MQSeries unterstützt drei Nachrichtenübertragungsmodelle: Datagramme, Veröffentlichen/Teilnehmen (Publish/Subscribe - P/S) und Anfordern/Antworten (Request/Reply - R/R).
Nachrichten, die als Datagramme gesendet werden, werden an ein einzelnes Ziel gesendet, ohne dass eine Antwort erwartet wird. Beim P/S-Modell sendet mindestens ein Herausgeber eine Nachricht an einen Veröffentlichungsservice, der die Nachricht an mindestens einen interessierten Subskribenten verteilt. Das R/R-Modell ist dem Datagramm-Modell ähnlich, der Sender erwartet jedoch eine Antwort.