9;2,0;;-2,2;7,7;;fps;-5,7;1,1;;-8,8;1,5;;fps;-13,2;-3,3;;-14,3;-6,4;;fps;-2,7;1,9;;-4,0;6,2
npu;-0,9;3,9;;11,4;23,7;;npu;-6,4;2,1;;1,3;14,1;;npu;-17,5;-5,2;;-7,7;2,1;;npu;-2,1;3,7;;8,6;21,4
apal;-1,8;0,9;;-3,9;3,0;;apal;-4,0;0,8;;-7,1;0,0;;apal;-7,9;-1,0;;-9,5;-4,0;;apal;-2,3;0,9;;-4,8;2,3
mfi;2,0;6,0;;4,4;14,4;;mfi;-1,9;5,0;;-2,4;8,0;;mfi;-9,6;0,4;;-8,2;-0,2;;mfi;1,2;5,9;;2,5;12,9
mfe;14,3;18,9;;14,7;26,5;;mfe;9,1;17,3;;5,2;17,6;;mfe;-1,3;10,6;;-3,0;6,4;;mfe;13,2;18,7;;12,1;24,3
**;;;;;;;**;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
rru;-2,8;1,9;;5,3;17,3;;mba;12,4;21,0;;5,6;18,6;;myr;-1,3;4,6;;-1,9;10,5;;cbei;-0,2;6,8;;-2,7;5,7
bsu;0,2;2,9;;-2,9;4,0;;pmq;-3,6;1,7;;-2,2;5,7;;vha;4,1;8,9;;4,8;14,9;;vha;-0,8;7,2;;-1,3;8,2
eco;14,3;18,9;;14,7;26,5;;cbei;1,6;7,5;;-1,0;7,8;;amed;-0,1;5,7;;4,2;16,2;;amed;-6,6;2,9;;-4,7;6,7
cvi;-2,73;1,92;;-0,33;11,54;;spl;2,9;10,0;;1,9;12,5;;ecoN;10,7;17,4;;7,6;21,6;;ecoN;2,3;13,2;;-4,4;8,9
ade;0,6;4,9;;-4,2;6,9;;myr;-4,9;3,3;;-7,8;4,6;;rpm;-4,7;1,5;;-2,4;10,7;;rpm;;;;;
cbn;1,9;4,9;;-0,8;7,1;;blo;0,6;8,5;;-1,8;10,1;;oan;4,4;10,6;;3,6;16,5;;oan;2,3;13,2;;-4,4;8,9
afn;-2,8;1,0;;-4,8;4,9;;rtb;;;;;;;abq;-1,1;5,4;;2,6;16,3;;abq;-9,3;1,5;;-8,9;4,1
scc;2,7;7,0;;7,2;18,1;;;;;;;;;abs;-0,5;6,3;;-0,4;13,9;;abs;-9,2;2,0;;-12,9;0,6
ase;6,6;11,8;;9,1;22,5;;cbei;-0,2;6,8;;-2,7;5,7;;agr;3,8;9,7;;2,6;14,8;;agr;-2,8;6,8;;-6,4;5,1
;;;;;;;pub;-8,5;-0,7;;-13,6;-4,2;;aua;5,7;11,6;;5,1;17,5;;aua;-1,1;8,6;;-4,2;7,5
pub;-1,78;0,88;;-2,60;6,07;;ant;-6,1;0,1;;-8,5;-1,1;;rpl;4,8;9,8;;5,8;16,3;;rpl;-0,3;7,9;;-0,9;9,0
vha;;;;;;;pmg;-9,3;-0,5;;-14,9;-4,3;;ppm;3,8;8,8;;4,8;15,3;;ppm;-1,3;6,9;;-1,9;8,0
amed;;;;;;;abra;-4,8;1,2;;-2,8;4,5;;lbu;-1,6;2,9;;-2,6;6,9;;lbu;-6,0;1,5;;-8,0;1,0
ecoN;;;;;;;mja;-5,4;1,7;;-7,5;1,1;;ban;0,2;2,9;;-0,2;5,4;;ban;-1,7;2,7;;-2,1;3,2
rpm;-1,6;2,0;;6,2;17,7;;;;;;;;;psor;-1,0;1,9;;-1,8;4,1;;psor;-3,0;1,7;;-3,9;1,7
oan;;;;;;;rru;-11,3;-1,5;;-7,9;3,9;;cdc;-0,4;1,8;;-0,4;4,1;;cdc;-1,7;1,8;;-1,5;2,7
abq;;;;;;;bsu;-3,2;2,4;;-7,2;-0,4;;hmo;-0,5;3,9;;0,0;9,2;;hmo;-4,7;2,6;;-5,2;3,5
abs;;;;;;;eco;5,9;15,6;;1,8;13,5;;fps;-3,1;1,9;;-4,7;5,6;;fps;-8,0;0,0;;-11,1;-1,4
agr;;;;;;;cvi;-11,1;-1,4;;-13,2;-1,5;;npu;-2,6;3,6;;7,6;20,5;;npu;-9,8;0,3;;-2,4;9,7
aua;;;;;;;ade;-6,8;2,2;;-15,4;-4,5;;apal;-2,5;0,9;;-5,1;2,0;;apal;-5,2;0,4;;-8,2;-1,4
rpl;;;;;;;cbn;-2,3;4,1;;-6,3;1,4;;mfi;0,8;5,8;;1,8;12,3;;mfi;-4,3;3,9;;-4,9;5,0
ppm;;;;;;;afn;-8,8;-0,8;;-13,3;-3,8;;mfe;12,7;18,6;;11,1;23,5;;mfe;;;;;
lbu;;;;;;;scc;-4,6;4,4;;-3,7;7,1;;;;;;;;;;;;;;
ban;;;;;;;ase;-3,7;7,2;;-7,4;5,9;;;;;;;;;;;;;;
psor;0,0;1,6;;0,1;5,3;;**;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cdc;;;;;;;mba;9,0;19,1;;1,8;14,1;;;;;;;;;;;;;;
hmo;;;;;;;pmq;-5,1;1,1;;-3,5;3,9;;;;;;;;;;;;;;
fps;-0,9;1,9;;0,7;9,7;;cbei;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
npu;;;;;;;spl;1,2;9,7;;-0,4;9,9;;;;;;;;;;;;;;
apal;-1,2;0,7;;-2,4;3,9;;myr;-8,1;1,6;;-11,2;0,5;;;;;;;;;;;;;;
mfi;;;;;;;blo;-2,3;7,0;;-4,9;6,3;;;;;;;;;;;;;;
mfe;;;;;;;rtb;0,7;8,9;;-0,9;9,0;;;;;;;;;;;;;;
**;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ant;-1,4;0,8;;-1,5;5,5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
pmg;-1,1;1,9;;-0,9;8,9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
abra;-0,3;1,8;;3,9;10,6;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
mja;0,4;2,8;;1,8;9,7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
afn;-1,8;0,9;;-1,9;6,9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
*'''Les génomes et leurs tRNAs, petit grand'''
&lt;pre&gt;
test;vha;amed;ecoN;rpm;oan;abq;abs;agr;aua;apal;
cds;5,432;4 285;5 157;3 484;4 900;6 576;6 817;5 159;4 721;1 453;
petit;18;32;33;43;32;43;46;29;28;13;
grand;5;11;14;21;14;18;23;13;11;9;
totat sans -;52;74;100;88;84;96;104;76;78;26;
total;54;76;100;90;90;96;104;76;80;26;
grand sans -;(4);(10);;(20);(13);;;;;;
;;;;;;;;;;;
test;rpl;ppm;lbu;ban;psor;cdc;hmo;fps;npu;mfi;mfe
cds;850;5 384;1 838;5 700;3 368;3 614;2 707;2 478;7 484;3 381;2 374
petit;19;20;21;6;8;4;19;26;39;23;21
grand;5;6;11;2;4;1;8;15;10;9;5
totat sans -;56;56;46;16;18;10;44;54;84;56;78
total;56;58;46;16;18;10;46;54;86;58;78
grand sans -;;(5);;;;;(9);;(9);(8);
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
;ko;ko;ko;ko;ok;ok;ko;ok;ko;ko;
p;0,415;0,858;0,773;0,827;0,649;0,570;0,911;0,866;0,768;0,848;
q;0,585;0,142;0,227;0,173;0,351;0,430;0,089;0,134;0,232;0,152;
compare;mba;mja;eco;ade;pmq;cbei;ant;pub;cbn;bsu;
cds;3 995;1 768;4 285;4 506;7 258;5 665;3 119;1 343;2 521;4 325;
petit;21;19;21;30;15;13;16;25;13;11;
grand;6;10;5;21;5;5;10;17;8;8;
totat sans -;86;42;78;68;32;40;32;50;34;26;
total;88;42;78;68;32;40;32;50;34;26;
grand sans -;(5);;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
;ok;ok;ko;ko;ko;ok;ko;ko;ko;ko;ok
p;0,771;0,810;0,744;0,741;0,886;0,757;0,854;0,768;0,651;0,767;0,630
q;0,229;0,190;0,256;0,259;0,114;0,243;0,146;0,232;0,349;0,233;0,370
compare;afn;cvi;ase;blo;pmg;myr;abra;scc;spl;rru;rtb
cds;2 093;4 345;8 256;1 824;1 839;3 611;1 712;1 847;4 269;3 854;828
petit;26;38;39;27;31;35;14;27;19;39;18
grand;17;20;17;11;20;18;4;9;5;15;5
totat sans -;52;78;100;72;64;78;30;66;60;80;56
total;52;78;100;72;64;78;30;66;60;80;56
&lt;/pre&gt;
*'''Les calculs des bornes'''
&lt;pre&gt;
;compare;test;;;;;;;;;
;afn;eco;;;;;;;;;
;0,771;21;;;;;;;;;
;0,229;5;;;;;;;;;
;;78;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
;3995;;;;3614;cds;bornes;p;q;;tRNAs
archeo;cds total;total;&lt;0;0-200;reste;;petit;0,771;0,229;;78
mba cds-cds;3995;3943;329;1500;2114;;34,181;p2;2pq;1-q2;q2
mba cds %;;;83;415;585;;39,741;0,595;0,353;0,948;0,052
mba tRNA;;88;1;27;60;;grand;varq;varp;attendus;
calculs;proba;effect;attendu;plage;2σ;;17,074;nq2(1-q2);np2(1-p2);petit;grand
petit;0,771;21;37;22 – 35;2,8;;29,336;1,932;9,398;36,961;23,205
grand;0,229;5;23,2;2 – 12;6,1;;;;;;
;;;;;;;34;40;;17;29
;;;;;;;;;;;
;;;;;;bornes;13,2;18,7;;12,1;24,3
;;;;;;petit;inf;sup;grand;inf;sup
&lt;/pre&gt;
=====Récapitulatif des taux discontinu/continu=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Récapitulatif_des_taux_discontinu/continu|Récapitulatif des taux discontinu/continu]]
&lt;pre&gt;
&gt;0;;;&lt;0;;;total;taux
tRNA-cds;;;tRNA-cds;;;;
Rc+;Rx+;Rx+ %;Rc-;Rx-;Rx- %;;R- %
808;464;&amp;36,5;2;6;&amp;75;1280;&amp;0,6
cds-cds;;;cds-cds;;;;
Sc+;Sx+;Sx+ %;Sc-;Sx-;Sx- %;;S- %
42200;19031;&amp;31,08;9564;1224;&amp;11,3;72019;&amp;15,0
cn;ac;ax;ax%;a%;intercal;;Sx%
1191;1934;649;&amp;25,1;&amp;3,4;75793;;28,1
&lt;/pre&gt;

=====Les taux de discontinus par classe génomique=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_taux_de_discontinus_par_classe_génomique|Les taux de discontinus par classe génomique]]
&lt;pre&gt;
gen;Sx-%;Sx+%;S-%;Rx+%;ax%
$I;;;;;
abra;°1,4;°22;&amp;25;°24;°6
ant;&amp;10,9;27;&amp;25;°15;°8
mja;&amp;24,2;30;13;42;&amp;36
pmg;&amp;36,0;&amp;39;14;39;&amp;41
pub;&amp;19,0;29;&amp;36;44;&amp;45
$II;;;;;
ade;&amp;11,9;&amp;36;18;32;13
afn;°1,3;°20;15;°19;11
ase;&amp;19,3;&amp;42;20;41;11
bsu;4,9;30;14;&amp;57;16
cbn;4,5;°23;°7;°25;°5
cvi;8,2;32;18;33;18
eco;&amp;12,3;33;18;43;&amp;35
rru;&amp;10,1;31;18;41;&amp;33
spl;°2,8;34;10;37;11
$III;;;;;
blo;7,0;32;13;33;18
cbei;°2,8;°23;°7;°26;°6
mba;5,5;34;°8;&amp;47;28
myr;6,6;30;°8;39;9
pmq;4,3;29;11;36;°4
rtb;°2,9;27;13;29;25
scc;7,8;32;19;&amp;48;18
total;10,6;31;15;37;19
écart;10±6;31±4;15±5;37±7;19±10
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires négatifs cds-cds=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_négatifs_cds-cds|Les fréquences des intercalaires négatifs cds-cds]]
*Tableau 
&lt;pre&gt;
14.8.21;continu;;;comp’;;;
inter;nc;nc%;pc;nx;nx%;px;diff
 -1;1671;'''17.5;;0;0;;
 -2;4;0.0;;40;3.3;;
 -3;5;0.1;;0;0;;
 -4;&amp;4476;'''46.8;&lt;u&gt;0.38;°410;'''33.5;&lt;u&gt;0.10;
 -5;9;0.1;;3;0.2;;
 -6;4;0.0;;35;2.9;;16
 -7;139;1.5;;19;1.6;;
 -8;&amp;945;'''9.9;0.15;°51;'''4.2;1.06;
 -9;3;0.0;;25;2.0;;14
 -10;93;1.0;;11;0.9;;
 -11;&amp;498;'''5.2;0.19;°52;'''4.3;0.69;
 -12;2;0.0;;23;1.9;;8
 -13;94;1.0;;15;1.2;;
 -14;&amp;329;'''3.4;0.29;°45;'''3.7;0.84;
 -15;1;0.0;;25;2.0;;12
 -16;58;0.6;;13;1.1;;
 -17;&amp;235;'''2.5;0.25;°42;'''3.4;0.90;
 -18;5;0.1;;13;1.1;;1
 -19;43;0.4;;12;1.0;;
 -20;&amp;162;'''1.7;0.30;°24;'''2.0;1.04;
 -21;0;0;;11;0.9;;3
 -22;22;0.2;;8;0.7;;
 -23;&amp;107;'''1.1;0.21;°20;'''1.6;0.95;
 -24;1;0.0;;19;1.6;;8
 -25;34;0.4;;11;0.9;;
 -26;&amp;101;'''1.1;0.35;°21;'''1.7;1.43;
 -27;2;0.0;;6;0.5;; -2
 -28;19;0.2;;8;0.7;;
 -29;&amp;61;'''0.6;0.34;°10;'''0.8;1.40;
 -30;0;0;;5;0.4;; -3
 -31;16;0.2;;8;0.7;;
 -32;&amp;45;'''0.5;0.36;°18;'''1.5;0.72;
 -33;0;0;;3;0.2;; -4
 -34;15;0.2;;7;0.6;;
 -35;&amp;35;'''0.4;0.43;°19;'''1.6;0.53;
 -36;0;0;;3;0.2;;0
 -37;9;0.1;;3;0.2;;
 -38;&amp;31;'''0.3;0.29;°12;'''1.0;0.50;
 -39;0;0;;3;0.2;; -4
 -40;5;0.1;;7;0.6;;
 -41;&amp;34;'''0.4;0.15;°8;'''0.7;1.25;
 -42;0;0;;4;0.3;; -2
 -43;16;0.2;;6;0.5;;
 -44;&amp;24;'''0.3;0.67;°4;'''0.3;2.50;
 -45;0;0;;2;0.2;; -1
 -46;5;0.1;;3;0.2;;
 -47;&amp;11;'''0.1;0.45;°4;'''0.3;1.25;
 -48;0;0;;2;0.2;; -2
 -49;11;0.1;;4;0.3;;
 -50;&amp;9;'''0.1;1.22;°6;'''0.5;1.00;
reste;169;1.8;;120;9.8;;
total;9558;100.0;;1223;100.0;;
&lt;/pre&gt;
*Fréquences des &lt;span id=&quot;nd50&quot;&gt;négatifs&lt;/span&gt;, détails jusqu'à -50 pour les continus et jusqu'à -80 pour les discontinus
&lt;pre&gt;
14.8.21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
discontinus de 1 à 80;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
reste;51;0;9;1;0;17;2;4;0;0;1;10;0;0;0;0;1;0;5;0;1;0
6 mod3;195;3;4;1;20;48;1;5;2;5;7;15;3;19;5;16;8;17;6;0;9;1
7 mod3;154;0;17;1;5;55;4;7;2;0;16;6;3;3;1;9;5;3;13;0;3;1
8 mod3;370;3;36;0;18;123;8;5;3;4;20;18;10;8;5;30;14;25;22;3;12;3
1-5/total %;37;25;35;25;48;31;17;40;36;0;36;48;27;46;45;38;33;51;38;25;11;58
1-5;453;2;36;1;40;109;3;14;4;0;25;45;6;26;9;33;14;47;28;1;3;7
total;1172;8;93;3;83;335;16;31;11;9;68;84;22;56;20;88;41;92;69;4;27;12
gen;comp’;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
2;40;0;3;0;0;18;1;0;0;0;3;2;2;0;0;0;3;3;1;1;1;2
3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
4;410;2;33;1;40;91;2;14;3;0;22;43;3;26;9;33;11;43;27;0;2;5
5;3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0
6;35;0;2;0;7;2;0;2;0;1;2;0;2;4;3;2;3;1;2;0;2;0
7;19;0;1;0;0;11;0;1;0;0;2;1;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0
8;51;0;5;0;5;6;2;1;1;1;0;1;0;2;0;11;0;14;0;0;0;2
9;25;1;0;0;3;2;0;1;0;1;1;2;0;3;0;1;1;7;0;0;2;0
10;11;0;1;0;1;4;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;0;0
11;52;0;4;0;3;17;0;1;0;2;4;0;0;2;2;3;2;4;4;0;4;0
12;23;1;1;0;3;5;0;0;0;1;1;1;0;3;0;2;0;3;0;0;2;0
13;15;0;3;0;0;6;0;0;0;0;2;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0
14;45;1;4;0;1;18;1;1;0;0;0;5;3;1;0;3;2;2;2;1;0;0
15;25;0;1;0;3;11;0;0;0;0;0;0;0;3;1;3;0;0;1;0;1;1
16;13;0;1;0;1;4;0;1;0;0;0;1;0;0;0;3;0;0;1;0;1;0
17;42;1;7;0;2;12;1;0;0;1;3;0;1;0;1;4;2;1;3;0;2;1
18;13;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;2;0;2;1;1;0;2;0;0;1;0
19;12;0;0;0;0;6;1;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
20;24;0;1;0;1;5;1;1;0;0;1;1;1;0;1;3;1;3;4;0;0;0
21;11;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;2;0;1;0;2;0;0;1;0;0;0
22;8;0;0;0;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;1;0;0;0
23;20;0;2;0;0;8;0;0;0;0;1;1;1;1;0;2;0;1;1;0;2;0
24;19;1;0;0;1;7;0;0;0;0;1;2;0;1;0;2;0;3;0;0;1;0
25;11;0;1;0;0;1;1;1;1;0;1;2;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0
26;21;1;0;0;1;8;0;0;1;0;0;1;1;0;0;1;3;0;2;0;2;0
27;6;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0
28;8;0;1;0;0;3;1;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0
29;10;0;2;0;1;3;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0
30;5;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0
31;8;0;0;0;0;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0
32;18;0;2;0;1;7;1;0;0;0;2;2;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0
33;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
34;7;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0
35;19;0;1;0;1;6;1;0;0;0;2;3;1;0;0;1;1;0;1;1;0;0
36;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0
37;3;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
38;12;0;1;0;1;5;1;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0
39;3;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0
40;7;0;1;1;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0
41;8;0;2;0;1;0;0;0;0;0;2;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0
42;4;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0
43;6;0;0;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0
44;4;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
45;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
46;3;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
47;4;0;1;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0
48;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0
49;4;0;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
50;6;0;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0
51;5;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0
52;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1
53;4;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
54;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
55;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0
56;5;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
57;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
58;5;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
59;7;0;1;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
60;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
61;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0
62;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0
63;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
64;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
65;6;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
66;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
67;4;0;1;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0
68;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0
69;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
70;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0
71;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
72;2;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
73;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
74;3;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
75;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
76;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
77;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
78;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
79;2;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
80;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
;;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
14.8.21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
negatifs;continus;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
-1;1671;68;70;38;164;168;52;72;71;34;118;163;33;25;71;36;80;152;81;10;39;126
-2;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-3;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0
-4;4476;141;537;129;221;885;109;229;82;28;375;260;117;51;60;69;384;80;394;33;156;136
-5;9;2;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;1;0;0;0;0
-6;4;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0
-7;139;1;6;6;12;18;1;11;8;5;10;14;5;1;10;1;5;2;5;2;6;10
-8;945;70;20;41;98;71;8;75;72;30;56;59;33;12;34;13;76;42;42;16;31;46
-9;3;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-10;93;3;2;1;7;9;3;5;5;6;6;6;4;1;3;2;8;2;6;1;5;8
-11;498;34;17;19;46;22;9;43;38;13;31;34;13;10;28;11;32;31;22;2;15;28
-12;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0
-13;94;1;7;5;9;12;0;6;4;2;10;3;4;4;1;3;7;2;4;3;2;5
-14;329;24;12;8;34;12;10;19;21;7;21;15;15;9;22;6;27;18;11;6;17;15
-15;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-16;58;1;3;3;0;5;1;5;3;3;4;2;5;2;2;2;5;2;2;1;4;3
-17;235;16;4;10;24;6;7;18;21;10;16;10;11;5;15;3;17;9;11;7;7;8
-18;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-19;43;1;2;2;2;5;2;4;2;2;3;4;4;2;1;0;1;1;4;0;0;1
-20;162;12;3;6;19;6;1;11;11;7;12;8;7;6;6;1;14;10;3;2;10;7
-21;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-22;22;1;2;0;0;3;0;2;1;1;1;3;1;0;0;0;5;1;0;1;0;0
-23;107;6;6;4;9;7;0;8;9;2;4;6;5;6;7;0;13;5;1;3;2;4
-24;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0
-25;34;1;0;0;2;5;0;1;1;1;2;2;5;3;1;2;3;1;1;1;2;0
-26;101;4;6;4;5;5;1;8;10;2;3;7;8;1;4;3;13;3;2;5;5;2
-27;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-28;19;0;0;0;0;4;1;0;4;1;0;3;3;1;0;0;0;1;0;0;0;1
-29;61;1;2;3;7;4;0;6;5;5;2;4;1;3;3;0;8;1;2;0;2;2
-30;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-31;16;1;0;2;1;1;1;1;0;1;1;1;0;0;0;0;2;1;2;0;1;0
-32;45;1;1;2;5;4;0;2;0;1;0;5;4;3;1;0;8;1;1;1;2;3
-33;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-34;15;0;2;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;2;3;0;2;1;1;0;1;1
-35;35;2;1;3;2;0;0;3;4;2;1;1;5;1;1;0;6;2;0;1;0;0
-36;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-37;9;0;1;1;0;2;0;1;1;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0
-38;31;2;0;2;3;0;0;2;4;0;2;1;3;3;2;0;2;2;0;2;0;1
-39;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-40;5;0;0;0;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
-41;34;0;0;1;0;3;0;8;1;1;1;0;1;2;2;1;5;2;2;1;2;1
-42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-43;16;0;0;0;0;1;1;3;1;0;0;8;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1
-44;24;0;0;1;0;4;0;2;2;1;3;1;1;1;1;1;3;1;0;0;2;0
-45;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-46;5;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0
-47;11;1;0;0;0;1;0;2;1;1;0;0;1;0;1;0;1;2;0;0;0;0
-48;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-49;11;1;0;0;0;2;0;1;1;0;0;0;3;1;0;0;2;0;0;0;0;0
-50;9;1;0;1;0;0;0;2;1;0;0;1;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0
;169;13;9;9;6;28;2;17;4;0;4;22;6;6;0;2;16;3;11;0;6;5
;9558;409;713;303;679;1300;210;573;389;167;687;644;307;163;282;158;753;381;609;98;319;414
;;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires négatifs cds-cds. Diagrammes=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_négatifs_cds-cds._Diagrammes|Les fréquences des intercalaires négatifs cds-cds. Diagrammes]]
*Tableau
&lt;pre&gt;
14.8.21;;diagrammes;;;;;;;;;;;
;R2;;;abscisses modulo 3;;;;;abscisses modulo 1;;moyennes;;
fréquence;droite;exp;p4;-a;b;-x;x’;w;'-x1;x’1;m;e;m/e
continu   50;;;;;;;;;;;;;
6;537;190;585;0,1;4;36;4;6;107;3.5;1.2;1.66;0.72
7;735;855;971;2,6;111;72;176;245;215;132;38.6;40.2;0.96
8;608;973;987;14,8;603;100;1389;2611;301;841;175.1;253.9;0.69
discontinu 50;;;;;;;;;;;;;
6’;820;912;913;0.7;32;72;54;45;217;43;11.9;10.8;1.11
7’;806;779;835;0.3;17;36;22;26;109;19;9.0;4.5;1.99
8’;857;888;933;1.2;56;61;97;56;184;71;22.4;17.0;1.32
discontinu 80;;;;;;;;;;;;;
6”;667;834;931;0.4;23;51;32;45;152;28;7.8;9.76;0.80
7”;806;769;887;0.2;15;38;22;21;115;19;6.2;5.04;1.22
8”;739;874;949;0.6;42;48;70;80;144;55;14.8;16.14;0.92
&lt;/pre&gt;

=====Les intercalaires négatifs cds-cds, recouvrements=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_intercalaires_négatifs_cds-cds,_recouvrements|Les intercalaires négatifs cds-cds, recouvrements]]
&lt;pre&gt;
recouvrements;;intercalaires cds-cds recouvrements;;;;;;;;
bsu;;;;;;eco;;;;
intercal;add1;add2;shift;couvre;;intercal;add1;add2;shift;couvre
continu;;;;;;continu;;;;
-7616;387744;398495;°-7475;141;;-2400;164730;167264;&amp;0;2400
;390880;391020;;;;;164865;167264;;
;;;;;;-2130;&amp;2731600;2733729;444;2130
-500;3717238;3717825;°-20;480;;;2731600;2734173;;
;3717326;3717805;;;;-1295;&amp;492092;493386;637;1295
;;;;;;;492092;494023;;
-492;2909520;2910011;735;492;;-897;&amp;4577958;4578854;483;897
;2909520;2910746;;;;;4577958;4579337;;
;;;;;;-729;1179520;1180359;&amp;0;729
-164;1252815;1253021;52;164;;;1179631;1180359;;
;1252858;1253073;;;;-448;1639030;1639527;°-193;255
;;;;;;;1639080;1639334;;
-154;2466721;2467953;209;154;;-242;578107;578568;°-59;183
;2467800;2468162;;;;;578327;578509;;
;;;;;;-212;508875;511379;&amp;0;212
-143;1916663;1917097;205;143;;;511168;511379;;
;1916955;1917302;;;;-153;&amp;16751;16903;57;153
;;;;;;;16751;16960;;
discontinu;;;;;;discontinu;;;;
-361;2601528;2603339;°-64;297;;-723;3111128;3111988;°-663;60
;2602979;2603275;;;;;3111266;3111325;;
;;;;;;-530;3838248;3839171;°-470;60
-127;3666841;3667059;°-43;84;;;3838642;3838701;;
;3666933;3667016;;;;-527;10643;11356;°-41;486
;;;;;;;10830;11315;;
-93;2652993;2653463;1410;93;;-436;3796948;3798207;°-361;75
;2653371;2654873;;;;;3797772;3797846;;
;;;;;;-210;3993739;3994059;276;210
;;;;;;;3993850;3994335;;
&lt;/pre&gt;
=====Classement des génomes par les fréquences des cds-cds négatifs discontinus=====
======Tableau cds-cds négatifs discontinus======
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Classement_des_génomes_par_les_fréquences_des_cds-cds_négatifs_discontinus|Classement des génomes par les fréquences des cds-cds négatifs discontinus]]
&lt;pre&gt;
14.8.21;recompte;;rouge pour les peu significatifs;;;;couleurs uniformisées;;;“p pour périodiques;;;;
;;génomes à forts cds-cds négatifs discontinues ;trié sur x‰  ;;;puis;génomes à faibles cds-cds négatifs discontinues;;;;;;;
clde;gen;r80;“6;“7;“8;“p;x6;x7;x8;x‰ ;cds;“5;x5;“80
1;'''pub;0;§17;3;25;&amp;45;§38;7;56;&amp;&lt;u&gt;70.4;1307;&amp;47;51;&amp;92
2;'''pmg;0;§16;9;30;&amp;55;§29;16;55;&amp;48.9;1800;&amp;33;38;&amp;88
3;'''ase;17;?48;55;123;&amp;&lt;u&gt;226;?21;24;54;&amp;42.9;&lt;u&gt;'''8197;&amp;&lt;u&gt;109;31;&amp;&lt;u&gt;335
4;'''mja;0;@19;3;8;&amp;30;@63;10;27;&amp;32.4;1730;&amp;26;46;&amp;56
5;'''ant;0;@20;5;18;&amp;43;@47;12;42;&amp;26.8;3095;&amp;40;48;&amp;83
6;'''eco;10;§15;6;18;&amp;39;§38;15;46;&amp;23.4;'''4024;&amp;45;48;&amp;84
7;'''ade;9;?4;17;36;&amp;57;?7;30;63;&amp;22.8;'''4464;&amp;36;35;&amp;93
8;'''rru;5;?6;13;22;&amp;41;?15;32;54;&amp;19.5;'''3786;&amp;28;38;&amp;69
9;'''cvi;1;?7;16;20;&amp;43;?16;37;47;&amp;16.1;'''4282;&amp;25;36;&amp;68
10;'''scc;1;§9;3;12;&amp;24;§38;13;50;&amp;15.5;1805;°3;11;27
11;'''blo;2;?1;4;8;13;?8;31;62;10.2;1772;°3;17;°16
12;'''bsu;4;?5;7;5;17;?29;41;29;8.3;'''4215;14;40;31
13;'''myr;0;§5;1;5;11;§45;9;45;5.6;'''3555;9;45;20
14;'''pmq;1;§8;5;14;&amp;27;§30;19;52;5.8;'''7223;14;33;41
15;'''mba;0;?3;3;10;16;?19;19;63;5.6;'''3943;°6;27;22
16;'''rtb;0;§0;0;3;$3;§0;0;100;$5.0;793;$1;25;$4
17;'''abra;0;@3;0;3;$6;@50;0;50;$4.8;1667;$2;25;$8
18;'''cbn;0;@5;0;4;$9;@56;0;44;$3.6;2491;$0;0;$9
19;'''spl;0;?1;1;3;°5;?20;20;60;°2.8;'''4213;7;58;°12
20;'''cbei;0;?2;2;3;°7;?29;29;43;°2.0;'''5622;°4;36;°11
21;'''afn;1;@1;1;0;$2;@50;50;0;$2.0;2039;$1;25;$3
;'''total;51;195;154;370;719;27;21;51;17.0;72023;453;37;1172
;;;;;;;;;;;;;;
§;bgcolor=&quot;#e8f2a8&quot;|;;?;bgcolor=&quot;#bbe333&quot;|;;@;bgcolor=&quot;#ff00ff&quot;|;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
*&lt;span id=&quot;cdmc&quot;&gt;Coefficient&lt;/span&gt; de détermination, moyenne et corrélation: effectifs
&lt;pre&gt;
	14.8.21	Effectifs des cds-cds négatifs continus		14.8.21	Effectifs des cds-cds négatifs discontinus				
gen	r50	“5	“6	“7	“8	total	cds	r80	“5	“6	“7	“8	total
abra	13	211	0	11	174	409	1667	0	2	3	0	3	8
ade	9	607	0	25	72	713	4464	9	36	4	17	36	102
afn	9	167	2	20	105	303	2039	1	1	1	1	0	4
ant	6	387	1	33	252	679	3095	0	40	20	5	18	83
ase	28	1054	3	70	145	1300	8197	17	109	48	55	123	352
blo	2	161	1	10	36	210	1772	2	3	1	4	8	18
bsu	17	305	0	42	209	573	4215	4	14	5	7	5	35
cbei	4	153	0	32	200	389	5622	0	4	2	2	3	11
cbn	0	62	0	23	82	167	2491	0	0	5	0	4	9
cvi	4	493	0	38	152	687	4282	1	25	7	16	20	69
eco	22	423	0	47	152	644	4024	10	45	15	6	18	94
mba	6	152	7	34	108	307	3943	0	6	3	3	10	22
mja	6	78	0	17	62	163	1730	0	26	19	3	8	56
myr	0	133	0	22	127	282	3555	0	9	5	1	5	20
pmg	2	105	0	10	41	158	1800	0	33	16	9	30	88
pmq	16	466	1	44	226	753	7223	1	14	8	5	14	42
pub	3	233	2	14	129	381	1307	0	47	17	3	25	92
rru	11	475	0	26	97	609	3786	5	28	6	13	22	74
rtb	0	43	0	9	46	98	793	0	1	0	0	3	4
scc	6	195	1	22	95	319	1805	1	3	9	3	12	28
spl	5	262	0	30	117	414	4213	0	7	1	1	3	12
total	169	6165	18	579	2627	9558	72023	51	453	195	154	370	1223
&lt;/pre&gt;
*Coefficient de détermination, moyenne et corrélation:Résultats
&lt;pre&gt;
‰. ;14.8.21;Effectifs des cds-cds négatifs continus;;;;;;;14.8.21;Effectifs des cds-cds négatifs discontinus;;;;;;‰. ;;;;;;;;;;;;;
gen;c50‰. ;c5‰. ;c6‰. ;c7‰. ;c8‰. ;c‰. ;;x80‰. ;x5‰. ;x6‰. ;x7‰. ;x8‰. ;x‰. ;;;;;c5‰. ;;c7‰. ;c8‰. ;c‰. ;;;x5‰. ;x6‰. ;x7‰. ;x8‰. ;x‰. 
abra;78.0;1265.7;0.0;66.0;1043.8;2453.5;;0.0;12.0;18.0;0.0;18.0;48.0;;;1;;248.9;;55.6;161.3;670.4;;;0.0;0.0;0.0;0.0;19.6
ade;20.2;1359.8;0.0;56.0;161.3;1597.2;;20.2;80.6;9.0;38.1;80.6;228.5;;;2;;272.1;;56.0;176.9;691.9;;;4.9;2.4;0.0;5.3;19.6
afn;44.1;819.0;9.8;98.1;515.0;1486.0;;4.9;4.9;4.9;4.9;0.0;19.6;;;3;;374.1;;56.4;203.2;778.6;;;7.1;3.6;0.0;7.1;28.5
ant;19.4;1250.4;3.2;106.6;814.2;2193.9;;0.0;129.2;64.6;16.2;58.2;268.2;;;4;;385.5;;56.9;227.8;793.2;;;12.0;4.9;2.4;11.9;36.1
ase;34.2;1285.8;3.7;85.4;176.9;1585.9;;20.7;133.0;58.6;67.1;150.1;429.4;;;5;;450.9;;60.9;256.2;877.8;;;12.6;5.6;2.8;14.1;48.0
blo;11.3;908.6;5.6;56.4;203.2;1185.1;;11.3;16.9;5.6;22.6;45.1;101.6;;;6;;542.2;;61.9;273.9;942.2;;;15.2;7.6;3.6;16.1;50.4
bsu;40.3;723.6;0.0;99.6;495.8;1359.4;;9.5;33.2;11.9;16.6;11.9;83.0;;;7;;583.3;;66.0;277.7;982.7;;;16.6;9.0;4.9;18.0;55.8
cbei;7.1;272.1;0.0;56.9;355.7;691.9;;0.0;7.1;3.6;3.6;5.3;19.6;;;8;;621.9;;68.7;312.9;1042.5;;;16.6;11.1;6.9;19.4;56.3
cbn;0.0;248.9;0.0;92.3;329.2;670.4;;0.0;0.0;20.1;0.0;16.1;36.1;;;9;;645.2;;71.2;329.2;1185.1;;;16.9;11.9;7.6;25.4;58.1
cvi;9.3;1151.3;0.0;88.7;355.0;1604.4;;2.3;58.4;16.3;37.4;46.7;161.1;;;10;;723.6;;85.4;355.0;1235.8;;;19.4;14.1;14.9;37.8;83.0
eco;54.7;1051.2;0.0;116.8;377.7;1600.4;;24.9;111.8;37.3;14.9;44.7;233.6;;;11;;819.0;;86.2;355.7;1359.4;;;25.3;15.8;16.2;44.7;101.6
mba;15.2;385.5;17.8;86.2;273.9;778.6;;0.0;15.2;7.6;7.6;25.4;55.8;;;12;;908.6;;88.7;357.2;1486.0;;;33.2;16.3;16.6;45.1;155.1
mja;34.7;450.9;0.0;98.3;358.4;942.2;;0.0;150.3;109.8;17.3;46.2;323.7;;;13;;1051.2;;92.3;358.4;1585.9;;;58.4;18.0;16.6;46.2;161.1
myr;0.0;374.1;0.0;61.9;357.2;793.2;;0.0;25.3;14.1;2.8;14.1;56.3;;;14;;1080.3;;98.1;377.7;1597.2;;;74.0;20.1;17.3;46.7;195.5
pmg;11.1;583.3;0.0;55.6;227.8;877.8;;0.0;183.3;88.9;50.0;166.7;488.9;;;15;;1151.3;;98.3;495.8;1600.4;;;80.6;37.3;22.6;58.1;228.5
pmq;22.2;645.2;1.4;60.9;312.9;1042.5;;1.4;19.4;11.1;6.9;19.4;58.1;;;16;;1250.4;;99.6;515.0;1604.4;;;111.8;49.9;23.0;58.2;233.6
pub;23.0;1782.7;15.3;107.1;987.0;2915.1;;0.0;359.6;130.1;23.0;191.3;703.9;;;17;;1254.6;;106.6;526.3;1608.6;;;129.2;58.6;34.3;66.5;268.2
rru;29.1;1254.6;0.0;68.7;256.2;1608.6;;13.2;74.0;15.8;34.3;58.1;195.5;;;18;;1265.7;;107.1;580.1;1767.3;;;133.0;64.6;37.4;80.6;323.7
rtb;0.0;542.2;0.0;113.5;580.1;1235.8;;0.0;12.6;0.0;0.0;37.8;50.4;;;19;;1285.8;;113.5;814.2;2193.9;;;150.3;88.9;38.1;150.1;429.4
scc;33.2;1080.3;5.5;121.9;526.3;1767.3;;5.5;16.6;49.9;16.6;66.5;155.1;;;20;;1359.8;;116.8;987.0;2453.5;;;183.3;109.8;50.0;166.7;488.9
spl;11.9;621.9;0.0;71.2;277.7;982.7;;0.0;16.6;2.4;2.4;7.1;28.5;;;21;;1782.7;;121.9;1043.8;2915.1;;;359.6;130.1;67.1;191.3;703.9
total;23.5;856.0;2.5;80.4;364.7;1327.1;;7.1;62.9;27.1;21.4;51.4;169.8;;;;;;;;;;;;;;;;
moyenne;23.8;859.9;3.0;84.2;427.9;1398.7;;5.4;69.5;32.4;18.2;52.8;178.3;;;R2 progrès;;;;;;;;;;;;;
écart;19.6;422.8;5.2;22.4;248.2;592.6;;8.0;86.6;37.6;18.2;53.8;181.3;;;droite;;967;;978;793;889;;;687;753;850;758;783
m/e;1.2;2.0;0.6;3.8;1.7;2.4;;0.7;0.8;0.9;1.0;1.0;1.0;;;exponentiel;;957;;975;941;967;;;969;980;956;961;986
R2 corel;c5;;;0.193;0.420;;R2 corel;x5;;0.888;0.494;0.853;;;;a;;0.089;;0.043;0.081;0.065;;;0.202;0.195;0.183;0.165;0.171
;c7;;;;0.420;;;x6;;;0.392;0.754;;;;b;;283.156;;50.427;153.421;628.757;;;3.747;1.976;1.444;5.367;16.404
;;;;;;;;x7;;;;0.745;;;;;;;;;;;;;;;;;
R2 deter;c5;;;0.037;0.176;;R2 deter;x5;;0.788;0.244;0.728;;;;;;;;;;;;;;;;;
;c7;;;;0.177;;;x6;;;0.154;0.569;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;x7;;;;0.555;;;;;;;;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
======Fréquences cds-cds négatifs discontinus jusqu'à 80, détails======
*Fréquences &lt;span id=&quot;disc80&quot;&gt;des&lt;/span&gt; discontinus jusqu'à 80, détails des cumuls
&lt;pre&gt;
14.8.21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
discontinus de 1 à 80;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
reste;51;0;9;1;0;17;2;4;0;0;1;10;0;0;0;0;1;0;5;0;1;0;51;;9
6 mod3;195;3;4;1;20;48;1;5;2;5;7;15;3;19;5;16;8;17;6;0;9;1;;;43
7 mod3;154;0;17;1;5;55;4;7;2;0;16;6;3;3;1;9;5;3;13;0;3;1;;;27
8 mod3;370;3;36;0;18;123;8;5;3;4;20;18;10;8;5;30;14;25;22;3;12;3;;;70
1-5/total %;37;25;35;25;48;31;17;40;36;0;36;48;27;46;45;38;33;51;38;25;11;58;;;30
1-5;453;2;36;1;40;109;3;14;4;0;25;45;6;26;9;33;14;47;28;1;3;7;;;64
total;1172;8;93;3;83;335;16;31;11;9;68;84;22;56;20;88;41;92;69;4;27;12;1172;;204
gen;comp’;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl;total;;faibles
1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;;0
2;40;0;3;0;0;18;1;0;0;0;3;2;2;0;0;0;3;3;1;1;1;2;2;;10
3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;;0
4;410;2;33;1;40;91;2;14;3;0;22;43;3;26;9;33;11;43;27;0;2;5;4;;52
5;3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;5;;2
6;35;0;2;0;7;2;0;2;0;1;2;0;2;4;3;2;3;1;2;0;2;0;6;;13
7;19;0;1;0;0;11;0;1;0;0;2;1;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;7;;1
8;51;0;5;0;5;6;2;1;1;1;0;1;0;2;0;11;0;14;0;0;0;2;8;;7
9;25;1;0;0;3;2;0;1;0;1;1;2;0;3;0;1;1;7;0;0;2;0;9;;6
10;11;0;1;0;1;4;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;0;0;10;;2
11;52;0;4;0;3;17;0;1;0;2;4;0;0;2;2;3;2;4;4;0;4;0;11;;11
12;23;1;1;0;3;5;0;0;0;1;1;1;0;3;0;2;0;3;0;0;2;0;12;;4
13;15;0;3;0;0;6;0;0;0;0;2;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;13;;3
14;45;1;4;0;1;18;1;1;0;0;0;5;3;1;0;3;2;2;2;1;0;0;14;;9
15;25;0;1;0;3;11;0;0;0;0;0;0;0;3;1;3;0;0;1;0;1;1;15;;3
16;13;0;1;0;1;4;0;1;0;0;0;1;0;0;0;3;0;0;1;0;1;0;16;;2
17;42;1;7;0;2;12;1;0;0;1;3;0;1;0;1;4;2;1;3;0;2;1;17;;10
18;13;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;2;0;2;1;1;0;2;0;0;1;0;18;;2
19;12;0;0;0;0;6;1;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;19;;2
20;24;0;1;0;1;5;1;1;0;0;1;1;1;0;1;3;1;3;4;0;0;0;20;;5
21;11;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;2;0;1;0;2;0;0;1;0;0;0;21;;2
22;8;0;0;0;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;1;0;0;0;22;;2
23;20;0;2;0;0;8;0;0;0;0;1;1;1;1;0;2;0;1;1;0;2;0;23;;3
24;19;1;0;0;1;7;0;0;0;0;1;2;0;1;0;2;0;3;0;0;1;0;24;;2
25;11;0;1;0;0;1;1;1;1;0;1;2;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;25;;4
26;21;1;0;0;1;8;0;0;1;0;0;1;1;0;0;1;3;0;2;0;2;0;26;;8
27;6;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;27;;1
28;8;0;1;0;0;3;1;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;28;;1
29;10;0;2;0;1;3;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;29;;0
30;5;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;30;;0
31;8;0;0;0;0;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;31;;1
32;18;0;2;0;1;7;1;0;0;0;2;2;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;32;;3
33;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;33;;0
34;7;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;34;;2
35;19;0;1;0;1;6;1;0;0;0;2;3;1;0;0;1;1;0;1;1;0;0;35;;4
36;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;36;;2
37;3;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;37;;0
38;12;0;1;0;1;5;1;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;38;;2
39;3;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;39;;1
40;7;0;1;1;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;40;;2
41;8;0;2;0;1;0;0;0;0;0;2;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;41;;1
42;4;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;42;;1
43;6;0;0;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;43;;0
44;4;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;44;;1
45;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;45;;1
46;3;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;46;;1
47;4;0;1;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;47;;1
48;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;48;;0
49;4;0;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;49;;0
50;6;0;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;50;;1
51;5;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;51;;2
52;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;52;;1
53;4;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;53;;0
54;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;54;;0
55;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;55;;1
56;5;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;56;;0
57;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;57;;0
58;5;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;58;;1
59;7;0;1;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;59;;0
60;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;60;;1
61;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;61;;0
62;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;62;;0
63;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;63;;0
64;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;64;;0
65;6;0;2;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;65;;1
66;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;66;;0
67;4;0;1;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;67;;0
68;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;68;;1
69;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;69;;1
70;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;70;;0
71;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;71;;1
72;2;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;72;;0
73;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;73;;1
74;3;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;74;;1
75;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;75;;1
76;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;76;;0
77;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;77;;0
78;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;78;;0
79;2;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;79;;0
80;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;80;;0
;;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl;total;;faibles
&lt;/pre&gt;

======Restes des cds-cds négatifs======
*Restes &lt;span id=&quot;rcdsn&quot;&gt;des&lt;/span&gt; cds-cds négatifs
&lt;pre&gt;
14.8.21;;discont;cont;cont;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;6;14;2;0;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;7;12;48;17;65;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;8;19;43;44;87;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;6;15;0;15;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;51;108;61;169;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;cont;cont;;discontinu;;;
;6;2;2;;6;7;0;;6;1;0;;6;4;0;;6;0;0;0;;;;
;7;1;11;;7;6;18;;7;3;11;;7;2;8;;7;12;5;17;;;;
;8;3;9;;8;4;10;;8;8;9;;8;3;15;;8;25;19;44;1;;;
;reste;5;9;;reste;0;0;;reste;1;6;;reste;0;0;;reste;0;0;0;;;;
;;11;31;;;17;28;;;13;26;;;9;23;;;37;24;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Les occurrences des négatifs autres que ceux des tableaux des continus jusqu’à -50 et des discontinus jusqu’à -80;;;;;;;;;;;;;;;;;discontinu;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;-89;1;;;;;;;
eco;discontinu;continu;;ase;discontinu;continu;;bsu;discontinu;continu;;scc;discontinu;continu;;pmq;continu;;ant;continu;;;Les restes ;jusqu’à
-56;;1;1;-51;;*;0;-58;;1;2;-120;1;;0;-53;1;1;-71;1;1;continus;169;50
-66;;1;0;-52;;3;2;-59;;1;1;-74;;1;1;-55;1;2;-65;1;1;discontinus;51;80
-75;;1;0;-53;;*;1;-65;;1;1;-68;;2;1;-56;2;1;-59;1;1;;;
-82;1;7;2;-55;;1;2;-82;;1;2;-59;;2;1;-65;2;1;-56;1;1;;discontinu;continu
-85;;1;2;-57;;*;0;-86;1;;1;-53;;1;1;-74;1;1;-55;1;2;eco;10;22
-86;1;;1;-58;;*;2;-91;;1;2;ok;1;6;;-89;*;1;-53;1;1;ase;17;28
-89;;1;1;-59;;2;1;-92;;1;1;rru;discontinu;continu;;-95;2;1;;;;bsu;4;17
-102;1;;0;-67;;1;2;-93;1;;0;-122;1;;1;-119;2;1;cbei;continu;;pmq;1;16
-113;1;;1;-70;;2;2;-94;;1;2;-120;1;;0;-116;1;1;-110;1;1;ade;9;9
-129;1;;0;-74;;1;1;-95;;1;1;-106;1;;2;-115;1;2;-64;1;2;abra;0;13
-210;1;;0;-76;;1;2;-361;1;;2;-104;2;;1;-113;1;1;-64;1;2;afn;1;9
-436;1;;2;-79;;1;2;-127;1;;2;-137;;1;1;-101;2;1;-62;1;1;ant;0;6
-527;1;;1;-81;1;;0;-7616;;1;1;-104;;*;1;;16;;;;;blo;2;2
-530;1;;1;-82;2;1;2;-500;;1;1;-73;;1;2;;;;mba;continu;;cbei;0;4
-723;1;;0;-86;2;1;1;-492;;1;0;-68;;1;1;pub;continu;;-59;2;1;cvi;1;4
-110;;1;1;-87;1;;0;-164;;1;1;-65;;1;1;-65;1;1;-56;4;1;mba;0;6
-153;;1;0;-88;1;;2;-154;;1;2;-64;;1;2;-59;1;1;-51;*;0;mja;0;6
-212;;1;1;-89;;1;1;-143;;1;1;-62;;1;1;-56;1;1;;;;pmg;0;2
-242;;1;1;-91;;1;2;-119;;1;1;-61;;1;2;;;;mja;continu;;pub;0;3
-448;;1;2;-93;2;;0;-113;;1;1;-59;;1;1;spl;continu;;-83;1;1;rru;5;11
-729;;1;0;-94;;2;2;-101;;1;1;-58;;*;2;-98;1;1;-73;1;2;scc;1;6
-897;;1;0;-95;;1;1;;4;17;;-53;;1;1;-77;1;1;-71;1;1;spl;0;5
-1295;;1;1;-97;;2;2;ade;discontinu;continu;;-52;;2;2;-56;1;1;-64;1;2;;51;169
-2130;;1;0;-100;;1;2;-55;;1;2;;5;11;;-53;2;1;-62;1;1;;;
-2400;;1;0;-120;1;;0;-61;;2;2;;;;;;;;-59;1;1;;;
;10;22;;-119;1;;1;-67;;1;2;blo;discontinu;continu;;abra;continu;;;;;;;
afn;discontinu;continu;;-111;1;;0;-68;;2;1;-102;1;;0;-92;1;1;pmg;continu;;;;
-83;1;;1;-109;2;;2;-116;1;;1;-85;1;;2;-86;1;1;-65;1;1;;;
-113;;1;1;-107;1;;1;-110;1;;1;-86;;1;1;-73;1;2;-59;1;1;;;
-79;;1;2;-106;1;;2;-107;1;;1;-53;;1;1;-67;9;2;;;;;;
-74;;1;1;-105;1;;0;-104;1;;1;;2;2;;-59;1;1;;;;;;
-71;;1;1;-119;;2;1;-101;1;;1;cvi;discontinu;continu;;;;;;24;;;;
-68;;1;1;-110;;1;1;-98;1;;1;-102;1;;0;;37;;;;;;;
-67;;2;2;-106;;2;2;-86;1;;1;-97;;1;2;;;;;;;;;
-59;;1;1;-101;;1;1;-82;1;;2;-94;;1;2;;;;;;;;;
-53;;1;1;;17;28;;-109;1;1;2;-73;;1;2;;;;;;;;;
;1;9;;;;;;-106;;1;2;-71;;1;1;;;;;;;;;
;;;;;;;;-100;;1;2;;1;4;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;9;9;;;9;23;;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;

=====Classement des génomes par les fréquences des cds-cds négatifs continus=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Classement_des_génomes_par_les_fréquences_des_cds-cds_négatifs_continus|Classement des génomes par les fréquences des cds-cds négatifs continus]]
*Tableau cds-cds-c
&lt;pre&gt;
*Tableau cds-cds-c;;;;;;;;;;;;
14.8.21;;classement des génomes par le taux c‰ ;;;;;;;;;;
gen;r50;continu;“6;“7;“8;“p;c8;c7;1-5”;c5;c‰;cds
'''cbn;0;167;;23;82;105;78;21.9;62;&lt;u&gt;'''37;&lt;u&gt;'''67;°2 491
'''cbei;4;389;;32;200;232;86;°13.8;153;'''39;'''69;&amp;5 622
'''mba;6;307;'''7;34;108;149;77;22.8;152;°50;'''78;3 943
'''myr;0;282;;22;127;149;85;°14.8;133;°47;'''79;3 555
'''pmg;2;158;;10;41;51;80;19.6;105;66;°88;°1 800
'''mja;6;163;;17;62;79;79;21.5;78;°48;°94;'''1 730
'''spl;5;414;;30;117;147;80;20.4;262;63;°98;4 213
'''pmq;16;753;1;44;226;271;84;°16.2;466;62;°104;&amp;7 223
'''blo;2;210;1;10;36;47;79;21.3;161;&amp;77;119;'''1 772
'''rtb;0;98;;9;46;55;84;°16.4;43;'''44;124;&lt;u&gt;'''793
'''bsu;17;573;;42;209;251;83;°16.7;305;53;136;4 215
'''afn;9;303;2;20;105;127;84;°15.7;167;°55;149;°2 039
'''ase;28;'''1300;3;70;145;218;68;&amp;32.1;1054;&amp;81;158.6;&amp;&lt;u&gt;8 197
'''ade;9;713;;25;72;97;74;&amp;25.8;607;&amp;&lt;u&gt;85;159.7;4 464
'''eco;22;644;;47;152;199;76;23.6;423;66;160.0;4 024
'''cvi;4;687;;38;152;190;80;20.0;493;&amp;72;160.4;4 282
'''rru;11;609;;26;97;123;79;21.1;475;&amp;78;160.9;3 786
'''scc;6;319;1;22;95;118;81;18.6;195;61;&amp;177;°1 805
'''ant;6;679;1;33;252;286;89;'''11.5;387;°57;&amp;219;3 095
'''abra;13;409;;11;174;185;94;&lt;u&gt;'''5.9;211;°52;&amp;245;'''1 667
'''pub;3;381;2;14;129;145;90;'''9.7;233;61;&amp;&lt;u&gt;292;'''1 307
'''total;169;9558;18;579;2627;3224;82;18.0;6165;64;134;72 023
&lt;/pre&gt;
*Tableau cds-cds-x
&lt;pre&gt;
*Tableau cds-cds-x;;;;;;;;;
14.8.21;;;;;;;;;
négatifs continus;;classement des génomes par le taux c‰ ;;;;;discontinus par -6;;
gen;c5‰;c7‰;c8‰;c‰;c1/c4;cds;x6;x5;x‰
'''cbn;'''25;9.2;°33;&lt;u&gt;'''67;&amp;121;°2 491;@56;0;$3.6
'''cbei;'''27;5.7;°36;'''69;&amp;87;&amp;5 622;?29;36;°2.0
'''mba;'''39;8.6;°27;'''78;°28;3555;?19;27;5.6
'''myr;'''37;6.2;°36;'''79;&amp;118;3943;§45;45;5.6
'''pmg;58;5.6;'''23;°88;52;°1 800;§29;38;&amp;48.9
'''mja;45;9.8;°36;°94;49;'''1 730;@63;46;&amp;32.4
'''spl;62;7.1;°28;°98;&amp;93;4213;?20;58;°2.8
'''pmq;65;6.1;°31;°104;'''21;&amp;7 223;§30;33;5.8
'''blo;91;5.6;'''20;119;48;'''1 772;?8;17;10.2
'''rtb;54;11.3;58;124;°30;&lt;u&gt;'''793;§0;25;$5.0
'''bsu;72;10.0;50;136;°31;4215;?29;40;8.3
'''afn;82;9.8;51;149;°29;°2 039;@50;25;$2.0
'''ase;129;8.5;'''18;158.6;'''19;&amp;&lt;u&gt;8 197;?21;31;&amp;42.9
'''ade;136;5.6;'''16;159.7;&lt;u&gt;'''13;4464;?7;35;&amp;22.8
'''eco;105;11.7;°38;160.0;63;4024;§38;48;&amp;23.4
'''cvi;115;8.9;°35;160.4;°31;3786;?16;36;&amp;16.1
'''rru;125;6.9;°26;160.9;'''21;4282;?15;38;&amp;19.5
'''scc;108;12.2;53;&amp;177;'''25;°1 805;§38;11;&amp;15.5
'''ant;125;10.7;&amp;81;&amp;219;&amp;74;3095;@47;48;&amp;26.8
'''abra;127;6.6;&amp;104;&amp;245;48;'''1 667;@50;25;$4.8
'''pub;178;10.7;&amp;99;&amp;&lt;u&gt;292;&amp;&lt;u&gt;190;'''1 307;§38;51;&amp;&lt;u&gt;70.4
'''total;86;8.0;36;134;37;72023;27;37;17.0
;;;;;;;;;
? bbe333;;;;;;;;;
§ e8f2a8;;;;;;;;;
@ ff00ff;;;;;;;;;
&lt;/pre&gt;
*Fréquences &lt;span id=&quot;fncont&quot;&gt;des&lt;/span&gt; intercalaires négatifs continus jusqu'à 50, détails
&lt;pre&gt;
negatifs;continus;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
-1;1671;68;70;38;164;168;52;72;71;34;118;163;33;25;71;36;80;152;81;10;39;126
-2;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-3;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0
-4;4476;141;537;129;221;885;109;229;82;28;375;260;117;51;60;69;384;80;394;33;156;136
-5;9;2;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;1;0;0;0;0
-6;4;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0
-7;139;1;6;6;12;18;1;11;8;5;10;14;5;1;10;1;5;2;5;2;6;10
-8;945;70;20;41;98;71;8;75;72;30;56;59;33;12;34;13;76;42;42;16;31;46
-9;3;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-10;93;3;2;1;7;9;3;5;5;6;6;6;4;1;3;2;8;2;6;1;5;8
-11;498;34;17;19;46;22;9;43;38;13;31;34;13;10;28;11;32;31;22;2;15;28
-12;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0
-13;94;1;7;5;9;12;0;6;4;2;10;3;4;4;1;3;7;2;4;3;2;5
-14;329;24;12;8;34;12;10;19;21;7;21;15;15;9;22;6;27;18;11;6;17;15
-15;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-16;58;1;3;3;0;5;1;5;3;3;4;2;5;2;2;2;5;2;2;1;4;3
-17;235;16;4;10;24;6;7;18;21;10;16;10;11;5;15;3;17;9;11;7;7;8
-18;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-19;43;1;2;2;2;5;2;4;2;2;3;4;4;2;1;0;1;1;4;0;0;1
-20;162;12;3;6;19;6;1;11;11;7;12;8;7;6;6;1;14;10;3;2;10;7
-21;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-22;22;1;2;0;0;3;0;2;1;1;1;3;1;0;0;0;5;1;0;1;0;0
-23;107;6;6;4;9;7;0;8;9;2;4;6;5;6;7;0;13;5;1;3;2;4
-24;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0
-25;34;1;0;0;2;5;0;1;1;1;2;2;5;3;1;2;3;1;1;1;2;0
-26;101;4;6;4;5;5;1;8;10;2;3;7;8;1;4;3;13;3;2;5;5;2
-27;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-28;19;0;0;0;0;4;1;0;4;1;0;3;3;1;0;0;0;1;0;0;0;1
-29;61;1;2;3;7;4;0;6;5;5;2;4;1;3;3;0;8;1;2;0;2;2
-30;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-31;16;1;0;2;1;1;1;1;0;1;1;1;0;0;0;0;2;1;2;0;1;0
-32;45;1;1;2;5;4;0;2;0;1;0;5;4;3;1;0;8;1;1;1;2;3
-33;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-34;15;0;2;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;2;3;0;2;1;1;0;1;1
-35;35;2;1;3;2;0;0;3;4;2;1;1;5;1;1;0;6;2;0;1;0;0
-36;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-37;9;0;1;1;0;2;0;1;1;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0
-38;31;2;0;2;3;0;0;2;4;0;2;1;3;3;2;0;2;2;0;2;0;1
-39;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-40;5;0;0;0;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0
-41;34;0;0;1;0;3;0;8;1;1;1;0;1;2;2;1;5;2;2;1;2;1
-42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-43;16;0;0;0;0;1;1;3;1;0;0;8;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1
-44;24;0;0;1;0;4;0;2;2;1;3;1;1;1;1;1;3;1;0;0;2;0
-45;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-46;5;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0
-47;11;1;0;0;0;1;0;2;1;1;0;0;1;0;1;0;1;2;0;0;0;0
-48;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-49;11;1;0;0;0;2;0;1;1;0;0;0;3;1;0;0;2;0;0;0;0;0
-50;9;1;0;1;0;0;0;2;1;0;0;1;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0
;170;13;9;9;6;28;2;17;4;0;4;22;6;6;0;3;16;3;11;0;6;5
;9559;409;713;303;679;1300;210;573;389;167;687;644;307;163;282;159;753;381;609;98;319;414
;;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
9559;?;?;?;?;?;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;total;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl
6;18;0;0;2;1;3;1;0;0;0;0;0;7;0;0;0;1;2;0;0;1;0
7;579;11;25;20;33;70;10;42;32;23;38;47;34;17;22;10;44;14;26;9;22;30
8;2627;174;72;105;252;145;36;209;200;82;152;152;108;62;127;41;226;129;97;46;95;117
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
“7/t”;18;6;26;16;12;32;21;17;14;22;20;24;23;22;15;20;16;10;21;16;19;20
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;3224;185;97;127;286;218;47;251;232;105;190;199;149;79;149;51;271;145;123;55;118;147
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
% 6+7+8 / 50;34;47;14;43;42;17;23;45;60;63;28;32;50;50;53;33;37;38;21;56;38;36
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
%1-5/total;64;52;85;55;57;81;77;53;39;37;72;66;50;48;47;66;62;61;78;44;61;63
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c1/c4;0.37;0.48;0.13;0.29;0.74;0.19;0.48;0.31;0.87;1.21;0.31;0.63;0.28;0.49;1.18;0.52;0.21;1.90;0.21;0.30;0.25;0.93
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
1-5”;6165;211;607;167;387;1054;161;305;153;62;493;423;152;78;133;105;466;233;475;43;195;262
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Diagrammes 400=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_positifs_cds-cds._Diagrammes_400|Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Diagrammes 400]]
*Légende
&lt;pre&gt;
12.2.22 Paris;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Diagramme 400;;Poly3;1 à 400;Sx+;;;;;;;;Poly3;1 à 400;Sc+;;;;;;;;;;
;;Polynome de d°3;;;;;;;;;;Polynome de d°3;;;;;;;;;;;;
gen;m50x;-7;-5;R2;flex x+;R2’;eff;f3;clx+;gen;m50c;-7;-5;R2;flex c+;R2’;eff;clx+;classe;;;;;12.2.22
° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_positifs_S+|rru]];min 50;-13;90;818;231;20;874;Sf;{{tri1|6}}b1;°rru;50;-34;275;878;270;139;2056;{{tri1|6}}b1;b1;Sf;°rru;20;6;{{tri1|6}}b1
§[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_positifs_S+|rtb]];max 80;45;-332;496;246;191;118;tF;{{tri1|14}}c3;§rtb;50;-36;279;569;258;82 Sm;402;{{tri1|14}}c3;c3;tF;§rtb;191;14;{{tri1|14}}c3
$[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_positifs_S+|pub]];min 20;-58;495;853;284;249;218;SF;{{tri1|1}}a1;$pub;50;-236;1732;559;245;338;537;{{tri1|1}}a1;a1;SF;$pub;249;1;{{tri1|1}}a1
° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_positifs_S+|cvi]];max 70;29;-174;611;200;30;1008;tf;{{tri1|8}}b2;°cvi;50;-44;372;852;282;203;2320;{{tri1|8}}b2;b2;tf;°cvi;30;7;{{tri1|8}}b2
° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_positifs_S+|ade]];min 50;-20;145;782;242;39;1229;Sf;{{tri1|5}}b1;°ade;50;-61;489;843;267;232;2242;{{tri1|5}}b1;b1;Sf;°ade;39;5;{{tri1|5}}b1
$[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_positifs_S+|ant]];min 50;-25;209;680;279;70;601;Sm;{{tri1|4}}a2;$ant;40;-135;1021;664;252;306;1616;{{tri1|4}}a2;a2;Sm;$ant;70;4;{{tri1|4}}a2
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_positifs_S+|eco]];max 50;22;-151;532;230;43;1003;tm;{{tri1|11}}c2;eco;50;-74;565;805;255;265;2130;{{tri1|11}}c2;c2;tm;eco;43;11;{{tri1|11}}c2
§[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_positifs_S+|spl]];max 80;47;-333;611;236;336;1071;tF;{{tri1|16}}c5;§spl;50;-47;363;806;257;192;2215;{{tri1|16}}c5;c5;tF;§spl;336;16;{{tri1|16}}c5
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_intercalaires_positifs_S+|bsu]];max  40;-6.4;69;458;359;18;1028;Sf;{{tri1|9}}c1;bsu;50;-41;352;790;286;173;2444;{{tri1|9}}c1;c1;Sf;bsu;18;9;{{tri1|9}}c1
&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_positifs_S+|pmq]];régulier;31;-283;878;304;813;1614;tF;{{tri1|19}}d2;&amp;pmq;70;-29;229;946;263;140;4164;{{tri1|19}}d2;d2;tF;&amp;pmq;813;19;{{tri1|19}}d2
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_positifs_S+|cbn]];max  50;16;-109;454;227;27;489;tf;{{tri1|10}}c1;cbn;50;-50;394;855;263;203;1701;{{tri1|10}}c1;c1;tf;cbn;27;10;{{tri1|10}}c1
&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_positifs_S+|cbei]];régulier;32;-258;712;269;708;946;tF;{{tri1|18}}d2;&amp;cbei;50;-46;338;779;245;213;3399;{{tri1|18}}d2;d2;tF;&amp;cbei;708;18;{{tri1|18}}d2
§[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_positifs_S+|afn]];max 4-14;29;-227;486;261;183;328;tF;{{tri1|15}}c4;§afn;50;-95;712;722;250;297;1323;{{tri1|15}}c4;c4;tF;§afn;183;15;{{tri1|15}}c4
° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_positifs_S+|ase]];max 70;19;-108;872;189;25;2398;tf;{{tri1|7}}b2;°ase;50;-43;352;910;273;216;3558;{{tri1|7}}b2;b2;tf;°ase;25;8;{{tri1|7}}b2
&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_positifs_S+|blo]];régulier;33;-233;728;235;138;448;tF;{{tri1|21}}d3;&amp;'''blo;40;-5.7;69;868;404;41 Sf;993;{{tri1|21}}d3;d3;tF;&amp;'''blo;138;21;{{tri1|21}}d3
$[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_positifs_S+|mja]];min 50;-16;150;660;313;78;406;Sm;{{tri1|3}}a2;$mja;50;-94;719;856;255;319;1047;{{tri1|3}}a2;a2;Sm;$mja;78;3;{{tri1|3}}a2
&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_positifs_S+|mba]];régulier;4.9;-71;350;483;348;705;tF;{{tri1|17}}d1;&amp;mba;50;-50;359;823;239;287;1651;{{tri1|17}}d1;d1;tF;&amp;mba;348;17;{{tri1|17}}d1
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_positifs_S+|myr]];max 70;33;-213;708;215;68;828;tm;{{tri1|12}}c2;myr;50;-94;717;742;254;290;2081;{{tri1|12}}c2;c2;tm;myr;68;12;{{tri1|12}}c2
$[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_intercalaires_positifs_S+|pmg]];min 40;-67;515;607;256;179;559;SF;{{tri1|2}}a1;$pmg;60;-107;844;869;263;368;895;{{tri1|2}}a1;a1;SF;$pmg;179;2;{{tri1|2}}a1
§[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_positifs_S+|abra]];max  50;53;-314;734;197;96;256;tF;{{tri1|13}}c3;§abra;60;-99;750;702;253;277;934;{{tri1|13}}c3;c3;tF;§abra;96;13;{{tri1|13}}c3
&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_positifs_S+|scc]];régulier;30;-200;690;222;71;416;tm;{{tri1|20}}d3;&amp;'''scc;60;-86;660;830;256;331;961;{{tri1|20}}d3;d3;tm;&amp;'''scc;71;20;{{tri1|20}}d3
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;Poly3;31 à 400;Sx+;;;;;;;;Poly3;31 à 400;Sc+;;;;;bgcolor=&quot;#66ffff&quot;|;;°;99ff99;§;
;;Polynome de d°3;;;;;;;;;;Polynome de d°3;;;;;;;bgcolor=&quot;#ffff00&quot;|;;&amp;;00ccff;$;
gen;teff;-7;-5;R2;flex x+;R2’;eff;f3;clx+;gen;f3;-7;-5;R2;flex c+;R2’;eff;clx+;;;;;;
°[[:image:Icds-cds-S+400-rru.png|rru]];3786;12;-97;833;269;36;726;tf;{{tri1|6}}b1;°rru;tm;13;-61;957;156;41;1509;{{tri1|6}}b1;;a1;$pub;249;1;
§[[:image:Icds-cds-S+400-rtb.png|rtb]];793;;;;;;;;{{tri1|14}}c3;§rtb;tF;70;-478;788;228;190;284;{{tri1|14}}c3;;a1;$pmg;179;2;
$[[:image:Icds-cds-S+400-pub.png|pub]];1307;-49;437;918;297;256;149;SF;{{tri1|1}}a1;$pub;SF;-48;403;945;280;365;200;{{tri1|1}}a1;;a2;$ant;70;4;
°[[:image:Icds-cds-S+400-cvi.png|cvi]];4282;;;;;;;;{{tri1|8}}b2;°cvi;tF;5.3;22;915;-138;107;1621;{{tri1|8}}b2;;a2;$mja;78;3;
°[[:image:Icds-cds-S+400-ade.png|ade]];4464;32;-228;874;238;67;958;tm;{{tri1|5}}b1;°ade;tF;2.5;38;957;-507;103;1490;{{tri1|5}}b1;;b1;°ade;39;5;
$[[:image:Icds-cds-S+400-ant.png|ant]];3095;60;-400;785;222;112;432;tF;{{tri1|4}}a2;$ant;tF;4.8;28;888;-194;142;833;{{tri1|4}}a2;;b2;°cvi;30;7;
[[:image:Icds-cds-S+400-eco.png|eco]];4024;;;;;;;;{{tri1|11}}c2;eco;tm;7.6;-18;934;79;61;1389;{{tri1|11}}c2;;b2;°ase;25;8;
§[[:image:Icds-cds-S+400-spl.png|spl]];4213;;;;;;;;{{tri1|16}}c5;§spl;tf;10.3;-50;915;162;30;1618;{{tri1|16}}c5;;b1;°rru;20;6;
[[:image:Icds-cds-S+400-bsu.png|bsu]];4216;48;-359;861;249;167;645;tF 51;{{tri1|9}}c1;bsu;tF;12;-27;954;75;104;1424;{{tri1|9}}c1;;c1;bsu;18;9;
&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-pmq.png|pmq]];7223;;;;;;;;{{tri1|19}}d2;&amp;pmq;Sm;-13;112;937;287;51;3257;{{tri1|19}}d2;;c1;cbn;27;10;
[[:image:Icds-cds-S+400-cbn.png|cbn]];2493;;;;;;;;{{tri1|10}}c1;cbn;tm;8.8;-32;932;121;41;1171;{{tri1|10}}c1;;c2;eco;43;11;
&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-cbei.png|cbei]];5623;;;;;;;;{{tri1|18}}d2;&amp;cbei;Sf;-13;15;935;38;8;2571;{{tri1|18}}d2;;c2;myr;68;12;
§[[:image:Icds-cds-S+400-afn.png|afn]];2039;;;;;;;;{{tri1|15}}c4;§afn;tm;9.5;-42;904;147;45;791;{{tri1|15}}c4;;c3;§abra;96;13;
°[[:image:Icds-cds-S+400-ase.png|ase]];8197;;;;;;;;{{tri1|7}}b2;°ase;SF;-18;182;976;337;149;2619;{{tri1|7}}b2;;c3;§rtb;191;14;
&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-blo.png|blo]];1773;;;;;;;;{{tri1|21}}d3;&amp;'''blo;tf;28;-174;897;207;36;786;{{tri1|21}}d3;;c4;§afn;183;15;
$[[:image:Icds-cds-S+400-mja.png|mja]];1729;47;-300;711;213;88;309;tF;{{tri1|3}}a2;$mja;SF;-6.2;87;964;468;105;623;{{tri1|3}}a2;;c5;§spl;336;16;
&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-mba.png|mba]];3943;;;;;;;;{{tri1|17}}d1;&amp;mba;SF;-6.7;100;789;495;209;2156;{{tri1|17}}d1;;d1;&amp;mba;348;17;
[[:image:Icds-cds-S+400-myr.png|myr]];3555;;;;;;;;{{tri1|12}}c2;myr;tF;7.8;-12;897;51;86;1265;{{tri1|12}}c2;;d2;&amp;cbei;708;18;
$[[:image:Icds-cds-S+400-pmg.png|pmg]];1800;23;-124;774;180;48;377;tm;{{tri1|2}}a1;$pmg;SF;-35;327;973;311;286;510;{{tri1|2}}a1;;d2;&amp;pmq;813;19;
§[[:image:Icds-cds-S+400-abra.png|abra]];1667;;;;;;;;{{tri1|13}}c3;§abra;tF;21;-104;912;165;85;548;{{tri1|13}}c3;;d3;&amp;'''scc;71;20;
&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-scc.png|scc]];1805;;;;;;;;{{tri1|20}}d3;&amp;'''scc;SF;-17;162;949;318;162;622;{{tri1|20}}d3;;d3;&amp;'''blo;138;21;
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Corrélations 400 et faibles fréquences=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_positifs_cds-cds._Corrélations_400_et_faibles_fréquences|Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Corrélations 400 et faibles fréquences]]
*Légende
&lt;pre&gt;
;;12.2.22 Paris;Corrélations x+/c+;;;;;;;;;;Faibles fréquences;;;;;;;;;;;;;
;;;effectifs diagramme;;Corrélations;;;;;;;;1-30  ‰ ;;;teff;;0  ‰;;&lt;0  ‰;;eff40;;corel40;classe;
;;gen;x+;c+;41-250;41-200;diff;1-250;mini;clx+;;gen;x+; c+;x+/c+;x;c;x;c;x-;c-;x+; c+;x+/c+;clx+;
°rru;;° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_intercalaires_positifs_S+|rru]];874;2056;611;193;418;792;min40;{{tri1|6}}b1;;°[[:image:Pro1-2.png|rru]];169;266;0.64;1037;2749;1;4;71;222;175;630;17;{{tri1|6}}b1;°rru
§rtb;;§ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rtb_intercalaires_positifs_S+|rtb]];118;402;148;-105;253;-165;min30;{{tri1|14}}c3;;§[[:image:Pr-bc1.png|rtb]];51;294;0.17;189;604;5;7;21;162;8;131;-81;{{tri1|14}}c3;§rtb
$pub;;$ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#pub_intercalaires_positifs_S+|pub]];218;537;883;857;26;852;min20;{{tri1|1}}a1;;$[[:image:Pro1-2.png|pub]];317;628;0.50;327;980;40;59;281;389;88;367;715;{{tri1|1}}a1;$pub
°cvi;;°[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#cvi_intercalaires_positifs_S+|cvi]];1008;2320;891;858;33;549;min30;{{tri1|8}}b2;;°[[:image:Pro-2.png|cvi]];112;301;0.37;1171;3111;4;3;59;221;130;815;582;{{tri1|8}}b2;°cvi
°ade;;° [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ade_intercalaires_positifs_S+|ade]];1229;2242;758;624;134;897;min50;{{tri1|5}}b1;;°[[:image:Pro-2.png|ade]];221;335;0.66;1412;3052;8;6;72;234;304;876;459;{{tri1|5}}b1;°ade
$ant;;$ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#ant_intercalaires_positifs_S+|ant]];601;1616;538;271;267;886;min40;{{tri1|4}}a2;;$[[:image:Pro-2.png|ant]];281;485;0.58;714;2381;13;24;116;285;186;836;575;{{tri1|4}}a2;$ant
eco;;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_intercalaires_positifs_S+|eco]];1003;2130;440;296;144;-64;min20;{{tri1|11}}c2;;[[:image:Pro-2.png|eco]];63;348;0.18;1169;2855;11;6;80;226;126;821;-119;{{tri1|11}}c2;eco
§spl;;§ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_intercalaires_positifs_S+|spl]];1071;2215;784;735;49;-202;min10;{{tri1|16}}c5;;§[[:image:Pro1-2.png|spl]];37;270;0.14;1313;2900;1;6;9;143;69;683;-342;{{tri1|16}}c5;§spl
bsu;;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_intercalaires_positifs_S+|bsu]];1028;2444;282;8;274;257;min10;{{tri1|9}}c1;;[[:image:Bac-2.png|bsu]];140;333;0.42;1125;3091;2;8;31;186;302;936;-432;{{tri1|9}}c1;bsu
&amp;pmq;;&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_intercalaires_positifs_S+|pmq]];1614;4164;-651;-832;181;-825;min10;{{tri1|19}}d2;;&amp;[[:image:Bac1-2.png|pmq]];32;218;0.15;1927;5296;3;5;22;140;68;1156;-207;{{tri1|19}}d2;&amp;pmq
cbn;;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_intercalaires_positifs_S+|cbn]];489;1701;508;548;-40;-112;min20;{{tri1|10}}c1;;[[:image:Bac1-2.png|cbn]];65;312;0.21;553;1940;2;5;17;86;56;620;-382;{{tri1|10}}c1;cbn
&amp;cbei;;&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_intercalaires_positifs_S+|cbei]];946;3399;-377;-510;133;-646;min10;{{tri1|18}}d2;;&amp;[[:image:Bac-2.png|cbei]];26;244;0.11;1219;4404;0;4;9;88;35;954;272;{{tri1|18}}d2;&amp;cbei
§afn;;§ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#afn_intercalaires_positifs_S+|afn]];328;1323;101;-26;127;-407;min10;{{tri1|15}}c4;;§[[:image:Bac-2.png|afn]];46;402;0.11;350;1689;6;5;11;179;36;580;-369;{{tri1|15}}c4;§afn
°ase;;°[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_intercalaires_positifs_S+|ase]];2398;3558;940;922;18;725;min40;{{tri1|7}}b2;;°[[:image:Bac-2.png|ase]];135;264;0.51;3031;5166;7;3;116;252;389;1165;346;{{tri1|7}}b2;°ase
&amp;'''blo;;&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#blo_intercalaires_positifs_S+|blo]];448;993;537;406;131;255;min20;{{tri1|21}}d3;;&amp;[[:image:Pr-bc1.png|blo]];89;208;0.43;518;1255;4;1;35;167;54;241;-109;{{tri1|21}}d3;&amp;'''blo
$mja;;$ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_intercalaires_positifs_S+|mja]];406;1047;571;326;245;857;min30;{{tri1|3}}a2;;$[[:image:Pro-2.png|mja]];239;405;0.59;495;1234;20;9;113;132;113;474;502;{{tri1|3}}a2;$mja
&amp;mba;;&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_intercalaires_positifs_S+|mba]];705;1651;-221;-330;109;-477;min10;{{tri1|17}}d1;;&amp;[[:image:Bac1-2.png|mba]];45;214;0.21;1255;2688;1;8;18;114;51;428;-74;{{tri1|17}}d1;&amp;mba
myr;;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_intercalaires_positifs_S+|myr]];828;2081;764;649;115;41;min20;{{tri1|12}}c2;;[[:image:Pro1-2.png|myr]];71;392;0.18;999;2556;5;5;20;110;97;899;-78;{{tri1|12}}c2;myr
$pmg;;$ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano#pmg_intercalaires_positifs_S+|pmg]];559;895;802;728;74;915;min40;{{tri1|2}}a1;;$[[:image:Bac-2.png|pmg]];326;430;0.76;692;1108;16;31;137;143;196;449;703;{{tri1|2}}a1;$pmg
§abra;;§ [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_intercalaires_positifs_S+|abra]];256;934;797;716;81;59;min10;{{tri1|13}}c3;;§[[:image:Pro1-2.png|abra]];94;413;0.23;279;1388;4;9;29;295;41;420;-243;{{tri1|13}}c3;§abra
&amp;'''scc;;&amp; [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/spiro#scc_intercalaires_positifs_S+|scc]];416;961;530;440;90;49;min10;{{tri1|20}}d3;;&amp;[[:image:Bac1-2.png|scc]];118;353;0.33;485;1320;4;5;58;242;60;389;-177;{{tri1|20}}d3;&amp;'''scc
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Taux des x+ dans les diagrammes 400=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_positifs_cds-cds._Taux_des_x+_dans_les_diagrammes_400|Les fréquences des intercalaires positifs cds-cds. Taux des x+ dans les diagrammes 400]]
*Légende
&lt;pre&gt;
12.2.22;;;gen;x+;c+;%x+ 1;x+;c+;%x+ 31;x+;c+;%x+ t;t-1;31-1;clx+
1;°rru;;°[[:image:Icds-cds-S+400-rru.png|rru]];874;2056;30;726;1509;32;972;2131;31;1.5;&lt;u&gt;2.7;{{tri1|6}}b1
2;§rtb;;§[[:image:Icds-cds-S+400-rtb.png|rtb]];118;402;'''23;112;284;'''28;189;505;27;'''4.5;5.6;{{tri1|14}}c3
3;$pub;;$[[:image:Icds-cds-S+400-pub.png|pub]];218;538;29;149;200;43;239;595;29;-0.2;'''13.9;{{tri1|1}}a1
4;°cvi;;°[[:image:Icds-cds-S+400-cvi.png|cvi]];1008;2320;30;895;1621;36;1115;2410;32;1.3;5.3;{{tri1|8}}b2
5;°ade;;°[[:image:Icds-cds-S+400-ade.png|ade]];1229;2242;35;958;1490;39;1320;2325;36;0.8;3.7;{{tri1|5}}b1
6;$ant;;$[[:image:Icds-cds-S+400-ant.png|ant]];601;1616;27;432;833;34;639;1694;27;0.3;7.0;{{tri1|4}}a2
7;eco;;[[:image:Icds-cds-S+400-eco.png|eco]];1003;2130;32;940;1389;40;1076;2210;33;0.7;'''8.3;{{tri1|11}}c2
8;§spl;;§[[:image:Icds-cds-S+400-spl.png|spl]];1071;2215;33;1031;1618;39;1304;2482;34;1.8;6.3;{{tri1|16}}c5
9;bsu;;[[:image:Icds-cds-S+400-bsu.png|bsu]];1028;2444;30;884;1629;35;1092;2513;30;0.7;5.6;{{tri1|9}}c1
10;&amp;pmq;;&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-pmq.png|pmq]];1614;4164;28;1562;3257;32;1893;4535;29;1.5;4.5;{{tri1|19}}d2
11;cbn;;[[:image:Icds-cds-S+400-cbn.png|cbn]];489;1701;'''22;457;1171;'''28;543;1776;23;1.1;5.7;{{tri1|10}}c1
12;&amp;cbei;;&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-cbei.png|cbei]];946;3399;'''22;921;2571;'''26;1213;4011;23;1.4;4.6;{{tri1|18}}d2
13;§afn;;§[[:image:Icds-cds-S+400-afn.png|afn]];328;1323;'''20;313;791;'''28;349;1386;20;0.2;'''8.5;{{tri1|15}}c4
14;°ase;;°[[:image:Icds-cds-S+400-ase.png|ase]];2398;3558;40;2072;2619;44;2726;3819;42;1.4;3.9;{{tri1|7}}b2
15;&amp;'''blo;;&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-blo.png|blo]];448;993;31;408;786;34;502;1044;32;1.4;&lt;u&gt;3.1;{{tri1|21}}d3
16;$mja;;$[[:image:Icds-cds-S+400-mja.png|mja]];406;1047;28;309;623;33;447;1063;30;1.7;5.2;{{tri1|3}}a2
17;&amp;mba;;&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-mba.png|mba]];705;1651;30;673;1297;34;1237;2378;34;'''4.3;4.2;{{tri1|17}}d1
18;myr;;[[:image:Icds-cds-S+400-myr.png|myr]];828;2081;28;769;1265;38;981;2270;30;1.7;'''9.3;{{tri1|12}}c2
19;$pmg;;$[[:image:Icds-cds-S+400-pmg.png|pmg]];559;895;38;377;510;43;604;942;39;0.6;4.1;{{tri1|2}}a1
20;§abra;;§[[:image:Icds-cds-S+400-abra.png|abra]];256;934;'''22;232;548;'''30;273;977;22;0.3;'''8.2;{{tri1|13}}c3
21;&amp;'''scc;;&amp;[[:image:Icds-cds-S+400-scc.png|scc]];416;961;30;367;622;37;462;993;32;1.5;6.9;{{tri1|20}}d3
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires cds-cds positifs continus. Diagrammes 40=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_cds-cds_positifs_continus._Diagrammes_40|Les fréquences des intercalaires cds-cds positifs continus. Diagrammes 40]]
*Légende
*Tableau
&lt;pre&gt;
Sc+  40;Diagrammes polynôme de d° 15;;;;;;;;;;;;Pourcentage des tranches de 7 fréquences;;;;;Effectif des tranches de 7 fréquences;;;;;
gen;R2;min1;max1;min;max;pente;mx1;mx;pente0;diagr;type;gen;1-7;8-14;15-21;22-28;29-35;1-7;8-14;15-21;22-28;29-35;total
'''rtb;$721;5;8;2;7;&amp;'''1.7;4;13;&amp;-10.7;$131;pr1;'''rtb;&amp;'''39;&amp;27;&amp;18;10;'''6;48;33;22;13;8;124
'''pub;&amp;981;6;8;13;13;$0;2;58;&amp;-11.0;&amp;367;pr2;'''pub;$63;$17;$8;'''6;'''6;223;61;27;21;20;352
'''rru;&amp;882;7;11;11;34;&amp;5.8;4;43;&amp;-11.3;&amp;630;pro1;'''rru;&amp;32;&amp;28;&amp;13;15;11;191;167;78;86;66;588
'''cvi;&amp;897;6;10;13;50;&amp;9.3;1;58;&amp;-9.0;&amp;815;pro;'''cvi;&amp;30;&amp;30;&amp;17;11;11;230;232;133;80;86;761
'''ade;&amp;929;5;9;19;51;&amp;8.0;2;63;&amp;-14.7;&amp;876;pro;'''ade;&amp;30;&amp;32;&amp;15;12;11;247;267;122;95;93;824
'''ant;&amp;923;7;9;14;88;&amp;'''37.0;1;109;&amp;-15.8;&amp;836;pro;'''ant;&amp;'''37;&amp;39;&amp;14;'''5;'''6;297;316;112;40;45;810
'''eco;&amp;894;5;9;13;61;&amp;12.0;2;54;&amp;-13.7;&amp;902;pro;'''eco;&amp;27;&amp;35;&amp;17;12;'''8;232;295;146;103;71;847
'''spl;&amp;881;6;10;13;33;&amp;5.0;2;53;&amp;-10.0;&amp;683;pro1;'''spl;&amp;30;&amp;31;&amp;15;13;11;193;202;94;86;73;648
'''bsu;°897;8;12;7;53;°11.5;1;41;°-4.9;°935;bac;'''bsu;°22;°25;°28;15;11;189;220;245;128;96;878
'''pmq;$758;9;14;10;45;°7.0;1;52;°-5.3;°1155;bac1;'''pmq;°25;°19;°22;18;17;255;192;224;181;177;1029
'''cbn;°891;8;12;9;32;°5.8;1;37;°-4.0;°620;bac1;'''cbn;°23;°24;°23;18;12;134;136;133;101;67;571
'''cbei;°873;7;12;8;51;°8.6;1;55;°-7.8;°954;bac;'''cbei;°22;°27;°25;15;11;194;242;220;138;101;895
'''afn;°829;7;12;5;46;°8.2;1;38;°-5.5;°580;bac;'''afn;°25;°30;°26;13;'''7;138;167;143;71;37;556
'''ase;°827;6;10;28;67;°9.8;1;60;°-6.4;°1165;bac-a;'''ase;$29;°28;$15;12;16;307;298;158;131;166;1060
'''blo;$636;7;10;4;11;°'''2.3;2;15;°'''-2.2;$241;bc1;'''blo;°28;°23;°22;17;10;62;52;50;37;23;224
'''mja;$670;6;9;4;32;&amp;9.3;4;32;&amp;-14.0;&amp;474;pro-a;'''mja;$23;&amp;31;$22;13;10;104;143;102;61;45;455
'''mba;$732;7;10;4;19;°5.0;2;31;-5.4;°428;bac1-a;'''mba;$32;°22;°20;13;12;124;87;79;50;48;388
'''myr;&amp;922;7;12;23;46;&amp;4.6;2;78;&amp;-11.0;&amp;899;pro1-a;'''myr;&amp;'''42;$25;&amp;16;11;'''7;355;213;133;93;61;855
'''pmg;$776;7;9;10;27;°8.5;2;27;°-3.4;°449;bac-b;'''pmg;$35;°25;$16;12;11;146;105;65;50;46;412
'''abra;&amp;895;7;12;4;33;&amp;5.8;1;58;&amp;-9.0;&amp;420;pro1;'''abra;&amp;'''41;&amp;30;&amp;14;10;'''6;165;119;56;39;24;403
'''scc;°855;6;9;4;20;°5.3;1;31;°-5.4;°389;bac1-b;'''scc;$31;°30;$18;13;'''8;113;110;66;46;29;364
;;;;;;;;
;ant;7;10;14;48;11.3;;
;ant;7;8;14;46;32;;
;;;;;;;;
;;moyenne;7.8;;;;;
;;écart;2.4;;;;;
;;m/e;3.2;;;;;
&lt;/pre&gt;
*&lt;span id=&quot;fc40&quot;&gt;Données&lt;/span&gt;
&lt;pre&gt;
fc40;abra;ade;afn;ant;ase;blo;bsu;cbei;cbn;cvi;eco;mba;mja;myr;pmg;pmq;pub;rru;rtb;scc;spl;total
0;12;17;9;56;13;1;25;19;10;10;16;21;11;13;33;26;58;12;4;6;17;389
1;58;35;38;109;60;12;41;55;37;58;43;22;18;66;17;52;52;21;10;31;46;883
2;40;63;25;54;59;15;31;39;31;44;51;31;28;78;27;46;58;31;7;27;53;841
3;21;55;20;56;38;8;34;23;13;42;44;12;6;61;25;35;37;38;8;23;29;631
4;29;25;28;24;48;5;27;36;12;30;26;17;32;56;26;34;25;43;13;7;22;572
5;7;19;13;22;43;9;19;17;17;25;13;23;11;29;18;28;26;29;2;13;16;399
6;6;24;9;18;28;9;21;16;13;13;12;15;4;42;23;32;13;18;5;4;13;340
7;4;26;5;14;31;4;16;8;11;18;23;4;5;23;10;28;12;11;3;8;14;281
8;15;37;7;46;37;8;7;15;9;13;15;4;15;32;11;12;13;22;7;11;29;370
9;16;51;19;88;53;6;16;23;10;41;56;8;32;25;27;10;12;14;7;20;29;568
10;12;38;16;48;67;11;19;17;19;50;58;19;28;23;14;21;8;15;2;20;33;539
11;19;32;28;43;49;10;32;48;22;42;48;16;16;41;19;23;5;34;5;12;27;571
12;33;42;46;45;33;7;54;51;32;26;39;8;22;46;14;38;7;30;5;15;35;628
13;13;39;29;31;33;7;46;41;22;35;22;19;17;19;14;43;6;26;3;16;20;501
14;11;28;22;15;26;3;47;47;22;25;37;13;13;27;6;45;10;26;4;16;29;472
15;13;26;37;19;23;14;52;43;23;21;23;12;13;16;12;39;2;13;5;12;15;433
16;7;23;24;19;28;8;31;29;20;28;20;13;14;19;10;34;3;13;5;8;10;366
17;6;16;10;12;23;9;41;25;16;19;19;11;10;24;11;25;3;16;1;7;13;317
18;11;19;25;22;12;5;44;38;20;17;19;13;17;19;11;36;6;9;3;15;20;381
19;7;14;12;16;17;3;23;23;14;18;14;7;18;21;6;29;4;10;3;7;14;280
20;7;12;15;8;35;4;29;30;20;14;23;15;14;19;13;24;5;12;3;12;10;324
21;5;12;20;16;20;7;25;32;20;16;17;8;16;15;2;37;4;5;2;5;12;296
22;7;17;13;7;24;6;29;25;17;13;18;8;11;15;7;32;4;12;2;6;12;285
23;14;13;11;6;23;8;22;18;12;7;13;4;9;15;4;23;3;11;0;9;13;238
24;4;8;9;4;14;4;24;21;13;18;19;14;11;18;8;45;5;10;4;8;19;280
25;5;14;9;4;18;6;15;23;19;10;10;4;12;14;5;28;2;16;3;6;3;226
26;5;14;5;10;24;7;12;22;10;13;14;6;9;10;6;15;3;8;2;9;9;213
27;3;9;14;5;14;3;12;18;17;7;14;10;6;9;11;24;2;13;0;3;21;215
28;1;20;10;4;14;3;14;11;13;12;8;4;3;12;9;14;2;16;2;5;9;186
29;3;7;3;12;28;4;17;16;12;13;9;4;6;10;8;25;3;14;2;3;11;210
30;4;14;10;6;17;2;15;18;14;11;14;10;8;12;11;30;2;11;0;1;11;221
31;4;13;5;8;22;6;16;18;11;17;7;2;4;8;3;26;3;9;0;7;17;206
32;6;14;5;1;34;3;12;13;5;12;7;6;4;14;9;20;5;10;2;2;9;193
33;3;15;3;8;20;2;18;11;11;13;7;8;11;5;7;26;1;7;3;3;8;190
34;1;19;5;5;23;4;7;12;8;11;8;7;11;9;1;20;2;11;0;8;9;181
35;3;11;6;5;22;2;11;13;6;9;7;11;1;3;7;31;4;4;1;5;8;170
36;6;9;3;5;19;3;13;9;8;11;15;8;4;10;11;23;4;7;1;5;6;180
37;4;15;8;6;23;3;5;8;11;9;7;9;3;8;6;24;3;10;2;2;6;172
38;3;8;3;4;29;2;11;11;8;9;7;11;5;7;6;24;1;6;0;7;10;172
39;2;6;6;7;14;9;21;15;10;10;8;6;7;13;6;27;4;9;2;9;7;198
40;2;14;4;4;20;0;7;16;12;15;7;6;0;6;8;28;3;10;2;2;6;172
reste;547;1446;796;810;2688;803;1557;3042;1143;1599;1375;1932;586;1362;467;3361;175;1498;371;606;1786;27950
total;979;2339;1385;1702;3866;1045;2518;4015;1773;2424;2212;2381;1071;2274;949;4543;600;2140;506;1001;2486;42209
diagr;420;876;580;836;1165;241;936;954;620;815;821;428;474;899;449;1156;367;630;131;389;683;13870
&lt;/pre&gt;

=====Les fréquences des intercalaires cds-cds positifs discontinus. Diagrammes 40=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_fréquences_des_intercalaires_cds-cds_positifs_discontinus._Diagrammes_40|Les fréquences des intercalaires cds-cds positifs discontinus. Diagrammes 40]]
*Légende
&lt;pre&gt;
13.9.21 Paris;;publié;;;;;;;;;;;;;
Sx+  40;;;;;
gen;poly3;mod3;tot;diagr;note
;;;;;
'''rru;°253;5;12;175;
'''rtb;;;;8;
'''pub;;;;88;
'''cvi;499;8;11;130;
'''ade;443;8;11;304;
'''ant;574;°'''1;9;186;
'''eco;'''647;6;11;129;parabole
'''spl;;;;69;
'''bsu;'''789;5;9;302;croit
'''pmq;;;;68;
'''cbn;;;;56;
'''cbei;;;;35;
'''afn;;;;36;
'''ase;°315;10;17;389;P15   611
'''blo;;;;54;
'''mja;467;4;12;113;
'''mba;;;;51;
'''myr;;;;97;
'''pmg;'''831;5;7;196;décroit
'''abra;;;;41;
'''scc;;;;60;
;;;;;
;Modulo 3;total;prévu;;
;5;7;;;
;16;22;;;
;10;17;;;
;5;9;;;
;6;11;;;
;5;12;;;
;47;78;26;;
;Jusqu’à 129;;;;
;51;90;30;;
;Jusqu’à 113;;;;
&lt;/pre&gt;

=====Intercalaires entre tRNA et rRNA en continu discontinu=====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Intercalaires_entre_tRNA_et_rRNA_en_continu_discontinu|Intercalaires entre tRNA et rRNA en continu discontinu]]
*Les tRNA-tRNA x+
&lt;pre&gt;
;tRNA-tRNA;
;x+;pbs
aua;ggc-atgf;404
;ttc-acc;161
;gac-gta;270
;ccg-caa;173
ase;gga-cca;130
mja;atgj-ctc;91
;acc-caa;178
ksk;cca-gga;151
mba;gcc-atc;223
mfe;gcc-atc;227
fps;ttg-cta;290
vpb;cgt-cgt;56 &quot;8 cgt avec 6 intercalaires 56-57 et 1 de 210&quot;
rtb;cgg-caa;60
;gac-gcc;1051
rpl;cgg-caa;49
;gac-gcc;830
agr;atgj-ggc;793
;gac-gta;446
lbu;gaa-ctt;151
npu;atgj-atgj;-1
&lt;/pre&gt;
*'''Tableau'''
&lt;pre&gt;
tRNA rRNA continu discontinu;;;;;;;;les génomes à discontinu;;;
type;total;c+;x+;c-;x-;x+%;;gen;x+;gen;x+
tRNA;1745;1714;19;1;0;1,1;;ase;1;;
t-rRNA;814;810;4*;0;0;;;ksk;1;vpb;1
rRNA;1043;1043;0;0;0;;;mja;2;rtb;2
aa interne;127;127;0;0;0;;;mba;1;rpl;2
genomes;50;50;13;;;26;;mfe;1;agr;2
4*;cdc8;aaa-5s;23s’-16s;16s’-16s’;16s-5s;;;fps;1;aua;4
adresse;;4229303;4229975;4189696;4179150;;;npu;c-;lbu;1
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;c- (-1pbs);;
&lt;/pre&gt;

===Les blocs à tRNA===
===Les cds dans les blocs à tRNA===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_cds_dans_les blocs à tRNA|cds]]
&lt;pre&gt;
27.9.20 Paris;;Les cds dans les blocs tRNA sans rRNA;;;d’après les annexes
;;;;;
;;;;;
génome;sens;adresse;nom;cds aa;intercal
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma|gamma]];autres rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_opérons|eal]];comp ;2042057..2043241 ;tuf1 ;395;117
;comp ;2043359..2043431;;acc gga tac aca;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_opérons|eco]];comp ;1287087..1287176 ;tpr ;30;67
;comp ;1287244..1287328  ;;tac tac;
;;4175754..4175829;;acc aca tac gga;114
;;4175944..4177128 ;tufb ;395;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#ecoN_opérons|ecoN]];comp ;2192566..2192655;;tcg;93
;;2192749..2193546 ;DgsA;266;100
;;2193647..2193722;;aac;
;comp ;2236186..2236261;;aac;4
;;2236266..2237909 ;YeeO;548;100
;;2238010..2238085;;aac;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_opérons|amed]];comp ;3913378..3913454;;tgg;52
;comp ;3913507..3914691 ;cds;395;171
;comp ;3914863..3914937;;gga ;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha|alpha]];;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_opérons|rpm]];comp ;659042..659116 ;;gtc ;155
;comp ;659272..660159 ;hydrolase;296;106
;comp ;660266..660340;;gtc ;
;comp ;2114823..2114899;;aga;55
;comp ;2114955..2115251 ;ETC;96;71
;comp ;2115323..2115399;;cca ;
; ;2632171..2632246 ;;gcc ;166
;&lt; ;2632413..2632965 ;transposase;184;-41*
;;2632925..2633473 ;hp;183;30
;comp ;2633504..2633579 ;;aca ;93
;comp ;2633673..2634200 ;transferase;176;271
;comp ;2634472..2634561 ;;tcg;
;;2863981..2864056;aca;;15
;;2864072..2864317 ;DUF2829;82;8
;;2864326..2864401;aaa;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_opérons|rru]];;1934224..1934300;;cca ;63
;;1934364..1934663 ;ETC;100;12
;;1934676..1934752;;aga;
;comp ;3124836..3125033 ;translocase;66;151
;comp ;3125185..3125260 ;;tgg ;343
;comp ;3125604..3126794 ;ef tu;397;93
;comp ;3126888..3126961 ;;gga ;
;comp ;3126989..3127074 ;;tac ;37
;;3127112..3128158 ;RlmB;349;57
;;3128216..3128291 ;;aca ;127
;;3128419..3128652;hp;78;
;;3378495..3378569;;acc;237
;;3378807..3379370 ;hp;188;234
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_opérons|oan]];comp ;2040234..2040453 ;hp;73;91
;;2040545..2040629 ;;tac ;
;;2040654..2040727 ;;gga ;6
;comp ;2040734..2040916 ;hp;61;-50*
;;2040867..2042042 ;ef Tu;392;65
;;2042108..2042183 ;;tgg ;420
;;2042604..2042804 ;translocase;67;
;comp ;2697238..2697314;;aga;123
;comp ;2697438..2697743 ;ETC;102;156
;comp ;2697900..2697976;;cca ;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_opérons|abq]];comp ;748703..749161 ;hp;153;38
;comp ;749200..749275 ;;aca ;91
;comp ;749367..750221 ;RlmB;285;144
;;750366..750451 ;;tac ;
;;750512..750585 ;;gga ;81
;;750667..751857 ;ef Tu;397;153
;;752011..752086 ;;tgg ;69
;;752156..752353 ;Translocase;66;
; ;872533..872608 ;;atgi ;5
;comp ;872614..873093 ;GNAT;160;134
;comp ;873228..873304 ;;cgt ;
; ;1354014..1354091 ;;cca ;49
;;1354141..1354437 ;ETC;99;10
;;1354448..1354524 ;;aga ;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_opérons|abs]];comp ;1500772..1501110 ;P-II;113;338
;;1501449..1501524 ;;cac ;
;;1501634..1501709 ;;cac ;129
;;1501839..1503305 ;epimerase;489;106
;;1503412..1504977 ;Manolyl CoA;522;173
;;1505151..1505235 ;;cta ;91
;;1505327..1506661 ;trigger factor ;445;
; ;1808815..1808892 ;;cca ;49
;;1808942..1809238 ;ETC;99;10
;;1809249..1809325 ;;aga;
; ;2293805..2293881 ;;cgt ;137
;;2294019..2294495 ;GNAT;159;5
;comp ;2294501..2294576 ;;atgi;
;comp ;2418203..2418400 ;translocase;66;69
;comp ;2418470..2418545 ;;tgg ;152
;comp ;2418698..2419888 ;ef Tu;397;81
;comp ;2419970..2420043 ;;gga ;
;comp ;2420104..2420189 ;;tac ;144
;;2420334..2421188 ;RlmB;285;91
;;2421280..2421355 ;;aca ;137
;;2421493..2423187 ;integrase;565;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_opérons|agr]]; ;1532381..1532455 ;;gaa ;121
;;1532577..1532818 ;P-hp;81;89
;;1532908..1532982 ;;gaa;
; ;1770727..1772280 ;integrase;518;91
;comp ;1772372..1772448 ;;cca ;265
;;1772714..1773019 ;ETC;102;51
;;1773071..1773147 ;;aga ;7
;comp ;1773155..1773892 ;DUF429;246;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_opérons|aua]]; ;2368353..2368429 ;;cca ;43
;;2368473..2368778 ;cds;102;36
;;2368815..2368890 ;;aga;
;comp ;2641950..2642023 ;;tgc ;153
;comp &lt; ;2642177..2642443 ;cds;89;296
;;2642740..2642814 ;;aac;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#beta|beta]];néant;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#delta|delta]];néant;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli|bacilli]];autres rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_opérons|pmq]]; ;20252..21532 ;cds;427;47
;;21580..21666 ;;tca ;140
;;21807..22157 ;hp;117;17
;;22175..22357 ;hp;61;23
;;22381..22524 ;hp;48;86
;comp ;22611..22796 ;hp;62;138
;comp ;22935..25265 ;replicase ;777;156
;;25422..26165 ;hp;248;220
;comp ;26386..26460 ;;cgg ;183
;;26644..27168 ;replicase ;175;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia|clostridia]];autres rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_opérons|hmo]];comp ;105958..106044 ;;ctg ;321
;comp ;106366..106929 ;cds;188;241
;comp ;107171..107246 ;;aca;
; ;1172120..1172196 ;;agg ;181
;;1172378..1172812 ;cds;145;62
;;1172875..1172966 ;;tcg ;
; ;1764087..1764161 ;;ggc ;92
;comp ;1764254..1764493 ;cds;80;72
;;1764566..1764641 ;;tgc;
;comp ;2496451..2496527 ;;gtc ;
;comp ;2496532..2496609 ;;atgj ;175
;;2496785..2497120 ;cds;112;217
;comp ;2497338..2497420 ;;ctc;
;*** Suivent 5 tRNAs comp ***;;;;
;comp ;2497882..2497958 ;;gtg ;-10
;comp ;2497949..2498185 ;cds;79;66
;;2498252..2498328 ;;ccg;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino|actino]];autres rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/actino#ase_opérons|ase]]; ;1520472..1520544 ;;aac ;315
;;1520860..1522122 ;cds;421;236
;;1522359..1522432 ;;atg;
;comp ;4901908..4901981 ;;gcg ;19
;comp ;4902001..4902321 ;cds;107;23
;comp ;4902345..4902417 ;;gac ;
;*** 7 tRNAs ggc cds cag 20 tRNAs ***;;;;
; ;6400506..6400577 ;;ggc ;25
;;6400603..6401055 ;cds;151;35
;;6401091..6401163 ;;cag;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide|bacteroide]];fps rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacteroide#myr_opérons|myr]];comp ;719769..719842 ;;tgg ;60
;comp ;719903..721090 ;cds;396;58
;comp ;721149..721220 ;;acc;
;omp ;1929840..1929925 ;;tta ;147
;comp ;1930073..1930444 ;cds;124;108
;comp ;1930553..1930638 ;;tta;
;comp ;2208797..2208872 ;;atgf ;106
;comp ;2208979..2209605 ;cds;209;147
;comp ;2209753..2209829 ;;atgj;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyano|cyano]];npu rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/cyana#pmg_opérons|pmg]];comp ;435678..435751 ;;gac ;149
;comp ;435901..436095 ;cds;65;35
;comp ;436131..436203 ;;tgg;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes|tenericutes]];;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#abra_opérons|abra]];comp ;1540706..1540780 ;;tgg ;47
;comp ;1540828..1541754 ;cds;309;137
;;1541892..1541967 ;;cac;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/tenericutes#apal_opérons|apal]];comp ;205299..205373 ;;tgg ;73
;comp ;205447..206382 ;cds;312;133
;;206516..206591 ;;cac ;
;comp ;1457388..1457463 ;;gac ;40
;comp ;1457504..1458355 ;cds;284;154
;comp ;1458510..1458585 ;;ttc;
;*** 10 tRNAs 5s23s ***;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo|archeo]];mfi mfe rien;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mja_opérons|mja]]; ;862590..862661 ;;cga ;41
;;862703..863392 ;cds;230;86
;;863479..863555 ;;aca;
;*** 3 tRNAs 5s gac ***;;;;
[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/archeo#mba_opérons|mba]]; ;4618540..4618617 ;;gaa ;351
;;4618969..4619190 ;hp;74;377
;;4619568..4619645 ;;gaa;
&lt;/pre&gt;

==Les totaux des génomes par type==
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_totaux_des_génomes_par_type|Les totaux des génomes par type]]
*Note: c'est un tableau de contrôle construit à partir des annexes (les génomes).
&lt;pre&gt;
;publié au tableur;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;57;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;
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;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;2;acc;2;aac;1;agc;3;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;
;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;1;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;
;gtc;;gcc;1;gac;2;ggc;;;gtc;3;gcc;2;gac;2;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;publié tableur;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6;;;;;;;;;
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;cta;;cca;1;caa;1;cga;;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
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;blo;;31;;;;;;;blo;19;;;;;;;;blo;6;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;publié tableur;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;4;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
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;gtc;;gcc;2;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;2;;gtc;3;gcc;;gac;;ggc;;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
;cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
;gta;1;gca;1;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;1;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;1;aag;3;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
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;gtg;4;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;2;ggg;;;;;;;;;;
;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;sma;;48;;;;;;;sma;17;;;;;;;;sma;7;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;publié tableur;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;19;;;;;;;;;
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;
;att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
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;ttc;;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;
;atc;1;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;2;agc;;;;;;;;;;
;ctc;2;ccc;1;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2;;;;;;;;;
;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;2;;gtc;3;gcc;3;gac;;ggc;2;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
;cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
;gta;1;gca;1;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;2;agg;;;;;;;;;;
;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;2;gcg;;gag;3;ggg;;;;;;;;;;
;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;actino;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;ksk;;37;;;;;;;ksk;14;;;;;;;;ksk;19;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;12;;;;;;;;;;;;;;;;;;72
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;avant 5s;atgi;3;tct;;tat;;atgf;3
avant 5s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;3 gga;att;;act;;aat;;agt;
3 gga;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;aca ;ctt;;cct;;cat;;cgc;
aca ;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;1;;;;;;;;;;1-3 aas;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2
1-3 aas;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;;;;;;;;;2 tta;atc;1;acc;;aac;4;agc;1
2 tta;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;2 atgi;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1
2 atgi;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;2
;tta;;tca;;taa;;tga;1;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;3;tca;3;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;4;aga;4
;cta;2;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;4;caa;3;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;;gaa;4;gga;4
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;psor;;5 *;;;;;5;;psor;12;;;;;;12;;;;;;;;;;;psor;;;4;72;;7;87
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4   1-3 aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;avant 5s;atgi;2;tct;;tat;;atgf;3
avant 5s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;gga 1;att;;act;;aat;;agt;
gga 1;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;aca 1;ctt;;cct;;cat;;cgc;
aca 1;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2
;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;atc;1;acc;2;aac;2;agc;1
;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;2
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;3;tca;3;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;4;aga;4
;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;3;caa;3;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;;gaa;4;gga;4
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;cdc;;4 *;;;;;4;;cdc;4;;;;;;4;;;;;;;;;;;cdc;;;2 *;70;;3;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;avant 5s;atgi;3;tct;;tat;;atgf;4
avant 5s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;gga 1;att;;act;;aat;;agt;
gga 1;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;aca 1;ctt;;cct;;cat;;cgc;
aca 1;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;1-3 aas;ttc;4;tcc;;tac;4;tgc;2
1-3 aas;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;tta 2;atc;1;acc;;aac;5;agc;1
tta 2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;atgi 2;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;1
atgi 2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;5;ggc;2
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;4;aaa;5;aga;5
;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;3;cca;4;caa;4;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;;;;;;;;;;;;gta;6;gca;;gaa;5;gga;5
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;4;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;cdc8;;5;;;;;5;;cdc8;4;;;;;;9;;;;;;;;;;;cdc8;;;2 *;89;;4;99
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4   1-3 aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;34;;;;;;;;;2;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;2;1-3 aas;;;;;;;;
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;gca;;;;;;;;
gca;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;atgi;;;;;;;;
atgi;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;aac;;;;;;;;
aac;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ttc;;;;;;;;
ttc;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;2;;atc;;acc;;aac;;agc;;aac2;;;;;;;;
aac2;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;&gt;1aa;;;;;;;;
;tta;;tca;;taa;;tga;1;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;atgf2;;;;;;;;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;2;caa;;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;4;gca;;gaa;3;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;cbc*;;10;;;;;10;;cbc*;36;;;;;;34;;cbc*;2;;;;;;2;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;48;;;;;;;;;4;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;avant 5s;atgi;;tct;;tat;;atgf;
avant 5s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;2 aac;att;;act;;aat;;agt;
2 aac;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
1-3aas;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;2;4-8 aas;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atgi;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;gag;atc;;acc;;aac;;agc;
gca;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;caa;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
2 aaa;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;aga;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
2 ttc;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;3;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;gga;tta;;tca;;taa;;tga;
aac;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;2;aga;3;;ata;;aca;;aaa;;aga;;cta;ata;;aca;;aaa;;aga;1
;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;1;cca;2;caa;2;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;;gaa;cta;1;cca;;caa;1;cga;
-16s;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;4;gca;;gaa;2;gga;4;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;1;gga;1
atc;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;&gt;1aa;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
gca;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;3;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;tgc2;atgj;;acg;;aag;;agg;
gga;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;tca2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;cbn;;12;;;;;12;;cbn;48;;;;;;48;;cbn;4;;;;;;4;;cbn;;;;6;;;6
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;38;;;;;;;;;2;;;;;;;;;
16s5saa23s;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;
1-3;att;;act;;aat;;agt;;après 16s;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;1-3;att;;act;;aat;;agt;
aaa;ctt;;cct;;cat;;cgc;;(atcgca)2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;;aaa;ctt;;cct;;cat;;cgc;
aga;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gca4;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;aga;gtt;;gct;;gat;;ggt;
gga;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;atc1;ttc;2;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;gga;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc;2
4 ggc;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;4;agc;
gaa;ctc;;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;après 5s;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
;gtc;;gcc;1;gac;;ggc;;16s5saa23s;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;4 ggc;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
-16s;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;gaa;tta;1;tca;;taa;;tga;
tcc;ata;1;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;3;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;3;aaa;1;aga;
tca;cta;1;cca;1;caa;;cga;1;;cta;1;cca;3;caa;3;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;cgt2;cta;;cca;;caa;;cga;
agc;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;3;gca;;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;ctt2;gta;3;gca;;gaa;2;gga;
;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
;atgj;;acg;2;aag;1;agg;1;;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;16s5saa23s;atgj;2;acg;;aag;;agg;
;ctg;2;ccg;;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;cle;;19;;;;;19;;cle;38;;;;;;38;;cle;2;;;;;;2;;cle;;;;26;3;9;26
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8  1-3aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;37;;;;;;;;;;;;;;;;;;39
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;;;;;;;;;1-3 aas;atgi;;tct;;tat;;atgf;1
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;ctc;att;;act;;aat;;agt;
ctc;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;acc;ctt;;cct;;cat;;cgc;
acc;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;3 aac;gtt;;gct;;gat;;ggt;
3 aac;ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;2;tgc;1;;;;;;;;;;aaa;ttc;1;tcc;1;tac;2;tgc;2
aaa;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;;;;;;;;;;;2 atgf;atc;;acc;1;aac;1;agc;2
2 atgf;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;;;;;;;;;tgg;ctc;;ccc;2;cac;1;cgt;2
tgg;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;2;gcc;;gac;2;ggc;4;;;;;;;;;;cgg;gtc;2;gcc;;gac;2;ggc;3
cgg;tta;;tca;1;taa;;tga;1;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;2;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;;;;;;;;;;ata;;aca;;aaa;3;aga;
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;cta;;cca;;caa;3;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;3;gga;;;;;;;;;;;;gta;2;gca;;gaa;3;gga;1
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;;acg;1;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;1;;;;;;;;;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;;;;;;;;;;ctg;2;ccg;1;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;1;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;hmo;;12;;;;;12;;hmo;37;;;;;;37;;;;;;;;;;;hmo;;;;39;;11;39
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;10 1-3 aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;63;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aac 3 -5 et 3 &gt;1;att;;act;;aat;;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aaa 2 +5 et 4 &gt;1;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gca 2+16s, 2+5s;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;3;tgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
les +5s sont;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;3;agc;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
des 1-3aas;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;4;tca;2;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;4;aga;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;3;cca;2;caa;2;cga;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;5;gca;;gaa;3;gga;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;1;agg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;clos;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;cbei;;11;;;;;11;;cbei;63;;;;;;63;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2   1-3aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
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;atgj;;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;1;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;lmo;;8;;;;;8;;lmo;9;;;;;;9;;;;;;;;;;;lmo;;;;44;;;44
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2   1-3aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;14;;;;;;;;;22;;;;;;;;;3;;;;;;;;;16
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1
1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
après 5s;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
3 aac;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
tcc;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;2;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;
;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;1;acc;;aac;;agc;1
&gt;1aa;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1
ggc3;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;1
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;
;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;2;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;lam;;14;;;;;14;;lam;22;;;;;;22;;lam;3;;;;;;3;;lam;;;;16;;;16
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4   1-3aas;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;15;;;;;;;;;22;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;;;;;;;;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;;;;;;;;;;ttc;2;tcc;2;tac;3;tgc;1
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;1;;;;;;;;;;;atc;1;acc;1;aac;4;agc;2
;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;4
;gtc;1;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;1;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;4
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;2;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;ata;;aca;3;aaa;5;aga;
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;cta;2;cca;4;caa;3;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;1;gca;;gaa;2;gga;;;;;;;;;;;;gta;5;gca;2;gaa;4;gga;3
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;;;;;;;;;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;1;agg;;;;;;;;;;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;ppm;;15;;;;;15;;ppm;22;;;;;;22;;;;;;;;;;;ppm;;;;68;;;68
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;6;;;;;;;;;45;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;2;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;1;tac;3;tgc;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atc;1;acc;;aac;;agc;;;atc;2;acc;;aac;3;agc;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;1;aca;1;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;2;caa;2;cga;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;1;gaa;2;gga;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;2;tag;;tgg;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;1;aag;;agg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ppm;;6;;;;;6;;ppm;45;;;;;;45;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;11;;;;;;;;;22;;;;;;;;;2;;;;;;;;;138
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;7
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg2;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ggc2  5s;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;4;tcc;4;tac;6;tgc;3
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;5;acc;2;aac;5;agc;3
;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;2;ccc;;cac;3;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;4;ccc;;cac;4;cgt;7
;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;3;gcc;1;gac;6;ggc;9
;tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;4;aaa;8;aga;1
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;7;caa;6;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;7;gca;4;gaa;7;gga;2
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;2;tcg;2;tag;;tgg;3
;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;2;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;2;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;5;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;pmq;;11;;;;;11;;pmq;22;;;;;;22;;pmq;2;;;;;;2;;pmq;;;;138;;;138
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;16;;;;;;;;;49;;;;;;;;;7;;;;;;;;;16
;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
;att;;act;2;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;ttg2;ttc;3;tcc;;tac;3;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;
;atc;;acc;1;aac;;agc;1;aag5;atc;1;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;2;agc;
;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;2
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;4;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;2
;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
;cta;;cca;;caa;2;cga;;;cta;1;cca;2;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;3;gca;;gaa;3;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;3;gca;;gaa;2;gga;
;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
;atgj;;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;5;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;
;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;lbu;;16;;;;;16;;lbu;49;;;;;;49;;lbu;7;;;;;;7;;lbu;;;;16;;;16
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;5;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;93
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3
;att;;act;;aat;;agt;;tca2 5s;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;;ttc;3;tcc;;tac;2;tgc;1
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;atc;3;acc;2;aac;6;agc;2
;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;4
;gtc;1;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;gtc;;gcc;;gac;5;ggc;6
;tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;tta;4;tca;5;taa;;tga;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;;;;;;;;;;ata;;aca;5;aaa;4;aga;
;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;;;cta;5;cca;4;caa;4;cga;
;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;2;gga;1;;;;;;;;;;;gta;6;gca;4;gaa;6;gga;2
;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;3
;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;1;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;baci;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;ban;;5;;;;;5;;ban;8;;;;;;8;;;;;;;;;;;ban;;;;93;;;93
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2 1-3aas;33 -16s;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;25;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atc;;acc;1;aac;1;agc;1;;atc;1;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtc;1;gcc;;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;cta;1;cca;1;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;1;cga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gta;1;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;alpha;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;aua;;30;;;;;30;;aua;10;;;;;;10;;aua;13;;;;;;13;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;22;;;;;;;;;37;;;;;;;;;23;;;;;;;;;
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;gtt;;gct;;gat;;ggt;;ggc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;
;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;;aac3;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;;;;;;;;;;
;atc;;acc;1;aac;1;agc;;tcc2;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;3;agc;;;;;;;;;;
;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;cac3;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;3;cgt;;;;;;;;;;
;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;;ctg4;gtc;;gcc;2;gac;7;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;5;;;;;;;;;
;tta;1;tca;1;taa;;tga;;ccg2;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
;ata;;aca;1;aaa;;aga;;atgj2;ata;;aca;;aaa;3;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
;cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;6;gca;;gaa;4;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;séquences;atgj;;acg;1;aag;2;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;2;cag;;cgg;;;;;;;;;;
;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;(gaa cgt)2;gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
;beta;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(gta gac)5 gtg gac;beta;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;beta;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;cvi;;22;;;;;22;(aaa aag)2 aaa;cvi;37;;;;;;37;;cvi;23;;;;;;23;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;27;;;;;;;;;18;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;1;;ttc;;tcc;1;tac;1;tgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atc;;acc;1;aac;;agc;;;atc;;acc;1;aac;;agc;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;tta;1;tca;;taa;;tga;1;;tta;;tca;1;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;1;aaa;;aga;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;cta;1;cca;;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;1;gca;;gaa;;gga;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;atgj;1;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;;acg;;aag;1;agg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;1;cgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;delta;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;delta;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;ade;;27;;;;;;;ade;18;;;;;;18;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;46;;;;;;;;;79;;;;;;;;;
;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;6;;;;;;;;;
;att;;act;;aat;;agt;;1-3 aas;att;;act;;aat;;agt;;spl;att;;act;;aat;;agt;;spl;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;après 5s;ctt;;cct;;cat;;cgc;;gta11;ctt;;cct;;cat;;cgc;;gta11;;;;;;;;
;gtt;;gct;;gat;;ggt;;acc;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tca2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tca2;;;;;;;;
;ttc;1;tcc;1;tac;;tgc;;2 gac;ttc;3;tcc;;tac;;tgc;4;cca2;ttc;;tcc;;tac;5;tgc;;cca2;;;;;;;;
;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;3;tac5;atc;;acc;;aac;7;agc;;tac5;;;;;;;;
;ctc;;ccc;1;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;2;cgt;;aac7;ctc;;ccc;;cac;;cgt;7;aac7;;;;;;;;
;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;séquences;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;;gac4 ;gtc;;gcc;;gac;4;ggc;8;gac4 ;;;;;;;;
;tta;;tca;2;taa;;tga;;(aca ttc)2;tta;4;tca;;taa;;tga;;aaa12;tta;;tca;2;taa;;tga;;aaa12;;;;;;;;
;ata;;aca;;aaa;;aga;;(tgc tta)3;ata;;aca;4;aaa;;aga;1;gaa13;ata;;aca;;aaa;12;aga;;gaa13;;;;;;;;
;cta;;cca;;caa;;cga;;(atf gtc)2;cta;5;cca;1;caa;5;cga;;atgf4+2;cta;;cca;2;caa;;cga;;atgf4+2;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;(caa cta atgj)3 ;gta;;gca;;gaa;;gga;1;cgt5+2;gta;11;gca;;gaa;13;gga;;cgt5+2;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;ou;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc8;ttg;;tcg;;tag;;tgg;2;ggc8;;;;;;;;
;atgj;;acg;;aag;;agg;1;(caa cta)5;atgj;3;acg;;aag;;agg;;tgg2;atgj;;acg;;aag;;agg;;tgg2;;;;;;;;
;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
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;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;spl;;8;;;;;8;;spl;46;;;;;;46;;spl;79;;;;;;79;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;11;;;;;;;;;60;;;;;;;;;22;;;;;;;;;
gtc2;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;6;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;gtc2;;;;;;;;
cta2+2;att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;att;;act;;aat;;agt;;cta2+2;;;;;;;;
tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;;;;;;;;
cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;gtt;;gct;;gat;;ggt;;cgt8;;;;;;;;
ggc4;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;ggc4;ttc;4;tcc;;tac;1;tgc;4;ggc4;ttc;;tcc;;tac;4;tgc;;ggc4;;;;;;;;
;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;1;aac;4;agc;2;;atc;;acc;;aac;;agc;;;;;;;;;;
acc 5s + 1 &gt;a;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;;acc 5s + 1 &gt;a;ctc;1;ccc;;cac;2;cgt;1;acc 5s + 1 &gt;a;ctc;;ccc;;cac;;cgt;8;acc 5s + 1 &gt;a;;;;;;;;
tca 2 5s+ 2 a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;tca 2 5s+ 2 a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;7;tca 2 5s+ 2 a;gtc;2;gcc;;gac;;ggc;4;tca 2 5s+ 2 a;;;;;;;;
;tta;;tca;2;taa;;tga;;;tta;3;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
;ata;;aca;;aaa;;aga;1;;ata;;aca;5;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
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(cac cca)2;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
(cgt agc)2;atgj;;acg;;aag;;agg;1;;atgj;4;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
ttc (aca aac)2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
ttc (aca ttc aac)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
cta (cta atgj cta caa)2 (cta caa)2 cta (cta atgj) caa (cta atgj);gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
(atgf ggc)2 ggc3 (atgf ggc)3;vpb;;11;;;;;11;;vpb;60;;;;;;60;;vpb;22;;;;;;22;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;14;;;;;;;;;51;;;;;;;;;19;;;;;;;;;
gtc2;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;8;gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;gtc2;;;;;;;;
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tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;ctt;;cct;;cat;;cgc;;tac4;;;;;;;;
tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;tgc2;;;;;;;;
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ggc3;atc;;acc;;aac;1;agc;;ggc3;atc;;acc;1;aac;4;agc;2;ggc3;atc;;acc;;aac;;agc;;ggc3;;;;;;;;
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acc 5s + 1 &gt;a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;acc 5s + 1 &gt;a;gtc;;gcc;;gac;;ggc;5;acc 5s + 1 &gt;a;gtc;2;gcc;;gac;;ggc;3;acc 5s + 1 &gt;a;;;;;;;;
tca 2 5s+ 2 a;tta;;tca;2;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;tta;3;tca;;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;tta;;tca;;taa;;tga;;tca 2 5s+ 2 a;;;;;;;;
gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;;aaa;;aga;1;gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;5;aaa;;aga;;gga 1&gt;a + 3a;ata;;aca;;aaa;;aga;;gga 1&gt;a + 3a;;;;;;;;
;cta;;cca;1;caa;;cga;;;cta;3;cca;2;caa;2;cga;;;cta;2;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
séquences;gta;;gca;;gaa;;gga;3;séquences;gta;;gca;;gaa;;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
(cac cca)2;atgj;;acg;;aag;;agg;1;(cac cca)2;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
cgt5 (cgt agc)2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;cgt5 (cgt agc)2;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
ttc (aca aac)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;ttc (aca aac)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
(atgf ggc) ggc2 (atgf ggc)4;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(atgf ggc) ggc2 (atgf ggc)4;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
ttc aca (ttc aac) aca (ttc aac);vha;;14;;;;;14;ttc aca (ttc aac) aca (ttc aac);vha;51;;;;;;51;;vha;19;;;;;;19;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;16;;;;;;;;;47;;;;;;;;;46;;;;;;;;;
amed;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;amed;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;amed;atgi;;tct;;tat;;atgf;9;amed;;;;;;;;
gtc5;att;;act;;aat;;agt;;gtc5;att;;act;;aat;;agt;;gtc5;att;;act;;aat;;agt;;gtc5;;;;;;;;
ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctg5;;;;;;;;
gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc5;;;;;;;;
tac3+2;ttc;;tcc;3;tac;;tgc;;tac3+2;ttc;3;tcc;;tac;1;tgc;2;tac3+2;ttc;;tcc;;tac;5;tgc;;tac3+2;;;;;;;;
aac2;atc;;acc;;aac;1;agc;;aac2;atc;;acc;;aac;3;agc;1;aac2;atc;;acc;;aac;2;agc;;aac2;;;;;;;;
caa2+2;ctc;;ccc;2;cac;;cgt;;caa2+2;ctc;1;ccc;;cac;3;cgt;;caa2+2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;5;caa2+2;;;;;;;;
atgf9;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;atgf9;gtc;;gcc;;gac;;ggc;2;atgf9;gtc;5;gcc;5;gac;;ggc;6;atgf9;;;;;;;;
cgt5;tta;;tca;1;taa;;tga;;cgt5;tta;1;tca;;taa;;tga;;cgt5;tta;;tca;;taa;;tga;;cgt5;;;;;;;;
ggc6;ata;;aca;;aaa;;aga;;ggc6;ata;;aca;1;aaa;5;aga;2;ggc6;ata;;aca;;aaa;;aga;;ggc6;;;;;;;;
;cta;;cca;;caa;1;cga;;;cta;1;cca;2;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;4;cga;;;;;;;;;;
;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;7;gca;;gaa;;gga;3;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
séquences;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;séquences;atgj;3;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;5;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
(atgj caa2)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;(atgj caa2)2;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
(gta aaa)4 (gta aag)2 gta aaa;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(gta aaa)4 (gta aag)2 gta aaa;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;amed;;16;;;;;16;;amed;47;;;;;;47;;amed;46;;;;;;46;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;23;;;;;;;;;25;;;;;;;;;23;;;;;;;;;
atgi 2a+&gt;a;atgi;2;tct;;tat;;atgf;1;atgi 2a+&gt;a;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;atgi 2a+&gt;a;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;atgi 2a+&gt;a;;;;;;;;
gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;;;;;;;;
gta2;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;;gta2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;gta2;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;gta2;;;;;;;;
ctg3;atc;;acc;;aac;4;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;ctg3;atc;;acc;;aac;;agc;;ctg3;;;;;;;;
gcc2;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;3;gcc2;;;;;;;;
tac2;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;tac2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;tac2;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;2;tac2;;;;;;;;
caa2;tta;;tca;1;taa;;tga;1;caa2;tta;1;tca;;taa;;tga;;caa2;tta;;tca;;taa;;tga;;caa2;;;;;;;;
cag2;ata;;aca;;aaa;;aga;1;cag2;ata;;aca;2;aaa;4;aga;1;cag2;ata;;aca;;aaa;;aga;;cag2;;;;;;;;
atgf3;cta;;cca;;caa;;cga;;atgf3;cta;1;cca;1;caa;;cga;;atgf3;cta;;cca;;caa;2;cga;;atgf3;;;;;;;;
cgt3;gta;;gca;;gaa;;gga;;cgt3;gta;2;gca;;gaa;;gga;2;cgt3;gta;2;gca;;gaa;;gga;;cgt3;;;;;;;;
ggc2;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;ggc2;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc2;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ggc2;;;;;;;;
;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;2;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;
;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;3;ccg;;cag;2;cgg;;;;;;;;;;
séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;
aaa (gta aaa)2;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;aaa (gta aaa)2;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
;eal;;23;;;;;23;;eal;25;;;;;;25;;eal;23;;;;;;23;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;23;;;;;;;;;20;;;;;;;;;29;;;;;;;;;
;atgi;2;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;;;;;;;;;
gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;att;;act;;aat;;agt;;gac a+2 5s;;;;;;;;
;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtc2;;;;;;;;
gta3;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;;gta3;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;gta3;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;gta3;;;;;;;;
ctg3;atc;;acc;;aac;4;agc;;ctg3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;ctg3;atc;;acc;;aac;;agc;;ctg3;;;;;;;;
gcc2;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;gcc2;ctc;;ccc;;cac;;cgt;4;gcc2;;;;;;;;
tac2;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;tac2;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;tac2;gtc;2;gcc;2;gac;;ggc;3;tac2;;;;;;;;
aaa3;tta;;tca;1;taa;;tga;1;aaa3;tta;1;tca;;taa;;tga;;aaa3;tta;;tca;;taa;;tga;;aaa3;;;;;;;;
caa2;ata;;aca;;aaa;;aga;1;caa2;ata;;aca;1;aaa;3;aga;;caa2;ata;;aca;;aaa;3;aga;;caa2;;;;;;;;
cag2;cta;;cca;;caa;;cga;;cag2;cta;1;cca;1;caa;;cga;;cag2;cta;;cca;;caa;2;cga;;cag2;;;;;;;;
atgf3;gta;;gca;;gaa;;gga;;atgf3;gta;2;gca;;gaa;;gga;1;atgf3;gta;3;gca;;gaa;;gga;;atgf3;;;;;;;;
cgt4;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;cgt4;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;cgt4;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;cgt4;;;;;;;;
ggc3;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;ggc3;atgj;2;acg;;aag;;agg;;ggc3;atgj;;acg;;aag;;agg;;ggc3;;;;;;;;
;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;3;ccg;;cag;2;cgg;;;;;;;;;;
séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;séquences;;;;;;;;
(aaa gta)2 aaa3;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(aaa gta)2 aaa3;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;(aaa gta)2 aaa3;;;;;;;;
;eco;;23;;;;;23;;eco;20;;;;;;20;;eco;29;;;;;;29;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;34;;;;;;;;;20;;;;;;;;;44;;;;;;;;;
3 gtc2;atgi;1;tct;;tat;;atgf;4;3 gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;;3 gtc2;atgi;;tct;;tat;;atgf;3;3 gtc2;;;;;;;;
gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;att;;act;;aat;;agt;;gta2 + 3;;;;;;;;
2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;ctt;;cct;;cat;;cgc;;2 ctg3;;;;;;;;
gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;gtt;;gct;;gat;;ggt;;gcc2 + 3;;;;;;;;
tac2;ttc;2;tcc;4;tac;;tgc;;tac2;ttc;;tcc;;tac;1;tgc;1;tac2;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;tac2;;;;;;;;
aaa3;atc;1;acc;1;aac;3;agc;;aaa3;atc;;acc;1;aac;;agc;1;aaa3;atc;2;acc;;aac;;agc;;aaa3;;;;;;;;
atgf3;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt;;atgf3;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;;atgf3;ctc;;ccc;;cac;;cgt;5;atgf3;;;;;;;;
ggc3;gtc;;gcc;;gac;1;ggc;;ggc3;gtc;;gcc;;gac;;ggc;1;ggc3;gtc;6;gcc;5;gac;;ggc;3;ggc3;;;;;;;;
atc :;tta;;tca;1;taa;;tga;2;atc :;tta;1;tca;;taa;;tga;;atc :;tta;;tca;;taa;;tga;;atc :;;;;;;;;
4 16s atc2 aa;ata;;aca;;aaa;;aga;2;4 16s atc2 aa;ata;;aca;1;aaa;3;aga;;4 16s atc2 aa;ata;;aca;;aaa;3;aga;;4 16s atc2 aa;;;;;;;;
gaa :;cta;;cca;;caa;;cga;;gaa :;cta;1;cca;1;caa;;cga;;gaa :;cta;;cca;;caa;2;cga;;gaa :;;;;;;;;
7 16s 5s 4aa;gta;;gca;;gaa;4;gga;;7 16s 5s 4aa;gta;2;gca;;gaa;;gga;1;7 16s 5s 4aa;gta;5;gca;;gaa;;gga;;7 16s 5s 4aa;;;;;;;;
acc :;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;acc :;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;acc :;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;acc :;;;;;;;;
2 5s &gt;aa aa;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;2 5s &gt;aa aa;atgj;2;acg;;aag;;agg;;2 5s &gt;aa aa;atgj;;acg;;aag;;agg;;2 5s &gt;aa aa;;;;;;;;
;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1;;ctg;6;ccg;;cag;2;cgg;;;;;;;;;;
gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;gac : 2 5s aa;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;gac : 2 5s aa;;;;;;;;
séquences;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;;;;;;;;
(aaa gta)2 aaa3;ecoN;;34;;;;;34;;ecoN;20;;;;;;20;;ecoN;44;;;;;;44;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;912;;;;;;;;;1047;;;;;;;;;493;;;;;;;;;751
;atgi;30;tct;0;tat;0;atgf;30;;atgi;7;tct;0;tat;0;atgf;36;;atgi;2;tct;0;tat;0;atgf;30;;atgi;14;tct;0;tat;0;atgf;31
;att;0;act;3;aat;0;agt;1;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0
;ctt;4;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;3;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;2;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0
;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0
;ttc;21;tcc;37;tac;7;tgc;16;;ttc;35;tcc;6;tac;44;tgc;38;;ttc;9;tcc;2;tac;28;tgc;4;;ttc;28;tcc;10;tac;26;tgc;17
;atc;4;acc;18;aac;28;agc;18;;atc;7;acc;22;aac;35;agc;34;;atc;2;acc;5;aac;22;agc;0;;atc;15;acc;9;aac;38;agc;15
;ctc;30;ccc;28;cac;14;cgt;15;;ctc;15;ccc;1;cac;34;cgt;19;;ctc;2;ccc;0;cac;11;cgt;49;;ctc;4;ccc;2;cac;20;cgt;30
;gtc;19;gcc;16;gac;14;ggc;17;;gtc;11;gcc;14;gac;54;ggc;59;;gtc;28;gcc;25;gac;13;ggc;43;;gtc;5;gcc;1;gac;41;ggc;38
;tta;18;tca;36;taa;0;tga;9;;tta;31;tca;12;taa;0;tga;0;;tta;2;tca;4;taa;0;tga;0;;tta;24;tca;19;taa;0;tga;0
;ata;1;aca;19;aaa;17;aga;29;;ata;1;aca;43;aaa;44;aga;21;;ata;0;aca;7;aaa;25;aga;2;;ata;0;aca;33;aaa;41;aga;15
;cta;21;cca;20;caa;19;cga;3;;cta;32;cca;39;caa;37;cga;7;;cta;8;cca;4;caa;12;cga;0;;cta;20;cca;33;caa;29;cga;0
;gta;13;gca;4;gaa;15;gga;15;;gta;54;gca;7;gaa;52;gga;45;;gta;26;gca;0;gaa;25;gga;6;;gta;51;gca;17;gaa;42;gga;25
;ttg;34;tcg;26;tag;0;tgg;31;;ttg;8;tcg;5;tag;0;tgg;13;;ttg;2;tcg;0;tag;0;tgg;2;;ttg;7;tcg;2;tag;0;tgg;12
;atgj;15;acg;28;aag;18;agg;31;;atgj;39;acg;5;aag;12;agg;1;;atgj;6;acg;0;aag;16;agg;0;;atgj;23;acg;2;aag;0;agg;0
;ctg;20;ccg;15;cag;9;cgg;24;;ctg;16;ccg;4;cag;14;cgg;10;;ctg;28;ccg;8;cag;10;cgg;0;;ctg;9;ccg;1;cag;0;cgg;0
;gtg;10;gcg;13;gag;9;ggg;20;;gtg;5;gcg;5;gag;5;ggg;6;;gtg;8;gcg;3;gag;12;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;1;ggg;1
;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;total;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;751;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;(sans abra apl 729);;;
&lt;/pre&gt;
===Les totaux des types===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_totaux_des_types|Les totaux des types]]
&lt;pre&gt;
bacts;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;duplicata;1-3aas;total
;1047;912;13;751;11;304;493;135;3666
&lt;/pre&gt;

===La référence +5s &gt;3===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#La_référence_+5s_&gt;3|La référence +5s &gt;3]]
&lt;pre&gt;
La référence;;;;;;;
+5s;sans 1-3aas;;729;;;;
atgi;12;tct;;tat;;atgf;29
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;26;tcc;10;tac;26;tgc;17
atc;15;acc;9;aac;38;agc;15
ctc;4;ccc;2;cac;20;cgt;30
gtc;5;gcc;1;gac;39;ggc;38
tta;22;tca;17;taa;;tga;
ata;;aca;31;aaa;39;aga;15
cta;20;cca;33;caa;29;cga;
gta;49;gca;15;gaa;42;gga;25
ttg;7;tcg;2;tag;;tgg;12
atgj;21;acg;2;aag;;agg;
ctg;9;ccg;1;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;1
;;;;;;;
faible 21;19;0.9;;;;;
moyen 16;236;14.8;;;;;
fort 14;474;33.9;;;;;
;729;;;;;;
g+cga 10;7;0.7;;;;;
agg+cgg;0;;;;;;
4 ccc;12;3.0;;;;;
autres 5;0;;;;;;
;19;;;;;;
&lt;/pre&gt;

===totaux par rapport au groupe de référence===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#totaux_par_rapport_au_groupe_de_référence|totaux par rapport au groupe de référence]]
&lt;pre&gt;
tRNAs;;blocs tRNAs;;;blocs rRNAs;;;;
;bacts;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;
21;faible;317;124;114;19;2;7;583;
16;moyen;345;327;80;246;43;253;1294;
14;fort;250;596;299;486;90;68;1789;
; ;912;1047;493;751;135;328;3666;
10;g+cga;151;68;57;7;;;283;
2;agg+cgg;55;11;;12;1;;79;
4;carre ccc;93;41;55;;1;7;197;
5;autres;18;4;2;;;;24;
;;317;124;114;19;2;7;583;
;total tRNAs  ‰ ;;;;;;;;
;bacts;1aa;&gt;1aa;dup;+5s;1-3aas;autres;total;ref. ‰
21;faible;86;34;31;5;1;2;159;26
16;moyen;94;89;22;67;12;69;353;324
14;fort;68;163;82;133;25;19;488;650
; ;249;286;134;205;37;89;3666;729
10;g+cgg;41;19;16;2;;;77;10
2;agg+cga;15;3;;3;0.3;;22;
4;carre ccc;25;11;15;;0.3;2;54;16
5;autres;5;1.1;0.5;;;;7;
;;86;34;31;5;0.5;2;159;
;blocs tRNAs ‰ ;;;;;;total colonne %;;
;bacts;1aa;&gt;1aa;dup;total;ref. ‰;1aa;&gt;1aa;dup
21;faible;129;51;46;226;26;35;12;23
16;moyen;141;133;33;307;324;38;31;16
14;fort;102;243;122;467;650;27;57;61
; ;372;427;201;2452;729;912;1047;493
10;g+cgg;62;28;23;113;10;48;55;50
2;agg+cga;22;4; ;27;;17;9;
4;carre ccc;38;17;22;77;16;29;33;48
5;autres;7;2;0.8;10;;6;3;2
;;129;51;46;226;;317;124;114
&lt;/pre&gt;

==Caractérisation des tRNAs==
===Caractérisation d'un tRNA par les 4 processus +5s 1aa &gt;1aa duplication===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Caractérisation_d'un_tRNA_par_les_4_processus_+5s_1aa_&gt;1aa_duplication|Caractérisation d'un tRNA par les 4 processus +5s 1aa &gt;1aa duplication]]
&lt;pre&gt;
gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;;;
atgi;14;30;7;2;tct;;;;;tat;;;;;atgf;31;30;36;30;;;
att;;;;;act;;3;;;aat;;;;;agt;;1;;;;;
ctt;;4;3;2;cct;;;;;cat;;;;;cgc;;;;;;;
gtt;;;;;gct;;;;;gat;;;;;ggt;;;;;;;
ttc;28;21;35;9;tcc;10;37;6;2;tac;26;7;44;28;tgc;17;16;38;4;;tener2;2*11
atc;15;4;7;2;acc;9;18;22;5;aac;38;28;35;22;agc;15;18;34;;;atgi j f;tca
ctc;4;30;15;2;ccc;2;28;1;;cac;20;14;34;11;cgt;30;15;19;49;;ttc;aca
gtc;5;19;11;28;gcc;1;16;14;25;gac;41;14;54;13;ggc;38;17;59;43;;tta;gca
tta;24;18;31;2;tca;19;36;12;4;taa;;;;;tga;;9;;;;gta;gac
ata;;1;1;0;aca;33;19;43;7;aaa;41;17;44;25;aga;15;29;21;2;;aaa;+5s
cta;20;21;32;8;cca;33;20;39;4;caa;29;19;37;12;cga;;3;7;;;;
gta;51;13;54;26;gca;17;4;7;;gaa;42;15;52;25;gga;25;15;45;6;;;
ttg;7;34;8;2;tcg;2;26;5;;tag;;;;;tgg;12;31;13;2;;;
atgj;23;15;39;6;acg;2;28;5;;aag;;18;12;16;agg;;31;1;;;;
ctg;9;20;16;28;ccg;1;15;4;8;cag;;9;14;10;cgg;;24;10;;;;
gtg;;10;5;8;gcg;;13;5;3;gag;1;9;5;12;ggg;1;20;6;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;200;240;264;125;;129;263;163;58;;238;150;331;174;;184;259;289;136;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;751;912;1047;493;;3203;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Pour 1000;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;gène;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;;;
atgi;19;33;7;4;tct;;;;;tat;;;;;atgf;41;33;34;61;;;
att;;;;;act;;3;;;aat;;;;;agt;;1;;;;;
ctt;;4;3;4;cct;;;;;cat;;;;;cgc;;;;;;;
gtt;;;;;gct;;;;;gat;;;;;ggt;;;;;;;
ttc;37;23;33;18;tcc;13;41;6;4;tac;35;8;42;57;tgc;23;18;36;8;;;
atc;20;4;7;4;acc;12;20;21;10;aac;51;31;33;45;agc;20;20;32;;;;
ctc;5;33;14;4;ccc;3;31;1;;cac;27;15;32;22;cgt;40;16;18;99;;;
gtc;7;21;11;57;gcc;1;18;13;51;gac;55;15;52;26;ggc;51;19;56;87;;;
tta;32;20;30;4;tca;25;39;11;8;taa;;;;;tga;;10;;;;;
ata;;1;1;;aca;44;21;41;14;aaa;55;19;42;51;aga;20;32;20;4;;;
cta;27;23;31;16;cca;44;22;37;8;caa;39;21;35;24;cga;;3;7;;;;
gta;68;14;52;53;gca;23;4;7;;gaa;56;16;50;51;gga;33;16;43;12;;;
ttg;9;37;8;4;tcg;3;29;5;;tag;;;;;tgg;16;34;12;4;;;
atgj;31;16;37;12;acg;3;31;5;;aag;;20;11;32;agg;;34;1;;;;
ctg;12;22;15;57;ccg;1;16;4;16;cag;;10;13;20;cgg;;26;10;;;;
gtg;;11;5;16;gcg;;14;5;6;gag;1;10;5;24;ggg;1;22;6;;;;
&lt;/pre&gt;
====Construction du tableau avec les sous-totaux====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Construction_du_tableau_avec_les_sous-totaux|Construction du tableau avec les sous-totaux]]
*Lien tableur au tableau de contrôle: [[#Les_totaux_des_g%C3%A9nomes_par_type|tableau]]
*Notes: Pour le 1er tRNA d'une colonne je somme sur une colonne de type, des sous totaux ci-dessous, et je copie &quot;formule&quot; pour les autres tRNAs de la colonne. Je récupère l'argument de cette somme sur un txt. Pour les arguments des 2 autres types (colonne) je change le nom de la colonne dans txt et je copie l'argument dans SOMME().
*Les sous-totaux: D'abord j'ai sommé le total (totaux de la fin du tableau de contrôle). Je repère les lignes de chaque clade pour faire le sous-total du clade. Ce n'est pas la peine de cliquer sur chaque case. Il suffit de récupérer l'argument de la somme de tous les génomes d'une colonne et de découper cet argument d'après le relevé des lignes de chaque clade.
&lt;pre&gt;
bact2;;;;;;;121;;bact2;;;;;;;36;;bact2;;;;;;;22;;bact2;;;;;;;63;;bact2;;;;;;;0
atgi;3;tct;;tat;;atgf;5;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;4;tcc;1;tac;7;tgc;2;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;;;ttc;3;tcc;;tac;4;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;2;aac;3;agc;3;;atc;;acc;;aac;1;agc;;;atc;;acc;2;aac;;agc;3;;atc;;acc;;aac;2;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;;cac;5;cgt;3;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;4;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;1;gac;4;ggc;2;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;2;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;1;tca;4;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;8;aaa;8;aga;4;;ata;;aca;1;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;1;aga;2;;ata;;aca;5;aaa;7;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;3;cca;6;caa;3;cga;2;;cta;;cca;2;caa;1;cga;2;;cta;1;cca;2;caa;;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;9;gca;;gaa;8;gga;7;;gta;3;gca;;gaa;;gga;1;;gta;1;gca;;gaa;;gga;;;gta;5;gca;;gaa;8;gga;6;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;3;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;3;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;3;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;1 -16s tac;28;150;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;*;1 -16s tac;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
tener2;;;;;;;66;;tener2;;;;;;;23;;tener2;;;;;;;21;;tener2;;;;;;;;;tener2;;;;;;;22
atgi;2;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;2
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;2;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;2;aac;;agc;2;;atc;;acc;2;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;2;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;2;cgt;2;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;4;ggc;2;;gtc;1;gcc;;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;2;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;2;tca;2;taa;;tga;
ata;;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;
cta;2;cca;3;caa;2;cga;1;;cta;1;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;3;caa;2;cga;1;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;2;gaa;4;gga;2;;gta;;gca;;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;3;gga;2;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;2;gaa;;gga;
ttg;2;tcg;1;tag;;tgg;2;;ttg;2;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;2;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;1;aag;2;agg;1;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;6 1-3aas aac;2 -16s tac;6;80;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;*;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6 1-3aas aac;2 -16s tac;;
cyano2;;;;;;;99;;cyano2;;;;;;;72;;cyano2;;;;;;;23;;cyano2;;;;;;;4;;cyano2;;;;;;;
atgi;3;tct;;tat;;atgf;3;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;3;;ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;2;tgc;1;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;3;aac;3;agc;3;;atc;;acc;1;aac;2;agc;2;;atc;;acc;2;aac;1;agc;1;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;2;ccc;2;cac;2;cgt;3;;ctc;1;ccc;2;cac;2;cgt;2;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;2;gcc;2;gac;3;ggc;2;;gtc;2;gcc;1;gac;2;ggc;2;;gtc;;gcc;1;gac;1;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;2;tca;2;taa;;tga;;;tta;1;tca;2;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;2;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;3;cca;3;caa;3;cga;;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;2;gaa;3;gga;2;;gta;2;gca;1;gaa;2;gga;2;;gta;;gca;1;gaa;1;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;3;tcg;2;tag;;tgg;3;;ttg;2;tcg;2;tag;;tgg;2;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;4;acg;2;aag;1;agg;2;;atgj;2;acg;2;aag;1;agg;2;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;2;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;2;cag;1;cgg;2;;ctg;1;ccg;1;cag;;cgg;2;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;10;109;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;*;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
actino4;;;;;;;294;;actino4;;;;;;;148;;actino4;;;;;;;108;;actino4;;;;;;;38;;;;;;;;;
atgi;4;tct;;tat;;atgf;11;;atgi;3;tct;;tat;;atgf;10;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;;;;;;;;
att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;1;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;
ttc;5;tcc;5;tac;5;tgc;10;;ttc;1;tcc;4;tac;3;tgc;3;;ttc;4;tcc;1;tac;2;tgc;7;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;
atc;5;acc;7;aac;9;agc;7;;atc;2;acc;2;aac;2;agc;2;;atc;3;acc;5;aac;1;agc;5;;atc;;acc;;aac;6;agc;;;;;;;;;;
ctc;8;ccc;6;cac;5;cgt;9;;ctc;6;ccc;6;cac;4;cgt;1;;ctc;2;ccc;;cac;1;cgt;4;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;4;;;;;;;;;
gtc;11;gcc;10;gac;10;ggc;14;;gtc;;gcc;3;gac;5;ggc;1;;gtc;5;gcc;2;gac;5;ggc;11;;gtc;6;gcc;5;gac;;ggc;2;;;;;;;;;
tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;;;;;;;;
ata;;aca;4;aaa;5;aga;5;;ata;;aca;4;aaa;4;aga;4;;ata;;aca;;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;;;;;;;;
cta;4;cca;6;caa;3;cga;;;cta;3;cca;2;caa;3;cga;;;cta;1;cca;4;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;;;;;;;;
gta;4;gca;5;gaa;5;gga;7;;gta;4;gca;2;gaa;1;gga;2;;gta;;gca;3;gaa;4;gga;5;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;;;;;;;;
ttg;5;tcg;4;tag;;tgg;7;;ttg;4;tcg;4;tag;;tgg;5;;ttg;1;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;
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atgi;11;tct;0;tat;0;atgf;48;;atgi;9;tct;;tat;;atgf;6;;atgi;2;tct;;tat;;atgf;18;;atgi;;tct;;tat;;atgf;24;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
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ttg;7;tcg;4;tag;0;tgg;4;;ttg;7;tcg;4;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;2;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;8
atgj;19;acg;4;aag;2;agg;7;;atgj;;acg;4;aag;;agg;7;;atgj;19;acg;;aag;2;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;21;ccg;4;cag;6;cgg;7;;ctg;;ccg;4;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;;cag;;cgg;7;;ctg;17;ccg;;cag;6;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;4;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;3;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;gama;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
;;;;;;;;;;;*;;;;;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;1-3aas;;;;45;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
afn;;;;;;;56;;afn;;;;;;;20;;afn;;;;;;;34;;afn;;;;;;;2;;afn;;;;;;;
atgi;1;tct;0;tat;0;atgf;1;;atgi;1;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;;tct;;tat;;atgf;
att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;0;cct;0;cat;0;cgc;0;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;1;tcc;2;tac;1;tgc;2;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;2;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;0;acc;1;aac;2;agc;1;;atc;;acc;;aac;1;agc;1;;atc;;acc;1;aac;1;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;;aac;;agc;
ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt;1;;ctc;;ccc;1;cac;;cgt;1;;ctc;1;ccc;;cac;1;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;1;gcc;1;gac;3;ggc;4;;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1;;gtc;;gcc;;gac;3;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;
tta;1;tca;1;taa;0;tga;0;;tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;1;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;0;aca;1;aaa;2;aga;1;;ata;;aca;;aaa;1;aga;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;;aca;;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;1;cca;1;caa;1;cga;0;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;0;gaa;2;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;2;gca;;gaa;2;gga;1;;gta;;gca;;gaa;;gga;;;gta;;gca;;gaa;;gga;
ttg;1;tcg;1;tag;0;tgg;1;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;1;acg;1;aag;1;agg;1;;atgj;;acg;1;aag;;agg;1;;atgj;1;acg;;aag;1;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;2;ccg;1;cag;2;cgg;1;;ctg;;ccg;1;cag;;cgg;1;;ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;2;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1;;gtg;1;gcg;1;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;1;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;duplicata;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total;;total;&gt;1aa;1aa;-5s;+5s;-16s;+16s;total
&lt;/pre&gt;
===Les processus +16s -16s -5s 1-3aas===
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_processus_+16s_-16s_-5s_1-3aas|Les autres processus +16s -16s -5s 1-3aas]]
====Les processus +16s -16s 1-3aas -5s comparés à la référence====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_processus_+16s_-16s_1-3aas_-5s_comparés_à_la_référence|Les processus +16s -16s 1-3aas -5s comparés à la référence]]
&lt;pre&gt;
;;total +16s;;;;;;;;;total 1-3aas;;;;;;;
;;+16s;gca;atc;aaa;gta;gcc;gaa;total;;;alpha;gama;baci;clos;tener;;
;;gama;29;23;8;8;2;33;103;;atgf;23;;2;2;;;
;;clos;26;11;;;5;;42;;gac;;23;2;1;;;
;;afn;2;2;;;;;4;;aac;;;4;7;6;;
;;baci;16;15;;;;;31;;acc;;9;1;1;;;
;;alpha +bd;37;43;;;;;80;;tgg;;8;;1;;;
;;b t c;21;23;;;;;44;;tca;;4;;;;;
;;actino;0;0;0;0;0;0;0;;gaa;;1;;2;;;
;;total;131;117;8;8;7;33;304;;tcc;;;1;;;;
;;;;;;;;;;;;23;45;10;14;6;;
;;;;;;;;;;;autres;;;;37;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;+16s;;;référence +5s;;;;304;;total 1-3aas;;;;;;;135
;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;8;tct;;tat;;atgf;27
;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;6;tcc;1;tac;;tgc;1
;;atc;117;acc;;aac;;agc;;;atc;;acc;11;aac;17;agc;
;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;
;;gtc;;gcc;7;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;26;ggc;4
;;tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;
;;ata;;aca;;aaa;8;aga;;;ata;;aca;;aaa;6;aga;1
;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
;;gta;8;gca;131;gaa;33;gga;;;gta;;gca;4;gaa;3;gga;1
;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;9
;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;;inter;;max;;min;;total;;;;;;;;;
;;;248;;49;;7;;304;;alpha gama;;clostridia;;;baci clos tener;;baci
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;-16s;-5s;;référence +5s;;;;24;;total 1-3aas;;;référence +5s;;;;135
-16s;;atgi;;tct;;tat;;atgf;;;atgi;8;tct;;tat;;atgf;27
2 gga;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
2 tac;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
aac;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
agc;;ttc;;tcc;1;tac;2;tgc;;;ttc;6;tcc;1;tac;;tgc;1
atc;;atc;1;acc;;aac;6;agc;1;;atc;;acc;11;aac;17;agc;
cgt;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;1;;ctc;1;ccc;;cac;;cgt;
gca;;gtc;;gcc;;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;;gac;26;ggc;4
tca;;tta;;tca;1;taa;;tga;;;tta;4;tca;4;taa;;tga;
tcc;;ata;;aca;3;aaa;;aga;;;ata;;aca;;aaa;6;aga;1
;;cta;;cca;;caa;;cga;;;cta;;cca;;caa;;cga;
-5s;;gta;;gca;1;gaa;;gga;7;;gta;;gca;4;gaa;3;gga;1
3 aca;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;9
5 gga;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
5 aac;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;;inter;;max;;min;;total;;*;inter;;max;;min;;total
;;;5;;19;;0;;24;;;43;;90;;2;;135
&lt;/pre&gt;
====Les processus +16s et 1-3aas des fiches mémoires====
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_processus_+16s_et_1-3aas_des_fiches_mémoires|Les processus +16s et 1-3aas des fiches mémoires]]
&lt;pre&gt;
+16s;;;référence +5s;;;;3957;;+16s;;;;;;;1000
atgi;;cds;121;16s;1039;atgf;2;;atgi;;tct;;tat;;atgf;1
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;1235;acc;;aac;;agc;;;atc;442;acc;;aac;;agc;
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;11;gac;;ggc;;;gtc;;gcc;4;gac;;ggc;
tta;;tca;;taa;;tga;;;tta;;tca;;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;11;aga;;;ata;;aca;;aaa;4;aga;
cta;;cca;4;caa;;cga;;;cta;;cca;1;caa;;cga;
gta;13;gca;1249;gaa;272;gga;;;gta;5;gca;447;gaa;97;gga;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;inter;;max;;min;;total;;;inter;;max;;min;;total
;2484;;302;;11;;2797;;;888;;108;;4;;1000
;;;;;;;;;;;;;;;;
1-3aas;;;;;;;736;;1-3aas;;;;;;;1000
atgi;15;tct;;tat;;atgf;172;;atgi;20;tct;;tat;;atgf;234
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1;;ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;21;tcc;2;tac;12;tgc;7;;ttc;29;tcc;3;tac;16;tgc;10
atc;3;acc;82;aac;73;agc;1;;atc;4;acc;111;aac;99;agc;1
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;4;;ctc;3;ccc;;cac;3;cgt;5
gtc;;gcc;;gac;172;ggc;12;;gtc;;gcc;;gac;234;ggc;16
tta;5;tca;5;taa;;tga;;;tta;7;tca;7;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;17;aga;1;;ata;;aca;1;aaa;23;aga;1
cta;;cca;1;caa;1;cga;;;cta;;cca;1;caa;1;cga;
gta;5;gca;14;gaa;7;gga;12;;gta;7;gca;19;gaa;10;gga;16
ttg;;tcg;;tag;;tgg;78;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;106
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;atgj;1;acg;1;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;;cgg;2;;ctg;1;ccg;;cag;;cgg;3
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;2;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;3
;inter;;max;;min;;total;;;inter;;max;;min;;total
;218;;510;;8;;736;;;296;;693;;11;;1000
&lt;/pre&gt;

====Classement des tRNAs avec les 8 processus====  
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Classement_des_tRNAs_avec_les_8_processus|Classement des tRNAs avec les 8 processus]]
&lt;pre&gt;
;Classement des tRNAs;;;;À 1000 par processus;;;;;;;;;
;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;1-3aas;+16s;;;+5s;1aa;&gt;1aa;dup;1-3aas;+16s
atgf;41;33;34;61;234;1;;tca;25;39;11;8;7;-
aac;51;31;33;45;99;-;;aga;20;32;20;4;1;-
I;;;;;;;;atgi;19;33;7;4;20;-
gaa;56;16;50;51;10;97;;tcc;13;41;6;4;3;-
gac;55;15;52;26;234;-;;ttg;9;37;8;4;-;-
gta;68;14;52;53;7;5;;ctc;5;33;14;4;3;-
aaa;55;19;42;51;23;4;;I;;;;;;
ggc;51;19;56;87;16;-;;ccc;3;31;1;0;-;-
tac;35;8;42;57;7;-;;tcg;3;29;5;0;-;-
II;;;;;;;;acg;3;31;5;0;1;-
aca;44;21;41;14;1;-;;agg;0;34;1;0;-;-
cca;44;22;37;8;1;2;;cgg;0;26;10;0;3;-
caa;39;21;35;24;1;-;;ggg;1;22;6;0;3;-
ttc;37;23;33;18;29;-;;II;;;;;;
gga;33;16;43;12;16;-;;ctg;12;22;15;57;1;-
tta;32;20;30;4;7;-;;gtc;7;21;11;57;-;-
atgj;31;16;37;12;1;-;;gcc;1;18;13;51;-;4
cta;27;23;31;16;-;-;;aag;0;20;11;32;-;-
cac;27;15;32;22;3;-;;gag;1;10;5;24;-;-
III;;;;;;;;cag;0;10;13;20;-;-
tgc;23;18;36;8;10;-;;ccg;1;16;4;16;-;-
agc;20;20;32;0;1;-;;gtg;0;11;5;16;1;-
IV;;;;;;;;gcg;0;14;5;6;-;-
cgt;40;16;18;99;5;-;;III;;;;;;
V;;;;;;;;cga;0;3;7;0;-;-
gca;23;4;7;0;19;447;;ata;0;1;1;0;-;-
atc;20;4;7;4;4;442;;tga;0;10;0;0;-;-
;;;;;;;;IV;;;;;;
VI;;;;;;;;ctt;0;4;3;4;-;-
acc;12;20;21;10;111;-;;act;0;3;0;0;-;-
tgg;16;34;12;4;106;-;;agt;0;1;0;0;-;-
&lt;/pre&gt;

==Les intercalaires dans les genome.cumuls==
*Lien tableau: [[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Les_intercalaires_dans_les_genome.cumuls|Les intercalaires dans les genome.cumuls]]
*'''Récapitulatif des chapitres cumuls'''
* - ne sont pris en compte que les moyennes en excluant quelques valeurs extrêmes (sans jaunes)
* - Les 2 dernières colonnes cdsa et cdsa300 sont en aas.
* - 19*, erreur dans la lecture de la colonne ( à corriger ant-cumuls et scc-cumuls)
&lt;pre&gt;
;sans rRNA;avec rRNA;cds;cdsd;;cdsa;cdsa 300;notes
gamme;200;200;500;500;;1100;330;
;;;;;;;;
pub;44;9;50;16;;239;-;
rtb;57;-;193;-;;269;176;
rru;119;66;148;-;;237;140;
cvi;26;86;-;-;;-;-;
ade;39;22;-;-;;-;-;
ant;25;*19;139;60;;239;-;
rpl;56;-;191;-;;243;172;
rpm;39;-;147;-;;252;170;
oan;138;11;258;-;;256;-;
abq;72;30;153;-;;249;166;
abs;71;31;151;-;;242;166;
agr;33;59;172;-;;185;137;
aua;131;-;226;153;;235;158;
;;;;;;;;
spl;58;-;-;-;;-;-;
vpb;43;26;-;-;;-;-;
eal;53;-;-;-;;-;-;
eco;57;-;-;-;;-;-;
ecoN;31;32;178;127;;260;172;
vha;46;30;183;86;;240;-;
amed;49;-;214;156;;274;-;
;;;;;;;;
bsu;14;17;-;-;;-;-;
lmo;11;20;-;-;;-;-;
lam;14;12;-;-;;-;-;
ppm;20;17;193;150;;292;229;cdsj ?
pmq;16;14;207;126;;235;213;cdsd ?
lbu;14;29;159;114;;275;-;
ban;14;15;165;132;;191;-;
;;;;;;;;
psor;9;10;173;95;;220;-;
cdc;14;9;206;165;;286;-;
cdc8;14;10;182;155;;208;-;
cbc;15;15;-;-;;-;-;
cbn;14;14;-;-;;-;-;
cle;19;22;-;-;;-;-;
hmo;8;8;196;137;;230;-;
cbei;18;7;350;195;;328;-;
afn;12;-;-;-;;-;-;
;;;;;;;;
ase;19;-;147;-;;254;179;
blo;34;-;-;-;;-;-;
sma;34;-;-;-;;-;-;
ksk;33;-;-;-;;-;-;
;;;;;;;;
myr;33;-;144;-;;244;189;
fps;30;-;135;-;;246;181;
;;;;;;;;
pnu;11;-;176;-;;240;188;
pmg;10;12;93;-;;248;170;
;;;;;;;;
abra;23;22;131;-;;201;148;
apal;25;17;122;-;;218;177;
;;;;;;;;
scc;32;*;188;124;;299;-;
;;;;;;;;
mja;29;18;152;-;;253;194;
mba;51;-;210;-;;186;158;
mfi;35;-;178;-;;213;171;
mfe;55;-;223;-;;207;157;
&lt;/pre&gt;</text>
      <sha1>6zfmn6nft1y5xmdu37fj032i0lrpbzv</sha1>
    </revision>
  </page>
  <page>
    <title>Recherche:Les Nombres et Dieu</title>
    <ns>104</ns>
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    <revision>
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      <parentid>880895</parentid>
      <timestamp>2022-08-03T10:31:12Z</timestamp>
      <contributor>
        <username>EclairEnZ</username>
        <id>50317</id>
      </contributor>
      <comment>/* Les nombres ne sont pas une «création» */ Malebranche</comment>
      <model>wikitext</model>
      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="12009" xml:space="preserve">{{Travail de recherche
  | titre        = Dieu et les nombres sont co-Étant
  | idfaculté    = Philosophie
 }}

== Les nombres ne sont pas une «création» ==
* Pythagore : ''« Les nombres sont l'essence des choses. » « Tout est arrangé par le nombre. »''
* Platon : ''« Les nombres sont le plus haut degré de la connaissance. Le nombre est la connaissance même. »''
* Leibnitz : ''« Lorsque l'analyse est bien poussée jusqu'à son terme, la connaissance est adéquate ; et je ne sais si les hommes peuvent en donner un exemple parfait ; cependant, la connaissance des nombres en approche fort''. » Pour aller beaucoup plus loin avec Leibnitz, qui encore à ce jour est très incompris, un autre thème, [http://www.philo5.com/Les%20philosophes%20Textes/Leibniz_MonadeSansFenetre.htm Monadologie], avec un concept très puissant (philosophie/métaphysique) évoqué par Claire Schwartz (audio à 33'10) : ''« Nous portons les marques de tout ce qui s’est passé et de tout ce qui se passera. » « Je suis affecté par tout ce qui s’est produit, se produit, et se produira. »[https://www.franceculture.fr/emissions/les-chemins-de-la-philosophie/leibniz-24-quest-ce-quune-monade].''

[[w:Charles_ Hermite (1822-1901)|Charles Hermite]] : ''« L’admiration, a-t-on dit, est le principe du savoir ; je m’autoriserai de cette pensée pour exprimer le désir qu’on fasse la part la plus large, pour les étudiants, &lt;span style=&quot;color:blue&quot;&gt;aux choses simples et belles&lt;/span&gt;. Je crois que les nombres et les fonctions de l’Analyse ne sont pas le produit arbitraire de notre esprit ; &lt;span style=&quot;color:blue&quot;&gt;je pense qu’ils existent en dehors de nous,&lt;/span&gt; avec le même caractère de nécessité que les choses de la réalité objective, et nous les rencontrons ou les découvrons, et les étudions, comme les physiciens, les chimistes et les zoologistes. (Lettre à Thomas Stieltjes). Il existe, si je ne me trompe, tout un monde qui est l’ensemble des vérités mathématiques, dans lequel nous n’avons accès que par l’intelligence, comme existe le monde des réalités physiques ; l’un et l’autre indépendants de nous, tous deux de création divine, qui ne semblent distincts qu’à cause de la faiblesse de notre esprit, qui ne sont pour une pensée plus puissante qu’une seule et même chose, et dont la synthèse se révèle partiellement dans cette merveilleuse correspondance entre les mathématiques abstraites d’une part, l’astronomie et toutes les branches de la physique de l’autre. »''
* J'aime beaucoup ces lignes de Charles Hermite, pourtant je ne suis pas d'accord avec le mathématicien (ce qu'il est avant tout) pour dire que les nombres sont une ‘’création‘’ de Dieu.
* De même cette affirmation de Leopold Kronecker, autre mathématicien : ''« Dieu a fait les nombres entiers, tout le reste est l'œuvre de l'Homme »,'' est évidemment fausse. D'une part et surtout parce que les nombres, qui sont ''« l'essence des choses »,'' ont toujours existé, d'autre part parce que, ''dans la vision de Kronecker'', si Dieu avait ''« fait [uniquement] les nombres entiers »,'' alors π par exemple, d'une importance vitale pour les mathématiques, mais un nombre irrationnel, aurait été créé par l'Homme.
Les Anciens, qui s'occupaient de bien des choses (philosophie, mathématiques, métaphysique...) n'occultaient jamais le sujet. Les mathématiciens actuels semblent n'y plus méditer, ou ils en parlent très rarement. Comme beaucoup d'entre nous, ils se sont assujettis à la complexité, à la technologie-idole.
* Pour Pythagore, le nombre et la limite étaient les caractères d’une '''perfection''' ''finie'' qui réside dans l'harmonie.
Imaginons qu’un homme ait une liberté d’esprit, une intelligence, un imaginal, qui lui permettent d’appréhender la notion d’unité entre Dieu et la beauté des Nombres dans toute son évidence. S'émerveillant devant cette Beauté, de leurs relations entre eux, cet homme se dit : ''« Dieu est vraiment dans un autre ‘’monde’’ que notre bas monde. Il se situe ailleurs, Il est Perfection ».'' Cet homme se dit aussi : ''« Que Dieu ne Soit pas, est impossible ».'' Posons :&lt;br&gt;
1. Les nombres sont une merveille d'infinie Beauté et Grandeur, ils recèlent la perfection.&lt;br&gt;
2. Les nombres existent en dehors de nous, ils ont toujours existé, ''ils n'auraient pu ne pas exister.''&lt;br&gt;
Donc :&lt;br&gt;
3. Les nombres sont une perfection éternelle.&lt;br&gt;
4. Je dis que '''Dieu et les Nombres sont ''Un, co-Étant.'''''&lt;br&gt;
5. Dieu ''n'aurait pu ne pas “exister”.'' Dieu ne peut qu'Être, il ne peut en être autrement.

Je dis que nous avons ici la plus forte preuve intellectuelle que Dieu Est. Mais paradoxalement il faut déjà être très croyant, au moins intellectuellement, pour pouvoir apprécier la merveille de cette déduction. Je n'aime pas faire preuve de fausse humilité, je ne pense pas du tout qu'il y ait un quelconque orgueil dans cette réflexion, je crois tout simplement avoir acquis, vers l'âge de 45 ans, ''la foi du charbonnier.'' Je ne l'ai pas à chaque instant de ma vie, vous n'avez certainement pas à m'envier, mais au fond de moi, oui je crois l'avoir. J'aime aussi pousser la logique jusqu'au bout, et l'audace dans l'imaginal est pour moi d'une importance capitale.  

''« Et ce sont les choses les plus cruciales, les plus fondamentales, au moment où elles sont enfin saisies, qui sont celles qui frappent le plus par leur caractère d’évidence ; celles dont on se dit après coup qu’elles “crevaient les yeux” – au point qu’on se trouve stupéfait que soi-même ni personne n’y ait songé avant et depuis longtemps ».'' ([[w:Alexandre_Grothendieck|Alexandre Grothendieck]]).

Celui qui n'a pas la foi peut toujours ''imaginer'' que Dieu n'Est pas, mais jamais il ne pourra en faire une réalité, trouver une seule preuve de l'inexistence du Créateur. J'irai même plus loin, jamais il ne pourra, quoi qu'il en pense, trouver une seule preuve de l'inexistence d'un Dieu bon, d'un Dieu aimant, d'un Dieu miséricordieux. S'il pense en avoir une, elle sera infirmée par cette [[Recherche:Enquête sur Dieu|Enquête sur Dieu]] à laquelle, évidemment, il aura bien du mal à adhérer, car son âme, et son esprit, et sa psychologie ne l'y ont pas disposé. Quant au croyant bien informé des principaux évènements “religieux” (profondément spirituels) ayant survenu et survenant toujours de par le monde, il ne cesse de trouver preuve sur preuve de l'existence de Dieu (de même dans sa vie personnelle). Ce qui n'empêche pas qu'il soit confronté, tout comme le non croyant, aux difficultés de la vie, qui peuvent parfois sembler insurmontables. On voit qu'ici aussi il y a une justice. Car si la foi est un don, le Fils de Dieu, par le don de sa vie sur la croix, s'est donné également à chacun d'entre nous.&lt;br&gt;
Un croyant familier des mathématiques et y posant un regard de philosophe pourrait considérer l'unicité ''“Dieu-les Nombres”'' comme une évidence, pourtant je n'ai jamais lu qu'un auteur ait eu la hardiesse de mentionner explicitement cette indissociabilité. Il est vrai que les évidences les plus profondes, les plus flagrantes, sont celles qu'on ose le moins convoquer. Cela tient sans doute au fait que le concept ressemble trop en effet à une preuve de l'existence de Dieu (au moins pour celui qui est déjà croyant). [[w:Augustin_d'Hippone|Augustin d'Hippone]] est le penseur qui a le mieux approfondi l'idée : « ''Ainsi, bien que les nombres soient infinis et sans nombre, l’infinité du nombre ne saurait être incompréhensible à celui dont l’intelligence est au-dessus du nombre. Et, par conséquent, s’il faut que tout ce qui est compris soit fini dans l’intelligence qui le comprend, nous devons croire que &lt;span style=&quot;color:blue&quot;&gt;l'infinité même est finie en Dieu d'une certaine manière ineffable,&lt;/span&gt; puisqu’elle ne lui est pas incompréhensible.'' »&lt;ref&gt;[http://Ainsi,%20bien%20que%20les%20nombres%20soient%20infinis%20et%20sans%20nombre,%20l’infinité%20du%20nombre%20ne%20saurait%20être%20incompréhensible%20à%20celui%20dont%20l’intelligence%20est%20au-dessus%20du%20nombre. Saint Augustin, Œuvres complètes, LIVRE DOUZIÈME]&lt;/ref&gt;. 

Les nombres me semblent être l’“aspect” de Dieu qui nous est le plus directement, le plus facilement accessible. Si l'on réunissait, et ''pouvait comprendre,'' toutes les connaissances faites par nos plus grands savants, nous serions quasiment des petits puits de science. Pourtant ce ne serait que de minuscules points d'accès à la Connaissance. Avec l'idée que nous avons développée plus haut nous pouvons comprendre comment les grands mathématiciens peuvent être émerveillés devant tant de beauté, tant d'harmonie, tant d'ordre, tant d'imbrications, tant de logique. Pourquoi aussi, n'étant pas trop motivés pour chercher ailleurs que dans les nombres la Beauté, l'Harmonie, ils peuvent aussi facilement se passer de la Croyance en un Dieu créateur {{Clin}}.

Les puissantes inventions du mathématicien [[w:Pierre_de_Fermat|Pierre de Fermat]] n'auraient pas été possibles sans une profonde intimité avec les nombres.&lt;ref&gt;Sur Wikiversité : [[Recherche:L’énigme de Fermat passée au crible|L’énigme de Fermat passée au crible]]&lt;/ref&gt; Le concept d’unité entre Dieu et les nombres aide à comprendre comment les 15 constantes physiques de base ayant permis la création de l’univers ont pu être ajustées aussi finement, aboutissant parmi tous les mondes possibles, au meilleur. Il n’est pour s’en convaincre que d’observer la magnificence de l'univers, ou bien l’harmonie du corps humain et ses admirables fonctionnalités.

Les nombres sont donc un des attributs de Dieu, l'attribut parmi d'autres qui a permis de créer le monde physique, et on rejoint ici ce que disent les scientifiques – pour la part laïque de l'explication en tout cas. Les mathématiciens ont beaucoup de plaisir à étudier les nombres, mais la plupart se sont éloignés de l'essentiel, inconscients qu'ils sont pour la plupart qu'en étudiant la Mathématique ils étudient la “composante” de Dieu qui leur est directement accessible. Le paradoxe est qu'en faisant leurs formidables découvertes, ''de plus en plus'' ils (pas tous heureusement) se croient eux-mêmes les véritables Créateurs et ont de moins en moins besoin de Dieu. Quant à nous, nous faisons tout pour devenir de plus en plus optimiste – ce qui est bon pour la santé. {{sourire}}
&lt;blockquote&gt;'''''&lt;span style=&quot;color:blue&quot;&gt;« L'étude des mathématiques est la plus pure application de l'esprit de Dieu. »&lt;/span&gt;''''' [[w:Nicolas Malebranche|Nicoloas Malebranche]]&lt;/blockquote&gt;
La Mathématique est comme un puissant symbole visible de Dieu où la notion d'infini est toujours présente, on y trouve les choses les plus simples et les plus belles, de nombreux termes peuvent faire penser à la métaphysique, en commençant par '''''Un''''', puis naturel, premier, transcendant, imaginaire, rationnel, irrationnel, complexe, hyper complexe, incertitude, indécidabilité , preuve ?... '''''Infiniment grand.'''''

== Voir aussi ==
[[w:Augustin_d'Hippone|Augustin d'Hippone]] : ''[http://www.clerus.org/bibliaclerusonline/es/bi4.htm#b5 UTILITÉ DE LA CONNAISSANCE DES LANGUES, DE LA NATURE, DES NOMBRES ET DE LA MUSIQUE POUR L'INTELLIGENCE DES SIGNES FIGURÉS.]''

Pour Augustin le nombre ''2'' “mesure tous les nombres pairs”, pour cette raison il écrit : ''« Qu’il me suffise d’avertir ici que trois est le premier nombre impair, et quatre le premier pair, et que ces deux nombres pris ensemble font celui de sept. »'' (Voir [https://www.bibliotheque-monastique.ch/bibliotheque/bibliotheque/saints/augustin/citededieu/livre11.htm#_Toc510342292 ici]). Certains de nos mathématiciens évoquent d'ailleurs ces deux nombres de la même façon.

== Références ==</text>
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    <title>Ensemble (mathématiques)/Exercices/Ensembles</title>
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        <username>Zetud</username>
        <id>1978</id>
      </contributor>
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      <text bytes="11595" xml:space="preserve">{{Exercice
  | idfaculté = mathématiques
  | numéro    = 1
  | précédent = [[../../|Sommaire]]
  | suivant   = [[../Ensembles et opérations/]]
  | niveau    = 14
}}

==Exercice 1-1==
Pour tout ensemble &lt;math&gt;X&lt;/math&gt;, vérifier que &lt;math&gt;\{\varnothing, X\}\subset\mathcal P(X)&lt;/math&gt; et que &lt;math&gt;x\in X\Leftrightarrow\{x\}\subset X&lt;/math&gt;.
{{Solution|contenu=
*&lt;math&gt;\{\varnothing, X\}\subset\mathcal P(X)&lt;/math&gt; car &lt;math&gt;\varnothing, X\in\mathcal P(X)&lt;/math&gt; car &lt;math&gt;\varnothing, X\subset X&lt;/math&gt;.
*&lt;math&gt;\{x\}\subset X\Leftrightarrow\forall y\in\{x\}\quad y\in X\Leftrightarrow x\in X&lt;/math&gt;.
}}

==Exercice 1-2==
#Vrai ou faux ?
#*a) &lt;math&gt;\varnothing\subset\varnothing&lt;/math&gt; ? 
#*b) &lt;math&gt;\varnothing\in\varnothing&lt;/math&gt; ? 
#*c) &lt;math&gt;\varnothing\in\{\varnothing\}&lt;/math&gt; ? 
#*d) &lt;math&gt;\varnothing\in\mathcal P(\varnothing)&lt;/math&gt; ?
#Décrire les éléments de &lt;math&gt;\mathcal P(\varnothing)&lt;/math&gt; et de &lt;math&gt;\mathcal P(\mathcal P(\varnothing))&lt;/math&gt;.
{{Solution|contenu=
#
#*a) Vrai (on a &lt;math&gt;X\subset X&lt;/math&gt; pour tout ensemble &lt;math&gt;X&lt;/math&gt;).
#*b) Faux (rien n'appartient à l'ensemble vide).
#*c) Vrai (on a &lt;math&gt;x\in\{x\}&lt;/math&gt; pour tout &lt;math&gt;x&lt;/math&gt;).
#*d) Vrai (on a &lt;math&gt;X\in\mathcal P(X)&lt;/math&gt; pour tout ensemble &lt;math&gt;X&lt;/math&gt; d'après a), et aussi &lt;math&gt;\varnothing\in\mathcal P(X)&lt;/math&gt;).
#&lt;math&gt;\mathcal P(\varnothing)=\{\varnothing\}&lt;/math&gt; donc &lt;math&gt;\mathcal P(\mathcal P(\varnothing))=\{\varnothing,\{\varnothing\}\}&lt;/math&gt;. Remarque : les cardinaux sont cohérents (&lt;math&gt;2^0=1&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;2^1=2&lt;/math&gt;).
}}

==Exercice 1-3==
À partir de la définition des couples par &lt;math&gt;(x,y)=\{\{x\},\{x,y\}\}&lt;/math&gt;, montrer que :
#&lt;math&gt;(x,y)=(x',y')\Rightarrow(x=x'\quad\text{et}\quad y=y')&lt;/math&gt; ;
#&lt;math&gt;\{x\}\times\{x\}=\{\{\{x\}\}\}&lt;/math&gt;.
{{Solution|contenu=
#Il suffit d'utiliser la [[w:Paire#Égalité de deux paires|condition d'égalité pour deux paires (ou singletons)]], en distinguant soigneusement tous les cas possibles.
#* Soit {''x''} = {''x{{'}}''} et {''x'', ''y''} = {''x{{'}}'', ''y{{'}}''}. Alors (égalité des deux singletons) ''x = x{{'}}''. D'autre part (égalité des deux paires), soit ''x = x{{'}}'' et ''y = y{{'}}'', ce que l'on veut démontrer, soit ''x = y' '' et ''y = x{{'}}'', mais comme par ailleurs ''x = x{{'}}'', les 4 éléments sont égaux d'où le résultat.
#* Soit {''x''} = {''x{{'}}'', ''y{{'}}''} et {''x'', ''y''} = {''x{{'}}''}. On déduit de ces deux égalités que les 4 éléments sont égaux, d'où le résultat.
#Par définition, &lt;math&gt;\{x\}\times\{x\}=\{(x,x)\}&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;(x,x)=\{\{x\}\}&lt;/math&gt;.
Remarquons qu'on aurait les mêmes résultats en définissant les couples par &lt;math&gt;(x,y)=\{\{y\},\{x,y\}\}&lt;/math&gt;,
}}
Avec cette même définition, décrire en compréhension le produit cartésien de deux ensembles &lt;math&gt;X&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;Y&lt;/math&gt;, comme sous-ensemble de &lt;math&gt;\mathcal P(\mathcal P(X\cup Y))&lt;/math&gt;.
{{Solution|contenu=
Vérifions d'abord qu'on a bien &lt;math&gt;X\times Y\subset\mathcal P(\mathcal P(X\cup Y))&lt;/math&gt;. Soient &lt;math&gt;x\in X&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;y\in Y&lt;/math&gt;. Alors, le singleton &lt;math&gt;a=\{x\}&lt;/math&gt; et la paire &lt;math&gt;b=\{x,y\}&lt;/math&gt; sont inclus dans &lt;math&gt;X\cup Y&lt;/math&gt; donc appartiennent à &lt;math&gt;\mathcal P(X\cup Y)&lt;/math&gt;, si bien que la paire &lt;math&gt;(x,y)=\{a,b\}&lt;/math&gt; est incluse dans &lt;math&gt;\mathcal P(X\cup Y)&lt;/math&gt; donc appartient à &lt;math&gt;\mathcal P(\mathcal P(X\cup Y))&lt;/math&gt;.

Moyennant quoi, on peut affirmer que
:&lt;math&gt;X\times Y=\{z\in\mathcal P(\mathcal P(X\cup Y))\mid\exists x\in X\quad\exists y\in Y\quad z=(x,y)\}&lt;/math&gt;.
}}
A-t-on &lt;math&gt;(a,(b,c))=((a,b),c)&lt;/math&gt; ?
{{Solution|contenu=Les deux paires &lt;math&gt;(a,(b,c))=(a,\{b,\{b,c\}\})=\{a,\{a,\{b,\{b,c\}\}\}\}&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;((a,b),c)=(\{a,\{a,b\}\},c)=\{\{a,\{a,b\}\},\{\{a,\{a,b\}\},c\}\}&lt;/math&gt; sont en général différentes : par exemple, les deux éléments de la seconde sont des paires, tandis que l'élément &lt;math&gt;a&lt;/math&gt; de la première n'en est généralement pas une.
}}

==Exercice 1-4==
On pose &lt;math&gt;E_0:=\varnothing&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;E_{k+1}:=\{E_k\}&lt;/math&gt;. Montrer que les ensembles &lt;math&gt;E_0,E_1,\dots&lt;/math&gt; sont deux à deux distincts et que l'ensemble &lt;math&gt;\{\varnothing,\{\varnothing\}\}&lt;/math&gt; n'est égal à aucun des ensembles &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt;.
{{Solution|contenu=
&lt;math&gt;E_0&lt;/math&gt;, les autres &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt;, et &lt;math&gt;\{\varnothing,\{\varnothing\}\}&lt;/math&gt; sont distincts car leur cardinal est respectivement 0, 1, 2. En particulier, pour tout &lt;math&gt;i&gt;0&lt;/math&gt;, &lt;math&gt;E_0\ne E_i&lt;/math&gt;. Par récurrence, on en déduit : &lt;math&gt;\forall n\in\N\quad E_n\ne E_i+n&lt;/math&gt; (car &lt;math&gt;a\ne b\Rightarrow\{a\}\ne\{b\}&lt;/math&gt;).
}}
==Exercice 1-5==
Soient &lt;math&gt;\mathcal A(x)&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\mathcal B(x)&lt;/math&gt; deux prédicats. On suppose : &lt;math&gt;\forall x(\mathcal A(x)\Rightarrow\mathcal B(x))&lt;/math&gt;. Montrer que si &lt;math&gt;\mathcal B(x)&lt;/math&gt; est [[../../Définitions#Prédicat collectivisant|collectivisant]] alors &lt;math&gt;\mathcal A(x)&lt;/math&gt; l'est aussi.
{{Solution|contenu=
Soit &lt;math&gt;B&lt;/math&gt; l'ensemble tel que &lt;math&gt;\forall x(\mathcal B(x)\Leftrightarrow x\in B)&lt;/math&gt;. Soit &lt;math&gt;A&lt;/math&gt; l'ensemble &lt;math&gt;\{x\in B\mid\mathcal A(x)\}&lt;/math&gt;. Alors, &lt;math&gt;\forall x(\mathcal A(x)\Leftrightarrow x\in A)&lt;/math&gt;.
}}
Le prédicat &lt;math&gt;x=x&lt;/math&gt; est-il collectivisant ?
{{Solution|contenu=
Non, sinon d'après la question précédente tout prédicat &lt;math&gt;\mathcal A(x)&lt;/math&gt; le serait — car &lt;math&gt;\forall x(\mathcal A(x)\Rightarrow x=x)&lt;/math&gt; — or il existe des prédicats &lt;math&gt;\mathcal A(x)&lt;/math&gt; non collectivisants, par exemple &lt;math&gt;x\notin x&lt;/math&gt;.
}}

==Exercice 1-6==
#Montrer que &lt;math&gt;A\subset B\Leftrightarrow\mathcal P(A)\subset\mathcal P(B)&lt;/math&gt;.
#À quelle condition a-t-on respectivement &lt;math&gt;\mathcal P(E)=\varnothing&lt;/math&gt; ? &lt;math&gt;\mathcal P(E)=\{a\}&lt;/math&gt; ? &lt;math&gt;\operatorname{card}\mathcal P(E)=2&lt;/math&gt; ?
{{Solution|contenu=
#&lt;math&gt;\Rightarrow&lt;/math&gt; : par transitivité de &lt;math&gt;\subset&lt;/math&gt;.&lt;br&gt;Réciproquement, &lt;math&gt;\mathcal P(A)\subset\mathcal P(B)\Rightarrow A\in\mathcal P(B)\Rightarrow A\subset B&lt;/math&gt;.
#&lt;math&gt;\operatorname{card}\mathcal P(E)=2^{\operatorname{card}(E)}&lt;/math&gt; n'est jamais nul ; il vaut 1 si et seulement si &lt;math&gt;E=\varnothing&lt;/math&gt;, et 2 si et seulement si &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; est un singleton.
}}

==Exercice 1-7==
On pose &lt;math&gt;E_0=\varnothing&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;E_{k+1}=\mathcal P(E_k)&lt;/math&gt;. Montrer que les ensembles &lt;math&gt;E_0,E_1,\dots&lt;/math&gt; sont deux à deux distincts. L'ensemble &lt;math&gt;\{\varnothing,\{\varnothing\}\}&lt;/math&gt; est-il égal à l'un des ensembles &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; ?
{{Solution|contenu=
La suite &lt;math&gt;\left(\operatorname{card}(E_k)\right)&lt;/math&gt; est strictement croissante donc les &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; sont distincts. &lt;math&gt;E_1=\{\varnothing\}&lt;/math&gt; donc &lt;math&gt;E_2=\{\varnothing,\{\varnothing\}\}&lt;/math&gt;.
}}

==Exercice 1-8==
{{Wikipédia|Ensemble transitif}}
On dit qu'un ensemble &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; est ''transitif'' si tout élément de &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; est inclus dans &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; : &lt;math&gt;\forall x\quad x\in E\Rightarrow x\subset E&lt;/math&gt;.
#On définit par récurrence &lt;math&gt;E_0=\varnothing&lt;/math&gt; et &lt;math&gt;\forall k\in\N\quad E_{k+1}=E_k\cup\{E_k\}&lt;/math&gt;. Démontrer que les &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; sont transitifs.
#Démontrer que les &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; forment une suite strictement croissante d'ensembles (pour l'inclusion). Combien l'ensemble &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; a-t-il d'éléments ?
#Prouver plus généralement que si un ensemble &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; est transitif, alors l'ensemble &lt;math&gt;F:=E\cup\{E\}&lt;/math&gt; l'est également, et que si de plus &lt;math&gt;E\notin E&lt;/math&gt;, alors &lt;math&gt;F\notin F&lt;/math&gt; et l'inclusion &lt;math&gt;E\subset F&lt;/math&gt; est stricte.
{{Solution|contenu=
#&lt;math&gt;\varnothing&lt;/math&gt; est transitif donc par récurrence (cf. question 3 pour l'hérédité) tous les &lt;math&gt;E_k&lt;/math&gt; le sont.
#La suite est croissante par construction. Elle l'est strictement par récurrence, car &lt;math&gt;\varnothing\notin\varnothing&lt;/math&gt; (cf. question 3 pour l'hérédité), et &lt;math&gt;\operatorname{card}(E_k)=k&lt;/math&gt; (à nouveau par récurrence).
#
#*Soit &lt;math&gt;x\in F&lt;/math&gt;, [[wikt:c.-à-d.|c.-à-d.]] &lt;math&gt;x\in E&lt;/math&gt; ou &lt;math&gt;x=E&lt;/math&gt;. Si &lt;math&gt;E&lt;/math&gt; est transitif, on a dans les deux cas &lt;math&gt;x\subset E&lt;/math&gt;.
#*Si de plus &lt;math&gt;x=F&lt;/math&gt; alors &lt;math&gt;F\subset E&lt;/math&gt;, c.-à-d. &lt;math&gt;E\in E&lt;/math&gt;. Par contraposition, on en déduit : si &lt;math&gt;E\notin E&lt;/math&gt; alors &lt;math&gt;F\notin F&lt;/math&gt;. Par ailleurs, &lt;math&gt;E\notin E\Leftrightarrow F\not\subset E&lt;/math&gt; (par définition de &lt;math&gt;F&lt;/math&gt;).
}}

==Exercice 1-9==
{{Wikipédia|Axiome de fondation}}
#Dans certaines variantes de la théorie des ensembles, on introduit l'''axiome de fondation'' : &lt;math&gt;\forall x\ne\varnothing\quad\exists y\in x\quad y\cap x=\varnothing&lt;/math&gt;. Démontrer que cet axiome équivaut à l'affirmation suivante : il n'existe pas de suite d'ensembles &lt;math&gt;x_0,x_1,\dots&lt;/math&gt; telle que &lt;math&gt;\forall i\in\N\quad x_{i+1}\in x_i&lt;/math&gt;. (Pour l'implication directe, considérer &lt;math&gt;x=\{x_i\mid i\in\N\}&lt;/math&gt;.)
#Démontrer que l'axiome de fondation entraine qu'il n'existe aucun ensemble qui soit élément de lui-même.
#On pose &lt;math&gt;s(x)=x\cup\{x\}&lt;/math&gt; (« successeur » de &lt;math&gt;x&lt;/math&gt;). Sous la même hypothèse, montrer que &lt;math&gt;x,s(x),s\bigl(s(x)\bigr),\dots&lt;/math&gt; sont deux à deux distincts.
#Toujours sous l'hypothèse de l'axiome de fondation, la relation &lt;math&gt;\left(\forall y \in x\quad y \in y\right)&lt;/math&gt; est-elle collectivisante ? Et la relation &lt;math&gt;\left(\forall y\in x\quad y\notin y\right)&lt;/math&gt; ?
{{Solution|contenu=
#Supposons qu'il existe une suite d'ensembles &lt;math&gt;(x_i)_{i\in I}&lt;/math&gt; telle que &lt;math&gt;\forall i\in\N\quad x_{i+1}\in x_i&lt;/math&gt; et posons &lt;math&gt;x=\{x_i\mid i\in\N\}&lt;/math&gt;. Alors, &lt;math&gt;x&lt;/math&gt; est non vide et tout &lt;math&gt;y\in x&lt;/math&gt; est égal à un &lt;math&gt;x_i&lt;/math&gt;, d'où &lt;math&gt;x_{i+1}\in y&lt;/math&gt;, or &lt;math&gt;x_{i+1}\in x&lt;/math&gt;, donc &lt;math&gt;x\cap y\ne\varnothing&lt;/math&gt;. On a donc prouvé (par contraposition) l'implication directe. Réciproquement, supposons &lt;math&gt;\exists x\ne\varnothing\quad\forall y\in x\quad y\cap x\ne\varnothing&lt;/math&gt;. Puisque &lt;math&gt;x\ne\varnothing&lt;/math&gt;, soit &lt;math&gt;x_0\in x&lt;/math&gt;. L'hypothèse sur &lt;math&gt;x&lt;/math&gt; permet ensuite de construire par récurrence (plus exactement : par [[w:Axiome du choix dépendant|choix dépendant]]) une suite &lt;math&gt;(x_k)&lt;/math&gt; telle que &lt;math&gt;\forall k\in\N\quad x_{k+1}\in x_k\cap x&lt;/math&gt;.
#Se déduit immédiatement de la question précédente, appliquée à une suite constante.
#Plus généralement, s'il existait deux indices &lt;math&gt;i&lt;j&lt;/math&gt; tels que &lt;math&gt;s^i(x)=s^j(x)&lt;/math&gt; alors, à nouveau d'après la question 1 (appliquée cette fois à une suite périodique : &lt;math&gt;s^j(x),s^{j-1}(x),\dots,s^{i+1}(x),s^j(x),s^{j-1}(x),\dots&lt;/math&gt;), cela contredirait l'axiome de fondation.&lt;br&gt;Autre argument : la suite des &lt;math&gt;s^k(x)&lt;/math&gt;, ''a priori'' croissante pour l'inclusion, serait en fait constante à partir de l'indice &lt;math&gt;i&lt;/math&gt; donc on aurait &lt;math&gt;s^i(x)=s^{i+1}(x)&lt;/math&gt;, ce qui équivaut à &lt;math&gt;s^i(x)\in s^i(x)&lt;/math&gt; donc nous ramène à la question précédente.
#La première relation est collectivisante — car &lt;math&gt;\left(\forall y \in x\quad y \in y\right)\Leftrightarrow x=\varnothing\Leftrightarrow x\in\{\varnothing\}&lt;/math&gt; — mais pas la seconde car &lt;math&gt;\left(\forall y\in x\quad y\notin y\right)\Leftrightarrow x=x&lt;/math&gt;, or &lt;math&gt;x=x&lt;/math&gt; n'est pas collectivisant {{supra|Exercice 1-5}}.
}}

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  | suivant   = [[../Ensembles et opérations/]]
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    <title>Recherche:Journée d'étude — Nouvelles intermédiations dans les dispositifs de co-recherche</title>
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      <contributor>
        <username>Elise Demeulenaere CNRS</username>
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      <comment>Mise à jour du pgr atelier 1</comment>
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      <text bytes="8972" xml:space="preserve">''Cette journée s’inscrit dans un travail transdisciplinaire débuté depuis plusieurs années afin de mieux comprendre l’institutionnalisation de partenariats entre organisations du tiers secteur et établissements d’enseignement supérieur et de recherche dans des dispositifs de co recherche. Elle a pour objectifs de répondre aux questions suivantes :''

* ''Nouvelles fonctions et nouveaux métiers : légitimité et reconnaissance''
* ''Quel rôle pour le tiers secteur ?''

''L'enjeu est de discuter les cadres d'analyse de ces co-recherches et d'équiper les acteurs pour la fabrique de lien.''
----'''Date :''' Le 4 octobre 2022

'''Lieu :''' Amphithéâtre d'INRAE – 147 rue de l’Université, Paris

'''Repas''' : Sur place à la cantine d'INRAE

'''Organisation (αβ) :''' Marc Barbier, Elise Demeulenaere, Alexandre Hannud Abdo, Evelyne Lhoste, Allison Loconto

'''Inscription:''' gratuite mais obligatoire par mail à &lt;code&gt;intermediations@umr-lisis.fr&lt;/code&gt; avant le 15 septembre

= Contexte =
L’institutionnalisation des partenariats de co-recherche résulte d’une double dynamique initiée par des acteurs émergents (groupes concernés, mouvements du libre, open source,...) et de l’économie sociale et solidaire (éducation populaire, innovation sociale....), puis relayée par les établissements publics d’enseignement supérieur et de recherche autour de concepts normatifs tels que les « sciences en société », open science, recherches participatives, ...sans oublier l’utilisation des savoirs de contributeurs bénévoles (bird watchers, collecteurs de tiques...). Cette institutionnalisation se traduit dans des politiques publiques.

Pour refléter cette double dynamique, nous nommons co-recherches, toutes ces activités qui impliquent des acteurs du tiers secteur&lt;ref group=&quot;Notes&quot;&gt;La notion de « Tiers Secteur de la Recherche », désigne le secteur non marchand (associations, syndicats, collectivités locales), le secteur marchand à but non lucratif (économie sociale et solidaire, groupements professionnels), les organisations à but lucratif de petite taille (auto-entrepreneurs, groupements agricoles ou artisanaux) (sources Akrich et col. 2017 et recommandation du conseil scientifique du CNRS pour une stratégie de recherches participatives. 15 octobre 2021).&lt;/ref&gt; et des chercheurs académiques. Ces acteurs se mettent ensemble pour résoudre un problème mal ou non pris en charge par le marché ou les pouvoirs publics (Barré, 2020). Il s’agit alors de produire et utiliser des connaissances dans des situations incertaines et sujettes à controverses (Loconto, 2021). Ces connaissances sont variées mais elles ont toutes en commun de produire des changements : connaissances scientifiques, apprentissages organisationnels, innovations élargies dans leurs processus et leurs objectifs, normes et règles, politiques publiques, marchés, pratiques sociétales, et bien sûr l'encapacitation des acteurs (éducation populaire, université, éducation nationale).  

Cette journée a été précédée de plusieurs autres journées de travail. D'une part, une série de séminaires organisés par le groupe de travail « intermédiations en recherche » de l’Alliss entre 2016 et 2018 ont fait l'objet d'un numéro thématique des Cahiers de l’action (2020). Ils ont montré que ces intermédiations jouaient un rôle crucial dans les processus de co-recherche : mise en lien et animation d'un collectif autour d'un problème commun ; traduction, capitalisation et transfert des résultats ; entrepreneuriat institutionnel...Ces activités diverses sont portées par des personnes différentes travaillant en étroite collaboration. Ces personnes partagent des valeurs sur la façon dont se font les liens entre science et société et une éthique de ce que doivent être les rapports au sein du collectif (Barré, 2020). D'autre part, un colloque organisé par l'IFRIS les 29 et 30 septembre 2019 s’est penché sur les besoins et limites actuels de l’institutionnalisation des recherches participatives : déficit d’acculturation réciproque provoquant des incompréhensions, voire de la défiance, et impactant la qualité des données recueillies et l’efficacité de la résolution des problèmes traités ; besoin d’outiller les acteurs et de structurer le champ, de reconnaitre la légitimité du tiers secteur et d’inciter les chercheurs à s’impliquer. Ces besoins et limites s’inscrivent dans un contexte de stabilisation d’un champ d’action stratégique des recherches participatives qu’il convient d’interroger (Lhoste, 2022).

[[Utilisateur:Solstag/Journée d'études Intermédiation et dispositifs de co-recherche#sdfootnote1anc|1]] La notion de « Tiers Secteur de la Recherche », désigne le secteur non marchand (associations, syndicats, collectivités locales), le secteur marchand à but non lucratif (économie sociale et solidaire, groupements professionnels), les organisations à but lucratif de petite taille (auto-entrepreneurs, groupements agricoles ou artisanaux) (sources Akrich et col. 2017 et recommandation du conseil scientifique du CNRS pour une stratégie de recherches participatives. 15 octobre 2021).

= Programme =

=== '''9:30 Accueil''' ===
Jean-Baptiste Merilhou-Goudard (INRAE - DISPSO) 

=== '''9:45 Introduction :''' Participation – policies – foresight ===
Matthias Weber (Center for Innovation Systems and Policy, Vienna, Austria)

=== '''10:30 Atelier 1 :''' L’institutionnalisation des recherches participatives dans les Établissements publics scientifiques et techniques (EPST) ===
Animation et organisation : Elise et Marc

Fil rouge : nouveaux métiers, nouvelles fonctions et nouveaux statuts dans les dynamiques de co-recherche

Intervenants :

* Co-construction des connaissances dans et pour les circuits alimentaires courts et de proximité : Yuna Chiffoleau (INRAE) 

* Les nouveaux métiers des sciences participatives dans le domaine de la biodiversité :  Romain Julliard (MNHN, directeur du [https://mosaic.mnhn.fr/ Programme Mosaic]), Alexandra Villarroel (Coordinatrice Particip-Arc et Vigie Muséum)
* Titre à venir, Janine Barbot (INSERM, CERMES3)
=== '''12:00 Atelier 2''' : L’affirmation du tiers secteur dans les co-recherches ===
Animation et organisation : Evelyne et Ale (LISIS) 

Fil rouge : de l’auto-organisation à l’institutionnalisation du TSR : enjeux et limites

Intervenants :

* Agro-alimentaire : Juliette Peres – Responsable développement - [https://fablim.org/fablim/ FAB'LIM], Le Labo des territoires alimentaires méditerranéens.

* Socio-culturel : Jules Desgouttes – [https://www.lafriche.org/ Friche de la Belle de Mai], lieux culturels à Marseille

* Économie circulaire :  Geneviève Fontaine - [http://scic-tetris.org/ SCIC TETRIS]
* Energie : Claire Manfredi - [https://www.enercoop.fr/nos-cooperatives/languedoc-roussillon Enercoop Languedoc-Roussillon]

=== 13:30 Déjeuner ===

=== '''14:45 Atelier 3''' : Les agents intermédiaires dans les transitions environnementales et sociales ===
Animation: Amina Béji-Bécheur - I[https://www.u-pec.fr/fr/recherche/laboratoires/institut-de-recherche-en-gestion-irg-ea-2354 nstitut de Recherche en Gestion], Univ. Eiffel

Fil rouge : conseiller pour les transitions : freins et succès

Intervenants :

* [http://collectif-cc.com/?team=isabelle-richard Isabelle Richard] – Bureau de recherche en psychologie environnementale
* Ewa Zlotek-Zlotkiewicz ­– [https://www.linkedin.com/company/klask-innovation-sociale/?originalSubdomain=fr KLASK] « docteurs au service de l’innovation sociale »

* Christophe Besson-Léaud – [https://sens-eco.org/ Alliance sens et économie], communauté des (co)producteurs d’une économie responsable et de territoires résilients

=== '''16:15 Wrap up''' : Grand témoin ===
Rachid Cherkaoui - [https://institutgodin.com/ Institut Godin]

=== 17:00 Conclusions et fin de la journée ===

== Pour en savoir plus ==
[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01607413 Prendre au sérieux la société de la connaissance : livre blanc] . Akrich M. et al. (2017)

Les dispositifs de co-recherche et intermédiations : [https://www.cairn.info/revue-cahiers-de-l-action-2020-1.htm Construire la recherche avec la société civile : les enjeux de la démarche d’intermédiation], Cahiers de l’action 2020/1 (N° 55)

Les recherches participatives et co-recherches : [https://www.openscience.fr/Trajectoire-d-un-champ-d-action-strategique-les-recherches-participatives-sont Trajectoire d’un champ d’action stratégique : les recherches participatives sont-elles solubles dans la science ?] Lhoste (2022, Technologie et innovation, volume 7)

De la standardisation à l’intermédiation : une sociologie des interactions. ''Vade me cum'': L’Intermédiation de la consommation et production durables (Vol. 2): Loconto (2021)

== Notes ==
&lt;references group=&quot;Notes&quot; /&gt;</text>
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      <text bytes="9061" xml:space="preserve">''Cette journée s’inscrit dans un travail transdisciplinaire débuté depuis plusieurs années afin de mieux comprendre l’institutionnalisation de partenariats entre organisations du tiers secteur et établissements d’enseignement supérieur et de recherche dans des dispositifs de co recherche. Elle a pour objectifs de répondre aux questions suivantes :''

* ''Nouvelles fonctions et nouveaux métiers : légitimité et reconnaissance''
* ''Quel rôle pour le tiers secteur ?''

''L'enjeu est de discuter les cadres d'analyse de ces co-recherches et d'équiper les acteurs pour la fabrique de lien.''
----'''Date :''' Le 4 octobre 2022

'''Lieu :''' Amphithéâtre d'INRAE – 147 rue de l’Université, Paris

'''Repas''' : Sur place à la cantine d'INRAE

'''Organisation (αβ) :''' Marc Barbier, Elise Demeulenaere, Alexandre Hannud Abdo, Evelyne Lhoste, Allison Loconto

'''Inscription:''' gratuite mais obligatoire par mail à &lt;code&gt;intermediations@umr-lisis.fr&lt;/code&gt; avant le 15 septembre

= Contexte =
L’institutionnalisation des partenariats de co-recherche résulte d’une double dynamique initiée par des acteurs émergents (groupes concernés, mouvements du libre, open source,...) et de l’économie sociale et solidaire (éducation populaire, innovation sociale....), puis relayée par les établissements publics d’enseignement supérieur et de recherche autour de concepts normatifs tels que les « sciences en société », open science, recherches participatives, ...sans oublier l’utilisation des savoirs de contributeurs bénévoles (bird watchers, collecteurs de tiques...). Cette institutionnalisation se traduit dans des politiques publiques.

Pour refléter cette double dynamique, nous nommons co-recherches, toutes ces activités qui impliquent des acteurs du tiers secteur&lt;ref group=&quot;Notes&quot;&gt;La notion de « Tiers Secteur de la Recherche », désigne le secteur non marchand (associations, syndicats, collectivités locales), le secteur marchand à but non lucratif (économie sociale et solidaire, groupements professionnels), les organisations à but lucratif de petite taille (auto-entrepreneurs, groupements agricoles ou artisanaux) (sources Akrich et col. 2017 et recommandation du conseil scientifique du CNRS pour une stratégie de recherches participatives. 15 octobre 2021).&lt;/ref&gt; et des chercheurs académiques. Ces acteurs se mettent ensemble pour résoudre un problème mal ou non pris en charge par le marché ou les pouvoirs publics (Barré, 2020). Il s’agit alors de produire et utiliser des connaissances dans des situations incertaines et sujettes à controverses (Loconto, 2021). Ces connaissances sont variées mais elles ont toutes en commun de produire des changements : connaissances scientifiques, apprentissages organisationnels, innovations élargies dans leurs processus et leurs objectifs, normes et règles, politiques publiques, marchés, pratiques sociétales, et bien sûr l'encapacitation des acteurs (éducation populaire, université, éducation nationale).  

Cette journée a été précédée de plusieurs autres journées de travail. D'une part, une série de séminaires organisés par le groupe de travail « intermédiations en recherche » de l’Alliss entre 2016 et 2018 ont fait l'objet d'un numéro thématique des Cahiers de l’action (2020). Ils ont montré que ces intermédiations jouaient un rôle crucial dans les processus de co-recherche : mise en lien et animation d'un collectif autour d'un problème commun ; traduction, capitalisation et transfert des résultats ; entrepreneuriat institutionnel...Ces activités diverses sont portées par des personnes différentes travaillant en étroite collaboration. Ces personnes partagent des valeurs sur la façon dont se font les liens entre science et société et une éthique de ce que doivent être les rapports au sein du collectif (Barré, 2020). D'autre part, un colloque organisé par l'IFRIS les 29 et 30 septembre 2019 s’est penché sur les besoins et limites actuels de l’institutionnalisation des recherches participatives : déficit d’acculturation réciproque provoquant des incompréhensions, voire de la défiance, et impactant la qualité des données recueillies et l’efficacité de la résolution des problèmes traités ; besoin d’outiller les acteurs et de structurer le champ, de reconnaitre la légitimité du tiers secteur et d’inciter les chercheurs à s’impliquer. Ces besoins et limites s’inscrivent dans un contexte de stabilisation d’un champ d’action stratégique des recherches participatives qu’il convient d’interroger (Lhoste, 2022).

[[Utilisateur:Solstag/Journée d'études Intermédiation et dispositifs de co-recherche#sdfootnote1anc|1]] La notion de « Tiers Secteur de la Recherche », désigne le secteur non marchand (associations, syndicats, collectivités locales), le secteur marchand à but non lucratif (économie sociale et solidaire, groupements professionnels), les organisations à but lucratif de petite taille (auto-entrepreneurs, groupements agricoles ou artisanaux) (sources Akrich et col. 2017 et recommandation du conseil scientifique du CNRS pour une stratégie de recherches participatives. 15 octobre 2021).

= Programme =

=== '''9:30 Accueil''' ===
Jean-Baptiste Merilhou-Goudard (INRAE - DISPSO) 

=== '''9:45 Introduction :''' Participation – policies – foresight ===
Matthias Weber (Center for Innovation Systems and Policy, Vienna, Austria)

=== '''10:30 Atelier 1 :''' L’institutionnalisation de démarches de co-recherche dans les Établissements publics scientifiques et techniques (EPST) ===
Animation et organisation : Elise (CNRS) et Marc (INRAE)

Fil rouge : nouveaux métiers, nouvelles fonctions et nouveaux statuts dans les dynamiques de co-recherche, dans les domaines de l'alimentation, de la biodiversité et de la santé

Intervenants :

* Co-construction des connaissances dans et pour les circuits alimentaires courts et de proximité : Yuna Chiffoleau (INRAE) 

* Les nouveaux métiers des sciences participatives dans le domaine de la biodiversité :  Romain Julliard (MNHN, directeur du [https://mosaic.mnhn.fr/ Programme Mosaic]), Alexandra Villarroel (Coordinatrice Particip-Arc et Vigie Muséum)
* Titre à venir, Janine Barbot (INSERM, CERMES3)
=== '''12:00 Atelier 2''' : L’affirmation du tiers secteur dans les co-recherches ===
Animation et organisation : Evelyne et Ale (LISIS) 

Fil rouge : de l’auto-organisation à l’institutionnalisation du TSR : enjeux et limites

Intervenants :

* Agro-alimentaire : Juliette Peres – Responsable développement - [https://fablim.org/fablim/ FAB'LIM], Le Labo des territoires alimentaires méditerranéens.

* Socio-culturel : Jules Desgouttes – [https://www.lafriche.org/ Friche de la Belle de Mai], lieux culturels à Marseille

* Économie circulaire :  Geneviève Fontaine - [http://scic-tetris.org/ SCIC TETRIS]
* Energie : Claire Manfredi - [https://www.enercoop.fr/nos-cooperatives/languedoc-roussillon Enercoop Languedoc-Roussillon]

=== 13:30 Déjeuner ===

=== '''14:45 Atelier 3''' : Les agents intermédiaires dans les transitions environnementales et sociales ===
Animation: Amina Béji-Bécheur - I[https://www.u-pec.fr/fr/recherche/laboratoires/institut-de-recherche-en-gestion-irg-ea-2354 nstitut de Recherche en Gestion], Univ. Eiffel

Fil rouge : conseiller pour les transitions : freins et succès

Intervenants :

* [http://collectif-cc.com/?team=isabelle-richard Isabelle Richard] – Bureau de recherche en psychologie environnementale
* Ewa Zlotek-Zlotkiewicz ­– [https://www.linkedin.com/company/klask-innovation-sociale/?originalSubdomain=fr KLASK] « docteurs au service de l’innovation sociale »

* Christophe Besson-Léaud – [https://sens-eco.org/ Alliance sens et économie], communauté des (co)producteurs d’une économie responsable et de territoires résilients

=== '''16:15 Wrap up''' : Grand témoin ===
Rachid Cherkaoui - [https://institutgodin.com/ Institut Godin]

=== 17:00 Conclusions et fin de la journée ===

== Pour en savoir plus ==
[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01607413 Prendre au sérieux la société de la connaissance : livre blanc] . Akrich M. et al. (2017)

Les dispositifs de co-recherche et intermédiations : [https://www.cairn.info/revue-cahiers-de-l-action-2020-1.htm Construire la recherche avec la société civile : les enjeux de la démarche d’intermédiation], Cahiers de l’action 2020/1 (N° 55)

Les recherches participatives et co-recherches : [https://www.openscience.fr/Trajectoire-d-un-champ-d-action-strategique-les-recherches-participatives-sont Trajectoire d’un champ d’action stratégique : les recherches participatives sont-elles solubles dans la science ?] Lhoste (2022, Technologie et innovation, volume 7)

De la standardisation à l’intermédiation : une sociologie des interactions. ''Vade me cum'': L’Intermédiation de la consommation et production durables (Vol. 2): Loconto (2021)

== Notes ==
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    <title>Wikiversité:La salle café/août 2022</title>
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      <comment>/* Recherche de coéquipier sur sujet de recherche mathématique */ nouvelle section</comment>
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      <text bytes="3818" xml:space="preserve">&lt;noinclude&gt;{{SC|2022|08}}{{Clr}}&lt;/noinclude&gt;

== Actualités techniques n°&amp;#x202f;2022-31 ==

&lt;section begin=&quot;technews-2022-W31&quot;/&gt;&lt;div class=&quot;plainlinks&quot;&gt;
Dernières '''[[m:Special:MyLanguage/Tech/News|actualités techniques]]''' de la communauté technique de Wikimedia. N’hésitez pas à informer les autres utilisateurs de ces changements. Certains changements ne vous concernent pas. [[m:Special:MyLanguage/Tech/News/2022/31|D’autres traductions]] sont disponibles.

'''Changements récents'''
* Des [[m:Special:MyLanguage/Help:Displaying_a_formula#Phantom|capacités LaTeX améliorées pour le rendu des mathématiques]] sont maintenant disponibles dans les wikis grâce à la prise en charge des balises &lt;bdi lang=&quot;zxx&quot; dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;code&gt;Phantom&lt;/code&gt;&lt;/bdi&gt;. Ceci complète une partie du [[m:Community_Wishlist_Survey_2022/Editing/Missing_LaTeX_capabilities_for_math_rendering|souhait nº&amp;#x202f;59]] de l'enquête sur les souhaits de la communauté 2022.

'''Changements à venir cette semaine'''
* [[File:Octicons-sync.svg|12px|link=|alt=|Sujet récurrent]] La [[mw:MediaWiki 1.39/wmf.23|nouvelle version]] de MediaWiki sera installée sur les wikis de test et sur MediaWiki.org à partir du {{#time:j xg|2022-08-02|fr}}. Elle sera installée sur tous les wikis hormis la majorité des Wikipédias le {{#time:j xg|2022-08-03|fr}} et enfin sur toutes les Wikipédias restantes le {{#time:j xg|2022-08-04|fr}} ([[mw:MediaWiki 1.39/Roadmap|calendrier]]).
* L'[[mw:Special:MyLanguage/Help:Extension:WikiEditor/Realtime_Preview|aperçu en temps réel]] sera disponible en tant que fonctionnalité bêta sur les wikis du [https://noc.wikimedia.org/conf/highlight.php?file=dblists%2Fgroup0.dblist groupe&amp;nbsp;0]. Cette fonctionnalité a été construite afin de répondre à l'[[m:Special:MyLanguage/Community_Wishlist_Survey_2021/Real_Time_Preview_for_Wikitext|une des propositions de l'enquête sur les souhaits de la communauté]].

'''Changements à venir'''
* La fonctionnalité bêta des [[mw:Special:MyLanguage/Help:DiscussionTools|Outils de discussion]] va être mise à jour pendant le mois d’août. L'apparence des discussions va changer. Vous pouvez voir [[mw:Special:MyLanguage/Talk pages project/Usability/Prototype|certains des changements proposés]].

'''Prochaines réunions'''
* Cette semaine, trois réunions sur l’[[mw:Special:MyLanguage/Reading/Web/Desktop Improvements|habillage Vector (nouvelle version&amp;nbsp;2022)]] avec interprétation en direct auront lieu. Le mardi, l'interprétation en russe sera assurée. Le jeudi, des réunions pour les arabophones et les hispanophones auront lieu. [[mw:Special:MyLanguage/Reading/Web/Desktop Improvements/Updates/Talk to Web|Voir comment participer]].

'''''[[m:Special:MyLanguage/Tech/News|Actualités techniques]]''' préparées par les [[m:Special:MyLanguage/Tech/News/Writers|rédacteurs des actualités techniques]] et postées par [[m:Special:MyLanguage/User:MediaWiki message delivery|robot]]&amp;nbsp;• [[m:Special:MyLanguage/Tech/News#contribute|Contribuer]]&amp;nbsp;• [[m:Special:MyLanguage/Tech/News/2022/31|Traduire]]&amp;nbsp;• [[m:Tech|Obtenir de l’aide]]&amp;nbsp;• [[m:Talk:Tech/News|Donner votre avis]]&amp;nbsp;• [[m:Global message delivery/Targets/Tech ambassadors|S’inscrire ou se désinscrire]].''
&lt;/div&gt;&lt;section end=&quot;technews-2022-W31&quot;/&gt;

1 août 2022 à 21:21 (UTC)
&lt;!-- Message envoyé par User:Quiddity (WMF)@metawiki en utilisant la liste sur https://meta.wikimedia.org/w/index.php?title=Global_message_delivery/Targets/Tech_ambassadors&amp;oldid=23615613 --&gt;

== Recherche de coéquipier sur sujet de recherche mathématique ==

Est-ce ici qu'il faut déposer une demande de coéquipier et est-ce permis ?[[Utilisateur:Ereduverseau|Ereduverseau]] ([[Discussion utilisateur:Ereduverseau|discuter]]) 2 août 2022 à 19:00 (UTC)</text>
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    <title>Recherche:Sur l’extension des genres grammaticaux en français/substantifs</title>
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      <contributor>
        <username>Psychoslave</username>
        <id>2753</id>
      </contributor>
      <comment>ajout de quelques suffixes et références</comment>
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      <text bytes="10248" xml:space="preserve">
&lt;blockquote&gt;🚧 À faire&amp;nbsp;:

* lister les suffixes féminin/masculin usuels, les réifier par des diacritiques
* aller au-delà dans les alternatives sexuées&amp;nbsp;: commun, mixte, non-binaire, etc. (pour les noms communs de personnes uniquement)
* analyse des suffixes communs en français, cf https://fr.wiktionary.org/w/index.php?title=Cat%C3%A9gorie:Suffixes_en_fran%C3%A7ais&amp;pagefrom=gate%0A-gate#mw-pages
*analyser les propositions dans https://lavieenqueer.wordpress.com/2018/07/26/petit-dico-de-francais-neutre-inclusif/
*analyser l’existant de suffixes comme -us, -um, -ul -os pour former des dérivés marquant un genre manifeste (masculin, neutre…), en considérant -euse/-esse comme le modèle protypique à suivre
*trouver une copie de Khaznadar, Edwige (2000) &quot;La suffixation du masculin et du féminin dans l’alternance en genre en français : de la réalité contemporaine et de quelques vieilles lunes »
*décrire la méthodologie retenue : croiser les suffixes documentés aux terminaisons phonologiques en usage pour prioriser sans limiter les morphes suffixaux envisagés sous le prisme statistique de l'existant 
&lt;/blockquote&gt;Les suffixes -euse et -esse permetent de rajouter le trait sémantique ''féminin'' ou ''femelle'' sur une base qui, en reprenant la terminologie précédement exposée, relève d’un genre strictement ambigü ou équivoque basculé vers un genre ostentatoire. ''Une ânesse'' porte sans conteste la supposition du trait ''femelle'', tandis qu’''un âne'' demeure équivoque tant que n’y est pas adjoint un épithète ''femelle'' ou ''mâle''. Cette forme pousse même, comme il a déjà était dit, jusqu’à laisser évasif l’intention exact du locuteur&amp;nbsp;:

* le sexe n’est pas spécifié parce que dans la perspective du locuteur il est sans importance pour le propos&amp;nbsp;;
* le sexe n’est pas spécifié parce qu’il importe pour le locuteur de ne pas le revéler&amp;nbsp;;
* le sexe n’est pas spécifié parce que le locuteur l’ignore.

L’objectif de cette section est de faire un relevé des pratiques existantes et de proposer une liste de suffixes utilisables pour exprimer de manière ostentatoire tout ou partie des catégories de genre décrites dans les sections précédentes, en limitant autant que possible les collisions conflictuels avec les usages déjà plus ou moins bien ancrés. Outre le genre, les notions connexes comme la dénomination d’un groupe indéterminant seront intégrés à la recherche. Pour le formule par un exemple concret  les cas tels que ''lectorat'' comparativement à ''lecteur'' et ''lectrice'' seront pris en compte comme prototype à calquer et étendre pour y adjoindre des formes ostantoirement marqués pour d’autres catégories de genre.
{| class=&quot;wikitable&quot;
|+
! colspan=&quot;2&quot; |Suffixe
! colspan=&quot;4&quot; |Nombre d’emploi correspondant dans le flou du français usuel
! colspan=&quot;5&quot; |Extensions ostentatoires
!
|-
!Graphie
!Prononciation
!Total
!Ambigü
!Équivoque
!Ambigü-équivoque
!Altersexualisant&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne construite autours de ''-iel-''.&lt;/ref&gt;
!Féminin&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne counstruite autours de la lettre ''u''. Emploi de -u- ou -û- lorsque que la prononciation donne /y/ et de ú pour /u/. Solution de repli sur -ul- en certains cas.&lt;/ref&gt;
!Générique&lt;ref&gt;Colonne construite autours de -a-, -al- en première solution de repli, et -ial- en seconde solution de repli par analogie avec -iel-.&lt;/ref&gt;
!Inanimé&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne construite autours de ''-o-'' en priorité, avec ogonek lorsque l'évitement d'une homographie le justifie ; puis utilisation de ''-ol-'' en première solution de repli.&lt;/ref&gt;
!Masculin&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Construit sur -i- en priorité. Ajout d'un accent grave au besoin.&lt;/ref&gt;
!Remarque
|-
| -os
|/ɔs/
|74
|4
|60
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|À ''hardos'' pourrait répondre ''hardesse'' qui semble sans emploi actuellement. Distinguer donc l’appairage à -esse de celui fait à -euse. En effet ''hardeuse'' répond à ''hardeur'' qui sont des termes de tout autre sens.
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|à évaluer comme complément à -euse
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|}
Pour aller plus loin dans l’exploration des suffixes nominaux, il sera opportun de consulter les références afférentes&lt;ref&gt;{{Lien web|nom1=Camus|prénom1=Laurent|titre=Suffixes|url=https://www.francaisfacile.com/cgi2/myexam/voir2.php?id=95684|site=www.francaisfacile.com|consulté le=2021-12-24}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Gaston|nom1=Zink|titre=Noms et adjectifs suffixés dans le Testament de Villon (éd. A. Longnon - L. Foulet, Paris, Champion)|périodique=L'information grammaticale|volume=56|numéro=1|date=1993|doi=10.3406/igram.1993.3170|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/igram_0222-9838_1993_num_56_1_3170|consulté le=2021-12-24|pages=42–45}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Chapitre-B|langue=fr|titre chapitre=Catégorie:Suffixes en français|titre ouvrage=Wiktionnaire|date=2021-01-12|lire en ligne=https://fr.wiktionary.org/w/index.php?title=Cat%C3%A9gorie:Suffixes_en_fran%C3%A7ais&amp;oldid=29089207|consulté le=2021-12-24}}&lt;/ref&gt;&lt;ref name=&quot;:33&quot; /&gt;&lt;ref name=&quot;:34&quot;&gt;{{Article|prénom1=Edwige|nom1=Khaznadar|titre=Apport de la francophonie dans la dénomination de la femme et de l'homme|périodique=Nouvelles Études Francophones|volume=24|numéro=1|date=2009|issn=1552-3152|lire en ligne=https://www.jstor.org/stable/25702188|consulté le=2021-12-24|pages=100–111}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|langue=fr|prénom1=Antoine|nom1=Di-Lillo|titre=Il n’y a pas de suffixe -ateur en français. Voyons ! (I)|périodique=Meta : journal des traducteurs / Meta: Translators' Journal|volume=27|numéro=3|date=1982|issn=0026-0452|issn2=1492-1421|doi=10.7202/002569ar|lire en ligne=https://www.erudit.org/fr/revues/meta/1982-v27-n3-meta297/002569ar/|consulté le=2021-12-24|pages=319–330}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Christian|nom1=Devos|titre=André (Jacques). Emprunts et suffixes nominaux en latin|périodique=Revue belge de Philologie et d'Histoire|volume=56|numéro=2|date=1978|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/rbph_0035-0818_1978_num_56_2_5516_t1_0453_0000_1|consulté le=2022-08-02|pages=453–454}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Louis|nom1=Deroy|titre=E. Benveniste, Noms d'agent et noms d'action en Paris|périodique=L'Antiquité Classique|volume=19|numéro=1|date=1950|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/antiq_0770-2817_1950_num_19_1_2914_t1_0217_0000_2|consulté le=2022-08-02|pages=217–221}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=André|nom1=Winther|titre=Un point de morpho-syntaxe : la formation des adjectifs substantivés en français|périodique=L'information grammaticale|volume=68|numéro=1|date=1996|doi=10.3406/igram.1996.3023|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/igram_0222-9838_1996_num_68_1_3023|consulté le=2022-08-02|pages=42–46}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Michèle|nom1=Verdelhan-Bourgade|titre=Procédés sémantiques et lexicaux en français branché|périodique=Langue française|volume=90|numéro=1|date=1991|doi=10.3406/lfr.1991.6196|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lfr_0023-8368_1991_num_90_1_6196|consulté le=2022-08-02|pages=65–79}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|langue=fr|prénom1=John|nom1=Reighard|titre=Contraintes sur le changement syntaxique|périodique=Cahier de linguistique|numéro=8|date=1978|issn=0315-4025|issn2=1920-1346|doi=10.7202/800073ar|lire en ligne=https://www.erudit.org/fr/revues/cl/1978-n8-cl3102/800073ar/|consulté le=2022-08-02|pages=407–436}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Margit|nom1=Köski|prénom2=Láslò|nom2=Garaï|prénom3=Paul|nom3=Wald|titre=Les débuts de la catégorisation sociale et les manifestations verbales : une étude longitudinale|périodique=Langage &amp; société|volume=4|numéro=1|date=1978|doi=10.3406/lsoc.1978.1068|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lsoc_0181-4095_1978_num_4_1_1068|consulté le=2022-08-02|pages=3–30}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Pierre|nom1=Hamblenne|titre=Vocabulaire latin (mots en ...eus) et analyse linguistique. À la recherche d'une méthode|périodique=Revue belge de Philologie et d'Histoire|volume=67|numéro=1|date=1989|doi=10.3406/rbph.1989.3663|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/rbph_0035-0818_1989_num_67_1_3663|consulté le=2022-08-02|pages=139–160}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Zellig Sabbettai|nom1=Harris|titre=Du morphème à l'expression|périodique=Langages|volume=3|numéro=9|date=1968|doi=10.3406/lgge.1968.2360|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lgge_0458-726x_1968_num_3_9_2360|consulté le=2022-08-02|pages=23–50}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Albert|nom1=Valdman|titre=Le créole : structure, statut et origine|périodique=Collection IDERIC|volume=8|numéro=1|date=1978|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/ierii_1764-8319_1978_mon_8_1|consulté le=2022-08-02}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Bernard|nom1=Moreux|titre=L'utilisation des méthodes quantitatives en linguistique grecque et latine|périodique=L'Antiquité Classique|volume=51|numéro=1|date=1982|doi=10.3406/antiq.1982.2077|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/antiq_0770-2817_1982_num_51_1_2077|consulté le=2022-08-02|pages=291–338}}&lt;/ref&gt;.
&lt;references group=&quot;N&quot; /&gt;</text>
      <sha1>271s4qlmf6hs87uw4fgsy137anlfa5y</sha1>
    </revision>
    <revision>
      <id>881028</id>
      <parentid>881025</parentid>
      <timestamp>2022-08-02T14:01:22Z</timestamp>
      <contributor>
        <username>Psychoslave</username>
        <id>2753</id>
      </contributor>
      <comment>reprise du paragraphe introductif</comment>
      <model>wikitext</model>
      <format>text/x-wiki</format>
      <text bytes="10772" xml:space="preserve">
&lt;blockquote&gt;🚧 À faire&amp;nbsp;:

* lister les suffixes féminin/masculin usuels, les réifier par des diacritiques
* aller au-delà dans les alternatives sexuées&amp;nbsp;: commun, mixte, non-binaire, etc. (pour les noms communs de personnes uniquement)
* analyse des suffixes communs en français, cf https://fr.wiktionary.org/w/index.php?title=Cat%C3%A9gorie:Suffixes_en_fran%C3%A7ais&amp;pagefrom=gate%0A-gate#mw-pages
*analyser les propositions dans https://lavieenqueer.wordpress.com/2018/07/26/petit-dico-de-francais-neutre-inclusif/
*analyser l’existant de suffixes comme -us, -um, -ul -os pour former des dérivés marquant un genre manifeste (masculin, neutre…), en considérant -euse/-esse comme le modèle protypique à suivre
*trouver une copie de Khaznadar, Edwige (2000) &quot;La suffixation du masculin et du féminin dans l’alternance en genre en français : de la réalité contemporaine et de quelques vieilles lunes »
*décrire la méthodologie retenue : croiser les suffixes documentés aux terminaisons phonologiques en usage pour prioriser sans limiter les morphes suffixaux envisagés sous le prisme statistique de l'existant 
&lt;/blockquote&gt;L’objectif de cette section est de faire un relevé des pratiques existantes et de proposer une liste de suffixes utilisables pour exprimer de manière ostentatoire tout ou partie des catégories de genre décrites dans les sections précédentes, en limitant autant que possible les collisions conflictuels avec les usages déjà plus ou moins bien ancrés. Outre le genre, les notions connexes comme la dénomination d’un groupe indéterminant seront intégrés à la recherche. Pour le formuler par un exemple concret  les cas tels que ''lectorat'' comparativement à ''lecteur'' et ''lectrice'' seront pris en compte comme prototype à calquer et étendre pour y adjoindre des formes ostantoirement marqués pour d’autres catégories de genre.

Les sections précédentes ont permis d’établir que dans une majeure partie des cas, les morphologies suffixales ne suffisent pas à déterminer la valeur d'un genre flou. En prenant en compte aussi bien l’oral que l’écrit, seul ''-çonne'' et ''-sion'' fourni un ensemble de termes associés au genre ambigu.

Cependant de nombreux suffixes démontrent un taux de corrélation à un genre flou, qui empiriquement est également associé à une sémantique sexuante dans le cas où ils désignent des entités vivantes. Ainsi -euse et -esse permettent de rajouter le trait sémantique ''féminin'' ou ''femelle'' sur une base qui, en reprenant la terminologie précédemment exposée, relève d’un genre strictement ambigu ou équivoque basculé vers un genre ostentatoire. ''Une ânesse'' porte sans conteste la supposition du trait ''femelle'', tandis qu’''un âne'' demeure équivoque tant que n’y est pas adjoint un épithète ''femelle'' ou ''mâle''. Cette forme pousse même, comme il a déjà était dit, jusqu’à laisser évasif l’intention exact du locuteur&amp;nbsp;:

* le sexe n’est pas spécifié parce que dans la perspective du locuteur il est sans importance pour le propos&amp;nbsp;;
* le sexe n’est pas spécifié parce qu’il importe pour le locuteur de ne pas le revéler&amp;nbsp;;
* le sexe n’est pas spécifié parce que le locuteur l’ignore.

{| class=&quot;wikitable&quot;
|+
! colspan=&quot;2&quot; |Suffixe
! colspan=&quot;4&quot; |Nombre d’emploi correspondant dans le flou du français usuel
! colspan=&quot;5&quot; |Extensions ostentatoires
!
|-
!Graphie
!Prononciation
!Total
!Ambigü
!Équivoque
!Ambigü-équivoque
!Altersexualisant&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne construite autours de ''-iel-''.&lt;/ref&gt;
!Féminin&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne counstruite autours de la lettre ''u''. Emploi de -u- ou -û- lorsque que la prononciation donne /y/ et de ú pour /u/. Solution de repli sur -ul- en certains cas.&lt;/ref&gt;
!Générique&lt;ref&gt;Colonne construite autours de -a-, -al- en première solution de repli, et -ial- en seconde solution de repli par analogie avec -iel-.&lt;/ref&gt;
!Inanimé&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Colonne construite autours de ''-o-'' en priorité, avec ogonek lorsque l'évitement d'une homographie le justifie ; puis utilisation de ''-ol-'' en première solution de repli.&lt;/ref&gt;
!Masculin&lt;ref group=&quot;N&quot;&gt;Construit sur -i- en priorité. Ajout d'un accent grave au besoin.&lt;/ref&gt;
!Remarque
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| -os
|/ɔs/
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|4
|60
|10
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|
|À ''hardos'' pourrait répondre ''hardesse'' qui semble sans emploi actuellement. Distinguer donc l’appairage à -esse de celui fait à -euse. En effet ''hardeuse'' répond à ''hardeur'' qui sont des termes de tout autre sens.
|-
| -euf
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|à évaluer comme complément à -euse
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| -yphe
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|Voir hyphe
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| -aire
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| -ir
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| -vore
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| -âtre
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|}
Pour aller plus loin dans l’exploration des suffixes nominaux, il sera opportun de consulter les références afférentes&lt;ref&gt;{{Lien web|nom1=Camus|prénom1=Laurent|titre=Suffixes|url=https://www.francaisfacile.com/cgi2/myexam/voir2.php?id=95684|site=www.francaisfacile.com|consulté le=2021-12-24}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Gaston|nom1=Zink|titre=Noms et adjectifs suffixés dans le Testament de Villon (éd. A. Longnon - L. Foulet, Paris, Champion)|périodique=L'information grammaticale|volume=56|numéro=1|date=1993|doi=10.3406/igram.1993.3170|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/igram_0222-9838_1993_num_56_1_3170|consulté le=2021-12-24|pages=42–45}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Chapitre-B|langue=fr|titre chapitre=Catégorie:Suffixes en français|titre ouvrage=Wiktionnaire|date=2021-01-12|lire en ligne=https://fr.wiktionary.org/w/index.php?title=Cat%C3%A9gorie:Suffixes_en_fran%C3%A7ais&amp;oldid=29089207|consulté le=2021-12-24}}&lt;/ref&gt;&lt;ref name=&quot;:33&quot; /&gt;&lt;ref name=&quot;:34&quot;&gt;{{Article|prénom1=Edwige|nom1=Khaznadar|titre=Apport de la francophonie dans la dénomination de la femme et de l'homme|périodique=Nouvelles Études Francophones|volume=24|numéro=1|date=2009|issn=1552-3152|lire en ligne=https://www.jstor.org/stable/25702188|consulté le=2021-12-24|pages=100–111}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|langue=fr|prénom1=Antoine|nom1=Di-Lillo|titre=Il n’y a pas de suffixe -ateur en français. Voyons ! (I)|périodique=Meta : journal des traducteurs / Meta: Translators' Journal|volume=27|numéro=3|date=1982|issn=0026-0452|issn2=1492-1421|doi=10.7202/002569ar|lire en ligne=https://www.erudit.org/fr/revues/meta/1982-v27-n3-meta297/002569ar/|consulté le=2021-12-24|pages=319–330}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Christian|nom1=Devos|titre=André (Jacques). Emprunts et suffixes nominaux en latin|périodique=Revue belge de Philologie et d'Histoire|volume=56|numéro=2|date=1978|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/rbph_0035-0818_1978_num_56_2_5516_t1_0453_0000_1|consulté le=2022-08-02|pages=453–454}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Louis|nom1=Deroy|titre=E. Benveniste, Noms d'agent et noms d'action en Paris|périodique=L'Antiquité Classique|volume=19|numéro=1|date=1950|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/antiq_0770-2817_1950_num_19_1_2914_t1_0217_0000_2|consulté le=2022-08-02|pages=217–221}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=André|nom1=Winther|titre=Un point de morpho-syntaxe : la formation des adjectifs substantivés en français|périodique=L'information grammaticale|volume=68|numéro=1|date=1996|doi=10.3406/igram.1996.3023|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/igram_0222-9838_1996_num_68_1_3023|consulté le=2022-08-02|pages=42–46}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Michèle|nom1=Verdelhan-Bourgade|titre=Procédés sémantiques et lexicaux en français branché|périodique=Langue française|volume=90|numéro=1|date=1991|doi=10.3406/lfr.1991.6196|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lfr_0023-8368_1991_num_90_1_6196|consulté le=2022-08-02|pages=65–79}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|langue=fr|prénom1=John|nom1=Reighard|titre=Contraintes sur le changement syntaxique|périodique=Cahier de linguistique|numéro=8|date=1978|issn=0315-4025|issn2=1920-1346|doi=10.7202/800073ar|lire en ligne=https://www.erudit.org/fr/revues/cl/1978-n8-cl3102/800073ar/|consulté le=2022-08-02|pages=407–436}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Margit|nom1=Köski|prénom2=Láslò|nom2=Garaï|prénom3=Paul|nom3=Wald|titre=Les débuts de la catégorisation sociale et les manifestations verbales : une étude longitudinale|périodique=Langage &amp; société|volume=4|numéro=1|date=1978|doi=10.3406/lsoc.1978.1068|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lsoc_0181-4095_1978_num_4_1_1068|consulté le=2022-08-02|pages=3–30}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Pierre|nom1=Hamblenne|titre=Vocabulaire latin (mots en ...eus) et analyse linguistique. À la recherche d'une méthode|périodique=Revue belge de Philologie et d'Histoire|volume=67|numéro=1|date=1989|doi=10.3406/rbph.1989.3663|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/rbph_0035-0818_1989_num_67_1_3663|consulté le=2022-08-02|pages=139–160}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Zellig Sabbettai|nom1=Harris|titre=Du morphème à l'expression|périodique=Langages|volume=3|numéro=9|date=1968|doi=10.3406/lgge.1968.2360|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/lgge_0458-726x_1968_num_3_9_2360|consulté le=2022-08-02|pages=23–50}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Albert|nom1=Valdman|titre=Le créole : structure, statut et origine|périodique=Collection IDERIC|volume=8|numéro=1|date=1978|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/ierii_1764-8319_1978_mon_8_1|consulté le=2022-08-02}}&lt;/ref&gt;&lt;ref&gt;{{Article|prénom1=Bernard|nom1=Moreux|titre=L'utilisation des méthodes quantitatives en linguistique grecque et latine|périodique=L'Antiquité Classique|volume=51|numéro=1|date=1982|doi=10.3406/antiq.1982.2077|lire en ligne=https://www.persee.fr/doc/antiq_0770-2817_1982_num_51_1_2077|consulté le=2022-08-02|pages=291–338}}&lt;/ref&gt;.
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